Academic literature on the topic 'Conifères – Croissance – Aspect moléculaire'

Tout au long de leur co-évolution, les plantes et les microorganismes pathogènes ont développé des relations complexes résultant d'un échange constant d'informations moléculaires. Les agents pathogènes ont élaboré toute une gamme de stratégies offensives pour parasiter les plantes et en contrepartie, les plantes ont déployé un arsenal défensif similaire à bien des égards aux défenses immunitaires animales. Les percées récentes en biologie moléculaire et en transformation des végétaux ont démontré que sensibiliser une plante à répondre plus rapidement à l'infection pouvait lui conférer une protection accrue contre des microorganismes virulents. Un aspect important dans la mise en évidence du rôle joué par les molécules de défense au niveau de l'expression de la résistance est une connaissance exacte de leur localisation spatio-temporelle dans les tissus en état de stress. Afin de cerner le processus associé à l'induction de résistance chez les plantes, l'effet d'éliciteurs biologiques, microbiens et chimiques sur la réponse cellulaire des plantes envers une attaque pathogène a fait l'objet d'investigations et les mécanismes impliqués dans le phénomène ont été étudiés. Dans tous les cas, il a été montré qu'une corrélation existait entre la réponse globale de la plante et des changements dans la biochimie et la physiologie des cellules, lesquels étaient accompagnés de modifications structurales incluant la formation d'appositions pariétales riches en callose et l'infiltration de composés phénoliques aux sites de pénétration potentielle par l'agent pathogène. L'activation du sentier des phénylpropanoïdes est un phénomème crucial dans la restriction de la croissance de l'agent pathogène et dans la survie des cellules-hôtes en conditions de stress. Bien qu'il n'existe que peu d'exemples d'application pratique de la résistance induite en tant que méthode de lutte contre les maladies des plantes, les résultats obtenus à partir de quelques expériences menées en plein champ et en serre sont encourageants et indiquent que cette approche a le potentiel de devenir une stratégie de lutte efficace et durable contre toute une gamme d'agents pathogènes.

Cette thèse porte sur l'étude expérimentale de l'interaction entre des ions lents de basses énergies (de l'ordre du keV) et des molécules isolées ou des agrégats d'hydrocarbures aromatiques polycycliques neutres en phase gazeuse. L'utilisation de rayonnement ionisant sur ces systèmes moléculaires complexes a permis de mettre en évidence des processus de fragmentation statistique (redistribution de l’énergie à travers l’ensemble des degrés de liberté de la molécule cible) et non-statistique (collision binaire). Il a également été observé un mécanisme de croissance moléculaire lié à la formation de fragments à l’intérieur des agrégats à une échelle de temps très courte (< ps) à la suite de collisions binaires. La présence d’un environnement moléculaire autour des fragments créés lors de l’interaction permet d’initier un processus de réactivité entre les fragments et les molécules constituant l’agrégat. Plus particulièrement, l’étude se concentre sur l’importance du pouvoir d’arrêt électronique SE et nucléaire SN des ions projectiles. Lorsque SN est grand devant SN, la croissance moléculaire devient plus importante.

La lignée alloplasmique de tabac Nta (rep)S représente le matériel d'étude. Elle est caractérisée par un phénotype mâle-stérile et par un défaut de développement des organes reproducteurs mâles. Ces derniers sont féminisés et certains d'entre eux fusionnent avec l'organe reproducteur femelle indiquant une perturbation de la frontière entre les verticilles 3 et 4 correspondant aux organes reproducteurs mâles et femelles, respectivement. Des analyses cytologiques ont révélé que les anomalies florales observées chez la lignée Nta (rep)S étaient dues à un défaut de fonctionnement du méristème floral. Afin de vérifier que le défaut cadastral était dû à une dérégulation du gène NtSUP, homologue de SUPERMAN (SUP) d'Arabidopsis, nous avons tenté de complémenter ce défaut par l'expression ectopique du gène SUP d'Arabidopsis. La surexpression de SUP chez la lignée Nta (rep)S a permis de restaurer (i) la frontière entre les verticilles 3 et 4, (ii) le développement des étamines et (iii) la fertilité mâle. En outre, l'analyse de la surexpression de SUP chez une plante mâle-fertile a permis de préciser les fonctions du gène SUP d'Arabidopsis : il exerce un contrôle négatif sur la prolifération, l'expansion et la différenciation cellulaire. La stérilité-mâle chez cette lignée alloplasmique étant transmise par voie maternelle, l'origine de la dérégulation de NtSUP par un mécanisme d'hyperméthylation a été démontrée. En utilisant comme sonde un fragment d'ADN génomique correspondant au gène NtSUP, nous avons montré que ce gène est sous-exprimé consécutivement à une hyperméthylation de sa séquence chez la lignée Nta(rep)S. Parrallmèlement et pour confirmer ces observations, l'analyse de l'effet d'un traitement hypométhylant de l'ADN chez la lignée alloplasmique Nta (rep)S a permis de montrer que la déméthylation conduit à une réactivation du gène NtSUP et à une restauration partielle du phénotype floral
The alloplasmic tobacco line (Nta(rep) combines the nucleus of Nicotiana tabacum with the cytoplasm of Nicotiana repanda. This line exhibits a male-sterile phenotype and a defect in male reproductive organ (stamens) development. The stamens are feminised and some of them are fused to the female reproductive organ (carpel) indicating a perturbation of the boundary between whorls 3 and 4 corresponding to the stamens and the carpel, respectively. Cytological analyses showed that floral anomalies in the Nta(rep)S line are due to an impairment of the floral meristem. To verify that the cadastral-type anomalies are linked to a misregulation of the NtSUP gene, homolog to the Arabidopsis SUPERMAN (SUP) we have tried to complement this defect by ectopic expression of Arabidopsis SUPERMAN gene. SUP over-expression in the fertile line led us to precise the SUP functions. SUP controls negatively cell proliferation but also cell expansion and differentiation. In the Nta(rep)S line, SUP over-expression had restored (i) the boundary between whorls 3 and 4 (ii) stamen development and (iii) the male fertility. As the male sterility is maternally inherited, a NtSUP misregulation by methylation process appeared to be an interesting way to investigate. A fragment of the NtSUP gene has been cloned and used as a probe to show that this gene is down-regulated by methylation in the Nta(rep)S line. To confirm these results, we analysed the effect of a hypomethylating treatment in the Nta(rep)S line. This treatment had for consequence a reactivation of the NtSUP expression and a partial restoration of the floral phenotype

La levure Saccharomyces cerevisiae est le premier organisme eucaryote dont le génome a été entièrement séquencé. L'analyse de sa séquence génomique a permis de détecter 6293 ORF qui doivent correspondre aux gènes permettant la vie autonome de la levure. 70 % de ces ORF correspondent à des gènes potentiels nouveaux. L'analyse fonctionnelle de l'ORF YBR260c a été entreprise. Elle a montré que cet ORF correspondait à un gène de S. Cerevisiae, qui a été nommé RGD1 pour Related GAP Domain 1. La protéine Rgd1 agit in vitro comme une GTPase Activating Protein (GAP) des petites protéines G Rho3 et Rho4 de la levure. Un crible génétique a permis de mettre en évidence une interaction létale synthétique entre les gènes RGD1 et VRP1 code pour la verproline, homologue de la protéine humaine WIP. La verproline interagit physiquement avec l'actine et les myosines de classe I, et elle est impliquée dans la croissance polarisée de la cellule. La caractérisation de l'interaction génique entre RGD1 et VRP1 a révélé l'implication des protéines Rho3 et Rho4, deux membres de la superfamille Ras. Les résultats obtenus à l'aide de formes mutantes de Rho3p et Rho4p sont en faveur d'une activité GAP de Rgd1p sur ces deux protéines in vivo. Les tests génétiques et fonctionnels qui ont été ensuite menés ont permis de mettre à jour les relations existant au sein de la cellule entre VRP1, RGD1, RHO3 ou RHO4 et des gènes liés au cytosquelette d'actine, en particulier avec l'homologue levure du gène WASP humain, LAS17. L'ensemble de ces résultats nous a permis de proposer un modèle biologique. Un complexe protéique, comprenant entre autre Vrp1p, travaillerait de concert avec une voie de signalisation cellulaire définie par les protéines Rho3 et Rho4 pour permettre la croissance polarisée de la cellule, Rgd1p, via son action GAP, agirait dans ce système comme un régulateur négtif de la voie Rho3/Rho4
The yeast Saccharomyces cerevisiae is the first eucaryote whose genome was fully sequenced. The analysis of its genomic sequence has led to the discovery of 6293 ORF, which might correspond to genes allowing yeast autonomous life. 70 % of these ORF correspond to potential new genes. The functional analysis of the ORF YBR260c was initiated. It showed that this ORF corresponded to a S. Cerevisiae gene, which was named RGD1 for Related GAP Domain. The Rgd1 protein acts in vitro as a GTPase Activating Protein (GAP) for the yeast Rho3 and Rho4 small G proteins. Using a genetic screen, a synthetic lethal interaction between RGD1 and VRO1 genes was discovered. The VRP1 gene encodes a protein named verproline, which is homologous to human WIP protein. The verproline is an actin and myosins interacting protein involved in polarized growth. Characterization of RGD1-VRP1 genetic interaction revealed the implication of the Rho3 and Rho4 proteins, two members of the Ras superfamily. The results obtained using mutant forms of Rho3p and Rho4p are in favour of Rho3p and Rho4p being the targets of Rgd1p RhoGAP activity in vivo. Genetic and functional analyses made it possible to enlighten cellular relationships between VRP1, RGD1, RHO3 or RHO4 and cytoskeleton-linked genes, in particular the yeast counterpart of human WASP gene, LAS17. These results allow us to present a biological model. A proteic complex, including Vr1p, would act in concert with a signalling pathway defined by the Rho3 and Rho4 proteins to participate in polarized cell growth. Rgd1p, via its GAP activity, would act as a negative regulator of the Rho3/Rho4 pathway