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Dissertations / Theses on the topic 'Conformation cis'

Author: Grafiati

Published: 4 June 2021

Last updated: 3 February 2022

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1

Voss, Emelyne. "Synthèse d’Analogues Bis-azotés de la Proline et Applications." Thesis, Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 2011. http://www.theses.fr/2011INPL059N/document.

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Abstract:

La liaison peptidique au sein d’un peptide ou d’une protéine est d’ordinaire plane et en conformation trans pour la majorité des acides aminés. La situation est un peu différente en amont d’une proline : la barrière thermodynamique qui s’oppose à la rotation de la liaison amide est plus faible et la tendance de la liaison à rester plane est un peu moins grande. Cette liaison AA-Pro peut donc adopter une conformation cis, entraînant la formation d’un coude prononcé dans une chaîne peptidique à son niveau. Ce travail décrit la synthèse et la réactivité chimique de nouveaux analogues bis-azotés d

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2

Mendez, Vanesa. "Measurments of Carotenoid Levels in Human Serum and a Catalog of the Lutein Conformation Populations from Semi-empirical Calculations." FIU Digital Commons, 2011. http://digitalcommons.fiu.edu/etd/523.

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Abstract:

Lutein is a principal constituent of the human macular pigment. This study is composed of two projects. The first studies the conformational geometries of lutein and its potential adaptability in biological systems. The second is a study of the response of human subjects to lutein supplements. Using semi-empirical parametric method 3 (PM3) and density functional theory with the B3LYP/6-31G* basis set, the relative energies of s-cis conformers of lutein were determined. All 512 s-cis conformers were calculated with PM3. A smaller, representative group was also studied using density functional t

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3

Mazeau, Karim. "Modelisation des conformations de l'adn : application au cas d'un adduit intrabrin cis-(pt(nh3)2(d(pgpcpg)))." Orléans, 1988. http://www.theses.fr/1988ORLE2030.

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4

Haugskott, Frida. "Investigating Minor States of the Oncoprotein N-MYC, with Focus on Proline Cis/Trans Isomerisation using NMR Spectroscopy." Thesis, Linköpings universitet, Institutionen för fysik, kemi och biologi, 2021. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-177936.

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Abstract:

MYC is a family of three regulator genes that codes for transcription factors. Expression of Myc proteins from MYC genes is found to be deregulated in 70 % of all cancer forms. The three human homologs C-Myc, N-Myc and L-Myc are mainly associated with cancer in the lymphatic system, nerve tissues and lung cancer, respectively. Even though N-Myc is associated with Neuroblastoma, the cancer variant that is most common among children, the field is focused towards C-Myc. The activation of C-Myc begins with phosphorylation of Serine 62, followed by trans-to-cis isomerisation of Proline 63. Then Thr

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5

Zervos, Michel. "Réactivité des aminonitriles vis à vis des cyclénones et comparaison avec celle des éthers de cyanhydrines : stéréochimie et conformation des cyclanones 2,3 disubstituées." Paris 11, 1986. http://www.theses.fr/1986PA112007.

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Abstract:

Cette thèse décrit l'addition conjuguée des dérivés lithiés équivalents d'acyle tels que les éthers de cyanhydrines et les aminonitriles aux α-cyclénones diversement substituées suivie de la protonation des énolates formés. L'action des équivalents de benzoyle sur les α-cyclénones α-substituées conduit aux adduits 1,4 de stéréochimie cis. D'autre part, contrairement aux éthers de cyanhydrines, les aminonitriles ne réagissent pas avec des α-cyclénones β-substituées. Par contre, en présence d'acides de Lewis leur réactivité vis à vis d'αénones encombrées est largement augmentée. Le piégeage des

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6

Wang, Xiaodong. "Design, Syntheses, and Bioactivities of Conformationally Locked Pin1 Ground State Inhibitors." Diss., Virginia Tech, 2005. http://hdl.handle.net/10919/26625.

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Abstract:

Pin1 (protein interacting with NIMA 1) is a peptidyl-prolyl isomerase involved in mitosis. As a potential anti-cancer drug target, Pin1 interacts and regulates the activity of an increasing number of cell cycle enzymes by an unknown mechanism. These cell cycle enzymes include Cdc25, Cdc27, Cyclin D1, Myt1, Wee1, NIMA, Cdc2, Plk1 and c-Myc. Recent research has revealed that Pin1 is overexpressed in a variety of cancer cell lines and Pin1 inhibitors inhibit proliferation activity of several cancer cells overexpressing Pin1. The most potent Pin1 inhibitors identified so far are in the micromolar

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7

Zhao, Song. "Part 1 Design, Synthesis and Bioactivity of a Phosphorylated Prodrug for the Inhibition of Pin1; Part 2 Conformational Specificity of Cdc25c Substrate for Cdc2 Kinase using LC-MS/MS." Diss., Virginia Tech, 2007. http://hdl.handle.net/10919/25989.

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Abstract:

The phosphorylation-dependent PPIase (peptidyl prolyl isomerase), Pin1 (Protein interacting with NIMA#1), has been found to regulate cell cycle through a simple conformational change, the cis-trans isomerization of phospho-Ser/Thr-Pro amide bonds. A variety of key cell cycle regulatory phosphoproteins, including Cdc25 phosphatase,Cdc27, p53 oncogene, c-Myc oncogene, Wee1 kinase, Myt1 kinase, and NIMA kinas, have been confirmed as substrates of Pin1. Pin1 was also observed to be overexpressed in a variety of cancer cell lines, and the inhibitors of Pin1 showed antiproliferative activities towar

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8

Nardi, Frederico. "Etudes par dynamique moléculaire et spectroscopie RMN de la structure locale des petits peptides en solution aqueuse mettant en jeu des résidus aromatiques." Université Joseph Fourier (Grenoble), 1999. http://www.theses.fr/1999GRE10089.

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Abstract:

Meme si habituellement les petits peptides ne possedent pas d'arrangement en solution aqueuse, certaines sequences leurs conferent une structure locale. A partir de l'analyse des deplacements chimiques mesures par spectroscopie rmn, kemmink et creighton j mol biol (1993) 234 861 detecterent dans de petits peptides en solution aqueuse extraits de la sequence du bpti la formation de structures locales mettant en jeu les residus aromatiques. Dans le peptide gly-ala-pro-tyr(i)-thr-gly-ala en solution aqueuse kemmink and creighton j mol biol (1995) 245 251 la tyrosine interagit avec le proton amide

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9

Stoven, Véronique. "Nouvelles techniques pour la reconstruction par RMN de la structure tridimensionnelle de molécules en solution." Paris 11, 1989. http://www.theses.fr/1989PA112190.

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Abstract:

De nouvelles techniques de traitement des spectres de Résonance Magnétique Nucléaire à deux dimensions (RMN-2D) sont présentées, en vue d’aider à la reconstitution de la structure tridimensionnelle des molécules. L’expérience de NOESY-2D étant l’expérience clef dans la détermination des conformations, les problèmes posés par l’interprétation quantitative de l’Effet Nucléaire Overhauser (NOE), sont présentées en détail. Une méthode est proposée pour la détection et l’intégration automatique des pics dans les cartes de RMN-2D. Elle est utilisée dans la détermination de distances internucléaires

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10

Mazeau, Karim. "Modélisation des conformations de l'ADN application au cas d'un adduit intrabrin cis-[Pt(Nh) {d(pGpCpG}] /." Grenoble 2 : ANRT, 1988. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37616127b.

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Zhang, Jiuchun. "Cis-acting elements and a conformational switch involved in replication of a positive-strand RNA virus." College Park, Md. : University of Maryland, 2006. http://hdl.handle.net/1903/3541.

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Abstract:

Thesis (PhD) -- University of Maryland, College Park, 2006.<br>Thesis research directed by: Cell Biology & Molecular Genetics. Title from t.p. of PDF. Includes bibliographical references. Published by UMI Dissertation Services, Ann Arbor, Mich. Also available in paper.

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12

Unnikrishnan, Aparna. "INVESTIGATION OF PROTEIN STRUCTURE AND DYNAMICS BY NMR SPECTROSCOPY." The Ohio State University, 2020. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=osu1595418229203869.

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Bekkouch, Kamal. "Etudes structurale et conformationnelle de phénylphénols : contribution à l'étude du polymorphisme dans le cas du ditertiobutyl-2,6 phényl-4 phénol." Lyon 1, 1988. http://www.theses.fr/1988LYO10085.

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Abstract:

Determination de la structure et de la conformation de quatre phenylphenols. Des liaisons hydrogene existent lorsqu'il n'y a pas de substituants en position ortho du groupe ph. Etude des conformations par mecanique moleculaire (programme mmp2) et comparaison des conformations a l'etat libre et dans les cristaux. Etude du polymorphisme du di-t-butyl-2,6 phenyl-4 phenol et proposition d'une explication theorique pour le passage entre les formes monoclinique et orthorhombique

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Carrière, Pascal. "Conformation de PMMA stéréoréguliers et de mélanges PMMA-oligomères à l'interface silice-solvant : conséquences sur la rhéologie de ces dispersions." Mulhouse, 2000. http://www.theses.fr/2000MULH0632.

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Abstract:

Le but est de faire varier la conformation du polymère à composition chimique constante (PMMA) à l'aide de sa tacticité, du solvant et des oligomères additionnés au PMMA. Il est apparu original de relier les paramètres conformationnels en solution influençant la conformation du polymère à l'interface et les propriétés rhéologiques de dispersions stabilisées par ces polymères. L'étude de la conformation du PMMA s'étend de la conformation locale (enchaînement trans-gauche) à la conformation globale du PMMA. Des différences de conformation du PMMA suivant sa tacticité existent reposant sur une st

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Negrelli, Mariana. "ANÁLISE CONFORMACIONAL DO CIS E TRANS 2-HIDROXICICLOEXANOCARBOXILATO DE ETILA." UNIVERSIDADE ESTADUAL DE PONTA GROSSA, 2011. http://tede2.uepg.br/jspui/handle/prefix/2090.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2017-07-24T19:38:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mariana Negrelli.pdf: 2632259 bytes, checksum: 8ffb18e87e90aff84b82a1268dc4596f (MD5) Previous issue date: 2011-02-25<br>Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior<br>This work describes the conformational analysis of cis/trans ethyl-2 hydroxycyclohexanecarboxylate. For this, were analyzed data obtained by ab initio theoretical calculations, the nuclear magnetic resonance spectroscopy (coupling constants 3JHH) and infrared (carbonyl stretch). Were performed calculations for the isolated molecule and

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Hattabou, Anas. "Pilotage de la performance globale entre logique de conformation et logique d'innovation : une approche par les systèmes ago-antagonistes : cas de deux entreprises pionnières au Maroc." Thesis, Bordeaux 4, 2011. http://www.theses.fr/2011BOR40050/document.

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Abstract:

Cette thèse s’intéresse à la dynamique actuelle du développement durable dans l’entreprise et la prise en compte de la responsabilité sociale dans les processus stratégiques. En particulier, elle vise à caractériser les logiques de conception des systèmes de pilotage de la performance globale au sein d’entreprises pionnières au Maroc et la manière dont ces dernières cherchent à articuler exigence de conformation et logique d’innovation en matière de développement durable. La première partie de cette thèse est consacrée à l’élaboration du cadre conceptuel de la recherche, abordant les fondement

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Diemer, Vincent. "Synthèse de phénolates de pyridinium, composés modèles pour l’optique non linéaire quadratique: étude de la relation entre la conformation de ces chromophores et leurs propriétés optiques et physico-chimiques." Mulhouse, 2007. http://www.theses.fr/2007MULH0893.

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Abstract:

Les biaryles de type phénolates de pyridinium constituent, à cause de leur caractère zwitterionique, des composés modèles pour l’optique non linéaire quadratique (ONL). Des simulations numériques ont mis en évidence que les propriétés ONL de ces chromophores dépendent de l’angle de torsion existant entre les deux cycles aromatiques. Afin de vérifier expérimentalement cette relation structure/activité, des phénolates de pyridinium substitués en positions ortho de la liaison intercycle ont été préparés, l’étape clé de ces synthèses étant un couplage de Suzuki. Plus les groupements alkyle introdu

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Chab-Majdalani, Ingrid. "Experimental and theoretical studies on the conformational properties of cis- and trans-4,5-methano-L-prolines." Thèse, 2016. http://hdl.handle.net/1866/19072.

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Abstract:

Il est connu que les 4,5-méthano-L-prolines ont des conformations et des caractéristiques différentes que la L-proline. L’aplatissement du cycle pyrrolidine dans la proline joue un rôle important dans sa stabilité et la conformation spatiale des analogues 4,5-méthano- de la L-proline. Ainsi, des études approfondies ont été menées pour analyser les différences de structure et les modèles de pliage des cis- et trans-4,5-méthano-L-prolines et leurs oligomères en corrélation avec la délocalisation électronique n→π∗ entre les carbonyles adjacents. Dans cette thèse, la stabilisation n→π∗ entre les g

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Nagarajaram, H. A. "Conformational Studies On Cyclic Pentapeptides And Structural Features In Globular Proteins." Thesis, 1995. http://etd.iisc.ernet.in/handle/2005/1648.

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Velazquez, Hector. "Molecular Dynamics Simulations Towards The Understanding of the Cis-Trans Isomerization of Proline As A Conformational Switch For The Regulation of Biological Processes." 2014. http://scholarworks.gsu.edu/chemistry_diss/89.

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Abstract:

Pin1 is an enzyme central to cell signaling pathways because it catalyzes the cis–trans isomerization of the peptide ω-bond in phosphorylated serine/threonine-proline motifs in many proteins. This regulatory function makes Pin1 a drug target in the treatment of various diseases. The effects of phosphorylation on Pin1 substrates and the basis for Pin1 recognition are not well understood. The conformational consequences of phosphorylation on Pin1 substrate analogues and the mechanism of recognition by the catalytic domain of Pin1 were determined using molecular dynamics simulations. Phosphorylat

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De, Pol Silvia [Verfasser]. "Synthesis, conformational investigations and applications of α-peptides [alpha-peptides] containing cis-β-aminocyclopropane [cis-beta-aminocyclopropane] dicarboxylic acids / vorgelegt von Silvia De Pol". 2007. http://d-nb.info/983860238/34.

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Teklebrhan, Robel Berhe. "Conformational preferences and structural characterization of prolyl cis/trans isomerization of carbohydrate-templated proline mimetics of some model peptides using computational methods." 2009. http://hdl.handle.net/1993/21590.

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Reddy, N. Damodara. "Design And Access To Disallowed And Unusual Conformers Of Peptides In Crystals And In Solution : Structural Consequences Of The Imidate And Thioimidate Isosteres For The Peptide Bond." Thesis, 2012. http://hdl.handle.net/2005/2511.

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Abstract:

This thesis entitled “Design and Access to Disallowed and Unusual Conformers of Peptides in Crystals and in Solution: Structural Consequences of the Imidate and Thioimidate Isosteres for the Peptide bond” is divided into eight chapters. Imidate Modification The range of disallowed dihedral angles for residues in peptides is governed by their local steric and electrostatic clashes. Rare tolerances of violations in these angles are attributed to distortions in both local and global bond characteristics of the peptides. Discerning the origins of such disallowed angles and the consequent disto

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Hangen, Hanne. "Expression von Peptidyl-prolyl cis/trans isomerase NIMA-interacting 1 (PIN1) in Blasten von Patienten mit akuter myeloischer Leukämie." Doctoral thesis, 2011. http://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-B1FB-C.

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Peng, Bo-Chun, and 彭柏淳. "I. Syntheses, Self-assembly and Thermodynamics of Cis-Trans Isomerization of Azobenzene Bridged Biscalix[4]arenes with 1,2-Alternate and Partial Cone Conformations. II. Synthesis of Chiral Azocalix[4]arene and Its Chiral Recognition of Amino Alcohols." Thesis, 2019. http://ndltd.ncl.edu.tw/handle/t9m83j.

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Abstract:

碩士<br>國立交通大學<br>應用化學系碩博士班<br>108<br>In the first part, we have synthesized calix[4]arene conformational isomers using metal template effect and azobenzene to bridge the calix[4]arenes by 1,3-dipolar cycloaddition and click chemistry. The gelation properties were tested to are whether different conformational isomers will have better packing ability or not. According to the results, compound (+/-)26, 27 and 30 could not form gel in any solvent. We also studied the thermally induced cis-trans isomerization of compounds (+/-)26, 27 and 30, and found that their activation energies were around 21.0

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