Dissertations / Theses on the topic 'Epidemology'

Fast-evolving RNA viruses are a leading cause of morbidity and mortality among human and animal populations, contributing significantly to both global health and economic burden. The advent and revolution of high-throughput sequencing has empowered phylogenetic analyses with increasing amounts of temporally and spatially sampled viral data. Moreover, the parallel advancement in molecular evolution and phylogenetic methods has provided investigators with a unique opportunity to gain detailed insight into the evolutionary and epidemiological dynamics of emerging viral pathogens. Using state-of-the-art statistical approaches, this thesis addresses some of the important but controversial questions in viral emergence. Chapter 2 introduces a new framework to quantify and investigate reassortment events in influenza A viruses. By developing a computationally efficient algorithm to calculate the largest common subtree for a pair of tree sets, which are estimated from diffe rent parts of the genome for the same taxa set, the level of phylogenetic incongruency due to reassortment can be appropriately ascertained. Chapters 3, 4 and 5 investigate the evolutionary origins of three diff erent viruses: the novel emergence and cross-species transmission of SARSCoV, the genesis and dissemination of the unique HCV circulating recombinant form, and the ancient divergence of all influenza viruses, respectively. Moreover, Chapter 4 presents an improved statistical framework, which provides more precise evolutionary estimates, by utilizing the hierarchical bayes approach to investigate recombination events in emerging RNA viruses. The last empirical study, presented in Chapter 6, applies the recently developed Bayesian phylogeography models to a large viral sequence dataset sampled from southern Viet Nam to examine the fine-scale spatiotemporal dynamics of endemic dengue in Southeast Asia. The work presented here reflects both the advancements made in sequencing technology and statistical phylogenetics, along with some of the challenges that remain in studying the emergence of fast-evolving RNA viruses. This thesis proposes new and improved solutions to these evolutionary problems, such as incorporating non-vertical evolution (i.e. homologous recombination and reassortment) into the phylodynamic framework, with the aim of facilitating future investigations of emerging viral diseases.

Purpose: The purpose of this study was to investigate the relationship between anthropometric measurements, proximal and distal lower extremity muscle performance, core muscle endurance, lower extremity flexibility, and neuromuscular control with the incidence of injury in recreational runners over one season. Also, when a relationship was established, we sought to evaluate the predictive validity for any of the variables being investigated for risk of injury in this population. Study Design: Prospective cohort Methods: Anthropometric measurements, proximal and distal isometric lower extremity muscle performance, isometric core muscle endurance, lower extremity flexibility and neuromuscular control were measured in 75 recreational runners prior to the start of a graded marathon training program. Incidence of injury was tracked over the course of 18 weeks, May 2014 – October 2014. Data was analyzed comparing the differences between injured and non-injured groups. Results: There were 33 repetitive stress injuries yielding a gross injury rate of 46% (male n=13, female n=20). Of all the variables analyzed, 5 variables emerged as possible a predictors including age, dominant limb rear foot posture, non dominant limb ankle DF ROM (extended), limb difference of Y balance scale composite scores and limb difference in the 6 M hop test. These variables were entered into a binary logistic regression analysis. Results of the regression indicated only the composite Y balance score difference variable as yielding a significant contribution (p = 0.01), with and predictive validity, (OR = 1.46, 95% CI =1.127 – 1.892). The model predicted 69.2% of the injuries with a specificity of 82% and sensitivity of 54.5%. A cutoff point of 3.6% was determined using a receiver operating characteristic curve. Runners were 3 times more likely to get injured with an asymmetry ≥ 3.6%. Conclusions: An asymmetry of lower extremity neuromuscular control ≥ 3.6% measured by the Y balance scale has been identified as a potential risk factor for injury in recreational runners. Clinical Relevance: This test can be performed as part of a pre-training screening or physical and may be helpful in identifying recreational runners at risk for injury.

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Dissertacao (Mestrado)
IPEN/D
Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN-CNEN/SP

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Dissertacao (Mestrado)
IPEN/D
Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN-CNEN/SP

A mastite é uma doença endémica considerada a mais frequente em vacas leiteiras e que causa maiores perdas económicas na produção leiteira, especialmente na forma subclínica. O contraste leiteiro é um registo, que consiste na avaliação da quantidade e qualidade do leite produzido por cada animal de uma exploração e que permite também monitorizar a eliminação de células somáticas. Através da aplicação de um programa de análise de contagem de células somáticas, pretendeu-se estudar, vários padrões epidemiológicos de mastites numa amostra de explorações do Entre Douro e Minho. Os resultados obtidos demonstram que apesar das variações sazonais esperadas, o ano de 2016 foi atípico relativamente à ocorrência de mastites, sobretudo pelos ajustes realizados na produção leiteira, exigidos pelos contratos de recolha de leite na região. Porém, a amostra em estudo apresenta bons índices epidemiológicos para mastites subclínicas; The use of milk recording as a tool for the analysis of subclinical mastitis in dairy farms in Entre Douro e Minho Abstract: Mastitis is an endemic disease considered to be the most frequent in dairy cows and causes greater economic losses in milk production, especially in the subclinical form. The milk recording is a register, which consists of the evaluation of the quantity and quality of milk produced by each farm animal and also allows to monitoring of somatic cell elimination. Through the application of a somatic cell count analysis program, it was intended to study several epidemiological patterns of mastitis in a sample of Entre Douro and Minho farms. The results show that despite the expected seasonal variations, the year of 2016 was atypical regarding the occurrence of mastitis, mainly due to adjustments made in milk production, required by the milk collection contracts in the region. However, the sample under study presents good epidemiological indices for subclinical mastitis.

The present doctoral thesis is a field epidemiology investigation carried in Myanmar for trialling a surveillance scheme for Avian Influenza (AI). The study was completed in Myanmar between 2009 and 2010 and was conducted in collaboration with the Livestock Breeding and Veterinary Department of the local Ministry of Agriculture and Fishery. The area selected for the study is the Moeyingyi Wetland including its wild bird sanctuary. This area produces the 60% of the country domestic ducks using traditional technology. After hatching, ducklings are grown up locally or sold in other area. An array of duck products (eggs, embryonated food eggs, drakes, spent laying ducks) are distributed all over the country. The previous history of AI epidemics occurred in Myanmar given by the H5N1 Highly Pathogenic Avian Influenza Virus (HPAIV) subtype increased the suspicion on the Moeyingyi area as a reservoir of AI viruses. Previous attempts to investigate H5N1 HPAIV were carried out by local veterinary services but results were not considered sound enough. This doctoral research proposed and tested a prospective surveillance scheme sensitive to territorial characteristics and local resources which were thoroughly assessed prior the study commenced. The scheme was designed to be effective and to maximise data and information gathered. Special targeted attempts to virus isolation were carried out. This surveillance scheme proved to produce information useful for planning control measures also based only on serological results. The data produced and the information generated showed that almost all the newly housed negative flocks got infected in the time span of the first egg laying cycle (August – April).
La presente tesi di dottorato si basa su uno studio epidemologico di campo eseguito in Myanmar per testare uno schema di sorveglianza dell’Influenza Aviare (IA). Lo studio è stato completato in Myanmar tra il 2009 ed il 2010 ed è stato eseguito in collaborazione con il Livestock Breeding and Veterinary Department del Ministry of Agriculture and Fishery. L’area selezionata per lo studio è la zona umida di Moeyingyi e comprende anche la omonima riserva protetta di uccelli selvatici. Questa area produce il 60% delle anatre domestiche del paese usando metodi di allevamento e riproduzione tradizionali. Dopo la schiusa, gli anatroccoli sono fatti crescere localmente o venduti in altre aree. Il settore locale di produzione delle anatre produce una varietà di prodotti (uova, uova embrionate per consumo alimentare umano, maschi di anatra, e femmine ricostituite a fine carriera di deposizione) che sono distribuiti in tutto il paese. La storia di epidemie precedenti sostenute dal sottotipo H5N1 del virus influenzale ad alta patogenicità (HPAIV) hanno generato preoccupazione sul rischio che la zona studiata fosse un reservoir geografico di virus influenzali aviari. Tentativi di studio dell’area precedenti eseguiti dai servizi veterinari non hanno generato risultati ritenuti soddisfacenti. La presente ricerca di dottorato propone e testa uno schema di sorveglianza longitudinale che tiene in considerazione le caratteristiche territoriali e le risorse locali per raggiungere una soddisfacente sostenibilità. Gli aspetti legati all’ambiente ed al territorio sono stati studiati sistematicamente prima di pianificare lo schema di sorveglianza. Il programma di sorveglianza è stato progettato per massimizzare i dati e le informazioni generati ed ha compreso una attività di sorveglianza virologica guidate dall’interpretazione dei risultati sierologici. La ricerca di questo dottorato ha dimostrato che lo schema proposto è in grado di generare informazioni utili alla pianificazione di misure di controllo anche sul solo dato sierologico. I dati e le informazioni prodotte hanno dimostrato che quasi il 100% dei nuovi gruppi negativi accasati in questa zona si infettano con il sottotipo H5N1 del virus dell’IA entro la fine del primo ciclo di deposizione (Agosto – Aprile). Le dinamiche di infezione sono descritte.

Fornisce una breve trattazione di due tipi di modelli matematici applicabili nel campo dell'epidemologia, prendendo spunto da un articolo del biologo matematico A. Korobeinikov, "Lyapunov function and global properties for SEIR and SEIS epidemic models".

Made available in DSpace on 2014-06-12T17:34:57Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4392_1.pdf: 2567667 bytes, checksum: fc5f3879e4fc8d945d806a8851c47851 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 1999
Envenenamentos por serpentes constituem sério problema de saúde pública no Brasil. Neste estudo foram analisadas 1.389 notificações de acidentes causados por animais peçonhentos e registrados pela Secretaria de Saúde de Pernambuco no triênio 1995-1997. As serpentes causaram 70% desses acidentes. A taxa de incidência foi 4,23/100.000 hab./ano. A maioria dos acidentes ocorreu na zona rural (80,5%). A região fisiográfica do Sertão apresentou a maior incidência (12,11/100.000 hab./ano), seguida do Agreste (5,52) e da Zona da Mata (1,28). A área da IV Diretoria Regional de Saúde (DIRES), sediada no município de Caruaru (Agreste), foi a primeira em número de acidentes (23,1%), seguida pela IX DIRES em Ouricuri, Sertão (18,4%) e pela VII DIRES em Salgueiro (11,3%), também no Serão. Alguns municípios do Sertão apresentaram taxas de incidência alarmantes como Afrânio (50,4 acidentes/100.000 hab./ano), Dormentes (45,3) e Carnaubeira da Penha (37,2). Considerando-se, apenas a zona rural, o município de Toritama, no Agreste, apresentou a maior taxa de incidência (78,4). Os acidentes ocorreram, principalmente, no período de março a maio (40,2%). As serpentes do gênero Bothrops foram as principais causadoras dos acidentes (78,7%), seguidas pelas do gênero Crotalus (18%), Micrurus (2,7%) e Lachesis (0,6%). A maioria dos pacientes (76,8%) foi do sexo masculino, tinha 11 a 20 anos (24,8%), estava trabalhando no momento do acidente (66,2%), demorou mais de 6 horas para chegar ao hospital (28,6%), foi atingida nos membros inferiores (76,9%), especialmente, nos pés.. As alterações locais mais freqüentemente observadas nas vítimas de acidentes botrópicos foram dor (77%), edema (68%) e sangramento (27%). Por outro lado, as vítimas de acidente crotálico apresentaram mialgia (25%), urina escura (12%) e alterações neurológicas como ptose palpebral (24%) e diplopia (21%). O tratamento utilizou, em média, 6,8 ampolas/acidente botrópico, 10 para acidente crotálico ou laquético e 8 para os elapídicos. A letalidade no Estado foi de 0,85%. Embora as serpentes do gênero Bothrops tenham causado mais óbitos (4/8) do que as do gênero Crotalus (3/8), a letalidade dos envenenamentos crotálicos foi, significativamente, maior (2,38%) do que dos botrópicos (0,73%)

Mestrado em Tradução Especializada
O presente trabalho foi realizado no segundo ano do Mestrado em Tradução Especializada, vertente Saúde e Ciências da Vida, lecionado na Universidade de Aveiro. Este projeto teve como objetivo a tradução de inglês para português de dois artigos científicos na área da Epidemiologia Nutricional, que investiga a relação entre a alimentação e a saúde. O trabalho analisa as várias fases do processo de tradução, desde a análise textual e o uso de ferramentas específicas de tradução, até à resolução dos problemas tradutológicos e a elaboração de um glossário.
The project under review was carried out in the second year of the Master’s degree in Specialized Translation (field of health sciences) at the University of Aveiro. The purpose of this project was to translate two scientific articles from English into Portuguese focusing on Nutritional Epidemiology, which investigates the relationship between nutrition and health. In addition, this study reflects on the various stages of the translation process, from analyzing the source texts and using specific translation tools to overcoming translation problems and creating a glossary.

Made available in DSpace on 2018-08-01T21:35:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_10835_Dissertação_Mirla Borghi.pdf: 2176338 bytes, checksum: 93f6c18aa70f06dc59c508a80f22245c (MD5) Previous issue date: 2017-02-20
A resistência cada vez mais ampla aos antimicrobianos beta-lactâmicos em espécies da família Enterobacteriaceae tem se tornado um grave problema de saúde pública. Do ponto de vista epidemiológico, a produção de carbapenemases merece destaque devido ao seu grande potencial de disseminação mundial. O presente estudo teve como objetivo determinar o perfil de resistência aos antimicrobianos, detectar genes de resistência aos beta-lactâmicos e analisar o polimorfismo genético das amostras de enterobactérias não susceptíveis aos carbapenêmicos isoladas de diversos materiais clínicos obtidos de pacientes atendidos em hospitais da Grande Vitória. ParaParaPara avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos foi realizado teste difusão em ágar edifusão em ágar e difusão em ágar e difusão em ágar edifusão em ágar edifusão em ágar edifusão em ágar edifusão em ágar edifusão em ágar edifusão em ágar edifusão em ágar edifusão em ágar e difusão em ágar e o teste teste teste teste de de de gradiente para determinação da concengradiente para determinação da concen gradiente para determinação da concen gradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concen gradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concen gradiente para determinação da concen gradiente para determinação da concengradiente para determinação da concen gradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concengradiente para determinação da concen gradiente para determinação da concentração mínima tração mínima tração mínima tração mínima tração mínima tração mínima tração mínima tração mínima tração mínima tração mínima inibitória inibitória inibitória inibitória. P araara detecdetecdetecdetecdetecção ção dos ge s genes de resistêncianes de resistêncianes de resistência nes de resistêncianes de resistência nes de resistência nes de resistêncianes de resistêncianes de resistência aos beta-lactâmicos foi realizadafoi realizadafoi realizada foi realizada foi realizadafoi realizadafoi realizadafoi realizada a técnic técnic técnic a de PCR e o pola de PCR e o pola de PCR e o pola de PCR e o pola de PCR e o pola de PCR e o pola de PCR e o pol a de PCR e o pola de PCR e o pola de PCR e o pola de PCR e o pola de PCR e o pola de PCR e o pola de PCR e o pola de PCR e o polimorfismo genético foi imorfismo genético foiimorfismo genético foiimorfismo genético foiimorfismo genético foi imorfismo genético foiimorfismo genético foiimorfismo genético foiimorfismo genético foiimorfismo genético foiimorfismo genético foiimorfismo genético foi imorfismo genético foiimorfismo genético foi imorfismo genético foi analisado analisado analisado analisado analisado analisado analisado analisado pelaspelaspelaspelaspelas técnica técnicatécnicatécnica s de PFGE e de PFGE e de PFGE e de PFGE e de PFGE e de PFGE e de PFGE e de PFGE e de PFGE e MLSTMLSTMLSTMLST. As As espéciesespécies espéciesespécies incluídas no estudoincluídas no estudoincluídas no estudo incluídas no estudoincluídas no estudoincluídas no estudo incluídas no estudoincluídas no estudoincluídas no estudoincluídas no estudoincluídas no estudoincluídas no estudo incluídas no estudoincluídas no estudo foram foram : Klebsiella pneumoniaeKlebsiella pneumoniae Klebsiella pneumoniae Klebsiella pneumoniaeKlebsiella pneumoniaeKlebsiella pneumoniaeKlebsiella pneumoniaeKlebsiella pneumoniaeKlebsiella pneumoniaeKlebsiella pneumoniaeKlebsiella pneumoniae (n=47), (n=47), (n=47), (n=47), (n=47), Serratia marcescensSerratia marcescensSerratia marcescens Serratia marcescensSerratia marcescens Serratia marcescensSerratia marcescensSerratia marcescensSerratia marcescens Serratia marcescensSerratia marcescens (n=14), (n=14), (n=14), (n=14), Enterobacter cloacaeEnterobacter cloacaeEnterobacter cloacae Enterobacter cloacae Enterobacter cloacaeEnterobacter cloacae Enterobacter cloacaeEnterobacter cloacaeEnterobacter cloacae Enterobacter cloacae Enterobacter cloacae (n=4 (n=4), Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae Enterobacter gergoviae (n=1) e (n=1) e (n=1) e (n=1) e (n=1) e Citrobacter freundii Citrobacter freundii Citrobacter freundiiCitrobacter freundiiCitrobacter freundii Citrobacter freundiiCitrobacter freundiiCitrobacter freundiiCitrobacter freundii Citrobacter freundiiCitrobacter freundiiCitrobacter freundii (n=1). (n=1). (n=1). (n=1). Essas amostras foram encaminhadas pelo Laboratório Central do Espírito Santo (LACEN) onde foram previamente analisadas e identificadas como resistentes a pelo menos um carbapenêmico. A maioria das amostras apresentou um perfil de multirresistência em relação aos 25 antimicrobianos analisados, destacando a resistência a polimixinas e tigeciclina. Todas as amostras apresentaram o gene blaKPC e a associação entre os genes de carbapenemases com genes de ESBL foi observada em todas as amostras. O perfil genético de resistência prevalente (34%) englobava os genes blaKPC, blaTEM, blaSHV, blaOXA-1 e blaCTX-Mgp1. Através da análiseAtravés da análise Através da análiseAtravés da análiseAtravés da análise Através da análiseAtravés da análiseAtravés da análiseAtravés da análiseAtravés da análiseAtravés da análiseAtravés da análise Através da análise por PFGE, por PFGE, por PFGE, por PFGE, por PFGE, por PFGE, foi observada foi observada foi observadafoi observadafoi observada foi observada foi observadafoi observadafoi observada a prevalência de dois pulsotipos entre as amostras de K. pneumoniae: kpA (40,42%) e kpB (19,14%). Já o pulsotipo smA foi encontrado em 13 das 14 das amostras de S. marcescens. As quatro amostras de E. cloacae apresentaram pulsotipos distintos. Através da técnica de MLST, realizada em 14 amostras de K. pneumoniae, o ST437 e ST340 foram os mais encontrados. O ST437 foi identificado na maioria (6\7) das amostras do pulsotipo kpB e o ST340 em todas as amostras do pulsotipo kpA (3\3). O ST628, ST37 e ST394 foram identificados nos pulsotipos kpD, kpO e kpH, respectivamente. O ST628 e o ST394 foram descritos pela primeira vez no Brasil.

Las infecciones con BLEE han experimentado importantes cambios epidemiológicos en los últimos tiempos y actualmente la atención se centra en el aumento de infecciones y colonizaciones en pacientes procedentes de la comunidad. La principal repercusión clínica de las BLEE parece ser la mayor frecuencia con la que estos pacientes con infecciones graves reciben un tratamiento empírico inadecuado (García et al., 2011). Por la problemática antes explicada y siendo los antibióticos betalactámicos las drogas más utilizadas para el tratamiento de infecciones bacterianas tanto a nivel ambulatorio como a nivel hospitalario, es que se planteó el presente estudio orientado a determinar la prevalencia de enterobacteriáceas productoras de BLEE en la Clínica Good Hope durante el periodo Marzo – Agosto del 2012, a fin de generar conocimientos sobre la magnitud y distribución de este tipo de bacterias resistentes y contribuir en la vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos.
Tesis

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:37:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1763198 bytes, checksum: a6cae95e6f8012cb14ce5b308bc9307a (MD5) Previous issue date: 2013-02-26
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
Mango wilt, caused by C. fimbriata, is a limiting factor to mango production in Oman, is here salinized soils predominant. As effect of salinity on disease intensity is unknown, we aimed to evaluate the effect of salinity on the disease in mango plants with different combinations rootstock x graft. Two experiments were carried out, E1 and E2. In both, we used five concentrations of NaCl (0, 15, 30, 45 and 60 mmol L-1) and three inoculation treatments (plants either uninoculated, inoculated in the rootstock, or inoculated in the graft). In E1, three cultivars were used as rootstocks ('Espada', 'Imbu' and 'Uba') and one as graft ('Haden'). In E2, Uba was used as rootstock and three cultivars were used as graft ('Palmer', 'Haden' and 'Tommy Atkins'). C. fimbriata was inoculated 10 cm above (graft inoculation) or below (rootstock inoculation) the grafting. The seedlings were kept in Hoagland solution in aerated hydroponic system. We run each experiment twice, each one in a completely randomized factorial design with four replicates (onde plant = one experimental unit). We assessed the time for the plants to wilt and die, length of lesions, and calculated the area under the disease progress curve and the rate of disease progression. At 0 and 90 days of exposure of the plant to the salt stress, we evaluated: plant height and diameter, and at 90 days the chlorophyll fluorescence and stomatal conductance. At the end of the experiments, we also determined: dry mass of the root and leaves, total dry matter, and content of N, P, K, Ca, Mg, Na and Cl in the root, stem, and leaves. The mango wilt intensity in the plants was greater when C. fimbriata was inoculated in the rootstock. There was a decrease in height, diameter, dry matter, and N, P, K, Ca and Mg with increasing concentrations of NaCl. In all cultivars evaluated disease symptoms were observed. In all situations in which Uba' was used as rootstock and 'Tommy Atkins' as graft, we detected lesser sensibility to salt stress and susceptibility to mango wilt.
A seca da mangueira, causada por Ceratocystis fimbriata, é o principal fator limitante à mangicultura em Omã. Nesse país, predominam os solos salinizados, e não se conhece o efeito da salinização na intensidade da doença. Assim, avaliou-se o efeito da salinidade sobre a doença em mudas de mangueiras, em diferentes combinações porta-enxerto x enxerto. Executaram-se dois ensaios, E1 e E2. Em ambos, usaram-se cinco concentrações de NaCl (0, 15, 30, 45 e 60 mmol L-1) e três condições de inoculação (sem inoculação, inoculação do porta-enxerto e inoculação do enxerto). Em E1, usaram-se três cultivares como porta-enxerto ( Espada , Imbu e Ubá ) e um como enxerto ( Haden ). Em E2, adotou-se Ubá como porta-enxerto e três cultivares ( Palmer , Haden e Tommy Atkins ) como enxerto. Inocularam-se as mudas, conduzidas em solução de Hoagland em sistema hidropônico aerado, com C. fimbriata a 10 cm acima (inoculação do enxerto) ou abaixo (inoculação do porta-enxerto) da marcação da enxertia. Executou-se cada ensaio por duas vezes, em esquema fatorial no delineamento inteiramente casualizado, com quatro repetições (uma muda=uma unidade experimental). Avaliaram-se os tempos para murcha e morte das plantas e o comprimento de lesões, e se calcularam a área abaixo da curva de progresso e a taxa de progresso da doença. Aos 0 e 90 dias após exposição ao estresse salino, avaliaram-se: altura e diâmetro das plantas, calculando-se o incremento na altura e no diâmetro no período, e aos 90 dias, avaliaram-se o índice SPAD e a condutância estomática. Ao final dos ensaios, determinaram-se: massa seca da raiz, do porta-enxerto, do enxerto, das folhas, e total, bem como os teores de N, P, K, Ca, Mg, Na e Cl na raiz, caule do porta-enxerto, caule do enxerto e folhas. A intensidade da seca foi maior quando se inoculou o porta-enxerto. Houve menor crescimento, em termos de altura e diâmetro, decréscimo da massa seca e dos teores de N, P, K, Ca e Mg com o aumento das concentrações de NaCl. Em todos os cultivares avaliados, observaram-se sintomas da doença. No conjunto das características avaliadas, Ubá usada como porta-enxerto e Tommy Atkins como enxerto, foram menos sensíveis ao estresse salino e à doença.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:47:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1129609 bytes, checksum: a3efeca5c3602073a6372b6303d99ce6 (MD5) Previous issue date: 2013-07-31
Surgical site infection (SSI) has been indicated as the third cause of nosocomial infection. The present study aimed at determining the epidemiological profile of SSI and its association to the described risk factors. It is a transversal study done at the São João Batista Hospital at at Viçosa-MG and at the Surgery Service of the Small Animals Veterinary Hospital of the Universidade Federal de Viçosa-MG, from September 2012 to February 2013. SSI global rates were 0.7% at the human and 3.46% at the veterinary hospitals. At the veterinary hospital, SSI rates were not related to contamination potential, with clean procedures presenting the greater rates. As for the type of surgery, orthopedic ones are the most common in both hospital and also the ones presenting the greater SSI rates. The diagnosis of SSI occurred within 30 days after surgery, and data HVT-UFV demonstrated effectiveness studies developed in this hospital, indicating improvement in the prevention and control of SSI, but in both hospitals is not performed surveillance post-discharge of patients, and may infer that there was underreporting of SSI. Bacteria isolated from surgical wounds were multi-resistant and the obtained data indicated that no criteria of antibiotic prophylaxis existed, mainly for clean surgeries. This scenario shows that the action of a commission to control nosocomial infection are extremely relevant in order to guarantee reliable data so that the quality of service may be evaluated and thus, promoting a decrease the risk of in post-operative complications.
A infecção de sítio cirúrgico (ISC) tem sido apontada como a terceira causa mais comum de infecção nosocomial. Este estudo objetivou determinar o perfil epidemiológico das ISCs e sua associação aos fatores de risco descritos. Trata-se de um estudo transversal, realizado no Hospital São João Batista de Viçosa-MG e na Clínica Cirúrgica de Cães e Gatos do Hospital Veterinário da Universidade Federal de Viçosa- MG, no período de setembro de 2012 a fevereiro de 2013. As taxas globais de ISC foram de 0,7% no hospital humano e 3,46% no veterinário. No hospital veterinário, a taxa de ISC não mostrou relação com o potencial de contaminação, apresentando a maior taxa nos procedimentos classificados como limpos. Quanto ao tipo de cirurgia, as ortopédicas são as mais comuns em ambos os hospitais e também as que apresentam maior taxa de ISC. Foi observada diferença significativa nas cirurgias com duração superior a 40 minutos pelos testes não paramétricos de Wilcoxon e Mann-Whitney (p=0,041) no HVT-UFV. O diagnóstico das ISC ocorreu dentro dos 30 dias após a cirurgia, e dados do HVT-UFV demonstraram efetividade dos estudos desenvolvidos neste hospital, indicando melhora das medidas de prevenção e controle das ISC, porém em ambos os hospitais não é realizada a vigilância pós-alta dos pacientes, podendo inferir que houve subnotificação das ISC. As bactérias isoladas das feridas cirúrgicas foram multirresistentes e os dados levantados indicam que não houve critério quanto ao emprego da antibioticoprofilaxia, principalmente nas cirurgias limpas. Este cenário mostra que é de extrema relevância a atuação de uma comissão de controle de infecção hospitalar, a fim de garantir obtenção de dados fidedignos, para que se possa avaliar a qualidade do serviço prestado e assim promover a redução dos riscos de complicações pós-operatórias.

Die genitale Bilharziose ist eine Manifestation der Bilharziose, über deren Bedeutung für die reproduktive Gesundheit der Frau bisher wenig bekannt ist. Das klinische Bild der genitalen Bilharziose ist heterogen, da alle Genitalorgane betroffen sein können. Durch die Bilharziose verursachte gynäkologische Probleme wie z.B. Infertilität können für die betroffenen Frauen erhebliche Auswirkungen auf ihr soziales Leben haben (Scheidung wegen Kinderlosigkeit, verringerte Heiratsaussichten). In der vorliegenden Arbeit werden epidemiologische, parasitologische und klinische Untersuchungsergebnisse von Feldforschungsarbeiten zur genitalen Bilharziose der Zervix, die in Tansania durchgeführt wurden, vorgestellt. In den Studiendörfern war die Häufigkeit der genitalen Bilharziose der Zervix (38 %) bei Frauen im Alter zwischen 15 und 45 Jahren nahezu zahlengleich mit der Häufigkeit der Blasenbilharziose (42 %). Die genitale Bilharziose der Zervix ging einher mit "sandy patches", die als pathognomisch angesehen werden, Leukoplakien und Epithelläsionen. In den Biopsien von Frauen mit genitaler Bilharziose wurde im Vergleich zu nichtinfizierten Frauen eine erhöhte Anzahl von Entzündungszellen gesehen. Nach Therapie mit Praziquantel sank die Häufigkeit der genitalen Bilharziose um 70 %. Die Diagnose der genitalen Bilharziose der Zervix durch den direkten Nachweis mittels eines Quetschpräparats des Zervixgewebes ist der histologischen Untersuchung der Zervixbiopsie und der zytologischen Untersuchung des Zervixabstriches überlegen. Die diagnostische Wertigkeit indirekter Krankheitsmarker wurde untersucht. Frauen mit genitaler Bilharziose wiesen höhere Spiegel von eosinophilem kathodischen Protein (ECP) in der vaginalen Lavage auf als nichtinfizierte Frauen. Dies war aber auch bei Frauen mit sexuell übertragbaren Infektionen der Fall war. Es wurden bei Frauen mit genitaler Bilharziose - im Verhältnis zur Eiausscheidung im Urin - höhere Schistosomenantigenspiegel (CAA) festgestellt als bei Frauen mit ausschließlicher Blasenbilharziose. Dies kann durch die "ektopische" Lokalisation der adulten Würmer im Zervixgewebe erklärt werden. Die Forschungsergebnisse geben Hinweise, die die Hypothese einer möglichen Interaktion zwischen der genitalen Bilharziose und Infektionen mit HIV bzw. HPV unterstützen. Dazu gehören z.B. die Störung der Barrierefunktion des Zervixepithels bereits im jungen Alter und die Anwesenheit von HIV-empfänglichen Zellen im Zervixgewebe, die das Risiko einer Infektion mit HIV erhöhen könnten.
Female genital schistosomiasis is a neglected manifestation of schistosomiasis and its public health importance is yet to be determined. Symptoms and signs induced by genital schistosomiasis are unspecific and depending on the localisation of the infection the clinical picture is heterogenous. Pathological consequences of female genital schistosomiasis such as infertility may have a considerable impact on the social life of the diseased woman resulting in divorce or reduced chances to marry. In this paper the results of epidemiological, parasitological and clinical investigations of female genital schistosomiasis, which have been carried out in two study villages in Northern Tanzania, are described. The frequency of schistosomiasis of the cervix in women aged 15 to 45 years (38%) was similar to the frequency of urinary schistosomiasis (42%). The main pathological lesions seen were sandy patches, which seem to be pathognomic, leucoplakia and epithelial lesions. In cervical biopsies of women with genital schistosomiasis a higher absolute number of inflammatory cells were seen compared to women without the infection. The standard therapy reduced the frequency of genital schistosomiasis by 70%. The diagnostic performance of the direct parasitological examination of cervical tissue was better compared to the histopathological examination of the biopsy or the cytological examination of the cervical smear. The diagnostic value of indirect disease markers were investigated. Women with diagnosed genital schistosomiasis and sexually transmitted diseases showed higher levels of eosinophil cationic protein (ECP) in the vaginal lavage compared to women without infections. In women with genital schistosomiasis higher levels of schistosome antigens (CAA) were detected compared to women with urinary schistosomiasis only. This might be explained by the "ectopic" localisation of adult schistosomes in the genital tract. The research results support the hypothesis of a possible interaction of genital schistosomiasis with sexually transmitted infections such as HIV and HPV, e.g. the disruption of the cervical epithelial barrier in young age and the presence of HIV-sensible cells due to genital schistosomiasis might increase the risk of HIV transmission.

L’objectiu principal de la recerca realitzada és analitzar la contaminació de la població general per compostos tòxics persistents (CTPs) i estudiar la relació de les concentracions corporals d’aquests contaminants amb alguns dels seus possibles efectes adversos en la salut humana. La tesi aporta dades i coneixement sobre la contaminació per CTPs de la població general a Catalunya i a la ciutat de Barcelona. Es basa per una banda en una mostra de participants de l’Enquesta de Salut de Catalunya i, per l’altra, en una mostra de participants de l’Enquesta de Salut de Barcelona; són dos dels tres únics estudis sobre CTPs a nivell espanyol lligats a enquestes de salut o nutricionals i amb dades representatives de la població general. En la tesi s’apliquen noves formes de presentar i analitzar els resultats d’aquest tipus d’estudis a través de corbes de distribució poblacional i d’indicadors com el ‘nombre de compostos detectats a altes concentracions’, el qual també s’aplica en aquesta tesi a les dades disponibles de l’enquesta de salut dels Estats Units (l’anomenada NHANES). Aquesta enquesta recull periòdicament una àmplia quantitat de dades de biomonitorització ambiental representatives de la població general d’Estats Units. La tesi també analitza les relacions entre les concentracions sèriques de CTPs i la salut autopercebuda, la prevalença de diabetis tipus 2, prediabetis i de fenotips metabòlics alterats en persones amb sobrepès i obesitat i, per primer cop, en persones amb pes normal. A més, té en compte marcadors poc utilitzats en aquest context com és la proteïna C-reactiva. Les troballes plantegen noves hipòtesis que poden ser analitzades en estudis amb dissenys prospectius longitudinals, els quals poden incloure a més altres contaminants i factors rellevants. El coneixement generat pot ser utilitzat tant alhora d’avaluar l’impacte i els efectes de la contaminació de la població per CTPs, com alhora d’avaluar l’impacte de les polítiques públiques i privades que es puguin realitzar per reduir-la.
The main aims of the research are to analyse the contamination of the general population by persistent toxic pollutants (PTS), as well as to study the relation between body concentrations of such compounds and some their possible adverse health effects. The thesis provides data and knowledge about the contamination by PTS of the general population of Catalonia and of the city of Barcelona. On one hand, it is based on a sample of participants of the Catalan Health Interview Survey, and in the other, on a sample of participants of the Barcelona Health Survey; these are two out of the three only studies on PTS in Spain linked to health or nutritional surveys and with representative data of the general population. New ways to present and analyse the results of this type of studies are applied in the thesis through population distribution curves and indicators such as the ‘number of compounds detected at high concentrations’, which is also computed in this thesis for the available data of the United States’ health survey (the so called NHANES). This survey periodically collets a wide quantity of environmental biomonitoring data representative of the general population of the United States. The thesis also analyses the relationships between serum concentrations of PTS and self-rated health, the prevalence of type 2 diabetes, prediabetes, and unhealthy metabolic phenotypes in overweight and obese individuals and, for the first time, in normal weight subjects. Moreover, markers not much used in this context, such as C-reactive protein, are considered. Findings suggest new hypotheses to be analysed in prospective longitudinal studies considering also other contaminants and relevant factors. The knowledge provided can be used when assessing the impact and effects of the population contamination by PTS, and also when assessing the impact of the public and private polices aimed to reduce such contamination.

Made available in DSpace on 2014-07-29T15:30:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao de Benigno Alberto Moraes Rocha.pdf: 429604 bytes, checksum: e7166c606b960cf25df199a5ddc928fd (MD5) Previous issue date: 2008-02-29
In Brazil, dengue is present in almost all states and territories, with a circulation of three different serotypes (DEN 1, DEN 2 and DEN 3), resulting in about 500 000 cases reported in 2007 (PAHO 2008; MS / SVS 2008a). This dissertation consists of a literature review, with emphasis on the epidemiology of dengue in Brazil and two articles that are designed to analyze the clinical and epidemiological characteristics of this condition, focusing on children under 15 years old, in Goiânia. The first article provides a profile analysis 59. 157 reported cases of dengue (SINAN), in Goiania, from 2001 to 2006. It also presents a reliability evaluation of the clinical classification of dengue, as recorded in the SINAN, compared with a revised classification proposed by the authors. There was an increase of dengue fever with complications or Dengue hemorrhagic fever in all age groups (p <0.05), children showed more hemorrhagic manifestations, however, no difference in the proportion of severe cases among adults and children. The results showed a low capacity of the surveillance system for classifying cases potentially serious in children under 15 years old (Kappa = 0.22; 95% CI 0.20 to 0.24). The second article examines 162 children under 15 years with acute febrile illness suggestive of dengue fever, attended from 2005 to 2006. We collected blood samples for detection of IgM anti-dengue (MAC-ELISA), molecular biology test (RT-PCR) and virus isolation. Half the cases were laboratory confirmed by serology and 84 and five by RT-PCR and / or virus isolation and identification of DEN 3 in all. Myalgia, arthralgia, rash, thrombocytopenia and leukopenia were more frequent among confirmed cases (p <0.05). PPV and NPV for suspected dengue cases, by clinical criteria, were respectively 54.8% and 40.0%. Recommended clinical criteria for diagnosis of dengue were reluctant for this specific age group, even in a region of high endemicity.
No Brasil, a dengue esta presente em quase todos os estados e territórios, com circulação de três sorotipos diferentes (DEN 1, DEN 2 e DEN 3), resultando em cerca de 500 mil casos notificados, em 2007 (PAHO 2008; MS/SVS 2008a). A presente dissertação de mestrado é composta por uma revisão da literatura, com ênfase na epidemiologia da dengue no Brasil e por dois artigos que se propõem analisar as características clínicas e epidemiológicas desse agravo, com enfoque em menores de 15 anos de idade, em Goiânia. O primeiro artigo traz uma análise do perfil de 59. 157 casos notificados de dengue (SINAN), em Goiânia, de 2001 a 2006. Apresenta, também, uma avaliação da confiabilidade da classificação clínica de dengue, conforme registrada no SINAN, em comparação com uma classificação revisada, propostas pelos autores. Houve aumento de dengue com complicação ou dengue hemorrágica, em todas as faixas etárias (p<0,05), Crianças apresentaram mais manifestações hemorrágicas, entretanto, não houve diferença na proporção de formas graves entre adultos e crianças. Foi evidenciada uma baixa capacidade do sistema de vigilância para classificar casos potencialmente graves, em menores de 15 anos de idade (Kappa = 0,22; IC95% 0,20-0,24). O segundo artigo analisa 162 menores de 15 anos, com quadro febril agudo, sugestivo de dengue, atendidas entre 2005 a 2006. Foram colhidas amostras de sangue para detecção de IgM anti-dengue (MAC-ELISA); teste de biologia molecular (RT-PCR) e isolamento viral. Metade dos casos foram confirmados laboratorialmente, sendo 84 por sorologia e cinco por RT-PCR e/ou isolamento viral, com identificação de DEN 3 em todos eles. Mialgia,artralgia, exantema, plaquetopenia e leucopenia foram mais freqüentes entre os casos confirmados (p< 0,05). VPP e VPN para casos suspeitos de dengue, pelos critérios clínicos, foram, respectivamente, de 54,8% e 40,0%. Critérios clínicos preconizados para o diagnóstico de dengue mostraram-se pouco específicos para esta faixa etária, mesmo em região de alta endemicidade.

ABSTRACT: This is a community-based cross-sectional study where the prevalence of domestic violence and its associated factors were determined. The aim of the study was to determine prevalence and epidemiology of domestic violence among female health worker of General Ministry of Health (MOH) Hospital in Jeddah, Kingdom of Saudi Arabia. A self-administered questionnaire was the tool of the study. Simple random sampling technique was used to select female health workers. All female health workers including physicians, nurses, pharmacists, physiotherapists and lab technicians from general MOH hospitals participated in the study. The prevalence of violence was 45.3 % among female health workers of general MOH hospitals. The Saudi nationality, divorce, higher monthly income, supporting their families financially, sharing children expenditure with their partners and using polygamy were found to be associated with domestic violence. The study concluded that domestic violence was found to be high in the study population and was associated with several factors.

Lead is a highly toxic metal that has been used by humans for over 2000 years. Over this time it has become increasingly apparent that despite its usefulness, lead is one of the most highly toxic substances known to man. Current research into lead exposure of humans focuses on low-level chronic exposure and its effects on learning and behaviour. However, investigations into lead exposure of wildlife are still focussed on mortalities, particularly of waterfowl and raptors, with little known about low-level exposures or the effects on other species. This study examines the exposure of free-ranging kea (Nestor notabilis) from the Aoraki/ Mt Cook village and national park, takahe (Porphyrio hochstetteri) from Tiritiri Matangi, Kapiti and Mana Islands, and the lead associated syndrome of clenched-claw paralysis and leg paresis in harriers (Circus approximans) in New Zealand. Thirty-eight kea had detectable blood lead with concentrations ranging from 0.028 mg/L to 3.43 mg/L (mean = 0.428 mg/L ± 0.581). Analysis of tissue samples found that seven of 15 birds died with elevated tissue lead. Lead exposure may be an important contributing factor in kea mortality. As a result of these findings, lead abatement in areas frequented by kea is being considered. Eighteen of 45 takahe had detectable blood lead concentrations ranging from 0.015 mg/L to 0.148 mg/L (mean = 0.028 mg/L ± 0.042). Analysis of tissue samples from offshore island and Murchison Mountains birds found that all had detectable lead. Despite levels of lead exposure in the population being low and unlikely to result in overt clinical signs, it is widespread and there may be significant exposure of birds living around old buildings. An investigation into the clinical signs, pathology and response to treatment of clenched-claw paralysis and leg paresis in wild harriers was carried out. Harriers with clenched feet had significantly higher blood lead concentrations than those without. In conclusion, lead is a major factor in the expression of this clinical syndrome but other factors not yet identified are playing a role. This study demonstrates that lead is widespread in the New Zealand environment exposing a diverse range of avifauna, and has made some progress towards exploring some of its effects on health and survival.