Dissertations / Theses: 'Écosystème'

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Fadda, Sylvain. "Organisation des communautés de coléoptères terricoles en écosystème multi-perturbé : le cas des écosystèmes de pelouses sèches." Aix-Marseille 3, 2007. http://www.theses.fr/2007AIX30079.

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Abstract:

Les objectifs principaux de cette thèse sont de quantifier les modifications engendrées sur les communautés de Coléoptères terricoles d'un écosystème steppique (la plaine de Crau dans les Bouches-du-Rhône) par des changements d'usage des terres : d'un pâturage ovin séculaire, correspondant à l'arrêt d'un régime de perturbation endogène. Si ces deux changements d'usage produisent un effet négatif sur la communauté végétale de la steppe méditerranéenne de Crau, en diminuant considérablement sa richesse et sa diversité ; l'effet produit sur les communautés de Coléoptères est quand à lui différent. Ainsi, les communautés de Coléoptères des friches post-culturales sont plus riches et plus équilibrées que celles de la steppe. Les espèces les plus communes dans la steppese trouvent dans les friches, avec cependant des densités inférieurs. L'auto-restauration des communautés de Coléoptères de la steppe sur les friches à partir des lisières n'est que partielle. Elle est limitée par l'absence de végétation steppique et la modification de certains facteurs biotiques. Des mesures de restauration écologique visant à rétablir le recouvrement de galets en îlots clairsemés et répartis de manière aléatoire, associée à une réduction ou à une exclusion du pâturage durant quelques années, peuvent être envisagées afin d'accélérer les processus de régénération des Communautés de Coléoptères. Leurs impacts au bout de quatre années restent cependant encore limités. . .

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Niu, Dandan. "La consommation de musique dans un écosystème." Thesis, Paris Sciences et Lettres (ComUE), 2018. http://www.theses.fr/2018PSLEM008/document.

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Abstract:

Pendant des décennies, la France a imposé des quotas pour la musique francophone. Les stations de radio doivent réserver un pourcentage minimal de pièces musicales pour les chansons de langue française depuis 1996. Le développement des services de diffusion en continu, sans quotas, a changé notre façon d'écouter de la musique et pose un nouveau défi aux organismes de réglementation. L'applicabilité des quotas est de plus en plus difficile dans l'industrie de la radiodiffusion et pose la question du désavantage concurrentiel. Dans cette thèse, j'essaie de répondre à trois questions principales sur le thème de la consommation de musique dans cet écosystème en mutation. Dans un premier temps, j'examine empiriquement les réponses stratégiques des radios françaises aux quotas de musique francophone. Les stations respectent-elles les quotas? L'audience réalisée pour la musique francophone est-elle inférieure à ce qu'elle serait en l'absence de ces réponses stratégiques? Pour répondre à ces questions, j'utilise des données détaillées sur les listes de lecture des principales stations de radio en France pour montrer que les stations ont une certaine latitude pour ajuster leurs playlists soumises aux contraintes de quotas. Deuxièmement, je construis un ensemble de données pour fournir des preuves descriptives sur les services de radio et de streaming. Ce sont des modèles économiques entièrement différents et ils ne sont pas comparables sans ajuster l'ensemble de données pour refléter les différences. Afin de comparer le nombre de titres musicaux sur les stations de radio avec le nombre de flux sur les services de streaming, je développe une méthodologie pour combiner les données radio avec les données en streaming en France en 2016. Troisièmement, en utilisant cette nouvelle base de données, la variété des motifs et de la musique sur les services de streaming se compare à celle de la radio. Je fournis également des preuves empiriques sur les ex ternalités de consommation des deux marchés
For decades, France has imposed quotas for Francophone music. Radio stations need to reserve a minimum percentage of total song plays for French-language songs since 1996. The development of streaming services, which faces no quotas, has changed how we listen to music and poses a new challenge to regulators. The applicability of quotas is increasingly difficult in the radio broadcasting industry and raises the question of competitive disadvantage. In this thesis, I try to answer three main issues on the topic of music consumption in this changing ecosystem. First, I empirically examine the strategic responses of French radio stations to quotas for Francophone music. Do stations comply with the quotas? Is the realized audience for Francophone music lower than it would be in the absence of these strategic responses? To answer these questions, I use detailed data on the playlists of major radio stations in France to show that stations have some scope for adjusting their playlists subject to the quota constraints. Second, I build a dataset to provide some descriptive evidence on radio and streaming services. These are entirely different economic models, and are not comparable without adjusting the dataset to reflect the differences. In order to compare the audience number of music titles on radio stations with the number of streams on streaming services, I develop a methodology to combine radio data with streaming data in France in 2016. Third, using this novel dataset, I look at music consumption pattern and music variety on streaming services compares to that of radio. I also provide empirical evidence on the consumption externalities of both markets

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Binauld, Cédric. "Tentative de renouveau d'un écosystème : les processus individuels et collectifs à la base de la non-émergence d'un écosystème d'innovation." Electronic Thesis or Diss., Université de Lille (2022-....), 2023. http://www.theses.fr/2023ULILA018.

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Abstract:

Le concept d'écosystème importé par Moore (1993) en stratégie est de plus en plus mobilisé par les praticiens et exploré par les chercheurs sur le plan théorique comme empirique. Conçu dans ce travail comme « a community of hierarchically independent, yet interdependent heterogeneous participants who collectively generate an ecosystem output », les organisations impliquées font face à des enjeux stratégiques spécifiques, e.g. positionnement dans la structure, management des goulots d'étranglement. Lors de la phase de renouveau, les organisations tentent par exemple de définir la Proposition de Valeur et de capter la valeur générée par l'innovation introduite. Notre revue de littérature montre que la phase de renouveau est peu investiguée empiriquement et que de façon générale, les enjeux stratégiques sont abordés selon une approche fonctionnaliste ou selon une approche volontariste centrée sur une organisation focale. Afin de tenir compte de la dynamique relationnelle, nous posons la question suivante : « Quels sont les processus individuels et les processus collectifs organisationnels mis en œuvre lors d'une tentative de renouvellement d'un écosystème ? ». Nous répondons à cette question par une étude de cas unique longitudinal avec encastrement d'unités. Notre observons l'échec d'un projet de tentative de renouveau d'un Écosystème d'innovation (ESI ci-après). Les données sont collectées en continu pendant plus de trois ans à l'aide de la tactique d'intervention et de celle de l'observation. L'analyse est réalisée au moyen d'un codage thématique à partir d'une adaptation de la méthode Gioia. Les résultats montrent que les organisations impliquées cherchent à limiter les changements dans leur propres Business Models (BM ci-après) et, au regard du besoin d'appariement des BM, cherchent également à minimiser les changements dans le BM des partenaires. Le modèle économique se révèle ainsi structurant pour le renouveau de l'écosystème. L'écosystème que nous étudions fait l'objet d'un monopole légal pour l'activité gestion du réseau de distribution. Nous observons que cette situation confère un important pouvoir à l'organisation qui en bénéficie alors même qu'elle n'est pas propriétaire de ce réseau. Nous contribuons à la littérature sur les écosystèmes en montrant que le renouveau d'un écosystème ne peut avoir lieu en l'absence d'accord sur sa nouvelle structure. Nous montrons l'enjeu pour les membres de maîtriser la définition de la PV et la gouvernance de l'écosystème. Nous montrons la présence d'une stratégie de création de goulot d'étranglement qui ne concerne pas uniquement les aspects techniques. Nous rapprochons la littérature des écosystèmes de celle des BM. Le BM donne sens aux comportements organisationnels et inter organisationnels et précise les parties de l'environnement avec lesquelles une organisation entre en relation. Nous observons que sans appariement des BM concernés, l'innovation ne peut être introduite et l'écosystème se renouveler. Nous concluons également que l'activité de Business Model Innovation (BMI ci-après) est une activité business. Sur le plan managérial, nous soulignons la nécessaire réévaluation par l'État de la structuration légale d'un écosystème au regard de nouveaux objectifs. Nous mettons également à disposition des managers un outil et une démarche pour leur permettre de décider en univers écosystémique
The concept of ecosystem imported by Moore (1993) in strategy is increasingly used by practitioners and explored by researchers both theoretically and empirically. Conceived in this work as "a community of hierarchically independent, yet interdependent, heterogeneous participants who collectively generate an ecosystem outcome", the organizations involved face specific strategic issues, e.g. positioning in the structure, management of bottlenecks. During the renewal phase, organizations try, for example, to define the Value Proposition and to capture the value activated by the resulting innovation. Our literature review shows that the renewal phase is little investigated empirically and that, in general, the strategic issues are approached according to a functionalist approach or according to a voluntarist approach centered on a focal organization. In order to take relational dynamics into account, we ask the following question: “What are the individual processes and the collective organizational processes implemented during an attempt to renew an ecosystem? ". We answer this question with a single longitudinal case study with embedded units. We observe the failure of an attempted renewal project of an ESI. Data is collected continuously for more than three years using intervention and observation tactics. The analysis is carried out by means of a thematic coding based on an adaptation of the Gioia method. The results show that the organizations involved seek to limit changes in their own Business Models (BM hereafter) and, with regard to the need for BM matching, also seek to minimize changes in the partners' BM. The economic model thus proves to be structuring for the renewal of the ecosystem. The ecosystem we are studying is subject to a legal monopoly for the distribution network management activity. We observe that this situation gives significant power to the organization that benefits from it even though it does not own this network. We contribute to the literature on ecosystems by showing that the renewal of an ecosystem cannot take place in the absence of agreement on its new structure. We show the challenge for members to master the definition of PV and the governance of the ecosystem. We show the presence of a bottleneck creation strategy that does not only concern the technical aspects. We bring together the literature of ecosystems with that of BMs. The BM gives meaning to organizational and inter-organizational behaviors and specifies the parts of the environment with which an organization enters into a relationship. We observe that without pairing the BMs concerned, innovation cannot be introduced and the ecosystem cannot be renewed. We also conclude that the activity of Business Model Innovation (BMI hereafter) is a business activity. On the managerial level, we underline the necessary reassessment by the State of the legal structuring of an ecosystem with regard to new goals. We also provide managers with a tool and an approach to enable them to decide in an ecosystemic universe

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Salameh, Khouloud. "Écosystème numérique pour une meilleure gestion des microréseaux." Thesis, Pau, 2017. http://www.theses.fr/2017PAUU3010/document.

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Abstract:

Durant la dernière décennie, de nouveaux concepts ont émergé dans le domaine de l'électricité, notamment les Smart Grids, la génération distribuée et les Microgrids (MGs). Dans cette thèse, nous nous concentrons principalement sur l'étude des MGs. Selon les prévisions des spécialistes du domaine, les MGs devraient prendre une place de plus en plus importante dans les futurs systèmes électriques. Mais pour cela, ils devront être mieux gérés, et il faudra donc d’abord résoudre plusieurs problèmes importants : l’identification, la mobilité, l’aspect multi-rôles, l’interopérabilité, la non-coopération et la planification de l’offre et la demande de l’électricité. Afin de résoudre tous ces problèmes, nous proposons un Framework dédié composé de 3 couches : physique, de connaissance et de gestion. Trois principales contributions sont présentées dans ce travail ciblant la résolution des problèmes déjà cités : OntoMG : un modèle d'information ontologique pour les Microgrids, DECF : un modèle coopératif pour l’optimisation de l’échange d’électricité dans le MG, et MOCSF : une planification coopérative multi-objectifs de l’électricité dans le MG. OntoMG est un modèle ontologique de données, basé sur les standards IEC 61970 et IEC 61580, complété par un nombre de paramètres additionnels permettant au MG d’atteindre l’ensemble de ses objectifs. Notre approche présente plusieurs avantages par rapport aux approches existantes dans la littérature scientifique, notamment : elle permet une planification de la consommation, la production et le stockage de l’électricité dans le MG, elle considère plusieurs sources d'énergie contrairement aux approches existantes qui ne prennent en compte que l'interaction des consommateurs avec une seule source d'énergie, et elle prend en compte l’ensemble des préférences des composants du MG à la différence des approches existantes qui ne considèrent ces préférences qu’en partie
Over the past decade, new concepts have emerged in the electricity field, including the Smart Grids, the Distributed Generation and the Micro- grids (MGs). In this thesis, we will be mainly focusing on the study of the MGs. An MG is a small-scale power system, consisting of local power generation, local loads and energy storage systems. Thanks to their numerous economical, ecological and operational benefits, the MGs are expected to hold the promise of becoming a major ingredient in the implementation of the future power systems. However, there are several significant challenges to overcome in order to achieve its expected bene- fits, namely: the cyber-attacks, the mobility aspect, the interoperability, the non-cooperation, and the demand-side management. Three main contributions are developed. First, we present OntoMG, an ontology-based data model, capable of representing the heterogeneous components of the MG and their properties, while being compliant with existing models and information standards (i.e., IEC 61970 and IEC 61850) and coping with the interoperability issues and the multi-objective aspect of MG. Secondly, we introduce DECF, a cooperative model for the optimization of the electricity exchange in the MG, offering several advantages over existing approaches, in particular: 1) its generic in that it considers all heterogeneous components of MG, 2) it is a cooperative model that reduces the technical, ecological and economic costs and encourages the local power exchange, and 3) it is user-oriented in that it gives the user the possibility to fine-tune the weight of each objective aspect . Finally, we introduce MOCSF, a ‘Multi-objective Cooperative Scheduling Framework’ designed for scheduling the production, consumption and storage in the MG. MOCSF 1) provides a multi-type scheduling in that it allows the scheduling of all the power consumption, production and storage of the MG, 2) considers multiple energy sources and 3) considers the MG components’ preferences. After detailing the existing power scheduling techniques and their drawbacks regarding our challenges, we presented our ‘MOCSF’ modules: The Preference-based compromise builder, designed to generate the best balance between the sellers and buyers desired schedules and the Multi-Objective Scheduler, aiming at scheduling the seller-to-buyer associations resulting from the DECF, while reducing the operational, economic and ecological costs of the MG. An illustrative example is provided after each step to ease the understanding of each module. Finally, a set of experiments showed the performance and efficiency of our approach. Illustrative examples are provided after each step to facilitate understanding of each module. Then, a number of simulations are made to show the effectiveness of our approaches to solve our challenges in relation to the existing approaches

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Roy, Grégoire Etienne. "Écosystème normatif minier et communautés politiques en Colombie transitionnelle." Thesis, Université d'Ottawa / University of Ottawa, 2019. http://hdl.handle.net/10393/39059.

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Abstract:

Résumé Cette thèse examine l’impact de l’octroi de titres miniers sur les dynamiques politiques ayant cours dans des territoires affectés par le conflit armé colombien. Du point de vue théorique, elle reprend les questions classiques que la philosophie politique formule au sujet du rapport entre normes et communauté politique, c.-à-d., autour du rapport dialectique entre politique et droit. Elle les reformule cependant au regard des transformations induites par la globalisation: la multiplication et la superposition de différents régimes normatifs, qui remettent en cause la cohérence de la sphère normative et, par le fait même, le rapport assumé entre droit, démocratie et souveraineté. M’appuyant sur les réflexions de chercheurs de l’École de Bruxelles de philosophie du droit, je propose le modèle « d’écosystème normatif » pour analyser les rapports qui s'établissent entre des régimes normatifs a priori incommensurables, allant du droit aux stratégies contre-insurrectionnelles, de la Responsabilité sociale des entreprises (RSE) à la morale; et des relations contractuelles à la violence politique. Sur la base d’études de cas menées dans deux régions de la province d’Antioquia, cette thèse démontre que l’octroi de titres miniers favorise des configurations particulières de l’écosystème normatif. En d'autres mots, l’octroi de titres miniers induit une certaine stabilisation des relations entre droit public, RSE, contractualité et gouvernementalité, que j'appelle « écosystème normatif minier ». Ma thèse conclut que l’écosystème normatif minier colombien est peu propice à l'articulation de communautés politiques et empêche la conduite délibérée et rationnelle des affaires publiques ainsi que l'organisation démocratique du territoire. L’écosystème normatif minier favorise au contraire des rapports sociaux utilitaires, la corruption, le clientélisme et la violence politique. Cette recherche démontre en outre que les « solutions » normatives mises de l’avant pour traiter les conflits suscités par l’activité minières remettent parfois en cause certaines catégories fondamentales de la pensée politique et juridique moderne. En Colombie, une politique d’institutionnalisation de la RSE, menée conjointement par l’État et les titulaires miniers, induit ainsi des changements profonds dans les rapports entre communautés, entreprises et gouvernements. Ma thèse clarifie ainsi certains des défis que la société colombienne doit surmonter, étant donné les nombreux titres miniers octroyés sur une grande proportion de son territoire, pour mener à bien le processus de paix initié en 2016. Summary This thesis examines the impact of granting mining titles on political dynamics in the territories affected by the Colombian armed conflict. From a theoretical point of view, it takes up the classic political philosophy interrogations about the relationship between norms and political community, i.e., the dialectical relationship between politics and law. Those questions are updated by taking into account the transformations induced by globalization: indeed, the multiplication and superimposition of different normative regimes undermines the coherence of the normative sphere and, by the same token, the assumed relationship between law, democracy and sovereignty. Based on the reflections of researchers at the Brussels School of Philosophy of Law, I propose the notion of “normative ecosystem” to analyze the relationships that are established between presumably incommensurable normative regimes, from law to the counter-insurgency strategies, from Corporate Social Responsibility (CSR) to morality; and from contractual relations to political violence. Based on case studies conducted in two regions of the province of Antioquia, this thesis demonstrates that the granting of mining titles favors particular configurations of the normative ecosystem. In other words, the granting of mining titles induces a certain stabilization of the relations between law, CSR, contractuality and governmentality, which I call the “mining normative ecosystem”. My thesis concludes that the Colombian mining normative ecosystem is not conducive to the articulation of political communities and prevents the deliberate and rational conduct of public affairs as well as the democratic organization of the territory. On the contrary, the mining normative ecosystem favors utilitarian social relations, corruption, clientelism and political violence. This research also shows that the normative “solutions” put forward to deal with conflicts in the mining sector call into question certain fundamental categories of modern political and legal thought. In Colombia, a policy of institutionalization of CSR conducted jointly by the State and mining title holders induces profound changes in the relationships between communities, companies and governments. My thesis thus clarifies some of the challenges that Colombian society must overcome, given the numerous mining titles granted over a large part of its territory, to successfully carry out the peace process initiated in 2016.

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Graillon, Patrick. "Cartographie biophysique du grand écosystème de Kouchibouguac, Nouveau-Brunswick." Mémoire, Université de Sherbrooke, 1999. http://savoirs.usherbrooke.ca/handle/11143/2170.

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Abstract:

Les gestionnaires du Parc national Kouchibouguac ont établi une zone d'influence qui entoure le parc, le Grand Écosystème de Kouchibouguac (GEK). L'objectif visé est d'arriver à un mode de gestion écosystémique qui tient compte des phénomènes environnementaux externes au parc. Pour ce faire, les caractéristiques biophysiques de cette zone d'influence doivent être connues. L'objectif du présent travail est de produire une cartographie biophysique qui permet de décrire et d'interpréter les processus anciens et actuels qui régissent l'état de l'environnement biophysique du GEK. Cette carte biophysique servira de référence pour tenter de prévoir et prévenir des phénomènes qui pourraient influencer les différents milieux du parc. Elle constitue une synthèse des éléments physiques du paysage. Elle inclue des informations sur la végétation, la géomorphologie, la topographie, l'hydrographie et la géologie. La représentation d?une carte biophysique repose sur la confrontation et l'intégration des dimensions écologiques et géomorphologiques d'un milieu. La carte biophysique permet de définir des zones biophysiques. La carte biophysique permet aussi d'observer certains phénomènes actuels qui ont des répercussions sur le parc."--Résumé abrégé par UMI.

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Nys, Claude. "Fonctionnement du sol d'un écosystème forestier : conséquences des enrésinements." Nancy 1, 1987. http://www.theses.fr/1987NAN10312.

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Abstract:

Modifications dues à la substitution d'une plantation de pices abies à une forêt feuillue mélangée des Ardennes sur les sols (morphologie, caractéristiques physicochimiques, bilan isoquartz) et le cycle biogéochimique (flux en solution, variation des concentrations, redistribution par les eaux de gravité, bilan apports-pertes dans les écosystèmes feuillus et résineux)

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Drouin, Richard. "Écosystème : un Framework pour la simulation visuelle interactive assistée." Doctoral thesis, Université Laval, 2018. http://hdl.handle.net/20.500.11794/29568.

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Abstract:

La simulation visuelle interactive (SVI) permet d’analyser et de comprendre des systèmes complexes. Par contre, leur compréhension est limitée par la capacité humaine de traiter et d’analyser l’information véhiculée par la simulation afin de prendre de bonne décision concernant son déroulement futur. Le projet présenté dans cette thèse vise à aider la compréhension d’un scénario simulé par l’utilisation d’un Framework qui permet de simplifier la tâche d’analyse de l’utilisateur. En effet, le Framework effectue de façon autonome des tâches d’analyse et de traitement pour informer l’utilisateur du type d’interactions entre les entités du scénario simulé. Pour ce faire, le Framework permet tout d’abord de structurer les éléments de la simulation en s’inspirant du paradigme des écosystèmes. Ensuite, le Framework trouve et identifie les types d’interactions présentes dans le scénario. Finalement, le Framework informe l’utilisateur de façon claire et simple des comportements à noter. Comme les résultats obtenus le démontrent, le Framework permet de simplifier la tâche d’analyse d’un utilisateur de SVI en l’informant du type d’interactions présentes dans le scénario à l’étude. -- Mots clés : Simulation visuelle interactive, logique floue, écosystème, interaction biologique, détection d’interaction, Framework, architecture logiciel, interaction, biomimétisme, système complexe, modélisation.

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Bourgoin, Gilles. "Étude des variations spatio-temporelles de l'activité et de l'utilisation des ressources par les herbivores : l'exemple du mouflon méditerranéen (Ovis gmelini musimon x Ovis sp.) et du chevreuil (Capreolus capreolus)." Lyon 1, 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/docs/00/32/61/29/PDF/Bourgoin-These.pdf.

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Abstract:

Face aux contraintes spatio-temporelles qu’ils peuvent rencontrer, les animaux doivent adopter des tactiques leur permettant d’assurer leur survie et leur reproduction. Nous avons cherché à identifier les tactiques d’utilisation des ressources et du temps ainsi que les facteurs de variation de cette utilisation dans deux populations de grands mammifères herbivores : le mouflon méditerranéen (Ovis gmelini musimon x Ovis sp. ) et le chevreuil (Capreolus capreolus). Nous montrons que les mouflons sont particulièrement sensibles aux fortes chaleurs estivales et répondent en réduisant leur activité, notamment durant la période diurne. Concernant l’utilisation de l’habitat, les mouflons en activité utilisent davantage les habitats ouverts et moins les forêts de feuillus que les mouflons inactifs. Les données de localisation utilisées dans cette étude ont été obtenues à l’aide de colliers GPS dont le succès de localisation est influencé par le comportement de l’animal et les caractéristiques de l’habitat (végétation, topographie). Enfin, nous montrons que les femelles chevreuil modifient la taille de leur domaine vital en fonction principalement de la richesse du milieu, du nombre de faons, de leur âge et de la saison. Les résultats obtenus à partir de ces deux études de cas mettent en évidence l’existence de modifications de l’activité et de l’utilisation des ressources par les grands mammifères herbivores en fonction de leur état et en réponse aux variations environnementales
According to the spatio-temporal constraints encountered, animals should adopt tactics enabling them to ensure their survival and reproduction. We sought to identify the tactics of resource use and time-budget as well as the factors causing their variation in two populations of large mammalian herbivores: the Mediterranean mouflon (Ovis gmelini musimon x Ovis sp. ) and the roe deer (Capreolus capreolus). We found that mouflon were particularly sensitive to strong summer heats and responded by decreasing their activity, in particular during the diurnal period. Concerning the habitat use, active mouflon used more the open habitats and less the deciduous forests than inactive mouflon. The location data used in this study came from GPS collars whose fix success is influenced by both animal behaviour and habitat characteristics (vegetation, topography). Lastly, we found that female roe deer adjusted the size of their home range according mainly to the abundance of resources, the number of fawns at heel, their age and the season. Based on these two case studies, our results highlight that large mammalian herbivores can adjust their activity and resource use according to their internal state and in response to changes of environmental conditions

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Caussy, Ramesh. "Processus de construction d'une architecture d'industrie : le cas de l'initiative d'Intel dans la maison numérique." Palaiseau, Ecole polytechnique, 2009. http://www.theses.fr/2009EPXX0011.

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Abstract:

Le rapprochement d'une littérature sur le thème de l'émergence d'industrie et celui des partenariats permet de rendre compte d'une situation de reconfiguration de marchés et potentiellement d'industries initiée par un leader d'industrie augmenté du poids d'un ensemble de partenariats. La thèse a précisé l'idée d'un contexte de convergence, étendu le concept de "partenariat d'exploration" souligné le rôle des hommes et de leurs capacités créatives, formalisé des types de réseaux aux fonctionnements distincts avec un nouveau type d'acteur, distingué le concept de leadership de plateforme de celui de leadership d'architecture d'industries que nous avons introduit. Le travail de thèse a par ailleurs permis de mettre en lumière le rôle clef du leader de l'architecture dans ce processus de reconfiguration et montre alors comment "la relation" peut aussi être un vecteur susceptible de générer un actif intangible de première importance.

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Müller, Johann. "Étude des impacts des composés organiques au sein des écosystèmes planctoniques : facilitation, interférence et signaux moléculaires." Paris 6, 2010. http://www.theses.fr/2010PA066492.

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Abstract:

Les mécanismes tels que le recyclage des nutriments ou la diversification du vivant jouent un rôle prépondérant dans le fonctionnement et la structuration de la biosphère. Ces mécanismes sont régulés selon différents processus participant au fonctionnement des écosystèmes. Les relations intra et inter spécifiques contrôlant la mosaïque des communautés et son impact sur l’environnement, sont à la base de ce fonctionnement et leur étude est par conséquent essentielle pour la compréhension et la gestion de la biosphère. Lors de mon travail de thèse, je me suis intéressé plus particulièrement à l’une de ces relations interspécifiques : l’impact de composés organiques, relargués dans les écosystèmes lacustres par des organismes, sur les relations entre espèces. A travers plusieurs expériences, mon but a été d’explorer ces effets sous plusieurs angles. Dans une première étude, je me suis concentré sur les effets de composés allélopathiques sur la compétition interspécifique pour une ressource en utilisant un modèle qui servit de base à la compréhension de la compétition : le complexe symbiotique Paramecium bursaria – Chlorella vulgaris (Gause, 1935). L’impact des composés organiques tels que les cyanotoxines et autres composés contenus dans la cyanobactérie Planktothrix agardhii sur les traits de vie d’un organisme zooplanctonique herbivore majeur, Daphnia magna, a été étudié dans un second axe. Enfin, le comportement de ce cladocère face à ces molécules produites par différentes espèces de phytoplancton a constitué le sujet d’un troisième et dernier axe. Au travers de ce travail, nous avons montré dans un premier temps qu’endosymbiose et interactions allélopathiques peuvent interagir et changer l’issue de la compétition pour l’exploitation d’une ressource et entraîner la coexistence des espèces. Par la suite, nous avons mis en évidence l’effet de composés organiques issus de cyanobactéries, à la fois sur les traits de vie et sur le comportement migratoire d’un consommateur majeur de phytoplancton, cet effet pouvant agir sur le contrôle de la prolifération des cyanobactéries dans les lacs. Ces résultats mettent en relief la place que recouvrent les composés organiques au sein des relations interspécifiques et leurs effets sur la composition des communautés et, par extension, sur les processus écosystémiques
Mechanisms such as nutrients recycling or life diversification play a major role in the structuring and functioning of the biosphere. These mechanisms are regulated by different processes involved in the functioning of ecosystems. Controlling the mosaic of communities and its impact on the environment, intra and inter specific relations are the basis of this functioning and their study is therefore essential for the understanding and management of the biosphere. During my PhD, I was particularly interested in one of these interspecific interactions: the impact of organic compounds released into the environment by organims on relationships between species. Through several experiments, I aimed to explore these effects in several ways. In a first study, I focused on the effect of allelopathic compounds on interspecific competition for a resource using a model that was the basis for understanding the competition: the symbiotic complex Paramecium bursaria - Chlorella vulgaris (Gause, 1935). The impact of organic compounds such as cyanotoxins and other compounds produced by the cyanobacteria Planktothrix agardhii on the life-history parameters of a major herbivorous zooplankton, Daphnia magna, was studied in a second axis. Finally, the migration behaviour of this cladoceran submitted to organic compounds produced by phytoplankton has been the subject of a third axis. Through this work, I showed that endosymbiosis and allelochemical-mediated interactions may interact and change the outcome of exploitation competition and govern species coexistence. Then, I showed that organic compounds produced by a cyanobacteria affect life history traits and migration behaviour of a major consumer of phytoplankton; this effect may impact the control of cyanobacteria bloom in lakes. These results highlight the role of organic compounds in the relationships between species and their effects on community composition and, by extension, on ecosystem processes

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Dias, Magali. "Méthylation du mercure par les bactéries anaérobies d'un écosystème estuarien." Pau, 2007. http://www.theses.fr/2007PAUU3015.

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Abstract:

Dans les estuaires les métaux traces tel que le mercure se retrouvent piégés dans les sédiments en conditions anoxiques. Parmi les communautés bactériennes colonisant ces milieux, certains microorganismes ont la capacité de produire du méthylmercure, fortement toxique pour les êtres vivants. L’objectif de ce travail était de comprendre le rôle des bactéries sulfato-réductrices (BSR) dans la méthylation du mercure au niveau des sédiments de l’estuaire de l’Adour. Des analyses in situ ont révélé un impact du méthylmercure sur les structures des communautés bactériennes d’une station d’étude intertidale (B20). La réalisation d’un mésocosme a permis de suivre l’impact du mercure sur la diversité bactérienne et la production de méthylmercure a pu être quantifiée. La contamination par du mercure inorganique imposait de par sa transformation en méthylmercure une pression de sélection sur les communautés, essentiellement en conditions anoxiques. L’isolement et l’étude de souches de BSR ont montré un lien entre la présence de certaines souches des genres Desulfomicrobium et Desulfovibrio et la méthylation du mercure. Cependant, une étude sur plusieurs souches de BSR, isolées lors de cette étude ou issues de collection, a montré le caractère espèce voire souche spécifique de la méthylation. L’association de techniques moléculaires (T-RFLP, clonage et séquençage) et culturales (isolement et caractérisation de souches bactériennes) a permis de déterminer la composition de la communauté de BSR in situ. Une seconde étude en mésocosme, basée sur l’étude des transcrits de dsrAB, semble indiquer que l’oscillation oxie/anoxie, simulant les cycles de marée, semble avoir une faible influence sur la communauté active de BSR. Au contraire, les ajouts de mercure causent des perturbations temporaires et influencent donc la communauté active de BSR
In estuaries, traces metals such as mercury are trapped in sediments and persist in anoxic conditions. Among the bacterial communities from these ecosystems, some microorganisms produce methylmercury, very toxic for living organisms. The aim of this work was to increase our knowledge about the role of sulphate reducing bacteria (SRB) in mercury methylation in sediments of the Adour estuary. In situ analyses revealed a methylmercury impact on bacterial communities structure in one intertidal sampling station (B20). Mesocosms experiments allowed to measure the impact of mercury on microbial diversity and the methylmercury production could be quantified. The contamination by inorganic mercury imposed, due to its transformation in methylmercury, a selection impact under anoxic conditions. Isolation and studies of SRB strains showed a link between the presence of Desulfomicrobium and Desulfovibrio strains and mercury methylation. However, a study based on several strains of SRB, isolated in this study or from reference culture collection, showed that mercury methylation was species or strains specific. Both molecular (T-RFLP, cloning and sequencing) and cultural approaches (isolation and characterization) allowed determining SRB community composition in situ. A second study in mesocosm based on dsrAB transcripts seemed to indicate that oxic/anoxic oscillations, simulating the cycles of tide, had a weak influence on the active community of SRB. On the contrary, mercury additions caused temporary disturbances and therefore influenced the active SRB community

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Souchu, Philippe. "Contribution à l'étude du cycle de l'azote en écosystème macrotidal." Brest, 1986. http://www.theses.fr/1986BRES2034.

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Abstract:

L'evolution saisonniere des transferts biogeochimiques d'azote inorganique dissous (nid) aux trois interfaces (eau douce-eau de mer; eau-sediment; eau-atmosphere) est etudiee dans un ecosysteme littoral macrotidal d'europe occidentale (la rade de brest, france). En periode hivernale et printaniere, la principale voie de fertilisation (azote nitrique) est d'origine fluviale (lessivage des sols de bassins versants agricoles). Le recyclage de l'azote, a l'interface eau-sediment, sous forme ammoniacale, permet le maintien d'une production primaire importante en ete et en automne. Les flux de nid d'origine atmospherique sont mesures sur trois sites de bretagne occidentale (influence marine, agricole et urbaine). S'ils restent faibles a l'echelle annuelle, ces flux peuvent representer pour l'ecosysteme littoral une source transitoire non negligeable, en periode estivale et automnale. Des budgets saisonniers des flux de nid entrant dans le systeme sont dresses et compares aux besoins de la production primaire pelagique. La dynamique du nid et de l'activite des producteurs primaires est interpretee en relation avec le concept d'ergocline

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Le, Calvez Thomas. "Diversité et fonctions écologiques des champignons en écosystème hydrothermal marin profond." Phd thesis, Université Rennes 1, 2009. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00465055.

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Abstract:

Les champignons sont des microorganismes essentiellement connus en écosystèmes aériens, s'étant diversifiés en milieu continental. A partir d'analyses d'horloges moléculaires, nous avons émis l'hypothèse d'une diversification des champignons dans les océans. Par ailleurs, de nombreux auteurs considèrent les écosystèmes hydrothermaux marins profonds comme le Berceau de la Vie : nous avons donc choisi d'étudier ces milieux, très peu exploités en terme de diversité fongique, dans l'espoir de retrouver des champignons ayant conservé des caractères ancestraux de ce Règne. Des analyses de diversité (établies après la création d'une base de données moléculaires dédiée), par PCR indépendantes de la culture (amplification du gène codant l'ARNr18S), ont révélé des organismes se branchant à la base de la phylogénie des champignons (phylum Chytridiomycota), en accord avec notre hypothèse de travail, couplée à une forte diversité spécifique fongique (phyla Chytridiomycota, Basidiomycota, et Ascomycota). Des souches isolées de ces écosystèmes en laboratoire ont également permis de détecter de nombreuses nouvelles espèces de champignons (phylum Ascomycota). Ces 2 approches combinées nous ont ainsi permis de révéler une diversité insoupçonnée dans ces milieux. Des hypothèses évolutives sur la diversification des champignons en milieu marin ont ainsi pu être proposées. Le second objectif de notre travail était de connaître les rôles de ces organismes au sein de ces écosystèmes. Pour cela, nous avons choisi une approche métagénomique originale : l'échantillon choisi sur la base de la fréquence du gène codant l'ARNr18S et des études de diversité, a été pyroséquencé (GS FLX ; 454 Life Sciences, ROCHE). L'échantillon testé contenait un seul phylotype fongique, constituant une branche profonde des champignons (phylum Chytridiomycota). Six ng d'ADN extraits ont été pyroséquencés en 3 runs indépendants : 168.909 contigs (longueur moyenne : 352 pb) ont été assemblés à partir de 1.441.839 séquences individuelles. Deux approches ont alors été choisies. La première consistait à analyser les contigs générés, afin d'extraire les fragments de gènes fongiques et de reconstruire leur métabolisme hypothétique. Des hypothèses de fonctionnement métabolique des champignons dans ces milieux, établies sur la base de recherche d'homologies dans les bases de données (BLASTX, ORF finder, KOG,...) ont pu être établies. La seconde approche, basée cette fois sur l'étude des séquences non assemblées, consistait à reconstruire les voies métaboliques du métagénome (BLASTX, mgRAST, ASGARD), et reconstituer la composition taxonomique de notre échantillon (MEGAN). Les résultats de l'analyse métagénomique présentés dans cette thèse, nous ont permis d'émettre des hypothèses sur les modes de vie des champignons en écosystème hydrothermal et nous ont également permis de reconstruire avec succès les métabolismes bactériens dominants dans l'écosystème. Les limites de cette analyse, ainsi que les nombreuses perspectives qu'offrent ce travail sont également développées.

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Ferron, Evelyne. "L'émergence d'une crise régionale au coeur d'un écosystème atypique : le Fayoum." Master's thesis, Université Laval, 2005. http://hdl.handle.net/20.500.11794/18087.

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Janati-Idrissi, Mohammed. "Evaluation de l'écotoxicité potentielle des contaminants sur un micro-écosystème expérimental." Rouen, 1997. http://www.theses.fr/1997ROUES035.

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Baudinet, Dominique. "Flux nutritifs particulaires et dissous dans un écosystème mytilicole côtier méditerranéen." Aix-Marseille 2, 1991. http://www.theses.fr/1991AIX22072.

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Abstract:

Ce travail a pour but principal l'etude des transformations de la matiere azotee dans les eaux cotieres ou cet element est souvent considere comme l'un des facteurs limitants de la production. Une attention particuliere est apportee aux parts respectives prises par les compartiments particulaire et dissous (nod et nid) dans les flux nutritifs d'un ecosysteme mediterraneen (anse de carteau) dont la biomasse animale est dominee par la moule mytilus galloprovincialis cultivee sur corde. Une station situee en marge de la zone mytilicole sert de reference et permet de presenter les caracteristiques hydrologiques et hydrobiologiques du site. Le compartiment particulaire s'enrichit au printemps et en ete a la suite d'efflorescences phytoplanctoniques. Nid au contraire s'accroit en automne et en hiver. Nod ne suit pas de regle precise de variations aussi bien sur des periodes mensuelles que journalieres. L'influence du vent apparait comme preponderante sur la nature des masses d'eau presente dans la baie. Le suivi d'une poussee de phytoplancton confirme l'existence d'un balancement de deux types d'eaux ou la chlorophylle a oscille entre 3 et 12 g l##1. La comparaison des caracteristiques de la station de reference a celle d'une eau situee au cur d'une table a moules permet d'apprecier les transformations engendrees sur les differentes formes de l'azote par les mollusques filtreurs: une diminution de l'energie trophique potentielle et une prise en acides amines libres dissous est suivie d'une augmentation en materiel dissous organique et inorganique a cette station, ayant une double provenance pour la seconde forme d'azote dissous. Les origines de cet enrichissement en ammonium sont une mineralisation de la matiere organique particulaire a partir des biodepots ou excretion directe par les mollusques. Des systemes experimentaux maintenus in situ ont permis de mettre en evidence le role tout a fait preponderant de l'excretion dans cette production de l'ammonium. Elle est 37 fois superieure a celle due a la mineralisation a partir des sediments enrichis en biodepots meme si les flux d'ammonium, de phosphates et silicates sont amplifies d'un facteur 3 a 5. Ces differents processus (excretion+sediment avec biodepots+sediment sans biodepots de moules) contribuent a 42% de la demande en azote du phytoplancton dans l'ensemble de la baie. Un bilan energetique a l'echelle d'une unite de production est realise

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Mehdi, Lotfi. "Structure verte et biodiversité urbaine. : l'espace vert : analyse d'un écosystème anthropisé." Thesis, Tours, 2010. http://www.theses.fr/2010TOUR1804.

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Abstract:

Ce travail de recherche s’est porté premièrement sur l’analyse de la structure verte, son organisation spatiale, son évolution, sa gestion et ses usages dans le cas de l’agglomération tourangelle. En second lieu nous avons analysé l’influence des activités anthropiques, plus particulièrement les opérations de gestion et les pratiques des usagers, sur les communautés des pelouses des espaces verts publics. Troisièmement, nous avons examiné l’effet du gradient urbain, sur la composition botanique des boisements urbains.L’analyse spatiale de l’évolution de la structure verte tourangelle a permis de démontrer que les espaces verts qui n’étaient pas protégés par un statut particulier (patrimoine, valeur écologique, zone inondable, etc.) ont disparu, ont été fragmentés ou fortement artificialisés. Ce travail a mis en évidence la structuration spatiale des communautés floristiques en fonction du gradient de fréquentation, dans les pelouses, et du gradient urbain dans le cas des bois. En présence d’une gestion intensive, comme dans les pelouses urbaines, l’effet des variables du milieu semble atténué
This research work focused firstly on the analysis of the green structures, their spatial organization, evolution, management and uses in the area of greater Tours. Secondly, we analyzed the influence of the anthropological activities, particularly management operations and users' practices, on the communities of the lawns of public green spaces. Thirdly, we examined the effect of the urban gradient on the botanical composition of urban afforestations.The spatial analysis of the evolution of the green structures of Tours has demonstrated that green spaces which were not protected by a special status (heritage site, ecological value, flood-risk area, etc.), have disappeared, been split up or become highly artificial. This work highlights the spatial structure of the floristic communities according to the gradient of frequencies in lawns, and the urban gradient in the case of wooded areas. In the presence of intensive management, as with urban lawns, the effect of the environment's variables appears to be reduced

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Kaboré, S. Séraphine. "Évaluation d'un écosystème pastoral sahélien, apport de la géomatique : Oursi, Burkina Faso." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 2001. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk3/ftp05/NQ61855.pdf.

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Savin, Guilhelm. "Intelligence en essaim pour la distribution de simulations dans un écosystème computationnel." Phd thesis, Université du Havre, 2014. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00932194.

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Abstract:

Nous présentons dans ces travaux une contribution concernant la distribution de simulations de système complexe dans des environnements distribués ouverts. Nous considérons ces environnements comme des écosystèmes computationnels, dont nous décrivons les propriétés et les caractéristiques, dans lesquels évoluent, de par leur exécution, les simulations. Elles sont modélisées sous la forme d'un réseau d'interactions représenté à l'aide d'un graphe dynamique. En considérant les différentes dynamiques possibles, nous proposons un formalisme général représentant ces graphes, ainsi qu'une interface de programmation, GraphStream, permettant de les manipuler et de les étudier.Le graphe dynamique est alors un sujet d'étude dans lequel nous recherchons des organisations, que nous suivons dans le temps, afin de minimiser les coûts de communication entre les machines et d'équilibrer la charge de calcul. Nous apportons une amélioration visant à réduire les oscillations des résultats de l'algorithme AntCo2 utilisant des colonies de fourmis numériques qui, grâce à des mécanismes de compétition et de collaboration, détecte des organisations. La stabilité de ces dernières est déterminée par l'intermédiaire d'une heuristique de recherche distribuée et dynamique de centroïdes.Un intergiciel est proposé permettant de distribuer de manière décentralisée et dynamique les simulations dans un écosystème computationnel en favorisant les organisations et en respectant l'équilibrage de charge.

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Pena, Geneviève. "Sels nutritifs et micropolluants métalliques dans un écosystème lagunaire, l'étang de Thau." Montpellier 2, 1989. http://www.theses.fr/1989MON20244.

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Abstract:

L'etude des sels nutritifs et des micropolluants metalliques s'inscrit dans un programme pluridisciplinaire ecothau qui consiste en une etude ecologique d'un ecosysteme lagunaire mediterraneen: l'etang de thau (herault, france). L'etude des sels nutritifs (ion ammonium, nitrates, phosphates) a permis de mettre en evidence l'existence des structures spatio-temporelles, a l'aide de methodes de classification et d'une analyse discriminante, au sein de l'etang, pour chacune des periodes etudiees permettant ainsi de definir l'emplacement et la frequence des prelevements en adequation avec le comportement de la lagune. Plusieurs facteurs environnementaux sont responsables des repartitions des sels nutritifs observees. Aux apports externes issus du bassin versant, s'ajoutent les apports internes provenant du relargage des sediments et la consommation de la biomasse phytoplanctonique qui entraine une disparition rapide des teneurs en composes azotes, au printemps et en ete. L'azote apparait donc comme facteur limitant la biomasse chlorophyllienne. L'etude des micropolluants metalliques a pour objectif d'evaluer la pollution des sediments de l'etant de thau. Les treize elements etudies sont: al, ca, cd, co, cr, cu, fe, hg, mg, mn, ni, pb, zn. La presence de metaux lourds dans le sediment est fortement correlee aux teneurs en matiere organique et en particules fines du depot sedimentaire. Les distributions spatiales des elements metalliques sont assujetties a la presence d'un gradient sud-nord. Le bassin nord de la lagune est tres urbanise, tres industrialise, c'est de plus une region portuaire. Les sediments de cette zone sont riches en cadmium, cuivre, plomb et zinc

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Navarro, Élisabeth. "Diversité du genre Nitrobacter : structure génétique d'une population naturelle d'un écosystème aquatique." Lyon 1, 1992. http://www.theses.fr/1992LYO10011.

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Abstract:

La nitrification, étape clé du cycle de l'azote est essentiellement le fait de micro-organismes autotrophes. Dans le sol, seul le genre Nitrobacter est capable de transformer le nitrite en nitrate. Cette fonction spécifique a été largement étudiée, alors que les populations microbiennes responsables sont peu connues. Ce travail constitue une première tentative d'étude de la diversité du genre Nitrobacter, en vue d'établir la structure génétique des populations naturelles. Il a tout d'abord nécessité la mise en place d'outils moléculaires adaptés à cette bactérie à croissance lente. Les études taxonomiques ont permis de confirmer l'appartenance du genre Nitrobacter à la subdivision α des protéobactéries et de répartir, les souches étudiées, en 3 espèces génomiques : l'espece N. Winogradskyi où l'existence de 3 sous-espèces génomiques a été mise en évidence pour la première fois, l'espèce N. Hamburgensis et l'espèce génomique 2, jamais décrite auparavant. Les souches de Nitrobacter ont été caractérisées par différentes techniques. Les résultats obtenus ont mis en évidence une diversité intraspécifique et ont permis de proposer un protocole de caractérisation. Une étude de la diversité de la population naturelle de Nitrobacter d'un étang de Dombes a été réalisée. Cette population se divise en 3 sous-populations : une sous-population caractéristique de l'eau, une sous-population caractéristique des sédiments et une sous-population non spécifique du milieu. La structure des populations plasmidiques révèle aussi une différence entre l'eau et les sédiments. En effet, un plasmide de 60 MDa a été mis en évidence dans une souche isolée de l'eau et un plasmide de 37 MDa dans 13 souches isolées des sédiments. La présence du plasmide de 37 MDa n'est pas liée à une sous-population mais à une localisation, les sédiments. Nous pouvons penser que ce plasmide confère aux souches le possédant une capacité d'adaptation à ce milieu

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Kaboré, Séraphine S. "Évaluation d'un écosystème pastoral sahélien apport de la géomatique (Oursi-Burkina Faso)." Thèse, Université de Sherbrooke, 2001. http://savoirs.usherbrooke.ca/handle/11143/2706.

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Abstract:

L'objectif principal de cette recherche est la mise au point d'une architecture d'intégration de données socio-bio-géographiques et de données satellitales dans un Système d'Information Géographique (SIG) en vue d'une aide à la prise de décisions dans un environnement semi-aride au nord du Burkina Faso. Elle répond à la question fondamentale de l'interprétation des effets des facteurs climatiques et socioéconomiques sur le milieu pastoral. La recherche s'est appuyée sur plusieurs hypothèses de travail: possibilité d'utilisation de modèle de simulation, d'approche multicritère et de données de télédétection dans un cadre de système d'information géographique. L'évolution spatiotemporelle des paramètres de productivité du milieu a été évaluée par approche dynamique selon le modèle de Wu et al. (1996) qui modélise les interactions entre le climat, le milieu physique, le végétal et l'animal pour mieux quantifier la biomasse primaire. À ce modèle, quatre paramètres ont été intégrés par approche floue et multicritère afin de prendre en compte la dimension socioéconomique de la productivité pastorale (apport majeur de la recherche): la santé, l'éducation, l'agriculture et l'eau. La télédétection (imagerie SPOT) a permis de définir la production primaire à partir de laquelle les simulations ont été réalisées sur 10 années. Les résultats obtenus montrent une bonne corrélation entre biomasse primaire in situ et celle calculée pour les deux modèles, avec toutefois une meilleure efficacité du modèle modifié (4 fois plus) dans les zones de forte productivité où l'on note un taux de surexploitation agricole élevé. À cause de la variabilité spatiale de la production primaire in situ, les erreurs des résultats de simulation (8 à 11%) sont acceptables et montrent la pertinence de l'approche grâce à l'utilisation des SIG pour la spatialisation et l'intégration des différents paramètres des modèles. Les types de production secondaire préconisés (production de lait pendant 7 mois ou de viande pendant 6 mois) sont basés sur les besoins de l'UBT et le disponible fourrager qui est de qualité médiocre en saison sèche. Dans les deux cas de figure, un déficit fourrager est observé. Deux types de transhumance sont proposés afin d'assurer une production durable selon deux scénarios: exploitation rationnelle des unités pastorales selon un plan de rotation annuelle et mise en défens à moyen terme des zones dégradées pour une régénération. Les zones potentielles pour la transhumance ont été déterminées selon les limites acceptables des critères d'exploitation durable des milieux sahéliens définis par Kessler (1994) soit 0,2 UBT.ha[exposant]-1.

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Ouannes, Nesrine. "Évolution et adaptation de comportements de créatures artificielles dans un écosystème simulé." Thesis, Toulouse 1, 2015. http://www.theses.fr/2015TOU10043.

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Abstract:

De par son enjeu écologique important, l’étude des relations des êtres vivants entre eux et avec leur environnement est un défi majeur de la biologie. Le travail de cette thèse s’inscrit dans le cadre de la vie artificielle, domaine scientifique destiné à l’étude du vivant par la création de phénomènes naturels dans des systèmes de synthèse. Le but de la recherche consiste à exploiter la force des techniques évolutionnaires pour faire émerger des comportements de créatures artificielles, dans un écosystème simulé. La problématique générale de cette thèse est de faire évoluer des créatures artificielles capables de comportements de recherche de nourriture. Deux modèles ont été développés. Le premier modèle consiste à exploiter la chimiotaxie bactérienne afin de surmonter les problèmes de détection des ressources (ou de l’environnement). La voie chimiotactique d’une cellule est modulée par une approche hybride qui utilise un modèle algébrique de l’activité des groupes récepteurs, et des équations différentielles pour la dynamique d’adaptation, ainsi qu’un modèle métabolique qui convertit des nutriments en biomasse. Dans la partie résultats, nous avons développé une certaine analyse du mouvement obtenu à partir de certaines bactéries et leur influence sur le comportement de la population évoluée. Nous avons pu constater que le processus évolutif améliore la capacité des bactéries à réagir dans leur environnement ainsi que leurs capacités de croissance leur permettant de mieux survivre. Ensuite, nous avons étudié l’effet de la communication bactérienne qui permet de faire émerger de nouvelles espèces, et qui explore la dynamique des colonies. Certains des comportements obtenus ont été testés dans des environnements différents afin de montrer la façon dont la communication bactérienne peut affecter leurs comportements. Le deuxième modèle est celui du développement de créatures 3D physiquement simulées (les herbivores) qui se nourrissent des ressources disponibles dans leur milieu. Un algorithme génétique couplé à un réseau de neurones artificiel ont été mis en œuvre afin de garantir l’émergence de certains de ces comportements tels que la recherche de nutriments qui sont disposés à différents endroits dans l’écosystème artificiel. Le processus évolutif utilise les propriétés physiques des créatures virtuelles et une fonction multi-objective externe qui mèneront aux comportements espérés. L’expérience consistant à faire évoluer des créatures virtuelles possédant des capacités de locomotion montre que ces créatures virtuelles tentent d’obtenir au moins une des sources alimentaires disposées sur leurs trajectoires. Nos meilleures créatures sont capables d’atteindre plusieurs sources alimentaires durant le temps imparti à la simulation
Because of its important ecological underpinnings, the study of interactions between animals as well as with their environment is a research area of major interest in Biology. The work in this thesis belongs to the field of Artificial Life, a scientific discipline devoted to the study of natural phenomena inherent to living organisms by reproducing them by synthetic means. The aim of this research is to exploit the power of evolutionary techniques to cause behaviors of artificial creatures to emerge in a simulated ecosystem. The overarching problematic of this thesis is to evolve foraging behaviors in artificial creatures. Two models have been developed. The first model exploits bacterial chemotaxis to overcome the problem of resource detection (or features in its environment). The cell chemotactic pathway is modulated by a hybrid approach that reproduces the receptor group activity using an algebraic model, the adaptation dynamics using differential equations, as well as a metabolic model that converts nutrients into biomass In the results section, we developed a type of analysis of motion from selected bacteria and their influence on the evolved population’s behavior. We observed that the evolutionary process improves the bacteria’s capacity to react to their environment as well as their ability to grow, effectively improving their ability to survive. We then studied the effect of bacterial communication that allows new species to emerge, which exploits colony dynamics. Some of the obtained behaviors have been tested in separate environments in order to show how inter-bacterial communication can impact their behavior. The second model is about the development of 3D physically realistic creatures (herbivores) that feed on resources available in their environment. A genetic algorithm coupled to a neural network guarantees the emergence of a variety of behaviors such as the search of nutrients that are spread across the virtual ecosystem. The evolutionary process takes advantage of the virtual creature’s physical properties and an external multimodal fitness function to lead to the expected behaviors. Experiments designed to evolve virtual creatures displaying locomotion abilities shows that they attempt to reach at least one of the food sources placed on their trajectory. Our best creatures are able to reach multiple food sources within the imparted simulation time

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Gomez, Yannick. "Le rôle et les motivations d’une firme leader dans l’essai de transformation de son écosystème d’affaires en écosystème de l’innovation : le cas du site de Marcoule et du démantèlement nucléaire." Thesis, Lyon, 2017. http://www.theses.fr/2017LYSE3037.

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Abstract:

L’américain James MOORE a été le premier à évoquer le concept d’écosystème d’affaires dans un article de 1993 et dans un ouvrage paru en 1996. Plusieurs questions théoriques nous paraissent cependant devoir être complétées : - La place et le rôle d’une firme leader au sein d’un écosystème d’affaires - La question du cycle de vie d’un écosystème d’affaires - L’apparition du terme « écosystème de l’innovation » et son positionnement par rapport à ce concept d’écosystème d’affaires. Pour étudier ces différentes questions de recherche, nous avons observé durant une longue durée l’évolution de la plate-forme nucléaire de Marcoule. En 2013, le CEA Marcoule a lancé l’initiative du Pôle de Valorisation des Sites Industriels. L’objectif de la firme leader est donc de transformer son écosystème d’affaires en écosystème de l’innovation.Dans la première partie de l’étude de cas, nous avons étudié les motivations de la firme leader pour transformer son écosystème d’affaires en écosystème de l’innovation.Le démantèlement nucléaire conduit à sept grands paradoxes (humain, contractuel, déchets, sûreté, financier, territorial, technologique). Le cas Marcoule démontre que si les paradoxes sont majeurs, l’entreprise peut ne pas trouver en interne, par ses propres forces, les moyens d’y répondre. Certains paradoxes imposent des innovations d’exploration sur les plans conceptuels, managériaux et technologiques.La deuxième partie de l’étude de cas a été consacrée à l’étude du rôle du CEA Marcoule, leader de l’écosystème d’affaires territorial, pour transformer celui-ci.Dans ce cadre, nous avons pu observer et décrire trois actions concrètes d’enrôlement des acteurs, dans l’objectif de promouvoir une dynamique d’innovation :- La traduction marché de la montée en gamme de l’écosystème - La création d’un objet-frontière autour de la labellisation écosystèmique - L’ouverture de l’innovation Cette phase d’observation des actions d’enrôlement initiées par le leader de l’écosystème s’est déroulée durant la période de 2013 à mi 2017. Nous avons pu observer les débuts prometteurs de l’initiative PVSI et l’enrôlement réussi des acteurs autour des premiers projets lancés. L’observation du terrain de recherche Marcoule à travers le prisme de notre cadre conceptuel, la sociologie de la traduction, permet de mettre en évidence deux résultats importants.En premier lieu, l’étude du cas Marcoule nous permet de compléter l’approche théorique sur le cycle de vie d’un écosystème d’affaires, en particulier sur la notion d’intentionnalité. En effet, les changements de phase, de la naissance à l’expansion, de l’expansion à l’autorité et de l’autorité au déclin, ne résultent pas des actions prévisibles d’acteurs déterminés par la biologie, mais résultent des intentions stratégiques d’acteurs intelligents. Cette approche nous permet de proposer un nouvelle vision du cycle de vie d’un écosystème d’affaires : Naissance  Expansion  Transformation en écosystème de l’innovation  Déclin et MortEn second lieu, l’observation du cas Marcoule et de la firme leader de son écosystème d’affaires territorial permet de compléter les travaux académiques qui existent sur l’articulation des différentes formes d’ambidextrie. Le cas étudié permet ainsi de mettre en évidence l’existence d’une concurrence ambidextrielle pour l’allocation des ressources qui s’appuie sur l’instrumentalisation des paradoxes internes à l’organisation
The American James MOORE was the first to discuss the concept of business ecosystem in an article from 1993 and in a book published in 1996. Several theoretical questions seemingly need to be completed:- The place and role of a leading firm within a business ecosystem - The question of the life cycle of a business - The emergence of the term "ecosystem of innovation" and its positioning in relation to the concept of business ecosystem.In order to study those different research questions, we have observed for a long time the evolution of the nuclear platform of Marcoule. In 2013, the CEA Marcoule launched the Industrial Sites Valorisation Pole initiative, which aims to promote the upgrading of the ecosystem. The objective of the leading firm is therefore to transform its business ecosystem into an ecosystem of innovation. In the first part of the case study, we studied the motivations of the leading firm for transforming its business ecosystem into an innovation ecosystem.Nuclear dismantling leads to seven major paradoxes (human, contractual, waste, safety, financial, territorial, technological). The case of Marcoule demonstrates that if the paradoxes are major, the company may not find, internally, by its own forces, the means to respond. Some paradoxes impose innovations of exploration on the conceptual, managerial and technological levels. The second part of the case study was devoted to the study of the role of the CEA Marcoule, leader of the territorial business ecosystem in order to transform it. Then we observed and described three concrete enrolment actions of the actors,- The translation on the market of the ecosystem upgrading- The creation of a frontier object around ecosystem labelling- The opening of the innovation This phase of observation of the enrolment actions initiated by the leader of the ecosystem took place during the period from 2013 to mid 2017. We were able to observe the promising start of the PVIS initiative and the successful enrolment of the actors around the first projects that were launched. The observation of the Marcoule research field through the prism of our conceptual framework, the sociology of translation, makes it possible to highlight two important results.First, the study of the Marcoule case allows us to complete the theoretical approach on the life cycle of a business ecosystem, in particular on the notion of intentionality. Phase changes - from birth to expansion, from expansion to authority and from authority to decline - do not result from the foreseeable actions of actors determined by biology, but are the result of the strategic intentions of intelligent actors who continually calculate the gains and losses they can derive from their participation in the business ecosystem.We suggest replacing the traditional life cycle of a business ecosystem proposed by James MOORE (Birth  Expansion  Authority  Renewal  Decline and Death) by the following sequence (Birth  Expansion  Transformation in ecosystem of innovation  Decline and Death).Secondly, the observation of the Marcoule case and the leading firm of its territorial business ecosystem completes the academic work that exists on the articulation of different forms of ambidexterity. The CEA/Marcoule case shows us that all the implemented ambidextrous actions were legitimised by highlighting the problems needing to be solved, linked to the paradoxes of nuclear dismantling. purchasing needs to achieve a competition respecting all the rules of the public procurement

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Shihan, Ammar. "La réponse souterraine à une sécheresse accentuée dans un écosystème de garrigue méditerranéenne." Thesis, Montpellier, 2017. http://www.theses.fr/2017MONTT110/document.

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Abstract:

Les modèles disponibles prévoient que le changement climatique entrainera de plus longues périodes de sécheresse et/ou une diminution globale des précipitations en région méditerranéenne. Ces changements affecteront probablement la composition des communautés, la biodiversité et les processus écosystémiques. Cependant, les effets de la biodiversité, des changements de précipitations et de leurs interactions sur le fonctionnement des écosystèmes restent mal connus. Dans cette thèse, j’ai cherché à quantifier le rôle de la diversité des plantes dans la réponse d’un écosystème de garrigue méditerranéenne à une diminution de la disponibilité en eau, avec un intérêt particulier pour les processus souterrains, tels que le fonctionnement de la communauté microbienne du sol et les réponses fonctionnelles des racines.Afin d’étudier les conséquences d’une sécheresse sévère répétée sur la croissance végétale, et particulièrement racinaire, j’ai mis en place une expérience en rhizotrons, en conditions semi-contrôlées. Dans chaque rhizotron ont été plantées deux individus d’une même ou de différentes espèces des trois espèces dominantes de notre site d’étude (Quercus coccifera, Cistus albidus, Brachypodium retusum). Les sécheresses sévères répétées ont eu un effet négatif sur la survie des deux espèces ligneuses mais pas sur celle de l’herbacée. La compétition interspécifique a généralement augmenté la survie de C. albidus et B. retusum comparé à la compétition intraspécifique. A l’inverse, la compétition interspécifique a diminué la survie de Q. coccifera. De la même manière, les traits morphologiques racinaires ont été plus affectés par l’identité des espèces voisines que par le traitement de sécheresse. Les profils métaboliques des communautés microbiennes (CLPP) de sol associé aux racines n’ont pas été affectés par les traitements de sécheresse ni par l’identité des espèces végétales. Cependant, avec l’augmentation de la profondeur du sol, les CLPP ont augmentés mais avec une utilisation de ressources moins diversifiées. Ces résultats suggèrent que la composition d’espèces végétales de la garrigue méditerranéenne étudiée a un effet plus important sur la croissance, la variabilité intraspécifique des traits racinaires et la survie que les sécheresses sévères répétées.Dans le contexte d’un projet collaboratif (CLIMED), j’ai utilisé un gradient naturel de diversité d’espèces d’arbustes d’un écosystème de garrigue méditerranéenne ayant reçu un traitement d’exclusion de pluie partielle (-12% de précipitation). Cette expérience m’a permis d’étudier les réponses des profils métaboliques des communautés microbiennes du sol CLPP à une diminution des précipitations ainsi qu’à un changement de diversité des litières végétales décomposant au sol comme ressource clé pour les microorganismes hétérotrophiques du sol, pendant deux ans. Alors que l’exclusion de pluie n’a eu qu’un impact mineur sur la diversité des substrats métabolisés par les communautés microbiennes, la richesse spécifique de la litière a favorisé l’activité microbienne du sol en augmentant la diversité catabolique de la communauté microbienne du sol. Ces résultats suggèrent que les effets indirects du changement climatique sur la composition et la richesse des espèces végétales pourraient avoir des conséquences plus importantes pour le fonctionnement microbien du sol que la réduction des précipitations prévue dans l’écosystème de garrigue méditerranéenne étudié.Mes deux études, de terrain et en rhizotron, ont clairement montrées que l’identité et la diversité des espèces végétales peuvent être plus importantes pour le fonctionnement de ces garrigues méditerranéennes qu’une augmentation des sécheresses. Je conclus que les changements de composition et de diversité d’espèces végétales induits par le changement climatique peuvent avoir des conséquences plus importantes pour le fonctionnement des garrigues méditerranéennes que les effets directs d’une modification des précipitations
Longer drought periods and/or overall less precipitation are thought to be major consequences of ongoing climate change in the Mediterranean region. These changes in the water regime will likely affect community composition, biodiversity and ecosystem processes, but very little is known about how biodiversity and changes in precipitation interactively affect ecosystem functioning. In my PhD thesis, I aimed to quantify the role of plant diversity in the response of Mediterranean shrubland ecosystem to a decrease in water availability, with a particular interest in belowground processes, such as soil microbial community functioning and functional responses in plant roots.I used a rhizotron approach under partially controlled conditions to study plant growth responses to repetitive severe droughts, with a particular focus on root growth. Two individuals of the same species or in all possible combinations of the three dominating species at our field site (Quercus coccifera, Cistus albidus, Brachypodium retusum) were grown together in a rhizotron. Repetitive severe droughts had a negative effect on survival of the two woody species (Q. coccifera, C. albidus), but not of the grass B. retusum. Interspecific competition generally increased survival of C. albidus and B. retusum compared to monospecific competition. Conversely, interspecific competition decreased the survival of Q. coccifera. Likewise, I found that root morphological traits were mostly affected by the neighbor species identity rather than by severe drought. The community level physiological profiles (CLPPs) of root associated soil microbial communities did not differ between drought treatments and were also not affected by plant species identity. However, CLPPs changed towards more total microbial activities but less diverse resource use at increasing soil depth. Collectively these results suggest that plant species composition of the studied Mediterranean shrubland has a stronger effect on growth, intraspecific variability in root traits and survival than repetitive severe droughts.In the context of a larger collaborative project (CLIMED), I used a natural gradient of shrub species diversity in a Mediterranean shrubland ecosystem (garrigue) to which a permanent partial rain exclusion treatment (12% less precipitation) was added. This field experiment allowed me to study the responses of soil microbial community level physiological profiles (CLPPs) to reduced precipitation and to a change plant-produced leaf litter material decomposing on the ground as a key resource for heterotrophic soil microorganisms over two years. While rain exclusion had only a minor impact on the diversity of substrates metabolized by the microbial communities, litter species richness promoted global soil microbial activity by increased catabolic diversity of the soil microbial community. These results suggest that indirect climate change effects on plant species composition and richness might have more important consequences for soil microbial functioning than reduced precipitation in the studied Mediterranean shrubland ecosystem.Both, the field study of soil microbial functioning and the rhizotron study of plant growth and survival clearly showed that plant species identity and diversity may be more important for the functioning of these Mediterranean shrublands than increased drought. I conclude that climate change induced shifts in plant species composition and diversity may have more important consequences for the functioning of Mediterranean shrublands than the direct effects of altered precipitation

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De, Cesare Silvia. "Les bivalves filtreurs Astarte moerchi : modèle biologique pour l'étude des écosystème marins arctiques." Thesis, Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2016. http://www.theses.fr/2016MNHN0010/document.

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Abstract:

Dans le contexte des changements climatiques, les écosystèmes marins arctiques sont confrontés à des modifications environnementales accélérés, dont les conséquences sur les communautés biotiques sont encore débattues. La diminution du couvert de glace, l’augmentation de la turbidité et des apports d’eau douce vont affecter les producteurs primaires arctiques, avec des effets en cascade sur un processus-clé de ces écosystèmes : la relation trophique entre producteurs primaires et consommateurs benthiques (à laquelle se réfère généralement l’expression « couplage pélagos-benthos »). L’étude directe de ces interactions complexes n’est pas aisée dans ces milieux. Le modèle biologique des bivalves filtreurs peut permettre de contourner ces problèmes en remplissant une fonction d’ « intermédiaire » pour la compréhension de ces processus écologiques. Parmi les avantages de ce modèle d’étude, il y a tout d’abord le fait que ces organismes enregistrent au sein de leur coquille, dans les couches de biocarbonates, certaines dynamiques de leurs environnements. Les informations contenues dans ces « bioarchives » sont interprétées grâce aux méthodes de la sclérochronologie et de la sclérochimie et concernent une fenêtre temporelle correspondante à la vie des individus (de quelques années à plus que 500 ans). Un autre avantage de ce modèle biologique est que, s’agissant d’organismes qui sont des consommateurs primaires, l’étude de leur régime alimentaire peut apporter des éléments sur la relation trophique avec les producteurs primaires. Avec les méthodes de l’écologie trophique, en particulier les acides gras et les isotopes stables, l’étude des tissus permet d’obtenir des informations sur les sources assimilées à l’échelle de quelques semaines/mois. L’objectif de cette thèse est de tester le potentiel des bivalves Astarte moerchi (complexe borealis) comme modèle biologique pour l’étude des écosystèmes marins arctiques. Pour ce faire, une approche couplée est utilisée combinant l’analyse de la coquille par les méthodes de la sclérochronologie et de la sclérochimie (ratios élémentaires) et l’analyse des tissus par les méthodes de l’écologie trophique (acides gras, isotopes stable du carbone et de l’azote, isotopes du carbone sur acides gras individuels). Deux populations actuelles d’Astarte moerchi ont été étudiées dans deux fjords présentant des caractéristiques environnementales contrastées : le Young Sound au Nord-Est du Groenland (considéré comme fjord « arctique ») et le Kongsfjorden à l’Ouest de l’Archipel du Svalbard (considéré comme site « sub-arctique »). L’étude des tissus d’A. moerchi a permis de mettre en évidence la plasticité trophique de cette espèce, avec des différences dans les sources d’alimentation de deux populations liées aux dynamiques locales de production primaire. L’étude de la coquille d’A. moerchi a permis de : a) corroborer l’hypothèse de la formation annuelle des stries de croissance, confirmant la longévité de cette espèce pouvant atteindre 150 ans ; b) montrer l’intérêt potentiel de l’étude des ratios élémentaires dans les biocarbonates et en particulier du ratio Barium sur Calcium (Ba/Ca), qui pourrait être relié aux efflorescences phytoplanctoniques et c) montrer que les conditions environnementales contrastées du site arctique et sub-arctique se traduisent dans des patrons de croissance coquillère différents. Des perspectives pour l’utilisation ultérieure de ce modèle en écologie sont discutées. Pour conclure, une réflexion épistémologique est amorcée sur la spécificité du modèle biologique d’étude des bivalves filtreurs. En opposition à une notion plus classique d’ « organisme modèle » utilisée en biologie expérimentale, nous proposons que les bivalves filtreurs (à l’instar d’autres « bioarchives » comme les arbres, des coraux et des algues corallines) appartiennent à une catégorie de modèles biologiques qu’on pourrait qualifier « in situ » et qui semble être spécifique à la discipline écologique
In the context of climate change, Arctic marine ecosystems are affected by rapid environmental modifications, whose effects on biotic communities are still debated. The sea-ice decline and the increase in freshwater inputs and turbidity are likely to impact Arctic primary producers, with cascade effects on a key-process in those ecosystems: the trophic relationship between primary producers and benthic consumers (generally referred as “pelagic-benthic coupling”). The direct study of such complex interaction is not straightforward in the Arctic. The biological model of filter-feeding bivalves offers the possibility to get around these problems, allowing to study those ecological processes indirectly. Among the advantages of this model, there is first of all the fact that these organisms record in their shell, in the carbonate layers, some dynamics of their environments. The information recorded in such “bioarchives” are interpreted through the methods of sclerochronology and sclerochemistry and relate to a time window corresponding to the organism lifespan (from some years to more than 500 years). Given that these organisms are primary consumers, another advantage of this biological model is that the study of their diet can provide information about the trophic relationship with primary producers. With the methods of trophic ecology, especially fatty acids and stable isotopes, the study of the tissues allows the investigation of sources assimilated at a timescale of weeks/months.The main objective of this thesis is to test the potential of bivalves Astarte moerchi (borealis complex) as a biological model for the study of marine Arctic ecosystems. A coupled approach is used to combine shell analysis by the methods of sclerochronology and sclerochemistry (elemental ratios) and tissue analysis by the methods of trophic ecology (fatty acids, carbon and nitrogen stable isotopes, compound-specific carbon stable isotopes on individual fatty acids). Two living A. moerchi populations have been studied in two fjords presenting contrasted environmental conditions: Young Sound in North-East Greenland (considered as “Arctic” site) and Kongsfjorden in the West coast of the Svalbard Archipelago (considered as a “sub-Arctic” site). The study of the tissues of A. moerchi allowed to show the trophic plasticity of this species, with differences in food sources of the two populations linked to local primary production dynamics. The analysis of the shell of A. moerchi allowed to: a) corroborate the hypothesis of annual growth lines formation, thus confirming the longevity of this species that can attain 150 years; b) show the potential interest of the analysis of elemental ratios and particularly the ratio between Barium and Calcium (Ba/Ca), which could be relied to phytoplanktonic blooms and c) show that contrasted environmental conditions in the Arctic and sub-Arctic sites result in different shell growth patterns. Some perspectives for the further use of this model study in ecology are discussed. To conclude, an epistemological reflection is sketched about the specificity of the biological model study of filter-feeding bivalves. In contrast to the classical notion of “model organism” used in experimental biology, we suggest that filter-feeding bivalves (as well as other “bioarchives” like trees, corals and coralline algae) belong to a category of biological models that could be named “in situ” and seems specific to the ecological discipline

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Bruno, Valérie. "Etude expérimentale et modélisation du transfert du radium dans un écosystème aquatique simplifié." Montpellier 2, 1990. http://www.theses.fr/1990MON20274.

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Abstract:

Le suivi du transfert du radium est realise au sein d'un ecosysteme aquatique experimental simplifie constitue de quatre niveaux trophiques. L'eau et le sediment constituent les deux supports physiques a partir desquels les autres maillons de l'ecosysteme pourront se contaminer, scenedesmus obliquus represente le producteur primaire, daphnia magna, gammarux pulex et chironomus sp. , les consommateurs de premier ordre; cyprinius carpio le consommateur de deuxieme ordre et enfin salmo gairdneri le super-predateur de l'ecosysteme. Chaque transfert est traduit par une equation mathematique ajustee grace a une analyse theorique des resultats experimentaux et representant l'evolution de la concentration en radium dans le compartiment considere. A partir de ces resultats un modele mathematique permettant de simuler la contamination de l'ecosysteme par du radium est propose. Ce modele prend en compte differents parametres: le type de contamination (chronique ou aigue suite a un accident), le type d'ecosysteme concerne par la contamination (etang ou riviere), la saison pendant laquelle a lieu la contamination (chaude ou froide). Les resultats obtenus avec le modele sont en accord avec les valeurs de terrain sur le niveau de contamination des poissons vivants dans l'environnement aquatique des sites miniers; en particulier ils mettent en evidence la preponderance de la voie trophique dans la radiocontamination de ces poissons

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Arias-Gonzalez, Jesus Ernesto. "Fonctionnement trophique d'un écosystème récifal : Secteur de Tiahura, iîle de Moorea, Polynésie française." Paris, EPHE, 1993. http://www.theses.fr/1993EPHE3011.

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Abstract:

Deux modeles sur le fonctionnement trophique des systemes recifaux frangeant et barriere du secteur de tiahura, ile de moorea, polynesie francaise sont presentes. Les donnees de base des deux modeles ont ete obtenues exclusivement a partir de travaux publies. Les modeles sont analyses a l'aide du logicial ecopath ii (version 2,1) propose par christensen et pauly (1991). L'echange de flux de matiere et d'energie entre les respectivement 43 et 46 composants principaux du recif frangeant et du recif barriere est estime pour analyser la tendance du flux dans les systemes. Cette analyse nous donne des informations concernant les taux de transferts des flux. La production primaire des deux systemes est dominee par les producteurs primaires benthiques. Une fraction tres faible de cette production est consommee directement dans les deux systemes. Les reseaux trophiques des deux systemes sont regroupes dans une chaine lineaire des transferts de sept niveaux trophiques pour le recif frangeant et huit pour le recif barriere. Pour les deux recifs le recyclage et la longueur moyenne de transferts sont considerables. Deux processus resument ce comportement dans les deux systemes: la forte utilisation des detritus et la forte predation interne. Les modeles des deux recifs se ressemblent dans leur structure generale cependant ils different dans leur fonctionnement. L'analyse du fonctionnement trophique des deux systemes est completee par une etude experimentale sur le recyclage de la matiere secondaire et par la proposition d'une methodologie pour l'estimation du rendement potentiel de peches sur les recifs coralliens

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Amri, Elhassane. "La lagune de Khnifiss (littoral Atlantique du Sahara marocain) : analyse d'un écosystème original." Paris 7, 1998. http://www.theses.fr/1998PA077005.

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Abstract:

La lagune de khnifiss est situee sur le littoral atlantique marocain, a 70 km au nord de tarfaya et a 400 km au sud d'agadir. La morphologie actuelle du systeme sebkha mzeira-lagune de khnifiss-sebkha tazra a commence a se mettre en place a l'holocene et se poursuit jusqu'a l'actuel. Des carottes atteignant le substratum permettraient de preciser les etapes de l'histoire recente de ce systeme. Une etude sedimentologique (granulometrie, carbonates, argiles, mineraux lourds) et micropaleontologique (foraminiferes benthiques en particulier) a ete realisee sur la lagune de khnifiss. L'analyse granulometrique fait apparaitre un certain nombre de caracteres originaux : - la dynamique sedimentaire est a la fois sous l'influence directe du flot oceanique, ainsi que celle des apports dus au vent (alizee et chergui), - la mise en evidence de deux dynamiques de courant dans la lagune de khnifiss : un regulier et l'autre irregulier lie a la vegetation, - la similitude des corteges argileux des sediments de lagune avec celui des formations geologiques regionales et - une variation des carbonates selon les differentes secteurs environnementaux de la lagune. L'etude de la lagune de khnifiss a permis de distinguer differents secteurs environnementaux (chenal, slikke et schorre) de point de vue granulometrie, parametres hydrologiques et physico-chimiques. Les associations des foraminiferes benthiques caracterisant ces differents secteurs environnementaux. Les foraminiferes planctoniques confirment l'arrivee d'une masse d'eau tres importantes a chaque maree et une bonne communication de la lagune avec l'ocean. Ainsi, l'influence du domaine marin est actuellement preponderante dans l'evolution de la lagune de khnifiss (hydrologie, sedimentologie et microfaune). Ce qui en fait un domaine particulier et original dans les systemes lagunaires non seulement atlantiques marocaine. Il s'agit en fait d'un chenal de maree peu profond, limite par une falaise sur la rive nord et des cordons dunaires sur la rive sur et ayant une bonne communication avec la mer par une seul passe ouverte dans le cordon littoral. Sa forme est generalement allongee, orientee obliquement par rapport a la cote. Elle est subdivisee en quatre zones principales bien individualisees, depuis l'ocean (passe actuelle) jusqu'a la sebkha tazra en bordure ouest du bassin de tarfaya. Une premiere zone a, (=zone aval), orientee ene - wsw une deuxieme zone b, (=zone intermediaire), orientee nnw - sse une troisieme zone c, (=zone amont proximal) orientee ene - wsw une quatrieme zone d, (=zone amont distal), qui prolonge la zone c, mais tres differente, cependant, par la morphologie et le dynamisme.

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Quévrain, Elodie. "Etude chimique et microbiologique d'un écosystème bactérien : cas de l'éponge calcaire Leuconia johnstoni." Paris 6, 2010. http://www.theses.fr/2010PA066232.

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Abstract:

La diversité et le fonctionnement des associations bactériennes des éponges marines calcaires et leurs conséquences sur la production et le rôle de leurs métabolites secondaires au sein de l’écosystème éponge-bactéries sont à ce jour mal connus. La Calcisponge Leuconia johnstoni (Calcaronea, Baerida) des eaux tempérées de l’Atlantique Nord-Est, a été sélectionnée parce que son extrait brut dichlorométhylénique présentait une activité antimicrobienne dirigée contre la bactérie à Gram positif Staphylococcus aureus. Cette activité biologique a été confirmée à toutes les saisons dans une série temporelle de prélèvements sur le même site (Concarneau, France) sur 5 années consécutives. L’activité antimicrobienne a été localisée dans la fraction enrichie en bactéries d’une suspension d’éponge dissociée et a donc été attribuée à ses bactéries associées. Le compartiment microbien et sa contribution au profil chimique de l’éponge ont été étudiés en suivant deux approches : (1) l’une indépendante de la culture, via la caractérisation des variations du profil de l’éponge en réponse à la charge bactérienne de l’eau de mer, étudiée par comparaison de données environnementales ou expérimentales en aquarium. Cette approche a été complétée par l’analyse des acides gras marqueurs bactériens au sein de l’éponge, et de leurs fluctuations en fonction des saisons ; (2) l’autre dépendante de la culture, via l’isolement de bactéries cultivables et actives contre S. Aureus, afin d’identifier les métabolites antimicrobiens d’origine bactérienne potentiellement responsable de l’activité biologique de L. Johnstoni

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Hayet, Audrey. "Contribution de l'écologie à la caractérisation de sites contaminés : application à l'évaluation des risques pour les écosystèmes." Lille 2, 2010. http://www.theses.fr/2010LIL2S055.

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Selmi, Slaheddine. "Diversité et fonctionnement des peuplements d'oiseaux nicheurs des oasis tunisiennes." Paris 6, 2001. http://www.theses.fr/2001PA066224.

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Cary, Lise. "Mobilité des éléments selon les alternances aérobie-anaérobie dans un écosystème rizicole en Camargue." Phd thesis, Aix-Marseille 3, 2005. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00186875.

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Abstract:

Les variations des conditions d'oxydo-réduction dans les sols des zones humides, cultivés ou en friche, influent sur les mécanismes de mobilisation et d'immobilisation des éléments chimiques. La mobilité des éléments est étudiée dans des rizières de Camargue, dont les sols sont issus du comblement récent d'un paléochenal du Rhône. Les processus qui régissent les eaux de nappe sont déterminés à partir d'une acquisition en continu in situ des paramètres physico-chimiques. L'impact des alternances aérobie-anaérobie, liées au cycle annuel d'irrigation ou à des pluies orageuses, est analysé à haute fréquence dans les eaux de la nappe et de la lame de submersion. Dans la zone saturée du sol, en profondeur, ces perturbations engendrent précipitation et dissolution de phases minérales. Trente années d'irrigation ont suffi pour que la dynamique annuelle génère la création d'un horizon d'accumulation, contenant un front d'oxydo-réduction. Pendant une année sans irrigation, la dissolution des phases néoformées, carbonates et oxydes, de cet horizon, est amorcée. Dans l'horizon submergé de la rizière, silice, fer et plomb sont soumis à des fluctuations saisonnières, liées aux conditions réductrices et à l'activité du riz. Les teneurs en fer, manganèse et magnésium des eaux ne sont pas contrôlées par les phases minéralogiques connues. L'acidification à pH 4 par le riz pendant les quatorze jours de la phase de pré-reproduction fournit des éléments nutritifs à partir de la dissolution de phases solides. Les argiles mal cristallisées et les phytolithes sont altérés pour fournir du silicium à la plante.

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Mhamdi, Alaoui Asmae. "Environnement et paléoenvironnement d'un écosystème côtier : la lagune de Moulay Bousselham, côte atlantique marocaine." Thesis, Bordeaux 1, 2009. http://www.theses.fr/2009BOR13967.

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Abstract:

La lagune de Moulay Bouselham est un écosystème très fragile, menacé par l'intensification des activités humaines. Elle s’avère être un excellent exemple d’une zone tidale, caractérisée par la confluence des eaux marines et continentales, dont la productivité primaire est très élevée. Notre étude porte sur une caractérisation des environnements et paléo environnements de cette lagune, en se basant sur un grand nombre de données obtenues à partir d’analyses cartographiques et d’échantillons prélevés en surface ou carottés. Sur ce matériel, ont été réalisées des analyses morphologiques, sédimentologiques, géochimiques et micropaléontologiques permettant de caractériser, qualifier et quantifier les paramètres de fonctionnement de cet écosystème côtier et en particulier .une instabilité de la zone des passes, une dynamique sédimentaire intra lagunaire et une très grande importance du rôle joué par les facteurs anthropiques (concentrations relativement élevées de métaux lourds)
[Abstract not provided]

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De, Bellefeuille Sonia. "La sapinière boréale en voie de régénération, un écosystème inhospitalier pour le lièvre d'Amérique." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 1997. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk2/ftp04/mq25548.pdf.

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Domergue, Odile. "Diversité fonctionnelle des rhizobia associés à la féverole en agro-écosystème Sud de France." Thesis, Paris Sciences et Lettres (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017PSLEP067/document.

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Abstract:

L’aptitude des symbioses rhizobium-légumineuses à fixer l’azote atmosphérique, peut offrir d’importants services aux agro-écosystèmes. Cependant, associés à des contraintes biotiques (i) absence et/ou (ii) inefficacité symbiotique des rhizobiums du sol, des facteurs abiotiques (i) excès d’intrants azotés et/ou (ii) carences en phosphore (P) peuvent limiter la fixation symbiotique d’azote (FSN). Le Myo-inositol hexakisphosphate (phytate), principale composante de P organique (Po) du sol, représente une potentielle source de P disponible du sol, bio-disponible pour la plante, en lien à des activités phytases microbiennes, minéralisatrices du phytate. Afin de rechercher des rhizobiums, symbiontes de Vicia faba, efficaces dans l’utilisation du P (EUP) pour la FSN, nous avons réalisé un diagnostic nodulaire multilocalisé, en agro-écosystèmes sud de France. Le niveau d’efficacité d’utilisation de la symbiose rhizobienne (EUSR), en intra- et inter-placettes agricoles et en conditions hydroaéroponiques en serre, a été déterminé en corrélation des biomasses aériennes et nodulaires de plants de V. faba, à floraison. Parmi 59 isolats de V. faba, 26 sont aptes à minéraliser le phytate (Phy +), en milieu solide et six d'entre eux confirment une activité phytase, en culture liquide. L’intérêt d’une sélection de rhizobiums locaux aptes à une EUP pour FSN, nous a conduits à une avancée dans la sélection de marqueurs moléculaires phytases pour le criblage d’isolats rhizobiens Phy+. Mots ClésRhizobium, diversité, phytase, féverole, Vicia faba, nodulation, France-sud, agro-écosystème
The ability of rhizobium-legume symbiosis to fix atmospheric nitrogen can provide important services to agro-ecosystems. However, associated with biotic constraints (i) missing and/or (ii) phosphorus (P) deficiency, can limit symbiotic nitrogen fixation (SNF). Myo-inositol hexakisphosphate (phytate), the main soil organic P (Po) component, represents a potential source of soil P available for plant P bio-availability, connected with microbial phytate-mineralizing activities. In order to look for rhizobium-Vicia faba, in P use efficiency (PUE) for SNF ability, nodular diagnosis was performed from a multi-location survey in an agro-ecosystem in South France. The efficiency in use of rhizobial symbiosis (EURS) was deduced from V. faba nodule and shoot dry weight values at flowering state, and compared in intra- and inter agricultural fields and in greenhouse hydroaeroponic conditions. Among 59 V. faba isolates, 26 were able to mineralize phytate (Phy+) in solid medium and six of them confirmed phytase activity in liquid culture. Looking for local rhizobiums with PUE for SNF ability, led us to a forward step in molecular marker selection for Phy+ rhizobium isolate screening. KeywordsRhizobium, diversity, phytase, faba-bean, Vicia faba, nodulation, South-France, agro-ecosystem

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Ranchou-Peyruse, Anthony. "Etude de populations bactériennes anaérobies d'un écosystème lagunaire impliquées dans la dégradation des hydrocarbures." Pau, 2006. http://www.theses.fr/2006PAUU3023.

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Abstract:

Les milieux côtiers sont régulièrement exposés à des pollutions pétrolières ; une part importante des composés de ce pétrole se retrouve piégée dans les sédiments et tend à persister en conditions anoxiques. Parmi les communautés bactériennes colonisant ces milieux, certains microorganismes sont capables de dégrader les hydrocarbures pétroliers et participent ainsi à la biorémédiation de ces écosystèmes. L'objectif de ce travail était de comprendre le rôle et la coopération des différents groupes métaboliques bactériens anaérobies lors de la dégradation de molécules d'hydrocarbures modèles (alcanes, HAPs). Pour cela, des communautés bactériennes anaérobies dégradant des hydrocarbures ont été sélectionnées en conditions anoxiques et de lumière (cultures batch et continue) à partir de biofilms photosynthétiques se développant à la surface de sédiments lagunaires contaminées par des hydrocarbures pétroliers (Etang de Berre, France). L'association de techniques moléculaires (T-RFLP, clonage et séquençage) et culturales (enrichissement, isolement et caractérisation de souches bactériennes) a permis de déterminer la composition de ces communautés bactériennes ainsi que les interactions entre les différentes populations. La même composition en terme de groupes fonctionnels bactériens, à savoir les bactéries sulfato-réductrices, nitrate-réductrices, phototrophes anoxygéniques pourpres et fermentatives, a été systématiquement retrouvée quelle que soit la molécule d'hydrocarbure modèle. La culture continue a permis de sélectionner plus rapidement qu'en culture d'enrichissements les bactéries d'intérêt. Plusieurs souches bactériennes, appartenant à la communauté bactérienne capable de dégrader les hydrocarbures, ont été isolées ; leur étude a montré un lien entre la présence de bactéries dénitrifiantes proches de l'espèce Pseudomonas balearica et la dégradation de ce type de molécules. Des phénomènes de coopération entre les groupes fonctionnels, notamment entre les bactéries dénitrifiantes et les bactéries anoxygéniques pourpres, ont été mis en évidence tant du point de vue métabolique que de celui de la production d'émulsifiants. Une étude de diversité des bactéries phototrophes anoxygéniques pourpres directement réalisée à partir de sédiments chroniquement contaminés a montré la dominance de microorganismes proche du clade des Roseobacter (bactéries phototrophes anoxygéniques pourpres aérobies). Des membres de ce groupe des Roseobacter sont régulièrement retrouvés parmi les communautés bactériennes aérobies dégradant les hydrocarbures. Deux souches bactériennes proche de ce clade ont été isolées et se sont révélées capables de croître photosynthétiquement en conditions anoxiques
Coastal ecosystems are frequently exposed to oil contamination; a major part of compounds is trapped in sediments and tends to persist in anoxic conditions. Among the bacterial communities from these ecosystems, some microorganisms may degrade oil hydrocarbons and participate in the bioremediation of these ecosystems. The aim of this work was to increase our knowledge about the role and the cooperation of these different metabolic anaerobic bacterial groups during model hydrocarbons molecules degradation (alkanes, PAH). Anaerobic bacterial communities able to degrade hydrocarbons were selected in anoxic and light conditions (batch and continuous cultures) from a photosynthetic biofilm growing on a lagoon sediment surface contaminated with oil hydrocarbons (Etang de Berre, France). Both molecular (T-RFLP, cloning and sequencing) and cultural approaches (enrichment cultures, isolation and characterization) allowed determining bacterial communities diversity and the interactions. The identical composition in term of functional bacterial groups was systematically found such as sulfate-reducing, nitrate-reducing, purple anoxygenic phototrophic and fermentative bacteria, whatever the hydrocarbon molecule model used. The continuous culture allowed the select of bacteria implied in the hydrocarbon degradation faster than batch cultures. Several isolated bacterial strains from the community able to degrade hydrocarbons were isolated. The study of this bacterial community allowed associating the alkane degradation to denitrifying bacteria belonging to Pseudomonas balearica. Cooperation phenomena between the different bacterial functional groups, in particular between denitrifying bacteria and purple anoxygenic phototrophic bacteria, were highlighted. A diversity study of the purple phototrophic anoxygenic bacteria from sediments chronically contaminated showed the dominance of microorganisms closed to the Roseobacter clade (Purple phototrophic anoxygenic aerobic bacteria). This Roseobacter group is regularly found among the bacterial aerobic community able to degrade hydrocarbons. Two bacterial strains closed to this clade were isolated and were able to grow photosynthetically in anoxic conditions

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Seguin-Callois, Florence. "Effets comparés de deux herbicides l'atrazine et le nicosulfuron, sur un écosystème aquatique expérimental." Toulouse 3, 2001. http://www.theses.fr/2001TOU30176.

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Halouani, Ghassen. "Modélisations de la dynamique trophique d'un écosystème Méditerranéen exploité : le Golfe de Gabès (Tunisie)." Thesis, Brest, 2016. http://www.theses.fr/2016BRES0076/document.

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Abstract:

L’objectif de cette thèse est d’améliorer la compréhension du fonctionnement et de la structure trophique du golfe de Gabès en Tunisie. Afin de concilier exigences écologiques et exploitation des ressources marines, différents modèles écosystémiques ont été développés pour étudier sa dynamique trophique et contribuer à la réflexion sur la mise en place de plans de gestion. Un modèle trophique d’équilibre de masse « Ecospace » a été construit afin d’évaluer les conséquences écosystémiques de différentes mesures de gestion. Les résultats des simulations ont permis d’explorer les interactions entre la pêche côtière et la pêche au chalut benthique et d’identifier des zones où les mesures de gestion sont effectives. Un modèle end-to-end a également été appliqué pour expliciter la dynamique des espèces considérées, depuis le forçage climatique jusqu'à la pêche. Cette approche de modélisation consiste à forcer le modèle individu-centré « OSMOSE » par un modèle biogéochimique « Eco3MMed ». Ce modèle a permis d’établir une représentation cohérente du réseau trophique et de simuler des scénarios de gestion théoriques de mise en réserve. Le modèle end-to-end a également été utilisé pour étudier la sensibilité d’un ensemble d’indicateurs écologiques à la pression de pêche. Les résultats ont révélé que les indicateurs de taille sont les plus adaptés pour faire le suivi de l’impact de la pêche dans le golfe de Gabès. Au final, une approche comparative entre plusieurs écosystèmes méditerranéens a été mise en place avec le modèle EcoTroph pour comparer leurs structures trophiques et explorer les effets de plusieurs niveaux d’exploitation par l’analyse de leurs spectres trophiques
The objective of this thesis is to improve the understanding of trophic structure and functioning of the gulf of Gabes in Tunisia. In order to reconcile environmental concerns and exploitation of marine resources, different ecosystem models have been developed to study the ecosystem dynamics and contribute to the discussion on the implementation of management plans. A spatial and temporal dynamic model “Ecospace” was built to evaluate the ecosystem consequences of different management measures based on scenarios derived from the current regulation. The results of simulations allowed to investigate the interactions between coastal and benthic trawl fishing and to identify areas where management measures are effective. An end-to-end model has been applied to the gulf of Gabes ecosystem to represent the dynamics of 11 high trophic level species, from climate forcing to fishing.This modelling approach consists in forcing the individual-based model "OSMOSE" by a biogeochemical model "ECO3M-Med". This model allowed to establish a coherent representation of the food web and simulate theoretical management scenarios of spatial fishing closure. The end-to-end model has also been used to study the sensitivity of a set of ecological indicators to fishing pressure. The simulation of different levels of fishing mortality showed that size indicators were the most relevant to monitor the impact of fishing in the gulf of Gabes. Finally, a comparative approach between several Mediterranean ecosystems was applied using the EcoTroph model to compare their trophic structures and explore the effects of different levels of fishing pressure through the analysis of their trophic spectra

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Nsanganwimana, Florien. "Influence du phytomanagement sur un écosystème contaminé par des métaux : application à Miscanthus × giganteus." Thesis, Lille 1, 2014. http://www.theses.fr/2014LIL10175/document.

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Abstract:

La phytoremédiation est présentée comme une option pour gérer des sols dégradés. Les potentialités de Miscanthus × giganteus ont été évaluées, dans des conditions ex situ et in situ, avec pour objectif de produire une biomasse sur des sols agricoles fortement contaminés par Cd, Pb et Zn. Il a été dressé un bilan sur le comportement de la plante face à un gradient de contamination des sols, en intégrant les variations saisonnières et différentes pratiques agronomiques (choix du cultivar, densité de plantation, amendement biologique, fertilisation azotée). Il a aussi été étudié l’influence du miscanthus sur la mobilité des métaux dans les sols. Les résultats ont montré que la contamination des sols ne perturbe pas la croissance de M. × giganteus et le rendement de la biomasse récoltée. Le cadmium, Pb et Zn sont principalement accumulés dans les racines et d’une façon générale, M. × giganteus réduit leur transfert vers les organes aériens. Cette plante présente un bon potentiel pour la phytostabilisation des métaux et d’une façon plus globale, pour le phytomanagement. Prises individuellement, les pratiques agronomiques n’ont pas d’effet sur le comportement de la plante. En revanche, la fertilisation azotée d’une part, et l’interaction entre le cultivar et l’ajout de l’inoculum endomycorhizien d’autre part, favorise légèrement l’accumulation de Cd et Zn dans les organes aériens des cultivars étudiés. Compte tenu du caractère pérenne de la plante, il conviendrait de valider ces résultats sur le long terme, d’étudier les effets du stress métallique sur la santé de la plante et d’évaluer le devenir des polluants en lien avec l’accumulation des matières organiques dans le sol
Phytoremediation is considered as an option for management of degraded soils. The potential of Miscanthus × giganteus were assessed in ex situ and in situ conditions, with the aim of producing biomass on agricultural soils heavily contaminated by Cd, Pb and Zn. The study mainly focused on the behavior of M. × giganteus growing on soils presenting a contamination gradient, and included seasonal variations and different agronomic practices, i.e., choice of the cultivar, planting density, biological soil amendment and nitrogen fertilization. The influence of the plant on metal mobility in soils was also assessed. The results show that soil contamination does not affect M. × giganteus growth and shoot yields. Cadmium, Pb and Zn are mainly accumulated in roots and in general M. × giganteus reduces their transfer to the aboveground organs. This plant presents therefore a great potential for metal phytostabilisation, and in a more comprehensive way, for phytomanagement. Taken individually, agronomic practices did not affect the plant behavior. However, nitrogen fertilization on one hand, and the interaction between the cultivar ad the endomycorrhizal inoculum on the other hand, increase the Cd and Zn accumulation in miscanthus organs. Given the perennial nature of the plant, long-term studies are needed to validate the present results, to assess the effects of metal-induced stress on the plant health as well as the fate of contaminants in relation to the accumulation of soil organic matter in miscanthus plantations

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Nsanganwimana, Florien. "Influence du phytomanagement sur un écosystème contaminé par des métaux : application à Miscanthus × giganteus." Electronic Thesis or Diss., Lille 1, 2014. http://www.theses.fr/2014LIL10175.

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Abstract:

La phytoremédiation est présentée comme une option pour gérer des sols dégradés. Les potentialités de Miscanthus × giganteus ont été évaluées, dans des conditions ex situ et in situ, avec pour objectif de produire une biomasse sur des sols agricoles fortement contaminés par Cd, Pb et Zn. Il a été dressé un bilan sur le comportement de la plante face à un gradient de contamination des sols, en intégrant les variations saisonnières et différentes pratiques agronomiques (choix du cultivar, densité de plantation, amendement biologique, fertilisation azotée). Il a aussi été étudié l’influence du miscanthus sur la mobilité des métaux dans les sols. Les résultats ont montré que la contamination des sols ne perturbe pas la croissance de M. × giganteus et le rendement de la biomasse récoltée. Le cadmium, Pb et Zn sont principalement accumulés dans les racines et d’une façon générale, M. × giganteus réduit leur transfert vers les organes aériens. Cette plante présente un bon potentiel pour la phytostabilisation des métaux et d’une façon plus globale, pour le phytomanagement. Prises individuellement, les pratiques agronomiques n’ont pas d’effet sur le comportement de la plante. En revanche, la fertilisation azotée d’une part, et l’interaction entre le cultivar et l’ajout de l’inoculum endomycorhizien d’autre part, favorise légèrement l’accumulation de Cd et Zn dans les organes aériens des cultivars étudiés. Compte tenu du caractère pérenne de la plante, il conviendrait de valider ces résultats sur le long terme, d’étudier les effets du stress métallique sur la santé de la plante et d’évaluer le devenir des polluants en lien avec l’accumulation des matières organiques dans le sol
Phytoremediation is considered as an option for management of degraded soils. The potential of Miscanthus × giganteus were assessed in ex situ and in situ conditions, with the aim of producing biomass on agricultural soils heavily contaminated by Cd, Pb and Zn. The study mainly focused on the behavior of M. × giganteus growing on soils presenting a contamination gradient, and included seasonal variations and different agronomic practices, i.e., choice of the cultivar, planting density, biological soil amendment and nitrogen fertilization. The influence of the plant on metal mobility in soils was also assessed. The results show that soil contamination does not affect M. × giganteus growth and shoot yields. Cadmium, Pb and Zn are mainly accumulated in roots and in general M. × giganteus reduces their transfer to the aboveground organs. This plant presents therefore a great potential for metal phytostabilisation, and in a more comprehensive way, for phytomanagement. Taken individually, agronomic practices did not affect the plant behavior. However, nitrogen fertilization on one hand, and the interaction between the cultivar ad the endomycorrhizal inoculum on the other hand, increase the Cd and Zn accumulation in miscanthus organs. Given the perennial nature of the plant, long-term studies are needed to validate the present results, to assess the effects of metal-induced stress on the plant health as well as the fate of contaminants in relation to the accumulation of soil organic matter in miscanthus plantations

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Andrianjakarivony, Felana Harilanto. "Caractérisation du virome d’un écosystème tropical fortement anthropisé : la lagune Ebrié en Côte d’Ivoire." Electronic Thesis or Diss., Aix-Marseille, 2022. http://www.theses.fr/2022AIXM0579.

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Abstract:

Dans cette thèse, nous avons choisi d’étudier la composante virale d’un site lagunaire exposé aux rejets domestiques, agricoles et industriels : la Lagune Ebrié bordée par la ville d’Abidjan, en Côte d’Ivoire. Les objectifs de cette thèse visaient (1) à caractériser les viromes benthiqes et planctoniques dans 7 sites de cette lagune présentant des niveaux d'eutrophisation contrastés, en distinguant les viromes ADN et ARN, et (2) à examiner les stratégies de reproduction virale. Pour cela, une approche métagénomique shotgun combinée à des analyses bioinformatiques a été utilisée. Nous avons montré que la composition des viromes ADN était spécifique à chaque compartiment (plancton/benthos). À l’inverse, la composition des viromes ARN était plus influencée par le niveau d’eutrophisation du milieu. Les viromes des sites les plus eutrophisés présentaient des séquences associées aux pathogènes humains d'origine fécale et aux indicateurs de pollution fécale humaine. L’étude des interactions entre les virus et leurs hôtes bactériens, a permis de montrer que cette lagune tropicale était plus propice aux stratégies lytiques de reproduction virale dans les stations les plus eutrophes. Enfin, en utilisant une approche basée sur la prédiction théorique des hôtes bactériens, nous avons pu montrer la fiabilité de l’approche choisie générant des profils taxonomiques bactériens comparables à ceux obtenus par l’approche classique basée sur le métabarcoding ciblant le gène ARN 16S. Ce travail de thèse a donc permis d’apporter un jeu de données unique, mais aussi de nouvelles connaissances fondamentales sur la composition du virome de sites aquatiques soumis à de forts niveaux de pollution.u
In this thesis, we chose to study the viral community in a tropical lagoon exposed to domestic, agricultural and industrial discharge : the Ébrié Lagoon bordering the city of Abidjan in the Ivory Coast. The objectives of this study were (1) to characterize the benthic and planktonic viromes in seven sites in the lagoon with contrasting levels of eutrophication, distinguishing between DNA and RNA viromes, and (2) to examine the reproductive strategies of viruses. To this end, we used shotgun metagenomic sequencing combined with bioinformatics analysis. The key findings showed that the composition of DNA viromes was specific to each compartment (plankton/benthos). Conversely, the composition of RNA viromes was more influenced by the level of eutrophication than by the compartment. Viromes of the most eutrophicated sites contained sequences associated with human pathogens of faecal origin and with indicators of human faecal pollution. The study of interactions between the viruses and their bacterial hosts showed that the most eutrophic sites in this tropical lagoon were more conducive to lytic viral reproductive strategies, while lysogeny was more common in the most oligotrophic sites. Lastly, the results of an approach based on the theoretical prediction of bacterial hosts via the Prokaryotic virus Host Predictor indicated the reliability of this tool in generating taxonomic profiles of bacterial hosts comparable to those obtained by the classical approach based on metabarcoding targeting the 16S rRNA gene. This study provided not only a unique dataset, but new fundamental knowledge on the composition of the virome of aquatic sites subjected to high levels of pollution

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Perruche, Coralie. "Influence de la dynamique mésoéchelle et submésoéchelle sur la compétition au sein d'un écosystème planctonique." Phd thesis, Université de Bretagne occidentale - Brest, 2009. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00508647.

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Abstract:

L'océan est un milieu fortement turbulent caractérisé notamment par de nombreuses structures tourbillonnaires très énergétiques interagissant entre elles. Dans les couches de surface, les observations ainsi que les modèles montrent que cette dynamique mésoéchelle et submésoéchelle combinée à la dynamique de la couche mélangée, contraint fortement la distribution des espèces phytoplanctoniques. L'objet de cette thèse est de réaliser une étude de processus en modélisation numérique afin de rationaliser l'effet de la turbulence méso- et subméso-échelle d'une part et du mélange vertical d'autre part, sur la diversité phytoplanctonique. L'étude analytique de la dynamique intrinsèque d'un modèle d'écosystème simple avec deux espèces de phytoplancton à l'aide de la théorie des systèmes dynamiques a tout d'abord permis de déterminer les équilibres non-linéaires ainsi que leur stabilité en fonction des paramètres. Nous avons montré ensuite que la diffusion verticale turbulente est un moteur de la coexistence des espèces phytoplanctoniques. La sensibilité de ces résultats a été testée à la fois vis à vis de la profondeur de la couche mélangée, de l'intensité du mélange et du nombre d'espèces phytoplanctoniques. Enfin, nous avons montré que la turbulence quasi-géostrophique de surface permet également la coexistence de deux espèces phytoplanctoniques sur une ressource limitante à l'équilibre statistique. De plus, ce type de turbulence organise différemment les espèces selon les structures : les structures filamentaires sont favorables au grand phytoplancton alors que les tourbillons apparaissent comme des niches écologiques pour le petit phytoplancton. Cette étude révèle que dans tous les cas, les injections verticales de nutriments sont un facteur important induisant cette différence de distribution entre les espèces.

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Marchais, Violette. "Relations trophiques entre producteurs primaires et quatre consommateurs primaires benthiques dans un écosystème côtier tempéré." Thesis, Brest, 2014. http://www.theses.fr/2014BRES0111/document.

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Abstract:

Dans les zones euphotiques des écosystèmes côtiers, les producteurs primaires se développent à la fois dans l’espace pélagique (colonne d’eau) et benthique (sur ou près du fond). Dans ces écosystèmes, le couplage bentho-pélagique prend une place non négligeable qu’il convient d’étudier. Les consommateurs primaires benthiques en sont des acteurs à travers leur activité alimentaire. La relation trophique entre les différents producteurs primaires et les consommateurs primaires benthiques reste toutefois mal élucidée. Pour apporter des éléments d’informations, cette thèse s’est focalisée dans un premier temps sur la dynamique spatio-temporelle des producteurs primaires au sein de la matière organique particulaire en suspension (MOPS), notamment au niveau de l’interface eau-sédiment. Cette étude a permis de montrer une forte variation saisonnière de ce peuplement algal à toutes les profondeurs, mais également une importante contribution relative des diatomées benthiques dans la MOPS près du fond en hiver. Le second axe de recherche s’est concentré sur la relation trophique entre des consommateurs primaires benthiques (coquille Saint-Jacques, pétoncle noir, moule et ormeau) et les producteurs primaires présents dans la MOPS. L’analyse des isotopes stables dans les tissus mous des pétoncles noirs et des moules a indiqué une prédominance du phytoplancton assimilé et une potentielle contribution du microphytobenthos dans leur régime alimentaire (plus importante pour la moule), notamment en période hivernale et près du fond. Cependant, ces études ont mis en lumière l’effet du métabolisme sur les valeurs isotopiques dans les tissus mous. Un aspect novateur de cette thèse a été d’utiliser les exosquelettes des coquilles Saint-Jacques et des ormeaux pour caractériser leur régime alimentaire dans le milieu naturel, afin de s’affranchir des problèmes liés à l’utilisation des isotopes stables dans les tissus mous. Des études en conditions contrôlées ont validé l’intégration des sources d’alimentation à travers le carbone métabolique dans les carbonates de la coquille Saint-Jacques et la couleur de la coquille pour l’ormeau. Des études complémentaires doivent toutefois être menées. Enfin, une dernière étude s’est focalisée sur la capacité de la coquille Saint-Jacques à mettre en suspension les particules benthiques par leurs mouvements de valves
In coastal euphotic areas, primary producers grow both in the pelagic (water column) and in the benthic zone (in or near the sediment). In these ecosystems, benthic-pelagic coupling is an important process which must be well described. Benthic primary consumers modify this coupling through their diet. Trophic relationships between primary producers and benthic primary consumers are not thoroughly understood. To gain additional information, this thesis was focused on the spatial and temporal dynamic of primary producers in suspended particulate organic matter (SPOM), especially at water-sediment interface. This study highlighted a seasonal variation of microalgal populations at all depths, and a relative dominance of benthic diatoms in SPOM near sediment and in winter. The second objective of the thesis was focused on the trophic relationships between benthic primary consumers (great scallop, black scallop, mussel and ormer) and primary producers in SPOM. Stable isotope analysis in soft tissues of black scallops and mussels showed a predominance of assimilated phytoplankton and the potential contribution of microphytobenthos in their diet (more important for mussel), especially in winter and near the sediment. However, this study highlighted the impact of metabolism on stable isotopic values of soft tissues. An innovative aspect of this thesis was the use of exoskeleton of great scallops and ormers to characterize their diet in natural environment and thus overcome problems related to the utilization of stable isotopes in soft tissues. Experiments in controlled conditions validated food sources integration through metabolic carbon in carbonates of great scallops and shell color for ormer but complementary studies are required on mollusk shell utilization. The last part of this thesis was focused on the ability of great scallops to achieve resuspension of benthic particles by valve movements

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Bonnet, Marie-Paule. "Fonctionnement d'un écosystème lacustre : modélisation des successions planctoniques de la retenue de Villerest (Loire, France)." Paris, ENMP, 1995. http://www.theses.fr/1995ENMP0001.

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Alexis, Marie. "Effet du feu sur le stockage de carbone dans un écosystème subtropical : dynamique des charbons." Paris 6, 2006. http://www.theses.fr/2006PA066332.

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Abstract:

L’impact des feux de biomasse sur le stockage de C dans les écosystèmes terrestres reste incertain. Nous mettons en relation la production et l’évolution des stocks de carbone pyrogénique dans un maquis à chênes subtropical. Au cours d’un événement de feu, les pertes de carbone de l’écosystème sont estimées à 2. 6kgCm-2 et la production de charbons à 140gCm-2. D’après des analyses élémentaires et isotopiques, RMN du 13C à l’état solide et calorimétrie, les charbons sont plus riches en C et moins concentrés en 13C que la MO initiale. L’oxydation chimique indique que la production de black carbon (BC) est de 10 à 30gm-2. A l’échelle du siècle, le taux de stabilisation du carbone par le feu est inférieur au taux de stabilisation par les processus d’humification classiques. La première étude in situ de la dynamique du BC dans les sols tend à confirmer qu’une part au moins du BC a un temps de résidence supérieur à 100 ans et constitue un compartiment de C stable dans les sols.

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Pourchez, Arnaud. "Impact de la diapause sur la dynamique de communautés planctoniques dans un écosystème Arctique numérique." Master's thesis, Université Laval, 2018. http://hdl.handle.net/20.500.11794/29871.

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Abstract:

L’Océan Arctique est l’un des environnements où l’on retrouve les plus fortes variations saisonnières au monde. L’un des outils utilisés pour représenter et comprendre de tels environnements variables sont les modèles biogéochimiques. Néanmoins, ces modèles n’ont qu’une représentation sommaire des espèces métazoaires, telles que les copépodes, qui représentent pourtant jusqu’à 80% de la biomasse totale du zooplancton arctique. De plus, les espèces de copépodes composant la majorité de cette biomasse ont développé un mécanisme leur permettant de bénéficier au maximum de la production primaire concentrée l’été en Arctique, la diapause. Ce mécanisme a été documenté comme ayant un impact direct sur la phénologie des autres espèces de la communauté planctonique, ainsi que sur la biogéochimie de leur environnement. Ce projet de recherche vise à combler le manque de représentation de ce trait en l’incluant au sein d’un modèle biogéochimique dans le contexte particulier de l’Arctique représenté par des données environnementales prélevées dans le Gulf d’Amundsen. Nos résultats démontrent que sans le trait de la diapause, le modèle ne permettait pas la survie d’espèces de métazoaires. Grâce à l’utilisation de relations allométriques ainsi qu’au mécanisme de sélection naturel présent dans le modèle utilisé, nous observons qu’une seule espèce de métazoaire peut présenter une dynamique de diapause comparable à celles retrouvées dans la zone d’étude. Nous discutons ensuite de l’importance que ce trait peut avoir sur la phénologie des espèces planctoniques en raison de cascades impliquant des chaines trophiques courtes. Finalement, l’ajout d’une migration saisonnière dans le modèle actuel permettra à de futurs projets de recherches d’étudier les deux mécanismes biogoéchimiques liés à la diapause que sont la pompe à lipide ainsi que le « court-circuit lipidique » (lipid shunt).

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Khedhiri, Slim. "L' écosystème de la sebkha El Kelbia (Tunisie centre orientale) : Dynamique sédimentaire et évolution géochimique." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2006. http://www.theses.fr/2006STR1GE07.

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Abstract:

La sebkha El Kelbia est un lac au centre de la Tunisie décrété réserve naturelle par l'Etat Tunisien depuis 1993. Elle a une grande importance nationale et internationale en terme de biodiversité puisque c’est un site remarquable d'hivernage pour différentes espèces d'oiseaux. Cet écosystème est naturel et peu anthropisé mais il risque d’être menacé du fait de la proximité d’une ville récemment industrialisée. Peu de travaux scientifiques se sont intéressés à cet écosystème, c'est pourquoi ce travail a été réalisé afin d’étudier la granulométrie, la minéralogie et la géochimie des sédiments ainsi que la géochimie de ses eaux mais aussi pour faire l’état des lieux en terme de contamination et d’évaluer l'impact des aménagements récents. Le présent travail s’intéresse au calcul des facteurs d’enrichissement qui permettent d’évaluer le degré de contamination des sédiments. Par ailleurs, une méthode d’extraction séquentielle a permit de préciser par rapport à la minéralogie, les sites de piégeage des métaux lourds présents. Des résultats d’analyses de métaux lourds sont présentés pour les sédiments et les eaux. Un accroissement des teneurs en cuivre dans l’extrême Nord de la sebkha, touchant aussi bien les sédiments de surface que ceux des carottes, qui serait une éventuelle source de contamination si les conditions physico-chimique (pH et Eh) du milieu changent; le cuivre est associé aux carbonates il est facilement relarguable quant le milieu devient acide. L’enrichissement en nickel et en chrome en surface et en profondeur au Nord-Est de la sebkha ne présente pas un risque potentiel de relarguage du fait que ses métaux sont piégés dans une phase minéralogique résistante (argiles). Selon les normes tunisiennes et internationales, on estime que les eaux de la sebkha ne présentent pas des concentrations anomaliques en éléments nutritifs, majeurs et métaux lourds, mais plutôt des teneurs naturelles qui seraient liées à la nature des roches lessivées
The sebkha El Kelbia is a lagoon in the middle part of Tunisia, considered as a natural reserve by the Tunisian State since 1993. It has a great national and international importance by it’s biodiversity. It is a remarkable site for various species of birds. This ecosystem is natural and slightly influenced by anthropogenic activities, but it is likely to be threatened because of proximity of a recently industrialized area. Few scientific studies were interested in this ecosystem, this is why this work was carried out in order to study granulometry, mineralogy and geochemistry of sediments and water but also to make the inventory of fixtures and to evaluate the impact of recent installations. In this work enrichment factors were calculated the sediments of the sebkha in order to evaluate the contamination gradient. In addition, a method of sequential extraction make it possible to specify, compared to mineralogy, the trapping sites of available heavy metals. Results of heavy metal analyses are presented for both sediment and water. An increase of copper concentration was detected in the north part of the sebkha, concerning both the surface and dipper sediments. Copper would be a possible source of contamination if the physicochemical conditions (pH and Eh) were changed; copper is associated to carbonates it is easily relarguable at acid pH. Nickel and chromium enrichment in both surface and depth sediment of the North-Eastern part of the sebkha does not present a potential risk of contamination according to the residual fraction which is resistant phase (clay)According to Tunisian and international standards', we estimate that water of the sebkha does not present anomalic concentrations in nutrient, major elements and heavy metals, but rather of the natural contents which would be related to the geologic field

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Renard, Hugo. "Modélisation à pas de temps horaire des transferts de tritium au sein d'un écosystème prairial." Thesis, Aix-Marseille, 2017. http://www.theses.fr/2017AIXM0639.

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Abstract:

Lors des rejets accidentels ou chroniques des installations nucléaires vers l'environnement, il est important de prédire le devenir des radionucléides dans l'environnement, en particulier à l'échelle de la prairie qui constitue un des maillons de la chaîne alimentaire. L'IRSN et EDF développent une plateforme de simulation pour le transfert de radionucléides dans l'environnement appelé SYMBIOSE, afin d'estimer la dose reçue par les humains. Le tritium est un exemple d'un radionucléide rejeté dans l'environnement par les installations nucléaires, dont le comportement est particulièrement difficile à prédire en raison de sa grande mobilité et de son affinité biologique selon la forme chimique considérée. Le modèle TOCATTA-khi, mis en œuvre dans la plateforme SYMBIOSE, s’intéresse entre autres aux transferts de tritium au sein d’un écosystème prairial. L'objectif principal de la thèse est d'améliorer et d'évaluer le modèle existant de TOCATTA-khi à partir d'expériences réalisées in situ à la plateforme technique IRSN La Hague et en laboratoire, en étudiant et quantifiant les transferts de tritium au sein d'un écosystème prairial, ainsi que les incertitudes rémanentes associées
In the context of accidental or chronic releases from nuclear installations to the environment, it is important to predict the future of radionuclides, particularly at the grassland scale, the first link in the human food chain. The IRSN and EDF are developing a simulation platform for the transfer of radionuclides in the environment, called SYMBIOSE, in order to estimate the dose received by humans. Tritium is an example of a radionuclide released into the environment by nuclear installations, whose behavior is particularly critical to predict because of its high mobility and biological affinity depending on the chemical form considered. The TOCATTA-khi model, implemented in the SYMBIOSE platform, is dedicated, among other things, to the transfer of tritium within a grassland ecosystem. The main objective of this thesis is to improve and evaluate the existing TOCATTA-khi model from experiments carried out in situ at the technical platform IRSN La Hague and in laboratory, by studying and quantifying the transfers of tritium within a grassland ecosystem, as well as the associated residual uncertainties

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Dissertations / Theses on the topic 'Écosystème'

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