Academic literature on the topic 'Glycan code'

Áreas produtoras de soja (Glycine max L. Merr.) no Paraná têm apresentado plantas com sintomas de encarquilhamento foliar, semelhante a toxicidade de Mn, com redução de porte, geralmente observados em reboleiras. O objetivo desse trabalho foi analisar propriedades químicas e microbiológicas do solo relacionadas à ciclagem de Mn e investigar se a alta disponibilidade desse nutriente pode ter causado o encarquilhamento foliar em áreas comerciais de soja. Foram coletadas amostras de solo e planta em áreas de reboleiras com sintomas e áreas sadias adjacentes de nove propriedades na safra 2012/13 e três na safra 2013/14. Na parte aérea das plantas foram determinados: a massa seca e os teores foliares de P, K, Ca, Mg, S, B, Cu, Fe, Mn e Zn. As amostras de solo foram coletadas nas profundidades de 0-5, 5-10, 10-20 e 20-40 cm, secas ao ar e analisadas quanto ao pH (CaCl2), C orgânico, P disponível, Ca, Mg, K, Al, H+Al, soma de bases, CTC, saturação por bases, teores de B, Cu, Fe, Mn e Zn. As análises microbiológicas foram realizadas nas amostras de solo de 0-5, 5-10 cm e na rizosfera. Foram avaliados o número de unidades formadoras de colônias (UFC) de bactérias oxidantes e redutoras de Mn, sendo que os isolados representativos tiveram a região rDNA 16S sequenciada para identificação. O C da biomassa microbiana (CBM), a respiração basal e colonização micorrízica também foram avaliados. As plantas com encarquilhamento foliar apresentaram redução na massa da parte aérea e na produtividade de grãos. Em adição, apresentaram teores foliares mais elevados de P, Ca, Mg, Mn e B e menores teores de K. No solo das áreas sem sintomas, a SB, a CTC, os teores de Ca, Mg e Fe (0-5 cm) foram maiores, enquanto o os teores de P e Zn (10-20 cm) foram mais baixos. Na safra 2012/13, o CBM foi significativamente maior nas áreas sem sintoma de encarquilhamento foliar. O número de UFC de bactérias oxidantes de Mn foi maior no solo da área sem sintomas (0-5 cm, rizosfera) enquanto que o número de bactérias redutoras foi maior na área com sintomas. A maior população de bactérias redutoras de Mn da área com sintomas coincidiu com maiores teores de Mn na planta, ligeiramente superiores aos encontrados nas plantas sem sintomas. Entre as bactérias redutoras de Mn, predominou o gênero Streptomyces enquanto diversos gêneros representaram as bactérias oxidantes de Mn: Arthrobacter, Streptomyces, Bacillus, Novosphingobium, Agrobacterium, Variovorax, Acinetobacter e Pseudomonas. O teor de P diferiu entre as áreas tanto no solo como na planta, enquanto os teores de Ca e Mg diferiram apenas no solo, sugerindo que o sintomas podem não estar relacionados a um nuntriente em particular, mas pode ser o resultado da interação de vários fatores. Apesar de os teores de Mn na planta e no solo, tanto nas áreas com sintomas como nas áreas sem sintomas serem considerados altos, não foram apontados como causa direta do problema. É provável haver uma interação multifatores na manifestação dos sintomas que precisa ser mais bem estudada.<br>Soybean (Glycine max L. Merr.) producing fields in Paraná State have presented plants with leaf crinkle, similar to symptoms of Mn toxicity, resulting in growth reduction, generally observed in spots. The aim of this work was to analyze soil chemical and microbiological properties related with Mn cycling and investigate if high amounts of this nutrient have caused the "crinkle leaf" in commercial areas of soybean. Soil and plant samples were collected in spots with symptoms and adjacent healthy areas of nine fields in 2012/13 season and three in 2013/14 season. In the shoots, the dry weight and foliar concentrations of P, K, Ca, Mg, S, B, Cu, Fe, Mn and Zn were determined. Soil samples were collected at depths of 0-5, 5-10, 10-20 and 20-40 cm, air-dried and analyzed for pH (CaCl2), organic C, available P, Ca, Mg, K, Al, H + Al, Sum of bases, CEC, base saturation, B, Cu, Fe, Mn and Zn concentrations. Microbiological analyzes were carried out in soil samples from 0-5, 5-10 cm and rhizosphere. The number of colony forming units (CFU) of oxidizing and Mn reducing bacteria was evaluated, and the most representative isolates had the 16S rDNA region sequenced for identification. Microbial biomass C (MBC), basal respiration and mycorrhizal colonization were also assessed. Plants with foliar crinkling presented lower shoot dry weight and grain yield. In addition, showed higher foliar concentrations of P, Ca, Mg, Mn and B, and lower concentrations of K. The values of SB, CEC, Ca, Mg and Fe concentrations (0-5 cm) were higher in the soil of plants without symptoms, whereas P and Zn (10-20 cm) were lower. In the 2012/13 season, MBC was significantly higher in the soils of plants without symptoms. The number of CFUs of Mn-oxidizing bacteria was higher in the soil of the symptomless area (0-5 cm, rhizosphere), whereas the number of Mn-reducing bacteria was higher in the area with plants showing symptoms. The largest population of Mn-reducing bacteria in the area with symptoms coincided with slightly higher concentrations of Mn in plant leaves, compared with plants without symptoms. The genus Streptomyces predominated among the Mn-reducing bacteria, while several genera represented the Mn-oxidizing bacteria: Arthrobacter, Streptomyces, Bacillus, Novosphingobium, Agrobacterium, Variovorax, Acinetobacter and Pseudomonas. The P concentrations differed between both soil and plants, while Ca and Mg differed only in the soil, suggesting that the symptom may not be related to a particular nutrient, but may depend on the interaction between several factors. Despite the concentrations of Mn in plants and in the soil are considered high, they could not be considered the sole cause of the problem. A multifactorial interaction probably occurs and must be more deeply studied.

A adição de Viscozyme L na suspensão de soja pode resultar em um tofu com características diferentes do tradicional. Devido à ação da enzima, material da parede celular (polissacarídeos) poderá ser parcialmente hidrolisado liberando mono e oligossacarídeos, os quais serão transferidos para o tofu, provavelmente modificando sua composição e textura. O objetivo deste trabalho foi estudar os efeitos, em tofu tipo silken, da hidrólise de carboidratos de soja realizada pelo complexo enzimático Viscozyme L. Na primeira etapa, foi realizada a otimização da temperatura de ação de Viscozyme L e foi verificado que, a 55 oC, os teores dos açúcares redutores aumentaram em até 4 vezes, comparado ao controle. Estaquiose foi o oligossacarídeo predominante no tofu tratado (4,58 g/100 g) e o conteúdo de rafinose foi de 1,22 e 0,75 g/100 g nos tofus tratado e controle, respectivamente. O nível de glicose, aproximadamente, duplicou no tofu tratado (1,66 g/100 g) em relação ao controle (0,74 g/100 g). O tofu tratado apresentou maior quantidade de compostos fenólicos que o controle (173 e 161 mg equivalentes de ácido gálico/100 g de tofu liofilizado, respectivamente) e maior atividade antioxidante pelo teste ABTS e DPPH. O conteúdo total de isoflavonas (92 mMol/100 g tofu) não apresentou diferença entre as amostras, mas o tofu tratado apresentou maior concentração de malonil glicosídeos e o controle de ?-glicosídeos. Os tofus apresentaram diferenças sensoriais como maior odor de soja e menor uniformidade da superfície (tofu tratado), mas não houve preferência de uma amostra em relação à outra. O tofu tratado teve maior quantidade de glicose e frutose que o controle, porém não foram verificadas diferenças nos gostos (ácido e amargo) das amostras. Isto pode ter ocorrido pelo fato dos tofus terem sido coagulados com glucona-delta-lactona, um coagulante ácido que pode ter mascarado o sabor doce do tofu tratado com enzima. As condições ideais de temperatura e concentração de Viscozyme L para extração de proteína foram 60 oC e 30 FBG (Fungal Beta Glucanase) por 30 minutos. O pré-tratamento enzimático para extração de proteínas resultou em rendimento de 56,27%, superior ao método alcalino tradicional, 33,04%; o efeito da temperatura de pré-tratamento foi a variável mais importante. Para hidrólise de carboidratos, as condições ótima de temperatura e concentração de enzima foram 45 oC e 45 FBG/10 g de farinha desengordurada de soja, respectivamente. Ambas amostras de tofu apresentaram aglomerados de microestruturas globulares de proteínas e estrutura tridimensional fibrosa, típica de tofus.<br>The addition of Viscozyme L in soy suspension may result in a tofu with characteristics differents from traditional. Due to the presence of the enzyme, cell wall material (polysaccharides) may be partially hydrolyzed to release mono-and oligosaccharides, which will be transferred to the tofu and probably influencing composition and texture. The aim of this work was to study the effects, in silken tofu, of the hydrolysis of soy carbohydrates by the enzyme complex of Viscozyme L. First, this study investigated the enzymatic pre-treatment of soy slurry to optimize conditions of the enzyme action. The optimum temperature of Viscozyme L was 55 oC and it was found that the levels of reducing sugars increased up to 4 times compared to the control. Stachyose was the predominant oligosaccharide in treated tofu 4.58 g/100 g, and of raffinose was 1.22 and 0.75 g/100 g in treated tofu and control, respectively. The glucose level was approximately doubled in the treated tofu (1.66 g/100 g) compared to control (0.74 g/100 g). The treated tofu had a higher amount of phenolic compounds compared to the control, 173 and 161 mg of gallic acid equivalent/100 g of dried tofu, and higher antioxidant activity by ABTS and DPPH test. The total content of isoflavonas (92 mMol/100 g tofu) did not differ between the samples but the treated tofu had a higher concentration of malonyl glycosides and the control of ?-glycosides. The tofus showed sensory differences as the largest soybean odor and less uniform surface (treated tofu), but there was no preference for one sample over the other. The treated tofu had higher amount of glucose and fructose than the control, but there was no observed differences in the taste (acid and bitter) of the samples. This may have occurred because the tofus were coagulated with glucona-delta-lactone, an acid coagulant that may have masked the sweet taste of treated tofu. The optimum conditions of temperature and concentration of Viscozyme L for protein extraction were 60 ° C and 30 FBG (Fungal Beta glucanase), during 30 minutes. Enzimatic pre-treatment for proteins extraction resulted in a yield of 56.27%, higher than the traditional alkaline method, 33.04%; the effect of the pre-treatment temperature was the most important variable. For carbohydrate hydrolysis the optimal conditions of temperature and enzyme concentration were 45° C and 45 g of FBG/10 g defatted soy flour. All tofu samples had a globular microstructure of protein which was integrated into clumps and showed a fibrous three-dimensional network structure, typical of tofu.

O tratamento de sementes tem sido evidenciado com boas perspectivas como medida complementar no controle de fitonematoides. Portanto, o objetivo desse trabalho foi verificar o efeito de produtos utilizados no tratamento de sementes de soja sobre o nematoide de galhas Meloidogyne javanica. Foram realizados ensaios in vitro e em casa de vegetação compostos pela combinação dos tratamentos: Testemunhas (inoculada e não inoculada com M. javanica para o ensaio em casa de vegetação); Abamectina; Tiametoxam; Fludioxonil + Metalaxil-M + Tiabendazol; Abamectina + Tiametoxam; Abamectina + Fludioxonil + Metalaxil-M + Tiabendazol; Tiametoxam + Fludioxonil + Metalaxil-M + Tiabendazol; e Abamectina + Tiametoxam + Fludioxonil + Metalaxil-M + Tiabendazol. O ensaio in vitro foi realizado com o objetivo de verificar o efeito de produtos sobre a eclosão, mobilidade e mortalidade dos juvenis de segundo estádio (J2) do nematoide. Para o ensaio em casa de vegetação, as sementes de soja cv. BRS 133 foram previamente tratadas conforme descrito anteriormente. A semeadura foi realizada em vasos com capacidade para 3 litros de substrato, com uma planta por vaso. Aos 15 dias da inoculação, avaliou-se o efeito dos tratamentos sobre o desenvolvimento das plantas e a penetração dos J2 pelo método de coloração com fucsina ácida. Após 30 e 60 dias, foram tomadas novamente medidas de desenvolvimento das plantas, bem como o número de galhas e massas de ovos, população final, fator de reprodução e número de nematoides por grama de raiz. Os tratamentos contendo Abamectina foram os mais eficientes em reduzir a taxa de eclosão dos J2, bem como os que apresentaram maiores taxas de imobilização e mortalidade sobre os juvenis, diferindo da testemunha. Aos 15 dias da inoculação, observou-se melhor desenvolvimento radicular, comprimento de parte aérea e massa fresca de parte aérea em plantas provenientes de sementes tratadas. Para o número de nematoides/g de raiz observou-se significativa diferença entre plantas provenientes de sementes tratadas e a testemunha inoculada, destacando-se os tratamentos contendo Abamectina, isolada, ou em combinação com os demais produtos. Após 30 dias, confirmou-se a eficiência do tratamento de sementes em reduzir a população do nematoide nos tratamentos 3 (Abamectina) e 9 (Abamectina + Tiametoxam + Fludioxonil + Metalaxil-M + Tiabendazol), apresentando menores valores para as variáveis população final, fator de reprodução e nematoides/g de raiz. No entanto, aos 60 dias, não observou-se eficiência dos tratamentos em manter baixa a população do nematoide. Portanto, a partir dos resultados obtidos confirmou-se que o tratamento de sementes é uma importante medida, auxiliar, a ser utilizada no manejo integrado dos fitonematoides.<br>The seed treatment have been demonstrated good prospects as a complementary measure to control nematodes. Therefore, this study aimed to investigate the effect of products used in the seeds treatment of soybean on root-knot nematode Meloidogyne javanica. To accomplish this, experiments were conducted in vitro and on greenhouse consisted of combinations of treatments: Control (inoculated and non-inoculated, for the test in a greenhouse with nematode and without seed treatment); Abamectin; Tiametoxam; Fludioxonil + Metalaxyl-M + Tiabendazole; Abamectin + Tiametoxam; Abamectin + Fludioxonil + Metalaxyl-M + Tiabendazole; Tiametoxam + Fludioxonil + Metalaxyl -M + Tiabendazole, and Abamectin + Tiametoxam + Fludioxonil + Metalaxyl-M + Tiabendazole. The in vitro assay was performed in order to verify the effect of chemicals on hatching, mobility and mortality of nematode second stage juveniles ( J2 ) . For the experiment in greenhouse, seeds were pretreated by the method of plastic bag with the following combination of treatment. The sowing was performed in glass with a capacity of 3 liters of substrate, leaving one plant per pot. At 15 days after inoculation, the treatment effect on plant growth and nematode penetration was evaluated by th the acid fuchsin method. After 30 and 60 days, were taken measures of plant development again, as well as the number of galls and egg masses, final population, reproduction factor and number of nematodes per gram of root. Treatments containing abamectin were the most effective in reducing the hatching rate of J2, as well as those which had higher immobilization and mortality rates on juveniles, differing from control. At 15 days, there was greater root development, length of shoot and fresh weight of shoots in plants grown from treated seeds. For the number of nematodes/g of root was observed significant difference among plants grown from treated seeds and inoculated control highlighting the treatments containing abamectin, isolated or in combination with other products. After 30 days, it was confirmed the effect of seed treatment on reducing nematode populations with treatment 3 (Abamectin) and 9 (Abamectin + Tiametoxam + Fludioxonil + Metalaxyl -M + Tiabendazole), with smaller values for final population factor, reproduction factor and nematodes/g of root. However, at 60 days, after inoculation, there was no effect of treatments on maintaining low nematode populations. Therefore, from the results obtained it can be concluded that the seeds treatment may be a measure that assists in the nematode integrated management.

A soja [Glycine max (L.) Merrill] a cada ano vem confirmando a sua posição ímpar como produto agrícola brasileiro de maior importância, quer na geração de divisas para o país, quer no incremento das atividades da agroindústria, da produção de carnes, de óleo e derivados. A principal utilização da soja, tanto no Brasil como no restante do mundo, é como matéria prima para a indústria de esmagamento que produz óleo degomado e farelo. O óleo é utilizado como matéria prima para a indústria alimentícia na produção de óleo refinado, e seus derivados, e o farelo é utilizado, principalmente, na indústria de rações como enriquecedor protéico. A qualidade do farelo de soja é dada pelo seu conteúdo de proteína. O farelo obtido da soja produzida no Brasil, especialmente na região Sul, tem apresentado conteúdo de proteína abaixo das especificações exigidas pelo mercado, o que tem depreciado seu valor. A concentração de óleo e proteína na semente de soja é herdada como uma característica quantitativa que sofre grande influência do meio ambiente. Em condições de cultivo in vivo é difícil controlar precisamente o fornecimento de carbono e nitrogênio destinado às sementes. Com o objetivo de avaliar a influência de genótipos de soja sobre a concentração de proteína e óleo na semente com desenvolvimento in vivo e in vitro, sementes imaturas das cultivares CD 202 e CD 206 foram retiradas da planta mãe no estádio R5, cultivadas in vitro em meio de cultura líquido, contendo 20, 40 e 60 mM de glutamina. As sementes foram incubadas em frascos de vidro em constante agitação, por oito dias a 25 . 0,2.C, com concentração de sacarose de 204,5 mM. Após esse período de incubação, foi determinado o ganho de massa fresca das sementes. Posteriormente, foi determinado o teor de óleo e proteína das sementes desenvolvidas in vitro e das desenvolvidas in vivo. O ganho de massa fresca não apresentou diferença significativa (P>0,05) em uma mesma cultivar quando houve alteração da concentração de glutamina. Entre as cultivares o ganho de massa fresca apresentou diferença significativa (P<0,05) nas concentrações de 40 e 60 mM de glutamina na cultivar CD 206 em relação à CD 202. A porcentagem de proteína na concentração de 20 mM de glutamina não apresentou diferença significativa (P>0,05) na cultivar CD 206 cultivada in vitro quando comparada com a cultivada in vivo. Porém o inverso ocorreu para as concentrações de 40 e 60 mM de glutamina. A cultivar CD 202 quando cultivada in vitro na concentração de 20 mM apresentou porcentagem de proteína menor que as sementes cultivadas in vivo. Porém, acima da concentração de 20 mM de glutamina, a cultivar CD 202 apresentou uma alta porcentagem de proteína, respondendo positivamente ao aumento da concentração de glutamina. Com suprimento adequado de nitrogênio para as sementes com desenvolvimento in vitro o genótipo não limitou o acúmulo de proteína. Entre as duas cultivares estudadas, a proteína se apresentou sempre em maior porcentagem na cultivar CD 206. As concentrações de óleo e proteína foram inversamente relacionadas. O genótipo influencia na composição da semente de soja, pois mesmo quando houve variação no suprimento de nitrogênio para as sementes com desenvolvimento in vitro diferenças estatísticas apresentadas na porcentagem de proteína e óleo, foram mantidas entre os genótipos.<br>Soybean [Glycine max (L.) Merrill] confirms every year its unparalleled position of most important agricultural Brazilian product as regards the flow of money to the country and the increasing of agro-industry activities and also meat, oil and respective sub products production. In Brazil as well as in the rest of the world, soybean is mainly used as raw material of the grinding industry which produces degummed oil and meal. Soybean oil is the raw material of the food industry for the production of refined oil and its sub products and the meal is mainly used to increase the protein content in animal food. The quality of soybean meal is evaluated by its protein content. Meal resulting from soybean produced in Brazil, specifically in southern region of Brazil, has been presenting a protein content lower than the demands of the market, what results in the product?s devaluation. The concentration of oil and protein in soybean seed is an inherited qualitative trait, but it is greatly influenced by the environment .Under the condition of cultivation in vitro it is difficult to control precisely the supply of carbon and nitrogen destined for the seeds. With the purpose of evaluating soybean?s genotype on the concentration of protein and oil of seeds developed in vivo and in vitro, immature seeds of cultivars CD 202 and CD 206 were removed from the mother-plant in the stage R5 and were cultivated in vitro, in a liquid milieu of cultivation which contained 20, 40 and 60 mM of glutamine. The seeds were incubated in glass flasks and agitated constantly during eight days at 25± 0,2 º C with 204,5 mM sucrose concentration. After that period of incubation it was determined the gain of fresh mass of the seeds. Afterwards it was also determined the oil and protein contents of the seeds developed in vitro and those developed in vivo. The fresh mass gain did not present a significant difference ( P>0,05) in the same cultivar when the glutamine concentration was altered , but between the two cultivars, fresh mass gain showed a significant difference (P<0,05) in the concentration of 40 and 60 mM of glutamine in the cultivar CD 206 as compared to the cultivar CD 202. The protein percentage in the 20 mM glutamine concentration did not present a significant difference (P>0,05) in the cultivar CD 206 cultivated in vivo. Nevertheless the opposite occurs in 40 and 60 mM of glutamine concentrations. Cultivar 202 when cultivated in vitro in 20 mM concentration showed a lower protein percentage than that of the seed cultivated in vivo. However, over 20 mM glutamine concentration, the cultivar CD 202 showed a high percentage of protein, what represents a good response to the increase of glutamine concentration. With an adequate supply of nitrogen for the seeds cultivated in vitro, the genotype did not limit the protein gain. Between the studied cultivars, protein percentage was always higher in the cultivar CD 206. Oil and protein concentrations were inversely related. The genotype has influence on soybean seeds composition, since it was observed that statistical differences in the oil and protein percentage remained unchanged even when a variation in the nitrogen supply to the seeds developed in vitro ocurred.