Academic literature on the topic 'Énergie de liaison'
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Journal articles on the topic "Énergie de liaison"
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Alcover, J. F., and R. F. Giese. "Energie de liaison des feuillets de talc, pyrophyllite, muscovite et phlogopite." Clay Minerals 21, no. 2 (1986): 159–69. http://dx.doi.org/10.1180/claymin.1986.021.2.05.
Full textAbstract:
ResumeNous présentons une méthode de calcul de l'énergie totale d'une structure cristallińe (énergie électrostatique, énergie de van der Waals, et énergie de répulsion). Nous utilisons ensuite cette méthode pour étudier une série de phyllosilicates (talc, pyrophyllite, muscovite et phlogopite), pour comparer et discuter leurs propriétés physico-chimiques en particulier l'énergi de liaison interfoliaire et la distance interlamellaire. Nous constatons que des méthodes de calcul, basées sur des expressions empiriques différentes de l'énergie de répulsion, conduisent à des résultats relatifs analogues. Nous vérifions que la distance interlamellaire calculée approche la distance mesurée à 0·1 Å près. Nous calculons des énergies de liaison interfoliaire du talc et de la pyrophyllite (de l'ordre de 30 Kcal/mol) plus faibles que celles de la muscovite et de la phlogopite (de l'ordre de 60 Kcal/mol).
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Gornet, Laurent, Romain Hamonou, Frédéric Jacquemin, Stéphane Auger, and Pierre Chalandon. "Détermination de la souplesse hors plan d’un assemblage de composites boulonnés à l’aide d’une démarche d’homogénéisation." Matériaux & Techniques 106, no. 3 (2018): 302. http://dx.doi.org/10.1051/mattech/2018052.
Full textAbstract:
Dans de nombreux secteurs industriels, les matériaux composites tissés à fibres de carbone et matrices thermoplastiques semblent être une alternative prometteuse aux matériaux métalliques pour alléger les structures. Les matrices composites thermoplastiques ont un coût plus adapté à la fabrication de pièces composites avec de grandes cadences. Les assemblages de structures peuvent être des jonctions mécaniques à base de rivets, de vis ou de boulons. Dans cette étude, nous proposons de développer une approche expérimentale et numérique pour identifier les souplesses hors plan des constituants élémentaires d’un assemblage boulonné. Il n’y a actuellement aucune règle de conception pour prédire la rupture des liaisons boulonnées constituées de substrats composites thermoplastiques. Par conséquent, une étude expérimentale d’une liaison boulonnée utilisant la technique de corrélation d’images est présentée. Simultanément, des modèles éléments finis tridimensionnels d’assemblages associés à une approche d’équivalence en énergie ont été développés afin de déterminer la souplesse des éléments de l’assemblage. Ces modèles éléments finis ont ensuite été comparés avec succès à des résultats expérimentaux.
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HENRY, Y. "Alimentation du porc pour la production de viande maigre : évolutions récentes et perspectives." INRAE Productions Animales 6, no. 1 (1993): 31–45. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.1993.6.1.4185.
Full textAbstract:
La production porcine a bénéficié, au cours des dernières décennies, de progrès importants et continus réalisés par la sélection pour une croissance sans cesse plus forte de tissus maigres et un dépôt décroissant de gras, en réponse à la demande des consommateurs. Cet article examine les changements intervenus dans l’alimentation en considérant les évolutions récentes et les perspectives, compte tenu de l’évolution prévisible des performances de production et de l’apport des nouvelles technologies. L’importance du progrès génétique en faveur de la croissance des tissus maigres a conduit en premier lieu à envisager une modélisation de la prévision des besoins nutritionnels (énergie, protéines et acides aminés, minéraux), dont les variations se traduisent notamment par des exigences moins marquées en énergie que par le passé et par un accroissement important des besoins en acides aminés relativement à l’apport énergétique. Grâce à cette démarche de modélisation, il est désormais possible de définir de nouvelles stratégies d’alimentation adaptées pour la production de viande maigre (plan de rationnement alimentaire, choix du type d’aliment pour une phase de production déterminée), en fonction des conditions particulières de production et à l’aide de systèmes d’évaluation des aliments suffisamment discriminants (énergie nette, digestibilité iléale des acides aminés). En outre, l’augmentation de certains intrants alimentaires (azote, phosphore) pour une production accrue de viande maigre implique une gestion raisonnée de leurs apports, afin de prévenir des rejets excessifs dans l’environnement (eau, atmosphère). La tendance à une certaine dégradation de la qualité de la viande, notamment sous l’angle technologique et organoleptique, au fur et à mesure des progrès de la sélection sur la croissance musculaire, oblige à une prise en compte, par l’alimentation, des exigences de qualité des produits, qu’il s’agisse des dépôts gras ou des tissus maigres (importance du gras intramusculaire). Il en est de même avec le recours à de nouvelles technologies permettant, soit de préserver le potentiel de croissance musculaire (utilisation du porc mâle entier), soit de le stimuler (facteurs de croissance). En dernier lieu, après avoir considéré les effets de l’alimentation sur la conformation des carcasses, en relation avec l’amélioration du développement musculaire, les conséquences d’un amaigrissement excessif des truies sur les performances de reproduction sont évoquées en liaison avec la mobilisation et la reconstitution des réserves lipidiques corporelles. Ce problème d’équilibre entre les tissus musculaire et gras constitue un enjeu important pour l’évolution future de l’alimentation du porc maigre. Au plan de l’application, les nouvelles approches nutritionnelles, basées sur l’établissement de lois de réponse qui prennent en compte la diversité à la fois des types génétiques (depuis les plus gras jusqu’aux plus maigres) et des conditions d’élevage et de milieu devraient permettre, dans chaque cas, de définir les conditions optimales de production d’un type de porc particulier.
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Sabbah, Raphaël, and Aaron Rojas Aguilar. "Étude thermodynamique des trois isomères de l'acide chlorobenzoïque. Partie II." Canadian Journal of Chemistry 73, no. 9 (1995): 1538–45. http://dx.doi.org/10.1139/v95-191.
Full textAbstract:
Our isoperibol rocking-bomb calorimeter, previously described, has been modified to: (i) reduce and stabilize the heat exchange between the calorimetric system and its surroundings; (ii) change its thermometer; (iii) associate with it a computer program for the robotics of different steps of an experiment, data acquisition, and determination of the thermodynamic quantities. After testing these modifications and calibrating the calorimetric system, the enthalpies of formation in the condensed state and at 298.15 K of the three isomers of chlorobenzoic acid have been determined by combustion calorimetry. Associating these values with those of their enthalpies of sublimation previously measured, we determined their enthalpies of formation in the gaseous state. The experimental values of the thermodynamic functions [Formula: see text] [Formula: see text] are given for 2-chlorobenzoic acid, 3-chlorobenzoic acid, and 4-chlorobenzoic acid. From the experimental value of the enthalpy of atomization, it has been possible to determine an enthalpy value for the Cb—Cl bond. The experimental and theoretical values of the resonance energy of the three isomers are compatible. The relative stability of some monosubstituted derivatives of benzoic acid studied in our laboratory is also discussed. Keywords: thermodynamics, combustion calorimetry, differential thermal analysis; 2-chlorobenzoic acid, 3-chlorobenzoic acid, 4-chlorobenzoic acid, enthalpies of combustion, of formation, resonance energy, enthalpies of atomization, of intramolecular bonds, reference material.Notre calorimètre isopéribolique à bombe rotative, précédemment décrit, a été modifié: (i) en diminuant et en stabilisant les échanges thermiques entre le système calorimétrique et le milieu extérieur; (ii) en modifiant son thermomètre de mesure; (iii) en lui associant un système informatisé de robotique, d'acquisition et de traitement des signaux thermiques. Après avoir vérifié la bonne marche de l'appareil ainsi modifié et réalisé l'étalonnage du système calorimétrique, nous avons déterminé à 298,15 K et par calorimétrie de combustion les enthalpies de formation à l'état condensé des trois isomères de l'acide chlorobenzoïque. En associant ces valeurs à celles de leurs enthalpies de sublimation à 298,15 K, nous avons pu déterminer leurs enthalpies de formation à l'état gazeux. Les valeurs expérimentales des fonctions thermodynamiques [Formula: see text] [Formula: see text] sont données pour les acides 2-chloro-benzoïque, 3-chlorobenzoïque et 4-chlorobenzoïque. À partir de l'enthalpie d'atomisation expérimentale de ces trois acides, une valeur enthalpique a été proposée pour la liaison Cb—Cl dans ce type de composés. Les valeurs expérimentale et théorique de l'énergie de conjugaison sont compatibles. Une discussion sur la stabilité relative de quelques dérivés monosubstitués de l'acide benzoïque étudiés au laboratoire est aussi développée. Motsclés: thermodynamique, calorimétrie de combustion, analyse thermique différentielle; acide 2-chlorobenzoïque, acide 3-chlorobenzoïque, acide 4-chlorobenzoïque, enthalpies de combustion, de formation, énergie de conjugaison, enthalpies d'atomisation, de liaisons intramoléculaires, substance d'intercomparaison.
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Demouveaux, Bastien, Valérie Gouyer, Mylène Magnien, et al. "La structure des mucines conditionne les propriétés viscoélastiques des gels de mucus." médecine/sciences 34, no. 10 (2018): 806–12. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/2018206.
Full textAbstract:
Le mucus représente la première ligne de défense innée chez les mammifères. Les mucines gélifiantes qui le constituent forment un réseau protéique au sein duquel coexistent des régions hydrophiles et hydrophobes. Il est maintenu par des interactions covalentes et réversibles qui définissent les propriétés rhéologiques du gel. Cette revue décrit la structure et les fonctions du mucus en se focalisant sur les interactions protéine-protéine, ou interactome, des mucines gélifiantes. Du fait de leur nature réversible et de leur dépendance vis-à-vis de l’environnement physico-chimique, le rôle des interactions de faible énergie n’est pas totalement compris. Cependant, ce type de liaisons constitue une cible thérapeutique prometteuse pour contrebalancer les anormalités du mucus observées dans les pathologies associées aux muqueuses.
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Hamelin, Louis-Edmond. "Développement nordique et harmonie." Cahiers de géographie du Québec 18, no. 44 (2005): 337–46. http://dx.doi.org/10.7202/021198ar.
Full textAbstract:
Le Nord canadien comprend deux territoires, la partie septentrionale de sept provinces et des eaux marines « intérieures », donc plusieurs entités politiques. Une super agence de liaisons devrait être établie entre les dix gouvernements canadiens qui « font du Nord ». Dans l'esprit d'une géographie politique appliquée, voici des réflexions se rapportant au développement de cet immense espace. Jusqu'à maintenant, les activités économiques ont été plus sectorielles que globales ; l'on se préoccupait peu des Indigènes, des intérêts régionaux ou de la promotion des structures politiques. En outre, l'administration du Nord est caractérisée par une profusion d'organismes fédéraux (61) pouvant être chevauchants et même en conflit. Les Provinces n'ont pas de gouvernement nordique résidant et auquel participeraient les Indigènes. Les gouvernements territoriaux n'entretiennent que peu de contacts avec les « grandes affaires ». L'ensemencement d'une notion non indigène de gouvernement a été faite par en haut et sans grande participation des Nordistes. Il y a double risque que les structures descendues du sommet ne rejoignent pas les intérêts d'en bas et que l'énergie politique latente du peuple, développée par l'éducation et par l'entraînement, devienne une énergie libérée donnant dans des oeuvres de contestation. Un test perceptif est venu confirmer que les grands projets de développement ne respectent pas suffisamment le Nord. Il n'y aura pas de développement harmonieux sans au moins une plus grande nordicité mentale chez les promoteurs.
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Alkorta, Ibon, Jose Elguero, and Janet E. Del Bene. "1,2-Dihydro-1,3,2-diazaborinine tautomer as an electron-pair donor in hydrogen-bonded complexes." Canadian Journal of Chemistry, July 8, 2021. http://dx.doi.org/10.1139/cjc-2021-0072.
Full textAbstract:
Ab initio MP2/aug’-cc-pVTZ calculations have been carried out to investigate 1,2-dihydro-1,3,2-diazaborinine:HX complexes for HX = H+, HF, HCl, H2O, HCN, NH3, HCP, and HCCH. Most complexes are stabilized by linear, traditional hydrogen bonds except for those with H2O and NH3 which have bridging structures and nonlinear hydrogen bonds. H-atom transfer from N to B can occur in complexes with HF and HCl, with formation of a traditional F-H…N and a proton-shared Cl…H…N bond. The binding energies of the uncharged complexes range from 25 to 88 kJ.mol–1. Spin-spin coupling constants have been used to characterize these hydrogen-bonded complexes.
 Des calculs ab initio MP2/aug'-cc-pVTZ ont été effectués pour étudier les complexes 1,2-dihydro-1,3,2-diazaborinine:HX pour HX = H+, HF, HCl, H2O, HCN, NH3, HCP et HCCH. La plupart des complexes sont stabilisés par des liaisons hydrogène traditionnelles, linéaires, à l'exception de celles avec H2O et NH3 qui ont des structures pont et des liaisons hydrogène non linéaires. Le transfert de l'atome d'hydrogène de N à B peut se produire dans des complexes avec HF et HCl, avec formation d'une liaison F-H···N traditionnelle et d'une liaison Cl···H···N avec un proton comparti. Les énergies de liaison des complexes non chargés vont de 25 à 88 kJ·mol–1. Des constantes de couplage spin-spin ont été utilisées pour caractériser ces complexes à liaison l'hydrogène.
Dissertations / Theses on the topic "Énergie de liaison"
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Bonenfant, Éric. "Énergie de liaison du deutéron dans un modèle de Skyrme étendu." Thesis, Université Laval, 2010. http://www.theses.ulaval.ca/2010/26868/26868.pdf.
Full text
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Leygnier, Jérôme. "Stabilité des petits agrégats d'alcalins : dissipation de leur énergie par évaporation." Paris 11, 1989. http://www.theses.fr/1989PA112353.
Full textAbstract:
Les agrégats produits par la détente supersonique d'une vapeur contiennent une certaine quantité d'énergie interne. Elle est répartie statistiquement sur tous les modes de vibration, mais il existe une probabilité d'en localiser une partie sur un mode donné. Ceci peut entrainer la dissociation unimoléculaire de l'édifice. La première partie de ce travail présente l'étude expérimentale la dissociation de la dynamique de la dissociation d'agrégats de 5 à 41 atomes de sodium ou de potassium. Les énergies de liaison et les températures des agrégats en sont déduites. La seconde partie indique que l'énergie apportée par un photon est également dissipée par évaporation d'atomes. L'étude de la photoévaporation donne accés aux énergies d'atomisation d'agrégats de 20 à 200 atomes. Leur comportement correspond aux prévisions du modèle de la goutte liquide. La troisième partie décrit la neutralisation d'agrégats ionisés triés en masse, par échange de charge avec des atomes de césium. L'énergie interne de l'agrégat intervient dans la fragmentation qui suit l'échange de charge. En conclusion, il apparait qu'une excitation électronique (collisionnelle ou photonique) d'un agrégat relaxe très rapidement en énergie de vibration. L'excés d'énergie interne est ensuite dissipé statistiquement par évaporation. La dynamique du processus renseigne sur l'état interne de l'agrégat.
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Mégret, Claire. "Détermination par des calculs DFT de la relation entre énergies de liaison H-C et M-C : Vers une évaluation du contrôle thermodynamique de la sélectivité d'activation C-H." Montpellier 2, 2004. http://www.theses.fr/2004MON20061.
Full text
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Fevrier, Sylvie. "Modélisation de la liaison entre croissance, énergie et développement dans les pays en voie de développement : application à l'Indonésie." Dijon, 1986. http://www.theses.fr/1986DIJOE006.
Full textAbstract:
Face à la restriction et à la complexité croissante des apports de ressources financières, le problème de l'accumulation explosive de l'endettement dans les pays du tiers monde prend une nouvelle dimension. Il importe donc d'en comprendre les mécanismes et de ne plus sous-estimer la liaison entre croissance et endettement. En outre, le renforcement des contraintes financières nécessite de repenser le contenu des politiques énergétiques car toute stratégie de développement basée exclusivement sur le pétrole constitue un goulot d'étranglement pour la croissance des pays non industrialises, importateurs ou exportateurs d'énergie. Afin de mieux de mettre en évidence cette problématique, nous avons oriente notre recherche vers la construction et la formalisation informatique d'un modèle économique, énergétique et financier. Son objet principal est de simuler la croissance d'un pays en voie de développement en fonction de diverses hypothèses (taux de croissance des valeurs ajoutées, élasticités énergétiques. . . ) et d'en déduire le besoin de financement associe. La relation fondamentale entre croissance, énergie et endettement constitue la base du modèle ainsi conçu. La formulation adoptée reprend les grandes lignes du modèle rmsm (revised minimum standard model) élaboré par la banque mondiale au début des années 70. L'étude d'un cas concret, l'Indonésie, nous a permis d'identifier les insuffisances de ce cadre analytique face à la problématique de base et de lui apporter les aménagements nécessaires. L’application à l'Indonésie du modèle ainsi élaboré a fourni des résultats significatifs.
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Achkar, Yamina. "Modélisation des interactions à grande distance internucléaire entre deux atomes dans divers états électroniques : applications à des atomes d'alcalins et de gaz rare." Lyon 1, 1990. http://www.theses.fr/1990LYO10044.
Full textAbstract:
Nous presentons un modele perturbatif pour l'etude theorique du comportement des courbes d'energie potentielle des etats moleculaires (fondamental et excites) des systemes diatomiques dans le domaine des grandes distances internucleaires telles que le recouvrement entre fonctions d'onde atomiques puisse etre considere comme negligeable ou faible, l'effet d'echange des electrons entre les deux atomes etant toujours considere comme negligeable dans notre modele. Dans une premiere partie, apres un rappel du formalisme general de determination des elements de matrice de l'energie d'interaction a grande distance dans l'hypothese de non recouvrement et pour deux cas de couplages differents: couplage a et couplage c de hund, nous presentons tout d'abord une application a la description d'un grand nombre d'etats moleculaires des 10 dimeres alcalins heteronucleaires mm (m, m=li, na, k, rb, cs). Puis nous avons decrit les 20 systemes alcalin-gaz rare mg (m=li, na, k, rb, cs; g=ne, ar, kr, xe) dans de nombreux etats electroniques en introduisant certaines approximations supplementaires dans le formalisme. Dans la deuxieme partie, nous presentons l'extension du formalisme au calcul de l'energie coulombienne d'interaction en tenant compte, cette fois, des effets du recouvrement. Une application a la description de l'etat fondamental des dimeres alcalins, na#2 et lina, dans le couplage a de hund est presentee et discutee
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Bayat, Parisa. "Spectrométrie de masse en tandem pour l'étude des énergies de liaison de complexes "hôte-invité" et l'élucidation structurale d'oligosaccharides." Thesis, Sorbonne université, 2018. http://www.theses.fr/2018SORUS108.
Full textAbstract:
En faisant progresser la chimie hôte-invité (H-G), des efforts importants ont été déployés pour synthétiser des molécules hôtes avec des caractéristiques de reconnaissance moléculaire spécifiques et bien définies, y compris de sélectivité et d’affinité ajustable. Une étape importante dans le processus est la caractérisation des forces de liaison des complexes H-G. Cette caractérisation est typiquement réalisée en solution en utilisant la RMN ou la fluorescence. L'étude en phase gazeuse de l'énergétique des systèmes H-G est très importante pour fournir des informations concernant leurs propriétés intrinsèques de liaison. La majeure partie de cette thèse est consacrée à l'étude de l'énergétique des complexes H-G formés par trois hôtes en cage d'hémicryptophane avec diverses molécules invitées biologiquement pertinentes. Parmi les techniques basées sur la spectrométrie de masse en tandem, nous utilisons ici la dissociation radiative infrarouge de corps noir (BIRD), la dissociation induite par collision basse énergie (CID à basse énergie), la dissociation de collision de plus haute énergie (HCD) et la CID haute pression pour les mesures énergétiques des complexes HG. Ces techniques ont été utilisées soit seules, soit en combinaison les unes avec les autres, soit avec la modélisation Rice-Ramsperger-Kassel-Marcus (RRKM). Ce travail nous a permis de développer la CID à basse énergie, technique prometteuse mais jusqu’à présent peu employée<br>In advancing host-guest (H-G) chemistry, considerable effort has been spent to synthesize host molecules with specific and well-defined molecular recognition characteristics including selectivity and adjustable affinity. An important step in the process is the characterization of binding strengths of the H-G complexes. This characterization is typically performed in solution using NMR or fluorescence. Gas-phase investigation of energetics of H-G systems is of great importance in providing information regarding their intrinsic binding properties. The major portion of this thesis is devoted to the study of the energetics of H-G complexes formed by three hemicryptophane cage hosts with various biologically-relevant guest molecules. Among the existing tandem mass spectrometry-based techniques, here we employ blackbody infrared radiative dissociation (BIRD), low-energy collision induced dissociation (low-energy CID), higher-energy collision dissociation (HCD) and high-pressure CID for measurements of energetics of H-G complexes. These techniques were used either alone, or in combination with each other, or with Rice–Ramsperger–Kassel–Marcus (RRKM) modeling. This work has allowed us to develop the low-energy CID, a promising technique, but so far infrequently used
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Minaya, Ramirez Enrique. "Un nouveau piège à ions circulaire pour la spectrométrie de masse et la structure nucléaire." Phd thesis, Université Paris Sud - Paris XI, 2009. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00421111.
Full textAbstract:
La détermination de la masse nucléaire permet d'accéder à l'énergie de liaison donc au bilan de toutes les forces agissant dans le noyau. L'exploration de la structure nucléaire requiert la mesure des masses loin de la stabilité. Néanmoins la production des ions radioactifs est peu sélective et l'ion d'intérêt est souvent noyé dans un fond de contaminants isobariques. Ces dernières années, l'utilisation des pièges à ions linéaires et du refroidissement par gaz tampon a été fortement développée permettant la mesure de masse des noyaux exotiques avec une grande précision. Cette thèse porte sur le développement innovant d'un piège de Paul circulaire, "le cirque d'ions". Sa géométrie lui permet de confiner les ions sur un grand nombre de tours. Ainsi, ils peuvent être refroidis avec une pression de gaz tampon de l'ordre de 10-4 mbar. Par ailleurs, il est capable de trier en masse les ions piégés et refroidis avec un pouvoir de résolution suffisant pour séparer des isobares. Nous avons réalisé et testé le premier prototype de ce spectromètre à Orsay. Cette thèse étudie également les prédictions des masses par les différents modèles théoriques, en les comparant avec l'approche microscopique HFB-17. Actuellement, la masse des noyaux très exotiques peut seulement être prédite. L'étude de l'énergie de séparation de deux neutrons avec HFB-17 met en évidence des zones d'instabilité numérique. Afin de l'améliorer, nous avons apporté une correction aux énergies de déformation calculées par ce modèle, en utilisant comme référence les masses des chaînes isotopiques 143-146Xe et 223-229Rn que nous avons mesurées avec le spectromètre ISOLTRAP au CERN.
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Sporea, Cristina-Elena. "Structures et propriétés d'agrégats de silicium dopés avec des alcalins." Phd thesis, Université Claude Bernard - Lyon I, 2007. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00175624.
Full textAbstract:
Ce mémoire est consacré à l'étude théorique des systèmes SinMp(+) avec M=Li, Na, K. Les calculs ont principalement été effectués au niveau DFT/B3LYP. <br /> Nous avons déterminé les géométries, les énergies de liaison, les potentiels d'ionisation et les moments dipolaires. Pour la majorité des SinMp(+) étudiés, les Si conservent le même arrangement que dans Sin, les alcalins M étant adsorbé à la surface. <br /> L'électron de valence s de l'alcalin est transféré vers la LUMO de Sin de sorte que la structure électronique de SinMp correspond approximativement à celle de Sinp- + pM+. La charge transférée est partagée entre les Si premiers voisins de M. Ce transfert de charge crée un moment dipolaire. Nos résultats pour le potentiel d'ionisation sont en bon accord avec les valeurs expérimentales seulement disponibles pour SinNa.<br /> Nous avons également étudié la possibilité de stabiliser une cage Sin en introduisant un alcalin à l'intérieur.
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Blazhynska, Marharyta. "Modeling and Standard Binding Free Energy Calculations of Complex Biological Objects." Electronic Thesis or Diss., Université de Lorraine, 2023. http://www.theses.fr/2023LORR0149.
Full textAbstract:
Pendant ma thèse, j'ai consacré mes recherches à l'analyse des calculs d'énergie libre de liaison absolue dans des complexes protéine-ligand. J'ai utilisé des approches basées sur la dynamique moléculaire, intégrant des restreintes telles que les itinéraires alchimiques et géométriques. Mon travail comprenait l'étude de trois complexes protéine-ligand distincts, contribuant ainsi à l'évaluation du logiciel BFEE2 pour l'automatisation de ces calculs. En poursuivant mes investigations, j'ai appliqué cette méthodologie aux interactions protéine-protéine, qui impliquent des phénomènes de reconnaissance et d'association plus complexes. J'ai examiné un exemple spécifique : un dimère d'insuline porcine dans lequel la dimérisation était induite par des interactions hydrophobes à l'interface des monomères. Ensuite, j'ai comparé les résultats des estimations d'énergie libre obtenus par calcul avec les données expérimentales correspondantes. Pour approfondir ma compréhension des calculs d'énergie libre de liaison dans les complexes protéine-ligand et protéine-protéine, j'ai réalisé une recherche méthodologique. J'ai évalué la robustesse de la méthode géométrique par rapport à une version simplifiée, où les degrés de liberté supplémentaires étaient maintenus non restreints lors de la séparation physique des partenaires. Après avoir démontré l'exactitude de la méthode géométrique, j'ai élargi son application à la prédiction et à l'évaluation des affinités de liaison des variants du SARS-CoV-2 en interaction avec un récepteur humain et des anticorps. De plus, j'ai exploré des stratégies visant à accélérer les calculs en utilisant l'option MTS disponible dans le module Colvars, avec ou sans l'astuce d'HMR. En ajustant les paramètres de Colvars, j'ai réussi à obtenir une accélération des calculs presque triplée, sans compromettre la précision des calculs d'énergie libre de liaison<br>During my thesis, I focused my research on analyzing the calculations of absolute binding free energy in protein-ligand complexes. I utilized approaches based on molecular dynamics, incorporating restraints such as alchemical and geometrical routes. My work involved studying three distinct protein-ligand complexes, contributing to the evaluation of the BFEE2 software for automating these calculations. Continuing my investigations, I applied this methodology to protein-protein interactions, which involve more complex recognition and association phenomena. I examined a specific example: a dimer of porcine insulin, where dimerization was induced by hydrophobic interactions at the interface of the monomers. Subsequently, I compared the results of calculated estimates of binding free energy with the corresponding experimental data. To deepen my understanding of binding free energy calculations in protein-ligand and protein-protein complexes, I conducted methodological research. I evaluated the robustness of the geometrical route compared to a simplified version, where additional degrees of freedom remained unrestrained during the physical separation of the partners. After demonstrating the accuracy of the geometrical route, I expanded its application to predict and evaluate the binding affinities of SARS-CoV-2 variants in interaction with a human receptor and antibodies. Additionally, I explored strategies to accelerate the calculations using the MTS option available in the Colvars module, with or without the HMR trick. By adjusting the parameters of Colvars, I achieved an almost threefold acceleration of the calculations without compromising the accuracy of the binding free energy calculations
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Lebhertz, Dorothée. "Modes de décroissance des réactions de capture radiative résonnantes des collisions 12C+12C et 12C+16O." Strasbourg, 2009. https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2009/LEBHERTZ_Dorothee_2009.pdf.
Full textAbstract:
Mon travail contribue à la recherche du lien entre résonances étroites et états moléculaires dans les systèmes 12C+12C et 12C+16O proches de la barrière de Coulomb via le processus de capture radiative. Ce mécanisme permet de sonder à la fois la voie d’entrée par son recouvrement avec les états du noyau composite et la nature des états alimentés via les transitions électromagnétiques. Les expériences ont été réalisées au laboratoire Triumf (Canada) afin d’utiliser le spectromètre à 0° Dragon et l'ensemble de 30 BGO associés. Les résultats présentent pour la première fois le spectre de décroissance complet de la capture radiative et montrent en particulier qu’une branche importante (>50% du flux γ) décroit vers des états quasi-liés autour de 10-11 MeV. En utilisant le code de transport Geant3 pour décrire l’ensemble de l’appareil de détection, j’ai proposé trois scénarii de décroissance : l’un, purement statistique, le deuxième, résonnant, à spin d’entrée unique, et le dernier basé sur un modèle cluster. J’ai ainsi déterminé les spins d’entrée ainsi que les sections efficaces totales de capture radiative. J’ai également effectué des calculs Hartree Fock dépendant du temps pour étudier le mécanisme de réaction et déterminer le temps de vie dinucléaire de ces réactions. Mon étude se termine par des calculs de simulation GEANT4 étudiant la fonction de réponse du futur multidétecteur PARIS, basé sur l’utilisation des nouveaux cristaux scintillants de LaBr3 qui sera installé auprès de Spiral2. Mes résultats montrent que la résolution et l’efficacité de ce futur détecteur permettra de statuer parmi les différents scénarii proposés dans ce travail<br>My work contributes to the search for the link between narrow resonances and molecular states in the 12C+12C and 12C+16O systems near the Coulomb barrier making use of the radiative capture. This mechanism allows to probe both the entrance channel by its overlap with the states of the composite nuclei and the nature of the states fed via electromagnetic transitions. The corresponding experiments were performed at TRIUMF (Canada) and used the 0° Dragon spectrometer and the associated 30 BGO array. The results show for the first time the complete radiative capture decay scheme and demonstrate in particular that a significant part (> 50% of the γ-flow) decreases to quasi-bound states around 10-11 MeV. Using the Geant3 transport code to model the whole experimental apparatus, I have proposed three decay scenarii: the first one is purely statistical, the second, resonant, with a unique entrance spin, and the last one based on cluster models. I have thus determined the entrance spins and the total radiative capture cross sections. I have also performed Time Dependent Hartree Fock calculations to study the reaction mechanism and determine the dinuclear lifetime for these reactions. My study concludes with GEANT4 calculations of the response function of the future multidetector PARIS, based on the use of new LaBr3 scintillating crytstals which will be installed at Spiral2 (Ganil, France). My results show that the resolution and efficiency of the future detector will allow to disentangle the different scenarii proposed in this work
Books on the topic "Énergie de liaison"
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Naberejnev, Dimitri. Etude de l'influence des liaisons chimiques sur l'absorption et la diffusion des neutrons aux énergies des résonances. 1998.
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"Chapitre 24. Structure et énergie de liaison des noyaux atomiques." In Énergie, électricité et nucléaire. EDP Sciences, 2020. http://dx.doi.org/10.1051/978-2-7598-0326-2.c027.
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