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Journal articles on the topic 'Diversité et divergence génétique'

Author: Grafiati

Published: 1 February 2023

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1

Diop, Abdel Kerim M., Mohamed S. Chrif Ahmed, Mohamed B. Biya, Mohamed Lemine Haki, Gaukhar Konuspayeva, and Bernard Faye. "Comparaison des phénotypes camelins de Mauritanie aux écotypes d’Afrique et d’Asie." Revue d’élevage et de médecine vétérinaire des pays tropicaux 73, no. 4 (November 25, 2020): 247–54. http://dx.doi.org/10.19182/remvt.31948.

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Abstract:

Afin d’évaluer la diversité phénotypique caméline en Mauritanie, des mensurations corporelles ont été réalisées sur 131 chamelles adultes amenées à l’abattoir de Nouakchott, animaux en provenance de l’ensemble du territoire mauritanien. En moyenne les mensurations corporelles ont été (en cm) de 51,5 ± 2,0 (longueur de la tête), 21,5 ± 1,5 (largeur de la tête), 108,4 ± 6,6 (longueur du cou), 65,6 ± 4,9 (tour du cou), 184,7 ± 8,1 (hauteur au garrot), 197,8 ± 8,2 (tour de poitrine), 147,1 ± 9,3 (longueur du corps) et 76,8 ± 5,2 (tour de cuisse). Par classification automatique, il a été possible d’identifier cinq phénotypes allant des animaux de petite taille, au petit gabarit et au cou fin et court, à des animaux longilignes de grande taille en passant par des gabarits de taille moyenne se distinguant par la grosseur de la tête ou des membres. Comparés aux données de la littérature, ces phénotypes apparaissent très proches des races décrites dans les pays du Maghreb et plus globalement des races africaines, et s’opposent aux races asiatiques, plus grandes et plus productives. La variabilité des phénotypes mauritaniens s’est avérée de faible ampleur, ce qui peut s’expliquer par la position de la Mauritanie, à l’extrémité occidentale de l’aire de répartition du dromadaire en Afrique, zone de brassage génétique important avec de faibles divergences rendues possibles par la topographie du pays.

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2

Donkpegan, Segbedji Armel Loïc. "Histoire évolutive du complexe Afzelia Smith (Leguminosae - Caesalpinioideae) dans les écosystèmes forestiers et savanicoles d’Afrique tropicale." BOIS & FORETS DES TROPIQUES 334 (January 2, 2018): 77. http://dx.doi.org/10.19182/bft2017.334.a31494.

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Abstract:

Le genre Afzelia Smith est connu pour comporter sept espèces africaines d’arbres dont deux se retrouvent dans la région zambézienne, une en région soudanienne et les quatre autres en région guinéo-congolaise. Ces taxons, à haute valeur commerciale, sont difficiles à distinguer les uns des autres. Ils sont donc commercialisés sous un même nom : « doussié » ou « afzelia ». Ces difficultés de distinction peuvent s’avérer préjudiciables à la gestion durable des populations.Le but de cette thèse de doctorat est de caractériser l’histoire évolutive du genre Afzelia. Plus spécifiquement, cette étude vise à : (i) évaluer le niveau des divergences morphologiques au sein du genre et décrire les relations phylogénétiques, afin de quantifier l’isolement reproductif entre les taxons d’Afzelia en mettant en évidence le rôle des changements climatiques passés et/ou des gradients écologiques dans la spéciation ; (ii) procéder à une analyse approfondie de la diversité et de la structuration génétique spatiale d’Afzelia spp. ; (iii) identifier et décrire les facteurs écologiques, biotiques et abiotiques susceptibles d’influencer les flux géniques à l’échelle des populations d’une espèce d’Afzelia (A. bipindensis).Une analyse morphogénétique des espèces a été effectuée et a confirmé la forte ressemblance botanique entre les taxons. Les espèces de savane se sont avérées être diploïdes et présentent la moitié de la taille du génome des espèces forestières qui sont donc tétraploïdes. Les phylogénies de gènes, nucléaires et chloroplastiques, diffèrent entre elles. De telles différences peuvent être générées à la suite d’épisodes d’hybridation ancestrale entre espèces. Ces hybridations seraient probablement anciennes et seraient survenues entre les lignées des espèces forestières et celles d’A. quanzensis (une espèce des savanes zambéziennes). La polyploïdie serait survenue entre 7 et 9,4 millions d’années au cours de l’histoire évolutive du genre. De plus, une assignation bayésienne et des analyses d’isolement reproductif ont suggéré l’existence de croisements interspécifiques, mais uniquement chez les espèces forestières distribuées en sympatrie. À une échelle spatiale plus limitée, deux groupes génétiques bien différenciés ont été observés en sympatrie chez A. bipindensis. Ceux-ci présentent une différenciation morphologique et un décalage phénologique de la floraison qui peut contribuer à leur isolement reproductif.Cette étude a permis de mettre en évidence quelques points importants que sont : la découverte d’un complexe polyploïde au sein du genre Afzelia ; la confirmation de la délimitation des espèces diploïdes de savane ; et la nécessité de réviser la taxonomie des espèces tétraploïdes forestières.

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3

Gunn, H. H., S. N. Chimenem-Amadi, V. U. Oleforuh-Okoleh, and B. O. Agaviezor. "Genetic diversity and association of motilin receptor gene between growth traits in Nigerian improved native chickens." Nigerian Journal of Animal Production 48, no. 5 (November 10, 2021): 20–29. http://dx.doi.org/10.51791/njap.v48i5.3184.

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Abstract:

The study was conducted to assess the genetic diversity and association of motilin receptor gene between growth traits in Nigerian improved native chickens by using 150 chickens of mixed sexes comprised of 50 naked neck, 50 Normal feathered and 50 Frizzled feathered. The birds were kept for 16 weeks during which feed and water were supplied ad libitum as well as medications/vaccinations. During this period, data on feed intake, feed conversion ratio, body weight, wing length, shank length, drumstick, body length, height at withers and breast girth were collected. Blood samples were collected for DNA extraction at the 16 week. Polymerase Chain Reaction and sequencing was done. Data collected were subjected to Analysis of Variance (ANOVA). The results revealed C>G mutation that was associated with the growth data. There was no significant (p>0.05) difference between the haplotypes (CC and CG) in feed intake although, CG haplotype (mutant gene) recorded the numerical higher value (3584.00±11.96g). Significant effect (p<0.05) was observed for feed conversion ratio with a range of 4.17±0.09 in CG to 4.22±0.11 in CC. Body weight was also significant (p<0.05) with values ranging from 1672.00±32.93g in CC to 1954.00±29.45g in CG. There was no significant (p>0.05) difference between the haplotype CC (normal) and haplotype CG (mutant) for wing length, shank length, drumstick, body length, height at withers and breast girth. The highest estimates of evolutionary divergence between sequences (0.046) were observed between naked neck chickens and Normal feathered chickens. Normal feathered chicken had the highest within mean group genetic distance of 0.143. These results if properly harnessed could assist in the improvement of the Nigeria local chicken in terms of improved growth performance. L'étude a été menée pour évaluer la diversité génétique et l'association du gène du récepteur de la motiline entre les traits de croissance chez des poulets indigènes améliorés nigérians en utilisant 150 poulets de sexes mixtes comprenant 50 à cou nu, 50 à plumes normales et 50 à plumes frisées. Les oiseaux ont été gardés pendant 16 semaines au cours desquelles de la nourriture et de l'eau ont été fournies ad libitum ainsi que des médicaments/vaccinations. Au cours de cette période, des données sur la prise alimentaire, le taux de conversion alimentaire, le poids corporel, la longueur des ailes, la longueur du jarret, le pilon, la longueur du corps, la hauteur au garrot et la circonférence de la poitrine ont été recueillies. Des échantillons de sang ont été prélevés pour l'extraction d'ADN à la 16e semaine. La réaction en chaîne par polymérase et le séquençage ont été effectués. Les données recueillies ont été soumises à une analyse de variance (ANOVA). Les résultats ont révélé une mutation C>G associée aux données de croissance. Il n'y avait pas de différence significative (p>0,05) entre les haplotypes (CC et CG) dans la prise alimentaire bien que l'haplotype CG (gène mutant) ait enregistré la valeur numérique la plus élevée (3584,00±11,96g). Un effet significatif (p<0,05) a été observé pour le taux de conversion alimentaire avec une plage de 4,17 ± 0,09 en CG à 4,22 ± 0,11 en CC. Le poids corporel était également significatif (p<0,05) avec des valeurs allant de 1672,00 ± 32,93 g en CC à 1954,00 ± 29,45 g en CG. Il n'y avait pas de différence significative (p>0,05) entre l'haplotype CC (normal) et l'haplotype CG (mutant) pour la longueur des ailes, la longueur du jarret, le pilon, la longueur du corps, la hauteur au garrot et la circonférence de la poitrine. Les estimations les plus élevées de divergence évolutive entre les séquences (0,046) ont été observées entre les poulets à cou nu et les poulets à plumes normales. Le poulet à plumes normal avait la distance génétique la plus élevée au sein du groupe moyen de 0,143. Ces résultats, s'ils sont correctement exploités, pourraient contribuer à l'amélioration du poulet local du Nigeria en termes de performances de croissance améliorées

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4

KREMER (Antoine). "Changements climatiques et diversité génétique." Revue Forestière Française, sp (2000): 91. http://dx.doi.org/10.4267/2042/5408.

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5

DUCOUSSO (Alexis) and JARRET (Pascal). "Diversité génétique des chênes et gestion forestière." Revue Forestière Française, sp (2001): 133. http://dx.doi.org/10.4267/2042/5285.

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6

Roquebert, B., F. Damond, F. Brun-Vézinet, and D. Descamps. "Diversité génétique des VIH et ses conséquences." Pathologie Biologie 57, no. 2 (March 2009): 142–48. http://dx.doi.org/10.1016/j.patbio.2008.04.004.

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7

Marry, E. "Diversité génétique et greffe de moelle osseuse." Bulletin de la Société de pathologie exotique 105, no. 2 (March 27, 2012): 137–42. http://dx.doi.org/10.1007/s13149-012-0228-y.

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8

De Braekeleer, Marc. "Homogénéité génétique des Canadiens français du Québec : mythe ou réalité?" Articles 19, no. 1 (March 25, 2004): 29–48. http://dx.doi.org/10.7202/010032ar.

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Abstract:

RÉSUMÉ Ces dernières années, plusieurs études sur le polymorphisme de plusieurs régions du génome ont permis de constater que la population canadienne-française présentait une grande diversité génétique. La présence d'une telle diversité peut s'expliquer par une grande hétérogénéité du noyau fondateur du XVIIe siècle et par sa grande taille, l'apport de gènes 'extérieurs' et la recombinaison génétique. De plus, la comparaison de plusieurs marqueurs génétiques entre le Québec et la France donne à penser que le patrimoine génétique québécois ne s'est pas appauvri, mais au contraire diversifié au contact d'autres populations.

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9

Gnagra Wognin, Marie-Thérèse, Didier Paulin Sokouri, Cyrille N’gouan Kouassi, Guiguigbaza K Dayo, Yté Wongbé, and Yapi-Gnaoré Chia Valentine. "Diversité génétique de six populations de Heterobranchus longifilis de Côte d’Ivoire." Journal of Animal & Plant Sciences 44, no. 2 (May 31, 2020): 7621–33. http://dx.doi.org/10.35759/janmplsci.v44-2.2.

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Abstract:

La structuration génétique de Heterobranchus longifilis de côte d’ivoire a été étudiée à travers six populations. L’objectif de cette étude est d’identifier une ou des souches d’élevage de Heterobranchus. longifilis en Côte d’Ivoire, en vue de leur valorisation et vulgarisation. Ainsi, 116 échantillons provenant de 4 bassins versants (Agneby, Bandama, Cavally et Sassandra), ont été génotypes à l’aide de 6 marqueurs microsatellites isolés de Clarias gariepinus (Cga01, Cga03, Cga05, Cga06, Cga09 et Cga10). Une grande variabilité génétique intra population a été observée chez les différentes populations de Heterobranchus longifilis étudiées avec une diversité génétique élevée (HS=0,454) et un nombre moyen d’allèles observés de 8 ± 5,90. Sous l’hypothèse de Hardy-Weinberg, toutes les populations de Heterobranchus longifilis ont montré un déficit significatif à la panmixie, à l’exception de celle du Cavally. Les valeurs de FST (0,037 ; 0,078 ; 0,095 et 0,096) ont montré une différenciation génétique modérée entre les populations de Agneby nord, Agneby sud, Bandama et Cavally. Cependant, une forte différentiation génétique a été révélée entre les populations du Sassandra (nord et sud) et celles des autres (Agneby nord, Agneby sud, Bandama et Cavally). Les valeurs des FST se situent entre 0,16 et 0,27. Les regroupements des populations réalisés à partir de la matrice des distances génétiques de Cavalli-Sforza & Edwards ont révélé une faible structuration génétique. Cependant, ces résultats indiquent l’existence de deux groupes bien distincts ; l’un composé de Agneby nord, Agneby sud, Bandama et Cavally et l’autre de Sassandra Nord et Sud.

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KREMER (Antoine), PETIT (Rémy-J.), and DUCOUSSO (Alexis). "Biologie évolutive et diversité génétique des chênes sessile et pédonculé." Revue Forestière Française, no. 2 (2002): 111. http://dx.doi.org/10.4267/2042/4907.

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SOUROU, Bienvenue Nawan KUIGA, Kifouli ADEOTI, Gustave DJEDATIN, Farid BABA- MOUSSA, Fatiou TOUKOUROU, and Christine OUINSAVI. "Analyse de la diversité génétique moléculaire de Haematostaphis barteri (Prune rouge) à l’aide des marqueurs RAPD." Annales de l’Université de Parakou - Série Sciences Naturelles et Agronomie 10, no. 1 (June 30, 2020): 41–54. http://dx.doi.org/10.56109/aup-sna.v10i1.42.

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Abstract:

Haematostaphis barteri est une espèce des savanes de l’Afrique tropicale qui fait objet d’usages multiples et qui joue un rôle socio-économique important pour les populations rurales. C’est une espèce d’Afrique tropicale, allant de la Côte d’Ivoire au Soudan, en passant par le Ghana, le Togo, le Bénin, le Nigéria, le Cameroun et le Tchad. Au Bénin, l’espèce est confinée le long de la chaîne de l’Atacora et fait partie des espèces ligneuses confrontées à un problème de régénération naturelle susceptible d’affecter sa diversité génétique. Dans la présente étude, des marqueurs moléculaires de type RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) ont été utilisés pour déterminer la structure génétique des populations de Haematostaphis barteri qui existent au Bénin. La diversité génétique révélée à partir de dix amorces est relativement importante (h = 0,250 ; HT = 0,295 ; Hs = 0,245). Par contre le coefficient de différenciation entre sous-populations est faible (FPT = 0,17) ; ce qui signifie que 17% de la diversité totale est inter sous-populations. Le flux de gènes estimé est modéré (Nm = 2,345 migrants par génération) indiquant un échange de graines et de pollens relativement modéré entre les sous-populations. En outre, trois différents groupes génétiques ont été obtenus avec une différenciation bien marquée des accessions du groupe de Boukombé par rapport aux deux autres groupes, indiquant l’existence d’une barrière génétique probablement due à la chaîne de l’Atacora et une limitation des échanges de graines et de pollens avec les autres sous-populations. Les allèles rares mis en évidence au niveau de quelques accessions du groupe génétique de Boukombé pourraient être utilisés, s’ils sont associés à des caractères morphologiques et biochimiques intéressants, dans des programmes de sélection et d’amélioration génétique.

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Létourneau, Lyne. "La Convention sur la diversité biologique s’applique-t-elle à l’être humain ?" Revue générale de droit 28, no. 3 (March 16, 2016): 349–68. http://dx.doi.org/10.7202/1035626ar.

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Abstract:

La Convention sur la diversité biologique s’applique-t-elle à l’être humain ? Cette question a surgi récemment dans la controverse entourant le Projet sur la diversité du génome humain (PDGH). En effet, le programme de recherche proposé par le PDGH réfère expressément à l’idée d’une diversité génétique humaine. Or, à prime abord, rien dans la Convention sur la diversité biologique n’exclut l’être humain, qui est biologiquement couvert par les définitions données. Toutefois, au mois de novembre 1995, lors de sa seconde rencontre, la Conférence des Parties à la Convention excluait le matériel génétique humain du champ d’application de la Convention. Dans le cadre du présent article, l’auteure atteste du caractère bien-fondé de cette décision à la lumière de la Convention sur la diversité biologique. À cet égard, l’historique de la Convention, sa nature de même que la philosophie sous-jacente au texte de la Convention du point de vue du statut moral des animaux et des plantes sont discutés. Plus qu’un simple regard sur la Convention sur la diversité biologique, le présent article pose la problématique de l’élaboration d’une politique sur la diversité génétique humaine.

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Henry, Jean-Pierre. "Génétique et origine d’Homo sapiens." médecine/sciences 35, no. 1 (January 2019): 39–45. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/2018311.

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Abstract:

La comparaison de l’ADN d’Homo sapiens avec celui des grands singes ou des hommes archaïques informe sur les mécanismes de l’hominisation. Le séquençage de 1 000 génomes bien identifiés géographiquement a permis des études génomiques. En utilisant la diversité régionale des génotypes, un modèle de généalogie d’Homo sapiens a été proposé. L’origine de l’homme moderne est africaine et date d’environ 200 000 ans ; Il est sorti d’Afrique il y a 50 000 à 100 000 ans et a alors envahi le reste du monde. En Europe et en Asie, il a rencontré les hommes archaïques (Néanderthal et Denisova) et la présence de 1 à 3 % d’ADN néanderthalien dans le génome de l’homme moderne atteste de croisements entre les espèces. Certains gènes provenant de ces croisements ont été sélectionnés.

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SELLIER, P. "La gestion des populations : La diversité des plans d’amélioration génétique." INRAE Productions Animales 5, HS (December 2, 1992): 229–35. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.1992.5.hs.4295.

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Abstract:

La diversité des programmes d’amélioration génétique des animaux domestiques concerne à la fois les plans de croisement et les plans de sélection. L’intérêt du croisement et les formes d’utilisation du croisement (création d’une nouvelle population ou croisement systématique de type discontinu ou continu) dépendent de l’importance des effets d’hétérosis, du degré d’antagonisme génétique entre la performance de production et la performance de reproduction et de l’excédent de fécondité de l’espèce par rapport à ce qui est nécessaire pour le maintien d’une population de race pure. De nombreux facteurs contribuent à la diversité des plans de sélection : la nature des caractères sélectionnés (notamment leur déterminisme génétique), les paramètres de reproduction de l’espèce (notamment le nombre de produits par femelle et par cycle de reproduction), les modalités du contrôle de performances chez les candidats à la sélection et/ou leurs apparentés, les méthodes d’estimation des valeurs génétiques des reproducteurs, la structure de la population (noyau de sélection et troupeaux de production).

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Rouvier, Carole, Jaime Schwencke, Yves Prin, Elisabeth Navarro, Patrick Benoist, Angeles Müller, Mina Girgis, et al. "Biologie et diversité génétique des souches deFrankiaassociées aux Casuarinacées." Acta Botanica Gallica 143, no. 7 (January 1996): 567–80. http://dx.doi.org/10.1080/12538078.1996.10515359.

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LEFORT-BUSON, Marianne, Yannick HEBERT, and Catherine DAMERVAL. "Les outils d'évaluation de la diversité génétique et phénotypique." Agronomie 8, no. 3 (1988): 173–78. http://dx.doi.org/10.1051/agro:19880301.

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Calvignac, Sébastien. "Événements climatiques et structuration géographique de la diversité génétique." médecine/sciences 24, no. 8-9 (August 2008): 686–88. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/20082489686.

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Rimlinger, Aurore. "Histoire évolutive de l’arbre fruitier Dacryodes edulis : implications pour sa conservation et sa gestion durable." BOIS & FORETS DES TROPIQUES 352 (May 1, 2022): 97–98. http://dx.doi.org/10.19182/bft2022.352.a36860.

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Abstract:

Dans les écosystèmes forestiers tropicaux, les humains utilisent de longue date les espèces végétales utiles, sources de nourriture, de fibre, de combustible ou de médication. Parmi ces produits forestiers non ligneux, certains d'entre eux ont progressivement été mis en culture, posant des questions tant sur les impacts évolutifs des interactions entre plantes et hommes que sur la durabilité des modes de gestion actuels de ces ressources. C'est le cas pour le safoutier (Dacryodes edulis, Burseraceae), un arbre fruitier emblématique d'Afrique centrale. Dans cette thèse, la dynamique de la diversité cultivée du safoutier est abordée via une approche interdisciplinaire alliant génétique des populations et ethnoécologie, afin de comprendre d’une part l’histoire évolutive de l’espèce sur le temps long, d’autre part les effets des changements contemporains de ses modes de culture. L’approche génétique centrée sur l'histoire évolutive du safoutier a permis d’identifier différents groupes génétiques sur son aire de distribution. Les patrons de distribution de l’ADN chloroplastique semblent résulter des événements de glaciation du Quaternaire plutôt que de la mise en culture de l'espèce. L’accent mis sur les savoirs des cultivateurs dans l’approche ethnoécologique met en lumière la nomenclature fine qu’ils mobilisent, et les préférences différentes qu’ils ont en fonction des usages du fruit : une bascule s'opère en faveur du critère de la taille du fruit chez ceux destinant leur production au marché urbain. Enfin, le croisement des deux approches a permis de mettre en valeur les effets des réseaux informels d'échanges de semences sur la distribution de la diversité génétique. Les semences utilisées pour planter des arbres en ville proviennent ainsi en majorité d'échanges sur de longues distances. En conséquence, des niveaux de diversité identiques, voire supérieurs, sont présents dans les aires urbaines par rapport au milieu rural. Ensemble, ces résultats permettent de conclure qu'il existe une grande diversité de connaissances, de pratiques et d'usages autour du safoutier, qui n'engendrent pas, à ce stade, d'effets néfastes sur sa diversité intra-spécifique. Le safoutier se présente comme un modèle stratégique pour étudier l'effet des pratiques humaines sur la diversité génétique en Afrique centrale, de nombreuses questions de recherche demeurant quant à l'origine de sa mise en culture et de sa diffusion.

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PHOCAS, F., C. BELLOC, J. BIDANEL, L. DELABY, J. Y. DOURMAD, B. DUMONT, P. EZANNO, et al. "Quels programmes d’amélioration génétique des animaux pour des systèmes d’élevage agro-écologiques ?" INRA Productions Animales 30, no. 1 (June 14, 2018): 31–46. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.2017.30.1.2232.

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Abstract:

L’agro-écologie utilise les processus naturels et les ressources locales plutôt que des intrants chimiques pour assurer la production tout en limitant l’impact environnemental de l’agriculture. A cette fin, des innovations en génétique sont nécessaires pour disposer d’animaux productifs et adaptés à des contextes locaux variés. Pour toute filière d’élevage, réorienter les programmes de sélection actuels semble plus utile que développer des programmes spécifiques qui peineront à être efficaces en termes de coûts et de progrès génétiques attendus. Améliorer la robustesse des animaux vise à promouvoir leurs capacités d’adaptation en intégrant de nombreux critères de sélection, en particulier de reproduction, santé, et d’adaptation à des ressources alimentaires peu digestibles et au changement climatique. Cela amène à considérer les interactions génotype-environnement dans la prédiction des valeurs génétiques et à évaluer les performances des animaux dans des systèmes à bas intrants pour sélectionner ceux qui sont adaptés à des conditions limitantes. La standardisation tant des animaux que des conditions d’élevage paraît antinomique avec les principes de l’agro-écologie prônant une adaptation des animaux aux ressources et contraintes locales dans des systèmes peu artificialisés et très liés à leur environnement physique. Il n’y a donc pas UN animal type agro-écologique, mais DES animaux aux profils variés permettant de répondre aux attentes de l’agro-écologie. Face à la diversité des milieux et des systèmes d’élevage, il faut conserver une diversité génétique importante intra-race, mais aussi préserver la diversité génétique entre races. Cela nécessite une caractérisation phénotypique et génétique des races locales. Enfin, il s’agit de favoriser l'appropriation par les éleveurs et les techniciens d’élevage des outils et des ressources génétiques disponibles pour répondre à leurs besoins.

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OLLIVIER, L., C. CHEVALET, and J. L. FOULLEY. "Utilisation des marqueurs pour la caractérisation des ressources génétiques." INRAE Productions Animales 13, HS (December 22, 2000): 247–52. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.2000.13.hs.3847.

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Abstract:

Un aperçu des méthodes de caractérisation des ressources génétiques basées sur les marqueurs moléculaires est présenté. La variabilité génétique entre races s’exprime généralement, à partir d’un ensemble de fréquences alléliques, sous la forme d’indices de fixation et de diversité génique, ainsi que de distances génétiques entre races. Ces dernières peuvent être converties en phylogénie, classification ou mesure globale de diversité. La richesse allélique est une information complémentaire intéressante à prendre en compte. La planification expérimentale des études de diversité et leur fiabilité statistique sont brièvement discutées.

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VERRIER, E., and M. SAINT-DIZIER. "Contraintes et opportunités pour l’amélioration génétique des ruminants." INRAE Productions Animales 24, no. 4 (September 4, 2011): 297–306. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.2011.24.4.3262.

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Abstract:

Après un aperçu des cheptels de ruminants élevés en France et dans l’Union Européenne, les caractéristiques des espèces qui influent sur les possibilités de mettre en oeuvre des programmes d’amélioration génétique et sur leur efficacité sont mentionnées. L’accent est mis sur les conséquences des paramètres de la reproduction, sur la nécessité d’une organisation rigoureuse et sur la diversité des situations rencontrées, entre espèces, races, territoires et filières. Les perspectives offertes par le développement en cours de la sélection génomique sont brièvement évoquées.

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Berthaud, Julien, François Anthony, André Charrier, Emmanuel Couturon, Daniel Le Pierres, and Jacques Louarn. "Les caféiers en Afrique: diversité génétique et amélioration des plantes." Bulletin de la Société Botanique de France. Actualités Botaniques 136, no. 3-4 (January 1989): 239–50. http://dx.doi.org/10.1080/01811789.1989.10826978.

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Bezançon, Gilles, Matilde Causse, Alain Ghesquiere, Alexandre De Kochko, Jean-Louis Pham, and Gérard Second. "Les riz en Afrique: diversité génétique, relations interspécifiques et évolution." Bulletin de la Société Botanique de France. Actualités Botaniques 136, no. 3-4 (January 1989): 251–62. http://dx.doi.org/10.1080/01811789.1989.10826979.

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Godbout, Julie, and Jean Bousquet. "Les génomes du pin gris et du pin tordu, témoins des bouleversements climatiques passés." Foresterie 138, no. 1 (January 6, 2014): 32–44. http://dx.doi.org/10.7202/1021041ar.

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Abstract:

La phylogéographie est un champ de la biogéographie qui s’appuie sur les outils de la génétique afin de mieux comprendre les conséquences d’évènements anciens sur la répartition de la diversité des espèces. Les aires actuelles de répartition de 2 espèces de pin dur, le pin gris (Pinus banksiana Lamb.) et le pin tordu (Pinus contorta Dougl. ex. Loud.) étaient presque entièrement recouvertes par l’inlandsis au moment du maximum glaciaire, il y a 21 000 ans. Ces 2 espèces représentent donc d’excellents modèles pour étudier l’effet de la dernière glaciation sur la diversité génétique des espèces et pour la compréhension des mouvements de colonisation qui ont accompagné le réchauffement climatique de l’Holocène. L’utilisation de marqueurs génétiques de l’ADN mitochondrial et chloroplastique a permis de détecter une structure géographique marquée pour chacune des 2 espèces, permettant de mettre en évidence plusieurs éléments du paysage ayant favorisé la différenciation génétique de sous-groupes durant l’ère glaciaire. Ces marqueurs ont aussi permis de détecter une introgression naturelle entre ces espèces ainsi que des fluctuations de leurs répartitions au cours de l’Holocène. Les contextes historique, théorique et méthodologique sont aussi abordés de façon à permettre la comparaison avec d’autres espèces du biome boréal.

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Kremer, A. "Diversité génétique et variabilité des caractères phénotypiques chez les arbres forestiers." Genetics Selection Evolution 26, Suppl 1 (1994): S105. http://dx.doi.org/10.1186/1297-9686-26-s1-s105.

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Bouzeghoub, Salima, and El Hadj Belabbesa. "La diversité génétique du VIH-1 et données actuelles en Algérie." Revue Francophone des Laboratoires 2007, no. 396 (2007): 17–20. http://dx.doi.org/10.1016/s1773-035x(07)80417-5.

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Barin, F., S. Laperche, and A. M. Couroucé. "Diversité génétique des virus Conséquences pour le dépistage et la prévention." Transfusion Clinique et Biologique 7, no. 5 (October 2000): 472–78. http://dx.doi.org/10.1016/s1246-7820(00)80035-x.

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RIQUET, J., and F. PITEL. "Les techniques de base de la génétique moléculaire." INRAE Productions Animales 13, HS (December 23, 2000): 29–35. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.2000.13.hs.3808.

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Abstract:

Les techniques les plus couramment utilisées en génétique moléculaire font l’objet de cet article. La première partie présente les outils de base, fondés sur des principes de physique, de chimie ou de biologie. Différentes combinaisons de ces outils sont ensuite développées pour aborder les techniques utilisées dans différents domaines de la biologie moléculaire : fragmentation, séparation, repérage, multiplication et lecture de l’ADN. L’accent est mis sur la diversité des techniques pouvant être mises en oeuvre et sur la vitesse d’évolution de ces techniques.

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TESNIÈRE, Germain, Vincent DUCROCQ, Eva BOXENBAUM, and Julie LABATUT. "Organisations nationales et instruments de gestion de l’amélioration génétique des bovins laitiers : une comparaison entre la France, l’Irlande et les Pays-Bas." INRA Productions Animales 32, no. 1 (March 11, 2019): 37–50. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.2019.32.1.2430.

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Abstract:

Depuis les années 2000, le développement de la génomique permet une connaissance étendue de l’ADN des plantes et animaux domestiques. Cette innovation transforme la façon dont ceux-ci sont évalués, sélectionnés et mis sur le marché. Couplée à des changements politiques et règlementaires, cette technologie contribue à faire évoluer les arrangements institutionnels dans le champ étudié - ici celui de l’amélioration génétique animale - aussi bien au niveau des dispositifs nationaux que des pratiques des acteurs. La libéralisation en cours questionne notamment la dimension collective de la production du progrès génétique et les droits de propriétés sur les ressources génétiques. Dans une perspective comparative impliquant la France, l’Irlande et les Pays-Bas, cette synthèse a pour objectif de présenter la pluralité des arrangements institutionnels établis dans le champ de la sélection génomique de la race bovine Holstein. Elle met d’abord en évidence trois régimes institutionnels qui présentent des arrangements différents notamment entre organisations publiques et privées. Ensuite, cette diversité d’arrangements est précisée par l’analyse des instruments contractuels entre entreprises de sélection et éleveurs via des modèles d’organisation de la production et des échanges de ressources génétiques (sous leurs formes biologiques et informationnelles). Ces modèles illustrent la diversité des formes de propriété dont ces ressources génétiques font l’objet entre éleveurs et entreprises et montrent que les rôles respectifs de ces acteurs sont redéfinis. Ces résultats permettent de mieux comprendre le développement d’une logique libérale (aux Pays-Bas) en dualité avec le renforcement (en Irlande) ou la fragilisation (en France) d’une logique coopérative de production du progrès génétique.

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Diouf, Meïssa, Ndèye B.M, and Aminata K. "Caractérisation des Accessions de 4 Espèces de Légumes-Feuilles Traditionnels (Hibiscus Sabdariffa L., Vigna Unguiculata (L.) WALP, Amaranthus L. Spp et Moringa Oleifera LAM) au Sénégal." African Journal of Food, Agriculture, Nutrition and Development 7, no. 14 (May 28, 2007): 01–16. http://dx.doi.org/10.18697/ajfand.14.ipgri1-5.

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Abstract:

La modernisation de l’agriculture caractérisée par l’abandon des variétés traditionnelles au profit de nouvelles variétés plus homogènes et à haut potentiel de rendement a conduit à la réduction de la diversité génétique. La collecte et la caractérisation de la diversité des écotypes locaux devient alors une nécessité. C’est ainsi que 64 accessions collectées lors de nos 3 missions de collecte et 18 accessions de la banque de gènes du Centre pour le Développement de l’Horticulture (CDH) ont fait l’objet de caractérisation à la station de recherche de l’ISRA-CDH. Le matériel était composé de 48 accessions de bissap (Hibiscus sabdariffa L.), 19 de niébé(Vigna unguiculata (L.) WALP), 9 d’amarante (Amaranthus (L.) spp) et 6 accessions de nébéday (Moringa oleifera Lam). Un dispositif complètement aléatoire en bandes simples sans répétition a été mis en place. Les clés de caractérisation des 4 espèces ou une version adaptée ont été utilisées. Cette caractérisation a permis de mettre en évidence la diversité intraspécifique de chacune des 4 espèces mais également le mouvement des semences (ou gènes) sur des distances pouvant atteindre 800 km et ce, sur la base des variables étudiées. On note en moyenne que 35 % des accessions collectées sont constituées de doublons. L’analyse de la diversité spécifique des accessions dans les localités visitées a révélé que 57 % d’entre elles sont sous haute menace d’érosion génétique. Cette caractérisation agro-morphologique devrait être complétée par des études plus approfondies notamment sur la plan biochimique et moléculaire pour permettre d’infirmer ou de confirmer nos résultats. L’utilisation d’un nombre plus important d’accessions des différentes espèces et d’autres méthodes de caractérisation pourraient contribuer à l’établissement de core collection, qui reste la meilleure stratégie de conservation du germoplasme.

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Ravakarivelo, Monique, Elodie Pepey, John A. H. Benzie, Noromalala Raminosoa, Harentsoaniaina Rasamoelina, Olivier Mikolasek, and Hugues De Verdal. "Genetic variation in wild populations and farmed stocks of Nile tilapia (Oreochromis niloticus) in Madagascar." Revue d’élevage et de médecine vétérinaire des pays tropicaux 72, no. 3 (October 7, 2019): 101. http://dx.doi.org/10.19182/remvt.31780.

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Abstract:

Quatre stocks issus de piscicultures et quatre populations sauvages de tilapias du Nil (Oreochromis niloticus), espèce qui a été introduite initialement à Madagascar il y a soixante ans, ont été évalués pour leurs variations génétiques à partir de l’analyse de neuf locus microsatellites pour déterminer les niveaux de variabilité génétique au sein des populations et les relations génétiques entre ces populations. La diversité allélique recoupait celle qui a été rapportée dans d’autres populations africaines. Il n’y avait ni évidence d’écart dans les fréquences alléliques attendues dans les conditions d’équilibre de Hardy-Weinberg ni de consanguinité dans les populations étudiées. Trois groupes génotypiques distincts ont montré trois introductions séparées (à partir d’Egypte et de l’île Maurice en 1956, et du Japon en 2011) et la présence de génotypes issus de plus d’un groupe dans une même population a fourni la preuve de mélanges. Il y avait des différences significatives entre les populations qui ne provenaient pas du même milieu (sauvage ou d’élevage) ou qui n’étaient pas géographiquement reliées. De par leur diversité génétique, les populations sauvages pourraient être des ressources intéressantes dans la perspective d’un développement de la pisciculture du tilapia du Nil à Madagascar.

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PHOCAS, F. "L’optimisation des programmes de sélection." INRAE Productions Animales 24, no. 4 (September 8, 2011): 341–56. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.2011.24.4.3266.

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Abstract:

La finalité d’un programme de sélection est de générer du progrès génétique dans les générations animales futures afin de répondreaux besoins alimentaires, nutritionnels, sociaux et environnementaux de demain. Les travaux pionniers en optimisation technique etéconomique des programmes de sélection des années 1970 à 1990 sont décrits dans cette synthèse. Maintenant, il s’agit d’accroître àla fois le nombre de caractères inclus dans les objectifs de sélection et la valeur prédictive des critères de sélection et des valeurs génétiquesprédites pour permettre le choix le plus fiable possible dès le plus jeune âge, de reproducteurs améliorateurs parmi les candidatsà la sélection. A ce titre, la sélection génomique est une véritable révolution dans la gestion des populations apparue dans la premièredécennie du 21ème siècle. L’organisation des programmes de sélection doit être revue en profondeur : la poursuite duraisonnement classique, c'est-à-dire la forte diffusion d’un petit nombre de reproducteurs élites est extrêmement dangereuse en termesde maintien d’une diversité génétique raisonnable au sein des populations animales, notamment si l’on raccourcit dans le mêmetemps l’intervalle entre générations en supprimant l’étape de contrôle sur descendance chez les bovins. Les objectifs de sélection doiventêtre adaptés, pour intégrer les nouveaux caractères, au fur et à mesure qu’ils seront évalués. Ce point est d’autant plus critiqueque des évolutions défavorables ont été constatées sur divers caractères fonctionnels et que la génétique devra s’intégrer dans uneplus grande diversité de systèmes de production pour répondre aux attentes sociétales.

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Doligez, Agnès, Claire Baril, and Hélène I. Joly. "Structure spatiale génétique et niveau de diversité intrapopulation chez les arbres forestiers." Genetics Selection Evolution 30, Suppl 1 (1998): S167. http://dx.doi.org/10.1186/1297-9686-30-s1-s167.

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HUGOT, Jean-Pierre, Se Hun GU, Carlos FELIU, Jacint VENTURA, Alexis RIBAS, Jérôme DORMION, Richard YANAGIHARA, and Violaine NICOLAS. "Diversité génétique de Talpa Europaea et de l'hantavirus Nova (NVAV) en France." Bulletin de l'Académie vétérinaire de France, no. 1-3 (2014): 277. http://dx.doi.org/10.4267/2042/54201.

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LAUVERGNE, J. J. "La gestion des populations : L’évaluation de la diversité génétique des gros animaux de ferme." INRAE Productions Animales 5, HS (December 2, 1992): 263–64. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.1992.5.hs.4301.

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Abstract:

Même s’il n’existe pas de corps de doctrine officialisée, l’évaluation de la diversité génétique domestique animale est un exercice auquel se sont livrés et se livrent encore de nombreux auteurs. Une telle démarche est évidemment fondamentale en phylogénie, sélection et gestion rationnelle des ressources génétiques de la planète. En ces quelques pages il ne peut être question d’épuiser le sujet, mais de dégager quelques notions de base.

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Ndiaye, Ndéné, Bakary Ndiaye, and Mbacké Sembene. "Diversité génétique du Cytochrome B et relations évolutives entre les races locales ovines sahéliennes du Sénégal." International Journal of Biological and Chemical Sciences 16, no. 3 (August 30, 2022): 1304–13. http://dx.doi.org/10.4314/ijbcs.v16i3.31.

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Abstract:

La connaissance de la diversité génétique des animaux d’élevage est un impératif pour leur bonne gestion. Au Sénégal, les pratiques d'élevage notamment l'amélioration génétique par la sélection sur les races locales ovines seraient à l'origine de la diversité phénotypique observée. Cependant, peu d'études génétiques ont été entreprises. L'objectif de cette étude était de contribuer à la caractérisation génétique des races locales ovines Peul-peul, Touabire et Ladoum du Sénégal. L’échantillonnage a été conduit dans les régions de Dakar et Thiès pour la race Ladoum et dans la région de Louga pour les races Peul-peul et Touabire. Dans chaque troupeau, au plus 3 animaux non apparentés ont été choisis. Le matériel biologique était constitué du sang total prélevé au niveau de la veine jugulaire des animaux. Le gène ciblé pour cette étude était le Cytochrome B. Les résultats obtenus ont révélé une plus grande diversité du Cytochrome B au sein de la population Peul-peul et la plus faible dans la population Ladoum. En effet, le mouton Peul-peul a présenté 24% de sites polymorphes et des diversités haplotypique et nucléotidique de 0,911±0,054 et 0,069±0,035. Par contre, 7% de sites variables ont été recensés dans la population Ladoum avec des valeurs de diversités haplotypique et nucléotidique respectives de 0,789±0,086 et 0,009±0,005. L’analyse phylogénétique a révélé deux lignées maternelles, l’une constituée par la population Peul-peul et l’autre regroupant les populations Touabire et Ladoum avec des introgressions entre clades. Les pratiques d’élevage seraient à l’origine de la diversité et de la structuration génétique des races ovines sahéliennes du Sénégal. Knowledge of the genetic diversity of farm animals is an imperative for their better management. In Senegal, breeding practices in particular genetic improvement through selection of local sheep breeds would be at the origin of the observed phenotypic diversity. However, few genetic studies have been undertaken. The objective of this study is to contribute to the genetic characterization of Senegalese local sheep breeds, Peul-Peul, Touabire and Ladoum. Sampling was conducted in the Louga region for the Peul-Peul and Touabire breeds and in Dakar and Thiès regions for the Ladoum breed. In each herd, at most 3 unrelated animals were chosen. The biological material consisted of whole blood taken from the jugular vein of the animals. The gene targeted for this study is Cytochrome B. The results showed a greater diversity of Cytochrome B within the Peul-Peul population and the lowest in the Ladoum population. Indeed, Peul-Peul sheep presented 24% of polymorphic sites, haplotypic and nucleotide diversity of 0.911±0.054 and 0.069±0.035. In contrast, 7% of variable sites were identified in the Ladoum population with respective haplotypic and nucleotide diversity values of 0.789±0.086 and 0.009±0.005. Phylogenetic analysis revealed two maternal lineages, one constituted by the Peul-Peul population and the other grouping together the Touabire and Ladoum populations with introgressions between clades. Breeding practices would be at the origin of the diversity and genetic structuring of Senegalese Sahelian sheep breeds.

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Bouchard, Gérard. "Représentations de la population et de la société québécoises : l’apprentissage de la diversité." Articles 19, no. 1 (March 25, 2004): 7–28. http://dx.doi.org/10.7202/010031ar.

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Abstract:

RÉSUMÉ De nombreux résultats issus de recherches récentes en sciences sociales et en génétique humaine invitent à nuancer substantiellement certaines représentations traditionnelles de la société québécoise, qui tendaient à mettre en valeur la remarquable homogénéité de la population, de la société et de la culture québécoises. Après avoir brièvement rappelé le discours traditionnel de l'homogénéité, l'auteur présente quelques exemples importants d'hétérogénéité, et suggère les révisions que celle-ci implique.

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Manga, Sylvestre-José-Tidiane. "L’utilisation des organismes génétiquement modifiés (OGM) dans l’agriculture et l’alimentation : enjeux sociaux et perspectives de l’encadrement du droit et de l’éthique." Revue générale de droit 30, no. 3 (December 5, 2014): 369–422. http://dx.doi.org/10.7202/1027708ar.

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Abstract:

L’utilisation des organismes génétiquement modifiés (OGM) dans l’agriculture et l’alimentation pose des enjeux sociaux importants malgré le potentiel économique de la biotechnologie. Les applications du génie génétique en agriculture semblent conduire à l’uniformisation de la diversité biologique et menacer les débouchés économiques des pays en développement. Le génie génétique semble remettre en cause l’indépendance du monde paysan. Il est perçu comme transgresseur des précautions individuelles de la protection de la santé et des principes moraux ou religieux. Cet article adopte une optique d’utilisation durable des OGM. Il traite des perspectives de l’encadrement du droit et de l’éthique. L’étiquetage, la traçabilité et la séparation des filières commerciales entre produits agricoles ordinaires et produits agricoles à base d’OGM, sont présentés comme les premiers balbutiements d’un droit naissant. À l’international, l’adoption du principe de précaution dans le Protocole de Carthagène sur la prévention des risques biotechnologiques ouvre les portes à un étiquetage clair des OGM. Mais il faudra attendre la fin des travaux de la COP des Parties à la CBD pour voir la véritable portée du principe de précaution sur cette question et ce, pas plus tard que deux ans après l’entrée en vigueur du Protocole.

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Streiff, Réjane, Alexis Ducousso, and Antoine Kremer. "Organisation spatiale de la diversité génétique et flux polliniques dans une chênaie mixte." Genetics Selection Evolution 30, Suppl 1 (1998): S137. http://dx.doi.org/10.1186/1297-9686-30-s1-s137.

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COLLEAU, J. J., and T. TRIBOUT. "Gestion optimisée de la variabilité génétique dans les populations porcines sélectionnées." INRAE Productions Animales 19, no. 5 (December 14, 2006): 339–46. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.2006.19.5.3500.

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Abstract:

Il est possible de modérer l’accroissement des coefficients de parenté et de consanguinité dans les populations sélectionnées en calculant les taux optimaux d’utilisation des reproducteurs, compte tenu de la diversité génétique existante, et en optimisant ensuite les accouplements. Les potentialités d’une telle approche ont été testées rétrospectivement sur la population Landrace Français en sélection en comparaison aux saillies réellement effectuées au cours d’une période test de 21 semaines. La contrainte majeure a été la conservation du niveau génétique moyen pour l’objectif global de sélection de la population, pour ne pas pénaliser le progrès génétique à court terme. En optimisant l’utilisation des verrats disponibles durant cette période, il aurait été possible de diminuer les coefficients de parenté et de consanguinité d’environ 20 %. Cette diminution aurait pu être portée à environ 30 % si en plus on avait optimisé le renouvellement et les réformes en considérant la variabilité génétique, toujours avec la même contrainte de niveau génétique inchangé par rapport au réel. A partir des résultats de cette dernière optimisation, il est possible de définir pour chaque individu un index synthétique pénalisé qui combine l’index synthétique actuel et une pénalité proportionnelle à sa parenté moyenne avec le reste de la population. Le coefficient de pondération de la parenté a été trouvé très élevé en dépit de la clause de conservation des niveaux génétiques pour l’index synthétique actuel. Ces résultats montrent l’intérêt qu’il y aurait à fournir à l’avenir, au moment de chaque évaluation génétique, les résultats de ces optimisations effectuées en continu, de manière à promouvoir la préservation de la variabilité génétique par les acteurs de la sélection.

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DUREL, C. E., and N. BAHRMAN. "Analyse de la diversité génétique des peuplements de pin maritime de Corse. Gestion et exploitation de la ressource génétique." Revue Forestière Française, no. 5 (1995): 509. http://dx.doi.org/10.4267/2042/26674.

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Catzeflis, François, and Anne Lavergne. "Diversité génétique et diversité taxonomique chez les mammifères : deux apports pour la biologie de la conservation en Guyane française." Journal d'agriculture traditionnelle et de botanique appliquée 40, no. 1 (1998): 447–64. http://dx.doi.org/10.3406/jatba.1998.3685.

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MÉNISSIER, F., and J. BOUIX. "L’amélioration génétique en France : le contexte et les acteurs - Les bovins et ovins producteurs de viande." INRAE Productions Animales 5, HS (December 29, 1992): 11–23. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.1992.5.hs.4254.

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Abstract:

Les bovins et ovins à viande jouent un rôle majeur dans les grands équilibres entre production, environnement et activité en raison de leurs caractéristiques biologiques et zootechniques. La diversité de leurs systèmes d’exploitation implique des objectifs de sélection définis par rapport aux aptitudes et régulations biologiques sous-jacentes, ainsi que des programmes de sélection adaptés à cette complexité et ses incertitudes. La croissance musculaire avec ses composantes quantitatives et qualitatives, et les qualités maternelles mettant en jeu des effets génétiques directs et maternels, sont ainsi les axes dominants de cette sélection des ruminants à viande. Cette sélection est mise en oeuvre à travers des outils et programmes de sélection diversifiés mais cohérents, conçus à partir des connaissances biologiques et des méthodologies génétiques disponibles.

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Manga, Sylvestre-José-Tidiane. "Les Organismes génétiquement modifiés (OGM) et la société: Le principe de précaution, une norme de régulation du débat social?" Canadian journal of law and society 15, no. 1 (April 2000): 221–45. http://dx.doi.org/10.1017/s0829320100006244.

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Abstract:

RésuméL'intervention du génie génétique dans la production de plantes agricoles et de denrées alimentaires n'est pas un domainet réservé aux seuls scientifiques. Les biotechnologies agricoles suscitent un débat social sans précédent. Elles opposent les intérêts des multinationales de l'industrie de la biotechnologie aux préoccupations environnementales des opposants au développement accéléré du recours au génie génétique dans l'agriculture et l'alimentation. Certes, la biotechnologie moderne de la recombinaison de l'ADN peut améliorer la productivité agricole. Toutefois les effets préjudiciables d'une telle technologie sur la diversité biologique et la santé humaine sont de plus en plus dénoncés. Cet article traite de quelques-uns des problèmes sociaux que pose le recours aux OGM dans l'agriculture et l'alimentation et relate l'avènement du principe de précaution dans le commerce international des OGM. L'adoption du principe de précaution dans le Protocole sur la prévention des risques biotechnologiques en fait désormais un cadre de régulation du débat social sur les OGM.

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Lefèvre, François, Thomas Boivin, Aurore Bontemps, François Courbet, Hendrik Davi, Marion Durand-Gillmann, Bruno Fady, et al. "Valoriser et renforcer les mécanismes d’évolution génétique par la sylviculture, pour l’adaptation au changement climatique." Revue forestière française 72, no. 5 (October 31, 2020): 383–410. http://dx.doi.org/10.20870/revforfr.2020.5339.

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Abstract:

L’adaptation est un enjeu majeur de la gestion forestière dans le contexte du changement climatique La diversité génétique qui caractérise les arbres forestiers leur confère un potentiel adaptatif très important mais pas illimité Prendre en compte les mécanismes de l’évolution dans les pratiques de gestion forestière adaptative renforcera la capacité des forêts gérées à répondre aux changements et aux aléas induits par le climat. En mettant l’accent sur le cas des forêts en régénération naturelle, nous proposons un cadre conceptuel général permettant d’intégrer la connaissance de ces mécanismes dans la prise de décision, dans une démarche de sylviculture par et pour l’évolution Ce cadre général pourra être décliné dans des situations locales diverses et complexes en s’appuyant sur la connaissance du contexte qu’ont les gestionnaires forestiers Nous développons une grille d’analyse simple, basée sur un petit nombre de paramètres caractérisant les mécanismes de l’évolution, pour comprendre l’impact des pratiques sylvicoles sur la dynamique de la diversité génétique et le maintien du potentiel d’évolution des populations d’arbres forestiers Après avoir rappelé l’état des connaissances sur les mécanismes de l’évolution chez les arbres forestiers, nous examinons les effets attendus de pratiques forestières actuelles ou innovantes sur ces mécanismes Pour illustrer la complexité des mécanismes en interaction, nous développons plus en détail les conséquences évolutives des interactions biotiques et celles d’un environnement fortement hétérogène La sylviculture par et pour l’évolution peut contribuer à l’adaptation des forêts au changement climatique Elle nécessite de combiner des objectifs à court et à long terme Nous proposons des pistes de recherche et d’expérimentation pour accompagner cette démarche.

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BOUQUET, A., G. RENAND, and F. PHOCAS. "Evolution de la diversité génétique des populations françaises de bovins allaitants spécialisés de 1979 à 2008." INRAE Productions Animales 22, no. 4 (June 20, 2009): 317–30. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.2009.22.4.3357.

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Abstract:

Cet article présente un bilan de la variabilité génétique des trois principales populations bovines allaitantes françaises en contrôle de performances (CP). Des noyaux de sélection diffusent largement des taureaux de monte naturelle (MN) ou d’insémination animale (IA) utilisés dans le reste des élevages de production au CP. La connaissance des généalogies est bonne dans les trois races mais est hétérogène entre élevages de sélection et de production. Les taux d’accroissement de consanguinité estimés sont faibles à modérés dans les populations Limousine, Charolaise et Blonde d’Aquitaine (environ 0,01, 0,1 et 0,2% par génération, respectivement) et correspondent à des effectifs génétiques relativement élevés (>1000, 601 et 247). Les effectifs génétiques estimés sont plus faibles dans les noyaux de sélection des reproducteurs de MN et d’IA que dans l’ensemble des élevages en CP mais ils restent importants. L’évolution des statistiques dérivées des probabilités d’origine des gènes montre l’existence de goulets d’étranglement anciens dans la population Blonde d’Aquitaine et plus récents dans les populations Charolaise et Limousine. Ces goulets résultent de l’utilisation de l’IA historiquement forte dans la population Blonde d’Aquitaine et plus modérée mais en constante augmentation dans les populations Charolaise et Limousine. Pour préserver la variabilité génétique toujours disponible dans ces populations, il conviendrait de recruter dans les programmes de sélection des taureaux d’IA une proportion suffisante de mâles issus de taureaux de MN et de veiller à équilibrer les contributions des pères à taureaux aux différentes séries de testage.

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GELLIN, J., and H. LEVÉZIEL. "Stratégie d’établissement des cartes géniques des espèces d’élevage." INRAE Productions Animales 5, HS (December 2, 1992): 281–86. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.1992.5.hs.4305.

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Abstract:

Au sein des différents pays impliqués dans les programmes de la CEE (BRIDGE et BIOTECH), la structure de recherche française est sans doute à l’heure actuelle, par le nombre de chercheurs, par l’ensemble des secteurs méthodologiques couverts, et par l’ensemble des soutiens dont elle dispose au niveau du Département de Génétique Animale, le regroupement le plus important travaillant sur la cartographie génique des porcs et des bovins. L’activité essentielle de cartographie chez les porcins et les bovins sera de définir, le long du génome, un certain nombre "d’étiquettes" (des microsatellites) permettant d’établir un premier réseau de marques génétiques espacées de 20 cM dont certains seront localisés précisement sur les chromosomes. Cette connaissance recueillie sur le génome sera intégrée aux analyses quantitatives actuelles grâce la mise en oeuvre de nouveaux concepts d’analyse génétique (programme INRA : PRODIGE-MMM). Elle permettra une évolution précoce des génotypes, une amélioration des méthodes d’identification des animaux et de vérification des filiations, la mise en évidence de régions du génome intervenant dans la variabilité de caractères quantitatifs (QTL), une appréciation de la diversité génétique des races. Les connaissances obtenues seront également utiles à la compréhension de certains aspects du génome humain, notamment le séquençage de eDNAs et la recherche de QTL difficile à étudier directement chez l’homme.

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Zaouali, Yosr, Najeh Ben Fadhel, and Mohamed Boussaid. "Diversité génétique des populations naturelles de l’Argyrolobium uniflorum Jaub. et Spach. (Fabaceae) en Tunisie." Ecologia mediterranea 28, no. 2 (2002): 23–37. http://dx.doi.org/10.3406/ecmed.2002.1571.

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GUYOMARD, R. "Principaux concepts et méthodes relatifs à la description de la diversité génétique d'une espèce." Bulletin Français de la Pêche et de la Pisciculture, no. 314 (1989): 98–108. http://dx.doi.org/10.1051/kmae:1989006.

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Vézina, Hélène, Michèle Jomphe, Ève-Marie Lavoie, Claudia Moreau, and Damian Labuda. "L’apport des données génétiques à la mesure généalogique des origines amérindiennes des Canadiens français." Articles 41, no. 1 (November 6, 2012): 87–105. http://dx.doi.org/10.7202/1012981ar.

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Abstract:

Dans le cadre d’un programme de recherche sur la diversité génétique des populations régionales du Québec, nous avons mesuré la contribution des ancêtres amérindiens au pool génique de 794 participants résidant dans les régions de Montréal, du Saguenay—Lac-Saint-Jean (SLSJ), de la Gaspésie et de la Côte-Nord. Les ancêtres amérindiens ont été identifiés à partir de reconstructions généalogiques (fichier BALSAC) et de données génétiques (ADN mitochondrial) à l’aide d’une approche qui repose sur l’exploitation conjointe de ces deux types de données. Les résultats indiquent que plus de la moitié des participants ont au moins un ancêtre amérindien dans leur généalogie. Ceci veut dire que la majorité des participants sont porteurs de gènes reçus de fondateurs amérindiens. Cependant la contribution génétique totale de ces ancêtres aux quatre groupes régionaux demeure faible. En effet, elle est de moins de 1 % au SLSJ et à Montréal alors qu’elle dépasse à peine 1 % sur la Côte-Nord et en Gaspésie.

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