Dissertations / Theses on the topic 'Evolucija'

La familia Hyaenidae (Mammalia, Carnivora) incluye actualmente cuatro especies, que están restringidas a África y Asia: las hienas rompedoras de huesos (Crocuta crocuta, Hyaena hyaena, Parahyaena brunnea) y el mirmecófago lobo de tierra (Proteles cristata). Durante el Neógeno y el Cuaternario, las hienas tenían mayor diversidad y se distribuían ampliamente por todo el Viejo Mundo y parte de Norteamérica, aunque su diversidad y disparidad ecomorfológica fueron disminuyendo progresivamente desde finales del Mioceno. El origen y diversificación de los hiénidos sigue siendo objeto de controversias. Esta tesis tiene como objetivo abordar algunas de estas problemáticas mediante el estudio ​de nuevos restos y el uso de técnicas innovadoras. Esta tesis está formada por un compendio de artículos, organizados en dos bloques: el primero consta de cinco publicaciones sobre hiénidos extintos (Hyaenictis, Pliocrocuta y Pachycrocuta), principalmente dedicadas a la descripción y comparación morfométrica de fósiles inéditos y sus problemas taxonómicos, con énfasis en las adaptaciones dentales a la durofagia; el segundo bloque se centra en el estudio la anatomía craneal interna de los hiénidos extintos (Pliocrocuta, Crocuta), obtenida mediante écnicas de visualización aplicadas a escáneres de tomografía computarizada (CT), con especial énfasis en la morfología cerebral y sus proporciones, en base a las cuales se pueden realizar inferencias paleobiológicas sobre el comportamiento social de cada especie. Las conclusiones principales de la tesis se pueden agrupar de la siguiente manera: 1. Taxonomía: el material inédito de Ronda Oest de Sabadell (Mioceno superior), La Puebla de Valverde y Villarroya (Plioceno Superior-Pleistoceno Inferior) y Cueva Victoria (Pleistoceno Inferior tardío) se atribuye, respectivamente, a Hyaenictis aff. almerai, Pliocrocuta perrieri y Pachycrocuta brevirostris. La autoría de este último se corrige de "Aymard, 1846" a "Gervais, 1850". Diferencias en la morfología cerebral, tanto en Crocuta spelaea como en Crocuta ultima, con respecto a Crocuta crocuta apoyan su distinción con rango de especie. 2. Paleobiología: El estudio tafonómico de los grandes restos de herbívoros de la Sección de Vallparadís (Pleistoceno Inferior tardío) indica que Pachycrocuta brevirostris fue el principal agente modificador de huesos en el yacimiento. A su vez, los senos frontales desarrollados de Pliocrocuta perrieri, relacionados con la resistencia mejorada del cráneo durante las tensiones en la mordida, respaldan una dieta durófaga para esta especie. Esto se aplica también al patrón microestructural en zig-zag del esmalte de Pliocrocuta perrieri y Hyaenictis aff. almerai, que permite reasignar esta última al ecomorfotipo 5 (hienas rompedoras de huesos transicionales). La morfología cerebral de Pliocrocuta perrieri, Crocuta spelaea y Crocuta ultima se parece a la de las hienas actuales, aunque su lóbulo frontal está menos desarrollado que en Crocuta crocuta, lo que sugiere una menor complejidad del comportamiento social que la presente en esta última (comparable a las de Hyaena y Parahyaena). Los datos paleoneurológicos disponibles indican que el cerebro de los hiénidos evolucionó hacia una mayor complejidad y tamaño a lo largo del Mioceno y que Proteles presenta, probablemente, el cerebro más plesiomórfico entre hiénidos actuales. 3. Historia evolutiva: En base los nuevos datos morfofuncionales y paleoneurológicos presentados, se proponen nuevas hipótesis para la evolución de las hienas rompedoras de huesos, como el origen de los hyaeninos actuales a partir de Hyaenictis. Algunas de estas hipótesis difieren de los análisis cladísticos basados en morfología, pero están en mayor concordancia con los datos moleculares. Los resultados destacan el potencial del estudio de la morfología interna del craneo como posible fuente de datos filogenéticamente informativos que, en el futuro, podrían permitir un análisis filogenético más completos y más bien resueltos que podría zanjar algunos de los debates actuales sobre la historia evolutiva de los hiénidos.<br>The family Hyaenidae (Mammalia, Carnivora) include four extant species restricted to Africa and Asia: the bone-cracking hyenas (Crocuta crocuta, Hyaena hyaena, Parahyaena brunnea) and the myrmecophagous aardwolf (Proteles cristata). During the Neogene and Quaternary, hyaenids were more diverse and widely distributed throughout the Old World and even North America, although their diversity and ecomorphological disparity progressively declined since the late Miocene onwards. Many controversies remain about the origin and diversification of hyaenids. This dissertation aims to address some of these topics based on new remains and innovative techniques. It includes a compendium of published articles, organized in two blocks: the first consists of five papers about extinct hyaenids (Hyaenictis, Pliocrocuta and Pachycrocuta), mostly devoted to the morphological description and morphometric comparison of previously unpublished fossils and related taxonomic issues, with emphasis on dental adaptations to durophagy; the second block relies on 3D imaging techniques applied to computed tomography (CT) scans to study the internal cranial anatomy of extinct hyaenids (Pliocrocuta, Crocuta), with emphasis on brain morphology and proportions to derive paleoneurological inferences on social behavior. The main conclusions of the dissertation may be grouped as follows: 1. Taxonomy: The unpublished material from Ronda Oest de Sabadell (late Miocene), La Puebla de Valverde and Villarroya (Late Pliocene-Early Pleistocene), and Cueva Victoria (Late Early Pleistocene) is attributed, respectively, to Hyaenictis aff. almerai, Pliocrocuta perrieri, and Pachycrocuta brevirostris. The authorship of the latter is corrected from “Aymard, 1846” to “Gervais, 1850”. Differences in brain morphology support the distinction of both Crocuta spelaea and Crocuta ultima from Crocuta crocuta at the species rank. 2. Paleobiology: The taphonomic study of the large herbivore remains from the Vallparadís Section (Late Early Pleistocene) indicates that Pachycrocuta brevirostris was the main bone modificator agent in the site. In turn, the developed frontal sinuses of Pliocrocuta perrieri, related to improved skull resistance against bite stresses, support a durophagous diet for this species, and the same holds for the zig-zag enamel microstructural pattern of both Pliocrocuta perrieri and Hyaenictis aff. almerai, which enable to reassign the latter to the transitional bone-cracking ecomorphotype 5. With regard to brain morphology, Pliocrocuta perrieri, Crocuta spelaea and Crocuta ultima resemble extant hyaenines, although their frontal lobe is less developed than in Crocuta crocuta, suggesting a less complex social behavior than in the latter species (comparable to that of Hyaena and Parahyaena). Currently available paleoneurological evidence indicates that the hyaenid brain evolved towards greater relative size and complexity throughout the Miocene and that Proteles probably displays the most plesiomorphic brain among extant hyaenids. 3. Evolutionary history: Based on the new morphofunctional and paleoneurological evidence presented, new hypotheses for the evolution of bone-cracking hyaenids are proposed, such as the origin of hyaenines from Hyaenictis. Some of these hypotheses differ from those supported by morphology-based cladistic analyses but are in greater agreement with molecular evidence. The results highlight the potential of cranial internal morphology as a source of phylogenetically informative data that, in the future, might hopefully enable more comprehensive and better resolved phylogenetic analyses that could settle some of the current debates about the evolutionary history of hyaenids.

This thesis presents an approach for working with low level source code that enables automatic restructuring and raising the abstraction level of the programs. This makes it easier to understand the logic of the program, which in turn reduces the development time.The process in this thesis was designed to be flexible and consists of several independent tools. This makes the process easy to adapt as needed, while at the same time the developed tools can be used for other processes. There are usually two basic steps. First is the translation to WSL language, which has a great number of semantic preserving program transformations. The second step are the transformations of the translated WSL. Two tools were developed for translation: one that works with a subset of x86 assembly, and another that works with MicroJava bytecode. The result of the translation is a low level program in WSL.The primary goal of this thesis was to fully automate the selection of the transformations. This enables users with no domain&nbsp; knowledge to efficiently use this process as needed. At the same time, the flexibility of the process enables experienced users to adapt it as needed or integrate it into other processes. The automation was achieved with a <em>hill climbing </em>algorithm.Experiments that were run on several types of input programs showed that the results can be excellent. The fitness function used was a built-in metric that gives the &ldquo;weight&rdquo; of structures in a program. On input samples that had original high level source codes, the end result metrics of the translated and transformed programs were comparable. On some samples the result was even better than the originals, on some others they were somewhat more complex. When comparing with low level original source code, the end results was always significantly improved.<br>U okviru ove teze se predstavlja pristup radu sa programima niskog nivoa koji omogućava automatsko restrukturiranje i podizanje na vi&scaron;e nivoe. Samim tim postaje mnogo lak&scaron;e razumeti logiku programa &scaron;to smanjuje vreme razvoja.Proces je dizajniran tako da bude fleksibilan i sastoji se od vi&scaron;e nezavisnih alata. Samim tim je lako menjati proces po potrebi, ali i upotrebiti razvijene alate u drugim procesima. Tipično se mogu razlikovati dva glavna koraka. Prvi je prevođenje u jezik WSL,za koji postoji veliki broj transformacija programa koje očuvavaju semantiku. Drugi su transformacije u samom WSL-u. Za potrebe prevođenja su razvijena dva alata, jedan koji radi sa podskupom x86 asemblera i drugi koji radi sa MikroJava bajtk&ocirc;dom. Rezultat prevođenja je program niskog nivoa u WSL jeziku.Primarni cilj ovog istraživanja je bila potpuna automatizacija odabira transformacija, tako da i korisnici bez iskustva u radu sa sistemom mogu efikasno da primene ovaj proces za svoje potrebe. Sa druge strane zbog fleksibilnosti procesa, iskusni korisnici mogu lakoda ga pro&scaron;ire ili da ga integri&scaron;u u neki drugi već postojeći&nbsp;&nbsp; proces.Automatizacija je&nbsp; postignuta pretraživanjem usponom (eng. hill climbing).Eksperimenti vr&scaron;eni na nekoliko tipova ulaznih programa niskog nivoa su pokazali da rezultati mogu biti&nbsp; izuzetni. Za funkciju pogodnosti je kori&scaron;ćena ugrađena metrika koja daje &ldquo;težinu&rdquo; struktura u programu. Kod ulaza za koje je originalni izvorni k&ocirc;d bio dostupan, krajnje metrike najboljih varijanti prevedenih i transformisanih programa su bile na sličnom nivou. Neki primeri su bolji od originala, dok su drugi bili ne&scaron;to kompleksniji. Rezultati su uvek pokazivali značajna unapređenja u odnosu na originalni k&ocirc;d niskog nivoa.

Los pequeños cambios económicos que se aprecian en un barrio cualquiera de una ciudad cualquiera son consecuencia de complejos factores que atienden no sólo a una escala urbana sino también a una escala regional, nacional o internacional. La creciente globalización económica comporta que las ciudades configuren una serie mecanismos económicos para poder competir con otras ciudades a escala global. Este proceso tiene una impronta directa en la estructura económica de espacios económicos intra-urbanos. La presente tesis tiene como objetivo contribuir a responder sobre los factores que afectan a la evolución de espacios económicos maduros en ciudades europeas. El caso de estudio es el Distrito Textil de Trafalgar (DTT), en Barcelona. A principios del siglo XX, el DTT se configuró como un clúster textil. A lo largo del siglo, el distrito fue perdiendo su condición de clúster para especializarse en el comercio mayorista de ropa. Actualmente, la estructura económica del DTT está enfocada a actividades basadas en el conocimiento, la creatividad y el turismo y a micro espacios económicos como los coworkings. Por lo tanto, el actual TGD es un new industrial cluster (NIC). La hipótesis principal es que la configuración y evolución del DTT primero como clúster textil y después como NIC responde a procesos económicos multi-escalares e interrelacionados. Sin embargo la escala local tiene un fuerte rol explicativo debido a contingencias históricas específicas de Barcelona y a especificidades urbanas del TGD. La validación de esta hipótesis se ha realizado a través de una metodología basada en métodos estadísticos y cualitativos y en la utilización de una serie de fuentes de datos que abarca fuentes primarias y secundarias. Por otra parte, la investigación se enmarca dentro un marco teórico que comprende varios conceptos tales como las economías de aglomeración, clúster, lock-in y los NIC. La interrelación de estos conceptos ayuda a analizar de manera poliédrica la configuración y evolución del DTT. La tesis concluye en que, a pesar de que la configuración y evolución del TGD es resultado de procesos multi-escalares, éstos no se pueden entender sin los procesos económicos de Barcelona y en las características históricas, urbanas y económicas propias del TGD.<br>The small economic changes that can be observed in any neighborhood of any city are a consequence of complex factors not only at an urban scale, but also at a regional, national and international scale. The growing economic globalization means that cities configure a set of economic mechanisms to compete with other cities at a global scale. This process has a direct imprint in the economic structure of intra-urban economic spaces. The thesis aims to contribute to answering the factors that affect the evolution of mature economic spaces in European cities. The case study is the Trafalgar Garment District (TGD), in Barcelona. At the beginning of the 20th century, the TGD was configured as a garment cluster. Throughout the century, the district was losing its nature as a cluster to specialize in the clothing wholesaling. Currently, the economic structure of the TGD is based on activities related to knowledge, creativity and tourism and new micro-economic spaces such as co-workings. Therefore, the present TGD is a new industrial cluster (NIC) The main hypothesis is that the configuration and evolution of the TGD as both an earlier garment cluster and an NIC responds to multi-scalar and interrelated economic processes. However, the urban scale has a strong explanatory role because of the historical contingencies of Barcelona and the urban specificities of the TGD. The validation of this hypothesis has been carried out through a methodology based on statistical and qualitative methods on the one hand and on the use of a set of primary and secondary source, on the other hand. The research is framed within a theoretical framework that includes several concepts such as agglomeration economies, cluster, lock-in and new industrial clusters (NICs). The interrelation of these concepts aids to analyze in a polyhedral way the configuration and evolution of the TGD. The thesis concludes that the configuration and evolution of the TGD is the result of multi-scalar economic processes. However, these cannot be understood without taking in account the Barcelona’s economic processes and the own economic, historical and economic characteristics of the TGD.

La resistència als compostos antibacterians és un greu problema a la sanitat moderna, tant humana com animal. Està ampliament demostrat que la resistència als antibiòtics va sorgir fa milions d’anys a bacteris productors d’aquests compostos o als seus competidors. No obstant això, la resistència als agents quimioterapèutics no es pot explicar pel mateix mecanisme, ja que no són produïts de forma natural. Per tant, clàssicament s’ha assumit que la resistència a aquest tipus de compostos va emergir i va evolucionar ràpidament a partir de la seva aplicación a la teràpia antibacteriana. La resistència clínica a les sulfamides i al trimetoprim es deu principalment a la presència dels gens mòbils sul i dfr, respectivament. Aquests gens codifiquen versions alternatives i funcionals dels enzims dihidropteroat sintasa i dihidrofolat reductasa que no són inhibits per l’acció d’aquests antibacterians, a diferència dels gens bacterians folP i folA que codifiquen les variants cromosòmiques d’aquests enzims i que són típicament sensibles als citats agents antibacterians. L’objectiu central de la present Tesis Doctoral ha estat la identificació de l’origen dels gens que confereixen resistència clínica a les sulfamides i al trimetoprim, així com l’anàlisis del procés evolutiu que ha donat lloc a les variants enzimàtiques actuals. Així, s’han analitzat les seqüències dels gens sul i el seu entorn amb l’objectiu de detectar elements que permetessin l’elucidació del seu origen. Com a conseqüència d’aquesta anàlisi, s’ha identificat un motiu Sul present a les seqüències de les proteïnes codificades pels gens mòbils sul1, sul2 i sul3, que confereixen resistència a les sulfamides, així com la associació física a múltiples plasmidis del gen sul2 amb un fragment del gen glmM que codifica una fosfoglucomutasa. L’estudi comparatiu des les seqüències dels gens folP cromosòmics de tot el domini Bacteria ha permet identificar la presencia del motiu Sul a les proteïnes codificades pels gens folP de dues famílies bacterianes: Rhodobiaceae i Leptospiraceae. L’estudi filogenètic de les proteïnes FolP/Sul i GlmM ha establert clarament que els gens sul1-2 i sul3 es van originar mitjançant sengles processos de mobilització independents dels gens folP cromosòmics presents, respectivament, a Rhodobiaceae i Leptospiraceae. Tanmateix, els experiments in vitro han revelat que els gens folP codificats a Rhodobiaceae i Leptospiraceae confereixen resistència a les sulfamides. Aquests resultats indiquen que la resistència a les sulfamides és ancestral i anterior a la introducció clínica d’aquest agent antibcterià. D’altra banda, es va analitzar l’origen i la evolució dels gens mòbils dfrA que confereixen resistència al trimetoprim. Al contrari del que s’ha descrit pels gens sul, els resultats obtinguts de l’anàlisis de les seqüències dels gens dfrA mòbils indiquen que aquests s’han originat mitjançant events múltiples de transferència lateral de gens folA cromosòmics. Així mateix, s’ha pogut establir que la majoria dels gens cromosòmics folA predecessors dels dfrA també confereixen resistència al trimetoprim. Tot això revela que la resistència al trimetoprim determinada per elements mòbils es pot explicar per dos processos independents i complementaris: i) la captació de gens folA cromosòmics, portadors d’una mutación ancestral responsable d’aquesta resistència i que es va originar en absència del quimitoeràpic, i ii) la transferència de mutants espontanis cromosòmics del gen folA, presents a una població bacteriana coetània amb l’exposició al citat antibacterià, i havent estat seleccionats per aquesta exposició.<br>La resistencia a los compuestos antibacterianos es un grave problema en la sanidad moderna, tanto humana como animal. Está ampliamente demostrado que la resistencia a los antibióticos surgió hace millones de años en bacterias productoras de estos compuestos o en sus competidoras. No obstante, la resistencia a los agentes antibacterianos sintéticos no se puede explicar por el mismo mecanismo, ya que no se producen de forma natural. Por consiguiente, se ha asumido que la resistencia a este tipo de compuestos emergió y ha evolucionado rápidamente a partir de su aplicación en la terapia antibacteriana. La resistencia clínica a las sulfamidas y al trimetoprim se debe principalmente a la presencia de los genes móviles sul y dfr, respectivamente. Estos genes codifican versiones alternativas y funcionales de las enzimas dihidropteroato sintasa y dihidrofolato reductasa que no son inhibidas por la acción de estos antibacterianos, a diferencia de los genes bacterianos folP y folA que codifican las variantes cromosómicas de estos enzimas, típicamente sensibles a los citados agentes quimioterapéuticos. El objetivo central de la presente Tesis Doctoral ha sido la identificación del origen de los genes que confieren resistencia clínica a las sulfamidas y al trimetoprim, así como el análisis del proceso evolutivo que ha dado lugar a las actuales variantes enzimáticas. Para ello, se han analizado las secuencias de los genes sul y su entorno para detectar elementos que permitiesen la elucidación de su origen. De este modo, se ha identificado un motivo Sul presente en las secuencias de las proteínas codificadas por los genes móviles sul1, sul2 y sul3, que confieren resistencia a las sulfamidas, así como la asociación física en múltiples plásmidos del gen sul2 con un fragmento del gen glmM que codifica una fosfoglucomutasa. El estudio comparativo de las secuencias de los genes folP cromosómicos de todo el dominio Bacteria ha permitido identificar la presencia del motivo Sul en las proteínas codificadas en los genes folP de dos familias bacterianas: Rhodobiaceae y Leptospiraceae. El análisis filogenético de las proteínas FolP/Sul y GlmM ha establecido claramente que los genes sul1-2 y sul3 se originaron mediante sendos procesos de movilización independientes de los genes folP cromosómicos presentes, respectivamente, en Rhodobiaceae y Leptospiraceae. Asimismo, los ensayos in vitro han revelado que los genes folP codificados en Rhodobiaceae y en Leptospiraceae confieren resistencia a sulfamidas. Estos resultados indican que la resistencia a las sulfamidas es ancestral y anterior a la introducción clínica de este antibacteriano. Por otro lado, se analizó el origen y evolución de los genes móviles dfrA que confieren resistencia al trimetoprim. Al contrario de lo descrito para los genes sul, los resultados obtenidos en el análisis de las secuencias existentes de genes dfrA móviles indican que éstos se han originado mediante múltiples eventos de transferencia lateral de genes folA cromosómicos. Asimismo, se ha podido establecer que muchos de los genes cromosómicos folA predecesores de los dfrA también confieren resistencia a trimetoprim. Todo ello revela que la resistencia a trimetroprim determinada por elementos móviles se puede explicar por dos procesos independientes y complementarios: i) la captación de genes folA cromosómicos movilizados, portadores de una mutación ancestral responsable de dicha resistencia originada en ausencia del quimioterápico, y ii) la transferencia de genes mutantes espontáneos folA cromosómicos, presentes en una población bacteriana coetánea con la exposición al citado antibacteriano, y habiendo sido seleccionados por dicha exposición.<br>Antibacterial resistance is a pressing problem in human and animal modern healthcare. It is widely accepted that antibiotic resistance originated million years ago in either the microbes that naturally produce the antibiotics or their competitors. However, resistance to synthetic chemotherapeutic agents cannot be explained by this mechanism, since these drugs are not naturally produced. Resistance to chemotherapeutic compounds is hence assumed to have emerged and evolved rapidly following the clinical introduction of these compounds. Resistance to sulfonamides and trimethoprim is mediated by mobile sul and dfr genes, respectively. These genes encode resistant variants of the di-hydro-pteroate synthase and di-hydrofolate reductase enzymes, in contrast to chromosomal folP and folA genes encoding variants sensitive to these agents. The overall objective of this Doctoral Thesis is the identification of the chromosomal origin of genes conferring clinical resistance to sulfonamides and trimethoprim, and the study of the evolutionary processes governing their emergence and dissemination. In this work, sul genes and their genetic neighborhoods have been analyzed to uncover elements that enable the elucidation of their genetic origin. This analysis has led to the identification of a Sul motif associated with sul-encoded proteins, as well as the observation of a consistent genomic association of the sul2 gene with a phosphoglucosamine mutase gene (glmM) . The study of chromosomal folP genes across the Bacteria domain revealed the presence of the Sul motif in the chromosomal folP genes of two families: the Rhodobiaceae and the Leptospiraceae. Phylogenetic analysis of FolP/Sul and GlmM proteins established that the sul1-2 and sul3 genes originated through the independent mobilization of chromosomal folP genes encoded by the Rhodobiaceae and the Leptospiraceae, respectively. In vitro experiments revealed that both the Rhodobiaceae and the Leptospiraceae chromosomal folP genes confer resistance to sulfonamides. These results suggest that resistance to sulfonamides is ancient and predates the clinical introduction of these drugs. Likewise, the origin and evolution of mobile dfrA genes conferring clinical resistance to trimethoprim have been analysed. The results have shown that, in contrast to sul genes, the dfrA gene arose from multiple mobilization events from chromosomal folA. Furthermore, it has been established that most chromosomal folA genes that are predecessors of mobile dfrA genes also confer trimethoprim resistance. Taken together, these results indicate that the resistance to trimethoprim determined by mobile elements can be explained by two independent and complementary processes: i) the mobilization of chromosomal folA genes carrying an ancestral mutation originated in the absence of trimethoprim and responsible for trimethoprim resistance, and ii) the mobilization of spontaneous mutants in chromosomal folA genes, present in a bacterial population coetaneous with the exposure to trimethoprim, and having been selected by that exposure. Given the absence of sulfonamides and trimethoprim in nature, these results provide a new perspective on the emergence and dissemination of resistance to new-generation chemotherapeutic agents. Thus, this work concludes that resistant genes may exist in the vast bacterial pangenome and can be selected for and mobilized upon exposure to these new drugs.

Aquesta tesi explora els discursos sobre l’evolució de les espècies en les primeres tres dècades de franquisme (1939-1967). A partir de l’estudi dels discursos a l’esfera pública, arriba als debats sobre aquest tema en grups elitistes: les elits eclesiàstiques, els científics i els considerats ideòlegs del règim. La tesi revela la preocupació d’aquestes elits per la circulació de les idees evolucionistes entre el gran públic. Aquesta preocupació es manifestà, primer, en un silenci evolucionista a la premsa general durant els primers deu anys de franquisme i, posteriorment, en les iniciatives per construir una versió de l’evolucionisme coherent amb els principis ideològics del règim, apte per a la seva circulació a l’esfera pública. La tesi revela que els discursos sobre l'evolució tingueren un paper clau en el projecte de cultura i ciència catòliques que constituïa una de les bases programàtiques del Nuevo Estado. A través d'ells es legitimà, no només la retòrica antimaterialista i transcendent propugnada pel règim, sinó també la seva retòrica anticomunista. A nivell internacional, l’ideal de ciència per a la Nova Espanya xocava amb els principis sobre els quals s’estava erigint el neodarwinisme o Síntesi Moderna de l’Evolució, que rebutjaven qualsevol explicació transcendent del procés evolutiu. El nou corrent s’estava promocionant amb força i recursos des del Regne Unit i els Estats Units. Aquesta tesi revela la implicació dels científics espanyols en la construcció d'una Síntesi Tradicional de l’Evolució, científicament fonamentada, que pogués competir amb el neodarwinisme. De l’èxit d'aquesta síntesi alternativa depenia l’èxit de la implantació de la ciència catòlica, part fonamental de la cultura catòlica en què havien basat la implantació del nou règim els ideòlegs del franquisme. En aquest sentit, aquesta tesi proposa que els científics es convertiren, també, en ideòlegs del franquisme i els seus discursos sobre ciència ajudaren a construir-ne les bases, legitimar-lo i perpetuar-lo. L’estudi dels discursos públics porta al focus en la Generación del 48. Aquest grup, hereus i continuadors del pensament tradicionalista catòlico-monàrquic espanyol, competia amb altres faccions del règim per l’hegemonia cultural. Aconseguir imposar el seu projecte de cultura era considerat un pas clau per aconseguir els seus fins polítics. La cultura que propugnaven era, com la de tots els grups, una cultura catòlica i unitària, en la qual totes les branques del saber estaven vinculades i unides al tronc de la teologia. La peculiaritat de la Generación del 48 era que pretenia deslliurar la cultura de tota “heterodòxia” passada i present i fonamentar-la únicament en la tradició més ortodoxa. Aquest grup tractà d’establir i difondre una versió de l’evolucionisme coherent amb els seus principis, lliure de tota llavor “heterodoxa”: una Evolución sin problema per a l’Espanya de Franco. Aquesta facció del règim dominà llocs estratègics de la gestió de la informació i la cultura durant bona part del període tractat i, per això, els seus discursos sobre l’evolució són el focus d’aquesta tesi. A través de les seves iniciatives per crear aquest discurs, en les quals participaren científics espanyols reconeguts, s’ha descobert una xarxa que uní la Generación del 48 en una empresa comú més enllà del que la historiografia sobre aquest grup deixava constància. La Síntesi Tradicional de l’Evolució que s’intentà gestar i difondre a Espanya, però, no fou el fruit autàrquic d'un franquisme isolat. La investigació revela les connexions i col·laboracions internacionals del projecte i mostra com Espanya no només pretenia ser la reserva espiritual de Occidente, sinó també la reserva científica de Occidente. La Generación del 48 estigué especialment il·lusionada amb aquest projecte, en el qual diversos científics espanyols de renom hi jugaren un paper crucial.<br>This thesis explores the discourses on the evolution of species in the first three decades of Francoism (1939-1967). From the study of these discourses in the public sphere, it reaches the debates on this subject in elitist groups: ecclesiastical elites, scientists and the so-called ideologues of the regime. It shows the concern of these elites for the circulation of evolutionary ideas among the general public. This preoccupation was manifested, first, in an evolutionary silence in the general press that lasted for the first ten years of Francoism and, subsequently, in the initiatives to build a version of evolutionism consistent with the ideological principles of the regime, and apt for its circulation in the public sphere. The thesis argues that the discourses on evolution played a key role in the Catholic culture -and science- project, which was one of the programmatic bases of the New State. Through them, not only the anti-materialist and transcendental rhetoric advocated by the regime, but also its anti-communist rhetoric, were legitimized. At an international level, the ideal of science intended for the New Spain clashed with the principles on which the Modern Synthesis of Evolution, or Neo-Darwinism, was being built. Neo-Darwinism rejected any transcendental explanation of the evolutionary process and it was being promoted with strength and resources from the United Kingdom and the United States. This thesis reveals the involvement of Spanish scientists in the construction of a scientifically based “Traditional Synthesis of Evolution” able to compete with Neo-Darwinism. The implantation of a Catholic science depended on the success of this alternative synthesis. And the Catholic science was part of the Catholic culture in which the ideologues of the Francoist state had based the implantation of the new regime. In this sense, this thesis proposes that the scientists were also converted into ideologues of the Franco regime. Their discourses on science helped to build its foundations, legitimize it and perpetuate it. The study of the public discourses leads to the focus on the Generation of ’48. This group, who were heirs and continuers of the traditional Catholic and monarchist Spanish thought, competed with other factions of the regime for cultural hegemony. Imposing their cultural project was considered a key step in achieving their political goals. The culture they advocated was, like that of all groups, a Catholic and unitary culture, in which all branches of knowledge were linked to the trunk of theology. The peculiarity of the Generation of ’48 was that it tried to liberate culture of all past and present “heterodoxy”. This group tried to establish and disseminate a version of evolution coherent with its principles, free of all “heterodox” seeds: an “Evolution without problem” for Franco's Spain. This faction of the regime dominated strategic positions in the management of information and culture in Spain for much of the period covered in this thesis. Therefore, its discourses on evolution are the focus of this thesis. Through the initiatives to create its discourse, in which renowned Spanish scientists participated, this thesis has discovered a network that brought together the Generation of ’48 in a common endeavour beyond what the historiography had brought to light. The “Traditional Synthesis of Evolution”, which was attempted and spread in Spain, however, was not the autarchic fruit of an isolated Franco regime. The research reveals the connections and international collaborations of the project, and shows how Spain not only sought to be “the spiritual reserve of the West” but also “the scientific reserve of the West”. The Generation of ’48 was especially excited about this project, in which several renowned Spanish scientists played a crucial role.

La infección por virus C afecta entre 130-150 millones de personas, siendo una de las infecciones víricas más prevalentes y la principal causa de enfermedad hepática en los países desarrollados. La mayoría de casos detectados son en la fase crónica que ocasiona un grado variable de inflamación y fibrosis, que puede evolucionar a cirrosis hepática y/o carcinoma hepatocelular, y puede ser modificado por el tratamiento antivírico. Los objetivos de la presente Tesis son analizar la progresión de la fibrosis en pacientes con fibrosis leve-moderada mediante BH previa y BH o ET posterior, además valorar la influencia del tratamiento antivírico en esta progresión así como en la evolución de la hepatopatía. Se incluyeron un total de 291 pacientes que habían realizado tratamiento. En el grupo 1 se incluyeron 107 pacientes con BH pareada y en el grupo 2, 184 pacientes con ET. Se evaluó en el período de seguimiento la progresión de la fibrosis que se definió como el incremento en el estadío de fibrosis, así como, la evolución a una hepatopatía y sus posibles complicaciones. La fibrosis en la BH inicial fue grado 0 en 87 pacientes (29,9%), grado 1 en 134 pacientes (46%) y grado 2 en 70 pacientes (24,1%), sin diferencias entre ambos grupos de estudio. Se objetivaron diferencias significativas entre los 3 estadíos de fibrosis en el valor de plaquetas, protrombina, colesterol, GOT, GPT y GGT, lo que puede traducir un grado mayor de afectación hepática. Todos los pacientes iniciaron tratamiento antivírico tras la BH. Al final de seguimiento, la fibrosis había progresado en 79 pacientes (27,1%), en 120 pacientes (41,2%) se mantenía igual y en 92 pacientes (31,6%) hubo mejoría. La tasa de progresión cuantificada por la variación de la puntuación METAVIR por año fue del 0,091+-0,11 en NR y de -0,083+-0,08 en RVS (P<0,0001). Los pacientes con F0 presentaron menor progresión de la fibrosis respecto a F1 y F2 (P<0,0001). La probabilidad actuarial global de tener una fibrosis avanzada (F3/4) fue del 1,9% a los 10 años y del 27,6% a los 20 años. En los pacientes con y sin RVS a alguno de los tratamientos fue respectivamente del 0 y 10,2% (RVS) y del 7,2 y 55,7% (NR) (P<0,0001). La probabilidad de presentar cirrosis fue del 1,5% y del 22,6% a los 10 y 20 años, observándose también unas marcadas diferencias entre pacientes que consiguieron la RVS (0 y 5,8% a 10 y 20 años) y los NR (9,8 y 50,5% en dichos períodos (P<0,0001). La probabilidad actuarial de presentar CHC durante el seguimiento global fue del 1 y del 9,8% a los 10 y 20 años. La probabilidad actuarial de supervivencia fue del 1 y el 13,8% a los 10 y 20 años respectivamente. En esta Tesis se ha observado que los pacientes sin fibrosis en la BH inicial tienen una menor progresión de la fibrosis, y es casi nula en los que alcanzan RVS. La ET permite una evaluación de la progresión de la fibrosis con una eficacia similar a la PBH. Se ha observado que el retratamiento de los pacientes NR evita la progresión en los que alcanzan RVS. En cambio, la probabilidad de cirrosis hepática en pacientes NR al tratamiento y retratamiento es del 50% a los 20 años. La actual Tesis pone de manifiesto la importancia de realizar tratamiento antiviral lo antes posible y de alcanzar la RVS.<br>Hepatitis C infection affects between 130-150 million people, being one of most prevalent viral infections and leading cause of liver disease in developed countries. Majority of detected cases are in chronic phase that causes a variable degree of inflammation and fibrosis, which can evolve to hepatic cirrhosis and / or hepatocellular carcinoma, and may be modified by antiviral treatment. Objectives of this Thesis are to analyze progression of fibrosis in patients with mild-moderate fibrosis by previous LB and subsequent LB or ET, in addition to assessing the influence of antiviral treatment in this progression as well as in the evolution of liver disease. A total of 291 patients who had been treated were included. Group 1 included 107 patients with paired LB and in group 2, 184 patients with TE. Progression of fibrosis was defined as increase in the stage of fibrosis, as well as the progression to liver disease and its possibles complications. Fibrosis in initial LB was grade 0 in 87 patients (29.9%), grade 1 in 134 patients (46%) and grade 2 in 70 patients (24.1%), with no difference between two study groups. Significant differences were observed between 3 stages of fibrosis in the value of platelets, prothrombin, cholesterol, GOT, GPT and GGT, which may translate into a higher degree of hepatic involvement. All patients started antiviral treatment after LB. At the end of follow-up, fibrosis progressed in 79 patients (27.1%), 120 patients (41.2%) remained the same and in 92 patients (31.6%) there was improvement. Rate of progression quantified by variation of METAVIR score per year was 0.091 + -0.11 in NR and -0.083 + -0.08 in RVS (P <0.0001). Patients with F0 presented lower fibrosis progression than F1 and F2 (P <0.0001). Overall probability of advanced fibrosis (F3 / 4) was 1.9% at 10 years and 27.6% at 20 years. In patients with and without SVR, was 0 and 10.2% (SVR) and 7.2 and 55.7% (NR), respectively (P <0.0001). Probability of cirrhosis was 1.5% and 22.6% at 10 and 20 years. There were also marked differences between patients who achieved SVR (0 and 5.8% at 10 and 20 years) and who not (9,8 y 50,5% in same periods) (P<0,0001). Probability of CHC during the global follow up was 1 and 9.8% at 10 and 20 years. Survival probability was 1 and 13.8% at 10 and 20 years, respectively. This Thesis has shown that patients without fibrosis in the initial BH have a smaller progression of fibrosis, and is almost null in those that reach RVS. TE allows an evaluation of the progression of fibrosis with an efficacy similar to LB. It has been observed that the retreatment of NR patients avoids the progression in those who reach SVR, whereas the probability of cirrhosis in patients NR to treatment and retreatment is 50% at 20 years. Current Thesis shows value of antiviral treatment and importance to achieve SVR.

Àfrica comprèn dues de les regions més riques en espècies vegetals del nostre planeta: la Regió Florística del Cap i la riba sud de la conca mediterrània. Aquest projecte de tesi doctoral pretén aportar nous coneixements sobre l’evolució de la biodiversitat d’Àfrica, la qual roman poc estudiada malgrat l’elevada riquesa d’espècies que presenta. Així mateix, el treball contribueix al millor coneixement dels processos evolutius de la flora de la riba sud de la mar Mediterrània, la qual ha estat molt menys investigada que la riba nord. En aquesta tesi hem estudiat els processos de diversificació que han tingut lloc al continent africà, així com els patrons de dispersió entre diferents regions d’Àfrica i àrees adjacents, amb especial èmfasi en els ambients àrids i mediterranis. Per abordar aquests objectius ens hem centrat en dues famílies de plantes vasculars, les campanulàcies i les geraniàcies. Aquestes famílies són presents a tots els continents excepte a l’Antàrtica, però els seus centres de distribució es troben principalment en les regions de clima mediterrani. Per tal d’obtenir una visió més completa dels processos de diversificació, colonització i adaptació d’aquestes espècies a Àfrica, hem investigat les dues famílies a escales macroevolutives i microevolutives. El nostre primer treball estudia la diversificació i la història biogeogràfica de les geraniàcies i investiga com l’evolució del tipus de fruit hauria facilitat l’expansió de Geraniaceae i la colonització de diferents ambients i regions biogeogràfiques. En el segon cas d’estudi, ens hem centrat en el gènere Monsonia, pertanyent a les geraniàcies, el qual és un grup quasi exclusivament africà adaptat a ambients mediterranis i àrids. En aquest treball, hem investigat com l’evolució del nínxol ecològic i de la morfologia podrien haver influït en la diversificació del gènere i en la seva història biogeogràfica. El tercer treball reconstrueix els orígens evolutius i la història biogeogràfica del grup Azorina, un llinatge de Campanula distribuït principalment a Àfrica i Macaronèsia. Aquest estudi ha tingut com a objectiu principal identificar els corredors biogeogràfics de dispersió a Àfrica a escala macroevolutiva, així com esbrinar quines zones haurien constituït refugis durant els períodes climàticament adversos. Finalment, el quart treball es centra també en el grup Azorina; en aquest cas hem realitzat un estudi a escala microevolutiva centrant-nos en el llinatge format per Campanula kremeri (distribuïda al nord d’Àfrica i al sud de la península Ibèrica) i Campanula occidentalis (endèmica de les illes Canàries) amb el propòsit d’investigar les connexions biogeogràfiques entre les flores d’aquestes regions en èpoques recents.<br>Africa harbours two of the richest regions in plant species of our planet: the Cape Floristic Region and the southern shore of the Mediterranean Sea. This PhD project aims to shed new light on the African biodiversity evolution, which remains poorly studied to date despite its high species richness. Moreover, this thesis contributes to a better understanding of the evolutionary processes that took place within the flora of the southern shore of the Mediterranean Sea, which has been much less investigated than the northern one. Specifically, we studied the diversification processes occurring within Africa, as well as the dispersal patterns between this continent and adjacent zones, with special emphasis on arid and Mediterranean biomes. In order to accomplish these objectives, we focused on two families of vascular plants, Campanulaceae and Geraniaceae. These families inhabit all the continents except Antarctica, but their distribution centres are located in the Mediterranean climatic regions. We investigated both families from a macroevolutionary and a microevolutionary point of view to gain understanding on the processes of diversification, colonisation and adaptation they experienced in Africa. Our first case study aimed to unravel the diversification and biogeographic history of the family Geraniaceae, and investigated how fruit evolution could have promoted the expansion of Geraniaceae to different environments and biogeographic regions. In the second case study, we focused on the genus Monsonia (Geraniaceae), which is an almost exclusively African lineage adapted to arid and Mediterranean environments. In this work, we investigated the evolution of the ecological niche and morphological traits that could have influenced the diversification of the genus and its biogeographic history. The third case study aimed to disentangle the evolutionary origins and the biogeographic history of the Azorina-group, a lineage of Campanula (Campanulaceae) mainly distributed in North Africa and Macaronesia. The main aim of this study was to identify the dispersal corridors within Africa at a macroevolutionary scale, and to unravel which areas constituted refugia during unfavourable climatic periods. Finally, we conducted a fourth work focusing also in the Azorina-group; in this case we conducted a microevolutionary study that zoomed in the lineage that comprises the species Campanula kremeri (distributed in north Africa and the south of the Iberian Peninsula) and Campanula occidentalis (endemic to the Canary islands) with the aim to investigate the biogeographic connections between the floras of these regions in recent times.

High-throughput sequencing technologies are allowing the description of genome-wide variation patterns for an ever-growing number of organisms. However, we still lack a thorough comprehension of the relative amount of different types of genetic variation, their phenotypic effects, and the detection and quantification of distinct selection regimes acting on genomes. The recent compilation of more than one thousand of worldwide wild-derived Drosophila melanogaster genome sequences reassembled using a standardized pipeline (Drosophila Genome Nexus, DGN, Lack et al. 2015, 2016) provides a unique resource to test molecular population genetics hypotheses, and ultimately understand the evolutionary dynamics of genetic variation in the populations. Besides, the increasing amount of genomic data available requires the continuous development and optimization of bioinformatics tools able to handle and analyze such information. Thus, the development and implementation of new biologically-oriented software addressing several steps from data acquisition, filtering, processing, display or analysis to the final reporting step is a constantly growing need, especially in fields dealing with large data sets, such as population genomics. This thesis is conceived as a comprehensive bioinformatics and population genomics project. It is centered in the development and application of bioinformatics tools for the analysis and visualization of nucleotide variation patterns and the detection of selective events in the genome of D. melanogaster, using the DGN data. The main goal is accomplished in three sequential steps: (i) capture the evolutionary properties of the analyzed sequences (i.e., create a catalog of population genetics metrics) and implement a tool for the graphical display of such information; (ii) develop a statistical package for the computation of the diverse selection regimes acting on genomes (positive and purifying selection), and finally (iii) perform an initial population genomics analysis in D. melanogaster using the previously developed tools. The common approach applied to process the data, starting at the assembly of genome sequences and ending up at the estimates of population genetics metrics, allows performing, for the first time, a comprehensive comparison and interpretation of results using samples from five continents. Overall, this work provides a global overview of the nucleotide variation and adaptation patterns along the genome, and a general assessment of the relative impact of the major genomic determinants of genetic variation, in Drosophila meta-populations with different geographical origin.

MicroRNAs (miRNAs) are major contributors to phenotypic diversity and have a demonstrated role in evolution. We performed an analysis on how miRNA nucleotide substitutions may have contributed to human divergence from their closest primate relatives. We first studied the functional implications of a substitution located in the seed region of mir-1304, reported to differ between present-day humans and Neandertals. We found a large change in the set of targets predicted for the two alleles, suggesting an important functional evolution for mir-1304. Among the few target genes predicted for the ancestral allele we found two genes involved in tooth development, ENAM and AMTN. Functional analysis revealed that these genes are differentially regulated by the two mir-1304 alleles suggesting that this change may have contributed to the modulation of phenotypic differences found between present-day humans and Neandertal dentitions. The thesis also offers a global view of the genetic diversification occurred in miRNA regions since the split of humans and chimpanzees. After careful alignment of all human miRNA sequences to chimpanzee and orangutan genomes, their substitution rates were calculated and compared between miRNA categories and with neutral sequences. Despite of the high conservation of these regulators, primate-specific miRNAs showed significantly higher substitution rates than more conserved miRNAs. This suggests that miRNA-driven evolution in primates could be partially sustained by mutation in novel, primate-specific miRNAs and that different miRNA categories show different evolutionary constraints and thus shall not be considered as an homogeneous group.<br>Los microRNAs (miRNA) contribuyen de manera importante a la diversidad fenotípica y tienen un papel demostrado en la evolución. En la presente tesis se realizaron análisis sobre la manera en que las sustituciones nucleotídicas en los miRNAs pudieran haber contribuido a la divergencia entre el humano y sus parientes primates más cercanos. Primero se estudiaron las implicaciones funcionales de un cambio localizado en la “seed-region” del mir-1304, que según se ha reportado difiere entre los humanos de hoy en día y los Neandertales. Al predecir los genes diana para estas dos versiones de mir-1304 encontramos un enorme cambio en número, lo que sugiere una importante evolución para mir-1304 a raíz de esta substitución nucleotídica. Entre los pocos genes diana previstos para el alelo ancestral, se encontraron dos genes implicados en el desarrollo de los dientes, ENAM y AMTN. Su análisis funcional reveló que estos genes pueden ser regulados diferencialmente por los dos alelos mir-1304, lo que sugiere que este cambio puede haber contribuido a la modulación de las diferencias fenotípicas encontradas entre las denticiones de los seres humanos de hoy en día y los Neandertales. La tesis también ofrece una visión global de la diversificación genética en las secuencias de miRNAs desde la separación de los seres humanos y los chimpancés. Después de alinear cuidadosamente todos los genes de miRNA humanos a los genomas del chimpancé y el orangután, se calcularon las tasas de substitución y se compararon agrupados por categorías y con respecto a referencias neutrales. En general se observó una alta conservación en estos reguladores, sin embargo los miRNAs primate-específicos mostraron significativamente más altas tasas de sustitución que los miRNAs más con una distribucion filogenética más amplia. Esto sugiere por una parte que la evolución impulsada por miRNAs en primates podría, al menos parcialmente, deberse a mutaciones en los miRNAs más jóvenes y específicos de los primates y por otro lado que los microRNAs no son una clase de reguladores homogénea sino que dentro de ella existen categorías sujetas a diferentes presiones evolutivas.

La brucelosis bovina es una enfermedad zoonótica, con una gran importancia en salud pública y también en el sector ganadero por las pérdidas económicas directas que ocasiona y sobre todo por las restricciones comerciales tanto a los animales infectados como a sus productos. Conocer el estatus sanitario de la enfermedad, su evolución en el tiempo y analizar los factores que influyen en su presentación, se consideran elementos útiles para la adecuada aplicación de medidas sanitarias en un país. En este sentido, se formularon cuatro estudios, cumpliendo con los objetivos planteados. El primer estudio pretendía analizar la evolución de la brucelosis bovina en el mundo Para ello se tomaron datos de 156 países miembros de la OIE en el periodo comprendido entre los años 1996 a 2014. Los países fueron clasificados en tres grupos en función de la situación sanitaria, a) Enzooticos: aquellos países donde la infección estuvo siempre presente o con breves periodos de ausencia (menores de tres años); y No-Enzooticos: aquellos países donde presentó uno o varios periodos de ausencia superiores a tres años y c) Libres: aquellos países donde la enfermedad estuvo ausente durante todo el periodo de estudio. Los países fueron comparados mediante los test no paramétricos de Kruskall-Wallis y de Mann-Whitney y el coeficiente de correlación de Spearman para dos variables cuantitativas. En el último caso, si la relación era significativa, se hizo un modelo de regresión lineal o cúbica para describir mejor la tendencia. Se encontró una relación entre el estatus de la enfermedad y la disponibilidad de recursos económicos, así países con un alto PIB per cápita tendían a estar libres de brucelosis bovina, países con un mayor censo bovino mostraron mayor probabilidad de tener la enfermedad presente. Las regiones más afectadas fueron Centro y Sur América, África y parte de Asia. Los siguientes trabajos se centraron en estudiar la epidemiología de la enfermedad en Colombia. El primero de ellos pretendía estimar la evolución del control de la brucelosis bovina en Colombia en un periodo de siete años (2006-2012). Se realizó un análisis univariado, posteriormente, se realizó un análisis de componentes principales para cada año separadamente. Los resultados indicaron que entre los años de estudio la prevalencia prácticamente no varió (las granjas pasaron de 22% a 23% y la de animales varió entre 4.7% y 4.6% para los años 2006 y 2012, respectivamente). Se definieron tres áreas diferenciadas de la enfermedad de acuerdo al estatus sanitario y la vigilancia. En el segundo estudio, se analizaron los movimientos de las especies animales domésticas de importancia económica en Colombia (bovinos, cerdos, equinos, caprinos y ovinos) durante un periodo de nueve años (2006-2014). Mediante un análisis de redes, se analizó la asociación entre la prevalencia de la enfermedad y el movimiento de animales en el país, posteriormente se desarrollaron un Modelo de Regresión Lineal Múltiple (MLR) y un ANOVA para analizar la relación entre la situación sanitaria y el movimiento de los animales. Los resultados indican el posible papel de los movimientos de équidos en la diseminación de la brucelosis. Finalmente, en el tercer estudio de Colombia, se pretendía identificar los factores de riesgo asociados a la reinfección por Brucella abortus en granjas bovinas de Colombia. Se hizo un estudio de caso-control donde se compararon 98 granjas caso (con reintroducción de la enfermedad) con 93 granjas control (sin reintroducción de la enfermedad). Se realizó un análisis bivariado y un modelo de regresión logística. El reemplazo de animales, la monta natural y el contacto con granjas infectadas o estatus sanitario desconocido, fueron factores que presentaron una relación altamente significativa con la re-infección de las granjas.<br>Bovine brucellosis is a zoonotic disease, with great importance in public health and in the livestock sector due to the direct economic losses it causes and, specially, due to the commercial restrictions for both the infected animals as well as their products. The knowledge of the health status of the disease, its evolution over time and the factors that influence its presentation is of great importance for the appropriate application of sanitary measures in a country. In this sense, four studies, fulfilling the proposed objectives, were formulated. The first study analyzes the evolution of bovine brucellosis in the world. Data were taken from 156 OIE member countries for the period between the years 1996 and 2014. The countries were classified into three groups according to their sanitary situation a) Enzootic: countries infected, which can have been free of brucellosis but for periods of less than 3 years. b) Non-enzootic: countries where the disease was present, but there was at least a 3-year period without the disease, and c) Free: countries where the disease remained absent during the whole period. The countries were compared by means of the Kruskall-Wallis and Mann-Whitney non-parametric tests, and the Spearman correlation coefficient for two quantitative variables. In this last case, if the relation was significant, a lineal or cubic regression model was made to better describe the tendency. A relationship was found between the status of the disease and the availability of economic resources; thus, countries with a high GDP per capita tended to be free from bovine brucellosis. Countries with a greater bovine census showed a greater probability to have the disease present. The most affected regions were Central and South America, Africa and parts of Asia. The next studies were focused on the epidemiology of the disease in Colombia. The first one intended to estimate the evolution of the bovine brucellosis control in Colombia over a seven years period (2006-2012). A univariate analysis was carried out, then a principal components analysis was performed for each year separately. The results indicated that, during the years of the study, prevalence remained practically unvaried (farms went from 22% to 23%, and animals varied between 4.7% and 4.6% between 2006 and 2012, respectively). Three different areas were defined according to brucellosis status and surveillance. In the second study, movements of the domestic animal species in Colombia (cattle and buffaloes, pigs, horses, goats and sheep) were analyzed over a period of nine years (2006-2014). The association between the disease prevalence and the animal movement was analyzed using a network analysis; subsequently, Multiple Linear Regressions (MLR) and ANOVA test were developed to analyze the relation between the health situation and the movement of animals. The results indicate the possible role of equine movements in the brucellosis spread between departments. Finally, the objective of the third study of Colombian data, was the identification of the risk factors associated with re-infection of Brucella abortus in cattle farms. A case-control study was performed in which 98 case-farms (herds were brucellosis was re-introduced) were compared to 93 control farms (without re-introduction of the disease). A bivariate analysis and a logistic regression model were done. The results indicated that the replacement animals, natural matting and contact with infected farms or with unknown sanitary status, were risk factors for the re-introduction of the disease.

Els gens estan sotmesos a forces selectives diferents. Un dels objectius de la Biologia Evolutiva és entendre els factors que determinen aquestes diferències. Els gens rarament actuen de manera aïllada, sinó que normalment funcionen com a elements de xarxes complexes formades per un gran nombre de molècules que interactuen entre si. Tot i la rellevància d’aquestes xarxes per entendre l’evolució dels gens, les propietats evolutives d’aquestes xarxes són encara poc conegudes. En aquesta tesi hem estudiat les forces selectives (selecció positiva i negativa) que han actuat sobre els gens implicats en la via de la insulina/TOR, i hem relacionat aquestes forces amb la posició dels gens a la via. Aquest estudi s’ha realitzat en 12 espècies del gènere Drosophila (primer article de la tesi), i en 6 espècies de vertebrats (humà, ratolí, vaca, opòssum, ornitorinc i pollastre) (segon article). A aquests efectes, s’han identificat i anotat els gens implicats a la via en totes les espècies estudiades, s’ha reconstruït la seva història evolutiva mitjançant tècniques d’anàlisi filogenètica, i s’han caracteritzat les forces evolutives que hi han actuat a partir de la relació la divergència no sinònima (dN) i sinònima (dS), ω = dN/dS. Totes les famílies gèniques estudiades tenen almenys un representant a totes les espècies estudiades. A més, tots els gens estudiats estan sotmesos a selecció purificadora, la qual cosa indica que aquests gens són funcionals. Per tant, tots els organismes estudiats presenten una via de la insulina/TOR completa i funcional. Tant a Drosophila com a vertebrats, observem que el nivell de limitació funcional (o selecció purificadora) sota el que evolucionen els gens es correlaciona amb la posició dels gens a la via (mesurada com el nombre de passos des del receptor de la insulina –posició 0– fins la resta de components –posicions 1 a 10), essent els gens de la part downstream els que evolucionen sota un major grau de limitació funcional. El sentit d’aquesta correlació és contrari al que s’ha trobat generalment en rutes metabòliques, on són els gens de la part upstream es que estan sotmesos a un major grau de limitació funcional. Vam avaluar l’impacte d’una sèrie de factors que es correlacionen amb ω (selecció positiva, nivell d’expressió gènica, nombre de teixits en què un gen s’expressa, grau d’esbiaix en l’ús de codons, longitud de les proteïnes codificades, i connectivitat en la xarxa d’interaccions proteïna-proteïna) sobre aquesta correlació. Aquesta anàlisi demostra que la correlació entre la posició a la via i els graus de limitació funcional és independent d’aquests factors. A més, observem que els gens que codifiquen proteïnes que interactuen físicament evolucionen sota seleccions selectives semblants, la qual cosa indica que aquestes proteïnes co-evolucionen. En global, aquests resultats indiquen clarament que els nivells de limitació funcional als què estan sotmesos els gens de la via de la insulina/TOR depenen de la posició que les proteïnes codificades ocupen a la via. Per tant, l’arquitectura de la via té un impacte sobre l’evolució dels seus gens.<br>Genes are subject to disparate evolutionary forces. One of the goals in Evolutionary Biology is to understand the factors underlying these differences. Genes rarely act in isolation, but they rather operate as elements of complex networks of interacting molecules. Despite the relevance of these networks for understanding gene evolution, the evolutionary properties of these networks remain poorly understood. In this thesis we have studied evolutionary forces (positive and negative selection) that acted on genes involved in the insulin/TOR pathway, and we have related these forces to the position that genes occupy in the pathway. This study has been performed in 12 species of the genus Drosophila, and in 6 vertebrate species. For that purpose, we have (1) identified and annotated the genes involved in this pathway in these species; (2) reconstructed their evolutionary history using phylogenetic analysis; and (3) characterized evolutionary forces that have acted on these genes from the nonsynonymous (dN) to synonymous (dS) divergence ratio (ω = dN/dS). All the studied gene families have at least one representative in all studied species. Furthermore, all studied genes evolve under purifying selection, indicating that they are functional. Therefore, all studied organisms have a complete and functional insulin/TOR pathway. In both Drosophila and vertebrates, we observed that the strength of purifying selection acting on genes correlates with their positions in the pathway, with downstream genes evolving under stronger selective constraint. We evaluated the impact of a number of factors (positive selection, gene expression level and breadth, codon bias, protein length, and connectivity in the protein-protein interaction network) on the observed correlation. This analysis shows that the correlation between pathway position and the strength of purifying selection is independent of these factors. Furthermore, we observed that genes encoding proteins that physically interact evolve under similar selective pressures, which indicates that these proteins co-evolve. Taken together, these results clearly indicate that levels of selective constraint acting on genes of the insulin/TOR pathway are affected by the position that their encoded products occupy in the pathway. Therefore, the structure of the pathway has an effect on the patterns of molecular evolution of its components.

Esta investigación se centra en el estudio de la evolución económica de Haití, con el objetivo de explicar los pobres resultados obtenidos por ese país durante el periodo 1915 – 1959. Para ello, ante la escasez de datos cuantitativos, el análisis que aquí presentamos parte del estudio del comercio exterior haitiano, considerando que la evolución de éste refleja la evolución y el desempeño económico del país. La tesis está organizada en tres capítulos. El primero está orientado a sustentar la metodología empleada y a evaluar la calidad de los datos de exportaciones e importaciones. A partir de ello buscamos trazar la trayectoria económica del país, identificando posibles etapas a partir de las fases de crecimiento, contracción o estancamiento del comercio y de los cambios en la estructura del comercio. El segundo capítulo analiza la primera de las etapas identificadas, que va de 1915 a 1940, enmarcada por la política de tutelaje que implementó Estados Unidos hacia Haití. La hemos considerado como de cambio por las reformas institucionales y el proceso de modernización emprendido por las autoridades de ocupación, pero también de continuidad, debido a las políticas económicas implementadas. El capítulo III aborda la que se puede considerar como la “época dorada” de Haití, que abarca de 1941 a 1959. Dicha etapa se caracterizó por el crecimiento del comercio exterior haitiano y, más importante, por el cambio que se aprecia en la estructura sectorial de las exportaciones en favor de los productos manufacturados. Lo que buscamos es determinar si ello se debe a un proceso de cambio en la estructura económica del país. Finalmente, se cierra esta tesis con un breve análisis de las principales conclusiones que del trabajo se derivan y con el establecimiento de la línea de investigación a seguir.<br>This research focuses on the study of the economic evolution of Haiti, aiming to explain its poor performance for the period 1915-1959. Given the scarcity of official economic indicators, this work uses foreign trade statistics to analyze the economic performance of the country which is justified because of the high dependency of Haitian economy on overseas markets. This thesis is organized in three chapters. The first one describes the methodology used to evaluate the quality of the data of imports and exports. This initial exercise allows us to identify the different phases of the Haitian economy and verify our hypotheses about the link with the phases of growth, contraction or stagnation of trade and the changes in its structure. In the second chapter we analyze the period from 1915 to 1940, characterized by the policies implemented by the US Trusteeship. From our perspective, this period was a “period of change” because of the introduction of institutional reforms but it was also a period of continuity with regards to the economic policy carried on by the American authorities. Chapter 3, analyses the period from 1941 to 1959, which can be considered as the “Golden Age” of the Haitian economy. This period is characterized by the growth of Haitian foreign trade and, more important, by the increase of manufactured goods in the local exports. Our main challenge is to determine if this change is related to a change in the industrial composition of the Haitian economy. Finally, this work ends with a summary of the conclusions derived from the analysis made in and setting up a new line of research to be followed in the future.

Se ha predicho teóreticamente que la epistasis, es decir, las interacciones genéticas entre diferentes mutaciones, cumple un rol sustancial en procesos evolutivos, tales como la emergencia de la reproducción sexual, la recombinación, la especiación y la evolución adaptativa. Sin embargo, existe poca evidencia experimental o estadística de la ubicuidad de las interacciones epistáticas en la naturaleza. Aquí, estudiamos la evolución de las proteínas a largo plazo, y demostramos que el modelo constante de selección independiente, no es capaz de describir las tasas y patrones de divergencia encontrados en las proteínas: las proteínas divergen mas allá de los límites teóricos y la tasa de divergencia es mucho mas lenta que la esperada. A su vez, demostramos que la evolución de las proteínas se explica mejor bajo la suposición de un intercambio rápido entre los valores de eficacia biológica asociados con aminoácidos individuales. Mas aún, extendemos nuestro estudio computacional y construimos un modelo teórico que captura el efecto de la selección inconstante sobre la evolución molecular.<br>Epistasis, or genetic interactions between different mutations, is theoretically predicted to play a substantial role in such evolutionary processes as emergence of sexual reproduction and recombination, speciation, adaptive evolution. However, there is little experimental or statistical evidence of the ubiquity of epistatic interactions in nature. Here, we study long-term protein evolution and show that the constant independent selection model cannot describe rates and patterns of protein divergence: protein sequences diverge beyond theoretical limits and the rate of divergence is much slower than predicted. We show that protein evolution is best explained under the assumption of rapid turnover of fitness values associated with individual amino acids. We further extend this computational study and build a theoretical model to capture the effect of non-constant selection on molecular evolution.

The mesoderm is the third germ layer, which is formed at gastrulation between the endoderm and the ectoderm in triploblastsc animals (Bilateria). The mesoderm differentiates into muscles, connective tissues and coelomic cavities. These structures have been key evolutionary innovations that prompted the enormous radiation of the bilaterians that at present make up for the 90% of animal species. As such, understanding the evolution of the mesoderm and its derivatives it is pivotal to understand the evolution of animals. In this thesis I have characterized the molecular patterning of the mesoderm and its derivatives (mainly muscles) in two different acoel species: Symsagittifera roscoffensis and Isodiametra pulchra. The acoels belong to the phylum Acoelomorpha (togheter with nemertodermatids and Xenoturbella). The phylogenetic placement of the Acoelomorpha is highly debated between a position basal to the bilaterians or nested inside the deuterostomes. The Acoelomorpha are morphologically simple animals and a trait sometimes considered a direct link to the cnidarians, the Bilateria sister group. With them they the acoelomorphs share a blind gut and a non centralized nervous system. Within the acoelomorphs, the acoels present the most derived body plan, however it is still rather simple if compared to other bilaterians. The nervous system for example is condensed anteriorly but not clear dorso ventral centralization exists as in most of the remaining bilaterians (the nerve cords are distributed circumferentially around the body). The mesoderm only develops from endodermal precursors, and this might be ancestral, since it is thought that the mesoderm evolved from the endoderm of a diploblastic, cnidarian-like ancestor. The muscles are the only mesodermal derivative in most basal acoelomorphs taxa, although in more advanced ones a parenchymal tissue, stem cells, and gonads also occupy the mesodermal space. The embryonic origins of the latter though, are at present still unknown. Thus acoelomorphs present most of traits considered to be eumetazoan ancestral traits (i.e. most of traits are also part of the cnidarians ground pattern), but still that the possibility that their body plan evolved in consequence of a secondary reduction must be considered as they could be more related to other deuterostomes than cnidarians. I have first investigated the molecular architecture of the muscles in the acoel Symsagittifera roscoffensis and found that although they have a smooth ultrastructural aspect they are molecularly more similar to the bilaterian striated muscles given that tey express key genes that control the contraction in the striated cells. This could be considered a first step into the evolution of the striated musculature without fully reaching it. Indeed, cnidarians have smooth epithelio muscular cells likely regulated by the same bilaterian smooth muscle proteins. However, the possibility of a secondary loss of the striation pattern cannot be discarded given that this already happened in some other bilaterians. Second, I have analyzed the expression of bilaterian mesodermal genes during embryogenesis and postembryonic development of Isodiametra pulchra and found that all but one (a FoxA ortholog) are expressed at the anterior pole, the site where the first myocytes start to differentiate. In juveniles and adults these genes are all expressed in muscles or at least a subset of them. Moreover the same genes are expressed in the gonads of I. pulchra and therefore it suggests that they could orginate in the endo-mesoderm of the worm. The cnidarians orthologues of these genes are expressed in the endoderm, which is moreover the site of the gametes differentation. The similarity between cnidarians endoderm and acoels mesoderm are astonishing, however before drawing conclusions we need a solid phylogenetic frame.<br>Los acelos son unos gusanos, principalmente marinos, de simetría bilateral y aplastados según el eje dorso ventral, que pertenecen al grupo de los acelomorfos (acelos +nemertodermatidos+xenoturbellidos), cuya posición filogenética es tema de debate entre los biólogos evolucionistas. Los acelomorfos carecen de cavidades corporales, su sistema digestivo es ciego y su sistema nervioso consiste de una concentración neuronal anterior y cuerda nerviosas no claramente desplazadas hacía el lado dorsal o ventral. La simplicidad morfológica de los acelos, entremedia entre la de cnidarios y bilaterales superiores, les hace buenos candidatos para el estudio de la transición de animales radiales-diploblastos a bilaterales-triploblastos. En esta tesis se presentan datos sobre el desarrollo e la especificación molecular del mesodermo, que ha sido una de las innovaciones claves para la radiación de los bilaterales. S. roscoffensis que como todos los acelos tiene exclusivamente musculatura de tipo liso, expresa un gen ortólogo a la troponina, un proteína clave para la regulación de los músculos estriados, y que no existe en cnidarios. La explicación más parsimoniosa es que las bases moleculares de evolución de músculos estriados se han implantado en los acelos, aunque estos no hayan alcanzado la condición completa (explicación favorecida si los acelomorfos son confirmados como grupo hermano de los demás bilaterales). Por otra parte se puede considerar esta condición como debida a una reducción secundaria (explicación favorecida en el caso que los acelos se confirmen ser deuteróstomos). Los ortólogos de genes endodermales de cnidarios y con clara expresión mesodermal en bilaterales se expresan en la músculatura del acelo l. pulchra. Estos datos concuerdan perfectamente con la evolución del mesodermo a partir del endodermo de animales diploblásticos. Aun así, es difícil proponer un modelo específico de evolución de miocitos hasta que la posición filogenética de los acelomorfos no esté resuelta.

A partir de 1985, després d'un procés agut d'inflació i recessió, Bolívia assoleix estabilitzar l'economia i aconsegueix taxes de creixement promig de 3% anual, la disciplina fiscal i l'estabilitat constitueixen la base de les polítiques macroeconòmiques de l'Estat. No obstant això, no s'ha assolit arribar a taxes de creixement econòmic i mecanismes de distribució suficients per a revertir les condicions de pobresa i desigualtat subsistents en el país.<br/>Des dels anys 90, l'Estat ve realitzant accions per a alleujar la pobresa establint un marc de polítiques que reconeixen la importància dels factors polític-institucionals i socials en el desenvolupament de Bolívia. Es van iniciar reformes socials en les àrees d'educació, salut i sanejament bàsic emmarcades en els processos de participació popular i descentralització administrativa. El resultat d'aquestes accions va ser l'increment de la inversió social, que entre altres aspectes, va permetre ampliar la infraestructura social bàsica.<br/>Després de més de 20 anys de democràcia i reformes estructurals, Bolívia ha assolit importants avanços per a consolidar la institucionalitat i estabilitat econòmica. No obstant això, el procés de canvi no ha finalitzat i es requereix aprofundir les accions a favor d'una major equitat que permeti reduir els elevats nivells de pobresa que prevalen especialment en l'àrea rural.<br/>D'igual manera, el baix perfil de les exportacions bolivianes configura al país com un dels més endarrerits d'Amèrica Llatina, degut al fet que la indústria extractiva participa amb més del 70% en el PIB. Així, l'oferta exportable de Bolívia s'encasella en provisions de matèria primera i productes de baix valor afegit. El baix grau tecnològic assolit, l'escàs desenvolupament de la infraestructura física, el progressiu deteriorament de les bases productives, entre altres factors, configuren un escenari en el qual Bolívia no arriba a produir béns i serveis que satisfacin els mercats internacionals, d'una banda, ni els seus ciutadans gaudeixin d'un nivell de vida que mostri un creixement sostenible. En altres paraules, Bolívia no assoleix ser competitiva.<br/>A més a més, el 90% dels nous llocs de treball en les ciutats capitals ha estat absorbit per la microempresa amb menys de 10 treballadors i prop del 95% dels empleats en l'àrea rural. Aquest patró d'ocupació mostra que un important sector econòmic del país és caracteritzat per condicions precàries de treball, baixa productivitat i ocupacions informals. Avui, prop del 83% de la població ocupada treballa en microempreses però contribueix només amb un 24% del PIB.<br/>Per això, és urgent ampliar la base econòmica, per a això es necessita multiplicar nous actors competitius i diversificar els tipus de producte dintre d'un nou escenari d'inserció internacional, que articuli la plataforma exportadora amb l'economia popular i redistribueixi l'excedent, la producció i la riquesa de manera més equitativa.<br/>Aquest treball d'investigació parteix de les insuficiències econòmiques, però acaba parlant de la transformació social, cultural i política que pot acompanyar la transformació econòmica, més enllà de les riqueses i promeses que comporta l'explotació dels recursos naturals.<br>A partir de 1985, después de un proceso agudo de inflación y recesión, Bolivia logra estabilizar la economía y consigue tasas de crecimiento promedio de 3% anual, la disciplina fiscal y la estabilidad se constituyen en la base de las políticas macroeconómicas del Estado. Sin embargo, no se ha logrado alcanzar tasas de crecimiento económico y mecanismos de distribución suficientes para revertir las condiciones de pobreza y desigualdad subsistentes en el país.<br/>Desde los años 90, el Estado viene realizando acciones para aliviar la pobreza estableciendo un marco de políticas que reconocen la importancia de los factores político-institucionales y sociales en el desarrollo de Bolivia. Se iniciaron reformas sociales en las áreas de educación, salud y saneamiento básico enmarcadas en los procesos de participación popular y descentralización administrativa. El resultado de estas acciones fue el incremento de la inversión social, que entre otros aspectos, permitió ampliar la infraestructura social básica.<br/>Después de más de 20 años de democracia y reformas estructurales, Bolivia ha logrado importantes avances para consolidar la institucionalidad y estabilidad económica. Sin embargo, el proceso de cambio no ha finalizado y se requiere profundizar las acciones a favor de una mayor equidad que permita reducir los elevados niveles de pobreza que prevalecen especialmente en el área rural.<br/>De igual manera, el bajo perfil de las exportaciones bolivianas configura al país como uno de los más atrasados de América Latina, debido a que la industria extractiva participa con más del 70% en el PIB. Así, la oferta exportable de Bolivia se encasilla en provisiones de materia prima y productos de bajo valor añadido. El bajo grado tecnológico alcanzado, el escaso desarrollo de la infraestructura física, el progresivo deterioro de las bases productivas, entre otros factores, configuran un escenario en el que Bolivia no alcanza a producir bienes y servicios que satisfagan los mercados internacionales, por un lado, ni sus ciudadanos disfruten de un nivel de vida que muestre un crecimiento sostenible. En otras palabras, Bolivia no logra ser competitiva.<br/>A su vez, el 90% de los nuevos puestos de trabajo en las ciudades capitales ha sido absorbido por la microempresa con menos de 10 trabajadores y cerca del 95% de los empleados en el área rural. Este patrón de empleo muestra que un importante sector económico del país es caracterizado por condiciones precarias de trabajo, baja productividad y empleos informales. Hoy, cerca del 83% de la población ocupada trabaja en microempresas pero contribuye sólo con un 24% del PIB.<br/>Por ello, es urgente ampliar la base económica, para lo cual se necesita multiplicar nuevos actores competitivos y diversificar rubros productivos dentro de un nuevo escenario de inserción internacional, que articule la plataforma exportadora con la economía popular y redistribuya el excedente, la producción y la riqueza de manera más equitativa.<br/>Este trabajo de investigación parte de las insuficiencias económicas, pero termina hablando de la transformación social, cultural y política que debe y puede acompañar la transformación económica, más allá de las riquezas y promesas que encierra la explotación de los recursos naturales.<br>After an acute process of inflation and recession in the previous years of 1985, Bolivia managed a political economy in order to stabilize the economy and to obtain a rate of 3% annual average GDP growth. The fiscal discipline and the stability constituted two major goals of the macroeconomic policies. However, these policies have not allow for enough rates of growth in order to reduce rates of poverty and inequality in the country. <br/>From the 90's, Bolivia has been striving battles to alleviate the poverty by establishing a frame of policies that recognize the importance of the political-institutional and social factors in the development of Bolivia. Social reforms in the education areas, and health started within the framework of popular participation as well as administrative decentralization. The result of these actions was the increase of the social investment, which among other aspects allowed to extent some basic social services. <br/>After more than 20 years of structural democracy and reforms, Bolivia has managed important advances to consolidate institutionalism and economic stability. Nevertheless, the change process has not finalised and it is required to deepen the actions in favour of a greater fairness than it allows, reducing the high levels of poverty that prevail especially in the rural area. <br/>The low profile of the Bolivian exports is one of the lowest in Latin America, because the extractive industry participates with more than 70% in total exports. Thus the exportable supply of Bolivia is focused mainly in raw materials and basic products of low added value. The low technological level, the low development of the physical infrastructure, the progressive deterioration of the productive bases, among other factors, explain why Bolivia does not produce goods and services that satisfy the international markets. On the other hand, its citizens can not enjoy a standard of life according to a sustainable growth. <br/>The 90% of the new jobs in the capital cities have been absorbed by micro-companies with less than 10 employees and nearly 95% of the country's workforce is in the rural area. This tendency is characterized by precarious conditions of work, low productivity and informal employment. Today, almost 83% of the occupied population works in micro-companies but only contribute to 24% of the GDP. <br/>For this reason, it is urgent to extend the economic base, for which it is needed to multiply new competitive performers and diversify the economic structure oriented to be more competitive in international markets and allow to reach a reduction of poverty <br/>This research work leaves from the economic insufficiencies, but it ends up speaking of the social, cultural and political transformation that must and can accompany the economic transformation, beyond the wealth and promises from natural resources.

Molts trastorns del moviment observats en pacients esquizofrènics passen desapercebuts, especialment els de lleu o moderada intensitat o bé els associats amb anosognosia. El valor dels moviments extrapiramidals i específicament de la discinèsia i el parkinsonisme com a factor pronòstic en l'esquizofrènia no és ben conegut. En aquest estudi prospectiu, s'estudia la relació de la discinèsia i altres símptomes extrapiramidals amb l'evolució a un any del trastorn en una cohort de 112 pacients en el seu primer episodi de l'espectre esquizofrènic tractat amb antipsicòtics de segona generació. Els resultats van mostrar que en el model ajustat de regressió lineal, la resposta primerenca al tractament (p = 0.001), l'abús d'alcohol (p = 0.026), el nivell ocupacional més alt aconseguit (p = 0.031), l'edat d'inici més primerenca (p = 0.033), els moviments discinéticos durant les primeres vint i cuatre setmanes (p = 0.034) i el sexe femení (p = 0.039), però no les primeres vuit setmanes de Parkinsonismo, com a variables significatives (R² ajustat 0.416). La direcció de l’associació de les discinèsies amb la severitat de la malatia fou negativa. Trenta-dos pacients van mostrar discinèsia en les primeres vint setmanes i sis pacients van ser diagnosticats com discinèsia tardana durant el seguiment de l'estudi (5.3% de 112 pacients en la mostra inicial, 8.3% dels 72 pacients que van completar el seguiment). Es postula el potencial dels primers moviments discinéticos com una finestra del sistema dopaminèrgic en l'esquizofrènia<br>Muchos trastornos del movimiento observadas en pacientes esquizofrénicos pasan desapercibidas, especialmente las de leve o moderada intensidad o bien las asociadas con anosognosia. El valor de los movimientos extrapiramidales y específicamente de la discinesia y el parkinsonismo como factor pronóstico en la esquizofrenia no es bien conocido. En este estudio prospectivo, se estudia la relación de la discinesia y otros síntomas extrapiramidales con la evolución a un año del trastorno en una cohorte de 112 pacientes en su primer episodio del espectro esquizofrenico tratado con antipsicóticos de segunda generación. Los resultados mostraron que en el modelo ajustado de regresión lineal la respuesta temprana al tratamiento (p = 0.001), el abuso de alcohol (p = 0.026), el nivel ocupacional más alto alcanzado (p = 0.031), la edad de inicio más temprana (p = 0.033) , los movimientos discinéticos durante las primeras veinticuatro semanas (p = 0.034) y el sexo femenino (p = 0.039), pero no las primeras ocho semanas de Parkinsonismo, como variables significativas (R² ajustado 0.416). La dirección de la asociación de les discinèsies con la severidad de la enfermedad fué negativa. Treinta y dos pacientes mostraron discinesia en las primeras veinticuatro semanas y seis pacientes fueron diagnosticados como discinesia tardía durante el seguimiento del estudio (5.3% de 112 pacientes en la muestra inicial, 8.3% de los 72 pacientes que completaron el seguimiento). Se postula el potencial de los primeros movimientos discinéticos como una ventana del sistema dopaminérgico en la esquizofrenia.<br>Many movement abnormalities observed in schizophrenic patients are neglected, especially those in mild and moderate forms or associated to anosognosia. The role of extrapyramidal movements and specifically dyskinesia and Parkinsonism as prognostic factor in schizophrenia is not well known. In this prospective work the relationship of dyskinesia and other extrapyramidal symptoms with one-year psychiatric outcome was studied in a cohort of 112 patients suffering from First Episode of Schizophrenia Spectrum disorder and treated with Second Generation Antipsychotics. Results showed that, linear regression model of outcome fitted early response (p= 0.001), abuse of alcohol (p= 0.026), higher occupational level reached (p= 0.031), younger age at onset (p= 0.033), dyskinetic movements during the first twenty-four week (p= 0.034) and female sex (p= 0.039), but not first eight weeks Parkinsonism, as significant variables (adjusted R² 0,416). Direction of the association of dyskinesia with severity of illness was negative. Thirty-two patients showed dyskinesia in the first twenty-four weeks and six patients were diagnosed as Tardive Dyskinesia during the follow-up of the study (5.3% out of 112 patients in the initial sample, 8.3% out of the 72 patients that complete the follow-up. The potential role of early dyskinetic movements as a window of the dopaminergic system in schizophrenia is postulated.

La pregunta por el origen, sentido y finalidad del Derecho nos conduce ineludiblemente hacia la búsqueda de los fundamentos naturales y neurobiológicos de la conducta humana. Las normas jurídicas (y morales) existen sólo porque el hombre, como el paradigma de las especies culturales, establece relaciones sociales. El ser humano como presupuesto, fundamento y sujeto de todo ordenamiento jurídico, político y moral está orientado hacia el reconocimiento, respeto y protección de sus derechos. La relación entre Derecho, Moral, Modelos evolucionistas y Neurociencia forma parte de una de las problemáticas más controvertidas, complejas y sugerentes de la Filosofía Política y Jurídica contemporánea. Sin lugar a dudas, la importancia de los modelos evolucionistas y neurobiológicos desborda otros conocimientos y disciplinas porque manifiesta la pregunta por el ser del hombre, hacia su esencia y su status en el reino de la naturaleza, es decir, del ser humano considerado simultáneamente como un ser biológico, cultural, psicológico y social. Una filosofía o ciencia jurídica desarrollada a partir de un enfoque naturalista permite enfrentarse, de forma real y factible, a la evidencia de que la naturaleza humana no sólo genera y limita las condiciones de posibilidad de nuestras sociedades sino que guía y pone límites al conjunto institucional y normativo que regula las relaciones sociales. Comprender mejor nuestro pasado evolutivo podría sentar las bases para un sistema viable con sentido, para un Derecho que proporcione orden y propósito a nuestras vidas en el futuro.

CHAPTER 1: Reconstructing ancient Mediterranean crossroads in Deronectes diving beetles Aim: To reconstruct the evolutionary history of a genus of freshwater beetle with a pan- Mediterranean distribution, to test classic hypotheses which proposed a Miocene origin for groups with high biodiversity in the Iberian and Anatolian peninsulas. Location: Mediterranean basin. Methods: We sequenced four mitochondrial and one nuclear gene from 51 specimens of 30 of the c. 60 extant species of Deronectes (Dytiscidae), all typical of mid-mountain streams from North Africa and Iberia over most of Europe to the Middle East. We used maximum likelihood, Bayesian probabilities with an a priori evolutionary rate and a dispersal–extinction–cladogenesis model to reconstruct their biogeographical history. Results: Deronectes has two major lineages which originated in the mid Miocene; one including mostly eastern and another mainly western and central Mediterranean species. From these two areas, range expansions, mainly at the end of the Miocene and beginning of the Pliocene, resulted in the many species groups and some of the extant species of the genus. Most of the current diversity and distributions are, however, of Plio-Pleistocene origin, particularly in widespread European species. Main conclusions: In line with traditional hypotheses, we found an ancient division between eastern and western Mediterranean lineages of Deronectes, likely resulting from the isolation of Europe west of the Alps from the Balkans and Anatolia during the early-middle Miocene. The history of the genus was strongly influenced by major geological and climatic events, with successive cycles of fragmentation and subsequent eastward and westward range expansions, resulting in a steady accumulation of species across the basin. Most of these range movements took place through the north side of the Mediterranean, with only local displacements in the south during the Messinian salinity crisis and a recent (Pleistocene) colonization of the Italian Peninsula, which remained largely submerged through most of the genus’ evolutionary history. CHAPTER 2: The origin of widespread species in a poor dispersing lineage (diving beetle genus Deronectes) In most lineages most species have restricted geographic ranges, with only few reaching widespread distributions. How these widespread species reached their current ranges is an intriguing biogeographic and evolutionary question, especially in groups known to be poor dispersers. We reconstructed the biogeographic and temporal origin of the widespread species in a lineage with particularly poor dispersal capabilities, the diving beetle genus Deronectes (Dytiscidae). Most of the ca. 60 described species of Deronectes have narrow ranges in the Mediterranean area, with only four species with widespread European distributions. We sequenced four mitochondrial and two nuclear genes of 297 specimens of 109 different populations of the four lineages of Deronectes including widespread species, together with their closest narrow range relatives, covering their entire distributions. Using Bayesian probabilities with an a priori evolutionary rate we performed (1) a global phylogeny/phylogeography to estimate the relationships of the main lineages within each group and root them, and (2) demographic analyses of the best population coalescent model for each species group, including a reconstruction of the geographical history estimated from the distribution of the sampled localities. We also selected 56 specimens to test for the presence of Wolbachia, a maternally transmitted parasite that can alter the patterns of mtDNA variability. All species of the four studied groups originated in the southern Mediterranean peninsulas and were estimated to be of Pleistocene origin. In three of the four widespread species the central and northern European populations were nested within those in the northern areas of the Anatolian, Balkan and Iberian peninsulas respectively, suggesting a range expansion at the edge of the southern refugia. In the Mediterranean peninsulas the widespread European species were replaced by vicariant taxa of recent origin. The fourth species (D. moestus) was proven to be a composite of unrecognised lineages with more restricted distributions around the Western and Central Mediterranean. The analysis of Wolbachia showed a high prevalence of infection among Deronectes, especially in the D. aubei group, where all sequenced populations were infected with the only exception of the Cantabrian Mountains, the westernmost area of distribution of the lineage. In this group there is a phylogenetic incongruence between the mitochondrial and the nuclear sequence, although not clear pattern links this discordance to the Wolbachia infection. Our results suggest that in different glacial cycles populations that happened to be at the edge of the newly deglaciated areas took advantage of the optimal ecological conditions to expand their ranges to central and northern Europe. Once this favourable ecological window ended populations become isolated, resulting in the presence of closely related but distinct species in the Mediterranean peninsulas. CHAPTER 3: Pleistocene range expansions in Western Palaearctic aquatic Coleoptera The Quaternary glacial cycles lead to large changes in the size and location of the geographic distribution of many species. During glacial maxima large areas of central and northern Europe become inhospitable to temperate species, which are generally assumed to have been recolonized by range expansions from Mediterranean refugia in the interglacials. An alternative possibility is that the recolonization was from non-Mediterranean sources, from glacial refugia in central Europe or western Asia, but data are still scarce concerning the origin of the central and north European species with very large geographic distributions, especially for insects. In this work we studied some species of three wide distributed lineages of freshwater beetles (Platambus maculatus complex, H. gracilis complex, and the genus Oreodytes), all typical of running waters and including both narrowly distributed southern endemics and widespread European species, some with distributions spanning the whole Palearctic. The main goal was to understand the role of the Pleistocene glaciations in the diversification and current distribution of these species. For this we sequenced four mitochondrial and two nuclear genes of 212 specimens of 107 different populations of the different lineages and used Bayesian probabilities and Maximum Likelihood to reconstruct the phylogenetic relationships, age and geographical origin of the western Palaearctic species of these three widely distributed lineages. All species of the three studied groups were estimated to be of Pleistocene origin. In the H. gracilis complex, a secondary fast range expansion from northern Anatolian populations to western and northern Europe resulted in the current widespread European H. gracilis. However, in the other two groups we found widespread central and northern European species the origin of which was not the Mediterranean area but central Asia, but with peripheral isolated forms in the southern Mediterranean peninsulas. These peripheral forms could have been confined as remnants of earlier diversification cycles or be result of incipient isolation of the most recent post-glacial expansion. The accumulation of narrow endemics of these lineages in the Mediterranean may thus be the result of successive cycles of range expansions with subsequent speciation (and local extinction in glaciated areas) through the multiple Pleistocene glacial cycles. CHAPTER 4: Range expansion and ancestral niche reconstruction in the Mediterranean diving beetle genus Meladema (Coleoptera, Dytiscidae) Species of the genus Meladema (Dytiscidae, Colymbetinae) are some of the largest macroinvertebrates in the western Palearctic region, being top predators in fishless streams. Two of the three described species, M. imbricata (Wollaston, 1871) and M. lanio (Fabricius, 1775) are Macaronesian endemics from the Canary Islands and Madeira respectively, while the third, M. coriacea Laporte, 1835, is widely distributed from Morocco and the Iberian Peninsula to Turkey, including the Canary Islands. Previous phylogenetic analysis using only mitochondrial markers revealed the existence of two cryptic lineages within M. coriacea, one restricted to Corsica and the other including the rest of sampled populations. We reconstruct here the evolutionary history of the species of Meladema using a more comprehensive sampling covering its whole geographical range, adding nuclear markers and Bayesian molecular dating. Using environmental niche modelling we test for possible differences in climatic preferences among lineages, and reconstruct their ancestral climatic niche. Our results strongly supported the existence of four monophyletic lineages represented by the three recognised species plus a fourth cryptic lineage with populations of M. coriacea from the Tyrrhenian islands (Corsica, Sardinia and Montecristo). This pattern is not likely to be the result of mitochondrial artefacts due to Wolbachia infection, as all 11 tested individuals were negative for this parasite. Dating analysis placed the origin of Meladema in the Middle Miocene although diversification among extant Meladema lineages started in the early Pleistocene and took place in a relatively short time period. Phylogeographic analysis inferred a continental origin of Meladema, with an independent colonization of the Macaronesian and Mediterranean islands. From the southwestern Mediterranean region the continental M. coriacea expanded its range up to Turkey in the northern basin, and to Tunisia in the southern. Results of niche modelling showed that seasonality is the critical factor in shaping the current distribution of Meladema. Island lineages (M. imbricata, M. lanio and the Thyrrenian lineage of M. coriacea) occur in sites with low seasonality, within the range of the reconstructed ancestral climatic niche of the genus. On the contrary, continental M. coriacea expanded its range to localities outside the ancestral climatic range of the genus, with a higher seasonality and aridity.<br>Una pregunta básica sobre los rangos geográficos es comprender por qué unas especies están ampliamente distribuidas mientras otras, estrechamente emparentadas tienen distribuciones restringidas. En este estudio pretendo comprender los factores que llevaron a algunas especies a expandir su rango original y sugerir posibles hipótesis que expliquen las enormes diferencias de rango entre especies emparentadas. Para ello, reconstruyo la historia evolutiva de varios linajes de coleópteros acuáticos del Paleártico Occidental bajo el contexto de la compleja historia geológica y climática de este área, con el fin de aclarar los procesos que han contribuido a la actual distribución de especies en estos grupos. Estos linajes son típicos de aguas corrientes (es decir, con baja capacidad dispersiva) e incluyen tanto endemismos distribuidos en pequeñas áreas, como especies de amplia distribución, mostrando su potencial de expansión de rango. Las reconstrucciones biogeográficas llevadas a cabo sugieren la existencia de varios eventos de expansión de rango entre la zona oriental y occidental de la Cuenca Mediterránea bajo condiciones favorables, seguidos de fragmentación cuando las condiciones empeoraban. Estas expansiones debieron producirse principalmente a lo largo de la costa norte del Mediterráneo, ya que por la sur hay ausencia de especies al este de Túnez. A pesar de que no es posible establecer un origen temporal común para los grupos estudiados, el Mioceno con sus múltiples conexiones entre el Mediterráneo occidental y oriental seguidas de aislamiento, parece estar implicado en el origen y disyunción este-oeste en varios grupos. Sin embargo, la mayor parte de las especies actuales se originaron durante el Pleistoceno, incluyendo aquellas que han alcanzado amplias distribuciones, siendo por tanto la época mas influyente en la distribución actual de especies. Las sucesivas rondas de expansión y fragmentación de rango resultaron principalmente en la acumulación de especies restringidas en el área Mediterránea, especialmente en Anatolia y la Península Ibérica. A pesar de la evidencia en muchos casos de especiación con estabilidad de rango dentro del área Mediterránea, algunas especies lograron expandir su rango original hasta alcanzar amplias distribuciones en áreas mas al norte, probablemente aprovechando una posición geográfica ventajosa cuando las condiciones ambientales fueron ventajosas. No obstante, diferencias en tolerancia fisiológica y/o ecológica también pudieron favorecer las expansiones de rango en unas especies y limitarlo en otras, aunque futuras investigaciones experimentales se requieren para poder testar esta hipótesis.

Many evolutionary processes are influenced by spatio-temporal environmental variation, including speciation, genetic divergence among populations, and evolutionary change in physiology, morphology and behaviour. However, despite the extensive environmental data available from Geographic Information Systems (GIS) most evolutionary biologists and conservationists have not taken advantage of this data until recently. The general objective of this thesis was to integrate and expand the use of geospatial methods in evolutionary biology (biogeography, phylogeography and systematics) and conservation research. This general objective was accomplished through three specific objectives spread over six chapters, which compromised both methodological developments and their application in a series of case studies on Western Palearctic herpetofauna. This thesis explored and successfully used a number of promising new geospatial methods in combination with more traditional molecular analyses. Such integrative approaches will ultimately allow us to better consider and examine the range of potential histories underlying both inter and intraspecific divergence patterns.<br>Molts processos evolutius estan influïts per variació ambiental-, incloent l’especiació, espai-temporal, divergència genètica entre poblacions, així com el canvi evolutiu en fisiologia, morfologia i comportament. No obstant això, malgrat l'àmplia quantitat de dades ambientals disponibles en els Sistemes d'Informació Geogràfica (SIG), la majoria dels biòlegs i conservacionistes no han aprofitat aquestes dades fins fa poc. L'objectiu general d'aquesta tesi és integrar i ampliar l'ús de mètodes geoespacials en biologia evolutiva (biogeografia, filogeografia i sistemàtica) i recerca de conservació. Aquest objectiu general es va aconseguir a través de tres objectius específics dividits en 6 capítols, els quals inclouen tant un desenvolupament metodològic i la seva aplicació en una sèrie de casos d'estudi espaciotemporals de herpetofauna paleárctica occidental. Aquesta tesi explora i utilitza de manera reeixida nous mètodes geoespacials en combinació amb anàlisis moleculars tradicionals. Aquests enfocament combinats ens permeten avaluar i examinar de millor manera les diverses possibles històries que hi ha al darrere patrons divergents inter i intraespecífics.<br>Muchos procesos evolutivos están influidos por variación ambiental espaciotemporal, incluyendo la especiación, divergencia genética entre poblaciones, así como el cambio evolutivo en fisiología, morfología y comportamiento. Sin embargo, a pesar de la amplia cantidad de datos ambientales disponibles en los Sistemas de Información Geográfica (SIG), la mayoría de los biólogos y conservacionistas no han aprovechado estos datos sino hasta hace poco. El objetivo general de esta tesis es integrar y ampliar el uso de métodos geoespaciales en biología evolutiva (biogeografía, filogeografía y sistemática) e investigación de conservación. Este objetivo general se logró a través de tres objetivos específicos divididos en 6 capítulos, los cuales incluyen tanto un desarrollo metodológico y su aplicación en una serie de casos de estudio espaciotemporales de herpetofauna paleárctica occidental. Esta tesis explora y utiliza de manera éxitosa nuevos métodos geoespaciales en combinación con análisis moleculares tradicionales. Estos enfoque combinados nos permiten evaluar y examinar de mejor manera las diversas posibles historias que subyacen en patrones divergentes inter e intraespecíficos.

L'objectiu d'aquesta tesi és comprendre com i per què les destinacions turístiques es transformen amb el temps, tot posant especial atenció a l’estudi de les dinàmiques del lloc en el seu conjunt en comptes de simplificar l’anàlisi a l'evolució de l'activitat turística, una de les discussions predominants entorn dels models evolutius tradicionals. Amb aquesta finalitat, es desenvolupa un model analític inspirat en avenços contemporanis en el camp de la geografia econòmica, més concretament, en l’àmbit de la geografia econòmica evolutiva (EEG) i la geografia econòmica relacional (REG). Des d’aquest enfocament, l'evolució de les destinacions es concep com un procés complex i en continu canvi que està influenciat per les característiques específiques i la interacció de múltiples forces en termes d'agència (human agency), contextualitat (contextuality) i dependència de la trajectòria (path dependence). Tot centrant l'anàlisi empíric en els catalitzadors específics que van tenir incidència en la definició de la trajectòria evolutiva de la Costa Daurada centre des de la dècada de 1980, la investigació s’orienta, en primer lloc, a estudiar els efectes de la interacció dels actors i els fluxos de coneixement en el comportament evolutiu de les destinacions (human agency). En segon lloc, la capacitat d'adaptació de les destinacions davant les dinàmiques de canvi local i global (contextuality). En tercer lloc, els efectes positius i negatius a llarg termini que es deriven de les decisions i esdeveniments ocorreguts en el passat (path dependence).<br>El objetivo de esta tesis es comprender cómo y por qué los destinos turísticos se transforman con el tiempo, poniendo especial atención al estudio de las dinámicas del lugar en su conjunto en vez de simplificar el análisis a la evolución de la actividad turística, una de las discusiones predominantes en torno a los modelos evolutivos tradicionales. Con este fin, se desarrolla un modelo analítico inspirado en avances contemporáneos en el campo de la geografía económica, más concretamente, en el ámbito de la geografía económica evolutiva (EEG) y la geografía económica relacional (REG). Desde este enfoque, la evolución de los destinos se concibe como un proceso complejo y en continuo cambio que está influenciado por las características específicas y la interacción de múltiples fuerzas en términos de agencia (human agency), contextualidad (contextuality) y dependencia de la trayectoria (path dependence). Centrando el análisis empírico en los catalizadores específicos que tuvieron incidencia en la definición de la trayectoria evolutiva de la Costa Dorada centro desde la década de 1980, la investigación se orienta, en primer lugar, a estudiar los efectos de la interacción los actores y los flujos de conocimiento en el comportamiento evolutivo de los destinos (human agency). En segundo lugar, la capacidad de adaptación de los destinos ante las dinámicas de cambio local y global (contextuality). En tercer lugar, los efectos positivos y negativos a largo plazo que se derivan de las decisiones y acontecimientos ocurridos en el pasado (path dependence).<br>The aim of this thesis is to understand how and why destinations change over time, putting attention to the dynamics of place instead of the evolution of tourism activity, one of the prevalent discussions around traditional evolutionary models. To achieve this, it develops an analytical model drawing inspiration on contemporary advances in economic geography – i.e. evolutionary economic geography (EEG) and relational economic geography (REG). From such an approach destination evolution is conceived as a complex ongoing process shaped by the specific characteristics and interplay of multiple forces in terms of human agency, contextuality and path dependence. By focusing on the analysis of specific catalysts that shaped the evolutionary trajectory of central Costa Daurada (Catalonia) since the 1980s, the exploratory research conducted studies, first, the effects of stakeholders’ interaction and knowledge flows on the evolutionary performance of destinations (human agency). Second, the adaptive capacity of destinations in front of dynamics of local and global change (contextuality). And third, the enabling and constraining long-term effects of decisions and events occurred in the past (path dependence). The methodological design of the empirical research comprises a combination of qualitative – interviews and documentary analysis – and quantitative – social network analysis – techniques.

L’origen de la multicel·lularitat en animals és un esdeveniment clau en l’evolució que vingué acompanyat de canvis profunds en els genomes, la biologia cel·lular i el desenvolupament dels ancestres unicel·lulars dels animals. En aquesta tesi analitzo l’origen dels animals mitjançant genòmica comprada i filogenòmica, amb l’objectiu de reconstruir les innovacions que sustentaren la transició a la multicel·lularitat mitjançant anàlisis de genomes animals i els seus parents unicel·lulars dins del llinatge Holoza. Els nostres anàlisis filogenòmics han establert quatre clades d’holozous: Teretosporea (Corallochytrium limacisporum i protistes ictiosporis), Filasterea (2 amebes, incloent-hi Capsaspora owczarzaki) i Choanoflagellata (protistes flagel·lats, ocasionalment colonials), a banda dels metazous multicel·lulars. Aquest marc filogenètic ens ha permès d’explotar la genòmica comparada per tal d’assenyalar els canvis genòmics concrets que ocorregueren a l’origen dels Metazoa. Hem reconstruït el contingut gènic ancestral de la via de senyalització de l’ubiquitina— famílies gèniques involucrades en el marcatge post-traduccional de proteïnes—, les miosines i factors de transcripció homeobox. Aquests anàlisis revelen un estat continuat d’innovació en aquests sets gènics, mitjançant origen de gens de novo, diversificació de dominis proteics i paralogia – la qual cosa suggereix que l’Urmetazoa fou un organisme genèticament complex i que la coopció de gens jugà un paper clau en l’origen de la multicel·lularitat. En segon lloc, vàrem examinar l’evolució de l’arquitectura genòmica en els premetazous. Hem seqüenciat i analitzat els genomes de 6 ictiosporis (Creolimax fragrantissima, Chromosphaera perkinsii, Sphaeroforma arctica, Ichthyophonus hoferi, Abeoforma whisleri i Pirum gemmata) i C. limacisporum; i els hem comparat als altres holozous unicel·lulars (C. Owczarzaki i els coanoflagel·lats) i als animals. Anteriorment, s’havia establert l’origen premetazou de diversos gens amb funcions en la multicel·lularitat, com per exemple factors de transcripció relacionats amb el desenvolupament, o proteïnes d’adhesió cel·lular. En aquest estudi, expandim anteriors resultats i demostrem que l’arquitectura genòmica també passà per importants innovacions evolutives: a banda de la invenció i diversificació gènica a l’origen dels holozous, identifiquem processos de disrupció i establiment de sintènia, guany d’introns i expansions genòmiques en els llinatges uni i multicel·lulars. Finalment, correlacionem l’evolució de l’estructura gènica amb els modes de splicing alternatiu presents en animals i eucariotes. Identifiquem un codi de determinació dels patrons de splicing alternatiu que afecta la freqüència d’ús d’exons-casette, a la manera típica dels animals, en organismes unicel·lulars com els ictiosporis (amb genomes grans i densos en introns). En global, demostrem que la genòmica comparada i les reconstruccions ancestrals són una poderosa eina per als anàlisis evolutius: per un cantó permeten inferir la composició primària dels genomes ancestrals; i per l’altre permeten estudiar l’evolució d’altres fonts d’innovació genòmica com ara la regulació transcripcional.<br>The origin of multicellularity in animals is a hallmark event in evolution, that was accompanied by profound changes in the genomes, development and cell biology processes of the animal ancestors. I analyze the origin of animals from the point of view of comparative genomics and phylogenomics, aiming to reconstruct the innovations behind the transition to multicellularity by analyzing animals and their closest unicellular relatives within Holozoa. Our initial phylogenomic analyses established four holozoan clades: Teretosporea (Corallochytrium limacisporum and ichthyosporean protists), Filasterea (2 amoebas, including Capsaspora owczarzaki) and Choanoflagellata (flagellated protists, sometimes colonial), as well as multicellular Metazoa. Then, we used this robust phylogenetic framework in combination with comparative genomics, aiming to pinpoint the specific changes underscoring the origin of Metazoa. We reconstructed the ancestral gene contents were focused of the ubiquitin signaling tool-kit—gene families involved in post-translational protein modification—, myosin molecular motors and homeobox transcription factors. In pre-metazoan lineages, we uncovered a continued state of innovation in terms of de novo gene origin, protein diversification and paralogy – thus suggesting a genetically complex Urmetazoa, and a prominent role of gene co-option at the origin of multicellularity. Next, we aimed to examine genome architecture evolution in premetazoans. Thus, we sequenced and analyzed the genomes of 6 ichthyosporeans (Creolimax fragrantissima, Chromosphaera perkinsii, Sphaeroforma arctica, Ichthyophonus hoferi, Abeoforma whisleri and Pirum gemmata) and C. limacisporum; and compared them to other unicellular holozoans (C. owczarzaki and choanoflagellates) and animals. We uncovered the premetazoan origin of many genes with multicellularity-related functions, e.g. developmental transcription factors or cell adhesion proteins. Here we show that genome architecture evolution was equally innovative: the early burst of gene diversity in the holozoans was followed by episodes of synteny disruption, intron gain, and genome expansions in unicellular and multicellular lineages. Finally, we correlated the evolution of alternative splicing- based transcriptome regulation with exon/intron gene structure in holozoans. We unraveled a universal code of alternative splicing that determines the frequency of animal-like exon skipping profile in large, intron-dense ichthyosporean genomes. We demonstrate that comparative genomics and ancestral reconstructions constitute a powerful tool for evolutionary analysis of ancestral eukaryotes: not only it allows to uncover the primary composition of ancestral genomes; it can also fuel inferences regarding their transcriptomic regulation and the role played by non-genomic sources of evolutionary innovation.

La descripció i explicació de la variació genètica dins i entre poblacions, l’objectiu de la genètica de poblacions des del seu origen, s’ha vist frenat durant dècades degut a la impossibilitat tècnica de mesurar directament la variació genètica de les poblacions. La present era genòmica, amb el creixement explosiu de genomes sequenciats alimentat per les tecnologies de seqüenciació de nova generació, han obert el camí a la present època daurada de l’estudi de la variació genètica a escala genòmica. La genètica de poblacions ja no és una ciència amb mancances empíriques, si no que és més que mai un camp de recerca on les eines bioinformàtiques per mineria de dades i gestió de grans volums de dades, models estadístics i evolutius, i noves tècniques moleculars de generació de seqüències, queden totes integrades en una empresa interdisciplinària. Com a conseqüència d’aquest avenç, una nova disciplina ‘òmica’ ha aparegut: La Genòmica de Poblacions. Però, què és la Genòmica de Poblacions? Segons Charlesworth (2010), simplement és “un nou terme per un camp d’estudi tant antic com la pròpia Genètica”. Es tracta de “l’antic camp” de la Genètica de Poblacions, quan l’estudi de la quantitat i les causes de la variabilitat natural a les poblacions és fa des d’una prespectiva genòmica. Aquesta tesis és tant un estudi de genòmica de poblacions com un projecte bioinformàtic centrat en la visualització, descripció i anàlisis de la variació del DNA a tot el genoma, a partir de dades d’una població natural de l’organisme model Drosophila melanogaster. Les dades utilitzades s’han obtingut a la iniciativa internacional Drosophila Genetic Reference Panel (DGRP) (Mackay et al. 2012). El DGRP ja seqüenciat els genomes complets de 158 (primera fase) i 205 (segona fase) línies consanguínies de D. melanogaster provinents d’una població natural a Raleigh (Estats Units). Un dels objectius principals del projecte va ser la creació d’un recurs de dades del polimorfisme genètic per a realitzar anàlisis de genòmica de poblacions. Les dades de seqüències del DGRP ens ha permès ralitzar un complet estudi de la variació a nivell genòmic a una població natural de D. melanogaster. Després de desenvolupar un complert accessible mapa públic del polimorfisme present en aquesta població, hem descrit els patrons de polimorfisme i divergència (tant de variants nucleotídiques com d’insercions i delecions, índels) al llarg dels braços cromosòmics. Observem un patró clar i consistent de diversitat genòmica al llarg dels autosomes tant per SNPs (varició d’un sol nucleótid) i índels: la diversitat es veu reduïda a les zones centromèriques en comparació a les no centromèriques, i també als telòmers. Aquest patró no s’observa al cromosoma X, on la diversitat és gairebé uniforme al llarg del cromosoma. Polimorfisme i recombinació es troben correlacionats al llarg dels braços cromosomis, però només en aquelles regions amb taxa de recombinació per sota 2cM Mb-1. La taxa de recombinació sembla ser la força principal responsable de donar forma als patrons de polimorfisme als cromosomes i el seu efecte sembla estar mediat pel seu impacte a la selecció lligada. Hem mapejat la petjada de la selecció natural a SNPs i índels a tot el genoma, observant una acció arreu de la selecció natural, tant per selecció adaptativa com purificadora. La selecció adaptativa actua preferentment a zones no centromèriques. La selecció natural actua diferent a insercions i delecions, sent les delecions seleccionades més intensament en contra per la selecció purificadora, fet que suporta la teoria de l’equilibri mutacional per a l’evolució de la mida del genoma.<br>The description and explanation of genetic variation within and between populations, the goal of population genetics since its origins, has been hampered by decades because of the technical inability to directly measure the genetic variation of populations. The present genome era, with the explosive growth of genome sequences fueled by the next-generation sequencing technologies, has lead us to the present golden age of the study of genetic variation at the genome scale. Population genetics is no longer an empirically insufficient science, but it is more than ever a research field where bioinformatics tools for data mining and management of large-scale dataset, statistical and evolutionary models, and advanced molecular techniques of mass generation of sequences are all them integrated in an interdisciplinary endeavor. As a consequence of this breakthrough, a new ‘omic’ discipline has emerged: Population Genomics. But, what is Population Genomics? For Charlesworth (2010), it's simply "a new term for a field of study as old as Genetics itself". It's the 'old field' of Population Genetics when studying the amount and causes of variability in natural populations in a genome-wide fashion. This thesis is both a population genomics study and a bioinformatics project centred on the visualization, description and analysis of the genome-wide DNA variation data from a natural population of model organism Drosophila melanogaster. The data used has been obtained by the international initiative The Drosophila Genetic Reference Panel (DGRP) (Mackay et al. 2012). DGRP has sequenced the complete genomes of 158 (freeze 1) and 205 (freeze 2) inbred lines of Drosophila melanogaster from a single natural population of Raleigh (USA). A major goal of this project was to create a resource of common genetic polymorphism data to further perform population genomics analyses. The DGRP sequence data has allowed us to carry out a thorough study of genome-wide variation in a natural population of D. melanogaster. After developing a complete, public and accessible map of the polymorphism present in this population, we have described the patterns of polymorphism and divergence (nucleotide and indel variants) along chromosome arms. We observe a clear and consistent pattern of genome diversity along arms of the autosomic chromosomes both for SNP and indels: diversity is reduced on average in centromeric regions relative to non-centromeric regions, and at the telomeres. This pattern is not observed in the X chromosome, where diversity is almost uniform all along the chromosome. Polymorphism and recombination are correlated along chromosome arms, but only for those regions where recombination rate is below 2cM Mb-1. Recombination rate seems to be the major force shaping the patterns of polymorphism along chromosome arms and its effect seems to be mediated by its impact on linked selection. We have mapped the footprint of natural selection on SNP and indel variants throughout the genome, observing a pervasive action of natural selection, both adaptive and purifying selection. Adaptive selection occurs preferentially in non-centromeric regions. Natural selection acts differently between insertions and deletions, being deletions more strongly selected by purifying selection, which supports the mutational equilibrium theory for genome size evolution.

Se ha propuesto que el cromosoma X tiene una tasa de fijación de reordenaciones cromosómicas subdominantes superior a la de los autosomas y algunos datos empíricos parecen concordar con esta predicción. Para contrastar esta hipótesis en el género Drosophila se han construido mapas físicos de los cromosomas X, 3 y 4 de las especies D. repleta y D. buzzatti (homólogos a los cromosomas X, 2L y 3L de D. melanogaster). La técnica utilizada para la obtención de estos mapas ha sido la hibridación in situ de un total de 218 marcadores (clones génicos, cósmidos y fagos P1) procedentes de la especie D. melanogaster. Las especies D. repleta y D. buzzatii pertenecen al grupo repleta del subgénero Drosophila y divergieron de D. melanogaster (subgénero Sophophora) hace 40-62 millones de años. En el caso del cromosoma 3 se analizó la organización molecular de la región de 1,944 Mb que rodea al locus Adh en la especie D. melanogaster. Para los cromosomas X y 4 se obtuvieron mapas físicos de todo el cromosoma con una densidad promedio de marcadores de uno cada 333 kb y uno cada 342 kb respectivamente. <br/>La comparación de los mapas físicos de las especies D. melanogaster y D. repleta nos permite estimar el número de inversiones fijadas durante la divergencia de estas dos especies. Los resultados también han sido comparados con los obtenidos previamente para el cromosoma 2 en estas mismas especies. Esta comparación muestra que hay diferencias de hasta cuatro veces en la tasa evolutiva entre cromosomas siendo el cromosoma X el que tiene una tasa más elevada. En conjunto se estima que el numero de inversiones paracéntricas fijadas entre estas dos especies es de 393 y la tasa promedio de disrupciones por Mb y por millón de años es de 0,053. Este resultado corrobora la elevada tasa de reordenaciones observada en el género Drosophila.<br/>La comparación de los mapas físicos obtenidos para las especies D. repleta y D. buzzatii indica que los puntos de rotura de las inversiones Xb y Xc fijadas entre estas dos especies han sido mal asignados. De acuerdo a los resultados obtenidos en el presente trabajo estas dos inversiones no estarían dispuestas en tándem sino que serían inversiones solapantes.<br>It has been proposed that the fixation rate of underdominant chromosomal rearrangements should be higher for the X chromosome than for autosomes and some empirical data agree with this prediction. To check this hypothesis in the Drosophila genus physical maps of the D. repleta and D. buzzatii X, 3 and 4 chromosomes (homologous to chromosomes X, 2L and 3L of D. melanogaster) have been constructed. In situ hybridization of 218 markers from D. melanogaster (gene clones, cosmids and P1s) was used to construct the maps. D. repleta and D. buzzatii belong to the repleta group of the Drosophila subgenus and diverged from D. melanogaster (Sophophora subgenus) 40-62 million years ago. The molecular organization of a 1,944 region of Drosophila melanogaster around the Adh locus was analyzed, whereas for chromosomes X and 4 physical maps of the whole chromosomes were obtained. The markers density in these two chromosomes is one marker per 333 kb for chromosome X and one marker per 342 kb in chromosome 4.<br/>The comparison of the physical maps of D. melanogaster and D. repleta allowed us to estimate the number of inversions fixed during the divergence of these two species. The results have also been compared to those previously obtained for chromosome 2. Four-fold differences in the number of inversions between chromosomes were found with chromosome X exhibiting the highest rate of rearrangement. Combining all results, we estimated that 393 paracentric inversions have been fixed in the whole genome since the divergence between D. repleta and D. melanogaster. This amounts to an average rate of 0.053 disruptions per Mb per million year, corroborating the high rate of rearrangement in the genus Drosophila. <br/>The chromosomal maps of D. repleta and D. buzzatii have also been compared showing that the breakpoints of inversions Xb and Xc have not been correctly assigned. According to our data these two inversions previously considered as in tandem, are overlapping inversions.

Entendre com les especies canvien al llarg de les generacions es un dels principals desafiaments de la biologia evolutiva. Per tal d'entendre el canvi evolutiu a nivell del fenotip és necessari conèixer quina variació fenotípica heretable és present a cada generació i com la seleccio natural actua sobre el fenotip. La variació genètica heretable s'associa a la variació fenotípica corresponent a través del mapa genotip-fenotip (MGF). En el cas de l'evolució morfològica, el MGF ve donat pel desenvolupament embrionari, que consisteix en xarxes d'interacció complexes i dinàmiques entre gens, cèl·lules i teixits. El MGF ens indica el conjunt de fenotips que el desenvolupament pot produir i també les mutacions genètiques especiífiques que es requereixen per aconseguir un determinat fenotip. En aquesta tesi utilitzem l'aproximació computacional per tal de generar prediccions teòriques sobre com la complexitat del MGF influeix en la variació morfològica resultant del desenvolupament i quin efecte té en les dinàmiques evolutives de les poblacions. Utilitzem la dent de mamífer com a sistema model a causa de la seva alta complexitat morfològica i la seva rellevància ecològica i evolutiva. Per mitjà de la simulació d'evolució in silico trobem que els règims selectius que es centren en tots els detalls del fenotip no aconsegueixen portar les poblacions a l'optimalitat fenotípica. També desenvolupem un model general de desenvolupament animal que és capaç de reproduir un ampli ventall de mecanismes de desenvolupament. Després utilitzem aquest model per extendre el model de desenvolupament de dents i explorem la variacio morfològica provinent d'alteracions en l'adhesió i biomecànica cel·lulars. Per mitjà de la simulació del desenvolupament de dents amb models matemàtics hem pogut fer prediccions sobre com un MGF complex afecta la distribució de la variació fenotípica i l'efecte de la selecció natural durant l'evolució adaptativa.<br>One of the main challenges of evolutionary biology is to understand how species change over generations. Phenotypic evolutionary change can only be understood by knowing how natural selection acts on the phenotype and which heritable phenotypic variation arises in each generation within populations. Heritable genetic variation is associated to the correspondent phenotypic variation by means of the genotype-phenotype map (GPM). In the case of morphological evolution, the GPM is determined by embryonic development which consists on complex and dynamic networks of interaction between genes, cells and tissues. The nature of the GPM tells us the ensemble of phenotypes that can be produced by development and also the specific genetic mutations that are required to reach a certain phenotype. In this thesis we use the computational approach to generate theoretical predictions on how the complexity of the GPM influences morphological variation arising from development and what effect has that on the evolutionary dynamics of populations. We use the mammalian tooth as a model system due to its high morphological complexity and ecological and evolutionary relevance. By performing in silico evolution we find that selective regimes that focus on all the details of the phenotype fail to drive populations to phenotypic optimality. We also develop a general model of animal development that is able to reproduce a wide range of developmental mechanisms. We then use this general model to extend the tooth development model and we explore the morphological variation arising from alterations in cell-cell adhesion and biomechanics. By simulating tooth development and evolution by means of mathematical models we have been able to make predictions on how a complex GPM arising from development affects the distribution of phenotypic variation and the effective of natural selection during adaptive evolution.

Els estudis en Evolució Humana han conclòs en general que els trets derivats en humans van facilitar comportaments relacionats amb l'ús d'eines i ens van fer primats especialment destres. La manera com els humans adquirim aquesta configuració única de caràcters musclo-esquelètics té profundes implicacions en el nostre enteniment de l'Evolució Humana en general, ja que la tecnologia lítica és un element clau per definir cultures. El propòsit d'aquesta Tesi és avaluar si la mà humana va evolucionar per selecció natural en adaptació a l'ús d'eines lítiques, la qual és la hipòtesi més estesa per a l'evolució de la mà. Amb aquest propòsit, una mostra de mans de primats actuals, principalment humans, ximpanzés i goril·les, ha sigut analitzada amb diferents mètodes que permeten relacionar forma i funció. El primer objectiu ha sigut avaluar el comportament del polze sota escenaris simulats d'ús d'un percutor en hominoïdeus, a través de l'anàlisi d'elements finits. Els resultats indiquen que la distribució de l'estrès als ossos probablement no va ser una pressió selectiva prou forta com per modelar la forma dels ossos de la mà en humans. El segon objectiu ha sigut avaluar si els humans mostren una estructura de covariació en els carps que és diferent a la de ximpanzés i goril·les. Els resultats indiquen que diferents patrons de covariació poden haver modelat l'evolució del canell en aquests primats, podent estar relacionat amb demandes funcionals. L'últim objectiu ha estat provar si la mida de les èntesis de lligaments i músculs són proxis fiables per inferir patrons d'activitat. Els resultats indiquen que l'ús d'eines lítiques pot ser inferit en hominins analitzant regions de la mà on s'uneixen tendons (amb èntesis fibro-cartilaginoses) i lligaments. Això pot contribuir a la discussió de quan els hominins començaren a utilitzar eines lítiques i amb quina freqüència.<br>Los estudios en evolución humana han concluido en general que los rasgos derivados en humanos facilitaron comportamientos relacionados con el uso de herramientas y nos hicieron primates especialmente diestros. Cómo los humanos adquirimos esta configuración única de caracteres musculoesqueletales tiene profundas implicancias en nuestro entendimiento de la evolución humana en general, ya que la tecnología lítica es un elemento clave para definir culturas humanas. El propósito de esta tesis es evaluar si la mano humana evolucionó por selección natural en adaptación al uso de herramientas líticas, la que es la hipótesis más extendida para la evolución de la mano. Con este propósito, una muestra de manos de primates actuales, principalmente humanos, chimpancés y gorillas, fue analizada con distintos métodos que permiten relacionar forma y función biológica. El primer objetivo fue evaluar el comportamiento del pulgar bajo escenarios simulados de uso de un percutor en hominoideos, a través del análisis de elementos finitos. Los resultados indican que la distribución del estrés en los huesos probablemente no fue una presión selectiva suficientemente fuerte como para modelar la forma de los huesos de la mano en humanos. El segundo objetivo fue evaluar si los humanos muestran una estructura de covariación en los carpos que es diferente a la de chimpancés y gorilas. Los resultados indican que patrones de covariación distintos pueden haber modelado la evolución de la muñeca en estos primates, lo que puede estar relacionado con demandas funcionales distintas de locomoción y manipulación. El último objetivo fue probar si el tamaño de las entesis de ligamentos y músculos son proxis confiables para inferir patrones de actividad. Los resultados indican que el uso de herramientas líticas puede ser inferido en homininos analizando regiones de la mano donde se unen tendones (con entesis fibrocartilaginosas) y ligamentos. Esto puede servir para discutir desde cuándo y con qué frecuencia los homininos utilizaron herramientas líticas.<br>Studies in hand morphology have generally concluded that derived traits in humans facilitated stone tool-related behaviors and made us a highly dexterous primate. How humans acquired this unique configuration of musculoskeletal traits has profound implications for our understanding of human evolution overall, considering that stone technology is a key element defining culture in our species. The aim of this thesis was to evaluate whether the human hand evolved by natural selection in adaptation to stone tool use, which is the most widespread hypothesis for the evolution of the human hand. For this purpose, a comparative sample of hands of extant primates, mainly humans, chimpanzees and gorillas, were analyzed under different methods that relate biological form and function. The first objective of this thesis was to evaluate the performance of the thumb during simulated hammerstone use through a finite element analysis. The results that stress distribution in hand bones was unlikely to be a selective pressure strong enough to shape the hand of humans. The second objective was to evaluate whether humans have a different covariation structure at the wrist than that of chimpanzees and gorillas. Results indicate that different covariation patterns may be shaping the evolution of the wrist in these primates, which might be related to different functional demands of locomotion and manipulation. The last objective was to test whether entheseal size of ligaments and muscles are reliable for inferring activity patterns in the hand. The results indicate that stone tool use may be inferred in hominins by analyzing hand regions where tendons (with fibrocartilaginous entheses) and ligaments attach. This serves to discuss since when and to which extent hominins were using stone tools.

Les convencions culturals compartides en una població emergeixen com a conseqüència de la interacció entre la cognició dels individus i l'estructura de la societat. L'espècie humana, més que cap altra en el regne animal, és capaç d'aprendre i transmetre vastes quantitats d'informació mitjançant el llenguatge i altres productes culturals. A més, els humans tenen una extraordinària capacitat per construir nínxols socials que poden ser modelats com a sistemes complexos. Les societats humanes estan organitzades per l'estructura de les xarxes socials i per altres entitats jeràrquiques super-estructurals que constitueixen sistemes integrats de regles que estructuren les interaccions socials (e.g. institucions). En aquesta tesi formalitzaré algunes de les relacions entre aquests factors usant diversos mètodes. En particular, exploraré les següents preguntes d'investigació: (1) Com afecten les interaccions entre els trets cognitius individuals i les dinàmiques temporals de connectivitat d'una xarxa social (i.e. l'ordre en què els individus d'una població interaccionen entre si) a la disseminació de variants culturals? (2) Com afecten les interaccions entre els trets cognitius individuals i les institucions a l'evolució de la diversitat cultural i l'emergència de convencions culturals? (3) Com els models d'aprenentatge iteratiu, la construcció de nínxol i la biologia evolutiva el desenvolupament poden ser sintetitzats en un marc compatible per a l'evolució de l'llenguatge? El cap. 1 conté una revisió literària i una introducció a les assumpcions que sostenen els models de la tesi. Al cap. 2, presento un model d'agents en el qual manipulo dinàmiques específiques de connectivitat, biaixos cognitius i memòria. Els resultats mostren que la connectivitat afecta les dinàmiques de disseminació de variants: una menor connectivitat retarda la convergència en convencions compartides. També mostro que, a l'comparés amb un model evolutiu neutre, un biaix de contingut (i.e. preferència per variants amb alt valor) és la major força produint convergència i amplifica els efectes de la connectivitat. La mida de la memòria i el biaix de coordinació (especialment el biaix egocèntric) retarden la convergència. Al cap. 3, comunico un experiment de laboratori que té dos objectius: primer, avaluar l'efecte de dues dinàmiques de connectivitat (primerenca i tardana) en l'evolució de la convergència de la població en convencions comunicatives; segon, comparar les prediccions de el model d'agents descrit en el cap. 2 amb les dades experimentals, i calibrar el model per trobar el millor ajust de paràmetres. Els resultats mostren que, tal com prediu el model, una connectivitat primerenca augmenta la convergència i una tardana la retarda. Els capítols 4 i 5 exploren la coevolució de sistemes de valors i institucions mitjançant la incorporació, en els algoritmes d'aprenentatge i producció, d'un conjunt de paràmetres que inclou biaixos conformitat (obediència), confirmació, contingut i freqüència. Els resultats mostren que, en general, el poder institucional facilita la formació de convencions culturals quan el conformisme amb els valors institucionals augmenta. En general, aquest conformisme augmenta la diversitat si les institucions són diverses i redueix la diversitat si les institucions transmeten sistemes de valors amb variants altament dominants. En algunes regions, les convencions globals emergeixen en l'absència de poder institucional i per tant d'institucions que guien el procés de convergència. Al cap. 6, ús el concepte de construcció de nínxol per estendre ponts entre explicacions cognitives d'eco-evo-devo i processos d'aprenentatge iteratiu. Proposo a més un model conceptual que pot ser útil com a marc generador d'hipòtesis al voltant de el qual investigadors en cognició puguin estructurar nous models formals de triple herència.<br>Las convenciones culturales compartidas en una población emergen como consecuencia de la interacción entre la cognición de los individuos y la estructura de la sociedad. La especie humana, más que ninguna otra en el reino animal, es capaz de aprender y transmitir vastas cantidades de información mediante el lenguaje y otros productos culturales. Además, los humanos tienen una extraordinaria capacidad para construir nichos sociales que pueden ser modelados como sistemas complejos. Las sociedades humanas están organizadas por la estructura de las redes sociales y por otras entidades jerárquicas super-estructurales que constituyen sistemas integrados de reglas que estructuran las interacciones sociales (e.g. instituciones). En esta tesis formalizo algunas de las relaciones entre estos factores usando varios métodos. En particular, exploraré las siguientes preguntas de investigación: (1) ¿Cómo afectan las interacciones entre los rasgos cognitivos individuales y las dinámicas temporales de conectividad de una red social (i.e. el orden en que los individuos de una población interaccionan entre sí) a la diseminación de variantes culturales? (2) ¿Cómo afectan las interacciones entre los rasgos cognitivos individuales y las instituciones a la evolución de la diversidad cultural y la emergencia de convenciones culturales? (3) ¿Cómo los modelos de aprendizaje iterativo, la construcción de nicho y la biología evolutiva del desarrollo pueden ser sintetizados en un marco compatible para la evolución del lenguaje? El cap. 1 contiene una revisión literaria y una introducción a las asunciones que sostienen los modelos de la tesis. En el cap. 2, presento un modelo de agentes en el que manipulo dinámicas específicas de conectividad, sesgos cognitivos y memoria. Los resultados muestran que la conectividad afecta las dinámicas de diseminación de variantes: una menor conectividad retrasa la convergencia en convenciones compartidas. También muestro que, al comparase con un modelo evolutivo neutro, un sesgo de contenido (i.e. preferencia por variantes con alto valor) es la mayor fuerza produciendo convergencia y amplifica los efectos de la conectividad. El tamaño de la memoria y el sesgo de coordinación (especialmente el sesgo egocéntrico) retrasan la convergencia. En el cap. 3, comunico un experimento de laboratorio que tiene dos objetivos: primero, evaluar el efecto de dos dinámicas de conectividad (temprana y tardía) en la evolución de la convergencia de la población en convenciones comunicativas; segundo, comparar las predicciones del modelo de agentes descrito en el cap. 2 con los datos experimentales, y calibrar el modelo para encontrar el mejor ajuste de parámetros. Los resultados muestran que, tal y como predice el modelo, una conectividad temprana aumenta la convergencia y una tardía la retrasa. Los capítulos 4 y 5 exploran la coevolución de sistemas de valores e instituciones mediante la incorporación, en los algoritmos de aprendizaje y producción, de un conjunto de parámetros que incluye sesgos conformidad (obediencia), confirmación, contenido y frecuencia. Los resultados muestran que, en general, el poder institucional facilita la formación de convenciones culturales cuando el conformismo con los valores institucionales aumenta. En general, este conformismo aumenta la diversidad si las instituciones son diversas y reduce la diversidad si las instituciones transmiten sistemas de valores con variantes altamente dominantes. En algunas regiones, las convenciones globales emergen en la ausencia de poder institucional y por lo tanto de instituciones que guíen el proceso de convergencia. En el cap. 6, uso el concepto de construcción de nicho para tender puentes entre explicaciones cognitivas de eco-evo-devo y procesos de aprendizaje iterativo. Propongo además un modelo conceptual que puede ser útil como marco generador de hipótesis alrededor del cual investigadores en cognición puedan estructurar nuevos modelos formales de triple herencia.<br>The emergence of shared cultural conventions in a population is shaped by the interaction between individuals' cognition and the structure of the society. Humans, more than any other species in the animal kingdom, are able to learn and transmit vast amounts of information, through language and other cultural products. Individual cognitive constraints include cognitive biases, value systems and memory among others. Additionally, humans have an extraordinary capacity to construct social niches that can be modelled as complex systems. Societies are shaped by the structure of the social network and other high-level hierarchical entities that constitute integrated systems of rules that structure social interactions (e.g. institutions). In this thesis I formalise some of the relationships between these factors using a variety of approaches. In particular, I explore the following three main research questions: (1) How do the interactions between individual cognitive traits and the temporal dynamics of social network connectivity, i.e the order in which individuals in a population interact with each other, affect the spread of cultural variants? (2) How do the interactions between individual cognitive traits and institutions affect the evolution of cultural diversity and the emergence of cultural conventions? (3) How might current iterated learning models, niche construction and evolutionary developmental biology be synthesised into a compatible framework for language evolution? Ch. 1 contains a review of the literature and an introduction to the assumptions underlying the models presented in this thesis. In Ch. 2, I present an agent-based model manipulating specific network connectivity dynamics, cognitive biases and memory. I show that connectivity dynamics affect the time-course of variant spread, with lower connectivity slowing down convergence of the population onto a single cultural variant. I also show that, compared to a neutral evolutionary model, content bias (i.e. a preference for variants with high value) is the main driver of convergence and amplifies the effects of connectivity dynamics, whilst larger memory size and coordination bias, especially egocentric bias, slow down convergence. In Ch. 3, I report an experiment in the lab which has two main goals: First, to evaluate the effect of two connectivity dynamics (early and late) on the evolution of the convergence of micro-societies on shared communicative conventions under controlled conditions. Second, to compare the predictions of the agent-based model described in Ch. 2 against experimental data, and calibrate the model to find the best-fitting parameter setting. Results show that, as predicted by the model, an early connectivity dynamic increases convergence and a late connectivity dynamic slows down convergence. Expanding on the agent-based model, Chs. 4 and 5 explore the co-evolution of value systems and institutions by incorporating a comprehensive parameter combination of compliance, confirmation, content and frequency biases into the learning and production algorithm. Results show that, in general, institutional power facilitates the emergence of cultural conventions when compliance biases increase. In general, a compliance bias pushes diversity up when institutions are diverse, and pushes diversity down when institutions convey value systems with strong dominance of one or few cultural variants. In some regions of the parameter space, global conventions can also emerge in the absence of institutional power and therefore of institutions that are in place to guide convergence. In Ch. 6, I use the concept of niche construction to build bridges between eco-evo-devo accounts for cognitive capacities and cultural evolution guided by iterated learning processes. I propose a conceptual model that might be useful to act as a hypothesis-generating framework around which cognitive scientists can structure new triple-inheritance formal models.

El objetivo principal de este trabajo es mostrar como se puede explicar la evolución cultural en un marco darwinista naturalisticamente aceptable. Para hacer esto, he considerado en primer lugar las principales teorías que se proponen el mismo objetivo: la sociobiología y la memética. En relación a la primera, he mantenido la idea de que los fenómenos culturales dependen a largo plazo de un condicionamiento biológico. En relación a la segunda, he aceptado que existe un sentido en el que la adaptación no es simple incremento de fitness. Mi segundo objetivo es explicar por qué ciertos fenómenos culturales, las maladaptaciones, no son adaptativas como "incremento de fitness", y presentar y aplicar un esquema explicativo que justifique los fenómenos culturales en un nuevo sentido adaptativo. Para articular estas tesis, he utilizado los trabajos de Boyd y Richerson y he introducido la distinción propia entre adaptaciones de primer y de segundo orden.<br>The main objective of this work is to show how can we explain culture within a general Darwinian, naturalistically acceptable framework. To do so, I first reconsider the two main theories that have been proposed with a similar goal: sociobiology and memetics. Concerning the first one, I preserve the idea that every cultural event depends in the long run on a pure biological conditioning. Regarding the latter, I accept that there is a sense of adaptation different from simple development of fitness. My second task is to explain why certain cultural phenomena, maladaptations, are not adaptive in the "increase of fitness" sense, and present and apply an explanatory scheme that accounts for cultural phenomena in a new adaptative manner. In order to articulate these theses in a new proposal, I make use of some work by Boyd and Richerson and introduce the main distinction between first and second order adaptations.

VII Jornadas Nacionales de Bibliotecas Académicas. "El aporte de la Biblioteca Univesitaria a la calidad Educativa", realizada del 7 al 8 de Junio de 2018 en la Universidad Continental, Huancayo. Perú. Evento organizado por Altamira.<br>Conferencia que aborda la evoluación digital o revolución cultural.

El curso electivo Evolución del Mueble en la carrera de Diseño Profesional de Interiores de carácter teórico está dirigido a los estudiantes del séptimo ciclo y busca desarrollar la competencia general de Pensamiento Crítico.El curso analiza la evolución del mueble y la influencia que han ejercido en el Diseño de Interiores y las diversas formas de manifestaciones artísticas desde las primeras civilizaciones hasta el Modernismo. Asimismo la injerencia de estos estilos en la producción artística e interiorista peruana.

El curso electivo Evolución del Mueble en la carrera de Diseño Profesional de Interiores de carácter teórico está dirigido a los estudiantes del séptimo ciclo y busca desarrollar la competencia general de Pensamiento Crítico.El curso analiza la evolución del mueble y la influencia que han ejercido en el Diseño de Interiores y las diversas formas de manifestaciones artísticas desde las primeras civilizaciones hasta el Modernismo. Asimismo la injerencia de estos estilos en la producción artística e interiorista peruana. Este curso desarrolla la competencia general de pensamiento critico mediante la reflexión y contextualizando los objetos en su evolución.

El curso electivo Evolución del Mueble en la carrera de Diseño Profesional de Interiores de carácter teórico está dirigido a los estudiantes del séptimo ciclo y busca desarrollar la competencia general de Pensamiento Crítico.El curso analiza la evolución del mueble y la influencia que han ejercido en el Diseño de Interiores y las diversas formas de manifestaciones artísticas desde las primeras civilizaciones hasta el Modernismo. Asimismo la injerencia de estos estilos en la producción artística e interiorista peruana. Este curso desarrolla la competencia general de pensamiento critico mediante la reflexión y contextualizando los objetos en su evolución.

Seminario para optar al grado de Ingeniero Comercial, Mención Economía<br>La ISO, o "International Organization for Standardization" define calidad como todos los atributos y cualidades que un bien o servicio deben poseer para satisfacer las necesidades de los clientes. En un comienzo, calidad estaba orientada principalmente a la inspección del producto, de modo que se pudiese asegurar un nivel de calidad determinado. Sin embargo, este método no solucionaba las causas del problema de no-calidad. Posteriormente la calidad fue incorporada a todas las áreas funcionales de una empresa que pudieran estar asociadas al proceso de producción. En un mercado global, comprender que es lo que los consumidores desean y esperan de los bienes y servicios es la base del intercambio, ya que un alto nivel de calidad en determinado producto, no es útil si los consumidores no desean dicho producto o si lo encuentran muy caro. Así, la clave esta determinada por elaborar el producto adecuado, bajo condiciones óptimas. La calidad, no sólo se limita a los productos, también se incorpora a la administración y diseño de funciones y actividades en la producción de un bien o servicio. Así, la calidad puede ser considerada como una función de administración, que necesita ser planeada, implementada, monitoreada y controlada.

Curso de especialidad de Evolución De Software en la carrera de Ingeniería de Software, de carácter teóricopráctico dirigido a los estudiantes del sexto ciclo, que busca desarrollar la competencia ANALIZA HECHOS DEL MUNDO CONTEMPORÁNEO IDENTIFICANDO EL IMPACTO EN EL DESEMPEÑO PROFESIONAL DE INGENIERÍA acorde al ABET - Student Outcome (J) Adaptándose a las nuevas necesidades de la industria, además de los conceptos clásicos de Gestión de Configuración, el contenido se complementa con tópicos propios del proceso de evolución del producto, tales como integración continua y despliegue automatizados de software. Cabe resaltar que el curso está muy relacionado con el tema de control de la calidad del producto, y esto le permite al estudiante estar preparado para controlar la calidad de los despliegues de N productos en sus N versiones, de manera automatizada, muy necesario para los proyectos de hoy en día.

En el año 2000 el Banco Macro no era una entidad de referencia del sistema financiero y, en muchos casos, la gente no conocía la existencia de Banco Macro Bansud SA, como se llamaba en ese momento. La inquietud de los orígenes y el fenomenal crecimiento fueron los principales factores de análisis que se quisieron descubrir con la presente investigación. El objetivo principal es lograr que el lector tenga un conocimiento general de la evolución del sistema financiero en su conjunto y del Grupo Macro en particular. Obtener conclusiones de los motivos que llevaron a esta entidad a ser uno de los principales bancos de capitales privados nacionales del país y el que posee la mayor red de sucursales. Conocer si este crecimiento fue acompañado por el sector al cual pertenece o fue proporcionalmente mayor. Si la estrategia adoptada fue acompañada por otras entidades o fue una fuente de diferenciación de sus competidores. Para lograr que el lector se pueda introducir fácilmente en el trabajo se decidió ordenar el mismo desde lo más general y del sector a lo particular del Grupo Macro y algunos competidores estratégicos.<br>Fil: Navesi, José Ignacio. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Económicas.

Los transposones son elementos genéticos que tienen la capacidad de modificar su posición en el genoma. Como consecuencia, tienen un impacto en la evolución de los genomas inactivando o alterando los genes del huésped y proporcionando nuevas funciones génicas. Los transposones ocupan una fracción importante en todos los genomas resecuenciados. El objetivo del trabajo presentado en esta tesis trata en estudiar los distintos impactos de transposones tanto en genes como en la evolución de los genomas de distintas especies de plantas. En esta tesis, se ha analizado la fracción de transposones en melón y pepino, dos especies muy cercanas. Los resultados sugieren que los transposones han proliferado más en melón, causando un aumento del tamaño del genoma. Los transposones no se encuentran distribuidos habitualmente de forma homogénea y tienden a acumularse en las regiones pericentroméricas heterocromáticas, como es el caso de los genomas de melón y pepino. Curiosamente, los resultados presentados muestran que los transposones han expandido las regiones pericentroméricas en melón, demostrando que los transposones pueden modificar la estructura de los genomas. El número de genomas de referencia de plantas disponibles y el número de variedades resecuenciadas ha crecido exponencialmente permitiendo estudiar la correlación entre las variaciones genéticas y fenotípicas. El propósito del trabajo resumido en la segunda parte de esta tesis consiste en analizar el impacto de los transposones en genomas de especies cultivables, detectando los polimorfismos ocasionados por la presencia o ausencia de transposones en un locus concreto, a través de la comparación de una variedad resecuenciada respecto al genoma de referencia. El análisis de inserciones polimórficas de transposones se ha realizado en tres especies distintas: melón, palmera datilera y Physcomitrella patens. Los resultados obtenidos pueden ayudar a identificar familias de transposones activas recientemente y proporcionar información nueva sobre polimorfismos genéticos que pueden estar ligados a caracteres seleccionados durante la evolución reciente de estas tres especies. Para estudiar el impacto de la transposición en la regulación génica, el trabajo presentado en la tercera parte de esta tesis se centra en la capacidad de los transposones en amplificar y redistribuir sitios de unión a factores de transcripción. Los resultados muestran que algunas familias de MITEs se han amplificado y redistribuido los sitios de unión del factor de transcripción E2F durante la evolución de algunas especies del género Brassica. El objetivo de este trabajo ha sido evaluar el impacto de los sitios de unión a E2F localizados dentro de transposones reprogramando la regulación de genes en la red transcripcional de E2F. Los resultados obtenidos han determinado que los sitios de unión a E2F localizados dentro de transposones tienen capacidad de unirse a los factores de transcripción de E2F in vivo, independientemente de las marcas epigenéticas en la región. Además, los transposones se utilizan como herramienta genética útil para generar colecciones de mutantes en animales y plantas debido a su capacidad de integrar copias en el genoma. En plantas, algunos retrotransposones se integran preferentemente cerca de genes siendo particularmente interesantes para la mutagénesis. De entre todos, el retrotransposón de tabaco Tnt1 se ha utilizado para generar mutantes en distintas especies de plantas. La última parte de esta tesis consiste en analizar la capacidad del retrotransposón de tabaco Tnt1 en transponer en el musgo Physcomitrella patens, ya que se demostró que Tnt1 transpone eficientemente en P. patens y se integra preferentemente cerca de genes. Finalmente, este estudio presenta vectores derivados de Tnt1 diseñados para transponer con alta eficiencia y ser utilizados para generar colecciones de mutantes con inserciones estables en esta especie briofita.<br>Els transposons són elements genètics que tenen la capacitat de modificar la seva posició dins el genoma. Com a conseqüència, tenen un impacte en l’evolució del genomes inactivant o alterant els gens de l’hoste i proporcionant noves funcions gèniques. Els transposons ocupen una fracció important de tots els genomes seqüenciats. L’objectiu del treball presentat en aquesta tesis consisteix en estudiar els diversos impactes de transposons tant en els gens com en l’evolució dels genomes de diferents espècies de plantes. En aquesta tesis, s’ha analitzat la fracció de transposons en meló i cogombre, dues espècies molt properes. Els resultats suggereixen que els transposons han proliferat més en meló, causant un augment de la mida del genoma. Els transposons no es troben distribuïts habitualment de forma homogènia i tendeixen a acumular-se en les regions pericentromèriques heterocromàtiques, com el cas dels genomes de meló i cogombre. Curiosament, els resultats presentats mostren que els transposons han expandit les regions pericentromèriques en meló, demostrant que els transposons poden modificar l’estructura dels genomes. El número de genomes de referència de plantes disponibles i el número de varietats reseqüenciades ha crescut exponencialment permetent estudiar la correlació entre les variacions genètiques i fenotípiques. El propòsit del treball resumit en la segona part d’aquesta tesis consisteix en analitzar l’impacte dels transposons en genomes d’espècies cultivables detectant els polimorfismes deguts a la presència o absència de transposó en un locus concret, comparant una varietat reseqüenciada respecte al seu genoma de referència. L’anàlisi d’insercions polimòrfiques de transposons s’ha realitzat en tres espècies diferents: meló, palmera datilera i Physcomitrella patens. Els resultats obtinguts poden ajudar a identificar famílies de transposons actives recentment i proporcionar informació nova sobre polimorfismes genètics que poden estar lligats a caràcters seleccionats durant l’evolució recent d’aquestes tres espècies. Per tal d’estudiar l’impacte de la transposició en la regulació gènica, el treball presentat en la tercera part d’aquesta tesis se centra en la capacitat dels transposons en amplificar i redistribuir llocs d’unió a factors de transcripció. Els resultats mostren que algunes famílies de MITEs s’han amplificat i han redistribuït els llocs d’unió del factor de transcripció E2F durant l’evolució d’algunes espècies del gènere Brassica. L’objectiu d’aquest treball és avaluar l’impacte dels llocs d’unió a E2F localitzats dins de transposons reprogramant la regulació de gens de la xarxa transcripcional de E2F. Els resultats obtinguts han determinat que els llocs d’unió a E2F localitzats dins de transposons tenen la capacitat d’unir-se als factors de transcripció de E2F in vivo, independentment de les marques epigenètiques de la regió. A més a més, els transposons s’han convertit en eines genètiques útils per generar col·leccions de mutants en animals i plantes degut a la seva capacitat d’integrar còpies en el genoma. En plantes, alguns retrotransposons s’integren preferentment a prop de gens sent particularment interessants per la mutagènesis. Entre tots ells, el retrotransposó de tabac Tnt1 s’ha utilitzat per generar mutants en diferents espècies de plantes. L’última part d’aquesta tesis consisteix en analitzar la capacitat del retrotransposó de tabac Tnt1 en transposar en la molsa Physcomitrella patens. S’ha demostrat que Tnt1 transposa eficientment en P. patens i s’integra preferentment a prop de gens. Aquest estudi presenta vectors derivats de Tnt1 dissenyats per transposar amb alta eficiència i ser utilitzats per generar col·leccions de mutants amb insercions estables en aquest briòfit.<br>Transposable elements are genetic elements that have the capacity to modify their position within the genome. As a consequence, they impact the evolution of genomes by inactivating or altering host genes and by providing new gene functions. Transposons account for an important fraction of all sequenced genomes. The goal of the work presented in this dissertation is to investigate the diverse impacts of transposons on gene and genome evolution in different plant species. The transposon content has been analyzed in melon and cucumber, two closely related species. The results suggest that transposons have proliferated to a greater extend in melon, causing an increase of its genome size. Transposable elements are usually not homogenously distributed and tend to accumulate in heterochromatic pericentromeric regions. This is also the case of melon and cucumber genomes. Interestingly, the results presented show that transposons have expanded the pericentromeric regions in melon, showing that transposons can modify the structure of genomes. The number of plant reference genomes made available and the number of varieties resequenced is growing exponentially, and this is allowing to study the correlation between genetic and phenotypic variations. The purpose of the work summarized in the second part of this dissertation is to analyze the impact of transposons in crop genomes by detecting polymorphisms due to the presence or absence of transposon at a given locus, comparing one resequenced variety respect to the reference genome. The analysis of transposon-related polymorphism insertions has been performed in three different species: melon, date palm and Physcomitrella patens. The results obtained can help to identify the transposon families recently active and to provide new information on genetic polymorphisms that can be linked to traits selected during the recent evolution of these three species. In order to study the impact of transposition on gene regulation, the work reported in the third part of this dissertation focuses on the capacity of transposons to amplify and redistribute transcription factor binding sites. The results show that some MITE families have amplified and redistributed the binding sites of E2F transcription factor during Brassica evolution. The goal of this study was to assess the impact of E2F binding sites located within a transposon in reprogramming gene regulation on the E2F transcriptional network. The results obtained have determined that E2F binding sites located within transposons have the capacity to bind E2F transcription factor in vivo, regardless the epigenetic mark context. Moreover, transposons have become a useful genetic tool to generate mutant collections in animals and plants due to the capacity to insert copies into the genome. In plants, some retrotransposons have been shown to integrate preferentially near genes making them particularly interesting for mutagenesis. Among them, the tobacco retrotransposon Tnt1 has been used to generate mutants in different plant species. The last part of this dissertation consists in analyzing the capacity of the tobacco retrotransposon Tnt1 to transpose in the moss Physcomitrella patens. It shows that Tnt1 efficiently transposes in P. patens and inserts preferentially in genic regions. This work presents Tnt1-derived vectors designed for high efficiency transposition that could be used to generate stable insertion mutant collections in this bryophyte species.

L’aparició de nous virus causants de malalties està estretament lligada a l’especialització de subpoblacions virals cap a nous tipus d’amfitrions. La modelització matemàtica proporciona un marc quantitatiu que pot ajudar amb la predicció de processos a llarg termini com pot ser l’especialització. A causa de la naturalesa complexa que presenten les interaccions intra i interespecífiques en els processos evolutius, cal aplicar eines matemàtiques complexes, com ara l’anàlisi de bifurcacions, al estudiar dinàmiques de població. Aquesta tesi desenvolupa una jerarquia de models de població per poder comprendre l’aparició i les dinàmiques d’especialització, i la seva dependència dels paràmetres del sistema. Utilitzant un model per a un virus de tipus salvatge i un virus mutat que competeixen pel mateix amfitrió, es determinen les condicions per a la supervivència únicament de la subpoblació mutant, juntament amb la seva coexistència amb el cep de tipus salvatge. Els diagrames d’estabilitat que representen regions de dinàmiques diferenciades es construeixen en termes de taxa d’infecció, virulència i taxa de mutació; els diagrames s’expliquen en base a les característiques biològiques de les subpoblacions. Per a paràmetres variables, s’observa i es descriu el fenomen d’intersecció i intercanvi d’estabilitat entre diferents solucions sistemàtiques i periòdiques en l’àmbit dels ceps de tipus salvatge i els ceps mutants en competència directa. En el cas de que diversos tipus d’amfitrions estiguin disponibles per a ser disputats per ceps especialitzats i generalistes existeixen regions de biestabilitat, i les probabilitats d’observar cada estat es calculen com funcions de les taxes d’infecció. S’ha trobat un rar atractor caòtic i s’ha analitzat amb l’ús d’exponents de Lyapunov. Això, combinat amb els diagrames d’estabilitat, mostra que la supervivència del cep generalista en un entorn estable és un fet improbable. A més, s’estudia el cas dels diversos ceps N>>1 que competeixen per diferents tipus de cèl·lules amfitriones. En aquest cas s’ha descobert una dependència no monotònica, contraria al que es preveia, del temps d’especialització sobre la mida inicial i la taxa de mutació, com a conseqüència de la realització d’un anàlisi de regressió sobre dades obtingudes numèricament. En general, aquest treball fa contribucions àmplies a la modelització matemàtica i anàlisi de la dinàmica dels patogens i els processos evolutius.<br>La aparición de nuevos virus causantes de enfermedades está estrechamente ligada a la especialización de las subpoblaciones virales hacia nuevos tipos de anfitriones. La modelizaci ón matemática proporciona un marco cuantitativo que puede ayudar a la predicción de procesos a largo plazo como la especialización. Debido a la naturaleza compleja que presentan las interacciones intra e interespecíficas en los procesos evolutivos, aplicar herramientas matemáticas complejas, tales como el análisis de bifurcación, al estudiar dinámicas de población. Esta tesis desarrolla una jerarquía de modelos de población para poder comprender la aparición y las dinámicas de especialización, y su dependencia de los parámetros del sistema. Utilizando un modelo para un virus de tipo salvaje y un virus mutado que compiten por el mismo anfitrión, se determinan las condiciones para la supervivencia únicamente de la subpoblación mutante, junto con su coexistencia con la cepa de tipo salvaje. Los diagramas de estabilidad que representan regiones de dinámicas diferenciadas se construyen en términos de tasa de infección, virulencia y tasa de mutación; los diagramas se explican en base a las características biológicas de las subpoblaciones. Para parámetros variables, se observa y se describe el fenómeno de intersección e intercambio de estabilidad entre diferentes soluciones sistemáticas y periódicas en el ámbito de las cepas de tipo salvaje y las cepas mutantes en competencia directa. En el caso de que varios tipos de anfitriones estén disponibles para ser disputados por cepas especializadas y generalistas existen regiones de biestabilidad, y las probabilidades de observar cada estado se calculan como funciones de las tasas de infección. Se ha encontrado un raro atractor caótico y se ha analizado con el uso de exponentes de Lyapunov. Esto, combinado con los diagramas de estabilidad, muestra que la supervivencia de la cepa generalista en un entorno estable es un hecho improbable. Además, se estudia el caso de los varias cepas N>> 1 que compiten por diferentes tipos de células anfitrionas. En este caso se ha descubierto una dependencia no monotónica, contraria a lo que se preveía, del tiempo de especialización sobre el tamaño inicial y la tasa de mutación, como consecuencia de la realización de un análisis de regresión sobre datos obtenidos numéricamente. En general, este trabajo hace contribuciones amplias a la modelización matemática y el análisis de la dinámica de los patógenos y los procesos evolutivos.<br>The occurrence of new disease-causing viruses is tightly linked to the specialisation of viral sub-populations towards new host types. Mathematical modelling provides a quantitative framework that can aid with the prediction of long-term processes such as specialisation. Due to the complex nature of intra- and interspecific interactions present in evolutionary processes, elaborate mathematical tools such as bifurcation analysis must be employed while studying population dynamics. In this thesis, a hierarchy of population models is developed to understand the onset and dynamics of specialisation and their dependence on the parameters of the system. Using a model for a wild-type and mutant virus that compete for the same host, conditions for the survival of only the mutant subpopulation, along with its coexistence with the wild-type strain, are determined. Stability diagrams that depict regions of distinct dynamics are constructed in terms of infection rates, virulence and the mutation rate; the diagrams are explained in terms of the biological characteristics of the sub-populations. For varying parameters, the phenomenon of intersection and exchange of stability between different periodic solutions of the system is observed and described in the scope of the competing wild-type and mutant strains. In the case of several types of hosts being available for competing specialist and generalist strains, regions of bistability exist, and the probabilities of observing each state are calculated as functions of the infection rates. A strange chaotic attractor is discovered and analysed with the use of Lyapunov exponents. This, combined with the stability diagrams, shows that the survival of the generalist in a stable environment is an unlikely event. Furthermore, the case of N=1 different strains competing for different types of host cells is studied. For this case, a counterintuitive and non-monotonic dependence of the specialisation time on the burst size and mutation rate is discovered as a result of carrying out a regression analysis on numerically obtained data. Overall, this work makes broad contributions to mathematical modelling and analysis of pathogen dynamics and evolutionary processes.

El sistema quimiosensorial (SQ) participa en la detección de nutrientes, depredadores y pareja, siendo -por tanto- fundamental en la supervivencia de los organismos y de las especies. En insectos, las primeras etapas de la quimiopercepción están mediadas por familias multigénicas que codifican: (i) proteínas extracelulares, como las Odorant-Binding Proteins (OBPs) y las Chemosensory Proteins (CSPs); (ii) proteínas quimiorreceptoras, como los Odorant (ORs), Gustatory (GRs) e Ionotropic Receptors (IRs). Dado que la eficacia biológica de los individuos depende de su correcta expresión, estas familias multigénicas constituyen un excelente modelo para estudiar procesos adaptativos a nivel molecular. La creciente disponibilidad de datos moleculares nos ha conferido la oportunidad de comprender el papel de la selección natural en la evolución transcripcional de los genes del SQ. No obstante, la naturaleza masiva e innovadora de estos datos ha hecho indispensable el desarrollo e implementación de nuevos métodos de genética de poblaciones y evolución molecular en las potentes herramientas bioinformáticas DnaSPv5, BadiRate y popDrowser. Utilizando éstas y otras herramientas, hemos determinado que los genes que codifican OBPs no están distribuidos aleatoriamente en el genoma de Drosophila, sino agrupados formando clústeres de genes. La conservación de estos clústeres está relacionada con la amplitud y el ruido transcripcional de sus integrantes, así como también con su estado de la cromatina (’transcription elongation’ y con la unión de la proteína JIL-1). Entre otras funciones, la JIL-1 libera la ARN polimerasa pausada en la región promotora, lo que produce una ráfaga de elongación de la transcripción génica que incrementa el ruido transcripcional. Debido a que las fluctuaciones de OBPs pueden alterar el comportamiento de los individuos, este ruido transcripcional puede generar una plasticidad fenotípica beneficiosa, especialmente en ambientes externos cambiantes. La arquitectura de la región promotora puede jugar un papel fundamental en pausar la actividad de la ARN polimerasa. En este sentido, hemos inferido que las regiones upstream de los aIRs y las CSPs están sometidas a una importante constricción funcional, mientras que las de los ORs y los GRs han experimentado un mayor impacto de la selección darwiniana. Aunque aún faltan más evidencias al respecto, la evolución de las regiones upstream de las OBPs podría estar vinculada con el impacto diferencial de la cromatina en su regulación transcripcional. De cualquier modo, no cabe duda que la selección natural (negativa y positiva) ha contribuido significativamente a la evolución transcripcional de las principales familias multigénicas del SQ, mediante los mecanismos que implican elementos cis-reguladores y estados de la cromatina.<br>The chemosensory system is involved in the detection of food, predators and mates, being thus essential for the species survival. In insects, the first steps of chemoperception are mediated by multigene families encoding: (i) extracellular proteins, such as Odorant-Binding Proteins (OBPs) and Chemosensory Proteins (CSPs), as well as (ii) chemoreceptors, such as Odorant (ORs), Gustatory (GRs) and Ionotropic Receptors (IRs). Since the fitness of individuals depends on their correct expression, these multigene families are an excellent model to study adaptive processes at the molecular level. The increasing availability of molecular data gives us the opportunity to understand the role of natural selection in the transcriptional regulation of the chemosensory genes. However, the massive and innovative nature of these data makes crucial the development and implementation of new methods for population genetics and molecular evolution in powerful bioinformatics tools, such as DnaSPv5, popDrowser and BadiRate. Using these and other tools, we determined that genes encoding OBPs are clustered along the Drosophila genome. The conservation of these clusters is related to the transcriptional amplitude and noise of their members, as well as to its chromatin state ('transcription elongation' and binding of JIL-1 protein). Among other functions, the JIL-1 releases the RNA polymerase paused at the promoter region, inducing a transcriptional elongation burst that increases expression noise. Because OBPs fluctuations can alter the behavior of individuals, this noise can generate a beneficial phenotypic plasticity, especially in changing external environments. The architecture of the promoter region can play a key role in the RNA polymerase pausing. In this regard, we have inferred that the upstream regions of aIRS and CSPs are under strong functional constraints, whereas Darwinian selection is more pervasive at the ORs and GRs upstream regions. Although further studies are needed, the evolution of the OBP upstream regions may be linked to the differential impact of the high-order chromatin regulatory mechanisms in the OBP transcription. Anyway, it is certain that natural selection (negative and positive) has significantly contributed to the transcriptional evolution of the major chemosensory multigene families, through mechanisms involving cis- regulatory elements and high-order chromatin states.

The work presented in this Ph.D. thesis is mostly related to the measurement and interpretation of the cross-correlation of different species. This is achieved using spectroscopic data from the BOSS survey of which I am a member. Along the thesis I will be visiting the cross-correlation of different tracers. This tracers include the Mg II absorbers, the Damped Lyα Systems (DLA), the Lyα forest, the quasars and the galaxies. Save the last mentioned, all tracers are measured from quasar spectra from BOSS. The galaxies are taken from the BOSS CMASS catalogue. The first cross-correlation I address is that of Mg II absorbers with CMASS galaxies. I present a new method for measuring the equivalent width of metal absorbers, developed in collaboration with Britt Lundgren and Jordi Miralda- Escud´e, and I apply it to the absorption doublet. Then I shift my attention to the DLAs and the Ly forest. Since the Lyα forest autocorrelation has already been studied (see e.g. Delubac et al. 2015; Blomqvist et al. 2015), the Lyα parameters are well constrained. I use those constraints to provide more accurate measurements of the DLA bias when analysing the cross-correlation of DLAs with the Lyα forest. The study has been made in collaboration with Andreu Font-Ribera, Nicol´as Busca, and Jordi Miralda-Escud´e. In particular, the estimator for the cross-correlation was orig- inally developed by Nicol´as Busca for the analysis of the Lyα autocorrelation and later adapted to the measurement of the cross-correlation. The first two cross-correlations studied and more importantly their interpre- tation, are mostly focused on large scales, where the linear theory is valid. At smaller scales, non-linear effects start to kick in and the linear approximation is no longer valid. I measure the cross-correlation of quasars with the Lyα forest, and focus on the small scales effects. I show that a contamination from metals is clearly present in the cross-correlation. Also, I discuss some of the possible non-linear effects and give a simple theoretical model to explain the effect that quasar radiation can have in the surrounding hydrogen clouds.<br>El treball fet en aquesta tesi doctoral es basa principalment en la mesura i interpretació de la correlació creuada entre diferents traçadors. Els traçadors emprats en aquesta tesi són les galàxies del catàleg CMASS, els quàsars del catàleg de Baryon Oscillations Spectroscopic Survey (BOSS), els sistemes absorbidors de MgII, el bosc de Lya i els sistemes Lya esmorteïts o DLAs (els tres darrers són sistemes absorbidors detectats als espectres dels quàsars). El projecte BOSS és un dels quatre projectes que han composat la tercera fase de la col·laboració de l’Sloan Digital Sky Survey (SDSS) el principal objectiu del qual ha estat la detecció del senyal de les oscil·lacions acústiques dels barions (BAO, de l’anglès Baryon Acoustic Oscillations) i que ha estat recollint espectres electromagnètics de quàsars i galàxies des de la tardor de 2013 fins a la tardor de 2014. L’estructura d’aquesta tesi es divideix en tres capítols que fan referència a l’estudi de diferents traçadors. En el capítol ì els traçadors emprats són les galàxies de CMASS i els sistemes absorbidors de MgII; en el capítol 3, els DLA i el bosc de Lya, i en el capítol 5, els quàsars i el bosc de Lya. A més la tesi compta amb una introducció en català, una altra en anglès i un compendi de les conclusions obtingudes.

Many topics in ecology and evolution are currently being studied under the framework of eco- evolutionary dynamics that is to say integrating genetic, ecological and demographic data. Here, I have focused my investigations on three neighbouring isolated populations of this species, the Balearic Wall lizards, also known as Lilord’s lizard. The three populations chosen are from the southern coast of Mallorca Island (Balearic Islands, Spain) belong to the same genetic clade and derived from the same recent colonization event. Therefore, I investigate life-history adaptations of this endemic species inhabiting on small islets where immigration and emigration are constraint. Using ‘soft’ comparative methods to assess the relative contribution of ecological, environmental, and evolutionary processes that govern the dynamic of these three populations, I tried to shed light on the selective pressures imposed by the insular environment and the consequences of individual responses on the evolution of life- history traits. Throughout this thesis I used techniques and concepts of ecology, allometric and genetic to develop an integrated population model that provides a new analytical framework to address eco-evolutionary questions and that unifies the ecological and genetic approaches in a demographic context. However, firstly I had to solve problems linked with the monitoring methods and in particular the imperfect sampling of natural populations. Indeed, animals might die, breed or move undetected. To solve this problem it is necessary to use statistical models to infer the biological processes or to obtain unbiased estimate of the demographic parameters from the raw observations. Then, I moved to the study of ecological predictors of body growth using individual-based data, lizards are considered animals of continuous growth and not surprisingly the growth rate is an important life-history parameter with inter-specific and inter-population differences. A problem linked with the estimate of growth parameters in wildlife populations is that individual age is often unknown. I used individual-based data to assess the length-at-age curve from capture–recapture data of uniquely identified and sexed individuals. Once the length-at-age relationship was described, I describe the influence of predictors of body growth. I further investigated the inter- and intra-population genetic structure to describe the genetic architecture of each populations and their relationship. Furthermore, I analysed patterns of divergence among the three populations not only using genetic markers, but also comparing lizards’ life-history traits such as body size, individual growth rate, fecundity, and survival probability. Finally, I merged all these results into an integral projection model (IPM) in which all demographic parameters were describes as a function of lizards’ body size to develop an analytical framework to address eco-evolutionary questions. IPM results were used to make predictions of the demographic consequences of body size and age variations.<br>Molts de temes en el camp de l'ecologia i la evolució estan íntimament lligats, avui dia molts d'estudis es fan de manera conjunta. Malgrat això, l'estudi de les dinàmiques eco-evolutives de poblacions naturals es molt complexa i requereix de molta informació ja que integra tant dades genètiques, com ecològiques i demogràfiques. Utilitzant un gran nombre de dades individuals, l'objectiu principal d'aquesta tesi ha estat la de posar de manifest les pressions selectives imposades per l'entorn insular de poblacions de sargantana balear (Podarcis lilfordi), tres poblacions aïllades veïnes d'aquesta espècie procedent de la costa sud de l'illa de Mallorca van ser triades per estudiar les conseqüències de les respostes individuals en l'evolució dels trets d'història de vida. Al llarg d'aquesta tesi he fet servir tècniques i conceptes de l'ecologia, genètica i morfologia per desenvolupar un model de població integrat que proporcioni un nou marc analític per abordar qüestions sobre dinàmiques eco-evolutives i que unifica els enfocaments ecològics i genètics en un context demogràfic.

To understand the origin of opisthokonts or infer evolutionary transitions within the group that contains two multicellular lineages (animals and fungi), it is first fundamental to understand the phylogenetic relationships between extant living species. Phylogeny and particularly phylogenomics (such the supermatrix approach) is the only valid procedure to infer evolutionary relationships between species, as morphological or molecular synapomorphies or rare genomic changes are cyclic arguments and really taxon dependent. This is why we have used genomic and transcriptomic data to build a novel dataset of Single Copy Protein Domains and test phylogenetic hypotheses with multiple methods to discard problems of systematic error. We have confirmed the division between Holomycota (Nucleariids, Opisthosporidia, chytrid fungi and fungi) and Holozoa (Ichthyosporea, Filasterea, Choanomonada and Metazoa). We also have generated RNAseq data to place a specially elusive species: Corallochytrium limacisporum and found it placed as sister group to Ichthyosporea, another osmotrophic holozoan group. With this solid phylogenetic background we can start to speculate on evolutionary transitions between groups, but not before reconstructing ancestral character states in different opisthokont lineages and also the extant living outgroups: Apusomonadida and Breviatea. So we conclude that there is no clear link between biflagellated free-living gliding bacterivores (outgroup) and any opisthokont lineage (ingroup). The Last Opisthokont Common Ancestor was probably uniflagellated but retained all other ancestral characters such amoeboid movement, filopodia, phagotrophy, etc. but had a less constrained cell shape or feeding mode. Then, we studied the similarities found between non-related groups of opisthokonts, such the walled osmotrophs or the naked filose amoebae through comparative genomics. For example, we found that Ministeria vibrans (Filasterea) and C. limacisporum (Ichthyosporea) have a flagellar apparatus previously unnoticed, and with a molecular pattern of flagellum reduction also seen in fungi and other eukaryotes. Also, Ichthyosporea probably use a chitin-like substance to build their cell wall (similar to fungi) but with an independently diversified pathway.<br>Per entendre l’origen dels Opistoconts (grup taxonòmic que conté animals, fongs i diversos llinatges protists emparentats) o inferir les seves transicions evolutives, és fonamental primer entendre les relacions filogenètiques entre les espècies existents en l’actualitat. La filogènia, particularment la filogenòmica, és el procediment vàlid per inferir relacions evolutives entre espècies, ja que la morfologia, les sinapomorfies moleculars o els canvis genètics singulars són arguments cíclics dependents del mostreig taxonòmic. Per aquesta raó hem fet servir dades genòmiques i transcriptòmiques per a construir un nou conjunt de dades format per dominis proteics de còpia única i els hem analitzat mitjançat diversos mètodes per prevenir errors sistemàtics. Hem pogut així confirmar la divisió entre Holomycota (Nucleariids, Opisthosporidia, quitridiomiciets i fongs) i Holozoa (Ichthyosporea, Filasterea, Choanomonada i Metazoa). També hem obtingut dades de RNAseq per situar espècies particularment ambigües com: Corallochytrium limacisporum la qual hem situat com a grup germà de Ichthyosporea, un altre grup holozou osmotròfic. Partint d’aquesta base filogenètica es pot començar a especular sobre les transicions evolutives entre els grups. No obstant, abans cal reconstruir els ancestres dels llinatges dels Opistoconts com també dels seus grups externs actuals: Apusomonadida i Breviatea. Els resultats indiquen que no existeix cap lligam definit entre els bacterívors ancestrals biflagelats (grup extern) i cap dels llinatges Opistoconts (grup d’interès). També que el darrer avantpassat comú dels Opistoconts probablement conservaria quasi tots els caràcters ancestrals com el moviment ameboide, filopodis, la fagotrofia, etc.; però seria uniflagel·lat, amb una forma cel·lular menys restringida pel tipus d’alimentació. Mitjançant la genòmica comparada hem estudiat les similituds entre grups no emparentats d’Opistoconts com els osmòtrofs amb paret cel·lular o les amebes filopodials nues. Per exemple, hem trobat que Ministeria vibrans (Filasterea) i C. limacisporum (Ichthyosporea) presenten un aparell flagel·lar fins ara desconegut amb un patró similar al que formen fongs i altres eucariotes. També que Ichthyosporea fa servir un material semblant a la quitina per construir la seva paret cel·lular. Aquestes similituds plantegen hipòtesis de convergència evolutiva o paral·lelisme entre llinatges propers que s’hauran de comprovar en un futur.

The research topic of this PhD thesis is a comparative analysis of classical specic&nbsp;geometric frameworks and of their anisotropic extensions; the construction of three different&nbsp;types of Finsler frameworks, which are suitable for the analysis of the cancer cells population&nbsp;dynamical system; the development of the anisotropic Beltrami framework theory with the&nbsp;derivation of the evolution&nbsp;ow equations corresponding to different classes of anisotropic&nbsp;metrics, and tentative applications in image processing.<br>Predmet istraživanja doktorske disertacije je uporedna analiza klasičnih i specifičnih&nbsp;geometrijskih radnih okruženja i njihovih anizotropnih pro&scaron;irenja; konstrukcija &nbsp;tri Finslerova&nbsp;radna okruženja različitog tipa koja su pogodna za analizu dinamičkog &nbsp;sistema populacije&nbsp;kanceroznih ćelija; razvoj teorije anizotropnog Beltramijevog radnog okruženja i formiranje&nbsp;jednačina evolutivnog toka za različite klase anizotropnih metrika, kao i mogućnost primene&nbsp;dobijenih teorijskih rezultata u digitalnoj obradi slika.

Memoria (licenciado en ciencias jurídicas y sociales)<br>El cambio de paradigma respecto a la niñez a partir de la proclamación de la Convención Internacional Sobre Los Derechos Del Niño deja atrás la concepción de la infancia y la adolescencia como “objeto de protección”, constituyéndose en objetos de caridad por parte de los organismos públicos y privados. En virtud de este nuevo marco, pasan a ser “sujetos de derecho” y titulares de éstos, pudiendo exigir su respeto y cumplimiento a su familia, a la sociedad y al Estado. El propósito del presente trabajo es establecer la responsabilidad que le cabe al Estado como garante de los derechos de la infancia cuando éstos han sido violentados o se ven amenazados de serlo. Los niños, niñas y adolescentes requieren vínculos estables que le brinden la seguridad y protección necesarias para su desenvolvimiento personal. La misión de procurar la estabilidad y satisfacción de sus múltiples necesidades está entregada a la familia como organismo fundamental de la sociedad. Sin embargo, producto de diferentes situaciones, circunstancialmente hay familias que no pueden brindar el ambiente seguro y estable que un niño o niña requiere para su desarrollo integral, debiendo el Estado ejecutar medidas para el restablecimiento de los derechos vulnerados o amenazados. Estas disposiciones son de diversa índole y grado de intervención. Si excepcionalmente se requiriese la separación del niño o niña de su familia, se han establecido medidas de cuidado alternativo como el acogimiento residencial o el acogimiento familiar; debiendo escogerse entre ellas la más idónea para el interés superior del niño y la observancia de sus derechos. Las repercusiones y efectos que estas providencias tienen en los niños y niñas son objeto de un estudio multidisciplinario, debiendo recurrir a otras áreas del conocimiento para su análisis, en especial sobre los beneficios entregados por el acogimiento familiar frente a las otras modalidades.

Este trabajo analiza la inclusión financiera como un factor para modificar las condiciones de vida de los ciudadanos en los diferentes países alrededor del mundo. Formar parte de la inclusión financiera implica acceder y utilizar los productos y servicios financieros que ofrecen las instituciones financieras. Este texto está organizado en seis capítulos. En el primer capítulo, se aborda la inclusión financiera desde la perspectiva de la oferta y la demanda. Por un lado, la oferta aborda el uso de herramientas tecnológicas que permitirán a las instituciones financieras la creación de productos y servicios para los excluidos, mientras que, por el lado de la demanda, implica trabajo en la educación de los usuarios. El segundo capítulo expone las barreras tanto voluntarias como involuntarias que impiden el acceso a la inclusión financiera: la distancia, infraestructura, la asimetría de la información, entre otros. El tercer capítulo aborda los determinantes de la incorporación financiera: género, educación, edad, nivel de ingresos, idioma y religión. En el cuarto capítulo, se desarrolla los efectos de la inclusión financiera como la reducción de la pobreza, fuente generadora de empleo, costo de capital más económico y la innovación de nuevo productos financieros. En el quinto capítulo, se presentan las mediciones y modelos para la inclusión financiera; entre estos, se encuentran el uso del análisis de componentes principales, mínimos cuadrados ordinarios, regresión lineal simple entre otros. Asimismo, en el sexto capítulo, se expone el papel de la inclusión financiera en las microfinanzas. Finalmente, se exponen las conclusiones de la investigación.<br>This work analyzes financial inclusion as a factor to modify the living conditions of citizens in different countries around the world. Being part of financial inclusion involves accessing and using financial products and services offered by financial institutions. This text is organized into six chapters. In the first chapter, financial inclusion is approached from the perspective of supply and demand. On the one hand, the offer addresses the use of technological tools that will allow financial institutions to create products and services for the excluded, while, on the demand side, it involves work in the education of users. The second chapter exposes both voluntary and involuntary barriers that prevent access to financial inclusion: distance, infrastructure, asymmetry of information, among others. The third chapter addresses the determinants of financial incorporation: gender, education, age, income level, language and religion. In the fourth chapter, the effects of financial inclusion are developed, such as the reduction of poverty, a source of employment, a cheaper cost of capital and the innovation of new financial products. In the fifth chapter, the measurements and models for financial inclusion are presented; Among these are the use of principal component analysis, ordinary least squares, simple linear regression, among others. Also, in the sixth chapter, the role of financial inclusion in microfinance is exposed. Finally, the conclusions of the investigation are presented.<br>Trabajo de Suficiencia Profesional

El presente trabajo proporciona una introducción a la teoría de la luz y los principios ópticos. Los cuales fueron las bases para la creación de los primeros dispositivos analógicos (cámaras) capaces de capturar imágenes. También se comentan los principios de funcionamiento de las cámaras fotográficas analógicas y digitales. Así como los conceptos de imagen digital y algunas de las técnicas fundamentales de procesamiento. Por último, se propone el diseño y programación de una interfaz gráfica que permitirá aplicar diversas técnicas de tratamiento digital a imágenes en los formatos más comunes de hoy día.

Doctor en Ciencias, Mención Geología<br>La evolución neógena de los Andes Centrales al sur del segmento de subducción plana ha sido ampliamente estudiada aunque sin haberse logrado un consenso acerca del origen de las variaciones en el estilo estructural, la edad de la deformación, el espesor cortical y la cantidad de acortamiento, entre otros, que muestra el orógeno a lo largo del rumbo. Mediante análisis cronoestratigráficos y estructurales, el presente estudio persigue caracterizar los periodos de deformación que experimentaron los Andes desde el Mesozoico hasta el presente, entre 34°45' y 35°30'S, con el fin de establecer su influencia en la construcción neógena del orógeno y en las diferencias que presenta este a lo largo del rumbo. Los resultados muestran que la deformación contraccional durante el Neógeno se caracterizó tanto por la reactivación de estructuras normales previas como por la generación de nuevas fallas. Estas estructuras involucraron el basamento en la deformación, desarrollando un estilo de piel gruesa favorecido por la presencia de fallas normales asociadas a las cuencas extensionales que caracterizaron la evolución de este segmento de los Andes durante el Mesozoico y Cenozoico. Asimismo, se pudieron reconocer dos pulsos de deformación contraccional previos al Neógeno que afectaron a esta región durante el Cretácico Superior y el Paleoceno. Sin embargo, no se pudo cuantificar la cantidad de acortamiento acomodado durante estos periodos, lo que imposibilita reconocer su influencia en periodos de deformación posteriores. Durante la deformación de la vertiente occidental de la cordillera (20-11 Ma), cerca de 18 km de acortamiento fueron acomodados en la corteza superior, mientras que la faja plegada y corrida de Malargüe acomodó 30 km, implicando una variación mínima con el acortamiento acomodado por la Cordillera Principal a los 33°30´S. No obstante, el porcentaje de acortamiento disminuye hacia el sur debido a que la deformación se distribuyó en una región más amplia. De esta forma, se establece que la disminución de acortamiento hacia el sur que presenta el orógeno, se originaría por la ausencia de la Cordillera Frontal al sur de 34°40'S, lo cual sería consecuencia directa de la menor cantidad de deformación que experimentó la corteza. Esta menor cantidad de deformación y acortamiento tendría implicancias directas en la forma en cómo se deforma la corteza. Es así como el acortamiento acomodado por la corteza superior ha sido transformado en engrosamiento cortical in-situ implicando un modo de deformación en cizalle puro, contrastando con el modo de cizalle simple que dominaría al norte de 35°S. Finalmente, si bien, la evolución y arquitectura previa influye sobre el estilo de deformación de la corteza, la cantidad de deformación que experimenta el continente es la responsable de que la segmentación de los Andes, quedando aún por dilucidar si esto depende de la cantidad de deformación que puede acomodar la placa superior o a varia ciones a lo largo de la placa subductada.

Feather mites are among the most abundant and commonly occurring bird ectosymbionts. They live permanently on the host body, are adapted to inhabit well-defined host microhabitats and are found in almost all avian groups. Although feather mites have been extensively studied at the taxonomic level, much diversity remains undescribed and there are many open questions on the biology, ecology and evolution of feather mites. There is also an ongoing debate on the type of symbiosis, that is, whether bird-feather mite interactions are parasitic, commensalistic or even mutualistic. Therefore, better knowledge of feather mite communities at different levels of their biological organization (i.e., among host individuals, host populations and host species) can contribute to our understanding of the evolutionary ecology of feather mite-bird interactions, and of the evolution of parasite biodiversity in general. In this context, the main goal of this thesis was to investigate the evolutionary and ecological factors driving the diversity and community structure of feather mites inhabiting seabirds of the north-eastern Atlantic Ocean and Mediterranean Sea. More specifically, using a multi-host and multi-mite species community approach, I quantify feather mite morphological and genetic diversity within different seabird species and populations; evaluate the relative importance of host versus geographic structure in influencing the evolution and population structure of seabird feather mites; investigate the spatial distribution and trophic structure within a host individual to identify the driving mechanisms and proximate factors shaping symbiont infra-community structure. Based on morphological criteria, the results show that seabird species harbour a diverse and unique mite fauna composed of 38 species belonging to 10 genera and three families. All seabird species hosted at least three feather mite species, while the richest community was composed of nine mite species. Each seabird genus harboured a distinct feather mite community and only three mite species were shared by two related shearwater genera. Seventeen of the 38 mite species found were new, undescribed species; official descriptions of six are included in this thesis. Overall, molecular data correlated well with morphological species descriptions, but also revealed the presence of six putative cryptic species belonging to four mite genera. The patterns of mite genetic structure were variable both among different sympatric hosts and among the same host species in different geographic regions. Thus, the great majority of mite species from sympatric seabirds exhibited strong host-associated patterns of genetic structure. When comparing mite communities among sibling host species from the same genus, some mite species were genetically unstructured among hosts and localities, whereas other mite species showed higher degree of genetic diversity and among population differentiation. These observed differences correspond to microhabitat use on the host body. No genetic differentiation among localities was found for feather mites, suggesting that mite dispersal regularly occurs between host populations. The distribution of two widely abundant mite species that co-occur on the flight feathers of a single seabird species, Calonectris borealis, showed clear spatial segregation among feathers; one species preferred the central primaries, whereas the other was restricted to the outermost primaries. This pattern resulted from a combination of habitat-specific adaptations and ongoing competition. In addition, isotopic analyses of mite diet indicated that the two mite species share the same host food resources, probably preen gland oil complemented with exogenous material. Altogether, this thesis highlights the vast and largely unrecognized diversity of feather mites harboured by seabirds, provides a comprehensive characterization of the patterns of seabird-feather mite species/lineages associations and contributes to a better understanding of the ecological and evolutionary processes that have lead to their high diversity.<br>Los ácaros de las plumas son unos de los ectosimbiontes más abundantes y comunes que se encuentran en casi todos los grupos de aves. Aunque han sido ampliamente estudiados a nivel taxonómico, mucha diversidad permanece sin ser descrita y todavía hay muchas preguntas abiertas sobre la biología, ecología y evolución de estos ectosimbiontes. Un mejor conocimiento de las comunidades de los ácaros de las plumas en diferentes niveles de su organización biológica puede contribuir a nuestra comprensión de la ecología evolutiva de las interacciones entre aves y ácaros, y de la evolución de la biodiversidad de los parásitos en general. El objetivo principal de esta tesis ha sido investigar los factores evolutivos y ecológicos que influyen la diversidad y la estructura de la comunidad de los ácaros de las plumas en aves marinas del Océano Atlántico y del Mediterráneo. Las especies de aves albergan una fauna de ácaros diversa y única compuesta por 38 especies perteneciendo a 10 géneros y tres familias. Cada género de ave albergaba una comunidad distinta de ácaros y solo tres especies de ácaros fueron compartidos por dos géneros cercanos de pardelas. Diecisiete de las 38 especies encontradas eran nuevas, no descritas; descripciones formales de seis especies están incluidas en esta tesis. Los datos moleculares correlacionaron bien con las descripciones morfológicas, pero también revelaron la presencia de seis especies cripticas pertenecientes a cuatro géneros de ácaros. Los patrones de la estructura genética de los ácaros fueron variables tanto entre los diferentes huéspedes simpátricos y entre la misma especie de huésped en diferentes regiones geográficas. La gran mayoría de las especies de ácaros de aves marinas simpátricas exhibió fuertes patrones de estructura genética asociados al huésped. Al comparar las comunidades de ácaros entre especies hermanas del mismo género de huésped, algunas especies de ácaros no estaban genéticamente estructuradas tanto entre huéspedes como entre localidades, mientras que otras especies presentaron diferenciación entre poblaciones. Estas diferencias observadas corresponden con el uso de microhabitats en el cuerpo del huésped. No se encontró ninguna diferenciación genética entre las localidades para los ácaros, sugiriendo que la dispersión de los ácaros se produce regularmente entre las poblaciones de huéspedes. La distribución de dos especies de ácaros que coocurren en las plumas del vuelo de Calonectris borealis mostró una clara segregación espacial entre plumas resultada de una combinación de adaptaciones específicas de hábitat y la competición en curso. Los análisis isotópicos de la dieta de los ácaros indicaron que las dos especies de ácaros comparten los mismos recursos alimenticios provenientes del huésped, probablemente aceite de la glándula uropígeal y material exógeno. En conjunto, esta tesis destaca la gran y poco conocida diversidad de los ácaros de las plumas albergada por las aves marinas y contribuye a una mejor comprensión de los procesos ecológicos y evolutivos que conlleva dicha alta diversidad.