Dissertations / Theses: 'Effet antiviral'

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Isorce, Nathalie. "Du criblage de l’activité antivirale de divers interférons et cytokines pro-inflammatoires contre HBV, vers la description du mécanisme antiviral de l’interleukine-1β dépendant de NF-κB." Thesis, Lyon 1, 2015. http://www.theses.fr/2015LYO10130.

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Abstract:

Dans les patients infectés par HBV, les thérapies avec les analogues de nucléos(t)ides (NAs) ou l'interféron α (IFNα) restent inefficaces pour éradiquer l'infection, à cause d'une forme persistante d'HBV, appelée l'ADN circulaire covalent clos (ADNccc), organisé comme un mini-chromosome. Notre but a été de revisiter l'activité anti-HBV d'un panel de cytokines in vitro en utilisant des hépatocytes non transformés, afin d'identifier de nouvelles options immunothérapeutiques. Parmi toutes les molécules testées, l'IFNβ, l'IFNγ, les IFNλ, le TNFα, l'IL-6, l'IL-1β et le ténofovir (ce dernier utilisé comme contrôle positif) ont montré un effet suppresseur sur la réplication d'HBV aussi fort et parfois plus fort que l'IFNα. La cytokine ayant l'effet le plus élevé sur l'ADN total d'HBV (EC50 ≈ 25 pg/mL), sans cytotoxicité, était l'interleukine-1β (IL-1β), qui est naturellement produite par les cellules de Kupffer (KC), les macrophages du foie. De façon importante, les ARNs totaux d'HBV et l'antigène sécrété HBeAg, mais pas HBsAg, ni l'ADNccc, sont fortement diminués par l'IL-1β. Nous avons donc émis l'hypothèse selon laquelle des promoteurs viraux spécifiques su l'ADNccc pourraient être inhibés, même si l'ADNccc n'est pas dégradé. Ensuite, nous avons étudié le mécanisme de l'activité antivirale de l'IL-1β. Nous avons montré que tous les promoteurs d'HBV sembleraient être inhibés par l'IL-1β. En parallèle, nous avons vérifié que l'IL-1β pouvait activer le promoteur de NF-κB, dont la fonction de transcription a été confirmée. Grâce à cette étude, l'IL-1β a été montré comme ayant un effet antiviral très efficace contre HBV in vitro, par l'intermédiaire de la fixation de NF-κB sur l'ADNccc
In HBV-infected patients, therapies with nucleos(t)ide analogues (NAs) or interferon α (IFNα) remain ineffective in eradicating the infection, because of a persistent form of HBV DNA, namely the covalently closed circular DNA (cccDNA), which is organized as a minichromosome. Our aim was to revisit the anti-HBV activity of a panel of IFNs and pro-inflammatory cytokines in vitro using nontransformed cultured hepatocytes of HBV infection, to identify new immunotherapeutic options. Amongst all molecules tested, IFNβ, IFNγ, IFNλ, TNFα, IL-6, IL-1β and tenofovir showed a suppressive effect on HBV replication at least as strong as, but sometimes stronger than IFNα. The cytokine showing the highest effect on intracellular total HBV DNA without any cytotoxicity, was interleukin-1β (IL-1β), which is naturally produced by Kupffer cells (KC), representing the macrophages of the liver. Importantly, total HBV RNAs and secreted HBeAg, but nor HBsAg, neither cccDNA, were strongly decreased. Thus, we hypothesized that even if cccDNA was not degraded, specific viral promoters on cccDNA could be silenced. Then, we investigated the mechanism of IL-1β antiviral activity. We have shown that all HBV promoters were early inhibited by IL-1β. In the meantime, we have verified that IL-1β can induce nuclear Translocation and expression of NF-κB. We also checked NF-κB functionality. Thanks to this study, IL-1β has been found to have very potent antiviral effect against HBV in vitro, through the binding of NF-κB on cccDNA

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Saulnier, Aure. "Effet antiviral de siRNA dans des modèles d'infections lytiques et persistantes par des virus à RNA positif." Paris 6, 2006. http://www.theses.fr/2006PA066083.

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Garnier, Nathalie. "De l'étude du rôle des miARN dans la physiopathologie de l'infection par le SARS-CoV-2 à l'élaboration d'une application clinique." Electronic Thesis or Diss., Université de Lille (2022-....), 2024. http://www.theses.fr/2024ULILS035.

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Abstract:

Le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (severe acute respiratory syndrome-related coronavirus, SARS-CoV-2), de la famille Coronaviridae, est responsable de la maladie à coronavirus de 2019 (coronavirus disease 2019, COVID-19). Malgré la disponibilité de vaccins, en cause dans la fin de l’urgence sanitaire de la COVID-19, la circulation virale du SARS-CoV-2 subsiste ainsi que les recherches sur la compréhension de sa physiopathologie, notamment l’implication et le rôle des microARN (miARN) dans cette infection virale. Les miARN sont des petits ARN non codants régulant l’expression des gènes et connus pour leurs implications dans de nombreuses voies de régulation cellulaire. Récemment, ils se sont révélés l’être également dans l’infection par le SARS-CoV-2. Ces recherches permettraient une meilleure connaissance dans ce domaine et pourraient s’avérer utiles dans le développement de nouveaux diagnostics et de traitements cliniques contre cette infection virale ou d’autres infections de la même famille virale. Ainsi, dans ce projet de recherche, nous avons d’abord caractérisé les miARN cellulaires biomarqueurs de l’infection virale par le SARS-CoV-2 à partir de prélèvements nasopharyngés de patients, qui est le prélèvement recommandé pour le diagnostic de cette infection virale. Nos travaux ont identifié en particulier, des miARN associés à des formes sévères de la COVID-19. Ces derniers ciblent des gènes impliqués dans les infections virales et les réponses antivirales et anti-inflammatoires aux infections virales. Ces potentiels effets antiviraux et anti-inflammatoires des miARN sur l’infection virale par le SARS-CoV-2 n’ont pas pu être démontrés in vitro lors de cette étude. Par la suite, on s’est penché sur l’hypothèse de la dérégulation de la biogénèse des miARN par cette infection virale. On a trouvé aucune sous-expression des ARNm des gènes impliqués de la voie de biogénèse des miARN lors de l’infection par le SARS-CoV-2, que ce soit en ex vivo ou en in vitro. Pour finir, nous avons voulu développer un possible traitement clinique contre l’infection virale par le SARS-CoV-2 ou tout autre pathologie par la délivrance de miARN d’intérêt. Il s’agirait de développer des nanoparticules et des nanomatériaux couplés à des miARN ou autres ARN doubles brins messagers ou non, afin de permettre l’entrée de ces derniers au sein des cellules et rétablir ainsi l’expression basale des gènes impliqués dans l’infection virale
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus 2 (SARS-CoV-2), a member of the Coronaviridae family, is responsible for coronavirus disease 2019 (COVID-19). Despite the availability of vaccines that helped end the COVID-19 health emergency, the viral circulation of SARS-CoV-2 remains, as well as research on the understanding of its pathophysiology, in particular the involvement and role of microRNAs (miRNAs) in this viral infection. miRNAs are small non-coding RNAs that regulate gene expression and are known to be involved in numerous cellular regulatory pathways. Recently, they have also been shown to be involved in SARS-CoV-2 infection. Such research would provide a better knowledge in this field and could be useful in the development of new diagnoses and clinical treatments against viral infection with SARS-CoV-2 or other infections of the same viral family. Thus, in this research project, we first characterized the cellular miRNA biomarkers of SARS-CoV-2 viral infection from patient nasopharyngeal swabs, which is the first diagnostic tool for this viral infection. In particular, our work has identified miRNAs associated with severe forms of COVID-19. These miRNA target genes involved in viral infections and antiviral and anti-inflammatory responses to viral infections. These potential antiviral and anti-inflammatory effects of miRNAs on SARS-CoV-2 viral infection could not be demonstrated in vitro in this study. Then, the hypothesis of deregulation of miRNA biogenesis by this viral infection was investigated. No under-expression of mRNAs of genes involved in the miRNA biogenesis pathway was found upon infection with SARS-CoV-2, either ex vivo or in vitro. Finally, based on a miRNA of clinical interest, we wanted to develop a possible clinical treatment against viral infection by SARS-CoV-2 or any other pathology through the delivery of miRNAs of interest, in this case antiviral. This would involve developing nanoparticles and nanomaterials coupled to miRNAs or other double-stranded messenger or non-messenger RNAs, to enable the latter to enter cells and thus restore basal expression of the genes involved in viral infection

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Desnues, Valérie. "Antiviraux et anticancéreux par voie percutanée." Paris 5, 1994. http://www.theses.fr/1994PA05P263.

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Sun, Wai-yin Raymond, and 辛偉賢. "The antitumor and antiviral properties of gold (III) porphyrins and their related complexes." Thesis, The University of Hong Kong (Pokfulam, Hong Kong), 2004. http://hub.hku.hk/bib/B31245973.

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Aillot, Ludovic. "Effets antiviraux de l'agonisation des Toll-like Récepteurs dans les cellules du foie, une nouvelle stratégie immunothérapeutique dans la lutte contre HBV." Thesis, Lyon, 2018. http://www.theses.fr/2018LYSE1139/document.

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Abstract:

Le virus de l'hépatite B (HBV) infecte chroniquement près de 240 millions d'individus dans le monde. L'infection chronique par HBV est un souci de santé publique majeur puisque l'infection peut évoluer au cours du temps vers la cirrhose et/ou l'hépatocarcinome (CHC). Malgré l'existence de traitements efficaces à base d'analogues de nucléos(t)ides permettant de diminuer la charge virale chez les patients, ceux-ci nécessitent une prise médicamenteuse à vie. En effet, malgré la diminution importante du risque de développer un cancer du foie, ces traitements ne permettent pas l'élimination définitive du virus. Les cellules infectées par HBV sont les hépatocytes du foie, qui remplissent la majorité des rôles vitaux de cet organe. La formation d'un minichromosome viral au sein de ces cellules infectées appelés ADNccc (pour ADN circulaire-covalemment-clos), est majoritairement responsable de la persistance du HBV. Les traitements actuels utilisés sont principalement des analogues de nucléos(t)ides et ceux-ci n'ont pas ou peu d'effets sur l'ADNccc. La nécessité de développer de nouvelles stratégies antivirales visant à éliminer définitivement HBV a donc conduit de nombreux laboratoires, dont le nôtre, à étudier l'utilisation de stratégies immuno-thérapeutiques incluant des stimulateurs de l'immunité innée (agonistes de TLR7, TLR8, RIG-1.) dans le cadre d'infections chroniques. De nombreuses études ont démontré que l'utilisation de ligands stimulant les récepteurs de l'immunité innée promouvait un fort effet antiviral, médié par la production endogène et locale de cytokines pro-inflammatoires et l'induction de gènes régulés par l'interféron (1SG). Dans ce but, nous nous sommes intéressés plus particulièrement aux potentiels effets antiviraux de l'agonisation des senseurs de l'immunité innée les plus connus, les Toll-like récepteurs (TLR), dans le cadre de l'infection par HBV dans les cellules hépatiques. La stratégie immuno-thérapeutique envisagée, vise à stimuler aussi bien les cellules immunitaires que les hépatocytes infectés. La caractérisation de l'expression de différents senseurs de l'immunité innée, d'une part dans les cellules primaires isolées du foie et d'autre part dans certaines lignées cellulaires correspondantes, nous a permis d'avoir une vue d'ensemble 1) des récepteurs exprimés par les différentes cellules du foie notamment dans les hépatocytes (TLR2/TLR3/TLR4/TLR5) ; 2) d'évaluer la fonctionnalité de ceux-ci pour la production de cytokines (IL-6 ; IP-10) lors de leur agonisation 3) d'évaluer les modèles disponibles parmi les lignées cellulaires les plus proches immunologiquement des cellules hépatiques. Les cellules HepaRG et une nouvelle lignée dérivée des macrophages du foie les iKC par exemple sont plus proches respectivement des hépatocytes et des macrophages primaires hépatiques et sont donc des modèles relevant pour les études immuno-thérapeutiques. L'utilisation de ligands de TLR2 et TLR3 sur des hépatocytes infectés chroniquement par HBV, a montré le plus fort effet antiviral (incluant une médiation par la sécrétion de cytokines et l'induction d'1SG) aussi bien sur la réplication d'HBV que sur l'ADNccc. De plus, cet effet semble stable au cours du temps sans résurgence massive de productions virales. Cette stratégie cible non seulement les hépatocytes infectés, mais également les cellules immunitaires dont les productions cytokiniques ont également un fort effet antiviral. Bien que l'effet in vivo, dans un modèle murin, ait été plus modeste, un ajustement des doses d'agonistes utilisées ainsi qu'un meilleur moyen de délivrance au foie de ligands de TLR2 ou TLR3 pourraient être une stratégie immuno-thérapeutique intéressante. Enfin nous nous sommes intéressés au cas particulier de l'agonisation du TLR9 en présence d'HBV… [etc]
HBV chronically infects 240 million peoples around the world. HBV chronic infection is a major public health problem and can lead to cirrhosis or/and hepatocarcinoma (HCC). Even if some efficient treatments are already available, based in particular on the use of nucleos(t)ides analogues that induce a decrease of viral load in patients, these drugs do not lead to a definitive HBV cure They enable an important decrease of liver cancer risk but need to be taken life-long. HBV infects hepatocytes the major liver cells which are involve in many vital mechanisms into the organism. The HBV minichromosome, which is formed into infected cells also called cccDNA (i.e., covalently-closed-circular DNA), is not affected by nucleos(t)ides treatments and thus is responsible for HBV persistence. The use of immune receptors (e.g. Toll-like receptors/TLR) agonists can lead to 1) an important cytokines/interferon (IFN) secretion; 2) promote immune cells activation/recruitment and 3) induction of many Interferon-Stimulated Genes (ISG). These mechanisms could lead to a greater viral clearance by cccDNA degradation or silencing. The need for new strategies to permanently eliminate HBV infection led many laboratories, including ours, to explore the use of immunotherapeutic treatments in a context of chronic infection, including innate immune stimulators (e.g. TLR7, TLR8 or RIG-I agonist are under clinical trials). To this end, we got interested on the potential anti-HBV effects of many TLR agonists in liver cells. Our strategy is to stimulate both infected hepatocytes and immune cells. We first characterized the expression of innate immune sensors in primary liver cells as well as in some liver cell lines. This allowed us to: 1) identify which sensors are expressed by liver cells, especially in hepatocytes (TLR2, TLR3, TLR4, TLR5); 2) evaluate their ability to produce cytokines (IL-6, IP-10) upon agonisation; 3) evaluation of cell lines model which are immunologically closed to the primary liver cells. HepaRG and a new liver macrophage cell line call iKC are immunologically close to their primary cells and appear to be relevant models for immune-therapeutics studies. The use of TLR2 and TLR3 agonists on HBV chronically infected hepatocytes showed a strong antiviral effect (i.e., decrease of HBV replication and cccDNA level) mediated directly by NF- kB-inducible and ISG genes activation and indirectly by cytokines secretion. Furthermore, this effect was shown stable over time without any viral replication rebound. This strategy targets not only infected hepatocytes but also immune cells, whose cytokines production also has a strong antiviral effect. Despite a weak in vivo effect in mice, a tuning in agonist doses used and better liver delivery could be an interesting immune-therapeutic strategy. Finally, we were investigated the particular case of TLR9 agonisation in presence of HBV. We showed an interaction between synthetic or not DNA ligands such as CpG ODN and HBV particles. This interaction leads in one hand, to HBV entry inhibition in hepatocytes, on the other hand, to a blockage of ligand delivery to TLR9 in pDC, which is not due to an inhibition of the TLR9 pathway, but to a lack of access of the ligand to its receptor. These two mechanisms are responsible for a decrease of viral infection during its establishment and a decrease in IFN synthesis by pDC, respectively. A decrease in IFN production, which this time was linked to a bona fide inhibition of the TLR9 pathway, in the presence of the sub-viral particles HBsAg was still observed, without retention of TLR9 ligand of the latter. It would seem, therefore, that use of TLR agonists represent an interesting strategy in setting up new anti-HBV immune-therapeutic approaches. However, their improvement will depend on the evaluation of viro-induced inhibitory mechanisms as well as better ways of in vivo delivering these ligands

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Lambour, Jennifer. "Rôle des polynucléaires neutrophiles et du FcgRIV dans les effets vaccinaux induit par immunothérapie antivirale par anticorps monoclonaux." Thesis, Montpellier, 2018. http://www.theses.fr/2018MONTT064/document.

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Abstract:

Les anticorps monoclonaux (AcM) sont désormais considérés comme une alternative thérapeutique crédible pour traiter les infections virales graves. Comprendre leurs multiples mécanismes d’action est donc crucial pour améliorer leur effet thérapeutique. En utilisant un modèle d’infection virale chez la souris (leucémie induite par le rétrovirus FrCasE), l’équipe a montré qu’une immunothérapie courte par un AcM neutralisant induisait une immunité antivirale protectrice sur le long-terme (effets « vaccinaux ») qui est dépendante du fragment Fc de l’AcM. Ainsi, des immuns complexes (IC) formés à partir de l’AcM thérapeutique et de déterminants viraux, induisent l’activation de cellules immunitaires, notamment les cellules dendritiques (DCs), via leur interaction avec les FcRs exprimés à la surface des cellules. Cependant, ces interactions IC-FcR peuvent également concerner d’autres cellules du système immunitaire outre que les DCs, telles que les macrophages, monocytes ou bien encore les neutrophiles, qui expriment elles aussi les FcRs à leur surface et ce de façon différentielle. Dans ce contexte, il est important d’identifier quels FcRs et quelles cellules les exprimant sont essentiels à l’induction des effets vaccinaux par les AcM. C’est pourquoi mes travaux thèse se sont focalisés sur l’étude du rôle des neutrophiles et des FcγRs dans la modulation de la réponse immune par les AcM. Cette étude repose sur le caractère Fc-dépendant de l’induction d’une réponse immune protectrice par les AcM ainsi que sur les propriétés immunomodulatrices des neutrophiles, qui ont été décrites dans différents contextes pathologiques mais jamais étudiées dans le cadre d’une immunothérapie antivirale par AcM. Pour cela, j’ai utilisé différentes approches in vitro, ex vivo et in vivo.En utilisant le modèle d’infection par FrCasE, il a été montré que les neutrophiles ainsi que le FcγRIV ont un rôle crucial dans l’induction des effets vaccinaux par les AcM, notamment via l’induction d’une réponse humorale antivirale endogène protectrice à très long-terme. De plus lors d’expériences in vitro, il a également été souligné que les neutrophiles sont plus efficacement activés par les IC comparé au virus seul et que différentes cytokines pro-inflammatoires et/ou immunomodulatrices (telles que le TNF et les intérferons de type I et II) potentialisent l’activation des neutrophiles induite par les IC. Mes travaux ont aussi mis en évidence que l’infection virale et l’immunothérapie modulent l’expression des FcRs, et notamment induisent la surexpression du FcRIV sur deux populations distinctes de neutrophiles (différentiées par le niveau d’expression du marqueur de surface Ly6G: Ly6Ghi et Ly6Gint) et sur les monocytes inflammatoires. Enfin, mes travaux montrent que l’immunothérapie par AcM module les profils de sécrétion chimiokinique et cytokinique de ces 3 types cellulaires surexprimant le FcRIV, bien que la nature des profils de sécrétion varie en fonction du type cellulaire et évolue au cours du temps. Ces résultats suggèrent que l’effet immunomodulateur des AcM repose sur l’activation de différents acteurs de la réponse immunitaire précoce, en induisant la sécrétion de chimiokines et de cytokines nécessaires à l’orchestration de la réponse immune. Ils suggèrent aussi une coopération entre ces différents acteurs dans la mise en place d’une immunité protectrice.Pour finir l’ensemble de mes travaux ont mis en évidence un rôle immunomodulateur clé du FcyRIV, ainsi que des différentes cellules l’exprimant, dans l’induction d’une réponse immune protectrice induite par des AcM antiviraux. Ces révélations pourraient avoir des conséquences importantes dans l'amélioration des immunothérapies à base d'AcM
Monoclonal antibodies (mAbs) are now considered as a true therapeutic alternative for treating severe viral infections. Figure out their multiple mechanisms of action is therefore crucial to improve their therapeutic effect. Using a mouse model of viral infection (the FrCasE retrovirus-induced leukemia), the team showed that a short immunotherapy with a neutralizing mAb induces long-term protective antiviral immunity ("vaccine" effects) which is Fc-dependent. Notably, immune complexes (IC) formed with therapeutic mAbs and viral determinants induce the activation of immune cells, especially dendritic cells (DCs) via their interaction with FcγRs expressed on the cell’s surface. However, IC-FcγR interactions can involve different cells of the immune system in addition to DCs, such as macrophages, monocytes or neutrophils, which differentially express FcγRs. In this context, it is important to identify which FcγRs and which FcγR-expressing cells are crucial in the induction of vaccine effects induced by mAbs. It’s the reason why my thesis work has focused on the study of the role of neutrophils and FcγRs in the modulation of immune response by mAbs. This study is based on the Fc-dependent nature of the induction of a protective immune response by mAbs and the immunomodulatory properties of neutrophils, described in different pathological situations but never studied in an mAbs antiviral immunotherapy context. To this end, I used different approaches in vitro, ex vivo and in vivo.By using the FrCasE infection model, it has been shown that neutrophils as well as FcγRIV have a crucial role in the induction of vaccine effects by mAbs, notably via the induction of a long-term protective antiviral humoral response. Moreover the in vitro experiments, highlighted that neutrophils are more effectively activated by IC compared to virus alone and that different pro-inflammatory and/or immunomodulating cytokines (i.e.TNFα and type I and type II interferons) potentiate the activation of neutrophils induced by IC. My work also revealed that viral infection and immunotherapy modulate the expression of different FcγRs, and notably they induce the overexpression of FcγRIV on two distinct populations of neutrophils (differentiated by their expression levels of the Ly6G surface marker: Ly6Ghi and Ly6Gint) and inflammatory monocytes. Finally, my work shows that immunotherapy with Mab modulates the chemokinic and cytokinic secretion profiles of these 3 FcγRIV-over-expressing cell, although the nature of the secretion profiles differs according to the cell type and evolves over time. These results suggest that the immunomodulatory effect of mAbs is based on the activation of different actors of the early immune response by inducing the secretion of chemokines and cytokines necessary for the orchestration of the immune response. They also suggest a potential cooperation between these different actors in the establishment of protective immunity.Altogether, these results show a key immunomodulator role of FcγRIV as well as of different cells expressing it in the induction of a protective immune response by antiviral mAb. They might have important consequences for the improvement of Mab-based immunotherapies

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Silhol, Michelle. "La microinjection dans les cellules somatiques : effet d'agents antiviraux." Montpellier 2, 1987. http://www.theses.fr/1987MON20232.

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Silhol, Michelle. "La Microinjection dans les cellules somatiques effet d'agents antiviraux /." Grenoble 2 : ANRT, 1987. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37609920n.

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Ismail-Cassim, Nazeem. "The effect of short chain fatty acids on picornavirus replication." Thesis, Rhodes University, 1993. http://hdl.handle.net/10962/d1004090.

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Abstract:

Picornavirus proteins VP1 to VP3 are exposed on the surface of the virus particle whereas VP4 is internal and modified at its amino terminus by the addition of myristic acid (Chow et al., 1987; Paul et al., 1987). Myristic acid occupies a position in the core of mature poliovirus particles; it has been suggested that it may be important for particle integrity or in the localization of the capsid protein precursor on the hydrophobic membranes during virion assembly (Chow et al., 1987). To determine the function of the amino-terminal myristylation of VP4 in picornaviruses, and to establish whether competition for the acylation site is a possible approach to antiviral chemotherapy, the effect of fatty acids on virus replication has been examined. Some fatty acids are able to enter picornavirus-infected cells and compete for the myristylation site on VP4. Unexpectedly, it was found that short chain fatty acids also inhibit an early event in the replication of bovine enterovirus (BEV) at concentrations which have no detectable effect on cellular macromolecular synthesis and cloning. These findings indicate that fatty acids inhibit cell-mediated uncoating. Short chain fatty acids inhibit the replication of bovine enterovirus but are almost ineffective against poliovirus type 1, coxsackievirus B5, encephalomyocarditis virus and human rhinovirus lB. Lauric acid binds to bovine enterovirus, thereby stabilizing the virus particle to heat degradation. Fatty acid-bound virions attach to susceptible cells but fail to undergo cell-mediated uncoating. The inhibitory effect is reversible with chloroform and may result from a hydrophobic interaction between the fatty acid and a specific site on the virus particie.

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Meza, Benjamin. "The Effect of Cell Type on the Efficacy of CMV Antiviral Drugs." VCU Scholars Compass, 2008. http://scholarscompass.vcu.edu/etd/1567.

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Abstract:

Until recently, all in vitro drug susceptibility assays of cytomegalovirus (CMV) were performed in clinically irrelevant fibroblast cells. This study sought to test if drug susceptibility was affected by cell type. MRC-5 embryonic lung fibroblasts and ARPE-19 retinal pigmented epithelial cells were infected with BADrUL131-Y4 epithelial/fibroblast tropic virus under serial concentrations of ganciclovir (GCV) or maribavir (MBV). Virus was quantified using plaque reduction, GFP fluorescence, and yield reduction. Both drugs performed less efficiently in ARPE-19 cells. A cell type effect was observed for both plaque reduction and yield reduction assays with implications for the treatment of CMV retinitis as well as other manifestations of CMV Disease that involve non-fibroblast cell types.

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McGraw, Thomas L. (Thomas Lee). "The Effect of N, N Bis (ethylene)-P (1-adamantyl) Phosphonic Diamide on Rous Sarcoma Virus." Thesis, North Texas State University, 1988. https://digital.library.unt.edu/ark:/67531/metadc501033/.

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Abstract:

The drug, N,N bis (ethylene)-P (1-adamantyl) phosphonic diamide inhibits focus formation of Rous Sarcoma Virus in tissue culture. Transformation of chick cells was inhibited when the drug was added to chick cells prior to infection. The drug did not inhibit the transformation of Normal Rat Kidney Cells infected with RSV, when the cells were grown at non-permissive temperatures and shifted to permissive temperatures upon addition of the drug. Nor did the drug revert cells transformed at permissive temperatures. These studies indicated that the inhibition of RSV is in the early stage of viral growth, possible penetration or uncoating.

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Marin, Brianna. "Determining the antiviral effect of HSP70 inhibitor, KNK437, by a time-dependent analysis." Walsh University Honors Theses / OhioLINK, 2019. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=walshhonors1555516450619539.

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Latham, Sally. "Proteomics to investigate hepatitis C virus infection and the effect of antiviral liposomes on host cells." Thesis, University of Oxford, 2010. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.547603.

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Béchard-Dubé, Steffi-Anne. "Effets de l'environnement lumineux et de l'âge foliaire sur la croissance, la capacité photosynthétique et la production protéique chez Nicotiana benthamiana." Master's thesis, Université Laval, 2015. http://hdl.handle.net/20.500.11794/26972.

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Abstract:

Tableau d’honneur de la Faculté des études supérieures et postdoctorales, 2015-2016
Cette étude visait à caractériser la croissance, la capacité photosynthétique, la concentration en azote et protéines totales solubles, la production de protéines recombinantes (HA) ainsi que la quantité de lumière interceptée à différents stades de développement de plants de Nicotiana benthamiana afin d’optimiser la production de vaccins. L’évolution des réponses physiologiques étudiées fut similaire chez toutes les feuilles primaires, suggérant que le processus de sénescence s’initie et progresse de façon semblable indépendamment de leur ordre d’initiation. Toutefois, la superposition des patrons temporels de sénescence et de croissance foliaire a mené à un rendement HA maximal se situant invariablement dans la partie médiane du plant lorsqu’exprimé sur une base foliaire. À l’échelle du plant entier, nos résultats suggèrent qu’il est possible d’augmenter la production de vaccins en récoltant les plants à un stade de développement plus tardif, ou en augmentant la densité de culture et en récoltant ces plants plus tôt.
Nicotiana benthamiana is a wild relative of tobacco increasingly used as a plant protein expression platform to produce recombinant vaccine antigens against the influenza virus. Investigation on the physiological determinants of this production is essential to optimize and regulate vaccines production following a new flu outbreak. We examined the photosynthetic photon flux density, growth, light-saturated photosynthesis, total soluble protein, nitrogen content and recombinant protein production at different phenological stages. The similar evolution of the studied physiological responses suggested that the senescence process is initiated and progresses in a similar way in all primary leaves, regardless of the order of initiation. In contrast, the superposition of the time pattern of senescence with that of leaf growth shows that maximal HA yield expressed on a leaf basis is invariably located in the middle part of the plant. At the whole plant scale, our results suggest that it is possible to increase the production of antigens by harvesting plants at a later developmental stage, or by increasing plant density and harvesting these plants earlier.

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COUFFIN, ANNE CLAUDE. "Association du poly(l-lysine citramide) avec une antiprotease du vih et evaluation de l'activite antivirale sur cellules infectees." Montpellier 2, 2000. http://www.theses.fr/2000MON20036.

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Abstract:

Cette these visait a vectoriser un inhibiteur de la protease du vih via une association avec le poly(l-lysine citramide), vecteur macromoleculaire hydrosoluble, biocompatible et bioresorbable afin de favoriser la penetration intracellulaire du principe actif a faible biodisponibilite. Le memoire debute par un rappel bibliographique des connaissances sur la protease du vih et sur les systemes macromoleculaires vecteurs potentiels d'inhibiteurs de la protease. Le chapitre ii est consacre a une nouvelle voie de synthese du poly(l-lysine citramide) en phase homogene, et a la caracterisation du vecteur obtenu. Par comparaison avec la polycondensation interfaciale, il est montre que les polymeres prepares par les deux voies sont de meme nature chimique mais different par la proportion des unites de type imide et oxolactone. Le chapitre iii rapporte la synthese et la caracterisation de conjugues polymere plca/inhibiteur (psi) ou non inhibiteur (pni) de la protease du vih via l'agent de couplage bop. Une etude physico-chimique de ces conjugues renseigne sur leur comportement en milieu aqueux. Afin de distinguer l'influence de la nature macromoleculaire des conjugues au cours des tests cellulaires, des composes modeles des unites constitutives de la prodrogue macromoleculaire sont synthetises et etudies comparativement (cipsi et lypsi). Le chapitre iv traite de l'evaluation in vitro de l'activite antivirale des conjugues et de leur comportement au contact de cellules infectees par le vih. L'interaction vecteurs synthetiques/cellules infectees est etudiee. Afin d'envisager une eventuelle exploitation therapeutique, l'absence de toxicite d'un conjugue in vivo est verifiee. Il est montre que l'activite antivirale est en fait liee a la nature macromoleculaire des conjugues et non a un comportement de prodrogues.

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Rocquigny, Hugues de. "Caractérisation moléculaire des domaines fonctionnels des nucléoprotéines NCp7 et NCp10 des rétrovirus HIV-1 et MoMuLV : synthèse chimique, études biochimique et structurale." Paris 5, 1993. http://www.theses.fr/1993PA05P630.

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Somasundaram, Balaji. "A surface plasmon resonance assay to determine the effect of influenza neuraminidase mutations on its affinity with antiviral drugs." Thesis, University of Canterbury. Chemical and Process Engineering, 2013. http://hdl.handle.net/10092/9183.

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Abstract:

The outbreak of pandemic influenza and its ability to spread rapidly makes it a severe threat to public health. Antiviral drugs such as oseltamivir (Roche’s Tamiflu™) and zanamivir (GlaxoSmithKline’s Relenza™) are neuraminidase (NA) inhibitors (NI), which bind more tightly to NA than its natural substrate, sialic acid. However, the virus can acquire resistance to antiviral drugs by developing single point mutations (such as H274Y) in the target protein. Thus in some cases the drugs may not be as effective as expected. The high level of inconsistency exhibited by fluorometric assays and the short half-life of the chemiluminescent assay for monitoring drug resistance lead to the need for a simple, label-free, reliable assay. To address this problem, this work focused on three main objectives: 1) to determine the binding affinities of two common anti-viral drugs (oseltamivir and zanamivir) against the influenza NA wild type and drug resistant mutants using bioinformatics software Schrodinger Suite™ 2010. 2) To develop a reliable label-free, real-time, surface plasmon resonance (SPR) assay to measure the binding affinity between influenza viral coat protein neuraminidase (wild type and mutant) and anti-viral drugs. 3) To develop an SPR inhibition assay to quantitatively compare the interactions of sialic acid, zanamivir and oseltamivir with the viral coat protein neuraminidase (wild type and mutant). The entire docking process was carried out using Schrödinger Suite™ 2010. The 2009 pandemic H1N1 neuraminidase (PDB: 3NSS) was used throughout the docking studies as the wild type structure. Five mutants (H274Y, N294S, H274N, A346N and I222V) and three ligands (sialic acid, oseltamivir and zanamivir) were built using the maestro module. The grid-based ligand docking with energetics (GLIDE) module and induced fit docking (IFD) module were used for docking studies. The binding affinities, Gibbs free energy change (∆G) and molecular mechanics-generalized born energy/ solvent accessible area (MM-GB/SA) values for wild-type NA interactions show that both the antiviral drugs studied interact strongly with the wild-type protein. The ∆G values for all antiviral interactions with mutant NA forms were reduced in magnitude, thereby indicating that they are less favourable than interactions with the wild-type protein. A similar trend was observed with MM-GB/SA results. Amongst all of the computed values, MM-GB/SA was the closest to the experimental data. In several cases, the interactions between the anti-viral drugs and NA mutants were markedly less favourable than those between sialic acid and the same mutants, indicating that these mutations could confer anti-viral resistance. Influenza NA wild-type and H274Y mutant were expressed in baculovirus expression system (BVES) in insect cells. The expressed proteins were partially purified using the standard purification techniques of anion exchange and size exclusion chromatography (SEC). A fluorometric activity assay was performed on the recombinant proteins. Both the wild type and the mutant showed similar level of activities. In addition, the recombinant NAs were used in an inhibition assay. Oseltamivir was found to be sensitive to wild type protein (IC50 = 0.59 nM) and resistant to the H274Y mutant protein (IC50 = 349.43 nM). On the other hand, zanamivir was sensitive to both wild type (IC50 = 0.26 nM) and the H274Y mutant (IC50 = 0.44 nM). This indicated that zanamivir was a more potent inhibitor than oseltamivir. These findings were in good agreement with the literature. An SPR assay for accurate monitoring of influenza antiviral drug resistance was developed. A spacer molecule (1, 6- hexanediamine) was site-specifically tethered to the inert 7-hydroxyl group of zanamivir. The tethered zanamivir was immobilized onto an SPR GLC chip to obtain a final immobilization response of 431 response units (RU). The reference subtracted binding responses obtained for NA wild-type and H274Y mutant were analysed using the ProteOn Manager™ Software tools. The SPR curves were fitted to a simple Langmuir 1:1 model with drift to obtain association rate constant (ka) and dissociation rate constants (kd). The relative binding values obtained from literature and the current SPR assay (1.9 and 1.7 respectively) suggested that the current SPR assay yielded similar results to the existing labelled enzymatic assay. In addition, an SPR inhibition assay was developed. The calculated IC50-spr values were compared and it was observed that oseltamivir was sensitive to wild type protein (IC50-spr = 7.7 nM) and resistant to the H274Y mutant protein (IC50-spr = 256 nM). On the other hand, zanamivir was sensitive to both wild type (IC50-spr = 2.16 nM) and the H274Y mutant (IC50-spr = 2.4 nM). Sialic acid was also found to be sensitive to both wild type (IC50-spr = 5.5 nM) and H274Y mutant (IC50-spr = 3.25 nM). In the cases studied, the viral proteins remained sensitive to sialic acid, consistent with retention of virulence of these mutant strains. It was concluded that zanamivir is a more potent inhibitor than oseltamivir for treating the H274Y mutant. Comparison of the SPR inhibition results with the docking results revealed a similar trend. The wild-type NA and H27Y mutant retained binding affinity for sialic acid and zanamivir. Oseltamivir showed a significant decrease in binding affinity for the H274Y mutant compared with the wild-type. This was because of the disruption of the salt bridge formation within NA that was vital for oseltamivir activity. To my knowledge, this is the first SPR biosensor assay developed to monitor influenza antiviral drug resistance. There is a tremendous scope to extend this study to more mutants and new antiviral drugs. This could pave the way for a reliable SPR biosensor assay to replace low consistency labelled enzymatic assays.

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Bodaghi, Bahram. "Strategies d'echappement du cytomegalovirus humain aux effets antiviraux des cytokines et des chimiokines." Paris 7, 1998. http://www.theses.fr/1998PA077185.

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Abstract:

Le cytomegalovirus entraine des affections graves potentiellement mortelles ou cecitantes chez les patients immunodeprimes. Il a developpe plusieurs strategies d'echappement a la reponse immunitaire de l'hote durant son evolution. Nous avons mis en evidence l'un de ces mecanismes dans le modele cellulaire des fibroblastes humains. Il s'agit d'un phenomene biphasique. Le cmv induit d'abord la synthese et secretion de la cc-chimiokine rantes durant la phase tres precoce de l'infection. Il provoque ensuite la depletion de rantes mais egalement celle de mcp-1, secretee de facon constitutive par ces cellules, dans le milieu extracellulaire. Cet epuisement est du a une internalisation et une sequestration des cc-chimiokines. Il necessite un genome viral actif. L'utilisation de mutants viraux depourvus des genes codant pour les homologues de recepteurs aux cc-chimiokines couples aux proteines g (us28, us27) a montre le role predominant d'us28 dans ce phenomene. Le cmv pourrait ainsi empecher l'attraction et l'activation des lymphocytes t et des cellules nk a proximite des cellules infectees. Nous avons choisi le modele des cellules epitheliales pigmentaires de la retine humaine afin d'analyser 2 aspects physiopathologiques de la retinite a cmv. Le processus d'entree virale intervient apres endocytose non clathrine-dependante et non pas apres un evenement de fusion comme cela a ete montre dans le modele des fibroblastes. Enfin, dans ces cellules, l'inhibition de la replication virale dependante de l'ifn- passe par l'activation de la voie de l'indoleamine 2,3 dioxygenase (ido) qui provoque le catabolisme du tryptophane en kynurenine et non pas par celle de la nitric oxide synthase inductible (nosii). En effet, le cmv est capable d'inhiber la synthese du monoxyde d'azote (no) dependante des cytokines mais ne parvient pas a contrecarrer l'effet de l'ido. Ces resultats ouvrent des perspectives de recherche in vivo afin d'etablir le role de ces mecanismes au cours des affections liees au cmv.

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Trout, Hervé. "Pharmacocinétique de population et absorption digestive de médicaments du SIDA : application aux antiviraux et médicaments associés." Paris 5, 1999. http://www.theses.fr/1999PA05P605.

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Gad, Hans Henrik. "Resistance of Chikungunya virus towards the antiviral effect of human 2',5'- oligoadenylate synthetase 3 involves the envelope E2 protein." Paris 7, 2012. http://www.theses.fr/2012PA077068.

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Abstract:

Le virus Chikungunya (CHIKV) est un alphavirus transmis par un moustique responsable d'une série d'épidémies en Afrique et en Asie durant la dernière décennie. Nous avons déjà montré que la 2',5'- oligoadenylate synthétase 3 (OAS3) induite par l'interféron possède une forte activité antivirale contre le CHIKV en empêchant l'accumulation d'ARN viral dans les cellules épithéliales humaines infectées. Dans ce travail, nous avons étudié la capacité du CHIKV a développer des stratégies d'échappement contre l'activité antivirale d'OASS. Par passage série d'un isolât clinique de CHIKV sur des cellules exprimant OAS3, nous avons identifié un variant qui montre une remarquable résistance envers OAS3. L'analyse de l'ARN génomique a permis d'identifier deux substitutions d'acides aminés : dans la protéine non structurale nsP2 et dans la glycoprotéine d'enveloppe E2. Grâce à un clone moléculaire de CHIKV exprimant la Renilla Luciférase, nous avons montré que seul le changement de Glu à Lys en position E2-166 est capable de restaurer la croissance virale dans les cellules humaines exprimant OAS3. L'étude de la croissance virale sur des myoblastes humains, qui sont associés à la pathogénèse du CHIKV, a montré que le CHIKV portant une lysine en position E2-166 se réplique plus efficacement que le virus sauvage. Cette efficacité de réplication accrue dans les myoblastes est associée à une forte phosphorylation de la PKR et d'elF2a suivie par une apoptose plus marquée des cellules. Nos résultats suggèrent que la substitution Glu166Lys dans la protéine E2 permets au CHIKV d'échapper à OAS3 en augmentant la réplication dans les cellules humaines plutôt qu'en agissant en tant que antagoniste
Chikungunya virus (CHIKV) is a mosquito-borne alphavirus that has reemerged within the last decade and caused a series of epidemics of unprecedented scale in Africa and Asia. We have previously reported that the interferon-inducible 2',5'-oligoadenylate synthetase 3 (OAS3) exerts potent antiviral activity against CHIKV in human epithelial cells by preventing accumulation of viral RIMA in infected cells. In this study, we investigated whether CHIKV may evolve strategies to circumvent the antiviral effect of OAS3. Through serial passage of a clinical isolate of CHIKV on OAS3-expressing cells, we identified a CHIKV variant which showed remarkable resistance towards OAS3. Analysis of its genomic RNA identified only two unique amino acid substitutions in the nonstructural nsP2 protein and the envelope E2 glycoprotein. Using a molecular clone of CHIKV expressing Renilla luciferase, we showed that only the change from Glu to Lys at position E2-166 was able to rescue viral growth in human cells expressing OAS3. Study of viral growth in human myoblasts, a host cell associated to the pathogenesis of Chikungunya disease, showed that CHIKV bearing Lys in E2-166 was more efficient at replicating in these cells when compared to wild-type virus. The greater efficiency of viral growth in myoblasts was associated with a robust phosphorylation of PKR and elF2a followed by more pronounced apoptotic cell death. Our data suggest that the Glu166Lys substitution in E2 enables CHIKV subversion of OAS3 by promoting viral growth in human cells rather than acting as an antagonist of PAS

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Amankwaah, Collins. "Incorporation of selected plant extracts into edible chitosan films and the effect on the antiviral, antibacterial and mechanical properties of the material." The Ohio State University, 2013. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=osu1366220367.

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Klages, Michael [Verfasser]. "Der antivirale Effekt des T-Zell-Zytokins Interleukin-26 auf die Infektion mit dem humanen Cytomegalovirus / Michael Klages." Kiel : Universitätsbibliothek Kiel, 2016. http://d-nb.info/1111558663/34.

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Nizamani, Zaheer Ahmed. "Délivrance in vivo de siRNA et évaluation de leur effet antivirale contre le virus de la peste des petits ruminants (PPRV)." Thesis, Montpellier 2, 2010. http://www.theses.fr/2010MON20100/document.

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Abstract:

L'interférence ARN est un processus biologique permettant la dégradation d'un ARN messager par un ARN double brin de courte taille spécifique de cet ARNm. Elle a un potentiel d'application en thérapie antivirale pour peu que les ARN interférents (ARNi) soient délivrés efficacement in vivo. Dans le genre Morbillivirus, on trouve des pathogènes importants en santé publique et vétérinaire tels que le virus de la rougeole et les virus de la peste des petits ruminants (PPR) et de la peste bovine. Il n'existe aucun traitement contre les infections à morbillivirus. L'objectif de ce travail était d'évaluer la possibilité d'administrer in vivo un ARNi actif contre le virus PPR in vitro. Une formulation basée sur des liposomes complexés avec des ARNi ou un adénovirus non réplicatif exprimant des ARN courts en tête d'épingle (shARN) ont été testés chez des chèvres dans un modèle d'épreuve infectieuse avec une souche virulente de PPR. Les différences observées n'étaient cependant pas significatives au plan statistique. Pour améliorer la délivrance par vecteur viral, nous avons comparé un autre vecteur de type baculovirus qui s'est avéré plus efficace in vitro que l'adénovirus précédent. Par ailleurs, nous avons testés in vitro également deux peptides capables de pénétrer dans les cellules. L'un d'entre eux, le Perfect 6 (PF6) a presque complètement inhibé l'expression du gène de la nucléoprotéine par le virus PPR. En revanche, l'autre (PF14) a été moins efficace mais a relativement mieux résisté à l'inhibition de son activité par la présence de fortes concentrations de sérum dans le milieu. Dans le but d'évaluer in vivo ces nouveaux systèmes de délivrance en s'affranchissant du modèle chèvre lourd et couteux à mettre en œuvre, nous avons initié une stratégie de mise au point d'un modèle non infectieux de suivi dynamique de l'interférence ARN chez la souris par imagerie in vivo. Dans ce travail, nous montrons qu'il est possible de mesurer et de standardiser l'expression d'un gène rapporteur comprenant une séquence du virus PPRV et ensuite de quantifier le niveau de dérégulation de l'expression induit par un ARNi dirigé contre le virus PPR. Après calibration, ce modèle est désormais pour tester différents systèmes de délivrance de siRNA chez la souris
RNA interference (RNAi) is the process of mRNA degradation that is induced by double-stranded RNA in a sequence-specific manner. RNAi has a potential of developing into an effective and specific antiviral therapy if small interfering RNAs (siRNAs) can be efficiently delivered in vivo. Morbillivirus genus includes important pathogens of humans and animals, which include measles virus, peste des petits ruminants virus (PPRV) and rinderpest virus. No treatment exists for morbillivirus diseases. The aim of this work was the in vivo delivery of siRNA against PPRV infection. The delivery of siRNA by a liposome and short hairpin RNA (shRNA) by means of a replication deficient adenovirus was tested in goats which were later challenged with PPRV. However, significant therapeutic effects were not obtained. To find more efficient vectors, the PPRV inhibition efficiency of recombinant replication deficient adenovirus and a baculovirus expressing shRNA against nucleoprotein of PPRV were compared in vitro. The baculoviral vector was found to be more efficient. Similarly, two cell penetrating peptides (CPPs) were also compared and PepFect6 (PF6) could deliver siRNA NPPRV1 effectively in vitro resulting in an almost complete inhibition of N gene expression by PPRV. Another CPP, the PF14 though with lower transfection efficiency in vitro, was found to be relatively serum resistant compared to PF6. A small animal model for PPRV infection does not exist. Due to economic, ethical, and biosecurity issues involved with use of small ruminants, a strategy based on the use of a non-infectious mouse model and a dynamic follow up of siRNA treatment by live imaging was developed. We show in this work that it is possible to measure and standardize the expression of a bioluminescent reporter gene containing a PPRV sequence and thus, to quantify a down-regulation of such gene by siRNA against PPRV. After some calibration, siRNA delivery can now be tested in this mouse model for comparing various delivery vectors in vivo

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Oladunni, Fatai S. "MECHANISMS OF TYPE-I IFN INHIBITION: EQUINE HERPESVIRUS-1 ESCAPE FROM THE ANTIVIRAL EFFECT OF TYPE-1 INTERFERON RESPONSE IN HOST CELL." UKnowledge, 2019. https://uknowledge.uky.edu/gluck_etds/43.

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Abstract:

Equine herpesvirus-1 (EHV-1) is one of the most important and prevalent viral pathogens of horses causing a major threat to the equine industry throughout most of the world. EHV-1 primarily causes respiratory disease but viral spread to distant organs enables the development of more severe sequelae; abortion and neurologic disease. In order to produce disease, EHV-1 has to overcome the innate barrier of the type-I interferon (IFN) system in host cells. However, the underlying mechanisms employed by EHV-1 to circumvent the type-I IFN response in host cells are not well understood. In this project study, using molecular techniques, we explored how EHV-1 is able to escape the type-I IFN response in host cells during infection. We also investigated whether EHV-4, a closely related but less pathogenic virus, has similar effects on type-I IFN as a clue to understanding how widespread IFN suppressive function is found among equine alphaherpesviruses. Our data showed that inhibition of the type-I IFN response in host cells is not a function of neuropathogenicity of EHV-1 strains. However, a reduced type-I IFN response correlated with pathogenicity as EHV-4, unlike EHV-1, was unable to down-regulate the type-I IFN response in equine endothelial cells (EECs). Investigation of the mechanisms employed by EHV-1 to suppress type-I IFN revealed that the virus sequentially prevented outside-in signaling events that lead to type-I IFN production. Specifically, EHV-1 blocked the expression of Toll-like receptors (TLR) 3 and TLR4 at 6 hours post-infection (hpi) and 12 hpi. EHV-1 also prevented the transcription of IRF7 and IRF9 at different time-points during infection. The virus also perturbed the JAK-STAT signaling pathway by negatively regulating the cellular levels of TYK2 and phosphorylation-mediated activation of STAT2 molecules. Immunofluorescence data revealed that during infection, EHV-1 was able to sequester STAT2 molecules from nuclear translocation. This may be a limiting step preventing the formation of interferon- stimulated gene factor 3 (ISGF3) whose nuclear translocation is required to transactivate interferon-stimulated genes (ISGs) including IRF7. Further investigation showed that unlike EHV-1, EHV-4 only interfered with phosphorylation-mediated activated STAT1 and STAT2 molecules at 3 and 6 hpi. EHV-4 was unable to block TLR3/4 and IRF7/9 mRNA expression at any time-point. Intriguingly, while viral late gene of EHV-1 mediates inhibition of STAT phosphorylation, our data showed that for EHV-4, a virus late gene did not mediate the inhibition of STAT phosphorylation. The findings from this study help illuminate how EHV-1 strategically interferes with limiting steps required for type-I IFN response in host cells to promote pathology. Our data also strengthen the hypothesis that the ability to shut off host factors required for type-I IFN production might be directly related to the degree of pathogenicity of the EHV subtypes.

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Vanden, Broecke Catherine G. "Evaluation des effets biologiques de l'interféron dans l'espèce bovine: activité antivirale et induction de la 2'-5' oligoadenylate synthetase." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 1986. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/213523.

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Meunier, Thomas. "Étude des mécanismes d’action de nouveaux inhibiteurs de coronavirus humains." Thesis, Université de Lille (2018-2021), 2021. http://www.theses.fr/2021LILUS057.

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Abstract:

Les coronavirus sont des virus ARN enveloppés qui infectent les mammifères et les oiseaux. Chez l’homme, quatre coronavirus causent des maladies bénignes comme des rhumes et rhinites, HCoV-OC43, HCoV-229E, HCoV-NL63 et HCoV-HKU1. Au cours des deux dernières décennies, trois nouveaux coronavirus hautement pathogènes ont été identifiés, le SARS-CoV (« Severe Acute Respiratory Syndrome ») en 2003, le MERS-CoV (« Midle East Respiratory Syndrome ») en 2012 et récemment le SARS-CoV-2 en décembre 2019. La pandémie mondiale du COVID-19 a mis en évidence le manque d’antiviraux ciblant les coronavirus. Bien que de nombreux vaccins efficaces soient développés pour contrer la pandémie de COVID-19 due au SARS-CoV-2, il n’y a toujours aucun antiviral spécifique commercialisé contre ce virus et les traitements actuels consistent à traiter uniquement les symptômes.L’équipe du Dr Karin SERON du laboratoire de Virologie Moléculaire et Cellulaire du Centre d’Infection et d’Immunité de Lille s’est spécialisée dans l’identification d’antiviraux d’origine naturelle. En effet les plantes sont une source importante de molécules thérapeutiques et de nombreuses plantes sont encore utilisées aujourd’hui en médecine traditionnelle. L’objectif de ma thèse a été d’utiliser les connaissances et techniques développées par le laboratoire pour identifier des antiviraux naturels contre les coronavirus humains hautement pathogènes et de comprendre leurs mécanismes d’action. Mon premier projet a été réalisé en collaboration avec le groupe de Dr Simon Bordage du laboratoire de Pharmacognosie de la Faculté de Pharmacie de Lille dirigé par le Pr Sevser Sahpaz. Suite au criblage d’extraits de plantes, utilisées en médecine traditionnelle ivoirienne, contre le coronavirus HCoV-229E, nous avons sélectionné l’extrait de Mallotus oppositifollius qui était le plus actif. Après un fractionnement bioguidé, le principe actif a été isolé et identifié. Il s’agit du phéophorbide a (Pba). Le Pba inhibe HCoV-229E mais aussi les coronavirus hautement pathogènes MERS-CoV et SARS-CoV-2 (IC50 = 0,18 μM) ainsi que d’autres virus enveloppés par un mécanisme de photo-inactivation dynamique. Nous avons montré que le Pba cible la membrane virale et inhibe l’étape de fusion. Le Pba est le premier antiviral naturel possédant une activité virucide photo-dépendante décrite contre le SARS-CoV-2. Cette molécule pourrait potentiellement être utilisée en thérapie clinique ou comme désinfectant de surface. Mon deuxième projet porte sur une anthocyanidine, la delphinidine, déjà décrite par notre laboratoire comme antiviral contre le virus de l’hépatite C. Nous avons montré que la delphinidine inhibe de façon dose-dépendante l’entrée des coronavirus HCoV-229E, MERS-CoV et SARS-CoV-2 dans les cellules (IC50 = 16-20 μM). Nos résultats montrent que la delphinidine cible les sites de glycosylation de la protéine de surface S. Grâce à une collaboration avec le laboratoire de Chimie Bio-organique et Médicinale de Strasbourg, dirigé le Dr Mourad Elhabiri, nous avons criblé des dérivés de la delphinidine afin d’identifier des molécules plus actives. Nous avons ainsi identifié un composé actif contre le HCoV-229E à une concentration très faible (IC50 = 0,06 μM) mais qui semble avoir un mécanisme d’action différent de la delphinidine. En effet, il est actif à l’étape de réplication.En conclusion, au cours de ma thèse j’ai pu identifier de nouveaux antiviraux naturels contre les coronavirus humains et notamment le SARS-CoV-2 ayant des mécanismes d’action inédits. Ces travaux pourront servir de base à l’obtention de molécules pouvant être utilisées, dans l’avenir, pour le traitement des maladies à coronavirus
Coronaviruses are enveloped RNA viruses infecting mammals and birds. Four coronaviruses causing mild diseases, like common cold, have been described in human, HCoV-OC43, HCoV-229E, HCoV-NL63 and HCoV-HKU1. During the last two decades, three new, highly pathogenic coronaviruses have been identified the SARS-CoV (Severe Acute Respiratory Syndrom) in 2003, the MERS-CoV (Middle East Respiratory Syndrome) in 2012 and recently the SARS-CoV-2 in December 2019. The COVID-19 global outbreak caused by SARS-CoV-2, highlighted the lack of specific antiviral available against this family of virus. The team of Dr Karin SERON from the Cellular and Molecular Virology laboratory of the Center for Infection and Immunity of Lille, is specialized in the identification of antiviral compounds from natural origin. Indeed, plants are a source of natural therapeutic compounds and many plants are still being used in traditional medicine. The aim of my thesis was to identify natural antiviral agents against highly pathogenic human coronaviruses with the help of the knowledge and tools developed by the laboratory. My first project was carried out in collaboration with the group of Dr Simon Bordage from the Pharmacognosy laboratory of the Faculty of Pharmacy of Lille directed by Pr Sevser Sahpaz. Plant extracts from Ivorian plants used it traditional medicine were tested against the coronavirus HCoV-229E and we selected the most active, the Mallotus oppositifollius extract. After bio-guided fractionation, the active compound was isolated and characterized, the pheophorbide a (Pba). Pba is able to inhibit the infection of HCoV-229E and highly pathogenic coronaviruses MERS-CoV and SARS-CoV-2 (IC50 = 0.18 μM) as well as other enveloped viruses using a photo-dynamic inactivation mechanism. Pba targets the viral envelop and inhibits the fusion step. Pba is the first described natural antiviral against SARS-CoV-2 with direct photosensitive virucidal activity. This molecule could potentially be used in therapy or as disinfectant. My second project was about an anthocyanidin, the delphinidin, identified in the laboratory for its antiviral activity against hepatitis C virus. We showed that delphinidin is an entry inhibitor of coronaviruses in a dose-dependent manner for HCoV-229E, MERS-CoV and SARS-CoV-2 (IC50 = 16-20 μM). Our results show that delphinidin targets the glycosylation sites on the surface protein S. Thanks to a collaboration with the laboratory of Medicinal and Bioorganic Chemistry of Strasbourg, led by Dr Mourad Elhabiri, delphinidin synthetic derivates were screened in order to identify compounds with higher antiviral capacities. We thereby identify an active compound against HCoV-229E with a lower IC50 than delphinidin (IC50 = 0.06 μM). Surprisingly, its mechanism of action seems to be different than delphinidin with an activity at the replication step.In conclusion, during my thesis I was able to identify new natural antivirals against human coronaviruses, and in particular SARS-CoV-2, with novel mechanisms of action. This work may serve as a basis for obtaining molecules that can be used in the future for the treatment of coronavirus diseases

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Bisbal, Catherine. "Synthèse d'analogues du 2'-5' oligoadénylate, étude de leurs effets antiviraux après vectorisation dans les cellules." Grenoble 2 : ANRT, 1986. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb375960595.

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Eloy, Ygor Raphael Gomes. "CaracterizaÃÃo fÃsico-quÃmica e estrutural de polissacarÃdeos obtidos de folhas da planta Aloe barbadensis Miller e avaliaÃÃo de suas atividades antiviral e anti-hemorrÃgica." Universidade Federal do CearÃ, 2012. http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=8537.

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Abstract:

CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior
FundaÃÃo Cearense de Apoio ao Desenvolvimento Cientifico e TecnolÃgico
Este trabalho teve como objetivos caracterizar fÃsico-quÃmica e estruturalmente polissacarÃdeos obtidos de folhas de Aloe barbadensis e avaliar suas atividades antiviral, anti-hemorrÃgica e prÃ-coagulante e possÃveis sinais de toxicidade. Foi realizada extraÃÃo aquosa de polissacarÃdeos totais (PT) de A. barbadensis, seguido de precipitaÃÃo por etanol e remoÃÃo dos contaminantes proteicos com TCA. A cromatografia em DEAE-celulose foi eficiente no fracionamento dos PT, onde foram obtidas as fraÃÃes PI e PII. A caracterizaÃÃo fÃsico-quÃmica mostrou que a fraÃÃo PI Ã composta por manose (78,4%), glucose (7,3%), galactose (2,1%), fucose (2,8%) e Ãcidos urÃnicos (10,0%), e isenta de grupos Ãster sulfato. Enquanto, a fraÃÃo PII Ã constituÃda por manose (39,2%), glucose (22,2%), galactose (26,3%), arabinose (3,8%), xilose (1,1%), Ãcidos urÃnicos (8,0%) e grupos Ãster sulfato (12,0%). Na revelaÃÃo das bandas polissacarÃdicas da fraÃÃo PII, obtidas por PAGE e gel de agarose corados com stainsall foi constatado a presenÃa de duas bandas que apresentaram diferentes coloraÃÃes, roxa e ciana, correspondentes a presenÃa de grupos sulfato e carboxilados, respectivamente. Na anÃlise estrutural das fraÃÃes PI e PII, por espectroscopia no IR, foi demonstrado que a fraÃÃo PI apresenta unidades monossacarÃdicas de Ã-manose O-acetiladas (812,2 e 960 onda.cm-1) e Ãcidos urÃnicos neutros (1738 onda.cm-1) em sua estrutura. Diferentemente, a fraÃÃo PII, mostrou-se ser constituÃda por unidades monossacarÃdicas de manose (1014,7 onda.cm-1), galactose (1078,2 onda.cm-1), Ãcidos urÃnicos carregados negativamente (1635 onda.cm-1) e Ãster sulfato (1329,5 e 1260,9 onda.cm-1). Na avaliaÃÃo estrutural da fraÃÃo PII por RMN foi comprovado Ã presenÃa do grupo Ãster sulfato. Em relaÃÃo Ãs atividades biolÃgicas, o teste de citotoxicidade mostrou que os PT e as fraÃÃes PI e PII nÃo apresentaram toxicidade para a maioria das cÃlulas testadas e nÃo foram eficientes na inibiÃÃo de vÃrus nÃo envelopados Ad-19 e Ad-41. No entanto, os PT e a fraÃÃo PI foram capazes de inibir a infecÃÃo causada por HSV-1 e HSV-2. Em ensaios com metapneumovÃrus (HMPV), a fraÃÃo PII apresentou atividade antiviral superior Ã ribavirina. Embora os PT e as fraÃÃes PI e PII nÃo terem apresentado atividade contra dengue vÃrus sorotipo 1 (DENV-1), os PT puderam inibir a hemorragia em ratos, diminuindo o tempo de sangramento e o tempo de protrombina. Os PT nÃo apresentaram toxicidade em camundongos, mas aumentaram o tamanho do baÃo e o nÃmero de plaquetas sanguÃneas. Pode ser concluÃdo que extratos foliares de A. barbadensis podem apresentar polissacarÃdeos neutros ou carregados negativamente por grupos carboxilados/sulfatados. Em adiÃÃo, alÃm de apresentar atividade inibitÃria contra os vÃrus HSV-1, HSV-2 e HMPV, podem tambÃm apresentar efeito anti-hemorrÃgico e prÃcoagulante, propriedades essas, importantes, visto que a complicaÃÃo de muitas viroses leva a quadros hemorrÃgicos. AlÃm disso, os PT de A. barbadensis nÃo apresentaram toxicidade expressiva, podendo ser utilizada como agente terapÃutico seguro e eficaz.
The aim of this study was to investigate the physicochemical and structural parameters of polysaccharides obtained from Aloe barbadensis leaves and to evaluate the antiviral and cytotoxic activities and procoagulant, anti-bleeding effects. In addition, toxicological analysis was carried out. The pulp was submitted to aqueous extraction (70 ÂC) and the total polysaccharides (PT) obtained by ethanol precipitation, TCA was used to remove the protein contamination. The fractionation of PT with DEAE-celulose resulted in two fractions (PI and PII). The physicochemical characterization showed that PI fraction presents mannose (78,4%), glucose (7,3%), galactose (2,1%), fucose (2,8%) and uronic acid (10,0%). Sulfate esters were not detected in PI fraction. On the other hand, PII fraction presents the monosaccharides mannose (39,2%), glucose (22,2%), galactose (26,3%), arabinose (3,8%), xylose (1,1%), uronic acids (8,0%) and sulfate esters groups (12,0%). The polysaccharidics of PII obtained by PAGE and agarose gel electrophoresis were revealed with toluidine blue and stainsall dye showing the presence of two different bands, one purple (indicative of sulfate) and another cyan (indicative of carboxilated groups). Structural analysis of PI and PII fractions by IR spectroscopy demonstrated that PI fraction is composed of residues of Ã-mannose O-acetylated (812.2 and 960 cm-1) and uronic acids (1738 cm-1). In contrast, the PII fraction is composed of mannose (1014.7 cm-1), galactose (1078.2 cm-1), negatively charged uronic acids (1635 cm-1) and sulfate ester (1329.5 and 1260.9 cm-1). These results corroborate with NMR analyses that suggest the presence of sulfate groups in PII structure. The cytotoxicity evaluation showed that PT and the fractions PI and PII did not show toxicity against most of tested cells and the same fractions were not effective against non-enveloped virus (Ad 19 and Ad 41) inhibition. However, the PT and PI fraction were able to inhibit the infection caused by HSV-1 and HSV-2. In addition, PII fraction presents antiviral activity against metapneumovirus. Although the PT and the fractions PI and PII did not show activity against dengue virus serotype 1 (DENV-1), PT could inhibit the bleeding effects in rats, reducing the bleeding and prothrombin time. The PT showed no toxicity in mice, but increased spleen size and number of blood platelets. In conclusion, A. barbadensis leaves contain neutral or negatively charged carboxylated/sulfated polysaccharides. In addition, besides having inhibitory activity against HSV-1, HSV-2 and HMPV, they can also anti-bleeding and procoagulant effect. Moreover, the PT of A. barbadensis showed no significant toxicity and can be used as a safe and effective therapeutic agent.

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Madelain, Vincent. "Modélisation de l’effet du favipiravir sur la dynamique viro-immunologique de la maladie à virus Ebola et implications pour son évaluation clinique." Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2018. http://www.theses.fr/2018USPCC049.

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Abstract:

En dépit d’épidémies répétées, il n’existe pas à ce jour de thérapeutique ayant démontré son efficacité dans la maladie à virus Ebola. Sur la base d’expérimentations réalisées chez la souris et le macaque dans le cadre du consortium Reaction!, l’objectif de cette thèse visait à caractériser l’effet d’une molécule antivirale, le favipiravir, via l’implémentation de modèles mathématiques mécanistiques de l’infection et de la réponse immunitaire associée. L’approche utilisée pour construire ces modèles et en estimer les paramètres reposait sur les modèles non linéaires à effets mixtes. Un premier travail a permis d’explorer la relation concentration-effet sur la charge virale plasmatique chez la souris. Le second projet a conduit à caractériser la pharmacocinétique non linéaire dose et temps dépendante du favipiravir chez le macaque, en vue d’identifier les schémas posologiques pertinents pour la réalisation des études d’efficacité chez l’animal infecté. Au décours de leur réalisation, l’intégration des données virologiques et immunitaires générées au sein d’un modèle conjoint a permis de caractériser un effet modéré du favipiravir sur la réplication virale, mais suffisant pour limiter le développement d’une réaction inflammatoire délétère, et ainsi améliorer le taux de survie des animaux traités. Les simulations réalisées avec ce modèle ont pu souligner l’impact déterminant du délai d’initiation du traitement sur la survie. Ces résultats incitent à la poursuite de l’évaluation clinique du favipiravir, en favorisant des essais de prophylaxie ou post exposition. Enfin, un dernier travail a démontré l’absence de potentialisation du favipiravir par la ribavirine dans Ebola
In spite of recurrent outbreaks, no therapeutics with demonstrated clinical efficacy are available in Ebola virus disease. Based on experimentations performed by Reaction! Consortium in mice and macaques, this thesis aimed to characterize the effect of an antiviral drug, favipiravir, using mechanistic mathematical models of the infection and associated immune response. The approach to build models and estimate parameters relied on nonlinear mixed effect models. The first project of this thesis explored the concentration-effect relationship on the viremia in mice. Then, a second project allowed to characterize the pharmacokinetics of favipiravir in macaques, underlying dose and time non linearity, and to identify relevant dosing regimen for efficacy experiments in infected animals. Once these experiments completed, the integration of the virological and immunological data into a mechanistic joint model shed light on the effect of favipiravir. The moderate inhibition of the viral replication resulting from the favipiravir plasma concentrations was enough to limit the development of a deleterious inflammatory response, and thus improve the survival rate of treated macaques. Simulations performed with this model underlined the crucial impact of the treatment initiation delay on survival. These results encourage the pursuit of the clinical evaluation of favipiravir in prophylaxis or post exposure trials. Finally, a last project demonstrated the lack of benefit of ribavirin addition to favipiravir in Ebola virus disease

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Biziagos, Evangélos. "Virus de l'hépatite A, méthodes d'étude dans les milieux hydriques : effet de substances antivirales sur la multiplication in vitro." Lyon 1, 1989. http://www.theses.fr/1989LYO10192.

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Abstract:

La mise au point de protocoles experimentaux pour la detection du virus de l'hepatite a (vha) dans les milieux hydriques et pour le criblage de substances actives sur sa multiplication in vitro a ete realisee. Apres avoir contamine experimentalement par le vha divers types d'eau, le virus a ete efficacement concentre par adsorption-elution sur membranes et precipitation par le polyethylene glycol 6000 (peg 6000). D'autre part, l'utilisation d'une methode d'extraction par elution et concentration par double precipitation par le peg 6000, a permis la recuperation du virus a partir de boues et de chair d'huitres experimentalement contaminees. Ces methodes ont ete appliquees avec succes pour la recherche de souches sauvages du virus dans l'environnement. Le vha est un virus tres resistant. La contamination experimentale d'une eau potable a montre que ce virus est stable a 4c pendant plusieurs mois et la perte complete de son infectiosite n'est obtenue qu'apres un an d'incubation a temperature ambiante. Apres le developpement d'un protocole de criblage de molecules capables d'inhiber la multiplication in vitro du virus, trois composes se sont reveles actifs et deux d'entre eux ont ete etudies de maniere detaillee, l'atropine et la protamine. La premiere a un effet prophylactique et agit aux premiers stades de la multiplication virale, probablement sur l'adsorption et/ou la decapsidation virale. La seconde est active sur la multiplication du virus jusqu'a la 6#e#m#e heure apres infection et son effet est irreversible. Elle pourrait agir au niveau de l'etape de la transcription. L'association des ces deux composes a, en outre, un effet synergique contre la multiplication du vha

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Biziagos, Evangélos. "Virus de l'hépatite A méthodes d'étude dans les milieux hydriques : effet de substances antivirales sur la multiplication in vitro /." Grenoble 2 : ANRT, 1988. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37611956x.

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Benedetti, Natália Augusto [UNESP]. "Avaliação da atividade antiviral dos compostos do esmalte de unha (acetato de etila e acetato de butila) no herpesvírus bovino tipo 5." Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2016. http://hdl.handle.net/11449/137910.

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Abstract:

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Rejected by Felipe Augusto Arakaki (arakaki@reitoria.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: A versão final da dissertação/tese deve ser submetida no formato PDF (Portable Document Format). O arquivo PDF não deve estar protegido e a dissertação/tese deve estar em um único arquivo, inclusive os apêndices e anexos, se houver. Por favor, corrija o formato do arquivo e realize uma nova submissão. Agradecemos a compreensão. on 2016-04-07T18:21:01Z (GMT)
Submitted by NATÁLIA AUGUSTO BENEDETTI null (benedetti@fmb.unesp.br) on 2016-04-12T15:26:01Z No. of bitstreams: 1 dissertação final abril 2016.pdf: 1048311 bytes, checksum: 20ef19de54a6fc1bc779302643956cce (MD5)
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O Sistema de Vigilância Sanitária da Itália detectou 445 casos de hepatite B e 69 de hepatite C, relacionados aos tratamentos de beleza. Fato esse alarmante, pois, os cuidados com a aparência, têm levado a população a buscar os padrões de beleza estabelecidos pela mídia. Destacando-se que os salões de beleza no Brasil estão cada vez mais comuns com a atuação dos profissionais de manicure e pedicure. Entretanto, os produtos cosméticos necessitam de uma avaliação da qualidade sanitária, ou seja, testes que indicam a quantidade de micro-organismos viáveis em cada amostra. Pois, evidências mostram a sobrevivência dos Trichophytonrubrum, Trichopyton mentagrophytes, Candida albicans, Candida parapsilosis no esmalte de unha. Todavia, a composição e a fabricação do esmalte são pouco conhecidas, devido várias etapas estarem envolvidas na produção dos esmaltes de unhas comuns. Objetivo: Avaliar a ação dos solventes presentes no esmalte de unha, o acetato de etila e o acetato de butila, sobre o herpes vírus bovino tipo 5. Método: Realizou ensaios da atividade antiviral nas diferentes fases do ciclo replicativo com os solventes, acetato de etila e o acetato de butila. Resultados: No pré-tratamento, não houve replicação viral no acetato de etila a partir da diluição 10-6 e no acetato de butila 10-5 . No póstratamento não houve replicação viral no acetato de etila a partir da diluição 10-7 e no acetato de butila 10-5 e na inativação viral, tanto o acetato de etila como o butila, após 48 e 72 horas, todas as diluições apresentaram replicação viral, 10-1 a 10-10 . Discussão: Apesar de não identificar na literatura relatos específicos sobre solventes acetato de etila e acetato de butila na atividade antiviral, o presente estudo evidenciou que apesar de pouca diferença entre as diluições sequenciais desses solventes, houve replicação viral em diluições mais concentradas de vírus e de solventes. A limitação do estudo, com o uso do esmalte de unha, se deu pelo fato deste produto não ser diluído em meio de cultura para células em sua totalidade, além de conter substâncias muito voláteis que secam o produto rapidamente. Conclusão: Concluiu-se que houve replicação viral nas diferentes diluições, em maior concentração de solvente e maior número de vírus. Para diminuir o risco de contaminação cruzada da população pela disseminação de micro-organismos, mostra a necessidade dos órgãos fiscalizadores atuarem mais nesses estabelecimentos, educando e verificando a rotina do trabalho desses profissionais.
The Health Surveillance System in Italy detected 445 cases of hepatitis B and 69 hepatitis C related to beauty treatments. These alarming facts, for care of the appearance have led people to look for the beauty standards set by the media. If highlighting the beauty salons in Brazil is becoming more common with the activities of manicure and pedicure professionals. However, cosmetic products require a quality assessment of the health, is tests which indicate the amount of viable microorganisms in each sample. For evidence shows the survival of Trichophyton rubrum, Trichophyton mentagrophytes, Candida albicans, Candida parapsilosis in nail polish. However, the enamel composition and manufacturing are little known due several steps are involved in the production of common nail enamels. Objective: To evaluate the action of solvents present in nail enamel, ethyl acetate and butyl acetate, about herpesvirus bovine type 5. Method: The antiviral activity test performed at different stages of the replicative cycle of the solvents, ethyl acetate and butyl acetate. Results: In the pre-treatment, there was no viral replication in the ethyl acetate dilution from 10-6 to 10-5 in butyl acetate. In the post-treatment there was no viral replication in ethyl acetate from the dilution 10-7 and 10-5 butyl acetate and viral inactivation, both the ethyl acetate and the butyl after 48 and 72 hours, all dilutions they showed viral replication, 10-1 to 10-10 . Discussion: Although not identify the specific reports literature solvents ethyl acetate and butyl acetate in antiviral activity, this study showed that despite little difference between serial dilutions of these solvents, there viral replication in more concentrated dilutions of virus and solvents. A limitation of the study, using the nail polish, was due to the fact that this product is not be diluted in culture medium to cells in its entirety, and contain highly volatile substances that dry the product quickly. Conclusion: We conclude that there was viral replication in the different dilutions, higher solvent concentration and a higher number of viruses. To reduce the risk of cross-contamination of the population by the spread of micro-organisms, it shows the need for regulatory agencies act more in these establishments, educating and checking the routine work of these professionals.

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Benedetti, Natália Augusto. "Avaliação da atividade antiviral dos compostos do esmalte de unha (acetato de etila e acetato de butila) no herpesvírus bovino tipo 5." Botucatu, 2016. http://hdl.handle.net/11449/137910.

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Abstract:

Orientador: Ione Corrêa
Resumo: O Sistema de Vigilância Sanitária da Itália detectou 445 casos de hepatite B e 69 de hepatite C, relacionados aos tratamentos de beleza. Fato esse alarmante, pois, os cuidados com a aparência, têm levado a população a buscar os padrões de beleza estabelecidos pela mídia. Destacando-se que os salões de beleza no Brasil estão cada vez mais comuns com a atuação dos profissionais de manicure e pedicure. Entretanto, os produtos cosméticos necessitam de uma avaliação da qualidade sanitária, ou seja, testes que indicam a quantidade de micro-organismos viáveis em cada amostra. Pois, evidências mostram a sobrevivência dos Trichophytonrubrum, Trichopyton mentagrophytes, Candida albicans, Candida parapsilosis no esmalte de unha. Todavia, a composição e a fabricação do esmalte são pouco conhecidas, devido várias etapas estarem envolvidas na produção dos esmaltes de unhas comuns. Objetivo: Avaliar a ação dos solventes presentes no esmalte de unha, o acetato de etila e o acetato de butila, sobre o herpes vírus bovino tipo 5. Método: Realizou ensaios da atividade antiviral nas diferentes fases do ciclo replicativo com os solventes, acetato de etila e o acetato de butila. Resultados: No pré-tratamento, não houve replicação viral no acetato de etila a partir da diluição 10-6 e no acetato de butila 10-5 . No póstratamento não houve replicação viral no acetato de etila a partir da diluição 10-7 e no acetato de butila 10-5 e na inativação viral, tanto o acetato de etila como o butila, após 48 e ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo)
Abstract: The Health Surveillance System in Italy detected 445 cases of hepatitis B and 69 hepatitis C related to beauty treatments. These alarming facts, for care of the appearance have led people to look for the beauty standards set by the media. If highlighting the beauty salons in Brazil is becoming more common with the activities of manicure and pedicure professionals. However, cosmetic products require a quality assessment of the health, is tests which indicate the amount of viable microorganisms in each sample. For evidence shows the survival of Trichophyton rubrum, Trichophyton mentagrophytes, Candida albicans, Candida parapsilosis in nail polish. However, the enamel composition and manufacturing are little known due several steps are involved in the production of common nail enamels. Objective: To evaluate the action of solvents present in nail enamel, ethyl acetate and butyl acetate, about herpesvirus bovine type 5. Method: The antiviral activity test performed at different stages of the replicative cycle of the solvents, ethyl acetate and butyl acetate. Results: In the pre-treatment, there was no viral replication in the ethyl acetate dilution from 10-6 to 10-5 in butyl acetate. In the post-treatment there was no viral replication in ethyl acetate from the dilution 10-7 and 10-5 butyl acetate and viral inactivation, both the ethyl acetate and the butyl after 48 and 72 hours, all dilutions they showed viral replication, 10-1 to 10-10 . Discussion: Although not identify the sp... (Complete abstract click electronic access below)
Mestre

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Duraffour, Sophie. "Utilisation de différents orthopoxvirus pour le développement de modèles substitutifs du virus de la variole afin d'évaluer l'activité antivirale." Aix-Marseille 2, 2008. http://www.theses.fr/2008AIX20663.

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Abstract:

A l’heure actuelle, le risque de réémergence de la variole n’est pas négligeable. Bien qu’une vaccination antivariolique efficace soit disponible en France, son utilisation reste contre-indiquée chez de nombreux sujets et notamment chez les individus immunodéprimés ou atopiques. Afin de traiter les infections à poxvirus, les recherches se sont orientées vers la sélection et la caractérisation de molécules antivirales actives et non toxiques. Dans cette thématique, nous avons développé trois types de recherches qui sont : (i) la caractérisation enzymatique de la protéine uracile ADN glycosylase du virus monkeypox, essentielle à la réplication virale et donc cible potentielle d’un traitement antiviral; (ii) le développement d’un modèle substitutif du virus de la variole, les modèles in vitro, ex vivo et in vivo du virus camelpox ; et enfin (iii) l’étude du mode d’action de la molécule ST-246 contre trois Orthopoxvirus, les virus de la vaccine, cowpox et camelpox
The intentional release of smallpox by bioterrorists is considered to be a significant threat. Although effective smallpox vaccines are available, adverse events to vaccination particularly in immunosupressed individuals can be life threatening. Thus, researches in the field of highly potent antiviral against poxviruses have been intensified. Here we report the use and the development of surrogate models of variola virus, using several related Orthopoxviruses, to study anti-poxviral compounds. We (i) characterized the DNA repair protein uracil-DNA glycosylase of monkeypox virus, which is essential for orthopoxvirus replication and thus its inhibition is a rational therapeutic strategy, (ii) developed in vitro, ex vivo and in vivo surrogate model of variola virus by using its closest known related virus, camelpox virus; and (iii) investigated the mode of action of a novel anti-orthopoxvirus molecule, ST-246, against three Orthopoxviruses, vaccinia, cowpox and camelpox viruses

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Riegger, David Martin [Verfasser], and Georg [Akademischer Betreuer] Kochs. "Die Plastizität des Nukleoproteins von Influenza-A-Virus erlaubt unterschiedliche Strategien dem antiviralen Effekt der Mx- Proteine auszuweichen." Freiburg : Universität, 2015. http://d-nb.info/1166053458/34.

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Grifon, Jean-François. "Analogues nucléosidiques inédits d'anomérie Bêta et d'énantiomérie non naturelle L : synthèse, propriétés antitumorales et antivirales de dérivés de la 5-fluorouracile et de la 5-fluorocytosine." Montpellier 2, 1998. http://www.theses.fr/1998MON20011.

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Abstract:

Afin de parvenir a de nouveaux composes efficaces en chimiotherapie tant anticancereuse qu'antivirale (sida, l'hepatite b, etc) une serie d'analogues nucleosidiques inedits d'anomerie beta et d'enantiomerie non naturelle l de la 5-fluorouracile et de la 5-fluorocytosine, a ete abordee. Apres avoir rappele, dans un premier chapitre, les bases fondamentales des chimiotherapies antitumorale et antivirale ainsi que les potentialites curatives des analogues nucleosidiques d'enantiomerie non naturelle l, nous avons decris, dans un deuxieme chapitre, la synthese des beta-l-pentofuranonucleosides de la 5-fluorouracile et de la 5-fluorocytosine, ainsi que celle de leurs derives desoxygenes en position 2' et/ou 3'. Les deux chapitres suivants ont ete consacres a l'etude de l'influence de l'introduction d'un atome de fluor, d'un groupement azido ou d'une insaturation en position 2'-3' des beta-l-pentofuranonucleosides de la 5-fluorouracile et de la 5-fluorocytosine. Parmi l'ensemble des nouveaux composes synthetises, certains ont presentes des activites cytostatiques significatives vis-a-vis de differentes souches de cellules tumorales. Plus important, des activites anti-vhb remarquables ont pu etre mises en evidence pour six de ces composes.

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Flusin, Olivier. "Stratégies de lutte contre des virus du risque infectieux : perspectives thérapeutiques contre les nairovirus et les orthopoxvirus." Paris 7, 2012. http://www.theses.fr/2012PA077054.

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Abstract:

Les infections au virus de la fièvre hémorragique de Crimée-Congo (CCHFV) et au virus de la variole (VARV), pour lesquelles aucun traitement n'est officiellement approuvé, constituent un risque réel pour les armées françaises en raison de la spécificité de leurs missions. Les travaux réalisés au cours de cette thèse décrivent l'utilisation de deux stratégies permettant l'identification de molécules inhibant des protéines et complexes moléculaires impliqués dans la réplication du génome du nairovirus Hazara (HAZV) et de l'orthopoxvirus de la vaccine (VACV), modèles substitutifs respectifs du CCHFV et du VARV. Dans une première étude, l'activité de plusieurs petits ARN interférents (siRNAs) ciblant les ARN messagers du HAZV a été évaluée en culture cellulaire. Nous avons montré que deux siRNAs dirigés contre les transcrits codant la nucléoprotéine permettent de réduire de plus de 90% la production des particules virales infectieuses. L'association de la ribavirine avec chacun des deux siRNAs induit un effet synergique ou additif sur l'inhibition de la réplication du HAZV. Dans une seconde étude, nous avons adapté la technique du double hybride en levure afin de réaliser un criblage haut débit permettant la sélection de modulateurs d'interactions protéine-protéine au sein du complexe de réplication du VACV. Nous avons identifié deux molécules dont l'activité antivirale in vitro est spécifique des OPV. Leur action est associée également à une inhibition de la synthèse du génome viral. Nos travaux suggèrent que les deux stratégies mises en place peuvent contribuer au développement de futurs traitements contre les infections à nairovirus et à OPV
Crimean-Congo hemorrhagic fever virus (CCHFV) and smallpox virus (VARV) infections, for which there are no licensed antiviral therapeutics, represent a significant threat to the strategic and operational missions of the French armed forces. Here, we reported two strategies used to identity novel antiviral compounds that are specifically effective in inhibiting proteins and molecular complexes involved in genome replication of Hazara nairovirus (HAZV) and vaccinia orthopoxvirus (VACV), respective surrogate models of CCHFV and VARV. In a first study, the activity of small interfering RNA (siRNAs) targeting the HAZV mRNA was evaluated in cell culture. We were able to identify two siRNAs directed against the transcripts encoding the nucleoprotein that reduced the production of infectious HAZV particles by over 90%. The combination of ribavirin with siRNAs induced an additive, or synergistic, effect on HAZV replication inhibition. In a second study, we adapted the yeast two-hybrid technique in order to perform a high throughput screening for the selection of protein-protein interaction modulators within the VACV replication complex. We identified two molecules that specifically inhibit orthopoxvirus (OPV) replication in vitro. Furthermore, we showed that both compounds interfere with the VACV genome synthesis. The initial results of this work indicate the potential of these two strategies to be applied for the development of future treatments against nairovirus and OPV infections

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Kim, Dong Hyun. "Investigation of HIV anti-viral drug effect on HPV16 E6 expressing cervical carcinoma cells using advanced metabolomics methods." Thesis, University of Manchester, 2011. https://www.research.manchester.ac.uk/portal/en/theses/investigation-of-hiv-antiviral-drug-effect-on-hpv16-e6-expressing-cervical-carcinoma-cells-using-advanced-metabolomics-methods(d52b3b66-2a7b-4577-a334-b74bc12b27cc).html.

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Abstract:

Metabolomics approaches have recently been used to understand the complex molecular interactions of biological systems. One popular area in which these methods are being developed is to understand the biochemical changes during abiotic and biotic stresses; for example, how a cell may respond to a drug. Since metabolites are the end products of gene expression, these can be used to indicate the result of the activities and interaction of the cell or organism with its environment. The investigation of the level and compositional changes of metabolites against metabolic stresses such as chemotherapeutic treatment (drug exposure) are required to understand more fully abiotic perturbation to biological systems. The aim of this project was to understand the metabolic effect that the anti-viral drugs indinavir and lopinavir (currently used by HIV patients) have on HPV-related cervical cancer cell lines by measuring changes in metabolism using a wide range of analytical techniques; including Fourier transform infrared (FT-IR) and Raman spectroscopies, and gas and liquid chromatography-mass spectrometry (GC and LC-MS). The analyses and interpretation of the large volumes of complex multidimensional data generated by metabolomics approaches were performed with a combination of multivariate data analysis techniques such as principal components analysis (PCA) and canonical variates analysis (CVA), as well as univariate approaches such as N-Way analysis of variance (ANOVA). By combining biochemical imaging, metabolite fingerprinting and footprinting, and metabolite profiling, with multi- and uni-variate analyses, the actions and effects of the anti-viral drugs were investigated. FT-IR spectroscopy was initially used to generate global biochemical finger- and foot-prints, and Raman spectroscopy was employed to investigate intracellular distribution of metabolites, and other cellular species, as well as the localisation of drug molecules within cells. FT-IR spectroscopy ascertained that the intra- and extra-cellular metabolomes were being directly influenced in a fashion that correlated with increasing anti-viral dosing; these effects were phenotypic rather than measurements of the drug level. Raman imaging spectroscopy indicated that the indinavir but not lopinavir was being compartmentalised within the cell nucleus, but only in HPV early protein 6 (E6) expressing cells. This observation was further confirmed by fractionation of cell samples into nuclear and cytoplasmic fractions and assessing the indinavir concentrations via LC-MS. Finally, LC-MS and GC-MS metabolite profiling were employed to investigate changes in the intracellular metabolome in response to the anti-viral compounds across a range of physiologically relevant concentrations and in the presence and absence of the E6 oncoprotein. General effects of both anti-viral compounds included the regulation of metabolites such as glutathione, octenedionoic and octadecenoic acids, which may be involved in stress related responses, reduced levels of sugars and sugar-phosphates indicating a potential arrest of glycolysis, and reduced levels of malic acid indicating potential decreased flux into the TCA cycle; all indicating that central metabolism was being reduced. Finally, LC-MS based quantification indicated that in the presence of E6, lopinavir was actively removed from the cell, whereas the indinavir intracellular concentration increased concomitantly with the level of dosing. These investigations have revealed that metabolomics approaches are an apt tool for the study of anti-viral effects within cell cultures, but improvements need to be made with respect to the major limitation of metabolite identification.

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Mamode, Habib Karim. "Interactions médicamenteuses avec les médicaments antirétroviraux." Paris 5, 1996. http://www.theses.fr/1996PA05P013.

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Nguyen, Thi Huyen Tram. "Handling data below the quantification limit in viral kinetic modeling for model evaluation and prediction of treatment outcome." Paris 7, 2014. http://www.theses.fr/2014PA077224.

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Abstract:

Les modèles de cinétique virale (VK) aident à comprendre le cycle de vie du virus de l'hépatite C et les mécanismes d'action des antiviraux. Inclure des informations pharmacocinétiques (PK) dans ces modèles permet de mieux comprendre la réponse virologique. Ces modèles pourraient aider à prédire l'issue du traitement pour chaque patient et personnaliser le traitement. Les données sous la limite de quantification (LOQ) sont très fréquentes dans la modélisation VK. L'impact de ces données et la méthode pour en tenir compte dans l'évaluation de modèle et la prédiction de la réponse thérapeutique sont encore en question. On a étendu l'erreur de prédiction de distribution (pd) et l'erreur de prédiction de distribution décorrélée normalisée (npde) pour tenir compte des données sous LOQ. Les métriques étendues ont de meilleurs comportements, avec de satisfaisantes erreurs de type I et puissances, que les méthodes omettant les données sous LOQ. On a construit un modèle PK¬VK pour caractériser la VK sous l'alisporivir donné avec ou sans peg-IFN. Le modèle a fourni de bonnes prédictions pour les réponses virologiques sous différentes combinaisons et doses de l'alisporivir dans une autre étude. On a aussi étudié plusieurs facteurs qui peuvent influer la prédiction de la réponse thérapeutique individuelle tels que les méthodes de traitement des données BQL, le protocole de prélèvement et l'information a priori sur les paramètres de population. On a montré que l'approche bayésienne pouvait donner de bonnes prédictions à partir de quelques premières réponses, à condition que les données sous LOQ soient correctement prises en compte et l'information a priori soit disponible
Viral kinetic (VK) models are useful tools to understand the lifecycle of hepatitis C virus and the mechanisms of action of antiviral agents. The understanding of virologic response can be improved by including pharmacokinetic (PK) information. VK model might also be useful to predict individual treatment outcome and support treatment personalization. One common problem in VK modeling is data below the quantification limit (BQL). However the impact of these data on model evaluation and treatment response prediction and how to properly handle them in these steps are still in question. We extended prediction discrepancies (pd) and normalized prediction distribution errors (npde) to handle BQL data and evaluated them in a simulation study. The extended metrics have better performance with satisfactory type I errors and powers, compared to the methods omitting BQL data. We developed a PK-VK model to characterize the VK to alisporivir, a cyclophillin inhibitor, given in with or without peg-IFN. The model provided good predictions for the virologic responses (BQL data fraction and SVR rate) for different combinations and doses of alisporivir in another study. We also studied by simulation the use of VK model to predict individual treatment outcome and evaluated several factors that can impact this prediction: methods for handling BQL data, design and a priori information on population parameters. We showed that Bayesian estimation of individual parameters can give good predictions for treatment outcome from only few early responses, provided that BQL data are correctly handled and correct a,priori information is available

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Yvon, Anne. "Etude des bases moléculaires de la résistance du virus de l'immunodéficience humaine 1 à la stavudine et la lamivudine en combinaison "in vitro"." Paris 5, 1997. http://www.theses.fr/1997PA05P020.

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Dioszeghy, Vincent. "Etude des activités antivirales solubles non cytolytiques des lymphocytes CD8+ au cours de l'infection par SIV : Effet d'un traitement par polychimiothérapie post-exposition, effet d'un traitement immuno-modulateur par l'interleukine 2 et mécanismes de reconstitution lymphocytaire T CD4+." Paris 11, 2006. http://www.theses.fr/2006PA11T012.

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Bonnet, Fabrice. "Evolution de la concentration plasmatique des marqueurs lipidiques et des récepteurs solubles du TNF-alpha et de l'interleukine-2 chez des patients infectés par le VIH et traités par antiprotéases." Bordeaux 2, 1999. http://www.theses.fr/1999BOR23087.

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Blanchandin, Laure. "Traitement ambulatoire dans l'infection par le virus de l'immunodéficience humaine : organisation de la prescription, de la dispensation et de l'information d'un malade suivi à l'hôpital X. Bichat-C. Bernard." Paris 5, 1997. http://www.theses.fr/1997PA05P029.

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Thöni, Gilles. "Anomalies métaboliques du patient infecté par le Virus de l'immunodéficience humaine (VIH) sous multithérapie antirétrovirale : vers une individualisation de la prise en charge par l'entraînement aérobie." Montpellier 1, 2002. http://www.theses.fr/2002MON14007.

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Abstract:

Parallelement a l'introduction des nouvelles molecules antiretrovirales, beaucoup de patients infectes par le vih ont vu se developper des anomalies de la repartition des graisses, des dyslipidemies, et/ou des anomalies du metabolisme oxydatif. Notre travail s'interesse aux procedures d'entrainement physique a preconiser dans la prise en charge de ces desordres. Une analyse des desordres metaboliques au repos et de la tolerance a l'exercice aigu nous a incite a proposer un entrainement prolonge au seuil ventilatoire. Ce type d'entrainement favorise une reduction de la masse grasse viscerale et une amelioration des parametres biologiques en faveur d'une reduction du risque cardio-vasculaire. L'efficacite de l'entrainement a ete evaluee selon l'age des patients. Sur le plan de l'accumulation adipeuse et des anomalies lipidiques, l'entrainement est benefique a tous les patients mais plus specialement aux patients les plus ages. Les alterations des reponses du metabolisme oxydatif a l'entrainement dans ce groupe suggerent le developpement d'une dysfonction mitochondriale avec le vieillissement, mais les benefices sur le risque cardio-vasculaire restent entiers. Nos travaux demontrent donc l'interet de l'exercice physique dans la prise en charge des anomalies metaboliques associes aux therapies antiretrovirales.

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Canini, Laetitia. "Dynamique de l'infection grippale : modélisation et applications." Phd thesis, Paris 6, 2012. http://www.theses.fr/2012PA066158.

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Abstract:

L'objectif principal de cette thèse était de définir un ensemble d'outils méhodologiques pour décrire et étudier la dynamique de la grippe et les paramètres de l'hitsoire naturelle. La cinétique virale (VK) de la grippe est utilisé pour représenter l'infectiosité, qui est la capacité à transmettre l'infection, alors que l'histoire naturele est décrite par la dynamique des symptômes (SD). Nous avons développé un modèle de cinétique virale/dynamique des symptômes (VKSD) basé sur approche de population. Notre modèle prolonge des travaux précédents en incluant la réponse immunitaire innée et en apportant des estimations réalistes des paramètres de l'infection et de la maladie, en prenant en compte la variabilité interindividuelle. Le choix d'un protocole d'étude est crucial pour estimer précisement les paramètres du modèle. Dans ce but nous avons optimisé un ensemble de protocoles afin qu'ils soient économiques et faciles à mettre en place pour aider à la mise en place de futures études. Enfin, nous avons réalisé une étude in silico pour étudier les effets des inhibiteurs de neuraminidases sur l'infection grippale et la maladie ainsi que sur l'émergence de virus résistants. Nous avons exploré l'efficacité de l'oseltamivir pour différentes posologies, chez des sujets sains ou immunodéficients et pour différentes dates de début de traitement. Nous avons identifié les situations pour lesquelles le traitement entraîne un équilibre efficacité/faible émergence de virus résistant. Cette thèse souligne l'importance d'acquérir des connaissance sur la dynamique de l'infection grippale afin de faire face aux épidémies/pandémies et d'en atténuer l'impact
The main objective of this PhD was to define a set of methodological tools to describe and study the time course of influenza and its natural history parameters. The principal work was the development of a model to describe influenza infection and illness timeline. Influenza virus kinetics (VK) is used as a surrogate of infectiousness, while the natural history of influenza is described by symptom dynamics (SD). We developped an original virus kinetics/symptom dynamics (VKSD) model based on a population approach. Our approach extends previous works by including the innate response and providing realistic estimates of infection and illness parameters, taking into account the strong interindividual variability. The choice of the study design is crucial to accurately estimate the model parameters. For this purpose we performed an optimal design analysis to propose cost-effective and practical designs. A set of designs adapted to study influenza VK, innate immune response and/or SD was elaborated and could help design further studies on influenza viral kinetics with decreased discomfort and cost. Finally, we realised an in silico analysis studying the effect of neuraminidase inhibitors on influenza infection and illness and on resistance emergence. We explored oseltamivir efficacy through simulated pharmacokinetics for differents regimens, in immunocompetent or immunodeficient subjects. We identified the situations leading to a balance between efficacy and resistance emergence. This work point out the importance of learning as much as we can about dealing with influenza infection and mitigating its impact

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Canini, Laetitia. "Dynamique de l'infection grippale : modélisation et applications." Phd thesis, Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00827770.

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Abstract:

L'objectif principal de cette thèse était de définir un ensemble d'outils méhodologiques pour décrire et étudier la dynamique de la grippe et les paramètres de l'hitsoire naturelle. La cinétique virale (VK) de la grippe est utilisé pour représenter l'infectiosité, qui est la capacité à transmettre l'infection, alors que l'histoire naturele est décrite par la dynamique des symptômes (SD). Nous avons développé un modèle de cinétique virale/dynamique des symptômes (VKSD) basé sur approche de population. Notre modèle prolonge des travaux précédents en incluant la réponse immunitaire innée et en apportant des estimations réalistes des paramètres de l'infection et de la maladie, en prenant en compte la variabilité interindividuelle. Le choix d'un protocole d'étude est crucial pour estimer précisement les paramètres du modèle. Dans ce but nous avons optimisé un ensemble de protocoles afin qu'ils soient économiques et faciles à mettre en place pour aider à la mise en place de futures études. Enfin, nous avons réalisé une étude in silico pour étudier les effets des inhibiteurs de neuraminidases sur l'infection grippale et la maladie ainsi que sur l'émergence de virus résistants. Nous avons exploré l'efficacité de l'oseltamivir pour différentes posologies, chez des sujets sains ou immunodéficients et pour différentes dates de début de traitement. Nous avons identifié les situations pour lesquelles le traitement entraîne un équilibre efficacité/faible émergence de virus résistant. Cette thèse souligne l'importance d'acquérir des connaissance sur la dynamique de l'infection grippale afin de faire face aux épidémies/pandémies et d'en atténuer l'impact

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Kourjian, Georgio. "Effect of HIV antiretroviral drugs on antigen processing and epitope presentation by MHC-I to cytotoxic T cells." Thesis, Strasbourg, 2015. http://www.theses.fr/2015STRAJ027/document.

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Abstract:

L’apprêtement antigénique par les protéases intracellulaires et la présentation des épitopes sont essentiels pour la reconnaissance des cellules infectées par les lymphocytes CD8+. Ici nous avons montré que certains inhibiteurs de la protéase de la VIH (IPs) modulent l’activité de la protéasome et aminopeptidase impliqué dans l’apprêtement antigénique endogène et l’activité cathepsins importante dans l’apprêtement croisée. Deux IPs agissent directement sur les cathepsins et leurs régulateurs en inhibant les activités kinase, NOX2 et en régulant le pH phagolysosomal. Les IPs ont changé la dégradation des protéines viral et la production des épitopes de façon séquence- et cellule-spécifique, ont altéré la présentation direct et croisée des épitopes, et ont partiellement changé l’auto-peptidome des cellules primaires. La modulation par les drogues de l’apprêtement et la présentation des épitopes peut fournir une approche thérapeutique alternative pour moduler la reconnaissance immunitaire
Antigen processing by intracellular proteases and peptidases and epitope presentation are critical for recognition of pathogen-infected cells by CD8+ T lymphocytes. Here we show that several HIV protease inhibitors (PIs) prescribed to HIV-infected persons variably modulate proteasome and aminopeptidase activities involved in endogenous antigen presentation and cathepsin activities involved in antigen cross-presentation. Two HIV PIs acted directly on cathepsins and on their regulators by inhibiting kinases, NOX2 and the regulation of phagolysosomal pH, subsequently enhancing cathepsin activities. HIV PIs modified HIV protein degradation and epitope production in a sequence- and cell-dependent manner, altered direct- and cross-presentation and T cell-mediated killing, and partly changed the self-peptidome of primary cells. Drug-induced modulation of antigen processing and peptidome may provide an alternate therapeutic approach to modulate immune recognition

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Outlioua, Ahmed. "Exploration des cytokines pro-inflammatoires et de l’inflammasome NLRP3 dans les infections intracellulaires : cas de H. pylori et des virus à ARN Gastric IL-1β, IL-8, and IL-17A expression in Moroccan patients infected with Helicobacter pylori may be a predictive signature of severe pathological stages RNA viruses promote activation of the NLRP3 inflammasome through cytopathogenic effect-induced potassium efflux The heme-regulated inhibitor is a cytosolic sensor of protein misfolding that controls innate immune signaling The Role of Optineurin in Antiviral Type I Interferon Production Possible introduction of Leishmania tropica to urban areas determined by epidemiological and clinical profiles of patients with cutaneous leishmaniasis in Casablanca (Morocco)." Thesis, université Paris-Saclay, 2021. http://www.theses.fr/2021UPASL029.

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Abstract:

Helicobacter pylori (H. pylori) est une bactérie qui infecte l’estomac et induit une gastrite inflammatoire, qui peut être chronique et évoluer vers un cancer gastrique. La sévérité de l’infection et son évolution clinique sont associées aux différents facteurs notamment le statut immunitaire de l’hôte. La réponse inflammatoire initiale à l'infection à H. pylori entraîne la sécrétion d'un large panel de cytokines, notamment l'interleukine-1β (IL-1β), l'IL-8 et l'IL-17A. qui semblent jouer un rôle clé dans l'initiation et la progression du cancer gastrique. Parmi ces cytokines, l'IL-1β est une cytokine clé au cours de l’infection à H. pylori dont l’expression est étroitement associée à l'inflammation gastrique et à la carcinogenèse. La production de cette cytokine dépend de l'activation de l'inflammasome, en particulier l'inflammasome NLRP3. Ce dernier, responsable de l’activation des processus inflammatoires, est essentiel pour le maintien de l'homéostasie contre diverses infections pathogènes telles les infections bactérienne et virale.L’objectif général de ce travail est i) d’étudier l’expression et le polymorphisme des gènes de cytokines comme IL-1β, IL-17 et IL-8 chez des patients marocains infectés par H. pylori. ii) explorer l’activation de l'inflammasome NLRP3 par H. pylori et déterminer les mécanismes impliqués dans l'activation de ce complexe par des virus à ARN ; connus comme des activateurs définis de NLRP3.Nos résultats ont souligné une prévalence élevée de H. pylori et ont mis en évidence une signature cytokinique : elle peut prédire la métaplasie au cours de la progression de l'infection à H. pylori impliquant une diminution de l’expression de l'IL17A dans l’antre et une augmentation de l’expression de l'IL-1β dans le fundus. Plus particulièrement, les polymorphismes génétiques de l’IL-1β (IL-1β -31 et -511) ne semblent pas influencer l’expression de l’IL-1β de manière significative.Au regard des difficultés rencontrés pour l’isolement et la culture de H. pylori, nous avons utilisé le LPS de H. pylori pour stimuler l’inflammasome. Nos résultats montrent que la transfection des cellules in vitro par le LPS bactérien induit la production de l’IL-1β qui semble être modulée par la caspase 4, NOD1 et NOD2. Par ailleurs, bien qu’il soit clairement établi que les virus à ARN induisent l’activation de l’inflammasome NLRP3, les mécanismes par lesquels ces virus induisent la production d'IL-1β ne sont pas bien compris et restent à confirmer. Les résultats de cette partie du travail ont montré que la réplication des virus à ARN cytopathogènes tels que le virus de la stomatite vésiculaire (VSV) ou le virus de l'encéphalomyocardite (EMCV) induit une mort cellulaire lytique conduisant à un efflux de potassium qui déclenche l'activation de l'inflammasome NLRP3. Ainsi, les virus à forte capacité de réplication et qui ont un effet cytopathique sont capables d'induire l'activation de la caspase-1 conduisant à la production d'IL-1β. A l'inverse, les virus qui induisent une très bonne réponse IFN de type I sont de très mauvais inducteurs de l'inflammasome NLRP3.Une meilleure compréhension de l’activation de l’inflammasome pourrait aider dans la mise au point de stratégies thérapeutiques ciblées utilisables dans la lutte contre les infections bactérienne et virale.Mots clés : Helicobacter pylori, inflammation, inflammasome NLRP3, IL-1β, virus à ARN
Helicobacter pylori (H. pylori) is a bacteria that infects the stomach and induces inflammatory gastritis, which can be chronic and progress to gastric cancer. The severity of the infection and its clinical course are associated with various factors including the immune status of the host. The initial inflammatory response to H. pylori infection results in the secretion of a wide range of cytokines, including interleukin-1β (IL-1β), IL-8 and IL-17A. which appear to play a key role in the initiation and progression of gastric cancer. Among these cytokines, IL-1β is a key cytokine during H. pylori infection whose expression is associated with gastric inflammation and carcinogenesis. The production of this cytokine depends on the activation of the inflammasome, in particular the NLRP3 inflammasome. The latter, responsible of the activation of inflammatory processes, is essential for the maintenance of homeostasis against various pathogenic infections such as bacterial and viral infections.The general objective of this work is i) to study the expression and polymorphism of genes for cytokines such as IL-1β, IL-17 and IL-8 in Moroccan patients infected with H. pylori. ii) explore the activation of the NLRP3 inflammasome by H. pylori and determine the mechanisms involved in the activation of this complex by RNA viruses; known as defined activators of NLRP3.Our results underlined a high prevalence of H. pylori and demonstrated a cytokine signature: it can predict metaplasia during the progression of H. pylori infection involving a decrease in IL17A expression in the antrum and increased expression of IL-1β in the fundus. In particular, the genetic polymorphisms of IL-1β (IL-1β -31 and -511) do not appear to influence IL-1β expression significantly.In view of the difficulties encountered in isolating and culturing H. pylori, we used LPS from H. pylori to stimulate the inflammasome. Our results show that the transfection of cells in vitro with bacterial LPS induces the production of IL-1β which appears to be modulated by caspase 4, NOD1 and NOD2. Furthermore, while it is clearly established that RNA viruses induce activation of the NLRP3 inflammasome, the mechanisms by which these viruses induce IL-1β production are not well understood and remain to be confirmed. The results of this part of the work showed that the replication of cytopathogenic RNA viruses such as vesicular stomatitis virus (VSV) or encephalomyocarditis virus (EMCV) induces lytic cell death leading to an efflux of potassium which triggers activation of the NLRP3 inflammasome. Thus, viruses with a high replication capacity and which have a cytopathic effect are capable of inducing the activation of caspase-1 leading to the production of IL-1β. Conversely, viruses which induce type I IFN response are very poor inducers of the NLRP3 inflammasome.A better understanding of the activation of the inflammasome could help in the development of targeted therapeutic strategies for use in the fight against bacterial and viral infections.Key words: Helicobacter pylori, inflammation, NLRP3 inflammasome, IL-1β, RNA virus

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Dissertations / Theses on the topic 'Effet antiviral'

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