Dissertations / Theses: 'Fungi isolates'

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Lau, Ching-lai, and 劉清麗. "Identification of pathogenic fungal isolates by ITS sequencing." Thesis, The University of Hong Kong (Pokfulam, Hong Kong), 2013. http://hdl.handle.net/10722/193540.

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Abstract:

In clinical microbiology laboratories, the conventional method for identification of pathogenic fungi is based on fungal culture and observation of fungal phenotypic characters. However, it is time-consuming, subjective and unreliable due to the long incubation period and variations in fungal colony morphology. Thus, there is a need for a rapid, objective and accurate identification of pathogenic fungal isolates. ITS regions are most commonly used targets for molecular identification of fungal pathogens because of the optimal inter- and intra-species variations and large copies in fungal genome. In this study, twenty-two clinical fungal isolates were identified using the phenotypic method and ITS sequencing. The results showed that there were only thirteen isolates identified to species level by phenotypic method, while others were only differentiated in genus level. Due to the poor differentiation based on the conventional phenotypic approach, misidentification of fungal pathogens occasionally occurred. However, ITS sequencing successfully achieved accurate species-level identification of all fungal isolates. The results were demonstrated in phylogenetic trees with high bootstrap support. In conclusion, ITS sequencing is a rapid and reliable for the identification of pathogenic fungal isolates. published_or_final_version Microbiology Master Master of Medical Sciences

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Clipston, Julie. "An investigation into the production by marine-derived fungi of secondary metabolites with pesticidal activities." Thesis, University of Portsmouth, 2001. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.343340.

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McCabe, Bernadette K., of Western Sydney Macarthur University, and Faculty of Business and Technology. "Production of cellulolytic enzymes using immobilised anaerobic fungi." THESIS_FBT_XXX_Mccabe_B.xml, 1998. http://handle.uws.edu.au:8081/1959.7/83.

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Abstract:

An investigation was made into the isolation and screening of highly cellulolytic anaerobic fungi and their production of cellulolytic enzymes using immobilised rhizomycelia. A total of 46 anaerobic fungi were isolated on cellulosic substrates from ruminant and non-ruminant herbivores. Primary screening of these isolates was performed using dye release from cellulose-azure which qualitatively detected cellulolytic activity. Twelve isolates were chosen on the basis of their maximum solubilisation rates of the labelled cellulose and then subjected to secondary screening which involved the quantification of enzyme activity. The enzyme mixtures were characterised by carboxymethylcellulase, xylanase, B-glucosidase, B-xylosidase and cellobiase assays, measured by the production of either reducing sugars, p-nitrophenol or glucose. All strains produced a number of enzymes that allowed them to hydrolyse straw and highest enzyme activity was measured in static cultures grown on 0.5% straw. A monocentric isolate, Piromyces strain KSX1 from a red kangaroo, and a cattle polycentric isolate, Orpinomyces strain 478P1, were selected for study of cellulolytic enzyme production on the basis of high fibre digestion capability and amenability toward encapsulation. The immobilised polycentric strain proved to be operationally superior to strain KSX1 as strain 478P1 did not produce any viable growth in the culture liquor. Studies into single batch cultures of free cells of strains KSX1 and 478P1 revealed that the maximum specific rate of B-glucosidase production occurred concomitantly with maximum specific growth rate suggesting that the immobilised fungus must grow for continuous enzyme production to occur. Although the physiology of cellulase synthesis in strains KSX1 and 478P1 was found to be growth-associated, immobilisation of the fungus offered the advantage of the repeat-batch use of cells with the accumulation of extracellular enzymes after each batch. Thus, operational gains were the key issues in assessing the potential application of immobilised anaerobic fungi in the production of cellulolytic enzymes. The repeat-batch system was operationally more efficient than the free cell batch cultures because immobilisation removed the need of reculturing the cells for every single batch. Doctor of Philosophy (PhD)

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Giraldo, López Dixie Alejandra. "Taxonomic study of clinical and environmental isolates of arthroconidial, acremonium-like and ochroconis-like fungi." Doctoral thesis, Universitat Rovira i Virgili, 2015. http://hdl.handle.net/10803/292251.

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Abstract:

En aquets tesis es vol enfocar en l'estudi dels géneres fúngics Acremonium, Arthrographis, Arthropsis, Ochroconis, Sarocladium, Scytalidium i Verruconis. Alguns d'ells són ocasionalment aïllats de mostres clíbiques, encara què, l'espectre real de les seves espècies en l'area clínica es poc coneguda, sumant-li la seva difícil identificació i complexa taxonomia. Es van estudiar un total de 248 aïllats, 131 obtingust de mostres clíniques o de sòls i 117 corresponents a soques tipus o de referència de col.leccions internacionals de cultius. La caracterizació fenotípica dels aïllats es va realitzar a traves de l'observació de les seves característiques macroscópiques i microscópiques. La identificació molecular, mitjacant la seqüenciació de les regions ribosomals ITS i LSU. Per obtenir una millor resolució filogenética entre algunes espècies, es van seqüenciar regions parcials d'altres gens (actina, tubulina, factor de elongació, RNA polimerasa i quitina sintasa). L'activitat in vitro d'alguns antifúngics va a ser evaluata front a espècies de Arthrographis, Arthropsis, Ochroconis i Scytalidium. Apart de les espècies comunment conegudes com a patògens oportunistes A. kalrae i V. gallopava, altres espècies no conegudas previament a partir de mostres clíniques vàren ser identificades (Arthropsis hispanica, Sarocladium terricola, Scytalidium cuboideum i Ochroconis cordanae). Incluint les noves espècies descrites aquí: Acremonium dimorphosporum, A. moniliforme, Arthrographis chlamydospora, A. pseudostrictum i S. subulatum. Adicionalment, quatre géneres nous, Acremoniopsis, Brunneomyces, Cervusimilis i Collarina i 16 nous taxons, Acremoniopsis suttonii, Acremonium asperulatum, A. citrinum, A: parvum, A: pilosum, A. variecolor, Brunneomyces brunnescens, B. hominis, B. europaeus, Cervusimilis alba, Collarina aurantiaca, Ochroconis icarus, Sarocladium gamsii, S. implicatum, S. summerbellii i S. terricola, vàren ser descrits de mostres de diferents origens. En general, les proves de sensibilitat antifúngica mostrar que la terbinafina va ser la droga més activa davant les espècies avaluades, excepte per S. cuboideum, on el posaconazol va a mostrar la millor activitat En esta tesis nos enfocamos en el estudio de los géneros fúngicos Acremonium, Arthrographis, Arthropsis, Ochroconis, Sarocladium, Scytalidium y Verruconis. Algunos de ellos son ocasionalmente aislados de muestras clínicas, sin embargo, el espectro real de sus especies en el área clínica es poco conocido, sumado a su difícil identificación y compleja taxonomía. Se estudiaron un total de 248 aislados, 131 obtenidos de muestras clínicas o de suelos y 117 correspondientes a cepas tipo o de referencia de colecciones internacionales de cultivos. La caracterización fenotípica de los aislados se realizó a través de la observación de sus características macroscópicas y microscópicas, y la identificación molecular, mediante la secuencación de las regiones ribosomales ITS y LSU. Para obtener una mejor resolución filogenética entre algunas especies, se secuenciaron regiones parciales de otros genes (actina, tubulina, factor de elongación, RNA polimerasa II y quitina sintasa). La actividad in vitro de varios antifúngicos fue evaluada frente a especies de Arthrographis, Arthropsis, Ochroconis y Scytalidium. Aparte de las especies comunmente reportadas como patógenos oportunistas, Arthrographis kalrae y Verruconis gallopava, otras especies no reportadas previamente a partir de muestras clínicas fueron identificadas (Arthropsis hispanica, Sarocladium terricola, Scytalidium cuboideum y Ochroconis cordanae), incluyendo las nuevas especies descritas aquí: Ochroconis olivacea, O. ramosa, Sarocladium bifurcatum, S. hominis, S. pseudostrictum y S. subulatum. Adicionalmente, cuatro géneros nuevos, Acremoniopsis, Brunneomyces, Cervusimilis y Collarina, y 16 nuevos taxones, Acremoniopsis suttonii, Acremonium asperulatum, A. citrinum, A. parvum, A. pilosum, A: variecolor, Brunneomyces brunnescens, B. hominis, B. europaeus, Cervusimilis alba, Collarina aurantiaca, Ochroconis icarus, Sarocladium gamsii, S. implicatum, S. sumerbellii y S. terricola, fueron descritos de muestras de diversos orígenes. En general, las pruebas de sensibilidad antifúngica revelaron que la terbinafina fué la droga más activa frente a las especies evaluadas, excepto para S. cuboideum, donde el posaconazol mostró la mejor actividad. In this thesis, we have studied the fungal genera Acremonium, Arthrographis, Arthropsis, Ochroconis, Sarocladium, Scytalidium and Verruconis. Some of them are occasionally recovered from clinical specimens, but the real spectrum of their species in the clinical setting is poorly known. Furthermore, the scarce morphological differentiation of their species make difficult their identification and taxonomy. A total of 248 isolates were studied. 131 obtained from clinical or soil samples and 117 corresponding to type or reference strains from international culture collections. Phenotypical characterization was performed by the observation of their macroscopic and microscopic features in artificial media. Molecular identification was assessed by sequencing of two ribosomal regions (ITS and partial LSU). To obtain deeper phylogenetic resolution of some species, fragments of different loci were also used (actin, tubulin, translation elongation factor, RNA polymerase II and chitin syntase). The in vitro activity of several antifungal drugs was evaluated against Arthrographis, Arthropsis, Ochroconis and Scytalidium species. Apart from the commonly reported opportunistic species Arthrographis kalrae and Verruconis gallopava, other species never associated before to clinical specimens were identified (Arthropsis hispanica, Sarocladium terricola, Scytalidium cuboideum, Ochroconis

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Mativandlela, Sannah Patience Nkam. "Evaluation of isolates and identified phenolics from pelargonium sidiodes against tuberculosis, other bacteria and fungi." Pretoria : [s.n.], 2005. http://upetd.up.ac.za/thesis/available/etd-02132006-113925.

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Mativandlela, S. P. N. (Sannah Patience Nkami). "Evaluation of isolates and identified phenolics from Pelargonium Sidoides against Mycobacterium Tuberculosis, other bacteria and fungi." Diss., University of Pretoria, 2005. http://hdl.handle.net/2263/28446.

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Abstract:

Anecdotal evidence of two South African Geranium species (Pelargonium reniforme and Pelargonium sidoides) from the United Kingdom with regard to plants being used against tuberculosis, which lacked scientific evidence’ prompted us to investigate these two plants for their antimicrobial properties. The German herbal remedy (‘Umckaloabo’) is prepared from these two plant species and is currently being sold for bronchitis. Acetone, chloroform and ethanol extracts were investigated against three bacteria (pathogens causing bronchitis), three fungi (fungal species associated with the upper and lower respiratory tract) and Mycobacterium tuberculosis. This is the first report on the extracts’ activity against Moraxella catarrhalis, and three fungi (Asperigilus niger, Rhizopus stolonifer and Fusarium oxysporum). Acetone and ethanol root extracts of P. sidoides and its combination with P. reniforme exhibited activity against bacteria at 5.0 mg/ml concentration. The fungi were significantly inhibited by the acetone and ethanol extracts of P. reniforme and the ethanol extract of P. sidoides at a concentration of 5.0 mg/ml. Antituberculosis activity was observed on acetone, chloroform and ethanol root extract of P. reniforme and chloroform extract of P. sidoides at 5.0 mg/ml concentration. The isolation and purification of compounds were attempted using two different approaches, of which the second approach resulted in isolation of four compounds and two flavonoids. One flavonoid (epigallocatechin) is isolated for the first time from P. sidoides. Laboratory investigations showed no activity of compounds isolated against M. tuberculosis. As Mycobacteria are intracellular pathogens, antimycobacterial activities may be due to either direct or indirect effects. Though the compounds in this study did not show antituberculosis activity, it can be speculated that the anecdotal evidence of TB-patients could be due to their immunostimulant activity. Dissertation (MSc (Plant Physiology))--University of Pretoria, 2005. Plant Science unrestricted

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Júnior, Giovani Marcio Coura. "Análise integrada das variáveis virulência e produção de conídios na seleção de fungos entomopatogênicos para o desenvolvimento de biopesticidas." Universidade de São Paulo, 2017. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11146/tde-16082017-135321/.

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Abstract:

Os fungos entomopatogênicos do gênero Metarhizium e Beauveria compreendem um importante grupo de patógenos de artrópodes-praga. A seleção de isolados de fungos promissores é a primeira e uma das mais importantes etapas no desenvolvimento de um biopesticida, pois alguns isolados podem apresentar alta virulência e não necessariamente boa produção em substrato e vice-versa, sendo interessante a combinação desses dois parâmetros para a viabilidade comercial de um produto. A dificuldade de criação ou manutenção de algumas espécies de pragas em laboratório é um limitante para a condução de testes de virulência, tornando-se interessante a utilização de espécies modelo, de fácil criação, nas etapas preliminares de seleção. Nesse sentido, este estudo objetivou selecionar isolados com alta produção de conídios e virulência, comparando a eficiência de controle de M. anisopliae e B. bassiana às pragas alvo Mahanarva fimbriolata e Bemisia tabaci Biótipo B, respectivamente, com a mortalidade em Tenebrio molitor. Inicialmente, foram selecionados 50 isolados a partir de 100 isolados de cada gênero, baseado em avaliações visuais do crescimento e esporulação em meio de cultivo em placas de Petri. Estes isolados selecionados foram cultivados em arroz parboilizado para quantificação do rendimento produtivo de conídios. Os 25 isolados mais produtivos de cada espécie de fungo foram utilizados nos bioensaios com T. molitor. Posteriormente, os cinco isolados que causaram maior e menor mortalidade de cada gênero, foram utilizados nos bioensaios com as respectivas pragas-alvo. A variação no rendimento de conídios de Beauveria spp., foi de 0,3 a 7,7 x 109 conídios.grama de arroz-1 e de Metarhizium spp. foi de 0,1 a 2,5 x 109 conídios.grama de arroz-1. A mortalidade confirmada de larvas de T. molitor por Beauveria spp., variou de 5,5 a 96,4% e por M. anisopliae variou de 29,1 a 89,1%. Alguns isolados causaram mortalidade elevada tanto no inseto modelo quanto na praga-alvo, porém, não foi verificada uma relação entre a virulência para as duas espécies. Da mesma forma, não foi observada associação entre os parâmetros produção de conídios e virulência. O isolado ESALQ 4958 de B. bassiana se destacou nos dois bioensaios apresentando mortalidades elevadas de ninfas de B. tabaci Biótipo B. Nos bioensaios utilizando ninfas de M. fimbriolata, ESALQ 1641 foi o isolado que apresentou os maiores percentuais de mortalidade nos dois bioensaios. Analisando conjuntamente as variáveis produção de conídios e virulência a T. molitor e a espécie alvo, os isolados ESALQ 540 (B. bassiana) e ESALQ 1116 (M. anisopliae) se destacaram por apresentarem valores elevados para todas as variáveis de interesse. Os resultados reforçam a necessidade de uma análise conjunta destas variáveis com um peso diferenciado para cada variável na seleção de isolados para utilização em produtos microbianos para o controle de pragas. The genus Metarhizium spp. and Beauveria spp. are important entomopathogenic fungi used to control arthropod pests. The selection of promising fungal isolates is the first and one of the most important steps on the development of a biopesticide, since some isolates may present high virulence and not necessarily good production in substrate and vice-versa, being the combination of these two parameters important for the commercial viability. Difficulties of rearing or maintaining some species of pests in laboratory are limitations for the conduction of virulence tests, justifying the use of easy to breed model species on the preliminary steps of selection. Therefore, this study aimed to select isolates with high conidia production and virulence, comparing the control efficiency of M. anisopliae and B. bassiana to the target pests, Mahanarva fimbriolata and Bemisia tabaci biotype B, respectively, with mortality in Tenebrio molitor. At first, 50 isolates were selected from 100 isolates of each genus, based on growth and sporulation in culture medium on Petri dishes. These isolates were grown in parboiled rice to quantify the yield of conidia. The 25 most productive isolates of each fungus species were used in the bioassays with T. molitor. After, the five isolates that caused higher and lower mortality of each genus were used in the bioassays with the respective target pests. Beauveria spp. conidia yield ranged from 0.3 to 7.7 x 109 conidia.grams of rice-1 and Metarhizium spp. from 0.1 to 2.5 x 109 conidia.gram of rice-1. The confirmed mortality of T. molitor larvae by Beauveria spp. varied from 5.5 to 96.4% and M. anisopliae varied from 29.1 to 89.1%. Some isolates caused high mortality in both, model insect and the target pest; however, no relationship between the virulence of both species was observed. Similarly, there was no association between the parameters conidia production and virulence. The B. bassiana isolate ESALQ 4958 in both bioassays presented high mortalities of B. tabaci Biotype B. In bioassays using M. fimbriolata nymphs, ESALQ 1641 was the isolate that presented the highest mortalities in both bioassays. Analyzing the variables, conidia production and virulence to T. molitor and the target species, the isolates ESALQ 540 (B. bassiana) and ESALQ 1116 (M. anisopliae) showed high values for all variables of interest. The results reinforce the necessity of a joint analysis of these variables with different weight for each one in the selection of isolates, aiming to use them in microbial products for pest control.

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Schreuder, Wouter. "Characterization and pathogenicity of South African isolates of Fusarium oxysporum f. sp. melonis." Thesis, Stellenbosch : Stellenbosch University, 2000. http://hdl.handle.net/10019.1/51651.

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Abstract:

Thesis (PhD(Agric))--University of Stellenbosch, 2000. ENGLISH ABSTRACT: The purpose of this study was to characterize the race and vegetative compatibility of Fusarium oxysporum f. sp. melonis (FOM) isolates collected in the major melon producing areas, to report on their geographical distribution, and their possible relatedness to isolates from other countries. Seventy two FOM isolates obtained from 30 fields in 17 melon producing regions were race-typed using the differential cultivars Topmark (susceptible to all races), Doublon (Fomi), CM 17187 (Fom2) and Perlita (Fom3) and grouped by means of vegetative compatibility. All isolates belonged to vegetative compatibility group 0134, indicating a high degree of genetic homogeneity among the South African FOM population. Fifty four isolates were identified as race 0, eight as race 1, and 10 as race 2. Race 0 occurred in 15 of the regions whereas race 1 was sporadically recovered. Race 2, on the other hand, was obtained only from four fields located in one geographical region. Perlita plants (carrying the gene Fom3) inoculated with local isolates ofrace 0 and race 2 and reference isolates of race 0 became stunted, their leaves turned yellow, and became thickened and brittle. These results suggested that Fom3 in Perlita confers a tolerant reaction compared to the resistant reaction of gene FornI in Doublon. The disease reaction of cultivar Perlita to FOM was therefore reinvestigated. Twenty isolates, including the four FOM races (0, 1, 2, and 1,2) obtained from different countries, were used. The differential cultivars were included to verify virulence of the isolates. Perlita plants inoculated with three isolates of race 2 remained asymptomatic. The remaining race 2 and 0 isolates, induced severe stunting of Perlita plants, but mean percentage stunting values did not differ significantly (P = 0.05) and ranged between 25.1 and 50.0. Leaves of stunted plants were chlorotic, thickened and brittle. Disease reaction of Perlita was verified at a lower inoculum concentration with two race 2 (pipette method) and two race 0 isolates (root dip method). Results proved that Fom3 does not confer similar resistance towards race 0 and some race 2 isolates as FornI in Doublon. Cultivars possessing Fom3, should therefore be considered tolerant to FOM races 0 and 2. The ability of a nit mutant isolate, generated from FOM race 0 which belongs to VCG 0134, to change its virulence during infection of melon plants, was investigated under quarantine. Seedlings of melon cultivars Imperial 45 and Early Sweet (no resistance genes), Amber (Fom2) and Fiata (FomI, Fom2) were consecutively grown in two cement troughs in a gauzehouse. Each planting was terminated when plants had advanced Fusarium wilt or after the fruit were harvested. In the first planting, Imperial 45 seedlings were transplanted and artificially inoculated with the nil mutant isolate. In the consecutive plantings, seeds were sown in the infested soil to enable natural infection. For each crop, representative plants showing Fusarium wilt were selected for isolation. All F. oxysporum isolates recovered were single-spored and their nit mutant and VCG status verified. Virulence of the labelled isolates was determined using differential cultivars. In trough A, all plants of the susceptible cultivars Imperial 45 and Early Sweet crops showed Fusarium wilt. The labelled isolates recovered from the selected plants were all designated race O. In the first crop (planting No.5) of the resistant cultivar Amber, 6.7% of the plants developed Fusarium wilt. In the second Amber crop the disease incidence increased to 56.6%, and to 81.8% in the final crop. Contrary to the susceptible cultivars, only race 2 isolates were obtained from the symptomatic Amber plants. Similar data were found with the susceptible cultivar Imperial 45 and the resistant cultivar Amber in trough B. Planting of Fiata caused a dramatic reduction in Fusarium wilt incidence in trough B. However, 1.2% of plants were affected by Fusarium wilt in the first Fiata crop (planting No.6), whereas 4% of the plants were symptomatic in the final planting. From these symptomatic Fiata plants only race 1,2 isolates were obtained. These findings, and the fact that the symptomatic plants represented a substantial proportion of the first Amber (approximately 7-15%) and Fiata (approximately 2%) crops, provedthat changes in the race structure of this fungal pathogen occurred rapidly when confronted with a resistant cultivar. The potential of RAPD analysis to differentiate between the isolates displaying virulence changes was evaluated. Four F. oxysporum f. sp. niveum isolates were included as an outgroup. A histopathological study was conducted to verify whether these isolates retain their ability to behave as true vascular pathogens. The three primers used clearly distinguished the 12 FOM isolates from the four F. oxysporum f. sp. niveum isolates. However, the primers showed a highly conserved and characteristic banding pattern for the FOM isolates which represented three physiological races (race 0, race 2, race 1,2), indicating that RAPD analysis cannot detect race-specific groupings in FOM. Disease reactions on the three differential cultivars confirmed the virulence of FOM isolates. The histopathological data furthermore proved that the two FOM races (race 2, race 1,2), which derived from the race 0 parent isolate, retained their ability to behave as true vascular pathogens. AFRIKAANSE OPSOMMING: DIE KARAKTERISERING EN PATOGENESITEIT VAN SUID-AFRIKAANSE ISOLATE VAN FUSARIUMOXYSPORUMF. SP.MELONIS Die doel van die studie was om Fusarium oxysporum f. sp. melonis (FOM) isolate wat in die hoof spanspekproduserende gebiede versamel is, volgens ras en vegetatiewe verenigbaarheid te karakteriseer, en hul geografiese verspreiding en verwantskap met isolate van ander lande aan te dui. Twee en sewentig FOM isolate afkomstig vanaf 30 landerye wat 17 spanspekproduserende areas verteenwoordig, is gebruik. Die differensiële kultivars Topmark (vatbaar vir alle rasse), Doublon (Forni), CM 17187 (Fom2) en Perlita (Fond) is gebruik om die rasbepalings te doen asook om die vegetatiewe verenigbare groepe (VVG) te bepaal. Al die isolate is as VVG 0134 geklassifiseer, wat 'n hoë mate van genetiese homogenesiteit binne die Suid-Afrikaanse populasie aandui. Vier en vyftig isolate is as ras 0, agt as ras 1 en 10 as ras 2 geklassifiseer. Ras 0 is vanaf 15 gebiede afkomstig, terwyl ras 1 sporadies voorgekom het. Ras 2 is vanuit vier landerye binne dieselfde geografiese gebied verkry. Plante van die kultivar Perlita wat met plaaslike isolate van ras 0 en 2, asook verwysings-isolate van ras 0 geïnokuleer is, het verdwerg voorgekom. Die blare van die plante het vergeel, verdik en bros voorgekom. Hierdie siekte reaksie het aangedui dat Fond in Perlita toleransie bewerkstellig in teenstelling met die weerstandbiedende reaksie van geen Fomi in Doublon. Die siekte reaksie van Perlita teenoor FOM is dus verder ondesoek. Hiervoor is 20 isolate wat al vier FOM rasse insluit (0, 1, 2, en 1,2), en van verskillende wêrelddele afkomstig is, gebruik. Die virulensie van die isolate is met die differensiële kultivars bevestig. Drie van die ras 2 isolate het geen siektesimptome op Perlita veroorsaak nie. Die ander ras 2 isolate, en al die ras 0 isolate, het egter die Perlita plante aansienlik verdwerg en die blare vergeel en verdik. Laasgenoemde groep isolate het 'n gemiddelde verdwergingsindeks van tussen 25.1% en 50.0% veroorsaak. Die siekte reaksie by Perlita is verder bevestig deur plante teen 'n laer inokulumdigtheid van twee ras 2 (pipet metode), en twee ras 0 (wortel-doop metode) isolate, te inokuleer. Uit die resultate was dit duidelik dat die weerstand wat Fom3 teenoor ras 0 en sommige ras 2 isolate verskaf, van FornI verskil. Kultivars wat oor die weerstandsgeen Fom3 beskik moet dus as tolerant beskou word. 'n Ondersoek is geloods na die vermoë van 'n nil mutant isolaat, genereer vanaf die wilde ras 0 isolaat van FOM (VVG 0134), om onder kwarantyn sy virulensie gedurende infeksie van spanspekplante te verander. Saailinge van die spanspekkultivars Early Sweet (geen weerstandsgene), Amber (Fom2) en Fiata (FornI, Fom2) is opeenvolgens in twee sement trêe in 'n gaashuis verbou. Die afsonderlike aanplantings is beëindig sodra gevorderde Fusarium-verwelksimptome verkry is, of nadat vrugte ge-oes is. Vir die eerste aanplanting is oorgeplante Imperial 45 saailinge kunsmatig met die nil mutant isolaat geïnokuleer. Tydens die opeenvolgende aanplantings is saad direk in die besmette grond gesaai ten einde natuurlike infeksie te verkry. Met elke aanplanting is isolasies gedoen vanaf verteenwoordigende plante wat Fusarium-verwelksimptome getoon het. Alle F. oxysporum isolate wat verkry is, is ge-enkelspoor en hul nit mutant status en VVG is bevestig. Virulensie van die gemerkte isolate is bepaal deur inokulasie van die differensiële kultivars. Alle plante van die vatbare Imperial 45 en Early Sweet kultivars wat in trog A geplant is, het Fusarium-verwelksimptome getoon. Die gemerkte isolate wat vanaf die verteenwoordigende plante verkry is, is almal as ras 0 geklassifiseer. Tydens die eerste aanplanting van die weerstandbiedende kultivar, Amber (aanplanting No.5), het 6.7% van die plante Fusarium-verwe1ksimptome ontwikkel. Tydens die tweede en derde aanplanting van Amber het die frekwensie van siektevoorkoms verhoog na 56.6% en 81.8 %, onderskeidelik. In teenstelling met die vatbare kultivars, is slegs ras 2 vanuit die Amber plante met siektesimptome verkry. Soortgelyke resultate is met Imperial 45 en Amber in trog B verkry. Aanplanting van kultivar Fiata het egter 'n dramatiese verlaging in die voorkoms van Fusarium-verwelk bewerkstellig. Tydens die eerste Fiata aanplanting (aanplanting No.6) het 1.2% plante Fusarium-verwelksimptome ontwikkel, en 4% tydens die laaste aanplanting. Vanaf hierdie plante is slegs ras 1,2 isolate verkry. Hierdie bevindings, en die feit dat 'n aansienlike hoeveelheid van die Amber (ongeveer 7-15%) en Fiata plante (ongeveer 2%) siektesimptome getoon het, bewys dat FOM vinnig van virulensie verander wanneer die patogeen 'n weerstanbiedende kultivar infekteer. Die vermoë van RAPD analise om tussen isolate wat in virulensie verander het, te onderskei, is ondersoek. Vier isolate van F. oxysporum f. sp. niveum is as 'n buite-groep ingesluit. Om te bevestig dat die isolate wat van ras verander het wel egte vaskulêre patogene is, is 'n histopatologiese ondersoek gedoen. Die drie inleiers wat gebruik is, het die 12 FOM isolate duidelik van die vier F. oxysporum f. sp. niveum isolate onderskei. Die 12 FOM isolate wat drie fiosologiese rasse (ras 0, ras 2, ras 1,2) verteenwoordig het, is egter saam gegroepeer, wat aandui dat hierdie metode nie tussen rasse van FOM kan onderskei nie. Inokulasiestudies met die differensiële kultivars het die virulensie van die isolate bevestig. Die histopatologiese ondersoek het verder bewys dat beide FOM rasse (ras 2, ras 1,2) wat vanaf die wilde tipe ras ° isolaat ontstaan het, hul vermoë behou het om as egte vaskulêre patogene op te tree.

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Entz, Susan Carol, and University of Lethbridge Faculty of Arts and Science. "Molecular methods and isolates of the entomopathogenic fungus Metarhizium anisolpliae for environmentally sustainable control of grasshoppers in Canada." Thesis, Lethbridge, Alta. : University of Lethbridge, Faculty of Arts and Science, 2005, 2005. http://hdl.handle.net/10133/249.

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Abstract:

Metarhizium anisoplia var. acridum, a gyphomycetous fungus registered worldwide for grasshopper and locust control, is currently under consideration as a worldwide for grasshopper and locust control, is currently under consideration as a potential alternative to chemical insecticides for grasshopper control in Canada. Research in this thesis has contributed data required for the registration of biological control agents in Canada. A diagnostic PCR assay was developed for the specific detection of M. anisopliae var. acridum DNA. The assay was highly sensitive and effective for the detection of fungal DNA in infected grasshoppers. A survey of southern Alberta soils conducted in the spring of 2004 revealed the presence of Metarhizium spp. at low natural incidennce. Two indigenous isolates demonstrated pathogenicity when bioassayed against laboratory-reared and field collected grasshoppers. One of the isolates demonstrated virulence comparable to a commercial isolate. An analysis of historical weather data revealed that summer weather in the Prairie provinces should not preclude the efficacy of M. anisopliae var. acridum under local conditions. xv, 127 leaves : ill. (some col.) ; 28 cm.

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Oliveira, Geovana Gomez de. "Trichoderma spp. no crescimento vegetal e no biocontrole de sclerotinia slcerotiorum e de patógenos em sementes de cártamo(Carthamus tinctorius)." Universidade Federal de Santa Maria, 2007. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/5145.

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Abstract:

The cultivation of flowers is, in Brazil, very recent and little known species have a high ornamental potential, Cartamus is such a species and there are cultivars for the production of oil and as well as for ornamental pourposes. Being a recent crop in Brazil, little is known about its associated diseases, specially those that affect the seeds and the soil borne, such as white mold that causes great losses to several crops. Six experiments were conducted with the objectives of testing the reaction of the crop to isolates of Sclerotinia sclerotiorum, the biocontrol of S. sclerotiorum and of pathogens associated to the seeds, and the effect of the biocontrollers on cartamus plant growth. Isolates of the pathogen from chrisantemum, lettuce, soybean, and carrots, as well as isolates of Trichoderma sp. (ETSR 20 e TC 1.15) and comercial products of Trichoderma spp. (Agrotrich and Trichodel®) were used. In the reaction test, the cartamus crop was more severely attacked by the isolate obtained from lettuce, which when incorporated to commercial substrate did not promote the development of the disease in plant, but reduced plant growth. Trichodel® was the product that promoted the highest growth of plants when incorporated to the substrate, even in the absence of the pathogen. The product more efficient in controlling seed pathogens was Agrotrich. In the growth of seedlings, the isolates ETSR20 and TC1.15 were the best, when applied to the seeds and the latter promoted the best emergency of seeds in commercial substrate. Therefore, the Trichoderma based products can be used in the control of seed pathogens and growth promotion of cartamus plants as seed or substrate treatment. There are differences in disease severity on cartamus among isolates of S. sclerotiorum from different crops and its presence reduces the crop s growth, even in the absence of visible symptoms A floricultura, no Brasil, é relativamente recente, existindo espécies pouco conhecidas com alto potencial ornamental. O cártamo é uma delas e possui cultivares tanto para a produção de óleo quanto para ornamentação. Por ser uma cultura recente no Brasil, pouco se conhece sobre as doenças associadas a ela, especialmente as que afetam as sementes e as veiculadas pelo solo, como o mofo branco, que causa grandes prejuízos a diversas culturas. Seis experimentos foram conduzidos com o objetivo de testar a reação da cultura a isolados de Sclerotinia sclerotiorum, o biocontrole de patógenos associados às sementes e de Sclerotinia sclerotiorum e o efeito dos biocontroladores no crescimento de plantas de cártamo. Foram utilizados isolados de Sclerotinia sclerotiorum das culturas do crisântemo, alface, soja e cenoura, e isolados de Trichoderma spp. (ETSR 20 e TC 1.15) e formulados comerciais à base de Trichoderma spp. (Agrotrich e Trichodel®). No teste de reação, a cultura do cártamo foi mais severamente atacada pelo isolado proveniente da alface, o qual, quando incorporado ao substrato comercial, não promoveu o desenvolvimento da doença nas plantas, porém prejudicou seu crescimento. Trichodel® foi o produto que maior crescimento proporcionou às plantas quando incorporado ao substrato, mesmo sem a presença do patógeno. O produto mais eficiente no controle dos patógenos das sementes foi o formulado comercial Agrotrich. No crescimento de plântulas, os isolados ETSR 20 e TC 1.15 se sobressaíram quando aplicados às sementes e este obteve melhor resultado na emergência de plântulas em substrato. Assim, os produtos a base de Trichoderma são viáveis para controle de patógenos de sementes e crescimento de plantas tanto no tratamento de sementes como do substrato. Existem diferenças na severidade da doença em cártamo entre isolados de Sclerotinia sclerotiorum oriundos de diferentes culturas e sua presença reduz o crescimento da cultura, mesmo na ausência de sintomas visíveis

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Wilson, Richard. "Endophytic fungi from four tree species in New Brunswick and a comparison of two methods of identification of Leptostroma isolates of Pinus resinosa, morphology and molecular probing." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 1997. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk2/tape16/PQDD_0003/NQ29475.pdf.

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Lira, Simone Possedente de. "\"Metabólitos secundários biologicamente ativos isolados de esponjas marinhas e do fungo Beauveria felina de origem marinha\"." Universidade de São Paulo, 2007. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/75/75132/tde-05062007-112443/.

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Abstract:

Neste trabalho descreve-se o estudo química dos extratos de quatro esponjas e dois fungos de origem marinha oriundos da costa do Brasil. Os extratos de três esponjas (Petromica ciocalyptoides, Topsentia ophiraphidites e Callyspongia sp.) apresentaram atividade inibitória à enzima adenosina fosforribosil transferase de Leishmania tarentolae. A partir desses extratos foram isolados 4 compostos. O trissulafato de halistanol, isolado das esponjas P. ciocalyptoides e T. ophiraphidites, e o ilhabelanol, ilhabreno e isoakaterpina, isolados da esponja Callyspongia sp. A partir do extrato bruto da esponja Axinella cf corrugata foram isolados dois derivados cumarínicos, provavelmente artefatos de isolamento do ácido 4-esculetínico, o qual é inédito como produto natural. O extrato bruto da esponja Axinella cf. corrugata apresentou atividade citotóxica, mas os compostos puros não apresentaram esta atividade. Os dois compostos puros foram testados ainda quanto sua atividade contra o vírus da SARS, na qual o éster etílico do ácido 4-esculetínico se apresentou ativo. A partir de dois extratos oriundos do fungo Beauveria felina, isolado da alga marinha Caulerpa sp, foram isoladas 17 frações puras que após diversas análises foram agrupadas em seis compostos conhecidos na literatura: a (Phe3, N-Val5) destruxina B, a cloroidrina da destruxina E, a roseotoxina B, a roseocardina, a isariina e a isariina B. Além disso, foram isolados dois compostos inéditos, a pseudodestruxina C e a cloloidrina Beta-Me-Pro da destruxina E. Os extratos brutos de Beauveria felina apresentaram atividades em bioensaios de atividade antituberculose e de citotoxicidade em linhagem de células de câncer. Os compostos puros avaliados no bioensaio antituberculose não foram ativos. Somente o composto roseotoxina B apresentou atividade citotóxica in vitro para quatro linhagens de células: mama, cólon, sistema nervoso e leucemia. In this work we report the chemical investigation of bioactive crude extracts obtained from four sponges and two fungal strains of marine origin. The crude extracts of three sponges species (Petromica ciocalyptoides, Topsentia ophiraphidites and Callyspongia sp.) displayed inhibitory activity towards the enzyme adenine fosforribosyl transferase of Leishmania tarentolae (L-APRT). Four compounds have been isolated from these extracts: the known halistanol sulfate was isolated of sponges P. ciocalyptoides and T. ophiraphidites, while the novel ilhabelanol, ilhabrene and isoakaterpin have been isolated from the sponge Callyspongia sp. All compounds exhibited inhibition of L-APRT at micro M concentrations. Two coumarin derivatives have been isolated from the crude extract of the sponge Axinella cf. corrugata, probably as artifacts of isolation: esculetin-4-carboxylic acid methyl ester and esculetin-4-carboxylic acid ethyl ester. While the crude extract of the sponge Axinella cf. corrugata presented cytotoxic activity, the pure compounds were inactive in these assays. The esculetin-4-carboxylic acid ethyl ester was found to be an in vitro inhibitor of SARS virus. The crude extract obtained of a marine-derived Beauveria felina strain, isolated from the alga Caulerpa sp., displayed antituberculosis activity against Mycobacterium tuberculosis H37Rv and cytotoxic activity against MCF-7 (breast), HCT-8 (colon) and B16 (murine melanoma) cancer cell lines. Chemical fractionation of the crude extract led to the isolation of two new cyclodepsipeptides pseudodestruxin C and [Beta-Me-Pro] destruxin E chlorohydrin, and of the known destruxin E chlorohydrin, [Phe3, N-Me-Val5] destruxin B, roseotoxin B, roseocardin, isariin and isariin B. The depsipeptides [Phe3, NMe- Val5] destruxin B and rosetoxin B, have been tested against M. tuberculosis H37 Rv and in cytotoxicity bioassays against SF 295 (human CNS) MDA-MB435 (human breast) HCT8 (colon) and HL60 (leukemia) cancer cell lines. Only roseotoxin B displayed moderate cytotoxicity against the cancer cell lines.

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BARROS, Nielson de Lima. "Caracterização morfológica e molecular de isolados de fusarium associados a grãos de milho." Universidade Federal Rural de Pernambuco, 2013. http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/6164.

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Abstract:

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-12-19T15:21:25Z No. of bitstreams: 1 Nielson de Lima Barros.pdf: 595780 bytes, checksum: 41b3822c59bb8a9d0ff834daed31532b (MD5) Made available in DSpace on 2016-12-19T15:21:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Nielson de Lima Barros.pdf: 595780 bytes, checksum: 41b3822c59bb8a9d0ff834daed31532b (MD5) Previous issue date: 2013-07-26 Fusarium species cause important diseases on maize such as stalk-rot and ear-rot. Fungi in the Gibberella fujikuroi species complex (GFSC) are among the causal agents of these diseases, such as F. proliferatum, F. subglutinans, F. temperatum and F. verticillioides. The present study aimed to characterize the diversity of Fusarium isolates from different maize growing areas in Brazil. Morphological characters and sequences of fragments of the gene that encodes the translation elongation factor (tef1) were used to characterize the isolates. Fifty isolates obtained from maize kernels in different growing areas in Brazil were used. In the morphological characterization the isolates showed variation regarding the colony color and mycelial growth. The colony color varied from salmon to violet and the average diameter of the colonies at three days varied from 2.83 cm to 4.07 cm. The majority of isolates showed long chains of conidia and monophialides. A few isolates showed short chains, false heads and polyphialides. None of the isolates formed chlamydospore. Considering the morphological characterization the isolates were identified as F. proliferatum (4 isolates) and F. verticillioides (46 isolates). In the molecular characterization a neighbor-joining phylogenetic tree was generated from the sequenced fragments of the tef1 gene. From 50 isolates analyzed, 47 grouped together with reference isolates of F. verticillioides forming a sister group to F. musae. Two isolates grouped close to F. fujikuroi and one isolate grouped close to F. proliferatum. Ten haplotypes were identified within the F. verticillioides isolates from Brazil, with six haplotypes being new to the species. The cultural and morphological characters could not be grouped according with the phylogenetic sub-groups and haplotypes. The phylogenetic groups also did not reflect the geographical localization of isolates. The data collected in this study show that F. verticillioides is the dominant species and is widely distributed in the maize growing regions of Brazil, with high genetic diversity in the population. Espécies de Fusarium causam doenças importantes no milho como a podridão do colmo e podridão de espigas. Fungos do complexo de espécies Gibberella fujikuroi (GFSC) estão entre os agentes causais dessas doenças, como F. proliferatum, F. subglutinans, F. temperatum e F. verticillioides. O presente estudo objetivou caracterizar a diversidade de isolados de Fusarium de diversas regiões produtoras de milho do Brasil. Para tal, foram utilizados marcadores morfológicos e sequências de fragmento do gene que codifica o fator de elongação 1-alfa (tef1). Foram utilizados 50 isolados obtidos de grãos de milho de diversas regiões produtoras do Brasil. Na caracterização morfológica os isolados apresentaram grande variação quanto à coloração das colônias e crescimento micelial. A cor das colônias variou do salmão ao violeta e o diâmetro médio das colônias aos três dias variou de 2,83 cm a 4,07 cm. A maioria dos isolados apresentou cadeias longas de conídios e monofiálides. Poucos isolados apresentaram cadeias curtas, falsas cabeças e polifiálides. Nenhum isolado formou clamidósporo. Pela caracterização morfológica os isolados foram identificados como F. proliferatum (4 isolados) e F. verticillioides (46 isolados). Na caracterização molecular foi gerada uma árvore filogenética de neighbor-joining a partir de fragmentos sequenciados do gene tef1. Dos 50 isolados analisados, 47 agruparam com isolados de referência de F. verticillioides, formando um grupo irmão à F. musae. Dois isolados agruparam próximo a F. fujikuroi e um isolado próximo a F. proliferatum. Foram identificados 10 haplótipos dentre os isolados de F. verticillioides do Brasil, com seis haplótipos sendo novos para a espécie. Não foi possível agrupar os caracteres culturais e morfológicos com os sub-grupos filogenéticos e haplótipos. Também não houve agrupamento filogenético refletindo localização geográfica dos isolados. Os dados apresentados neste estudo mostram que F. verticillioides é a espécie dominante e está amplamente distribuída nas regiões produtoras de milho do Brasil, com alta diversidade genética na população.

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Weinstein, Richard Neil. "Ecophysiology of fungi isolated from soil in an Antarctic fellfield ecosystem." Thesis, University of Cambridge, 1999. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.624489.

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Westwell, Jane Marie. "Effect of spore immobilisation of the pathogenicity of a Cochliobolus isolate." Thesis, University of Westminster, 1994. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.240167.

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Heung, Shing-yan, and 向承恩. "Multilocus sequence typing of Candida albicans strains isolated in Hong Kong." Thesis, The University of Hong Kong (Pokfulam, Hong Kong), 2010. http://hub.hku.hk/bib/B44660005.

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Bastos, Francisco Albuquerque. "OTIMIZAÇÃO DO PROCESSO DE PRODUÇÃO DE TIQUIRA EMPREGANDO ENZIMAS COMERCIAIS E FUNGOS ISOLADOS A PARTIR DOS BEIJUS UTILIZADOS NO MÉTODO TRADICIONAL." Universidade Federal do Maranhão, 2013. http://tedebc.ufma.br:8080/jspui/handle/tede/955.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2016-08-19T12:56:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao Francisco.pdf: 2147558 bytes, checksum: b0b562717d876cfad47f45868c73ab80 (MD5) Previous issue date: 2013-12-20 Tiquira, a strong content beverage from Maranhão ( Brazil ), obtained from cassava (Manihot esculenta Crantz.) has its production concentrated in several counties of the State, through a handmade process , rather primitive, in which the conversion of starch cassava is taken into fermentable sugars by fungi which is found on the native beijus of manioc where strains are picked at random. Alcoholic fermentation is also made by yeasts found in the environment. Its commercialization is practiced informally, making it difficult to record statistical data of production and the number of producers in the Ministry of Agriculture. In order to optimize this process, commercial enzymes, strains of fungi (Aspergillus niger), were used to in order to convert starch into fermentable wort and pressed yeasts for fermentation. The processes proposed here follow three steps: gelation of starch scarification and subsequent dextrinization the sugars, alcoholic fermentation and distillation of fermented wine. Substituting the mold for commercial enzymes in the proposed circumstances, the manufacturing of tiquira was performed in just 25 hours, whereas when using fungi isolated, the production of tiquira took approximately 136 hours for its processing. As one can see, there was a considerable reduction of time in the two cases presented here in relation to the traditional process, which takes approximately 20 days to achieve the distillate. It was also found that the fermentation and destillation of the wort resulting from the scarification of cassava is equivalent to that of cane sugar, and both processes can be processed with the same equipment by tiquira producers. It was shown that the concentrations of copper and ethyl carbamate were visibly reduced in comparison to the traditional process, enabling a better quality of the beverage, as well as reducing the risks to consumer health. From the experiments it can be concluded that the replacement of the traditional process by commercial enzymes, fungi isolated and pressed yeast are highly and technically recommended primarily to small producers. A tiquira é uma bebida típica do Maranhão (Brasil), obtida a partir de mandioca (Manihot esculenta, Crantz.), sua produção se concentra em diversos municípios do Estado, através de um processo artesanal, bastante primitivo, no qual a conversão do amido de mandioca em açúcares fermentescíveis é feita por bolores nativos que surgem sobre os beijus de massa de mandioca, onde as cepas são colhidas ao acaso. A fermentação alcoólica também é feita por leveduras selvagens. Tem sua comercialização praticada de modo informal, dificultando o registro de dados estatísticos de produção e número de produtor no Ministério da Agricultura. Com o objetivo de otimizar o referido processo, utilizaram-se, enzimas comerciais, cepas de fungos (Aspergillus níger), para a conversão do amido em mosto fermentescíveis e leveduras prensadas para fermentação. Os processos aqui propostos seguiram três etapas: gelificação do amido com a posterior dextrinização e sacarificação a açúcares, fermentação alcoólica e destilação do vinho fermentado. Substituindo-se os bolores por enzimas comerciais nas circunstâncias propostas, a fabricação da tiquira foi realizada em apenas 25 horas, enquanto que ao utilizar fungos isolados, a produção do aguardente demorou, aproximadamente, 136 horas para o seu processamento. Evidenciou-se assim, uma considerável redução de tempo, nos dois processos aqui apresentados em relação ao processo tradicional, que demora, aproximadamente, 20 dias para a consecução do destilado. Verificou-se também que os processos de fermentação e destilação do mosto oriundos da sacarificação da massa de mandioca são equivalentes ao da cana-de-açúcar, podendo ser processados com os mesmos equipamentos, por pequenos produtores de tiquira. Comprovou-se que as concentrações de cobre e carbamato de etila foram visivelmente reduzidas nos processos propostos em relação ao processo tradicional, possibilitando uma melhor qualidade da bebida, assim como reduzindo os riscos à saúde dos consumidores. A partir dos experimentos realizados conclui-se que a substituição do processo tradicional por enzimas comerciais, fungos isolados e levedura prensada se mostra tecnicamente possível e recomendada, primordialmente, aos pequenos produtores.

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April, Trevor Marc. "Hydrocarbon-degrading filamentous fungi isolated from flare pit soils of northern and western Canada." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 1999. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk2/ftp01/MQ40024.pdf.

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Ghaderian, Seyed Majid. "The effect of toxic heavy metals upon fungi of the genus Pythium isolated from soil." Thesis, University of Sheffield, 1998. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.301558.

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Schierbaum, Anna. "Occurrence, distribution and agroactive metabolite production of endophytic fungi isolated from marine and shoreline plants." Thesis, University of Portsmouth, 2008. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.479128.

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Keyser, Chad Alton. "Development of a Laboratory Based System for Selecting Insect Pathogenic Fungi with Greatest Potential for Success in the Field." DigitalCommons@USU, 2010. https://digitalcommons.usu.edu/etd/604.

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Abstract:

Many insects are important agricultural pests, and active control is necessary to keep them at abeyance. The naturally occurring entomopathogenic fungus Metarhizium is a promising tool to control pest insects, and its use avoids the well-known harmful side effects of chemical pesticides. Thousands of unique isolates of Metarhizium exist throughout the world. These isolates vary widely in their ability to cause infection and to tolerate stressful habitats. The research reported here tests the THESIS: A laboratory-based system can be devised that identifies, from among many Metarhizium isolates, those isolates with the greatest potential for successful biological control of pest insects in the field. The study was built on the testing of four hypotheses: (1) Laboratory bioassays using target pest insects will distinguish highly virulent strains of Metarhizium from less virulent strains, (2) Quantity and quality of mass-produced pathogenic fungi will vary among species and strains of Metarhizium, (3) The tolerance to ultraviolet radiation will vary among species and strains of Metarhizium, (4) The effect of temperature on growth rates and survival of both Metarhizium spores and hyphae will vary among isolates and species. These hypotheses test four field-relevant traits using a panel of ten isolates of Metarhizium isolates. Seven sets of laboratory experiments were devised to define the range of responses within the traits covered by the hypotheses. This series of general laboratory tests was developed to assist in identifying fungal isolates with high potential for field use. These tests included evaluation of each isolate's (a) insect pathogenicity, (b) mass–production capabilities, (c) tolerance to high temperatures, (d) tolerance to UV-B radiation, (e) rate of vegetative growth, (f) rate of spore germination, and (g) an evaluation of presence or absence of a post–stress growth inhibition. The application of this protocol to the isolates used in this study indicates that four isolates have high field potential, i.e., DWR 203, DWR 346, DWR 356 and ARSEF 324, and three of these were tested in a field trial. By following the procedures outlined in this thesis, selection of “good” isolates can be accomplished in the laboratory, and a successful isolate can be identified from the abundance of isolates present in nature.

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Rodrigues, Amanda Rafaela. "Análise do secretoma de isolados do fungo Trichoderma asperellum (TR356) em resposta ao fungo fitopatogênico Sclerotinia sclerotiorum." Universidade Federal de Goiás, 2014. http://repositorio.bc.ufg.br/tede/handle/tede/4912.

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Abstract:

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-11-19T10:15:55Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Amanda Rafaela Rodrigues - 2014.pdf: 1648839 bytes, checksum: 9a00f301e577d05e94214afe813688c5 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-11-19T10:17:31Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Amanda Rafaela Rodrigues - 2014.pdf: 1648839 bytes, checksum: 9a00f301e577d05e94214afe813688c5 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Made available in DSpace on 2015-11-19T10:17:31Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Amanda Rafaela Rodrigues - 2014.pdf: 1648839 bytes, checksum: 9a00f301e577d05e94214afe813688c5 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2014-10-23 Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES The genus Trichoderma is represented by non-pathogenic soil fungi that have been studied by act as biological control agents against fungal pathogens, such as Sclerotinia sclerotiorum, the fungus that causes white mold, besides that, reduce environment and human health risks by being able to replace agrochemicals. Proteomic strategies with MS techniques have been important tools in studies of patterns identification for protein expression in different growth conditions. This work aims to development new strategies that enable the detection and identification of proteins secreted by Trichoderma asperellum (TR356) and Sclerotinia sclerotiorum when inoculated together and separated. The results obtained by MALDI / TOF analysis allowed the identification of a β-1.3--glucanosiltransferase and α-1.2-Dmannosidase, demonstrating the possibility of proteins identification for better comprehension about interaction between these organisms. It was therefore possible to identify the proteins through strategies used, but further analysis are required in order to elucidate the function and interaction of proteins secreted by the fungus Trichoderma asperellum TR356 against S. sclerotiorum. OgêneroTrichodermaérepresentadoporfungosdesolonãopatogênicosquesãoestudad osporsuaaçãocomoagentesdecontrolebiológicocontrafungosfitopatógenos,comoScler otiniasclerotiorum,ofungocausadordomofobranco.Osfungos Trichoderma spp.atuamcomoimportantesagentesdecontrolebiológico,diminuindoosriscosàsaúdehu manaeaomeioambienteporseremcapazesdesubstituirosagroquímicos.Estratégiasprot eômicas juntamente com técnicas de MSsãoimportantesferramentasemestudosdepadrão, identificação e expressãodeproteínasemdiferentescondiçõesdecrescimento.Levando em consideração a importância de tais estudos, o presente trabalho tem por objetivo o desenvolvimento de novas estratégias que possibilitem a detecção e identificação de proteínas secretadas por Trichoderma asperellum (TR356) e Sclerotinia sclerotiorum quando inoculados juntos e/ou separados os dois organismos vivos. Os resultados obtidos através das análises por MALDI/TOF permitiram a identificação dasproteínas, β-1,3-glucanosiltransferase e α-1,2-D-mannosidase,demonstrando a possibilidade de identificaçãopara o entendimento futuro acerca da interação destes organismos. Foi possível, portanto, a identificação das proteínas através das estratégias utilizadas, porém serão necessárias futuras análises afim de elucidar a interação e função das proteínas secretadas através do fungo T. asperellum TR356sobre S. sclerotiorum.

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Ferreira, Luiz Fernando Romanholo. "Diversidade genética de isolados polispóricos de Crinipellis perniciosa (Stahel) Singer." Universidade de São Paulo, 2005. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11138/tde-26082005-150225/.

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Abstract:

A diversidade genética de Crinipellis perniciosa foi avaliada quanto à capacidade adaptativa de diferentes genótipos à dispersão geográfica e à associação preferencial ou diferencial com hospedeiros. Isolados polispóricos de C. perniciosa provenientes de diferentes Estados brasileiros (AM, RO, MG, BA, SP, MT e PA) e diferentes hospedeiros (Theobroma cacao L., Solanum cernuum, Solanum paniculatum, Solanum grandiflorum L., Solanum e lianas), foram analisados pelas técnicas de compatibilidade somática (SCG - Somatic Compatibility Group), através de reações de compatibilidade e/ou incompatibilidade, o uso de gel de eletroforese de proteínas totais, velocidade de crescimento, ELISA e Western Blot. Os diversos isolados foram agrupados com base em conjuntos de dados sobre suas características genéticas, identificando-se agrupamentos de acordo com a dispersão geográfica e hospedeiros de onde foram isolados. Foram construídos dois dendogramas pelo teste de compatibilidade permitindo classificar os isolados em três grupos: i)grupo formado pelos isolados de Rondônia e Pará e ii) grupo formado pelos isolados de Rondônia, Pará e Amazonas e o iii) grupo formado pelo isolado de Mato Grosso; o segundo teste separou os isolados em dois grandes grupos: i) grupo formado pelos isolados da Bahia, Minas Gerais, São Paulo, Mato Grosso e Rondônia e ii) grupo formado pelo isolado do Pará. O dendograma criado pelo perfil protéico permitiu agrupar os isolados em três grupos, de acordo com o hospedeiro e região de origem: (1) grupo formado pelo isolado de Theobroma cacao de Ouro Preto DOeste; (2) grupo constituído pelos isolados de Theobroma cacao da Bahia e os diversos isolados de Solanaceae do Estado de Minas Gerais, Bahia e São Paulo e grupo (3) formado pelo isolado de Lianas (cipós). De forma geral, conclui-se que há ampla diversidade genética entre os isolados de C. perniciosa provenientes das diferentes regiões brasileiras e em relação aos hospedeiros, comprovando-se haver elevada capacidade adaptativa caracterizada pela prevalência em ambientes diversos e pela disseminação a longas distâncias geográficas. Há também indicativos de que a velocidade de crescimento do fungo pode ser um dos fatores importantes para assegurar a colonização, já que é correlacionada com a dispersão geográfica, e também, para a seleção de biótipos patogênicos e para a variabilidade genética do fungo. The genetic diversity of Crinipellis perniciosa was evaluated how much to the capacity of adaptation of different genotypes to the geographic dispersion and the preferential or distinguishing association with hosts. Polisporics isolated of C. perniciosa proceeding from different Brazilian States (AM, RO, MG, BA, SP, MT e PA) and different hosts (Theobroma cacao L., Solanum cernuum, Solanum paniculatum, Solanum grandiflorum L., Solanum and lianas), had been analyzed by the techniques of somatic compatibility (SCG - Somatic Compatibility Group), through reactions of compatibility and/or incompatibility, the gel use of proteins electrophoresis, speed of growth, ELISA and Western Blot. Diverse the isolated ones had been grouped on the basis of different data on its genetic characteristics, identifying to groupings in accordance with the geographic dispersion and hosts of where they had been isolated. Two dendrogramas for the compatibility test had been constructed allowing to classify the isolated ones in three groups: i)group formed by isolated of Rondônia and Pará and ii) group formed for the isolated ones of Rondônia, Pará and Amazonas and iii) group formed for the isolated one of Mato Grosso; as the test separated the isolated ones in two great groups: i) group formed for isolated of the Bahia, the Minas Gerais, São Paulo, Mato Grosso and Rondônia and ii) group formed for the isolated one of Pará. The dendrograma created by the protein profile allowed to group the isolated ones in three groups, in accordance with the host and region of origin: (1) group formed for isolated of Theobroma cacao of Ouro Preto D'Oeste; (2) group consisting of isolated of Theobroma cacao of the Bahia and diverse the isolated ones of Solanaceae of the State of Minas Gerais, Bahia and São Paulo and group (3) formed by the isolated one of Liana. Of general form, it is concluded that it has ample genetic diversity enters the isolated ones of C. perniciosa proceeding from the different Brazilian regions and in relation to the hosts, proving to have high capacity of adaptation characterized by the prevalence in diverse environments and the dissemination the long geographic distances. It has also indicative of that the growth speed can be one of the factors important to assure the correlated settling since with the geographic dispersion, favors new biotypes, important factor for the genetic variability of fungus.

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Ruegger, Marcelo José Silveira. "Atividade enzimática e produção de ácido y-linolênico por fungos filamentosos isolados do solo, da estação ecológica de Juréia-Itatins, SP /." Rio Claro : [s.n], 2001. http://hdl.handle.net/11449/103961.

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Resumo: Os fungos constituem um reino de seres vivos que vêm despertando crescentes interesses em virtude do elevado potencial em elaborar substâncias economicamente importantes, como alimentos, solventes, enzimas, vitaminas, antibióticos, ácidos graxos e outros produtos, justificando a sua aplicação biotecnológica. As atividades enzimáticas destacando-se neste trabalho a da carboximetilcelulase e da xilanase foram avaliadas em oitenta linhagens de fungos isolados do solo da Estação Ecológica de Juréia-Itatins, SP. Os fungos foram cultivados em meio de farelo de trigo a 25oC por 4 dias. As enzimas liberadas no meio de cultura foram extraídas com 30 ml de água gelada e as respectivas atividades enzimáticas foram avaliadas em unidades (U) de enzima necessária para liberar um mol de glicose ou xilose por mililitro por minuto, nas condições do ensaio. As melhores atividades da carboximetilcelulase (8,38 U) e da xilanase (496,72 U) foram obtidas, respectivamente, nos cultivos com Trichoderma longibrachiatum (n. 31) e T. inhamatum (n. 33) a 28oC por 4 dias. A produção de ácido -linolênico foi avaliada em 25 linhagens de fungos zigomicetos, cultivados em meio contendo 2% de glicose e 1% de extrato de levedura, por 4 dias a 25oC. As culturas foram realimentadas com 20% de meio e permaneceram por 3 dias a 12oC. Nestas condições Mucor ramosissimus foi selecionado por apresentar a maior produção de ácido -linolênico (47,70 mg.l-1). Analisando-se diferentes fontes de carbono e nitrogênio e a influência do pH inicial do meio de cultura, verificou-se que o uso de glicose e extrato de levedura em meio com pH inicial de 4,5, após 4 dias a 25oC sob agitação constante de 150 rpm, a produção de ácido -linolênico correspondeu a 106,44 mg.l-1. Abstract: The fungi constitute a group of organisms that wake up crescents interests by virtue of their high potential in elaborating substances economically important, as enzymes and fatty acids justifying for the vast biotechnology application that they offer. The CMCase and xylanase activities were evaluated in eighty isolated fungi strains in the Ecological Station of Juréia-Itatins soil, in São Paulo State. These microorganisms were cultivated in wheat bran medium at 25oC for four days. The enzymes liberated in the culture medium were extracted with 30 ml of cold distilled water. Enzyme production is expressed as units of enzyme and one unit of enzyme activity is defined as 1 mol glucose or xylose released per minute per milliliter of culture extract. The best CMCase (8.38 U) and xylanase (496.72 U) activities were obtained, respectively, with Trichoderma longibrachiatum (n. 31) and Trichoderma inhamatum (n. 33) after cultivations at 28oC, for four days in wheat brain medium. The -linolenic acid production was evaluated in 25 strains of zygomycetous fungi in a culture medium containing 2% glucose and 1% yeast extract, after four days of incubation at 25oC. The cultures were added with 20% (v/v) of culture medium and they stayed at 12oC for three days. In these conditions Mucor ramosissimus was selected by presenting the best -linolenic acid production (47.70 mg.l-1). After analyzed different carbon and nitrogen sources and the influence of the initial culture medium pH, it was verified that the -linolenic acid production in the culture medium with 2% glucose and 1% yeast extract and initial pH 4.5, after four days at 25oC with a rotary shaker at 150 rpm, corresponded to 106.44 mg.l-1. Orientadora: Sâmia Maria Tauk Tornisiello Coorientadora: Gláucia Maria Pastore Banca: Sandra Regina Ceccato Antonini Banca: Siu Mui Tsai Banca: Dejanira de Franceschi de Angelis Doutor

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Lautert, Claudia. "Caracterização de isolados do fungo Malassezia pachydermatis através do perfil enzimático." reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS, 2010. http://hdl.handle.net/10183/29065.

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Abstract:

Malassezia spp. são fungos lipofílicos, reconhecidos há mais de cem anos como membros da microbiota cutânea normal humana, bem como agentes de doenças dermatológicas. Desde 1980, são relatados como causadores de infecções sistêmicas oportunistas. Estas leveduras são frequentemente encontradas em uma grande variedade de animais homeotérmicos, e sua ampla distribuição no meio ambiente agora está sendo explorada através de técnicas moleculares e bioquímicas. O enfoque deste estudo foi a espécie não lipido-dependente Malassezia pachydermatis, e a sua caracterização através do perfil enzimático pelo sistema Api-Zym®. Deste modo, utilizaram-se 30 amostras de M. pachydermatis isoladas de cães, com e sem sinais clínicos, identificadas pela técnica de Reação em Cadeia da Polimerase (PCR). As amostras foram cultivadas em meio de Dixon modificado, incubadas a 37°C durante 48 horas, para posterior quantificação através de espectrofotometria. Um inóculo de 65 μl foi colocado em cada orifício do kit comercial de verificação enzimática e, após, incubado a 37ºC por 4 horas. Os resultados foram obtidos através da leitura visual e interpretação das titulações por escalas pré-determinadas, também foram avaliadas as reações através de “escaneamento” eletrônico. Todos os testes foram realizados em triplicata. Os resultados demonstraram a atividade de enzimas específicas pertencentes ao grupo das peptídeo hidrolases (100%), fosfohidrolases (98,3%) e éster hidrolases (91,6%), enquanto que as enzimas α-galactosidase, β-galactosidase, β-glicuronidase, α-manosidase e α-fucosidase caracterizaram 10% de todos os isolados. Além disso, não se comprovou a viabilidade do sistema utilizado no estudo para a caracterização enzimática da levedura. Malassezia spp. are lipophilic fungi, which have been recognised for over a century as members of the normal human cutaneous flora, and also as agents of certain skin diseases. In addition, since the 1980s, they have been reported as causing opportunistic systemic infections. These yeasts have frequently been found on a diverse range of other warm-blooded animals, and their wider distribution in nature is now being explored using molecular techniques. The focus of the present study was the species no lipid-dependent Malassezia pachydermatis, and its characterization through the enzymatic profile by the Api-Zym® system. Then 30 isolated samples of dogs had been used, with and without clinical signals, identified by the technique of Polymerase Chain Reaction (PCR). The samples were cultivated into Dixon’s modified medium, incubated at 37°C during 48 hours, for posterior quantification through spectrophotometry. An inocula of 65 μl was placed in each microwell of the commercial kit of enzymatic verification and, after, it was incubated at 37ºC for 4h. The results were obtained through the visual reading and interpretation of the titulations by predetermined scales, it were also evaluated the reactions through electronic scanning. All the tests were performed in triplicate. The results demonstrated the activity of specific enzymes pertaining to the group of the peptide hydrolases (100%), phosphohydrolases (98,3%) and ester hydrolases (91,6%), while the enzymes α-galactosidase, β-galactosidase, β-glucuronidase, α-mannosidase and α-fucosidase characterized 10% off all the isolates. Moreover, it was not proven the viability of the system used in the study for the enzymatic characterization of the yeast.

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Tonelotto, Mariana. "Produção de celulases, purificação e caracterização bioquímico-cinética da ß-Glicosidase produzida por fungo isolado da região amazônica." Universidade Federal de São Carlos, 2012. https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/7001.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2016-08-17T18:39:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 4514.pdf: 2385637 bytes, checksum: 89b533535415a993d655f83f1387c6f0 (MD5) Previous issue date: 2012-06-27 Financiadora de Estudos e Projetos The selection of cellulase-producing fungi is one of the possible estrategies for obtaining necessary enzymes to hydrolyze the lignocellulosic material of plant biomass and thereby contribute to the viability of cellulosic ethanol production. The aim of this study was achive a screening of isolated fungi from the Amazon region to assess the production of enzymes related to plant biomass degradation, in order to select a line for production, purification and biochemical, kinetical and and structural biology characterizationof the ß-Galactosidase enzyme. Therefore, this work was undertaken in three stages, first of all it was performed a screening of 40 fungal strains isolated from the Amazon region through the cultivation in solid state fermentation (FES) at 35ºC for 240 hours, using as substrate wheat bran. It was evaluated the production of xylanase, endoglucanase, FPase, pectinase, ß-Glicosidase and total protein, and the fungi that stood out were: P6B2, the best producer of xylanase, P47C3 (Aspergillus niger), the best producer endoglucanase and ß-Glicosidase and P40B3, the best producer of FPase. These three fungi were selected for the second phase of this work for assessment in the production of xylanase, FPase, endoglucanase, ß-Glicosidase and total protein by submerged fermentation (FSm). The fermentation took place for 5 days at 30ºC and 200 rpm with a source of carbon: 1% of wheat bran washed and nutrient medium. The fungi P47C3, which was identified as Aspergillus niger, showed the best production of these enzymes, being selected for the third stage of this project. This last step involved the selection of an enzyme that has not been elucidated its structural biology. Given this fact, we carried out a study of selection of the medium, purification and biochemicalkinetical characterization of ß-Galactosidase. The Aspergillus niger (P47C3) was subjected to submerged for 5 days at 200 rpm at 30ºC. Purification occured in three steps using: ion exchange column SP-Sephadex C-50 and SP TSK-5PW column, and gelfiltration, with the resin Sephacryl S-200. The enzyme ß-Galactosidase showed a molecular weight of 125 kDa, being stable at pH 4,0, with anoptimum temperature of 55ºC. It was evaluated theKmap e Vmáxap of two substrates, PNPG and lactose, being: 2,204 mM-0,285 mM/min and 2,101 mM-0,75mM/min, respectively. The inhibition of hydrolasis of the substrate PNPG by ß-Galactosidase in the presence of galactose inhibitor product showed a Ki value of 5,01 mM. Finally, the ß-Galactosidase was subjected to crystallization conditions, the best conditions occurred in buffer 0,2M Tris- HCl, with the precipitation agent, 12% PEG 4000 at pH 8,6. Therefore, the unpublished protocol for purification of ß-Galactosidase was efficient and it is possible to crystallize this enzyme of isolated fungi from the Amazon region, which showed great potencial for the production of this enzyme and that the future can be used in industrial application and biotechnological innovations. A seleção de fungos produtores de celulases é uma das possíveis estratégias para a obtenção das enzimas necessárias para hidrolisar o material lignocelulósico da biomassa vegetal e com isso contribuir para a viabilização da produção de etanol celulósico. O objetivo desse trabalho foi realizar um screening dos fungos isolados da região amazônica para a avaliação da produção de enzimas relacionadas à degradação da biomassa vegetal, a fim de selecionar uma linhagem para produção, purificação e caracterização bioquímica, cinética e biologia estrutural da enzima ß-Galactosidase. Dessa forma, esse trabalho foi realizado em três etapas, primeiramente foi realizado um screening de 40 linhagens fúngicas isoladas da região amazônica, através do cultivo em fermentação em estado sólido (FES), a 35°C, por 240 horas, utilizando como substrato o farelo de trigo. Avaliou-se a produção de xilanase, endoglucanase, FPase, pectinase, ßglicosidase e proteínas totais, sendo que os fungos que mais se destacaram foram o: P6B2, melhor produtor de xilanase, P47C3 (Aspergillus niger), melhor produtor de endoglucanase e ß-glicosidase e o P40B3, melhor produtor de FPase. Esses três fungos, foram selecionados para a segunda fase do trabalho para avaliação na produção de xilanase, FPase, endoglucanase, ß-glicosidase e proteínas Totais por fermentação submersa (FSm). A fermentação ocorreu por 5 dias, à 30ºC e 200 rpm tendo como fonte de carbono: 1% de farelo de trigo lavado e meio nutriente. O fungo P47C3, identificado como Aspergillus niger, apresentou melhor produção dessas enzimas, sendo selecionado para a terceira etapa desse projeto. Essa última etapa, envolveu a escolha de uma enzima que não estivesse sua biologia estrutural elucidada. Diante desse fato, realizou-se um estudo de seleção do meio de cultivo, purificação e caracterização bioquimico-cinética da ß-Galactosidase. O fungo Aspergillus niger (P47C3) foi submetido a fermentação submersa, durante 5 dias, à 200 rpm em 30ºC. A purificação ocorreu em três etapas utilizando: colunas de troca iônica SP - Sephadex C-50 e a coluna SP -TSK 5PW; e gel filtração, com a resina Sephacryl S-200. A enzima ß-Galactosidase apresentou uma massa molecular de 125 kDa, sendo estável em pH 4,0, e com temperatura ótima de 55ºC. Avaliou-se a Kmap e Vmáxap de dois substratos, o PNPG e a lactose, sendo: 2,204 mM - 0,285 mM/min e 2,101 mM 0,750 mM/min, respectivamente. A inibição da hidrólise do substrato PNPG pela ß-Galactosidase na presença do produto inibidor galactose apresentou um valor de Ki de 5,01 mM. Por fim, a ß-Galactosidase foi submetida a condições de cristalização, as melhores condições ocorreram em tampão 0,2M Tris-HCl, tendo como agente precipitante, PEG 4000 12% em pH 8,6. Portanto, o protocolo inédito de purificação da ß-Galactosidase foi eficiente, sendo possível cristalizar essa enzima do fungo isolado da região amazônica, o qual apresentou grande potencial para a produção dessa enzima e que futuramente possa ser utilizado em aplicações industriais e inovações biotecnológicas.

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Simões, Maria Lúcia Garcia [UNESP]. "Produção de xilanase por fungos filamentosos isolados de solo de área de caatinga." Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2006. http://hdl.handle.net/11449/95030.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:25Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-07-28Bitstream added on 2014-06-13T19:56:06Z : No. of bitstreams: 1 simoes_mlg_me_rcla.pdf: 924529 bytes, checksum: 4fd62ec448289172b02333ca84efaa63 (MD5) Neste estudo, foram isoladas 67 linhagens de fungos filamentosos de solo de área de caatinga, sendo as coletas efetuadas em períodos seco e chuvoso, com o objetivo de se conhecer a biodiversidade deste bioma não explorado e avaliar o potencial destes fungos na produção de xilanase. Algumas linhagens não foram identificadas por inexistência de metodologias específicas e outras foram identificadas através de métodos microscópicos e bioquímicos. Foi efetuada uma triagem dos fungos potencialmente produtores desta enzima em meio de Vogel contendo xilano 1% como única fonte de carbono e avaliou-se através do Método Turbidimétrico Automatizado (Bioscreen-C), a melhor fonte de carbono para crescimento dos fungos selecionados. Os resultados obtidos nos cultivos em MFS, foram inexpressivos quando comparados aos obtidos em MFT. Os melhores produtores de xilanase em MFT foram cultivados em meio líquido de Vogel e MFT com adição individual de outras fontes de carbono a 1% (carbometilcelulose- CMC, xilano e a melhor fonte de carbono para crescimento, determinada pelo Bioscreen-C) em temperaturas apropriadas, pH 5, por 5 dias, inóculo de 1 x 107 esporos/mL. O CMC causou repressão catabólica na síntese de xilanase por estes fungos tendo a adição do xilano apresentado o mesmo efeito, com exceção de Trichoderma viride, que teve sua atividade aumentada para 143,0 U/mL e Aspergillus niger 11 que teve sua atividade aumentada de 33,4 U/mL para 57,1 U/mL. In this study, 67 strains of filamentous fungi were isolated from caatinga area, the collections were performed during the dry and rainy period, aiming to know the biodiversity of this not explored bioma and to evaluate the potential of these fungi to produce xylanase. Some of the strains were not identified due to the lack of specific methodologies and others were identified through microscopic and biochemical methods. A selection of the fungi which were considered potentially producers of xylanase was carried out in Voguel medium containing 1% of xylan as an only carbon source, and through a Automatized Turbidimetric Method (Bioscreen - C) the best carbon source for the fungi growth was evaluated. The results obtained in SBM were not expressive when compared to the ones obtained in WBM. The best xylanase producers in WBM were cultivated in Voguel liquid medium and WBM adding individually other carbon sources at 1% (carboxymethylcellulose -CMC; xylan; and the best growth carbon source determined by Bioscreen-C) at appropriated temperatures, pH 5,0 ; for 5 days, and a spore concentration of 1 x107 spores/mL. The CMC addition caused catabolic repression in xylanase production by these fungi, xylan addition showed the same effect, but Trichoderma viride 13 and Aspergillus niger 11 which have their activities increased from 39,21 U/mL to 143,0 U/mL and from 33,4 U/mL to 57,1 U/mL, respectively.

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Ferrarezi, Juliano Henrique. "Fungos isolados da Antártica com atividade antibacteriana a fitopatógenos /." Rio Claro, 2019. http://hdl.handle.net/11449/181431.

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Título original: Fungos isolados do solo da Antártica : avaliação da atividade contra bactérias fitopatogênicas Orientador: Daiane Cristina Sass Banca: Ben-Hur Mattiuz Banca: Patricia Giovanella Grazziotin Resumo: As bactérias fitopatogênicas do gênero Xanthomonas são capazes de atingir diversos cultivares de interesse comercial, causando anualmente perdas severas na produção. Um exemplo deste gênero é a Xanthomonas citri subsp. citri, causadora do cancro cítrico em diversas espécies de citros. O controle desta doença atualmente conta com o uso de quebraventos, erradicação de plantas contaminadas e desinfecção de equipamentos, embora o modo mais eficiente seja o uso de produtos químicos a base de cobre. Outra bactéria pertencente ao mesmo gênero é a X. albilineans, causadora da escaldadura-das-folhas na cana-de-açúcar. O controle dessa doença ainda é pouco efetivo, sendo aconselhada a desinfecção de equipamentos e mudas. Pensando no problema fitossanitário relacionado a essas bactérias e nos efeitos negativos associados aos produtos químicos à base de metais pesados, torna-se indispensável a busca por compostos naturais capazes de controlar estas doenças e que possam ser menos nocivos ao ambiente. Neste contexto, micro-organismos de ambientes extremos podem produzir metabólitos secundários ainda desconhecidos. Assim, o objetivo deste trabalho foi obter extratos brutos de fungos filamentosos isolados do solo antártico e avaliar seu potencial de bioatividade contra X. citri e X. albilineans através de ensaios de viabilidade celular. Foram testados 122 extratos contra ambas as bactérias. Nove destes extratos inibiram de forma satisfatória (>90%) o crescimento celular de X. citri e dois ex... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) Abstract: Phytopathogenic bacteria of the genus Xanthomonas able of attain several cultivars of commercial interest, causing yearly severe production losses. An example of bacterium of this genus is Xanthomonas citri subsp. citri, which causes citrus canker in various species of citrus. The control of this disease currently counts on the use of windbreaks, eradication of contaminated plants and disinfection of equipment, although the most efficient way is the use of copper-based chemicals. Another bacterium belonging to the same genus is X. albilineans, which causes leaf scald in sugarcane. The control of this disease is still not very effective, being advised the disinfection of equipment and seedlings. Thinking about the phytosanitary problem related to these bacteria and the negative effects associated with heavy metal chemicals, it is essential to search for natural compounds capable of controlling these diseases and that are less harmful to the environment. In this sense, microorganisms from extreme environments can produce secondary metabolites that are still unknown. Thus, the aim of this work was to obtain crude extracts of filamentous fungi isolated from the Antarctic soil and to evaluate their bioactivity potential against X. citri and X. albilineans through cell viability assays. In total, 122 extracts were tested against both bacteria. Nine of the 122 extracts inhibited satisfactorily (>90%) the cell growth of X. citri and two of the 122 extracts showed satisfactory inhibit... (Complete abstract click electronic access below) Mestre

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Simões, Maria Lúcia Garcia. "Produção de xilanase por fungos filamentosos isolados de solo de área de caatinga /." Rio Claro : [s.n.], 2006. http://hdl.handle.net/11449/95030.

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Orientador: Sâmia Maria Tauk Tornisielo Banca: Jonas Contiero Banca: Luis Henrique Souza Guimarães Resumo: Neste estudo, foram isoladas 67 linhagens de fungos filamentosos de solo de área de caatinga, sendo as coletas efetuadas em períodos seco e chuvoso, com o objetivo de se conhecer a biodiversidade deste bioma não explorado e avaliar o potencial destes fungos na produção de xilanase. Algumas linhagens não foram identificadas por inexistência de metodologias específicas e outras foram identificadas através de métodos microscópicos e bioquímicos. Foi efetuada uma triagem dos fungos potencialmente produtores desta enzima em meio de Vogel contendo xilano 1% como única fonte de carbono e avaliou-se através do Método Turbidimétrico Automatizado (Bioscreen-C), a melhor fonte de carbono para crescimento dos fungos selecionados. Os resultados obtidos nos cultivos em MFS, foram inexpressivos quando comparados aos obtidos em MFT. Os melhores produtores de xilanase em MFT foram cultivados em meio líquido de Vogel e MFT com adição individual de outras fontes de carbono a 1% (carbometilcelulose- CMC, xilano e a melhor fonte de carbono para crescimento, determinada pelo Bioscreen-C) em temperaturas apropriadas, pH 5, por 5 dias, inóculo de 1 x 107 esporos/mL. O CMC causou repressão catabólica na síntese de xilanase por estes fungos tendo a adição do xilano apresentado o mesmo efeito, com exceção de Trichoderma viride, que teve sua atividade aumentada para 143,0 U/mL e Aspergillus niger 11 que teve sua atividade aumentada de 33,4 U/mL para 57,1 U/mL Abstract: In this study, 67 strains of filamentous fungi were isolated from caatinga area, the collections were performed during the dry and rainy period, aiming to know the biodiversity of this not explored bioma and to evaluate the potential of these fungi to produce xylanase. Some of the strains were not identified due to the lack of specific methodologies and others were identified through microscopic and biochemical methods. A selection of the fungi which were considered potentially producers of xylanase was carried out in Voguel medium containing 1% of xylan as an only carbon source, and through a Automatized Turbidimetric Method (Bioscreen - C) the best carbon source for the fungi growth was evaluated. The results obtained in SBM were not expressive when compared to the ones obtained in WBM. The best xylanase producers in WBM were cultivated in Voguel liquid medium and WBM adding individually other carbon sources at 1% (carboxymethylcellulose -CMC; xylan; and the best growth carbon source determined by Bioscreen-C) at appropriated temperatures, pH 5,0 ; for 5 days, and a spore concentration of 1 x107 spores/mL. The CMC addition caused catabolic repression in xylanase production by these fungi, xylan addition showed the same effect, but Trichoderma viride 13 and Aspergillus niger 11 which have their activities increased from 39,21 U/mL to 143,0 U/mL and from 33,4 U/mL to 57,1 U/mL, respectively Mestre

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Svahn, Stefan. "Analysis of Secondary Metabolites from Aspergillus fumigatus and Penicillium nalgiovense : Antimicrobial Compounds from Filamentous Fungi Isolated from Extreme Environments." Doctoral thesis, Uppsala universitet, Avdelningen för farmakognosi, 2015. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-242611.

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Abstract:

This thesis describes the cultivation and extraction of filamentous fungi isolated from extreme environments in the search for new antibiotic compounds. Filamentous fungi are a rich source of medicines including antibiotics, and it is believed that many currently unknown fungal species and bioactive fungal metabolites remain to be discovered. Aspergillus fumigatus and Penicillium nalgiovense strains were isolated from an antibiotic-contaminated riverbed near Hyderabad, India, and soil taken from a penguin’s nest on Paulete Island, Antarctica, respectively. It was anticipated that the extreme conditions within these environments would exert unusual selective pressures on their filamentous fungi, possibly causing the secretion of new bioactive compounds. The cultivation, extraction and analysis of metabolites from the A. fumigatus strain resulted in the isolation of the antimicrobial substance gliotoxin. Subsequent investigations revealed that this strain’s secretion of gliotoxin was increased by as much as 65 % when it was cultivated in the presence of pathogen-associated molecular patterns. These results indicate the existence of a fungal receptor/signaling system for detecting nearby bacteria. The scope for using gliotoxin and the related metabolite bis(methyl)gliotoxin as biomarker metabolites for diagnosing the lethal pulmonary condition invasive aspergillosis was also investigated. Bronchoalveolar lavage fluid from 42 patients with and without possible invasive aspergillosis was extracted and analyzed. The results obtained suggest that gliotoxin and bis(methyl)gliotoxin are not suitable markers for diagnosing invasive aspergillosis. Studies on the P. nalgiovense strain from Antarctica resulted in the isolation of the antifungal agent amphotericin B. The secretion of this compound increased when P. nalgiovense was cultured on a potato-dextrose agar enriched with coconut flakes rather than liquid RPMI 1640 medium. This was the first time amphotericin B was isolated from any organism other than the bacterium Streptomyces nodosus. The results presented in this thesis will be useful in the continuing search for novel bioactive compounds, the diagnosis of fungal infections, and as a source of insight into the interactions between microorganisms. Moreover, they show that even extensively studied fungal genera such as Aspergillus and Penicillium are not completely understood and may produce unexpected or previously unknown bioactive metabolites under appropriate conditions.

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Ferranti, Larissa de Souza. "Aspergillus section Nigri produtores de fumonisina B2 isolados de castanha-do-brasil." Universidade de São Paulo, 2012. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-23042013-081849/.

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A castanha-do-brasil é uma planta de grande importância econômica na região da Amazônia. Os baixos níveis tecnológicos característicos de sua cadeia produtiva e as condições inadequadas de manejo da matéria prima, favorecem o aparecimento de contaminação por fungos produtores de micotoxinas. A fumonisinas B2 (FB2) é uma micotoxina produzida por espécies de Fusarium e Aspergillus section Nigri, e é motivo de preocupação para a saúde humana e de animais. O objetivo do presente trabalho foi verificar o potêncial toxigênico quanto à produção de fumonisina B2 das cepas de A. section Nigri isolados de castanha-do-brasil e verificar a contaminação desse alimento por essa micotoxina. De um total de 200 cepas de A. section Nigri testadas quanto à capacidade de produção de fumonisina B2, apenas 39 cepas (19,5 %) produziram FB2, cento e trinta e oito (69 %) não foram produtoras de fumonisina B2 e 23 cepas (11,5 %) apresentaram picos menores que o limite de detecção. Das 100 amostras de castanha-do-brasil analisadas, nenhuma estava contaminada por fumonisina B2. Brazil nut is a plant with vast economic importance in the Amazon region and is an important product exported by Brazil. However, low levels of technology, and inadequate management of raw material favor the appearance of contamination by fungi that produce toxic metabolites called mycotoxins. Fumonisin B2 (FB2) is a mycotoxin produced by Fusarium species and Aspergillus section Nigri, and is of concern for human health. The aim of this study was to assess the toxigenic potential for fumonisin B2 production by Aspergillus section Nigri strain isolated from brazil nut and check the contamination of food by this mycotoxin. From a total of 200 strains of Aspergillus section Nigri tested for the ability to produce fumonisin B2, only 39 strains (19.5 %) were producing FB2, 138 (69 %) were not producing fumonisin B2, and 23 strains (11.5 %) showed peaks less than the detection limit. Of the 100 samples of brazil nuts analyzed, none were contaminated with fumonisin B2.

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Wellbaum, Christian [UNESP]. "Produção de ácidos graxos por linhagens de Mucor spp. isoladas de solo de área de cerrado, município de Corumbataí, Estado de São Paulo." Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2006. http://hdl.handle.net/11449/103980.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-10-26Bitstream added on 2014-06-13T21:05:13Z : No. of bitstreams: 1 wellbaum_c_dr_rcla.pdf: 1434990 bytes, checksum: 675e636851cc599591f7297d59472801 (MD5) Na área de cerrado, município de Corumbatai, SP, foram isoladas 267 linhagens de fungos filamentosos em amostras de solo, coletadas no inverno (2002) e no verão (2003), pelos métodos da Técnica da placa-de-solo e Técnica da diluição em série. Destas, 12 linhagens foram consideradas potenciais produtoras de ácidos Á-linolenico (AGL) e araquidônico (AA) por pertencerem a ordem Mucorales. Foram realizados ensaios preliminares para avaliar a eficiência de diversos protocolos de extração de ácidos graxos dos fungos. Foram testadas modificações de metodologias tradicionais, adicionando uma ou duas vezes a solução extratora de metanol-cloroformio-água (2,0:1,0:0,8 v/v) a biomassa úmida, congelada, liofilizada, seca e/ou macerada. De acordo com os resultados obtidos, optou-se por utilizar a biomassa liofilizada, tratada duas vezes com a solução extratora. Os extratos resultantes foram transesterificados e analisados por cromatografia gasosa. Algumas linhagens foram cultivadas em erlenmeyeres de 125mL e 250mL, contendo respectivamente 50mL e 100mL de meio de cultura líquido de extrato de malte a 2%, durante 6 dias sob agitação, a 25C. Foi observado que a linhagem MX produziu maior quantidade de AGL, apresentando médias de 61,9mg.L-1e 55,7mgEL-1, respectivamente, em frascos de 250mL e 125mL. Maior produção de AA foi verificada na linhagem M132, cuja média foi de 0,3mgEL-1. As linhagens MX, M131 e M132 foram também cultivadas em frascos de 125mL contendo 50mL de meio líquido de extrato-de-malte suplementado com óleo de girassol a 2% e 1% de extrato de levedura. Nestes, as maiores quantidades médias de AGL, 201,62mgEL-1, e de AA, 3,12mgEL-1, foram observadas no cultivo da linhagem M131, sendo estes valores 1.311,15% e 1011,37% maiores em relação aqueles verificados em meio de extrato de malte. In the savannah area, municipal district of Corumbatai, state of Sao Paulo, 267 fungi strains were isolated in soil samples collected, in the winter (2002) and in the summer (2003), with the gsoil plate methodh and serial dilution method. Twelve strains were considered potential producers of Á-linolenic acid (GLA) and arachidonic acid (AA) for belonging to the order Mucorales. Preliminary experiments were accomplished to evaluate the efficiency of several protocols of extraction of fatty acids from fungi. Modifications of traditional methodologies were tested, adding one or twice the solvent solution of methanol-chloroform-water (2.0:1.0:0.8 v/v) to the wet, frozen, freeze-dried, dried and/or disrupted biomass. In agreement with the obtained results, the biomass was freeze-dried and treated twice with the solvent solution. The resulting extracts were transesterified and analized by gas cromatography Some strains were cultivated in shake flasks of 125mL and 250mL, containing respectively 50mL and 100mL of liquid malt extract culture media (2%), for 6 days under agitation, at 25C. It was observed that the strain MX produced larger amounts of GLA, mean of 61.9mgEL-1 and 55.7mgEL-1, respectively, in shake flasks of 250mL and 125mL. Higher production of AA was verified in the strain M132, mean of 0.3mgEL-1. The srains MX, M131 and M132 were also cultivated in shake flasks of 125mL containing 50mL of liquid malt extract media enhanced with sunflower oil (2%) and yeast extract (1%). In these the largest amounts of GLA, mean of 201.62mgEL-1, and of AA, mean of 3.12mgEL-1, were observed in the cultivation of the strain M131, these values being 1,311.15% and 1,011.37% larger in relation to those verified in same strain cultivated in malt extract media. The three strains were grown in Bioreactor with capacity of 2L containing 1L of malt extract media (2%) added or not with sunflower oil (2%).

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Wellbaum, Christian. "Produção de ácidos graxos por linhagens de Mucor spp. isoladas de solo de área de cerrado, município de Corumbataí, Estado de São Paulo /." Rio Claro : [s.n.], 2006. http://hdl.handle.net/11449/103980.

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Abstract:

Orientador: Sâmia Maria Tauk-Tornisielo Banca: Jorge Horri Banca: Sandra Regina Ceccato Antonini Banca: Eleonora Cano Carmona Banca: Luis Henrique Souza Guimarães Resumo: Na área de cerrado, município de Corumbatai, SP, foram isoladas 267 linhagens de fungos filamentosos em amostras de solo, coletadas no inverno (2002) e no verão (2003), pelos métodos da Técnica da placa-de-solo e Técnica da diluição em série. Destas, 12 linhagens foram consideradas potenciais produtoras de ácidos Á-linolenico (AGL) e araquidônico (AA) por pertencerem a ordem Mucorales. Foram realizados ensaios preliminares para avaliar a eficiência de diversos protocolos de extração de ácidos graxos dos fungos. Foram testadas modificações de metodologias tradicionais, adicionando uma ou duas vezes a solução extratora de metanol-cloroformio-água (2,0:1,0:0,8 v/v) a biomassa úmida, congelada, liofilizada, seca e/ou macerada. De acordo com os resultados obtidos, optou-se por utilizar a biomassa liofilizada, tratada duas vezes com a solução extratora. Os extratos resultantes foram transesterificados e analisados por cromatografia gasosa. Algumas linhagens foram cultivadas em erlenmeyeres de 125mL e 250mL, contendo respectivamente 50mL e 100mL de meio de cultura líquido de extrato de malte a 2%, durante 6 dias sob agitação, a 25C. Foi observado que a linhagem MX produziu maior quantidade de AGL, apresentando médias de 61,9mg.L-1e 55,7mgEL-1, respectivamente, em frascos de 250mL e 125mL. Maior produção de AA foi verificada na linhagem M132, cuja média foi de 0,3mgEL-1. As linhagens MX, M131 e M132 foram também cultivadas em frascos de 125mL contendo 50mL de meio líquido de extrato-de-malte suplementado com óleo de girassol a 2% e 1% de extrato de levedura. Nestes, as maiores quantidades médias de AGL, 201,62mgEL-1, e de AA, 3,12mgEL-1, foram observadas no cultivo da linhagem M131, sendo estes valores 1.311,15% e 1011,37% maiores em relação aqueles verificados em meio de extrato de malte Abstract: In the savannah area, municipal district of Corumbatai, state of Sao Paulo, 267 fungi strains were isolated in soil samples collected, in the winter (2002) and in the summer (2003), with the gsoil plate methodh and "serial dilution method". Twelve strains were considered potential producers of Á-linolenic acid (GLA) and arachidonic acid (AA) for belonging to the order Mucorales. Preliminary experiments were accomplished to evaluate the efficiency of several protocols of extraction of fatty acids from fungi. Modifications of traditional methodologies were tested, adding one or twice the solvent solution of methanol-chloroform-water (2.0:1.0:0.8 v/v) to the wet, frozen, freeze-dried, dried and/or disrupted biomass. In agreement with the obtained results, the biomass was freeze-dried and treated twice with the solvent solution. The resulting extracts were transesterified and analized by gas cromatography Some strains were cultivated in shake flasks of 125mL and 250mL, containing respectively 50mL and 100mL of liquid malt extract culture media (2%), for 6 days under agitation, at 25C. It was observed that the strain MX produced larger amounts of GLA, mean of 61.9mgEL-1 and 55.7mgEL-1, respectively, in shake flasks of 250mL and 125mL. Higher production of AA was verified in the strain M132, mean of 0.3mgEL-1. The srains MX, M131 and M132 were also cultivated in shake flasks of 125mL containing 50mL of liquid malt extract media enhanced with sunflower oil (2%) and yeast extract (1%). In these the largest amounts of GLA, mean of 201.62mgEL-1, and of AA, mean of 3.12mgEL-1, were observed in the cultivation of the strain M131, these values being 1,311.15% and 1,011.37% larger in relation to those verified in same strain cultivated in malt extract media. The three strains were grown in Bioreactor with capacity of 2L containing 1L of malt extract media (2%) added or not with sunflower oil (2%) Doutor

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Sobreira, Aline Cavalcante Mesquita. "Study chemical and cytotoxic secondary metabolites isolated endophytic fungi from Aroeira-do-SertÃo (Myracrodruon urundeuva Fr. All.):Pseudofusicoccum stromaticum and Lasiodiplodia theobromae." Universidade Federal do CearÃ, 2016. http://www.teses.ufc.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=16644.

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Abstract:

Empresa Brasileira de Pesquisa AgropecuÃria Banco do Nordeste do Brasil Fungos endofÃticos tÃm sido apontados como uma fonte promissora de substÃncias biologicamente ativas, entre as quais compostos com potencial atividade anticÃncer. Neste contexto, o presente trabalho descreve o primeiro estudo de prospecÃÃo quÃmica e citotoxicidade de dois fungos endofÃticos isolados de Aroeira-do-sertÃo (Myracrodruon urundeuva Fr. All.): Pseudofusicoccum stromaticum (MUB58) e Lasiodiplodia theobromae (MUB65). Os extratos de acetato de etila MUB58 e MUB65 foram obtidos atravÃs de partiÃÃo lÃquido-liquido do caldo destas cepas fÃngicas, as quais foram cultivadas por 21 dias em extrato de BD e malte, respectivamente. Os extratos fÃngicos foram inicialmente analisados por cromatografia lÃquida de ultraeficiÃncia acoplada a espectrometria de massas de alta resoluÃÃo (CLUE-EM) e posteriormente submetidos a cromatografia em Sephadex LH-20, seguida de cromatografia lÃquida de alta eficiÃncia com detector de arranjo de diodo. AnÃlise de CLUE-EM permitiu caracterizar a presenÃa de sete metabÃlitos no extrato MUB-58: O-sulfato de colina, xantofusina, 7-hidroxi-1-isocromanona, Ãcido multicÃlico, djalonensona, 3-Ãcido carboxÃlico-8-metoxicarbonila-1-hidroxi-9-oxo-9H-xantona e ciclo-Phe-Leu-Val-Leu-Leu. AlÃm disso, foram isolados quatro metabÃlitos ciclo-L-Phe-D-Leu1-L-Leu2-L-Leu3-L-lle (FC1), 5-hidroxi-metilfurfural (FC2), rotenolona (FC3) e tefrosina (FC4). O composto FC1 Ã inÃdito na literatura, enquanto os compostos FC3 e FC4 estÃo sendo relatados pela primeira vez em fungos endofÃticos. Da mesma forma, a anÃlise CLUE-EM do extrato MUB-65 levou Ã caracterizaÃÃo quÃmica de oito compostos jÃ relatados na espÃcie L. theobromae: 4-hidroximeleina; meleina; (3R, 5R)- 5-hidroxila-de-O-metil-lasiodiplodina; (3R,5R)-hidroxilasiodiplodina; 2,4,6-trimetiloct-2-enoato,1,2,6,8a- tetrahidro-7-hidroxi-1-8a-dimetil-6-oxo-2-naftalenila; lasiodiplodina; lasiojasmonato A e lasiojasmonatos B ou C. Adicionalmente, dois metabÃlitos foram isolados: lasiodiplodina (LT1) e rel-11-12- (7âR*, 4âR*, 2âR*- tetrahidrofuro[1â,2â] piranil)- lasiodiplodina (LT2). O composto LT2 estÃ sendo relatado pela primeira vez na literatura. As estruturas quÃmicas de todas as substÃncias isoladas foram elucidadas por espectrometrias de RessonÃncia MagnÃtica Nuclear de 1H e 13C, infravermelho e CLUE-EM. Os extratos e seus respectivos metabÃlitos isolados foram submetidos ao ensaio de citotoxicidade para avaliaÃÃo dos seus efeitos antiproliferativos frente a uma linhagem celular de cÃncer colorretal (HCT-116). O extrato de MUB58 apresentou significativa atividade (75%) correspondendo a um IC50 de 10,40 Âg.mL-1, enquanto o extrato de MUB65 foi inativo. Os metabÃlitos isolados LT1 (IC50 11,24 Âg.mL-1), FC3 (IC50 5,59 Âg.mL-1) e FC4 (IC50 0,51 Âg.mL-1) apresentaram atividades na faixa de 11,24 a 0,51 Âg.mL-1. Endophytic fungi have been identified as a promising source of biologically active substances,including compounds with potential anticancer activity. In this context, this paper describes the first study of chemical prospecting and cytotoxicity two endophytic fungi isolated from Aroeira -do-SertÃo(Myracrodruon urundeuva Fr.ll.):Pseudofusicoccum stromaticum (MUB-58) and Lasiodiplodia theobromae (MUB - 65). The ethylacetate extracts MUB-58 and MUB-65 were obta ined by liquid-liquid partition broth these fungal strains which were cultured for 21 days on BD and malt extract , respectively. The fungal extracts were first analyzed by liquid chromatography of ultraefficiency coupled to spectrometry, high resolution mass (CLUE -MS) and subsequently subjected to chromatography on Sephadex LH - 20, followed by liquid chromatography of high efficiency with diode array detector. CLUE - MS analysis allowed to determine the prese nce of metabolites in seven MUB 58 extract: cholin - O - sulfate, xanthofusin, 7-hidroxy -1-isochromanone, multico licacid, djalonensone, 8 - methoxycarbonyl-1-hidroxy-9-oxo-9H-xanthene-3-carboxylix acidand cyclo-Phe-Leu-Val-Leu-Leu. In addition, were isolated four metabolites:cycloL-Phe-D-Leu1-L-Leu2-L-Leu 3-L-Ile (FC1), 5-hidroxy-methilfurfural (FC2), rotenolone (FC3) and tephrosin (FC4).The compound FC1 is unprecedented in the literature, while FC3 and FC4 compounds are being reported for the first time in en dophytic fungi. Likewise, a CLUE - MS analysis the MUB - 65 extract led to characterization of eight chemical compounds already reported in the species L. theobromae:4-hidroxymelein; Mellein;(3R,5R)-5-hidroxyl-de-O-methyl-lasiodiplodin;(3 R,5 R)- hydroxyla siodiplodin; 2,4,6-trimethyloct-2-enoic acid-1,2,6,8a-tetrahydro-7-hydroxy-1-8a-dimethyl-6-oxo-2- naphtalenyl-ester;lasiodiplodin;lasiojasmonate A and lasiojasmonates B ou C. Additionally, two metabolites w ere isolated: lasiodiplodin(LT1) and rel-11-12-(7'R* 4'R*, 2 'R*-tetrahydrofuro [1', 2'] pyranyl)-lasiodiplodin (LT2). The compound LT2 being first reported in the literature. The chemical structures of all isolated compounds were elucidated by spectrometries Nuclear Magnetic Resonance 1 H and 13C, IR and CLUE-MS. The extracts and their isolated metabolites were subjected to the cytotoxicity assay to evaluate their antiproliferative effects against a colorectal cancer cell line (HCT-116). The MUB-58 extract showed significant activity (75%) corresponding to an IC50of 10.40 μg.mL -1, while the MUB65 extract was inactive. The LT1 isolated metabolites (IC5011.24 μg.mL-1), FC3(IC50 5.59 μg.mL-1) and FC4(IC500.51 μg.mL-1) showed activity in the range of 11.24 to 0.51 μg.mL-1.

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Gomes, Larissa Bitencourt. "Diversidade, potencial toxigênico e patogenicidade de espécies de Fusarium isolados em arroz." reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS, 2014. http://hdl.handle.net/10183/183551.

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Abstract:

Neste estudo, 144 amostras de sementes de arroz oriundas de áreas de produção de sementes dos estados do Rio Grande do Sul, Santa Catarina e Goiás, cultivadas em três safras, foram analisadas quanto a presença de Fusarium. Colônias de espécies do complexo Fusarium graminearum (FGSC) foram identificadas em 43% das 110 amostras da safra 2011/12 com incidência média de 0,7% e colônias de outras espécies do gênero em 77% das amostras com incidência média de 3,6%. Quinze amostras com variada incidência de Fusarium, apresentaram concentração média da micotoxina deoxinivalenol (DON) de 5.750 μg/kg. Em uma coleção de 144 isolados purificados de Fusarium obtidos das sementes de arroz infectadas, foram identificadas, por métodos moleculares (genotipagem multilocus e similaridade com sequencias do gene TEF1-alfa), quatro complexos de espécies: F. fujikuroi (FFSC) F. chlamydosporum (FCSC), F. graminearum (FGSC) e F. incarnatum-equiseti (FIESC). Dentre os 96 isolados do FGSC, a espécie-genótipo tricoteceno predominante foi F. asiaticum-NIV (68/96), seguido de F. graminearum-15-ADON (14/96), F. cortaderiae-NIV (13/96) e um F. meridionale-NIV. Isolados de F. asiaticum oriundos do arroz e F. graminearum oriundos do trigo, quando cultivados em grãos de arroz, produziram a micotoxina predita pela genotipagem, NIV e 15-ADON, respectivamente No entanto os isolados de F. asiaticum do trigo produziram DON e seus acetilados, discordando da genotipagem (NIV). Nos ensaios de patogenicidade em plantas de arroz, o isolados de F. asiaticum do arroz mostraram-se mais agressivos do que F. asiaticum e F. graminearum do trigo. Já no trigo, os isolados F. asiaticum do arroz foram os menos agressivos. Esses resultados suportam a hipótese que adaptação ao hospedeiro pode influenciar na distribuição das espécies do complexo. Na análise de tricotecenos nas sementes dos ensaios de patogenicidade no arroz, somente os isolados de F. chlamydosporum produziram DON (800 a 900 μg/kg). Nas inoculações em trigo, somente os isolados F. asiaticum oriundo do trigo produziram a micotoxina nivalenol. Os resultados deste estudo contribuem para o aumento do conhecimento sobre a diversidade de espécies de Fusarium em arroz e alertam sobre a alta contaminação com tricotecenos por um complexo de espécies toxigênicas. In this study, 144 samples of rice seeds obtained from seed-growing areas of the states of Rio Grande do Sul, Santa Catarina and Goiás, during three seasons, were assessed for the presence of Fusarium. Fungal colonies resembling species of the Fusarium graminearum species complex (FGSC) were identified in 43% of 110 samples from the 2011/12 season with mean incidence of 0,7%. Also, colonies of other species of the genus were found in 77% of the samples with mean incidence of 3,6%. Fifteen seed samples that showed various Fusarium incidence levels had high levels of deoxynivalenol (DON) mycotoxin (mean = 5.750 μg/kg) and its acetylates. In a collection of 144 purified isolates obtained from the infected seeds, 19 species grouped in four species complexes were identified using molecular analysis (multilocus genotyping targeting FGSC and sequences of TEF1-alfa): F. fujikuroi species complex (FFSC), F. chlamydosporum species complex (FCSC), F. graminearum species complex (FGSC) and F. incarnatum-equiseti species complex (FIESC). Among the four phylogenetic species-trichothecene genotype within the FGSC, F. asiaticum-NIV was the most prevalent (68/96), followed by F. graminearum-15-ADON (14/96), F. cortaderiae-NIV (13/96) and one F. meridionale-NIV. F. asiaticum isolates from rice and F. graminearum from wheat produced the same trichothecene predicted by the PCR assay, NIV and 15-ADON, respectively Nevertheless, F. asiaticum isolates from wheat did not produce NIV as predicted by the genotyping. In the pathogenicity assay in rice, F. asiaticum isolates from rice were more aggressive than F. asiaticum and F. graminearum isolates from wheat. In wheat, F. asiaticum from rice were the least aggressive isolates. The trichothecene analysis in seeds from the pathogenicity assays showed that only isolates of the FCSC produced DON (800 a 900 μg/kg). In wheat, only F. asiaticum from wheat produced NIV. Results of this study contributes to expand the knowledge on the diversity of Fusarium affecting rice seeds and raise concern about the high contamination of rice with trichothecenes possibly produced by a complex of toxigenic species. Also, it corroborates with the hypothesis that host preference possibly regulates distribution of species within the FGSC complex.

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Reis, Eduardo José de Carvalho [UNESP]. "Leveduras patogênicas em fezes de aves de cativeiro: relação fenotípica e genotípica entre os isolados." Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2015. http://hdl.handle.net/11449/136688.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2016-04-01T17:54:47Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-06-19. Added 1 bitstream(s) on 2016-04-01T18:00:27Z : No. of bitstreams: 1 000859873.pdf: 2638623 bytes, checksum: 90fbdca81a4a3fccc9087d1e9cec6b1c (MD5) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Os homens e animais possuem uma relação milenar, em que o grupo das aves, em especial, é utilizado amplamente para diversas finalidades, tais como alimentação e companhia. As aves são retratadas como disseminadoras de patógenos ao ambiente, entretanto, o conhecimento a respeito deste papel a determinadas espécies aviárias, intimamente correlacionadas ao ser humano, são um tanto escassos. O presente trabalho teve como objetivos isolar, identificar e caracterizar o fenótipo e o genótipo de leveduras obtidas de fezes de cinco aves de cativeiro: galinha (Gallus gallus domesticus), Pássaro-do-amor (Agapornis spp), Periquito-australiano (Melopsittacus undulatus) calopsita (Nymphicus hollandicus) e canário (Serinus canaria domesticus). Para tanto, foram avaliadas 247 amostras de fezes destas cinco espécies aviárias, provenientes de sete cidades localizadas na região noroeste do estado de São Paulo, Sul de Minas Gerais e sudoeste do Mato Grosso do Sul. A coleta foi realizada com auxílio de espátulas estéreis. O material foi semeado em ágar Sabouraud dextrose e ágar semente de Níger, como titulações. A identificação das espécies baseou-se nas características macro e micromorfólogicas, e bioquímicas. Ademais, todos os isolados identificados, foram submetidos ao teste de antifungigrama por disco-difusão (CLSI, documento M44-A), frente a anfotericina B, cetoconazol, fluconazol e itraconazol. Aqueles que apresentavam padrões de suscetibilidade dose-dependente ou resistente, foram submetidos ao teste de microdiluição em caldo (CLSI, documento M27-A3). A ocorrência de leveduras se deu em 89% das amostras, variando de 77,5% a 94,0% independente da ave estudada. Foram obtidos 318 isolados, pertencentes a 29 espécies diferentes. O gênero prevalente foi Candida com 183 isolados (57,5%), seguido de Cryptococcus com 45 (14,2%), Rhodotorula com 38 (11,9%) e Trichosporon com 36 (11,3%); os demais gêneros totalizaram 16 isolados... Men and animals have an age-old relationship, where the group of birds, in particular, is widely used for various purposes, such as food and company.Men and animals have an age-old relationship, where the group of birds in particular is widely used for various purposes, such as food and company. The birds are portrayed as disseminators of pathogens to the environment, however, knowledge about this role certain avian species, closely correlated to humans, are somewhat scarce. This study aimed to isolate, identify and characterize the phenotype and the genotype obtained yeast stool five captive birds: chicken (Gallus gallus domesticus), Love bird (Agapornis spp), Budgerigar (Melopsittacus undulatus) cockatiel (Nymphicus hollandicus) and canary (Serinus canaria domesticus). Therefore, we evaluated 247 stool samples of these five avian species from seven cities located in the northwest from State of São Paulo, southern of Minas Gerais and southwestern Mato Grosso do Sul. The collection was performed using sterile spatulas. The material was seeded in Sabouraud dextrose agar and seed Niger agar, with titrations. The identification of species was based on biochemical and macro and micromorphological characteristics. In addition, all isolates identified were submitted to antifungal susceptibility testing by disk diffusion (CLSI, M44-A), compared to amphotericin B, ketoconazole, fluaconazole and itraconazole. The occurrence of yeasts occurred in 89% of samples, ranging from 77.5% to 94.0% of the studied independently bird. There were obtained 318 isolates belonging to 29 different species. There were obtained 318 isolates belonging to 29 different species. The prevalent genus isolated was Candida with 183 (57.5%), followed by Cryptococcus with 45 (14.2%), Rhodotorula with 38 (11.9%) and Trichosporon with 36 (11.3%); other genres totaled 16 isolates (5.0%). Note that, in the number of fungal species isolated, C. albicans, C. guilliermondii, C. ...

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Reis, Eduardo José de Carvalho. "Leveduras patogênicas em fezes de aves de cativeiro : relação fenotípica e genotípica entre os isolados /." São José do Rio Preto, 2015. http://hdl.handle.net/11449/136688.

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Abstract:

Orientador: Margarete Teresa Gottardo de Almeida Coorientador: Banca: Ana Marisa Fusco Almeida Banca: Debora Aparecida Pires de Campos Zuccari Resumo: Os homens e animais possuem uma relação milenar, em que o grupo das aves, em especial, é utilizado amplamente para diversas finalidades, tais como alimentação e companhia. As aves são retratadas como disseminadoras de patógenos ao ambiente, entretanto, o conhecimento a respeito deste papel a determinadas espécies aviárias, intimamente correlacionadas ao ser humano, são um tanto escassos. O presente trabalho teve como objetivos isolar, identificar e caracterizar o fenótipo e o genótipo de leveduras obtidas de fezes de cinco aves de cativeiro: galinha (Gallus gallus domesticus), Pássaro-do-amor (Agapornis spp), Periquito-australiano (Melopsittacus undulatus) calopsita (Nymphicus hollandicus) e canário (Serinus canaria domesticus). Para tanto, foram avaliadas 247 amostras de fezes destas cinco espécies aviárias, provenientes de sete cidades localizadas na região noroeste do estado de São Paulo, Sul de Minas Gerais e sudoeste do Mato Grosso do Sul. A coleta foi realizada com auxílio de espátulas estéreis. O material foi semeado em ágar Sabouraud dextrose e ágar semente de Níger, como titulações. A identificação das espécies baseou-se nas características macro e micromorfólogicas, e bioquímicas. Ademais, todos os isolados identificados, foram submetidos ao teste de antifungigrama por disco-difusão (CLSI, documento M44-A), frente a anfotericina B, cetoconazol, fluconazol e itraconazol. Aqueles que apresentavam padrões de suscetibilidade dose-dependente ou resistente, foram submetidos ao teste de microdiluição em caldo (CLSI, documento M27-A3). A ocorrência de leveduras se deu em 89% das amostras, variando de 77,5% a 94,0% independente da ave estudada. Foram obtidos 318 isolados, pertencentes a 29 espécies diferentes. O gênero prevalente foi Candida com 183 isolados (57,5%), seguido de Cryptococcus com 45 (14,2%), Rhodotorula com 38 (11,9%) e Trichosporon com 36 (11,3%); os demais gêneros totalizaram 16 isolados... Abstract: Men and animals have an age-old relationship, where the group of birds, in particular, is widely used for various purposes, such as food and company.Men and animals have an age-old relationship, where the group of birds in particular is widely used for various purposes, such as food and company. The birds are portrayed as disseminators of pathogens to the environment, however, knowledge about this role certain avian species, closely correlated to humans, are somewhat scarce. This study aimed to isolate, identify and characterize the phenotype and the genotype obtained yeast stool five captive birds: chicken (Gallus gallus domesticus), Love bird (Agapornis spp), Budgerigar (Melopsittacus undulatus) cockatiel (Nymphicus hollandicus) and canary (Serinus canaria domesticus). Therefore, we evaluated 247 stool samples of these five avian species from seven cities located in the northwest from State of São Paulo, southern of Minas Gerais and southwestern Mato Grosso do Sul. The collection was performed using sterile spatulas. The material was seeded in Sabouraud dextrose agar and seed Niger agar, with titrations. The identification of species was based on biochemical and macro and micromorphological characteristics. In addition, all isolates identified were submitted to antifungal susceptibility testing by disk diffusion (CLSI, M44-A), compared to amphotericin B, ketoconazole, fluaconazole and itraconazole. The occurrence of yeasts occurred in 89% of samples, ranging from 77.5% to 94.0% of the studied independently bird. There were obtained 318 isolates belonging to 29 different species. There were obtained 318 isolates belonging to 29 different species. The prevalent genus isolated was Candida with 183 (57.5%), followed by Cryptococcus with 45 (14.2%), Rhodotorula with 38 (11.9%) and Trichosporon with 36 (11.3%); other genres totaled 16 isolates (5.0%). Note that, in the number of fungal species isolated, C. albicans, C. guilliermondii, C. ... Mestre

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Reis, Gislâine Vicente dos. "Diversidade genética de isolados do fungo Sporisorium scitamineum analisada através de fingerprinting da região telomérica." Universidade de São Paulo, 2012. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11138/tde-25102012-163305/.

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Abstract:

No presente trabalho, foi utilizada uma coleção de 14 isolados de Sporisorium scitamineum coletados em diferentes regiões canavieiras, para estudar a diversidade genética por RFLP da região telomérica de maneira comparativa a marcadores AFLP. Os teliósporos, esporos de resistência do fungo, foram coletados a partir do sintoma mais característico da planta infectada que é formação do chicote. Os teliósporos são diplóides e quando germinam dão origem ao probasídio, onde, por meiose formam-se os esporídios haplóides. Estes quando compatíveis sexualmente voltam a se fundir formando um micélio dicariótico infectivo. A fase do ciclo de vida escolhida para as análises foram os derivados haplóides de cada linhagem dicariótica obtida a partir dos teliósporos. Na técnica de AFLP foram encontrados 40 loci polimórficos (3%) entre 1311 analisados obtidos a partir de 2 enzimas de corte raro, 1 de corte frequente e 19 combinações de primers. A técnica de RFLP da região telomérica foi comparativamente mais eficiente, no qual foram utilizadas três enzimas de restrição que geraram 102 loci, sendo 36 polimórficos (34,3%). O agrupamento com base nos coeficientes de similaridade e os resultados de atribuição pelo programa Structure revelaram dois grupos genotípicos homogêneos, tanto quando os marcadores foram analisados separadamente como na análise conjunta. Não houve agrupamento por localidade, mas ficou claro que o fluxo desses isolados é baixo. Os derivados haplóides de tipos de reação sexual opostos de cada linhagem dicariótica (teliósporo) permaneceram dentro do mesmo grupo, com exceção de uma única linhagem. Desta forma, de maneira geral na natureza, a fusão entre os esporídios deve acontecer entre aqueles que estão mais próximos. Uma análise molecular de diversidade genética em isolados obtidos em diferentes regiões do mundo por outros autores revelou uma alta homogeneidade entre eles, de forma que somente em localidades da Ásia foi possível revelar, com os marcadores utilizados, alguma diversidade genética. Nossos resultados indicam que a escolha do marcador foi fundamental para revelar diversidade entre os isolados de S. scitamineum, sendo que o RFLP-tel revelou um fingerprinting de DNA quase que específico para cada isolado, sendo assim mais apropriado do que os descritos anteriormente. A quantidade de loci AFLP necessária para revelar polimorfismo foi mais alta do que para RFLP-tel. Uma segunda contribuição deste trabalho foi a detecção de heterozigotos quando consideramos a análise conjunta de derivados haplóides por teliósporo. Um alto grau de homozigosidade foi detectado quando as análises foram realizadas considerando o comportamento dicariótico como diplóide, no entanto, loci heterozigotos puderam ser encontrados. Esta é a primeira vez que um estudo desta natureza foi realizado com isolados de Sporisorium scitamineum do Brasil. The genetic diversity of Sporisorium scitamineum, the sugarcane smut agent, was characterized in a 14 isolates collection. The isolates were obtained from various sugarcane growing areas and RFLP of the telomeric region was used as molecular marker, compared with AFLP. Teliospores were collected from the whip of infected plants. Teliospores are diploids and germinate producing a probasidium where meiosis takes place originating four haploid cells. These cells if sexually compatible can fuse and a dikaryotic mycelium is formed. The haploid phase, derived from each dikaryotic line obtained from teliósporos, was used to perform the analysis. Our results showed that 40 polymorphic loci (3%) were described among 1,311 analyzed. These were obtained with two rare-cutter restriction enzymes, one frequent-cutter restriction enzyme and 19 primers combinations. The RFLP markers were more efficient when compared to AFLP to reveal polymorphisms. Three restriction enzymes produced 102 loci, from which 36 were polymorphic (34.3%). Clustering using similarity coefficients and results obtained by Structure software revealed two genotypic groups. The analyses were performed with individual markers and combining RFLP and AFLP markers. Locations were not responsible for clustering, and low flux of isolates was evident. The opposite sexual types haploid derivatives originated from the same teliospore were clustered together, with only one exception. This implies that sporideos that are located close together are more likely to fuse. Our data suggest that choosing RFLP as markers were the key for unrevealing diversity among isolates of S. scitamineum. RFLP-tel revealed almost unique DNA fingerprintings to various isolates. A second contribution of this work was that heterozygous were detected when considering a combined analyses of haploids derivatives from the same teliospore. This is the first time a study of this nature was organized with Brazilian isolates of S. scitamineum.

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Giménez-Pecci, María de la Paz. "Caracterização de partículas virais e RNA de dupla fita isolados do fungo entomopatogênico Matarhizium anisopliae." reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS, 1996. http://hdl.handle.net/10183/164625.

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Abstract:

Micovírus são freqüentemente encontrados infectando vários gêneros de fungos. Em alguns sistemas, bem caracterizados, foi demonstrada a interferência de genes virais com o fenótipo do fungo, sendo o caso melhor documentado a hipovirulência em fungos fitopatogênicos. Em nosso laboratório, seis linhagens de Metarhizium anisopliae, um fungo entomopatogênico usado no controle biológico de pragas importantes em agricultura, foram analisadas para a presença de dsRNA. Todas as linhagens foram isoladas de insetos e três apresentam dsRNA viral (linhagens Al, MS e RJ). Nosso objetivo é analisar a possível interferência dos micovírus (Ma V s) com a entomopatogenicidade de M anisopliae. Neste trabalho foram caracterizados três MaVs através de purificação em gradientes de CsCl, microscopia eletrônica, análise de proteínas, padrão eletroforético dos componentes dsRNA, sorologia e análise da homologia entre os componentes dsRNA individuais de um mesmo Ma V e entre os componentes dsRNA dos diferentes MaVs, utilizando sondas de cDNA. As partículas virais dos MaVs RJ, AI e MS são isométricas, com diâmetro médio de 3S nm e são separados em várias bandas em gradientes de CsCI nas densidades de flotação de 1,32 a 1,41 (MaV-RJ); 1,3S a 1,45 (MaV-Al) e 1,40 a 1,43 g/ml (MaV-MS). Espectros de absorção típicos de nucleoproteínas foram observados em todas estas bandas e nas preparações de micovírus. Após a dissociação das partículas virais foi observada a presença de componentes dsRNA com o mesmo perfil eletroforético obtido em extratos de micélio. Foi demonstrado que o ácido nucléico viral é composto por dsRNA, pela digestão enzimática específica e purificação em colunas de celulose CFll. MaV-RJ apresenta, pelo menos, treze componentes dsRNA, variando de 3,1 a 0,5 kb e um polipeptídeo majoritário do capsídeo de 46 kDa. Ma V-AI apresenta pelo menos, cinco componentes dsRNA variando de 4,1 a 1 kb e um polipeptldeo majoritário do capsídeo de 80 kDa. Ma V -MS é muito semelhante a Ma V -AI em relação ao componente dsRNA de 4,1 kb e polipeptídeo majoritário, entretanto apresenta um número menor de componentes dsRNA pequenos. Durante o desenvolvimento do trabalho, Ma V-AI e MaV-MS apresentaram um padrão instável de componentes dsRNA, progressivamente mais complexo em relação aos componentes dsRNA pequenos. Foi caracterizado um mutante estável (linhagem RJd), derivado espontaneamente da linhagem RJ que não apresenta os componentes dsRNA de maior peso molecular, tendo apenas os nove componentes menores presentes na linhagem parental RJ. Esta linhagem derivada, RJd, apresenta morfologia da colônia alterada, contudo não temos evidências experimentais para associar diretamente estas alterações com o padrão alterado de componentes dsRNA. Anticorpos policlonais foram produzidos contra os três Ma V s e mostramos que estes Ma V s são sorologicamente relacionados. Em testes de dupla difusão MaV-RJ reage com antisoro contra MaV-AL e MaV-M5 indicando relações sorológicas. Em Western, todos os polipeptídeos dos capsídeos dos três Ma V s, reagem com os antisoros contra MaV-Al e MaV-M5. Sondas de cDNA do componente dsRNA de 4,1 kb de MaV-Al hibridizam com os componentes de 4,1 kb de MaV-M5 e com os componentes dsRNA S2, M3 e Ml de MaV-RJ. Quando a sonda de cDNA é preparada a partir do componente dsRNA de 4,1 kb de MaV-M5 também ocorre hibridização com o componente dsRNA de mesmo tamanho de MaV-AL ~com o componente dsRNA S2 de MaV-RJ. Se conclui que os três micovírus são relacionados entre si em relação a pelo menos um componente dsRNA. Além disso, a análise de hibridização mostrou que existe homologia entre todos os componentes de Ma V-RJ mas sondas a partir do componente dsRNA de 4,1 kb de MaV-Al não hibridizam com nenhum outro componente da mesma linhagem. Nossas tentativas de transferir micovírus ou dsRNA a linhagens "livres de micovírus" utilizando biobalística falharam. Micovirus are frequently found infecting severa! genus of fungi in nature. In some, well characterised systems, the interference of vira! genes with the fungai phenotype was demonstrated, as is the case of hypovirulence mediated by viral dsRNA in phytopathogenic fungi. In our laboratory, six strains of Metarhizium anisopliae, an entomopathogenic fungus used in biological control of agronomic important pests, were screened for the presence of dsRNA. The strains analysed were isolated from insects and three have vira! dsRNA (strains AI, M5 and RJ). We aim to access the possibility of interference o f micovirus (Ma V s) with the entomopathogenicity o f M anisopliae. In this work the Ma V s were characterised through purification by CsCl gradients, eletron microscopy, protein analysis, dsRNA pattem, serology and homology between individual dsRNA components within the same Ma V and among the Ma V s. The Ma V s parti eles are isometric, with an average diameter o f ca. 3 5 nm and are resolved into severa! bands in CsCl gradients at buoyant densities o f 1.32 to 1.41 (Ma V -RJ); 1.35 to 1.45 (MaV-Al) and 1.40 to 1.43 g/ml (MaV-M5). Absorbance spectra, typical of nucleoproteins, waS detected in ali vira! preparations. The vira! nucleic acid was shown to be dsRNA, by specific enzymatic digestions and celiulose-CF11 chromatography. Upon dissociation, the particles were shown to contain dsRNAs, with the same eletrophoretic pattem of dsRNA components as extracted from mycelium. MaV-RJ have, at least, thirteen dsRNA components, ranging from 3.1 to 0.5 kb and one major capsid polypeptide o f 46 kDa. Ma V -AI have, at least, five dsRNA components, ranging from 4.1 to 1 kb and one major capsid polypeptide of 80 kDa. MaV-M5 is very similar to MaV-Al, in respect to the dsRNA component of 4.1 kb and major polypeptide, however, has fewer smalier dsRNA components. During the development of the work, Ma V -Al and Ma V -MS displayed an unstable dsRNA pattem, progressively more complex in relation to the smaller components. A stable mutant (strain RJd), derived spontaneously from strain RJ, was characterised and it lacks some of the large dsRNA components and has only nine of the smali dsRNA components present in the parental strain RJ. This derived strain displays altered colony morphology, nevertheless we have no experimental data to associate these alterations directly to the altered dsRNA pattem. Polyclonal antibodies were produced against the three Ma V s and we show that the Ma V s are serologicaliy related to each other. In double-diffusion serological test Ma VRJ reacted with antiserum against MaV-Al and MaV-M5, indicating serological relationships. In Westem blot, ali capsid polypeptides of the three MaVs, reacted with both antiserum against MaV-Al and against MaV-M5. cDNA probes from the 4.1 kbdsRNA component of Ma V -Al hybridised with the 4.1 kb-dsRNA component from MaV-M5 and the S2, M3 and Ml-dsRNA components from MaV-RJ. Moreover, a cDNA probe from 4.1 kb-dsRNA component from MaV-M5 hybridised with both the 4.1 kb-dsRNA component from MaV-Al and S2-dsRNA component from MaV-RJ. lt was concluded that the three viroses are related to each other, at least in one dsRNA component. In addition, hybridisation analysis revealed sequence homology between all dsRNA components of MaV-RJ but probes from the 4.1 kb-dsRNA component from MaV-Al do not hybridise with any other dsRNA components of the same strain. Our attempts to transfer the Ma V s to different "free o f vírus" strains of M. anisopliae by biobalistic, using both micovirus and naked dsRNA, have failed.

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Pereira, Helen Karine Araujo. "Caracterização morfológica, molecular e sensibilidade a fungicidas de isolados de Colletotrichum spp. associados a goiabeira /." Jaboticabal, 2018. http://hdl.handle.net/11449/154938.

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Abstract:

Orientador: Antonio de Goes Coorientador: Fernanda Dias Pereira Banca: Gabriella Souza Cintra Banca: Rita de Cássia Panizzi Resumo: Fungos do gênero Colletotrichum causam infecções em pré e pós-colheita em frutos de goiabeiras, causando prejuízos significativos. Neste estudo foram avaliados 26 isolados de Colletotrichum oriundo de frutos de goiabeiras com sintomas de antracnose, de diversos municípios do estado de São Paulo, com caracterização morfológica de conídios e apressórios, caracterização molecular com PCR espécie-específica e avaliação in vitro quanto à sua sensibilidade aos fungicidas tiofanato-metílico, trifloxistrobina e tebuconazole. Os resultados foram submetidos a análise de variância e teste de Scott-Knott, Tukey, a 5% de probabilidade e IC50. Os isolados avaliados apresentaram alto polimorfismo, sendo C. gloeosporioides a espécie predominante. Outras espécies foram também encontradas. Os isolados, na sua maioria foram altamente sensíveis a tebuconazole e insensíveis a trifloxistrobina e tiofanato-metílico, in vitro. Revisão das estratégias de controle da doença fazem-se necessárias, sendo discutidas no presente trabalho. Abstract: Fungi of the genus Colletotrichum cause infections in pre and post harvest in fruits of guava trees, causing significant losses. This study evaluated 26 isolates of Colletotrichum from guava fruits with symptoms of anthracnose from several municipalities in the state of São Paulo, with morphological characterization of conidia and apressoris, molecular characterization with species-specific PCR and in vitro evaluation of their sensitivity to the thiophanate-methyl fungicides, trifloxystrobin and tebuconazole. The results were submitted to analysis of variance and Scott-Knott's test, Tukey, at 5% probability and IC50. The evaluated isolates showed a high polymorphism, being C. gloeosporioides the predominant species. Other species were also found. The isolates were mostly highly sensitive to tebuconazole and insensitive to trifloxystrobin and thiophanate-methyl in vitro. Review of disease control strategies are necessary, being discussed in the present work. Mestre

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Rosales, Enrique Ariel Castiglioni. "Efeito de derivados de meliáceas e isolados de fungos entomopatogênicos sobre o cupim subterrâneo Heterotermes teunis (Hagen, 1858)(Isoptera, Rhinotermitidae)." Universidade de São Paulo, 2002. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11146/tde-25072002-140640/.

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Abstract:

Esta pesquisa teve o objetivo de avaliar o efeito de derivados das meliáceas Azadirachta indica (nim), Melia azedarach e Trichilia pallida e os fungos entomopatogênicos Metarhizium anisopliae (isolado 1037) e Beauveria bassiana (isolado 634) visando ao controle do cupim subterrâneo Heterotermes tenuis. Os derivados vegetais foram avaliados em relação à toxicidade e repelência para o cupim. A formulação comercial Nimkol®, à base de folhas de nim, foi tóxica para o cupim, em concentrações de 0,3% de ingrediente ativo ou superiores. Não foi constatada a transmissão do Nimkol de indivíduos alimentados com esse produto para outros indivíduos. Os demais extratos vegetais estudados não apresentaram toxicidade significativa para H. tenuis. Nenhum dos produtos avaliados foi repelente a ponto de evitar a construção de galerias em placas com ágar ou provocar o fechamento das mesmas. Entretanto, em testes de escolha em arenas de preferência, H. tenuis demonstrou repelência pelo extrato aquoso de folhas de nim (5%). Os demais derivados avaliados, incluindo o Nimkol, não foram repelentes para o cupim. O efeito dos derivados vegetais e dos entomopatógenos na sobrevivência de H. tenuis, em forma independente e associada, foi estudada em laboratório e em condições de campo, visando avaliar um possível efeito estressor dos derivados vegetais sobre o cupim. Testes de compatibilidade in vitro indicaram resposta dependente da concentração do Nimkol, para a inibição do crescimento de colônias, da produção e da germinação de conídios dos entomopatógenos. A associação de extratos vegetais e entomopatógenos, em geral, diminuiu a atividade fungitóxica sobre H. tenuis. Entretanto, observou-se benefícios da associação de Nimkol (0,2 a 0,4% i.a.) com os isolados de B. bassiana e M. anisopliae quando houve um mínimo de 24 horas de diferença entre a aplicação do produto vegetal e dos fungos no alimento dos cupins. Os resultados de campo para Nimkol, M. asinopliae e a associação de ambos, mostraram tendências semelhantes às observadas para esses tratamentos em laboratório, embora com menores níveis de mortalidade. The objective of this research was to evaluate the effect of by-products of the Meliaceae Azadirachta indica (neem), Melia azedarach and Trichilia pallida, and of the entomopathogenic fungi Metarhizium anisopliae (isolate 1037) and Beauveria bassiana (isolate 634) in the control of the subterranean termite Heterotermes tenuis. The vegetal by-products were evaluated in relation to the toxicity and repellency for the termite. The commercial formula Nimkol, obtained from neem leaves, was toxic for the termite at concentrations of 0.3% a.i. and higher. There was no detected transmission of the Nimkol from individuals fed with the product to other individuals. The rest of the vegetal extracts were not significantly toxic for H. tenuis. None of the tested products was repellent to the extent of preventing the gallery construction in agar plates or causing them to be closed. In selection experiments on preference, H. tenuis showed repellency towards the aqueous extract of neem leaves (5%). The rest of the by-products tested, including Nimkol-L, were not repellent for the termite. The effect of the vegetal by-products and the entomopathogens, independently and associated, was studied under field and laboratory conditions, looking for a possible stressing effect of the vegetal by-products on the termite. In vitro compatibility tests showed a response of the Nimkol-L, dependent on the concentration, on the growth of colonies, production and germination of conidia of the entomopathogens. The association of entomopathogens and vegetal extracts decreased in general the toxic activity of the fungi over H. tenuis. With a minimal difference of 24h between the application of the vegetal product and the fungi in the food of the termites, a beneficial association was detected between Nimkol-L and isolates of B. bassiana and M. anisopliae. The field results for Nimkol-L, M anisopliae and the combination of the two, showed a trend similar to the one observed in the laboratory results, but with lower mortality levels.

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Rodrigues, Gisele Nunes. "Biotransformação do pesticida metil paration por fungos isolados da ascídia Didemnum ligulum." Universidade Federal de São Carlos, 2013. https://repositorio.ufscar.br/handle/ufscar/2092.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:32:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 5397.pdf: 2672237 bytes, checksum: 66d95a1c81d09e4aa7e3b8016ac5b2dc (MD5) Previous issue date: 2013-07-29 Universidade Federal de Sao Carlos Pesticides are potentially toxic compounds to humans and other living beings, which are indispensable for pests removal in agriculture worldwide. The result of their overuse is the inevitable contamination of aquatic and terrestrial ecosystems. The need for degradation of these compounds has been subject of several studies. The enzymatic biodegradation of synthetic pesticides by microorganisms is an important strategy for removing these pollutants from the environment. Marine fungi are an excellent source of highly oxygenated bioactive compounds with huge potential to biotransform xenobiotics such as pesticides. Thus, the objective of this project was to study the biotransformation of the organophosphate pesticide methyl parathion using fungi of marine origin isolated from the ascidian Didemnum ligulum. Initially, 17 fungi strains have undergone screening on agar culture medium containing different pesticide concentrations (120 mg/L, 240 mg/L and 360 mg/L), and the three strains that showed the greatest growth diameter of the colony, were subjected to culture in a liquid medium to quantify the possible degradation of the methyl parathion. For these strains, the eficiency of degradation was monitored by high performance liquid chromatography (HPLC). Methyl parathion was almost completely degraded in 20 days, but there was no significant difference between the reactions with the fungi strains and the abiotic control. The microorganisms, however, showed ability to metabolize p-nitrophenol, the main degradation product of methyl parathion. In conclusion, these three marine fungi, identified as two strains of Penicillium citrinum and one strain of Fusarium proliferatum, have proven to be important sources to study xenobiotic biotransformation. Os pesticidas são compostos, potencialmente tóxicos ao homem e demais seres vivos, que hoje são indispensáveis na remoção de pragas na agricultura mundial. O resultado do seu uso excessivo é a inevitável contaminação dos ecossistemas aquáticos e terrestres. A necessidade da degradação destes compostos tem sido fonte de diversos estudos. A biodegradação enzimática de pesticidas sintéticos por micro-organismos representa uma importante estratégia para a remoção desses poluentes do meio ambiente. Uma excelente fonte de compostos bioativos altamente oxigenados, com enorme potencial bioenzimático a ser explorado na biotransformação de xenobióticos, como os pesticidas, são os fungos marinhos. Sendo assim, o objetivo deste projeto foi estudar a biotransformação do pesticida organofosforado metil paration utilizando-se de fungos de origem marinha isolados da ascídia Didemnum ligulum. Inicialmente, 17 linhagens de fungos passaram por uma triagem em meio de cultura sólido contendo diferentes concentrações (120 mg/L, 240 mg/L e 360 mg/L) de pesticida, e as que apresentaram o melhor desenvolvimento nesse meio, de acordo com observação por diâmetro de crescimento da colônia, foram submetidas a um cultivo em meio líquido para quantificar a possível degradação do metil paration. Três linhagens foram selecionadas para essa segunda etapa, na qual a eficiência de degradação foi monitorada por cromatografia líquida de alta eficiência (CLAE). O metil paration foi completamente degradado em 20 dias, porém não houve significativa diferença entre as reações com as linhagens de fungos e o controle abiótico. Os micro-organismos, no entanto, se mostraram capazes de metabolizar o p-nitrofenol, principal produto de degradação do pesticida metil paration. Assim, esses três fungos marinhos, identificados como duas linhagens de Penicillium citrinum e uma de Fusarium proliferatum, demonstraram ser importantes fontes para estudos de biotransformação de xenobióticos.

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Silva, Patrícia Mota da, and 92-99202-2595. "Produção de Lipases por fungos isolados de amostras de solo da Floresta Amazônica." Universidade Federal do Amazonas, 2015. https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6389.

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Abstract:

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-05-16T15:53:44Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Patrícia Mota Silva.pdf: 979608 bytes, checksum: ce07874ce0155d48be4cc47700cab638 (MD5) Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-05-16T15:53:58Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Patrícia Mota Silva.pdf: 979608 bytes, checksum: ce07874ce0155d48be4cc47700cab638 (MD5) Made available in DSpace on 2018-05-16T15:53:58Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Patrícia Mota Silva.pdf: 979608 bytes, checksum: ce07874ce0155d48be4cc47700cab638 (MD5) Previous issue date: 2015-08-31 FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas Microbial lipases have a great potential for industrial applications, including cosmetic industry. Forward the great diversity of the Amazon forest micro-organisms, it can be said that few bioprospecting work of producing lipases fungi were performed. This study aimed to investigate lipase production by fungi isolated from soil samples of the Amazon rainforest. Samples were collected in Reserva Florestal Adolpho Ducke. The fungi were isolated, purified and identified (macro and micromorphologically). Lipase producing fungi were selected by the ability of those in hydrolyzing pNPP (p-nitrophenylpalmitate). Univariate experiments were conducted in order to investigate the influence of bioprocess variables in the production of lipase-selected isolated Fusarium INPA 4. It was also investigated the optimum temperature and pH of Fusarium lipases INPA 4:01 preliminary analysis as the cytotoxicity of broth cultivation of the fungus. The results revealed that: 100 isolates were obtained and the three most common genera of fungi were Aspergillus (41%), Penicillium (34%) and Trichoderma (13%). The isolated highlighted on lipase production were INPA83 Penicillium, Fusarium INPA 4, Paecilomyces Aspergillus INPA INPA 53 and 59. The levels of the most appropriate factors for production of the Fusarium lipases INPA 4 were 15 g / L Soy oil 1 g / L (NH4) 2SO4, pH 5, the relationship between the culture medium and glassware 1/5, initial inoculum of 105 cell / ml, orbital stirring of 100 rpm and a time of 72 h.Na determination of pH and temperature optimum the lipase of Fusarium INPA 4 was more active in the pH range of 7.0-9.0 and temperature range of -20oC to 30oC. The cultivation broth of Fusarium INPA 4 showed no cytotoxicity from the third dilution having a viability above 100%. The Fusarium INPA 4 showed a good lipase producer, may be a source of this enzyme for future industrial applications, but for this, it is necessary an additional study for the best biotech enzyme potential and his producer are exploited. Lipases microbianas têm um grande potencial para aplicações industriais, inclusive para indústria de cosméticos. Frente a grande diversidade de micro-organismos da floresta amazônica, pode-se afirmar que poucos trabalhos de bioprospecção de fungos produtores de lipases foram realizados. Este trabalho teve como objetivo investigar a produção de lipases por fungos isolados de amostras de solo da floresta amazônica. Foram coletadas amostras na Reserva Florestal Adolpho Ducke. Os fungos foram isolados, purificados e identificados (macro e micromorfologicamente). Foram selecionados fungos produtores de lipase pela capacidade desses em hidrolisar o pNPP (p-nitrofenilpalmitato). Foram realizados experimentos univariados com a finalidade de investigar a influência das variáveis de bioprocesso na produçao de lipases pelo isolado selecionado Fusarium INPA 4. Foi investigada também a temperatura e pH ótimos das lipases de Fusarium INPA 4 e uma análise preliminar quanto a citotoxicidade do caldo de cultivo deste fungo. Como resultados observou-se que: foram obtidos 100 isolados e os três generos fúngicos mais frequentes foram Aspergillus (41%), Penicillium (34%) e Trichoderma (13%). Os isolados destacados na produção de lipases foram: Penicillium INPA83, Fusarium INPA 4, Paecilomyces INPA 53 e Aspergillus INPA 59. Os níveis dos fatores mais adequados para produção das lipases pelo Fusarium INPA 4 foram 15 g/L de óleo de soja, 1 g/L de (NH4)2SO4, pH 5, relação entre meio de cultura e vidraria de 1/5, inóculum inicial de 105 cell/mL, agitação orbital de 100 rpm e o tempo de 72 h.Na determinação do pH e temperatura ótimos, a lipase do Fusarium INPA 4 foi mais ativa na faixa de pH entre 7,0-9,0 e na faixa de temperatura de 20oC a 30oC. O caldo de cultivo do Fusarium INPA 4 não apresentou citotoxicidade a partir da terceira diluição, tendo uma viabilidade acima de 100%. O Fusarium INPA 4 se mostrou um bom produtor de lipase, podendo ser uma fonte dessa enzima para futuras aplicações industriais, mas para isso, torna-se necessário um estudo complementar para que o melhor potencial biotecnológico da enzima e seu produtor sejam explorados.

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Sanches, Michele Alves. "Utilização de resíduos vegetais para a produção de biossurfactantes por fungos isolados de amostras de solo da região amazônica." Universidade Federal do Amazonas, 2016. http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/5159.

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Abstract:

Submitted by Sáboia Nágila (nagila.saboia01@gmail.com) on 2016-07-29T14:48:25Z No. of bitstreams: 1 Dissertação-Michele Alves Sanches.pdf: 930400 bytes, checksum: 3b455ac91457a2d15e86539fbdc9d3e3 (MD5) Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-08-26T13:29:03Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação-Michele Alves Sanches.pdf: 930400 bytes, checksum: 3b455ac91457a2d15e86539fbdc9d3e3 (MD5) Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-08-26T13:32:09Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação-Michele Alves Sanches.pdf: 930400 bytes, checksum: 3b455ac91457a2d15e86539fbdc9d3e3 (MD5) Made available in DSpace on 2016-08-26T13:32:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação-Michele Alves Sanches.pdf: 930400 bytes, checksum: 3b455ac91457a2d15e86539fbdc9d3e3 (MD5) Previous issue date: 2016-03-15 CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior O homem tem a necessidade de misturar a água com substâncias insolúveis em suas atividades diárias e industriais. Os surfactantes, derivados de petróleo, têm sido utilizados com essa finalidade, no entanto, esses apresentam problemas quanto a sua toxicidade e biodegradabilidade. Os biossurfactantes de origem microbiana são uma alternativa para essa situação, porém, o seu custo de produção é alto, e em parte, devido aos substratos que são utilizados nos bioprocessos. Neste contexto, o objetivo deste trabalho foi investigar a utilização de resíduos como substrato para produção de biossurfactantes por fungos filamentosos isolados de amostras de solo da região Amazônica. Foram realizados bioprocessos com cinco isolados fúngicos sabidamente produtores de biossurfactantes, com a finalidade de investigar qual deles produziria em menor tempo. Em seguida, foi avaliada a possibilidade de utilização de resíduos (cascas de tucumã, pupunha, banana, cupuaçu e também o óleo pós-fritura) como subtrato para o bioprocesso com o isolado selecionado. Os fatores que influenciam na produção do biossurfactante foram avaliados por planejamento fatorial. O fungo Fusarium oxysporum 87-2LIVI produziu altos níveis de biossurfactantes em três dias de bioprocesso. E também se destacou devido a alta produção de biossurfactante utilizando a casca de pupunha como substrato. O pH e extrato de levedura foram os fatores mais importantes relacionados a produção de biossurfactante por esse isolado. Desta forma, o presente trabalho demonstrou que isolados da espécie F. oxysporum, isolados de solo Amazônico, são potenciais produtores de surfactantes e que resíduos Amazônicos, em especial casca de pupunha, possui potencial para ser utilizado como substrato. Human being has the need to mix water with insoluble substances in their daily and industrial activities. Surfactants derived from petroleum have been used for this purpose, however, they have problems such as their toxicity and biodegradability. Biosurfactants from microbial origin are an alternative to this, on the other hand, its production cost is high due to the substrates that are used in the bioprocesses. In this context, the aim of this study was to investigate the use of wastes as a substrate for the production of biosurfactants by filamentous fungi isolated from soil samples in Amazon region. Bioprocess were conducted with five known fungi isolates producers of biosurfactants in order to investigate which of them would produce in a shorter time. Then, we evaluated the possibility using wastes of peel from tucumã, peach palm, banana, cupuacu and also the post-fry oil as substrate for the bioprocess with the selected isolated. Factors that influence the production of biosurfactant were evaluated by factorial design. As a result, the fungus Fusarium oxysporum 87-2LIVI produced high levels of biosurfactants in three days of bioprocess. Moreover, this specie also showed highlight due to high biosurfactant production using peach palm peel as substract. The pH and yeast extract were the most important factors related to production of biosurfactant by this isolated. Thus, the present study showed isolated of F. oxysporum specie from Amazonian soil is potential producer of surfactants and also Amazon waste, particularly, peel of peach palm has the potential to be used as a bioprocess substrate for production of biosurfactant.

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Galvão, Rozana de Medeiros Sousa, and 92-99126-3410. "Diversidade genética de isolados de Botryosphaeria rhodina produtores de jasmonatos." Universidade Federal do Amazonas, 2008. http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/5871.

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Abstract:

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-08-28T14:14:35Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Rozana M. S. Galvão.pdf: 1560472 bytes, checksum: 5434a76f0b516e97d5f0698b73fa8050 (MD5) Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-08-28T14:14:49Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Rozana M. S. Galvão.pdf: 1560472 bytes, checksum: 5434a76f0b516e97d5f0698b73fa8050 (MD5) Made available in DSpace on 2017-08-28T14:14:49Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese - Rozana M. S. Galvão.pdf: 1560472 bytes, checksum: 5434a76f0b516e97d5f0698b73fa8050 (MD5) Previous issue date: 2008-02-22 In this work three Brazilian B. rhodina, and also two strains from Cuba, selected for their ability to produce jasmonate compounds, were submitted to molecular analysis of internal transcribed spacers- ITS regions of rDNA to characterize their genetic variability. rDNA extraction procedures were conducted according classic protocols followed by amplification, via the PCR technique, of conserved ITS regions with the primers ITS1 and ITS4. The PCR products were purified using the GFX purification kit (GE-Healthcare), resolved in “MegaBace” 1000 – DNA Analysis System (GE-Healthcar) and further identified by comparative analysis with ITS regions of rDNA sequences from the databases available at the National Center for Biotechnology Information (NCBI). Analyses were performed with the BLAST tool and the multiple alignments of sequences with Clustal W program from the computational package BioEdit. Moreover, analysis using the TCS program resulted in the identification of nine haplotypes separated by ten polymorphic sites. AFLP analyses were also implemented using four combinations of oligonucleotide primers which resulted in the generation of 300 polymorphic markers. The mean number of amplified fragments by primer pair was 79 with up to 95% of polymorphic bands. The genetic distance between B. rhodina strains was estimated in 29.19%. Dendogram constructed with Jaccard’s coefficient of similarity showed that analyzed strains were assembled in four groups with high genetic variability found in all strains. Os microrganismos produzem substâncias químicas como resultado do metabolismo primário e secundário. No metabolismo secundário estão envolvidas vias metabólicas para a síntese de produtos naturais que não são essenciais para o crescimento do organismo produtor. O fungo Botryosphaeria rhodina, tem despertado um interesse crescente devido à produção de uma serie de ácidos graxos ciclopentanos, do tipo ácido jasmônico (AJ), com propriedades reguladoras do crescimento de plantas superiores. Usualmente o AJ é um regulador de crescimento vegetal endógeno, sintetizado de maneira natural por uma grande variedade de plantas, pertence aos reguladores de crescimento vegetal (RCV) denominados jasmonatos, sendo os mais representativos o ácido (-)-jasmônico (-)-AJ e o ácido(+)-7-isojasmônico [(+)-7-isoAJ] os quais se encontram amplamente distribuídos nas plantas. AJ tem inúmeras aplicações conhecidas tais como a utilização do AJ na fabricação de perfumes; na produção do chá preto; na redução do consumo de estimulador de crescimento; na produção de malte em indústrias de cerveja; no aumento da produção de taxol; na produção de flavorizantes alimentícios, entre outros. Os microrganismos produzem substâncias químicas como resultado do metabolismo primário e secundário. No metabolismo secundário estão envolvidas vias metabólicas para a síntese de produtos naturais que não são essenciais para o crescimento do organismo produtor. O fungo B. rhodina, tem despertado um interesse crescente devido à produção de uma serie de ácidos graxos ciclopentanos, do tipo AJ, com propriedades reguladoras do crescimento de plantas superiores. A importância crescente do uso de microrganismos na biotecnologia nos levou a propor a prospecção dos metabólitos produzidos pelos microrganismos existentes em espécies vegetais da Amazônia. Desse modo, foram obtidos isolados de B. rhodina capazes de produzir o ácido jasmônico e seus derivados os quais foram caracterizados geneticamente por meio de seqüenciamento do DNA ribossomal e pela técnica de AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism ou Polimorfismo de Comprimento de Fragmentos Amplificados). Trinta e quatro linhagens de B. rhodina isoladas como patógenos de plantas tropicais, tais como: citros, manga, mogno africano, mamão, cupuaçu e madeira cortada foram analisadas para verificar a capacidade de produção de AJ utilizando-se a metodologia de Miersch et al., 1989. Os ensaios para produção de AJ e seus derivados foram realizados em meio Miersch (M1) e Miersch Modificado (M2) e, avaliados em placas de Cromatografia em camada delgada comparativa (CCDC) e quantificados por meio de Cromatografia líquida de alta eficiência (CLAE). Após a avaliação da produção de jasmonatos as linhagens foram submetidas à análise molecular de regiões ITS do rDNA para avaliação da diversidade genética. A extração do DNA foi realizada por métodos clássicos, seguido da amplificação das regiões conservadas ITS do rDNA por meio da técnica de PCR, onde foram utilizados os oligonucleotídeos ITS1 e ITS4. A distância genética entre as linhagens variou de 0 a 1,6%. A taxa de transição/transversão foi de 1,2. Os alinhamentos foram submetidos ainda ao Programa TCS, resultando na identificação de nove haplótipos e 10 sítios polimórficos. A matriz de distância genética assim como a árvore filogenética resultante mostrou pouca divergência genética nas regiões de DNA analisadas. Também foi feita a analise das linhagens de B. rhodina por meio de marcadores moleculares AFLP. Para a obtenção dos resultados foram utilizadas quatro combinações de iniciadores nas reações AFLP, possibilitando a geração de 300 marcadores polimórficos. O número médio de bandas obtidas por iniciador foi de 79% e a porcentagem de bandas polimóficas foi de 95%. A distância genética entre as linhagens de B. rhodina foi de 29,19%, e a porcentagem de loci polimórfico foi de 0,95%. Todas as linhagens investigadas foram agrupadas em quatro grupos e foram obtidos indicadores de alta variabilidade genética entre todos os isolados.

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Souza, Eduardo Lorensi de. "Produção de mudas e crescimento de Eucalyptus grandis Hill ex maiden inoculado com fungos ectomicorrízicos em área arenizada." Universidade Federal de Santa Maria, 2009. http://repositorio.ufsm.br/handle/1/5492.

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Abstract:

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico Eucalyptus. grandis is one of the main species used in forestry, in the Rio Grande do Sul State. The reforestations have been concentrated in low fertility soil areas, especially in phosphorus, such as the Quartzarenic Neosoils, which occur in the south of the state. It represents a problem for the establishment of this culture in field. This forestry species has the capacity of making symbiosis with ectomycorrhizal fungi that increase plant grown and the absorption of water and nutritious. The aim of the work was to evaluate the initial growth of eucalyptus in sandy area and the ectomycorrhizal fungi inoculation isolated, individually or mixed in Neosoil. In the first stage, eucalyptus seedlings were produced in greenhouse, inoculated or no-inoculated with the UFSC-Pt116 isolated, produced in peat or in Neosoil. After 120 days seedlings were transplanted to an area subjected to the process of sanding in São Francisco de Assis and evaluated regarding the survival, height, stem s diameter and tenors of nitrogen, phosphorus and potassium, total phosphorus, inorganic phosphorus, and wood production. In the second stage it was tested, in greenhouse, the effect of ectomycorrhizal fungi inoculation with the UFSC-Pt116, UFSC-Pt188 and UFSC-SA9 isolates, individually or mixed in peat substrate and in Neosoil. Determinations were accomplished regarding stem s diameter and height, dry matter of the aerial portion and the roots, roots volume, mycorrhizal colonization as well as the level of nitrogen, potassium and total, organic and inorganic phosphorus of the aerial portion of plants. In field, the plants produced in Neosoil and inoculated with the isolated UFSC-Pt116 obtained the highest survival, stem s height and diameter, nitrogen level, as well as wood production in relation to the no-inoculated seedlings. In the second study, the plants that received individual inoculation of the isolated UFSC-Pt116 and UFSC-SA9 and that were produced with peat obtained the highest height, stem s diameter, mycorrhizal colonization and dry matter accumulation. The plants that were produced in Neosoil and the individually inoculated with the isolated UFSC-Pt116, UFSC-Pt118 and UFSCSA9 showed highest height, stem s diameter, dry matter of the aerial portion and roots volume. The seedlings produced in Neosoil obtained higher height and diameter than those produced in peat. No Estado do Rio Grande do Sul o E. grandis é uma das principais espécies utilizadas na silvicultura. Os reflorestamentos têm se concentrado em regiões de solos com baixa fertilidade, especialmente em fósforo, como os Neossolos Quartzarênicos, que ocorrem na metade sul do Estado, tornando-se um problema para o estabelecimento dessa cultura no campo. Esta espécie florestal tem a capacidade de formar simbiose com fungos ectomicorrízicos que auxiliam o crescimento das plantas através do aumento na absorção de nutrientes e água. No presente trabalho teve-se por objetivos avaliar o crescimento inicial do eucalipto em área arenizada e a inoculação dos isolados fúngicos ectomicorrízicos, individualmente ou em mistura em Neossolo. Na primeira etapa do trabalho, foram produzidas mudas de eucalipto em casa de vegetação, que foram inoculadas ou não com o isolado UFSC-Pt116, produzidas em turfa ou em Neossolo. Após 120 dias, essas foram transplantadas para uma área arenizada em São Francisco de Assis e avaliadas quanto à sobrevivência, altura, diâmetro do caule e teores de nitrogênio, fósforo e potássio, fósforo total, fósforo inorgânico, fósforo orgânico e produção de madeira. Na segunda etapa testou-se em casa de vegetação o efeito da inoculação dos isolados de fungos ectomicorrízicos UFSC-Pt116, UFSC-Pt188 e UFSC-SA9, individualmente e em mistura no substrato turfa e no Neossolo. Foram realizadas avaliações quanto à altura e diâmetro do caule, massa seca da parte aérea e das raízes, volume de raízes, percentual de colonização micorrízica e teores de nitrogênio, fósforo e potássio da parte aérea das plantas. No campo, as plantas que foram produzidas no Neossolo e inoculadas com o isolado UFSC-Pt116 obtiveram a maior sobrevivência, altura e diâmetro do caule, teores de nitrogênio, bem como produção de madeira em relação às mudas não inoculadas. No segundo estudo, as plantas que receberam inoculação individual dos isolados UFSC-Pt116 e UFSC-SA9 e foram produzidas com turfa obtiveram a maior altura, diâmetro do caule, colonização micorrízica e acúmulo de massa seca. As plantas que foram produzidas em Neossolo e inoculadas com os isolados UFSC-Pt116, UFSC-Pt188 e UFSC-SA9 individualmente alcançaram a maior altura, diâmetro do caule, massa seca da parte aérea e volume de raízes. As mudas produzidas no Neossolo alcançaram altura e diâmetro maiores que as produzidas na turfa.

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Sobreira, Aline Cavalcante Mesquita. "Estudo químico e citotóxico de metabólitos secundários isolados de fungos endofíticos de Aroeira-do-Sertão (Myracrodruon urundeuva Fr. All.): Pseudofusicoccum stromaticum e Lasiodiplodia theobromae." reponame:Repositório Institucional da UFC, 2016. http://www.repositorio.ufc.br/handle/riufc/18538.

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Abstract:

SOBREIRA, Aline Cavalcante Mesquita. Estudo químico e citotóxico de metabólitos secundários isolados de fungos endofíticos de Aroeira-do-Sertão (Myracrodruon urundeuva Fr. All.): Pseudofusicoccum stromaticum e Lasiodiplodia theobromae. 2016. 173 f. Dissertação (Mestrado em química)- Universidade Federal do Ceará, Fortaleza-CE, 2016. Submitted by Elineudson Ribeiro (elineudsonr@gmail.com) on 2016-06-03T18:46:17Z No. of bitstreams: 1 2016_dis_acmsobreira.pdf: 10703965 bytes, checksum: a2d1061f921ba2a7339fb3d8bee947e3 (MD5) Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa (jairo@ufc.br) on 2016-07-20T20:46:19Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_dis_acmsobreira.pdf: 10703965 bytes, checksum: a2d1061f921ba2a7339fb3d8bee947e3 (MD5) Made available in DSpace on 2016-07-20T20:46:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_dis_acmsobreira.pdf: 10703965 bytes, checksum: a2d1061f921ba2a7339fb3d8bee947e3 (MD5) Previous issue date: 2016 Endophytic fungi have been identified as a promising source of biologically active substances,including compounds with potential anticancer activity. In this context, this paper describes the first study of chemical prospecting and cytotoxicity two endophytic fungi isolated from Aroeira -do-Sertão(Myracrodruon urundeuva Fr.ll.):Pseudofusicoccum stromaticum (MUB-58) and Lasiodiplodia theobromae (MUB - 65). The ethylacetate extracts MUB-58 and MUB-65 were obta ined by liquid-liquid partition broth these fungal strains which were cultured for 21 days on BD and malt extract , respectively. The fungal extracts were first analyzed by liquid chromatography of ultraefficiency coupled to spectrometry, high resolution mass (CLUE -MS) and subsequently subjected to chromatography on Sephadex LH - 20, followed by liquid chromatography of high efficiency with diode array detector. CLUE - MS analysis allowed to determine the prese nce of metabolites in seven MUB 58 extract: cholin - O - sulfate, xanthofusin, 7-hidroxy -1-isochromanone, multico licacid, djalonensone, 8 - methoxycarbonyl-1-hidroxy-9-oxo-9H-xanthene-3-carboxylix acidand cyclo-Phe-Leu-Val-Leu-Leu. In addition, were isolated four metabolites:cycloL-Phe-D-Leu1-L-Leu2-L-Leu 3-L-Ile (FC1), 5-hidroxy-methilfurfural (FC2), rotenolone (FC3) and tephrosin (FC4).The compound FC1 is unprecedented in the literature, while FC3 and FC4 compounds are being reported for the first time in en dophytic fungi. Likewise, a CLUE - MS analysis the MUB - 65 extract led to characterization of eight chemical compounds already reported in the species L. theobromae:4-hidroxymelein; Mellein;(3R,5R)-5-hidroxyl-de-O-methyl-lasiodiplodin;(3 R,5 R)- hydroxyla siodiplodin; 2,4,6-trimethyloct-2-enoic acid-1,2,6,8a-tetrahydro-7-hydroxy-1-8a-dimethyl-6-oxo-2- naphtalenyl-ester;lasiodiplodin;lasiojasmonate A and lasiojasmonates B ou C. Additionally, two metabolites w ere isolated: lasiodiplodin(LT1) and rel-11-12-(7'R* 4'R*, 2 'R*-tetrahydrofuro [1', 2'] pyranyl)-lasiodiplodin (LT2). The compound LT2 being first reported in the literature. The chemical structures of all isolated compounds were elucidated by spectrometries Nuclear Magnetic Resonance 1 H and 13C, IR and CLUE-MS. The extracts and their isolated metabolites were subjected to the cytotoxicity assay to evaluate their antiproliferative effects against a colorectal cancer cell line (HCT-116). The MUB-58 extract showed significant activity (75%) corresponding to an IC50of 10.40 μg.mL -1, while the MUB65 extract was inactive. The LT1 isolated metabolites (IC5011.24 μg.mL-1), FC3(IC50 5.59 μg.mL-1) and FC4(IC500.51 μg.mL-1) showed activity in the range of 11.24 to 0.51 μg.mL-1. Fungos endofíticos têm sido apontados como uma fonte promissora de substâncias biologicamente ativas, entre as quais compostos com potencial atividade anticâncer. Neste contexto, o presente trabalho descreve o primeiro estudo de prospecção química e citotoxicidade de dois fungos endofíticos isolados de Aroeira-do-sertão (Myracrodruon urundeuva Fr. All.): Pseudofusicoccum stromaticum (MUB58) e Lasiodiplodia theobromae (MUB65). Os extratos de acetato de etila MUB58 e MUB65 foram obtidos através de partição líquido-liquido do caldo destas cepas fúngicas, as quais foram cultivadas por 21 dias em extrato de BD e malte, respectivamente. Os extratos fúngicos foram inicialmente analisados por cromatografia líquida de ultraeficiência acoplada a espectrometria de massas de alta resolução (CLUE-EM) e posteriormente submetidos a cromatografia em Sephadex LH-20, seguida de cromatografia líquida de alta eficiência com detector de arranjo de diodo. Análise de CLUE-EM permitiu caracterizar a presença de sete metabólitos no extrato MUB-58: O-sulfato de colina, xantofusina, 7-hidroxi-1-isocromanona, ácido multicólico, djalonensona, 3-ácido carboxílico-8-metoxicarbonila-1-hidroxi-9-oxo-9H-xantona e ciclo-Phe-Leu-Val-Leu-Leu. Além disso, foram isolados quatro metabólitos ciclo-L-Phe-D-Leu1-L-Leu2-L-Leu3-L-lle (FC1), 5-hidroxi-metilfurfural (FC2), rotenolona (FC3) e tefrosina (FC4). O composto FC1 é inédito na literatura, enquanto os compostos FC3 e FC4 estão sendo relatados pela primeira vez em fungos endofíticos. Da mesma forma, a análise CLUE-EM do extrato MUB-65 levou à caracterização química de oito compostos já relatados na espécie L. theobromae: 4-hidroximeleina; meleina; (3R, 5R)- 5-hidroxila-de-O-metil-lasiodiplodina; (3R,5R)-hidroxilasiodiplodina; 2,4,6-trimetiloct-2-enoato,1,2,6,8a- tetrahidro-7-hidroxi-1-8a-dimetil-6-oxo-2-naftalenila; lasiodiplodina; lasiojasmonato A e lasiojasmonatos B ou C. Adicionalmente, dois metabólitos foram isolados: lasiodiplodina (LT1) e rel-11-12- (7’R*, 4’R*, 2’R*- tetrahidrofuro[1’,2’] piranil)- lasiodiplodina (LT2). O composto LT2 está sendo relatado pela primeira vez na literatura. As estruturas químicas de todas as substâncias isoladas foram elucidadas por espectrometrias de Ressonância Magnética Nuclear de 1H e 13C, infravermelho e CLUE-EM. Os extratos e seus respectivos metabólitos isolados foram submetidos ao ensaio de citotoxicidade para avaliação dos seus efeitos antiproliferativos frente a uma linhagem celular de câncer colorretal (HCT-116). O extrato de MUB58 apresentou significativa atividade (75%) correspondendo a um IC50 de 10,40 µg.mL-1, enquanto o extrato de MUB65 foi inativo. Os metabólitos isolados LT1 (IC50 11,24 µg.mL-1), FC3 (IC50 5,59 µg.mL-1) e FC4 (IC50 0,51 µg.mL-1) apresentaram atividades na faixa de 11,24 a 0,51 µg.mL-1.

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Silva, Érica Araújo Rodrigues [UNESP]. "Seleção de isolados de fungos entomopatogênicos para o controle de Leptopharsa heveae Drake & Poor (Hemíptera: Heteroptera, Tingidae)." Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2007. http://hdl.handle.net/11449/97178.

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Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:36Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-02-02Bitstream added on 2014-06-13T19:37:25Z : No. of bitstreams: 1 silva_ear_me_botfca.pdf: 272666 bytes, checksum: 6d16798c5b5ef0ec6a50253109a805bb (MD5) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Com o objetivo de avaliar e comparar a eficiência dos fungos S. insectorum, M. anisopliae, B. bassiana e Paecilomyces spp. no controle de Leptopharsa heveae em diferentes concentrações de aplicação e condições climáticas, este trabalho foi constituído de seleção de isolados em laboratório, testes de produção e viabilidade de conídios em laboratório e análises de eficiência em condições de campo. Foram analisados vinte e sete isolados procedentes de diversos hospedeiros e regiões. A produção de conídios dos patógenos foi efetuada em placas de Petri contendo meio de cultura BDA. Insetos de terceiro instar da praga foram então inoculados através de pulverizações com suspensão de conídios na concentração de 1 x 109 conídios/mL. Avaliações de mortalidade foram efetuadas a cada dois dias e os valores de mortalidade confirmada contabilizados. Neste experimento ocorreu grande variação na patogenicidade entre os isolados testados, sendo que os mais patogênicos foram: 1189, E9, PL63, IBCB87 e 1225. Os dois isolados padrão, SJRC e 1200 não atingiram resultados satisfatórios neste experimento. Os cinco isolados mais patogênicos resultantes da seleção de isolados, mais os dois tidos como padrão, foram então submetidos aos testes de produção, onde foram avaliados quanto ao número de conídios viáveis produzidos. Para tanto, pré-matrizes em placas de Petri, contendo meio de cultura BDA, foram preparadas. A partir destas placas, matrizes contendo arroz como meio de cultura foram inoculadas com suspensão de conídios originária das pré-matrizes na concentração de 5 x 107 conídios/mL. Concluído o desenvolvimento dos patógenos nas matrizes, sacos de polipropileno contendo canjica de milho como meio de cultura foram inoculados com 40mL da suspensão obtida a partir as matrizes. Após um período de incubação de quinze dias... With the objective to evaluate and compare the efficiency of the fungi S. insectorum, M. anisopliae, B. bassiana and Paecilomyces spp. in the biological control of Leptopharsa heveae, in different concentrations of application and climatic conditions, this research was consisted by an election of isolates in laboratory, tests of production and viability of conidia in laboratory, and analyses of efficiency in field conditions. Twenty-seven isolates from different hosts and regions had been evaluated and seven of them were elected. The pathogens production of conidia was made in Petri dishes with BDA as the culture media. Nymphs from the third instar of the pest were then inoculated through sprayings of the conidia suspension in the concentration of 1 x 109 conidia/mL. Evaluations of mortality had been done each two days and the values of confirmed mortality registered. In this experiment, a great variation of pathogenicity among the isolates was observed, but the most pathogenic were: 1189, E9, PL63, IBCB87 and 1225. The two standard isolates, SJRC and 1200 had not reached satisfactory results in this experiment. The five more pathogenic isolates resultants from the election, plus the two standards, had been submitted to production tests, where they were evaluated about the number of viable conidia produced. With this objective, pre-matrices in Petri dishes with BDA as culture media were prepared. From these cultures, matrices with rice as culture media were inoculated with the original suspension of conidia obtained from the pre-matrices in the concentration of 5 x 107 conidia/mL. After the development of the pathogens in the matrices, polypropylene bags with maize as culture media were inoculated with 40mL from the gotten suspension in the matrices. After an incubation period of fifteen days, the content of the bags was evaluated about the production of conidia and their viability... (Complete abstract click electronic access below)

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OLIVEIRA, Luciana Gonçalves de. "Diversidade e potencial enzimático de fungos filamentosos isolados do solo, Semi-Árido, Pernambuco, Brasil." Universidade Federal de Pernambuco, 2009. https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/12808.

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Submitted by Leonardo Freitas (leonardo.hfreitas@ufpe.br) on 2015-04-08T19:57:48Z No. of bitstreams: 2 Tese Luciana de Oliveira.pdf: 1908204 bytes, checksum: d106719829e859b269968dc234a2c86c (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Made available in DSpace on 2015-04-08T19:57:48Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese Luciana de Oliveira.pdf: 1908204 bytes, checksum: d106719829e859b269968dc234a2c86c (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2009-07-03 CAPES; PPBio; CNPq; DAAD Os fungos compreendem um grupo heterogêneo de microrganismos, atuando como sapróbios, parasitas e simbiontes. Como sapróbios, podem viver em diversos ambientes, especialmente no solo. Este trabalho teve como objetivos o isolamento, identificação e atividade enzimática (lacase e peroxidase) de fungos filamentosos do solo do Vale do Catimbau, semi-árido pernambucano. Quatro coletas de solo foram feitas durante os períodos chuvosos (2) e de estiagem (2). Foram identificadas 87 espécies de fungos filamentosos pertencentes aos fungos anamorfos (74), Zygomycota (8) e Ascomycota (6). Penicillium e Aspergillus predominaram com 28 e 18 espécies, respectivamente. Aspergillus fumigatus, A. versicolor, A. terreus, Fusarium solani, Penicillium commune, P. decumbens, P. restrictum, P. verruculosum e P. waksmanii foram classificados como abundantes. Não foram observadas diferenças significativas entre as unidades formadores de colônia em relação aos períodos chuvoso e de estiagem e às superfície e profundidade do solo. O Índice de Diversidade de Shannon-Wiener foi de 4,84 bits por indivíduo. Das espécies identificadas, Pestalotiopsis palustris e Pestalozziella artocarpi estão sendo citadas pela primeira vez para as Américas do Sul e Latina, respectivamente. Trinta e duas espécies foram testadas quanto à atividade enzimática, onde 22 e 27 foram positivas para a lacase e peroxidase, respectivamente. Chaetomium globosum apresentou melhor atividade lacase, enquanto Pithomyces chartarum revelou melhor atividade para peroxidase. O pH ótimo para atividade lacase foi 3,0 em Pithomyces chartarum e, 4,5 em C. pallescens para peroxidase. A temperatura ótima foi observada em C. globosum foi 70ºC por 60 min para lacase e, 50ºC por 60 min em Mirothecium roridum para peroxidase. Curvularia pallescens, Pestalotiopsis palustris, Pestalozziella artocarpi e Scopulariopsis chartarum estão sendo citadas como primeiro registro com atividade para fenoloxidases. Os resultados desta pesquisa indicam que os fungos anamórficos predominam no solo do Vale do Catimbau e que as espécies testadas quanto a produção de fenoloxidases são promissoras para a biotecnologia.

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Santos, Rafaella Costa Bonugli. "Fungos isolados de macro-organismos marinhos brasileiros = diversidade genética e potencial biotecnológico." [s.n.], 2010. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/254771.

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Orientadores: Lucia Regina Durrant, Lara Durães Sette Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos Made available in DSpace on 2018-08-15T23:25:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Santos_RafaellaCostaBonugli_D.pdf: 1864466 bytes, checksum: 5bb70197e101a9e0e85c0147626dbf2e (MD5) Previous issue date: 2010 Resumo: Os ecossistemas marinhos representam uma fonte potencial de recursos genéticos para diversas aplicações biotecnológicas. Neste sentido, os fungos filamentosos derivados do ambiente marinho podem ser considerados estratégicos para a produção de compostos naturais bioativos e para aplicações em processos industriais que requerem tolerância às condições salinas. Neste contexto, o presente trabalho teve como objetivo geral avaliar a diversidade genética de fungos derivados de macro-organismos marinhos (cnidários e esponjas) e o potencial destes isolados para a biorremediação de poluentes ambientais. A caracterização da diversidade dos fungos isolados de cnidários marinhos demonstrou que a maioria dos isolados pertencem ao filo Ascomycota, sendo identificado apenas um único isolado do filo Zygomycota (gênero Mucor). Diversos fungos filamentosos isolados dos cnidários marinhos apresentaram potencial biotecnológico para produção das enzimas ligninolíticas. Entretanto, os fungos Aspergillus sclerotiorum CBMAI 849, Cladosporium cladosporioides CBMAI 857 (Ascomycota) e o Mucor racemosus CBMAI 847 (Zygomycota) foram selecionados devido à capacidade de produção de quantidades significativas de enzimas ligninolíticas na triagem inicial. Esses três isolados foram submetidos à avaliação de diferentes fatores (fonte de carbono, farelo de trigo e salinidade) envolvidos na atividade ligninolítica. A atividade da lacase e MnP foi ampliada quando a glicose foi utilizada como fonte de carbono, contudo LiP foi produzida apenas no meio contendo extrato de malte. A adição do farelo de trigo não influenciou a produção das enzimas, contudo, a salinidade foi o fator mais importante na atividade ligninolítica. Valores mais altos de MnP e lacase foram produzidos por M. racemosus CBMAI 847 em 12,5% e 23% de salinidade, sendo o primeiro relato da atividade ligninolítica para o gênero Mucor. Levando-se em consideração que os fungos basidiomicetos são os principais produtores de enzimas ligninolíticas, três basidiomicetos isolados de esponjas marinhas, identificados como Marasmiellus sp. CBMAI 1062, Tinctoporellus sp. CBMAI 1061 e Peniophora CBMAI 1063 foram investigados quanto à atividade de LiP, MnP e Lac, diversidade dos genes que codificam para a atividade extracelular da lacase e degradação do corante Remazol Brilhante Blue R (RBBR). A atividade enzimática foi altamente significativa para os três basidiomicetos derivados marinhos em meio contendo extrato de malte como fonte de carbono (condição não salina) e em meio formulado com água do mar artificial (condição salina). A atividade ligninolítica aumentou quando o farelo de trigo e CuSO4 foram adicionados ao meio de cultivo contendo glicose como fonte de carbono. Uma elevada diversidade de genes que codificam para a lacase foi encontrada nos três basidiomicetos estudados, sugerindo a detecção de novas lacases, que podem apresentar características diferentes das produzidas por micro-organimos terrestres. Em adição, os três basidiomicetos estudados apresentaram capacidade significativa de descoloração do corante RBBR. O fungo Tinctoporellus sp. CBMAI 1061 foi o mais eficiente na degradação do corante RBBR, com 100% de degradação após 3 dias de cultivo e a MnP foi a principal enzima produzida durante a descoloração do corante por este fungo. Os resultados obtidos no presente estudo demonstram o potencial biotecnológico dos fungos derivados de ambientes marinhos pertencentes a diferentes grupos taxonômicos (ascomicetos, zigomicetos e basidiomicetos), principalmente na degradação de poluentes por enzimas ligninolíticas em ambiente ou processos salinos, como na biorremediação de Hidrocarbonetos Policíclicos Aromáticos (HPAs) e vários compostos aromáticos derivados do derramamento de petróleo nos oceanos e mares ou no tratamento de efluentes têxteis, os quais contêm altas concentrações de sais Abstract: Marine ecosystems represent potential genetic resources for various biotechnological applications. In this sense, the fungi derived from marine environments can be considered strategic for the production of natural bioactive compounds and for applications in industrial processes that require tolerance to saline conditions. In this context, this study aimed to evaluate the biotechnological potential of fungi derived from marine macroorganisms (cnidarians and sponges) on the degradation of environmental pollutants, as well as to characterize the diversity of isolates derived from such samples. Our results showed that most marine-derived fungal isolates belong to the phylum Ascomycota, and only one isolate was identified as representative of the genus Mucor, phylum Zigomycota. Several filamentous fungi isolated from marine cnidarians showed potential for industrial applications. However, Aspergillus sclerotiorum CBMA 849, Cladosporium cladosporioides CBMA 857 (Ascomycota) and Mucor racemosus CBMAI 847 (Zygomycota) were selected for their ability to produce significant amounts of ligninolytic enzymes in the initial screening. These three isolates were submitted to experiments related to the influence of different variable parameters (carbon source, wheat bran and salinity) on ligninolytic activity. Lac and MnP activities were enhanced when glucose was used as carbon source. However LiP was produced only in medium containing malt extract. According to the statistical analysis, the addition of wheat bran did not influence the enzyme productions, but the salinity was the most important parameter on the ligninolytic activities. The highest amounts of MnP and laccase were produced by M. racemosus CBMAI 847 in 12.5% and 23% salinity and this was the first report related to ligninolytic activity for the genus Mucor. Taking into account that basidiomycetes are the major producers of ligninolytic enzymes, three basidiomycetes isolates from marine sponges identified as Marasmiellus sp. CBMAI 1062, Tinctoporellus sp. CBMAI 1061 and Peniophora sp. CBMAI 1063 were investigated in relation to LiP, MnP and Lac activities, as well as the diversity of extracellular laccase genes and the decolorization of Remazol Brilliant Blue R (RBBR) dye. The enzyme activity was highly significant for the three marine-derived basidiomycetes in medium containing malt as carbon source (non-saline condition) and in medium formulated with artificial seawater (saline condition). Ligninolytic activity was enhanced when wheat bran and CuSO4 were added to the culture medium containing glucose as carbon source. A high diversity of Lac genes was found in the three basidiomycetes studied, suggesting the detection of new laccase, which may present different characteristics from those produced by terrestrial microorganisms. In addition, the three basidiomycetes studied showed significant capacity to decolorize the RBBR dye. Tinctoporellus sp. CBMAI 1061 was the most efficient fungus in the dye decolorization, presenting 100% degradation after 3 days of cultivation in liquid medium, and MnP was the main enzyme produced during RBBR decolorization by the three marine-derived fungi. Results from our study revealed the biotechnology potential of marine-derived fungi belonging to different taxonomic groups (ascomycetes, zygomycetes and basidiomycetes), in the degradation of pollutants by ligninolytic enzymes in saline environments and/or processes, such as the bioremediation of Polycyclic Aromatic Hydrocarbons (PAHs) derived from oil spills in the ocean or in the treatment of industrial (textile) colored effluents, which contain high concentrations of salts. Os ecossistemas marinhos representam uma fonte potencial de recursos genéticos para diversas aplicações biotecnológicas. Neste sentido, os fungos filamentosos derivados do ambiente marinho podem ser considerados estratégicos para a produção de compostos naturais bioativos e para aplicações em processos industriais que requerem tolerância às condições salinas. Neste contexto, o presente trabalho teve como objetivo geral avaliar a diversidade genética de fungos derivados de macro-organismos marinhos (cnidários e esponjas) e o potencial destes isolados para a biorremediação de poluentes ambientais. A caracterização da diversidade dos fungos isolados de cnidários marinhos demonstrou que a maioria dos isolados pertencem ao filo Ascomycota, sendo identificado apenas um único isolado do filo Zygomycota (gênero Mucor). Diversos fungos filamentosos isolados dos cnidários marinhos apresentaram potencial biotecnológico para produção das enzimas ligninolíticas. Entretanto, os fungos Aspergillus sclerotiorum CBMAI 849, Cladosporium cladosporioides CBMAI 857 (Ascomycota) e o Mucor racemosus CBMAI 847 (Zygomycota) foram selecionados devido à capacidade de produção de quantidades significativas de enzimas ligninolíticas na triagem inicial. Esses três isolados foram submetidos à avaliação de diferentes fatores (fonte de carbono, farelo de trigo e salinidade) envolvidos na atividade ligninolítica. A atividade da lacase e MnP foi ampliada quando a glicose foi utilizada como fonte de carbono, contudo LiP foi produzida apenas no meio contendo extrato de malte. A adição do farelo de trigo não influenciou a produção das enzimas, contudo, a salinidade foi o fator mais importante na atividade ligninolítica. Valores mais altos de MnP e lacase foram produzidos por M. racemosus CBMAI 847 em 12,5% e 23% de salinidade, sendo o primeiro relato da atividade ligninolítica para o gênero Mucor. Levando-se em consideração que os fungos basidiomicetos são os principais produtores de enzimas ligninolíticas, três basidiomicetos isolados de esponjas marinhas, identificados como Marasmiellus sp. CBMAI 1062, Tinctoporellus sp. CBMAI 1061 e Peniophora CBMAI 1063 foram investigados quanto à atividade de LiP, MnP e Lac, diversidade dos genes que codificam para a atividade extracelular da lacase e degradação do corante Remazol Brilhante Blue R (RBBR). A atividade enzimática foi altamente significativa para os três basidiomicetos derivados marinhos em meio contendo extrato de malte como fonte de carbono (condição não salina) e em meio formulado com água do mar artificial (condição salina). A atividade ligninolítica aumentou quando o farelo de trigo e CuSO4 foram adicionados ao meio de cultivo contendo glicose como fonte de carbono. Uma elevada diversidade de genes que codificam para a lacase foi encontrada nos três basidiomicetos estudados, sugerindo a detecção de novas lacases, que podem apresentar características diferentes das produzidas por micro-organimos terrestres. Em adição, os três basidiomicetos estudados apresentaram capacidade significativa de descoloração do corante RBBR. O fungo Tinctoporellus sp. CBMAI 1061 foi o mais eficiente na degradação do corante RBBR, com 100% de degradação após 3 dias de cultivo e a MnP foi a principal enzima produzida durante a descoloração do corante por este fungo. Os resultados obtidos no presente estudo demonstram o potencial biotecnológico dos fungos derivados de ambientes marinhos pertencentes a diferentes grupos taxonômicos (ascomicetos, zigomicetos e basidiomicetos), principalmente na degradação de poluentes por enzimas ligninolíticas em ambiente ou processos salinos, como na biorremediação de Hidrocarbonetos Policíclicos Aromáticos (HPAs) e vários compostos aromáticos derivados do derramamento de petróleo nos oceanos e mares ou no tratamento de efluentes têxteis, os quais contêm altas concentrações de sais Doutorado Doutor em Ciência de Alimentos

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Dissertations / Theses on the topic 'Fungi isolates'

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