Academic literature on the topic 'Génome fongique'

Pénicillium roqueforti est un champignon filamenteux ascomycète que l'on trouve fréquemment dans F environnement. Il peut être à l'origine de destruction de stocks de fourrage, de fruits ou de légumes. Mais il est essentiellement connu pour être un ferment d'affinage de certains fromages tels que les fromages à pâte persillée. La souche de P. Roqueforti étudiée ici présente un phénomène d'apparition spontanée d'un phénotype variant. Ce phénotype est caractérisé par une baisse de la conidiation et donc une perte de pigmentation. Lorsque cette altération se produit au cours de la production fromagère, elle est à l'origine d'un affinage de mauvaise qualité. La forme variante de la souche est caractérisée par une baisse de la sporulation et une perte de l'inhibition de contact. L'étude des modalités d'apparition de la forme variante ont révélé qu'elle était favorisée par la présence d'oxygène et la croissance en milieu liquide. On peut noter que ces conditions environnementales ne sont pas celles rencontrées par P. Roqueforti lors de la production fromagère. Il a été mis en évidence que l'événement à l'origine de cette forme variante est probablement d'ordre génétique, aucun événement de réversibilité vers la forme normale n'ayant été observé. L'étude du transcriptome de la souche a révélé des différences. De manière générale une baisse de la transcription de nombreux gènes dans la forme variante a été observée. La mise au point de différents outils de biologie moléculaire a montré qu'il est possible de déléter des gènes, nous pouvons maintenant créer des souches génétiquement modifiées afin de mieux caractériser la physiologie de P. Roqueforti en générant des mutants
Penicillium roqueforti is a filamentous ascomycete fungus that is found frequently in the environment. It can cause destruction of stocks of fodder, fruit or vegetable. But it is mainly known as a closed refining of certain cheeses such as blue cheese. The strain of P. Roqueforti studied here present a phenomenon of spontaneous emergence of a variant phenotype. This phenotype is characterized by a decrease in conidiation and therefore a loss of pigmentation. When this change occurs during cheese production, it is causing a fining of poor quality. The variant form of the strain is characterized by a decrease in sporulation and loss of contact inhibition. The study of conditions of occurrence of the variant form revealed it was favored by the presence of oxygen and growth in liquid medium. It may be noted that these environmental conditions are not those encountered by P. Roqueforti in cheese production. It was highlighted that the event at the origin of this variant form is probably genetic, no event of reversal to the normal form have been observed. The study of the transcriptome of the strain revealed differences. In general a decrease in the transcription of many genes in the variant form was observed. The development of various tools of molecular biology has shown that it is possible to delete genes, we can now create genetically modified strains to further characterize the physiology of P. Roqueforti generating mutants

La recombinaison méiotique assure la ségrégation des chromosomes durant la première division méiotique (MI) ainsi que la diversité génétique par remodelage du génome. Cependant une analyse de ségrégation a suggéré l'absence de crossing-over chez une levure jusqu'à présent peu étudiée, Saccharomycodes ludwigii (Yamakazi et al, 1976). Afin de mieux comprendre les mécanismes impliqués dans la ségrégation des chromosomes et l'impact de l'absence de recombinaison sur la structure du génome, nous avons étudié la recombinaison méiotique chez Sd. Ludwigii. Pour réaliser cette analyse, le séquençage du génome ainsi que le développement de protocoles de manipulations génétiques ont été requis afin d'établir Sd. Ludwigii en tant qu'organisme modèle. A partir d'une lignée hybride construite avec différentes isolats, plusieurs milliers de SNPs ont été utilisés comme marqueurs de ségrégation pendant la méiose, nous permettant ainsi de confirmer l'absence totale de recombinaison entre les chromosomes homologues. En parallèle, des analyses fonctionnelles ont été menées afin d'étudier la ségrégation de chromosomes pendant MI chez Sd. Ludwigii, vu que la plupart des gènes requis pour la recombinaison méiotique ont été identifiées. Etonnamment, en utilisant des méthodes cytologiques, des cassures double brin (CDBs) ont été observées et apparaissent indispensables pour assurer la ségrégation des chromosomes. L'initiation de ces CDBs ainsi que leur dégradation semblent se produire d'une façon similaire à S. Cerevisiae. Ainsi l'ensemble de nos données montre la présence de CDB, dont la localisation reste incertaine, et indiquent qu'elles jouent un rôle dans la ségrégation de chromosomes en Ml
Meiotic recombination ensures both faithful chromosome segregation during meiosis I and genetic diversity by genome reshuffling. However segregation analysis suggested the absence of crossover in the poorly studied yeast species Saccharomycodes ludwigii (Yamakazi et al, 1976). In order to understand the mechanisms involved in chromosome segregation and the impact of the lack of recombination on the genome structure, meiotic recombination has been investigated in Sd. Ludwigii. To conduct this study, the sequencing of the genome and the establishment of genomic engineering protocols were required to establish Sd. Ludwigii as a model organism. Using hybrid strains created from different isolates and following many thousand SNPs as segregation markers during meiosis, the absence of any detectable meiotic exchange between homologs was confirmed. In parallel, functional studies were performed to investigate the segregation of chromosomes during meiosis I in Sd ludwigii as most genes involved in meiosis were identified in the genome. Surprisingly, using cytological methods, meiotic double strand breaks (DSBs) were observed and turned out to be required for proper chromosome segregation. The initiation and processing of these DSBs appeared to be performed as in S. Cerevisiae. Taken together, our results support the existence of meiosis specific DSBs, at yet unclear localization and indicate their role in meiotic chromosome segregation

Le champignon Fusarium graminearum est l'un des principaux agents responsables de la fusariose des épis, une maladie nécrosante des céréales associée à une contamination des grains et des aliments par des mycotoxines. De récentes observations suggèrent une évolution de l’agressivité des populations de ce pathogène, questionnant l’efficacité et la durabilité des moyens de luttes actuels. Mieux anticiper cette évolution nécessite une meilleure caractérisation de la diversité phénotypique et génotypique existante entre souches. Six nouveaux génomes de F. graminearum ont été séquencés et ont permis l’identification et la caractérisation de 243 000 variations génétiques. La majorité de ces variants (77%) est concentrée dans des îlots de polymorphisme, représentant 32% du génome et enrichis en probables effecteurs liés à la pathogénicité de F. graminearum. La construction d’une population recombinante, et son génotypage avec 1 300 marqueurs moléculaires, ont permis le développement de la première carte génétique à haute-densité de l’espèce. La corrélation entre le taux de recombinaison et le polymorphisme a mis en évidence une organisation « à deux-vitesses » du génome de cette espèce. Finalement, l’intégration de ces données dans une approche de génétique quantitative a permis l’identification d’un locus polymorphe, affectant le gène FgVeA, et responsable de 90% de la variation d’agressivité et de la production de mycotoxine observée. Les différents résultats obtenus durant ces travaux font l’objet d’une discussion générale sur le potentiel adaptatif et d’évolution de ce pathogène
F. graminearum is one of the main causal agents of the fusarium head-blight (FHB), a cereal disease leading to head necrosis, in addition to grain and food/feed contamination by stable and toxic metabolites. Recent observations refer to an increase of pathogenicity, questioning efficiency and durability of current management practices. In order to anticipate this evolution, we must bring a deeper characterization of the currently existing diversity. Six new genomes of F. graminearum were sequenced, and 243,000 genetic variations have been identified and characterized. Seventy seven percent of the total number of the variants was located within 32% of the genome, delineating highly polymorphic islands. These islands are enriched with probable effectors linked to Fusarium’s pathogenicity. The construction and the genotyping on 1,300 molecular markers of a recombinant population have enabled the development of the first high-density genetic map of the species. The remarkable correlation between polymorphism and recombination rate highlighted the 'two-speed' genome organization of this pathogen. Finally, the integration of these data through a quantitative genetic approach allowed the discovery of one quantitative trait locus, likely to affect the gene FgVeA, and responsible for 90% of the observed variation of aggressiveness and mycotoxin production. These results are discussed in the light of F. graminearum’s adaptive potential and evolution

Face à la résistance accrue aux antibiotiques menaçant la santé publique, la prospection de nouvelles molécules biologiquement actives est pressante. Les champignons filamenteux se distinguent par leur capacité à synthétiser une large gamme de produits naturels, sous l’influence de clusters de gènes biosynthétiques (BGC) qui orchestrent la production de métabolites spécialisés. Toutefois, de nombreux produits issus de ces BGCs n’ont pas encore été caractérisés et leur chimiodiversité demeure sous-explorée en raison de l’incapacité à activer l’ensemble de leur potentiel en laboratoire. L’approche OSMAC (One Strain Many Compound) permet de solliciter ce potentiel en variant les conditions de culture. Cependant, cette méthode reste complexe et coûteuse en raison de son caractère aléatoire et du grand nombre d’expérimentations nécessaires. L’optimisation de ces processus nécessite l’intégration de stratégies plus rationnelles et efficaces. A l’aide d’approches systémiques liées à la biologie des systèmes, les réseaux métaboliques à l’échelle du génome (GSMN) offrent une modélisation détaillée des voies métaboliques, des enzymes impliquées et des gènes associés, fournissant un aperçu précis du métabolisme. Dans ce cadre, nous proposons une stratégie alternative: l’OSMAC in silico. En reconstruisant un GSMN actualisé pour Penicillium rubens, nous avons pu étudier les réponses de son métabolisme sous divers scénarios nutritionnels. Cette modélisation a permis d’évaluer l’influence de différentes sources de carbone et d’azote sur sa croissance et la production de métabolites spécialisés, ouvrant ainsi de nouvelles perspectives pour optimiser la production de produits naturels
Given the pressing issue of increasing antibiotic resistance threatening public health, new biologically active molecule research is urgent. Filamentous fungi are charcterised by their ability to synthesise a wide range of natural products, driven by biosynthetic gene clusters (BGCs) that orchestrate the production of specialised metabolites. However, many products derived from these BGCs remain uncharacterised, and their chemodiversity is underexplored due to the inability to activate their full potential in laboratory settings. The OSMAC (One Strain Many Compounds) approach seeks to harness this potential through culture condition variations. Nevertheless, this method remains complex and costly due to its randomness and vast number of experiments required. Therefore, optimising these processes needs the integration of more rational and efficient strategies. Using systems biology approaches, genome-scale metabolic networks (GSMNs) provide detailed modeling of metabolic pathways, involved enzymes, and associated genes, offering a precise overview of metabolism. In this context, we propose an alternative strategiy: in silico OSMAC. By reconstructing an updated GSMN for Penicillium rubens , we studied its metabolic responses under various nutritional scenarios. This modelling enabled us to assess the influence of different carbon and nitrogen sources on growth and the production of specialised metabolites, thereby opening new prospects for optimising the production of natural products

Les travaux réalisés dans le cadre de cette thèse ont eu pour objectif de i) concevoir et surproduire chez les champignons filamenteux de nouveaux outils enzymatiques performants pour la dégradation de la biomasse végétale et ii) d'étudier les relations synergiques existant au sein de ces enzymes hybrides bi- ou multi-modulaires. Dans une première partie, des enzymes libres impliquées dans la dégradation des hémicelluloses ont été surproduites chez Aspergillus niger (la féruloyl estérase B, FAEB et la xylanase B, XYNB). Les niveaux de production en fioles ont atteint respectivement, 100 mg. L-1 et 900 mg. L-1 pour la FAEB et XYNB. Ces protéines recombinantes ont été purifiées puis caractérisées. La seconde partie de l’étude a porté sur la conception et la production d’enzymes chimères dans lesquelles des modules d’intérêt ont été rapprochés physiquement en utilisant des fusions traductionnelles. Dans cette étude, la production d’une protéine chimère basée sur le modèle des enzymes cellulosomales bactériennes a été réalisée chez A. Niger. Ces travaux ont permis de produire la première enzyme fongique, FAEA, fusionnée à un module bactérien dockérine fonctionnel. Le travail sur les protéines chimères a été élargi en fusionnant deux enzymes complémentaires, la FAEA et XYNB afin d’améliorer l’efficacité enzymatique globale en favorisant l’action synergique entre les partenaires fusionnés. De plus, dans une seconde construction, un module de fixation à la cellulose (CBM) a été additionné à cette protéine bifonctionnelle pour étudier l’effet du ciblage vers le substrat. Ces enzymes bifonctionnelles ont été surproduites (~1,5 g. L-1), caractérisées et testées dans le cadre du relargage d’un composé à haute valeur ajoutée, l’acide férulique à partir de sous-produits agricoles et se sont montrées plus efficaces que les enzymes libres correspondantes. Par conséquent, le rapprochement physique entre une enzyme principale (XYNB) et une enzyme secondaire (FAEA) ainsi que le ciblage apporté par le module non-catalytique (CBM) a permis de favoriser la synergie enzymatique et représente une stratégie intéressante pour l’amélioration enzymatique. Une dernière étude basée sur une nouvelle enzyme hybride a été également réalisée, chez un nouvel hôte, dans le cadre de cette thèse. La construction de ces protéines chimères performantes présente de grands intérêts dans de nombreuses applications du domaine de la chimie verte, notamment pour la production de biocarburants à partir de la biomasse végétale
The objectives of this thesis were i) to design and overproduce new and efficient enzymatic tools in filamentous fungi involved in the plant-cell-wall degradation and ii) to study the synergistic relationships of the corresponding bi- or multi-modular hybrid enzymes. Firstly, free hemicellulolytic enzymes were overproduced in Aspergillus niger (feruloyl esterase B, FAEB and xylanase B, XYNB). Production yields reached 100 mg. L-1 et 900 mg. L-1 for FAEB and XYNB, respectively. Recombinant proteins were purified and fully characterized. Secondly, this study concerned the design and production of chimeric enzymes, in which modules of interest were fused together to enable physical proximity between them. In this study, a chimeric enzyme, based on the model of bacterial cellulosome, was produced in A. Niger. The first fungal enzyme, FAEA, fused to a functional bacterial dockerin module, was successfully produced. Our work was extended to others hybrid proteins by fusing two complementary enzymes, FAEA and XYNB in order to improve the enzymatic efficiency, by increasing synergistic effect of the fused enzymes. Moreover, in a second construction, a Carbohydrate-Binding Module (CBM) was added to the bifunctional enzyme to study the effect of the substrate targeting. These bifunctional enzymes were overproduced (~1,5 g. L-1), characterized, and tested for the ferulic-acid release from agricultural by-products and their action was improved as compared to that of the corresponding free enzymes. Therefore, physical proximity between these primary (XYNB) and secondary (FAEA) enzymes and the substrate targeting by the CBM promote the enzymatic synergy. Finally, a new hybrid enzyme was designed in a new host in this work. The design of these improved chimeric enzymes is of great interest for future applications in industrial sectors, such as the biofuel production from vegetal biomass

Les espèces du complexe Scedosporium apiospermum sont des agents pathogènes émergents qui se situent au deuxième rang parmi les champignons filamenteux rencontrés au cours de la mucoviscidose. Ils sont omniprésents et particulièrement rencontrés dans les zones polluées. En dépit de leur importance clinique, nos connaissances sur leur biologie moléculaire et leur physiologie restent limitées. Chez les champignons, la paroi constitue un bouclier protecteur face à des conditions environnementales défavorables, et joue un rôle essentiel dans la pathogénicité. Ici, nous avons étudié les changements dynamiques de la paroi des conidies de S. boydii, l’une des deux espèces majeures de ce complexe avec S. apiospermum, avec pour objectif d'identifier des facteurs de virulence potentiels. En utilisant une large variété de techniques, allant de la microscopie électronique à balayage ou à transmission à l’analyse protéomique des protéines à ancre glycosylphosphatidylinositol (GPI) en passant par la microélectrophorèse et la partition de phase, la cytométrie en flux, la microscopie de force atomique, la résonance paramagnétique électronique, ou encore des techniques moléculaires, nous avons mis en évidence diverses modifications qui se produisent dans la paroi pendant la maturation et la germination des conidies de S. boydii et nous avons identifié la DHN-mélanine ainsi qu'un nombre important de protéines à ancre GPI. Enfin, nous avons fourni la première séquence complète du génome de S. apiospermum qui appuierait les différents domaines de la recherche sur ces champignons que ce soit pour l’étude des mécanismes pathogènes ou pour des applications biotechnologiques
Species of the Scedosporium apiospermum complex are emerging human pathogens which rank the second, after Aspergillus fumigatus, among the filamentous fungi colonizing the airways of patients with cystic fibrosis. These fungi are ubiquitous in nature and particularly encountered in polluted areas. Despite their clinical relevance, our knowledge about their molecular biology and physiology remains rather limited. In fungi, the cell wall forms a protective shield against adverse environmental conditions, and therefore plays a key role in pathogenesis, which makes it an interesting target for antifungal drug development. Here, in an attempt to identify potential virulence factors, we investigated the dynamic changes of the cell wall of conidia in S. boydii, one of the main pathogenic species within this species complex with Scedosporium apiospermum. Using various techniques, ranging from scanning and transmission electron microscopy to proteomic analysis of glycosylphosphatidylinositol (GPI)- anchored proteins, through two-phase partitioning and microelectrophoresis, atomic force microscopy and chemical force spectroscopy, flow 5 cytometry, electron paramagnetic resonance and molecular techniques, we highlighted various modifications occurring in the cell wall during maturation and germination of S. boydii and we identified DHN-melanin as well as a substantial number of GPI-anchored proteins in the cell wall. Finally, we provided the first publicly available genome sequence of S. apiospermum that would support various research fields on these fungi whether for understanding their pathogenic mechanisms or for various biotechnological applications

Les champignons sont présents dans la plupart des environnements naturels. Beaucoup jouent un rôle dans les activités humaines, comme les quelques-uns qui vivent dans le fromage, un substrat unique où ils doivent coexister avec les bactéries. Dans un souci de sécurité alimentaire, les producteurs fromagers doivent assurer l’innocuité des microorganismes qu’ils utilisent, et l’identification correcte des espèces est la base de cette procédure. Cette étude s’est focalisée sur les plus importants Ascomycetes filamenteux utilisés dans la production fromagère, jusqu’alors peu étudiés, et a permis la délimitation exacte des espèces. Une étude phylogénétique a montré leur diversité puisqu’ils appartiennent à deux classes différentes et a permis d’identifier leurs plus proches parents sauvages afin de discuter de leur adaptation au milieu fromager. Le fromage n’est pas un habitat naturel pour les champignons, et ceux du fromage ont dû acquérir des propriétés de fermentation et d’autres traits particuliers qui leur ont permis de se spécialiser à cette niche. Les génomes de Penicillium camemberti et P. Roqueforti ont été séquencés pendant cette étude, et ont permis, avec la souche productrice de pénicilline P. Rubens, une approche comparative préliminaire pour rechercher des mécanismes évolutifs liés à l’adaptation. Cette étude a mis en évidence le transfert horizontal de larges régions génomiques portant au moins deux gènes (zymocine et PAF) pouvant conférer des avantages évolutifs aux champignons dans l’environnement fromager. La capacité à la reproduction sexuée de P. Roqueforti a aussi été examinée comme un potentiel de générer de la diversité parmi les inoculums, aujourd’hui obtenus par reproduction clonale. Des preuves indirectes ont ainsi été trouvées : la présence des deux types sexuels dans une large collection d’isolats fromagers, la détection de sélection purifiante sur les gènes MAT, l’identification d’un set de gènes nécessaires à la méiose et de signatures de RIP. Cette recherche a permis de fournir des outils précis d’identification des champignons du fromage. Elle a aussi apporté de nouvelles données sur les capacités à la reproduction sexuée chez P. Roqueforti et elle a permis d’initier une comparaison génomique des champignons du fromage pour trouver des mécanismes adaptatifs
Fungi are very diverse as they are found in almost all natural environments. Many have a significant importance with regards to human activities, like a very few of them able to grow on cheese, a unique substrate where they have to compete against bacteria. In the context of food safety, cheese producers have to ensure that microorganisms they use are innocuous, and correct species identification is the base of this proceeding. This study focused on the most important filamentous Ascomycetes used in cheese production, hitherto poorly studied. The phylogenetic study showed their diversity as they belong to two different classes, and allowed the identification of their wild closest relatives to investigate their adaptation to the cheese environment. From an evolutionary point of view, cheese is not a natural habitat for fungi, and cheese fungi may have acquired key fermentative activities and other particular traits to specialize to this particular niche. The genomes of Penicillium camemberti and P. Roqueforti have been sequenced during this study, and enabled, along with the penicillin producer P. Rubens, a preliminary comparative genomic approach to search for evolutionary mechanisms of adaptation. It highlighted the horizontal transfer of large genomic regions in cheese fungi, carrying at least two genes (zymocin and PAF) that may confer adaptive advantages for fungi in the cheese environment. The genome of P. Roqueforti was also used to examine the capability of sexual reproduction as a potential to generate diversity within inoculums currently produced by clonal-subcultures. Indirect evidence of a sexual cycle in P. Roqueforti was shown: the presence of both MAT genes in a large collection of cheese isolates, the detection of purifying selection acting on MAT genes, the identification of a set of genes involved in meiosis and of RIP-like footprints. This research provided accurate tools for the identification of cheese fungi. It also brought new insights in the reproduction capabilities of P. Roqueforti, and it initiated the genomic comparison of cheese domesticated fungi to find adaptive mechanisms

L’objectif de cette thèse est de développer une nouvelle souche de champignon filamenteux pour la production d’acide lactique. Pour répondre à cet objectif, nous avons tout d’abord d’exploré la biodiversité fongique à la recherche de champignons filamenteux capables de produire de l’acide lactique ou présentant de bonnes prédispositions pour la production d’acides organiques sans neutralisation du pH. Grâce à ce criblage, une souche sauvage d’Aspergillus brasiliensis a été sélectionnée et utilisée pour construire, grâce à l’ingénieure métabolique, les premières souches d’Aspergillus capables de produire de l’acide lactique à pH acide. Ces souches ont ensuite été caractérisées et les conditions de culture en fioles et fermenteurs volumes ont été étudiées. Cette étude des conditions de culture donne des résultats prometteurs et dévoile de nombreuses voies possibles pour continuer à améliorer la production d’acide lactique par ces organismes
The objective of this thesis is to develop a new filamentous fungal strain for the production of lactic acid. To meet this goal, we first explored the fungal biodiversity in order to find filamentous fungi able to produce lactic acid or having good predispositions for the production of organic acids without pH neutralization. Through this screening, a wild type strain of Aspergillus brasiliensis was selected and used to construct, using the metabolic engineer, new strains capable of producing lactic acid at an acidic pH. These strains were then characterized and culture conditions in flasks and bioreactors were studied. The study of culture conditions shows promising results and reveals many possible ways to further improve the production of lactic acid by these organisms

La 6-pentyl-alpha-pyrone (6PAP) est un métabolite fongique spécialisé, isolé pour la première fois dans les années 1970 à partir de cultures du champignon Trichoderma viride. Outre ses nombreuses propriétés biologiques (agent antifongique, hormone de croissance et inducteur de mécanismes de défense pour les plantes, etc.), ce composé possède des propriétés organoleptiques proches de celles de la massoia lactone et de la delta-décalactone, dont il est par ailleurs un précurseur potentiel. Son agréable odeur de noix de coco nuancée de noisette et de fève tonka en fait un arôme d’intérêt, utilisé aujourd’hui comme additif dans certaines boissons et aliments. A ce jour, la 6PAP n’est cependant synthétisée à l’échelle industrielle que par voie chimique. Sa production par voie biotechnologique et biosourcée est inexistante en dépit d’importants efforts de recherche encouragés par une demande croissante des consommateurs pour les molécules d’origine naturelle. Dans ce travail de recherche, nous avons donc développé un procédé de fermentation à partir de matières premières végétales peu coûteuses, en conditions douces, avec une souche fongique du genre Trichoderma n’ayant subi aucune modification génétique. En nous appuyant dans un premier temps sur des études par plans d’expériences, nous avons finalement obtenu des concentrations de 6PAP allant jusqu'à 1 g/L, aussi bien en fioles qu’en fermenteur, par un procédé de fermentation biphasique liquide-liquide
6-pentyl-alpha-pyrone (6PAP) is a specialized fungal metabolite first isolated in the 1970s from cultures of the fungus Trichoderma viride. In addition to its numerous biological properties (antifungal agent, phytohormone-like effect, inducer of plant defense mechanisms, etc.), it has organoleptic properties similar to those of massoia lactone and delta-decalactone, of which it is also a potential precursor. Its pleasant smell and taste of coconut, with a hint of nutty and tonka bean, makes it an aroma of interest on its own, already used as an additive in some food products and beverages. To date, 6PAP has been produced on industrial scale only by chemical synthesis. Its biotechnological production from bio-based materials is non-existent despite the extensive research efforts encouraged by a growing consumer demand for molecules of natural origin. In this work, we have therefore developed a fermentation process from inexpensive agricultural raw materials, under mild conditions, with a fungal strain of Trichoderma that has not undergone any genetic modification. Based initially on design of experiments (DOE) studies, we finally obtained up to 1 g/L of 6PAP, both in flask and in bioreactors, by a biphasic liquid-liquid fermentation process

Dans ce chapitre, nous donnons un aperçu de la diversité évolutive des organisations centromériques, Nous nous concentrons spécifiquement sur l'organisation centromérique qui reste peu étudiée, y compris la diversité des centromères fongiques ainsi que l'évolution des holocentromères chez plusieurs animaux et plantes.