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Dissertations / Theses on the topic 'Cryo-electron tomography, cryo-ultramicrotomy, cryo-planing'

Author: Grafiati
Published: 4 June 2021
Last updated: 1 February 2022

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Gruska, Manuela. "Visualisierung zellulärer Strukturen mittels optimierter Methoden der Kryo-Elektronentomographie." Doctoral thesis, Saechsische Landesbibliothek- Staats- und Universitaetsbibliothek Dresden, 2010. http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:bsz:14-qucosa-33213.

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Abstract:
Die Kryo-Elektronentomographie (Kryo-ET) ermöglicht als einzigartige Methode die dreidimensionale Visualisierung der makromolekularen Struktur von Eis-eingebetteten Zellen in ihrem nativen Zustand [Baumeister 2005; Leis et al. 2009]. Ziel dieser Arbeit war es einen universellen Einsatz der Kryo-ET bei eukaryotischen Zellen zu ermöglichen. Dazu wurden neue Ansätze entwickelt bzw. bestehende Methoden optimiert. Da bei der Anwendung der Tomographie die Probendicke mit jedem Kippwinkel zunimmt, gilt momentan die Probendicke (< 1 µm) als limitierender Faktor bei der Kryo-ET. Während prokaryotische
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Sandin, Sara. "Cryo-electron tomography of individual protein molecules /." Stockholm, 2005. http://diss.kib.ki.se/2005/91-7140-462-7/.

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Wang, Qing. "Protein labels for cellular electron cryo-tomography." Thesis, University of Cambridge, 2011. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.609234.

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4

Palmer, Colin Michael. "A cylindrical specimen holder for electron cryo-tomography." Thesis, University of Cambridge, 2013. https://www.repository.cam.ac.uk/handle/1810/244503.

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Abstract:
The ‘missing wedge’ is a long-standing problem in electron tomography, caused by the use of slab-like flat specimens, which increase in thickness when tilted to high angles. Attempts have been made to reduce the undesirable effects caused by the missing wedge, but the problem remains, particularly for the radiation-sensitive frozen-hydrated specimens used for high resolution imaging. Specimens with cylindrical symmetry offer a way to overcome this problem, since the thickness remains constant at all viewing angles. However, while this has been suggested before, it has never been demonstrated f
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Zanetti, Giulia. "Virus structure studied by cryo-electron tomography and averaging." Thesis, University of Oxford, 2009. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.531795.

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6

Grange, Michael. "Integrative imaging and electron cryo-tomography of viral transport mechanisms." Thesis, University of Oxford, 2016. https://ora.ox.ac.uk/objects/uuid:704e3459-053a-4a1c-b95a-9aaeca809cb2.

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Abstract:
To comprehensively understand a biological process or mechanism from molecule to cell it requires the combination of multiple techniques across a range of resolutions and scales. We currently rely on a variety of different approaches to highlight given aspects of biology that are then interlinked through interpretation. Intracellular transport is a process whereby vesicles and organelles are transported to different parts of cells with a precise spatial and temporal accuracy. This process is often hijacked by viruses, which utilize cellular machineries for active transport to and from the nucl
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7

Turoňová, Beata Verfasser], and Philipp [Akademischer Betreuer] [Slusallek. "Progressive stochastic reconstruction technique for cryo electron tomography / Beata Turoňová ; Betreuer: Philipp Slusallek." Saarbrücken : Saarländische Universitäts- und Landesbibliothek, 2016. http://d-nb.info/1114735000/34.

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Guesdon, Audrey. "Mécanismes moléculaires impliqués dans la liaison des +TIPs aux microtubules." Thesis, Rennes 1, 2013. http://www.theses.fr/2013REN1S196/document.

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Abstract:
Les microtubules (MTs) sont des constituants hautement dynamiques du cytosquelette, impliqués dans de nombreux processus cellulaires tels que la division cellulaire ou le transport d'organites. Leur comportement dynamique est régulé par différents facteurs tels que les +TIPs, qui présentent la particularité de cibler les extrémités en croissance des MTs. Une de ces protéines, EB1, cible de façon autonome ces extrémités et y recrute un grand nombre d'autres +TIPs. Néanmoins, les mécanismes moléculaires impliqués dans cette reconnaissance restent imprécis. Afin de mettre en évidence une caractér
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9

Peukes, Julia [Verfasser], and John [Akademischer Betreuer] Briggs. "Structural studies of influenza A virus by cryo-electron tomography / Julia Peukes ; Betreuer: John Briggs." Heidelberg : Universitätsbibliothek Heidelberg, 2020. http://d-nb.info/1220911593/34.

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Glynn, Anne-Marie. "Cryo-electron tomography of frozen-hydrated sections of supramolecular complexes in Chinese Hamster Ovary Cells." Thesis, University of Dundee, 2008. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.505634.

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Moebel, Emmanuel. "New strategies for the identification and enumeration of macromolecules in 3D images of cryo electron tomography." Thesis, Rennes 1, 2019. http://www.theses.fr/2019REN1S007/document.

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Abstract:
La cryo-tomographie électronique (cryo-ET) est une technique d'imagerie capable de produire des vues 3D de spécimens biologiques. Cette technologie permet d’imager de larges portions de cellules vitrifiées à une résolution nanométrique. Elle permet de combiner plusieurs échelles de compréhension de la machinerie cellulaire, allant des interactions entre les groupes de protéines à leur structure atomique. La cryo-ET a donc le potentiel d'agir comme un lien entre l'imagerie cellulaire in vivo et les techniques atteignant la résolution atomique. Cependant, ces images sont corrompues par un niveau
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Fogelqvist, Emelie. "Laboratory Soft X-Ray Cryo Microscopy: Source, System and Bio Applications." Doctoral thesis, KTH, Biomedicinsk fysik och röntgenfysik, 2017. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-206428.

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Abstract:
Soft x-ray microscopes routinely perform high-resolution 3D imaging of biological cells in their near-native environment with short exposure times at synchrotron radiation facilities. Some laboratory-sized microscopes are aiming to make this imaging technique more accessible to a wider scientific community. However, these systems have been hampered by source instabilities hindering routine imaging of biological samples with short exposure times. This Thesis presents work performed on the Stockholm laboratory x-ray microscope. A novel heat control system has been implemented, improving the stab
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Blum, Thorsten Verfasser], Werner [Akademischer Betreuer] [Gutachter] [Kühlbrandt, and Bernd [Gutachter] Ludwig. "Electron cryo-tomography of macromolecular membrane proteins / Thorsten Blum. Betreuer: Werner Kühlbrandt. Gutachter: Bernd Ludwig ; Werner Kühlbrandt." Frankfurt am Main : Universitätsbibliothek Johann Christian Senckenberg, 2016. http://d-nb.info/1113107650/34.

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Marco, Alex de [Verfasser], and Anne-Claude [Akademischer Betreuer] Gavin. "Analysis of retroviral assembly and maturation using cryo-electron tomography / Alex de Marco ; Betreuer: Anne-Claude Gavin." Heidelberg : Universitätsbibliothek Heidelberg, 2013. http://d-nb.info/1177809427/34.

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Blum, Thorsten [Verfasser], Werner [Akademischer Betreuer] [Gutachter] Kühlbrandt, and Bernd [Gutachter] Ludwig. "Electron cryo-tomography of macromolecular membrane proteins / Thorsten Blum. Betreuer: Werner Kühlbrandt. Gutachter: Bernd Ludwig ; Werner Kühlbrandt." Frankfurt am Main : Universitätsbibliothek Johann Christian Senckenberg, 2016. http://d-nb.info/1113107650/34.

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De, Marco Alex [Verfasser], and Anne-Claude [Akademischer Betreuer] Gavin. "Analysis of retroviral assembly and maturation using cryo-electron tomography / Alex de Marco ; Betreuer: Anne-Claude Gavin." Heidelberg : Universitätsbibliothek Heidelberg, 2013. http://d-nb.info/1177809427/34.

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Michels, Yves. "Reconstruction tomographique d'objets déformables pour la cryo-microscopie électronique à particules isolées." Thesis, Strasbourg, 2018. http://www.theses.fr/2018STRAD031/document.

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Abstract:
La cryo-microscopie électronique à particules isolées est une modalité d’imagerie permettant d’estimer la structure 3D de molécules. L’obtention d’un volume 3D est effectué par des algorithmes de reconstruction tomographique après acquisition par un microscope électronique à transmission d’un ensemble d’images de projection de l’objet observé. Les méthodes de reconstruction tomographique existantes permettent de déterminer la structure des molécules avec des résolutions proches de l’angström. Cependant la résolution est dégradée lorsque les molécules observées sont déformables. Les travaux réa
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Yu, Zhou [Verfasser], Achilleas [Akademischer Betreuer] Frangakis, and Jochen [Akademischer Betreuer] Triesch. "From tomograms to molecular structure : image processing in cryo-electron tomography / Zhou Yu. Gutachter: Achilleas Frangakis ; Jochen Triesch." Frankfurt am Main : Univ.-Bibliothek Frankfurt am Main, 2015. http://d-nb.info/1071235648/34.

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19

Salfer, Maria [Verfasser], and Karl-Peter [Akademischer Betreuer] Hopfner. "Computational methods for the quantitative analysis of membranes in cryo-electron tomography / Maria Salfer ; Betreuer: Karl-Peter Hopfner." München : Universitätsbibliothek der Ludwig-Maximilians-Universität, 2020. http://d-nb.info/1225683009/34.

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Guichard, Paul. "Etude structurale de la morphogénèse du centrosome humain par cryo-tomographie électronique." Paris 6, 2010. http://www.theses.fr/2010PA066440.

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Abstract:
Le centrosome est un organite cellulaire qui joue un rôle majeur dans l'organisation spatiale du réseau de microtubules. Le centrosome est composé de deux centrioles qui ne se dupliquent qu'une seule fois pendant le cycle cellulaire, générant un procentriole en région proximale des centrioles matures. En dépit des rôles essentiels du centrosome, les mécanismes structuraux impliqués dans la duplication du centriole restent largement mal connus. Cette thèse décrit l’assemblage du procentriole humain en utilisant la cryo-tomographie électronique. Dans les centrosomes isolés de cellules KE37, nous
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Gedda, Magnus. "Contributions to 3D Image Analysis using Discrete Methods and Fuzzy Techniques : With Focus on Images from Cryo-Electron Tomography." Doctoral thesis, Uppsala universitet, Centrum för bildanalys, 2010. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-121579.

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Abstract:
With the emergence of new imaging techniques, researchers are always eager to push the boundaries by examining objects either smaller or further away than what was previously possible. The development of image analysis techniques has greatly helped to introduce objectivity and coherence in measurements and decision making. It has become an essential tool for facilitating both large-scale quantitative studies and qualitative research. In this Thesis, methods were developed for analysis of low-resolution (in respect to the size of the imaged objects) three-dimensional (3D) images with low signal
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Ihiawakrim, Dris. "Etude par les techniques avancées de microscopie électronique en transmission de matériaux fragiles." Thesis, Strasbourg, 2019. http://www.theses.fr/2019STRAE005/document.

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Abstract:
Le travail présenté dans ce manuscrit a montré l’importance du développement méthodologique et technique pour identifier et débloquer les verrous empêchant l’analyse de matériaux hybrides et complexes qui se dégradent sous irradiation par un faisceau d’électrons. Nous avons mis en évidence que des dégâts sur l’échantillon produits par les électrons n’apparaissent qu’au-dessus d'un certain seuil de densité de courant électronique qui dépend de la nature du matériau et de ses caractéristiques morphologiques et structurales. Ces développements couplés à la Cryo-EM, nous ont permis de mettre en év
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Kepsutlu, Burcu. "Interaction of Biologically Relevant Nanoparticles with Cells Studied by Cryo Soft X-Ray Tomography." Doctoral thesis, Humboldt-Universität zu Berlin, 2019. http://dx.doi.org/10.18452/19803.

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Abstract:
In dieser Arbeit, wurden Endozytose und intrazellulären Transportwegen für zwei verschiedene biologisch relevante Nanopartikel (dendritisch Polyglycerolsulfat (dPGS-np) und Polyethylenimin beschichtete Goldnanopartikel (PEI-np)) mit Kryo-Röntgentomographie untersucht. Diese Untersuchungen zeigten, beide Nanopartikeln über Makropinozytose endozytiert werden und dass die meisten Nanopartikel in Endosomen, multivesikulären Körpern und Lysosomen lokalisiert sind. Trotz dieser Ähnlichkeiten im Verhalten beider Partikel gab es auch Unterschiede die zeigten. Im Gegensatz zu PEI-np, wurden einige dPGS
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Asano, Shoh Michael [Verfasser], Wolfgang [Akademischer Betreuer] Baumeister, Bram [Akademischer Betreuer] Koster, and Matthias [Akademischer Betreuer] Rief. "Electron Cryo-Tomography Studies of Mammalian Neurons / Shoh Michael Asano. Gutachter: Bram Koster ; Matthias Rief ; Wolfgang Baumeister. Betreuer: Wolfgang Baumeister." München : Universitätsbibliothek der TU München, 2015. http://d-nb.info/1073642631/34.

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Schrod, Nikolas Johannes [Verfasser], Wolfgang [Akademischer Betreuer] [Gutachter] Baumeister, and Matthias [Gutachter] Rief. "From Axons to Synapses: Cryo-Electron Tomography of Neurons / Nikolas Johannes Schrod ; Gutachter: Matthias Rief, Wolfgang Baumeister ; Betreuer: Wolfgang Baumeister." München : Universitätsbibliothek der TU München, 2016. http://d-nb.info/1117796663/34.

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Kämmerer, Sahradha [Verfasser], Wolfgang [Akademischer Betreuer] Baumeister, Martin [Gutachter] Zacharias, and Wolfgang [Gutachter] Baumeister. "Prospects for Visual Proteomics using in situ cryo-electron tomography / Sahradha Kämmerer ; Gutachter: Martin Zacharias, Wolfgang Baumeister ; Betreuer: Wolfgang Baumeister." München : Universitätsbibliothek der TU München, 2018. http://d-nb.info/1195140738/34.

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Ibrahim, Rana. "Caractérisation de structures centriolaires par tomographie électronique et cryo-Microscopie Electronique à Transmission." Paris 6, 2008. http://www.theses.fr/2008PA066315.

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Tan, Aaron Wai Kit [Verfasser], and John [Akademischer Betreuer] Briggs. "Structural insights into HIV-1 capsid assembly, maturation and stability by cryo-electron tomography / Aaron Wai Kit Tan ; Betreuer: John Briggs." Heidelberg : Universitätsbibliothek Heidelberg, 2020. http://d-nb.info/1223308332/34.

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Tan, Aaron Wai Kit [Verfasser], and John A. G. [Akademischer Betreuer] Briggs. "Structural insights into HIV-1 capsid assembly, maturation and stability by cryo-electron tomography / Aaron Wai Kit Tan ; Betreuer: John Briggs." Heidelberg : Universitätsbibliothek Heidelberg, 2020. http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:bsz:16-heidok-275271.

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Prabhu, David. "Automated Plaque Characterization of Intravascular Optical Coherence Tomography (IVOCT) Images Using 3D Cryo-image/Histology Validation." Case Western Reserve University School of Graduate Studies / OhioLINK, 2019. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=case1556293860943414.

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Chen, Yuxiang Verfasser], Nassir [Akademischer Betreuer] [Navab, and Wolfgang [Akademischer Betreuer] Baumeister. "3D Image Processing for Structural Analysis of Macromolecules Using Cryo-Electron Tomography / Yuxiang Chen. Gutachter: Nassir Navab ; Wolfgang Baumeister. Betreuer: Nassir Navab." München : Universitätsbibliothek der TU München, 2015. http://d-nb.info/1075595967/34.

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32

Katzmann, Emanuel. "Cryo-electron tomographic and genetic analysis of the actin-like MamK cytoskeleton during magnetosome chain assembly and division of Magnetospirillum gryphiswaldense." Diss., lmu, 2012. http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:bvb:19-153319.

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Le, Bihan Olivier. "Etude par microscopie électronique des mécanismes d'action de vecteurs synthétiques pour le transfert de gènes." Thesis, Bordeaux 1, 2009. http://www.theses.fr/2009BOR13972/document.

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Abstract:
La grande majorité des essais cliniques de transfert de gènes in vivo utilise des vecteurs viraux. Si ces derniers sont efficaces, ils présentent des risques immunogènes, toxiques, voire mutagènes avérés. Les vecteurs synthétiques (non viraux), par leur grande modularité et leur faible toxicité représentent une alternative très prometteuse. Le principal frein à leur utilisation est leur manque d’efficacité. L’objectif majeur de ce travail de thèse a été de comprendre le mécanisme de transfert de gènes associé à différents complexes vecteurs synthétiques/ADN plasmidique, ce qui est indispensabl
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Bollschweiler, Daniel [Verfasser], Wolfgang [Akademischer Betreuer] Baumeister, and Sevil [Akademischer Betreuer] Weinkauf. "Study of the archaeal motility system of Halobacterium salinarum by cryo-electron tomography / Daniel Bollschweiler. Betreuer: Wolfgang Baumeister. Gutachter: Sevil Weinkauf ; Wolfgang Baumeister." München : Universitätsbibliothek der TU München, 2015. http://d-nb.info/1081487577/34.

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Schäfer, Tillman [Verfasser], Wolfgang [Akademischer Betreuer] Baumeister, Sevil [Gutachter] Weinkauf, and Wolfgang [Gutachter] Baumeister. "Correlative cryo-electron tomography studies of artificial beta-protein aggregates in mammalian cells / Tillman Schäfer ; Gutachter: Sevil Weinkauf, Wolfgang Baumeister ; Betreuer: Wolfgang Baumeister." München : Universitätsbibliothek der TU München, 2018. http://d-nb.info/1174305479/34.

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Pöge, Matthias [Verfasser], Wolfgang [Akademischer Betreuer] Baumeister, Matthias [Gutachter] Feige, and Wolfgang [Gutachter] Baumeister. "The nanoscale architecture of the mouse rod outer segment elucidated by cryo-electron tomography / Matthias Pöge ; Gutachter: Matthias Feige, Wolfgang Baumeister ; Betreuer: Wolfgang Baumeister." München : Universitätsbibliothek der TU München, 2021. http://d-nb.info/123878173X/34.

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Nguyen, David. "Etude de la nucléation contrôlée de latex polymère à la surface de nanoparticules d’oxyde pour l’élaboration de colloïdes hybrides structurés." Thesis, Bordeaux 1, 2008. http://www.theses.fr/2008BOR13715/document.

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Abstract:
Des colloïdes à base de silice et de polystyrène ont été synthétisés. Les particules d’oxyde ont d’abord été élaborées et modifiées en surface, puis ont servi de germes au cours d’une étape de polymérisation du styrène. Deux procédés de polymérisation en phase hétérogène ont été utilisés (émulsion ou dispersion) menant à des colloïdes aux morphologies originales et contrôlées. Une étude morphologique par tomographie électronique a permis de mieux comprendre les mécanismes de croissance et d’organisation des particules de latex autour des germes de silice. La synthèse de particules Janus pour l
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Katzmann, Emanuel [Verfasser], and Dirk [Akademischer Betreuer] Schüler. "Cryo-electron tomographic and genetic analysis of the actin-like MamK cytoskeleton during magnetosome chain assembly and division of Magnetospirillum gryphiswaldense / Emanuel Katzmann. Betreuer: Dirk Schüler." München : Universitätsbibliothek der Ludwig-Maximilians-Universität, 2012. http://d-nb.info/1031381058/34.

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Desert, Anthony. "Colloïdes hybrides silice/polystyrène de morphologie contrôlée." Phd thesis, Université Sciences et Technologies - Bordeaux I, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00949569.

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Abstract:
Les molécules colloïdales peuvent être décrites comme des agrégats robustes de particules sphériques prenant la forme de certaines molécules simples. La préparation de suspensions de molécules colloïdales est étudiée afin d'obtenir de hauts rendements en morphologie et des distributions étroites en taille des objets, conditions indispensables pour envisager de futures applications comme leur assemblage et l'élaboration de matériaux. La stratégie repose sur l'introduction de germes de silice fonctionnalisés dans une polymérisation en émulsion du styrène, menant à la nucléation-croissance d'un n
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Limage, Stéphanie. "Relations entre propriétés et structures dans les émulsions stabilisées par un mélange de tensioactifs et de nanoparticules." Thesis, Aix-Marseille 3, 2011. http://www.theses.fr/2011AIX30053.

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Abstract:
Ce travail de thèse s’inscrit dans le cadre du projet ISS/FSL/FASES dont l’objectif est de comprendre les mécanismes de vieillissement des émulsions en microgravité. Ce manuscrit est dédié à l’étude au sol des émulsions de ce projet et notamment de celles stabilisées par des mélanges tensioactifs/nanoparticules. Ces émulsions sont diluées et constituées d’une phase continue d’huile de paraffine et d’une phase dispersée aqueuse contenant un tensioactif et des nanoparticules. Leur étude et leur caractérisation est réalisée par microscopie tomographique optique et cryo-microscopie électronique à
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Trépout, Sylvain. "Etude de l'assemblage du système d'efflux membranaire MexAB-OprM impliqué dans la résistance aux antibiotiques chez Pseudomonas aeruginosa : caractérisation combinée par Microbalance à cristal de quartz avec mesure de dissipation et cryo-tomographie électronique." Thesis, Bordeaux 1, 2008. http://www.theses.fr/2008BOR13710/document.

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Abstract:
Pseudomonas aeruginosa est une bactérie Gram-négative qui présente une grande résistance aux antibiotiques, lui permettant de sévir dans le milieu hospitalier en infectant plus particulièrement les patients immunodéprimés. Cette résistance est principalement due au système d’efflux membranaire MexAB-OprM, capable d’exporter les antibiotiques en dehors de la cellule. Cette pompe à efflux est composée de trois protéines, MexA, MexB et OprM, incorporées dans les membranes internes et externes de la paroi bactérienne. Les structures de MexA, OprM et AcrB -une protéine présente chez E. coli, homolo
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Kepsutlu, Burcu [Verfasser], Matthias [Gutachter] Ballauff, Gerd [Gutachter] Schneider, and Helge [Gutachter] Ewers. "Interaction of Biologically Relevant Nanoparticles with Cells Studied by Cryo Soft X-Ray Tomography / Burcu Kepsutlu ; Gutachter: Matthias Ballauff, Gerd Schneider, Helge Ewers." Berlin : Humboldt-Universität zu Berlin, 2019. http://d-nb.info/1188713205/34.

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Phan, Minh-Son. "Contribution à l'estimation de la similarité dans un ensemble de projections tomographiques non-orientées." Thesis, Strasbourg, 2016. http://www.theses.fr/2016STRAD041/document.

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Abstract:
La cryo-microscopie électronique est une technique tomographique permettant de reconstituer la structure 3D d’un objet complexe en biologie à partir d’un jeu d’acquisitions. Ces images de l’objet complexe sont appelées les projections et sont acquises sous orientations inconnues. Un des avantages de la cryo-microscopie électronique est l’obtention d’un modèle 3D de très haute résolution de l’objet dans un état naturel. La procédure de reconstruction comporte plusieurs étapes telles que l’alignement, la classification des projections, l’estimation de leurs orientations et le raffinement des pro
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Nguyen, David. "Etude de la nucléation contrôlée de latex polymère à la surface de nanoparticules d'oxyde pour l'élaboration de colloïdes hybrides structurés." Phd thesis, Université Sciences et Technologies - Bordeaux I, 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00384507.

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Abstract:
Des colloïdes à base de silice et de polystyrène ont été synthétisés. Les particules d'oxyde ont d'abord été élaborées et modifiées en surface, puis ont servi de germes au cours d'une étape de polymérisation du styrène. Deux procédés de polymérisation en phase hétérogène ont été utilisés (émulsion ou dispersion) menant à des colloïdes aux morphologies originales et contrôlées. Une étude morphologique par tomographie électronique a permis de mieux comprendre les mécanismes de croissance et d'organisation des particules de latex autour des germes de silice. <br />La synthèse de particules Janus
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Trépout, Sylvain Lambert Olivier. "Etude de l'assemblage du système d'efflux membranaire MexAB-OprM impliqué dans la résistance aux antibiotiques chez Pseudomonas aeruginosa caractérisation combinée par Microbalance à cristal de quartz avec mesure de dissipation et cryo-tomographie électronique /." S. l. : Bordeaux 1, 2008. http://ori-oai.u-bordeaux1.fr/pdf/2008/TREPOUT_SYLVAIN_2008.pdf.

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Huisman, Maximiliaan. "Vision Beyond Optics: Standardization, Evaluation and Innovation for Fluorescence Microscopy in Life Sciences." eScholarship@UMMS, 2019. https://escholarship.umassmed.edu/gsbs_diss/1017.

Full text
Abstract:
Fluorescence microscopy is an essential tool in biomedical sciences that allows specific molecules to be visualized in the complex and crowded environment of cells. The continuous introduction of new imaging techniques makes microscopes more powerful and versatile, but there is more than meets the eye. In addition to develop- ing new methods, we can work towards getting the most out of existing data and technologies. By harnessing unused potential, this work aims to increase the richness, reliability, and power of fluorescence microscopy data in three key ways: through standardization, evaluat
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(5929526), Scott C. Bolton. "Quaternary Structure Analysis of Calcium/Calmodulin-Dependent Protein Kinase II Alpha by Cryo-Electron Microscopy." Thesis, 2019.

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Abstract:
<div><div><div><p>Calcium-dependent protein kinase II alpha (CaMKIIα) is a highly abundant protein within the hippocampus, the region of the brain responsible for memory and learning. CaMKII has both structural and signaling roles in the regulation of the connective strength of synapses in excitatory neurons. It has a unique structure comprised of twelve subunits that form a dynamic assembly and is highly flexible. Its structural behavior has been shown to affect its activity, and a comprehensive mechanism of structure and function is still not fully understood. The determination of the quater
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Benjamin, Jordan. "Structural studies of human immunodeficiency virus type 1 by cryo-electron tomography." Thesis, 2006. https://thesis.library.caltech.edu/2459/1/JB_thesis.pdf.

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Abstract:
Gag, the major structural component of the type 1 human immunodeficiency virus (HIV-1), comprises the matrix (MA), capsid (CA), nucleocapsid (NC), and p6 proteins, as well as the SP1 and SP2 spacer peptides. In the immature HIV-1 virion, the domains of Gag are arranged radially with the amino-terminus of MA at the membrane. Mature viral particles are formed when Gag is proteolytically cleaved, allowing CA to reassemble into the viral core, which contains NC bound to genomic RNA. While the structures of nearly every HIV-1 protein are known in atomic detail from X-ray crystallography and NMR spe
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(6591728), Rui Yan. "The Development of Image Processing Algorithms in Cryo-EM." Thesis, 2019.

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Abstract:
Cryo-electron microscopy (cryo-EM) has been established as the leading imaging technique for structural studies from small proteins to whole cells at a molecular level. The great advances in cryo-EM have led to the ability to provide unique insights into a wide variety of biological processes in a close to native, hydrated state at near-atomic resolutions. The developments of computational approaches have significantly contributed to the exciting achievements of cryo-EM. This dissertation emphasizes new approaches to address image processing problems in cryo-EM, including tilt series alignment
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Hoffmann, Christian [Verfasser]. "Strategies for cryo-electron tomography of the mycobacterial cell envelope and its pore proteins and functional studies of porin MspA from Mycobacterium smegmatis / Christian Werner Hoffmann." 2010. http://d-nb.info/1006985409/34.

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