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Juscamayta L., Eduardo, Lenin Maturrano H., and Raúl Rosadio A. "Análisis Genómico de Mannheimia haemolytica Serotipo A2 para la Identificación de Potenciales Candidatos Vacunales contra la Neumonía en Alpacas." Revista de Investigaciones Veterinarias del Perú 28, no. 2 (July 23, 2017): 397. http://dx.doi.org/10.15381/rivep.v28i2.13075.
Full textAbstract:
El objetivo del presente trabajo fue identificar antígenos inmunoprotectivos en la secuencia genómica de Mannheimia haemolytica serotipo A2 Ovino, aislado de ovino y disponible en las bases de datos, que puedan ser utilizados como potenciales candidatos vacunales contra la neumonía en alpacas. Para ello, se empleó la secuencia completa del genoma de este microorganismo disponible en las bases de datos y mediante el uso de herramientas bioinformáticas se procedió a la búsqueda e identificación de genes candidatos, la anotación funcional, la predicción de la localización subcelular y la identificación de motivos de secuencias, incluyendo dominios transmembrana, peptidos señal de secreción y lipoproteínas. Los factores de virulencia fueron identificados en la base de datos de factores de virulencia (VFDB) y en la base de datos microbiana de virulencia (MvirDB). Los criterios de selección incluyeron proteínas conservadas, secretadas y asociadas a superficie con hélices transmembrana d»1. Se realizó la búsqueda de homología de genes con la base de datos de antígenos protectivos (Protegen), permitiendo la identificación de 23 antígenos potencialmente inmunoprotectivos, conservados entre los serotipos virulentos de M. haemolytica y otros patógenos de la familia Pasteurellaceae. Los genes identificados están relacionados con la patogénesis, virulencia y evasión del sistema immune del hospedero y podrían ser grandes candidatos a ser evaluados como potenciales vacunas contra la pasteurelosis neumónica.
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Barboza Rojas, Karina, Alejandro Hernández Soto, and Claudia Zúñiga Vega. "Estudio de los genes allinasa y quitinasa en el ajo costarricense (Allium sativum L.)." Revista Tecnología en Marcha 26, no. 1 (March 22, 2013): 46. http://dx.doi.org/10.18845/tm.v26i1.1121.
Full textAbstract:
<p class="p1">El cultivo del ajo en Costa Rica se ha visto afectado por la calidad y cantidad de semillas almacenadas. La producción de los bulbos también se ve deteriorada por las enfermedades. Sin embargo, este cultivo es apetecido por su sabor, considerado superior al del ajo importado de China. La pungencia del ajo está dada en parte por la acción de la enzima allinasa. Además, la resistencia a ciertos hongos patógenos está influenciada por la actividad de la enzima quitinasa. En el presente estudio se analizaron los genes que codifican para ambas enzimas, utilizando plántulas in vitro obtenidas a partir de materiales de las zonas de Llano Grande, Santa Ana, Miramar, San Ramón y de ajo importado de China. Se compararon y estudiaron las secuencias de ADN utilizando estos genes, con el fin de encontrar diferencias que permitieran la caracterización de distintos materiales. Los resultados obtenidos indicaron la presencia de distintas copias del gen allinasa. El gen de la quitinasa presentó una secuencia muy conservada en todos los materiales analizados. Se encontraron dos intrones altamente conservados en el germoplasma costarricense y el material de referencia asiático. Se concluyó que el ajo costarricense es muy similar al asiático. Y se presenta el primer informe de la existencia de intrones en la quitinasa del ajo.</p>
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Garcia, Vinícius, Alessandra Ferreira Ribas, Luiz Gonzaga Esteves Vieira, and Tiago Benedito dos Santos. "IN SILICO ANALYSIS OF THE Dof TRANSCRIPTION FACTOR FAMILY IN Coffea canephora." COLLOQUIUM AGRARIAE 14, no. 4 (December 1, 2018): 99–111. http://dx.doi.org/10.5747/ca.2018.v14.n4.a253.
Full textAbstract:
A família Dof(DNA-binding with One Finger) é um grupo de fatores de transcrição que desempenham papéis importantes no crescimento, desenvolvimento e na resposta das plantas aos estresses bióticos e abióticos. Os genes Dofforam identificados e caracterizados em várias espécies de plantas;entretanto até o presente momento não há informações sobre esses genes em café. No presente estudo foram identificados 24 membros da família Dofno genoma de C. canephoradepositados no banco de dados Coffee Genome Hub. Análises sistemáticas de bioinformática foram realizadas para caracterizar os genes DofemC. canephora, incluindo a análise desequênciasgenômicas, domínios proteicos conservados, localizações subcelulares, relações filogenéticas e perfis de expressão gênica em diferentes tecidos. Os resultados obtidos fornecem uma melhor compreensãosobre a família dos genes CcDofpermitindo projetar experimentos futuros para caracterização molecular dessesgenes no cafeeiro.
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Silva, Carlos Alberto, Bruno Ferreira Gonçalves Silva, Renan Richard, Alexandre Reis Taveira Souza, and Patrícia Carla Paulino. "A expressão dos Genes HOX e a má formação da coluna vertebral." Saúde em Revista 17, no. 46 (August 25, 2017): 59. http://dx.doi.org/10.15600/2238-1244/sr.v17n46p59-65.
Full textAbstract:
Genes HOX são grupos de genes com fatores de transcrição altamente conservados, originalmente descrito como responsável por controlar funções críticas no desenvolvimento do plano corporal ao longo do eixo anteroposterior (AP) em Drosophila. Ao Longo das últimas 3 décadas, estudos foram realizados gerando dados no aspecto evolutivo de diversos táxons, onde se destacam claramente que as mudanças nos padrões de expressão destes genes estão estreitamente associadas com a regionalização do eixo AP, sugerindo que os genes HOX tem desempenhado importante papel durante a evolução do plano corporal em especial a bilateria. Apesar da sua conservação funcional e a importância deste gene na padronização do eixo AP, questões fundamentais permanecem sobre muitos aspectos obscuras sobre a biologia molecular do gene HOX. Destaca-se aqui dados recentes sobre a origem do cluster HOX em mamíferos, os papeis dos genes HOX na geração do plano corporal e os possíveis mecanismos utilizados pelos genes HOX para codificar a especificidade do plano corporal.
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Santana, Juliano Oliveira, Gonçalo Santos Silva, and Luciano Angelo De Souza Bernardes. "DUAS PROTEÍNAS (TcTIA6 e TcTIA7) ENVOLVIDAS NA BIOSSÍNTESE DA TIAMINA CODIFICADAS PELO GENOMA do Theobroma cacao L." Infarma - Ciências Farmacêuticas 29, no. 3 (September 25, 2017): 208–13. http://dx.doi.org/10.14450/2318-9312.v29.e3.a2017.pp208-213.
Full textAbstract:
A tiamina funciona como um cofator para atividades de várias enzimas que atuam no metabolismo de carboidratos e aminoácidos. Este trabalho objetivou analisar através de técnicas de bioinformática os genes responsáveis pela biossíntese da tiamina codificadas pelo genoma do Theobroma cacao L. Foram encontrados dois genes, um no cromossomo6 e outro no 7, sendo nomeados TcTIA6 e TcTIA7. O alinhamento múltiplo da TcTIA6 e TcTIA7 revelou alta identidade com a proteína da Arabidopis thaliana e seu direcionamento é destinado para a rota secretora do cloroplasto. Foram observados motifs conservados na região C-terminal, indicando participação no mecanismo de reparo de DNA. Analisando o dendrograma ficou evidenciado que os genes estudados tiveram um ancestral comum com Gossypium raimondii. As análises mostraram que as proteínas TcTIA6 e TcTIA7 provavelmente são bifuncionais, uma vez queestão envolvidas na biossíntese da tiamina e na estabilidade da molécula de DNA.
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Solis Calero, Christian. "Modelaje de proteínas de Mycobacterium tuberculosis relacionadas a su defensa frente al estrés oxidativo." Ciencia e Investigación 8, no. 1 (June 13, 2005): 33–39. http://dx.doi.org/10.15381/ci.v8i1.5225.
Full textAbstract:
En el presente trabajo se describe el uso de procedimientos bioinformáticos e información genómica de acceso libre por Internet, para identificar y caracterizar proteínas que participan en la defensa de Mycobacterium tuberculosis (MT) frente al estrés oxidativo, con el propósito de obtener nuevos blancos farmacológicos en este patógeno. Las secuencias de aminoácidos de las proteínas correspondientes a los genes katG, ahpC, ahpD, sodA, sodC y mgtC fueron comparadas con el genoma de Mycobacteríum tuberculosis H37Rv a través del servidor del National Center for Biotechnology Information, determinando su posible redundancia en el genoma. Paralelamente, se obtuvo información sobre sus residuos más conservados evolutivamente por alineamiento múltiple global usando el programa MAXHOM, así como modelos de sus estructuras tridimensionales usando los métodos de «modelaje molecular comparativo» a través del servidor SWISS-MODEL o modelaje por el método de «reconocimiento de plegamiento» (threading) a través del metaservidor GENESILICO. En base al análisis genómico se puede concluir que las proteínas codificadas por los genes katG, ahpD y mgtC son buenos candidatos como blancos farmacológicos debido a que no tienen similaridad significativa con alguna proteína codificada por genes presentes en el genoma humano y no presentan redundancia en el genoma del Mycobacterium tuberculosis.
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Bolina, C. O., J. A. Marchese, M. V. Paladini, C. Pinnow, G. Benin, I. M. O. Sousa, and M. A. Foglio. "Dissimilaridade genética em variedades de Artemisia annua L. embasada em caracteres agronômicos, fisiológicos e fitoquímicos." Revista Brasileira de Plantas Medicinais 16, no. 2 suppl 1 (2014): 356–63. http://dx.doi.org/10.1590/1983-084x/12_039.
Full textAbstract:
O presente estudo objetivou estimar a variabilidade genética existente entre caracteres agronômicos, fisiológicos e fitoquímicos em variedades de A. annua. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado e os tratamentos foram as variedades Artemis, 2/39x5x3M, e 2/39x1V de A. annua, submetidas a avaliações agronômicas, fisiológicas e fitoquímicas. Para a realização das estimativas de distância genética foram geradas matrizes de dissimilaridade utilizando a distância Euclidiana e os métodos de agrupamento de Tocher e UPGMA. Além disso, avaliou-se a importância relativa dos caracteres para divergência genética pelo método de Singh. As análises foram realizadas pelo software Genes e os dendrogramas obtidos pelo NTSYS. A presença de variabilidade genética dentro das variedades permitiu a identificação de acessos dissimilares e com média elevada para as características estudadas. O número de ramificações, concentração intracelular de CO2, e o rendimento de óleo essencial foram os caracteres que mais contribuíram para a dissimilaridade genética de A. annua. Os acessos B24, C5 e C32 foram os mais promissores dentro das variedades e devem ser conservados para futuras hibridações, sendo que as hibridações mais promissoras na obtenção de populações segregantes desejadas são B24 x C5, B24 x C32 e C5 x C32.
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Camel Paucar, Vladimir, Esteban Galeano, and Helaine Carrer. "Análisis in silico y expresión génica del factor de transcripción TgNAC01 implicado en xilogénesis y estrés abiótico en Tectona grandis." Acta Biológica Colombiana 22, no. 3 (September 1, 2017): 359–69. http://dx.doi.org/10.15446/abc.v22n3.62164.
Full textAbstract:
El xilema secundario es el componente más abundante de la biomasa vegetal. Por tanto, conocer los genes que regulan su formación ayudaría a diseñar estrategias para el mejoramiento genético de la madera. Así, el objetivo de este trabajo fue realizar el análisis computacional de la estructura primaria y secundaria del factor de transcripción (FT) TgNAC01 de Tectona grandis, además de evaluar su historia evolutiva, dominios conservados y expresión génica en tejidos lignificados de árboles de 12 y 60 años. Para ello, se realizó una evaluación del potencial de interacción ion-electrón (PIIE), mediante el método del espectro de la información (MEI) utilizando la librería SFAPS de R-Project, seguido del modelamiento estructural utilizando el software MODELLER y visualizado mediante PyMol. Además, el análisis de alineamiento de secuencia múltiple y filogenia fue mediante el software Bioedit y MrBayes respectivamente. También se evaluó los niveles de síntesis del FT TgNAC01 mediante qRT-PCR. Como resultados, se evidencio que el FT mantiene una estructura β-hoja antiparalela retorcida, que se compacta contra una α-hélice en la región N-terminal, teniendo así tres dominios α hélice y siete dominios β plegada. Asimismo, mediante el MEI se demostró que tiene alrededor de cinco funciones biológicas y mutaciones sobre los aminoácidos con mayor PIIE, lo que conlleva a evoluciones sobre las redes de regulación genética. Finalmente, el FT TgNAC01 juega un papel fundamental en la organización y desarrollo de las partes que componen la albura, como las células radiales de la zona cambial, los vasos, fibras y los anillos de crecimiento.
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Vergara, Rodrigo C., and Mauricio Toro. "Conserved: inherited beyond genes / Conservado: heredado más allá de los genes." Estudios de Psicología 38, no. 1 (January 2, 2017): 269–74. http://dx.doi.org/10.1080/02109395.2016.1268395.
Full text
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Hipólito-Romero, Enrique, Eliezer Cocoletzi-Vásquez, José M. Ramos-Prado, Cesar Espinoza, Magdiel Torres-de la Cruz, and Jorge Ricaño-Rodríguez. "Breve aproximación a la naturaleza genómica de Moniliophthora roreri CPMRT01 aislado de cacao en Tabasco, México//Brief approach to the genomic nature of Moniliophthora roreri CPMRT01 isolated from cocoa in Tabasco, Mexico." Biotecnia 22, no. 2 (March 21, 2020): 39–49. http://dx.doi.org/10.18633/biotecnia.v22i2.1244.
Full textAbstract:
Moniliophthora roreri es un hongo de suma importancia agroeconómica principalmente en el continente americano, ya que es el agente causal de la moniliasis de al menos cuatro especies de cacao. El genoma de este hongo consta de aproximadamente 52,3 Mpb, cuyos genes de interés se reagrupan dependiendo de su naturaleza (e.g. hemibiotróficos, biotróficos y fitopatogénicos). Por otro lado, Moniliophthora es capaz de metabolizar proteínas involucradas en procesos de infección, regulación metabólica y mecanismos de defensa. El objetivo principal de este trabajo fue caracterizar un fragmento del genoma de una cepa de M. roreri, previamente aislada de cacao en el Estado de Tabasco, México. Para ello, se implementó una estrategia experimental que involucró la generación de bibliotecas genómicas así como una secuenciación de regiones nucleotídicas consenso, predicción heurística-funcional e identificación de hipotéticos dominios conservados, respectivamente. El estudio permitió explorar alrededor del 16 % del genoma de la cepa. Entre los resultados y conclusiones obtenidas más interesantes, se generaron reconstrucciones filogenéticas de máxima identidad respecto a un genoma de referencia y, cuyos transcritos se encontrarían involucrados en procesos de fitopatogenicidad y metabolismo secundario, identificándose aparentes dominios proteicos y sitios catalíticos activos en algunos de los cóntigos estudiados.ABSTRACTMoniliophthora roreri is a fungus of extreme agroeconomic importance mainly in the American continent, since it is the causal agent of moniliasis of at least four cocoa species. The genome of this fungus consists of approximately 52,3 Mbp, whose genes of interest may be regrouped depending on their nature (e.g. hemibiotrophics, biotrophics and phytopathogenics). On the other hand, Moniliophthora is liable to metabolize proteins involved in infection processes, metabolic regulation and defense mechanisms. The aim of this work was to partially characterize a fragment of the genome of a M. roreri strain previously isolated from cocoa in the State of Tabasco, Mexico. To reach this goal, an experimental strategy was implemented that involved the generation of genomic libraries as well as a consensus nucleotide region sequencing, functional-heuristic prediction and identification of hypothetical conserved domains, respectively. The study allowed to explore about 16 % of the strain´s genome. Among the most interesting results and conclusions obtained, phylogenetic reconstructions of maximum identity respect to the reference genome were reached, whose transcripts would be involved in phytopathogenic processes and secondary metabolism, identifying apparent protein domains and active catalytic sites in some of the contigs under study.
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Zamora-Muñoz, Juan, Carmen Sánchez, Edna Hernández-Domínguez, Jorge Álvarez-Cervantes, and Rubén Díaz. "Herramientas bioinformáticas usadas en el estudio de enzimas fenoloxidasas del género Pleurotus." Mexican Journal of Biotechnology 3, no. 1 (January 1, 2018): 95–118. http://dx.doi.org/10.29267/mxjb.2018.3.1.95.
Full textAbstract:
El análisis bioinformático permite relacionar, predecir y analizar un conjunto de proteínas de interés que comparten áreas conservadas en común a través de un computador (in silico). Este análisis bioinformático se realiza a partir de la secuencia de bases de datos, dominios y de regiones clave que conforman la función catalítica de una proteína. La secuencia de aminoácidos proporciona una predicción correspondiente a las regiones conservadas. Posteriormente las secuencias de aminoácidos se acoplan de manera ordenada por su función y estructura, mismas que generan proyecciones espaciales de estructuras terciarias que permiten el reconocimiento de secuencias claves para mutaciones coordinadas. La bioinformática en las enzimas fenoloxidasa como lacasa, manganeso peroxidasa y decolorante peroxidasa permite observar estructuras proteicas, cadenas alfa y beta, así como los iones responsables de la catálisis. Las técnicas in silico juegan un papel importante en áreas como la medicina, la biotecnología y la genómica en beneficio de la salud humana. La técnica de secuenciación de ADN identifica organismos por medio de secuencias de aminoácidos tomadas de bancos de datos para elaborar proteínas molde, alineamiento de secuencias, modelamientos por homología y la validación o identificación de organismos.
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Tortajada hernando, Sonia, and Manuel María Blanco Domínguez. "Cleaning plaster surfaces with agar-agar gels: evaluation of the technique." Ge-conservacion 4 (July 31, 2013): 111–26. http://dx.doi.org/10.37558/gec.v4i0.153.
Full textAbstract:
Abstract: Cleaning plaster surfaces represent a challenge for conservators It should only be performed following fully tested methods that guarantee the conservation of such fragile material. The goal of this work is to establishing a suitable cleaning method for this type of artworks from the tested concentrations and time of applications, using agar gels on plaster supports.Morphological, porosity and weight variations have been studied. Confocal and stereomicroscopy have been used as analytical techniques, as well as the measurement of water vapor permeability and weight have been taken on the samples.La limpieza de superficies de yeso-escayola con geles de agar-agar: evaluación de la técnicaResumen: La limpieza segura y eficiente de las superficies de yeso constituye un reto y una responsabilidad para el conservador-restaurador, y debe llevarse a cabo siguiendo métodos testados que garanticen su correcta conservación. La intención de este trabajo es determinar, a partir de las concentraciones y tiempos de aplicación ensayados, cuáles serían los parámetros óptimos para la ejecución de una limpieza eficaz e inocua empleando geles de agar-agar sobre soportes de yeso.Se han comprobado las posibles variaciones morfológicas de la superficie, las variaciones de la porosidad y del peso, así como la presencia de residuos, para lo cual se ha empleado la microscopía confocal, microscopía binocular, la medida de la permeabilidad al vapor de agua y la medida del peso de las muestras.
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Alves, Meire de Cássia, Juliana Regina Rossi, Maria Gabriela Fontanetti Rodrigues, Eliane Cristina da Cunha Alves, Antonio Sergio Ferraudo, Manoel Victor Franco Lemos, Janete Apparecida Desidério, and Odair Aparecido Fernandes. "Identificação e caracterização de genes vip e cry coleóptero‑específicos em isolados de Bacillus thuringiensis." Pesquisa Agropecuária Brasileira 46, no. 9 (September 2011): 1053–60. http://dx.doi.org/10.1590/s0100-204x2011000900012.
Full textAbstract:
O objetivo deste trabalho foi identificar e caracterizar os genes cry3, vip1, vip2 e vip1/vip2 em uma coleção de 1.078 isolados de Bacillus thuringiensis potencialmente tóxicos para larvas de coleópteros. Foram utilizados pares de oligonucleotídeos iniciadores gerais obtidos a partir de regiões conservadas dos genes e do alinhamento de sequências consenso. Posteriormente, os isolados positivos foram caracterizados por meio da técnica de PCR‑RFLP, tendo-se utilizado enzimas de restrição específicas, para identificar novas subclasses de genes nos isolados. Cento e cinquenta e um isolados foram positivos para os genes avaliados, com maior frequência para o gene vip1/vip2 (139 isolados). Pela técnica de PCR‑RFLP, foram observados 14 perfis polimórficos, o que indica a presença de diferentes alelos e, consequentemente, de distintas subclasses desses genes.
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Hernández-Rodríguez, Patricia, Mónica Baquero P., Andrés Felipe Santander Torres, and Arlen Gómez. "Diversidad molecular de candidatos vacunales en Leptospira spp." Revista de Medicina Veterinaria, no. 30 (September 20, 2015): 95. http://dx.doi.org/10.19052/mv.3613.
Full textAbstract:
El objetivo de este estudio fue determinar la diversidad molecular de las proteínas OmpL1, LipL32, LipL41, LigA y LigB y de los genes que las codifican mediante análisis bioinformáticos en diferentes cepas patógenas de Leptospira spp., a partir de la información disponible en las bases de datos. Se utilizaron las secuencias de aminoácidos de las proteínas OmpL1, LipL32, LipL41, LigA y LigB, así como las de los genes que las codifican en las cepas de Leptospira spp. registradas en The National Center for Biotechnology Information (NCBI). Los análisis de las proteínas y los genes se realizaron mediante los recursos Protein, Nucleotide y Gene del NCBI. La alineación de las secuencias consenso se realizó con las herramientas PSI-BLAST y BLASTn. El porcentaje de cobertura de las secuencias seleccionadas de los genes ompL1, lipL32, lipL41, ligA y ligB en cepas patógenas de Leptospira spp. es de 100 % para ompL1, lipL32 y lipL41, 75 % para ligA y 99 % para ligB con porcentajes de identidad de 85, 98, 88, 90 y 80 % respectivamente; el porcentaje de cobertura de las secuencias seleccionadas de las proteínas es de 100, 77, 99, 100 y 100 % con porcentajes de identidad de 90, 99, 92, 63 y 60 % respectivamente, lo cual indica que los genes y las proteínas, excepto las proteínas LigA y LigB, son bastante conservadas en los diferentes serovares patógenos de Leptospira spp. Según dichos resultados, se recomienda realizar análisis complementarios de estas proteínas con el fin de determinar si es viable su uso como candidatos vacunales.
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Morante-Carriel, Jaime, Milena Acosta-Farías, Víctor Huebla-Concha, Anna Agnieszka-Obrebska, Roque Bru-Martínez, and María Lorena Cadme-Arévalo. "Identificación de un gen codificante de polifenol oxidasa (PPO) en Theobroma cacao L. (cacao) de Ecuador." Ciencia y Tecnología 10, no. 2 (December 31, 2017): 89–101. http://dx.doi.org/10.18779/cyt.v10i2.172.
Full textAbstract:
En Ecuador, las plantaciones de cacao presentan bajos promedios de producción debido a la diversidad de patógenos, especialmente a la infección por Moniliophthora roreri (monilia). Se cree que existe una relación entre el ataque del hongo y el aumento de los niveles de expresión de genes codificantes de polifenol oxidasas (PPOs) como mecanismo de defensa ante patógenos y herbívoros en diferentes plantas. Para la identificación de genes que codifican para PPOs, se seleccionaron hojas de cacao Nacional, provenientes de plantas resistentes y susceptibles a monilia, ubicadas en la Finca Experimental La Represa, propiedad de la Universidad Técnica Estatal de Quevedo. Se afinó un protocolo de extracción de ARN total de alta calidad para hojas de cacao recalcitrantes. Después de su retrotranscripción a ADNc, se realizaron ensayos de amplificación por PCR con diferentes primers, diseñados a partir de secuencias conservadas de PPOs. Los productos de amplificación permitieron la identificación de un gen de 961 pb, similar a un gen que codifica para la PPO predictiva de Theobroma cacao depositada en NCBI (XP_017978715.1) La identificación de este gen, es fundamental para evaluar a futuro los niveles de expresión y cuantificación en diferentes estados de desarrollo del fruto. Dicha cuantificación permitirá proponer herramientas de control para monilia y construir las bases para el mejoramiento genético del cacao Nacional.
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Morante-Carriel, Jaime, Milena Acosta-Farías, Víctor Huebla-Concha, Anna Agnieszka-Obrebska, Roque Bru-Martínez, and María Lorena Cadme-Arévalo. "Identificación de un gen codificante de polifenol oxidasa (PPO) en Theobroma cacao L. (cacao) de Ecuador." Ciencia y Tecnología 10, no. 2 (December 1, 2017): 89–101. http://dx.doi.org/10.18779/cyt.v10i2.213.
Full textAbstract:
En Ecuador, las plantaciones de cacao presentan bajos promedios de producción debido a la diversidad de patógenos, especialmente a la infección por Moniliophthora roreri (monilia). Se cree que existe una relación entre el ataque del hongo y el aumento de los niveles de expresión de genes codificantes de polifenol oxidasas (PPOs) como mecanismo de defensa ante patógenos y herbívoros en diferentes plantas. Para la identificación de genes que codifican para PPOs, se seleccionaron hojas de cacao Nacional, provenientes de plantas resistentes y susceptibles a monilia, ubicadas en la Finca Experimental La Represa, propiedad de la Universidad Técnica Estatal de Quevedo. Se afinó un protocolo de extracción de ARN total de alta calidad para hojas de cacao recalcitrantes. Después de su retrotranscripción a ADNc, se realizaron ensayos de amplificación por PCR con diferentes primers, diseñados a partir de secuencias conservadas de PPOs. Los productos de amplificación permitieron la identificación de un gen de 961 pb, similar a un gen que codifica para la PPO predictiva de Theobroma cacao depositada en NCBI (XP_017978715.1) La identificación de este gen, es fundamental para evaluar a futuro los niveles de expresión y cuantificación en diferentes estados de desarrollo del fruto. Dicha cuantificación permitirá proponer herramientas de control para monilia y construir las bases para el mejoramiento genético del cacao Nacional.
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Parra Huertas, Sandra Liliana, María Marcela Pérez Casas, Mauricio Bernal Morales, Zulma Suárez Moreno, and Dolly Montoya Castaño. "Implementación y evaluación de dos métodos deconservación y generación de la base de datos del banco de cepas y genes del Instituto de Biotecnología de la Universidad Nacional de Colombia (IBUN)." Nova 4, no. 5 (June 15, 2006): 39. http://dx.doi.org/10.22490/24629448.346.
Full textAbstract:
76 cepas de las familias Enterobacteriaceae y Pseudomonadaceae fueron conservadas por el método semistock en papel filtro y 68 de las mismas por el método stock de criopreservación, en el banco de cepas y genes del Instituto de Biotecnología de la Universidad Nacional de Colombia (IBUN). La eficacia de los métodos de preservación se realizó mediante la evaluación de la viabilidad a las 24 horas de conservación y fue calculado el porcentaje de recuperación. En conclusión, la preservación en papel filtro y criopreservación son adecuados métodos semistock y stock, respectivamente; ya que el 73.7% de los microorganismos de la familia Enterobacteriaceae y el 82.3% de los microorganismos de la familia Pseudomonadaceae, presentaron un porcentaje de recuperación mayor al 50%. Por otra parte, se implementó una base de datos elaborada en el software Access ®, la cual se implementó con éxito en el IBUN y en la página Web de la Universidad Nacional de Colombia en la dirección electrónica <a href="http://www.ibun.unal.edu.co/instituto/cepario">www.ibun.unal.edu.co/instituto/cepario</a> , que está disponible al público en general.
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Urrea López, Rafael. "Mejoramiento genético acelerado de angiospermas perennes vía inducción floral por sobre-expresión del gen FT." Revista Mexicana de Ciencias Forestales 9, no. 47 (May 10, 2018): 007–27. http://dx.doi.org/10.29298/rmcf.v9i47.174.
Full textAbstract:
Los bosques y selvas enfrentan el reto de satisfacer la demanda por recursos de una población en crecimiento, así como la amenaza del rápido cambio climático que exacerba la magnitud y frecuencia de estreses bióticos y abióticos. Para ello, es urgente acelerar el mejoramiento genético de especies forestales. Sin embargo, sus largas etapas juveniles y asincronía floral retrasan peligrosamente este proceso. El presente ensayo explora los adelantos biotecnológicos en inducción floral y su potencial aplicación en especies forestales. Entre los genes identificados y caracterizados que participan en la ruta de señalización de la floración, especial atención se destina al gen FLOWERING LOCUS T, considerado un integrador de rutas de señalización altamente conservado entre las angiospermas, que, al sobre-expresarse por ingeniería genética, es capaz de inducir la floración de forma eficiente. Esta novedosa estrategia biotecnológica se ha utilizado, recientemente, para segregar genes de resistencia a enfermedades, en un menor tiempo, en germoplasma comercial de manzana y ciruela. Permite soslayar barreras naturales que por mucho tiempo han restringido a las especies forestales al mejoramiento por selección, principalmente. Entre sus ventajas está la de poder restringirla al proceso y no al producto, para acelerar las cruzas sexuales sin modificar genéticamente la progenie; se aleja así de la controversia alrededor de la liberación y consumo de organismos genéticamente modificados, y de los costos y trámites obligatorios para los OGM para monitoreo de posibles riesgos. Se proyecta como una tecnología que puede acelerar, significativamente, el mejoramiento de especies forestales.
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Cardona, Andrés Felipe, and Noemí Reguart. "The role of Notch, Hh and Wnt in lung cancer development." Revista Colombiana de Hematología y Oncología 1, no. 3 (September 1, 2012): 51–62. http://dx.doi.org/10.51643/22562915.313.
Full textAbstract:
Hedgehog (Hh), Notch y Wingless-Int-(Wnt) son vías de señalización altamente conservadas entre las especies, esenciales para el desarrollo embrionario y para definir el destino de las células progenitoras. Todas participan en el desarrollo del pulmón, así como en diversos procesos relacionados con la reparación del epitelio en la vía aérea. La activación aberrante de estas vías se observa en una gran variedad de neoplasias, lo que sugiere que contribuyen en la evolución y el mantenimiento de un fenotipo maligno. Nueva evidencia implica la transformación maligna del linaje neuroendocrino con la activación anormal de la vía Hedgehog, mientras que la señalización de Notch y Wnt puede ser importantes en otros tipos de células tumorales derivadas de las vías respiratorias. Teniendo en cuenta la importancia de las teorías sobre la formación de tumores partir de células pluripotenciales en lugar del modelo estocástico de la carcinogénesis, no sorprende el creciente interés en estos genes que están directamente implicados en el proceso de renovación de las células troncales. En la actualidad, se están diseñando múltiples compuestos centrados en la reorientación de estas vías en el cáncer de pulmón. Esta revisión se concentra en el papel del Hh, Wnt y Notch en la tumorigénesis del cáncer de pulmón.
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Araújo, Dakson Douglas, Raí Emanuel da Silva, Higinalice da Silva Pereira, Dacylla Sampaio Costa, Rodrigo Elísio de Sá, Antonio Rodrigues da Silva Neto, Nathanael dos Santos Alves, and Fernanda Machado Fonseca. "Avaliação da diversidade genética de amostras de Cryptococcus neoformans isoladas em diferentes regiões geográficas." Research, Society and Development 10, no. 9 (August 1, 2021): e51410918333. http://dx.doi.org/10.33448/rsd-v10i9.18333.
Full textAbstract:
Cryptococcus neoformans é o agente etiológico da criptococose, uma infecção fúngica oportunista e ocorre frequentemente em pacientes imunodeprimidos, com uma doença de base, afetando principalmente o sistema nervoso central e os pulmões. Análises de sequências genômicas de microrganismos por meio de filogenias têm demonstrado um amplo espectro de aplicações na pesquisa científica e na medicina. Na área da saúde, a utilização desta ferramenta auxilia no diagnóstico e consequentemente na elaboração de programas para melhor tratamento e controle das doenças. Ainda, a análise filogenética é importante para caracterizar novas espécies que possam vir a sofrer possíveis recombinações genéticas, que na grande maioria das vezes é responsável pela resistência de patógenos frente ao tratamento. Desta forma, o presente estudo teve como objetivo analisar a variabilidade genética dos genes 18S e 28S de C. neoformans em diferentes regiões geográficas. Foram selecionadas 191 sequências gênicas do gene 18S e 132 sequências gênicas do gene 28S para realização das análises filogenéticas e Split. Os resultados demonstraram que o gene 28S tem uma maior variabilidade genética se comparado ao gene 18S que se mostrou mais conservado. Essa variabilidade pode ser resultante de recombinações genéticas e migrações de cepas diferentes de uma região geográfica para outra, como por exemplo, através do turismo de indivíduos portadores do fungo. Além disso, a recombinação genética pode resultar futuramente em uma nova espécie com capacidade de causar doenças no homem.
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Jiménez-Uscanga, Rubén Darío, Margarita Carsolio-Trujano, Diana Andrea Herrera-Sánchez, María Isabel Castrejón-Vázquez, Fedra Irazoque-Palacios, María Eugenia Vargas-Camaño, Nora Ernestina Martínez-Aguilar, and María del Carmen Chima-Galán. "Lupus eritematoso sistémico y CD24v." Revista Alergia México 62, no. 4 (November 2, 2015): 265–70. http://dx.doi.org/10.29262/ram.v62i4.76.
Full textAbstract:
Antecedentes: el lupus eritematoso sistémico es un padecimiento autoinmunitario, de origen multifactorial, con predisposición genética; más de 100 genes participan en su etiopatogenia. El gen de CD24 puede mediar varias funciones, como su actividad coestimuladora en la expansión clonal de las células T. El polimorfismo de un simple nucleótido de CD24, que resulta en un reemplazo no conservador de alanina a valina (CD24v), que precede inmediatamente al sitio de anclaje GPI (posición ω-1), condiciona la pérdida de actividad de CD24. Se ha descrito que CD24v está asociado con esclerosis múltiple y lupus eritematoso sistémico en otras poblaciones. Objetivo: encontrar la existencia de CD24v en pacientes mexicanos con lupus eritematoso sistémico.Material y método: estudio de genotipificación de CD24v en el que se incluyeron 64 sujetos, 32 casos con lupus eritematoso sistémico: 28 mujeres y 4 hombres; y 32 controles: 9 mujeres y 23 hombres; todos eran pacientes con lupus eritematoso sistémico del Centro Médico Nacional 20 de Noviembre, del ISSSTE, atendidos en los servicios de Inmunología Clínica y Reumatología. Resultados: de los casos, 19 pacientes tenían genotipo homocigoto silvestre, 12 con genotipo heterocigotos y sólo un paciente mostró el polimorfismo en estado homocigoto. De los controles, 17 sujetos mostraron genotipos heterocigotos silvestres, 14 eran heterocigotos y sólo en uno se encontró que era homocigoto polimórfico. Se obtuvo una razón de momios de 0.84 y chi cuadrado de 0.17, por lo que no hubo diferencia estadísticamente significativa. Conclusiones: se demostró que no hay diferencia estadísticamente significativa entre pacientes con lupus eritematoso sistémico y controles respecto a la existencia de CD24v.
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Barboza Rojas, Karina, Alejandro Hernández Soto, and Claudia Zúñiga Vega. "Semejanzas entre el ajo (Allium sativum) costarricense y el ajo asiático según secuencias de ADN ribosomal." Revista Tecnología en Marcha 25, no. 2 (August 14, 2012): 32. http://dx.doi.org/10.18845/tm.v25i2.312.
Full textAbstract:
En Costa Rica, la producción de ajo (Allium sativum) es escasa y se limita principalmente a las regiones de Llano Grande de Cartago. Sin embargo, por el precio que tiene actualmente en el mercado, el ajo costarricense se vislumbra como una hortaliza que podría constituirse en un recurso valioso para los productores nacionales. Por lo anterior, en este artículo se presenta la caracterización mediante secuencias ribosomales de materiales de ajo provenientes Costa Rica y su comparación con ajo importado de China. El ADN se extrajo a partir de hojas de vitroplantas de ajo mantenidas en un congelador a -70°C, pulverizadas en un mortero. El ADN ribosomal se amplificó, purificó y secuenció. Se realizó el análisis bioinformático de las secuencias ribosomales. El BLASTn permitió determinar que los productos de PCR amplificados corresponden a la secuencia parcial de los genes 28S y 18S (sitios de unión de los cebadores) y a la secuencia completa de la región ITS-1, 5.8S e ITS-2. Se encontró que todas las secuencias alinearon en casi un 100% con la accesión EU626375.1 publicada en la base de datos del GeneBank, correspondiente al clon Allium sativum voucher BF-ALL-037. En general, las secuencias mostraron ser muy conservadas. Los puntajes obtenidos del alineamiento realizado con ClustalW reflejaron una identidad del 97 al 99% entre las secuencias.El presente estudio es el primer reporte de este tipo que se realiza sobre ajo costarricense y generó información básica e indispensable para continuar con los estudios moleculares de este cultivo.
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Arbizú Medina, Oscar, Kenia García Rosales, Benjamín Castillo Gómez, Arelys Mejía Álvares, and Abraham Salinas. "Carbapenemase en Pseudomonas aeruginosa en los hospitales de Managua Nicaragua." Revista Torreón Universitario 8, no. 21 (November 29, 2019): 16–24. http://dx.doi.org/10.5377/torreon.v8i21.8851.
Full textAbstract:
El presente estudio se planteó con el propósito de conocer la frecuencia de Pseudomonas aeruginosa metalo-β-lactamasas y patrón de resistencia en pacientes hospitalizados. Para ello se realizó un estudio transversal en el periodo julio 2016, enero del 2017. Las cepas se obtuvieron de los diferentes procesos infecciosos de los pacientes hospitalizados, dichas cepas fueron conservadas en caldo leche en los hospitales hasta su posterior análisis, las cepas fueron reactivadas en agar MacConkey, se realizó un tamizaje por el método de Kirby Bauer, se tomó el valor de corte, cuando Imipenem y Meropenem estuvo ≤21mm, se determinó el test de sinergia, utilizando los carbapenémicos y sus inhibidores, ácido etilendiaminotetraacético (10ᶙg) y ácido fenil borónico (10ᶙg), el perfil de resistencia se realizó mediante vitek2 Compact, también se determinó la concentración mínima inhibitoria para Imipenem 2-4 µg/mL y para Ertapenem 2 µg/mL, la genotipificación se determinó mediante la Reacción en cadena de la Polimerasa y el peso molecular se determinó por electroforesis.
El universo estuvo comprendido por 288 cepas de estas 22 fueron Pseudomonas aeruginosa, que corresponde al 7.6%, las cepas analizadas presentaron multirresistencia a los diversos antibióticos analizados, solo 7 (32%), presentó resistencia a Tigeciclina y ninguna de las cepas presento resistencia a Colistina, los genes con mayor frecuencia fue VIM, para un 68%, el tipo de muestra con mayor frecuencia, donde se aisló Pseudomonas, fue muestras traqueal, 7 (32%), seguido de secreción 5(23%), Hemocultivo 1(4%), punta de catéter 4(18%), y las salas con mayor frecuencia donde estaban presente estos microorganismo, fue UCI pediátrico con el 91%.
Como resultado del estudio se concluye que la prevalencia de Pseudomonas aeruginosa, productoras de carbapenemasas, en hospitales de Nicaragua, es baja, pero debe ser de preocupación para autoridades hospitalarias, debido que las cepas contienen diversos tipos de genes combinados como; VIM y GIM, VIM y SPM, que pueden desencadenar brotes epidémicos, la frecuencia con la que aparece nueva cepas resistente a los carbapenémicos es evidente, esta evidencia conlleva a la búsquedas de estrategias, para evitar la dispersión de cepas multiresistentes en diferentes unidades de salud en el momento del traslado de un paciente portador a otra unidad hospitalaria
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Tapiero, Aníbal L., Diego Aristizábal, and Morris Levy. "Exclusión de linajes como estrategia para la obtención de resistencia durable en el arroz a Pyricularia grisea Sacc. en Colombia." Corpoica Ciencia y Tecnología Agropecuaria 4, no. 1 (September 30, 2003): 15. http://dx.doi.org/10.21930/rcta.vol4_num1_art:9.
Full textAbstract:
<p>La durabilidad de la resistencia genética del arroz a <em>Pyricularia grisea </em>Sacc. había estado comprometida en Colombia, por una rápida adaptación aparente del patógeno a los genes dispuestos para contrarrestar su incidencia. Las variedades mejoradas se veían afectadas por la enfermedad en el curso de pocos años y, en ocasiones, a sólo meses de haber sido liberadas. La exclusión de linajes es una estrategia de mejoramiento que propone la identificación y posterior ‘piramidación’ de genes con habilidad para reconocer de manera complementaria las avirulencias de las familias genéticas (linajes) del patógeno. Poblaciones ecológicamente distintitas, caracterizadas molecularmente mediante la sonda MGR-586, exhiben una estructura clonal en la que cada aislamiento del linaje comparte históricamente el mismo espectro de virulencia. La resistencia obtenida con la piramidación de genes complementarios funciona como factor de exclusión hacia la totalidad de la virulencia en la población del patógeno en un ecosistema determinado. Así, en Colombia, los genes <em>Pi-1 (t) </em>y <em>Pi-2 (t) </em>son diferencial y complementariamente excluyentes de la virulencia de las poblaciones de <em>P. grisea</em>. Fueron obtenidas líneas con estos genes piramidados mediante el cruzamiento de dos líneas isogénicas; la presencia y condición homocigota de los genes de resistencia en las nuevas líneas fue establecida a través de marcadores moleculares. El comportamiento de las pirámides fue evaluado en el laboratorio, en cámaras de crecimiento con aislamientos representativos de los linajes colombianos y, en el campo, en una región dedicada tradicionalmente a la producción de arroz donde las epidemias de piricularia son frecuentes.Tanto en las inoculaciones artificiales, como en las áreas de cultivo, las pirámides conservaron la resistencia. La estructura de virulencia entre la población del patógeno en el campo permaneció estable durante tres años, aunque estacional y transitoriamente se identificaron algunos aislamientos virulentos a las pirámides en la estación experimental.</p><p> </p><p><strong><em>Abstract</em></strong></p><p><strong>Lineaje-exclusion, a strategy for breeding rice with durable resistance to </strong><strong><em>Pyricularia grisea </em></strong><strong>Sacc. in Colombia</strong></p><p>Rice blast has challenged plant breeders when they were searching for durable resistance in Colombia. Rapid resistance breakdowns were commonly observed in newly bred cultivars and they are attributed to frequent appearance of new pathotypes. Recent population studies of the rice blast pathosystem have shown that <em>Pyricularia grisea </em>in a given region, typically expresses a phylogenetic organization of distinct lineages (‘genetic families’ as defined by MGR-DNA fingerprinting). Each lineage exhibits a definable virulence spectrum, and the potential for developing new pathotypes appears to be constrained by lineage-specific avirulences. Lineageexclusion is a breeding strategy aimed to enlighten the choosing of genes to obtain more durable resistance in the field. Combining genes that complementary exclude fragments of virulence, will provide complete resistance to known lineages. The resistance of pyramids bearing the major resistance genes <em>Pi-1 (t) </em>and <em>Pi-2 (t) </em>was determined at three sites in a primary rice growing region in Colombia, from 1996 to 1998.The chosen R-genes are individually defeated by common lineages in Colombia, but combined, provide resistance to the complementary spectra of virulence. The pyramids were selected by screening the progeny of a cross of nearisogenic lines with the representative.The presence and homozygosity of both genes were confirmed through molecular markers. Neither single Colombian isolate, nor mixture of isolates infected the pyramids. The pyramids proved to be highly resistant in the field, and no major changes in lineage composition or virulence spectrum were observed. However, some moderately compatible isolates of lineage SRL-6 were transiently observed in the area of Santa Rosa. Resistance breakdown (vulnerability) may depend on within lineage rather than between lineage distributions of virulence.</p>
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Pinares, Rubén, Alan Cruz, María Silvana Daverio, Juan Pablo Gutiérrez, Federico Abel Ponce de León, María Wurzinger, Florencia Di Rocco, and Gustavo Augusto Gutiérrez. "Polimorfismos de nucleótido simple (PNSs) del gen MC1R en alpacas negras y marrones." Revista Peruana de Biología 28, no. 1 (February 24, 2021): e19742. http://dx.doi.org/10.15381/rpb.v28i1.19742.
Full textAbstract:
En alpacas los fenotipos del color de vellón tienen diferentes terminologías que induce a una confusión dentro del color marrón y sus tonalidades, el que requiere de una mejor descripción y cuantificación. En consecuencia los objetivos del estudio fueron cuantificar el color de fibra e identificar los PNSs informativos del gen MC1R (receptor 1 de melanocortina) en alpacas marrones y negras. Un fenotipo vicuña (n=14) y cuatro fenotipos de alpacas (n=79), marrón claro, marrón oscuro, marrón-negro y negro fueron evaluados por colorimetría. El vellón de vicuña mostró mayor luminosidad (47.74) e intensidad de color (24.33) respecto a las alpacas marrones. Los valores obtenidos de CIE L*a*b* (luminosidad e intensidad) sugieren valores bajos en alpacas eumelánicas y altos en alpacas feomelánicas. En vicuña y alpaca la secuencia codificante del gen MC1R tiene un solo exón de 954 pb, las vicuñas no mostraron la deleción (c.224_227del). Sin embargo, esta deleción se ha observado en los tres fenotipos de alpaca (marrón claro, marrón oscuro y negro), al igual que los cinco PNSs no sinónimos que ya fueron descritos en otras poblaciones, c.82A>G, c.259G>A, c.376G>A, c.587T>C, c.901C>T (p.T28A, p.M87V, p.G126S, p.F196S y p.R301C). Para las dos especies, se identificaron un total de ocho haplotipos definidos por los cinco PNSs. No se observaron asociaciones entre los fenotipos de color y los PNSs: c.259G>A, c.376G>A y c.901C>T (p>0.05), probablemente debido a la influencia de otros genes como el ASIP en la expresión del color. Nuestros resultados, así como los estudios previos evidenciaron regiones altamente conservadas en la secuencia codificante del gen MC1R.
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Reyes-Silva, Alberto I., Héctor G. Núñez-Palenius, Gustavo Hernández-Guzmán, Ángel G. Alpuche-Solís, Cristina Garcidueñas-Piña, and José F. Morales-Domínguez. "ADNc RELACIONADOS CON LA MADURACIÓN DEL FRUTO DE GUAYABA (Psidium guajava L.). CARACTERIZACIÓN Y ANÁLISIS DE EXPRESIÓN." Revista Fitotecnia Mexicana 36, no. 2 (June 13, 2013): 117. http://dx.doi.org/10.35196/rfm.2013.2.117.
Full textAbstract:
En este estudio se presentan los análisis bioinformáticos y de la expresión de cuatro clonas de ADNc que codifican para una poligalacturonasa (PG), para ácido 1 aminociclopropano-1-carboxílico oxidasa (ACCo), y para dos α-expansinas (α-Exp) en guayaba (Psidium guajava L.). Mediante RT-PCR se obtuvo un fragmento parcial de 301 pb (PgPG1) correspondiente a una PG que se expresa a partir de fruto maduro, uno de 320 pb (PgACO1) para una ACCo de fruto sobremaduro, y dos para α expansinas: uno de 466 pb (PgEXP2) de fruto sobremaduro y otro de 362 pb (PgEXP3) de pedúnculo. El análisis bioinformático de los ADNc mostró que codifican para proteínas putativas con una alta homología con proteínas relacionadas. La secuencia de aminoácidos de la proteína parcial PgPG1 contiene regiones características y conservadas de las PGs en plantas superiores y está relacionada con la maduración de frutos; PgACO1 mostró características presentes en todas las ACCo y está relacionada con la maduración; PgEXP2 y PgEXP3 contienen parte de los dos dominios presentes de las expansinas, y están agrupadas filogenéticamente con las α-expansinas. Los estudios de expresión mediante Dot Blot mostraron que el gen PgPG1 fue visible en todos los estadios de maduración del fruto, con mayor intensidad durante el estadio maduro; el gen PgACO1 fue visible en los cinco estadios de maduración del fruto y presentó su expresión más alta durante el estadio de transición, cuando comienza el cambio de color verde al amarillo (estos dos genes muestran comportamientos similares a los reportados en frutos climatéricos); en PgEXP2 la expresión génica se detectó en todos los tejidos, con un incremento a partir del estadio verde 2 al sobremaduro, similar al comportamiento reportado en frutos no climatéricos; para PgEXP3 la expresión fue visible en cuatro estadios de maduración del fruto y en pedúnculo, con mayor intensidad en el estadio maduro que en todos los demás.
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Villa, Alba Lucía, Alejandra María Sánchez, Raúl Iván Valbuena, and Roosevelt Escobar. "Evaluación preliminar de técnicas de crioconservación en una accesión de Solanum phureja." Corpoica Ciencia y Tecnología Agropecuaria 8, no. 2 (January 7, 2008): 50. http://dx.doi.org/10.21930/rcta.vol8_num2_art:94.
Full textAbstract:
<p>En el Centro de Investigación Tibaitatá de Corpoica se llevan a cabo ensayos para determinar los mejores métodos de crioconservación de los materiales que integran la Colección Central Colombiana de Papa; ésta se encuentra constituida por 1.098 accesiones de las cuales 151 corresponden a <em>Solanum phureja </em>(98 conservadas <em>in vitro </em>y 53 en campo), especie que se considera estratégica por poseer genes de resistencia a <em>Phytophtora infestans </em>y por ser un importante recurso alimenticio para la población colombiana. A tal fin se evaluaron las técnicas de encapsulación-deshidratación y encapsulación-vitrificación, reportadas en la actualidad para <em>Solanum </em>spp., implementando algunos ajustes y dedicando especial atención a las etapas previas a la congelación en cuanto la selección del material vegetal y los medios de propagación, la calidad del tejido, la encapsulación de los ápices, la concentración y el tiempo de exposición a sacarosa, la deshidratación en sílica gel y el efecto de la solución cargadora y de las soluciones PVS2 y PVS4. Fue posible establecer que la calidad de explante y el medio de recuperación determinaron el éxito del proceso de crioconservación. El medio de preacondicionamiento MS, suplementado con 0,18 μM BAP y 0,28 μM durante 3 a 5 días, permitió mejorar la calidad del tejido después del corte. Además, la suplementación del alginato con 0,004 mg·L-1 BAP y 0,04 mg·L-1 AG3, incidió positivamente en la respuesta de los ápices en las etapas previas al congelamiento. Se destaca que <em>S. phureja </em>es muy susceptible a condiciones de estrés físico y químico, razón por la cual la tasa de recuperación después del congelamiento fue de 10%. </p><p> </p><p><strong>Preliminary evaluation of cryoconservation techniques in an accession of <em>Solanum phureja </em></strong></p><p>The Tibaitatá Research Center of Corpoica is the repository of the main Colombian potato germplasm collection with 1098 accessions, 151 belonging to <em>Solanum phureja </em>(98 preserved <em>in vitro </em>and 53 in the field), a key species because it posses resistant genes against <em>Phytophtora infestans </em>and because it is an important food resource for the Colombian population. There crioconservation methods are evaluated to determine the best conservation practices. For this purpose, encapsulation-dehydration and encapsulationvitrification techniques were evaluated as reported for the <em>Solanum </em>species, adjusting methodologies and paying especial attention to tissue selection and quality, propagation media, apex encapsulation, concentration and time exposure to sucrose, dehydration in silica gel, and the effect of charger and PVS2 and PVS4 solutions, previous to freezing. Results indicated that explant quality and recuperation media determined the success in the crioconservation process. A preconditioning M&S medium supplemented with 0.18 μM of BAP and 0.28 μM of GA3 during 3 to 5 days allowed for tissue quality improvement after excision. Furthermore, alginate supplemented with 0.004 mg·L-1 of BAP and 0.04 mg·L-1 of GA3 positively enhanced the response of shoot tips during steps previous to freezing. Of importance in this study, <em>Solanum phureja </em>is highly susceptible to physical and chemical stress, and the reason why after freezing the recovery rate was only 10%. </p>
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Cantú, Talita, Claudia Borsari Trevizan, Crislaine Emidio Vieira, Rafaélla David Piffer, Giovanna Carneiro Luiz, and Silvia Graciele Hülse de Souza. "CARACTERIZAÇÃO IN SILICO DOS GENES ENVOLVIDOS NO METABOLISMO DO NITROGÊNIO EM MILHO (Zea mays)." Arquivos de Ciências Veterinárias e Zoologia da UNIPAR 19, no. 4 (April 4, 2017). http://dx.doi.org/10.25110/arqvet.v19i4.2016.6102.
Full textAbstract:
O N é o nutriente mineral requerido pelas plantas em maior quantidade e frequentemente limita o crescimento e produtividade. A partir de uma análise in silico foram identificados 26 genes envolvidos na assimilação do nitrogênio: quatro genes que codificam a enzima nitrato redutase (ZmNR), oito nitrato redutase de transporte (ZmNRT), uma nitrito redutase (ZmNRi), uma nitrito de transporte (ZmNRiT), seis glutamina sintetase (ZmGS), quatro glutamato sintase (ZmGOGAT) e duas glutamato desidrogenase (ZmGDH). A árvore filogenética foi construída onde foi possível observar a formação de cinco grupos distintos de acordo com as funções. A análise da estrutura dos genes mostrou que o número de íntrons variou de 0 a 32. A análise dos domínios conservados mostrou que a maioria dos genes identificados possuem o domínios específicos a função que desempenham na rota de assimilação do N em milho. Além disso, esses genes apresentaram padrões de expressão diferenciais em tecidos e órgãos. Os dados gerados neste trabalho forneceram subsídios para selecionar genes-candidatos para futuras análises funcionais a serem utilizados nos programas de melhoramento de milho.
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Gordillo, Milton, José Tobar, Venancio S. Arahana B., and María de Lourdes Torres. "Identificación de alelos S asociados con autoincompatibilidad en individuos de capulí (Prunus serótina subsp. capulí) mediante la amplificación del Intrón I del gen de la S-RNasa." ACI Avances en Ciencias e Ingenierías 7, no. 1 (May 22, 2015). http://dx.doi.org/10.18272/aci.v7i1.224.
Full textAbstract:
La autoincompatibilidad gametofítica es un mecanismo genético que ha evolucionado para prevenir la autofecundación en varias familias de plantas; su funcionamiento está regulado por el locus S y ha sido identificado en varias especies del género Prunus. El conocimiento de la composición alélica S de individuos y cultivares de especies frutales es esencial para el establecimiento de huertos productivos, mediante la definición de combinaciones entre cultivares compatibles. La identificación y clonación de genes de S-RNasas en especies del género Prunus ha permitido el desarrollo de técnicas moleculares para la caracterización de genotipos S en varias especies silvestres y especies poco estudiadas del género. El presente estudio evaluó 80 individuos de capulí (Prunus serotina subsp. capuli) colectados en 8 provincias de la Sierra ecuatoriana para determinar la diversidad alélica del locus S, utilizando primers degenerados diseñados a partir de regiones conservadas del gen de la S-RNasa de varias especies del género Prunus. Los productos de PCR fueron separados en geles de agarosa de acuerdo a su tamaño y los amplicones polimórficos fueron secuenciados. El análisis de las secuencias reportó un total de 11 alelos presentes en la muestra estudiada y además mostró la existencia de similitud con secuencias de distintas especies del género Prunus. Se podría especular que las secuencias encontradas en P serotina que presentan un alto porcentaje de identidad con las secuencias reportadas en otras especies del género fueron heredadas a partir de un ancestro común que ya las poseía. Por otro lado, las secuencias con un menor porcentaje de identidad habrían tenido orígenes independientes en las distintas especies. El uso de primers consenso degenerados permitió realizar un screening rápido y eficiente de los individuos de capulí analizados, mediante la asignación de genotipos putativos. Los resultados obtenidos en este estudio deben ser complementados con pruebas en el campo para confirmar el comportamiento fenotípico de los individuos de capulí estudiados.
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De Faria Siqueira, Flávia, Sávio Henrique De Cicco Sandes, Sílvia Helena Costa Campos, Cleusa Graça da Fonseca, Rogério Parentoni Martins, Maria Auxiliadora Drumond, and Maria Raquel Santos Carvalho. "Análise filogenética do minhocuçu Rhinodrilus alatus, Righi 1971 (glossoscolecidae: annelida) baseada em sequências dos genes de rDNA 5.8S, do espaço interno transcrito (its1) e da subunidade i da citocromo C oxidase mitocondrial." ACTA ZOOLÓGICA MEXICANA (N.S.) 26, no. 2 (August 10, 2010). http://dx.doi.org/10.21829/azm.2010.262878.
Full textAbstract:
O minhocuçu Rhinodrilus alatus Righi, 1971 é uma espécie endêmica do cerrado de Minas Gerais e tem sido explorada como isca para pesca por >70 anos. O objetivo do trabalho foi validar marcadores moleculares para estudos genético-populacionais, de filogenia e de filogeografia do minhocuçu. Os genes rRNA 5.8S, espaço interno transcrito (ITS1) e subunidade I da citocromo oxidase (COI) mitocondrial foram estudados. Foram amostrados indivíduos da espécie R. alatus (n = 53) em diferentes hábitats de Minas Gerais e da espécie R. motucu Righi, 1971 (n = 3), coletados em brejos de Goiás, no Brasil. A análise filogenética do gene do rRNA 5.8S mostrou que todas as seqüências de R. alatus, R. motucu e Eisenia fetida (Savigny, 1826) agruparam-se no mesmo clado (bootstrap = 98), sugerindo que, nestes organismos, o gene é conservado. Os clados formados a partir de seqüências de rRNA 5.8S de invertebrados disponíveis na base de dados são inconsistentes do ponto de vista evolutivo, sugerindo taxas evolutivas distintas entre diferentes espécies. Para a região do ITS1, foram obtidos 11 sítios polimórficos, gerando nove haplótipos. Os exemplares de R. motucu apresentaram o haplótipo mais freqüente dentre os R. alatus de Minas Gerais, não havendo evidências moleculares de que se tratem de espécies diferentes. Para o gene COI, de um total de 634 pb, obteve-se 185 sítios polimórficos, gerando árvores filogenéticas com topologia mais adequada, separando R. motucu de R. alatus.
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Barros, Maylson Alves Nogueira, Vitor Bruno Teslenco, Guilherme Nucci dos Reis, and Herbert Cavalcanti de Abreu. "Queratocisto odontogênico: relato de caso." ARCHIVES OF HEALTH INVESTIGATION 8, no. 11 (June 4, 2020). http://dx.doi.org/10.21270/archi.v8i11.4636.
Full textAbstract:
O queratocisto compreende um cisto odontogenico que surge dos restos da lâmina dentaria associado a alterações genéticas no gene PTCH1, aumento expressão PCNA, Ki-67, extinção de vários genes supressores tumorais. Apresenta comportamento agressivo, invasivo, altamente redicivante e com potencial de malignização. Este relato de caso tem como objeto apresentar tratamento conservador de um queratocisto odontogenico. Paciente sexo feminino, leucoderma, 19 anos, encaminhada ao ambulatório do serviço Cirurgia e Traumatologia Bucomaxilofacial, com queixa de dormência do lábio inferior, associado dor em região mandibular direita. Foi diagnosticada com queratocisto odontogenico, onde foi submetida enucleação com piezocirurgia associado a cauterização química sob anestesia geral. O tratamento proposto foi efetivo até atual momento, a neoformação óssea é evidenciada, ausência de sinais clínicos e radiográficos de recidiva. Porém é necessário um acompanhamento a longo prazo para constatação da ausência de recidiva.Descritores: Patologia Bucal; Cistos Ósseos; Cirurgiões Bucomaxilofaciais.ReferênciasNeville BW, Damm DD, Alen CM, Bouquot JE. Patologia oral e maxilofacial. Rio de Janeiro: Elsevier; 2009.Stoelinga PJW. Keratocystic odontogenic tumour (KCOT) has again been renamedodontogenic keratocyst (OKC). Int J Oral Maxillofac Surg. 2019;48(3):415-16.Philipsen H.P. Tumor odontogenico queratocistico. In: Barne L, Eveson JA, Reichart P, Sindrasky D. Genetica e Patologia dos Tumores de Cabeça e Pescoço. São Paulo: Santos; 2009.Marin S, Kirnbauer B, Rugani P, Mellacher A, Payer M, Jakse N. Theeffectiveness of decompression as initial treatment for jaw cysts: A 10-yearretrospective study. Med Oral Patol Oral Cir Bucal. 2019;24(1):e47-52.Ali IK, Karjodkar FR, Sansare K, Salve P, Dora A, Goyal S. Nevoid Basal CellCarcinoma Syndrome - Clinical and Radiological Findings of Three Cases. Cureus.2016;8(8):e727.Alchalabi NJ, Merza AM, Issa SA. Using Carnoy's Solution in Treatment ofKeratocystic Odontogenic Tumor. Ann Maxillofac Surg. 2017;7(1):51-6.Díaz-Belenguer Á, Sánchez-Torres A, Gay-Escoda C. Role of Carnoy’s solution in the treatment of keratocystic odontogenic tumor: a systematic review. Med Oral Patol Oral Cir Bucal. 2016;21(6):e689-95.Tonietto L, Borges HOI, Martins CAM, Silva DN, Sant'Ana Filho M. Enucleation and liquid nitrogen cryotherapy in the treatment of keratocystic odontogenic tumors: a case series. J Oral Maxillofac Surg. 2011;69(6):e112-17.Freitas R, Moraes PC. Cirurgia dos Cistos da região Bucomaxilofacial. In: Freitas Rd et al. Tratado de Cirurgia Bucomaxilofacial. São Paulo: Santos; 2006.Consolaro MFM-O, Sant' Ana E, Moura Neto G. Cirurgia piezelétrica ou piezocirurgia em Odontologia: o sonho de todo cirurgião. Rev Dent Press Ortodon Ortop Facial . 2007;12(6):17-20.Scarano A, Carinci F, Lorusso F, Festa F, Bevilacqua L, Santos de Oliveira P, Maglione M. Ultrasonic vs drill implant site preparation: post-operative pain measurement through VAS, swelling and crestal bone remodeling: a randomized clinical study. Materials (Basel). 2018;11(12):2516.Medawela RMSHB, Jayasuriya NSS, Ratnayake DRDL, Attygalla AM, Siriwardena BSMS. Squamous cell carcinoma arising from a keratocystic odontogenic tumor: a case report. J Med Case Rep. 2017;11(1):335.
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Full textAbstract:
Riassunto: Questo breve trattato di Ibn ʿArabī, redatto prima delle al-Futūḥāt al-Makkiyya, ha come tema principale l’Uomo, creato secondo la forma delle cose create e del Creatore. La peculiarità di questo testo è la presenza di alcune tabelle e figure, che vengono appunto richiamate nella prima parte del titolo, e l’indicazione grafica delle connessioni tra i vari elementi della figura mediante delle linee. Queste connessioni non sono però puramente concettuali, bensì sono reali, e vengono chiamate fini o minute realtà: non si tratta di una immagine statica di corrispondenze bensì di una rete dinamica di connessioni che canalizzano influenze, come è riportato nella seconda parte del titolo. Nel corso della trattazione vengono anche esposte i quattro gradi di esistenza, le classi dei non-esistenti, i tre gradi delle cose ed in particolare la “terza cosa”, che non è né esistente né non-esistente, le classi degli esistenti, le dieci categorie, le classi dei Nomi divini e la causa dell’inizio del Mondo e della sua genesi. La traduzione del trattato è stata effettuata sul più antico manoscritto disponibile, conservato a Manissa in Turchia, di cui è presentata anche l’edizione in arabo, ed è accompagnata dalla traduzione dei brani di altre opere di Ibn ʿArabī in cui essa è citata.Parole chiave: Uomo Universale. Esistenza e non-esistenza. Classi di cose esistenti e non esistenti. Cosmogonia. Nomi divini.Abstract: The main subject of this short treatise of Ibn ʿArabī, written before al-Futūḥāt al-Makkiyya, is the Man, created upon the form both of the creatures and of the Creator. The peculiarity of this work is the presence of tables and figures, quoted in the first part of the title, along with a graphic representation of the connections between the various elements of the figure through lines. These connections are not merely conceptual, they are real and are called fine or minute realities: this hasnothing to do with a picture of static correspondences, but with a dynamic network of connections which are channelling influences, as it is reported in the second part of the complete title.While dealing with the main subject Ibn ʿArabī also explains the four degrees of existence, the classes of non-existent things, the three degrees of things and particularly the “third thing” which is neitherexistent nor non-existent, the classes of existent things, the ten categories, the classes of Divine Names and the cause of the beginning of the World and of its genesis. The translation has been carried out on the oldest known manuscript, kept in the Manisa Library in Turkey and whose Arabic edition is here joined along with the translation of passages of other works of Ibn ʿArabī in which this treatise is mentioned.Keywords: Universal Man. Existence and non-existence. Classes of existing and non-existing things. Cosmogony. Divine Names.