Academic literature on the topic 'Conception de médicaments in silico'
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Journal articles on the topic "Conception de médicaments in silico"
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Couvreur, Patrick. "Les nanotechnologies pour la conception de nouveaux médicaments." Biologie Aujourd'hui 206, no. 4 (2012): 237–48. http://dx.doi.org/10.1051/jbio/2012025.
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2
Opperdoes, FR. "Conception rationnelle de nouveaux médicaments contre la maladie du sommeil." médecine/sciences 11, no. 9 (1995): 1305. http://dx.doi.org/10.4267/10608/2451.
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3
VAILLANT, H., Y. RUELLE, and JS CADWALLADER. "BREVES DE MEDECINE." EXERCER 34, no. 198 (December 1, 2023): 479–80. http://dx.doi.org/10.56746/exercer.2023.198.479.
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Anticancéreux 1 : communiquer les données Des chercheurs ont évalué la fréquence à laquelle des informations pertinentes et précises sur les bénéfices et les incertitudes liées aux médicaments anticancéreux sont communiquées aux patients et aux cliniciens dans les sources d’information réglementées en Europe. De 2017 à 2019, 29 médicaments anticancéreux ont reçu une première autorisation de mise sur le marché dans 32 indications. Presque tous les résumés des caractéristiques des produits donnaient des informations complètes sur le nombre et la conception des études principales, le bras témoin éventuel, la taille de l’échantillon et les principaux critères d’évaluation. Aucune des notices d’information destinées aux patients n’indiquait comment les médicaments avaient été évalués. Trente et un (97 %) résumés des caractéristiques des produits et 25 (78 %) résumés publics contenaient des informations sur les avantages des médicaments qui étaient exactes et cohérentes avec celles des documents d’évaluation réglementaire. La présence ou l’absence de preuves qu’un médicament prolonge la survie était présente dans 23 (72 %) résumés des caractéristiques du produit et dans 4 (13 %) résumés publics. Aucune des brochures d’information destinées aux patients ne contenait d’informations sur les bénéfices attendus du médicament sur la base des résultats de l’étude. Les préoccupations des évaluateurs réglementaires européens concernant la fiabilité des preuves sur les bénéfices des médicaments, soulevées pour presque tous les médicaments de l’échantillon, ont rarement été communiquées. Ces résultats soulignent la nécessité d’améliorer la communication des avantages et des incertitudes liées aux médicaments anticancéreux. BMJ 2023. doi: 10.1136/bmj-2022-073711.
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Claude, Nancy, Françoise Goldfain-Blanc, and André Guillouzo. "La place des méthodesin silico, in vitro, in omicdans l’évaluation de la sécurité des médicaments." médecine/sciences 25, no. 1 (January 2009): 105–10. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/2009251105.
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5
Fournier, Chloé, David Feldman, Catherine Greffier, Isabelle Rouiller-Furic, and Pierre Lombrail. "Conception d’un outil d’éducation thérapeutique sur les médicaments génériques : de l’idée à la mise en place." Education Thérapeutique du Patient - Therapeutic Patient Education 3, no. 2 (July 28, 2011): S101—S110. http://dx.doi.org/10.1051/tpe/2011110.
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6
Jose, J. "Bioanalyse en chimie médicinale : de la mise au point d’analyses à la conception évolutive de médicaments." Annales Pharmaceutiques Françaises 67, no. 6 (November 2009): 399–407. http://dx.doi.org/10.1016/j.pharma.2009.07.002.
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7
Hibert, Marcel. "Approches moléculaires et thérapeutiques des interactions entre l’ocytocine et son récepteur." Biologie Aujourd’hui 216, no. 3-4 (2022): 125–30. http://dx.doi.org/10.1051/jbio/2022013.
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L’ocytocine est une neurohormone connue à l’origine pour son rôle dans les contractions de l’utérus au moment de l’accouchement et les contractions des glandes mammaires pour permettre l’éjection du lait lors de la tétée. Depuis les 25 dernières années, de multiples autres effets centraux et périphériques ont été identifiés, notamment dans les processus d’attachement entre parents et enfant, entre adultes et entre un individu et son groupe social. Nous avons abordé au cours de cette période la question fondamentale de l’architecture structurale et fonctionnelle du complexe formé par l’ocytocine et son récepteur et l’application de ce savoir à la conception de candidats médicaments. Ceci a conduit à la découverte du premier agoniste non peptidique de l’ocytocine, le LIT-001, restaurant l’interaction sociale dans un modèle animal d’autisme.
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Román-Alonso, G., F. Rojas-González, M. Aguilar-Cornejo, S. Cordero-Sánchez, and M. A. Castro-García. "In-silico simulation of porous media: Conception and development of a greedy algorithm." Microporous and Mesoporous Materials 137, no. 1-3 (January 2011): 18–31. http://dx.doi.org/10.1016/j.micromeso.2010.08.016.
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9
Chames, Patrick, and Thierry Wurch. "Les anticorps et scaffold bispécifiques, des médicaments innovants en oncologie impliquant le ciblage des cellules immunitaires." médecine/sciences 35, no. 12 (December 2019): 1072–82. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/2019242.
Full textAbstract:
Une connaissance approfondie de la biologie et de l’immunologie des tumeurs, mais aussi la conception de formats innovants d’anticorps et d’autres charpentes (ou scaffolds) protéiques ont permis de générer une véritable explosion de nouvelles molécules à visée thérapeutique au cours de ces 10 dernières années. Dans ce cadre, les anticorps bispécifiques (Abs) tiennent une place de choix. Ils permettent en effet, (1) d’apporter des propriétés biologiques et pharmacologiques nouvelles qui dépendent de l’engagement simultané des deux cibles, (2) d’améliorer le profil de sécurité par rapport à une combinaison d’anticorps en favorisant sa localisation tumorale en oncologie, et également (3) de combiner en une seule molécule les activités de deux anticorps conventionnels, réduisant ainsi les coûts de développement clinique et de fabrication. Cet article de revue a pour objectif d’analyser les différentes molécules bispécifiques décrites à ce jour dans le domaine de l’immuno-oncologie, et de présenter leurs différents formats et principales propriétés.
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Duclos, Vincent. "La voie de l’intérieur." Diversité urbaine 9, no. 2 (March 11, 2010): 51–71. http://dx.doi.org/10.7202/039387ar.
Full textAbstract:
Résumé Cet article fait suite à une recherche de terrain menée auprès de migrants indiens de Montréal et dont l’objectif était de cerner le sens associé à la détresse chez ceux-ci et de constater les différentes stratégies thérapeutiques utilisées en sa présence ou pour la prévenir. L’article se concentre principalement sur la prise en charge de la détresse, laquelle a pour trame de fond une certaine image de l’individu, de ses états d’esprit et de leur temporalité. Les migrants indiens percevant la détresse comme une rupture de l’équilibre intérieur, leurs actions thérapeutiques visent principalement le renforcement de l’intérieur en s’appuyant sur différentes pratiques telles que le yoga, la prière, l’alimentation et l’exercice. Le recours aux médicaments, quant à lui, se situe dans une relation d’extériorité sémantique avec la conception de l’individualité et de la détresse avancée par les répondants.
Dissertations / Theses on the topic "Conception de médicaments in silico"
1
Jacq, Nicolas. "Recherche de médicaments in silico sur grilles de calcul contre des maladies négligées et émergentes." Clermont-Ferrand 2, 2006. http://www.theses.fr/2006CLF21715.
Full textAbstract:
Les grilles de calcul sont une nouvelle Technologie de l'Information permettant la collecte et le partage de l'information, la mise en réseau d'experts et la mobilisation de ressources en routine ou en urgence. Elles ouvrent de nouvelles perspectives de réduction des coûts et d'accélération de la recherche in silico de médicaments contre les maladies négligées et émergentes. Dans ce contexte, la première partie de la thèse a porté sur la conception de services bio-informatique sur grille. Ils facilitent le déploiement et la mise à jour sur la grille RUGBI de logiciels et de bases de données. La seconde partie a vu le déploiement d'expériences de criblage virtuel à haut débit sur l'infrastructure de la grille EGEE. Les expériences ont démontré que les grilles collaboratives ont la capacité à mobiliser d'importantes ressources de calcul dans des buts bien définis pendant une periode de temps significative, et qu'elles produisent des résultats biologiques pertinents
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Montes, Matthieu. "Développement et applications de méthodes de drug-design et de criblage in silico." Paris 5, 2007. http://www.theses.fr/2007PA05P611.
Full textAbstract:
Les méthodes de criblage in silico basées sur la structure du récepteur sont utilisées pour faciliter la découverte de nouvelles molécules à visée thérapeutique. En utilisant différents outils de docking/scoring, nous avons optimisé un protocole de criblage hiérarchique développé au laboratoire. Ce nouveau protocole a été validé et optimisé pour différentes protéines aux propriétés structurales et physicochimiques très diverses puis appliqué sur deux cibles ayant un rôle déterminant dans différents cancers, la phosphatase à double spécificité CDC25 et le protéasome 20S. En utilisant des chimiothèques filtrées ADME-tox et préparées pour ces projets, nous avons identifié de nouvelles molécules actives sur ces cibles réputées difficiles. Ces inhibiteurs prometteurs ayant une activité in vitro de l’ordre du micromolaire, actifs sur cellules et possédant des squelettes novateurs et optimisables constitueront une base intéressante pour le développement de nouveaux médicaments à visée antiproliférativeVirtual ligand screening methods based on the structure of the receptor are extensively used to facilitate the discovery of lead compounds. Using different docking/scoring packages, we optimized a hierarchical virtual ligand screening protocol developed in our lab. This new protocol has been validated on different targets with different binding site properties. This multi-step hierarchical protocol has been applied to two targets of therapeutic importance, namely, the dual specificity phosphatase CDC25 and the 20S proteasome. Using ADME-tox filtered compound collections processed in our lab, we identified several new active molecules on these two difficult targets. These promising micromolar inhibitors displaying novel and growable scaffolds can lead to new potential drugs for cancer treatment
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Schalon, Claire. "Comparaison in silico de sites de liaison de protéines." Strasbourg 1, 2008. http://www.theses.fr/2008STR13091.
Full textAbstract:
Après la sélection de différents ensembles de protéines d'intérêt pharmacologique (banque sc-PDB) et l'identification de leur site de liaison, ces ensembles ont été utilisés pour valider et faire des criblages avec un programme d'alignement structural, SiteAlign. SiteAlign utilise une sphère discrétisée et des scores normalisés pour comparer deux sites de liaison. Un protocole de score puis les applications possibles du programme, ont été déterminés. SiteAlign peut être utilisé pour l'annotation fonctionnelle de protéines génomiques, pour la prédiction de réactivités croisées, et la prédiction de cibles pour des ligands (validation expérimentale des calculs). SiteAlign a ensuite été utilisé, dans le cadre de la chémogénomique, pour étudier en 3D les récepteurs couplés aux protéines G et proposer des ligands pour des récepteurs orphelins, ainsi que pour comparer l'espace structural des sites de la sc-PDBAfter the selection of different sets of proteins with a pharmacological interest (sc-PDB databank) and the identification of their binding sites, these sets have been used to validate and to do screenings with a structural alignment program, SiteAlign. SiteAlign use a discretized sphere and normalized scores to compare two binding sites. A scoring protocol, then the possible applications of the program have been determined. SiteAlign can be used for functional annotations of genomic proteins, for predictions of cross reactivity and predictions of ligands targets (experimental validation of this calculation). SiteAlign has then been used, in the chemogenomic part of the project, for studying in 3D the G-coupled protein receptors and for suggesting new ligands for orphan receptors. Last, SiteAlign has been used to compare the structural space of sc-PDB sites
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Checa, Ruano Luis. "Structure-based design of antiviral drugs against respiratory viruses using in silico approaches." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2024. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2024SORUS0743.pdf.
Full textAbstract:
Les interactions protéine-protéine (IPP) jouent un rôle crucial dans de nombreuses voies biologiques et sont de plus en plus explorées en tant que cibles thérapeutiques potentielles, notamment pour le traitement des maladies infectieuses. Cependant, la conception de petites molécules modulatrices pour les IPP reste un défi, car les interfaces des IPP n'ont pas évolué pour lier des petites molécules comme les cibles thérapeutiques conventionnelles telles que les enzymes ou les récepteurs membranaires. Par conséquent, la preuve de leur drugabilité doit être apportée au cas par cas. Dans ce contexte, les approches computationnelles peuvent être utiles pour aider à la conception de modulateurs IPP. Ce travail vise à développer de nouveaux protocoles de conception de médicaments in silico spécifiquement adaptés aux cibles IPP, dans le but de concevoir de nouveaux médicaments antiviraux contre deux cibles IPP : le virus respiratoire syncytial (VRS) et le SARS-CoV-2Protein-Protein interactions (PPI) play crucial roles in many biological pathways and are being increasingly explored as potential therapeutic targets, including for treating infectious diseases. However, designing small molecule modulators for PPI remains challenging as PPI interfaces have not evolved to bind small molecules like conventional drug targets such as enzymes or membrane receptors. Therefore, proof of their druggability must be made on a case-by-case basis. In this context, computational approaches can be useful in assisting the design of PPI modulators.This work aims to develop new in silico drug design protocols specifically tailored to PPI targets, with the goal of designing new antiviral drugs against two PPI targets: the respiratory syncytial virus (RSV) and the SARS-CoV-2
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Fourches, Denis. "Modèles multiples en QSAR/QSPR : Développement de nouvelles approches et leurs applications au design "in silico" de nouveaux extractants de métaux, aux propriétés ADMETox ainsi qu'à différentes activités biologiques de molécules organiques." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2007. http://www.theses.fr/2007STR13119.
Full textAbstract:
Cette thèse est consacrée à l’amélioration des performances des modèles structure-propriété QSAR, grâce au développement de modèles multiples, basées sur les descripteurs fragmentaux, et à leurs applications à différents domaines de la chimie (complexation et extraction de métaux, propriétés ADMETox, activités biologiques). Dans une première partie, les principales notions et méthodes de la chemoinformatique sont récapitulées. Dans une seconde partie, la plateforme de logiciels ISIDA (In Silico Design and Data Analysis) est présentée. Lors de cette thèse, deux approches à modèles multiples ont été développées : la stratégie « Diviser pour Conquérir » et l’approche Stepwise k-Nearest Neighbors. Dans une troisième partie, les méthodes d’ISIDA ont été appliquées avec succès à la modélisation de différentes propriétés chimiques et biologiques. Les tests expérimentaux d’extractants de métaux conçus grâce aux calculs ont confirmé les performances d’ISIDAThis thesis work concerns the improvement of prediction performances of QSAR structureproperty models, using consensus modelling strategies based on fragment descriptors, and also, to their applications for « in silico » design of metal binders, ADMETox properties and different biological activities of organic compounds. In the first part, some important concepts and methodologies of chemoinformatics are described. In the second part, the ensemble of programs ISIDA (In Silico Design and Data Analysis) is introduced. During this thesis work, two consensus approaches have been suggested: the « Divide and Conquer » strategy and the Stepwise k- Nearest Neighbors approach. Applications of new strategies lead to significant improvement of predictions accuracy, compared to the conventional models. In the third part, all ISIDA methods have been successfully applied to model various chemical and biological properties. Experimentally proven predictions demonstrate the robustness of the methods
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Villemagne, Baptiste. "Conception, synthèse et dévelopement d'inhibiteurs du répresseur transcriptionnel mycobactérien ETHR selon une approche par fragments. Une nouvelle approche dans la lutte contre la tuberculose." Thesis, Lille 2, 2012. http://www.theses.fr/2012LIL2S052/document.
Full textAbstract:
Avec plus d’un million et demi de morts chaque année, la tuberculose reste aujourd’hui la seconde cause de mortalité liée à un agent infectieux. De plus l’organisation mondiale de la santé (OMS) a estimé en 2011 qu’un tiers de la population mondiale était porteuse du bacille Mycobacterium tuberculosis responsable de la maladie. Depuis la fin des années 1980, une recrudescence du nombre de cas de tuberculose est observée à l’échelle mondiale. Cette recrudescence est due à la fois à l’apparition de souches résistantes, mais également à l’épidémie de VIH qui est un facteur de prédisposition au déclenchement de la maladie.En 2000, le répresseur transcriptionnel mycobactérien EthR a été identifié comme étant un régulateur clé dans la bioactivation de l’éthionamide (ETH), un antituberculeux utilisé pour le traitement de seconde intention. En 2009, l’inhibition de ce répresseur par le développement de molécules « drug-like » a permis de potentialiser l’activité de l’éthionamide d’un facteur 3 chez la souris infectée et a permis de valider cette cible pour une future approche thérapeutique.Ce travail repose sur la découverte et l’optimisation de nouveaux inhibiteurs de ce répresseur transcriptionnel mycobactérien, à partir d’une petite molécule appelée « fragment » qui a été cocristallisée avec la protéine. Par la combinaison d’un criblage in silico, d’un criblage in vitro des touches identifiées, de l’étude des structures radiocristallographiques des complexes ligands/protéines et de la chimie médicinale, le développement de trois approches complémentaires dites « fragmentgrowing », « fragment-merging » et « fragment-linking » a permis de développer des composés présentant de fortes activités. Ces résultats permettront très prochainement de sélectionner une nouvelle molécule issue de ce travail dans la perspective de nouveaux essais sur le modèle murinTuberculosis (TB) remains the leading cause of death due to a single infective agent with more than 1.5 million people killed each year. In 2011, the world health organization (WHO) estimated that one third of the world’s population is infected with Mycobacterium tuberculosis, the pathogen responsible for the disease. This phenomenon may be due to an explosive escalation of TB incidence that occurred in the 1980s due to the emergence of both resistant strains and HIV epidemic.In 2000, EthR, a mycobacterial transcriptional repressor, was identified as a key modulator of ethionamide (ETH) bioactivation. ETH is one of the main second-line drugs used to treat drug resistant strains. In 2009, it was shown that co-administration of ETH and drug-like inhibitors of EthR was able to boost ETH activity threefold in a mouse-model of TB-infection, thus validating the target for a new therapeutic strategy.This work deals with the discovery and optimisation of new EthR inhibitors, based on a small molecule, called a “fragment”, co-crystallized with the protein. We combined in silico screening, in vitro evaluation of the hit compounds, study of co-crystal structures and medicinal chemistry to develop three complementary approaches called “fragment growing”, “fragment merging” and “fragment linking” that led to the discovery of very potent inhibitors. Based on these results, we are currently selecting a potential candidate for new in vivo experiments
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Vallet, Thibault. "Conception d'un outil d'évaluation de l'acceptabilité des médicaments." Thesis, Paris, ENSAM, 2017. http://www.theses.fr/2017ENAM0048/document.
Full textAbstract:
Le développement d’un médicament est réalisé dans le but de répondre à des objectifs thérapeutiques tout en prévenant les risques pour les patients. L’observance, qui correspond au suivi rigoureux de la prescription du médecin, est une condition primordiale de la réussite du traitement. L'acceptabilité, qui peut être définie comme la capacité et la bonne volonté du patient à utiliser, et de son donneur de soins à administrer, le médicament tel que est prévu, joue un rôle crucial dans l’observance, notamment chez les individus les plus vulnérables. L’acceptabilité d'un médicament est déterminée par ses caractéristiques et celles des utilisateurs. De ce fait, le concepteur se doit de considérer les spécificités des utilisateurs cibles pour assurer l’adéquation d’un nouveau produit avec leurs besoins et leurs attentes. Intégrer l'évaluation de l’acceptabilité au développement pharmaceutique et clinique des médicaments apparaît alors d’une importance de premier ordre. A ce jour, il n’existe aucun outil validé et reconnu internationalement permettant d’évaluer ce concept multi-dimensionnel. Cette carence s’accompagne d’un manque de connaissances sur ce phénomène complexe. Ces travaux de thèse présente la conception d’un outil, le référentiel d’acceptabilité, qui permet, d’une part, d’évaluer de manière standardisée l’acceptabilité des médicaments, et d’autre part, d’extraire des connaissances utilisables dès les phases amonts du processus de conception de nouveaux produits. La démarche développée et appliquée dans le domaine des médicaments a été formalisée pour être utilisable dans d’autres univers d’étudeMedicine development must satisfy efficiency and safety objectives. Patient compliance with physician’s prescription is an essential condition to achieve these objectives. Patient acceptability of a medicine improves patient compliance and thus ensures drug success, in particular in paediatric and geriatric populations. Acceptability could be defined as the overall ability and willingness of the patient to use, and its care giver to administer, the medicine as intended. Acceptability is driven by the users’ and the products’ characteristics. Thus, designers have to consider the specific features of the targeted users to develop a medicine with the most adapted characteristics to reach the best acceptability. Evaluation of the acceptability should be an integral part of pharmaceutical and clinical development. Today, knowledge on this complex phenomenon is still fragmented and there are no internationally agreed methods available to assess this multidimensional concept. This document sets out the development of a validated tool, the acceptability reference framework, providing standardized medicines acceptability evaluation and relevant knowledge usable by designers from the early stage of medicine development. As this research was carried out in a medical field, we propose a formalized methodology transferable to other domains
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Vallet, Thibault. "Conception d'un outil d'évaluation de l'acceptabilité des médicaments." Electronic Thesis or Diss., Paris, ENSAM, 2017. http://www.theses.fr/2017ENAM0048.
Full textAbstract:
Le développement d’un médicament est réalisé dans le but de répondre à des objectifs thérapeutiques tout en prévenant les risques pour les patients. L’observance, qui correspond au suivi rigoureux de la prescription du médecin, est une condition primordiale de la réussite du traitement. L'acceptabilité, qui peut être définie comme la capacité et la bonne volonté du patient à utiliser, et de son donneur de soins à administrer, le médicament tel que est prévu, joue un rôle crucial dans l’observance, notamment chez les individus les plus vulnérables. L’acceptabilité d'un médicament est déterminée par ses caractéristiques et celles des utilisateurs. De ce fait, le concepteur se doit de considérer les spécificités des utilisateurs cibles pour assurer l’adéquation d’un nouveau produit avec leurs besoins et leurs attentes. Intégrer l'évaluation de l’acceptabilité au développement pharmaceutique et clinique des médicaments apparaît alors d’une importance de premier ordre. A ce jour, il n’existe aucun outil validé et reconnu internationalement permettant d’évaluer ce concept multi-dimensionnel. Cette carence s’accompagne d’un manque de connaissances sur ce phénomène complexe. Ces travaux de thèse présente la conception d’un outil, le référentiel d’acceptabilité, qui permet, d’une part, d’évaluer de manière standardisée l’acceptabilité des médicaments, et d’autre part, d’extraire des connaissances utilisables dès les phases amonts du processus de conception de nouveaux produits. La démarche développée et appliquée dans le domaine des médicaments a été formalisée pour être utilisable dans d’autres univers d’étudeMedicine development must satisfy efficiency and safety objectives. Patient compliance with physician’s prescription is an essential condition to achieve these objectives. Patient acceptability of a medicine improves patient compliance and thus ensures drug success, in particular in paediatric and geriatric populations. Acceptability could be defined as the overall ability and willingness of the patient to use, and its care giver to administer, the medicine as intended. Acceptability is driven by the users’ and the products’ characteristics. Thus, designers have to consider the specific features of the targeted users to develop a medicine with the most adapted characteristics to reach the best acceptability. Evaluation of the acceptability should be an integral part of pharmaceutical and clinical development. Today, knowledge on this complex phenomenon is still fragmented and there are no internationally agreed methods available to assess this multidimensional concept. This document sets out the development of a validated tool, the acceptability reference framework, providing standardized medicines acceptability evaluation and relevant knowledge usable by designers from the early stage of medicine development. As this research was carried out in a medical field, we propose a formalized methodology transferable to other domains
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Baccouche, Rym. "Conception de ligands protéiques artificiels par ingénierie moléculaire in silico." Phd thesis, Université René Descartes - Paris V, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00807525.
Full textAbstract:
Les travaux réalisés portent sur la conception de ligands protéiques capables de cibler le site catalytique des métalloprotéases matricielles (MMPs) grâce à une méthode d'ingénierie développée au laboratoire qui repose sur le greffage de motifs fonctionnels. Le motif fonctionnel choisi correspond aux 4 résidus N-terminaux du TIMP-2, un inhibiteur naturel des MMPs. Des plates-formes protéiques possédant des motifs d'acides aminés dans une topologie similaire à celle du motif de référence dans le complexe TIMP-2/MMP-14 ont été identifiées par criblage systématique de la PDB à l'aide du logiciel STAMPS (Search for Three-dimensional Atom Motif in Protein Structure). Dix candidats ligands satisfaisant les contraintes topologiques, stériques et de similarité électrostatique avec le ligand naturel TIMP-2 ont été sélectionnés. Ces ligands ont été produits par synthèse chimique ou par voie recombinante puis leur capacité à inhiber une série de 6 MMPs a été évaluée. Les résultats indiquent que tous les ligands protéiques conçus in silico sont capables de lier les sites catalytiques des MMPs avec des constantes d'association allant de 450 nM à 590 mM, sans optimisation supplémentaire. La caractérisation structurale par diffraction X de 2 variants d'un de ces ligands protéiques a permis de montrer que les interactions établies par le motif 1-4 dans ces ligands étaient similaires à celles observées dans le complexe TIMP-2/MMP-14, avec cependant des différences dans la géométrie de certaines d'entre elles. Des études de simulation par dynamique moléculaire ont également permis de mettre en évidence de possibles différences dans la géométrie et la stabilité de certaines des interactions reproduites dans les 10 plates-formes, pouvant contribuer aux affinités modestes observées pour ces ligands. Cependant, les résultats obtenus montrent que la méthode de conception in silico utilisée est capable de fournir une série de ligands protéiques de 1ère génération ciblant de manière spécifique un site catalytique d'intérêt avec un bon rendement. Cette méthode pourrait constituer la 1ère étape d'une approche hybride de conception in silico de ligands combinée à des techniques de sélection expérimentales.
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Asses, Yasmine. "Conception par modélisation et criblage in silico d'inhibiteurs du récepteur c-Met." Phd thesis, Université Henri Poincaré - Nancy I, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00653609.
Full textAbstract:
L'enjeu des travaux effectués au cours de cette thèse est l'extraction in silico de molécules potentiellement intéressantes dans le processus d'inhibition du récepteur tyrosine kinase c-Met. La faculté de cette protéine à interagir dans les phénomènes d'embryogenèse et de réparation tissulaires rendent son inhibition cruciale dans les traitements contre les développements tumoraux où c-Met se trouve impliquée. Dans ce but, la stratégie que nous avons employée implique l'utilisation de plusieurs méthodes in silico de conception rationnelle de médicaments. Nous avons utilisé comme support les multiples structures cristallographiques publiées sur la ProteinData Base (PDB). Un travail de modélisation par homologie fut tout d'abord nécessaire pour combler les lacunes des structures cristallographiques collectées. Afin d'échantillonner au mieux l'espace conformationnel du récepteur kinase c-Met et de caractériser sa flexibilité, une longue campagne de simulation de Dynamique Moléculaire (DM) fut menée concernant les formes apo et holo des structures cristallographiques disponibles. Pour compléter ces simulations, une partie du travail consista à utiliser également la méthode des modes normaux de vibration (NM). De ces 2 approches (DM et NM), nous avons extrait un ensemble de 10 conformères considérés comme les plus représentatifs de l'espace conformationnel simulé pour la kinase c-Met et avons proposé un mode de fonctionnement de ce récepteur. Utilisant les conformations extraites de l'échantillonnage conformationnel, nous avons ensuite mené une importante campagne de criblage virtuel sur plusieurs chimiothèques constituant au total environ 70.000 composés. L'analyse des résultats de l'arrimage moléculaire nous a conduits à la sélection de plusieurs molécules intéressantes possédant théoriquement une bonne affinité pour la kinase c-Met. Ces molécules ont été soumises aux tests expérimentaux effectués par l'équipe de biologistes associée à nos travaux.
Books on the topic "Conception de médicaments in silico"
1
Darryl, León, and Markel Scott, eds. In silico technologies in drug target identification and validation. Boca Raton: CRC Press, 2006.
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2
1947-, Reid Ronald E., ed. Peptide and protein drug analysis. New York: M. Dekker, 2000.
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3
Sterility, sterilisation and sterility assurance for pharmaceuticals: Technology, validation and current regulations. Oxford: Woodhead Publishing Limited, 2013.
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5
V, Lees Graham, ed. Drug discovery: From bedside to Wall Street. Amsterdam: Elsevier Academic, 2006.
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7
de, Waterbeemd Han van, ed. Chemometric methods in molecular design. Weinheim: VCH, 1995.
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10
W, Ellis Ronald, and Brodeur Bernard R, eds. New bacterial vaccines. Georgetown, Tex: Landes Bioscience/Eurekah.com, 2003.
Find full textBook chapters on the topic "Conception de médicaments in silico"
1
Balansard, Guy. "Conception of an antimalaria medicinal product from plants used in traditional medicine." In Des sources du savoir aux médicaments du futur, 243–44. IRD Éditions, 2002. http://dx.doi.org/10.4000/books.irdeditions.7234.
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2
Balansard, Guy. "Conception d’un médicament antimalarique à base de plantes issues de la médecine traditionnelle." In Des sources du savoir aux médicaments du futur, 241–42. IRD Éditions, 2002. http://dx.doi.org/10.4000/books.irdeditions.7233.
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