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Dissertations / Theses on the topic 'Cyanobactéries – France'

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Via-Ordorika, Lorena, and Simone Puiseux-Dao. "Analyse systématique et toxicologique de cyanobactéries isolées dans diverses régions de France." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 1999. http://www.theses.fr/1999MNHN0023.

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Abstract:
En région parisienne une étude de 18 mois a été conduite sur les populations phototrophes de trois rivières qui servent à l'approvisionnement en eau potable. Une première approche a concerné l'analyse de la richesse spécifique et l'estimation de l'abondance relative. En outre, quelques paramètres physico-chimiques ont été analysés statistiquement dans le but de déterminer une éventuelle corrélation avec la diversité. L'attention a été portée particulièrement sur les cyanobacteries à cause de la toxicité de certaines espèces qui prolifèrent dans les plans d'eau. Des cyanobacteries de la région parisienne ainsi que d'autres régions de France ont été isolées afin de les caractériser sur le plan morphologique et physiologique. Cette étude a montré une grande diversité dans la réponse aux conditions étudiées. Pour compléter la caractérisation, une étude génétique a été menée sur des souches potentiellement toxiques de planktothrix agardhii et de microcystis aeruginosa. D'une part, le polymorphisme du domaine its localise entre les gènes 16s et 23s de l'opéron ribosomal a été analyse par amplification et digestion ultérieure des produits pcr (rflp). La discrimination des souches en dessous du niveau de l'espèce montre que ce type d'analyse est un bon outil taxonomique. Une comparaison de divers bioessais de cytotoxicité et d'embryotoxicité ainsi que d'inhibition d'activités enzymatiques a été effectuée. Pour des raisons de facilite de mise en œuvre, ce dernier a été sélectionné pour tester l'ensemble de cyanobactéries, mettant en évidence une grande variation dans le type de réponse
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Maloufi, Selma. "Diversité du phytoplancton et dominance des cyanobactéries : réponse aux pressions anthropiques en milieu périurbain." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2014. http://www.theses.fr/2014MNHN0033.

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Abstract:
L'Etude des patrons biogéographiques du phytoplancton est essentielle pour mieux comprendre la réponse des systèmes aquatiques face aux changements globaux. Pour cela, cette thèse s'est intéressée à évaluer la distribution spatio-temporelle des communautés phytoplanctoniques au sein d'une région présentant de forts gradients environnementaux : la région Ile-de-France. Les travaux présentés dans ce manuscrit se sont organisés autour de trois objectifs : 1) caractériser la diversité du phytoplancton à une échelle locale (diversité-α), entre les sites (diversité-β) et à l'échelle de la région (diversité-γ), 2) identifier les processus et facteurs de contrôle impliquées dans la distribution des communautés phytoplanctoniques via des approches de modélisation, 3) évaluer l'impact de la dominance des communautés des cyanobactéries sur la diversité des communautés phytoplanctoniques
The study of phytoplankton biogeographic patterns is essential to broaden our understanding of the responses of aquatic ecosystems’ to on-going environmental changes. In this context, the work presented in this thesis aimed at evaluating the spatiotemporal distribution of phytoplankton communities within a region exhibiting strong environmental contrasts: he Ile-de-France region. The work presented in this thesis is organized around three main objectives : 1- to characterize at local-scale (i. E. α-diversity), among individual sites (i. E. β-diversity) and at the region-scale (i. E. γ-diversity), 2- to identify the processes and drivers involved in the distribution of phytoplankton communities through modelling approaches, 3- to evaluate the impact of the dominance of phytoplankton communities by cyanobacteria on their diversity
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Catherine, Arnaud. "Déterminisme des efflorescences et de la toxicité des cyanobactéries en milieu périurbain (Ile-de-France)." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2009. http://www.theses.fr/2009MNHN0007.

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Abstract:
Les efflorescences à cyanobactéries toxiques constituent une problématique environnementale et sanitaire émergente dont la prise en compte par les pouvoirs publics s’est accrue ces dernières années. Cependant, les déterminants de la présence d’efflorescences à cyanobactéries et les facteurs contrôlant leur dynamique et leur production de toxines doivent encore être précisés. Dans ce contexte, cette thèse présente l’utilisation d’outils de modélisation mathématique afin de répondre au double objectif de la compréhension (i) des facteurs contrôlant la dynamique de biomasse d’une efflorescence à Planktothrix agardhii ainsi que sa toxicité et (ii) des facteurs impliqués dans la répartition spatiale des cyanobactéries à l’échelle d’une région (Ile-de-France)
Toxic cyanobacterial blooms (cHABs) are considered as an emerging environmental and sanitary issue, which is now more closely considered by local environmental agencies throughout western countries. However, the determinants controlling cyanobacterial blooms spatial distribution, as well as the controlling factors of cyanobacterial blooms dynamics and toxin production, still need to be addressed. In this context, this PhD thesis proposes the use of mathematical modelling approaches to improve our understanding of (i) the factors controlling the dynamics of a Planktothrix agardhii bloom and its toxicity in a shallow periurban pond, and (ii) the factors leading to the spatial distribution of cyanobacterial proliferations at a regional scale (Ile-de-France)
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Briand, Jean-François. "Cyanobactéries toxiques : prolifération et production toxinique de deux espèces de la région parisienne, Cylindrospermopsis raciborskii et Planktothrix agardhii. Développement d'un bio-essai sur neuroblastomes pour la détection des toxines de type PSP." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2001. http://www.theses.fr/2001MNHN0007.

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5

Robin, Joël. "Dynamique saisonnière du phytoplancton en étang de pisciculture de la plaine du Forez (Loire) : essais de contrôle des cyanobactéries." Lyon 1, 1999. http://www.theses.fr/1999LYO10265.

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Abstract:
Les etangs de pisciculture du forez (loire, france) subissent actuellement les effets des fertilisations appliquees regulierement depuis plus de cinquante ans. L'accumulation dans le sediment d'une quantite importante de phosphore apporte sous forme de scories provoque des proliferations de cyanobacteries pendant l'ete. Les biomasses sont parfois importantes, et les consequences souvent desastreuses pour le peuplement piscicole. Suite a l'arret des fertilisations phosphatees (debut 1990), des amendements de chaux (250 kg/ha de cao) ont ete effectues en 1993-1994, pour provoquer le relargage precoce de phosphore et stimuler la croissance des algues presentes a cette periode de l'annee. La diversification temporaire du peuplement observee suite au relargage n'est pas associee a une augmentation de la biomasse algale. La hausse de la teneur en orthophosphates apres le chaulage profite finalement aux cyanobacteries, qui dominent pendant tout l'ete. En 1997-1998, des fertilisations azotees a base d'une solution liquide de nitrate d'ammonium ont ete effectuees pour re-equilibrer le rapport azote/phosphore. Des apports tardifs induisent la diversification du peuplement, avec le developpement pendant l'ete de nombreuses especes de chlorophytes aux depens des cyanobacteries. Jusqu'en 1995, la dynamique estivale se resumait generalement a l'enchainement des genres : volvox aphanizomenon anabaena microcystis. Les apports tardifs d'azote provoquent l'apparition de differents genres de chlorophytes (volvox, chloromonas, scenedesmus, pediastrum,) limitant durablement l'abondance des cyanobacteries. Ces fertilisations a base d'azote directement disponible dans la masse d'eau constituent donc une methode d'intervention efficace et peu onereuse. Non seulement elles limitent la periode a risque constituee par la presence des cyanobacteries, mais elles prolongent la periode de croissance du peuplement piscicole en favorisant un meilleur fonctionnement de la chaine alimentaire.
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Didier, Stéphanie. "Le plancton en étangs piscicoles extensifs : production et exportation." Metz, 2003. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/UPV-M/Theses/2003/Didier.Stephane.SMZ0302.pdf.

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Abstract:
Les étangs piscicoles lorrains extensifs ont été étudiés pour définir les modèles saisonniers de fonctionnement écologique interne. Les relations étang/milieu récepteur ont été abordées dans le cas du plancton de l'étang de Lindre exporté dans la Seille. Dans un même contexte de richesse trohique, la morphologie des étangs influence les modèles saisonniers du plancton. La très faible profondeur permet la colonisation estivale des macrophytes. Dans les étangs plus profonds, des blooms de Cyanobactéries ne peuvent être contrôlés par le zooplancton. La typologie et la richesse trophique de l'étang de Lindre tendent à favoriser un bilan net positif d'exportation de la biomasse planctonique, fortement influencé par la vidange. La partie amont de la Seille représente un challenge environnemental pour le plancton exporté par le Lindre. La dégradation de ce matériel biologique exporté et la dérive d'espèces toxiques nécessite une surveillance accrue de la qualité de la Seille
The aim of the study was to define a descriptive plan of extensive fish-breeding ponds functioning and to understand ponds-river interactions concerning plankton export and drift from the pond of Lindre (Lorraine) through the river Seille. In a same eutrophic context, morphology of ponds influenced the seasonal pattern of plankton. A very low depth allowed summer colonization of hydrophytes. In deeper ponds, Cyano bacteria bloom couldn't be controlled by plankton-exported biomass. But the upstream part of the river Seille represented an environmental challenge for this exported organic matter. The degradation of this planktonic matter, the drift of Cyanobacteria, and especially their death in the upstream part of the river Seille, displayed the necessity of an acute survey with rregard to the incurrent risk (toxicity)
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Romari, Khadidja. "Contribution à l'étude de la diversité cyanobactérienne du tapis microbien de la station thermale de Saint Thomas-les-Bains." Montpellier 2, 2000. http://www.theses.fr/2000MON20065.

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Abstract:
Ce travail propose dans un premier temps l'isolement, la purification de sept cyanobacteries provenant d'un tapis microbien (plancton thermal) de la source d'aigues (station thermale de st thomas les bains, pyrenees orientales). Six de ces isolats ont ete examinees pour leurs proprietes ultra-structurales. Les etudes physiologiques et genetiques ont ete realisees sur 4 souches axeniques. Dans un second temps, nous presenterons nos resultats d'une etude phylogenetique basee sur le polymorphisme de taille et de restriction de la region its (internal transcribed spacer), situee entre les genes 16s et 23s de l'operon ribosomial (rrn). Cette etude a ete menee sur 47 cyanobacteries axeniques de la collection pcc (pasteur culture collection of cyanobacteria) et deux souches du tapis microbien de la source d'aigues. Les resultats obtenus ont montre d'une facon incontestable l'interet de cette region pour realiser des groupements au sein d'un genre ou d'une espece. L'etat des connaissances actuelles sur le thermalisme, les eaux thermo-minerales ainsi que quelques generalites sur les cyanobacteries, sont resumes dans l'apercu bibliographique.
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Latour, Delphine. "Vie planctonique et vie benthique de la Cyanobactérie Microcystis aeruginosa sur la retenue de Grangent (Loire)." Saint-Etienne, 2002. http://www.theses.fr/2002STET4008.

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Abstract:
Malgré une diminution des apports nutritifs, la Cyanobactérie M. Aeruginosa forme chaque fin d'été, dans la retenue hypereutrophe de Grangent (Loire), d'importantes efflorescences. Afin d'identifier les facteurs déclenchant la propagation des colonies dans l'eau et d'approfondir la compréhension du cycle annuel de cette Cyanobactérie, un suivi hebdomadaire adapté a été réalisé dans la colonne d'eau et le sédiment. En hiver, les colonies de M. Aeruginosa s'avèrent extrêmement nombreuses dans les sédiments profonds (jusqu'à 430 col. Ml-1) , en absence de lumière et à 4ʿC. Leur viabilité a par ailleurs été confirmée par la mesure des estérases cellulaires et la présence de cellules en division. Au printemps, ces colonies benthiques reprennent une activité métabolique plus intense qui se manifeste par l'augmentation des teneurs en protéine (> 20ug. ML-1) et de la viabilité (doublée en 1 mois) dans la couche superficielle (0-2 cm) du sédiment. Il s'en suit une chute importante de leur nombre dans le benthos s'expliquant par le passage à la vie planctonique. Ce processus de recrutement semble être stimulé par l'augmentation de la température hypolimnique (≥ 8ʿC). En revanche, l'anoxie totale n'interviendrait pas, mais la réduction des teneurs en oxygène de l'hypolimnion favoriserait la propagation et le développement de M. Aeruginosa dans l'eau. Lorsque les conditions estivales sont favorables, on assiste à la formation de fleur d'eau dans l'épilimnion. Parallèlement, les faibles concentrations en colonies benthiques augmentent lentement suite à la sédimentation des premières Cyanobactéries printanières. Enfin, consécutivement à la chute des températures et au brassage automnal, le déclin de l'efflorescence se traduit par une forte élévation du nombre de colonies en surface du sédiment. Il apparaît ainsi que le cycle annuel de M. Aeruginosa permette de constituer une réserve benthique formant un inoculum susceptible d'initier chaque printemps l'efflorescence de fin d'été
Despite a decrease of nutrient content, the Cyanobacterium M. Aeruginosa, forms blooms every summer in the hypereutrophic Grangent reservoir (Loire). . . [etc. ]
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Barberousse, Hélène. "Etude de la diversité des algues et des cyanobactéries colonisant les revêtements de façade en France et recherche des facteurs favorisant leur implantation." Phd thesis, Museum national d'histoire naturelle - MNHN PARIS, 2006. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00188566.

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Abstract:
Certaines façades présentent des développements verts, rouges ou noirâtres, d'origine biologique. Ces salissures nuisent à l'aspect esthétique du bâtiment et peuvent entraîner à long terme une dégradation structurale du revêtement colonisé. Ce développement biologique peut ainsi engendrer des frais liés au ravalement ou, à plus long terme, à la rénovation de la façade. Des biocides incorporés dans les revêtements permettent actuellement de retarder l'implantation des organismes incriminés. Cependant, les dernières réglementations européennes tendent à restreindre l'utilisation de ces produits, ce qui nécessite la mise au point de matériaux efficaces et durables, de surcroît compatibles avec l'environnement.
Paradoxalement, les algues microscopiques et les cyanobactéries constituant ces biofilms sont peu connues en France. La première approche de ce projet a donc consisté à prélever des fractions de revêtements de façade colonisés afin d'identifier les micro-organismes s'y développant. 22 espèces d'algues et 25 espèces de cyanobactéries ont ainsi été observées dans les 71 prélèvements analysés, les algues étant dominantes sur tous types de matériaux.
Les facteurs favorisant l'implantation et le développement de ces micro-organismes ont ensuite été étudiés. Un traitement statistique des données environnementales recueillies lors de la campagne d'échantillonnage a ainsi mis en évidence l'importance des facteurs climatiques liés à l'humidité, des facteurs permettant la dissémination des spores, tels que le vent ou la proximité de végétation, ainsi que l'importance de la nature du support colonisé. Cette dernière observation a pu être approfondie grâce à l'utilisation d'un banc d'essai permettant l'évaluation simultanée de différents matériaux quant à leur colonisation par des algues et des cyanobactéries isolées en façade au cours de cette étude. Ces essais ont montré que des facteurs tels que la porosité, la rugosité et le pH de surface des matériaux influent sur la colonisation par ces micro-organismes.
En parallèle, afin d'envisager le développement de matériaux défavorisant l'accroche des micro-organismes, les mécanismes d'adhésion d'une sélection d'algues sur des surfaces modèles ont été étudiés à l'aide d'une cellule à flux laminaire. Les surfaces hydrophiles ont provoqué le plus faible taux d'adhésion. L'exploitation de ces résultats a également mis en évidence l'initiation d'interactions hydrophobes et électrostatiques lors du processus d'adhésion.
Finalement, les polymères extracellulaires produits par une sélection de micro-organismes isolés en façade ont été analysés. Ils ont ainsi montré être de nature polysaccharidique, anionique et plus ou moins hydrophobe selon les souches les sécrétant. L'adsorption d'un polymère d'une souche de Klebsormidium flaccidum, algue verte dominante en façades en France, a été plus importante et plus forte sur des surfaces hydrophobes que sur des surfaces hydrophiles. En outre, la dégradation enzymatique des polymères de cette même souche tend à diminuer l'adhésion sur surface hydrophobe. Ces observations confirment donc l'hypothèse d'une intervention des polymères extracellulaires dans l'étape de contact du micro-organisme avec une surface, puis lors de l'étape de consolidation de cette adhésion, par le biais d'interactions hydrophobes et sans doute électrostatiques.
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Bonnet, Marie-Paule. "Fonctionnement d'un écosystème lacustre : modélisation des successions planctoniques de la retenue de Villerest (Loire, France)." Paris, ENMP, 1995. http://www.theses.fr/1995ENMP0001.

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Sabart, Marion. "Variations spatiotemporelles dans la dynamique, la diversité génétique et le potentiel toxique de populations de Microcystis aeruginosa (Cyanobacteria) dans plusieurs écosystèmes aquatiques du centre de la France." Chambéry, 2009. http://www.theses.fr/2009CHAMS039.

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Abstract:
Les proliférations de cyanobactéries dans les milieux aquatiques continentaux représentent un problème environnemental, économique et sanitaire, notamment à cause de la capacité de certains genres à produire des toxines. En étudiant les variations spatio-temporelles de la diversité génétique et du potentiel toxique de populations de la cyanobactérie hépatotoxique Microcystis dans différents types d'écosystèmes aquatiques (retenues, étangs, fleuve) situés dans une même aire géographique, nous avons montré une structuration génétique des populations ainsi que d'importantes différences du potentiel toxique de ces proliférations. L'étude des variations de la structure en taille des colonies de Microcystis et des quotas cellulaires en microcystines en lien avec la stabilité de la colonne d'eau ont suggéré l'importance des colonies de petite taille dans le maintien des populations ainsi que dans la production de microcystines
Proliferations of cyanobacteria in freshwater ecosystems are a source of growing concern because they lead to ecological disturbances and the toxins they produce constitute health risks for animals and human beings. By studying the spatiotemporal variations in genetic diversity and toxic potential of several populations of the hepatotoxic cyanobacterium Microcystis in different kind of freshwater ecosystems located in the same geographical area, we evidenced a genetic structuration of the populations, and great differences in the proportion of potentially microcystinproducing genotypes in these populations. The temporal variations in the population size structure and in the microcystin cellular quotas related to the stability of the water column suggested the importance of small Microcystis colonies in sustaining the populations in unfavourable conditions for growth and also in microcystin production
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Courtinat, Bernard. "Les organoclastes des formations lithologiques du Malm dans le Jura méridional : systématique, biostratigraphie et éléments d'interprétation paléoécologique." Lyon 1, 1987. http://www.theses.fr/1987LYO10038.

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Abstract:
Ce travail porte sur la systematique des organoclastes des formations lithologiques du malm du jura meridional. L'inventaire comprend des scolecodontes, des scytinascias, des spores de champignons, bryophytes et pteridophytes, des pollens de gymnospermes, des dinoflagelles, des acritarches et des restes de cyanobacteries, de filaments et de fructifications fungiques. Des genres et especes nouveaux sont reconnus. L'examen global des sediments organiques permet de degager trois ensembles majeurs caracterises par leur palynofacies.
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Qsair, Zoubida. "Le barrage d'Eguson, cas révélateur de changement de paradigme environnemental : un lac et son bassin face aux enjeux de l'eutrophisation." Thesis, Orléans, 2019. http://intranet.univ-orleans.fr/bibliotheques/theses/zoubida-qsair_4809_vm.pdf.

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Abstract:
Certains lacs-réservoirs subissent une évolution permanente de leurs usages qui varient de la production énergétique à l’usage récréatif : c’est le cas pour le lac du barrage d’Eguzon, appelé aussi lac Chambon, bâti dans les premiers contreforts du Massif central. Malgré une construction très controversée au début du XXe siècle, le barrage semble avoir acquis une acceptabilité sociale par son ancrage socioéconomique dans son territoire. Un des objectifs de la thèse est d’utiliser le cas remarquable de sa longue existence pour comprendre le changement de paradigme environnemental, entre l’époque de sa construction, avec une vision productiviste, et l’époque actuelle, marquée par une valorisation touristique balnéaire en dépit des problèmes environnementaux, son eutrophisation avancée et ses proliférations de cyanobactéries, qui fragilisent son acceptabilité sociale.Pour évaluer l’état trophique du lac Chambon et comprendre le processus de ses proliférations de cyanobactéries, nous avons proposé un nouvel indice de statut trophique composé de cinq variables et l’application d’une approche de géographie limnologique à partir de deux échelles, l’échelle du lac combinée à l’échelle de son bassin hydrographique. Des campagnes de prélèvements ont été menées à ces deux échelles à l’aide de deux procédés limnologiques, bouée thermistance, sonde multi-paramètres ; le suivi de la masse algale par fluorescence, sonde FluoroProbe ; un Photomètre multi-paramètres pour le suivi des nutriments et le Disque de Secchi pour le suivi de la transparence.À l’échelle du lac-réservoir, cette thèse évalue le rôle de son fonctionnement limnique et biochimique dans ses proliférations de cyanobactéries. À l’échelle du bassin versant du lac, ce travail confirme que le lac Chambon est sous l’influence de son bassin versant pour tous les apports, y compris en nutriments. La cause durable de la dégradation de sa qualité de l’eau est le fait de ses tributaires fluviaux, les eaux lacustres n’étant qu’un révélateur du problème, du fait de leur capacité d’auto-épuration moindre
Some reservoir lakes undergo a permanent evolution of their uses; varies from energy production to recreational use; this is the case for the Eguzon dam lake, also called Lac Chambon, built in the foot hills of the Massif Central. Despite a very controversial construction at the beginning of the 20th century, the dam appears to be socially acceptable because of its socioeconomic anchorage in its territory. One of the objectives of the thesis is to use the remarkable case of its long existence to understand the change of environmental paradigm, between the time of its construction, productivist vision, then the current era, marked by a seaside tourism valorization curbed by environmental problems, its advanced eutrophication and its proliferation of cyanobacteria, which weakens its social acceptability.To evaluate the trophic status of Chambon Lake and to understand the process of its cyanobacterial blooms, we proposed a new index of trophic status composed of five variables and the application of a limnological geography approach from two scales, the scale of the lake combined at the scale of its watershed. Sampling campaigns were conducted at these two scales using two limnological methods, buoy thermistance, multi-parameter probe; the monitoring of the algal mass by fluorescence, FluoroProbe; a multi-parameter photometer for monitoring nutrients and the Secchi Disk for monitoring transparency.At the lake-reservoir scale, this thesis evaluates the role of its limnic and biochemical functioning in its cyanobacterial blooms. At the scale of the lake's watershed, this work confirms that Lake Chambon is under the influence of its watershed for all inputs, including nutrients. The long-term cause of the degradation of its water qualityis the fact of its river tributaries, its lacustrine waters being only a revealer of the problem, because of their capacity of less self-purification
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Stefanini, Philippe. "La spiruline : essai anthropologique sur le processus de conversion éthique des agriculteurs varois en quête de sens." Thesis, Aix-Marseille, 2012. http://www.theses.fr/2012AIXM5010.

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Abstract:
Aujourd'hui dans le Var, certains agriculteurs produisent dans des eaux saumâtres une bactérie alimentaire appelée : spiruline. En se formant à cette culture atypique, ces agriculteurs ne visent pas uniquement une production d'avenir, car leur identité est en jeu. Dès lors, leur vision du monde a commencé à changer. Le but de ce travail est d'étudier comment la culture de la spiruline et sa consommation peuvent déclencher notamment par ses représentations et ses pratiques un processus de « conversion éthique » sur ces agriculteurs en quête de sens. Afin de restituer au mieux, une étude anthropologique, nous avons choisi d'investir deux groupes cibles : des agriculteurs qui suivent une formation professionnelle afin de devenir des producteurs de spiruline et des producteurs formés à cette culture. Le protocole ethnographique employé s'attache à récolter les données par des entretiens libres inscrits dans une méthode compréhensive et une observation participante. Cette approche novatrice, mettant en œuvre l'étude de producteurs/consommateurs de spiruline s'avère pertinente. Elle a permis de mettre en évidence une véritable conversion de mes groupes cibles qui ont basculé progressivement d'une singularité biologique à une singularité sociale ancrée dans l'éthique. L'échec professionnel et la crise identitaire qu'ils vivaient, ont été le démarrage de leur démarche introspective et la préparation consciente ou inconsciente à leur rencontre avec la spiruline
Today in the Var some farmers produce in brackish waters a food bacterium called spirulina. By training in this atypical cultivation, these farmers do not only aim at a future turned production: their identity is at stake. From then on, their vision of the world has begun to change. The purpose of this work is to study how spirulina cultivation and its consumption can activate, in particular by its representations and its practices, a process of "ethical conversion" on these farmers in search of meaning sense. To restore at best, an anthropological study, we chose to induct two target groups: Farmers attending a professional training course to become spirulina producers and producers trained in this cultuvation. The applied ethnographical protocol attempts to collect data during free discussions fitting a comprehensive method and a participating observation. This innovative approach, involving spirulina producers /consumers in a study turns out to be relevant. It allowed to bring to light a real conversion of my target groups which gradually swinged from a biological peculiarity to a social peculiarity fixed in the ethics. Their professional failure and the identity crisis they endured turned to be the starting point of their introspective processes, preparing consciously or not their minds for their encounter with spirulina. Then, by learning about the culture of this food and about its consumption, these farmers changed steadily their representations, their behavior and their practices, to finally restructure their life and identity
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Pobel, David. "Les proliférations cyanobactériennes en étangs piscicoles : impact de l'environnement sur la dynamique et génétique des populations et sur la production de toxines." Thesis, Grenoble, 2011. http://www.theses.fr/2011GRENA007.

Full text
Abstract:
Les proliférations de cyanobactéries présentent en général d'importantes variations spatiales et temporelles de leur abondance cellulaire et de leur potentiel toxique, ce qui rend très difficile la surveillance de ces microorganismes et l'estimation des risques sanitaires associés à ces événements. Dans ce cadre général, le premier objectif de ma thèse a été de tester différentes stratégies d'échantillonnage pour suivre au mieux l'évolution des abondances cellulaires lors des proliférations de cyanobactéries. Par un échantillonnage à haute fréquence (six points tous les deux jours) réalisé sur un étang piscicole du Forez, nous avons montré que les deux espèces qui proliféraient dans cet écosystème (Microcystis aeruginosa et Aphanizomenon flos-aquae) présentaient des dynamiques spatiales et temporelles de leur abondance cellulaire très contrastées, ne permettant pas de définir une stratégie d'échantillonnage optimale commune aux deux espèces. Si pour ces deux espèces, trois points d'échantillonnage sont au minimum nécessaires pour bien prendre en compte l'hétérogénéité dans la distribution spatiale des cellules, les fréquences d'échantillonnage optimales sont en revanche très variables, allant d'un échantillonnage mensuel ou bimensuel pour Microcystis à un échantillonnage au minimum hebdomadaire pour Aphanizomenon. Le second objectif de ma thèse a été de m'appuyer sur cette stratégie d'échantillonnage à haute fréquence, pour mieux comprendre le développement de la prolifération de M. aeruginosa. Pour ce faire, nous avons estimé les changements spatiaux et temporels intervenant dans la composition génotypique de la population de cyanobactéries (par utilisation de la SSCP sur l'ITS 16S-23S) et dans sa toxicité potentielle (par le dosage des microcystines et l'évaluation de la proportion de cellules possédant le gène mcyB, un des gènes de synthèse de la microcystine). La répartition spatiale de la composition génotypique s'est révélée homogène à l'échelle de l'étang. Il est également apparu qu'au cours de la phase de croissance de la population, cette composition génotypique subissait de nombreux changements à courte échelle temporelle puis restait stable pendant plusieurs semaines lorsque le maximum d'abondance était atteint. Au niveau du potentiel toxique, la proportion de cellules possédant le gène mcyB est resté proche de 60 % durant toute la prolifération avec toutefois, des variations plus importantes pendant le développement du bloom. Aucune relation n'a pu être établie entre les variations observées dans la composition génotypique de la population et celles dans les proportions de cellules toxiques. De même, aucun lien n'a pu être établi entre les variations de diverses variables environnementales (nutriments, température, pluie) et celles de l'abondance cellulaire, de la toxicité potentielle et de la composition génotypique de la population de Microcystis. L'ensemble de ces résultats suggère que d'autres facteurs et processus interviennent probablement dans ces variations et qu'il existe sans doute des interactions très complexes entre toutes ces variables. Enfin, le troisième objectif de ma thèse a été de comparer la composition génotypique et le potentiel toxique de plusieurs populations de Microcystis plus ou moins connectées entre elles. Cette comparaison a permis de montrer l'importance fondamentale des facteurs et processus environnementaux locaux, dans la mise en place et le développement de ces évènements
Generally, cyanobacteria proliferations show great spatial and temporal variations in their cell abundances and potential toxicity, which makes it difficult to control the development of these microorganisms and to predict the health risks associated with these events. Within this scope, the first goal of my PhD thesis was to test different sampling strategies to guarantee the best monitoring of the cell abundances during cyanobacteria proliferations. We made a high frequency sampling (six points every other day) in a shallow lake located in Forez and we evidenced that the two blooming-species (Microcystis aeruginosa and Aphanizomenon flos-aquae) showed strongly contrasted spatial and temporal patterns of their cell abundances precluding having a common optimal sampling strategy for both species. Even if three sampling points were enough to take into account the spatial heterogeneity of Microcystis and Aphanizomenon cells, a monthly or two-monthly sampling was sufficient for Microcystis whereas a weekly sampling was necessary for Aphanizomenon. The second goal was to gain a better understanding of Microcystis proliferation development. To achieve this aim, we estimated spatial and temporal changes in the genotypic composition (using the SSCP method in the 16S-23S ITS) and in the potential toxicity (by measuring the microcystin concentration and proportion of mcyB+ cells). We obtained a homogeneous spatial repartition of the genotypic composition. Moreover, during the growth phase, there were many rapid changes in the genotypic composition whereas this composition remained stable for several weeks where the maximum cell abundance was reached. As for potential toxicity, the proportion of mcyB+ cells remains at around 60 % during the proliferation but we observed higher variations during the growth phase. No relation was found between the variations of the genotypic composition and proportion of toxic cells on the one hand and the variations of several environmental factors (nutrients, temperature, rain) on the other hand, suggesting that other factors may be involved in these variations and that many complex interactions occur between these factors. Finally, the third goal of my PhD thesis was to compare the genotypic composition and the potential toxicity of different Microcystis populations, which were more or less interconnected. This comparison evidenced the great importance of local environmental factors and processes in the beginning and development of these events
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