Academic literature on the topic 'Découverte de motifs ADN'

Depuis 2003 et la découverte de Mimivirus, la saga des virus géants se poursuit avec l’isolement de nouveaux virus d’amibes qui se répartissent maintenant en sept familles bien distinctes, aux origines toujours aussi mystérieuses que controversées. À la faveur de l’identification de 3 nouveaux membres de la famille des Pandoraviridae, dont les particules de tailles micrométriques et les génomes de plus de 2 mégabases empiètent sur le monde cellulaire, nous avons procédé à une ré-analyse pointilleuses de leur contenu en gènes, aidé par les apports combinés de la transcriptomique, de la protéomique et de la bioinformatique. Nous en avons conclu que le seul scénario capable de rendre compte de la répartition et de l’énorme proportion de gènes orphelins qui caractérisent les Pandoravirus est qu’ils aient été créés de novo au sein des régions intergéniques. Ce processus, peut-être partagé par d’autres grands virus à ADN, vient remettre en question le paradigme central de l’évolution moléculaire selon lequel tous les gènes/protéines ont une histoire.

Pendant plusieurs dizaines d’années après la mise en place des programmes de sélection génétique, la découverte de nouvelles anomalies est restée sporadique. Cela a incité jusqu’à présent les gestionnaires de ces programmes à appliquer une politique d’éradication drastique des reproducteurs porteurs, combinée à la procréation de futurs reproducteurs non porteurs. Mais la situation est en train de changer avec l’avènement de la sélection génomique et des technologies associées, qui permettent de détecter les anomalies plus rapidement et donc en plus grand nombre. Il est donc indispensable de faire évoluer la façon de les prendre en compte dans les programmes de sélection. Un état de la situation dans la population doit d’abord être établi en estimant la fréquence allélique de l’anomalie et en caractérisant le statut des reproducteurs les plus importants avec les tests moléculaires disponibles, en particulier avec les puces à « Single Nucleotide Polymorphism » (SNP). Dans certains cas, une prédiction indirecte, à partir d’haplotypes ou d’imputation, permet de connaître le statut à la mutation des reproducteurs plus anciens avec une forte probabilité sans nécessité de ré-analyser leur ADN. Une fois ce bilan établi, les mesures à prendre dépendent du poids économique des anomalies qui est fonction de deux paramètres, le coût par individu atteint et la fréquence allélique dans la population. La méthode optimale permettant une éradication progressive des anomalies repose sur l’utilisation d’un objectif de sélection combinant les anomalies aux autres caractères. Une phase délicate à gérer, principalement au travers des accouplements, est celle de l’utilisation de reproducteurs porteurs durant la période de transition entre la découverte de l’anomalie et l’éradication complète. Enfin, il est rappelé qu’une mesure simple permettant de limiter l’émergence de nouvelles anomalies est d’utiliser un nombre élevé de reproducteurs tout en restreignant leur taille de descendance.

La découverte de quelques pièces ornementales en ivoire dans une tombe à crémation du premier quart du IIIe s. av. J.-C. se signale par la présence d’un décor de lit funéraire. Il s’agit d’un cas de rituel unique au sein de la nécropole d’Orgamè, celui de l’incinération du défunt à même le lit de prothesis. Cette étude analyse l’origine et la typologique du lit, sa chronologie et les rapprochements entre les éléments du décor préservés à Orgamè et les décors similaires, identifiés sur d’autres sites situés entre la mer Noire et la Méditerranée occidentale. Elle relève les nombreux exemples d’emploi de la même technique et de motifs similaires. Elle met en évidence les coïncidences chronologiques entre les lits funéraires découverts en mer Noire et la famille athénienne de Démos thène impliquée dans la production de lits, ainsi que les relations directes de cette famille avec certaines cités nord-pontiques. Enfin, elle étudie la signification sociale du lit décoré, qui a pour but de faire ranger le jeune défunt au sein de l’élite orgamènienne, à l’exemple des cas livrés par d’autres cités, de sorte que cette découverte constitue un marqueur important pour l’histoire économique du site et de ses réseaux commerciaux.