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Dissertations / Theses on the topic 'Etude de liaison et d'association'
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De, Sousa Teixeira Vitor Hugo. "Identification et caractérisation des gènes candidats dans la polyarthite rhumatoïde." Thesis, Evry-Val d'Essonne, 2009. http://www.theses.fr/2009EVRY0032/document.
Full textAbstract:
La Polyarthrite Rhumatoïde, une des maladies auto-immunes les plus répandues, est caractérisée par une destruction progressive des articulations, conduisant à des déformations et handicaps. La nature multifactorielle de la PR fournit une hétérogénéité élevée avec des combinaisons spécifiques entre un profil génétique et des facteurs environnementaux qui influencent la susceptibilité, la gravité et le développement de la maladie. L’objectif de cette thèse est l’identification et la caractérisation de gènes candidats dans la PR. Nous avons confirmé l’association ainsi que la liaison des régions TRAF1-C5 et 6q23, et démontré une tendance pour une association et liaison entre la région génique 4q27 et la PR dans la population européenne. De plus, nous avons fourni des résultats concluants qui s’opposent à une implication des gènes PRKCH, CASP7, RANK, RANKL et PTPN22-1123G dans la susceptibilité génétique à la PR dans la population européenne. Nous avons effectué une étude d’expression génique utilisant 48.701 ADNc des PBMC de patients et contrôles sains. Une expression différentielle de 339 gènes entre les deux groupes a été observée. Nous avons identifié une expression élevée d’un spectre de nouveaux gènes impliqués dans différents mécanismes immunitaires de la PR. Nous avons aussi identifié une association entre les allèles HLA EP et le tabac au sein des patients ACPA positifs avec une PR familiale ou sporadique. Ces différentes approches complémentaires ont permis l’identification de nouveaux gènes et la mise en évidence d’interactions gène-autoanticorps-environnement, contribuant ainsi à une meilleure compréhension des mécanismes pathologiques de la PRRheumatoid Arthritis, one of the most common autoimmune diseases, is characterized by progressive articular damage leading to joint deformities and disability. The multifactorial nature of RA provides high disease heterogeneity with specific combinations of a genetic background and environmental factors that influence the susceptibility, severity and outcome of the disease. The aim of this thesis was the identification and characterization of candidate genes in RA. We have confirmed the association and linkage of TRAF1-C5 and 6q23 gene regions, and demonstrated a trend for the association and linkage of the 4q27 gene region with RA in European descent populations. Furthermore, we provided evidence against the involvement of the PRKCH, CASP7, RANK and RANKL genes and the PTPN22–1123G allele in RA genetic susceptibility in the European population. We performed a large-scale gene expression profiling study using 48.701 cDNAs in PBMCs of RA patients and healthy controls. A differentially expression of 339 genes (238 down-regulated and 101 up-regulated) between the two groups was observed. We identified a remarkably elevated expression of a spectrum of new genes involved in immunity and defense mechanisms. Finally, we identified an association between HLA SE alleles and tobacco smoking for anti-CCP positivity in French population with familial and sporadic RA. All these complementary approaches that allowed the identification of new genes and gene-autoantibodies-environment interactions contribute to a better understanding of RA disease mechanisms and could lead to the identification of innovative clinical biomarkers for diagnostic procedures and therapeutic interventions
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LEBOYER, EL CAMARCAT MARION. "Approche genetique de la maladie maniaco-depressive et de la schizophrenie : problemes methodologiques, etudes d'association et de liaison genetique." Paris 6, 1990. http://www.theses.fr/1990PA066580.
Full textAbstract:
Les etudes familiales, de jumeaux et d'adoption ont montre que des facteurs de susceptibilite genetique intervenaient dans l'etiopathogenie des troubles de l'humeur et de la schizophrenie. Mais, jusqu'a present, l'identification de ces facteurs de vulnerabilite genetique et de leur mode de transmission n'a pu etre realisee. Cependant, les progres effectues d'une part en genetique, identification de nouveaux marqueurs genetiques polymorphes repartis sur l'ensemble du genome, et d'autre part en clinique, utilisation de methodologies diagnostiques augmentant la fidelite intercotateur, ont renouvele l'espoir de pouvoir identifier les facteurs de susceptibilite genetique des maladies psychiatriques. Apres avoir passe en revue les methodologies genetiques et les donnees issues de leur application a l'etude des troubles de l'humeur et de la schizophrenie, nous avons cherche a repondre a trois questions methodologiques specifiques aux recherches en genetique et psychiatrie: 1) quels sont les criteres de choix des systemes diagnostiques au cours d'etudes familiales? 2) combien de familles nucleaires doit-on reunir pour repliquer un resultat de linkage en psychiatrie? 3) quel est l'impact d'une erreur d'attribution du statut maladie sur les resultats d'une etude de linkage? ceci nous a amene a decrire les strategies cliniques, biologiques et genetiques choisies ici pour tenter de repliquer les premiers resultats de linkage obtenus en psychiatrie. Deux etudes de linkage, entre marqueurs du chromosome 5 et schizophrenie d'une part, et entre marqueurs du chromosome 11 et maladie maniaco-depressive d'autre part, ne nous ont pas permis de repliquer les premiers resultats positifs obtenus avec ces marqueurs genetiques. Par contre, nous avons mis en evidence une association entre un polymorphisme de la tyrosine hydroxylase, situe sur le bras court du chromosome 11, et les depressions bipolaires. Ce resultat nous conduit a souligner les incertitudes qui entourent la realisation d'etudes de linkage en psychiatrie et les avantages que presentent l'application de methodes non parametriques, comme les etudes de paires de germains atteints ou les etudes d'association, utilisant des genes candidats suffisamment polymorphes
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Brand, Eva. "Rôle des gènes candidats dans l'hypertension artérielle." Paris 6, 2008. http://www.theses.fr/2008PA066410.
Full textAbstract:
L’implication de la génétique dans l’hypertension essentielle a été démontrée par des études épidémiologiques portant sur des familles et des jumeaux. A l’INSERM-U525, nous avons étudié plusieurs gènes candidats de l’hypertension essentielle. Au cours de la thèse, des résultats sur 3 différents candidats - l’angiotensinogen (AGT), l'aldostérone synthase (CYP11B2) et le récepteur couplé aux protéine kinase (GRK4) - complétés par des études fonctionnelles qui consistaient en des analyses de promoteurs par des gènes reporters, des cotransfections, des electrophoretic mobility shift assays, et des supershift assays, sont présentés. L’application des nouvelles technologies pour identifier de nouveaux gènes candidats par des études d’association pan-génomiques (genome-wide association studies), des analyses d’expressions de gènes, des approches transcriptomiques et protéomiques en liaison avec des analyses fonctionnelles moléculaires représentent de très importants outils pour la recherche approfondie des maladies génétiques complexes. Family and twin studies have suggested a significant contribution of genetics to developing essential hypertension. At INSERM U525, we have studied several candidate genes for hypertension. In the present thesis, I propose results on 3 different genes including angiotensinogen (AGT), aldosterone synthase (CYP11B2) and G-protein coupled receptor kinase (GRK4) accompanied by functional studies such as promoter reporter gene assays, cotransfection assays, electrophoretic mobility shift assays and supershift assays. Applying new technologies for non-hypothesis driven candidate gene identification using genome-wide association studies, gene expression analyses, transcriptome approaches and proteomics and linking them with reliable and sophisticated molecular genetic/biological techniques will be one most important future challenges to come closer to the deciphering of complex genetic diseases.
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Veyrieras, Jean-Baptiste. "Etude du déterminisme génétique de caractères quantitatifs chez les végétaux : méta-analyse de QTL et études d'association." Phd thesis, INAPG (AgroParisTech), 2006. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00002275.
Full textAbstract:
L'étude de l'hérédité de caractères quantitatifs est au coeur de la génétique depuis l'avènement de cette science au siècle dernier. La génétique quantitative dispose désormais d'un cadre expérimental et théorique bien établi pour étudier les facteurs génétiques sous-jacents à l'hérédité de caractères complexes, que ce soit dans un but cognitif ou pour épauler les programmes d'amélioration variétale chez les espèces d'intérêt agronomique. Généralement, l'étude du déterminisme génétique de caractères quantitatifs s'articule autour de trois étapes majeures: i) déterminer les principaux locus impliqués dans la variation observée (dénommés QTL pour (( Quantitative Trait Loci ))), ii) identifier les gènes en cause, iii) discriminer les principales formes alléliques de ces gènes et évaluer leurs effets. L'avènement des marqueurs moléculaires et de la génomique au cours des vingt dernières années a facilité la mise en oeuvre de dispositifs expérimentaux de cartographie de QTL en génétique végétale. Il est désormais possible d'avoir accès, via les bases de données publiques, à une masse importante de résultats de détection de QTL. Parallèlement, pour certaines espèces végétales, l'annotation de leurs génomes fournit une information de plus en plus riche et précise sur la structure et la fonction des gènes. L'objectif de cette thèse était double. D'une part nous avons cherché à développer une nouvelle approche de type méta-analyse pour optimiser le croisement entre les données de QTL et celles issues de la génomique, dans le but de faciliter la recherche de gènes candidats. Une fois ces derniers identifiés, l'association entre leur diversité allélique et la variation du caractère peut
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Ghandil, Pegah. "Genetic study of the type 1 diabetes : search for susceptibility genes on chromosom 16." Paris 6, 2005. http://www.theses.fr/2005PA066593.
Full text
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Pugh, Moreno Tatiana. "Etude des déséquilibres de liaison dans une collection de cacaoyers (Theobroma cacao L. ) appartenant au groupe criollo/trinitario et application au marquage génétique des caractères d'intérête." Montpellier, ENSA, 2005. http://www.theses.fr/2005ENSA0005.
Full textAbstract:
La structure du génome des variétés de Criollo modernes et Trinitario de cacaoyer résulte d'une domestication récente datant de 250 ans et qui a mis en jeu un nombre réduit d'ancêtres parentaux : Criollo ancien et Forastero bas amazoniens. Une collection de 247 accessions de Criollo modernes et Trinitario conservées au CATIE (Centro Agronómico Tropical de Investigación y Enseñanza, Costa Rica) a été étudiée. La base génétique très étroite de ce groupe génétique et le petit nombre de générations de recombinaisons qui se sont produites depuis les premières hybridations entre ancêtres parentaux en font un bon modèle pour des études d'associations. Afin de disposer d'un outil d'analyse performant pour ces études d'association, une carte génétique saturée en marqueurs SSR (single sequence repeat) a été produite. Cette carte contient 465 marqueurs (268 SSR, 176 RFLP, 5 isoenzymes et 16 Rgenes). Sa longueur est de 783 cM, avec une distance moyenne entre marqueurs de 1,7 cM et une distance moyenne entre marqueurs SSR de 3 cM. La diversité génétique des 247 accessions de Criollo modernes /Trinitario a été évaluée à l'aide de 34 SSR répartis sur tout le génome du cacaoyer. Une moyenne de 5,2 allèles par locus a été observée. Deux allèles, toujours plus fréquents que les autres, correspondent à ceux des principaux ancêtres fondateurs: Criollo ancien et Forastero bas-amazoniens. Un sous ensemble de 37 accessions représentant 99,5% de la variabilité allèlique totale de cette collection de Criollo/Trinitario a été identifiée. Une caractérisation morphologique de 150 de ces accessions a été faite il y a 25 ans par Engels et al. (1981), et ces données sont accessibles par la base de données ICGD (International Cocoa Germplasm Database). Ces 150 accessions ont été utilisées pour nos études de déséquilibre de liaison. Un premier lot de 24 SSR a servi à vérifier l'absence de structure de cette collection ainsi que le déséquilibre de liaison (DL) global qui est apparu faible. Puis 110 SSR, pour lesquels des allèles spécifiques des Criollo ont été identifiés, ont été utilisés pour évaluer l'étendue du DL. Celui est variable mais s'étendre jusqu'à 30 cM. Des associations entre caractères de fruit, de fève et de fleur ont été identifiées sur 13 régions chromosomiques. Parmi elles 8 correspondent à des régions où des QTL portant sur les mêmes caractères ont déjà été identifiés par des approches classiques. Ces résultats nous démontrent l'intérêt et la faisabilité de ces études d'association pour identifier les bases génétiques des caractères d'intérêt chez le cacaoyer et représentent une valorisation supplémentaire des données de caractérisation de collection qui existent.
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Wang, Fu-Cai. "Etude des phénomènes d'association mis en jeu lors de la formation de gels physiques obtenus par synthèse de polyuréthanes en solution dans le styrène." Lyon, INSA, 1991. http://www.theses.fr/1991ISAL0042.
Full textAbstract:
Le but de ce travail est de comrrendre le ou les mécanismes d'association intranet intermoléculaires et éventuellement de formation de gel physique lors du mûrissement d'une résine polyester insaturé pas un isocyanate, pour une application composites (SMC et BMC). Nous avons choisi un système réactif modèle constitué d'un oligomère polyadipate saturé réagissant avec un diisocyanate en solution dans le styrène. Les phénomènes de gel physique ont été observés pour les mélanges dans un domaine de concentration très large. L'étude à l'aide de 1 'Infrarouge à Transformée de Fourier des gels obtenus nous a permis de mettre en évidence et d'analyse quantitativement les liaisons hydrogène entre les chaînes polyuréthane formées ainsi qu'entre les chaînes polyuréthane et les noyaux aromatiques du styrène. La caractérisation de la solvatation dans les gels a montré qu'un, ombre important de molécules de styrène sont "intercalées" sous forme de couches monomoléculaires dans le réseau tridimensionnel physique formé par les liaisons hydrogène. De même, les mesures de propriétés rhéologiques des gels ont montré qu'aux échelles de temps longues, ces gels se comportent plutôt comme des liquides viscoélastiques. Par conséquent 1'enchevêtrement des chaînes et les liaisons hydrogène ne conduisent qu'à un « gel faible »The aim of this work is to understand the mechanisms of intra- or intermolecular association which causes the formation of the Physical gels, during the thickening process of unsaturated of esters in sheet molding compounds by isocyanate. A model reactive s stem was chosen: a saturated hydoxy-terminated polyadipate with a diisocyanate in styrene. The phenomenon of physical gels was observed in large range of concentrations. With the aid of Fourier Transform Infrared the study of the gels shows that hydrogen bonds exist not only between polyurethane chains but also between polyurethane chains and styrene molecules. These hydrogen bonds were also investigated quantitatively. The characterization of solvating of these gels indicates that a great number of styrene molecules are « intercalated » in the form of monomolecular layers in the three-dimensional network which is formed by the hydrogen bonding, the measure of the rheological properties of the gels demonstrates that at low frequencies these gels are viscoelastic liquids, therefore they are produced by entanglements and hydrogen bonding and are considered only weak gels
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Danis, François. "Etude cinétique et thermochimique de réactions d'association de radicaux halogènes d'intéret atmosphérique." Bordeaux 1, 1990. http://www.theses.fr/1990BOR10557.
Full textAbstract:
Ce memoire concerne la determination experimentale: 1) des constantes de vitesse des reactions: a) bro+no#2+mbrono#2+m entre 263 et 343 k et de 4 a 12 torr; b) ccl#3+ccl#3+mc#2cl#6+m entre 253 et 623 k et a 760 torr; c) ccl#3+o#2+mccl#3o#2+m entre 233 et 333 k et de 0,5 a 760 torr. Une comparaison est faite entre ces valeurs experimentales et les resultats obtenus grace a la theorie des reactions monomoleculaires; 2) de l'enthalpie de la derniere reaction a partir de l'etude de l'equilibre ccl#3+o#2+mccl#3o#2+m observe entre 351 et 421 k et a 760 torr
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Bessac, Fabienne. "Etude théorique de gros systèmes : analyse de liaison et modélisation." Toulouse 3, 2004. http://www.theses.fr/2004TOU30213.
Full text
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Lenoir, Pascal. "L'audition chez l'enfant autiste - etude clinique et electrophysiologique des fonctions de perception et d'association transmodale." Paris 6, 1994. http://www.theses.fr/1994PA066742.
Full textAbstract:
La reactivite anormale a des stimulations sensorielles diverses de l'environnement est bien connue des parents d'enfants autistes. Elle est pourtant encore ignoree des classifications nosographiques. De meme l'association entre la sensorialite auditive et visuelle parait perturbee. Nous avons voulu demontrer la realite et la specificite des troubles de la reactivite auditive dans l'autisme en nous appuyant sur l'hypothese neurophysiologique d'un trouble de la modulation sensorielle cerebrale. La perception auditive et l'habituation ont ete explorees chez 23 enfants autistes compares a des enfants retardes et normaux avec une echelle quantitative (echelle de comportement auditif), un test experimental (test de perception-habituation), et un protocole electrophysiologique de modulation des potentiels evoques auditifs corticaux. Les resultats montrent des troubles importants dans la perception et l'habituation chez les autistes. On a pu mettre en evidence des sous-groupes d'autistes suivant des profils biocliniques. Ces donnees sont en faveur d'un trouble primaire de la modulation sensorielle cerebrale. L'association croisee auditivo-visuelle a ete exploree chez le meme echantillon d'enfants avec une echelle quantitative (echelle d'association croisee auditivovisuelle), un test experimental (test d'association croisee auditivo-visuelle), et un protocole electrophysiologique de couplage son-lumiere. Les resultats montrent que l'association est possible chez les autistes (sauf pour l'association visuo-verbale) mais elle est bizarre et variable dans le temps avec une fixite parfois excessive a long terme qui tranche avec un maintien insuffisant a la repetition. Cette capacite d'association meme irreguliere rend possible des apprentissages. Des applications pratiques pour les evaluations et les soins therapeutiques sont proposees
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Reffay, Myriam. "Caractérisation de complexes protéiques : etude statique et dynamique d'association entre des proétines membranaires." Phd thesis, Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2007. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00442387.
Full textAbstract:
Les protéines membranaires interviennent dans de nombreux mécanismes cellulaires. Cependant, peu de techniques sont adaptées à l'étude des interactions entre ces protéines. Nous sommes parvenus à les caractériser dans un milieu de membranes modèles dont l'épaisseur et la séparation entre bicouches sont ajustables. L'étude de la diffusion d'objets membranaires a permis de remettre en question l'utilisation du modèle de Saffman-Delbrück. Ces résultats montrent la sensibilité de la mobilité par rapport à l'état de liaison d'une protéine. Grâce à des mesures de recouvrement de fluorescence, nous avons caractérisé des interactions entre protéines membranaires en étudiant deux exemples : l'interaction connue entre streptavidine et biotine et celle entre des protéines constituant une pompe à efflux chez la bactérie P. aeruginosa. Cette thèse s'articule autour des différentes questions soulevées par une interaction : la géométrie du complexe, sa stoechiométrie selon différentes conditions de pH mais aussi la mesure des constantes dynamiques de l'accrochage comme les taux d'association ou de dissociation ainsi que des constantes d'affinité. Ces mesures ont été effectuées entre des protéines diffusant sur une surface dans des conditions proches de leur environnement biologique.
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Teyssèdre, Simon. "Dissection génétique des caractères par analyse de liaison et d'association : aspects méthodologiques et application à la sensibilité à l'ostéochondrose chez les Trotteurs Français." Thesis, Toulouse, INPT, 2011. http://www.theses.fr/2011INPT0082/document.
Full textAbstract:
Diverses lésions ostéochondrales peuvent affecter les articulations des jeunes chevaux et réduire leurs futures performances en course. L’objectif de cette thèse est d’identifier les régions du génome, appelées locus à caractère quantitatif (QTL), associées avec des caractères mesurant l’ostéochondrose (OC) enregistrés dans le programme GENEQUIN sur une population de Trotteurs Français. Le génotypage a été réalisé à l’aide de la puce SNP Illumina BeadChip EquineSNP50, qui est dense et permet d’exploiter le déséquilibre de liaison par des analyses d’association. Ces analyses sont sujettes à certains problèmes en présence d’une structure familiale des données. Dans la première partie de la thèse, une comparaison de la puissance et de la robustesse d’un choix restreint de méthodes d’analyses est effectuée. L’originalité de ce travail réside dans la dérivation algébrique des moments des distributions des statistiques de test comparées, donnant ainsi plus de généralité à nos résultats et permettant une meilleure compréhension des différences. Les résultats peuvent notamment servir à l’optimisation du dispositif expérimental. La deuxième partie est consacrée à la cartographie des régions QTL des caractères mesurant l’OC en différents sites articulaires dans une population de 583 Trotteurs Français. Cette étude a permis de mettre en évidence plusieurs régions QTL d’effets moyens et faibles à un niveau significatif mais pas hautement significatif. Nous montrons que l’OC est un caractère polygénique et qu’aucun QTL, ayant un effet à la fois sur l’OC du jarret et l’OC du boulet, n’est détectable dans ce protocole QTL, ce qui infirme l’hypothèse simple d’une cause génétique commune de la sensibilité à cette maladie sur les différents sites anatomiques. Suite à ces travaux, l’identification des gènes candidats et des mutations causales devrait clarifier la physiopathologie moléculaire de l’OC et ainsi permettre de développer des stratégies efficaces pour l’évaluation des risques. Pendant ce temps, les marqueurs peuvent être utilisés dans un contexte de sélection assistée par marqueurs afin d’améliorer la santé et le bien-être du chevalOsteochondral lesions are commonly observed in young horses and may be responsible for reduced performances in racing. The purpose of the PhD thesis was to identify genome regions, called quantitative trait loci (QTL), associated with various traits measuring osteochondrosis (OC) and recorded in the GENEQUIN program in a population of French Trotters horses. Genotyping was performed using the EquineSNP50 Illumina high density chip, which allows to exploit the linkage disequilibrium with genome-wide association studies. These analyses are subject to several problems in presence of family structure. We hence first proposed a comparison of power and robustness of a limited choice of models for this type of analysis. The originality of this work lies in the algebraic derivation of the distribution moments of the test statistics compared, making the outcome of this comparison more general and allowing a better understanding of differences. The results can be used to establish an experimental design. The second part was devoted to the QTL fine mapping of traits that measure OC in different joint sites. This study highlighted several significant QTL with low and medium effects but none of them were highly significant. We showed that OC is a polygenic trait and we were not able to identify QTL affecting both OC on the hock and the fetlock, rejecting the hypothesis of a single genetic determinism of susceptibility to this desease accross anatomical sites. Further studies will now focus on the identification of candidate genes and screening for mutation in an attempt to clarify the molecular physiopathology of OC and develop efficient strategies for risk assessment. Meanwhile, markers could be used in a marker-assisted selection context to improve horse health and welfare
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Lecomte, Marc A. "Etude de la liaison covalente d'eicosanoides aux protéines des plaquettes." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 1992. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/212939.
Full text
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Weber, Tiphaine. "Etude expérimentale et modélisation des modes d'association du fer avec la matière organique naturelle." Paris 6, 2006. http://www.theses.fr/2006PA066650.
Full textAbstract:
Le but de ce travail était de mieux comprendre et prédire les modes d’association du fer avec la Matière organique Naturelle. Des expériences d’adsorption du fer ont été conduites à l’aide d’un acide humique insolubilisé comme analogue de la MON. La combinaison de techniques spectroscopiques (IR,RPE et spectroscopie Mössbauer d’échantillons enrichis en 57Fe) appliquées à la phase solide et d’analyses chimiques de la solution ([Fe]totale par GF-AAS et spéciation redox par colorimétrie) ont permis de contraindre la modélisation de ces phénomènes. Nous avons montré que les interactions avec la MON modifient la solubilité de l’oxyhydroxyde de fer précipité et qu’elle peut imposer sont potentiel à la solution, fixant ainsi le rapport [Fe(II)]/[Fe(III)]. De plus, la comparaison de la spéciation prédite par le modèle ajusté et de résultats de spectroscopie a permis d’identifier la présence de nanophases d’oxyhydroxydes de fer, fortement associées à la matière organiqueThe aim of this work was a better understanding and prediction of interactions between iron and Natural Organic Matter. Iron adsorption was performed onto an insolubilised humic acid as a NOM analogue. Combining spectroscopic techniques (IR, EPR and Mössbauer spectroscopy of 57Fe enriched samples) and chemical analysis onto the solution ([Fe]total using GF-AAS and redox speciation with colorimetry) allowed to constrain the modelling of these phenomena. We’ve demonstrated that interactions with organic matter modify the solubility of the precipitated Hydrous Ferric Oxide and that it can impose its potential to the solution, determining the [Fe(II)]/[Fe(III)] ratio. Furthermore comparing the adjusted model speciation predictions and spectroscopic results allowed to identify HFO nanoparticles, intimately associated with organic matter
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Mourad, Raphaël. "Modélisation pangénomique du déséquilibre de liaison à l'aide de réseaux bayésiens hiérarchiques latents et applications." Phd thesis, Université de Nantes, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00628759.
Full textAbstract:
Les récentes technologies génomiques à haut-débit ont ouvert la voie aux études d'association visant la caractérisation systématique à l'échelle du génome des facteurs génétiques impliqués dans l'apparition des maladies génétiques complexes, telles que l'asthme et le diabète. Dans ces études, le déséquilibre de liaison (linkage disequilibrium, LD) reflète l'existence de dépendances complexes au sein des données génétiques et joue un rôle central, puisqu'il permet une localisation précise des facteurs génétiques. Néanmoins, la haute complexité du LD, ainsi que la dimension élevée des données génétiques, constituent autant de difficultés à prendre en compte. Les travaux de recherche réalisés au cours de cette thèse se sont placés dans cette perspective. La contribution des travaux de recherche présentés est double, puisqu'elle est à la fois théorique et appliquée. Sur le plan théorique, nous avons proposé une nouvelle approche de modélisation du LD. Elle est basée sur le développement d'un modèle issu du domaine de l'intelligence artificielle et de l'apprentissage automatique, la forêt de modèles hiérarchiques à classes latentes (FMHCL). Les nouveautés les plus significatives introduites sont la possibilité de prendre en compte la nature floue du LD et de hiérarchiser les différents degrés de LD. Un nouvel algorithme d'apprentissage supportant le passage à l'échelle, nommé CFHLC, a été développé et décliné en deux versions: la première nécessitant le découpage du génome en fenêtres contiguës pour résoudre le problème de passage à l'échelle, et la seconde (CFHLC+), plus récente et évoluée, résolvant le problème au moyen d'une fenêtre glissante sur le chromosome. A l'aide d'un jeu de données réelles, la comparaison de la méthode CFHLC avec des méthodes concurrentes a montré qu'elle offre une modélisation plus fine du LD. En outre, l'apprentissage sur des données présentant des patrons de LD variés a démontré la capacité de la FMHCL a reproduire fidèlement la structure du LD. Enfin, l'analyse empirique de la complexité de l'apprentissage a montré la linéarité en temps lorsque le nombre de variables à traiter augmente. Sur le plan appliqué, nous avons exploré deux pistes de recherche: la recherche de causalités et la visualisation synthétique et intuitive du LD. D'une part, une étude systématique de la capacité des FMHCL à la recherche de causalités est illustrée dans le contexte de la génétique d'association. Ce travail a établi les bases du développement de nouvelles méthodes de recherche dédiées à la découverte de facteurs génétiques causaux pour les études d'association à l'échelle du génome. D'autre part, une méthode a été développée pour la visualisation synthétique et intuitive du LD adaptée aux trois principales situations que peut rencontrer le généticien: la visualisation du LD de courte distance, de longue distance et dans un contexte pangénomique. Cette nouvelle méthode apporte des atouts majeurs qui sont les suivants: (i) le LD par paires (deux variables) et le LD multilocus (deux variables ou plus) sont simultanément visualisés, (ii) le LD de courte distance et le LD de longue distance sont facilement distingués, et (iii) l'information est synthétisée de manière hiérarchique.
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MEDA, PHILIPPE. "Etude de la liaison de la tubuline au centrosome." Université Joseph Fourier (Grenoble), 1996. http://www.theses.fr/1996GRE10189.
Full textAbstract:
Le centrosome est le centre majeur d'organisation des microtubules dans les cellules eucaryotes. Le mecanisme de nucleation de la tubuline sur le centrosome est encore mal compris, bien que le modele le plus probable implique une liaison initiale des dimeres de la tubuline sur le centrosome. Ce travail demontre que la liaison tubuline-centrosome est specifique et que le centrosome possede en moyenne 25. 000 sites de liaison, avec une constante de dissociation (kd) d'environ 5,5 micromolaires. Une banque de peptides de tubuline produite par digestions endoproteasiques a ete utilisee, avec d'autres methodes biochimiques, pour rechercher le domaine de liaison dans la sequence de la tubuline
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Fodil, Mostefa. "Etude d'association génétique et analyse de gènes candidats différentiellement exprimés au cours de la polyarthrite rhumatoïde." Thesis, Evry-Val d'Essonne, 2015. http://www.theses.fr/2015EVRY0017/document.
Full textAbstract:
Nous nous sommes intéressés à l’étude génétique de la PR, maladie auto-immune, chronique et inflammatoire affectant principalement les articulations et entraînant leur destruction. La PR est une pathologie multifactorielle où le système HLA semble être le principal, mais non unique, facteur de prédisposition génétique.Pour la première partie de notre étude, nous nous sommes intéressés à la recherche d’association avec la PR, dans la population Algérienne, pour des polymorphismes de gènes déjà confirmés dans d’autres populations. Cette approche a permis d’établir une preuve solide d’association pour les deux SNPs les plus importants PTPN22rs2476601 et STAT4rs7574865. De plus amples études avec des échantillons élargis et l’inclusion de nouveaux polymorphismes de gènes candidats permettraient d’établir de nouvelles preuves d’association génétique avec la PR dans la population Algérienne.Dans un second temps, nous nous sommes intéressés à l’analyse familiale d’association génétique de polymorphismes de gènes présentant un différentiel d’expression dans la PR. Cette partie de l’étude représente un complément d’information pour la compréhension du fonctionnement de ces gènes et de leur implication dans la PR. Ce travail d’analyse d’association génétique a été complété par l’étude de la relation entre les génotypes des SNPs étudiés et le taux d’expression des gènes considérés.Les polymorphismes d’intérêts mis en évidence au cours de cette thèse représentent des cibles de choix pour l’analyse conjointe de la PR dans les deux populations algérienne et française en vu d’une comparaison ethnique des différents facteurs de prédisposition génétique à la PRWe are interested in genetic study of rheumatoid arthritis “ra”, an autoimmune and chronic inflammatory disease affecting mainly joints and involving their destruction.“ra” is a multi-factor pathology in which the hla region seems to be the main but not unique genetic factor predisposition.for the first part of our study, we are interested in search of association with “ra” in the algerian population for genes polymorphisms already confirmed in other populations. this approach has allowed us establishing an association with solid evidence for the two most important snps ptpn22rs2476601 and stat4rs7574865. further studies with expanded samples and the inclusion of new genes polymorphisms candidates could establish new evidence of genetic association with pr population in algeria.in a second time, we are interested to family association analysis of genetic polymorphism gene having differential expression in pr. this part of the study represents supplementary information for understanding genes these operating and their involvement in pr. this work analysis genetics association was supplemented by the study of relationship between genotypes of snps studied and the rate of gene expression considered.polymorphisms of interest shown during this study represent good targets for a combined analysis of “ra” in both french and algerian populations to establish an ethnic comparison of various factors for genetic predisposition to “ra”
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Martineau, Joëlle. "Etude de la fonction d'association de sa régulation et de son dysfonctionnement dans l'autisme de l'enfant." Tours, 1993. http://www.theses.fr/1993TOUR3303.
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Couturier, Valérie. "Etude de la liaison du [3H]-mazindol et du profil neuropsychopharmacologique du mazindol." Paris 5, 1993. http://www.theses.fr/1993PA05P168.
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Boivin, Stéphane. "Etude structurale du récepteur de l'urotensine-2 et caractérisation du site de liaison." Rouen, 2008. http://www.theses.fr/2008ROUES069.
Full textAbstract:
Les récepteurs couplés aux protéines G (RCPGs) constituent, par leur complexité et leur diversité, une cible intéressante pour le développement d’outils pharmacologiques. Le récepteur UT fait partie de cette famille et est impliqué dans la régulation de l’activité biologique du plus puissant peptide vasoconstricteur identifié à ce jour chez l’homme, l’urotensine-II (U-II). Étant donné l’intérêt thérapeutique de récepteur, la compréhension de ces mécanismes constitue un enjeu majeur. Ce projet de doctorat a pour but de caractériser le complexe U-II/UT d’abord en identifiant le rôle de certains domaines structuraux de UT dans le processus de reconnaissance et d’activation en relation avec U-II, et ensuite en apportant des données sur la structure tridimensionnelle de ces domaines. Cette étude apporte de nouvelles données qui contribuent à une meilleure connaissance du complexe U-II/UT ce qui pourrait représenter un atout supplémentaire pour le développement d’outils pharmacologiques destinés à l’étude du système cardiovasculaireUrotensin-II (U-II) is a vasoactive hormone that acts through a G-protein-coupled receptor named UT. This receptor is expressed abundantly in the mammalian cardiovasculature. We carried out a study with the aim 1) to determine the role of structural domain in the recognition of ligands and 2) to characterize conformational arrangement of the three extracellular loops of UT as well as the transmembrane domains III and IV. Moreover, we determine the solution structure of extracellular two and three by high-resolution NMR and molecular modeling, and examined, the binding with hU-II at residue level to propose points of interaction in the ligand–receptor complex
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Fernandez, Nadia. "Separation et etude des composants de liaison cellulaires fixant les substances aromatiques polycycliques." Toulouse 3, 1987. http://www.theses.fr/1987TOU30247.
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Messaoudi, Abdelatif. "Etude de la liaison chimique dans les clusters organométalliques et réarrangement de ligands." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2006. http://www.theses.fr/2006STR13203.
Full textAbstract:
Ce manuscrit, essentiellement basé sur des études théoriques (Calculs EHT et DFT), est divisé en deux parties. La première partie est consacrée à l’étude de la structure électronique et des liaisons chimique dans des édifices polymétalliques. Diverses approches sont présentées, en particulier l’analogie isolobale. La deuxième partie concerne essentiellement des études de réactivité. Elle se décliné en cinq chapitres; Le 1er traite l’étude d’un fil moléculaire à liaisons Ag-Pd, suivi d’une étude de la migration intermétallique d’un ligand silyle. Le 3ème chapitre concerne un réarrangement Pseudo-Hofmann sur un cluster de ruthenuim. Les deux derniers s’intéressent plus particulièrement à une chimie de ligands, d’une part l’étude d’un radical cationique obtenu par réaction de dimérisation d’un noyau quinonique, d’autre part le phénomène de tautomérie concernant une phosphine amino-thiazolineThis thesis, essentially based on theoretical studies (EHT and DFT calculations), is divided into two parts. The first part is devoted to the study of the electronic structure and chemical bonding in polymetallic complexes. Several approaches are presented, in particular the isolobal analogy. The second part concerns essentially reactivity studies. This part is divided into five chapters. The first one being about the study of a molecular wire containing Ag-Pd bonds. This chapter is followed by a study of the intermetallic migration of a silyl ligand. The third chapter concerns a Pseudo-Hofmann rearrangement on a ruthenium cluster. The last two chapters are more particularly based on ligands chemistry. In the first instance on the study of a cationic radical obtained by dimerisation of a quinonic ring, in the second instance on the tautomerism of an amino-thiazoline phosphine
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RICHARD, FABIEN. "Etude des mecanismes d'interaction entre la follitropine et son recepteur (doctorat : biochimie et biologie moleculaire)." Paris 11, 1998. http://www.theses.fr/1998PA11T018.
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CHARLES, PATRICK. "Etude et realisation d'une liaison entre les logiciels de dao et une cellule d'usinage laser tridimensionnel." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 1989. http://www.theses.fr/1989STR13197.
Full textAbstract:
A l'heure actuelle, les machines d'usinage tridimensionnel par laser sont essentiellement programmees par apprentissage. Cette methode est longue, fastidieuse, elle a egalement comme inconvenient d'immobiliser les macnhines pendant toute la phase de programmation. De plus, les commandes numeriques employees ne permettent pas une vitesse d'usinage elevee. Nous avons cherche a remedier a ces problemes en utilisant un nouveau type d'interpolateur et en realisant une programmation hors ligne, les donnees geometriques definissant les trajectoires a suivre etant directement extraites des logiciels de dessin assiste par ordinateur (dao). Nous avons egalement mis en evidence les problemes que souleve ce type de programmation, notamment l'obligation de la correction par programme de certains defauts geometriques de la machine, ainsi que l'importance de la simulation de l'usinage, afin de detecter une collision eventuelle entre l'outil et la piece
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Zein, Ghaïs el. "Etude et réalisation d'une liaison numérique radiomobile à étalement de spectre en site urbain." Grenoble 2 : ANRT, 1988. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb376192489.
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Gallias, Jean-Louis. "Etude des caractéristiques physiques et chimiques de la liaison acier corrodé-pâte de ciment." Toulouse 3, 1992. http://www.theses.fr/1992TOU30131.
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Les principaux phenomenes physiques et chimiques, intervenant entre les armatures corrodees et le beton qui les enrobe, sont etudies sur un modele experimental associant acier corrode et pate de ciment et sur des melanges simples entre les produits de corrosion de l'acier et les composants du ciment. La couche des produits de corrosion sur l'acier, en raison de son importance porosite ouverte, absorbe par capillarite une fraction de l'eau de la pate fraiche provoquant la perturbation de l'hydratation du ciment dans une epaisseur trois fois plus importante que celle de la couche de corrosion sur l'acier. L'absorption d'eau s'accompagne par un degagement de l'air occlus dans la couche de corrosion formant des vides a la limite de presence de la pate et creant, ainsi, une zone de faible resistance entre l'acier et la pate. Des les premiers jours de cure, les produits de corrosion de l'acier reagissent avec l'hydroxyde de calcium et l'eau de la pate pour former un ferrite de calcium hydrate hexagonal et un ferrite de calcium hydrate cubique. La presence d'ions carbonates ou chlorures accelere les reactions precedentes et conduit a la formation de carboferrite de calcium hydrate ou de solutions solides entre ferrite et chloroferrite de calcium hydrate. En presence d'ions sulfates, le monosulfoferrite et le trisulfoferrite de calcium hydrate se forment. La cristallisation de ces produits dans la zone de transition entre l'acier corrode et la pate de ciment se traduit par une amelioration locale des proprietes mecaniques de la liaison
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PIERRE, DUPLESSIX ANNE. "Etude et realisation d'une liaison serie a un gigabauds independante du codage des donnees." Paris 6, 1997. http://www.theses.fr/1997PA066156.
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Passer d'une interface parallele a une interface serie permettrait d'augmenter considerablement les debits d'entree/sortie des circuits integres. Pour realiser cette transformation, il faut disposer de nombreuses liaisons serie integrees a la peripherie du circuit utilisateur. La liaison serie est l'assemblage d'un convertisseur parallele/serie (ou serialiseur), et d'un convertisseur serie/parallele (ou deserialiseur). Les architectures paralleles, les infrastructures de reseaux, les applications multimedia font partie des domaines qui beneficieraient largement de l'utilisation de liaisons serie haut debit. Le sujet de cette these est la conception et la realisation d'une liaison serie haut debit adaptee a n'importe quel type de codage des donnees et a deux types de support physique : cable coaxial ou fibre optique. On vise la realisation d'une macrocellule de faible surface et de faible consommation qui puisse etre facilement integree dans un circuit cmos. Le document decrit principalement les principes fonctionnels originaux mis au point pour realiser les transformations parallele/serie et serie/parallele. Il presente egalement les resultats concrets obtenus par la methode proposee.
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Zein, Ghaïs El. "Etude et realisation d'une liaison numerique radiomobile a etalement de spectre en site urbain." Rennes 1, 1988. http://www.theses.fr/1988REN10048.
Full textAbstract:
La premiere partie de ce memoire porte sur la description du modem realise et l'evaluation theorique et experimentale de ses performances en presence de diverses perturbations. La deuxieme partie est consacree a la description de la liaison realisee et a sa mise en oeuvre en vue d'une caracterisation fine du canal urbain
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Wan, Chuangeng. "Étude de la liaison métal-alumine élaborée par voies liquide et solide : mouillage, thermocompression." Grenoble INPG, 1992. http://www.theses.fr/1992INPG0023.
Full textAbstract:
La premiere partie de cette etude a ete consacree a la conception de deux nouveaux alliages de brasure de l'alumine en visant des caracteristiques optimales pour l'utilisateur. L'essentiel du travail a consiste en une etude des proprietes de mouillage, realisee par la methode de la goutte posee sous vide pousse, avec les deux alliages cupdti et nifecrsiti sur substrats mono et polycristallins d'alumine. Les interfaces et les produits de reaction ont ete caracterises par rugosimetrie, microscopie electronique a balayage et micro-analyse, et les resultats discutes a l'aide d'arguments thermodynamiques. La deuxieme partie a ete consacree a des aspects fondamentaux de la realisation par thermocompression d'une liaison entre monocristaux d'alumine et de nickel. Le travail a montre que l'on pouvait transposer a un couple metal-ceramique un modele de cinetique de soudage developpe pour des couples metalliques. Un calcul de reseau de coincidence a permis de confirmer que l'une des orientations cristallographiques relatives frequemment mentionnee dans la litterature, etait tres certainement energetiquement favorable. Avec cette orientation relative, nous avons pu effectivement synthetiser une serie d'echantillons bicristallins par thermocompression sous vide secondaire. La caracterisation de l'interface a ete faite par microscopie optique, microscopie electronique a balayage et en transmission.
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Brisebarre, Audrey. "Recherche de facteurs génétiques impliqués dans la résistance au paludisme et au sepsis : études pangénomiques de liaison génétique et d'association, intégration des résultats d' association aux réseaux d' intéractions protéine-protéine." Thesis, Aix-Marseille, 2014. http://www.theses.fr/2014AIXM4072.
Full textAbstract:
Le paludisme et le sepsis sont des maladies infectieuses très répandues causant plusieurs centaines de milliers de morts tous les ans. Elles sont toutes deux multifactorielles. Les devenirs de ces infections sont influencés par des facteurs environnementaux, par des facteurs sociaux-économiques, politiques et comportementaux mais aussi par des variables dépendant du patient comme son âge. De nombreux arguments existent en faveur d'un contrôle génétique de la résistance au paludisme et au sepsis. Ces deux maladies sont considérées comme proches par les spécialistes car leur physiopathologie est liée notamment à une inflammation systémique non contrôlée responsable des formes les plus graves. Afin d'identifier de nouveaux gènes potentiellement impliqués dans la résistance à ces deux maladies, nous avons effectué des études génétiques pangénomiques dans deux populations vivant en zone endémique pour le paludisme à Plasmodium falciparum au Burkina-Faso et dans une cohorte de patients atteints de sepsis.Enfin nous avons réalisé les deux premières études d'association pangénomiques identifiant des associations significatives avec la mortalité suite à un choc septique. Nous avons obtenu 32 SNPs significativement associés à la mortalité précoce et 108 significativement associés à la mortalité tardive. Le réseau des interactions protéine-protéine impliquant les protéines codées par les gènes associés a permis d'établir une liste non exhaustive des fonctions altérées durant le choc septique, notamment liées à la réponse immune, et a révélé, malgré les différences au niveau des gènes impliqués, un mécanisme commun participant à la susceptibilité précoce et tardive au choc septiqueMalaria and sepsis are widespread infectious diseases causing hundreds of thousands deaths each year. There is a growing body of evidence for a genetic control of malaria and sepsis resistance. Both diseases are considered close because they are characterized by a systemic inflammation, some common organ dysfunctions, and disorders of coagulation. In order to identify new genes potentially involved in disease resistance, we performed genomewide genetic studies in two populations living in endemic regions for Plasmodium falciparum malaria in Burkina-Faso and in a cohort of septic shock patients. Genetic linkage studies revealed significant genetic linkages on chromosome 6p21.3 and 17p12 with, respectively, mild malaria and asymptomatic parasitaemia. We also performed the first genetic linkage studies concerning immunoglobulin G and their sub-classes against Plasmodium falciparum antigens. We detected significant linkages of IgG3 sub-class with chromosomes 8p22-p21 and 20q13 and between IgG4 sub-class and chromosome 9q34. Finally we performed the first two genomewide association studies identifying significant associations with all-causes mortality after a septic shock. We identified 32 SNPs significantly associated with early mortality and 108 SNPs significantly associated with late mortality. We identified a protein-protein network containing proteins associated with both early and late mortality. Furthermore, the network of protein-protein interactions involving proteins encoded by associated genes allowed us to establish a list of some altered functions during septic shock, most of them being related to the immune responses or the renin-angiotensin-aldosterone system
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Cadic, Eléna. "Recherches de facteurs génétiques impliqués dans l'élaboration du rendement sous contrainte hydrique chez le tournesol Helianthus annuus par génétique d'association et analyse de liaison dans une population recombinante." Toulouse 3, 2014. http://thesesups.ups-tlse.fr/3447/.
Full textAbstract:
La disponibilité en eau est un facteur essentiel pour le rendement des principales espèces cultivées. Le tournesol figurant parmi les espèces d'importance économique majeure est concerné par cet enjeu. L'objectif de cette thèse est d'identifier les régions génomiques permettant d'expliquer la variabilité du rendement sous contraintes hydriques. Une approche de génétique d'association a été menée sur un panel de 384 lignées cultivées et élites évalué en combinaison hybride sur un réseau expérimental de 17 environnements. L'analyse séparée de chaque environnement a permis d'identifier 157 marqueurs associés avec au moins un caractère grâce à l'utilisation d'un modèle prenant en compte la structuration du panel en deux groupes : restauratrices de fertilité et mainteneuses de stérilité mâle. Parmi ces marqueurs significatifs, 34 étaient associés avec un caractère lié à la productivité, mais ceci, le plus souvent, de manière spécifique à un environnement, soulignant ainsi l'importance de l'interaction génotype-environnement. Un modèle éco-physiologique simulant la performance de génotypes en fonction des conditions environnementales, a permis de caractériser le stress hydrique au sein du réseau. En utilisant des variétés témoins définies dans le modèle, un index de stress a été estimé pour chaque environnement. La réponse du panel à cet index a ensuite été testée en génétique d'association permettant d'identifier de nouveaux loci impliqués dans la tolérance au stress hydrique et la stabilité du rendement. Enfin, La détection de QTL à partir d'une population bi-parentale a permis de confirmer certaines zones détectées en génétique d'association et d'en découvrir de nouvellesFor most crops, water availability is a major component of yield. We must improve crop plants tolerance to water deficit in order to guarantee food security. Sunflower, a species of economic importance is also concerned by this challenge. The aim of this thesis is to identify genomic regions involved in the variability of yield and its components under drought. To this purpose, an association mapping approach has been led on a core collection of 384 cultivated and elite lines evaluated as hybrids combinations in a multi environment trial of 17 environments. In a first step, the separated analysis per environment led to the identification of 157 markers associated with at least one trait by apply a model taking into account the structuration in two groups: male restorer lines and female lines. Among these significant markers, 34 were associated with productivity but only on a specific environment, underlying the importance of genotype by environment interaction. In a second step, a crop model simulating sunflower genotypes yield depending on environmental conditions, led to the characterization of drought stress inside the multi environment trial. By using varieties defined before in the model, a drought index has been estimated for each environment. Thus, the panel response to this index has been tested in association mapping leading to the identification of several new loci involved in drought stress response and yield stability. QTL mapping in a bi parental population confirmed some regions and led to the detection of new ones
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Cubry, Philippe. "Structuration de la diversité génétique et analyse des patrons de déséquilibre de liaison de l'espèce Coffea canephora Pierre ex. Froehner." Phd thesis, Université Montpellier II - Sciences et Techniques du Languedoc, 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00365078.
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La recherche d'associations entre marqueurs moléculaires et les variations de caractères d'intérêt agronomique est un enjeu majeur du développement de la sélection assistée par marqueurs, notamment pour des espèces pérennes. La connaissance de la diversité génétique et de la structure de celle-ci est un préalable indispensable à la mise en place de telles études. Au même titre, la connaissance de l'étendue et de l'intensité du déséquilibre de liaison au sein des populations considérées est également nécessaire. Nous avons donc entrepris de confirmer et de préciser la diversité et la structure génétique de Coffea canephora Pierre afin d'évaluer les potentialités d'études d'association sur cette espèce. Nous avons posé les bases d'une caractérisation rapide des collections de ressources génétiques de cette espèce à l'aide de marqueurs microsatellites et précisé l'origine génétique d'une population jusqu'à présent non étudiée. Cette base pourra également servir au développement de futures cores-collections. L'évaluation de la structure et de l'étendue du déséquilibre de liaison à différentes échelles et au niveau de différentes populations ou groupes de diversité à l'aide de 108 marqueurs répartis sur l'ensemble du génome nous a permis de proposer des populations utilisables pour les 2 types d'approches de génétique d'associations, scan génome entier ou région candidate. Un premier essai d'étude d'association a montré les potentialités importantes de ces approches pour notre espèce. Les implications de l'importance de la diversité génétique et de sa structure ainsi que de la structure du déséquilibre de liaison au sein de nos populations pour l'amélioration sont discutées.
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Demirdjian, Hagop. "Etude théorique d'une solution aqueuse d'acide fluorhydrique : aspects statiques et dynamiques." Paris 6, 2004. http://www.theses.fr/2004PA066086.
Full text
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Diop, Cheikh Talibouya. "Etude et mise en oeuvre des aspects itératifs de l'extraction de règles d'association dans une base de données." Tours, 2003. http://www.theses.fr/2003TOUR4027.
Full textAbstract:
Avec l'augmentation de la capacité de stockage, nous avons assisté durant ces dernières années à une croissance importante des moyens de génération et de collection des données. C'est ainsi que l'on a commencé à parler de découverte de connaissances à partir de données (KDD) ou encore de Data Mining ou de Fouille de données. Les techniques de Data Mining permettent de découvrir des informations importantes (cachées) dans les données. Cependant la découverte de telles informations que l'on appelle aussi des motifs pose un certain nombre de problèmes. Le premier est le temps de calcul de ces motifs. En effet, les requêtes d'extraction de ces motifs sont des requêtes complexes et prennent ainsi du temps à s'exécuter. Le deuxième problème de la découverte d'informations intéressantes est la taille importante des réponses. Le nombre de motifs trouvés est généralement très important. C'est ainsi qu'est apparu l'idée de représentations condensées qui consiste à trouver un sous ensemble des motifs à partir duquel on pourra retrouver tous les autres. C'est ce sous-ensemble qui est appelé représentation condensée. La principale contribution de ce mémoire est de proposer une approche itérative de l'extraction des motifs intéressants. Celle-ci consiste à utiliser les résultats des extractions antérieures, plus précisément la représentation condensée de ces résultats pour optimiser le calcul des extractions futures. L'autre contribution est de proposer une représentation condensée non pas d'une réponse à une requête mais plutôt à un ensemble de réponses à des requêtes. En effet, étant donné que les ensembles de motifs trouvés ne sont pas indépendants, un problème crucial qui se pose est la redondance dans le stockage. Il apparaît alors nécessaire de ne pas stocker les représentations condensées indépendamment les unes des autres, mais de trouver une représentation condensée d'une ensemble de réponses à des requêtes. Le mémoire est ainsi divisé en deux parties. La première partie fait l'état de l'art sur la découverte de motifs intéressants, les représentations condensées, et l'extraction itérative de motifs. La seconde partie, qui est la contribution, présente, d'une part l'approche incrémentale d'extraction des motifs intéressants, d'abord par un formalisme logique, ensuite par un formalisme algébrique, et d'autre part la représentation condensée d'un ensemble de réponses à des requêtes.
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Mezmouk, Sofiane. "Analyse des bases génétiques et moléculaires de la tolérance à la sécheresse chez le maïs par génétique d'association." Toulouse 3, 2012. http://www.theses.fr/2012TOU30071.
Full textAbstract:
Le maïs est l'une des céréales les plus cultivées au monde. C'est une espèce majeure sur le plan économique qui est particulièrement sensible aux déficits hydriques. Il est donc très important d'améliorer la tolérance du maïs à cette contrainte du milieu. La génétique d'association est l'une des approches qui permettent de détecter des polymorphismes impliqués dans la tolérance à cette contrainte abiotique, ou des polymorphismes en déséquilibre de liaison avec ces derniers. Cette thèse est subdivisée en deux parties distinctes. La première partie du travail avait pour objectif de mieux comprendre l'effet des méthodes de contrôle de la structuration sur les résultats d'association. Un panel composé de 342 lignées publiques caractérisées pour le poids de mille grains et pour la précocité de floraison mâle a été utilisé. Ce panel, génotypé pour plus de 12 000 Single Nucleotide Polymorphism (SNPs), comporte une structuration interne très complexe. Cette dernière a été estimée en utilisant des méthodes de réduction dimensionnelle et le logiciel Structure (approche bayésienne) pour différents nombres de groupes. Les tests d'association ont montré une grande sensibilité des résultats aux modèles de contrôle de la structuration utilisés. Pour sélectionner les loci les plus robustes, une méta-analyse des tests d'association a donc été réalisée en se basant sur les résultats de tous les modèles de structuration testés. La deuxième partie du projet avait pour objectif de rechercher des polymorphismes impliqués dans le déterminisme de la tolérance au stress hydrique. Deux panels de lignées représentatifs de deux groupes hétérotiques différents ont été utilisés. Ces deux panels ont été phénotypés pour différents caractères en conditions d'irrigation normale ou restrictive ; ils ont été génotypés pour plus de 68 000 SNPs. Dans un premier temps, les données de génotypage ont été utilisées pour estimer la diversité génétique, la structuration et le déséquilibre de liaison dans chacun des deux panels. Puis, dans un deuxième temps, les données phénotypiques (dates de floraison et composantes du rendement) issues d'un dispositif multi-lieux et multi-années, ont été ajustées aux différents effets environnementaux à l'aide de modèles spatiaux. A partir des valeurs génétiques estimées, des indices de tolérance au stress hydrique ont été calculés. Pour finir, les loci significativement associés à la tolérance au stress hydrique ont été recherchés par génétique d'association. Ainsi, 47 zones impliquées spécifiquement dans le déterminisme de la tolérance au stress hydrique ont été identifiées dans les deux panels travaillésMaize is one of the most cultivated cereals worldwide. This economically important species is very sensitive to water stress. It is thus important to improve the tolerance of maize to this abiotic stress. Association mapping is one of the approaches that make it possible to map loci underlying the tolerance to water stress or loci in linkage disequilibrium with the causal ones. This PhD project was divided in two separate parts. The first part aimed at evaluating the effect of structure models on association mapping results. A real maize data set of 342 inbred lines, genotyped with more than 12 000 single nucleotide polymorphisms (SNPs), was used to carry out this study. These inbred lines were phenotyped for both male flowering dates and thousand kernel weight. The complex structure of this panel was estimated with both dimensional reduction methods and STRUCTURE software (Bayesian approach) for several group numbers. Our results show a significant effect of the structure model used on association mapping tests. This effect depends on both the method and the number of groups used to control the panel structure. In order to select the most robust loci, a meta-analysis approach was carried out, making use of the results of association mapping tests with all structure models. The second part of the project aimed at mapping loci and genomic regions involved in maize drought tolerance. Two panels of elite inbred lines, representative of two heterotic groups were used. These panels were phenotyped under well-watered and water-stressed conditions. All inbred lines were genotyped with about 68 000 SNPs. The genotypic data was used to estimate the genetic diversity, the structure and the linkage disequilibrium within each panel. At the same time, the phenotypic data (flowering dates and yield related traits) were used to estimate genetic values which made it possible to calculate drought tolerance indices. To finish, association mapping tests were carried out between all polymorphic SNPs and drought tolerance indices. They allowed for the identification of 47 genomic regions that are specifically involved in drought tolerance
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Ajzenberg, Nadine. "Etude in vitro de la liaison du facteur willebrand a l'heparine et a ses derives." Toulouse 3, 1992. http://www.theses.fr/1992TOU31703.
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Zavialoff, Nicolas. "Etude de la liaison entre les composantes verbale et non verbale du langage : approche biolinguistique." Bordeaux 3, 1990. http://www.theses.fr/1990BOR30028.
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La reflexion sur la prosodie, consideree comme partie integrante des pratiques langagieres, s'est imposee au cours de l'etude du vocabulaire de l'ideologie revolutionnaire dans 3 textes d'al. Radiscev. En effet son systeme philosophique qui fonde la revendication du bonheur par la vengeance (la revolution), par l'expression du desir de l'immortalite de l'ame, s'appuie sur la raison. Celle-ci s'inscrit dans les schemas suivant:raison logique-langue-rhetorique-support (corps,cerveau). Ce sont les considerations sur la sensibilite, sur le hiatus entre le son et le sens qui ont suscite le recours necessaire a des outils neuropsychologiques. Un modele cinetique pouvait rendre compte de certains intuitions, grace a une notion-cle : la sensitivite. C'est la prosodie qui permet de faire la laison entre les composantes verbales et non verbale du langage qui, entendu alors comme aptitude, correspond au besoin de comprendre et de s'emouvoir et qui s'actualise en langue code structure logique (memoire stable et sociale) et en rhetorique (memoire biographique). La "voix" de radiscev est le temoin de ce mouvement dans l'usage qu'il fait de la langue en evolution dans le cadre des lumieres. Le sujet parlant prend des dimensions bio-psychosociales que l'histoire a reduit un moment a l'abstrait "homme" des rapports sociauxThe study of prosody achieved recognition through 3 texts by al. Radiscev analysing the vocabulary of revolutionary ideology. In effect his philosophical system, which found the right to happiness onvengeance (revolution), by meansof the expression of the desire for the soul's immortality, is based on reason. The concept of reason is part of the following framaework:reason logic-language-rhetoric-support (bodybrain). Reflections on sensitive aspects, on the hiatus between sound and sense rendered necessary the use of neuropsychological tools. A kinetic model was able to account for radiscev's intuitions, thanks to a key notion-that of sensitivity. Indeed, prosody enables us to link the verbal and non verbal componenets of language which- when seen as an aptitude - corresponds to the need to understand and to affect the emo- tion, and which is actualized both as language code structure logic(so- cial memory) and as rhetoric (biographical memory). The "voice" of radi- scev bears witness to this mouvement through the use he makes of the russian language which was in the midst of great change during the en- lightenment. The speakingsubject thus took on bio-psychosocial dimen- sions which history tried, for a time, to reduce to the absttract "man"
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El, Khalifa Moulay Abdelaziz. "Étude de la liaison Mo-Mo dans des composés inorganiques moléculaires et de l’état solide." Rennes 1, 1992. http://www.theses.fr/1992REN10065.
Full textAbstract:
Ce manuscrit decrit des travaux de chimie theorique appliquee a l'etude de la coordination dans des composes moleculaires et de l'etat solide comportant des liaisons molybdene-molybdene, ainsi que dans des especes bimetalliques apparentees. Les calculs ont ete effectues selon la methode de huckel etendue, dans le cadre du formalisme tight-binding pour l'etude des composes de l'etat solide. Ce travail est divise en quatre chapitres. Le premier traite du mode de liaison mo-mo observe dans de nombreux chalcogenures de metaux de transition de formule mmo#2s#4 presentant des feuillets de type ms#2. L'etude des principales interactions orbitalaires indique que le compte electronique joue un role determinant dans le choix de la structure geometrique de ces materiaux. Pour la configuration d#3 il y a formation de chaines de clusters mo#4, pour la configuration d#2 la formation de chaines en zig-zag et pour la configuration d#1 la formation de dimeres isoles. Le deuxieme chapitre aborde l'etude de la coordination dans des complexes papillon a 42 et 44 electrons de type m#2cp#2(co)#4e#2 (m=mo, cr, w: e=s, se, sr, pr. . . ). Les facteurs electroniques susceptibles de favoriser telle ou telle conformation sont identifies. Les possibilites d'interconversion entre differents isomeres sont abordees. L'investigation theorique du comportement electrochimique de mo#2cp#2(co)#4sr)#2#0#/#2#+ permet l'interpretation de leur comportement vis-a-vis de la substitution de co sous activation electronique. L'aspect mecanistique de reactions d'isomerisation de complexes de type mo#2cp#2(co)#2(sr)#2, presentant une double liaison metal-metal, est ensuite aborde. Les differents intermediaires ou etats de transition possibles ont ete etudies. Le role joue par co en tant que catalyseur est analyse. Enfin, la reactivite de ces complexes vis-a-vis de la substitution de co par un isocyanure est analysee sur les memes bases. La derniere partie de ce manuscrit concerne l'etude de la liaison mo-mo dans des especes inorganiques dinucleaires presentant un cur mo#2o#2, et en particulier dans le nouveau complexe mo#2|#2(op(ph)#3)#3o#4. Bien que cette molecule soit dissymetrique, il est montre que, les deux atomes metalliques sont au meme degre d'oxydation +v. La nature de la liaison metal-metal dans ces complexes est analysee, et la correlation entre la force de celle-ci et la preference structurale pour la conformation cis est mise en evidence. Enfin, la reactivite de mo#2|#2(op(ph)#3)#3o#4 vis-a-vis d'electrophiles et nucleophiles est abordee
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DALATI, MOHAMED TAWFIK. "Etude des parametres de van der waals et de liaison hydrogene de 276 solvants organiques." Nantes, 1991. http://www.theses.fr/1991NANT2019.
Full textAbstract:
L'importance du solvant en chimie justifie de le caracteriser par des parametres soigneusement definis et clairement interpretables. Les parametres physiques macroscopiques ou microscopiques ne permettent pas de prevoir et d'expliquer de maniere satisfaisante le comportement des solvants. C'est pourquoi de nombreux parametres empiriques, dans le sens de tires de l'experience, ont ete proposes dans la litterature a la suite des travaux de kosower. Grace a une base de donnees nombreuses, diversifiees et fiables nous avons complete et corrige les echelles empiriques les plus populaires. La theorie de mc rae permet de montrer que trois d'entre elles mesurent principalement les interactions de dispersion et d'induction alors que l'echelle et mesure majoritairement le terme electrostatique des forces de van der waals. Il est des lors possible de proposer une equation biparametrique presentant un bon caractere explicatif. Une nouvelle methode de comparaison rmn permet d'obtenir une echelle de basicite de liaison hydrogene des solvants, qui est comparee a l'echelle correspondante des solutes. Les differences sont expliquees par le modele du champ de reaction de block et walker
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Djeridi, Henda. "Etude de la liaison entre un scalaire passif et sa dissipation en écoulements turbulents libre et de paroi." Aix-Marseille 2, 1992. http://www.theses.fr/1992AIX22096.
Full textAbstract:
Les resultats presentes ici concernent la mesure des trois termes du taux de dissipation des fluctuations de temperature. Ils portent principalement sur les donnees obtenues dans une couche limite sur plaque plane faiblement chauffee et dans un jet rond faiblement chauffe. La liaison entre les fluctuations de temperature et celles de son taux de dissipation a ete etudiee a travers une analyse spectrale et probabiliste. L'hypothese d'independance statistique entre la temperature et sa dissipation est verifiee uniquement dans les regions ou les fluctuations de temperature sont a peu pres symetriques. Le coefficient de correlation a le meme signe que le facteur de dissymetrie de temperature et la liaison a lieu aux basses frquences correspondant a la macroechelle de l'ecoulement. Aux positions ou le coefficient de correlation est voisin de zero, l'independance resulte en fait d'une contribution positive contrebalancee par une contribution negative relatant la symetrie du signal de temperature; aux autres positions, la correlation est due aux fluctuations de faibles amplitudes tant pour la temperature que pour sa dissipation
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Tcatchoff, Lionel. "Etude des interactions entre une protéine humaine de liaison aux odorants et ses partenaires, odorants et récepteurs olfactifs." Versailles-St Quentin en Yvelines, 2007. http://www.theses.fr/2007VERS0018.
Full textAbstract:
Les molécules odorantes, généralement hydrophobes, activent les récepteurs olfactifs (RO) exprimés à la membrane des neurones sensitifs recouverts d’une couche de mucus hydrophile. Des protéines liant les odorants, les OBP (Odorant-Binding Protein) présentes dans le mucus olfactif transporteraient les odorants à travers le mucus vers les RO. On s’est intéressé dans ce travail à un variant humain d’OBP, hOBP-2A qui présente une spécificité de liaison pour les aldéhydes et les acides aliphatiques. Par une approche de mutagenèse dirigée, on a pu montrer le rôle fondamental dans cette spécificité d’une lysine de la cavité de hOBP-2A. L’expression fonctionnelle d’un RO, OR1G1, a montré son activation par des composés se liant à hOBP-2A. Une étude comparative de l’activation avec et sans OBP a révélé qu’elle n’avait pas d’impact sur l’activité du récepteur OR1G1. Ce qui n’exclue pas la possibilité que les OBP interviennent dans d’autres processus biologiques que le transport des odorantsOdorant molecules, generally hydrophobic, activate the olfactory receptors (OR) embedded in the membrane of sensitive neurons which are covered with an aqueous layer of mucus. It was proposed that odorant-binding proteins, named OBP, transport odorants through olfactory mucus towards OR. In this work we studied a human OBP variant, hOBP-2A, which has a narrow specificity for aliphatic aldehydes and acids. Using site directed mutagenesis, we demonstrated the fundamental role, in this specificity, of a lysin located in the hydrophobic cavity of hOBP-2A. The functional expression of an olfactory receptor, OR1G1, revealed an activation of this receptor by some compounds that bind to hOBP-2A. Study of the activation of OR1G1 with and without hOBP-2A revealed that hOBP-2A did not have impact on OR1G1 activity. One cannot however exclude the possibility that the OBP is involved in other biological processes than odorants transport
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Fontana, Pierre. "Etude d'association génotype-phénotype des polymorphismes des récepteurs plaquettaires P2Y12 et PAR-1 : du volontaire sain à la pathologie." Paris 5, 2003. http://www.theses.fr/2003PA05P631.
Full textAbstract:
Les plaquettes ont un rôle essentiel dans la pathogenèse et les complications thrombotiques de la maladie athéroscléreuse. Il existe une variabilité interindividuelle de la réponse plaquettaire à divers agonistes dont le mécanisme reste inconnu. Nous avons analysé la réponse plaquettaire chez 100 volontaires sains et avons mis en évidence des groupes phénotypiques distincts en terme d'agrégation plaquettaire à l'ADP et au TRAP. La recherche de polymorphismes génétiques d'un des récepteurs à l'ADP (P2Y12) a permis de mettre en évidence 2 haplotypes (H1/H2), l'allèle H2 étant associé à l'agrégation plaquettaire à l'ADP. De plus, un polymorphisme intronique du récepteur à la thrombine PAR-1 (IVSN-14A/T) est associé à la réponse plaquettaire au TRAP dans notre population. Finalement, l'allèle H2 est associé à l'artériopathie des membres inférieurs dans une étude cas-contrôles. Les variations génétiques des récepteurs P2Y12 et PAR-1 ont un rôle fonctionnel et sont intéressantes en cliniquePlatelets play a crucial role in the pathogenesis and thrombotic complications of atherosclerotic disease. Variability in platelet response to several agonists has been described, but the underlying mechanisms are unknown. We studied platelet response in 100 healthy volunteers and evidenced different phenotypic groups in term of platelet aggregation to ADP and TRAP. We then looked for genetic polymorphisms of one of the ADP receptors (P2Y12) and evidenced 2 haplotypes (H1/H2). The H2 allele is associated with platelet response to ADP in our population. Moreover, an intronic genetic polymorphism of the thrombin receptor PAR-1 is associated with platelet response to TRAP. Finally, the H2 allele is associated with peripheral arterial disease in a case-control study. In conclusion, we evidenced genetic polymorphisms of 2 platelet receptors with a functional role which may be interesting in clinical practice
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Waithayakul, Kamthon, and Guy Pujolle. "Etude des caracteristiques de la liaison de transmission et des politiques de routage des cellules atm." Paris 6, 1991. http://www.theses.fr/1991PA066383.
Full textAbstract:
La technique temporelle asynchrone (atm) est une nouvelle technique qui permettra de transmettre la voix, les donnees et les images dans un meme canal de communication. Les caracteristiques du reseau atm sont definies par le ccitt en 1988 (recommandation i. 121). Dans ce reseau, la qualite de services depend de deux facteurs la qualite de la liaison de transmission et les performances du commutateur. Nous presentons tout d'abord dans ce travail un modele de calcul du taux d'erreur de bout en bout sur la liaison de transmission et ensuite les performances et les effets de diverses politiques de routage de cellules dans un reseau d'interconnexion a trois etages de type clos. Les resultats analytiques sur le taux d'erreur de bout en bout et les performances de reseau a trois etages de type clos sont presentes. De meme, des etudes sur les politiques de routage de cellules dans le reseau de clos par la simulation a evenements discrets ont ete realisees, la comparaison des parametres de performances permet de determiner la meilleure politique de routage
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Flori, Laurence. "A la recherche des gènes contrôlant la résistance humaine au paludisme à P. Falciparum : apport des analyses de liaison génétique et d'association allélique avec la parasitémie et le risque d'accès palustre." Aix-Marseille 2, 2004. http://www.theses.fr/2004AIX22037.
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Lesueur, Fabienne. "La prédisposition génétique aux cancers non-médullaires de la thyroïde : analyse de liaison génétique sur les formes familiales : étude d'association entre les variants allèliques du proto-oncogène RET et les formes papillaires sporadiques." Lyon 1, 2001. http://www.theses.fr/2001LYO1T185.
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Gajahi, Soudahome Marie Angélique. "Etude des effets de la glycation sur les interactions protéine-ligand dans le cadre du diabète et de l’athérosclérose : la liaison entre l’albumine et le liraglutide et entre l’apolipoprotéine A1 et ses partenaires de liaison." Thesis, La Réunion, 2018. http://www.theses.fr/2018LARE0009/document.
Full textAbstract:
Les interactions protéine-ligand interviennent dans de nombreux processus biochimiques et permettent notamment à certaines protéines sanguines d’assurer leur rôle de transport. Parmi ces protéines figurent notamment l’albumine, protéine la plus abondante du plasma, ou l’apolipoprotéine A1 (ApoA1), majoritaire au sein des lipoprotéines de haute densité (HDL). Dans un contexte diabétique, la glycation des protéines induit des modifications structurales affectant ainsi leur potentiel d’interaction.Le premier objectif de ce travail de thèse visait à déterminer l’impact de la glycation de l’albumine sur sa liaison au liraglutide, un médicament de plus en plus utilisé dans le traitement du diabète de type 2. Ensuite, la seconde partie de ce travail a consisté en la production d’une ApoA1 humaine recombinante fonctionnelle afin d’étudier ses propriétés d’interaction, sous forme libre ou associée aux phospholipides. La technique RMN (résonance magnétique nucléaire) a été utilisée sur les protéines préalablement marquées au fluor (pour le liraglutide) ou aux isotopes stables 13C/15N (pour l’ApoA1). La titration microcalorimétrique isotherme (ITC), méthode complémentaire à la RMN a été appliquée pour l’étude des interactions avec l’avantage de ne nécessiter aucun marquage. Différentes stratégies de clonage ont été explorées pour la surexpression de l’ApoA1 en bactérie Clearcoli.Les résultats obtenus démontrent une altération de l’affinité de l’albumine pour le liraglutide in vitro et in vivo, dépendante du degré de glycation. Ces résultats, enrichis d’une analyse lipidomique et peptidique, permettent d’expliquer les observations cliniques concernant la baisse de l’efficacité de médicaments liant l’albumine chez les patients ayant un diabète mal contrôlé. Concernant l’ApoA1, le choix de l’étiquette de fusion reste à optimiser, mais sa surexpression de manière soluble et abondante a été obtenue pour l’ApoA1 marquée et non marquéeProtein-ligand interactions are involved in many biochemical processes. They are notably implicated in the role of transporter proteins in blood. Albumin, the most abundant plasma protein, and apolipoprotein A1 (ApoA1), which is the main component of high-density lipoprotein (HDL) belong to this class of proteins. In the context of diabetes, proteins are altered by glycation which leads to structural modifications and potentially affect their interactions.The first objective of this work was to determine the impact of albumin glycation on its binding to liraglutide, a drug increasingly used in the treatment of type 2 diabetes. Then, the second part of this work involved the production of recombinant functional human ApoA1 in order to study its interaction properties, in its lipid-free form or associated with phospholipids. The NMR (nuclear magnetic resonance) technique has been used on proteins previously labeled with fluorine (for liraglutide) or stable 13C/15N isotopes (for ApoA1). In addition, isothermal titration microcalorimetry (ITC), has been applied to the study of interactions with the advantage of not requiring any labeling. Various cloning strategies have been explored for the overexpression of ApoA1 in Clearcoli bacteria.The results demonstrate an alteration of the affinity of albumin for liraglutide in vitro and in vivo, depending on the degree of glycation. These results, supported by a lipidomic and peptide analysis, explain clinical observations concerning the decrease of efficacy of albumin-binding drugs in patients with poorly controlled diabetes. Regarding ApoA1, the choice of the fusion tag remains to be optimized, but both labeled and unlabeled ApoA1 were successfully overexpressed at high yields in a soluble form
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Romero, Salas Tonatiuh. "Etude in vitro des interactions entre la protéine de réplication A humaine (hRPA) et l' ADN." Paris 6, 2005. http://www.theses.fr/2005PA066542.
Full text
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Stepanian, Alain. "Etude moléculaire de la liaison du facteur Willebrand à la glycoprotéine Ib plaquettaire et de sa multimérisation." Paris 7, 2006. http://www.theses.fr/2006PA077167.
Full textAbstract:
Le facteur Willebrand (VWF) est une glycoprotéine multimérique de l'hémostase qui intervient surtout dans l'adhésion plaquettaire en se liant à la glycoprotéine Ib (GPIb) grâce au domaine Al de sa sous-unité. Sa structure est issue de l'assemblage des sous-unités en dimères puis en multimères et fait intervenir les domaines D3 et CK. Les multimères de haut poids moléculaire (HPM) sont indispensables à sa fonction normale. La maladie de Willebrand (VWD) est une affection hémorragique constitutionnelle qui comprend plusieurs types. Dans le type 2A, les multimères de HPM sont absents et la liaison du VWF à la GPIb est diminuée. Dans le type 2M, la liaison est diminuée indépendamment de la structure multimérique. Le but de ce travail est d'étudier la structure fonctionnelle du VWF en mettant en évidence des aa impliqués d'une part dans sa liaison à la GPIb et d'autre part, dans la formation de sa structure multimérique. Notre méthodologie a consisté à caractériser des VWF recombinants portant des mutations identifiées chez des patients atteints de VWD de type 2A ou 2M. Dans la première partie, nous avons montré que la Ser1285 joue un rôle majeur dans le maintien d'une conformation de la boucle Al adéquate à la liaison à la GPIb. Dans la seconde partie, nous avons montré que la mutation des Cys 1157 et 1234 modifient la conformation du domaine D3 ; leur absence induit une disparition des multimères de HPM, une rétention intracellulaire dans le réticulum endoplasmique et une sécrétion très diminuée du VWF. Dans la dernière partie, nous avons montré que l'Ala2801 est nécessaire pour une multimérisation normale du VWF. La mutation A2801D induit vraisemblablement une conformation anormale du domaine CK, qui résulte en la formation de dimères instables de la sous-unité. Ces différents exemples nous ont permis de montrer qu'une anomalie conformationnelle très localisée dans la sous unité du VWF peut empêcher sa liaison à la GPIb ou l'établissement normal de sa structure multimériqueVon Willebrand factor (VWF) is a multimeric glycoprotein of haemostasis, mainly acting in platelet adhesion by binding to glycoprotein Ib (GPIb) with the A1 domain of its sub-unit. The multimeric structure results from the association of the sub-units into dimers and then, of the dimers into multimers, with the involvement of D3 and CK domains. The high molecular weight (HMW) multimers are required in its regular function. Von Willebrand disease (VWD) is a constitutive hemorragic affection which comprises different types. In type 2A, HMW multimers are absent and GPIb-binding is decreased. In type 2M, the binding is also decreased but independently from the multimeric structure. The aim of this work is to study the funtionnal structure of VWF by finding amino-acids involved in the GPIb-binding and in the multimerization process. Our methodologic approach consisted in the characterization of recombinant VWF with mutations identified in patients with type 2A or 2M VWD. In the first chapter, we show that amino-acid Ser1285 plays a major role in the normal conformation of the Al loop required for GPIb-binding. In the second chapter, we show that mutation of Cys 1157 or 1234 modify the conformation of D3 domain; mutations C1157F and C1234W induce the absence of the HMWmulimers, an intracellular retention in the endoplasmic reticulum and a decreased secretion of VWF. In the last chapter, we show that amino-acid Ala2801 is required for normal multimerization of VWF. The A2801D mutation probably induces an abnormal conformation of the CK domain, that results in the formation of unstable dimers. These results together also show that a very localized conformational abnormality in V
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Desarnaud, Franck. "Etude structurale des récepteurs de l'angiotensine II : purification et contribution à la cartographie du site de liaison." Montpellier 2, 1992. http://www.theses.fr/1992MON20134.
Full textAbstract:
Le present travail s'integre dans un projet visant a contribuer a l'etude des proprietes structurales et moleculaires des recepteurs de l'angiotensine 2. Une sonde biotinylee photoactivable possedant un pont disulfure dans son bras espaceur a ete concue pour le marquage covalent des recepteurs de l'angiotensine 2 et l'adsorption subsequente des complexes covalents sur avidine ou streptavidine immobilisees. Les proprietes de cette sonde ont ete etablies. Les conditions d'application de cette sonde a un protocole de purification du recepteur de foie de rat (sous-type at#1) ont ete elaborees. Sont rapportees la diversite d'utilisation de ce protocole, sa generalisation a la purification d'autres proteines ainsi que sa transposition a la purification du recepteur de type at#2. L'application de la purification et de la fragmentation du recepteur at#1 a la cartographie du site de liaison de l'hormone a permis de formuler une hypothese: le marquage covalent par la sonde implique une zone du recepteur comportant le troisieme domaine transmembranaire et les portions des boucles adjacentes. Les perspectives d'etudes de la structure tridimensionnelle du recepteur et de la cartographie de son interaction avec l'hormone sont discutees
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RICHARD, VALERIE. "Etude cristallographique du site de liaison du 2,3-diphosphoglycerate a l'hemoglobine et d'un etat t semi-lie." Paris 7, 1991. http://www.theses.fr/1991PA077079.
Full textAbstract:
La cristallisation de l'hemoglobine (hb) a partir de solutions de polyethyleneglycol permet la double etude du site de fixation du diphosphoglycerate (d. P. G. ) a l'hemoglobine ainsi que d'etats t partiellement lies. Autrement dit, dans ce dernier cas, de decrire une voie de passage conduisant a la transition t vers r. L'analyse cristallographique de cristaux du complexe hb-dpg exposes a a l'oxygene de l'air a confirme les resultats obtenus sur d'autres structures t semi-liees, mais a aussi mis en evidence un facteur d'occupation different pour la molecule d'oxygene de chacun des hemes alpha, en accord avec la difference d'amplitude des changements structuraux observes. Cette difference d'occupation semble etre due aux contacts cristallins. Ces contacts, fortement asymetriques, perturbent aussi la symetrie du site de liaison du dpg qui n'adopte qu'une seule position. Toutefois, cette etude a permis de mettre en evidence le role primordial des lysines 82 beta dans la fixation du dpg a l'hb, ces lysines stabilisant toutes deux le dpg par cinq liaisons au total