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Dissertations / Theses

Academic literature on the topic 'Éléments intégratifs mobilisables (IME)'

Author: Grafiati

Published: 8 June 2024

Last updated: 31 July 2025

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Dissertations / Theses on the topic "Éléments intégratifs mobilisables (IME)"

1

Lao, Julie. "Conception et mise en oeuvre d’une approche bioinformatique dédiée à l’identification des ICE, IME et éléments composites dans les génomes de Firmicutes." Electronic Thesis or Diss., Université de Lorraine, 2021. http://www.theses.fr/2021LORR0063.

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Abstract:

Les ICE (Éléments intégratifs conjugatifs) et les IME (Éléments intégratifs mobilisables) sont des éléments mobiles bactériens qui jouent un rôle clé dans les transferts horizontaux. Ils ont la capacité de s'intégrer et de se transférer par conjugaison d'une bactérie à une autre. Ces éléments sont très répandus dans les génomes bactériens mais sont encore mal connus. Leur identification automatique est un défi et ils ne sont en général pas annotés dans les génomes. Jusqu'à présent, seules deux approches bioinformatiques permettent la détection des ICE et la détection des IME, mais leur fiabili

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2

Coluzzi, Charles. "L'exploration des génomes par l'outil ICEFinder révèle la forte prévalence et l'extrême diversité des ICE et des IME de streptocoques." Thesis, Université de Lorraine, 2017. http://www.theses.fr/2017LORR0352/document.

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Abstract:

Les éléments génétiques mobiles contribuent grandement à la diversité et à l’évolution des génomes bactériens par le biais du transfert horizontal. Parmi eux, les éléments intégratifs conjugatifs (ICE) codent leur propre excision, leur transfert par conjugaison et leur intégration. En revanche, les éléments intégratifs et mobilisables (IME) ne sont autonomes que pour leur excision et intégration et ne codent seulement que certaines des protéines/fonctions (oriT) dont ils ont besoin pour leur transfert conjugatif. Par conséquent, les IME ont besoin d’un élément conjugatif « helper » pour se tra

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3

Bellanger, Xavier. "Transfert, accrétion et mobilisation des éléments intégratifs conjugatifs et des îlots génomiques apparentés de "Streptococcus termophilus" : Un mécanisme clef de l'évolution bactérienne ?" Thesis, Nancy 1, 2009. http://www.theses.fr/2009NAN10125/document.

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Abstract:

Des analyses de génomes avaient suggéré que de nombreux îlots génomiques bactériens seraient des éléments intégratifs conjugatifs (ICE) ou des éléments en dérivant. Les ICE s'excisent sous forme circulaire par la recombinaison site-spécifique, se transfèrent par conjugaison et s'intègrent chez une cellule réceptrice. Les éléments de ce type sont très abondants aux seins des génomes de bactéries et d'archées. Divers îlots génomiques apparentés sont intégrés dans l'extrémité 3' de l'ORF fda chez plusieurs souches de Streptococcus thermophilus. Cette famille inclut 2 éléments intégratifs potentie

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4

Pavlovic, Guillaume. "Evolution d'une famille d'éléments intégratifs potentiellement conjugatifs et/ou mobilisables de Streptococcus thermophilus." Nancy 1, 2004. http://www.theses.fr/2004NAN10009.

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Abstract:

Lors de ce travail, quatre types d'îlots génomiques apparentés à ICESt1 ont été caractérisés. Ils sont intégrés au même site que lui chez sept souches de S. Thermophilus. L'un des éléments, ICESt3 est probablement un ICE. Deux autres types d'éléments, CIME19258 et CIME302 sont flanqués par des sites attL et attR apparentés à ceux d'ICESt1 et d'ICESt3 tandis que DCIME308 possède uniquement un site attR. Ces éléments dérivent d'un ICE par délétion des modules de conjugaison et de recombinaison. La comparaison des ICE et CIME (CIs Mobilisable Element ) de S. Thermophilus et des études fonctionnel

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5

Chaffanel, Fanny. "Diversité génétique et phénotypique d'une collection de souches de Streptococcus salivarius : étude des éléments intégratifs et des capacités d’adhésion aux cellules des écosystèmes digestif et buccal." Thesis, Université de Lorraine, 2016. http://www.theses.fr/2016LORR0070/document.

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Abstract:

Streptococcus salivarius est une bactérie commensale présente dans la cavité buccale et tout au long du tractus digestif (Eckburg et al., 2005; Hao & Lee, 2004). Elle est fréquemment retrouvée attachée à la langue ou aux parois stomacales et intestinales au sein de biofilms (Cvitkovitch et al., 2003). Dans un biofilm, la densité cellulaire implique une proximité physique entre les bactéries de différentes espèces propice aux échanges de gènes entre elles. Ces transferts horizontaux permettent l’acquisition par les bactéries de gènes d’adaptation tels que des gènes de résistance aux antibio

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