Dissertations / Theses: 'Dimères'

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Boutillier, Cédric. "Modèles de dimères : comportements limites." Phd thesis, Université Paris Sud - Paris XI, 2005. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00011334.

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Abstract:

Le modèle de dimères est un système de mécanique statistique qui modélise l'adsorption de molécules diatomiques sur la surface d'un cristal, représenté par un réseau périodique plan biparti. On attribue à chaque type d'arête une énergie. Pour une telle distribution d'énergie, il existe une famille à deux paramètres de mesures de Gibbs, dont les comportements sont classifiés en trois phases : gazeuse, liquide, solide.

Dans la première partie, on étudie le comportement d'un tel système près de la transition liquide-solide. En examinant le cas du réseau hexagonal, nous exhibons deux types de comportements limites. Le premier est une collection de chemins aléatoires conditionnés à s'éviter. Le deuxième, le modèle du collier de perles, est un processus ponctuel sur ZxR. Ces deux modèles limites ont pour marginales le processus déterminantal sur R avec noyau sinus, décrivant aussi les valeurs propres des grandes matrices aléatoires de l'ensemble GUE. Le modèle du collier de perles est universel : on montre qu'il est la limite de tout modèle de dimères sur un graphe planaire biparti périodique.

Dans une deuxième partie, on étudie la statistique des motifs dessinés par des dimères. Les fluctuations de densité d'un motif convergent à la limite d'échelle vers un champ gaussien. Dans le cas liquide, l'objet limite est la somme d'une dérivée du champ libre et d'un bruit blanc indépendant. Pour une mesure gazeuse, la limite est juste un bruit blanc.

Enfin, on aborde un problème de dénombrement de chemins sur le graphe-échelle, lié à l'étude du noyau de la chaleur sur le groupe de l'allumeur de réverbères, ainsi qu'à celle des opérateurs de Schrödinger aléatoires.

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Russier, Isabelle. "Etude spectroscopique des dimères de lithium." Lyon 1, 1995. http://www.theses.fr/1995LYO10013.

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Abstract:

Le sujet de ce travail se situe dans le cadre de l'etude des dimeres de lithium. La premiere partie est une presentation de la molecule de lithium, comprenant une revue des travaux anterieurs, entrepris par differents auteurs, sur un grand nombre de ses etats electroniques. Le second chapitre presente une description du montage experimental de double resonance utilise lors des differentes campagnes de manipulation. Les rappels theoriques, necessaires a la comprehension et l'elaboration des traitements utilises, sont donnes dans la troisieme partie. Dans les chapitres suivants, l'etude de deux des etats electroniques de li2 est decrite. L'etat a est l'etat triplet de plus basse energie de li2. Cet etat, qui ne peut etre atteint directement a partir de l'etat fondamental, a ete observe a la fois par fluorescence induite par collision et par double resonance optique-optique facilitee par perturbation. Une nouvelle determination de son energie de dissociation et du nombre quantique effectif de vibration a la dissociation a ete donnee. Le potentiel a longue distance de l'etat b suscite beaucoup d'interet du fait de l'existence d'une barriere de potentiel pres de la dissociation. Cette originalite se traduit sur les spectres par un elargissement significatif des raies par effet tunnel a travers la barriere de potentiel. Le calcul des energies des niveaux elargis, c'est-a-dire des niveaux proches du sommet de la barriere, va nous permettre de determiner la hauteur et la position de celle-ci sur l'axe des distances internucleaires et de preciser la courbe de potentiel dans la region de la barriere. Le nombre considerable de donnees a egalement permis une etude du dedoublement lambda de l'etat b

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Laslier, Benoît. "Dynamique stochastique d'interface discrète et modèles de dimères." Phd thesis, Université Claude Bernard - Lyon I, 2014. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01044463.

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Abstract:

Nous avons étudié la dynamique de Glauber sur les pavages de domaines finies du plan par des losanges ou par des dominos de taille 2 × 1. Ces pavages sont naturellement associés à des surfaces de R^3, qui peuvent être vues comme des interfaces dans des modèles de physique statistique. En particulier les pavages par des losanges correspondent au modèle d'Ising tridimensionnel à température nulle. Plus précisément les pavages d'un domaine sont en bijection avec les configurations d'Ising vérifiant certaines conditions au bord (dépendant du domaine pavé). Ces conditions forcent la coexistence des phases + et - ainsi que la position du bord de l'interface. Dans la limite thermodynamique où L, la longueur caractéristique du système, tend vers l'infini, ces interfaces obéissent à une loi des grand nombre et convergent vers une forme limite déterministe ne dépendant que des conditions aux bord. Dans le cas où la forme limite est planaire et pour les losanges, Caputo, Martinelli et Toninelli [CMT12] ont montré que le temps de mélange Tmix de la dynamique est d'ordre O(L^{2+o(1)}) (scaling diffusif). Nous avons généralisé ce résultat aux pavages par des dominos, toujours dans le cas d'une forme limite planaire. Nous avons aussi prouvé une borne inférieure Tmix ≥ cL^2 qui améliore d'un facteur log le résultat de [CMT12]. Dans le cas où la forme limite n'est pas planaire, elle peut être analytique ou bien contenir des parties "gelées" où elle est en un sens dégénérée. Dans le cas où elle n'a pas de telle partie gelée, et pour les pavages par des losanges, nous avons montré que la dynamique de Glauber devient "macroscopiquement proche" de l'équilibre en un temps L^{2+o(1)}

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Laslier, Benoît. "Dynamique stochastique d’interface discrète et modèles de dimères." Thesis, Lyon 1, 2014. http://www.theses.fr/2014LYO10110/document.

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Abstract:

Nous avons étudié la dynamique de Glauber sur les pavages de domaines finies du plan par des losanges ou par des dominos de taille 2 × 1. Ces pavages sont naturellement associés à des surfaces de R^3, qui peuvent être vues comme des interfaces dans des modèles de physique statistique. En particulier les pavages par des losanges correspondent au modèle d'Ising tridimensionnel à température nulle. Plus précisément les pavages d'un domaine sont en bijection avec les configurations d'Ising vérifiant certaines conditions au bord (dépendant du domaine pavé). Ces conditions forcent la coexistence des phases + et - ainsi que la position du bord de l'interface. Dans la limite thermodynamique où L, la longueur caractéristique du système, tend vers l'infini, ces interfaces obéissent à une loi des grand nombre et convergent vers une forme limite déterministe ne dépendant que des conditions aux bord. Dans le cas où la forme limite est planaire et pour les losanges, Caputo, Martinelli et Toninelli [CMT12] ont montré que le temps de mélange Tmix de la dynamique est d'ordre O(L^{2+o(1)}) (scaling diffusif). Nous avons généralisé ce résultat aux pavages par des dominos, toujours dans le cas d'une forme limite planaire. Nous avons aussi prouvé une borne inférieure Tmix ≥ cL^2 qui améliore d'un facteur log le résultat de [CMT12]. Dans le cas où la forme limite n'est pas planaire, elle peut être analytique ou bien contenir des parties “gelées” où elle est en un sens dégénérée. Dans le cas où elle n'a pas de telle partie gelée, et pour les pavages par des losanges, nous avons montré que la dynamique de Glauber devient “macroscopiquement proche” de l'équilibre en un temps L^{2+o(1)}
We studied the Glauber dynamics on tilings of finite regions of the plane by lozenges or 2 × 1 dominoes. These tilings are naturally associated with surfaces of R^3, which can be seen as interfaces in statistical physics models. In particular, lozenge tilings correspond to three dimensional Ising model at zero temperature. More precisely, tilings of a finite regions are in bijection with Ising configurations with some boundary conditions (depending on the tiled domain). These boundary conditions impose the coexistence of the + and - phases, together with the position of the boundary of the interface. In the thermodynamic limit where L, the characteristic length of the system, tends toward infinity, these interface follow a law of large number and converge to a deterministic limit shape depending only on the boundary condition. When the limit shape is planar and for lozenge tilings, Caputo, Martinelli and Toninelli [CMT12] showed that the mixing time of the dynamics is of order (L^{2+o(1)}) (diffusive scaling). We generalized this result to domino tilings, always in the case of a planar limit shape. We also proved a lower bound Tmix ≥ cL^2 which improve on the result of [CMT12] by a log factor. When the limit shape is not planar, it can either be analytic or have some “frozen” domains where it is degenerated in a sense. When it does not have such frozen region, and for lozenge tilings, we showed that the Glauber dynamics becomes “macroscopically close” to equilibrium in a time L^{2+o(1)}

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Longueville, Willy. "Dynamique moléculaire d'un cristal plastique de dimères : l'acide pivalique." Lille 1, 1987. http://www.theses.fr/1987LIL10188.

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Abstract:

Résultats de quatre types d'études : la structure basse température est p1 tandis que celle de la phase plastique est fm3m en moyenne avec des facteurs de température importants ; dans les deux cas, dimères par liaisons hydrogène - la diffusion Raman conduit à l'affectation de l'ensemble des raies pour quatre variétés isotopiques - la diffusion quasi élastique des neutrons aboutit aux types de mouvements et aux temps de corrélation correspondants pour les groupement : t-butyl, méthyl, carboxylique - la diffusion cohérente inélastique des neutrons donne les amorces des courbes de dispersion de fréquences pour les modes acoustiques et conduit aux constantes élastiques

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Tardy, Bernard. "Utilité des D-Dimères ELISA dans la prise en charge diagnostique et thérapeutique des thromboses veineuses." Saint-Etienne, 2004. http://www.theses.fr/2004STET011T.

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Abstract:

Utilité des D-dimères ELISA à titre diagnostique : Le but de la première étude était d’évaluer l’intérêt des D-dimères chez 96 patients âgés de plus de 70 ans admis pour suspicion d’EP. Dans cette étude, le dosage ELISA des D-dimères a, pour une valeur seuil inférieur à 500ng/ml , une excellente sensibilité et valeur prédictive négative pour le diagnostic d’exclusion d’une EP. Par contre, sa spécificité est médiocre de l’ordre de 15%. Le but de la deuxième étude était d’évaluer l’intérêt des D-dimères des patients admis pour céphalée aiguë suspecte de thrombose veineuse cérébrale (TVC). La population a consisté en 18 patients avec une TVC et 34 témoins avec céphalée aiguë d’origine migraineuse. Dans cette étude, les D-dimères ELISA ont une excellente valeur prédictive négative (100%) pour le diagnostic d’exclusion de TVC chez les patients présentant des céphalées aiguës. D-dimères ELISA à titre thérapeutique : Le but de la première étude était de comparer l'évolution des Fragments Prothrombiniques 1+2 et des D-dimères après arrêt brutal ou progressif d'un traitement AVK chez des malades traités pour une maladie thromboembolique veineuse. Dans cette étude randomisée et en double aveugle portant sur 20 patients, aucun argument biologique ne supporte l’existence d’un effet rebond lié à l'arrêt brutal du traitement AVK. Le but de la deuxième étude était d’évaluer la cinétique des D-dimères au cours du traitement héparinique des TVC. Les résultats préliminaires sur 17 patients montrent que le taux de D-dimères se normalisent rapidement au cours des traitements adaptés par héparine mais qu’ils stagnent ou augmentent en cas d’extension de la thrombose ou d’insuffisance du traitement anticoagulant.

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Ferrand, Damien. "Synthèse, polymérisation et copolymérisation de dimères acryliques : application à la stabilisation de dispersions de TiO2 en milieu organique." Mulhouse, 1996. http://www.theses.fr/1996MULH0403.

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Abstract:

Les dimères d'acrylates (1 pentène 2,5 dicarboxylates) possèdent une fonction ester supplémentaire par rapport aux acrylates classiques. La synthèse de ces dimères, s'est faite à partir des acrylates correspondants, à l'aide de catalyseurs de type phosphine. Ces produits ont ensuite été polymérisés par voie radicalaire. La réactivité de ces monomères est fortement diminuée par la seconde fonctionnalité, mais ceci n'empêche pas l'obtention de polymères de masses importantes. Nous avons ensuite étudié la polymérisation anionique du dimère d'acrylate de méthyle (DAMe) et du dimère d'acrylate de tertio butyle (DAtBu), qui n'avait jamais été réalisée auparavant. Des réactions secondaires de désactivations ont été mises en évidence, et pour limiter celles-ci, nous avons opéré à -80°C, dans le THF, avec un contre-ion potassium. Dans ces conditions, nous avons mis en évidence pour la polymérisation du DAtBu, une réaction de transfert avec cyclisation intramoléculaire, limitant ainsi les masses molaires obtenues. Néanmoins, des copolymères à blocs PS-b-PDAtBu et PMMA-b-PDAtBu ont été synthétisés de manière satisfaisante. Apres hydrolyse sélective, à l'aide d'acide trichloracétique, de la séquence PDAtBu de ceux-ci, en dimère de l'acide acrylique (PDAA), nous avons obtenu des copolymères à blocs hydrophobe/hydrophile possédant des propriétés tensio-actives. Nous avons utilisé ces polymères pour la stabilisation de particules de TiO2 en milieu organique. La comparaison, avec les modèles théoriques, de l'adsorption de PMMA-b-PDAA sur la surface du TiO2, a montré que ceux-ci pouvaient être considérés comme des polymères superfonctionnalisés. Ainsi l'ancrage de tels composés sur les particules est favorisée par la structure compacte du PDAA, conduisant ainsi à une couronne de polymère plus dense avec une structure en brosse. Cela a des effets directs sur la dispersion et la stabilisation des particules de TiO2, avec des résultats, dans la plupart des cas, supérieurs à ceux de polymères classiques

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Costalat, Robert. "Photophysique de l'induction de dimères de thymine par des psoralènes." Paris 13, 1988. http://www.theses.fr/1988PA13A001.

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Michaud, Sandra. "Les dimères de thymine : de leur photosensibilisation à leur photoréversion." Toulouse 3, 2008. http://thesesups.ups-tlse.fr/323/.

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Abstract:

Peu de photosensibilisateurs sont susceptibles de donner lieu à un transfert d'énergie triplet-triplet avec l'ADN, à l'origine de la formation de dimères de thymine, lésion hautement mutagène. Il faut en effet que le composé allie un rendement quantique de croisement intersystème élevé avec une énergie d'état triplet supérieure à celle de la thymine, base de plus faible énergie d'état triplet dans l'ADN. L'objectif de ces travaux de thèse a tout d'abord été d'établir l'aptitude de trois anti-inflammatoires non stéroïdiens, le kétoprofène, l'acide tiaprofénique et le naproxène ainsi que celle de leurs photoproduits, à photosensibiliser la formation de dimères de thymine. L'implication majeure des photoproduits dans la formation de cette photolésion a confirmé l'importance de considérer les propriétés photochimiques de drogues photoinstables dans ces processus de photosensibilisation. L'étude photophysique des différents composés a permis d'approcher l'énergie d'état triplet de la thymine dans l'ADN. La seconde partie de ces travaux a été consacrée à l'étude des dommages oxydatifs induits sur l'ADN par ces mêmes composés et plus spécifiquement aux lésions mettant en œuvre un transfert électronique. Une corrélation entre les propriétés photobiologiques et les propriétés photoredox de ces composés a de plus été établie. Parallèlement, des études visant à concevoir des photolyases artificielles capables d'induire la réparation des dimères de thymine ont également été menées. Ces travaux ont concerné des phtalocyanines dont les potentiels redox sont rendus modulables par métallation
Few photosensitizers are likely to induce triplet-triplet energy transfer with DNA, leading to thymine dimers formation. Indeed, the compound must display a high intersystem crossing quantum yield and a triplet state energy higher than that of thymine, base which have the lowest triplet state energy in DNA. The purpose of this PhD work was first to establish the ability of three non steroidal anti-inflammatory drugs, ketoprofen, tiaprofenic acid and naproxen, to induce thymine dimers formation. Major involvement of photoproducts in this lesion photosensitization showed the importance to consider photochemistry of compounds which are not stables photochemically. Photophysical study of these products allowed us to make a new estimation of thymine triplet state energy in DNA. The second part concerned photosensitization of oxidative damages on DNA by these same compounds, especially oxidative damages by electron transfer mechanisms. If it is predominant for ketoprofen derivatives, it is in competition with hydroxyle radicals in the case of tiaprofenic acid and naproxen family. A correlation between photobiological and photoredox properties was done. At the same time, studies taking aim at designing artificial photolyases, able to induce thymine dimers repair, were driven. This work concerned phthalocyanines whose redox potential were variables thanks to metallation

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Scribano, Johann. "Etude théorique du dimère de l'eau (H2O)2 et de son rôle dans l'atmosphère." Montpellier 2, 2006. http://www.theses.fr/2006MON20019.

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Abstract:

Dans cette thèse, nous avons calculé la constante d'équilibre associée au processus de dimérisation de l'eau ainsi que le spectre d'absorption du dimère de l'eau. Ces calculs ont été réalisés en utilisant un schéma d'extrapolation bâti sur les 150 premiers états propres rovibrationnels obtenus par une approche pseudo-spectrale couplée à l'algorithme de Lanczos. Deux axes méthodologiques ont également été présentés. Le premier concerne la détermination d'une nouvelle surface de potentiel flexible de qualité spectroscopique. La méthode heuristique employée s'est révélée très efficace car les quantités spectrosopiques et thermodynamiques calculées sur cette nouvelle surface montrent un très bon accord avec les valeurs expérimentales disponibles. Le second axe concerne la formulation semi-classique de la constante d'équilibre, qui permet de tenir compte de façon perturbative des états métastables du continuum du dimère. Cette nouvelle formulation présente l'avantage de réduire considérablement le temps de calcul et fournit des valeurs en accord avec les valeurs expérimentales
In this thesis, we have computed the equilibrium constant for the water dimerization process and thes absorption coefficient of the water dimer. These calculations were realized by considering all the rovibrational bound states up to dissociation and for high angular momentum values. We have used an extrapolation scheme to compute the rotational energy and transition dipole matrix for higher levels. We have found that our results are in good agreements with avalaible experimentals values for the equilibrium constant. The second pert of this thesis presents a new flexible potential energy surface obtained by means of stochastic optimisation. Our soectroscopic and thermodynamics results are in good agreement with experimentals values. Finally, we present a semi-classical formulation of the equilibrium constant which takes into account the metastables states of the water dimer and which is very eficient in terms of computational cost

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Pérez, Marie-Claire. "Etude de la réactivité de différentes laccases fongiques. Application à la polymérisation de phénols." Aix-Marseille 3, 1999. http://www.theses.fr/1999AIX30058.

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Abstract:

Les laccases sont des phenoloxydases a cuivre capables d'oxyder les composes phenoliques. Ces reactions sont accompagnees par la reduction du dioxygene en eau qui joue le role d'accepteur final d'electrons. L'etude de la polymerisation de phenols via des reactions d'oxydations catalysees par les laccases, fait l'objet de ce travail. Les enzymes utilisees, selectionnees en raison de leurs caracteristiques biochimiques differentes, sont synthetisees par marasmius quercophilus, myceliophthera thermophila, polyporus pinsitus et dichomitus squalens. Une premiere approche avec le 2,6-dmp utilise comme substrat modele, a montre que la reaction enzymatique est sensible a la temperature, au ph du tampon, a la quantite et a la nature du solvant (acetone, acetonitrile et dme). L'etude de la bioconversion du 4-t-butylphenol a mis en evidence la capacite des laccases a oxyder ce substrat en presence des differents solvants utilises. Les proportions des produits obtenus, dimeres de o et c-arylation et oligomeres, varient en fonction des enzymes et des conditions experimentales (ph, temperature et nature du solvant). La polymerisation de ce substrat est possible avec les laccases synthetisees par d. Squalens, tandis que les laccases de m. Thermophila, p. Pinsitus et m. Quercophilus permettent d'obtenir les dimeres de c-arylation. D'autre part, l'etude de l'activite de ces memes enzymes vis-a-vis de divers substrats phenoliques (les di-methylphenols, les t-butylphenols, les di-t-butylphenols et les methyl-t-butylphenols) a montre qu'elles sont sensibles a l'encombrement sterique et a la position des substituants sur le cycle aromatique.

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Jolibois, Henri. "Les Phénoxychlorostannanes : Synthèses, étude et réactivité : Etude de la réaction des esters phénoliques p-substitués sur le chlorure d'étain." Université de Franche-Comté. UFR des sciences et techniques, 1986. http://www.theses.fr/1986BESA2005.

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Abstract:

Les p-alkylphenoxy trichloro stannanes sont préparés par action de sncl::(4) sur les p-alkyl phénols correspondants. Ce sont des composes dimères, présentant deux atomes d'étain hexacoordines relies entre eux par des ponts oxygène. La réaction de sncl::(4) avec les p-alkylphenoxy tri méthyl silanes conduit à une deuxième catégorie de composes (r-c::(6)h::(4)-o)::(4)sn::(3)cl::(8). Sncl::(4) permet la synthèse supportée d'anthocyanidines. La réduction des sels de flavylium obtenus, soit par voie catalytique, soit par voie chimique, conduit a des molécules organiques complexes, heptacycliques. La stucture rx de deux d'entre elles est établie

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Milanetto, Schlittler Thiago. "Etude de modèles de dimères et partitions quantiques sur réseaux hexagonaux." Thesis, Paris 6, 2015. http://www.theses.fr/2015PA066120/document.

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Abstract:

Les modèles de dimères quantiques (QDM's) ont une série de comportements intéressants, comme de l'ordre topologique et des phases de liquides de spin. Dans cette thèse, nous explorons ces modèles pour un réseaux hexagonal, ainsi que leur équivalence aux problèmes de partitions, un sujet qui fait partie du domaine de la combinatoire. Premièrement, nous étudions le modèle RK, pour lequel la question sur la présence d'une phase avec un gap non-nul restait encore ouverte. Nous décrivons un algorithme Monte-Carlo qui nous permet, entre autres résultats, d'accéder directement au gap du système. Deuxièmement, nous proposons une généralisation de ce modèle. Nous trouvons un diagramme de phase beaucoup plus complexe, avec des transitions de phase entre différents secteurs topologiques, et compatible avec le déconfinement de Cantor. Troisièmement, nous étudions l'application du modèle RK à des réseaux hexagonales associés à des problèmes de partitions planaires. Cela impose des nouvelles conditions de bord, et nous trouvons un nouveau comportement du modèle. Nous proposons aussi une méthode que utilise les propriétés de l'espace de configurations des problèmes de partitions pour réduire la complexité du QDM.Finalement, nous modélisons les problèmes de croissance et effondrement de coin de cristaux classiques dans le cadre des problèmes de partition, trouvant une transition souple entre des interfaces limites du type "amibe" et le cercle arctique
The quantum dimer models (QDM's) have a series of interesting behaviors, such as topological order and spin liquid phases. In this thesis, we study these models for an honeycomb lattice, and also their equivalence with the partition problems, a subject of the domain of combinatorics. Firstly, we study the RK model, for which the question on whenever one of its phases is gapped or not was still open. We describe an Monte-Carlo algorithm that allows to, among other results, access this gap directly. Secondly, we propose a generalization of this model. We find a more complex phase diagram, with phase transitions between the different topological sectors, and compatible with the Cantor deconfinement. Thirdly, we study the application of the RK model to honeycomb lattices associated to the planar partition problems. This imposes new boundary conditions, and we find a new model behavior. We also propose a méthod that uses the properties of the partition problem's configuration space to reduce the complexity of the QDM. Finally, we modelize the problems of classical crystal corner growth and melting with the formalism of the partition problems, finding a smooth transition between the limit interfaces of type "amoebae" and the arctic circle

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Salami, Houssam. "Étude des spectres électroniques et courbes de potentiel de dimères alcalins hétéronucléaires." Phd thesis, Université Claude Bernard - Lyon I, 2007. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00382009.

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Abstract:

Cette thèse présente une étude expérimentale de la fluorescence induite par laser analysée par un spectromètre à transformée de Fourier haute résolution de la molécule KLi. Des courbes de potentiel précises ont été calculées pour l'état fondamental, X1+, de 39K7Li et 39K6Li. Une étude simultanée de ces deux isotopologues a établi une brisure de l'approximation de Born-Oppenheimer faible mais significative. Nous avons aussi détecté 6 niveaux vibrationnels élevés de l'état a3+, également corrélé à l'asymptote atomique Li(2s) + K(4s). Bien que les données ne couvrent que 25 % du puits de potentiel, une expression analytique donne une bonne extrapolation vers le minimum du potentiel et ajuste toutes les données dans limites de l'incertitude expérimentale. Une expérience similaire de CuCl2 formé en jet supersonique a conduit à déterminer la constante de spin-orbite de l'état X2g de CuCl2. Des spectres de polarisation de NaLi ont été aussi analysés, donnant des informations préliminaires sur deux états excités

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Anguelov, Antonio. "Les D-dimères dans l'exclusion de la thrombose veineuse profonde en gériatrie." Paris 13, 2004. http://www.theses.fr/2004PA130024.

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Paubert, Marc. "Préparation et étude d'agents tensio-actifs dérivés d'acides gras monomères et dimères." Toulouse, INPT, 1993. http://www.theses.fr/1993INPT048G.

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Abstract:

Un certain nombre d'acides gras, d'acides dimeres, notamment insatures, et quelques-uns de leurs derives ont ete sulfones par le trioxyde de soufre ou par la chlorhydrine sulfurique en phase liquide et en discontinu. Les matieres premieres principales sont les acides stearique et oleique et les dimeres de ce dernier, sous forme libre ou sous forme d'ester (methylique, 2-ethylhexylique, decylique). Les produits de sulfonation obtenus ont ete neutralises par des bases diverses, alcalines ou organiques. Ils conduisent a des agents tensio-actifs anioniques dont certains ne sont pas decrits dans la litterature. Trois proprietes physico-chimiques de ces sulfonates liees a leur adsorption a l'interface eau-air et a leur capacite d'association en solution aqueuse ont ete etudiees: l'abaissement de la tension superficielle, le pouvoir moussant et la concentration critique micellaire (cmc). En raison de la presence de plusieurs chaines hydrocarbonees, la solubilite et la cmc des produits dimeres sont elevees au vu de leur nombre d'atomes de carbone. L'abaissement de tension superficielle obtenu avec ces memes produits est tres favorable, bien qu'inferieur a celui, remarquable, du sulfonate de sodium de l'oleate de n-decyle, egalement etudie ici. Le pouvoir moussant des sulfonates de dimeres insatures est environ deux fois plus faible que celui des sulfonates des monomeres correspondants. Au vu des proprietes physico-chimiques des sulfonates des dimeres quasi satures et de l'evolution de ces proprietes en fonction de la structure des tensio-actifs, les sulfonates d'acides et d'esters dimeres insatures se revelent plus performants que leurs analogues satures

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Nolivos, Sophie. "Étude du mécanisme de résolution des dimères de chromosomes chez les streptocoques." Toulouse 3, 2010. http://thesesups.ups-tlse.fr/1232/.

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Abstract:

La majorité des bactéries connues possèdent un unique chromosome circulaire. Lors de la réplication du chromosome, des évènements de recombinaison homologue peuvent lier les deux chromosomes frères en une molécule unique, appelée dimère de chromosome. Le système de recombinaison spécifique de site dédié à résoudre les formes dimériques en monomères est le système Xer. Il est composé chez la bactérie modèle Escherichia coli de deux recombinases à tyrosine, XerC et XerD, qui agissent sur un site chromosomique unique, dif, localisé dans la région du terminus de réplication. Le système de recombinaison Xer est sous le contrôle de la protéine septale FtsK. FtsK est une translocase à ADN qui est dirigée sur le chromosome par des motifs, les KOPS, dont l'orientation s'inverse à dif. De ce fait, elle est toujours dirigée vers le site de recombinaison où elle active la machinerie permettant la résolution des dimères de chromosomes. Des homologues des protéines XerC, XerD et FtsK, ainsi qu'un site dif, sont retrouvés chez un grand nombre de bactéries, suggérant que la machinerie ainsi que le contrôle de la recombinaison sont conservés. Cependant, chez les Streptocoques, la machinerie de recombinaison implique une seule recombinase, XerS, qui agit sur un site atypique, difSL. Ce manuscrit concerne l'étude du mécanisme et du contrôle de la recombinaison Xer chez la bactérie Lactococcus lactis appartenant à la famille des Streptocoques. Dans une première partie, nous mettons en évidence in vitro que l'implication d'une seule recombinase ne modifie pas le mode de fixation et de recombinaison au site, en comparaison au système Xer " classique " d'E. Coli. D'autre part, nous montrons in vivo que le système est contrôlé par la protéine FtsK mais que le mode d'activation de la recombinaison est différent de celui décrit chez E. Coli. Dans une deuxième partie nous nous intéressons au mode d'orientation de la protéine FtsK de L. Lactis. Nous mettons en évidence par une combinaison d'approches in vivo, in vitro et in silico, que la reconnaissance de motifs biaisés sur le chromosome est conservée mais que la taille et la séquence du motif reconnu diffère des systèmes déjà décrits
Most known bacteria harbour a unique circular chromosome. Recombination between sister chromosome during replication may fuse them into a single DNA molecule called a chromosome dimer. Dimers are resolved to monomers by Xer site-specific recombination. In Escherichia coli it consists of two recombinases, XerC and XerD acting at a specific dif site located in the replication terminus. The Xer recombination system is controlled by the septum associated protein, FtsK. FtsK is a DNA translocase oriented by specific motif of the chromosome, named KOPS. The polarity of the KOPS is skewed and revers at dif site, hence FtsK is always directed toward the recombination site. Homolog of XerC, XerD an FtsK proteins, as well as a dif site, are find in most bacteria suggesting that the machinery of recombination and its control are well conserved. However, in the Streptococci family of bacteria, dimer resolution uses a single recombinase, XerS, which acts at an atypical dif site, difSL. This manuscript concerns the study of the mechanism and control of Xer recombination in Lactoccocus lactis, a member of the Streptococci family. In a first part we demonstrate, in vitro, that using a single recombinase does not change the mode of binding and recombination at the specific site, by comparison with the "classical" E. Coli Xer recombination system. Furthermore, we show in vivo that the L. Lactis Xer system is controlled by FtsK but that activation of recombination is achieved by a different mechanism. In a second part, we investigate the orientation of FtsK translocation. We demonstrate, by combining in silico, in vitro and in vivo approaches, that orientation by skew motifs is conserved in L. Lactis but that the sequence and length of the motif used is different from known systems

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Trousselet, Fabien. "Modèles de dimères classiques et quantiques pour des systèmes d'électrons corrélés bidimensionnels." Toulouse 3, 2009. http://thesesups.ups-tlse.fr/933/.

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Abstract:

Cette thèse aborde diverses problématiques concernant les électrons fortement corrélés dans des systèmes bidimensionnels (composés a frustration géométrique, phases à liens de valence résonants), décrits a l'aide de modèles de dimères. Une partie de la thèse concerne des modèles classiques sur un réseau triangulaire anisotrope, présentant des phases critiques qu'on peut décrire à l'aide de théories confirmes; en se basant sur ces théories, l'analyse numérique de ce modèle par matrice de transfert a permis de caractériser les conditions d'existence de la criticalité, et plus généralement le diagramme de phases du modèle en fonction d'interactions a courte portée et de l'anisotropie de réseau. Une autre partie traite d'un système d'électrons sur un réseau pyrochlore bidimensionnel (ou damier), a remplissage commensurable, en interactions a courte portée. Dans une limite de fortes interactions les électrons subissent des contraintes qui se traduisent par un modèle effectif de dimères quantiques (se différentiant par rapport au modèle dit de Rokhsar et Kivelson motivé par les états à liens de valences résonants, par un degré de liberté supplémentaire, de spin). Une étude par diagonalisation exacte, complétée par une approche variationnelle et des arguments perturbatifs, a permis d'identifier une phase cristalline à singulets resonants; une extension de ce modèle a une mobilité finie des électrons a été considérée pour caractériser la transition de cette phase isolante vers un état métallique en fonction du rapport entre la mobilité des électrons et leurs interactions
This thesis treats various topics about strongly correlated electronic systems in 2 spatial dimensions (compounds with geometrical frustration, resonating valence bond phases) described in terms of dimer models. A part of this thesis discusses classical dimer models, and especially an interacting dimer model on an anisotropic triangular lattice, presenting critical phases descriptible with help of conformal field theories; based on these theories, the numerical analysis of this model allowed to characterize the conditions for the existence of criticality, and more generally the phase diagram in function of interaction parameters and of the lattice anisotropy. Another part treats a system of electrons on a two-dimensional version (checkerboard lattice) of the pyrochlore lattice, at commensurable particle filling. In a strong interacting limit, local constraints on charge repartition are those of dimers on the square lattice, thus an effective quantum dimer model is derivated. This model differs from the Rokhsar-Kivelson model (motivated by resonating valence bond phases in cuprates) by, here, an additional spin degree of freedom for each dimer. A study with exact diagonalisation, completed by a variational approach and arguments from from perturbation theory, allowed to identify an insulating crystal phase of resonating singlets; an extension of this model to small but finite electron mobility was eventually consitered with the aim to characterize the transition from this insulator to a metallic state when increasing the ration of the electron mobility over interaction strength

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Kaldapa. "Les porphyrines dimères glucosylées : de nouveaux photosensibilisateurs pour la photothérapie des cancers." Limoges, 1999. http://www.theses.fr/1999LIMO0007.

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Abstract:

Nous presentons pour la premiere fois la synthese de nouveaux dimeres des meso-arylglycosylporphyrines avec pour finalite leur utilisation en phototherapie des cancers. Deux series de dimeres sont decrites : neutres et cationiques. La strategie adoptee consiste a synthetiser tout d'abord les monomeres des porphyrines par condensation d'aldehydes glucosyles ou non glucosyles avec du pyrrole selon la methode de little et pour certains d'entre eux par celle de lindsey. Puis nous procedons aux reactions de couplage entre deux unites porphyriniques precedentes identiques (glucosylees) ou differentes (glucosylees et toluylees), separees par un bras espaceur flexible. Et enfin la partie glucidique des produits obtenus est deprotegee en milieu basique. Les composes synthetises sont caracterises par differentes methodes spectroscopiques (uv-visible, masse maldi, rmn). En particulier une etude detaillee de la rmn permet d'attribuer tant en #1h qu'en #1#3c les differents signaux des noyaux presents et d'apprehender les differentes conformations. Des tests biologiques realises sur une lignee cellulaire leucemique k562 ont permis d'evaluer l'activite phototoxique de ces porphyrines comparee a celle d'hematoporphyrine. Par leur pouvoir photosensibilisateur, ces molecules constituent de bons candidats pour la therapie photodynamique.

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Allegra, Nicolas. "Propriétés critiques des modèles de dimères, de chaînes de spin et d’interfaces." Thesis, Université de Lorraine, 2015. http://www.theses.fr/2015LORR0203/document.

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Abstract:

L’étude réalisée dans cette thèse porte sur les phénomènes critiques classiques et quantiques. En effet, les phénomènes critiques et les transitions de phases sont devenus des sujets fondamentaux en physique statistique moderne et en théorie des champs et nous proposons dans cette thèse d’étudier certains modèles qui présentent un comportement critique, à la fois à l’équilibre et hors de l’équilibre. Dans la première partie de la thèse, certaines propriétés du modèle de dimères à deux dimensions sont étudiées. Ce modèle a été largement étudié dans les communautés de physique statistique et de mathématiques et un grand nombre d’applications en physique de la matière condensée existent. Ici, nous proposons de mettre l’accent sur des solutions exactes du modèle et d’utiliser l’invariance conforme afin d’avoir une compréhension profonde de ce modèle en présence de monomères et/ou en présence de bords. Les mêmes types d’outils sont ensuite utilisés pour explorer un autre phénomène important apparaissant dans les modèles de dimères et de chaînes de spin : le cercle arctique. Le but étant de trouver une description adéquate en termes de théorie des champs de ce phénomène, en utilisant des calculs exacts ainsi que de l’analyse asymptotique. La deuxième partie de la thèse concerne les phénomènes critiques hors de l’équilibre dans le contexte des modèles de croissance d’interfaces. Ce domaine de recherche est très important de nos jours, principalement en raison de la découverte de l’équation Kardar-Parisi-Zhang et de ses relations avec les ensembles de matrices aléatoires. La phénoménologie de ces modèles en présence des bords est analysée via des solutions exactes et des simulations numériques, on montre alors que des comportements surprenants apparaissent proches des bords
The study carried in this thesis concerns classical and quantum critical phenomena. Indeed, critical behaviors and phase transitions are fundamental topics in modern statistical physics and field theory and we propose in this thesis to study some models which exhibit such behaviors both at equilibrium and out of equilibrium. In the first part of the thesis, some properties of the two-dimensional dimer model are studied. This model has been studied extensively in the statistical physics and mathematical communities and a lot of applications in condensed matter physics exist. Here we propose to focus on exact solutions of the model and conformal invariance in order to have a deep understanding of this model in presence of monomers, and/or boundaries. The same kind of tools are then used to explore another important phenomenon appearing in dimer models and spin chains: the arctic circle. The goal was to find a proper field theoretical description of this phenomenon using exact solutions and asymptotic analysis. The second part of the thesis concerns out of equilibrium critical phenomena in the context of interface growth models. This field of research is very important nowadays, mainly because of the Kardar-Parisi-Zhang equation and its relations with random matrix ensembles. The phenomenology of these models in presence of boundaries is studied via exact solutions and numerical simulations, we show that surprising behaviors appear close to the boundaries

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Legros, Vanessa. "Conception et synthèse de nouveaux dimères de cyclodextrines, structures covalentes et associations supramoléculaires." Poitiers, 2012. http://www.theses.fr/2012POIT2330.

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Abstract:

Du fait de leur structure cyclique, les cyclodextrines (CDs) possèdent de remarquables propriétés d'encapsulation et sont pour cela présentes dans de nombreux domaines. Pour améliorer les capacités d'inclusions des CDs, des dimères et des trimères de CDs ont été élaborées. Au cours de cette thèse nous nous sommes intéressés à la formation d'assemblages non covalents et covalents de CDs. Dans un premier temps, nous avons utilisé la capacité de reconnaissance moléculaire des nucléobases pour former des assemblages supramoléculaires de CDs. Pour cela, nous avons fonctionnalisé des CDs naturelles et méthylées par des nucléobases telles que l'adénine, la guanine et la thymine par le biais d'une réaction de click chemistry ou de substitution nucléophile. La guanine étant capable de former des G-quartets, cette propriété a été mise à profit pour former des assemblages de type G-quartet/CDs. Malheureusement, les études menées par RMN 1H et DOSY sur les dérivés CD-G n'ont pas permis de détecter la formation de G-quartet/CD. Dans un deuxième temps, nous avons effectué la synthèse de dimères covalents de CDs. La première voie a consisté à utiliser les capacités de la thymine à se dimériser sous l'effet de radiations UV. Nous avons utilisé cette capacité pour former des dimères covalents et régulables de CDs. Les réactions photochimiques effectuées sur les dérivés CD-T ont montré que la formation de dimères covalents de CD-T était possible. La deuxième voie utilisée a été basée sur la synthèse par click chemistry de dimères de CDs reliés par un bras de type glycérol en faisant varier la longueur de la chaine. La formation de pseudo-rotaxanes a été observée à partir du dimère possédant la chaine la plus longue
Cyclodextrins (CDs) are cyclic oligosaccharides, characterized by their ability to include molecules of interests inside their cavity. CDs have been used as solubilizing, inclusion or protection compounds in many applications. CDs dimers were shown to exhibit larger inclusion constants than the parents monomers. In this work, we focused on the formation of new supramolecular or covalent assemblies of cyclodextrins. In a first part, the molecular recognition capability of nucleobases was used in order to form supramolecular assemblies of CDs. The synthesis of cyclodextrin derivatives functionalized with adenine, thymine and guanine was performed by two different routes: alkylation and click chemistry. As guanine is well known to self-assemble into hydrogen-bonded cyclic tetramers, the so called G-quartet, this property was used to construct G-quartet/CDs assemblies. Nevertheless the formation of G-quartet/CDs was not observed by 1H NMR and DOSY. In a second part, were performed the synthesis of covalent dimers of CDs. We first used the capability of thymine to dimerize under the influence of light radiation. This ability was used to synthesize covalent reversible CDs dimers. We could show the formation of CDs dimers from the CD-T derivative by photochemical reaction. Then, the synthesis of CDs dimers bridged by glycerol-type spacers was achieved by click chemistry. The formation of pseudo-rotaxanes was observed during the characterization of these dimers, particularly the one having the longest chain

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Bonnet, Pascal. "Etude par modélisation moléculaire de dimères de cyclodextrines et de leurs complexes d'inclusion." Doctoral thesis, Universitat Autònoma de Barcelona, 2001. http://hdl.handle.net/10803/3114.

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Abstract:

Las ciclodextrinas (CDS) son oligómeros cíclicos de varias unidades de a-D-glucopiranosa. Las más frecuentes se denominan a-, b- y g-CD dependiendo de cuantas unidades de glucosa (6, 7 o 8 respectivamente forman la pared del macrociclo toroidal. Esta poca común forma define dos zonas especiales bien definidas: una pared externa hidrófila y una cavidad interna hidrófoba que puede incluir substratos orgánicos en medio aucoso. Los complejos de inclusión son asociaciones moleculares en las que un componente (el host) incluye a una molécula (el guest) generalmente con una estequiometría 1:1. Sin embargo, si el guest es más grande, la estequiometría puede llegar a alcanzar 2:1.
En este trabajo, estudiamos la preferencia de la orientación que adopten dos moléculas de CD con la finalidad de comprender las interacciones intermoleculares responsables. La agregación preferencial de dímeros de a-, b- y g-CD en ausencia de disolvente se estudió en primer lugar considerando las tres orientaciones más probables Head-Head, Head-Tail y Tail-Tail. En segundo lugar, se procedió al estudio de los mismos dímeros en un medio similar al biológico, es decir en presencia de moléculas de agua, para averiguar la orientación preferencial en disolución gracias a los resultados de los cálculos de energía de interacción y de las interacciones responsables de sus formaciones.
Una vez realizado este estudio, pasamos al estudio teórico del complejo supramolecular de esteoquimetría 2:1, formado por un dímero g-CD con el fullereno (C60) para averiguar las fuerzas responsables que favorecen la formación de este complejo en medio acuoso cambiando el campo de fuerza.
Finalmente, estudiamos por modelización molecular la separación de los enantiómeros de la benzoina utilizados en electroforesis capilar. Los disolventes quirales utilizando teórica y experimentalmente fueron ciclodextrinas aniónicas (mono y tetrasulfobutiléter-b- CD) y neutras permetil-b- CD). Se estudiaron las posibles agrupaciones y estequiometrías (1:1 y 2:1) de los complejos para racionalizar las enantiodiferenciación, en base a la energía de interacción entre la benzoina y las ciclodextrinas.
Todos los cálculos se llevaron a cabo mediante los programas de modelización molecular AMBER, Macromodel y MM3, en los supercomputadores del Centro de Supercomputación de Catalunya (CESCA).
Cyclodextrins are cyclic oligomers of several a-D-glucopyranose units .The toroidal macrocyclic shape defines two clear spatial regions, a hydrophilic external wall and a hydrophobic cavity. They are well known to act as hosts in supramolecular chemistry having the capability to form inclusión complexes with a large variety of organic molecules (the guest), generally with a 1:1 stoichiometry between host and guest. Nevertheless, complexes formed with large guests usually have 2:1 stoichiometries.
Our work has been carried out to detemine the preferential orientation of the cyclodextrin dimers and to understand the responsible intermolecular interactions. The preferential aggregation of two a-, b- and g-cyclodextrin molecules in the absence fo solvent have been studied in a first part, considering the three most likely orientations: Head-Head, Head-Tail and Tail-Tail. In a second part, the cyclodextrin dimers have been studied using water as explicit solvent with the aim of determing their preferential orientation in water solution by studying the binding energy and the interactions responsible for their informations.
As one 2:1 complex, the supramolecular complexation of the fullerene C60 in a g-cyclodextrin dimer has been studied. The force field for the fullerene has been changed to correctly consider its intramolecular interactions.
Also, thanks to some experimental results of capillary electrophoresis, we have reproduced and analysed the enantiodifferenciation of an inclusion complex formed by different cyclodextrin dimers and one chiral molecule: the benzoine. Different stoichiometries, different derived cyclodextrins (as permethyl-b-cyclodextrin, monosulfated-b-cyclodextrin and tetrasulfatedb-cyclodextrin), and different orientations of the complex (as Head-Head and Head-Tail) have been studied. Moreover, in each case the two posible orientations of the benzoine incide the cyclodextrin cavity were also considered.
All of the simulations have been carried out on using MM3, MacroModel and AMBER force fields in the Supercomputing Center of Catalonia (CESCA).

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Bijaoui, Alexandra. "Intérêt du dosage des D-dimères dans le diagnostic de la maladie thromboembolique." Paris 5, 1998. http://www.theses.fr/1998PA05P126.

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Tilière, Béatrice de. "Dimères sur les graphes isoradiaux et modèle d'interfaces aléatoires en dimension 2+2." Paris 11, 2004. http://www.theses.fr/2004PA112268.

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Abstract:

Le modèle de dimères modélise la répartition de molécules diatomiques à la surface d'un cristal. Nous supposons que le réseau vérifie une condition géométrique appelée isoradialité, et que les arêtes du réseau sont munies de la fonction de poids critique. Le modèle a alors un comportement "critique", il n'a que 2 phases possibles, solide ou liquide, au lieu de 3 en général. Nous obtenons 3 résultats pour le modèle de dimères isoradial. Nous prouvons une formule explicite pour le taux de croissance de la fonction de partition de l'exhaustion naturelle, et pour la mesure de Gibbs d'entropie maximale. L'originalité et l'intérêt de ces 2 formules résident dans le fait qu'elles ne dépendent que de la géométrie locale du graphe. Nous pensons que cette propriété de localité est caractéristique du cas isoradial. Les configurations de dimères ont une interprétation géométrique en tant que surfaces discrètes décrites par une fonction de hauteur. Nous montrons que lorsque les surfaces sont distribuées selon la mesure de Gibbs d'entropie maximale, la fonction de hauteur converge vers un champ libre Gaussien. Nous introduisons le modèle de quadri-pavages triangulaires. Nous montrons que ce modèle est superposition de 2 modèles de dimères sur des graphes isoradiaux, et l'interprétons géométriquement comme surfaces de dimension 2 dans un espace de dimension 4. Nous étudions ce modèle dans sa phase "critique". Nous montrons une formule explicite pour le taux de croissance de la fonction de partition totale et pour une mesure sur l'espace de tous les quadri-pavages. C'est le premier modèle d'interfaces aléatoires en dimension 2+2 sur lequel des résultats de ce type ont pu être obtenus
The dimer model represents diatomic molecules adsorbed on the surface of a crystal. We suppose that the lattice satisfies a geometric condition called isoradiality, moreover we assume that the critical weight function is assigned to edges of the lattice. The model then has a "critical" behavior, i. E. It can be in 2 different phases, solid or liquid, instead of 3 in general. Our three main results on the isoradial dimer model are the following. We prove an explicit formula for the growth rate of the partition function of the natural exhaustion of the infinite lattice, and for the maximal entropy Gibbs measure. The interesting feature of those two formulas lies in the fact that they only depend on the local structure of the graph. We believe this locality property to be specific of the isoradial case. Geometrically, dimer configurations can be interpreted as discrete surfaces described by one height function. We show that when the surfaces are chosen with respect to the maximal entropy Gibbs measure, the height function converges to a Gaussian free field. We introduce the triangular quadri-tile dimer model, where quadri-tilings are tilings by quadrilaterals made of adjacent right triangles. We show that this model is the superposition of two dimer models, and interpret it geometrically as surfaces of dimension 2 in a space of dimension 4. We study this model in the "critical" phase. We prove an explicit formula for the growth rate of the total partition function, and for a measure on the space of all quadri-tilings. It is the first random interface model in dimension 2+2 for which those kind of results can be obtained

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Vanucci, Corinne. "Etude photochimique de dimères modèles de lignine en solution et à l'état adsorbé." Bordeaux 1, 1987. http://www.theses.fr/1987BOR10653.

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Abstract:

Dans le cadre de l'etude du jaunissement photochimique des papiers de pates a haut rendement, attribue principalement a la photodegradation de la lignine, on a cherche a mieux comprendre les mecaniques photochimiques mis en jeu a l'aide de molecules dimeres modeles de type -o-4,-1 et -o-4 representant les principaux motifs structuraux du polymere, irradies en solution fluide et sur support cellulosique a l'etat adsorbe. On montre que la presence du chromophore carbonyle, du groupe phenolique et de l'oxygene n'est pas indispensable pour induire un jaunissement. On met en evidence l'influence du milieu solide sur le processus de photodegradation. On propose des mecanismes primaires intramoleculaires de scission homolytique. Des etudes photochimiques detaillees sont presentees sur l'-(methoxy-2, phenoxy) dimethoxy-3,4 acetophenone, sur la bis(dimethoxy-3,4 phenyl)-1,2 ethanone et sur l'-(trimethyl-2,4,8 phenoxy) dimethoxy-3,4 toluene

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Kuchumov, Nikolai. "Formes limites pour le modèle de dimères dans des domaines non simplement connexes." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2024. http://www.theses.fr/2024SORUS281.

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Abstract:

Cette thèse se compose de trois parties, le but de la première partie est d'étudier les pavages aléatoires de dominos d'un domaine non simplement connexe avec une fonction de hauteur définie sur l'espace de revêtement universel du domaine. Nous établissons un principe de grandes déviations pour la fonction de hauteur dans deux régimes asymptotiques. Le premier régime couvre tous les pavages de dominos du domaine. Une loi des grands nombres pour le changement de hauteur dans ce régime est également obtenue. Le second régime couvre les pavages de dominos avec un changement de hauteur asymptotique donné. La deuxième partie de la thèse est une extension de la première partie. Nous prouvons l'existence d'une forme limite pour le modèle de dimères sur des graphes bipartis périodiques planaires avec un domaine fondamental arbitraire et des poids périodiques arbitraires. La troisième partie est consacrée au calcul de la courbe arctique du diamant aztèque avec trous dans deux régimes. Le premier régime, appelé cas non contraint, correspond à la mesure uniforme sur l'ensemble des pavages par dominos. Le second régime, appelé cas contraint, pose une condition sur le changement de hauteur des dominos
This thesis consists of three parts, the goal of the first part is to study random domino tilings of a multiply-connected domain with a height function defined on the universal covering space of the domain. We establish a large deviation principle for the height function in two asymptotic regimes. The first regime covers all domino tilings of the domain. A law of large numbers for height change in this regime will also be derived. The second regime covers domino tilings with a given asymptotic height change.The second part of thesis is an extension of the first part. We prove the existence of a limit shape for the dimer model on planar periodic bipartite graphs with an arbitrary fundamental domain and arbitrary periodic weights.The third part is devoted to computation of the arctic curve of the multiply-connected Aztec diamond in two regimes. The first regime, called an unconstrained case, corresponds to the uniform measure on a set of domino tilings. The second regime, constrained case, puts a condition on the height change of domino tilings

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Hussein, Khaled. "Etude à grande distance internucléaire de l'état fondamental des molécules Na2 et KH et transferts collisionnels résonnants entre états électroniques de Na2 et Li2." Lyon 1, 1985. http://www.theses.fr/1985LYO19024.

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Abstract:

I. Etude de la structure des etats fondamentaux de na::(2) et kh par spectrometrie de fluorescence induite par laser, a transformee de fourier. Deduction des courbes d'energie potentielle jusqu'a des niveaux proches de leurs limites de dissociation. Observation d'un transfert d'energie collisionnel entre etats electroniques b**(1)pi ::(u) et (2) **(1)sigma ::(g)**(+) de na::(2). Ii. Description d'un formalisme pour calculer la probabilite de transition de transfert d'energie collisionnel au 1er ordre, a l'approximation de born de la matrice de diffusion atome-molecule diatomique. Calcul de la probabilite de transition au 2eme ordre et du terme d'interference au 1er et 2eme ordre. Application au calcul des sections efficaces des processus na::(2)(b**(1)pi ::(u),v,j) + na(3p**(2)p) -> na::(2)( (2) **(1)sigma ::(g)**(+),v',j') + na(3p **(2)p) + delta e et li::(2)(a**(1)sigma ::(u)**(+),v,j) + li(2s **(2)s) -> li::(2)(x**(1)sigma ::(g)**(+),v',j') + li(2p **(2)p) + delta e

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Bouty, Olivier. "Energie d'interaction d'échange à grande distance internucléaire dans une molécule diatomique." Lyon 1, 1994. http://www.theses.fr/1994LYO10100.

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Abstract:

Cette these presente la generalisation de la methode dite asymptotique d'evaluation de l'energie d'interaction d'echange entre electrons de valence pour des systemes diatomiques, a des distances internucleaires r intermediaires et grandes. Nous decrivons tout d'abord les fondements de la methode et nous l'etendons a l'interaction entre atomes a couche ouverte de n'importe quelle symetrie spatiale. Puis, nous discutons la validite et la compatibilite de certaines approximations qui sous-tendent la methode par rapport aux hypotheses physiques du probleme. Nous presentons les resultats fournis par la methode asymptotique pour les etats electroniques de molecules diatomiques composees d'atomes mono et multielectroniques, en couplage a) et c) de hund. Puis, nous introduisons les effets d'interaction entre une configuration ionique et des configurations covalentes, ces effets s'averant importants pour decrire correctement certains etats de dimeres d'alcalins a grand r. Finalement, nous presentons des resultats numeriques pour les molecules na2, li2, k2 ainsi que pour les molecules co et o2. Pour les dimeres d'alcalins, des courbes completes d'energie potentielle a grande distance sont presentees en couplage a) et c) de hund pour les dissociations ns+np les plus basses. Elles sont en bon accord avec des resultats issus d'autres modeles ou calculs ab initio, ainsi qu'avec les courbes experimentales disponibles. Les molecules co et o2 sont etudiees lorsque leurs atomes sont dans l'etat fondamental. Nous nous attachons en particulier aux etats quintuplets qui presentent des minima a grande distance internucleaire et montrons que ceux-ci sont bien decrits par la methode proposee. Une application du calcul de l'echange au dimere de o2 est egalement presentee, montrant un bon accord qualitatif avec des resultats ab initio. Une conclusion sur les differentes possibilites d'extension et d'amelioration de cette methode termine ce travail

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Vandel, Laurence. "Analyse du potentiel transformant des facteurs de transcription de la famille Jun : utilisation de variants agissant sous forme homodimérique." Lyon 1, 1995. http://www.theses.fr/1995LYO1T293.

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Aller, Pierre. "Etude du domaine transmembranaire de récepteur tyrosine kinase dans un environnement membranaire : aspects structuraux et mécanistiques explorés par dynamique moléculaire." Orléans, 2004. http://www.theses.fr/2004ORLE2034.

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Abstract:

La dimérisation induite par la fixation de ligand est nécessaire à l'activation des récepteurs tyrosine kinase. Le domaine transmembranaire unique de ces protéines joue un rôle crucial dans ces mécanismes. Le récepteur Neu chez le rat et son homologue ErbB2 chez l'humain sont à l'origine de nombreux cancers provoqués par la mutation ponctuelle Val/Glu dans le segment transmembranaire ou la surexpression du récepteur. La structure du domaine transmembranaire dans le récepteur dimère semble déterminante dans les processus d'activation. Les simulations de dynamique moléculaire montrent que, dans une membrane modèle constituée de DMPC ou de POPC hydratés, les hélices transmembranaires de Neu sauvage et oncogénique s'associent préférentiellement en enroulement gauche formant une interface symétrique. Dans le cas de Neu oncogénique le résidu polaire Glu, enfoui dans la membrane, stabilise les interactions entre hélices en formant de fortes liaisons hydrogène.

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Aci, Samia. "Etude par simulation de dynamique moléculaire de la variabilité conformationnelle du dimère de la séquence SL1 du génome de VIH-1." Orléans, 2004. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00008151v3.

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Abstract:

Le génome du VIH-1, l'agent responsable du SIDA, est composé de deux molécules identiques d'ARN liées de façon non-covalente par une région de leur extrémité 5'. Il a été montré que la tige-boucle SL1, localisée dans cette région, était capable d'initier cette dimérisation. La dimérisation constitue une étape clé du cycle de réplication du virus et fait intervenir deux types de complexe de SL1 : un « kissing-complex » et un complexe en forme de double hélice contenant deux boucles internes. Plusieurs structures contradictoires ont été publiées pour ces deux complexe, et différents mécanismes de transition entre ces complexes ont été envisagés jusque là. Ce travail a permis d'étudier la stabilité des différentes structures publiées, et en particulier de faire ressortir de l'ensemble des structures de « kissing-complex » publiées une conformation plus probable. Parallèlement, l'étude du mécanisme de transition a mis en évidence une structure intermédiaire dans ce processus. Ce travail constitue un ensemble d'informations qui pourra par la suite être utilisé pour la conceptions d'inhibiteurs de la dimérisation.

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Gangneux, Laure. "Le site d'initiation de dimérisation des ARN rétroviraux : influence de la séquence du site d'initiation dans la dimérisation de l'ARN provenant d'isolats différents du rétrovirus d'immunodéficience humaine : VIH-1 Lai et VIH-1 Mal." Orléans, 2003. http://www.theses.fr/2003ORLE2040.

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Abstract:

Le génome du virus de l'immunodéficience humaine(VIH), est constitué de deux molécules d'ARN liées entre elles au niveau de la région 5' terminale. Ce phénomène de dimérisation est lié à différentes étapes clés du cycle rétroviral. C'est pourquoi, l'inhibition de la dimérisation pourrait représenter une voie de traitement possible pour le VIH. Notre travail porte sur l'étude du mécanisme de dimérisation de courts fragments d'ARN de 23 nt correspondant à la séquence d'initiation de dimérisation de différents isolats Lai et Mal et de mutants. Nous avons mis en évidence des différences au niveau des intermédiaires de dimérisation pour ces différents ARN et des différences de stabilité grâce à des expériences de dénaturation thermique et de formation des dimères sur gel d'électrophorèse. Ces travaux mettent en évidence l'importance de la séquence autocomplémentaire de la boucle et l'importance des purines à la jonction tige-boucle dans le mécanisme de dimérisation.

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Cortez, Diego. "Amélioration des méthodes pour la détection des éléments intégrés dans les génomes de bactéries et d’archaeaÉtude du système Xer-dif chez les Archaea." Paris 11, 2009. http://www.theses.fr/2009PA112111.

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Abstract:

Les archées, le troisième domaine du vivant, ont des chromosomes circulaires et une machinerie de recombinaison homologue active. Par conséquent, les archées doivent héberger un mécanisme pour résoudre les éventuels dimères de chromosomes et ainsi surmonter cet obstacle dans leur cycle cellulaire. Nous avons identifié des sites dif dans des différents chromosomes d’archées, localisés toujours dans la région où la réplication se termine. Les protéines XerA est très active et capable de résoudre et de former des multimères de plasmides. Nos résultats indiquent que Xer/dif était présent à la base des bactéries et des archées, bien qu’on ne puisse pas distinguer s’il est dû à un transfert horizontal entre domaines ou à une présence chez LUCA. Les génomes de bactéries et d’archées possèdent un certain nombre de gènes d’origine étrangère qui sont arrivés par des événements récents de transfert horizontal de gènes. Néanmoins, le rôle de ces éléments intégratifs, comme les virus, les plasmides, les transposons, dans ce processus, n’a pas été entièrement quantifié. Nous avons réalisé une analyse globale des éléments intégratifs dans 119 génomes d’archées et de bactéries. Les résultats de ce travail indiquent que les génomes d’archées et de bactéries possèdent un nombre important d’éléments étrangers (dont les séquences orphelines) qui proviennent d’un énorme réservoir des éléments intégratifs que l’on à peine commencé à explorer
Archaea, the third domain of life, have circular chromosomes and active homologous recombination. Therefore, archaea should harbour a mechanism to solve dimeric chromosomes and overcome this obstacle on their cell cycle. Here we have identified putative dif-like sites in different archaeal chromosomes. The XerA protein is highly active and specific recombining two dif sites. Our results show that the Xer/dif were already present at the base of Bacteria and Archaea, although, we failed to determine whether this is due to an ancient horizontal gene transfer between domains or because the system was already present in LUCA. Archaeal and bacterial genomes contain a number of genes of foreign origin that arose from recent horizontal gene transfer, but the role of integrative elements, such as viruses, plasmids, and transposable elements, in this process has not been extensively quantified. We have performed a large-scale survey of potential recently acquired integrative elements in 119 archaeal and bacterial genomes. Our results strongly indicate that archaeal and bacterial genomes contain an impressive proportion of recently acquired foreign genes (including ORFans) coming from a still largely unexplored reservoir of integrative elements

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Azizi, Sihem. "Etude des propriétés électroniques de dimères d'alcalins. Application à la formation de molécules froides." Phd thesis, Université Paris Sud - Paris XI, 2006. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00012184.

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Abstract:

Les dimères d'alcalins ont été largement étudié ces dernières années par les techniques de spectroscopie et par la photoassociation d'atomes froids.
L'un des objectifs de ce travail consiste en l'obtention de données moléculaires adaptées à l'interprétation de processus collisionnels. Nous avons entrepris une étude systématique des ions moléculaires alcalins, en nous attachant à évaluer la précision des résultats en fonction des hypothèses retenues. Nous avons comparé nos résultats obtenus avec une méthode de pseudopotentiel, pour les ions lourds Rb2+, Cs2+ et RbCs+ à ceux obtenus avec une méthode de potentiel modèle.
Les taux de photoassociation de paires d'atomes mixtes d'alcalins et les taux de formation de molécules froides des dimères dans leur état fondamental ont été calculés avec une approche perturbative où les fonctions d'onde sont exactement déterminées. Ces taux ont la même grandeur pour tous les dimères contenant les atomes Rb et Cs.
Les taux de formation de molécules froides sont similaires à ceux mesurés et calculés pour les molécules de Cs2. Nous avons étudié le cas spécifique de la photoassociation dans deux états excités couplés par une interaction spin-orbite mettant en relief le rôle du couplage résonnant dans la formation de molécules froides stables dans des niveaux peu excités.

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Lampre, Isabelle. "Propriétés photophysiques de dimères formés par des sels de triarylpyrylium : étude expérimentale et théorique." Paris 11, 1996. http://www.theses.fr/1996PA112504.

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Mazoyer, Stéphane. "Synthèse et évaluation biologique de dimères et de tétramères acridiniques pontés en positions latérales." Aix-Marseille 3, 1998. http://www.theses.fr/1998AIX30015.

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Abstract:

Depuis leur decouverte, a la fin du siecle dernier, les acridines, ou dibenzob,epyridines, ont fait l'objet de nombreuses applications, notamment comme agents therapeutiques. C'est de leur capacite a s'intercaler entre les bases des acides nucleiques, mais aussi, et surtout, a bloquer l'action des proteines de replication, que semblent dependre leurs proprietes pharmacologiques. En consequence, la mise au point d'agents polyfonctionnels combinant plusieurs sous-unites acridiniques, dans une seule molecule, peut donner lieu a des composes ayant une plus grande affinite pour l'adn, et par la meme, des proprietes biologiques plus marquees qu'un intercalant simple. Pour ces raisons, nous avons mis au point la synthese de nouveaux composes comportant deux et quatre motifs acridiniques. La 4-bromomethylacridine, un intermediaire cle de notre synthese decrit en cinq etapes, est desormais accessible en une seule etape par une reaction de bromomethylation. Au cours de ce travail, nous avons egalement pu caracteriser des derives de c-alkylation du phenol. Les tests biologiques effectues sur les composes obtenus ont montre que certains d'entre eux presentaient, in vitro, une activite anticancereuse notable.

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Azizi, Sihem. "Etude des propriétés électroniques de dimères d’alcalins : application à la formation de molécules froides." Paris 11, 2006. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00012184.

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Abstract:

Les dimères d'alcalins ont été largement étudiés ces dernières années par les techniques de spectroscopie et par la photoassociation d'atomes froids. L'un des objectifs de ce travail consiste en l'obtention de données moléculaires adaptées à l'interprétation de processus collisionnels. Nous avons entrepris une étude systématique des ions moléculaires alcalins, en nous attachant à évaluer la précision des résultats en fonction des hypothèses retenues. Nous avons comparé nos résultats obtenus avec une méthode de pseudopotentiel, pour les ions lourds Rb2+, Cs2+ et RbCs+ à ceux obtenus avec une méthode de potentiel modèle. Les taux de photoassociation de paires d'atomes mixtes d'alcalins et les taux de formation de molécules froides des dimères dans leur état fondamental ont été calculés avec une approche perturbative où les fonctions d'onde sont exactement déterminées. Ces taux ont la même grandeur pour tous les dimères contenant les atomes Rb et Cs. Les taux de formation de molécules froides sont similaires à ceux mesurés et calculés pour les molécules de Cs2. Nous avons étudié le cas spécifique de la photoassociation dans deux états excités couplés par une interaction spin-orbite mettant en relief le rôle du couplage résonnant dans la formation de molécules froides stables dans des niveaux peu excités
The alkaline dimers and their cations have been studied previously with classical spectroscopy techniques and photoassociation of cold atoms. One of the goals of this study was to obtain molecular data appropriate to the interpretation of collisionnal processes. We did a systematic study of molecular alkaline ions while assessing the precision of the results depending on the hypothesis which had been chosen. We compared our results obtained with a pseudopotential method with those obtained with a potential method for the heavy ions Rb2+, Cs2+ and RbCs+. The rates of photoassociation of mixed alkali dimers, as well as the rates of formation of cold molecules in the ground stats, were calculated using a perturbative approach for which the wavefunctions are exactly determined. These rates have the same magnitude for all the heteronuclear dimers contained Rb and Cs atoms. The rates of cold molecules formation are similar to those mesured and computed for Cs2 molecules. We studied the specific case of photoassociation in two states coupled by a spin-orbit interaction who emphasizes the role of the resonant coupling in the formation of stable cold molecules in levels weakly excited

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Iskandar, Waêl. "Étude des collisions à basse énergie entre ions multichargés et dimères de gaz rare." Caen, 2015. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01243329.

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Abstract:

Ce projet doctoral consiste en l’étude de la dynamique de l’interaction entre des ions multichargés et des dimères de gaz rare dans des collisions à basse énergie. Après capture d’un ou plusieurs électrons de la cible par le projectile, plusieurs états moléculaires ioniques peuvent être produits. Ces états vont ensuite relaxer en fragments chargés via plusieurs processus de dissociation. Expérimentalement, cette étude est réalisée en utilisant la technique COLTRIMS, particulièrement efficace puisqu’elle permet la détection en multi-coïncidence des fragments moléculaires et du projectile. Théoriquement, la dynamique de la collision est interprétée à l’aide d’un calcul classique basé sur le modèle de la barrière coulombienne mais adapté au traitement de cibles moléculaires tels que les dimères de gaz rares. Ce modèle s’est montré en bon accord avec les résultats expérimentaux, que ce soit en termes de production relative des différents processus de dissociation, ou en termes de dépendance angulaire entre l’orientation de la molécule et la direction du projectile diffusé. L’ensemble de ce travail a finalement permis d’établir une cartographie des processus dans le repère de la molécule cible et de mettre en évidence un nouveau processus de relaxation de l’ion moléculaire. Ce processus de relaxation est émetteur d’électrons de très basse énergie et pourrait avoir un rôle non négligeable dans l’estimation des dommages causés par impact d’ion
Within this thesis, the dynamics of collisions between low energy multi-charged ions and Van-der-Waals dimers is investigated theoretically and experimentally. During the interaction ion/dimer, electrons from the target can be captured by the projectile and produce ionic states of the dimer. These states will then relax into charged fragments via multiple dissociation processes. Experimentally, this study is performed by means of Cold-Target Recoil-Ion Momentum Spectroscopy, a powerful technique which allows the multi-coincidence detection of target ionic fragments and the projectile. Theoretically, the collision dynamics is investigated using a classical calculation based on the Coulombic Over-Barrier Model and adapted to treat diatomic molecules such as dimers. This model has shown good agreement with the experimental results, both in terms of relative production of the different dissociation processes, and in terms of angular dependence of the molecular orientation in respect with the scattered projectile direction. All of this work has finally enabled to provide, for the different processes, the two-dimensional probability maps p(b) in the molecular frame and to highlight a new relaxation mechanism of the molecular ion named Interatomic Coulombic Decay. This relaxation process is electron emitter of very low energy and could have a significant role in the assessment of damage caused by ion impact

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Sun, Wangru. "Modèle de forêts enracinées sur des cycles et modèle de perles via les dimères." Thesis, Sorbonne université, 2018. http://www.theses.fr/2018SORUS007/document.

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Abstract:

Le modèle de dimères, également connu sous le nom de modèle de couplage parfait, est un modèle probabiliste introduit à l'origine dans la mécanique statistique. Une configuration de dimères d'un graphe est un sous-ensemble des arêtes tel que chaque sommet est incident à exactement une arête. Un poids est attribué à chaque arête et la probabilité d'une configuration est proportionnelle au produit des poids des arêtes présentes. Dans cette thèse, nous étudions principalement deux modèles qui sont liés au modèle de dimères, et plus particulièrement leur comportements limites. Le premier est le modèle des forêts couvrantes enracinées sur des cycles (CRSF) sur le tore, qui sont en bijection avec les configurations de dimères via la bijection de Temperley. Dans la limite quand la taille du tore tend vers l'infini, la mesure sur les CRSF converge vers une mesure de Gibbs ergodique sur le plan tout entier. Nous étudions la connectivité de l'objet limite, prouvons qu'elle est déterminée par le changement de hauteur moyen de la mesure de Gibbs ergodique et donnons un diagramme de phase. Le second est le modèle de perles, un processus ponctuel sur $\mathbb{Z}\times\mathbb{R}$ qui peut être considéré comme une limite à l'échelle du modèle de dimères sur un réseau hexagonal. Nous formulons et prouvons un principe variationnel similaire à celui du modèle dimère \cite{CKP01}, qui indique qu'à la limite de l'échelle, la fonction de hauteur normalisée d'une configuration de perles converge en probabilité vers une surface $h_0$ qui maximise une certaine fonctionnelle qui s'appelle "entropie". Nous prouvons également que la forme limite $h_0$ est une limite de l'échelle des formes limites de modèles de dimères. Il existe une correspondance entre configurations de perles et (skew) tableaux de Young standard, qui préserve la mesure uniforme sur les deux ensembles. Le principe variationnel du modèle de perles implique une forme limite d'un tableau de Young standard aléatoire. Ce résultat généralise celui de \cite{PR}. Nous dérivons également l'existence d'une courbe arctique d'un processus ponctuel discret qui encode les tableaux standard, defini dans \cite{Rom}
The dimer model, also known as the perfect matching model, is a probabilistic model originally introduced in statistical mechanics. A dimer configuration of a graph is a subset of the edges such that every vertex is incident to exactly one edge of the subset. A weight is assigned to every edge, and the probability of a configuration is proportional to the product of the weights of the edges present. In this thesis we mainly study two related models and in particular their limiting behavior. The first one is the model of cycle-rooted-spanning-forests (CRSF) on tori, which is in bijection with toroidal dimer configurations via Temperley's bijection. This gives rise to a measure on CRSF. In the limit that the size of torus tends to infinity, the CRSF measure tends to an ergodic Gibbs measure on the whole plane. We study the connectivity property of the limiting object, prove that it is determined by the average height change of the limiting ergodic Gibbs measure and give a phase diagram. The second one is the bead model, a random point field on $\mathbb{Z}\times\mathbb{R}$ which can be viewed as a scaling limit of dimer model on a hexagon lattice. We formulate and prove a variational principle similar to that of the dimer model \cite{CKP01}, which states that in the scaling limit, the normalized height function of a uniformly chosen random bead configuration lies in an arbitrarily small neighborhood of a surface $h_0$ that maximizes some functional which we call as entropy. We also prove that the limit shape $h_0$ is a scaling limit of the limit shapes of a properly chosen sequence of dimer models. There is a map form bead configurations to standard tableaux of a (skew) Young diagram, and the map is measure preserving if both sides take uniform measures. The variational principle of the bead model yields the existence of the limit shape of a random standard Young tableau, which generalizes the result of \cite{PR}. We derive also the existence of an arctic curve of a discrete point process that encodes the standard tableaux, raised in \cite{Rom}

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Ben, Abderrahman Moufida. "Oxydation d'ions carboxylates : déshydrodimérisation et synthèse d'amidoesters." Lyon 1, 1985. http://www.theses.fr/1985LYO11691.

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Abstract:

Formation de radicaux methyle par oxydation electrochimique d'acides carboxyliques. Ces radicaux permettent la realisation d'une reaction de deshydrodimerisation a partir de l'isobutyronitrile et du methoxyacetate de methyle, et d'une reaction de dimerisation entre les monoesters de diacides et des acylaminoacides. Influence de la structure des composes de depart sur la nature des produits obtenus

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Cérède, Odile. "Etudes des mécanismes moléculaires de l'invasion des cellules hotes par Toxoplasma gondii : rôle des protéines de micronèmes." Tours, 2006. http://www.theses.fr/2003TOUR3804.

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Abstract:

L'invasion des cellules par les Apicomplexa est associée à la sécrétion de protéines de micronèmes. Nous avons étudié la fonction de deux protéines, MIC1 et MIC3, possédant des propriétés d'adhésion pour la surface des cellules in vitro. Le domaine d'adhésion de MIC3 est apparenté au domaine de fixation du N-actétylglucosamine. Il est fonctionnel sous forme dimérique et seulement après clivage d'une proséquence. Deux acides aminés aromatiques indispensables à la fonction de reconnaissance de la cellule hôte ont été identifiés. Après délétion par génétique inverse des gènes MIC1 et MIC3 indépendamment ou simultanément et nous avons montré le rôle additif de ces protéines dans la virulence. Seulement le Mic1KO présente un défaut d'invasion. Le rôle de MIC3 dans la virulence dépend de ses propriétés adhésives pour la surface des cellules hôtes. Des essais de vaccination utilisant le double mutant conduisent à une protection totale des souris vis à vis d'une seconde infection par voie orale
Cell invasion by apicomplexan is associated ith secretion of microneme proteins. We have investigated the role of two soluble MIC1 and MIC3 proteins, which have affinity for cell surface. We have developped an original MIC3 binding essay by transfection of mammalian cells. The receptor binding site of MIC3 is located in the N-terminal chitin binding-like domain, which remains poorly accessible until the adjacent propetide has been cleaved, and shown that binding requires dimerization. Two aromatic amino acids in this domain have been identified to be crucial for binding to cells. Mic1KO, mic1-3KO or mic1-3KO parasites have been genetically engineered. While individual disruption of MIC1 or MIC3 genes slightly reduced virulence, doubly depleted parasites were markedly impaired in virulence and confered protection against oral cyst challenge. Deletion of the MIC1 gene alone affected fibroblast invasion. MIC3 binding function is crucial for expression of virulence

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Bonné, Marie Laetitia. "Etude de la translocase à ADN FtsK et de ses interactions avec les recombinases XerCD chez Escherichia coli." Paris 11, 2009. http://www.theses.fr/2009PA112259.

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Abstract:

Chez les bactéries possédant des chromosomes circulaires, la formation de dimères de chromosomes par recombinaison homologue peut bloquer la ségrégation de l’ADN lors de la division cellulaire. Chez E. Coli, 2 recombinases à tyrosine XerCD résolvent les dimères par recombinaison spécifique de site à dif. Les brins clivés par XerC et XerD sont nommés respectivement Top et Bottom. Quand l’ADN est piégé au septum, une translocase à ADN, FtsK, se charge sur des motifs spécifiques, les KOPS, répartis sur les 2 replichores du chromosome. Dif est à la jonction de la polarité des KOPS. FtsK pompe l’ADN jusqu’à rencontre des sites dif du dimère et active la recombinaison en contactant XerD. J’ai voulu déterminer ce qui dans la structure de l’ADN est important pour la translocation et l’activation de la recombinaison par FtsK. En testant la capacité de FtsK à activer Xer sur des substrats d’ADN double brin avec des régions simple brin et à défaire des structures branchées, j’ai trouvé une asymétrie des effets des régions ‘simple brin’ top/bottom. Même si FtsK peut transloquer sur du simple brin, des contacts avec un brin sont essentiels pour l’activation de la recombinaison. Par ailleurs, la translocation de FtsK devrait être stoppée au site dif ou lors du contact avec les recombinases pour permettre l’activation de la recombinaison. J’ai observé l’efficacité de translocation de FtsK in vitro en présence/absence de dif et/ou XerCD, et in vivo sur plasmide. Il apparaît que XerC et D bloquent la translocation de FtsK et non dif
In bacteria harbouring circular chromosomes, the formation of chromosomes dimer due to homologous recombination can block DNA segregation at cell division. In E. Coli, 2 tyrosine recombinases, XerC and XerD, resolve chromosome dimers by site specific recombination at dif. The strands cleaved by XerC and D are called top and bottom strands, respectively. When DNA is trapped at the septum, a DNA translocase, FtsK, loads on specific DNA motifs, the KOPS, skewed on the 2 chromosome replichores. Dif is located at the junction of KOPS polarity. FtsK pumps DNA until dif sites are brought together, and activates recombination via a direct interaction with XerD. I wanted to know what in the structure of DNA is important for DNA translocation and Xer recombination activation by FtsK. I monitored the activity of FtsK using Xer recombination on synthetic double stranded DNA substrates containing single stranded gaps and its capacity to displace forked DNA structures. Results indicate a top/bottom asymmetry in the effect of single strand gaps. Preferential contacts with one strand of DNA are essential for FtsK activation of Xer recombination, even if FtsK can translocate on single strand DNA. Moreover, FtsK translocation should stop when it reaches dif or contacts one or both recombinases, to allow recombination activation. I monitored the efficiency of FtsK translocation in vitro in the presence or absence of dif and/or XerCD, and in vivo on plasmids. Data indicate that both XerC and XerD block FtsK translocation but not dif

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Rachez, Christophe. "Détermiants structuraux du récepteurs humain alpha de l'acide rétinoïque (RAR) impliqués dans la dimérisation et la liaisin à l'ADN." Lille 1, 1996. https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/Th_Num/1996/50376-1996-89.pdf.

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Abstract:

L'acide rétinoïque, un dérive de la vitamine a, est un élément clef du contrôle de la prolifération et de la différenciation cellulaires. Son mécanisme d'action met en jeu l'activation de gènes cibles, notamment via deux récepteurs nucléaires. Dans cette étape, les récepteurs de l'acide rétinoïque tout-trans (rar) et de son dérive 9-cis (rxr) se lient sous forme d'heterodimeres à des éléments de réponse appelés rare. Le positionnement précis des deux récepteurs sur l’ADN cible est déterminé par plusieurs motifs structuraux qui forment des interfaces de mémorisation des récepteurs et d'interaction avec l’ADN. Nous avons mis au point une stratégie basée sur des modifications chimiques spécifiques d'amino-acides afin d'examiner le rôle des lysines, arginines, cystéines, histidines, tyrosines et tryptophane du rar dans ses fonctions de liaison a l’ADN, d'homodimerisation et d'heterodimerisation en présence et en absence d’ADN. Nous avons observé une implication différentielle de ces aminoacides dans les différentes fonctions testées. Dans un deuxième temps, le radio marquage des lysines accessibles du rar natif a permis de localiser ces résidus dans la 8#e heptad repeat au sein du domaine de liaison au ligand. Ces résultats fournissent une mise en évidence directe de l'implication différentielle de résidus a groupement basique, thiol ou aromatique dans les propriétés de liaison a l’ADN, homodimerisation et heterodimerisation du rar, et illustrent la mise en jeu de plusieurs interfaces de dimerisation.

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Descamps-Francois, Carole. "Conception et synthèse de ligands mélatoninergiques sélectifs du sous-type MT 1." Lille 1, 2000. https://pepite-depot.univ-lille.fr/RESTREINT/Th_Num/2000/50376-2000-420.pdf.

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Abstract:

La melatonine ou n-acetyl-5-methoxytryptamine est une neurohormone synthetisee la nuit, principalement par la glande pineale (epiphyse). Ses perspectives therapeutiques majeures sont celles liees a la resynchronisation du cycle veille-sommeil dans le cas de decalage horaire, de travail poste et de desordres affectifs saisonniers ainsi que l'anxiete, le cancer et l'immunodeficience. Toutefois l'interet therapeutique de la melatonine se trouve limite par un certain nombre d'inconvenients, tels qu'un temps de demi-vie court et une action ubiquitaire, due notamment a sa lipophilie et a la diversite de ses recepteurs. En effet, chez l'homme, deux sous-types receptoriels mt 1 et mt 2 ont ete clones et sequences. L'objectif de ce travail reside dans la conception et la synthese d'analogues structuraux melatoninergiques metaboliquement plus stables et plus selectifs du sous-type receptoriel mt 1 afin de caracteriser son role fonctionnel et d'envisager des indications therapeutiques nouvelles
En appliquant le principe de bioisosterie a l'heterocycle indolique de la melatonine, et en utilisant les relations structure - affinite-activite, nous avons concu et synthetise differents ligands melatoninergiques : - dans un premier temps, nous avons introduit diverses chaines alkyles lineaires fonctionnalisees en position 7 de l'analogue naphtalenique. - dans un deuxieme temps, nous avons synthetise des derives homodimeriques espaces par une chaine carbonee de longueur variable. Sur le compose le plus interessant, nous avons ensuite realise des pharmacomodulations au niveau de la fonction acetamide. - enfin, nous avons prepare des heterodimeres et des derives apparentes. Tous ces derives ont fait, ou font encore l'objet d'etudes pharmacologiques, effectuees par la societe adir, filiale des laboratoires servier. Les resultats pharmacologiques presentes sont discutes sous l'angle des relations structure-affinite

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Catherin, Manon. "Synthèse et propriétés spectroscopiques d'assemblages moléculaires basés sur le chromophore curcuminoïde de bore." Electronic Thesis or Diss., Aix-Marseille, 2020. http://www.theses.fr/2020AIXM0193.

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Abstract:

Le développement de colorants organiques contenant des groupes donneurs (D) et accepteurs (A) d’électrons connectés via un pont conjugué est un domaine très actif. En effet, les systèmes D-π-A-π-D de type quadripolaire présentent des structures électroniques caractérisées par un transfert de charge intermoléculaire à l’état fondamental et excité qui permet d'obtenir des propriétés d'absorption et d'émission de fluorescence remarquables.Depuis 2012, notre équipe développe la synthèse de chromophores D-π-A-π-D à partir du squelette curcuminoïde dans lequel A est un chélate de bore. Une grande série de cycles de donneurs aromatiques a été envisagée, permettant une modulation efficace des propriétés optiques et électroniques en solution. Ces molécules ont également été étudiées dans le solide et des valeurs élevées de rendements quantiques de fluorescence dans le proche infrarouge ont été obtenues. Tout d’abord, afin d'obtenir des informations précieuses sur les corrélations entre les propriétés optiques et les interactions interchromophoriques supramoléculaires, nous avons conçu des bichromophores covalents dans lesquels deux unités curcuminoïdes-BF2 sont reliées par une liaison flexible et rigide.Ensuite, nous avons décidé d’étudier la dynamique de spin des chromophores curcuminoïdes excités. Nous décrivons ici la synthèse de deux familles de dérivés curcuminoïdes substitués en position centrale par un radical persistant TEMPO ou 6-oxoverdazyle
The development of organic dyes containing electron donor (D) and acceptor (A) groups connected via a π-conjugated bridge is a very active domain. Indeed, quadrupole-like D-π-A-π-D systems show electronic structures characterized by an intermolecular charge transfer in the ground and excited states which makes possible to obtain remarkable absorption and fluorescence emission properties. Since 2012, our team is developing the synthesis of D-π-A-π-D chromophores based on the curcuminoid skeleton in which A is a boron chelate. A large series of aromatic donor cycles could be considered, allowing efficient modulation of optical and electronical properties in solution. These molecules have also been studied in the solid and high values of near-infrared fluorescence quantum yields were obtained. Firstly, in order to get valuable insights into the correlations between optical properties and supramolecular interchromophoric interactions, we are designing covalent bichromophores in which two curcuminoid-BF2 units are connected by a flexible and rigid link. Secondly, we decided to explore the perturbation of the excited curcuminoid chromophore by an unpaired electron spin. We describe the synthesis of two families of curcuminoid derivatives substituted in the central position by a persistent TEMPO or 6-oxoverdazyl radical

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De, Tilière Béatrice. "Modèles exactement solubles de mécanique statistique en dimension deux : modèle d'Ising, dimères et arbres couvrants." Habilitation à diriger des recherches, Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00909569.

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Abstract:

Ce mémoire donne un aperçu de mes travaux de recherche depuis la thèse. La thématique générale est la mécanique statistique, qui a pour but de comprendre le comportement macroscopique d'un système physique dont les interactions sont décrites au niveau microscopique. De nombreux modèles appartiennent à la mécanique statistique; nos résultats se concentrent sur le modèle d'Ising, le modèle de dimères et les arbres couvrants en dimension deux. Ces trois modèles ont la particularité d'être exactement solubles, c'est-à-dire qu'il existe une expression exacte et explicite pour la fonction de partition. Ce mémoire décrit et met en perspective les résultats de mes publications, et donne les étapes principales des démonstrations.

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Chollet, Constance. "Synthèse de monomères et dimères fluorés d'artémisinines : évaluation de leurs activités antipaludiques, antitumorales, et antiangiogéniques." Université Paris XI, 2006. http://www.theses.fr/2006PA114832.

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Abstract:

L'artémisinine, extraite d'Artemisia annua, est une molécule de référence dans le traitement du paludisme. Aujourd'hui, ses dérivés sont utilisés massivement en thérapie, mais leur dégradation rapide dans l'organisme limite leur efficacité. L'introduction de groupements fluorés sur l'artémisinine avait conduit à des familles de fluoro-artémisinines, plus stables vis-à-vis du métabolisme, et très actives contre le paludisme. Récemment, des dimères d'artémisinines ont montré une activité cytotoxique in vitro et l'hypothèse d'une activité antiangiogénique a été avancée. Cette thèse s'articule en trois parties. Une nouvelle famille de fluoro-artémisinines a d'abord été obtenue par l'étude d'une compétition SN/SN' et a montré une activité antipaludique satisfaisante. Des dimères d'artémisinines fluorées ont ensuite été conçus et synthétisés par deux voies de synthèses originales: la métathèse et des réactions de transfert de soufre par le tétrathiomolybdène (MOLY). Enfin les activités biologiques de ces dimères ont été évaluées. Une activité antitumorale très intéressante a été mise en évidence in vitro et in vivo. Par contre, l'activité antiangiogénique n'a pas été démontré pour ces dimères
Artemisinin, extracted from Artemisia annua, is one of the most active antimalarial. Its derivatives are widely used in therapy, but their fast degradation in human organism limits their efficacy. The introduction of fluoroalkyl group on artemisinin skeleton led to fluoro-artemisinins families, presenting a better stability against metabolism, and a very good antimalarial activity. Recently, artemisinins dimers have shown a cytotoxic activity in vitro and the hypothesis of an antiangiogenic activity has been advanced. This thesis is divided in three parts. First, a new family of fluoro-artemisinins had been synthesized through the study of a SN/SN' competition, and had shown a satisfying antimalarial activity. In a second part, fluoro-artemisinins dimers had been conceived and synthesized, using two original ways : metathesis reactions and sulfur transfer reactions with tetrathiomolybdate (MOLY). Then, biological activities of those dimers were evaluated. A very interesting antitumorale activity was demonstrated in vitro and in vivo. Antiangiogenic activity had not been demonstrated for those dimers

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Bellot, Morgane. "Caractérisation des dimères de récepteurs à l'angiotensine II AT1 et a2C-adrénergiques et conséquences fonctionnelles." Toulouse 3, 2013. http://thesesups.ups-tlse.fr/2185/.

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Abstract:

Les mécanismes de sécrétion de noradrénaline (NA) via les récepteurs de l'angiotensine (AT1) et alpha2-adrénergiques (alpha2A/C-AR) restant méconnus, nous avons émis l'hypothèse de l'implication d'un dimère AT1/alpha2C. Nos résultats montrent que ces deux récepteurs interagissent directement et que la liaison l'angiotensine II (AngII) et de NA stabilisent des conformations différentes du dimère. De plus, dans des conditions mimant l'hypertension artérielle (HTA ; costimulation NA+AngII), le dimère adopte une nouvelle conformation. En utilisant une technique originale permettant de mesurer spécifiquement l'activation des voies de signalisation intracellulaires induite uniquement par le dimère AT1/alpha2C, nous avons mis en évidence que la costimulation induit l'activation par le dimère d'une nouvelle voie de signalisation faisant intervenir la voie Galphas/PKA. Enfin, nous avons étudié la relevance physiologique de cette nouvelle entité in vivo en explorant l'activité du SNA chez la souris par microneurographie. De façon étonnante, la co-injection AngII+NA engendre une augmentation de l'activité du SNS, par rapport à l'injection d'AngII seule suggérant potentiellement un rôle du dimère AT1/alpha2C dans le contrôle de l'activité du SNA. En conclusion, l'ensemble de ces travaux montrent pour la première fois l'existence du dimère AT1/alpha2C et surtout la création d'une nouvelle entité pharmacologique via un dimère. A plus long terme, le dimère AT1/alpha2C pourrait représenter une nouvelle entité pharmacologique qui modulerait de façon originale le tonus sympathique et pourrait constituer une nouvelle cible de médicaments notamment dans le cadre du traitement de l'HTA
Mechanisms of norepinephrine (NE) secretion via angiotensin (AT1) and alpha2-adrenergic (alpha2A/C-AR) receptors remains unknown. So we hypothesized the involvement of a AT1/alpha2C dimer. Our results show that these two receptors are able to interact directly and binding of angiotensin II (Ang II) or NA stabilize different conformations of the dimer. In addition, under conditions mimicking arterial hypertension (HTN; costimulation NA+AngII), AT1/alpha2C dimer adopts a new conformation. Using a new technique allowing a specific measure of intracellular signaling pathways activation only induced by AT1/alpha2C dimer, we demonstrated that costimulation induces a new signaling pathway involving the Galphas / PKA pathway. Finally, we studied the physiological relevance of this new entity in vivo by exploring the SNS activity in mice by microneurography. Surprisingly, co-injection AngII + NA causes an increased SNS activity, compared to the injection of AngII alone, suggesting a role of AT1/alpha2C dimer in the control of controlling SNS activity. In conclusion, all this work show for the first time the existence of the AT1/alpha2C dimer and especially the creation of a new pharmacological entity in HTN condition. In the longer term, AT1/alpha2C dimer may represent a new pharmacological entity that originally modulate the sympathetic tone and may be a new drug target in particular the treatment of HTN

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Le, Meur Rémy. "Etude structurale du mécanisme d'échange de chaînes des dimères de la protéine HU d'E. coli." Thesis, Orléans, 2015. http://www.theses.fr/2015ORLE2004/document.

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Abstract:

HU est une protéine bactérienne de type histone impliquée dans de nombreuses fonctions biologiques telles que la compaction, la transcription, la réplication et la réparation de l'ADN. Chez E. coli, il existe trois espèces dimériques de HU (HUα2, HUβ2 et HUαβ) ayant des rôles biologiques distincts. La formation de l'hétérodimère repose sur un échange de chaines peptidiques entre les homodimères. Un mécanisme modèle a été proposé par Ramstein et collaborateurs (J.M.B. 331, 101-121 2003) et a servi de point de départ a ce travail. Dans ce modèle, les homodimères transitent d'une conformation native (N2) vers une conformation intermédiaire (I2). Les homodimères sous forme I2 s'associent ensuite dans un hétérotetramère transitoire qui se redissocie en formant des hétérodimères. L'objectif principal de ce travail de thèse a été de caractériser chaque étape du mécanisme d'échange du point de vue structural et cinétique. Parmi les principaux résultats de ce travail, deux structures originales, HUβ2 de E. coli et HU de L. lactis, ont été obtenues par diffraction des rayons X et complètent la caractérisation structurale des protéines HU sous leur forme N2. Un modèle de la conformation I2, partiellement désordonnée, a été élaboré à partir des résultats obtenus en RMN et en simulation de dynamique moléculaire. De plus, l'existence de la conformation tétramérique a été mise en évidence en faible concentration par spectrométrie de masse en conditions natives. Des protocoles de production/purification/oxydation ont été mis au point pour l'introduction de ponts disulfure afin de stabiliser la conformation tétramérique en vue de sa caractérisation structurale. L'ensemble des données acquises par ces différentes méthodes biophysiques affine la compréhension du mécanisme d'échange de chaines d'un point de vue structural et cinétique et met en lumière le rôle clef de la conformation I2 dans le contrôle de la composition des dimères de HU
HU is a histone like protein of bacteria involved in numerous biological functions such as DNA compaction, transcription, replication and repair. In E. coli, three HU dimers types are present (HUα2, HUβ2 et HUαβ) and show distinct biological roles. The heterodimer is formed from homodimers through a peptidic chain exchange. A model of this mechanism has been proposed by Ramstein and coworkers (J.M.B. 331, 101-121 2003) and was used as a starting point for this study. In this model, homodimers undergo a conformationnal change from a native state (N2) toward an intermediate state (I2). Then, I2 homodimers associate to form a transient heterotetramer which then dissociate into heterodimers. The main aim of this work was to characterize the structure and kinetic of each step of this mechanism. Major results of this work include the elucidation of two original crystal structures : HUβ2 from E. coli and HU from L. lactis in N2 states. A model of the partially disordered I2 state has also been proposed for HUβ2 and HUα2, and is consistent with results obtained from both NMR and molecular dynamics experiments. In addition, the existence of a low concentration tetrameric conformation has been evidenced by native mass spectrometry experiments. A protocol of production/purification/oxydation as been developped for the introduction of disulfide bridges in order to stabilize this conformation and characterize its structure. Together, results obtained from these different biophysical means refine our understanding of the chain exchange mechanism at the molecular level and highlight the role of the I2 conformation in controlling HU dimers composition

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Abdul-Hassan, Wathiq Sattar. "Matériaux moléculaires électro-stimulables et assemblages organisés reposant sur des briques élémentaires de type pi-dimères." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2018. http://www.theses.fr/2018GREAV005/document.

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Abstract:

Le but de cette proposition est d'explorer un nouveau concept de matériaux moléculaires sensibles à l'oxydoréduction. Les architectures commutables électron-sensibles ont longtemps été reconnues comme le choix le plus simple et le plus viable pour produire des dispositifs pratiques, mais la conception efficace de tels systèmes à l'échelle moléculaire reste un défi. L'approche développée dans ce projet repose sur la production électrochimiquement déclenchée de radicaux pi à partir de dérivés de viologène, l'objectif étant d'induire la formation d'une liaison non-covalente et réversible entre ces radicaux pi pour contrôler la conformation des échafaudages supramoléculaires. Les nanomatériaux comprendront des fils moléculaires provenant de polymères de coordination et des fils moléculaires produits par des interactions π le long de l'axe du fil, mis en œuvre par des interactions faibles périphériques telles que l'agrégation des chaînes latérales lipophiles ou la liaison H. Les efforts initiaux se concentreront sur l'optimisation de la formation de π-dimères et de pimer, avec ou sans assistance d'interactions secondaires. Après avoir déterminé les paramètres qui produisent l'auto-assemblage dirigé π le plus efficace, des motifs basés sur les viologènes appropriés seront introduits dans des blocs de construction plus sophistiqués. Tout au long de la synthèse des assemblages, la π-dimérisation utilisée comme force motrice principale pour l'auto-assemblage des nanomatériaux peut être consolidée par un blocage covalent des structures. En fin de compte, l'électrostimulation des systèmes π fournira des assemblages moléculaires dynamiques dans lesquels la morphologie sera sensible aux stimuli redox
The aim of this proposal is to explore a new concept of redox-responsive molecular materials. Electron-responsive switchable architectures have long been recognized as the most straightforward and viable choice to produce practical devices but efficiently designing such systems on the molecular scale still remains a challenge. The approach developed in this project relies on the electrochemically triggered production of pi-radicals from viologen derivatives, the objective being to induce the formation of non-covalent and reversible binding between these pi-radicals to control the conformation of supramolecular scaffolds. The nanomaterials will comprise molecular wires arising from coordination polymers and molecular wires produced by π-interactions along the wire's axis implemented by peripheral weak interactions such as lipophilic side chain aggregation or H-bonding. The initial efforts will focus on the optimization of π-dimer and pimer formation, with or without assistance of secondary interactions. After determining the parameters that yield the most efficient π directed self-assembly, suitable viologen based motifs will be introduced in more sophisticated building blocks. Throughout the synthesis of the assemblies, π-dimerization that is used as the primary driving force for the self-assembly of nanomaterials may be consolidated by covalent locking of the structures. In the end, the electro-stimulation of π systems will provide dynamic molecular assemblies in which the morphology will be responsive to redox stimuli

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Dissertations / Theses on the topic 'Dimères'

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