Academic literature on the topic 'Hybrides cellulaires'

Résumé La technique de l’analyse syntaxique de la visibilité (Visibility Graph Analysis – VGA) et de l’accessibilité (All Line Analysis – ALA) par logiciel “DepthMap©(UCL, Londres)” et l’analyse du dysfonctionnement wayfinding par méthode “movement traces”, sont utilisées dans ce papier afin de développer un modèle d’analyse et d’investigation de l’impact des changements spatiaux sur le dysfonctionnement socio-spatial du wayfinding, ainsi sur la reproduction urbaine, notamment les transformations des façades et l’appropriation des espaces extérieurs dans les grands ensembles en Algérie. Nous donnons ici le cas d’étude de la cité 1000 logt-Biskra et la cité 500 logt-M’sila. Afin de vérifier cette hypothèse, un modèle d’analyse hybride a été développé par croisement des résultats d’analyses des deux techniques. Par conséquent, le schéma de l’interférence montre que la majorité des piétons préfèrent parcourir les axes courts et droits — caractérisés par une forte propriété syntaxique de visibilité et d’accessibilité (l’intégration, la connectivité et l’intelligibilité) — en directions des équipements adjacents et aux milieux des deux cités. Ces itinéraires ont un impact sur les transformations des façades et l’appropriation des espaces extérieurs. Le modèle développé promet de futures recherches sur le plan de la quantification, la modélisation et la simulation du processus de la reproduction urbaine, notamment par les automates cellulaires.

Ce numéro de la revue INRA Productions Animales contient un dossier consacré aux dernières avancées de la recherche sur le foie gras. En effet, la démocratisation de la consommation de ce produit haut de gamme a été permise notamment par les efforts de recherche et développement sur l’élevage des palmipèdes à foie gras et la maîtrise de la qualité du produit. Ce dossier est l’occasion de faire en préalable quelques rappels sur cette belle histoire ! Un peu d’histoire La pratique du gavage est une tradition très ancienne, originaire d’Egypte, dont les traces remontent à 2 500 avant JC. Elle avait pour objectif d’exploiter la capacité de certains oiseaux à constituer des réserves énergétiques importantes en un temps court pour disposer d’un aliment très riche. Si les basreliefs datant de l’ancien empire égyptien attestent de la pratique du gavage, il n’existe pas de preuves que les égyptiens consommaient le foie gras ou s’ils recherchaient la viande et la graisse. Ces preuves sont apparues pour la première fois dans l’empire romain. Les romains gavaient les animaux avec des figues et pour eux le foie constituait le morceau de choix. Le nom de jecur ficatum, signifiant « foie d’un animal gavé aux figues », est ainsi à l’origine du mot foie en français. La production de foie gras s’est développée dans le Sud-ouest et l’Est de la France aux XVIIe et XVIIIe siècles avec le développement de la culture du maïs. Le foie gras est aujourd’hui un met inscrit au patrimoine culturel et gastronomique français (article L. 654-27-1 du code rural défini par la Loi d’Orientation Agricole de 2006). Le contexte de la production de foie gras Avec près de 72% de la production mondiale en 2012, la France détient le quasi monopole de la production de foie gras. Les autres pays ayant des productions significatives sont la Hongrie et la Bulgarie en Europe Centrale, avec environ 10% pour chacun de ces pays, mais aussi l’Espagne avec 3% de la production. L’Amérique du nord et la Chine représentent les deux autres pôles de production les plus significatifs, mais avec moins de 2% du marché. La production française a connu un essor considérable, sans doute le plus important de toutes les productions agricoles, passant de 5 880 tonnes en 1990 à plus de 19 000 tonnes en 2012. A l’origine, le foie gras était principalement obtenu par gavage des oies, longtemps considérées comme l’animal emblématique de cette production. Aujourd’hui, le canard mulard, hybride d’un mâle de Barbarie (Cairina Moschata) et d’une cane commune (Anas Platyrhynchos), est plus prisé (97% des palmipèdes gavés en France). En France, l’oie a vu de ce fait sa part relative pour la production de foie gras diminuer, et c’est la Hongrie qui contrôle 65% de la production mondiale de foie gras d’oie. Toutefois, cette espèce ne représente que 10% de la production mondiale. La France est également le principal pays consommateur de foie gras avec 71% du total, l’Espagne se classant au second rang avec environ 10%. Compte tenu de son image de produit de luxe et d’exception, le foie gras est consommé un peu partout dans le monde lors des repas de haute gastronomie. Les grandes avancées de connaissance et l’évolution des pratiques d’élevage L’amélioration des connaissances sur la biologie et l’élevage des palmipèdes à foie gras a permis de rationnaliser les pratiques d’élevage et d’améliorer la qualité du produit. Plusieurs laboratoires de recherche et structures expérimentales, ayant leurs installations propres et/ou intervenant sur le terrain, ont contribué à l’acquisition de ces connaissances : l’INRA avec l’Unité Expérimentale des Palmipèdes à Foie Gras, l’UMR Tandem, le Laboratoire de Génétique Cellulaire, la Station d’Amélioration Génétique des Animaux et l’UR Avicoles, l’Institut Technique de l’AVIculture, la Ferme de l’Oie, le Centre d’Etudes des Palmipèdes du Sud Ouest, le LEGTA de Périgueux, l’ENSA Toulouse, l’ENITA Bordeaux et l’AGPM/ADAESO qui a mis fin en 2004 à ses activités sur les palmipèdes à foie gras. Aujourd’hui ces structures fédèrent leurs activités dans un but de rationalité et d’efficacité. Les avancées des connaissances et leur transfert dans la pratique, associés à une forte demande du marché, sont à l’origine de l’explosion des volumes de foie gras produits. Ainsi, la maîtrise de la reproduction couplée au développement de l’insémination artificielle de la cane commune et à la sélection génétique (Rouvier 1992, Sellier et al 1995) ont permis la production à grande échelle du canard mulard adapté à la production de foie gras. En effet, ses géniteurs, le mâle de Barbarie et la femelle Pékin, ont fait l’objet de sélections spécifiques basées sur l’aptitude au gavage et la production de foie gras de leurs descendants. La connaissance des besoins nutritionnels des animaux et le développement de stratégies d’alimentation préparant les animaux à la phase de gavage ont également été des critères déterminants pour la rationalisation d’un système d’élevage (Robin et al 2004, Bernadet 2008, Arroyo et al 2012). La filière s’est par ailleurs structurée en une interprofession (le Comité Interprofessionnel du Foie Gras - CIFOG) qui soutient financièrement des travaux de recherches et conduit des actions (organisation de salons du foie gras par exemple) visant à rendre accessibles toutes les avancées de la filière. Ainsi, l’amélioration du matériel d’élevage (gaveuse hydraulique et logement de gavage) a engendré des gains de productivité considérables (Guy et al 1994). Par exemple, en 20 ans, la taille d’une bande de gavage est passée de deux cents à mille individus. Enfin, la construction de salles de gavage, dont l’ambiance est parfaitement contrôlée autorise désormais la pratique du gavage en toute saison. Des études ont aussi permis de déterminer l’influence des conditions d’abattage et de réfrigération sur la qualité des foies gras (Rousselot-Pailley et al 1994). L’ensemble de ces facteurs a contribué à ce que les possibilités de production soient en cohérence avec la demande liée à un engouement grandissant pour le foie gras. Les pratiques d’élevage actuelles Aujourd’hui, le cycle de production d’un palmipède destiné à la production de foie gras comporte deux phases successives : la phase d’élevage, la plus longue dans la vie de l’animal (11 à 12 semaines chez le canard ou 14 semaines chez l’oie) et la phase de gavage, d’une durée très courte (10 à 12 jours chez le canard ou 14 à 18 jours chez l’oie). La phase d’élevage se décompose elle même en trois étapes (Arroyo et al 2012). Pendant la phase de démarrage (de 1 à 4 semaines d’âge) les animaux sont généralement élevés en bâtiment clos chauffé et reçoivent à volonté une alimentation granulée. Pendant la phase de croissance (de 4 à 9 semaines d’âge), les animaux ont accès à un parcours extérieur. Ils sont nourris à volonté avec un aliment composé de céréales à 75% sous forme de granulés. La dernière phase d’élevage est consacrée à la préparation au gavage (d’une durée de 2 à 5 semaines) grâce à la mise en place d’une alimentation par repas (220 à 400 g/j). Son objectif est d’augmenter le volume du jabot et de démarrer le processus de stéatose hépatique. Pendant la phase de gavage les animaux reçoivent deux (pour le canard) à quatre (pour l’oie) repas par jour d’une pâtée composée à 98% de maïs et d’eau. Le maïs est présenté soit sous forme de farine (productions de type standard), soit sous forme d’un mélange de graines entières et de farine, soit encore sous forme de grains modérément cuits (productions traditionnelles ou labellisées). En France, on distingue deux types d’exploitations. Dans les exploitations dites en filière longue et de grande taille (au nombre de 3 000 en France), les éleveurs sont spécialisés dans une des phases de la production : éleveurs de palmipèdes dits « prêt-à-gaver », gaveurs ou éleveurs-gaveurs. Ce type de production standard est sous contrôle d’un groupe ou d’une coopérative qui se charge des opérations ultérieures (abattage, transformation, commercialisation ou diffusion dans des espaces de vente à grande échelle). Il existe également des exploitations en filière courte qui produisent les animaux, transforment les produits et les commercialisent directement à la ferme et qui sont généralement de plus petite taille. Ces exploitations « fermières » ne concernent qu’une petite part de la production (10 à 15%), mais jouent un rôle important pour l’image de production traditionnelle de luxe qu’elles véhiculent auprès des consommateurs. Pourquoi un dossier sur les palmipèdes à foie gras ? Au-delà des synthèses publiées précédemment dans INRA Productions Animales, il nous a semblé intéressant de rassembler et de présenter dans un même dossier les avancées récentes concernant la connaissance de l’animal (articles de Vignal et al sur le séquençage du génome du canard et de Baéza et al sur les mécanismes de la stéatose hépatique), du produit (articles de Théron et al sur le déterminisme de la fonte lipidique du foie gras à la cuisson et de Baéza et al sur la qualité de la viande et des carcasses), ainsi que les pistes de travail pour concevoir des systèmes d’élevage innovants plus durables (article de Arroyo et al). L’actualité et les enjeux pour demain La filière est soumise à de nombreux enjeux sociétaux qui demandent de poursuivre les efforts de recherche. En effet, pour conserver son leadership mondial elle doit rester compétitive et donc maîtriser ses coûts de production tout en répondant à des attentes sociétales et environnementales spécifiques telles que la préservation de la qualité des produits, le respect du bien-être animal ou la gestion économe des ressources. Ainsi, la production de foie gras est parfois décriée eu égard à une possible atteinte au bien-être des palmipèdes pendant l’acte de gavage. De nombreux travaux ont permis de relativiser l’impact du gavage sur des oiseaux qui présentent des prédispositions à ce type de production : la totale réversibilité de l’hypertrophie des cellules hépatiques (Babilé et al 1998) ; l’anatomie et la physiologie des animaux de même que l’absence de mise en évidence d’une élévation du taux de corticostérone (considéré comme marqueur d’un stress aigu) après l’acte de gavage (Guéméné et al 2007) et plus récemment la mise en évidence de l’aptitude à un engraissement spontané du foie (Guy et al 2013). Le conseil de l’Europe a toutefois émis des recommandations concernant le logement des animaux qui préconisent, la disparition des cages individuelles de contention des canards pendant le gavage au profit des cages collectives. Par ailleurs, il recommande la poursuite de nouvelles recherches pour développer des méthodes alternatives au gavage. Parallèlement, à l’instar des autres filières de productions animales, la filière foie gras doit aussi maîtriser ses impacts environnementaux (voir aussi l’article d’Arroyo et al). Les pistes de recherches concernent prioritairement la maîtrise de l’alimentation, la gestion des effluents et des parcours d’élevage. Il reste donc de grands défis à relever pour la filière foie gras afin de continuer à proposer un produitqui conjugue plaisir et durabilité.Bonne lecture à tous !

Cette thèse aborde le problème de la résolution des problèmes combinatoires à l'aide d'algorithmes génétiques. Ce type d'algorithme présente en effet nombres d'avantages. Cependant, ils sont généralement relativement lents. Cette thèse est donc centrée sur les algorithmes hybrides, c'est-à-dire des algorithmes construits à l'aide de plusieurs méthodes différentes. Dans notre cas, nous étudions les algorithmes qui réunissent algorithmes génétiques et heuristiques. Il existe deux méthodes pour générer de tels algorithmes qui sont la représentation directe et la représentation indirecte. Ces deux méthodes sont étudiés au travers de trois problèmes distincts : l'ordonnancement statique de programmes parallèles, le placement de composants électroniques et la planification de réseaux cellulaires. Pour chacun des trois problèmes, les algorithmes hybrides ont montrés leur efficacité. Pour le problème de la planification de réseaux cellulaires, une nouvelle modélisation a été faite. Cette modélisation permet d'effectuer en même temps le placement des émetteurs et l'allocation de fréquences.

Chez Saccharomyces cerevisiae , Rnt1p, l'orthologue de la RNase III bactérienne, est impliquée directement et indirectement dans 3 étapes: Elle effectue le premier clivage du pré-ARNr 35S, produit les snoRNAs requis pour les modifications de l'ARNr et produit également les snRNAs nécessaires à l'épissage des ARNm des protéines ribosomales. Cependant le rôle de Rntlp dans la cellule ne semble pas s'arrêter là, car l'activité de clivage de structures d'ARN double-brins des RNases III semble requise dans d'autres voies de maturation d'ARN. Afin d'identifier d'autres rôles pour la ribonucléase III chez les levures et de mieux comprendre les voies dans lesquelles on sait qu'elle est déjà impliquée, un criblage double-hybrides a été initié pour découvrir des partenaires protéiques possibles de Rnt1p. Ce criblage s'avéra très fructueux car de nombreuses interactions de Rntlp avec des protéines ont été révélées. Fait intéressant: plusieurs protéines peuvent être reliées avec des phénotypes observés dans les levures délétées en RNT1 , qui présentent entre autres, une sensibilité aux températures élevées et une incapacité à croître sur milieu sans leucine. La signification biologique de l'association de Rntlp avec l'une de ses partenaires a été investiguée en détail."--Résumé abrégé par UMI.

Dans le contexte de l’immunothérapie anti-tumorale, la fusion des cellules dendritiques (DC) avec les cellules tumorales a pour but d’obtenir des cellules fusionnées capables d’éradiquer les tumeurs établies ou d’empêcher leur développement. Nos objectifs sont : (1) d’optimiser la production de cellules fusionnées et de les caractériser en identifiant les faux positifs, (2) d’étudier leur immuno-phénotype et leur fonctionnalité. Ce travail permet de réduire les facteurs de variabilité du processus de fusion DC/cellules tumorales et d’insister sur la complémentarité des méthodes de caractérisation. Les cellules fusionnées sont capables d’induire une réponse immunitaire et leur fonctionnalité, liée à leur état de maturation, se manifeste par la sécrétion de cytokines et de perforine par les LT activés. Leur phénotype non adhérent et leur capacité à exprimer le gène CCR7 ouvrent la voie à des expériences de migration et d’évaluation de l’activité anti-tumorale chez l’animal.

L’émergence des utilisateurs mobiles et la popularité croissante des services multimédias linéaires ont entrainé, ces dernières années, une augmentation impressionnante du trafic de données au sein des réseaux mobiles. En effet, le principal moteur de cette croissance est lié à la consommation de contenus vidéo de façon linéaire (télévision) ou non (vidéo à la demande) par de nombreux utilisateurs sur des appareils mobiles (tablettes, smartphones, ordinateurs portables, etc.) connectés aux réseaux cellulaires. Cependant, l’acheminement de ce trafic via le mode de transmission unicast traditionnel des réseaux cellulaires risque de générer un engorgement rapide du réseau au détriment de la qualité du service rendu. Ainsi, pour faire face cette demande continuellement croissante en débit des utilisateurs mobiles et devant la raréfaction croissante du spectre radioélectrique, les opérateurs n’ont d’autre choix que de densifier leurs infrastructures d’accès au réseau radio (RAN) et déployer des réseaux d’accès hétérogènes et hybrides exploitant plusieurs technologies (WiFi/small cells (3G/4G)) permettant le délestage du trafic de données mobiles. Dans cette optique, cette thèse porte sur la modélisation et l’optimisation d’un réseau hybride de diffusion de contenus multimédias pouvant exploiter de façon complémentaire deux infrastructures réseaux existantes et radicalement différentes, à savoir les réseaux cellulaires (LTE) et les réseaux de diffusion (DVB-T2 Lite, DVB-NGH ou éventuellement le mode broadcast LTE-eMBMS).Dans un premier temps nous nous consacrons à la modélisation et à la simulation du réseau hybride en considérant un scénario d’extension de couverture, où les deux réseaux coopèrent pour distribuer des services linéaires aux utilisateurs mobiles. A l’aide d'un simulateur système, nous évaluons les performances du réseau hybride en termes de capacité, consommation de puissance et efficacité énergétique.Dans un second temps, nous nous intéressons à l’optimisation de la capacité, de la consommation énergétique et de l’efficacité énergétique du réseau hybride pour la diffusion de ces services linéaires. Sur la base du modèle hybride, nous proposons une approche théorique, basée sur la distribution des utilisateurs, pour trouver une expression analytique de la zone de couverture optimale du réseau de diffusion tout en tenant compte de la qualité du service rendu aux utilisateurs. Les résultats théoriques et ceux obtenus à l’aide du simulateur système sont très proches. Nous étudions également l’impact de la popularité du service (en termes de nombre d’utilisateurs demandant le service) sur cette zone de couverture optimale.Enfin, nous proposons une extension au modèle de réseau hybride pour la diffusion des services non linéaires comme la vidéo à la demande, le téléchargement de fichiers, etc. Nous proposons une formalisation du problème d’optimisation en tenant compte des contraintes liées à ces services non-linéaires, en particulier le temps d’attente et de téléchargement ainsi que la fiabilité des transmissions radios.L’approche analytique proposée dans cette thèse constitue un atout précieux pour l’hybridation des réseaux cellulaires et des réseaux de diffusion. Ce modèle pourrait également permettre, d’une part d’évaluer le gain de telles approches hybrides, et d’autre part, de mettre en évidence les scénarios et stratégies de transmission de contenus multimédias les plus avantageux en fonction de critères donnés dans le contexte des réseaux « 4G avancés » voire « 5G »
The increasing popularity of linear multimedia services such as mobile TV, broadcasting live and sports events to mobile and portable devices, has led to a dramatic growth of the mobile data traffic. Indeed, the reason of this growth is related to the consumption of video content either as a linear service (live TV) or as a non-linear service (time-shifted or on demand), by many users on different devices (tablets, smartphones, laptops, etc.) connected to a cellular network. In cellular networks, these types of services are usually delivered over unicast connections, i.e. as many times as the number of users. This strategy is likely to lead to critical situations, e.g. network congestion at the expense of the quality of service. Thus, to deal with this mobile data traffic explosion and the lack of frequency bands, operators need to densify their radio access network infrastructure (RAN) and deploy heterogeneous and hybrid access networks using multiple technologies (WiFi / small cell (3G / 4G)), that enable data offloading.In this context, this thesis focuses on the definition and optimization of a hybrid network, where a unicast network (LTE) and a broadcast network (DVB-T2 Lite, DVB-NGH, LTE-eMBMS, etc.) cooperate to deliver multimedia content to mobile and portable devices.Firstly, we focus on the modeling and simulation of the hybrid unicast-broadcast network for the delivery of linear services. We consider a coverage extension scenario, where the coverage area of the broadcast network can be adjusted with respect to the distribution of the users and the number of users requesting the service. Using the TU-Wien system level simulator, we evaluate the performance of the hybrid network in terms of capacity, power consumption and energy efficiency.Secondly, with the proposed model, we provide a theoretical method to find an analytical expression of the broadcast coverage area that optimizes the service capacity, the power consumption and the energy efficiency of the hybrid network with respect to the quality of service requirements. Indeed, the theoretical results are in agreements with the simulation ones. Based on the proposed model, we analyze the impact of the number of users requesting the service on the optimal broadcast coverage area.Finally, we focus on the extension of the proposed hybrid network for the delivery of the non-linear services such as video on demand and file download services. We state an optimization problem regarding the constraints of these non-linear services, especially the waiting and downloading time and the transmission errors. This thesis provides great insights on the potential benefits that such hybrid approaches may bring in a context of “4G advanced” and “5G” networks where the UHF broadcasting spectrum is under pressure for being partly or completely attributed to mobile broadband operators due to the predicted explosion of the mobile data traffic

Le travail présenté dans cette thèse porte sur l'élaboration de couches minces des biomatériaux biomimétiques nanostructurées par des techniques lasers pulsés et leur évaluation de point de vue physico-chimique et biologique (biocompatibilité, prolifération et différentiation cellulaires avec des biomatériaux). Le but vise à développer une nouvelle méthode de recouvrement d'implants osseux par des techniques laser pulsé avancées (PLD - Pulsed Laser Deposition et MAPLE - Matrix Assisted Pulsed Laser Evaporation). Ces techniques sont utilisées pour la synthèse d'un système biphasique composé de nanoparticules d'hydroxyapatite (HA) associées à des protéines d'adhérence type fibronectine (FN) et vitronectine (VN) déposées sur un substrat type titane. Le support métallique permettra de maintenir la rigidité mécanique, l'hydroxyapatite favorisera la bio-intégration dans le tissu osseux et les protéines accélèreront l'adhérence cellulaire. L'objectif principal est d'accélérer l'adhérence des cellules et formation des tissus sur les implants. Les études de prolifération et différentiation cellulaire suggèrent une prédisposition des cellules à la prolifération induite par les revêtements VN et à la différentiation stimulée par les revêtements FN. Les effets significatifs sur l'attachement, l'adhésion et la prolifération observés dans nos études sont très importants pour la première phase de stabilité mécanique d'un implant. Les couches HA/protéines déposées par laser pourraient permettre de réduire cette phase.

Cette thèse avait pour objectif de mettre au point la culture de couche cellulaire mince épidermique afin d’induire la floraison in vitro chez le Petunia. Ceci a permis d'une part, de comparer les capacités embryogènes des anthères in situ et in vitro et d'autre part d'identifier la nature de l’hybride somatique partiel entre Petunia hybrida et Nicotiana plumbaginifolia. Nous avons défini les conditions expérimentales optimales de la floraison in vitro (âge de la plante-mère, taille et origine de milieu de culture et conditions thermiques). Les boutons floraux apparaissent sur les pousses florales et non pas directement sur l'explant, comme dans le cas de Nicotiana tabacum. Leur fréquence d'apparition est faible; selon le génotype elle varie entre 2,7 et 12,5%. Leur néoformation est contrôlée par le génotype. Nous avons mis en évidence un gradient de floraison situé entre la partie végétative et les deux premiers entre-noeuds de la partie reproductive d'une ramification florale. Par contre, les explants prélevés sur le 3ème entre-noeud forment des fleurs plus tardivement et prélevés sur le 4ème, ils ne forment que des pousses feuillées. Un 2ème cycle de régénération par voie de couche cellulaire mince épidermique induit la floraison de ces pousses feuillées. Un microbouturage réalisé par la suite permet d'obtenir plus de plantes à floraison précoce. Nous avons émis l'hypothèse selon laquelle l'expression florale sur un explant semble être sous l'influence de l'âge génétique de la plante-mère au moment de la différenciation des tissus prélevés. Nos résultats montrent que le C31pl1 est un hybride intergénérique somatique partiel. L'instabilité de son génome se manifeste par la modification de la couleur des fleurs en cours de culture à un type parentale. L'expression d'une forme normale de corolle n'est possible qu'à ce stade. Chez les plantes NpPh, à l'issue de l'androgenèse nous avons obtenu deux plantes avec des fleurs épanouies, roses ou vert-jaune. Ces caractères n'ont pas été identifiés chez leurs plantes-mères. Nous pouvons donc penser que parmi les plantes NpPh certaines sont issues de l'allofusion bien qu'elles ne montrent aucun caractère de fusion. Les résultats que nous avons obtenus montrent que l'androgenèse in vitro permet l’obtention d'un nombre plus important d’anthères embryogènes et de plantes régénérées. Cependant leur niveau de ploïdie reste à déterminer. Il faut remarquer que l'existence de marqueurs génétiques chez le Petunia rend la maîtrise de la technique de la couche cellulaire mince épidermique particulièrement intéressante dans le domaine de la manipulation génétique.

La protéine Int6 humaine, localisée à la fois dans le noyau et le cytoplasme, a initialement été caractérisée comme une cible de la protéine oncogénique Tax du rétrovirus HTLV-I. La fonction de cette protéine, exprimée à la fois chez S. Pombe, les plantes et les mammifères n’a pas été encore élucidée. Cependant les publications récentes montrent qu’elle est associée à au moins deux complexes multiprotéiques à domaine PCI : le facteur d’initiation de la traduction eIF3, et le signalosome COP9. Mes travaux sur la fonction d’Int6 ont débuté par la réalisation d’un criblage en double hybride dans la levure des protéines humaines interagissant avec Int6. Nous avons ainsi mis en évidence puis confirmé l’interaction Int6 avec la sous-unité MCM7 du complexe MCM d’initiation de la réplication. Cette interaction a été l’objet principal de mes recherches durant ma thèse. Nous avons ainsi confirmé l’interaction d’Int6 avec les protéines MCM4, 6 et 7 par co-immunoprécipitation des protéines endogènes. L’analyse du complexe Int6-MCM7 dans des cellules Jurkat synchronisées a montré que ce complexe se formait essentiellement en phase G1 et se dissociait en phase S. Chez le xénope, l’intéraction d’Int6 avec MCM7 est détectée dans des extraits mitotiques d’œufs. Dans ce système d’étude, l’introduction d’un excès de protéine Int6 recombinante inhibe la réplication in vitro. La multiplicité des interacteurs mis en évidence (Rfp, eIF3, COP9, MCM) et les différentes fonctions affectées (cycle cellulaire, traduction, réplication) impliquent donc qu’Int6 joue un rôle important au sein de la cellule
The int6 gene was originally identified as a frequent site of integration of the MMTV provirus in preneoplastic and neoplastic mammary lesions. The human cDNA encoding Int6 was independently isolated in a two-hybrid screen for cellular proteins interacting with the Tax oncoprotein of HTLV-1. Finally, the Int6 protein was shown to correspond to a subunit of purified eIF3 translation initiation factor. Its presence in eIF3 has been established in the following organisms : rabbit, S. Pombe et A. Thaliana. In A. Thaliana Int6 has also been shown to associate with the signalosome via binding to the CSN7 subunit of this complex. A two-hybrid screen performed with the Int6 protein as bait showed that it binds the Ret finger protein (Rfp) which interacts with PML and localises with a subset of PML nucear bodies. Int6 and Rfp are co-localised in certain PML nuclear bodies in lymphocytes. Another clones were interesting with respect to recent publications indicating interactions between eIF3, signalosome and proteasome complexes : CSN3, a subunit of signalosome, and Rpt4, a subunit of 19D proteasome. Finally, the two-hybrid screen showed that Int6 binds to MCM7, a component of MCM complex. Analysis of this interaction indicated that it intervenes between normal endogenous proteins in primary cells. Experiments with synchronised cells established that Int6 binds MCM7 in a cell cycle dependent manner during mitosis and G1. The Int6 protein also exists in Xenopus. Its association with the MCM complex was observed only with metaphase-arrested egg extract but not interphase extract. In vitro DNA replication assays using the Xenopus system showed that addition of purified In-6 has an inhibitory effect. These results suggest that Int6 regulates the activity of the MCM complex through an interaction with its MCM7 subunit. They also support a possible link between oncogenesis and the control of the licensing activity

Les vésicules hybrides, résultant de l’auto-assemblage combiné de copolymères amphiphiles et de phospholipides, font l’objet d’un intérêt grandissant depuis plusieurs années. Ces assemblages peuvent être vus comme des structures vésiculaires avancées comparés aux liposomes et polymersomes. Ils permettent en effet de combiner la variabilité chimique et la stabilité mécanique de la membrane polymère avec la bio-fonctionnalité et la perméabilité de la membrane lipidique. Ces objets pourraient être utilisés dans plusieurs domaines : nano-réacteur pour des réactions enzymatiques, modèle biomimétique de membrane cellulaire, etc. De précédents travaux au sein du LCPO ont permis de développer des vésicules hybrides, principalement à partir de copolymères triblocs PEO-b-PDMS-b-PEO. Ces systèmes ont cependant montré des limitations en termes de propriétés mécaniques, puisqu’ils présentent des déformations à rupture inférieures à celles des liposomes. Le mélange de conformations (en boucle et étendue) des copolymères triblocs dans la membrane serait à l’origine de la faible stabilité mécanique des membranes hybrides. Une des approches pour remédier à ce problème est de contrôler la conformation des chaînes de polymère dans la membrane. Dans ce contexte, l’objectif de cette thèse est de développer des systèmes hybrides en substituant les copolymères triblocs par des copolymères diblocs PDMS-b-PEO. Ces derniers s’organisent en bicouches dans la membrane de la même manière que les phospholipides, ce qui pourrait stabiliser les interfaces polymère/lipide.Le travail de cette thèse a consisté à synthétiser une série de copolymères diblocs PDMS-b-PEO pouvant former des polymersomes. Les paramètres d’auto-assemblage des LUV ont été déterminés (concentration d’agrégation critique, rayon de giration et hydrodynamique, nombre d’agrégation, etc.). Les mesures d’épaisseur de membrane ont été réalisées par Cryo-TEM et diffusion des neutrons. Nous nous sommes également intéressés aux propriétés de membrane des polymersomes (fluidité et tenue mécanique).Des vésicules hybrides micrométriques (GHUV) et nanométriques (LHUV) ont été obtenues à partir des copolymères diblocs et du POPC, un lipide modèle. La formation et la structurationde membrane des LHUV a été vérifiée par Cryo-TEM, diffusion des neutrons et spectroscopie de fluorescence tandis que la formation et la structuration de membrane des GHUV a été étudiée par microscopie confocale. Différentes structurations de membrane ont été obtenues pour les GHUV, suivant la masse molaire du copolymère ou encore la composition en lipide. A l’inverse, les membranes des LHUV semblent homogènes, quelle que soit la fraction en lipide utilisée.La perméabilité et la tenue mécanique des membranes hybrides ont pu être modulées suivant la composition en lipide. Étonnement, les polymersomes semblent plus perméables que les liposomes. A l’inverse, l’utilisation de copolymères diblocs permet bien de renforcer la membrane des vésicules hybrides. Les valeurs de ténacité obtenues sont bien supérieures à celles mesurées pour les liposomes et pour les vésicules hybrides composées de copolymères triblocs.Pour finir, la tension de ligne associée aux interfaces polymère/lipide a été mesurée pour la première fois pour des systèmes hybrides. Les valeurs de tensions de ligne trouvées sont comparables à celles mesurées pour des membranes lipidiques multi-phasées
Hybrid vesicles, resulting from the combined self-assembly of amphiphilic copolymers and phospholipids, have been the subject of growing interest for several years. These assemblies can be seen as advanced vesicular structures compared to liposomes and polymersomes. They combine the chemical versatility and mechanical stability of the polymer membrane with the bio-functionality and permeability of the lipid membrane. These objects could be used in several fields: nano-reactor for enzymatic reactions, biomimetic model of cell membrane, etc. Previous work at the LCPO has led to the development of hybrid vesicles, mainly from triblock copolymers PEO-b-PDMS-b-PEO. However, these systems have shown limitations in terms of mechanical properties, since they have lower lysis strain than liposomes. The mixture of conformations (loop and extended) of triblock copolymers in the membrane would be at the origin of the poor mechanical stability of hybrid membranes. One approach to solve this problem is to control the conformation of polymer chains in the membrane. In this context, the objective of this thesis is to develop hybrid systems by substituting triblock copolymers with PDMS-b-PEO diblock copolymers. The latter are organized in bilayers in the membrane in the same way as phospholipids, which could stabilize the polymer/lipid interfaces.The work of this thesis consisted in synthesizing a series of diblock copolymers PDMS-b-PEO that can form polymersomes. The self-assembly parameters of the LUVs were determined (critical aggregation concentration, radius of gyration and hydrodynamics, number of aggregations, etc.). Membrane thickness measurements were performed by Cryo-TEM and neutron scattering. We were also interested in the membrane properties of polymersomes (fluidity and mechanical properties).Micrometric (GHUV) and nanometric (LHUV) hybrid vesicles were obtained from diblock copolymers and POPC, a model lipid. LHUV membrane formation and structuration was studied by Cryo-TEM, neutron scattering and fluorescence spectroscopy while GHUV membrane formation and structuration was checked by confocal microscopy. Different membrane structurations have been obtained for GHUVs, depending on the molar mass of thecopolymer or on the lipid composition. On the other hand, the LHUV’s membranes appear to be homogeneous, regardless of the lipid fraction used.The permeability and mechanical properties of the hybrid membranes could be modulated according to the lipid composition. Surprisingly, polymersomes seem more permeable than liposomes. On the other hand, the use of diblock copolymers improve the mechanical properties of the hybrid membranes. The toughness values obtained are much higher than those measured for liposomes and for hybrid vesicles composed of triblock copolymers.Finally, the line tension associated with polymer/lipid interfaces was measured for the first time for hybrid systems. The line tension values founded are comparable to those measured for multi-phase lipid membranes

L’algorithme Marked Point Process parallélisé en mémoire partagée permet d’accélérer la détection de noyaux cellulaires. Cependant, les limites imposées par le nombre de cœurs CPU ou la capacité mémoire des cartes GPU ne permet pas d’analyser une image histologique entière (50 000 × 50 000 pixels). Pour y parvenir, nous proposons d’ajouter une dimension distribuée à cette parallélisation en utilisant le modèle hybride Ordered Read-Write Locks. Afin de garantir la validité de l’algorithme original, nous avons mis en place différentes stratégies pour d’une part garantir le traitement de l’ensemble des noyaux et d’autre part, pour que les traitements locaux soient considérés à l’échelle globale. Les tests menés ont tout d’abord permis de valider le passage à l’échelle de l’application puis d’afficher un facteur d’accélération de 40 sur 64 cœurs CPU
The shared memory parallelized version of the Marked Point Process algorithm allows to speed-up cells nuclei detection. However, the limitations imposed by the number of CPU cores or the memory capacity of GPU cards do not allow to analyse an entire histological image (50,000 × 50,000 pixels). To achieve this, we propose to add a distributed dimension to this parallelization using the hybrid Ordered Read-Write Locks model. In order to guarantee the validity of the original algorithm, we have implemented different strategies to ensure that all nuclei are processed and that local processing is considered on a global scale. The tests carried out first validated the scalability of the application and then showed an acceleration factor of 40 on 64 CPU cores