Dissertations / Theses: 'Hypoxie (Écologie des eaux)'

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Lamarche, Marie-Claude. "Impact de l'hypoxie chronique et aigüe sur les capacités métaboliques de la morue franche (Gadus Morhua)." Thesis, Université Laval, 2010. http://www.theses.ulaval.ca/2010/27004/27004.pdf.

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Lanoux, Aurélie. "Caractérisation et rôle respectif des apports organiques amont et locaux sur l'oxygénation des eaux de la Garonne estuarienne." Phd thesis, Université Sciences et Technologies - Bordeaux I, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00874532.

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Abstract:

L'estuaire de la Gironde est le plus grand estuaire macrotidal d'Europe formé par la confluence de la Garonne (où se situe l'agglomération de Bordeaux) et de la Dordogne. L'une de ses principales caractéristiques est la présence d'une zone à forte turbidité (bouchon vaseux) où les processus hétérotrophes (dégradation de la matière organique) sont favorisés et où au contraire les processus autotrophes (production primaire) sont limités par le manque de lumière. Ainsi, des déficits en oxygène pouvant être préjudiciables à la vie aquatique se développent systématiquement dans la zone du bouchon vaseux de la Garonne estuarienne. Ces préoccupations environnementales ont donc conduit à étudier en détail dans le cadre de ce travail de doctorat, les facteurs environnementaux qui provoquent ces hypoxies estuariennes. Dans un premier temps, j'ai réalisé un suivi sur le réseau d'eaux urbaines partiellement séparatif et unitaire de la Communauté Urbaine de Bordeaux, de ses stations d'épurations et déversoirs d'orage afin d'appréhender les apports urbains de matières organique et azotées et de les comparer à ceux en provenance du bassin versant amont. Bien que les deux stations d'épuration réalisent des abattements très significatifs sur la matière organique et l'ammonium, il s'avère que les flux vers le milieu naturel restent importants, notamment durant les périodes estivales, pendant lesquelles des orages peuvent engendrer des déversements d'effluents non traités. Ensuite, des expériences d'incubations ont permis de mettre en évidence le caractère fortement labile de cette matière organique urbaine. Le carbone organique dissous et l'ammonium, contenus dans les eaux usées, sont des composés fortement consommateurs en oxygène. Des expériences de respirométrie ont également permis d'estimer les taux de consommation en oxygène nettement plus importants dans les effluents urbains que dans les eaux de la Gironde. Enfin, l'analyse des données du réseau de mesures en continu de la qualité physico-chimique des eaux MAGEST (MArel Gironde ESTuaire) a démontré que l'estuaire subit dans sa section garonnaise des périodes d'hypoxie lors d'étiages prononcés, la masse d'eau la plus affectée par ces désoxygénations étant celle qui oscille aux alentours de l'agglomération de Bordeaux. Si ces résultats démontrent l'impact significatif de l'agglomération Bordelaise, le traitement statistique des données MAGEST pour la période 2005-2011 montre que les phénomènes de désoxygénation sont accrus en période d'étiage prononcé, en présence du bouchon vaseux et lorsque la température de l'eau est élevée. Dans ces conditions, l'oxygène dissous, déjà présent en faible quantité, peut être rapidement consommé lors d'apports supplémentaires d'eaux urbaines non traitées qui ont lieu pendant de fortes précipitations orageuses. Ce travail démontre également que le type de traitement biologique des eaux usées employé par les stations d'épuration et les capacités de stockage temporaire d'eaux d'orages ont un rôle critique sur les bilans de ces composés rejetés dans le milieu naturel. Enfin, ce travail permet de proposer aux gestionnaires des stratégies de rejets des effluents à court et moyen terme, en fonction des conditions hydrologiques et physico-chimiques du milieu, dans le but de limiter leur impact sur l'oxygénation des eaux estuariennes de la Garonne.

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Madiec, Hervé. "Dosage et spéciation des ultra-traces d'étain dans les écosystèmes aquatiques par spectrométrie d'absorption atomique avec génération et décomposition d'hydrures." Pau, 1986. http://www.theses.fr/1986PAUU3001.

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Sourisseau, Sandrine. "Simulation de la réponse d’hydrosystèmes continentaux (mares et rivières) à une perturbation de type toxique : effet du regroupement d’entités taxonomiques sur la pertinence de l’évaluation des risques écotoxicologiques." Rennes, Agrocampus Ouest, 2008. http://www.theses.fr/2008NSARD050.

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Abstract:

L’utilisation de modèles d’écosystèmes pour l’évaluation des risques écotoxicologiques implique souvent l’élaboration d’une représentation théorique (modèle conceptuel) de l’écosystème étudié. Ces modèles peuvent être détaillés ou au contraire très simplifiés. La simplification d’un modèle détaillé se fait via un regroupement de variables. Ce regroupement peut être envisagé d’un point de vue taxonomique, fonctionnel ou encore selon la sensibilité des compartiments biologiques à un polluant. Cette étude vise à évaluer jusqu’à quel point la simplification du modèle peut être réalisée sans remettre en cause la pertinence de ses sorties en ce qui concerne l’évaluation des risques écotoxicologiques. Le cas retenu est celui de la contamination ponctuelle d’un écosystème aquatique par la deltaméthrine. Les données utilisées ont été obtenues lors d’expériences réalisées dans des mésocosmes lentiques et lotiques. Deux outils ont été utilisés, Aquatox et TerraSys. Les modèles conceptuels ont été définis en fonction des groupes taxonomiques présents et des connaissances disponibles sur leur écologie. Avec Aquatox, des modèles simplifiés ont tout d’abord été développés en regroupant ces groupes toxonomiques selon leurs caractéristiques trophiques et fonctionnelles. Les modèles ont ensuite été détaillés en distinguant des compartiments caractérisés par des sensibilités différentes par rapport à la deltaméhtrine. Un protocole pour l’analyse de sensibilité des modèles développés avec Aquatox a été élaboré et mis en œuvre sur les différents modèles, ce qui permettra à l’avenir de mieux cibler les paramètres qui nécessitent l’acquisition d’informations détaillées. Les modèles d’écosystèmes lotiques et lentiques permettent de simuler correctement les compartiments en conditions normales
The use of mathematical ecosystem models for ecological risk assessment often implies to develop a theoretical representation (conceptual model) of the studied ecosystem. These models are divided into two types : detailed models and simple models. The aggregation of variables permits to simplify a detailed model into a simple one. Aggregation may be performed based on taxonomic or functional aspects, or according to the differential sensitivy of the various organisms to the same toxicant. This study aimed at evaluating at which level the simplification of the model can be carried out without questioning the relevance of the model outprunts in the context of ecological risk assessment. The data used were obtained during experiments performed in lentic and lotic mesocosms treated with the pyrethroid insecticide deltamethrin. Two softwares were used in this study, Aquatox and Terra Sys. The conceptual models were defined according to the species identified in the samples and the available knowledge on their ecology. With Aquatox highly simplified models were first developed by grouping species according to their trophic and functional characteristics. These models were then detailed by distinguishing the compartments characterized by different sensitivities to the insecticide. A multivariate method for performing sensitivity analysis of the models developed with Aquatox was developed and applied to the various models. IT permits to identify those parameters that will deserve particular attentionduring forthcoming experiments. The results showed that both lotic and lentic ecosystem models may be used to adequately simulate the compartments under control conditions

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Li, Xunde. "Cryptosporidium parvum et environnement : épidémiologie et contrôle de l'environnement hydrique." Rouen, 2000. http://www.theses.fr/2002ROUE11NR.

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Abstract:

Cryptosporidium parvum oocysts are widely distributed in the environment including natural waters and water supplies and causes both human and animal infection. Waterborne cryptosporidiosis has been identified as an emerging public health problem. This parasite is resistant to most currently used water disinfectants and no effective spécifie treatment has been available. Infectivity of oocysts recovered from waters should be evaluated for estimating the risks of contamination. Variable importance in outbreaks and significance in distribution had been documented for subgenotypes of C. Parvum. In the present study, A NMRI-suckling mice model was developed for evaluation of infectivity of C. Parvum oocysts and in vitro excystation was measured as viability. Infectivity of fourteen isolates of C. Panwm oocysts were investigated and all were infective to suckling mice. Influence of temperature and durations of storage on viability, infectivity and morphology of oocysts were studied. Infectivity of oocysts stored at +10°C decreased more rapidly than that of those stored at +4°C, more contracted size and more changes in external wall structure were observed on oocysts stored at +10°C. Using polypropylene cartridge filter and Gelman Envirochek capsule filters, local environmental waters and local distribution waters were filtered respectively. C. Parvum oocysts were detected in the condensed water samples by IFA. C. Parvum oocysts were also found from condensed mussel (Mytilus edulis) tissues by IFA, IMS and PCR-sequencing. Curative anticryptosporidial activity of nitazoxanide (NTZ) was evaluated in an immunosuppressed rat model and compared with the effects of sinefungin (SNF) and paromomycin (PRM). Although the inhibition rate was lower than that of SNF and PRM, NTZ exerted a long-lasting curative anti-C. Parrwm activity in the immunosuppressed rat. Using the 18S rDNA primers, PCR were performed on 6 isolates of C. Par-tiwm oocysts from clinic AIDS patients, 1 isolate from experimentally infected calf and 2 isolates from mussels. Séquence analysis were performed on the PCR products. Two isolates frome AIDS patients were human genotype (genotype 1), the other four isolates from AIDS patients and the isolates from calf were bovine (genotype 2). The two isolates from mussels were bovine genotype.

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Blanc, Laurence. "Données spatio-temporelles en écologie et analyses multitableaux : examen d'une relation." Lyon 1, 2000. http://www.theses.fr/2000LYO10044.

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Abstract:

En écologie, l'étude de tout écosysteme dans ses dimensions espace-temps conduit à l'obtention d'un ensemble de données tri-dimensionnelles (variables x temps x espace) qui s'organisent naturellement sous la forme de plusieurs tableaux. En statistique, des méthodes dites multitableaux ont été créées pour analyser simultanément plusieurs tableaux de données. Or, bien que ces méthodes semblent bien adaptées aux traitements des données récoltées en écologie, leur usage dans cette discipline est encore peu répandu. En s'inscrivant à l'interface de la statistique et de l'écologie, l'objectif de ce mémoire est d'étudier dans quelle mesure les méthodes d'analyse multitableaux permettent de répondre effectivement aux questions posées par les écologues dans le cadre des études spatio-temporelles des écosystèmes aquatiques. Notre travail, fondé sur une synthese bibliographique et sur notre propre expérience acquise en traitant plusieurs jeux de données, a montré que ces méthodes permettent d'aborder dans un cadre rigoureux les problèmes d'identification de structures spatiales ou temporelles et l'étude de la permanence de ces structures dans le temps ou dans l'espace. Par ailleurs, ce travail a montré également l'apport dans de nombreux cas de ces méthodes par comparaison avec d'autres stratégies ou méthodes d'analyses de données plus couramment utilisées. En revanche, il s'est également révélé que dans certaines situations, l'utilisation des analyses multitableaux n'est pas forcement justifiée ou conduit à des résultats dont l'interprétation peut parfois être délicate. Finalement, l'intérêt des méthodes multitableaux apparaît fortement lié à l'objectif de l'étude et au degré de précision désiré par l'écologue lors de l'exploitation des résultats. En conclusion, nous pensons que la capacité de ces méthodes à répondre si précisément à autant de questions diverses concernant la permanence des structures fait qu'une diffusion plus large en écologie est fortement souhaitable.

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Bettarel, Yvan. "Importance quantitative et fonctionnelle des virus dans les écosystèmes aquatiques." Clermont-Ferrand 2, 2002. http://www.theses.fr/2002CLF21403.

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Abstract:

L'objectif général de ce travail de thèse était de déterminer l'importance quantitative et fonctionnelle des virus en milieu aquatique, notamment lacustre. Il s'agissait, plus précisément, de mesurer l'importance relative de la lyse virale et de la prédation par les protistes bactérivores, dans les processus de pertes affectant les communautés bactériennes. Plusieurs études ont été conduites à différentes échelles temporelles (nycthémérale et saisonnière), dans des milieux contrastés (lacustre et marin), le long d'un gradient trophique (oligotrophe et entrophe), et à des profondeurs correspondants à des environnements bio-physico-chimiques distincts (épi-, méta- et hypolimnion des lacs). L'ensemble des résulats acquis nous amène à conclure que les virus représentant une composante abondante, ubiquiste et dynamique des milieux aquatiques dont l'activité lytique est responsable, en moyenne, de 10 à 20% des pertes de la production bactérienne dans les écosystèmes aquatiques, notamment lacustres. Dans les milieux de nature oligotrophe, la prédation des protistes constitue la cause essentielle des pertes bactériennes alors que dans les milieux eutrophes, la prédation du métazooplancton (rotifère, cladocères) ainsi que d'autres processus de mortalité bactérienne comme l'autolyse pourraient intervenir de façon significative

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Dandelot, Sophie. "Les Ludwigia spp. Invasives du Sud de la France : Historique, Biosystématique, Biologie et Ecologie." Aix-Marseille 3, 2004. http://www.theses.fr/2004AIX30052.

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Abstract:

Depuis leur introduction au début du XIXème siècle à Montpellier, les Ludwigia d’origine américaine ont, peu à peu, envahi toute la France. Notre étude morphologique et cytogénétique a permis de confirmer la présence en France de deux taxa bien différents. Les diploïdes (2n=16) correspondent à L. Peploides subsp. Montevidensis (Spreng. ) Raven, et les décaploïdes (2n = 80) à L. Grandiflora subsp. Hexapetala (Hook. & Arn. ) Nesom & Kartesz. Les diploïdes colonisent surtout la région méditerranéenne (sauf l’extrême Sud-Est), tandis que les polyploïdes prédominent partout ailleurs. De plus, ces deux taxons possèdent une intense multiplication végétative, mais des modes distincts de reproduction sexuée. Le second objectif de ce travail a été de comprendre quels sont les impacts des Ludwigia sur les écosystèmes. Nous avons suivi les relations entre le développement des herbiers de Ludwigia avec la qualité de l’eau, les autres producteurs primaires, les communautés bactériennes et la macrofaune. Pour cela, nous avons prospecté différents écosystèmes aquatiques méditerranéens caractérisés par des propriétés physiques et des fonctionnements hydrologiques différents
Since they were first introduced at the beginning of the 19th century into the Lez river at Montpellier, the American Ludwigia have gradually colonized the whole of France. A morphological and cytogenetic study confirmed the presence of two different taxa in France. The diploids (2n=16) correspond to L. Peploides subsp. Montevidensis (Spreng. ) Raven, and the decaploids (2n = 80) to L. Grandiflora subsp. Hexapetala (Hook. & Arn. ) Nesom & Kartesz. The diploids mainly colonize the Mediterranean region (except for the south-eastern part), while the polyploids predominate in all the other regions. Both taxa show an intense vegetative growth, but they have distinct breeding systems. The second objective of this study concerns the question of whether Ludwigia stands have an impact on ecosystems. We have study relations between Ludwigia growth and water quality, other primary producers, bacteria communities and macrofauna. We have investigated several mediterranean aquatic ecosystems mainly distinguished by their physical properties and their hydrological functioning

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Lefébure, Tristan. "Origine, évolution et mesure de la biodiversité des eaux souterraines : analyse moléculaire du genre Niphargus (Crustacea)." Lyon 1, 2005. http://www.theses.fr/2005LYO10151.

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Abstract:

Malgré des conditions de vie contraignantes, les eaux souterraines abritent une faune très diversifiée. Au sein du genre Niphargus et à partir d'outils moléculaires, ce travail teste tout d'abord l'impact des phénomènes de convergence sur l'estimation de la biodiversité. Parallèlement, l'influence de la stabilité et de la forte fragmentation du milieu sur l'origine de cette biodiversité sont analysées. Les résultats démontrent une forte sous-estimation de la biodiversité par la taxonomie morpho-anatomique et soulignent l'importance de la diversité cachée. Ce travail soutient également le rôle central des isolements géographiques dans l'évolution des organismes et l'émergence d'un fort endémisme, mais suggèrent néanmoins la possibilité d'importantes phases de dispersion

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Winiarski, Thierry. "Analyse systémique du fonctionnement de l'interface système naturel et système anthropisé : exemple de l'interface décharge aquifère." Lyon 1, 1994. http://www.theses.fr/1994LYO10322.

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Abstract:

Une methologie basee sur le concept systemique est appliquee a l'etude de la zone de transition entre un centre d'enfouissement technique (decharge) et un aquifere, afin de qualifier l'impact de ce type de traitement de dechets sur les eaux souterraines. Deux elements fonctionnels sont particulierement etudies: les bentonites, argiles habituellement utilisees dans les techniques de confinement et la zone non saturee, siege de reactions biophysicochimiques entrainant des transformations des solutions de percolation. Les proprietes de gonflement et de retention des bentonites calciques et sodiques sont etudies en fonction de solutions d'hydratation telles que l'eau et des lixiviats de cet de classe 2. Les gonflements mesures avec des lixiviats sont faibles par rapport a des eaux chargees. Un largage de sodium, suivi d'une adsorption de calcium et potassium est observe. Un modele physique permet une etude globale de cette interface situee entre le contact sol-dechets et la surface piezometrique de la nappe d'eau souterraine. Des mesures physico-chimiques permettent d'obtenir des informations sur le role de la zone non saturee d'un aquifere dans les mecanismes de transformations biophysicochimiques d'un lixiviat de decharge. Des phenomenes de stockage de cations et de nitrification sont observes

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Crespin, de Billy Véronique de. "Régime alimentaire de la truite (Salmo trutta L. ) en eaux courantes : rôles de l'habitat physique et des traits des macroinvertébrés." Lyon 1, 2001. http://www.theses.fr/2001LYO10173.

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Abstract:

Comprendre les fluctations d'abondance de la truite (Salmo trutta L. ) nécessite de déterminer les facteurs limitant sa production. Par exemple, la modification de l'habitat peut altérer la survie de cette espèce et modifier la disponibilité (abondance) et la qualité (vulnérabilité) des ressources trophiques. Dans ce contexte, j'ai étudié comment les caractéristiques des habitats et des proies (invertébrés aquatiques et terrestres) modifient les régimes alimentaires des truites. J'ai collecté des données de benthos, dérive et contenus stomacaux de truites, dans trois tronçons de cours d'eau des Pyrénées dont deux soumis à un débit réservé. Les résultats montrent que si la quantité de proies consommées varie à large échelle (tronçon: 10 au cube par m ), la composition des régimes change en fonction des conditions locales du milieu (macro-habitat: 10 au carré par m). Pour comprendre ces variations, j'ai analysé la vulnérabilité potentielle des proies face à un prédateur, en cochant leurs traits écologiques, comportementaux et morphologiques. J'ai ainsi observé que 1) les traits des proies potentielles (invertébrés benthiques) varient essentiellement avec les paramètres hydrauliques, et la quantité des ressources trophiques tend à augmenter avec la vitesse du courant ; 2) malgré les différences de régimes observées entre les habitats, la truite sélectionne les proies les plus vulnérables (ex : exposées au courants, mobiles, flexibles, tailles entre 8 et 16 mm); et 3) le rôle des traits des proies sur les régimes augment avec la diminution des caractéristiques torrentielles du milieu. Ainsi, l'utilisation des traits codant la vulnérabilité potentielle des proies est pertinente dans la compréhension des régimes alimentaires des truites, notamment dans les milieux aux faibles contraintes hydrauliques (débits réservés). Dans le cadre de l'évaluation de la qualité des milieux, ceux-çi devraient constituer un véritable complément aux outils de gestion déjà existants.

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Petit, Stéphanie. "Écologie et dangerosité des Pseudomonas aeruginosa des milieux aquatiques anthropisés." Thesis, Lyon 1, 2012. http://www.theses.fr/2012LYO10166.

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Abstract:

En santé publique, de nouveaux programmes de surveillance et de gestion sont à proposer notamment pour les masses d'eaux fortement affectées par l'urbanisation et les rejets urbains par temps de pluie. Les niveaux, les réservoirs et les sources de contamination microbiologique des milieux aquatiques doivent être évalués et identifiés, et leur incidence sur la dissémination des bactéries pathogènes et les risques d'exposition des populations humaines comprises. Parmi les agents pathogènes retrouvés dans les milieux hydriques, Pseudomonas aeruginosa représentent une préoccupation sanitaire majeure. A partir de deux sites expérimentaux, les objectifs de ce travail de thèse furent de définir la contribution des rejets d'eaux usées sur la prévalence de P. aeruginosa dans les cours d'eau récepteurs et d'étudier l'écologie des formes introduites dont ces habitats incluant leur dynamique spatiotemporelle. Les sédiments, les biofilms de surface (périphyton) et les végétaux aquatiques submergés, permettraient leur survie voire la multiplication de certains génotypes de Pseudomonas aeruginosa. La répartition des indicateurs de contaminations fécales et de la bactérie pathogène Aeromonas caviae ont également été étudiée. Il a été mis en évidence que les forces hydrauliques, le morpho-dynamisme de la rivière et les variations saisonnières étaient des facteurs structurants de la répartition des contaminants microbiens analysés. La dangerosité des souches isolées a été évaluée et montré que toutes les souches avaient un potentiel de virulence élevée. Ceci s'est confirmé par la détection de clones épidémiques majeurs au sein de la collection dont des souches apparentées aux clones PA14 ou C. Les capacités métaboliques de ces souches ont été étudiées dont leur antibio-résistance
In Public Health, new monitoring and management programs are needed, especially for the aquatic environments strongly affected by urbanization and urban wet weather discharges. The levels, reservoirs and sources of microbiological contamination of the aquatic environment should be assessed and identified, and their impact on the spread of pathogenic bacteria and the risk of exposure of human populations understood. Among the pathogens found in water environments, Pseudomonas aeruginosa is of major health concern. From two experimental sites, the objectives of this work were to define the contribution of wastewater discharges on the prevalence of P. aeruginosa in receiving watercourses and study the ecology of the introduced forms, including their spatiotemporal dynamic and preferential habitats. Sediments, surface biofilms (periphyton) and the submerged aquatic vegetations appeared to favour the survival or growth of some genotypes of Pseudomonas aeruginosa. The distribution of fecal indicator bacteria and of Aeromonas caviae were also studied. It was highlighted that hydraulic forces, the morpho-dynamics of the river and the seasonal vaiations were determinant factors in the distribution of the analyzed microbial contaminants. The health hazard of the clones found in these systems was estimated through indirect molecular approaches. It was shown that all Pseudomonas aeruginosa strains had a high virulence potential and that some were related to the PA14 and C clones which are spread worldwide and pathogenic

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Beffy, Jean-Luc. "Approche des structures ternaires en écologie par l'analyse en composantes principales à trois modes." Lyon 1, 1993. http://www.theses.fr/1993LYO10057.

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Abstract:

En ecologie, une partie importante des problematiques de recherche de typologies conduit a l'echantillonnage de descripteurs biotiques ou abiotiques dans le temps et l'espace sous certaines conditions experimentales. Un cadre general des etudes de ce type peut donc etre elabore a l'aide des quatre dimensions ecologiques de base: les descripteurs, les lieux et dates d'echantillonnage et les conditions experimentales. La prise en compte de trois dimensions parmi quatre definit des problematiques dites ternaires dont on peut essayer d'etablir une typologie globale en considerant pour chacune des dimensions des niveaux d'apprehension (niveaux taxonomiques, echelles spatiales et temporelles, pratiques experimentales) que l'on peut ensuite mettre en relation (meme interet accorde a chaque niveau, preference accordee a un niveau particulier,). Inspiree de recentes propositions en morphometrie, une approche des etudes mises en uvre en ecomorphologie fournit une illustration du cadre general propose. Lorsque le plan d'observation est complet, l'etude des memes descripteurs dans les memes lieux a differentes dates permet l'obtention de donnees tridimensionnelles que l'on peut organiser sous une forme cubique formalisee par l'archetype lieux x descripteurs x dates. L'integration d'hypotheses ou contraintes ecologiques souleve le probleme des transformations applicables sur les donnees recueillies. Partant de l'examen des travaux effectues sur ce theme en ecologie vegetale dans un cadre bidimensionnel, nous exposons un large eventail de transformations qui correspondent aux multiples points de vue que l'on peut privilegier dans l'abord de donnees tridimensionnelles. En psychometrie, le besoin d'un traitement approprie de donnees cubiques a suscite le developpement d'une famille de methodes statistiques adequates. Au sein de cet ensemble, l'analyse en composantes principales a trois modes, introduite comme une extension de l'analyse en composantes principales (tucker, 1963), constitue un outil methodologique de choix (kroonenberg, 1983). Privilegiant une perspective historique, nous presentons les fondements mathematiques, les solutions algorithmiques successivement proposees et les proprietes statistiques associees. L'interet de la methode dans la mise en evidence d'interactions ternaires exprimant des structures complexes est ensuite teste sur divers jeux de donnees obtenus en limnologie, en ichtyologie et dans l'etude de la vegetation aquatique

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Flammarion, Patrick. "Mesure in situ de l'induction du cytochrome P450 1A chez des cyprinidés d'eau douce : optimisation de l'interprétation." Metz, 1997. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/UPV-M/Theses/1997/Flammarion.Patrick.SMZ9749.pdf.

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Abstract:

La mesure de variables biologiques est complémentaire des analyses chimiques pour l'évaluation de la qualité de l'eau. Les biomarqueurs biochimiques détectent ainsi l'exposition d'organismes aquatiques à des polluants. Par exemple, l'induction de l'activité enzymatique erod chez le poisson est liée à la présence de hap, pcb et dioxines. Ce biomarqueur est couramment utilisé pour des évaluations ponctuelles mais une utilisation à grande échelle rend indispensable l'obtention de valeurs témoins chez des espèces sentinelles, ainsi que la quantification la plus précise possible des facteurs de variabilité tant chimiques que naturels. Nous avons donc réalisé une large collecte de données sur des cyprinides du bassin du Rhône dans des rivières polluées ou non. Les résultats obtenus permettent d'avancer des valeurs de référence pour l'activité erod de trois espèces : barbeau, chevaine et goujon. Des situations polluées ont aussi été étudiées et interprétées en liaison avec la pollution et les facteurs naturels de variabilité de la réponse erod (maturité sexuelle notamment). En parallèle, des expériences de laboratoire ont permis d'étudier et de quantifier l'influence de la dose de l'inducteur et de la maturité sexuelle ainsi que la sensibilité et la réversibilité de l'induction de l'erod. La détection complémentaire du cytochrome P450 1A par une méthode immunochimique a par ailleurs permis d'améliorer le diagnostic dans certains situations ou des phénomènes d'inhibition de l'activité étaient possibles. L'ensemble de ces résultats permettent de proposer, sur des critères statistiques, des classes d'induction de l'activité erod. La mesure de ce biomarqueur ainsi que l'interprétation des niveaux observés ont désormais une maturité suffisante pour s'engager dans une phase de normalisation de la mesure pour une utilisation dans des réseaux de suivi de la qualité des écosystèmes aquatiques
Biological assessment is useful in addition to conventional chemical analyses to monitor the water quality. Biochemical markers are early warning systems of the exposition of aquatic organisms to pollutants. Among them, the measurement of the fish EROD induction enables the detection of PAHs, PCBs and dioxines. The biomarker was used as a fitted tool in numerous limited field studies. Yet, in a large scale biomonitoring perspective, it is necessary to determine baseline values in sentinel fish species as well as to precisely quantify the biotic and abiotic sources of variability. Cyprinids were thus sampled in the Rhône river watershed in low polluted and in polluted areas. Reference baseline EROD activities were calculated for three species : barbel, chub and gudgeon. The data from the polluted sites were related to contamination and female sexual maturity. In the same way, laboratory experiments provided information on the effect of the level of the inducer, the influence of the sexual maturity as well as the sensitivity and reversibility of the EROD induction. The immunodetection of the cytochrome P450 1A protein provided better assessment of results where an inhibition effect could have occured. With all results, a classification of the EROD levels was proposed through statistical analysis of the EROD distributional properties. Both measurement and interpretation of the EROD biomarker are then mature enough to begin a normalisation procedure in a biomonitoring perspective

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Fakhri, Milad. "Interactions de deux sources continentales, naturelle et anthropogénique, sur les caractéristiques physico-chimiques et biologiques du milieu marin de Batroun au Liban Nord (Méditerranée Orientale)." Aix-Marseille 2, 2005. http://theses.univ-amu.fr.lama.univ-amu.fr/2005AIX22085.pdf.

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Abstract:

L'influence des rejets directs de l'usine chimique de Selaata et celle de la rivière saisonnière Al-Jaouz sur les eaux côtières de Batroun (Nord Liban, Méditerranée Orientale), ainsi que leurs interactions, sont à la base de cette étude pour mesurer leurs impacts sur un environnement marin oligotrophe. Pour suivre les variations spatiales et temporelles à grande et petite échelles des paramètres physico-chimiques, biogéochimiques et biologiques, plusieurs stratégies d'échantillonnage ont été utilisées pendant 26 mois de mai 2001 à juin 2003 sur l'eau de surface : réseau de stations fixes, mesures en continu à haute fréquence d'enregistrement, variations diurnes (12 heures) en un point fixe, radiale perpendiculaire à la côte, expériences de la drogue dérivante. Ces études ont été complétées par celles de sédiments (milieu plus intégrateur des variations à long terme) en surface et en profondeur. Dans l'eau, la signature (orthophosphates, pH, eaux plus chaudes) de l'usine est marquée en permanence. Elle est très forte à son voisinage, et se dilue mais reste repérable dans toute la zone d'étude. Il y a une bonne concordance entre les moyennes annuelles des valeurs de l'eau de surface et la composition des sédiments, ce qui confirme cette permanence. Au contraire, la signature (nitrates, dessalure, eaux plus froides) de la rivière est saisonnière. L'interaction de ces deux influences sur les eaux côtières et leur extension spatiale varient en fonction de leur débit propre, mais aussi du régime des vents comme le montrent les différentes stratégies de mesures utilisées. Sur le plan biologique, au voisinage de l'usine, on constate une chute des effectifs phytoplanctoniques et de la chlorophylle a, ainsi que des déformations morphologiques, mais sur l'ensemble de la zone, la poussée printanière reste très marquée, en particulier près de l'embouchure de la rivière Al-Jaouz (source de nitrates). Par comparaison avec d'autres eaux côtières libanaises, celle-ci a donc un effet fertilisant qui ne semble pas inhibé par l'impact de l'usine. En revanche, le reste de l'année, les très forts apports permanents en orthophosphates ne provoquent pas de poussée, conséquence sans doute de la température et des faibles teneurs en nitrates. Au niveau benthique, les indicateurs biologiques utilisés (méiofaune et chlorophylle a) montrent que l'effet de l'usine est très limité dans l'espace dans les sédiments des stations situées en face du rejet nord-ouest
This study is based on both influences of the direct discharges of Selaata chemical plant and of Al-Jaouz seasonal river on Batroun coastal water (North Lebanon, Eastern Mediterranean), and on their interactions to measure their impacts on an oligotrophic marine environment. In order to follow the spatial and temporal variations at big and small scales of the different physico-chemical, biogeochemical and biological parameters, many sampling strategies were used during 26 months (from May 2001 till June 2003) on surface water: a classical strategy of a network of fixed stations, continuous measurements at high frequency, diurnal variations (12 hours) at a fixed point, a perpendicular radial to the coast, experiments of the buoyant drogue. These measurements were completed with sediments studies (a more integrated medium for long term variations) in surface and in depth. In water, the signature (orthophosphates, pH, warmer water) of the chemical plant is permanently marked. It is so strong in its vicinity; it is diluted but well detected in the whole area of the study. Strong agreements, between the annual mean values of surface water and the sediments compositions, confirm this permanence. But the signature (nitrates, water dilution, cooler water) of Al-Jaouz River is seasonal. The interaction of these two influences on coastal water and their spatial extension vary in function of their own flow, and also on wind conditions, like it was found in the different adopted strategies. On the biological plan, a decrease in phytoplankton density and chlorophyll a concentrations is noticed in the proximity of the plant, accompanied with morphological deformation. But, all the area shows a well marked spring blooming, in particularly in front of Al-Jaouz River (source of nitrates). In comparison with other Lebanese coastal waters, the river has a fertilising effect not inhibited by plant's impact. On the other hand, the permanent and strong enrichment of orthophosphates during the remaining of the year doesn't cause cells proliferation, and this is due to the influence of temperature and the low concentrations of nitrates. At benthic level, the biological indicators used (méiofaune and chlorophyll a) show that the effect of the chemical plant is spatially limited to the sediments of stations located in front of the north-western emissary

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Vasseur, Christophe. "Rôle du rayonnement ultraviolet-B sur la structure et le fonctionnement du réseau trophique microbien de la Polynie North Water (75-79°N), Arctique canadien." Aix-Marseille 2, 2003. http://www.theses.fr/2003AIX22103.

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Xambeu, Isabelle. "Oxydation biologique du manganèse par les bactéries libres ou fixées, des eaux souterraines." Lyon 1, 1990. http://www.theses.fr/1990LYO10067.

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Abstract:

L'eau de la nappe de l'ile de la motte contient de 0,6 a 1 mg. L##1 de mn(ii). Pour eliminer le manganese indesirable, une station de demanganisation a ete construite en 1986. Les boues de lavage de la station contiennent une abondante microflore filamenteuse plus ou moins incrustee d'oxydes de manganese et constituee principalement de bacteries de type leptothrix. Ces boues de lavage ont servi a l'ensemencement de mini-filtres de laboratoire ou de pilotes industriels et ont permis un demarrage rapide de la demanganisation. En mini-filtre, une demanganisation totale n'a pas ete possible lorsque les boues avaient ete sterilisees ou lorsque l'eau d'alimentation contenait de l'azoture de sodium. L'apport de matiere organique exogene dans l'eau d'alimentation a inhibe la demanganisation; l'extrait de levure a meme provoque une importante solubilisation du manganese. Un apport de phosphate dans l'eau a provoque une diminution de la proportion des bacteries de type leptothix au profit des bacteries de type crenothrix. Il se produit une evolution des bacteries engainees du type leptothrix vers le type crenothrix; ces dernieres pourraient etre une simple variation morphologique d'une ou de plusieurs especes de leptothrix. Ceci a ete accompagne d'une inhibition partielle de la demanganisation. Deux souches pures ont ete etudiees. Elles n'excretent pas dans le milieu de molecule permettant l'oxydation du mn(ii), mais un contact entre le mn(ii) et les cellules et la presence d'une source de carbone organique sont necessaires. L'oxydation du mn(ii) par les deux souches est inhibee, au moins partiellement, par l'azoture de sodium et le chloramphenicol

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Frémaux, Bastien. "Écologie des Escherichia coli producteurs de Shiga-toxines (STEC) dans les effluents d'élevages bovins et le sol." Lyon 1, 2007. http://tel.archives-ouvertes.fr/docs/00/20/01/18/PDF/MANUSCRIPTTHESEFINAL.pdf.

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Abstract:

Les Escherichia coli entérohémorragiques (EHEC) sont considérés comme l’un des plus importants groupes de pathogènes émergents responsables de toxi-infections alimentaires. Depuis ces dix dernières années, l’environnement est de plus en plus incriminé dans les épidémies à EHEC. Dans cette étude, nous nous sommes intéressés à la prévalence des E. Coli producteurs de Shiga-toxines (STEC) dans les exploitations laitières ainsi qu’à leur survie dans les effluents d’élevages et le sol. Au sein des exploitations laitières, une grande diversité de souches STEC, capables de persister sur de nombreux supports (abreuvoirs, murs et sol des enclos, etc), a été observée. Dans les effluents d’élevages (fumier et lisier bovins non traités), la survie des STEC non-O157 a été évaluée à plus de 90 jours. Lorsque les tas de fumier sont retournés (pratique d’assainissement menée par les exploitants) la survie est de seulement 45 jours ; la température élevée au cœur des andains (≥ 65°C) est associée au déclin important des STEC. En ce qui concerne la survie dans les sols, nous avons montré qu’in vitro les souches STEC O26:H11 persistaient pendant plus d’une année dans différents types de sols mélangés à du fumier, même en présence de taux d’humidité faibles (< 0,08 g H2O g-1 sol sec). La température ambiante (i. E. 20°C versus 4°C) est significativement associée (P<0,001) à une inhibition marquée des STEC. In situ, la survie et le transfert des STEC dans le sol à partir de bouses naturellement contaminées ont également été évalués dans différentes stations d’un bassin versant d’altitude situé dans les Alpes du Nord. Les STEC sont capables de persister dans la matière fécale et sont détectés dans le sol rhizosphérique sous-jacent (jusqu’à 20 cm de profondeur) pendant environ 2 mois, jusqu’à la disparition complète des bouses. Dans la rhizosphère, la survie des STEC peut être affectée par des populations microbiennes productrices de métabolites antibactériens. En prenant comme modèle de populations telluriques antagonistes, une souche de Pseudomonas productrice d’un antibiotique, le 2,4-diacétylphloroglucinol (Phl), aucun effet négatif de la production de cet antibiotique sur la survie d’E. Coli O157:H7 dans la rhizosphère du blé n’a pu être cependant mis en évidence. L’ensemble de ces résultats suggère que l’environnement constituerait un réservoir important en STEC dont le contrôle passe notamment par le respect de mesures d’hygiène rigoureuses en exploitations
Enterohemorragic Escherichia coli (EHEC) is one of the most important foodborne pathogens. During the last decade, cattle environment has frequently been implicated as the cause of EHEC outbreaks. This work aims to study the prevalence of Shiga toxin-producing E. Coli (STEC) cells on dairy farms, and their survival in cattle effluents and soil. In dairy farms, a wide diversity of STEC strains, which were able to persist on various materials (water troughs, pen walls, soil, etc) was observed. In cattle effluents (untreated cattle manure and slurry), non-O157 STEC strains could be detected during more than 90 days. In turned manure heaps, the STEC survival is of only 45 days, and the high temperature recovered in the main body of the manure heaps (≥ 65°C) is associated with the serious decrease of STEC cells number. In vitro, STEC O26 strains were detected in various manure amended-soil types for at least 1 year, even in presence of low moisture levels (i. E. Less than 0,08 g H2O g-1 dry soil). The ambient temperature (i. E. 20°C versus 4°C) is significantly associated (P<0,001) with the highest STEC count decline in all soils tested. In situ, the persistence of STEC and their transfer from naturally contaminated bovine feces to subsoil layers were determined in different pasture units of a high mountain watershed located in North Alps. STEC are able to persist in bovine feces, and to be transferred in subsoil layers at a depth up to 20 cm, over a period of approximately 2 months, until the fecal material had completely decayed. In the rhizosphere, STEC survival may be affected by antibiotic-producing microbial populations. However, using a 2,4-diacetylphloroglucinol (Phl)-producing Pseudomonas strain as a model of biocontrol rhizobacteria, any negative effect of the Pseudomonas production of Phl on E. Coli O157:H7 survival in wheat rhizosphere was observed. According to these results, cattle environment constitutes a second significant reservoir of STEC cells, and effective measures to prevent STEC cells entry into environment should be adopted

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Besse, Jean-Philippe. "Impact environnemental des médicaments à usage humain sur le milieu récepteur : évaluation de l'exposition et des effets pour les écosystèmes d'eau douce." Thesis, Metz, 2010. http://www.theses.fr/2010METZ023S/document.

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Abstract:

Un nombre important de molécules pharmaceutiques sont consommées en France et peuvent contaminer le compartiment aquatique, ce qui a conduit les gestionnaires et le public à s’interroger sur la présence et l’impact de ces substances dans l’environnement. Compte du nombre important de molécules consommées en France, il est nécessaire, avant d’établir un protocole de surveillance des milieux, d’établir une liste de molécules prioritaires à surveiller. Le travail présenté ici s’est donc attaché à proposer une liste pertinente de molécules à rechercher dans les eaux de surface, en tenant compte des concentrations attendues dans l’environnement et des effets biologiques sur les organismes aquatiques. Plusieurs méthodologies ont été mises en place, en fonction des substances médicamenteuses évaluées, et en fonction de la disponibilité des données. Au final, 300 molécules parentes couvrant majorité des classes thérapeutiques utilisées, ainsi qu’une cinquantaine de métabolites humains ont été évalués et des listes de molécules prioritaires justifiables du point de vue scientifique et de l’état actuel des connaissances ont pu être définies. Ce travail a par ailleurs permis de dégager les conclusions suivantes : La question de l’impact environnemental des substances médicamenteuses doit être abordé sous l’angle des mélanges et de leurs effets associés aux autres contaminants. Il est nécessaire de limiter autant que possible la dissémination environnementale des médicaments. La bonne gestion de cette problématique passera par l’entente entre les différentes agences et services responsables de la santé publique et par l’implication des industriels et des professionnels de la santé
A high number of pharmaceuticals are used in France and can reach the aquatic environment. This observation have contributed to a growing concern for authorities in targeting and quantifying these substances in freshwaters. Considering the high number of molecules used in France, it is necessary, prior to implement any comprehensive monitoring survey in freshwaters, to build a list of priority pharmaceuticals in terms of their risk for the aquatic environment. The work conducted here aims at proposing reliable lists of priority pharmaceuticals, based on expected environmental concentrations and biological effects on aquatic non-target organisms. Several methodologies were implemented, depending on the type of pharmaceuticals assessed and the availability of data. Finally, 300 parent molecules and 50 human metabolites were screened and scientifically sound priority lists were built. Moreover, this work allowed to draw the following conclusions : The issue of pharmaceutical mixtures and their interactions with other environmental polutants needs to be addressed. Preventing the rejection of human pharmaceuticals in the aquatic environment should be a priority. For a good management of the environmental risk of pharmaceuticals, an agreement between public health authorities, environment authorities on one hand, and pharmaceutical industries and professionals on the other hand, is necessary

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Soulard, Christophe. "Les agriculteurs et la pollution des eaux par les nitrates : proposition d'une géographie des pratiques." Paris 1, 1999. http://www.theses.fr/1999PA010596.

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Abstract:

Les questions d'environnement conduisent à étudier d'un nouveau point de vue les relations des agriculteurs à leur espace de travail. Nous proposons une géographie des pratiques dont l'objet est la confrontation des conceptions et pratiques de l'espace par les agriculteurs, aux catégories de l'espace, du milieu et du territoire, mobilisées par d'autres acteurs pour résoudre un problème de pollution par les nitrates. La méthode de recherche repose sur un dispositif d'enquêtes auprès d'agriculteurs concernés par un problème local de pollution. Nous étudions d'abord la définition des pratiques "non polluantes" proposées aux agriculteurs. L'analyse des effets locaux de la mise en place de politiques de réduction des pollutions dans deux petites régions de Bourgogne révèle une diversité d'interprétations du problème pose selon les petites régions, les communes et les agriculteurs. Cette diversité est expliquée par l'agencement de trois composantes spatiales du problème posé : l'espace de perception des risques de pollution agricole, l'espace d'application des politiques préventives et l'espace de gestion locale de l'eau potable. Nous étudions ensuite la mise en œuvre par les agriculteurs des pratiques "non polluantes". L'étude des pratiques d'ajustement à la parcelle de la fertilisation azotée du blé permet d'identifier différentes formes de prise en compte de l'hétérogénéité des "terres", reliées à deux faits géographiques majeurs : les logiques d'organisation spatiale des déplacements sur les parcelles et les stratégies de répartition des risques entre parcelles. En conclusion, nous proposons une grille de lecture des composantes spatiales qui interviennent dans le traitement d'un problème de pollution. Cela permet une réflexion sur l'intérêt de renouveler l'approche géographique de l'activité agricole pour comprendre et améliorer les relations entre l'agriculture et l'environnement
Environnemental questions lead researchers to study the relations of farmers with their work space. In this thesis, i propose a geography of the practices whose object is the confrontation of perceptions and practices of space by farmers, with the categories of space, milieu and territory, used by other actors to solve a question of pollution. The method of research consist in survey with farmers whose are concerned by a local problem of pollution. First, I study the definition of the "non-polluting" practices recommended to the farmers. The analysis of the local effects of environmental policies in two local areas of burgundy reveals a diversity of interpretations of the question according to the areas, the districts and the farmers. This diversity is explained by the combination of three space components of the local question : the space of perception of agricultural pollution, the space of application of environmental policies and the space of local management of drinking water. Then, I study the adoption of the "non-polluting" practices by the farmers. The study of the practices of adjustment to the field of the nitrogen fertilisation of wheat makes it possible to identify various forms of appreciation of the heterogeneity of the soils, connected to two major geographical facts : the logic of spatial organisation of field operations and the strategies of risk limitation between fields. In conclusion, I propose a grid to read the space components which intervene in the treatment of a problem of pollution. I conclude with a reflection on the issue of renewing the geographical approach to the agricultural activity with the end of understanding and improving the relations between agriculture and environnement

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Teillac-Deschamps, Pauline. "Introduction en milieu anthropisé : cas de la tortue de Floride en Ile-de-France." Paris 11, 2007. http://www.theses.fr/2007PA112319.

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Abstract:

Préserver la planète, les espèces, et les espaces qui la composent, est l’enjeu majeur de la biologie de la conservation. Les invasions biologiques, conséquence d’introductions réussies, sont reconnues comme une des principales causes d’extinction d’espèces. Bien gérer ces espèces s’appuie sur la connaissance du fonctionnement des écosystèmes d’introduction et de l’impact des espèces introduites sur celui-ci. Cependant seulement une faible part des introductions parvient à une invasion. Les décisions concernant ces espèces mêlent souvent considérations écologiques et éthiques. Dans un monde très anthropisé, la seule prise en compte de la nature sauvage ne peut conduire à une préservation durable de la biodiversité. L’intégration de l’Homme aux processus de conservation est indispensable. De l’écologie de la réservation, et de la restauration, une écologie de la réconciliation s’est développée ces dernières années, mettant l’accent sur le besoin de développer les activités humaines en intégrant la protection de la nature. Au-delà de la réconciliation des activités humaines dans le respect de la nature, certains auteurs commencent à soulever le problème de la déconnexion des citadins vis-à-vis de cette nature qu’ils ne connaissent plus et ne fréquentent plus. Dans ces contextes urbains les espèces introduites, n’ont peut-être pas la même place que dans des contextes de réserves où la pression anthropique est beaucoup plus faible et où l’on trouve des espèces en voie d’extinction. Dans le cadre de ma thèse, j’ai abordé ces différentes thématiques en étudiant l’introduction de la tortue à tempes rouges, Trachemys scripta elegans, dans les écosystèmes d’eau douce d’Ile-De-France
Preserving our planet, the species and the spaces that comprise it, is the main goal of Conservation Biology. Biological invasions, after successful introductions, are recognised to be one of the major cause of species extinction. Being able to manage those species rely on the knowledge of ecosystem functioning, for the introduced ecosystems. However, only a few part of introduced species become invasive. Decisions over these species often mix biological, ecological aspects and ethical considerations. In a world with a growing human pressure, taking only wilderness into account for preserving biodiversity is not sustainable. Integrating human beings is a key factor for conservation processes. From restoration and reservation ecology, new reconciliation ecology is of growing importance for a decade, that emphasis the need to develop human activities with respect to the wilderness needs. More than reconciliation, some authors now underline the frequent disconnection between city dwellers and the nature they do not even know anymore. The management of exotic species in urban contexts might not be the same than in reserve areas where lots of endangered species are. During my PhD, I studied a particular case of introduced species that mixes ecological and social aspects: the introduction of a former exotic pet, the Slider turtle, Trachemys scripta elegans, in French freshwater ecosystem

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Montfort, Patrick. "Étude écologique, immunologique et pathogénique des Aeromonas mobiles dans les milieux aquatiques et à travers différents systèmes épurateurs." Montpellier 2, 1987. http://www.theses.fr/1987MON20279.

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Abstract:

Evolutions spatio-temporelles des bacteries aeromonas dans des eaux superficielles et saumatres plus ou moins usees, et dans differents epurateurs des eaux usees. Distribution au sein du genre aeromonas, des especes a. Hydrophila, a. Caviae, et a. Sobria dans ces memes milieux

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Chouteau, Céline. "Développement d'un biocapteur conductimétrique bi-enzymatique à cellules algales." Lyon, INSA, 2004. http://theses.insa-lyon.fr/publication/2004ISAL0066/these.pdf.

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Abstract:

La préservation des écosystèmes aquatiques nécessite des outils d’alarme précoce comme les biocapteurs pour une surveillance in situ et en continu. De tels outils peuvent fournir des informations quant à la nature des polluants à condition d’être conçus pour répondre de manière spécifique. Ce travail propose un biocapteur conductimétrique utilisant des cellules algales Chlorella vulgaris immobilisées. Ces microalgues possèdent des enzymes membranaires, notamment certaines phosphatase alcalines et cholinestérases dont l’activité peut alors être facilement mesurée sur cellule entière sans extraction préalable. Le principal objectif de ce travail a été la mise au point de la détection de ces activités avec les biocapteurs afin de détecter, dans le milieu aquatique, la présence de composés toxiques inhibiteurs des activités enzymatiques considérées. La première étape a donc consisté à optimiser l’immobilisation des cellules algales sur les électrodes ainsi que les protocoles de mesures des activités phosphatases alcalines et cholinestérases. Des essais de toxicité ont ensuite été réalisés afin d’étudier les effets de métaux lourds ainsi que de pesticides organophosphorés et carbamates sur les activités phosphatase alcaline et cholinestérase. Ces biocapteurs permettent ainsi la détection de Cd2+ et Zn2+ avec une limite de détection proche de 10ppb. Les premières expérimentations réalisées avec le méthyl-paraoxon ont montré, pour leur part, que celui-ci inhibe significativement l’activité cholinestérase à la différence du carbofuran et du méthyl-parathion
The protection of aquatic ecosystems requires early warning systems for on line and in situ monitoring. These tools can give information on the family of pollutants when they are designed to respond specifically. This works aims at developing a conductometric biosensor using immobilized algal cells. These microalgae provide a large number of membrane-bound enzymes (particularly sorne alkaline phosphatases and cholinesterases). Their enzymatic activities can then be detected easily using these sensors. . First, algae immobilisation on electrodes was optimised as well as protocols for the detection of enzymatic activities. Then, toxicity tests were performed to detect toxic compounds in aquatic ecosystems. These biosensors have detected Cd2 + and Zn2 + down to 10ppb. First experiments with paraoxon-methyl have shown that it inhibits cholinesterase activity significantly

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Hayer, Frank. "Estimation de la contamination du milieu aquatique par les composés organo-halogénés (AOX et EOX) : application à l'étude d'accumulation et de relargage des EOX par Anodonta cygnea L., exposé in situ aux effluents d'une usine de pâte à papier." Metz, 1997. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/UPV-M/Theses/1997/Hayer.Frank.SMZ9745.pdf.

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Abstract:

Les composés organo-halogènes sont, contrairement à ce que l'on a souvent pensé, ubiquistes dans l'environnement, et leurs origines diverses sont aussi bien naturelles qu'anthropiques. L'utilisation des paramètres de groupe aox (composés organo-halogènes adsorbables) et eox (composés organo-halogènes extractibles) permet de palier les problèmes analytiques de l'identification individuelle de ces composés, dont une grande majorité reste inconnue de nos jours, et de les quantifier dans les différents compartiments de l'écosystème aquatique : eau, sédiments et organismes. L'étude de quatre cours d'eau a permis de mettre en évidence et de confirmer l'existence de multiples sources de composés organo-halogènes dans l'eau et les sédiments du nord-est de la France. Parmi celles-ci, une usine de pâte à papier blanchissant au chlore se distingue des autres, et se caractérise par des rejets chroniques et des concentrations élevées en aox dans l'eau et les sédiments du milieu récepteur. Afin de rendre compte des effets de tels effluents sur les organismes, et de quantifier la fraction de micropolluants biodisponibles, quatre espèces de mollusques aquatiques, anodonta cygnea l. (bivalve unionidae), unio pictorum l. (bivalve unionidae), dreissena polymorpha p. (bivalve dreissenidae) et viviparus viviparus l. (gasteropode viviparidae) ont été transférés et exposés en amont et en aval des rejets de l'usine. L'anodonte, anodonta cygnea l. , a été retenu comme indicateur biologique pour plusieurs raisons : sa bonne résistance aux effluents ; sa taille suffisamment grande pour permettre l'étude sur des organismes individuels et des organes ; son taux élevé d'accumulation de composés organo-halogènes. L'accumulation et le relargage de ces micropolluants par l'anodonte se font de manière différente selon les organes considérés, et dépendent des propriétés physico-chimiques des composes organo-halogènes présents dans l'effluent
Halogenated organic are more widespread in the environment than previously assumed, and originated either from natural and antropogenic sources. The use of the sum parameters aox (adsorbable organic halogens) and eox (extractable organic halogens), allows to palliate the analytical problems of individual identification of those compounds, among which a great majority is still unknown, and enables also their quantification in the different compartments of the aquatic environment : water, sediments and organisms. The study of four water courses has permitted to bring to the fore, and to confirm, the existence of several sources of organic halogenated compounds in the water and the sediments of North-eastern France. Among them, a chlorine bleaching pulp and paper mill is distinguished, and characterised by chronic emissions and high aox concentration in the water and the sediments of the receiving medium. In order the account the effects of such effluents on organisms, and to quantify the bioavailable fraction of micropolluants, four species of aquatic molluscs, Anodonta cygnea L. (bivalve unionidae), unio pictorum L. (bivalve unionidae), Dreissena polymorpha P. (bivalve dreissenidae) et Viviparus viviparus L. (gastropod viviparidae), were transferred and exposed up and down stream of the mill. The swan mussel, Anodonta cygnea L. , has been retained as biological indicator for several reasons : its good resistance to the effluents ; its large size allowing studies on individual organisms and organs ; its high accumulation rate of halogenated organics. The accumulation and the release of these micropollutants by the mussel differ according to the considered organ, and depend on the physico-chemical characteristics of the organic halogenated compounds present in the effluent

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Julien, Karen. "La peau sur les eaux : transmissions de savoir-faire, mémoires familiales et dynamiques territoriales en Grande Brenne." Poitiers, 2011. http://www.theses.fr/2011POIT5024.

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Abstract:

La Grande Brenne (Indre) compte plus de 2 200 étangs organisés en chaînes et répartis sur environ 80 000 hectares. Ces étangs se trouvent généralement blottis au coeur de vastes domaines où propriétaires, gardes et villageois s'adonnent aux activités piscicoles et cynégétiques. L'eau est partout en Grande Brenne, et c'est donc autour d'un réseau hydrographique complexe que la société brennouse s'organise, se cherche, se structure. Et ce sont bien les familles ancrées sur ce territoire depuis des générations, qui ont connu, et connaissent encore aujourd'hui, le privilège de la maîtrise de l'eau. Maîtrise de l'eau qui engendre la maîtrise du territoire ainsi que différentes formes de domination sociale et symbolique. En Grande Brenne, l'eau constitue donc un enjeu écologique, économique, mais aussi et surtout social et symbolique. En effet, la gestion agricole, piscicole et cynégétique du territoire est prise en charge par les grands propriétaires et leurs réseaux sur un mode familial et intimiste quant aux représentations de la « nature ». Des représentations qui sont aujourd'hui concurrencées par le regard identitaire fondé sur le discours patrimonial des élus locaux, ainsi que par le regard environnementaliste porté par ceux que l'on appelle ici « les écolos ». Autant d' « idéologies spatiales » qui s'affrontent au sein de la société brennouse
Grande Brenne (Indre) has more than 2,200 ponds organized in chains and distributed on approximately 80,000 hectares. These ponds are usually snuggled up in the heart of vast properties where owners, guards and the network of villagers devote to fishing and game activities. Water is everywhere in Grande Brenne, and it is thus around the complex river system that the brennouse society gets organized, looks for itself, forms itself. And these are the families who have been truly living and utterly anchored in in this territory for generations, who have known, and still know today, the privilege to control water. The control of water which engenders the control of the territory as well as various forms of social and symbolic domination. In Grande Brenne, water is an ecological and economic asset, but is also social logically and symbolically very important. In the sense that the agricultural and cynegetic management of the territory, as well as the fish, are under the responsability of the big property owners and their network, on a familial and intimate model as for the representations of the "nature". These representations are henceforth competed by a feeling of identity based on the patrimonial speech built by locally elected representatives, as well as the environmental friendly ethic carried by those whom we call "the Greens". So many "spatial ideologies" which are in confrontation within the brennouse society

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Di-Ruggiero, Jocelyne. "Écologie et physiologie des bactéries réduisant le manganèse : exemple de la nappe alluviale du Rhône, Avignon (Vaucluse)." Lyon 1, 1989. http://www.theses.fr/1989LYO10085.

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Abstract:

La présence de manganèse dans les eaux souterraines pose des problèmes au niveau des installations de captage, des réseaux de distribution (colmatage, fatigue des pompes), et altère la qualité physico-chimique de l'eau. Cette étude a eu pour but, en prenant en exemple une nappe aquifère de la vallée du Rhône (plaine alluviale d'Avignon, Vaucluse), de montrer l'incidence des activités microbiennes dans la mobilisation du manganèse. L'eau de cette nappe présente depuis plusieurs années des teneurs en manganèse dissous supérieures à 1 mg/l. Des analyses microbiologiques ont mis en évidence la présence dans les sédiments aquifères de bactéries toujours nombreuses et potentiellement très actives dans la réduction des nitrates, du manganèse et des sulfates. Des analyses d'échantillons d'eau, de vase et de sédiment, prélevés dans l'ensemble de l'aquifère, ont montré les conditions physico-chimiques susceptibles d'orienter les activités des microorganismes : le PH reste voisin de 7, le potentiel d'oxydo-réduction s'abaisse jusqu'a 400 mv dans la vase, il demeure assez bas au niveau des piézomètres. L'ensemble des sédiments de l'aquifère est hétérogène du fait de l'existence de lônes et paléolônes. La fraction solide de tous les échantillons contient du manganèse sous forme oxydée. Au laboratoire, des échantillons de vase et sédiment contenant la microflore native, incubes en atmosphère confinée, provoquaient la solubilisation du manganèse et une diminution du potentiel d'oxydo-réduction à des valeurs comprises entre +10 et 380 mv. Des cultures pures de 88 souches bactériennes, isolées de ces échantillons, réduisaient les oxydes de manganèse à des potentiels redox de +280 à +100 mv, le PH variant de 7,2 à 5,7. Si dans de nombreux cas l'abaissement du PH et du potentiel d'oxydo-réduction suffisait à réduire le manganèse dans le milieu (réduction non spécifique), dans d'autres cas les bactéries semblaient catalyser spécifiquement la réduction à un potentiel redox plus élevé (réduction spécifique), ne permettant pas une solubilisation spontanée des oxydes de manganèse. Deux souches isolées de l’aquifère ont été étudiés plus en détail. L’une des souches excrète une molécule dialysable, réduisant le manganèse, dont la synthèse est inductible. La réduction par l’autre souche nécessite le contact entre les cellules bactériennes et les oxydes de manganèse ; dans ce cas, l’hypothèse d’une « respiration manganèse » peut être envisagée.

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Bruno, Valérie. "Etude expérimentale et modélisation du transfert du radium dans un écosystème aquatique simplifié." Montpellier 2, 1990. http://www.theses.fr/1990MON20274.

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Abstract:

Le suivi du transfert du radium est realise au sein d'un ecosysteme aquatique experimental simplifie constitue de quatre niveaux trophiques. L'eau et le sediment constituent les deux supports physiques a partir desquels les autres maillons de l'ecosysteme pourront se contaminer, scenedesmus obliquus represente le producteur primaire, daphnia magna, gammarux pulex et chironomus sp. , les consommateurs de premier ordre; cyprinius carpio le consommateur de deuxieme ordre et enfin salmo gairdneri le super-predateur de l'ecosysteme. Chaque transfert est traduit par une equation mathematique ajustee grace a une analyse theorique des resultats experimentaux et representant l'evolution de la concentration en radium dans le compartiment considere. A partir de ces resultats un modele mathematique permettant de simuler la contamination de l'ecosysteme par du radium est propose. Ce modele prend en compte differents parametres: le type de contamination (chronique ou aigue suite a un accident), le type d'ecosysteme concerne par la contamination (etang ou riviere), la saison pendant laquelle a lieu la contamination (chaude ou froide). Les resultats obtenus avec le modele sont en accord avec les valeurs de terrain sur le niveau de contamination des poissons vivants dans l'environnement aquatique des sites miniers; en particulier ils mettent en evidence la preponderance de la voie trophique dans la radiocontamination de ces poissons

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Triffault-Bouchet, Gaëlle. "Effets sur les écosystèmes aquatiques lentiques des émissions de polluants provenant de différents modes de valorisation/élimination de déchets - Application à des mâchefers d'IUOM et à des boues de dragage de canaux." Chambéry, 2004. http://www.theses.fr/2004CHAMS004.

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Abstract:

La valorisation des déchets a été favorisée par la loi du 13 juillet 1992 et la définition de la notion de déchets ultimes. L'impact de deux scénarios d'études ont été évalués vis-à-vis des écosystèmes lentiques : valorisation de mâchefers d'incinération d'ordures ménagères (MIOM) en technique routière et immersion de sédiments de dragage en gravière. Ces travaux devaient apar ailleurs permettre de compléter la méthodologie d'évaluation de l'écocompatibilité des déchets, mise au point par l'ADEME. Le potentiel toxique des matrices a été évalué à l'aide d'eeais en microcosmes. Cinq sédiments de dragage ont été étudiés : (i) en condition statiques, (ii) pour 3 rapports eau/sédiment et (iii) 3 conditions de renouvellement de la colonne d'eau. Les percolats de MIOM, obtenus à l'aide d'un lysimètre, ont été évalués à l'aide de 4 essais monospécifiques, d'essais en microcosmes de 2 litres en conditions statiques et d'un essai en microcosmes de 100 litres. Les 5 sédiments des dragage ont été classés au vu de leur potentiel toxique. Quatre des sédiments présentent un potentiel toxique élévé dont des risques d'eutrophisation du milieu récepteur. Les critères d'effets mesurés ont été classés, la survie de Hyalella azteca étant le plus sensible. Les risques liés à l'immersion des sédiments sous eau ne sont pas acceptables pour ces 5 sédiments. Des recommandations quant au volume de sédiement à immerger et aux conditions de ces dépôts ont été émises. L'impact ds percolats de MIOM est avéré pour l'ensemble des espèces tests. Le cuivre semble être à l'origine des effets mesurés. Il apparaît comme un contaminant majeur des percolats de MIOM. Les risques liés à ce scénario de valorisation des MIOM ne sont pas négligeables pour l'écosystème lentique récepteur. Des recommandations pour une mise en oeuvre dans les meilleures conditions possibles ont été émises. Cette étude a enfi souligné l'intéret d'utiliser les essais en microcosmes pour évaluer l'impact de matrices contaminées vis-à-vis d'écosystèmes lentiques. Certains aspects du protocole restent, à ce jour, à optimiser afin d'optenir, notamment, des niveaux de variabilité acceptables pour l'ensemble des paramètres suivis
Waste reused has been promoted by the definition of final wastes (law of the 13/07/92). The impact of two scenarios against lentic ecosystems was studied : one deals with municipal solid waste incineration bottom ashes (MSWIBA) reused in road embankment, the other with under water deposition of dredged materials in a gravel pit. One of the purpose of yhis study was to complete the methodology for the assessment of waste ecocompatibility, focused by ADEME. The toxic potential of these materials have been distinguished and ordered according to their toxic potential. Four of the dredged materials were characterized by a high toxic potential and presented risks of lentic ecosystem eutrophisation. Risks of this storage scenario are not acceptable for these sediments. Recommendations have been made for the sediment amount to be submerged and for the constraints around thsese deposits. MSWIBA leachates impact was demonstrated whatever the methodology used. Copper seems to be responsible of the effects measured on species. It can be considered as a major pollutant of MSWIBA leachates. Risks of this reused scenario are not acceptable for lentic ecosystems. Recommendations have been made for MSWIBA reused as road embankment. With this study, the interest of microcosm assays have been emphasized. Yhis kind of approach was convenient for the evaluation of contaminated matrix impact against lentic ecosystems. Some aspects of this protocol have to be optimised in order to obtain acceptable variability levels for each parameter

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Palesse, Stephanie. "Déterminisme de la décision lysogénique au sein des communautés virales aquatiques : importance des fluctuations physiologiques et métaboliques des hôtes procaryotes." Thesis, Clermont-Ferrand 2, 2014. http://www.theses.fr/2014CLF22520.

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Masselot, Gérard. "La synécoparcimonie : un outil d'évaluation biologique de la qualité des eaux courantes : Théorie et applications." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2005. http://www.theses.fr/2002MNHN0027.

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Abstract:

Un nouvel outil d'évaluation biologique de la qualité des eux courantes, la synécoparcimonie, est proposé et testé. Ses bases méthodologiques sont développés. Sa validité est testée sur plusieurs cas concrets, d'origines géographiques diverses (néarctique et ouest-paléarctique). Il est montré que cet outil peut être utilisé tant pour analyser des peuplements faunistiques que microfloristiques. L'outil nouveau permet de minimiser les hypothèses ad hoc. Il autorise la confrontation directe et rigoureuse des données biologiques avec les caractéristiques mésologiques des cours d'eau. La notion de taxon indicateur est discutée, et le concept de taxon signifiant est proposé. Les outils indiciels européens actuels d'évaluation biologique de la qualité des eaux courantes sont étudiés et critiqués. Il est démontré que la méthode proposé peut permettre une approche pertinente de la qualité des eaux et/ou des milieux aquatiques. Son domaine de validité est précisé, et les études complémentaires à réaliser pour en parfaire la mise en place sont exposées. La nécessité de l'utilisation de matrices de données biologiques qualitatives proches de l'exhaustivité, y compris en retenant les taxons " rares ", est montrées. Le niveau spécifique de détermination des taxons est confirmé comme étant le plus informatif. La méthode proposée pourrait s'intégrer à terme dans l'ensemble des outils à disposition des gestionnaires de l'eau douce en Europe
A new freshwater biomonitoring tool, the synecoparsimony method, is proposed and tested. The methodological bases are explained. Its validity is tested on several real cases, of various geographical origins (neartic and west-palearctic). It is shown that this method can be used as well to analyze faunistic data as microfloristic. The new tool makes it possible to minimize the ad hoc hypothesis. It enables direct and rigorous confrontation between biological data and the mesologic characteristics of the rivers. The concept of “bio-indicator” taxa is discussed, and the concept of “significant taxa” is proposed. The new European freshwater biomonitoring tools ara studied and criticized. It is shownthat the new suggested method can allow a relevant approach of the quality of water and/or of aquatic environments. Its validity field is specified, and the complementary studies necessary to improve this new tool are exposed. The need for the use of “total evidence” matrices of qualitative biological data, necessary including “rare” taxa, is shown. The specific level of determination of taxa is confirmed as being the most informative. The method we propose could be integrated as a complementary tool available for freshwater managers in Europe

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Bouvier, Thierry. "Structure et dynamique du réseau trophique microbien dans le bassin nord occidental de la Mer noire sous influence du Danube." Montpellier 2, 1998. http://www.theses.fr/1998MON20196.

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Abstract:

Lors du melange des eaux du danube avec celles de la mer noire, la succession des changements des conditions physicochimiques genere une succession d'ecosystemes differents repartis en trois zones : eaux saumatres (0. 3-12), eaux intermediares (12-17) et eaux marine (> 17). Au cours de ce continuum, l'effet de l'enrichissement en nutriments inorganiques et organiques sur les biomasses carbonees des bacteries, phytoplanctons et protozaires est le plus visible dans la zone intermediare, c'est a dire entre 12 et 17 de salinite en fin d'hiver, debut de printemps et en ete. Dans les eaux saumatres et intermediares, quelle que soit la saison, le reseau trophique microbien n'est pas couple c'est-a-dire qu'une grande partie de la production de chaque groupe d'organisme n'est pas consommee par leurs consommateurs respectifs. Le systeme genere donc un exces de matiere organique non utilise par le reseau trophique pelagique. En zone marine, les interactions entre les differentes niveaux trophiques sont complexes et la majorite de la production des differentes communautes planctoniques est transferee aux niveaux trophiques superieurs. La particularite de ce reseau tient en ce que le mesozooplancton ingere et controle a la fois la production du microplancton et de ses proies (nanoplancton). Au printemps, le role des organismes gelatineux (meduses et ctenophores) dans l'ingestion du nanoplancton et microplancton produit par la chaine trophique microbienne serait important.

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Nex, Fabien. "Modélisation numérique de la biodégradation des composés organo-chlores dans les aquifères fondée sur des expérimentations in situ : Le cas des chloroéthènes." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2004. https://publication-theses.unistra.fr/public/theses_doctorat/2004/NEX_Fabien_2004.pdf.

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Charbonnel, Nathalie. "De la génétique à la dynamique des populations : l'exemple du gastéropode des eaux douces, Biomphalaria pfeifferi à Madagascar." Montpellier, ENSA, 2001. http://www.theses.fr/2001ENSA0018.

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Tizghadam, Ghazani Mostafa. "Etude des performances et optimisation d'un réacteur cascade à biomasse hybride pour le traitement des eaux usées urbaines." Limoges, 2007. http://aurore.unilim.fr/theses/nxfile/default/64980613-b375-43bd-ae4b-8816e68604b1/blobholder:0/2007LIMO4027.pdf.

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Abstract:

Afin de résoudre les problèmes liés à la surcharge organique de certaines stations et d’améliorer plus généralement les performances épuratoires vis-à-vis de la pollution azotée et phosphorée, la transformation des stations de traitement à boues activées peut être envisagée avec l’adjonction dans le bassin d’un support de microorganismes. On couple alors à une culture libre d'un réacteur un système à culture fixée ; le procédé est dit « hybride ». Un Réacteur Cascade à Biomasse Hybride (RCBH) est un nouveau réacteur multi-étagé au sein duquel l’effluent circule alternativement de manière ascendante et descendante et dans lequel sont immergés des matériaux supports de développement d’un biofilm bactérien. Ce type de réacteur hybride, doit permettre l’amélioration du traitement du carbone organique, le couplage au sein du même bassin des réactions de nitrification et de dénitrification biologique, avec une amélioration de la décantabilité des boues (minimisation du « bulking »filamenteux grâce au type d’écoulement choisi dans le réacteur). Les objectifs de ce travail ont été d’étudier les performances du RCBH afin d'évaluer les possibilités de réduction des dimensions des installations de type boues activées tout en permettant un traitement du carbone et de l’azote. Quatre réacteurs aérés de même volume utile, alimentés soit par un effluent synthétique soit par un effluent réel, ont été comparés en terme de performances : un réacteur parfaitement agité en culture libre (RPA), un réacteur cascade en culture libre (RC), un réacteur hybride dans un bassin parfaitement agité (RPABH) et un réacteur cascade avec support bactérien (RCBH). (Pour ce dernier réacteur, le fonctionnement avec des conditions aérobie-anoxie a également été étudié). L’hydrodynamique des réacteurs a été caractérisée afin d'en évaluer la contribution sur l’élimination des pollutions carbonées et azotées, et sur la décantabilité de la boue. Dans un second temps, les conditions de fonctionnement des réacteurs ont été modifiées afin d’apprécier leur importance sur les mécanismes d’élimination du carbone et de l’azote : charge massique, charge volumique en azote, temps de séjour hydraulique, âges des boues. Enfin, les paramètres régissant les performances de l’élimination du carbone, les réactions de nitrification et de dénitrification ont été étudiés pour des conditions expérimentales contrôlées et maintenues pendant de longues périodes de fonctionnement. Dans ces conditions, lors d’une alimentation avec un effluent urbain, les rendements de l’élimination de la DCO totale dans les réacteurs RPA, RPABH, RC et RCBH sont respectivement de 89, 92, 91 et 93% et dans le même ordre, les rendements de l’élimination de l’azote ammoniacal sont respectivement de 20, 29, 88 et 89%. Les modifications de l’hydrodynamique et la mise en œuvre de la biomasse dans le bassin d’aération aboutissent à l’amélioration des performances épuratoires de l’installation. La configuration d'un RCBH séquencé aérobie-anoxie avec deux compartiments d’anoxies en tête est optimisée pour obtenir une concentration en DBO5 inférieure à 30 mgO2. L-1 et une concentration en azote total inférieure à 10 mgN. L-1 dans le rejet. La configuration compartimentée du bassin d’aération facilite la mise en place des zones aérobies- anoxies dans le réacteur et permet l'élimination de 90% de la pollution azotée (azote kjeldahl). Cette valeur est de 38% pour un système classique dans les mêmes conditions expérimentales. De plus, la configuration du réacteur cascade permet de mettre en place la nitrification-dénitrification dans un même réacteur
In order to solve the problems involved in the organic overload of certain wastewater treatment plants and more generally to improve their performances with respect to nutrients removal, the transformation of the activated sludge treatment plants can be achived with the addition of a biofilm support in the aeration basin. We coupled a suspended growth system with an attached growth system into the same reactor; the process is known as “hybrid”. The cascaded reactor with hybrid biomass (RCBH) is a novel multistage reactor design using a series of baffles designed to force the wastewater to flow alternatively under and over the baffles, in which the supports for development of a biofilm immersed. This type of hybrid reactor, allows the improvement of the treatment of organic carbon, the coupling of the biological nitrification and denitrification within the same basin, with the improvement of the sludge settleability (minimization of the filamentous “bulking” related to the type of flow in use in the reactor). The aims of this work were to study the performances of the RCBH in order to evaluate the possibilities of dimension reductions of the activated sludge plant installations while allowing the carbon and nitrogen treatment. Four aerated reactors with the same effective volume alimented either by a synthetic effluent or by a domestic wastewater, were compared in term of the performances: a suspended growth completely mixed reactor (RPA), a suspended growth cascaded reactor (RC), a hybrid growth completely mixed reactor (RPABH) and a hybrid growth cascaded reactor (RCBH). (For the latter reactor, operation with aerobic- anoxic conditions was also studied). The hydrodynamics of reactors were characterized in order to evaluate its contribution in the elimination of carbonaceous and nitrogenous pollutions, and the sludge settleability. In the second time, the operating conditions of the reactors were modified in order to appreciate their influence on the mechanisms of elimination of carbon and nitrogen: mass loading, nitrogen loading, hydraulic retention time, sludge age. Lastly, the parameters influencing the performances of the carbon elimination, the nitrification and denitrification were studied for the control and maintenance of the experimental conditions. Where the systems was feded with the domestic wastewater, the COD efficiencies in RPA, RPABH, RC and RCBH are 89, 92, 91 and 93% respectively and in the same order, the ammonia nitrogen efficiencies 20, 29, 88 and 89% are respectively. The hydrodynamics modifications and the biomass implementation in the aeration basin leaded to the improvement the efficiency of the installation. The configuration of a RCBH sequenced aerobic-anoxic with two anoxic compartments at the head of the reactor, was optimized to obtain a concentration in DBO5 lower than 30 mg O2. L-1 and a total nitrogen concentration below 10 mgN. L-1 in effluent. The compartmentalized (cascade) configuration of the aeration basin facilitated the installation of the aerobic-anoxic zones into the reactor and allowed the elimination of 90% of kjeldahl nitrogen. This value was 38% for a traditional system under the same experimental conditions. Moreover, the configuration of the cascaded reactor made it possible to set up nitrification-denitrification in the same reactor

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Ould, Jiddou Mohamed. "Caractérisations hydrologique et hydrogéologique du sud-ouest mauritanien : Apport de l'analyse des données géophysiques : Diagnostic et gestion conjointe des ressources en eaux superficielles et souterraines." Angers, 2005. http://www.theses.fr/2005ANGE0670.

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Abstract:

Ce travail presente une caracterisation du sud-ouest mauritanien a partir de l'analyse de donnees de plusieurs types. Il se propose d'entreprendre une reflexion formelle sur la gestion des ressources en eau. Dans cette zone, les eaux superficielles sont rares et fortement dependantes de l'alea climatique et ce sont les eaux souterraines qui assurent la majorite de l'approvisionnement en eau. Toutefois, la presence de zones humides en particulier les lacs d'aleg et de male, dans un tel contexte climatique, a permis le developpement d'ecosystemes riches et varies qui ont subi un impact anthropique fort lors des periodes de grande secheresse. Neanmoins, force est de constater que la gestion des aquiferes du sud-ouest mauritanien presente un certain nombre de preoccupations : exploitation a un rythme superieur aux possibilites de recharge et degradation de la qualite des eaux. A cet egard, la situation du site d'idini est assez exemplaire puisque le maintien de la qualite de la ressource fait l'objet d'une attention croissante
This work is a characterization of the mauritanien southwest according to the analysis of several data types. It consists in undertake a definite reflection of the management of the water resources. In this zone, superficial waters are scarce and are strongly dependent on the climatic changes, and the underground waters, as an aquifer layer, assure the majority of water supply. Nevertheless, the presence of wetlands, particulary aleg and male lakes in such a climatic context, have allowed the development of a rich varied ecosystem. However, the management of these aquifers presents too many worries : exploitation is beyond the possibilities of "refill" and degradation of the water quality. In this respect, the position of the idini site is exemplary, in fact, the maintenance of the resource quality interests progressively

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Ferreira, David. "Biodiversité aquatique souterraine de France : base de données, patrons de distribution et implications en termes de conservation." Lyon 1, 2005. http://www.theses.fr/2005LYO10200.

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Abstract:

L'état des connaissances sur la diversité des espèces strictement inféodées aux eaux souterraines (i. E. Stygobies) est fragmentaire et limite sévèrement nos capacités à réaliser un bilan et un suivi de l'inventaire des espèces, à tester des hypothèses biogéographiques, macroécologiques et macroévolutifs, et à donner les bases d'une politique adéquate pour sa conservation. A partir de la constitution d'une base de données spatialisées, l'objectif de ce travail était de mettre en évidence de grandes tendances dans la distribution taxonomique et spatiale de la stygofaune à l'échelle de la France et de considérer ses implications en termes de conservation. La base de données établie qui comprend 380 espèces et sous-espèces, correspondant à près de 5700 enregistrements place la stygofaune française parmi l'une des plus riches d'Europe. Dominée par le groupe des Crustacés, la richesse en espèces stygobies reste cependant encore largement sous-estimée à la fois taxonomiquement et spatialement. L'évolution exponentielle du nombre cumulé d'espèces montre effectivement qu'un nombre important d'espèces stygobies reste à découvrir. De plus, l'évaluation de la variation spatiale de l'effort d'échantillonnage démontre que l'exploration biologique des eaux souterraines a été majoritairement limitée aux régions karstiques, comparativement aux aquifères poreux qui restent quasiment inexplorés. Les résultats obtenus ont néanmoins permis d'apporter des éléments de compréhension fondamentaux concernant la structuration spatiale de la diversité stygobie à grande échelle. Malgré l'accumulation de données durant plus d'un siècle, les aires de distribution spatialement réduites des espèces stygobies mettent en évidence un fort degré d'endémisme. L'augmentation de la contribution de la bêta diversité (différence de composition en espèces entre aquifères) à la diversité totale en espèces avec l'échelle spatiale (aquifères, sous-régions, régions) soutient l'hypothèse d'une structuration spatiale hiérarchique de la biodiversité. Ce résultat suggère qu'une stratégie efficace de conservation, pour préserver la biodiversité stygobie globale, serait de protéger un réseau d'aquifères distribués dans des régions faunistiquement distinctes, permettant ainsi de maximiser la bêta diversité. Les résultats obtenus soulignent également la nécessité d'augmenter et de renforcer l'étendue spatiale couverte par les données rassemblées dans la base afin d'obtenir une meilleure évaluation de la variation spatiale de la diversité en espèces. Dans cette perspective, la stratégie d'acquisition de données la plus efficace serait d'étudier la composition faunistique d'un nombre restreint d'aquifères dans des régions qui ont été jusqu'à présent peu échantillonnées. L'acquisition d'un tel corpus de données devrait permettre de consolider les bases scientifiques acquises durant ce travail pour une meilleure compréhension des mécanismes de la dynamique de répartition de la stygofaune et pour le développement de stratégies de conservation

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Nedeltcheva, Théodora. "Analyse spatiale de la composition chimique des ruisseaux vosgiens." Nancy 1, 2005. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/SCD_T_2005_0189_NEDELTCHEVA.pdf.

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Abstract:

Ce travail avait pour objectif l'établissement de modèles statistiques décrivant la variabilité de la composition chimique des ruisseaux vosgiens, basés sur des raisonnements mécanistes et traduisant notre compréhension du milieu. Les facteurs écologiques de l'acquisition de la composition chimique des eaux étaient par ordre d'importance : les précipitations, la richesse du substrat en minéraux altérables et la taille du bassin versant. L'influence majeure de la lame d'eau précipitée suggère que l'essentiel des concentrations des ruisseaux s'acquière dans les sols. L'influence de la minéralogie de la roche ne devient dominante que pour des substrats riches en minéraux altérables, influençant ainsi les concentrations en Ca et Mg dans les ruisseaux. Les teneurs en potassium paraissent résulter d'un double contrôle : l'altération du feldspaths potassique et la fixation au niveau des argiles. Sur grès, le sodium provient des précipitations et la silice, de la dilution des solutions des sols par la pluie. Sur granite, à cette dilution se rajoute l'échange ionique, par lequel le sodium remplace dans les eaux de drainage les autres cations (Ca, Mg, K) libérés par l'altération
The aim of this study was to analyse the spatial variability of stream water composition at lowflow in the Vosges Mountains. We showed that the mineral element concentration can be explained by three main factors: annual rainfall, bedrock composition and the area of the catchment. The principal influence of the precipitations suggests that the stream water concentrations are acquired in the soil. Stream water concentrations in base cations are strongly related to the bedrock content in weatherable minerals, when these minerals are still available in substantial amounts in the soil horizons and saprolite. Potassium concentrations are mainly related to the K-feldspar weathering and the trapping of the K, released by K-feldspar weathering, by clays. On sandstone, Na originates mainly from the atmosphere, and Si results from dilution of the soil solutions by the rainfall. On granite, in addition to this dilution, Na concentrations are controlled by ion exchange with the other cations released in the drainage waters by the weathering

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Rebillard, Jean-Pierre. "Contribution à la connaissance de l'écologie du fleuve Charente : étude de la physico-chimie des eaux, des algues et de l'activité bactérienne en aval d'Angoulême." Metz, 1999. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/UPV-M/Theses/1999/Rebillard.Jean_Pierre.SMZ9948.pdf.

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Abstract:

Ce travail a permis d'étudier sur le fleuve Charente en aval d'Angoulême, les relations existantes entre le phytoplancton et les bactéries en relation avec les concentrations en éléments nutritifs et de quantifier in situ le processus de dénitrification. Les conditions hydrodynamiques, les teneurs en nutriments et la pénétration lumineuse dans I'eau sont favorables à la croissance d u phytoplancton. Toutefois, les concentrations en chlorophylle-a sont peu élevées (inférieures à [mu]40 g/l). Il est possible que la relative faiblesse des développements d'algues puissent s'expliquer par des phénomènes de compétition entre diverses formes végétales (macrophytes, périphyton et phytoplancton). Les bactéries qui accompagnent les effluents de cette ville sont caractérisées par une physiologie (rapport leucine/ thymidine supérieur à 20) et une morphologie (biovolume supérieur à 0,2[mu]m3) différentes des bactéries autochtones (volume cellulaire égal à 0,15 [mu]m3 et rapport leucine/thymidine égal à 10). En effet, aucune relation significative entre les communautés phytoplanctoniques et bactériennes n 'a pu être mise en évidence. En effet, il est probable que les apports allochtones en matière organique permettent de subvenir la demande en carbone des bactéries qui n'ont ainsi pas besoin du soutien de la production primaire (excrétion algale) pour se développer. La vitesse de dénitrification à I'interface eau-sédiment est considérée comme constante et indépendante des variations en température, en teneurs en nitrate et oxygène dissous. Sur un cycle annuel, le taux moyen de dénitrification (perte d'azote sous forme gazeuse) dans la Charente est de 682 mg NO3/m2/j
The present study is aimed at providing (i) accurate data on the relationships between phytoplankton and bacteria responses to varying loading levels of nutrients such as nitrogen, phosphorus and organic matter, and (ii) insight into the denitrification process from in situ experiments. The low developpment of phytoplankton was unlikely to be accounted for by the prevailing hydrodynamic, trophic and light conditions, all indeed favouring its growth, therefore competion processes were thougth to exist between diverse plant standing stocks. Regarding the bacterial compartment, a significant increase in biomass and activity was also manifest downstream of Angoulême's sewage effluent discharges. Bacteria associated to such urban effluents were characterized by both physiological features (high ratio, i. E. 20, for leucine to thymidine incorporation rates) and morphological features (high biovolume, i. E. Higher 0. 2 [mu]m3) far distinct from those displayed by autochthonous bacteria (i. E. Mean cellular volume fo roughly 0,15 [mu]m3 and low leucine : thymidine ratio of approx. 10). The present investigation, however, gave no evidence of signifiant relations betweeen phytoplanktonic and bacterial communities. Indeed, allochthonous supplies of organic matter were merely shown to meet bacterial carbon requirements sufficiently so that no further substantial supply by primary production (in terms of excretion or algal exudates) was needed to enable bacteria to develop. The denitrification process resulting in nitrogen losses as nitrogen gas (NH2), it was clearly pointed out that if such a denitrification process did not occur in the whole water column, its rate at the water-sediment interface might be considered as constant and independant from variations in temperature, nitrate contents and dissolved oxygen levels at the interface. Then, the annual mean rate of denitrification in the River Charente levelled off at 682 mgNO3/m2/j bejond any marked environmental influence

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Caro, Audrey. "Effets de facteurs stressants sur la cultivabilité, la viabilité cellulaire et le pouvoir pathogène de "Salmonella typhimurium" dans l'environnement aquatique." Montpellier 2, 1998. http://www.theses.fr/1998MON20044.

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Cordier, Clémence. "L'ultrafiltration pour une meilleure maîtrise de la qualité de l'eau dans les écloseries et nurseries conchylicoles." Thesis, Aix-Marseille, 2019. http://www.theses.fr/2019AIXM0505.

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Abstract:

La profession conchylicole est une activité phare du littoral français. Les écloseries et nurseries qui produisent des huîtres au stade naissain pour les vendre aux professionnels proposent une méthode de culture alternative en conditions contrôlées avec la possibilité de maîtriser la qualité des eaux entrantes et sortantes. Au sein de ces établissements, le traitement de l’eau devient donc un sujet essentiel pour le maintien d’huîtres géniteurs, les élevages larvaires et la production de microalgues fourrages. L’objectif de la thèse est de développer l’ultrafiltration pour le traitement de l’eau dans ces structures avec le but d’éliminer en amont les agents pathogènes et les parasites pour la pérennisation des espèces et des cultures, mais aussi pour le traitement de l’eau en aval qui doit viser l’inactivation de tout matériel biologique non endémique dans les zones de production concernées. La fiabilité et la robustesse de l’ultrafiltration ont été éprouvées à l’échelle semi industrielle et validées sur les différentes matrices testées en optimisant les conditions opératoires, de nettoyage mais aussi par l’utilisation d’un rétrolavage essoré. Une biosécurisation des élevages est réalisée avec (i) la protection des animaux du stade larvaire à adulte vis-à-vis d’agents pathogènes (virus OsHV1 et bactérie Vibrio aestuarianus) (ii) la rétention des gamètes d’huîtres dans les effluents, potentiellement à risque pour le milieu marin (iii) la mise en place d’un circuit d’eau purifiée réutilisée au sein même des structures conchylicoles. La production d’algues a également été améliorée par l’ultrafiltration permettant d’envisager un transfert de technologie vers l’industrie
Shellfish production is a leading economic activity on French coast. Hatcheries et nurseries which produce oyster spat to be sold to producers, offer an alternative way of breeding under controlled conditions with the possibility to monitor quality of in et out waters. Within those structures, water treatment is essential for adult oysters, larvae breedings et microalgae production. The aim of this work is to develop ultrafiltration for water treatment in those shellfish production facilities. The objectives are to remove pathogens et parasites from upstream water in order to protect animals et cultures et to treat effluents with the aim to inactivate non endemic biological material from concerned production area. Reliability et sustainability of ultrafiltration were checked at semi-industrial scale et validated for the matrices tested by an optimisation of operating conditions, cleanings et the use of air-backwashes. A biosecuring of breedings was obtained with (i) the protection of oysters from larvae stage to adults towards pathogenic agents (virus OsHV-1 et bacteria Vibrio aestuarianus) (ii) the retention of oyster gametes in effluents, potentially detrimental for marine biodiversity, (iii) the reuse of effluent within shellfish farms. Microalgae production was also improved with ultrafiltration suggesting the possibility of a technology transfer to industry

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Khalaf, Gaby. "Étude biocénotique et qualité des eaux de quatre cours d'eau côtiers libanais Nahr Ibrahim, Nahr el Kalb, Nahr Antélias et Nahr Beyrouth : biologie et écologie de Capoeta damascina Günther 1868 (poisson, cyprinidae)." Perpignan, 2003. http://www.theses.fr/2003PERP0528.

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Abstract:

Quatre cours d'eau libanais ont fait l'objet d'une étude écologique basée sur des observations, des recherches et des mesures physico-chimiques et biologiques afin d'évaluer la qualité des eaux de ces hydrosystèmes continentaux. Les barrages sur Nahr Ibrahim n'ont pas d'effet notoire sur la qualité des eaux. Nahr el Kalb possède un régime d'écoulement temporaire dans son cours moyen. Les communautés zoologiques sont plus pauvres que celles du Nahr Ibrahim. Nahr Antélias est pollué sur tout son cours, les rejets d'eaux usées aggravant cette pollution. Le genre Physa caractérise ce cours d'eau. Dans le Nahr Beyrouth les indices biotiques possèdent des valeurs assez grandes. Le cours inférieur est un égout en basses eaux, avec des espèces faunistiques et floristiques caractéristiques des eaux polluées. Capoeta damascina, est un poisson phytophage, qui se nourri de diatomées (Navicula et Synedra) et de l'algue Rhizoclonium. L'étude du cycle sexuel de C. Damascina montre l'apparition d'un dimorphisme sexuel, et un sex-ratio supérieur à 1
The ecology of 4 rivers in Lebanon, Nahr Ibrahim, Nar el Kalb, Nahr Antelias and Nahr Beirut has been studied based on systematic observations and on the study of physico-chemical and biological parameters in order to evaluate their ecological status and characterize any anthropological impacts. Dams on Nahr Ibrahim have no measurable effect on the ecosystem. Nahr el Kalb possesses a temporary flow in its middle section. The zoological communities appear to be poorer than that of Nahr Ibrahim. Nahr Antelias is polluted throughout mainly as a result of discharges from the village of Antelias. The river is characterized by the presence of the mollusca Physa. In Nahr Beirut, the biotic indices are high. The lower section of the river, transforms into a sewer in periods of low water flow as evidenced by fauna and flora characteristic of such waters. Capoeta damascina in these waters is a phytophagous fish and diatoms ( Navicula & Synedra) with the algae Rhizoclonium are its major dietary source. The fish shows sexual dimorphism with the sex ratio higher than 1

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Maurice, Corinne. "Étude des cycles de vie des bactériophages dans les écosystèmes aquatiques par analyse de cellules individuelles : importance de la physiologie, de la diversité de l'hôte et de la variabilité de l'écosystème." Montpellier 2, 2009. http://www.theses.fr/2009MON20235.

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Abstract:

Dans les écosystèmes aquatiques, les bactériophages constituent le compartiment biologique le plus abondant, excédant par un ordre de grandeur celui des bactéries. Ces phages peuvent se répliquer selon deux cycles principaux: les cycles lytique et lysogène. Nos connaissances sur la prévalence et les facteurs de régulation de ces cycles proviennent en majorité d'études en conditions contrôlées, et les mécanismes environnementaux ou bactériens impliqués in situ restent peu connus. L'objectif général de cette thèse est d'étudier en milieu naturel la prévalence de ces deux cycles de réplication viraux et leurs mécanismes de régulation, de l'échelle de la cellule bactérienne à celle de l'écosystème. À l'échelle de la cellule bactérienne, nous avons montré l'importance de la physiologie et de l'activité cellulaire sur la prépondérance d'un cycle par rapport à l'autre. Plus précisément, nous avons mis en évidence un double rôle de la physiologie, agissant d'abord comme un signal pour la mise en place de la lysogénie, puis comme un signal inducteur du cycle lytique; menant au concept ‘d'abandonner le navire qui coule'. En plus de la physiologie, nous suggérons que certaines espèces phylogénétiques seraient plus susceptibles d'être lysogènes. À l'échelle de l'écosystème, la lysogénie serait plus fréquente dans les systèmes d'eau douce qu'au sein des lagunes côtières. De plus, la variabilité naturelle des conditions environnementales influence la dynamique de ces cycles, les plus fortes fréquences des deux cycles trouvées en conditions de variabilité environnementale intermédiaire. Enfin, une comparaison inter-écosystèmes indique une dynamique de remplacement des deux cycles, alors qu'au sein du même écosystème, ils peuvent co-exister et même co-varier. Ces travaux montrent in situ, l'influence de l'environnement sur les cycles de vie, directement à travers la variabilité des conditions environnementales, et indirectement à travers la physiologie et l'activité bactériennes
Within aquatic ecosystems, bacteriophages are the most abundant entities even exceeding bacterial numbers by an order of magnitude. Viral production takes place via two major replication cycles: the lytic and the lysogenic cycles. The prevalence and the regulation factors of both cycles have been extensively studied using phage/host systems in controlled conditions, and the in situ environmental and bacterial parameters involved remain unclear. The main objective of this PhD is to study the regulation mechanisms underlying the prevalence of both viral replication cycles within natural ecosystems, from the single-cell level of analysis to the level of the ecosystem. At the single-cell level, we show the importance of bacterial physiology and activity on the prevalence of one cycle over the other. More specifically, we demonstrate a dual role of the bacterial physiology, acting first as a signal for a lysogenic interaction, then as an inducing signal of the lytic cycle, leading to the ‘abandon the sinking ship' concept. In addition to the significant impact of bacterial physiology, we further establish that certain bacterial phylogenetic groups could be more susceptible to lysogenic infections than others. At the ecosystem level, lysogeny seems to occur more frequently in freshwater systems than in coastal lagoons. Furthermore, natural variability of the environmental conditions influences the dynamics of both cycles, as their highest frequencies occurred under intermediate variability conditions. Finally, an inter-ecosystem analysis reveals a replacement dynamic between these two cycles, whereas within the same ecosystem, both cycles can co-exist and even co-vary. This work shows in situ the influence of the environment on both viral replication cycles, directly through the variability of environmental conditions, and indirectly through changes of bacterial physiology and activity

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Guilmet, Martine. "Impact des rejets urbains et industriels de la région Toulouse-sud sur l'écosystème aquatique de la Saudrune." Toulouse, INPT, 1988. http://www.theses.fr/1988INPT001A.

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Abstract:

Notre travail, avec pour but la préoccupation de la protection du milieu aquatique, nous a conduit à étudier différents aspects successifs du problème : 1. Qualité physico-chimique des eaux : les données sur l'eau, malgré leur part d'incertitude sont nécessaires et représentent une base essentielle car en relation directe avec les données de rejets sur lesquelles peuvent s'exercer les actions de dépollution. 2. Etude de la micropollution métallique dans les sédiments : ils représentent un des éléments intégrateurs du milieu et permettent de faire face à certains problèmes liés à l'étude de la physico-chimie des eaux. 3. Tests écotoxicologiques : l'intérêt de ces test pour l'évaluation globale de la toxicité est manifeste. La pollution chimique est formée, pour le site qui nous préoccupe, d'un ensemble très complexe de molécules difficiles à identifier complètement. De plus, les différentes actions entre les substances rendent la prévision d'effets toxiques, impossible par l'analyse chimique. 4. Etudes des populations benthiques et piscicoles : ils représentent les autres éléments intégrateurs du milieu et sont la réponse biologique, indispensable à connaître, des différentes atteintes du milieu.

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Lagauzère, Sandra. "Influence de la bioturbation des macro-invertébrés benthiques sur le comportement biogéochimique de l'uranium au sein des sédiments d'eau douce." Aix-Marseille 2, 2008. http://theses.univ-amu.fr.lama.univ-amu.fr/2008AIX22059.pdf.

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Abstract:

Dans les écosystèmes aquatiques continentaux, les sédiments représentent un compartiment d’accumulation pour les polluants métalliques comme l’uranium. Secondairement, ils peuvent également se comporter comme des sources endogènes de contamination, par remise en suspension (e. G. Crues, bioturbation) ou par évolution de la spéciation des métaux, laquelle va également jouer sur leur biodisponibilité. En effet, les composés métalliques peuvent être transformés en composés plus ou moins toxiques ou inertes sous l’effet de modifications des conditions physico-chimiques (pH, conditions rédox, force ionique) et microbiologiques du sédiment. Ces conditions sont elles-mêmes sous le contrôle de l’activité des macro-invertébrés benthiques via les processus de bioturbation. L’objectif principal de ce doctorat a été de déterminer l’influence de la bioturbation de deux espèces de macro-invertébrés benthiques (Chironomus riparius et Tubifex tubifex) sur la répartition et les transferts de l’uranium dans le sédiment des écosystèmes aquatiques continentaux. Pour cela, des expériences en laboratoire avec des dispositifs de type microcosmes, ont été réalisées pour (i) évaluer les effets de l’uranium sur les macro-invertébrés benthiques, plus particulièrement sur leur activité de bioturbation, (ii) déterminer l’influence de ces organismes sur le comportement de l’uranium grâce à des mesures physico-chimiques à haute résolution (e. G. Optodes à oxygène, gels DET), et (iii) appréhender les conséquences de ces interactions sur un organisme de la colonne d’eau, Xenopus laevis, via des mesures de génotoxicité (essai micronoyaux) et de biomarqueurs moléculaires (taux d'expression d'un certain nombre de gènes codant pour des protéines induites lors de stress environnementaux). Les principaux résultats obtenus montrent que l’intensité de la bioturbation des macro-invertébrés peut être diminuée dans un sédiment contaminé par de l’uranium, mais que les espèces étudiées dans cette étude présentent une bonne tolérance. Pour des concentrations en uranium élevées (>100 fois le bruit de fond géochimique naturel), les vers T. Tubifex sont capables de maintenir une activité de bioturbation suffisante pour entraîner une forte remobilisation de l’uranium initialement associé au sédiment vers la colonne d’eau. Ceci représente donc un risque potentiel pour le reste de la biocénose aquatique. Cependant, en voulant tester cette hypothèse, il a été constaté de façon surprenante que le comportement des vers pouvait être modifié en présence d’un autre organisme dans la colonne d’eau et qu’ainsi il n’entraînait plus de relargage d’uranium vers la colonne. Toutefois, l’uranium associé au sédiment, sans l’effet de la bioturbation, induit des effets négatifs sur cet organisme. Au final, ce travail de thèse a permis de décrire les interactions pouvant exister entre les organismes aquatiques, la biogéochimie du sédiment et un polluant métallique comme l’uranium. Les informations apportées sont originales et permettent d’envisager de façon plus précise les conséquences d’une pollution à l’uranium dans l’environnement aquatique. Plus globalement, les travaux de recherche entrepris dans le cadre de cette thèse contribueront à améliorer les connaissances actuelles en vue d’une meilleure évaluation des risques écologiques des écosystèmes aquatiques contaminés par des polluants
In freshwater ecosystems, sediments act as an accumulation compartment for metallic pollutants as uranium. Secondary, there can also represent endogenous sources of contamination by resuspension (e. G. Flood, bioturbation) or changes of metal speciation that acts upon their bioavailability. Indeed, metallic compounds can be transformed in more or less toxic or inert compounds through physico-chemical (e. G. PH, redox conditions, ionic force) and microbiological variations. These conditions are themselves under the effects of benthic macro-invertebrate activities via bioturbation processes. The main objective of this PhD was to determinate the influence of two benthic macroinvertebrate species (Chironomus riparius and Tubifex tubifex) on the distribution and the transfers of uranium within freshwater sediments. To reach this goal, laboratory experiments were performed in order to (i) assess the effects of uranium on benthic macroinvertebrates, more particularly on their bioturbation activity, (ii) determine the influence of these organisms on uranium behaviour through high resolution physico-chemical measurements (e. G. Oxygen optodes, DET gel probes), and (iii) estimate the consequences of these interactions on pelagic organisms via genotoxicity measurements (micronuclei assay and molecular biomarkers analysis on Xenopus laevis). The results demonstrate that bioturbation intensity of macroinvertebrates can be affected in uranium-contaminated sediments, but the two species studied in this work show a relative tolerance. For high uranium concentrations (>100 times the geochemical background level), corresponding however to realistic concentrations in highly contaminated sites, T. Tubifex worms are able to maintain a sufficient bioturbation activity that induces a high remobilization of uranium initially associated with sediments to the overlying water (factor 2 to 10). That represents therefore a potential risk for the remaining aquatic biocenosis. However, by testing this assumption on X. Laevis, it was surprisingly noticed that the worms’ behaviour can be modified in presence of this organism in the water column. The effect of bioturbation on uranium release from the sediments was thus altered conducing to lower uranium concentrations in the water column. Nevertheless, sediment-associated uranium, without the effect of bioturbation, induces negative effects on this pelagic organism. Finally, this PhD work illustrates the interactions that can exist between aquatic organisms, sediment biogeochemistry and a metallic pollutant as uranium. The novel results obtained permit to view more precisely the consequences of uranium pollution in aquatic environment. More globally, this work will contribute to a better assessment of ecological risks in polluted aquatic ecosystems

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Carpentier, Patrice. "Caractérisation de structures spatiales et temporelles en écologie : application aux séries physico-chimiques de qualité des eaux du réseau national de bassin en Artois-Picardie et aux peuplements benthiques du site de Gravelines et de la Manche orientale." Lille 1, 1999. https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/Th_Num/1999/50376-1999-489.pdf.

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Abstract:

L'étude de l'évolution temporelle de la qualité des eaux de surface du bassin Artois-Picardie - en particulier les teneurs en azote et phosphore, principaux agents de l'eutrophisation - a nécessité le choix et la mise en place d'une méthodologie statistique à la fois simple et robuste, s'adaptant notamment au caractère irrégulier des séries chronologiques constituées dans le cadre du réseau national de bassin. Une amélioration de la qualité de l'eau, plus fortement marquée dans les zones urbaines, a été ainsi mise en évidence au cours des dix dernières années. Des méthodes apparentées ont été mises en oeuvre pour caractériser les changements temporels du peuplement macrozoobenthique des sables fins envasés (peuplement à Abra alba) du site de Gravelines. Elles ont permis de dégager une évolution cyclique d'une période de 6-7 ans liée à un cycle de la température. La diversité spécifique du peuplement ne montre par contre pas d'évolution particulière. Des méthodes d'interpolations, couplées à des analyse multivariables, ont été appliquées aux données granulométriques et biologiques issues des fichiers de la base de données du GDR Manche. Ces interpolations permettent d'obtenir une typologie des peuplement benthiques et de leur diversité. Sur ces deux jeux de données benthiques, l'effet du changement de l'échelle d'observation modifie la perception des structures de la diversité et des différents facteurs qui l'influencent. Enfin, à l'aide de simulations, on met en évidence la dépendance de différents estimateurs de la diversité par rapport à l'effort d'échantillonnage. Les résultats montrent que l'estimation de l'indice de Shannon va nécessiter un effort d'échantillonnage moins important que celle de la richesse spécifique.

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Le, Calvez Nicolas Yves. "Mise au point d'une méthodologie analytique appliquée au devenir de contaminants organiques dans l'environnement aquatique." Lille 1, 2002. https://pepite-depot.univ-lille.fr/RESTREINT/Th_Num/2002/50376-2002-197.pdf.

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Abstract:

Le travail présenté dans ce manuscrit porte sur l'étude des produits phytosanitaires (plus particulièrement les insecticides organochlorés et organophosphorés et les herbicides organoazotés) dans l'environnement aquatique. Il décrit tout d'abord la mise au point d'un protocole analytique permettant la recherche simultanée de différents pesticides présentant une grande diversité au niveau de leurs propriétés physico-chimiques. Les analyses ont été réalisées par chromatographie en phase gazeuse (GC) associée à plusieurs détecteurs spécifiques (ECD, NPD, MSD). Les applications de ce protocole ont été réalisées dans la baie de l'Authie (région Nord-Pas-de-Calais -Picardie) lors de plusieurs radiales longitudinales. Une corrélation a pu être mise en évidence entre les résultats obtenus et une étude menée en collaboration entre les SRPV Nord-Pas-de-Calais et Picardie. Enfin, ce travail présente un premier état des lieux de la contamination de la baie de l'Authie en produits phytosanitaires.

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Leloup, Maud. "Evaluation de l'impact des blooms algaux et d'efflorescences bactériennes sur les caractéristiques de la matière organique des eaux naturelles." Limoges, 2013. https://aurore.unilim.fr/theses/nxfile/default/82354669-4494-47ae-8266-f601e4450b96/blobholder:0/2013LIMO4025.pdf.

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Abstract:

Les phénomènes d'eutrophisation induisent de nombreux impacts négatifs sur les écosystèmes aquatiques mais également sur les usages des ressources en eaux. Ils conduisent à la prolifération du phytoplancton, qui, par son activité métabolique et sa sénescence, génère une grande quantité de Matière Organique Algale (MOA) dont la composition et la réactivité diffèrent de celles de la Matière Organique issue du milieu Naturel (MON). L'évolution des caractéristiques de la MOA a été étudiée sur des cultures mono-spécifiques d'algues et de cyanobactéries, de sa production au cours de la formation du bloom à son humification. Des fractions de MOA extraites selon leur caractère hydrophobe ont été caractérisées par spectroscopie UV et de fluorescence, ultrafiltration et spectrométrie de masse (MALDI-TOF). Des propriétés spécifiques à la MOA ont ainsi été mises en évidence et reliées aux observations sur le terrain. Une étude in-situ sur un plan d'eau hypereutrophe de la région Limousin a été menée sur une période de 18 mois. Les apports récurrents en MOA perturbent la dynamique de la MON de la ressource et modifient ses caractéristiques en augmentant la part de composés hydrophiles, en accord avec les observations en laboratoire. Ces changements qualitatifs et quantitatifs ont également des conséquences sur les procédés de traitement des eaux et notamment sur la coagulation-floculation. Les performances du procédé appliqué à une eau riche en MOA sont ainsi réduites par rapport à une eau non eutrophe; les fractions hydrophobes et hydrophiles sont les plus impactées. Les mécanismes mis en jeu dans l'élimination de matières organiques d'origines variées ainsi que le rôle de chaque fraction ont pu être identifiés
Eutrophication phenomena adversely impact ecosystems and disturb the uses of the affected water resources. They lead to phytoplanktonic proliferations resulting in a large quantity of Algal Organic Matter (AOM) due to metabolic activity and senescence of populations. The composition and reactivity of AOM differ from those of Natural Organic Matter (NOM). The AOM evolution was studied from its production by blooms formation to the humification stage, on laboratory cultures of mono-specific species of algae and cyanobacteria. Fractions of AOM extracted according to hydrophobicity were characterized by UV and fluorescence spectroscopy, ultrafiltration and mass spectrometry (MALDI-TOF). Some specific properties of AOM were thus determined. These properties were in agreement with the in-situ observations. An in-situ monitoring program was conducted on an hypereutrophic pond in the Limousin area over a 18 months period. Recurrent inputs of AOM disturb the NOM dynamics and modify its characteristics by increasing the hydrophilic part, in agreement with the laboratory observations. These qualitative and quantitative changes also affect drinking water treatment processes and especially coagulation-flocculation. Efficiency of the process applied to an eutrophic water was thus reduced compared to a non eutrophic water; both hydrophobic and hydrophilic fractions were the most impacted. Mechanisms involved in the elimination of organic matters from various origins and the role of each fraction were also identified

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Chafiq, Mohamed. "L'interface eau souterraine-eau superficielle comme régulateur des flux de matière organique : relation entre flux de carbone, organismes souterrains et biofilm." Lyon 1, 1995. http://www.theses.fr/1995LYO10191.

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Abstract:

Une etude a ete entreprise sur les transferts de matieres organiques du milieu souterrain vers le milieu superficiel dans une plaine alluviale du rhone situee en amont de lyon. L'approche utilisee etait basee sur l'etude de gradients longitudinaux le long de deux petits affluents karstiques (ordre 1) et de gradients verticaux au niveau des interfaces eau souterraine/eau superficielle que sont les sources karstiques, les sources interstitielles et les sous-ecoulements de cours d'eau. L'etude a consiste a etablir des relations entre les parametres physico-chimiques des eaux, les flux de matiere organique dans les sediments et dans les eaux, les biomasse et activite microbiennes et la biomasse bacterienne et les densites et les structures de peuplement interstitiels. L'objectif etait alors de comprendre la dynamique de ces flux, de tester leur homogeneite au sein de la plaine alluviale depuis les contreforts calcaires jusqu'au fleuve lui-meme, et enfin de mesurer l'importance des interfaces eaux souterraines/eaux de surface dans la dynamique des nutriments (retention, stockage, utilisation, lessivage) et dans la biodiversite de la plaine alluviale. L'etude de la structure et de la distribution spatio-temporelle des peuplements d'invertebres aquatiques karstiques et interstitielles montrent un gradient longitudinal fonctionnel different du gradient topographique. La richesse et la densite dependent des types de contact. C'est au niveau des sources karstiques comme interstitielles que les echanges sont les plus intenses entre milieu souterrain et milieu de surface. On peut distinguer deux types d'ecotones: ceux pour lesquels les quantites de matiere organique sont faibles et la dispersion de la faune interstitielle importante et ceux pour lesquels il y a d'importantes accumulations de nutriments et une grande concentration de faune souterraine. Du point de vue des flux de nutriments, la presence de cultures dans la plaine alluviale enrichit le milieu souterrain en nitrates, mais des phenomenes de denitrification et de retention ont ete observes lors de la presence de ripisylves. Que ce soit au niveau des gradients longitudinaux amont-aval des affluents ou verticaux souterrain-surface, le carbone organique fin, la biomasse microbienne et bacterienne et l'activite microbienne sont lies a la repartition des sediments fins. La dynamique temporelle du facteur hydrologique (frequence et intensite des pluies) est determinante dans les phenomenes d'accumulation, de retention de la matiere organique mais aussi dans la dynamique du biofilm. En definitive, il existe une tres grande heterogeneite de repartition des ressources et des organismes au niveau des contacts eau souterraine/eau superficielle au sein des plaines alluviales qui jouent un role non negligeable dans les transferts de flux vers le fleuve

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El, Haji Mounia. "Etude des propriétés physico-chimiques des eaux de bassins et de leurs influences sur certains phénomène biologiques : cas du Port du Havre." Le Havre, 1998. http://www.theses.fr/1998LEHA0018.

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Abstract:

Dans la première partie, l'étude concerne l'analyse des paramètres physico-chimiques des eaux de bassins, exploitées paramètre par paramètre, à partir d'une banque de données initiée des 1977 par le port du havre. Des prélèvements réguliers, mensuels ont été réalisés au droit de 11 points dans la zone du port du havre et de sa zone industrielle s'étendant sur 530 km en rive droite de l'estuaire de la seine. L'interprétation des mesures in situ des caractéristiques physiques et chimiques du milieu environnant a permis la mise en évidence de phénomènes de corrosion bactérienne. Une synthèse précise de ces données a été entreprise ainsi qu'une étude des paramètres en fonction de l'espace et du temps. Dans la deuxième partie, un couplage des processus physico-chimiques aux phénomènes bactériologiques a été réalisé, afin de mettre en évidence les interactions et surtout l'impact de l'accumulation de la matière organique dans la prolifération des bactéries sulfato-reductrices. Ces bactéries jouent un rôle prépondérant dans l'accélération de l'attaque corrosive des installations portuaires. Cette partie a fait l'objet de la mise au point des techniques expérimentales pour mettre en évidence les sites de prolifération de ces micro-organismes. Dans ce but, des barres d'acier au carbone ont été installées, en fond de bassin portuaire au voisinage de certains points de prélèvements. Une observation microscopique a révèle l'existence d'une source d'énergie conduisant à la prolifération de certaines bactéries. Un dénombrement bactérien dans le milieu solide et liquide a confirmé la présence d'une activité bactérienne, plus élevée dans certains sites de la zone industrielle du port. L'intensité de cette activité est conditionnée par les conditions physico-chimiques du milieu. Dans la troisième partie, l'exploitation des résultats obtenus a conduit à la mise en œuvre d'un logiciel dans le but, d'une part, de caractériser et d'expliquer les tendances évolutives de transfert des polluants à long terme dans les bassins confinés et, d'autre part, d'apporter une contribution à la compréhension des phénomènes de corrosion des ouvrages immerges en milieu saumâtre. Cette approche permettra de disposer d'outils utiles pour assurer une bonne gestion des infrastructures portuaires et de faire des extrapolations entre différents présentant certaines similitudes.

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Gomez, Hernandez Maria Elena. "Rôle des sédiments dans l'eutrophisation d'une lagune littorale Méditerranéenne (étang du Méjean-Hérault) : échanges du phosphate entre le sédiment et l'eau en fonction des conditions environnementales." Montpellier 1, 1996. http://www.theses.fr/1996MON13520.

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Dissertations / Theses on the topic 'Hypoxie (Écologie des eaux)'

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