Academic literature on the topic 'Extinction des espèces'

SummaryThe distribution of Tahitian landbirds in the early twentieth century and at presented here together with maps. Three categories may be recognized: (1) species with a declining distribution owing to changes in habitats (Green-backed Heron), (2) stable or increased species, including local and earlier introduced species, and (3) newly introduced species (Zebra Dove, Red-vented Bulbul, Silvereye and Crimson-backed Tanager). Moreover, owing to their low population numbers, two species, the Pacific Pigeon and the Tahiti Monarch, are on the verge of extinction even if their distribution has not changed notably during this century.Les repartitions des oiseaux terrestres reproducteurs de Tahiti, au début et à la fin du 20e siècle, sont présentées sous forme de cartes. Trois catégories d'espèces sont dis-tinguées: (1) espèce dont la répartition est en déclin a la suite des modifications d'habitats (Héron vert), (2) espèces stable ou en légère augmentation, chez qui on trouve des oiseaux locaux et des oiseaux introduits, et enfin (3) les espèces introduites durant le 20e siècle (Tourterelle striée, Bulbul à ventre rouge, Zosterops à poitrine grise et Tangara cramoisi). II apparaît que deux espèces, le Carpophage du Pacifique et le Monarque de Tahiti, sont aujourd'hui très menacées, même si leur répartition n'a pas régressé d'une façon significative.

Aujourd’hui, le monde fait face à une érosion importante de sa biodiversité ; le déclin des populations animales est si important qu’il est considéré par certains comme la sixième extinction de masse de la terre. L’homme, au travers de ses actions, est la cause principale de cette crise écologique et menace une biodiversité qui lui est pourtant indispensable. Agir pour la préserver devient donc primordial et passe par une meilleure connaissance des espèces à protéger. Ainsi, la science joue un rôle essentiel, notamment via trois disciplines spécifiques : l’écologie, qui étudie les êtres vivants en relation avec leur milieu naturel, l’éthologie, axée sur le comportement animal, et l’écophysiologie, qui s’intéresse aux adaptations physiologiques des êtres vivants aux changements de leur environnement. Ensemble, celles-ci permettent d’œuvrer pour la protection de la biodiversité grâce à une meilleure compréhension des espèces animales et de leur mode de vie qui conduit à mettre en place des actions de conservation spécifiques et réfléchies.

Cette étude porte sur deux espèces ligneuses à savoir Afzelia. africana et Isoberlinia. doka qui sont classées sur la liste des espèces vulnérables et menacées dans le monde. Elle a permis d’estimer l’état actuel desdites espèces dans le parc national de W. Ces espèces sont menacées de disparition dans toute l’Afrique. L’objectif visé a été d’étudier la structure de leur population dans le Parc National du W du Niger. Pour ce faire, trente (30) placettes carrées de dimension 30m*30m ont été installées suivant les pistes tracées du Parc W que nous avons considérées comme des transects. Les relevés phytosociologiques ont été réalisés selon la méthode sigmatiste de Braun-Blanquet (1932). L’installation de la placette dépend de la présence de l’une des deux espèces où de toutes les deux. Les placettes sont distantes de 500 m les une des autres. La superficie totale inventoriée était de 2,7 ha. Dans les placettes toutes les espèces ont été recensées et les mesures dendrométriques ont porté sur A. africana et d’I. doka. Au total 51 espèces reparties en 41 genres et 21 familles ont été recensées. En termes d’abondance, les familles les mieux représentées sont les Combretaceae (17,31%), les Mimosaceae (15,38%), les Ceasalpinoidea (9,61%). Dans la famille des cesalpinoidea les espèces Afzelia africana et Isoberlinia doka ont un taux de représentions de 5,64% dont Afzelia africana avec un taux de représentation de 4,07% contre 1,57% pour Isoberlinia doka. L’indice de diversité spécifique de Shannon et l’équitabilité de Pielou sont respectivement de 1,38 bit et de 0,8 ; ce qui montre que la végétation est moyennement diversifiée. La densité d’A. africana est de 45,17 pieds/ha et 17,49 pieds/ha chez I. doka, la régénération est de l’ordre de 75,92 pieds/ha chez A. africana et 31,11 pieds/ha chez I. doka. Les dimensions en diamètre et en hauteur pour chacune des espèces sont illustrées par des histogrammes en forme de cloche à travers l’ajustement de Weibull avec des dissymétries gauches caractéristiques des individus relativement jeunes. L’ajustement de Weibull montre également que les distributions en diamètre des deux espèces sont identiques. Les modes de régénération par drageons sont plus observés chez les deux espèces avec peu de cas de germination par graines chez A. africana. Cette étude a permis d’avoir des connaissances sur l’état actuel sur la présence desdites espèces au parc W. Cette étude a permis de disposer des connaissances scientifiques sur les deux populations et donc de proposer des mesures idoines de gestion durable des ces espèces dans les réserves périphériques au Niger. ABSTRACT This study focuses on two woody species namely Afzelia. africana and Isoberlinia. doka which are on the list of vulnerable and endangered species worldwide. It has made it possible to estimate the current status of these species in the National Park W. These species are threatened with extinction throughout Africa. The aim was to study the structure of their population in Niger's National Park W. To do this, thirty (30) square plots of 30m * 30m size were installed along the marked tracks of Park W that we considered as transects. The phytosociological surveys were carried out according to the sigmatist method of Braun-Blanquet (1932). The installation of the plot depends on the presence of one of the two species or both. The plots are 500 m apart from each other. The total area surveyed was 2.7 ha. In the plots all species were recorded and the dendrometric measurements were carried out on A. africana and I. Doka. A total of 51 species divided into 41 types and 21 families were identified. In terms of abundance, the best represented families are Combretaceae (17.31%), Mimosaceae (15.38%), and Ceasalpinoidea (9.61%). In the family of the Cesalpinoidea species Afzelia africana and Isoberlinia doka have a representation rate of 5.64% including Afzelia africana with a representation rate of 4.07% against 1.57% for Isoberlinia doka. The Shannon specific diversity index and the Pielou equitability are respectively 1.38 bit and 0.8; which shows that the vegetation is moderately diversified. The density of A. africana is 45.17 feet / ha and 17.49 plants / ha in I. doka, regeneration is in the order of 75.92 plants / ha in A. africana and 31.11 plants / ha in I. doka .The diameter and height dimensions for each of the species are illustrated by bell-shaped histograms through Weibull adjustment with left asymmetries characteristic of relatively young individuals. The Weibull adjustment also shows that the diameter distributions of the two species are identical. The sucker regeneration modes are more observed in both species with few cases of seed germination in A. africana. This study made it possible to have knowledge of the current state of the presence of these species at Park W. This study made it possible to obtain scientific knowledge on the two populations and thus to propose appropriate measures of these species sustainable management in the peripheral reserves in Niger.

La taxidermie est une pratique d’entre-mondes. Au service d’une perspective « simple » d’identification et de monstration des espèces en collections dans les muséums ou les cabinets, témoignage de la preuve dans le monde des chasseurs à travers l’alignement des trophées, à l’oeuvre pour la mémoire toujours déçue des compagnons disparus chez les particuliers ou les soigneurs, elle s’élabore toujours à l’interface de plusieurs attentes que le vivant seul pourrait concilier : la vérité du type, la justesse individuée, la grâce d’une rencontre. Qu’elle serve à la reconstitution d’espèces disparues ou à la construction de spécimens chimériques, à la conservation, à la publicité ou au marché kitsch, elle négocie sans cesse entre visible et invisible, elle saisit ce qui s’échappe et le perd dès qu’elle croit se l’être approprié. Elle trouble le regard et autorise un toucher inespéré mais pour le trahir aussitôt. Alors même qu’on s’attendrait à voir cette pratique s’effacer au profit du film, elle rencontre un nouvel engouement. On la trouve de plus en plus souvent intégrée aux dispositifs de l’art contemporain pour servir un discours critique sur la relation au vivant ou l’incarnation revendiquée d’une sensibilité proprement animale. La conscience des extinctions des espèces lui rend des vertus exceptionnelles. Elle est le plus souvent abordée selon sa réception. Mais cette étude s’attache prioritairement à la perspective du taxidermiste lui-même, dans son atelier, aux prises avec les corps, les techniques et les attentes. En Belgique (contrairement à ce qui se passe en France), il n’existe pas de formation au métier : la taxidermie fait l’objet d’une transmission intergénérationnelle dans certaines familles ou d’un compagnonnage où chacun affine ses observations anatomiques, éthologiques et ses compétences pragmatiques au « rendu ». Partant toujours de l’extériorité même du vivant, de l’indice, elle a vu se transformer ses savoir-faire et la demande qui lui était adressée. Elle témoigne des modifications de perception du monde animal comme des régimes d’identification ontologiques des hommes. Qu’est-ce que la pratique de la taxidermie fait au naturalisme dont elle est issue ? Quels liens, quels désirs, quelles connaissances et quelles passions met-elle en jeu ?

Le changement climatique constitue un grand défi à relever par les politiques publiques et les gestionnaires des espaces naturels. La compréhension de ses impacts sur les écosystèmes forestiers constitue un préalable nécessaire à toute réflexion visant leur conservation et le maintien des services écosystémiques qu’ils offrent. Cette étude s’est intéressée à la modélisation de la distribution potentielle de Cedrus atlantica Manetti, à l’identification des variables environnementales conditionnant sa distribution, et à la définition de l’étendue géographique des aires qui sont favorables à sa présence sous les conditions climatiques passées, actuelles et futures. Ce travail a été réalisé en se basant sur le principe d’entropie maximale. La cartographie des aires potentielles révèle la sensibilité du cèdre aux changements climatiques passés et suggère une grande étendue (quadruple de la surface d’occurrence actuelle de l’espèce) des zones bioclimatiquement adaptées au développement de cette espèce sous les conditions climatiques actuelles. Cependant, les distributions potentielles futures semblent être dépendantes de certains sites spécifiques et risquent d’être affectées négativement par le climat futur. Ces résultats mettent en évidence l’ampleur des régressions projetées des superficies du cèdre dans le futur, ce qui pourrait impacter considérablement les fonctions et services de cet écosystème et augmenter les risques d’extinction locale. Ils constituent par ailleurs un bon outil de prise de décision pour les gestionnaires du territoire quant à la conservation de ce précieux écosystème forestier, afin d’éviter toute extinction de ce foyer de biodiversité marocaine.

Pericopsis elata est une espèce ligneuse à grande valeur commerciale menacée d’extinction. Les plantations d’Assamela installées dans la Réserve Forestière de Deng-Deng en 1974 ont été abandonnées après leur mise en place. Dès lors, très peu de connaissances relatives au développement de ces peuplements sont disponibles. L’objectif de la présente étude est de contribuer à la compréhension des conditions de croissance de Pericopsis elata dans la réserve et induire un aménagement efficace. Trois inventaires exhaustifs ont été conduits, au cours desquels les données dendrométriques et structurales ont été collectées. Les indices de compétition de Hegyi, les semi-variogrammes et la distribution spatiale des tiges ont été analysés et interprétés. Les densités actuelles sont sans effet limitant pour la croissance des tiges. Les effets du milieu se révèlent comme étant le facteur qui a plus d’impact sur la croissance des tiges de Pericopsis elata. La plantation de recrû (33,21 cm), moins sensible à l’effet de la densité en termes de croissance comparée aux plantations des grands layons (26,91 cm et 26,89 cm), enregistre les meilleures performances de croissance en diamètre. Ainsi, des travaux d’entretien et des éclaircies portées vers une réduction considérable des compétitions interspécifique et intra spécifique sont nécessaires.Mots clés : Indice de Hegyi, méthodes sylvicoles, modes de compétition, plantations équiennes, semi-variogramme, Cameroun. English Title: Characterization of the competition and growth of Pericopsis elata (Harms) Van Meeuven in the plantations of the Deng-Deng Forest Reserve (East, Cameroon)Pericopsis elata is a valuable woody species threatened with extinction. The Assamela plantations established in the Deng-Deng Forest Reserve in 1974 were abandoned after their establishment. As a result, very little knowledge about the development of these stands is available. The objective of the present study is to contribute to the understanding of the growing conditions of Pericopsis elata in the Reserve and to induce proper management. Three exhaustive inventories were conducted, during which dendrometric data were collected. Hegyi’s competition indices, variograms and spatial distribution of stems were developed. Current densities have no limiting effect on stem growth. Environmental effects were found to be the factor that had the greatest impact on the growth of Pericopsis elata stems. The recruiting plantation (33.21 cm), which is less sensitive to the effect of density in terms of growth compared to the large layon method (26.91 cm and 16.89 cm), has the best growth in diameter performance. Thus, maintenance work and thinning leading to a considerable reduction in interspecific and intraspecific competition is necessary.Keywords: Regular plantations, Hegyi’s competition index, mode of competition, Silvicultural methods, semi-variogram, Cameroon.

Centaurea corymbosa pourret (asteraceae) est une espèce végétale endémique de seulement 3 km#2, sur le massif de la Clape, dans l'Aude. Six populations, qui occupent des falaises calcaires, distantes de 300 m a 2 km, comprennent chaque année de quelques individus reproducteurs a environ 200, pour un total de 500. Afin de comprendre le fonctionnement des populations de cette espèce, dans une perspective de conservation, une approche multi-disciplinaire a été utilisée. La synthèse de résultats démographiques, écologiques, et de génétique des populations, nous permet de mieux comprendre les causes et les conséquences de la rareté de C. Corymbosa. C. Corymbosa est probablement issue d'une espèce répandue, C. Maculosa. Isolée depuis longtemps, C. Corymbosa s'est morphologiquement différenciée de C. Maculosa, et adaptée au milieu particulier que représentent les falaises du massif de la Clape. Actuellement, la métapopulation C. Corymbosa a une dynamique très lente étant donné la faible aptitude colonisatrice de l'espèce, due à la faible dispersion des graines, à l'auto-incompatibilité, et à la monocarpie. Il y a peu de chances que ces caractéristiques évoluent étant donné la structure du paysage et la rareté des événements de fondation, bien que de nombreux sites inoccupés, à proximité des populations naturelles, semblent favorables à l'espèce, comme l'ont montré les résultats préliminaires d'une introduction expérimentale. La survie de l'espèce semble donc dépendre de la viabilité des six populations actuelles, qui échangent peu de gènes et sont de petite taille ; elles sont donc soumises à une forte dérive génétique, et les individus y sont probablement assez consanguins. Il semble que la production de graines soit un facteur clé dans les fortes variations d'effectifs observées dans les populations. La production de graines est essentiellement limitée par la disponibilité des ressources et des pollinisateurs. La prédation joue un rôle négligeable. Il est possible également que, dans les plus petites populations, de faibles taux de fécondation résultent d'une faible diversité allélique aux locus d'incompatibilité, et les forts taux d'avortement, d'un fardeau de mutation élèvé. Nous discutons des implications de ces résultats pour la conservation de C. Corymbosa.

La biodiversité mondiale est victime d'une crise d'extinction majeure qui s'accompagne indéniablement d'une crise morale pour l'humanité. Nous avons ainsi été menés à comprendre dans quelle mesure la disparition des espèces constituait un objet légitime de souci éthique et quels arguments philosophiques étaient avancés pour justifier la protection des espèces. Il nous a aussi fallu saisir les causes historiques de cette tardive prise de conscience écologique de l'humanité, qui, jusque là, avait provoqué l'extinction de centaines d'espèces sans s'en soucier. Nous avons donc retracé à l'échelle de l'histoire humaine la lente élaboration intellectuelle de l'idée d'extinction ainsi que la formalisation scientifique de ce concept. Enfin, nous avons tenté de cerner la notion d'extinction, grâce à l'idée de mort individuelle, par une démarche phénoménologique et épistémologique comparée, ce qui nous a conduit à formuler une solution originale aux problématiques de conservation de la nature
Global biodiversity is presently falling victim to a major extinction crisis, which also implicates a moral crisis for the human species. In this work, we attempt to understand the extent to what the extinction of species is a legitimate subject of moral concern and we consider which philosophical arguments are formulated to justify the protection of species. We also investigate the historical causes behind this delayed awareness of the ecological significance of extinction. Both the slow intellectual development of the idea of extinction thoughout human history and the scientific emergence of the concept are explained. Finally, we investigate the notion of extinction through the idea of individual death. We employ a comparative phenomenological and epistemological approach towards death and extinction, which leads us to expound an original solution to the isuue of nature conservation

La rarefaction progressive des espèces de faune et de flore a conduit le législateur, aussi bien en France qu'à l'étranger, à s'interroger sur les outils juridiques à même d'enrayer ce processus. Limitées à la seule réglementation du prélèvement et du commerce, les mesures de protection sont néanmoins vite apparues insuffisantes. C'est la raison pour laquelle cette vision analytique tend maintenant à laisser place à une approche plus synthétique qui tente d'appréhender l'ensemble des menaces auxquelles sont confrontées les espèces. De telles mesures, parce qu'elles sont parfois susceptibles d'entrer en conflit avec des interêts acquis, ne deviendront toutefois légitimes qui si elles reposent sur des fondements juridiques solides. Au niveau national, la reconnaissance que la protection de la nature est d'intérêt général pourrait remplir cet office. Cet intérêt ne saurait toutefois se limiter au territoire national et aux générations présentes comme en temoigne la référence de plus en plus fréquente au concept de patrimoine commun de l'humanité
It is now obvious that fauna and flora are more and more threatened. To reverse this trend, governments have tried to develop legal mechanisms. It is nevertheless clear that the prohibition of the taking and trade of individuals animals and plants can not achieve this goal by its own. It's why it is clearly essential that legislator should adress all threats to a species. But, because, theses measures impose restrictions on public freedoms and private property and limits certain activities, they are not always very popular. Or, it is essential to facilitate the acceptance of conservation need by laying down a clear duty for the state and its citizens to preserve biological diversity or, at international level, by using the concept of common humankind which encompasses present and future generations

Une des caractéristiques essentielles de la biodiversité est la dominance des espèces rares et petites dans les communautés. Ces espèces sont également les moins étudiées. Par ailleurs, environ 1,75 million d’espèces sont connues, mais le nombre total d’espèces vivantes dépasse sans doute 10 millions, peut-être bien davantage. Enfin, il est maintenant établi que nous vivons une crise d’extinction majeure dans l’histoire de la vie. La documentation de la biodiversité est donc urgente, ne serait-ce que pour pouvoir mieux la préserver. C’est aux taxonomistes que revient cette tâche, puisque ce sont eux qui découvrent et décrivent les espèces, mais leur discipline souffre d’un grave manque de main-d’oeuvre et d’infrastructures. Face à ce triple constat (lacunes des connaissances sur la biodiversité, crise d’extinction, handicap taxonomique), nous nous interrogeons sur le rôle que peuvent jouer les taxonomistes pour la conservation. Le coeur du travail du taxonomiste est constitué de deux grandes étapes : discriminer les espèces, puis les nommer. La discrimination des espèces les unes par rapport aux autres, avant de les nommer, permet de dégager rapidement les caractéristiques des communautés sur la richesse spécifique, la rareté et la taille des espèces et peut aider au choix des sites à protéger. Lorsque les espèces sont nommées, il est possible d’évaluer l’endémisme et les statuts de menace, afin d’orienter les actions de conservation. Nous illustrons ces contributions de l’apport des taxonomistes à la conservation par des articles issus d’inventaires des mollusques terrestres au Gabon et en Polynésie française. Enfin, l’analyse de la base de données Fauna Europaea, compilée par des taxonomistes, est l’occasion de montrer que les indicateurs habituellement utilisés pour mesurer l’état de la biodiversité font l’impasse sur la majorité des espèces, et ne remplissent donc que partiellement leur rôle. La dernière partie de cette thèse aborde l’intérêt et la faisabilité d’une nomenclature scientifique française pour les mollusques de France, pour favoriser la conservation de ces espèces méconnues à forte valeur patrimoniale. Pour les espèces les plus nombreuses et les moins connues, les taxonomistes sont les seuls à pouvoir apporter des informations sur la richesse spécifique ou les patrons d’endémisme. Ils permettent donc de prendre en considération l’ensemble de la biodiversité, et non uniquement les grands vertébrés et les plantes supérieures. Dans ce contexte, avec les biologistes des populations, les généticiens et les écologues, ils ont un rôle de premier plan à jouer dans la conservation de la biodiversité
The abundance of rare and small species is a characteristic of biodiversity, and these species are the least known. Moreover, ca. 1. 75 million species are known, but the global magnitude of biodiversity is probably over 10 million species, maybe many more. Last but not least, we are experiencing a major extinction crisis. Documenting biodiversity is thus a priority, if only to preserve it. Taxonomists are responsible for this documentation, as these are the ones who discover and describe species, but they suffer from a lack of manpower and infrastructure. Considering these facts (lack of knowledge on biodiversity, extinction crisis, taxonomic impediment), we examine the role taxonomists could play in conservation. The core of taxonomical work is double: discriminating species, and naming them. Discriminating species, before naming, gives data on species richness, rarity and size patterns, and could help the choice of conservation areas. When species are named, assessing endemism and threat status is possible, which also allows to orientate conservation actions. We illustrate these contributions to conservation with papers presenting results of terrestrial mollusc inventories in Gabon and French Polynesia. We then analyze the Fauna Europaea database, compiled by taxonomists, which shows that the indicators usually used to measure the state of biodiversity are missing most species and give a partial image of the situation. This thesis ends with an assessment of the interest and possibility of having a French scientific nomenclature for the molluscs of France, to facilitate conservation of poorly-known threatened species. Only taxonomists can deliver data on specific richness and patterns of endemism for the most numerous and least known species. Their contribution allows to take into account all biodiversity, and not only large vertebrates and flowering plants. In this framework, their role is crucial in conservation biology, together with population biologists, geneticists and ecologists

De nombreux travaux mettent en lumière la surexploitation des ressources halieutiques dans le monde. Ce phénomène, initié depuis plusieurs décennies, se traduit de nos jours par une crise majeure dans le secteur de la pêche. En Atlantique, la langouste rouge est devenue une capture accessoire en raison d’une pêche intensive. En Corse, Palinurus elephas fait l’objet d’une pêche ciblée par une petite flottille composée de petits métiers. C’est l’espèce qui présente la plus forte valeur marchande et qui est recherchée par la grande majorité des pêcheurs artisans durant les 7 mois d’ouverture de la pêche. Or, si la pêche artisanale dans l’île semble constituer un modèle de pêche durable telle que le prône les politiques les plus récentes en matière d’halieutique, il semble que la population de Palinurus elephas ait régulièrement décliné depuis les années 1950. Ainsi, dans le but de mieux appréhender les causes de cette crise langoustière, cette thèse tentera de comprendre si le déclin de la population de Palinurus elephas est le résultat d’un problème de surpêche. De même, ce travail aura pour but de savoir s’il faut envisager ce déclin comme la résultante d’un processus multifactoriel, impliquant, outre la pêche, des raisons biologiques, écologiques ou encore climatiques. Pour cela, un effort bibliographique conséquent a été réalisé dans le but de posséder de bonnes connaissances sur la biologie et l’écologie de la langouste rouge en particulier et des Palinuridae en général. De même, les données anciennes d’effort de pêche et de captures ont été recherchées dans la littérature afin de mieux retracer l’historique de la pêche insulaire. Enfin, les données halieutiques récentes ont été collectées par un réseau d’enquêteurs présents sur l’ensemble du littoral insulaire durant toute la durée de la période de pêche à la langouste. Ces données ont été récoltées directement à bord des bateaux de pêche professionnelle pendant 8 années, de 2004 à 2011. Dans une première étape, les données récentes couplées aux travaux plus anciens ont permis de suivre l’évolution de la flottille de pêche insulaire au cours des dernières décennies. De même, ces données ont été utilisées pour reconstituer l’évolution des captures de langouste et d’effort de pêche en terme d’engins mis à l’eau. Les résultats de cette étude montrent une importante diminution des débarquements au cours du 20e siècle. Cette tendance s’est amplifiée dans les années 60 quand les filets trémails en nylon ont été introduits et se sont substitués progressivement aux nasses traditionnelles. Pourtant, l’effort de pêche porté sur ces crustacés semble avoir régressé depuis un demi siècle. Dans un second temps, il semblait nécessaire d’avoir une vision plus fine dans l’île pour mieux comprendre le fonctionnement de la pêche insulaire et l’exploitation de la langouste rouge. Ainsi, l’analyse microrégionale des données a permis de mettre en avant la variabilité de l’exploitation des différentes zones de pêche dans l’île. De même, l’évolution des rendements des filets de pêche durant huit années a montré une forte variabilité interannuelle et intersectorielle. Ce phénomène est probablement induit par les fluctuations du recrutement, un processus encore mal compris chez les Palinuridae. Plusieurs études biologiques portant sur la maturité sexuelle, l’éclosion, les larves et les post-larves ont ensuite été réalisées en première approche. Ces travaux ouvrent des perspectives pour la poursuite des recherches sur la biologie méconnue de ces crustacés. Enfin, toutes ces données bibliographiques, halieutiques et biologiques sont discutées dans le cadre de la gestion de la pêche, l’objectif étant de retrouver durablement un stock robuste de langouste sans mettre à mal la viabilité des entreprises de pêche
Numerous studies have dealt with the decrease of marine resources across the world. This decrease started many years ago, and caused a currently observed major crisis in the fishing industry. On the coasts of the North-eastern Atlantic, notably in Brittany, Plinurus elephas has been traditionally exploited. However, the red spiny lobster is now a bycatch because of its excessive fishing. In Corsica, the small-scale fishing fleet is mostly composed of little artisanal boats. Of all caught species, Palinurus elephas is the most valuable one, and, as a result, it is targeted by most fishmen during the 7-months fishing season. Most recent fisheries management studies agre with the view that in Corsican the coastal fleet seems to be a model of sustainable exploitation. However, the red spiny lobsters populations seem to decrease since the 50's. In this context, the aim of this thesis is to understand if the decline of Plinurus elephas population is a consequence of overfishing. This population drop could indeed be caused by several biological, ecological or climatic reasons. To achieve this goal, we started with a thorough, in-deep examination of available literature. An important part of this study consisted in collection of past biological and ecological data about European spiny lobster species and, more generally, Plinuridae. We also looked for old data concerning fishing effort and captures, at different levels : official numbers, scientific articles, local institution reports or other confidential documents. Finally, since 2004, an on-board monitoring programme took place for collection of reliable information; Fleet characteristics, capture and fishing effort data, as well as lobster population structure were studied. We first used old and recent data to follow fleet evolution since the last century. These data were also used to reconstruct captures and fishing efforts from 1950 to 2011. Our results point out an important capture decrease during the 20 th century. This trend started during the 1950's and 1960s, when trammel nets were introduced and substitued to traditional wood traps. The fishing effort (i. E. , the number of lobster nets) nevertheless seemed to decrease accordingly. Results from this first step indicated that a micro-regional analysis was necessary for a correct perception of the Corsican spiny lobster fisheries. This analysis revealed that exploitation intensity widely varied among different areas around the island. Moreover, landings and catch rates showed an important spatial and temporal variability. This could be caused by changes in recruitement. However, recruitement processes of this species are still poorly understood. To fill this gap, several biological investigations were carried out. We focused on sexual maturity, hatching behaviours, and larval and post-larval stages. These results improve our understanding of population parameters, and open different perspectives for future research. Finally, all the data collected during this thesis are discussed from the management strategies point of view, with the double objective of 1) allowing spiny lobster populations to reach a sustainable level and 2) preserve the traditional fishing activity in Corsica

Les changements climatiques actuels reçoivent une attention grandissante mais leurs impacts sur la biodiversité restent mal appréhendés. Cette thèse a permis de mettre en évidence une réponse cohérente des poissons d'eau douce au réchauffement climatique des dernières décennies se traduisant par des remontées en altitudes et vers les sources. Il est cependant apparu que des facteurs non-climatiques avaient majoritairement contribué aux changements observés, ce qui pourrait indiquer l'existence de délais importants dans la réponse des espèces et avoir des conséquences importantes pour leur capacité à faire face aux changements climatiques à venir. Néanmoins, certains mécanismes en lien avec des caractéristiques clés des espèces et leur histoire évolutive semblent conditionner leur capacité à persister in situ ou à suivre leur niche climatique. Ces résultats pourraient avoir des implications importantes quant à notre capacité à anticiper les changements à venir et à initier des politiques de gestion adaptées, dont les missions futures ne peuvent désormais plus être conçues sans tenir compte de l'évolution du climat
Despite increasing recognition that recent climate changes are influencing biodiversity, the specific impacts of those changes are still largely unknown. This thesis highlights systematic stream fish species shifts towards higher elevation and upstream habitats, consistent with the geographic variation associated with climate change. The results demonstrated, however, that patterns in climate-driven range shifts were less marked than those attributed to non-climatic drivers, suggesting more severe longer-term effects of climate warming on stream fish and profound consequences on the ability of species to cope with future climate modifications. Nevertheless, the results also provide evidence that several mechanisms are linked to species' evolutionary history and some key biological and ecological traits, allowing species to persist in situ or to track their climatic niche through space. These research findings improve our ability to anticipate future climate change-induced impacts and will assist with initiating effective conservation and management strategies, which can no longer be effectively designed without taking into account climate change

Pour évaluer l'impact de la glaciation ashgillienne sur les microfossiles organiques nord-gondwaniens, 156 échantillons prélevés, à limite Ordovicien-Silurien, en Algérie, Maroc, République tchèque et le Massif armoricain ont été analysés. Les crises fauniques du Permo-Trias et Frasnien-Famennien sont brièvement discutées. La biostratigraphie des coupes, basée sur les chitinozoaires, pour fixer la chronologie des événements recensés a été réalisée. L' essentiel de l'étude porte sur la quantification et l'interprétation du comportement du plancton sous les effets d'un stress climatique majeur. Trois périodes principales de fluctuations de la biodiversité et de l'abondance ressortent dans les assemblages de ces microfossiles. La période pré-glaciaire accuse une forte abondance et diversité de ces derniers. La période glaciaire se traduit par l'appauvrissement des populations de chitinozoaires, d'acritarches et sphaeromorphes. Aucune extinction massive en lien direct avec la glaciation n'est enregistrée. La période post-glaciaire enregistre un regain de diversité. La récupération faunique silurienne est perturbée par l'anoxie.

Les radiations évolutives sont des phénomènes de diversification rapide, et une source majeure de la diversité biologique sur Terre. J'explore ici l'hypothèse selon laquelle les mécanismes écologiques et génétiques à la base des radiations évolutives structurent les patrons macroécologiques et macroévolutifs de diversité. Pour ce faire, j'analyse les prédictions de plusieurs modèles de radiation émergeant des dynamiques spatio-temporelles à l'échelle individuelle. Ces analyses montrent d'abord que la structuration spatiale est un facteur majeur de diversité et d'endémisme au sein des archipels océaniques, en raison d'interactions entre dispersion et spéciation allopatrique. L'intégration de la dynamique des paysages et des processus d'interactions compétitives révèle ensuite comment ces facteurs se combinent pour structurer la forme des arbres phylogénétiques, et notamment générer des arbres déséquilibrés et une décélération du tempo de branchement, souvent observés dans les phylogénies moléculaires. J'explore alors les mécanismes responsables de cette décélération. Je montre qu'elle reflète une diversité-dépendance négative du taux de spéciation, liée à une réduction de la persistance et différentiation écologique des nouvelles populations. Le taux d'extinction n'est lui pas influencé par la diversité, les extinctions étant ici surtout causées par une combinaison d'exclusion compétitive et d'hybridation d'espèces incipientes. Enfin, je mets en évidence l'importance, lors d'une crise d'extinction, de la topologie rangée des arbres phylogénétiques et de la distribution des extinctions sur les pertes de diversité phylogénétique, et donc sur le potentiel d'évolution future
Evolutionary radiations are phenomena of rapid diversification, and one of the major sources of biodiversity on Earth. Here, I explore the hypothesis that ecological and genetic mechanisms underpinning evolutionary radiations structure macroecological and macroevolutionary patterns of diversity. To this end, I analyse the predictions of several models in which radiations emerge from spatio-temporal dynamics at the scale of the individual. These analyses first show that spatial structure is a major driver of diversity and endemism on oceanic archipelagos due to interactions between dispersal and allopatric speciation. Second, by integrating landscape dynamics and the processes of competitive interactions, I reveal how these factors combine to shape phylogenetic trees, and in particular to beget trees that are unbalanced and exhibit a deceleration in branching tempo, which is often observed on molecular phylogenies. I then explore the mechanisms responsible for this deceleration. I show that it reflects a negative diversity-dependence of the speciation rate, itself linked to a reduction in the persistence and ecological differentiation of new populations. The extinction rate is, on the other hand, uninfluenced by species diversity, extinctions being here mainly caused by a combinaison of competitive exclusion and hybridization of incipient species. Finally, I show that during mass extinctions the ranked topology of phylogenetic trees and the distribution of extinctions among the tips have a strong impact on the loss of phylogenetic diversity, and hence on the potential for future evolution

P. Apollo (linnaeus, 1758) est une espece emblematique des montagnes francaises. Un severe declin a ete enregistre dans de nombreuses populations de p. Apollo. Nous avons choisi de developper plusieurs axes dans ce travail de recherches en essayant de faire le lien entre recherche fondamentale et biologie de la conservation. Cette etude aborde l'ethologie de l'espece, elle a permis de mettre en evidence des differences marquees entre le comportement des imagos males et femelles. Des experiences sur la valeur trophique des plantes nourricieres ont revele des differences notables entre l'efficacite trophique de certaines especes de sedum. Les transects se sont averes un outil interessant pour le suivi des populations de p. Apollo en france. Les resultats de trois annees de suivi sont exposes, des cartographies dans le parc national des ecrins et le parc national des cevennes ont ete realisees. Elles mettent en evidence un statu tres different de l'espece suivant les massifs. Les captures-marquages-recaptures (cmr) ont permis d'etudier la dynamique de deux populations importantes, a la chau et a drigas. On notera de grandes variations dans la phenologie et dans les effectifs saisonniers, entre stations, mais egalement d'une annee sur l'autre. La repartition des individus sur le site s'effectuant principalement en rapport avec les plantes nourricieres des chenilles. Les relations et flux geniques interspecifiques ont egalement ete abordes en etudiant l'hybridation avec p. Phoebus. La derniere partie est consacree a un aspect plus applique, lie a la biologie de la conservation de l'espece p. Apollo. Nous proposerons des elements pour l'elaboration de plans d'action.