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Dissertations / Theses on the topic 'Écologie – Réseaux d'interactions – Environnement'

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Nelva, Pasqual Jean-Sébastien. "Exploration des réseaux d'interactions en écologie : de la structure vers la dynamique : signification des analyses des matrices de communauté en écologie des estuaires." Electronic Thesis or Diss., Bordeaux, 2014. http://www.theses.fr/2014BORD0114.

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Abstract:
Le concept de réseau d'interactions est central en Écologie et différents modèles et méthodes ont été utilisés. Ce travail de thèse met en relation deux approches développées par des courants séparés : l'étude des matrices de communauté et les analyses entrée-sortie. Il confronte leurs hypothèses aux propriétés fondamentales des écosystèmes estuariens. Il précise explicitement les liens entre les différentes matrices, ainsi que la signification des mixed trophic impacts. Les matrices de la storage et de la throughflowanalyses sont reliées à des jacobiennes de modèles à compartiments dont les f
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Nelva, Pasqual Jean-Sébastien. "Exploration des réseaux d'interactions en écologie : de la structure vers la dynamique : signification des analyses des matrices de communauté en écologie des estuaires." Thesis, Bordeaux, 2014. http://www.theses.fr/2014BORD0114/document.

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Abstract:
Le concept de réseau d'interactions est central en Écologie et différents modèles et méthodes ont été utilisés. Ce travail de thèse met en relation deux approches développées par des courants séparés : l'étude des matrices de communauté et les analyses entrée-sortie. Il confronte leurs hypothèses aux propriétés fondamentales des écosystèmes estuariens. Il précise explicitement les liens entre les différentes matrices, ainsi que la signification des mixed trophic impacts. Les matrices de la storage et de la throughflowanalyses sont reliées à des jacobiennes de modèles à compartiments dont les f
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Liautaud, Kevin. "Community stability and turnover in changing environments." Thesis, Toulouse 3, 2020. http://www.theses.fr/2020TOU30264.

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Abstract:
Les communautés d'êtres vivants peuvent elles êtres considérées comme des organismes complexes, ou au contraire comme de simples groupes d'espèces, individuelles ? Cette question est à l'origine de nombreux débats en écologie, ces deux visions impliquant notamment des prédictions très différentes dans les patrons spatiaux et temporels de communautés. Lorsque l'environnement change graduellement dans l'espace ou dans le temps, la vision individualiste implique des changements graduels dans la composition des communautés, tandis que la vision du "super-organisme" prédit des changements davantage
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Lombard, Julien. "Dynamiques éco-évolutives des interactions hôte-parasite dans des environnements spatialement structurés." Electronic Thesis or Diss., Université de Lille (2022-....), 2025. http://www.theses.fr/2025ULILS101.

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Abstract:
Pourquoi les parasitesfont-ils plus ou moins de de malà leurs hôtes? Qu'est-ce qui déterminele fait que certaines épidémiesdeviennent pandémiques,quand d'autres restent localisées?S'il est notoire que les parasiteset les maladies infectieuses constituentdes ennemis de longue datede l'Humanité, comprendre leurs dynamiquesd'émergence, de propagationet d'évolution constitue un levierimportant pour la gestion des épidémies(animales ou végétales) par despolitiques publiques. Parmis tous lesfacteurs environnementaux qui façonnentles dynamiques de propagationet d'évolution des parasites,la structure
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Subrahmaniam, Jaishree. "Identification des bases génétiques de la coopération plante-plante chez la plante modèle Arabidopsis thaliana." Thesis, Toulouse 3, 2020. http://www.theses.fr/2020TOU30043.

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Abstract:
Malgré l'importance des interactions plante-plante dans le fonctionnement des écosystèmes naturels et des agro-écosystèmes, les études sur les interactions plante-plante ont encore deux lacunes importantes à combler, à savoir (i) la génétique associée à la variation naturelle des interactions plante-plante et (ii) l'importance relative des interactions positives au sein des espèces végétales. Après avoir rédigé deux revues faisant un état de l'art sur chacune de ces lacunes, j'ai décidé de m’intéresser à l’étude des bases génétiques adaptatives des interactions plante-plante positives chez Ara
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Génin, Alexandre. "Réseaux d'interactions écologiques, stabilité et résilience des écosystèmes." Thesis, Montpellier, 2018. http://www.theses.fr/2018MONTG031/document.

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Abstract:
Les systèmes écologiques sont complexes car composés d'une multitude d'éléments en interaction. Ces interactions, entre espèces par exemple, forment des réseaux qui présentent des propriétés structurelles déterminantes pour la réponse du système écologique entier aux perturbations.Pour mieux identifier cette réponse, il est donc important de cartographier les interactions présentes dans les communautés écologiques et de comprendre leurs variations dans le temps et l'espace.Dans ce travail, nous avons utilisé les communautés de plantes comme systèmes écologiques modèles afin (i) d'identifier à
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Ohlmann, Marc. "Vers une théorie spatiale des réseaux d'interaction en écologie : méthodes, concepts et applications Diversity indices for ecological networks : a unifying framework using Hill numbers Unveiling the food webs of tetrapods across Europe through the prism of the Eltonian niche A spatial theory of mutualistic metacommunities : assesment of metacommunity capacity (in prep) Mapping the imprint of biotic interactions on β-diversity Multi-trophic -diversity mediates the effect of environmental gradients on the turnover of multiple ecosystem functions Combining abundances from different markers for environmental DNA (in prep)". Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019GREAV065.

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Abstract:
Cette thèse s’intéresse aux liens entre réseaux d’interactions en écologie, espace et temps. On assiste à un changement croissant de représentation d’un communauté d’espèces, d’un ensemble d’espèces à un ensemble d’espèces et leurs interactions : un réseau d’interactions. On s’attachera alors à élaborer les prémisses d’une théorie spatiale des réseaux, en développant des méthodes, des modèles et en les appliquant sur des données écologiques. La thèse s’articule autour de quatre chapitres. Dans un premier chapitre, on se penchera sur le problème de comparaison de réseau en différents points du
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Maghnia, Fatima-Zahra. "Décryptage des réseaux d'interactions plante-champignon pour une meilleure gestion des subéraies méditerranéennes." Thesis, Montpellier, 2017. http://www.theses.fr/2017MONTT073/document.

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Abstract:
Le chêne-liège (Quercus suber) est une essence forestière d’une grande importance écologique et socio-économique pour les habitants de Méditerranée. Cependant, au cours des dernières décennies, ces subéraies et particulièrement les subéraies marocaines ont été soumises à de fortes contraintes climatiques, environnementales et humaines entrainant une accélération des processus de dégradation. La conservation de ces écosystèmes est fortement dépendante de notre capacité à prédire les changements induits par ces différentes pressions ainsi que du développement d’approches durables pour leur réhab
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Kamenova, Stefaniya. "Réseaux d'interactions, biodiversité et services éco-systémiques en milieu agricole : que nous apprennent les coléoptères carabiques ?" Thesis, Poitiers, 2013. http://www.theses.fr/2013POIT2319.

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Abstract:
Le contrôle des ravageurs est l'un des principaux services éco-systémiques rendus par la biodiversité à l'agriculture. Les communautés d'insectes auxiliaires, hébergées par les espaces agricoles présentent des niveaux de diversité, spécifique et fonctionnelle, élevés et leurs biologie et traits de vie sont bien décrits et étudiés. Ces communautés constituent donc un excellent modèle pour aborder des questions d'intérêt à la fois fondamental et appliqué sur les mécanismes à l'origine de la biodiversité et sur l'impact de la biodiversité sur l'approvisionnement en services éco-systémiques. Dans
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Fracchia, Félix. "Les phytohormones, des régulateurs clefs du microbiote du peuplier ?" Electronic Thesis or Diss., Université de Lorraine, 2022. http://www.theses.fr/2022LORR0217.

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Abstract:
Les écosystèmes forestiers sont des environnements dynamiques aussi bien à l'échelle macroscopique que microscopique. Les arbres abritent un vaste cortège de microorganismes, appelé microbiote, majoritairement constitué de bactéries et de champignons. Ces communautés microbiennes colonisent les différents tissus des arbres et participent à diverses interactions, aussi bien défavorables (e.g. pathogènes), que bénéfiques. En effet, certains microorganismes (e.g. Plant Growth Promoting Bacteria : PGPR ; champignons mycorhiziens), améliorent la croissance et le développement de leur hôte via le tr
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Auclair, Etienne. "Réseau bayésien dynamique étiqueté : cadre et apprentissage de structure pour application aux réseaux écologiques." Thesis, Toulouse 3, 2019. http://www.theses.fr/2019TOU30002.

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Abstract:
Un réseau écologique désigne l'ensemble des interactions entre les espèces vivantes d'un écosystème donné. En connaître la structure est un défi important dans le domaine de l'écologie. Cela peut se faire par des méthodes d'inférence, c'est à dire le fait d'utiliser des données d'observation écologique (l'abondance des espèce, leur présence/absence...) afin de reconstruire par des méthodes mathématiques les interactions en captant leur influence sur ces observations. Dans cette thèse, nous nous plaçons dans le cadre où les données écologiques dont on dispose sont des données de présence/absenc
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Manincor, Natasha de. "Ecologie des plantes et des pollinisateurs dans les prairies calcaires le long d'un gradient latitudinal en France : diversité des espèces et structure des réseaux d'interaction plantes-pollinisateurs." Thesis, Lille 1, 2019. http://www.theses.fr/2019LIL1R024/document.

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Abstract:
Dans le contexte actuel de crise de la biodiversité et des risques associés de dégradation des services écosystémiques, les réseaux plantes-pollinisateurs sont parmi les réseaux mutualistes les plus étudiés. Sans pollinisateurs, de nombreuses plantes sauvages et cultivées ne pourraient pas se reproduire. Il est important de comprendre les réseaux plantes-pollinisateurs si nous souhaitons empêcher la destruction des interactions de pollinisation et des services écosystémiques connexes. Dans ces réseaux, les espèces doivent être présentes au même endroit et au même moment pour interagir. En Fran
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Manincor, Natasha de. "Ecologie des plantes et des pollinisateurs dans les prairies calcaires le long d'un gradient latitudinal en France : diversité des espèces et structure des réseaux d'interaction plantes-pollinisateurs." Electronic Thesis or Diss., Université de Lille (2018-2021), 2019. http://www.theses.fr/2019LILUR024.

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Abstract:
Dans le contexte actuel de crise de la biodiversité et des risques associés de dégradation des services écosystémiques, les réseaux plantes-pollinisateurs sont parmi les réseaux mutualistes les plus étudiés. Sans pollinisateurs, de nombreuses plantes sauvages et cultivées ne pourraient pas se reproduire. Il est important de comprendre les réseaux plantes-pollinisateurs si nous souhaitons empêcher la destruction des interactions de pollinisation et des services écosystémiques connexes. Dans ces réseaux, les espèces doivent être présentes au même endroit et au même moment pour interagir. En Fran
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Silva, Dayana Karla Melo da. "Mouvements-Réseau : technique, environnement et socialités à l'époque de l'Anthropocène." Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2016. http://www.theses.fr/2016USPCB019/document.

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Abstract:
Ce travail de recherche s'interroge sur les nouvelles formes de mobilisation sociale qui répondent à l'émergence des réseaux numériques et à la crise environnementale. Nous privilégions deux axes de compréhension épistémologique. Le premier basé sur la question de la technique au-delà de l'instrumentalité et le deuxième sur la notion d'écosophie. Notre réseau d'observation empirique est constitué par les collectifs mobilisés autour de la thématique écologique qui concerne les plus de trois cents rivières canalisées et enterrées dans la ville de São Paulo au Brésil, dorénavant visibles par le b
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Houssard, Patrick. "Variations des concentrations en mercure dans les réseaux trophiques marins de l'Océan Pacifique Sud : état des lieux, caractérisation des sources et relations avec la dynamique trophique et physique du milieu." Thesis, Nouvelle Calédonie, 2017. http://www.theses.fr/2017NCAL0001/document.

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Abstract:
Le mercure est un métal présent naturellement dans l’environnement qui a la particularité, sous sa forme organique (le monométhylmercure; MMHg), de se bioaccumuler dans les organismes et de se bioamplifier le long des chaînes alimentaires. Depuis la prise de conscience de la toxicité du MMHg, les travaux se sont multipliés pour comprendre où et comment le MMHg est produit puis incorporé dans les réseaux trophiques marins. Les réponses à ces questions sont primordiales afin d’anticiper le devenir du MMHg dans les espèces commercialisées dans un contexte d’augmentation des émissions de mercure e
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Braga, Joăo. "Etude de la diversité spatiale des réseaux trophiques et ses implications pour la conservation." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2018. http://www.theses.fr/2018GREAV069.

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Abstract:
Les espèces qui cooccurrent partagent plus que l'espace physique, elles partagent aussi des interactions biotiques. Les interactions trophiques sont un type particulier d'interactions antagonistes qui représentent le flux de biomasse d'une espèce proie vers son prédateur. Les réseaux trophiques, dans leur forme la plus simple, sont composés de producteurs, de consommateurs et de décomposeurs. En raison de la nature des interactions qui composent les réseaux trophiques, leur structure nous révèle les processus gouvernant l'assemblage des communautés, la distribution de la biodiversité, le fonct
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Deshpande, Jhelam Nitin. "Eco-evolutionary feedbacks and networks : from genes to landscapes." Electronic Thesis or Diss., Université de Montpellier (2022-....), 2024. http://www.theses.fr/2024UMONG011.

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Abstract:
Il est reconnu depuis longtemps que l'écologie et l'évolution se rétroagissent l'une sur l'autre. En partant d'une compréhension mécaniste des liens entre l'écologie et l'évolution au niveau des processus, des mécanismes et des patrons, je présente les principaux défis à relever pour comprendre les rétroactions éco-évolutives : échelles de temps, interactions au sein des échelles d'organisation et entre elles, et structure spatiale (chapitre 1). Ensuite, en utilisant une perspective de réseaux hiérarchiques, je pose la question suivante : comment la prise en compte explicite des interactions a
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Nicvert, Lisa. "Méthodes statistiques et outils logiciels pour l'analyse et l'inférence de réseaux écologiques et le traitement de données multi-espèces." Electronic Thesis or Diss., Lyon 1, 2024. http://www.theses.fr/2024LYO10130.

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Abstract:
Les interactions entre espèces dans les communautés écologiques sont complexes : de nombreuses espèces peuvent interagir les unes avec les autres de façons variées et à différentes échelles spatiales et temporelles. De plus, ces réseaux d'interactions sont la résultante de multiples causes, engendrent de multiples processus et ont des conséquences parfois indirectes transmises au travers de la structure du réseau. Cette complexité nécessite une diversité d'approches pour comprendre les déterminants des interactions et prédire leurs effets dans les systèmes écologiques. Cette thèse étudie plusi
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Anakok, Emre. "Prise en compte des effets d'échantillonnage pour la détection de structure des réseaux écologiques." Electronic Thesis or Diss., université Paris-Saclay, 2024. http://www.theses.fr/2024UPASM049.

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Abstract:
Dans cette thèse, nous nous intéressons aux biais que peut causer l'échantillonnage sur l'estimation des modèles statistiques et des métriques décrivant les réseaux d'interactions écologiques. D'abord, nous proposons de combiner un modèle d'observation qui traite des efforts d'échantillonnage et un modèle à blocs stochastiques représentant la structure des interactions possibles. L'identifiabilité du modèle est démontrée et un algorithme est proposé pour estimer ses paramètres. La pertinence et l'intérêt pratique de ce modèle sont confirmés par un grand ensemble de données de réseaux plantes-p
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Bles, Olivier. "Approche théorique et expérimentale du choix de source et de la gestion collective des ressources alimentaires chez la fourmi." Thesis, Strasbourg, 2019. http://www.theses.fr/2019STRAJ007/document.

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Abstract:
Au cours de cette thèse, des outils théoriques (simulation) et expérimentaux (tracking) ont été développés afin d’établir les mécanismes sous-jacents aux phénomènes de choix collectifs d’exploitation de sources de nourriture et à la gestion collective des stocks de nourriture constitués au sein d’une colonie de fourmis. Le premier volet de mon travail révèle l’influence de caractéristiques physiques (telles que l’angularité et la topographie) des pistes entre le nid et les sources de nourritures, sur les comportements des fourmis au niveau individuel et leur résultante au niveau collectif en t
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Lievens, Eva J. P. "Biotic challenges for extremophiles : reproductive interference and parasite specialization in Artemia." Thesis, Montpellier, 2016. http://www.theses.fr/2016MONTT146/document.

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Abstract:
Les défis posés par des facteurs biotiques – les interactions avec des compétiteurs, des parasites, etc. – jouent un rôle important dans l’évolution des populations, mais sont souvent difficiles à étudier. Dans cette étude, nous avons utilisé le système biologique Artemia dans les salins d’Aigues-Mortes, France, pour étudier le caractère et l’évolution de plusieurs interactions interspécifiques. Le système est particulièrement bien adapté à cette recherche : il est simple, contenant deux espèces d’Artemia, trois parasites fortement prévalents (un helminthe et deux microsporidies), et des micro
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Lumbroso, Sarah. "Prospective et stratégies pour l’environnement : entre fabrique des futurs et situation de gestion, quelles prises pour l’action ?" Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019SACLA001/document.

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Abstract:
Face aux enjeux pour le futur posés par l’ampleur des dérèglements écologiques (changement climatique, extinction des espèces, pressions sur les ressources en eau…), les discours sur l’avenir se multiplient, qu’ils promettent une résolution des problèmes par la technologie, des modèles de société utopiques ou considèrent l’effondrement comme inéluctable. Ces discours sur l’avenir ont-ils une influence sur les situations concrètes de gestion de l’environnement ? Peuvent-ils soutenir ou contraindre l’action des acteurs cherchant à améliorer l’état des écosystèmes ? Cette thèse traite ces questio
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Ribeiro, Diogo. "Discovery of the role of protein-RNA interactions in protein multifunctionality and cellular complexity." Thesis, Aix-Marseille, 2018. http://www.theses.fr/2018AIXM0449/document.

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Abstract:
Au fil du temps, la vie a évolué pour produire des organismes remarquablement complexes. Pour faire face à cette complexité, les organismes ont développé une pléthore de mécanismes régulateurs. Par exemple, les mammifères transcrivent des milliers d'ARN longs non codants (ARNlnc), accroissant ainsi la capacité régulatrice de leurs cellules. Un concept émergent est que les ARNlnc peuvent servir d'échafaudages aux complexes protéiques, mais la prévalence de ce mécanisme n'a pas encore été démontrée. De plus, pour chaque ARN messager, plusieurs régions 3’ non traduites (3’UTRs) sont souvent prése
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Jakuschkin, Boris. "Genetic architecture of the interactions between English oak (Quercus robur L.) and the microbial community of its phyllosphere." Thesis, Bordeaux, 2015. http://www.theses.fr/2015BORD0170/document.

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Abstract:
De nombreux et divers micro-organismes vivent dans les tissus interne et externe desfeuilles des plantes, la phyllosphère. Ils influencent de nombreux traits, les interactions biotiques,le flux d’énergie, la tolérance au stress de leur hôte et en fin de compte la valeur sélectivede leurs hôtes. Il a été montré que plusieurs traits quantitatifs de plantes structurentla communauté microbienne de la phyllosphère. Ainsi des Loci de ces traits quantitatifs(Quantitative Trait Loci QTL) liés à la structure de cette communauté étaient attendus.L’objectif principal de ce travail était de rechercher des
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Laurent, Lisa. "Apports d’une approche écosystémique à l’étude de la dynamique des communautés végétales forestières : vers une prise en compte des interactions écologiques multiples." Thesis, Orléans, 2016. http://www.theses.fr/2016ORLE2050/document.

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Abstract:
Un des principaux challenges pour prédire la composition, la structure et la dynamique des communautés végétales est de déterminer comment l’environnement biotique et abiotique va modifier la direction et l’amplitude des interactions entre plantes. L’objectif de ma thèse est de mettre en évidence le rôle prépondérant des interactions complexes (impliquant plus de deux compartiments biotiques) dans la dynamique forestière et plus particulièrement dans la dynamique de régénération des ligneux d’intérêt sylvicole tel que le chêne sessile. Les résultats soulignent l’importance de prendre en compte
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Quillien, Nolwenn. "Des écosystèmes naturellement stressés sous menace anthropique : réponses de la faune des plages de sable macrotidales aux marées vertes." Electronic Thesis or Diss., Brest, 2016. http://www.theses.fr/2016BRES0024.

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Abstract:
Les plages de sable sont des écosystèmes dynamiques couvrant 70% des côtes mondiales. Ces systèmes abritent un cortège spécifique unique et assurent des fonctions essentielles de nourricerie, de nurserie et d’épuration des eaux. Or à proximité des côtes, la population humaine est en développement constant ce qui accroît les multiples pressions d’origine anthropique sur les écosystèmes côtiers. L’apport en excès de nutriments constitue une menace majeure qui peut se traduire par le développement d’importantes biomasses de macroalgues opportunistes (eutrophisation). La fréquence et l’intensité d
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