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Dissertations / Theses on the topic 'Contrôle de l'expression'
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Studniarek, Cécilia. "Contrôle de l'expression génique par la RNP 7SK." Thesis, Toulouse 3, 2019. http://www.theses.fr/2019TOU30318.
Full textAbstract:
Le facteur positif de l'élongation P-TEFb stimule l'élongation de la transcription par l'ARN Polymérase II (ARN Pol II) en phosphorylant les facteurs négatifs de l'élongation et le domaine carboxy-terminal (CTD) de l'ARN Pol II. L'activité nucléaire de P-TEFb est contrôlée par la particule ribonucléoprotéique (RNP) 7SK, composée du petit ARN nucléaire 7SK et des protéines Larp7 et MePCE. Avec l'aide d'un dimère de protéines HEXIM1/2, la RNP 7SK séquestre de manière dynamique et réversible une fraction de P-TEFb dans la RNP 7SK/P-TEFb catalytiquement inactive. En dehors de la RNP 7SK, P-TEFb s'associe avec différents facteurs de transcription et cofacteurs avec lesquels il forme des complexes actifs recrutés sur les gènes pour activer leur expression. De nombreux stimuli et stress cellulaires affectant la croissance cellulaire, dont les dommages à l'ADN causés par les UV, induisent la dissociation rapide de la RNP 7SK/P-TEFb, libérant ainsi une fraction conséquente de P-TEFb actif. En plus de son rôle de réservoir nucléaire de P-TEFb, la RNP 7SK/P-TEFb occupe également les régions promotrices de certains gènes pour permettre une libération ciblée de la forme active de P-TEFb et ainsi stimuler la transcription de gènes spécifiques. En utilisant des lignées cellulaires dans lesquelles l'expression de l'ARN 7SK est abolie (cellules KO-7SK), nous avons évalué les conséquences fonctionnelles de la perte de l'ARN 7SK sur la transcription par l'ARN Pol II avant et après induction de dommages à l'ADN par les UV. L'analyse de la transcription naissante par Mammalian Native Elongating Transcript-sequencing (mNET-seq) a révélé que la perte de l'ARN 7SK a peu d'impact sur la transcription par l'ARN Pol II en conditions normales. Cependant, en réponse aux UV, l'activation transcriptionnelle de gènes clé de la réponse aux dommages à l'ADN est compromise dans les cellules KO-7SK alors qu'ils sont rapidement induits dans les cellules contrôles. Etant donné que les niveaux d'activité de P-TEFb dans les lignées contrôle et KO-7SK sont comparables, ces données indiquent que l'activation correcte de ces gènes après irradiation repose sur la fraction de P-TEFb séquestrée au sein de la RNP 7SK. Des expériences supplémentaires suggèrent qu'après irradiation aux UV, P-TEFb est spécifiquement extrait de la RNP 7SK et transféré dans le Super Elongation Complex (SEC), au sein duquel il est recruté sur ces gènes cibles pour stimuler l'entrée de l'ARN Pol II en élongation productive et le recrutement de facteurs d'élongation. En conclusion, nous avons démontré que l'ARN 7SK n'est pas requis pour la viabilité cellulaire en conditions de croissance normales, mais s'avère essentiel pour orchestrer la réponse transcriptionnelle aux dommages à l'ADN générés par les UVThe positive transcription elongation factor b (P-TEFb) stimulates transcription elongation through phosphorylation of negative elongation factors and the carboxyl-terminal domain (CTD) of RNA polymerase II (RNA Pol II). The cellular activity of P-TEFb is controlled by the 7SK small nuclear RNP (snRNP) composed of the 7SK snRNA, LARP7 and MePCE. Together with HEXIM, the 7SK snRNP dynamically sequesters a fraction of nuclear P-TEFb into catalytically inactive 7SK/HEXIM/P-TEFb snRNP. Outside of the 7SK snRNP, active P-TEFb is targeted to gene promoter regions to stimulate transcription elongation through its association with transcription factors and cofactors. Active P-TEFb is also rapidly released from 7SK/HEXIM/P-TEFb snRNP in response to various stress and physiological conditions which globally affect cell growth - including UV-induced DNA damage. Besides serving as a P-TEFb reservoir, the inactive 7SK/HEXIM/P-TEFb snRNP is selectively targeted to and loaded onto various gene promoters to allow 'on site' P-TEFb extraction and to support specific gene activation. Using human 7SK knock-out (KO) cell lines, we have assessed the functional consequences of 7SK snRNA loss on RNAPII transcription before and after UV-induced DNA damage. Mammalian Native Elongating Transcript-sequencing (mNET-seq) showed that under normal growth conditions the lack of 7SK snRNA has only subtle impacts on RNA Pol II transcription. However, upon UV irradiation, some key early-responsive genes which are readily induced in control cells show impaired transcriptional activation in 7SK KO cells. Since the levels of active P-TEFb in control and 7SK KO cells are highly comparable, we concluded that proper activation of these 7SK-dependent genes relies on the 7SK-associated inactive fraction of P-TEFb. Further experiments suggested that upon UV irradiation, P-TEFb is specifically extracted from the 7SK/P-TEFb snRNP and recruited to selected target genes as part of the Super Elongation Complex (SEC) in order to stimulate RNA Pol II entry into productive elongation and recruitment of RNA Pol II elongation factors. In conclusion, we have demonstrated that the 7SK snRNA is not required for cell viability under normal growth conditions but it is critical to orchestrate accurate transcriptional response upon UV-induced DNA damage
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Van, Heuverswyn Brigitte. "Contrôle de l'expression du gène de la thyroglobuline." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 1985. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/213601.
Full text
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Boutonnet, Christel. "Contrôle pharmacologique de l'expression d'un transgène au niveau traductionnel." Toulouse 3, 2004. http://www.theses.fr/2004TOU30077.
Full textAbstract:
Nous avons conçu un nouveau procédé de contrôle externe permanent et modulable de l'induction de l'expression d'un gène dans des cellules en culture par modulation de l'état de prénylation d'une protéine de fusion inductrice de la traduction dudit gène : L' expression d'une protéine de fusion R17-4G entre la protéine R17 de liaison à l'ARN et le facteur d'initiation de la traduction eIF4G peut diriger la traduction du deuxième cistron d'un ARN messager bicistronique contenant dans l'espace intercistronique le site de liaison de la protéine R17. Un traitement pharmacologique par un inhibiteur de prényl transférase est capable de contrôler l'état de prénylation, et l'activité traductionnelle, de protéines de fusion R17-4G-CAAX contenant des domaines de prénylation CAAX. L'expression conditionnelle, par ce système, d'un transgène dans des cellules eucaryotes, conduit à la production d'une protéine détectable par western-blot et dont on peut étudier les effets biologiques.
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Bertin, Marine. "Contrôle de l'expression du régulateur central AtxA chez Bacillus anthracis." Paris 7, 2010. http://www.theses.fr/2010PA077029.
Full textAbstract:
Bacillus anthracis, l'agent Biologique de la maladie du charbon, est. Une bactérie à Grain positif sporulante. Les facteurs majeurs de virulence sont une toxine tripartite immunomodulatriçe et une capsule antiphagocytaire. L'expression des gènes de chacun de ces deux facteurs de virulence est sous le contrôle du régulateur central AtxA. Les mécanismes exacts permettant à AtxA d'activer la transcription des gènes des composants de la toxine ne sont pas connus,Par un jeu de délétion, nous avons mis en évidence que l'expression d'atxA est régulée par des éléments agissant e. N cis du gène. Les régions d'ADTsl en amont et en aval d'afr/it sont nécessaires à l'expression optimale d'atx4 et en conséquence des gènes de la toxine, En amont se trouve, décrit entre temps par une autre équipe, un deuxième promoteur. Une copie d'atxA délétée juste après le codon stop est responsable d'un défaut d'expression-. -d'atxA, Cette délation-n'est pas complémentaire par l'apport du fragment en tram sur un plasmide multi-copie. Elle entraîne une déstabilisation du transcrit. L'ARNm d'atxA présente une région 3'UTR de 520 bases contenant une structure en tige et boucle suivie d'un poly-U à son extrémité. Cette région 3'UTR exercerait un rétrocontrôle. Responsable de la stabilisation de l'ARNm d'atxA. L'analyse de l'ARNm d'atxA par RT-PCR montre que l'ARNm"se termine dans la région de la tige et boucle. Nous avons confirmé que la structure en tige et boucle de la région 3'UTR du transcrit atxA est un terminateur, La séquence d'atxA, clonée avec ses régions 5'UTR et 3'UTR, est suffisante à une expression maximale de pagA en absence de tout autre élément de pXOlBacillus anthracis, the ethiological agent of anthrax, is a Gram positive spore forming bacterium. After entry into the mammalian host the bacilli multiply and produce key virulence factors, an immunomodulating tripartite toxin and an antiphagocytic poly-y-D-glutamate capsule, Genes responsible for synthesis of the key virulence factors are under AtxA contrai» a global transcriptional regulator. Toxin gene expression has been investigated but the mechanism by which is still undefined. With a set of deleted strains, we have determined that in cis elements located in the vicinity of atxA act on this gene expression. Regions located both upstream and downstream atxA are roquired for full expression of the gene, Upstream of atxA, a second promoter located before the initially identified promoter has been described by another team. An atxA copy deleted just after the translation stop codon gene is responsible for a defect m atxA and pagA expression and this phenotype is not restored by an in trans complementation of the deleted part. The truncated atxA gene produces an instable mRNA. We have determined that the atxA 3'UTR region of 520 bases ends with a rho-independent terminator. We hypothesized that the stem and loop structure is necessary for protection of the transcript against 3'-5' exoribonucleases. The stem end loop structure acts as a transcriptional repressor when inserted between an inducible promoter and a reporter gene. We have shown that the atxA gene, as now defined with a long 5'UTR, containing the described promoters, and the 3'UTR region, containing a stem, and loop follow by poly-T, is the only pXQl element required for pagA gene optimal expression
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Christophe, Daniel. "Du gène de la thyroglobuline: structure et contrôle de l'expression." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 1988. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/213376.
Full text
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Lafontaine, Jennifer. "Contrôle de l'expression des gènes ribosomaux chez la levure et l'homme." Mémoire, Université de Sherbrooke, 2013. http://hdl.handle.net/11143/6322.
Full textAbstract:
L’expression génique est un processus qui se fait en trois étapes: la transcription, la maturation des ARNm et la traduction. Il est bien établi que le ribosome est la machinerie macromoléculaire responsable de la traduction. Cependant, nous en connaissons très peu sur la régulation des protéines ribosomales constituant cette machinerie. Une dérégulation de l’expression des protéines ribosomales peut entraîner différentes maladies telles que les anémies, les ribosomopathies, ainsi que des cancers. Il est donc important d’avoir une régulation contrôlée de l’expression des protéines ribosomales maintenant l’homéostasie. Chez la levure, plusieurs études suggèrent que les protéines ribosomales sont impliquées dans la régulation de leurs paralogues. Dans le laboratoire, des travaux ont montré la régulation négative de rpl30-2 par son paralogue Rpl30-1. Mes travaux sur la levure Schizosaccharomyces pombe ont permis de clarifier le mécanisme par lequel Rpl30-1 régule rpl30-2. Sachant que cette régulation est intron dépendant, nous avons vérifié si Rpl30-1 peut lier directement l’intron de rpl30-2 par retardement sur gel. Il faut aussi déterminer la région de l’intron permettant cette liaison. Différentes constructions devaient être générées afin de cibler la région nécessaire à la liaison. Certains problèmes sont survenus et ont persisté nous obligeant à mettre ce projet de côté. Nos travaux ont permis de proposer un nouveau modèle d’autorégulation de la protéine ribosomale S2 (rpS2) chez l’homme. Une lignée stable a été créée permettant de contrôler l’expression du gène de fusion GFV-RPS2 par l’ajout de doxycycline au milieu de culture. Une réduction de la protéine endogène rpS2 est notable lorsque l’expression de GFP-rpS2 est induite. Étonnamment, en excès de rpS2, les niveaux endogènes d’ARNm de RPS2 ne varient pas suggérant une régulation post-transcriptionnelle. De plus, nos résultats suggèrent une régulation indépendante des régions non traduites en 5’ et 3’. Nous avons vérifié la possibilité d’un mécanisme impliquant la stabilité de la protéine. Nos résultats semblent indiquer que la stabilité de rpS2 ne serait pas impliquée. D’autres expériences montrent que GFP-rpS2 semble lier l’ARNm de RPS2. Ce nouveau résultat permet de proposer un nouveau modèle dans lequel rpS2 pourrait lier son transcrit pour venir réprimer la traduction.
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Van, Reeth Thierry. "Contrôle de l'expression du gène de l'alpha-foetoprotéine par l'hormone thyroïdienne." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2000. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/211760.
Full text
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Berberof, Magali. "Contrôle de l'expression des gènes d'antigènes de surface majeurs chez trypanosoma brucei." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 1995. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/212579.
Full text
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Achour, Lamia. "Contrôle de l'expression à la surface cellulaire du récepteur de chimiokine CCR5." Paris 5, 2009. http://www.theses.fr/2009PA05T011.
Full textAbstract:
CCR5 est un récepteur de chimiokine appartenant à la famille des récepteurs couplés aux protéines G (RCPG), jouant un rôle important dans l'entrée du VIH, en association avec la glycoprotéine CD4. Nous avons pu démontrer que la grande majorité de CCR5 (90%) était maintenue à l'état fonctionnel dans les compartiments intracellulaires des cellules immunitaires humaines et des fibroblastes transfectés. CCR5 est particulièrement localisé dans le réticulum endoplasmique (RE) et le Golgi. Les mécanismes moléculaires qui régulent l'export de CCR5 en provenance des compartiments intracellulaires s'avèrent différents dans le RE et le Golgi. La progression de CCR5 hors du RE est lente, et favorisée par son association avec CD4, qui fonctionne comme une protéine d'escorte et régule l'adressage de CCR5 vers la membrane plasmique. D'un point de vue mécanistique, CD4 induirait un changement conformationnel de CCR5, permettant de lever sa rétention dans le RE par PRAF2, une protéine résidente de ce compartiment. Dans le Golgi, la libération de CCR5 est beaucoup plus rapide (5-10min) et contrôlée par des signaux extracellulaires initiés par l'adhésion cellulaire. La rétention dans les compartiments intracellulaires de CCR5 et, plus généralement, des RCPG, pourrait constituer un système d'adaptation permettant de maintenir une réponse physiologique prolongée, dans des contextes cellulaires qui requièrent une réactivité de réponse soutenue, comme au cours du chimiotactisme des leucocytes, via le remplacement progressif des récepteurs de surface désensibilisés et internalisésCCR5 a chemokine receptor belonging to the G protein-coupled receptor (GPCR) family, plays a major role in HIV entry, by forming the viral receptor in association with the glycoprotein CD4. We report that the vast majority of fully functional CCR5 (=90%) is maintained within the intracellular compartments of human immune cells and of transfected fibroblasts. Intracellular CCR5 is mostly localized in the endoplasmic reticulum (ER) and the Golgi apparatus. The molecular mechanisms which control the export of CCR5 from the intracellular compartments are different in the ER and the Golgi. In the ER, the progression of CCR5 is slow and depends on its association with CD4 which functions as an escort protein and controls the CCR5 exit. Association with CD4 would induce a conformational change of CCR5, which would release the receptor from its retention in the ER by a resident protein, PRAF2. In the Golgi, the release of CCR5 is faster (5-10min) and is controlled by extracellular signals promoted by cell adhesion. The intracellular retention of CCR5 and, more generally, of GPCRs could represent an adaptive mechanism to maintain a prolonged physiological response. In particular contexts, which require sustained receptor response such as leukocyte chemotaxis, intracellular receptors would allow the permanent replacement of cell surface desensitized and internalized receptors
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Polanowska, Jolanta. "Contrôle de l'expression du gèbe cycline E au cours du cycle cellulaire." Montpellier 2, 2000. http://www.theses.fr/2000MON20095.
Full textAbstract:
La progression a travers le cycle cellulaire est sous le controle de complexes a activite kinase composes d'une sous-unite regulatrice exprimee transitoirement au cours du cycle (la cycline) et d'une sous-unite catalytique (cdk). L'expression de la cycline e en fin de phase g1 est un evenement critique pour la progression des cellules de mammiferes dans la phase s. Le travail presente dans ce manuscrit decrit les mecanismes de regulation transcriptionnelle du gene de la cycline e par les proteines des familles e2f et prb. L'activite du promoteur du gene de la cycline e est sous le controle de cerm (cyclin e repressor module), un element bipartite represseur localise pres du site de demarrage de la transcription. Il est forme d'un site e2f et d'une sequence riche en a et t. La cooperation de ces sites en phase g0 et g1 cause un delai de la transcription de la cycline e jusqu'a la transition g1/s. Cerm lie un complexe cellulaire, appele cerc. Cette liaison est observee dans la phase g0 et g1 et disparait graduellement lors de la progression vers la phase s. La cinetique de cet evenement est correlee avec l'activation de la transcription du gene de la cycline e. Cerc est un nouveau complexe de haut poids moleculaire qui comprend e2f4, dp1, une proteine poche, une histoire deacetylase et au moins une autre proteine non-identifiee. Contrairement aux complexes e2f classiques, qui ne varient pas ou qui varient tres peu dans les cellules en phase exponentielle de croissance, l'analyse de l'activite du promoteur dans les populations de cellules elutriees a revele l'implication du site cerm et du complexe cerc dans la repression active du promoteur de la cycline e durant chaque phase g1 des cellules en proliferation. Dans ce cas, la mutation du site cerm abolit completement l'activation periodique du promoteur de la cycline e. Le travail presente dans ce manuscrit nous a permis d'identifier un nouvel element regulateur qui controle la repression du gene de la cycline e.
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Guilhon, Emmanuelle. "Induction par hyperthermie de l'expression d'un transgène sous contrôle d'un promoteur thermosensible." Bordeaux 2, 2002. http://www.theses.fr/2002BOR28983.
Full textAbstract:
La thérapie génique a pour but d'éliminer une pathologie d'un organisme en induisant l'expression d'un gène nouveau dans un ou plusieurs types cellulaires. Ce type d'approche ouvre des perspectives dans le domaine du cancer, car elle offre une alternative aux traitements actuels, très invasifs ou possédant des effets secondaires non négligeables. Un effet spécifique peut être obtenu, non pas par la délivrance spécifique du transgène à une population cellulaire cible, mais par l'activation contrôlée de l'expression du transgène. Notre stratégie est l'induction locale de l'expression d'un gène en employant un promoteur thermo-sensible. Le chauffage local permet de limiter l'expression du transgène à la zone chauffée. Une étude in vitro a montré la fonctionnalité du promoteur. In vivo, l'élévation de la température est produite par une focalisation de faisceaux d'ultrasons, et est contrôlée par thermographie par Imagerie de Résonance Magnétique, assurant, entre autre, une approche non invasive dans le traitement des tumeurs. Une première approche effectuée avec un gène rapporteur, la GFP, a démontré la faisabilité du système. L'utilisation d'un gène suicide dans un modèle de gliome sous-cutané permet une approche thérapeutiqueThe aim of the gene therapy is the cure of pathology by inducing a gene expression in one or more cellular type. It opens views in the cure of cancer, because it offers one other way to cure than the actual treatments, highly invasive or inducing damageable secondary effects. A specific effect can be obtained with the control of the activation of the gene expression. Our aim is to locally induce the gene expression by using a thermo-sensible promoter. A local heating can limit the gene expression to the warmed zone. An in vitro study show the functionally of the promoter. Here, we use MRI guided focused ultrasound (MRI-FUS) with real-time feedback control on a whole-body clinical MRI system for a completely automatic execution of a predefined temperature-time trajectory in the focal point. This hallows a non-invasive way to heat tumours in vivo. A first approach with a reporter gene show the feasibility of this system. The use of a suicide gene in a sub-cutaneous glioma model gives a therapeutical way
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Walgraffe, David. "Mécanismes de contrôle de l'expression des gênes de VSG chez Trypanosoma brucei." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2004. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/211122.
Full textAbstract:
Le trypanosome est le parasite responsable de la maladie du sommeil chez l’homme et de la Nagana chez le bétail. Afin d’échapper au système immunitaire de son hôte mammifère, il remplace périodiquement la protéine VSG (Variant Surface Glycoprotein) présente en 10 millions d’exemplaires à sa surface. Ce mécanisme a pour nom la variation antigénique. Pour être exprimé, le gène de VSG (VSG) doit se trouver en fin d’un site d’expression (ES) particulier. Cet ES est polycistronique, télomérique et transcrit par une ARN polymérase de type ribosomique (Pol I). 20 à 40 ESs similaires et un millier de VSGs sont recensés dans le génome du trypanosome. Cependant, un seul ES est totalement transcrit (actif) et un seul VSG est exprimé. La variation antigénique est donc possible par deux mécanismes: soit l’activation d’un autre ES, soit le remplacement du VSG dans l’ES actif. La base de ce système est l’activation d’un seul ES à la fois (contrôle monoallélique).
Au laboratoire, un modèle a été proposé où la transcription s’initie au niveau de tous les ESs mais n’aboutit au VSG que dans le cas de l’ES actif (Vanhamme et al. 2000). Dans ce cas uniquement, le transcrit primaire subit une maturation correcte (épissage et polyadénylation) et est exporté dans le cytoplasme. Etant donné que des transcrits Pol I subissent une maturation identique à des transcrits Pol II, la régulation s’effectuerait par recrutement d’une machinerie d’élongation/maturation de l’ARN de type Pol II (Pol II « RNA factory »). Cette dernière serait uniquement localisée au niveau de l’ES actif dans le compartiment nucléaire appelé ES body (Navarro and Gull, 2001).
Durant cette thèse, diverses stratégies ont été élaborées pour tester la validité du modèle. La première visait à comparer l’état de maturation d’un ES en fonction de son activité. Nos résultats ont appuyé l’idée que les transcrits d’ESs ayant subi une maturation correcte provenaient préférentiellement de l’ES actif mais le(s) facteur(s) en quantité limitante ne permettant cette maturation qu’au niveau de l’ES actif doivent encore être identifiés. Le seconde stratégie analysait l’acétylation des histones ainsi qu’un éventuel attachement différentiel à la matrice nucléaire de l’ES suivant son activité. Le niveau d’acétylation d’un ES lorsqu’il est actif n’a pu être étudié. Des résultats préliminaires en faveur d’une association préférentielle de l’ES à la matrice nucléaire lorsqu’il est actif ont été obtenus. Enfin, nous avons cloné deux homologues d’un facteur général de la transcription appelé TFIIS. Ce dernier permet à la Pol de redémarrer lorsqu’elle est bloquée par un site de pause. Individuellement chacun de ces facteurs ne semble pas être essentiel au trypanosome. Cependant, un retard de croissance a été observé lorsque les deux facteurs sont invalidés dans la même lignée cellulaire. Ce phénotype particulier doit être caractérisé. En parallèle, nous avons envisagé de caractériser le complexe de la Pol I du trypanosome. Cette stratégie constituait la manière la plus simple de mettre en évidence un éventuel contact physique et/ou fonctionnel entre la Pol I transcrivant l’ES et la machinerie d’élongation/maturation de l’ARN de type Pol II « RNA factory ». 5 sous-unités du complexe ont été identifiées, associées à une protéine de fonction inconnue ainsi qu’à des histones. L’identification d’autres protéines associées au complexe constitue notre perspective principale. La phosphorylation de la plus grande sous-unité du complexe a été démontrée mais son rôle doit encore être élucidé.
Doctorat en sciences, Spécialisation biologie moléculaire
info:eu-repo/semantics/nonPublished
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Charpentier, Maud. "Caractérisation et contrôle de l'expression des antigènes de mélanome issus de la traduction de l'ARNm meloe." Thesis, Nantes, 2017. http://www.theses.fr/2017NANT1035/document.
Full textAbstract:
Mis en évidence par notre équipe, les antigènes de mélanome MELOE-1 et MELOE-2 présentent un profil d’expression original qui en fait des cibles de choix pour l'immunothérapie anti-cancéreuse. Ils sont en effet issus d’un lncRNA polycistronique, meloe, transcrit uniquement dans les cellules de la lignée mélanocytaire et leur traduction est restreinte aux cellules de mélanome. Cette traduction restreinte repose sur l’activation de séquences IRES exclusivement dans les cellules tumorales. Nous présentons ici l'identification d'un ORF supplémentaire de l'ARN meloe qui à la différence des deux précédents est traduit de façon strictement coiffe dépendante pour générer un polypeptide appelé MELOE-3. L’étude de son profil d’expression montre que contrairement à MELOE-1 et -2, il est exprimé non seulement dans les cellules de mélanome mais aussi dans les mélanocytes normaux. Nous documentons que MELOE-3 est très peu immunogène contrairement à MELOE-1 et 2. Cette observation est cohérente avec une tolérance immunitaire vis à vis d'une protéine exprimée physiologiquement par les mélanocytes. De plus, nos travaux sur les conditions d'activation de l’IRES de MELOE-1 dans les cellules de mélanome indiquent que des inducteurs de stress du réticulum augmentent significativement l’expression de MELOE-1. Cela pourrait refléter les conditions de stress dans l'environnement tumoral in vivo. En conclusion, les antigènes issus de la traduction IRES-dépendante de meloe sont les cibles thérapeutiques les plus pertinentes et notre hypothèse actuelle est que de tels antigènes IRES-dépendants existent probablement dans d'autres types de cellules cancéreuses à partir d'autres lncRNAMELOE-1 and MELOE-2 are two melanoma antigens previously identified by our team whose expression profile is attractive for their use as anti-tumor immunotherapy targets. They are indeed encoded by meloe, a polycistronic lncRNA only transcripted in cells of the melanocytic lineage and MELOE-1 and MELOE-2 translation is restricted to melanoma cells. This specific translation relies on the exclusive activation of IRES sequences in tumor cells. In the present study, we identified an additional meloe derived protein named MELOE-3 that unlike the two others is translated through the classical cap dependent pathway. Whereas MELOE-1 and -2 were melanoma specific, MELOE-3 expression profile showed that it is expressed in both melanoma cells and normal melanocytes. We documented that in opposition to MELOE-1 and -2, MELOE-3 is poorly immunogenic, an observation that is consistent with an immune tolerance towards a protein physiologically expressed by melanocytes. Furthermore, our work on the conditions of MELOE-1 IRES activation in melanoma cells shows that ER stress inducers significatively increase MELOE-1 expression. These conditions could reflect the cellular stress experienced by cells in the tumor microenvironment. In conclusion, meloe derived antigens translated through IRES sequences are the most relevant therapeutic targets for immunotherapy. Our current hypothesis is that IRES dependent antigens encoded by cryptic transcripts such as lncRNAs probably exist in other tumor types and should be taken into account when studying anti-tumor immune responses
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Gerard, Catherine. "Contribution à l'étude du contrôle de l'expression de gènes spécifiques du tissu thyroïdien." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 1989. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/213241.
Full text
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Karaa, Zeïneb. "MicroARN et hypoxie : étude du contrôle de l'expression de HIF-1alpha et du VEGF." Toulouse 3, 2008. http://thesesups.ups-tlse.fr/754/.
Full textAbstract:
Une diminution de la pression en oxygène, appelée hypoxie, constitue un changement environnemental qui induit des modifications majeures de l'expression génique, principalement orchestrées par le facteur de transcription HIF-1 (HIF-1alpha et HIF-1beta). Il permet la transduction de nombreux gènes en hypoxie, comme le vegf. Le VEGF est un facteur angiogénique dont l'inhibition constitue un traitement anticancéreux en plein essor. L'objet de cette thèse porte sur l'étude du rôle des microARN (miARN) dans la régulation de l'expression des gènes codant pour HIF-1a et VEGF. Les miARN sont des petits ARN non codants, participant à la régulation de l'expression génique. Cette étude a permis de démontrer que 1- miR-16 inhibe la traduction du VEGF, via la liaison directe d'un site présent dans sa région 3'UTR. 2- miR-16 inhibe sélectivement la traduction du VEGF initiée à l'IRES-B. 3- miARN peut contrôler différents types d'initiation de la traduction et ce, au sein d'un même transcrits. 4- sur un plan physiologique, miR-16 inhibe l'expression des formes les plus diffusibles du VEGF. 5- miR-16 régule positivement l'accumulation de la protéine HiF-1a en s'associant à celle-ci. 6- cet effet positif passe par une voie originale puisqu'il s'agit de l'effet directe d'un miARN sur une protéine. 7- dans un modèle de xénogreffe, l'inhibition de miR-16 inhibe la croissance tumorale en bloquant l'accumulation et donc l'activité de HIF-1a dans les tumeurs. MiR-16 est donc un miARN fondamental dans la régulation de l'angiogenèse puisqu'il opère dans une boucle de rétrocontrôle où il régule positivement l'expression de HIF-1a et négativement celle du VEGF dont une expression excessive qui serait délétèreThe major response to reduced oxygen availability (hypoxia) is mediated through inducing gene expression of the hypoxia-inducible-factors (HIFs). HIF-1 is a transcription factor (HIF-1alpha and HIF-1beta) that functions as the main mediator of oxygen homeostasis in response to reduced O2 availability. HIF-1 directs the transcription of numerous genes implicated in oxygen delivery and energy metabolism, such as vascular endothelial growth factor (VEGF). VEGF is an essential growth and survival factor for endothelial cells. It plays a major role in physiological and pathological angiogenesis. The purpose of this thesis is the study of the regulation of the expression of both HIF-1alpha and VEGF by microRNA (miRs). MiRs are short single stranded regulatory RNAs which traditionally play a role in mRNA 5'- 3'degradation, deadenylation, and translation inhibition. In this study we show that miR-16 inhibits VEGFA translation though its direct interactions with a binding site in the VEGFA 3'UTR and that miR-16 inhibits selectively VEGF translation initiated at the IRES-B. This study demonstrates for the first time the inhibition of cellular IRES driven translation by a miR. Consequently, miR-16 preferentially alters the level of the diffusible VEGF isoform. Furthermore, this study demonstrates that miR16 increases the protein level of HIF-1alpha, through increasing HIF-1alpha stability. This HIF-1a positive regulation by miR-16 was confirmed in vivo, where decrease level of miR-16 inhibits HeLa tumors growth. MiR-16 acts as a mainspring of hypoxic response in a feedback loop by promoting HIF-1alpha stabilization in part, and inhibiting VEGF translation in order to avoid unwanted VEGF overexpression
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Guyot, Boris. "Contrôle de l'expression de l'adaptateur moléculaire MONA (Monocytic adaptor) dans le système hématopoïétique humain." Lyon 1, 2002. http://www.theses.fr/2002LYO10079.
Full textAbstract:
La différenciation d'une cellule pluripotente s'accompagne de l'expression d'un programme génétique spécifique qui donne à la cellule mature toutes les caractéristiques propres à son lignage. L'hématopoièse est le processus qui conduit à la différenciation d'au moins huit lignages différents à partir d'une seule cellule souche, elle constitue donc un modèle intéressant pour l'étude du contrôle de l'expression des gènes spécifiques de lignage. Mona (Monocytic adapter) est un adaptateur moléculaire spécifiquement exprimé dans le système hématopoiétique. Ce travail décrit l'étude des mécanismes transcriptionnels et post-transcriptionnels de contrôle de l'expression de Mona. Les transcrits de Mona exprimés dans les cellules T et myéloides (transcrits 1A) sont différents de ceux exprimés dans les cellules mégacaryocytaires et les plaquettes (transcrits 1B) au niveau de leur 5'UTR mais ils ont la même séquence codante. Les transcrits 1A et 1B sont synthétisés à partir de deux promoteurs distincts, nommés 1A et 1B, qui sont respectivement spécifiques des lignages T et myélo-monocytaire, et du lignage mégacaryocytaire. La caractérisation du promoteur 1A montre que son activité dépend principalement du facteur de transcription AML-1 (Acute Myeloid Leukemia-1). La caractérisation du promoteur 1B montre qu'il est caractéristique des promoteurs mégacaryocytaires connus, son activité dépend en effet de facteurs de transcription des familles GATA et ETS. L'expression de Mona dans le lignage mégacaryocytaire dépend également d'un mécanisme post-transcriptionnel. En effet, la traduction de Mona à partir des transcrits 1B est inhibée par deux trames de lecture ouverte dans la 5'UTR 1B. Nos résultats suggèrent que l'inhibition de la traduction de Mona pourrait être levée au cours de l'activation des plaquettes. Alternativement, une isoforme de Mona produite après épissage alternatif du transcrit 1B pourrait être stabilisée par l'activation des plaquettes.
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Coiffet, Michaël. "Etude du contrôle épigénétique de l'expression de trois rétrovirus endogènes ZAM, Idefix et Gypsy." Clermont-Ferrand 1, 2009. http://www.theses.fr/2009CLF1MM05.
Full textAbstract:
Les éléments transposables sont des séquences d'ADN trouvées chez tous les organismes vivants, capables de se déplacer d'un site à un autre. Certains d'entre eux possèdent une structure génomique similaire à celle des rétrovirus, et sont appelés rétrovirus endogènes. Les éléments transposables sont une source de mutations et doivent donc être finement contrôlés par leurs hôtes. Afin de parer à leur mobilisation, les génomes ont mis en place des mécanismes de régulation impliquant de petits ARNs dont les siARNs sont la composante la plus connue. Récemment, il a été mis en évidence chez la drosophile une nouvelle classe de petits ARNs appelés piARNs qui contrôlent spécifiquement les éléments transposables dans les tissus reproducteurs. ZAM et Idefix sont 2 rétrotransposons à LTR chez la drosophile, isolés au sein du laboratoire. Habituellement quiescents et contrôlés par le génome de l'hôte, ils sont réactivés et mobilisés dans une lignée génétiquement instable où leur nombre de copies a été amplifié. L'étude des lignées de drosophile stables, réprimant l'expression de ZAM et Idefix, ainsi que de la lignée instable appelée Rev, a permis de localiser génétiquement le déterminant de la stabilité sur le chromosome X, dans la région 20A, un locus péricentromérique situé dans l'hétérochromatine. Cette région 20A est par ailleurs connue pour contrôler un autre rétrotransposon à LTR Gypsy et a donc été appelée "Centre Organisateur de la Mobilisation" : COM ou flam/COM. J'ai précisé les caractéristiques moléculaires du locus flam/COM dans différentes lignées contrôlant ou non l'expression de ZAM, Idefix et Gypsy. Il apparaît que la structure génomique et la conformation de la chromatine sont différentes. Par ailleurs, des transcrits ont été détectés dans certaines régions du locus flam/COM. Ils correspondent à des transcrits complémentaires des messagers d'éléments transposables localisés dans l'euchromatine. Il a été montré au laboratoire qu'Idefix était régulé par un mécanisme post-transcriptionnel (PTGS) qui implique les piARNS dans les tissus reproducteurs de drosophiles. Je me suis intéressé à savoir si en plus de ce contrôle, il existait une régulation transcriptionnelle (TGS) entretenue sur Idefix. En étudiant le différentiel d'expression entre un transgène contenant Idefix et donc réprimé par un PTGS et le même transgène dont la répression par PTGS est levée, j'ai montré qu'une régulation transcriptionnelle était absente dans les cellules folliculaires de l'ovaireTransposable elements are DNA sequences, that have been found in all studied organisms, able to move from a chromosomal site to another causing genomic alterations. Thus, elaborated genomic defenses have evolved to restrict their transposition. One of those involves mechanisms depending on small RNA (RNAi), whose siARNs are the most known constituent. Recently, a new class of small RNA has been identified in Drosophila and called piRNA. These piRNAs control specifically transposable elements in reproductive tissues. ZAM and Idefix are two LTR retrotransposon in Drosophila melanogaster isolated in our laboratory. They are usually quiescent but we isolated a drosophila line which lost this control, and where ZAM and Idefix express and transpose at high rate. The genetic locus responsible for this control is located on the X chromosome, at position 20A. This heterochromatic region is also known to regulate the expression of Gypsy an other LTR retrotransposon and thus, has been called "Centre Organisateur de la Mobilisation" : COM or flam/COM. Here I describe the moleclar determinants present in the flam/COM locus between different lines which control or not the expression of ZAM, Idefix and Gypsy. It has been shown that genomic and heterochromatic structures are different. Furthermore, transcripts from this locus have been detected in some regions. These transcripts are complementary to transposable element messengers which are located elsewhere in the drosophila genome. It has been shown in the laboratory that Idefix is controled by a post-transcriptional regulation (PTGS) involving piRNA in reproductive tissues of Drosophila. I was interested to known if, besides PTGS, another regulation which would implicate a transcriptional silencing (TGS) might also repress the expression of Idefix. By studying the differential of expression between a transgene repressed by PTGS, because it contains an Idefix fragment, and the same transgene from which the PTGS repression is released, I showed that a TGS doesn't occur in the somatic cells of the adult ovaries
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Gout, Johann. "Contrôle de l'expression des gènes du système mélanocortinergique dans différentes conditions hormonales et nutritionnelles." Lyon 1, 2007. http://www.theses.fr/2007LYO10328.
Full textAbstract:
Le système mélanocortinergique hypothalamique régule, au niveau central, le comportement alimentaire, ainsi que l’homéostasie énergétique. Dans un premier temps, nous avons étudié in vitro les facteurs contrôlant l’expression constitutive du gène codant MC4-R au niveau transcriptionnel. Par la suite, nous nous sommes intéressés aux variations d’expression des récepteurs et ligands de ce système in vivo dans différentes conditions hormonales et nutritionnelles et avons montré notamment le rôle joué par la leptine. Nous avons également étudié ces variations dans un modèle murin d’obésité induite par un régime alimentaire hyperlipidique, chez l’adulte et les descendants. Ces modifications d’expression, tendant à contrôler le statut énergétique, sont associées à des troubles des métabolismes glucidique et lipidique. Ces altérations métaboliques apparaissent rapidement chez les descendants de mères obèses. Chez ces derniers, le changement de régime alimentaire, en faveur d’un régime standard ou hyperprotéique, améliore les paramètres métaboliques, d’autant plus rapidement que ce changement s’effectue tôt dans la vie, en particulier en période périnatale, en corrélation avec des modifications d’expression des gènesAt the central level, the hypothalamic melanocortin system controls food intake and energy homeostasis. In the first in vitro experiment, we studied the factors responsible of the constitutive expression of the gene encoding MC4-R at the transcriptional level. Then, we studied the variation of expression of the genes encoding ligands and receptors of this system in vivo in different hormonal and nutritional conditions and have demonstrated the role of leptin. We also studied these alterations in a murine model of high fat diet-induced obesity, in adults and in offspring. These variations of expression, which aim to control the energy status, are associated with disorders in carbohydrate and lipid metabolisms. These metabolic disorders appear early in the offspring of obese mother. The change of diet of the progeny, for a standard or a high protein content diet, improves metabolic parameters. The improvement depends of the precocity of the changes and is correlated with changes in gene expression
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Kim, Wanhui. "Rôle de l'acétylation des histones dans le contrôle de l'expression du génome d'Arabidopsis thaliana." Paris 11, 2008. http://www.theses.fr/2008PA112156.
Full textAbstract:
L’acétylation des histones apparaît comme un commutateur central de l’inter-conversion entre l’état permissif et répressif des domaines de la chromatine. L’homéostasie de l’acétylation des histones est assurée par les histones acétyltransférases (HAT) et les histones déacétylases (HDAC). Mais leurs rôles aux niveaux de la chromatine et de la régulation transcriptionnelle ou post-transcriptionnelle ne sont pas éclairci. Les objectifs de ce travail étaient d’étudier le rôle de l’acétylation des histones dans le contrôle de l’expression de gènes chez Arabidopsis thaliana. Pour cela, des mutants HDACs et HATs ont été identifié et caractérisé. Tout d’abord, AtGCN5 intervient, avec la voie des miARNs, aux niveaux transcriptionnel et post-transcriptionnel. Ceci indique que l’acétylation/déacétylation des histones est un mécanisme épigénétique impliqué dans la régulation de la production de miARN. La caractérisation des mutations HDACs révèle que la mutation de AtHDA9 induit un phénotype de floraison précoce en conditions de jours courts. Ces caractéristiques s’accompagnent d’une sur-expression de gènes activateurs dans la voie de la transition florale. La mutation de AtHDA9 et AtSRT2 affecte également la méthylation de l’ADN de la séquence péricentromérique répétée de 180 pb et du transposon AtSN1. Ces résultats révèlent les différents rôles joués par des HATs et HDACs individus dans le contrôle de l’expression du génome d’ArabidopsisHistone acetylation appears as a central switch for interconversion between permissive and repressive state of chromatin domains. Homeostasis of histone acetylation is made sure by histones acetyltransferases (HAT) and histones desacetylases (HDAC). But their role on chromatin and transcriptional/posttranscriptional regulation was not clear. The objective of my work was to study the role of histone acetylation in the control of gene expression in Arabidopsis thaliana. For this reason, HAT and HDAC mutants had been identified and characterized. First of all, we show that AtGCN5 interfere, in the pathway of miRNA, on transcriptional and posttranscriptional regulation of gene. It indicates that histone acetylation/desacetylation is an epigenetic mechanism involved in the regulation of miRNA production. Characterization of the mutants reveled that AtHDA9 mutation induces a phenotype of early flowering in short days. This characteristics is associated with overexpression of activator genes in the pathway of flowering. AtHDA9 and AtSRT2 mutation affect also DNA méthylation of pericentromeric sequence repeat 180 bp and retroelement AtSN1. Our results reveal the different role of individual HAT and HDAC in the control of genome expression of Arabidopsis
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Chapat, Clément. "Nouveaux rôles du complexe CCR4-NOT dans le contrôle de l'expression des gènes eucaryotes." Thesis, Lyon 1, 2013. http://www.theses.fr/2013LYO10139/document.
Full textAbstract:
De la synthèse des ARNm jusqu'à leur dégradation, le complexe CCR4-NOT est un régulateur essentiel de l'expression des gènes eucaryotes. CAF1 est une sous-unité catalytique qui joue un rôle central dans la fonction de ce complexe. La protéine humaine hCAF1 possède une activité déadénylase, régule la méthylation des arginines dépendante de PRMT1 et est un régulateur transcriptionnel des récepteurs nucléaires. Bien que l'ensemble des travaux publiés sur hCAF1 lui confère une place importante dans la régulation de l'expression des gènes, son mécanisme d'action et surtout les voies de signalisation qu'elle régule restent encore mal compris dans les cellules humaines. Lors de ce travail de thèse, nous avons mis en évidence une nouvelle fonction de la protéine hCAF1 comme régulateur de la voie des interférons via le contrôle du facteur de transcription STAT1 et la dégradation de ses ARNm cibles. L'identification de hCAF1 comme régulateur de l'activité de STAT1 et de la réponse aux interférons est très importante car des activations anormales de ces voies sont associées à de nombreuses pathologies telles que le cancer ou des maladies immunitaires. En parallèle, nous avons caractérisé un nouvel isoforme nommé hCAF1v2 produit par le gène humain Caf1 suite à un évènement d'épissage alternatif. Nos résultats indiquent que hCAF1v2 présente une divergence fonctionnelle vis-à-vis de hCAF1 puisqu'elle ne possède pas d'activité déadénylase intrinsèque et s'avère requise pour la régulation de la méthylation des arginines via son interaction avec l'enzyme PRMT1. L'ensemble des résultats obtenus identifient une nouvelle voie de signalisation régulée par la protéine hCAF1 dans les cellules humaines et permettent de mieux comprendre l'implication du complexe CCR4-NOT dans les mécanismes de régulation de l'expression des gènesThe multi-subunit CCR4-NOT complex has been implicated in all aspects of the mRNA life cycle, from synthesis of mRNAs in the nucleus to their degradation in the cytoplasm. The CAF1 protein is a catalytic subunit which plays a central role inside the complex. Human CAF1 is a deadenylase, modulates arginine methylation, and is a transcriptional cofactor of several nuclear receptors. The main objective of the thesis was to elucidate the molecular mechanism of hCAF1- mediated gene expression. We reported that hCAF1 is an important negative regulator of the interferon pathway and that hCAF1 is associated in the cytoplasm of resting cells with STAT1, a crucial transcription factor of this pathway. We found that hCAF1 participates in the extinction of the IFN signal via its deadenylase activity, by speeding up the degradation of some STAT1-induced mRNAs. Our findings are important because abnormal activations of this pathway are frequently associated with cancer and auto-immune diseases. In parallel, we characterized a novel isoform called hCAF1v2 produced by alternative splicing of the Caf1 gene. We reported that hCAF1v2 displays divergent functions compared with hCAF1. In fact hCAF1v2 does not have a deadenylase activity and is preferentially associated with PRMT1 to modulate arginine methylation. Altogether, our findings identify a new signalling pathway which is regulated by hCAF1, and reveal novel mechanisms utilized by the CCR4-NOT complex to control gene expression
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Hamouche, Lina. "Contrôle spatio-temporel de l'expression génétique et du comportement d'une communauté migrante de Bacillus subtilis." Sorbonne Paris Cité, 2015. http://www.theses.fr/2015USPCC206.
Full textAbstract:
Les bactéries sont susceptibles de coloniser des surfaces variées et former de véritables communautés complexes. Nous nous intéressons au "swarming" ou migration rapide des bactéries sur une surface, phénomène précédant la formation des biofilms. Bacillus subtilis, migre sous forme de dendrites qui restent en monocouche sur de longues distances ce qui permet les analyses quantitatives spatio-temporelles de l'expression génique in situ en cellule unique. La migration d'une dendrite en monocouche cellulaire est un phénomène bi-dimensionnel qui ne peut être expliqué par une croissance exponentielle de tous les membres de la communauté. Nous avons pu montrer qu'il existe de réelles différences de l'expression génétique entre les cellules "swarmers", localisées à la pointe de la dendrite, et les autres cellules composant la dendrite. Les swarmers expriment fortement des gènes clés indicatifs de la réplication de l'ADN et de la traduction. Cette augmentation indique que les swarmers sont métaboliquement plus actifs que les autres bactéries de la dendrite. Le marquage avec des acides aminés fluorescents (FDAA) du peptidoglycane néo-synthétisé confirme clairement la division cellulaire non uniforme dans la dendrite. Nous avons également exploité ce système expérimental pour effectuer une analyse quantitative et spatio-temporelle de l'expression de ribonucléases clés, la RNaseJl et la RNaseY. Par ailleurs, par microscopie TIRF, nous avons pu montrer que la RNaseY est associée à la membrane où elle se déplace très rapidement sous forme de foci fugaces. Ni l'arrêt de transcription ni la surproduction d'un substrat n'ont eu d'effet sur la localisation de la RNase YBacteria adopt social behavior, as a communities, to expand into new territories. Mass migration of Bacillus subtilis is an attractive model system to study swarming motility. This is the most rapid form of surface translocation that preceeds biofilm formation. In our conditions, the bacterial community advances in the form of dendrites that remain as a cellular monolayer over long distances, greatly facilitating spatio-temporal gene expression analysis in single cells. The linear two- dimensional progression of the dendrites is at odds with the anticipated exponential growth of the cells. Here we show, that the rate of DNA replication and protein translation depend on the localization of an individual cell within the migrating population. Fluorescent D-amino acid (FDAA) labeling of newly synthesized peptidoglycan clearly confirms the non-uniform cell division pattern. Our data go against the common view that swarming cells have slow division rate. On the contrary our data show that only a few specialized swarmer tells at the forefront of the migrating community, propulse the population forward and account in large part for the increase in biomass. Our theorized two-population-model fully explains the linear expansion rates of migrating bacterial communities. We also used this experimental system for quantitative and spatiotemporal expression analysis of key ribonucleases, the RNaseJl and RNaseY. Furthermore we have shown, by TIRF microscopy, that RNaseY is associated with the membrane that move dynamically along the lipid bilayer forming fugitive foci. Neither transcription arrest or overproduction of a substrate had an effect on RNase Y localization
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Parmentier, Jean-Hugues. "Répression des cytochromes P450 par les Interleukines-1 et 6 : contrôle de l'expression du CYP4A1." Nancy 1, 1995. http://www.theses.fr/1995NAN10455.
Full text
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Onesto, Cercina. "PAIP2 et ARNm du VEGF : un modèle original de contrôle de l'expression de gènes angiogéniques." Nice, 2005. http://www.theses.fr/2005NICE4049.
Full textAbstract:
Le VEGF-A est un des régulateurs majeurs de l'angiogenèse. L'ARNm du VEGF étant très labile, la régulation de sa stabilité est une étape clé dans le contrôle de son expression. Nous avons démontré que PAIP2 est un partenaire protéique de la région 3'UTR de l'ARNm du VEGF, une région impliquée dans les phénomènes de stabilité des ARNm. La surexpression de PAIP2 stabilise l'ARNm endogène du VEGF, conduisant alors à une augmentation de VEGF sécrété. De manière inverse, l'invalidation de PAIP2 par interférence ARN affecte les niveaux basaux d'ARNm du VEGF, diminuant de 50% les quantités de VEGF sécrété. De plus, PAIP2 est capable d'interagir avec HuR, une autre protéine stabilisatrice de l'ARNm du VEGF, suggérant une coopération de ces deux protéines. Des expériences de "Gene Array" ont montré que PAIP2 module également l'expression d'autres gènes angiogéniques (interleukine 8, neuropiline 1, récepteur de l'EGF, intégrines α5 et αv et Id3). Ainsi, l'impact de PAIP2 sur la néovascularisation et la croissance tumorales a été étudié par invalidation de son expression in vivo par interférence ARN dans des essais de tumorigenèse. L'administration systémique de siRNA chez la souris s'étant révélée inefficace, nous avons développé des vecteurs lentiviraux permettant d'inhiber l'expression de PAIP2 in vivo. Enfin, une étude rétrospective sur des carcinomes ORL humains a montré une forte corrélation entre l'expression de PAIP2 et celle du VEGF, suggérant que PAIP2 contrôle l'expression du VEGF également au sein de tumeurs humaines. Ainsi, le rôle clé de PAIP2 en tant que modulateur de l'angiogenèse pourrait faire de lui une cible potentielle dans des thérapies anti-angiogéniquesThe VEGF-A is one of the most important regulators of angiogenesis. Thus, studying mechanisms governing its expression appears to be crucial to understanding physiological and pathological processes involved in angiogenesis. VEGF expression is tightly regulated, particularly at the level of its mRNA stability, which is essentially mediated through the 3' untranslated region (3'UTR) of the VEGF mRNA. By performing screening experiments, we identified PAIP2 as a protein partner of the VEGF mRNA 3'UTR. PAIP2 overexpression stabilizes endogenous VEGF mRNA, leading to an increase in VEGF secretion. Conversely, PAIP2 silencing by RNA interference impairs the VEGF mRNA basal level, inducing a 50% decrease in the level of secreted VEGF. Moreover, PAIP2 can interact with HuR, another VEGF mRNA-stabilizing protein, suggesting cooperation of both proteins in VEGF mRNA stabilization. "Gene Array" experiments demonstrated that PAIP2 also regulates the expression of other angiogenic genes, such as those encoding interleukin 8, neuropilin 1, EGF receptor, α5 and αv integrins and Id3. Hence, we analyzed the role of PAIP2 in neovascularization and tumor growth by silencing PAIP2 expression in vivo using RNA interference. As systemic administration of siRNA to mice proved to be ineffective, we developed lentiviral vectors that allowed PAIP2 silencing in vivo. Finally, a retrospective study into human head and neck carcinomas showed a strong correlation between PAIP2 and VEGF expression, suggesting that PAIP2 also controls VEGF expression in human tumors. Thus, due to its crucial role in regulating angiogenesis, PAIP2 may be used as a potential target in anti-angiogenic therapies
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Zhang, Elodie. "Etude de facteurs impliqués dans le contrôle-qualité de l'expression des gènes, chez Saccharomyces cerevisiae." Thesis, Paris 6, 2017. http://www.theses.fr/2017PA066500/document.
Full textAbstract:
La régulation et le contrôle-qualité de l'expression génique permettent respectivement de maintenir un équilibre entre synthèse et dégradation des ARNm répondant aux besoins cellulaires et d'empêcher l'expression d'ARNm ou protéines aberrants potentiellement toxiques. Pour mieux comprendre ces processus cytoplasmiques, je me suis intéressée à Jlp2, Tac4 et Ska1, trois protéines ayant des liens physiques ou fonctionnels avec des acteurs du contrôle-qualité des ARNm et peptides appartenant aux complexes RQC et SKI. Jlp2 montre des liens de létalité synthétique avec les complexes RQC et SKI mais son absence n'altère pas le " NonStop mRNA Decay ". Elle pourrait donc être impliquée dans une autre voie de contrôle dépendante des complexes RQC et SKI. Tac4 est une ARN hélicase putative associée aux ribosomes, au niveau de l'hélice H16 de l'ARNr 18S comme son homologue putatif mammifère DHX29. Elle interagit également au niveau de régions 3'UTR d'ARNm. Ces observations suggèrent que Tac4 pourrait être impliquée dans la réinitiation de la traduction et le sauvetage de ribosomes non-dissociés récemment identifiés dans la région 3'UTR d'ARNm. Enfin, nous avons identifié Ska1, une protéine appartenant à une nouvelle sous-population de complexes SKI. Nos données suggèrent que ce complexe SKI-Ska1 est impliqué dans la dégradation de transcrits dépourvus de ribosome. Nous proposons un modèle selon lequel ce complexe SKI-Ska1 agirait durant la dégradation de 3'UTR avec l'exosome, puis en arrivant dans la région codante et en rencontrant un ribosome, Ska1 se dissocierait du complexe pour lui permettre d'interagir directement avec le ribosome et poursuivre la dégradation 3'-5' de l'ARNMechanisms responsible for the regulation of gene expression and its quality-control are required, respectively for maintaining an equilibrium between mRNA synthesis and degradation and to prevent synthesis of aberrant mRNAs and proteins potentially toxic for the cells. To better understand these quality-control processes, I studied three factors, Jlp2, Tac4 and Ska1, with physical or functional links described with factors involved in mRNA and protein quality-control, the RQC and SKI complexes. Jlp2 shows synthetic lethality with the RQC and SKI complexes but its deletion has no effect on the NonStop mRNA Decay, suggesting that Jlp2 could be implicated in another control pathway linked to the RQC and SKI complexes. Tac4 is a putative RNA helicase bound to ribosomes, on the 18S rRNA H16 helix, as its mammalian putative homolog DHX29. DHX29 plays a role in translation initiation but surprisingly, Tac4 interacts, in addition to ribosomes, with mRNA 3’UTRs. These observations suggest that Tac4 could be implicated in translation reinitiation and rescue of non-dissociated-ribosomes, recently described within mRNA 3’UTRs. Finally, we identified Ska1, a new factor associated to a SKI complex subpopulation. Our observations suggest that the SKI-Ska1 complex is implicated in the degradation of transcripts devoid of ribosomes. It suggests a model by which the SKI complex would proceed in two steps. First, the SKI-Ska1 complex could assist the exosome to degrade 3’UTR regions of RNAs and then, when its reaches the coding region and encounter a ribosome, Ska1 would leave the complex and allow it to interact directly with ribosomes to proceed further in the 3’-5’ RNA degradation
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Leriche, Anne. "Contribution à l'étude du contrôle par la thyrotropine de l'expression génétique de la glande thyroïde." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 1987. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/213472.
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Meller, Alain. "Apsis : un système pour l'expression de connaissances décisionnelles en robotique." Paris 11, 1985. http://www.theses.fr/1985PA112153.
Full textAbstract:
La modélisation de la fonction décision d'un robot ou d'un système robotique évolue a donne lieu a des travaux qui se sont le plus souvent attachés à la problématique de la génération de plans d'actions et ont considéré le contrôle d'exécution de ces plans de façon secondaire. Cette approche a quelque peu situe cette fonction décision dans un cadre "hors ligne" ou tout au moins en recul par rapport a la phase "action" du robot. Si cette approche a ses succès pour différents problèmes, elle a révélé ses faiblesses partout ou planification et exécution sont étroitement liées, en particulier en robotique, ou de nombreuses connaissances décisionnelles peuvent être exploitées dynamiquement. Il est apparu alors qu'il fallait au préalable définir un cadre d'expression et d'exploitation pour de telles connaissances. L'objectif de ce travail est de souligner les motivations et de décrire le système APSIS qui constitue un tel cadre. Ce système est basé sur la méthodologie des systèmes de productions et constitue un moteur d'inférences dont on précisera les fonctionnalités et dont on illustrera l'utilisation à l'aide d'exemples. Enfin, un manuel d'utilisation d'APSIS figure en annexe à cette thèse.
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Boucher, Annie. "Contrôle hormonal de l'expression de MCP-1 par les cellules endométriales chez les femmes ayant l'endométriose." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 1999. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk1/tape9/PQDD_0007/MQ43777.pdf.
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Ville, Thérèse. "Etude des mécanismes intervenant dans le contrôle transcriptionnel de l'expression des gènes de globines γ humaines." Lyon 1, 1994. http://www.theses.fr/1994LYO10064.
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Chez l'homme, les genes responsables de la production des chaines de type beta de l'hemoglobine sont regroupes dans un complexe situe sur le chromosome 11 et sont disposes dans l'ordre dans lequel ils s'expriment au cours du developpement. L'expression des deux genes ggamma et agamma, majoritaire durant le developpement ftal, devient residuelle un an apres la naissance. Cette expression est donc soumise a des controles tissu et stade-specifiques. L'objectif de mon travail a ete d'apporter une contribution a la comprehension des mecanismes impliques dans ces controles. Ce travail a comporte deux parties: l'analyse, par un systeme d'expression transitoire, des sequences impliquees dans l'expression tissu-specifique des genes gamma. Nos resultats montrent que, dans un contexte erythroide, l'expression d'un gene gamma est controlee par des interactions entre le promoteur proximal et, d'une part, le site hypersensible a l'adnase i hs2 et, d'autre part, une region enhancer situee en 3 du gene agamma. L'analyse, chez un sujet adulte ne produisant pas de globine ggamma detectable, du taux d'arnm ggamma et agamma par rt-pcr et, par sequencage, de la structure du gene ggamma et d'autres regions du complexe beta. Nos resultats montrent que la quasi-absence de globine ggamma chez ce sujet est correlee a un taux faible d'arnm ggamma et que celui-ci est relie a une combinaison de structures genetiques, au sein du complexe beta, pouvant etre impliquee dans l'expression differentielle des deux genes gamma
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Soutourina, Olga. "Contrôle de l'expression des gènes dans le processus de motilité chez les bactéries à Gram-négatif." Versailles-St Quentin en Yvelines, 2001. http://www.theses.fr/2001VERS011V.
Full textAbstract:
La motilité constitue un atout pour les bactéries tant dans leurs déplacements vers les environnements les plus favorables que dans la pathogénicitéou l'adhésion et la formation des bio films. En contrepartie, la motilité demande de grandes dépenses énergétiques et les filaments des flagelles portent des caractères antigéniques marques. Il n'est donc pas étonnant qu'un système très élaboré contrôle la synthèse des flagelles suivant les conditions environnementales. Nous avons aborde les bases moléculaires de ces processus chez E. Coli. Les résultats obtenus montrent que le complexe camp-cap et la protéine h-ns, mais pas la protéine para logue stpa, contrôlent la synthèse des flagelles au niveau de l'opéron maître flhdc. Camp-cap active directement la transcription, tandis que l'effet positif d'h-ns dépend de la présence de la région régulatrice complète incluant l'extrémité 5 de l'arnm. L'analyse des profils d'expression dans un mutant hns montre la position hiérarchique élevée d'h-ns dans le contrôle de la physiologie bactérienne, en particulier en réponse aux facteurs environnementaux comme le pH acide. La caractérisation de revertants spontanés motiles dans un contexte hns a révèlé un contrôle coordonne de la motilité et de la résistance au pH acide. Par ailleurs, nos résultats montrent un remarquable parallélisme entre la régulation de l'opéron flhdc par h-ns et par les conditions environnementales, impliquant les effets locaux d'h-ns sur la topologie de l'ADN. La présence de régions régulatrices similaires dans les opérons homologues à flhdc,
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Gourdon, Geneviève. "Etude des mécanismes intervenant dans le contrôle transcriptionnel de l'expression des gènes de globines α humaines." Lyon 1, 1990. http://www.theses.fr/1990LYO10183.
Full textAbstract:
L'ensemble de nos resultats suggere que la regulation transcriptionnelle des genes de globines alpha humaines dans les cellules erythroides est vraisemblablement, au moins en partie, assuree par les memes facteurs nucleaires (nfe1 et/ou nfe2) que les autres genes de globines. Il demontre toutefois que les regions fixatrices de ces facteurs, situees en 5 et 3 des genes alpha, sont insuffisantes pour permettre une regulation complete de ces genes en dehors de leur contexte chromosomique naturel
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North-Chassande, Sophie. "Contrôle transcriptionnel de l'expression du gène CDC2 au cours du développement de la neurorétine de caille." Lyon, École normale supérieure (sciences), 1996. http://www.theses.fr/1996ENSL0035.
Full textAbstract:
Au cours du développement de la neurorétine aviaire, l'expression du gène CDC2 chute entre les jours 7 et 9. L'arrêt de transcription de ce gène, codant pour une protéine clé du cycle cellulaire, pourrait être un des éléments déterminant pour l'arrêt de prolifération des précurseurs neuronaux qui survient à cette période du développement. Pour étudier ce mécanisme, nous avons cloné le promoteur du gène cdc2 de caille. Ce promoteur sans boîte TATA, possède deux boîtes CAT et divers éléments cis-régulateurs potentiels. L'étude de ce promoteur nous a permis de définir deux éléments nécessaires à la régulation transcriptionnelle de CDC2 au cours du développement: ― le site E2F permet l'expression du gène CDC2 par le facteur E2F-1 aux stades précoces de développement de la rétine. ― le site Ig permet l'activation indirecte du promoteur par c-myc et son activation directe par une protéine de la famille des facteurs de transcription de type HLH apparentée à la protéine Fos Interacting Protein. Ce motif semble impliqué de façon différentielle dans la régulation de l'expression de CDC2 au cours du cycle cellulaire et de la différenciation. Aux stades précoces de développement, FIP et E2F activent la transcription du gène CDC2. A partir de E7, la forme hypophosphorylée de pRb devient prédominante dans les cellules de rétine. Cette protéine se fixe sur ces deux facteurs et bloque ainsi leur effet activateur. À plus long terme, l'arrêt de l'expression de E2F-1 et la disparition de l'activité de liaison au DNA sur le motif Ig, observés dans les rétines à 10 jours, conduisent à l'extinction définitive de l'expression du gène CDC2. Ce modèle de régulation de l'expression du gène CDC2 permet d'expliquer l'arrêt définitif de l'expression de ce gène au cours du développement, un des événements nécessaires au maintien des neurones à l'état quiescent.
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Pescador, Salas Nazario. "Contrôle de l'expression du gène de la protéine de régulation rapide de la stéroïdogénèse pendant la lutéinisation." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 1999. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk2/ftp02/NQ42269.pdf.
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Le, Roux Frédérique. "Latence et réactivation du virus d'Epstein-Barr : contrôle de l'expression de EB1, régulateur clé du cycle productif." Lyon 1, 1995. http://www.theses.fr/1995LYO1T213.
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Renouf, Sylvie. "Contrôle de l'expression du gène de l'argininossucinate lyase dans les hépatocytes de rat pendant la période périnatale." Rouen, 1993. http://www.theses.fr/1993ROUES004.
Full textAbstract:
Le contrôle de l'expression du gène de l'ASL dans le foie de rat, est étudié par analyse en northern blot de son messager pendant le développement. L'ARNm de l'ASL s'accumule dans le foie foetal dès 15,5 jours de gestation, il s'accumule progressivement jusqu'au terme pour atteindre un taux maximum après la naissance. Cette évolution pendant la période périnatale est parallèle à celle de l'activité enzymatique. In vitro, l'apport de dexaméthasone aux hépatocytes foetaux cultivés entraîne à tous les stades une augmentation du taux d'ARNm. L'effet du stéroïde peut être inhibé par l'apport simultané d'actinomycine D ou de puromycine. Ces résultats suggèrent une action du stéroïde au niveau transcriptionnel, avec la synthèse d'une ou de plusieurs protéines intermédiaires, l'apport de glucagon ou de Bt2 provoque une augmentation rapide du taux d'ARNm. L'utilisation d'inhibiteurs de transcription et de traduction tendent à montrer un effet transcriptionnel direct du nucléotide cyclique. L'addition d'insuline inhibe totalement l'effet de la dexaméthasone in vivo et in vitro. Ainsi, le faible taux d'ARNm pendant la vie foetale peut être en partie expliqué par la forte insulinémie foetale en fin de gestation. La faible expression du gène de l'ASL pendant la vie foetale pourrait être liée à un état hyperméthyle du gène. L'injection de 5'-azacytidine provoque à tous les stades une augmentation prématurée du taux d'ARNm. Pendant le développement, l'expression du gène de l'ASL est soumis à un contrôle multihormonal mais un autre niveau de contrôle lié à la méthylation est également envisagé
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Guillin, Olivier. "Le Brain-derived neurotrophic factor contrôle l'expression du récepteur D3 de la dopamine : implications dans la sensibilisation." Paris 6, 2002. http://www.theses.fr/2002PA066169.
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Hommais, Florence. "Contrôle Collectif de l'Expression des Gènes en Réponse au pH Acide chez les Bactéries à Gram Négatif." Paris 7, 2001. http://www.theses.fr/2001PA077087.
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Archer, Amena. "Rôle des récepteurs nucléaires HNF-4α et HNF-4γ dans le contrôle de l'expression de gènes entérocytaires." Paris 6, 2005. http://www.theses.fr/2005PA066472.
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Subramanian, Murugan. "Fonction de la protéine "Fragile x mental retardation" dans le contrôle de l'expression des ARN messagers neuronaux." Strasbourg, 2009. https://publication-theses.unistra.fr/restreint/theses_doctorat/2009/SUBRAMANIAN_Murugan_2009.pdf.
Full textAbstract:
Le syndrome de l’X-fragile (FXS) représente la forme la plus fréquente de retard mental héréditaire. Ce syndrome est dû à l’absence de la protéine Fragile X Mental Retardation (FMRP), une protéine de liaison aux ARN impliquée dans plusieurs aspects du métabolisme des ARNm. L’absence de FMRP chez les patients FXS et dans le modèle souris de la pathologie conduit à des altérations de la morphologie des épines dendritiques des neurones corticaux et à des altérations de la plasticité synaptique. La synthèse des protéines synaptiques, qui est essentielle à la plasticité synaptique, est altérée dans les neurones de souris FXS. Ainsi, FMRP, grâce à ses propriétés de liaison aux ARN, apparaît comme un acteur clé du contrôle de la traduction synaptique. Le rôle exact de FMRP dans ce processus demeure incompris. Cette thèse a visé à mieux comprendre le rôle moléculaire de FMRP dans le métabolisme des ARNm neuronaux et en particulier dans le transport et la traduction des ARNm. Plusieurs aspects du métabolisme des ARNm ont été abordés. Dans un premier temps, nous avons étudié le lien possible entre FMRP et la régulation de la traduction par les micro-ARN [. . . ] Dans un deuxième temps, nous avons entrepris de caractériser les cibles ARNm neuronales de FMRP en relation avec le phénotype dendritique du FXS […] Dans la troisième partie de ce travail, nous avons étudié la localisation intracellulaire de FMRP avec elle-même (dimérisation) et avec ses interacteurs (FXR1, FXR2, CYFIP1/Sra1, CYFIP2) en cellules vivantes en utilisant la méthode de complémentation de fluorescence bimoléculaire (BiFC) […] Enfin, nous avons étudié le rôle du paralogue de FMRP, FXR1P, une protéine de liaison aux ARN importante pour le développement normal des muscles squelettiques et du coeur [. . . ]Fragile X syndrome (FXS) is the most common form of inherited mental retardation and is due to the lack of the expression of Fragile X Mental Retardation protein (FMRP). FMRP is a RNA-binding protein involved in several steps of RNA metabolism. Data from fragile X patients and from the fragile X mouse model revealed abnormalities of the dendritic spines and of the synaptic plasticity. Synaptic protein synthesis, which underlies synaptic plasticity, is altered in the fragile X mouse model. Thus, FMRP, due to its RNA binding properties, appears as a key actor in the control of local mRNA translation in dendrites. The exact role of FMRP in this process remains however unclear. This thesis aimed at characterizing the exact molecular function of FMRP in neuronal mRNA metabolism and in particular in the transport and local translation of mRNAs. In a first part, we studied the previously proposed link between FMRP and translation regulation by miRNAs. [. . . ] In a second part, we characterized some neuronal mRNA target of FMRP relevant to the dendritic phenotype of FXS. […]In a third part, we studied the intracellular localization of FMRP with itself (dimerization) and its interactors (FXR1, FXR2, CYFIP1/Sra1, CYFIP2) in living cells using the bi-molecular fluorescence complementation assay (BiFC) […] Finally, we studied the role of FMRP paralogue, FXR1P, an RNA binding protein important for heart and skeletal muscle development [. . . ]
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Lema, Ingrid. "Contrôle post-transcriptionnel de l'expression rénale du récepteur minéralocorticoide par les variations de tonicité extracellulaire : conséquences physiopathologiques." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2016. http://www.theses.fr/2016SACLS290.
Full textAbstract:
L’aldostérone et le Récepteur Minéralocorticoïde (MR) participent au contrôle de la balance hydrosodée et de la pression artérielle. Les altérations de l’expression du MR ou de la signalisation minéralocorticoïde sont associées à de nombreuses pathologies chez l’Homme. Dans ce travail, nous avons démontré, le rôle majeur de protéines de liaison à l’ARN, Tis11b et HuR, dans le contrôle post-transcriptionnel de l’expression du MR en réponse aux variations de tonicité extracellulaire dans un modèle de cellules principales rénales et chez la souris. L’hypertonicité (500 mOsmol/L) induit l’expression de la protéine Tis11b, qui lie la région 3’-non traduite du transcrit MR afin d’accélérer sa dégradation, diminuant ainsi l’expression rénale de la protéine MR et de la signalisation minéralocorticoïde. A l’opposé, l’hypotonicité (150 mOsmol/L) stimule la translocation nucléo-cytoplasmique de HuR, qui stabilise le transcrit MR, augmentant ainsi l’expression du MR et la sensibilité rénale à l’aldostérone. De plus, HuR est responsable de l’édition d’un nouveau variant d’épissage du MR, le variant MR Δ6, obtenu par l’exclusion de l’exon 6.Ce variant d’épissage exerce un effet dominant négatif sur la signalisation minéralocorticoïde. Enfin, l’identification de microARN modulés par l’hypertonicité suggère leur rôle potentiel dans le contrôle de la signalisation minéralocorticoïde rénale. La caractérisation de ces mécanismes inédits modulant l’action du MR améliore notre compréhension de la physiopathologie de la signalisation minéralocorticoïde, et pourrait aboutir, à terme, à de nouvelles stratégies thérapeutiquesAldosterone and the Mineralocorticoid Receptor (MR) participate to the control of salt and water balance and the arterial pressure. Alteration of renal MR expression or mineralocorticoid signaling pathway contributes to the development of numerous human disorders. In this work, we have demonstrated the major role played by the RNA-Binding Proteins, Tis11b and HuR, in the control of MR expression in response to variations of extracellular tonicity in a model of principal tubular cells and in vivo. Hypertonicity (500 mOsmol/L) increases the expression ofTis11b, which binds the 3’-untranslated region of MR transcript and accelerates the degradation of MR transcript, leading to the reduction of the mineralocorticoid signaling. Conversely, hypotonicity (150 mOsmol/L) stimulates nuclear-cytoplasmic shuttling of HuR protein, which stabilizes MR transcript increasing its expression and renal sensitivity to aldosterone action. Furthermore, HuR participates to the editing of the novel MR Δ6 splice variant, which lacks exon 6, and exerts a dominant negative effect on mineralocorticoid signaling. Finally, we have provided evidence that hypertonicity modulates expression of microRNA, which may control mineralocorticoid signaling pathway. Characterization of these original mechanisms modulating MR action is pivotal for a better understanding of mineralocorticoid-related pathophysiology, and should ultimately lead to the development of new therapeutic strategies
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Devaux, Sara. "Recherche de facteurs impliqués dans le contrôle de l'expression des gènes d'antigènes de surface chez Trypanosoma brucei." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2007. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/210740.
Full textAbstract:
Trypanosoma brucei est un parasite unicellulaire qui est transmis d’un hôte mammifère à l’autre par l’intermédiaire de la mouche Tsé-tsé. Au cours de son cycle de vie, il est donc confronté à des environnements extrêmement différents auxquels il s’adapte en modifiant, entre autres choses, ses antigènes de surface. Dans la mouche, l’antigène de surface exprimé est la PROCYCLINE alors que dans le sang des mammifères, l’antigène exprimé est le VSG. Ces protéines sont importantes pour l’adaptation du parasite à son environnement. L’objet de ce travail était de trouver des facteurs impliqués dans le contrôle de l’expression de ces antigènes de surface. Nous nous sommes donc intéressés aux mécanismes de transcription, impliqués dans la régulation de l’expression des gènes. Chez les autres eucaryotes, les gènes codant pour des protéines sont toujours transcrits par une ARN polymérase de type II (Pol II). Les ARN codant pour des protéines subissent en effet une maturation particulière (épissage et polyadénylation) et la machinerie enzymatique nécessaire à cette maturation est spécifiquement recrutée par la Pol II. Une particularité étonnante des gènes de PROCYCLINE et de VSG est qu’ils sont transcrits par une ARN polymérase de type I (Pol I) mais les transcrits résultants sont maturés comme s’ils étaient transcrits par la Pol II. L’hypothèse à la base de ce travail est que la régulation de l’expression des gènes codant pour la PROCYCLINE et le VSG s’effectue via le recrutement, au niveau de la Pol I, d’un/de facteurs normalement associé(s) à la Pol II. Nous avons donc tenté de trouver un lien entre les machineries Pol I et Pol II du parasite. Pour ce faire, nous nous sommes intéressés d’une part au facteur de transcription TFIIH et d’autre part à la machinerie de transcription Pol II du trypanosome.
Le facteur TFIIH est un facteur de transcription qui interagit avec la Pol II mais aussi avec la Pol I chez d’autres eucaryotes. Il nous semblait donc être un bon facteur potentiel de lien entre les deux machineries de transcription. Nous avons dans un premier temps mis en évidence que six des dix sous-unités humaines de ce complexe ont des homologues chez le parasite et que au moins quatre d’entre elles forment un complexe. Nous avons ensuite montré que la présence de TFIIH est importante pour la transcription des gènes Pol II du parasite. Sa fonction dans la transcription des gènes Pol I devra être confirmée.
Par ailleurs, nous avons caractérisé la composition du complexe Pol II du parasite ce qui nous permet de conclure que la composition globale de la Pol II du parasite est conservée par rapport à celle de l’homme et de la levure. Nous avons aussi montré que la sous-unité RPB5 qui interagit avec le complexe Pol II n’est pas la même que celle qui interagit avec le complexe Pol I. Le trypanosome possède en effet deux gènes codant pour deux isoformes de RPB5 (RPB5 et RPB5z) alors que la majorité des eucaryotes ne possèdent qu’un seul variant de cette protéine. Nous avons mis en évidence au cours de ce travail que chaque isoforme était spécifique d’un complexe de polymérase particulier. L’isoforme associée à la Pol II et à la Pol III ressemble à la protéine homologue présente chez l’homme et la levure, tandis que l’isoforme associée à la Pol I diverge de cette isoforme canonique. Le même phénomène a été mis en évidence pour la sous-unité RPB6. La présence d’isoformes divergentes spécifiquement associées à la Pol I du parasite pourraient être liées aux capacités qu’à cette holoenzyme de transcrire des gènes codant pour des protéines.
Enfin, au cours de ce travail, nous avons montré que l’inhibition de la transcription Pol II perturbait l’expression spécifique de stade des gènes codant pour les antigènes de surface. Bien que le mécanisme sous-jacent reste inconnu, il est possible que l’inhibition de la transcription Pol II, créee artificiellement dans nos expériences, mime ce qui ce passe naturellement lorsque le parasite s’apprête à changer de stade.
Doctorat en Sciences
info:eu-repo/semantics/nonPublished
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Placek, Katarzyna. "Contrôle épigénétique de la différentiation des cellules Th humaines." Paris 7, 2010. http://www.theses.fr/2010PA077212.
Full textAbstract:
Dans ce projet nous avons identifié les mécanismes impliqués dans la régulation de l'expression du gène TBET et les changements épigénétiques des locus codant pour les cytokines IL-22, IL-26 et IFN-γ pendant le développement des lymphocytes T auxiliaires (Th) humaines. TBET n'est pas exprimé dans les cellules T naives mais il est induit pendant la différentiation des cellules Thl. Nous avons montré que l'activation des cellules T CD4 induit deux sites hypersensibles à la Dnase I (HS) sur le locus TBET, l'acétylation des histones et l'expression du gène. NFAT activé par TCR est recruté au HS in vivo. IL-12 et IFN-γ ne sont pas suffisant pour induire TBET mais amplifient son expression dans les cellules stimulées par TCR. STAT4 activé par IL-12 est recruté au niveau du troisième HS trouvé dans les cellules Thl. Nous avons montré que les modifications des histones et l'expression du gène TBET sont initiées par NFAT activé en réponse à la stimulation par TCR et sont renforcées par STAT4 activé par IL-12. Ces deux facteurs sont recrutés au niveau de sites distincts sur le locus TBET. Les gènes codants pour les cytokines IL-22 et IL-26 sont localisés à proximité du gène IFNG suggérant leur corégulation. Nous avons trouvé que différentes conditions de stimulation induisent des niveaux d'expression et des niveaux de modifications épigénétiques différentes de ces trois gènes. Les modifications H4ac et H3K4me2 sur les régions régulatrices potentielles de locus IL22/IL26/IFNG sont induites par le TCR et la présence de cytokines peuvent les modifier. L'activation par le TCR n'affecte pas le niveau de PH3K27me3 sur les gènes IL22 et IL26 mais le diminue sur le locus de VIFNGIn this work we study of the factors determining the expression of the T-bet gene, the master regulator of Th type 1 (Thl) cell development and epigenetic changes at the IL22/IL26/IFNG locus during Th cell differentiation. T cell activation induced two strong DNAsel hypersensitive sites (HS) and rapid histone acetylation at these elements in CD4+ T cells. Histone acetylation and T-bet expression were strongly inhibited by CsA and NFAT bound to a HS in vivo. IL-12 and IFN-γ signaling alone were not sufficient to induce T-bet in naive CD4+ T cells, but enhanced T-bet expression in TCR-stimulated cells. A third HS 12kb upstream of the mRNA start site in developing Thl cells was bound by IL-12-activated STAT4. Our data suggest that TBET locus remodeling and gene expression are initiated by TCR-induced NFAT recruitment and amplified by IL-12-mediated STAT4 binding to two distinct distal regulatory elements during human Thl cell development. The IL22 and IL26 genes are located close to the Thl-specific IFNG gene, suggesting that these loci may be coregulated. We found that different stimulation conditions induced transcription and different histone modification pattern of these genes. Permissive H4ac and H3K4me2 were strongly induced by TCR during in vitro differentiation of T helper cells. Cytokines may influence the level of these modifications at potential regulatory elements of IL22/IL26/IFNG locus. In contrast, T cell activation by TCR does not influence the level of H3K27me3 at IL22 and IL26 genes but removes H3K27me3 from the INFG locus. These observations suggest that there are different modes regulating expression of these three genes
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Hocquet, Clémence. "Etude du rôle de Condensine dans le contrôle de l'expression génique chez la levure Schizosaccharomyces pombe." Thesis, Lyon, 2018. http://www.theses.fr/2018LYSEN037.
Full textAbstract:
Condensine est un complexe protéique organisateur du génome qui conduit l’assemblage des chromosomes et promeut leur transmission fidèle en anaphase. De nombreuses études ont rapporté des changements dans les niveaux des ARNs cellulaires quand Condensine est défaillante, suggérant un rôle pour Condensine dans la régulation de l’expression génique. Cependant, les mécanismes sous-jacents sont demeurés énigmatiques, et l’on ignore dans quelle mesure le rôle joué par Condensine dans l’expression génique est lié ou non à sa fonction dans l’organisation des chromosomes. Lors de ma thèse, j’ai étudié l’activité de Condensine dans la régulation de l’expression génique en utilisant la levure S. pombe comme organisme modèle. Contrairement à l’idée communément admise, mes résultats montrent que Condensine ne joue aucun rôle direct dans le maintien du transcriptome, ni en interphase, ni en mitose chez cette levure. En accord avec les études précédentes, j’observe des changements de niveau et de qualité des ARNs dans les cellules mutantes pour Condensine au sortir de la mitose ; des ARNs non codants et des ARNs aberrants, étendus en 3’, s’accumulent. En revanche, je démontre que ces changements sont la conséquence de défauts de transmission des chromosomes en anaphase. L’inactivation de Condensine cause la non-disjonction de l’ADN ribosomique et du nucléole, entrainant une déplétion de l’ARN-exosome des cellules filles, lesquelles accumulent alors des ARNs normalement dégradés par l’ARN-exosome. De façon cruciale, je montre qu’empêcher les anomalies de migration des chromosomes restaure une expression normale des gènes malgré l’inactivation de Condensine, démontrant que c’est l’instabilité chromosomique qui est source des changements d’expression génique observés quand Condensine est défaillante, et non le complexe Condensine en tant que tel. Ce travail remet en question le concept de régulation de l’expression génique par les complexes Condensine et appelle à la prudence lorsque l’on cherche à étudier les fonctions de ces complexes en dehors de la condensation de la chromatine en mitoseCondensin is a genome organiser that shape chromosomes and promote their accurate transmission in anaphase. Several studies have related changes in RNA level when Condensin is defective, suggesting that the complex has also a role in gene expression. However, the mechanisms have remained enigmatic and we still don’t know to what extent it is related to its role in chromosome organization. During my thesis, I studied the role played by Condensin in the regulation of gene expression using S. pombe as a model system. In contrast to previous studies, my results provide compelling evidence that Condensin plays no direct role in the maintenance of the transcriptome, neither during interphase nor during mitosis in this yeast. Accordingly to previous studies, I observed changes in RNA level in cells mutated for Condensin; non coding and 3’ extended RNA accumulate. However, I showed that the changes in gene expression in post-mitotic fission yeast cells that result from Condensin inactivation are largely a consequence of chromosome missegregation during anaphase, which notably depletes the RNA-exosome from daughter cells. Crucially, preventing karyotype abnormalities in daughter cells restores a normal transcriptome despite Condensin inactivation. Thus, chromosome instability, rather than a direct role of Condensin in the transcription process, changes gene expression. This work challenges the concept of gene regulation by canonical Condensin complexes and ask for caution when studying Condensin role outside chromosome condensation in mitosis
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Benayoun, Béatrice. "Etude du contrôle de l'expression et de la fonction du proto-oncogène C-MOS dans le système myogénique." Paris 5, 1997. http://www.theses.fr/1997PA05S024.
Full textAbstract:
Le proto-oncogène C-MOS code pour une protéine serine thréonine kinase, impliquée dans différentes étapes de la maturation des oocytes. Bien qu'étant capable de transformer les fibroblastes nih3t3, elle possède un rôle d'activateur de la différenciation, dans diverses lignées cellulaires. Au cours de la maturation post natale du muscle squelettique de rat, la protéine mos s'accumule pour atteindre un niveau maximal d'expression dans le muscle adulte. Nous avons alors cherche à savoir quel pouvait être son rôle dans la différenciation myogénique, et quel(s) étai(en)t le(s) facteur(s) régulant son expression dans les cellules musculaires. Nos résultats montrent que la protéine MOS possède un domaine interne, hautement conserve chez les mammifères, et possédant une forte similitude de séquence avec la région helice-2 du facteur de transcription ubiquitaire e12. Grace à ce domaine, la protéine MOS interagit physiquement et de manière spécifique avec les facteurs musculaires de type b-hlh (myod, mrf4, myogénine). La kinase mos est alors capable de phosphoryler ces facteurs myogéniques, principalement sur des résidus serines situes en dehors de leur région b-hlh. Ainsi phosphoryles, ces facteurs ne peuvent plus interagir avec l'adn sous forme d'homodimeres inactifs. Par contre la forme hétéromère b-hlh myogénique/e12, active sur la transcription des gènes musculaires, se retrouve alors privilégiée. Ainsi, une surexpression constitutive du proto-oncogène c-mos, dans la lignée de myoblastes de souris c2c12, conduit à une accélération de la différentiation qui se caractérisé par une augmentation de l'expression du facteur myogénique MYOD et des protéines spécifiques du tissus musculaire. Dans les cellules musculaires, la transcription du proto-oncogène C-MOS s'effectue à partir d'un promoteur particulier dépourvu de boite tata, constitue d'une séquence initiatrice riche en résidus pyrimidiques (initiateur). Nous montrons que le facteur de transcription usf-1 (upstream stimulatory factor), appartenant à la famille des b-hlh leucine zipper, est capable d'interagir et de transactiver cette séquence initiatrice. L'ensemble de nos données sont en faveur d'une nouvelle fonction pour la protéine kinase mos, celle de corégulateur positif de l'expression des gènes musculaires.
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Gimenez, Juliette. "Implication de la méthylation dans le contrôle de l'expression de rétrovirus endogènes humains en contextes physiologiques et pathologiques." Thesis, Lyon 1, 2009. http://www.theses.fr/2009LYO10222.
Full textAbstract:
Les rétrovirus endogènes (ERV) sont des éléments constitutifs de la plupart des génomes eucaryotes, et représentent chez l’humain environ 400000 loci. Les HERV sont divisés en familles distinctes, composées d’éléments apparentés mais structurellement hétérogènes. Leur activité peut être néfaste, neutre, mais aussi bénéfique. La majorité des HERV semble silencieuse dans les cellules somatiques. Cependant certains présentent une forte activité en contextes physiologiques. Par ailleurs, une expression significative de HERV est fréquemment observée dans des contextes pathologiques, tels que les cancers. La mise sous silence des éléments répétés est supposée se produire principalement par la méthylation de leur ADN. Nous nous sommes donc intéressés à l’implication de la méthylation des régions régulatrices des HERV, les LTR, dans le contrôle de leur expression. D’une part cette étude nous a permis de mettre en évidence une méthylation locus- et tissu- spécifique de LTR HERV en contexte physiologique, impliquant notamment des modalités particulières de méthylation contrôlant l’expression placentaire de HERV domestiqués. D’autre part ce travail nous a permis de déterminer que six loci HERV-W, incluant un locus domestiqué, sont réactivés de manière autonome dans des tumeurs testiculaires sous l’influence d’un changement de modalité de méthylation intra-famille. Ainsi la méthylation des HERV influence leur expression, mais sous des modalités variables selon les loci et les contextes concernésEndogenous retroviruses are constitutive elements of most eukaryotic genomes. They represent about 400,000 loci in the human genome. HERVs are divided into distinct families on the basis of phylogenetic identities but are highly heterogeneous in structures. Their activity can be detrimental, neutral, or beneficial to the host. Majority of HERVs seems silent in somatic cells. Still, some are highly expressed in physiological contexts. Besides, a significant expression of HERVs is frequently observed in pathological contexts such as cancers. Silencing of repeated elements is supposed to occur mainly through DNA methylation. We were therefore interested by the implication of HERV regulatory region (LTR) methylation in the control of their expression. First, this study identified locus and tissues –specific HERV LTR methylation in physiological context, worth noting particular methylation modalities that control domesticated HERVs placental expression. Second, we could determine a change in intra-family LTR methylation modalities in testicular tumors leading to the autonomous reactivation of six HERV-W loci, among which a domesticated one. Thus methylation clearly influences HERVs expression, but under modalities varying upon the loci and the contexts
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Plante, Lydia. "L'implication de la protéine KDM5A lors de l'expression des gènes sous le contrôle du récepteur à l'oestrogène [alpha]." Mémoire, Université de Sherbrooke, 2011. http://savoirs.usherbrooke.ca/handle/11143/4916.
Full textAbstract:
L'oestrogène joue un rôle important dans plusieurs processus physiologiques, tels la reproduction, le développement et le métabolisme cellulaire. Ses fonctions biologiques sont orchestrées par deux membres de la famille des récepteurs nucléaires, soit les récepteurs de l'oestrogène (ERs) [alpha] et [bêta]. Ceux-ci sont des facteurs de transcription inductibles par leur ligand naturel, le 17 [bêta]-oestradiol (E2). Le mode d'action des ER suggère que les récepteurs stimulent la transcription par le recrutement de différents complexes nécessaires à l'activation des gènes cibles et par la mise en place d'une architecture de la chromatine favorable à l'expression génique. Il est maintenant accepté que les mécanismes épigénétiques, incluant les voies de signalisation impliquant la méthylation et la déméthylation de l'histone H3 sur sa lysine 4, sont essentiels afin d'établir un contrôle de l'expression des gènes cibles d'ERs. Par ces mécanismes, les enzymes impliquées dans cette voie constituent un instrument de régulation versatile et idéal, assurant des changements dynamiques de l'expression des gènes contrôlés par ERs. Par exemple, la di- et tri-méthylation de la lysine 4 de l'histone 3 (H3K4me2/me3) est étroitement associée au promoteur en 5' du gène actif (TSS) et les régions régulatrices de certains gènes. Jusqu'à présent, plusieurs méthyltransférases de H3K4 ont été identifiées et nommées"members of the Mixed Lineage Leukemia". De récentes investigations ont démontré que certaines protéines de ces complexes interagissent avec ER[alpha] et sont impliquées dans l'activation des gènes cibles d'ER[alpha]. Également, ces protéines sont bien connues pour leur rôle de coactivateur de la transcription. Avant 2004, la méthylation des histones était considérée comme une modification stable définie par un programme épigénétique tout comme la méthylation de l'ADN. La découverte d'enzymes possédant une activité déméthylase, agissant sur les résidus lysine des histones, démontre une dynamique plus complexe des modifications épigénétiques. Parmi les déméthylases identifiées, la protéine KDM5a, aussi connue sous le nom de"retinoblastomabinding protein 2" (RBP2), a été identifiée. Cette protéine possède la capacité de retirer la tri-méthylation sur H3K4. De plus, il a été montré que KDM5a pouvait interagir directement avec le domaine de liaison à l'ADN de ER[alpha]. L'implication de la protéine KDM5a dans la voie de signalisation d'ER[alpha] suggère un mécanisme de régulation générale pour la transcription par ER[alpha]. Celle-ci coordonne l'interaction entre les coactivateurs et les corépresseurs tout en contribuant au contrôle de la transcription. Cette étude avait pour but de démontrer le rôle de la protéine KDM5a pour l'expression des gènes régulés par les récepteurs nucléaires tel le récepteur de l'oestrogène [alpha]. Notre hypothèse était que la protéine KDM5a permet l'activation des gènes régulés par le récepteur de l'oestrogène, via la déméthylation de H3K4. Dans cette étude, nous avons montré le rôle coactivateur de la protéine KDM5a pour l'expression des gènes dépendants du ER[alpha]. En effet, la déplétion de la protéine KDM5a dans les cellules MCF-7 a montré une diminution importante de l'expression des gènes contrôlés par ER[alpha]. De plus, les expériences d'immunoprécipitation de la chromatine suivies du séquençage ont montré sa présence au niveau du TSS de l'ensemble des gènes. En outre, sa présence au TSS du gène TFF1, gène modèle pour l'étude sur les récepteurs de l'oestrogène, a été montrée par immunoprécipitation de la chromatine. Également, les études de l'immunoprécipitation de la chromatine ont montré son rôle pour le recrutement du récepteur de l'oestrogène [alpha] et de l'ARN polII. De plus, cette étude a montré que sa présence est nécessaire pour les marques de méthylation H3K4me3/me2. En effet, la diminution de la protéine KDM5a conduit à la perte de ces marques sur le gène TFF1.
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Lenoir, Olivia. "Contrôle du développement des cellules endocrines pancréatiques par les Histones Désacétylases." Paris 7, 2011. http://www.theses.fr/2011PA077125.
Full textAbstract:
Le pancréas permet le maintien de l'homéostasie glucidique, via la sécrétion d'hormones telles que l'insuline et la somatostatine par les cellules endocrines ß et δ, respectivement. Les anomalies de fonctionnement du tissu endocrine peuvent aboutir au diabète. Il est donc crucial de comprendre les mécanismes qui régulent la différenciation des cellules endocrines pour le développement de thérapies du diabète. L'objectif de ma thèse a été de caractériser le rôle des histones désacétylases (HDACs) au cours du développement pancréatique. Les HDACs sont des facteurs épigénétiques qui contrôlent l'expression des gènes en modulant l'état de compaction de la chromatine. Nous avons d'abord utilisé une stratégie globale d'inhibition des HDACs, par des inhibiteurs sur des explants pancréatiques, pour montrer que les HDACs interviennent à des points clés du développement du pancréas. En particulier nous avons montré que les inhibiteurs des HDACs de classe I amplifient le pool de cellules progénitrices endocrines. Afin de déterminer le rôle particulier de certains HDACs, nous avons analysé leur profil d'expression et montré que HDAC4, 5 et 9 sont spécifiquement exprimés dans les cellules endocrines ß et δ. Nous avons également étudié le phénotype pancréatique d'embryons de souris délétés pour Hdac4, 5 et 9 et développé une méthode de transfert de gène médiée par lentivirus afin de surexprimer ces HDACs dans les explants pancréatiques. Nous avons ainsi pu montrer que HDAC4, 5 et 9 contrôlent le lignage des cellules ß/δ. Ces résultats nous permettent de mieux comprendre les mécanismes épigénétiques qui contrôlent la différenciation des cellules pancréatiquesThe pancreas maintains glucose homeostasis, through hormones secretion such as insulin and somatostatin by ß and δ endocrine cells, respectively. The abnormal function of the endocrine tissue can lead to diabetes. Consequently, it is crucial to understand the mechanisms that control endocrine cell differentiation in order to develop new diabetes therapies. The objective of my thesis was to characterize the role of histone deacetylases (HDACs) during pancreas development. HDACs are epigenetic factors that control gene expression by modulating chromatin compaction state. First, we used a global strategy of HDAC inhibition, using HDAC inhibitors on pancreatic explants, to demonstrate that HDACs act at key points during pancreas development. Particularly, we showed that class I HDACs inhibition amplifies the pool of pancreatic endocrine progenitors. In order to identify the role of specific HDACs, we analyzed their expression profile and found that HDAC4, 5 and 9 are specifically expressed in ß and δ cells. Next, we studied the pancreatic phenotype of embryos from mice with a deletion of Hdac4, 5 or 9. We also developed a new model of gene transfer mediated by lentivirus to overexpress these HDACs in pancreatic explants. We demonstrated that HDAC4, 5 and 9 control the differentiation of the ß/δ endocrine lineage. These results allow to better understand the epigenetic mechanisms that control pancreatic cell differentiation
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Ghislin, Stéphanie. "Contrôle épigénétique sur les capacités invasives des cellules tumorales dans le mélanome humain." Paris 7, 2011. http://www.theses.fr/2011PA077224.
Full textAbstract:
Les chimiothérapies actuellement utilisées pour traiter le mélanome métastatique présentent une très faible efficacité, l'étude des mécanismes impliqués dans son développement est donc essentielle pour développer de nouvelles thérapies. Cependant celle-ci est rendue complexe par l'existence d'une importante plasticité, avec des conversions entre phases prolifératives et phases invasives, ces dernières étant associées à une dédifférenciation. Nous avons tout d'abord montré que des cellules de mélanome cultivées en trois dimensions dans un milieu défini pour la culture des neurosphères étaient polarisées vers un état invasif et surexprimaient Oct4 et Nanog. Afin d'expliquer les dérégulations transcriptionnelles observées, nous avons analysé les variations épigénétiques ayant lieu dans ces conditions et mis en évidence des modifications importantes au niveau de l'histone H3. Puis nous avons identifié la protéine PHF19 comme un facteur important dans la conversion phénotypique, mais n'intervenant pas dans la régulation de l'expression de Nanog et Oct4, suggérant l'intervention d'au moins un autre facteur. Ainsi nous avons montré que P-Akt est un inhibiteur de l'expression de ces deux gènes et un activateur de celle de PHF19, suggérant donc un rôle central de la voie Akt dans la conversion phénotypique. Nous avons également cherché à identifier les molécules intervenant dans l'extravasation des cellules de mélanome. Nous avons montré que les lignées de mélanome peuvent exprimer JAM-A et/ou JAM-C, molécules impliquées dans la migration transendothéliale. Ainsi nous avons montré que JAM-A inhibe la transmigration des cellules de mélanome tandis que JAM-C la favoriseThe chemotherapy currently used to treat metastatic melanoma has a very low efficiency, the study of mechanisms involved in its development is essential to develop new therapies. However it is complicated due to the existence of high plasticity, with conversions between proliferative phases and invasive phases, the latter being associated with dedifferentiation. We first showed that melanoma cells cultured in three dimensions in a defined medium for growing neurospheres were polarized to a state invasive and overexpressed Oct4 and Nanog. To explain the observed transcriptional dysregulation, we analyzed the epigenetic changes which take place in these conditions and showed significant changes at the level of histone H3. We then identified the protein PHF19 as an important factor in the phenotypic switching, but not involved in regulating the expression of Oct4 and Nanog, suggesting the involvement of at least another factor. Thus we have shown that P-Akt is an inhibitor of the expression of these two genes and an activator that of PHF19, thus suggesting a central role of Akt pathway in the phenotypic conversion. We also sought to identify some molecules involved in extra vasation of melanoma cells. We have shown that melanoma lines can express JAM-A and/or JAM-C, molecules involved in transendothelial migration in lymphocyte. Thus we have shown that JAM-A inhibits the transmigration of melanoma cells while JAM-C favors
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Pichon, Bruno. "Contrôle de l'expression génique par l'AMPc dans la thyroïde :étude du rôle possible du facteur de transcription NGFI-B." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 1998. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/212050.
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Pons, Eric. "Etude des mécanismes moléculaires du contrôle transcriptionnel de l'expression du gène de la glutathion peroxydase 5 dans l'épididyme murin." Clermont-Ferrand 2, 2003. http://www.theses.fr/2003CLF21439.
Full textAbstract:
Dans le cadre de l'étude de la spécification hormono-dépendante du contrôle de l'expression des gènes, nous avons poursuivi les travaux sur gpx5, le modèle du laboratoire Epididyme et Maturation du Gamète. Ce gène est exprimé strictement dans la tête de l'épididyme de la souris adulte sous contrôle androgénique. Effectivement, des éléments de réponse fonctionnels pour les facteurs de transcription PEA3 et le récepteur des androgènes avaient déjà été localisés dans son promoteur. Après avoir mis en évidence et exploré la fonctionnalité in vitro de motifs cis de type WGATAR dans le promoteur proximal de gpx5, nous avons démontré l'expression de deux facteurs de transcription dans l'épididyme murin, GATA-4 et 6, d'importants acteurs de la différençiation gonadique. Par des expériences de transfections transitoires ex vivo en système hétérologue, nous avons démontré que GATA-4 transactive le promoteur de gpx5, probablement par les motifs conservés en -824 et/ou -937 relativement au site d'initiation de la transcription. GATA-6 inhibe cette activité ex vivo. Parallèment, l'exploitation de lignées murines transgéniques nous a permis de démontrer que les 1 800 paires de bases proximales du promoteur de gpx5 suffisent à induire l'expression ubiquiste d'un rapporteur GFP. Par comparaison avec l'expression restreinte à la tête de l'épididyme d'une construction de 5 000 paires de bases nous suggérons que la région -1800/-5000 du promoteur de gpx5 contient des éléments cis ciblant la transcription dans l'épididyme murin et un silencer modulant celle-ci
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Iwaz, Jean. "Contrôle de la production des interleukines 1 et 2 et de l'expression des antigènes lymphocytaires par l'adénosine monophosphate cyclique." Lyon 1, 1990. http://www.theses.fr/1990LYO1T089.
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