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Dissertations / Theses on the topic 'Indicators; Bioindicators'
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Turnbull, David Andrew. "The water quality of the Ouseburn : a part urban, part rural catchment." Thesis, Northumbria University, 1994. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.241516.
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Miniutti, Danielle M. "Bioindicators of Desorbed Contaminants Following Resuspension of Penobscot River Sediments." Fogler Library, University of Maine, 2007. http://www.library.umaine.edu/theses/pdf/MiniuttiDM2007.pdf.
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Gill, Margaret Elizabeth. "Estuarine fish and their health, as indicators of anthropogenic change." Thesis, University of Newcastle Upon Tyne, 1998. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.388651.
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Summers, Jay W. "Feathers as bioindicators of PCB exposure in clapper rails /." View online, 2009. http://repository.eiu.edu/theses/docs/32211131565121.pdf.
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Schneider, Andrea. "Polygon ponds and their ostracode assemblages as bioindicators in the Indigirka Lowland (north-east Siberia)." Thesis, Stockholms universitet, Institutionen för naturgeografi och kvartärgeologi (INK), 2013. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-94118.
Full textAbstract:
Freshwater ostracods (crustacea, ostracoda) are sensitive to environmental conditions, and are widely used as biological indicators for past and present environmental changes. The abundance and diversity of ostracods from permafrost areas is currently documented in scattered records with incomplete ecological characterizations. The objectives of the thesis were to determine the taxonomic and ecological range of ostracod assemblages and their habitat conditions in polygon ponds in different landscape units of the Indigirka Lowland (north-east Siberia, Russia). A monitoring approach focused seasonal meteorological and limnological variability of a selected pond site, its ostracod population dynamics, and the geochemical properties of ostracod valve calcite. Shallow, well-oxygenated, and dilute ponds with slightly acidic to circumneutral pH hosted an abundant and diverse ostracod fauna. A total of 4849 identified ostracods from eight species and three taxa represent the first record of the ostracod fauna in the Indigirka Lowland. Fabaeformiscandona krochini and Fabaeformiscandona groenlandica were documented for the first time in continental Siberia. Fabaeformiscandona sp. I and Fabaeformiscandona sp. II were newly found taxa holding a strong indicative potential for hydrochemical parameters. Repeated sampling of a typical low-center polygon pond revealed detailed insights in the population dynamics of Fabaeformiscandona pedata and its reproduction strategy. Substrate properties, physical and hydrochemical conditions in the studied ponds offered largely homogeneous habitats across different landscape units and pond types to ostracods. River flooding and differences in morphology between pond types resulted in variations in sediment, vegetation, hydrochemical and stable water isotope composition of the ponds. Ponds in the river floodplain and intrapolygon ponds hosted the most diverse ostracod fauna while species diversity was lowest in thaw lakes. Air temperature and precipitation were identified as the main external drivers of water temperatures, water levels, ion concentrations, and stable water isotope composition in small periglacial waters on diurnal and seasonal scales. Ostracod valve calcite recorded seasonal variations in stable oxygen isotopes of the ambient waters, but needs to be interpreted carefully with regard to species-specific background knowledge.POLYGON - Polygons in tundra wetlands: state and dynamics under climate variability in polar regions
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Cotín, Martínez Javier. "Birds as Bioindicators of Pollution in Aquatic and Terrestrial Environments." Doctoral thesis, Universitat de Barcelona, 2012. http://hdl.handle.net/10803/101099.
Full textAbstract:
Birds have been widely used as bioindicators. In this study we face the use of birds as bioindicators of metal pollution in two different scenarios of contamination: one that takes place in an aquatic environment, the Ebro river basin, and a second that occurs in a terrestrial environment, the Bolivian Andes.
In the case of the Ebro river basin, the pollution threat is a factory located at the river bend, close to Flix, that due to its long operational activity and along with the construction of a dam next to the plant around 1960, resulted in the accumulation of 200,000–360,000 tons of industrial wastes in the riverbed, occupying an area of 700 m of length and 60 m of width. In this study case we evaluated whether aquatic birds such as the Purple Heron reflect the potential pollutant exposure from Flix Reservoir among different riverine and deltaic areas, and assess their usefulness as bioindicators. Also we examined if the polluted wastes of Flix reservoir affect the levels of pollution of the habitats where waterbird populations of the Ebro Delta (situated 90 km downstream) forage and feed.
As results stable isotopes shown the high nitrification and lower carbon signatures in the river, and together with the niche width metrics, that Common and Sandwich Tern behave as strict specialists at the Ebro Delta, with narrow niche widths, while in the opposite way, Little Tern, Little Egret, Purple Heron, Night Heron and the Moorhen behave like generalists foragers, with broad niche widths. Mercury levels in nestlings of Purple Heron at Flix site and eggs of Audouin’s Gull, Little Tern and Common Tern ‘Banya’ at the Ebro Delta are high enough to be of special concern. Arsenic (specially used in combination with carbon signatures) discriminates outstandingly between marine and freshwater species. Both eggs and nestling feathers of Purple Herons are adequate bioindicators for trace element pollution, but nestling feathers present certain advantages. The six selected blood parameters (TOSC ROO*, TOSC OH*, BhCE, CbE, LDH and MN) provide the first evidence of an association of biological responses with pollutants in heron species.
The second study case takes place in Bolivia. Anthropogenic mining has taken place in the Bolivian Andes since at least the fifteenth century. Particularly the East of Oruro Department in the Eastern Andean Cordillera is affected by a long term history of mining. These mining activities were characterized by the deposition of large tailing piles, which accumulated in abandoned and active mines, where trace metals such as lead, arsenic, cadmium, and antimony could reach surface waters and soils, and so the biota. In this case we evaluated the potential of Tinamou species as sentinels of exposure to local trace metal pollution and studied different routes of lead accumulation into the sentinel species, in order to assess the usefulness of feather levels as a measure of the exposure to this pollutant.
As results we found that the detected small home ranges detected in Ornate Tinamou (lower than 1 km2) and their sedentary habits make of this species an adequate bioindicator of local pollution. We recommend feathers for future monitoring programs as they are a non invasive sample. Higher rates of histopathological damage were found in kidney at the polluted sites. We detected high levels of trace elements detected at the polluted sites in the two studied species of Tinamou (Ornate and Darwin Tinamou), many of them trespassing hazard levels. The calamus is the most suitable section for assessing the original endogenous lead levels in feather samples.En este estudio las aves serán utilizadas como bioindicadoras de contaminación por metales pesados en dos escenarios diferentes: el primero en un ambiente acuático, la cuenca del rio Ebro, mientras que el segundo tiene lugar en un ambiente terrestre, los Andes bolivianos. En el primer caso la fuente de contaminación es una fábrica localizada cerca de Flix, que produjo cientos de toneladas de lodos tóxicos. Así evaluamos si aves acuáticas como la Garza imperial reflejan la exposición potencial a los contaminantes de Flix entre zonas fluviales y deltaicas, comprobando su utilidad como bioindicadoras, y también examinamos si dichos residuos afectan a la contaminación de los hábitats donde la avifauna del Delta del Ebro se alimenta. Como resultados los isótopos estables mostraron la alta nitrificación y signaturas más bajas de carbono en el río y observamos que el Charrán común y patinegro actúan como especialistas en el Delta, mientras que Charrancito, Garceta común, Garza Imperial, Martinete y Gallineta de agua son generalistas, presentando amplios nichos tróficos. El mercurio en volantones de Garza Imperial en Flix y huevos de Gaviota de Audouin, Charrancito y Charrán común “Banya” en el Delta presentan valores alarmantes. El arsénico discrimina claramente entre especies marinas y dulceacuícolas. Ambos huevos y plumas son bioindicadores adecuados de contaminación, pero las plumas presentan más ventajas. El segundo estudio tiene lugar en los Andes Bolivianos, donde la actividad minera ha dado lugar a la acumulación de residuos. Evaluamos el potencial de las especies de Tinamúes como bioindicadoras de la exposición a dicha contaminación, incluyendo las diferentes vías de acumulación de plomo en las especies bioindicadoras. Como resultados, los pequeños territorios detectados y hábitos sedentarios hacen del Tinamú Pisacca un bioindicador adecuado de la contaminación local. Se recomienda el uso de plumas al son una muestra no invasiva. El mayor daño histopatológico se encontraron en muestras de riñón de las zonas contaminadas. La contaminación minera ha quedado de manifiesto con los altos niveles detectados en las dos especies estudiadas de Tinamú. El cálamo es la sección más adecuada para la evaluación de los niveles originales endógenos de plomo.
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Belyanovskaya, Alexandra. "Composition élémentaire de mammifères dans les zones naturelles et anthropiques et et impacts potentiels avec la méthode USEtox." Thesis, Paris, ENSAM, 2019. http://www.theses.fr/2019ENAM0049.
Full textAbstract:
L'hétérogénéité géochimique de la biosphère, due a des conditions naturelles et anthropiques différentes, est en train de changer de manière significative du fait du développement de l'homme et de la société. cependant, dans de nombreuses études, les données sur l'interaction des éléments chimiques dans ces cadres de différentes conditions écologiques locales sont absentes; peu d'attention est accordée a l'approche complexe, par exemple, l'utilisation du modèle d’évaluation des impacts sur les organismes vivants. la méthode de l'analyse du cycle de vie (acv) permet de mesurer l'ampleur et l'importance de l'impact sur l'environnement et l'organisme humain. le coefficient caractéristique (cf) - est une valeur tabulaire, proposée par le modèle, selon l'emplacement de la région. dans ce document, il est propose de modifier ce coefficient en introduisant les résultats de l'analyse biogéochimique de territoires présentant des situations écologiques différentes, afin de les classer plus précisément. cette modification détermine la pertinence de l’étude. l’objet de la recherche est déterminé par évaluation de l’état géo-écologique des zones locales de la Russie et du Kazakhstan avec l’aide des 'indicateurs de la composition élémentaire des organes et des tissus des mammifères et d'un classement de la toxicité des différents éléments a l'aide du modèle usetox. cette méthode permet d’élargir le modèle en utilisant des données locales sur la composition chimique du produit alimentaire - le porc -et ensuite peut être utilisée pour évaluer les risques sanitaires pour la population des territoires étudiésThe geochemical heterogeneity of the biosphere, due to different natural and anthropogenic conditions, is changing significantly as a result of the development of man and society. Modern geo-ecological studies of different territories prove the fact of close connections of living organisms with the environment. However, little attention is paid to the complex approach, for example with the use of the model of impact assessment on living organisms. The Life Cycle Assessment (LCA) method, is allowed the magnitude and significance of the impact on the environment and the human organism to be monitored. The characteristic coefficient (CF) - is a tabular value, proposed by the model, depending on the region's location. In this thesis, however, it is proposed to modify this coefficient by introducing the results of biogeochemical analysis of territories with different ecological situations, in order to rank them more precisely. It is this modification, which determines the relevance of the study. The PhD thesis is purposed to assess the geo-ecological state of local areas of Russia and Kazakhstan with the use of indicators of the elemental compositions of organs and tissues of mammals, and a ranking of the toxicity of individual elements using the USEtox model. The modification method of the USEtox impact assessment model, using the results of the chemical analysis, can be used as a local supplement in the assessment of toxic effects on the population
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Naigaga, Irene. "Use of bioindicators and biomarkers to assess aquatic environmental contamination in selected urban wetlands in Uganda." Thesis, Rhodes University, 2013. http://hdl.handle.net/10962/d1002603.
Full textAbstract:
Pollution of aquatic resources in Uganda is on the increase and the trends are expected to increase with increase in population size and urbanisation. Assessment and mitigation of the environmental impacts on water quality and biodiversity have now become necessary. The aim of the study was to integrate invertebrate and fish as bioindicators and fish histopathology as a biomarker in the assessment of water quality deterioration in urban wetlands in Uganda. The integration harnesses the advantages and counteracts the shortcomings of each method and thus builds a more robust diagnostic tool that gives a better view of the impacts to the entire ecosystem. Four endpoints which included, physicochemical variables, benthic macroinvertebrate bioindicators, fish bioindicators and fish histopathology biomarkers were compared between varied effluent-impacted wetlands (Murchison Bay in Kampala, and Kirinya, Masese and Winday Bay in Jinja) and a non-impacted reference wetland (Lwanika in Mayuge). Results from the effluent-impacted sites differed from the less impacted reference site. The two sampling locations at Murchison Bay (inshore and offshore) and one sampling location at Kirinya (inshore), that were highly impacted with urban effluent, showed elevated nutrient levels, low pH, dissolved oxygen and secchi depth readings. This corresponded with low invertebrate taxa and fish species diversity and richness; and severe histopathological responses in liver, gonads and gills of O. niloticus. Sensitive taxa such as ephemeroptera and trichoptera were completely absent while pollution tolerant taxa Chironomus sp, Corbicula and Oligochaeta were present. Also notable was the absence of many native haplochromines and presence of mainly Brycinus sadleri, Oreochromis niloticus and leucostictus. The organs manifested high prevalence of severe inflammatory and regressive changes and higher organ indices that fell within the pathological category. These sites were consistently classified as highly polluted under the four endpoints. The reference site was classified as least polluted while Masese and Winday Bay were moderately polluted. Results suggested that the approach of using invertebrate and fish as bioindicators and the fish histopathology as a biomarker, in relation to water quality physicochemical variables was a useful tool in highlighting the spatial differences in environmental quality.
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Stauffer, Marie. "Impact des taillis à très courte rotation de saules sur les propriétés fonctionnelles des sols et définition d'indicateurs de qualité." Thesis, Université de Lorraine, 2014. http://www.theses.fr/2014LORR0030/document.
Full textAbstract:
Les Taillis à Très Courte Rotation sont une culture destinée à produire des plaquettes de bois énergie. L'objectif de la thèse était d'étudier l'impact des TTCR sur le fonctionnement des sols et de proposer des indicateurs de qualité. Cinq prélèvements ont été effectués chaque printemps et automne entre 2010 et 2012 sur les sols de quatre couples de TTCR et bandes enherbées, d'une forêt alluviale et d'un agrosystème, localisés dans la vallée de l'Aisne. Les paramètres suivants ont été mesurés: matières organiques, carbone total, capacité d'échange cationique et éléments échangeables, phosphore disponible, minéralisation du carbone et de l'azote, biomasse, abondance et diversité des communautés lombriciennes, abondance relative et diversité des communautés fongiques et bactériennes, activités enzymatiques, caractérisations physiques et chimiques des matières organiques. 6 années après la mise en place des TTCR, les densités fongiques et lombriciennes, la respiration basale, l'activité laccase étaient plus élevées dans les TTCR par rapport à l'agrosystème. Ces modifications peuvent être reliées aux changements quantitatifs et qualitatifs des matières organiques (augmentation du C/N, diminution de l'indice hydrogène). L'azote et le phosphore semblent être limitant mais les retours importants et le turn over rapide de la MO viennent tamponner les fortes exportations. Ces mesures ont conduit à la définition d'indicateurs et aboutissent à la proposition de trois indices : fertilité, activité biologique, abondance et diversité des communautés biologiques. L'utilisation des courbes de réponses principales confirme l'effet positif des TTCR sur la qualité du sol, observée avec le calcul d'indices synthétiquesShort Rotation Coppices (SRC) are a crop system intended to produce energy wood chips. This thesis aimed at assessing the impact of SRC on soil functioning and proposing quality indicators. Five samplings were performed in spring and autumn between 2010 and 2012 on plots including four couples of SRC and grassland, an alluvial forest and an agrosystem, in the Aisne valley. The following parameters were monitored: organic matter, total carbon, cation capacity exchange, available phosphorus, carbon and nitrogen basal respiration, earthworm biomass, density and diversity, fungal and bacterial density and diversity, enzymatic activity, physical and chemical organic matter characterisations. 6 years after conversion to SRC, earthworm and fungal density, basal respiration and laccase activity were higher in SRC soil compared to conventional agrosystem. These changes can be linked to qualitative and quantitative organic matter evolutions (increase of the C/N ratio and decrease of hydrogen index). Nitrogen and phosphorus seemed to be limiting factors for SRC crop yields. However, soil nutrient return and the good turnover of organic matter can buffer strong exportations. The measured parameters led to indicator definition and proposition of three indices: fertility, biological activity, density and diversity of biological communities. Principal response curves confirmed the positive effect of SRC on soil quality as observed with synthetic indices calculation
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Kermarrec, Lénaïg. "Apport des outils de la biologie moléculaire pour l'utilisation des diatomées comme bioindicateurs de la qualité des écosystèmes aquatiques lotiques et pour l'étude de leur taxonomie." Thesis, Grenoble, 2012. http://www.theses.fr/2012GRENA010.
Full textAbstract:
La Directive Cadre Européenne sur l'eau impose d'évaluer la qualité des cours d'eau au moyen d'indicateurs chimiques et biologiques dont les diatomées font partie. Les indices basés sur la composition taxonomique et l'abondance relative des taxa de diatomées sont robustes. Cependant, de nombreux échantillons doivent être analysés chaque année alors que l'identification de ces micro-algues en microscopie optique est difficile à cause des incertitudes taxonomiques, et nécessite temps et expertise. Ainsi, des améliorations peuvent encore être apportées pour faciliter le suivi en routine de la qualité de l'eau. Les techniques de biologie moléculaire sont des outils efficaces pour identifier les microorganismes et pourraient donc être utilisées pour améliorer l'identification des diatomées. Les objectifs de cette thèse étaient donc de compléter les connaissances sur la taxonomie des diatomées d'eau douce par des méthodes moléculaires et de progresser dans le développement d'un outil moléculaire permettant l'identification des diatomées dans des échantillons naturels, en vue de son utilisation en bioindication. L'étude de la taxonomie de plusieurs groupes de diatomées a été réalisée en combinant des approches morphologiques et des approches moléculaires. Nos travaux ont montré les capacités des séquences ADN pour discriminer les taxa de diatomées et révéler leurs relations phylogénétiques. L'utilisation de séquences ADN a montré que les critères morphologiques utilisés pour identifier les diatomées ne correspondaient pas systématiquement à leurs relations phylogénétiques. L'utilisation de différents marqueurs a permis des discriminations à différents niveaux taxonomiques. Nos résultats ont également révélé l'importance de combiner des approches complémentaires, morphologiques et moléculaires, pour améliorer notre compréhension des relations entre les différents taxa de diatomées et ainsi stabiliser leur taxonomie. Les séquences ADN permettant une discrimination des taxa de diatomées, nous avons testé un outil moléculaire de séquençage haut-débit, le pyroséquençage 454, dans le but d'identifier les taxa composant les communautés de diatomées. Nous avons ainsi assemblé des bases de séquences de référence bénéficiant d'une identification taxonomique. Nous avons également participé au développement d'outils bioinformatiques nécessaires à l'analyse des données de pyroséquençage. Enfin, nous avons pu tester ces outils pour établir des inventaires taxonomiques de diatomées dans des communautés artificielles (mélanges de souches) et dans des communautés environnementales (biofilms d'eau douce). Ces études ont prouvé le potentiel du pyroséquençage 454 pour étudier les communautés de diatomées à des niveaux taxonomiques précis. La comparaison de différents marqueurs nucléiques a révélé que le marqueur rbcL était le marqueur le plus adapté à l'identification des diatomées par pyroséquençage. En effet, en prenant en compte les bases de séquences de référence, la reproductibilité et les biais de la méthode ainsi que le pouvoir résolutif du marqueur, l'utilisation du rbcL a permis la meilleure estimation de la composition en diatomées d'échantillons complexes. Des progrès devront encore être faits avant de pouvoir utiliser les outils moléculaires pour évaluer la qualité de l'eau par les diatomées. Cependant nos différentes études permettront de guider les prochaines analyses de manière à aboutir à un suivi de la qualité de l'eau basé sur des inventaires moléculaires des taxa de diatoméesThe European Water Framework Directive requires assessing the river quality using chemical and biological indicators among which are diatoms. Indices based on taxonomic composition and relative abundance of diatom taxa are robust. However, thousands of diatom samples are analyzed every year while microscopic identification is difficult due to taxonomic uncertainties, and requires time and expertise. Thus, it is still possible to improve the routine monitoring of water quality. The molecular biology techniques are accurate tools to identify microorganisms and could be used to enhance diatom identification. The objectives of this thesis were therefore to improve our knowledge on the freshwater diatom taxonomy by molecular methods and to progress in the development of a molecular tool in order to identify diatoms in natural samples, thus improving bioindication tools. The taxonomic study of several groups of diatoms was achieved by combining morphological and molecular approaches. Our results showed the capacity of DNA sequences to discriminate diatom taxa and revealed their phylogenetic relationships. The use of DNA sequences showed that the morphological criteria used to identify diatoms do not correspond systematically to their phylogenetic relationships. The use of different markers allowed discrimination at different taxonomic levels. Our results also revealed the importance of combining complementary approaches, morphological and molecular, to improve our understanding of the relationships between different diatom taxa and thus stabilize their taxonomy. As DNA sequences allowed discrimination of diatom taxa, we tested a molecular tool of high throughput sequencing, 454 pyrosequencing, in order to identify the diatom composition of communities. We assembled reference libraries of sequences linked to taxonomic identification and we contributed to the development of bioinformatic tools required to analyze data from pyrosequencing. Finally, we tested these tools to establish taxonomic inventories of diatoms in artificial communities (mixtures of strains) and environmental communities (freshwater biofilm samples). The studies showed the potential of 454 pyrosequencing to accurately analyze diatom communities. The comparison of different nucleic markers revealed that the rbcL marker was the most suitable to identify diatoms using pyrosequencing. Indeed, taking into account reference libraries, reproducibility and bias of the method, and the resolving power of marker, the use of rbcL allowed the best estimation of the diatom composition in complex samples. Improvements will be necessary to use molecular tools in order to assess water quality using diatoms. However our studies lead the way for future experiments in order to achieve a monitoring of water quality based on molecular inventories of diatom taxa
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Rivaux, Emmanuel. "Les lichens : généralités, rôle comme bioindicateurs de la pollution." Paris 5, 1998. http://www.theses.fr/1998PA05P039.
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Quemeneur, Marianne Leyval Corinne Jauzein Michel. "Les processus biogéochimiques impliqués dans la mobilité de l'arsenic recherche de bioindicateurs /." S. l. : Nancy 1, 2008. http://www.scd.uhp-nancy.fr/docnum/SCD_T_2008_0088_QUEMENEUR.pdf.
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Pascaud, Alice. "Bioindicateurs microbiens et biosurveillance des agrosystèmes : cas des sols viticoles." Bordeaux 2, 2007. http://www.theses.fr/2007BOR21491.
Full textAbstract:
L'évaluation de l'état biologique des sols est un élément important de jugement de la durabilité des agrosystèmes et des pratiques culturales. Au sein du sol, les micro-organismes représentent des sources potentielles de bioindicateurs/biomarqueurs, permettant la construction de cet indicateur. L'objectif de ce travail est de déterminer parmi les paramètres microbiens caractéristiques de la taille, de l'activité et de la diversité des communautés microbiennes naturelles, des indicateurs les plus susceptibles de donner lieu à des analyses de routine ainsi que leurs domaines de variabilité naturelle respectifs. Dans une première partie, une séparation préalable des corps microbiens combinant une dispersion mécanique dans un milieu chimique dispersant et une séparation densitométrique a été mise au point et permis d'extraire entre 7 et 15% des micro-organismes selon le type de sol. Dans une deuxième partie, de part l'obtention d'une suspension cellulaire purifiée, élargissant les possibilités analytiques aux kits commerciaux d'analyses biochimiques de cultures microbiennes, l'utilisation de techniques spectrophotométriques a permis d'accéder aux caractéristiques microbiennes. Seule, la détermination de la diversité spécifique reste tributaire de techniques moléculaires peu automatisables. Enfin, la variabilité spatiale de ces paramètres microbiens a été étudiée sur une parcelle viticole et comparée à celle de paramètres physico-chimiques du sol, permettant de valider les approches analytiques retenues, de faire apparaître des liens entre variables abiotiques et biologiques, mais surtout de soulever le problème de la taille de l'échantillonnage pour ce qui concerne les variables biologiques.
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Shotwell, Matthew Stephen. "Fluctuating Asymmetry and Its Relationship to Established Indicators of Environmental Stress." Digital Commons @ East Tennessee State University, 2006. https://dc.etsu.edu/etd/2182.
Full textAbstract:
Fluctuating asymmetry (FA) is commonly thought to be a predictor of environmental stress. However, the relationship between FA and established indicators for environmental stress has received little attention. In this study, 10-38 specimens of the freshwater fish Rhinichthys atratulus were collected from 15 natural populations under varying amounts of environmental stress. Asymmetry measurements in three bilateral characters of the specimens were used to investigate the relationship between FA and established indicators of environmental stress. Significant differences in the magnitude of FA were observed between sampling locations. However, the relationship between estimates of FA and established indicators produced varying results. The present study concludes with a discussion on the usefulness of FA as a bioindicator for environmental stress and implications for future studies.
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Guillot, Héloïse. "L’herpetofaune, sentinelle de l’accumulation et des effets des contaminants environnementaux ?" Thesis, La Rochelle, 2017. http://www.theses.fr/2017LAROS024/document.
Full textAbstract:
Le développement des activités industrielles et agricoles du siècle dernier a eu pour conséquence le rejet de substances chimiques dans l’environnement, qui contaminent les écosystèmes, et peuvent s’accumuler dans les plantes, les sédiments, et le long des chaînes alimentaires. Il apparait primordial d’effectuer une évaluation du risque écologique associé à la présence de ces composés dans les milieux naturels et les espèces sentinelles sont des outils judicieux pour déterminer l’exposition des individus et évaluer les conséquences sur les organismes. Les amphibiens et les reptiles possèdent des caractéristiques écologiques et biologiques qui les rendent potentiellement intéressants en tant qu’espèces sentinelles. L’objectif des études présentées dans cette thèse est de déterminer la disponibilité de certaines substances dans l’environnement, et d’évaluer les effets de la contamination environnementale sur les organismes en utilisant plusieurs espèces de reptiles et d’amphibiens, (i) en mesurant les niveaux de polluants accumulés dans les tissus d’espèces de reptiles ; (ii) en évaluant l’influence d’un habitat contaminé sur la morphologie d’adultes de crapaud commun (Bufo bufo) ; (iii) en mesurant de manière expérimentale l’impact d’une molécule fréquemment retrouvée dans l’environnement sur le développement de têtards de crapaud commun. Nos résultats montrent d’une part que les reptiles accumulent efficacement les polluants organiques et les éléments traces métalliques dans leurs tissus, et permettent d’évaluer efficacement la contamination globale d’une zone, mais aussi de mettre en évidence des pollutions ponctuelles localisées. D’autre part, nos travaux montrent une influence de l’habitat agricole sur la morphologie du crapaud commun, potentiellement causé par la présence de contaminants dans ces milieux. Enfin, nous avons pu mettre en évidence un effet de concentrations faibles d’AMPA, métabolite principal du glyphosate, sur le développement de têtards de crapaud commun. Les amphibiens constituent donc des organismes efficaces pour étudier l’impact de la contamination de l’environnement sur les caractéristiques individuelles. Nos travaux montrent ainsi l’utilité de certaines espèces de reptiles et d’amphibiens comme espèces sentinelles de la présence de contaminants dans l’environnement et de leur impact potentiel sur les organismes. Les travaux en écotoxicologie qui portent sur ces organismes restent trop rares, et il est impératif de développer la recherche dans ce domaine, pour participer de manière efficace à l’évaluation du risque environnementalThe development of industrial and agricultural activities over the last century has resulted in the release of chemicals into the environment, which contaminate ecosystems and can accumulate in plants, sediments and across food webs. As such, it is essential to conduct an assessment of the ecological risk associated with the presence of these compounds in natural environments. Achieving this can be aided through the study of sentinel species, which can be used to determine exposure rates of individuals and assess how these subsequently impact wildlife. Amphibians and reptiles display ecological and biological characteristics that may make them particularly attractive as sentinel species. The collection of studies presented in this thesis aims to determine the availability of contaminants in the environment and estimate the effects of this on individual traits of living organisms. Across several species of reptiles and amphibians we, (i) measured levels of pollutants accumulated in the tissues of several reptile species ; (ii) assessed how contaminated habitats impact the morphology of adult common toads (Bufo bufo) ; and (iii) experimentally measured the influence of a molecule frequently detected in the environment on common toad tadpoles’ growth. Results show that reptiles efficiently accumulate organic pollutants and metal trace elements in their tissues, and thereby allow efficient evaluation of the global contamination of an area, as well as the occurrence of localized pollution events. In addition, our work shows an influence of the agricultural habitat on the morphology of adult common toads, which is potentially a consequence of the presence of chemicals in these environments. Finally, we were able to demonstrate an effect of low concentrations of AMPA, the main metabolite of glyphosate, on the development of common toad tadpoles. Amphibians are therefore efficient organisms to study the impact of environmental contamination on individual characteristics. Our work shows the usefulness of certain species of reptiles and amphibians as sentinel species for the presence of contaminants in the environment, and their potential impact on organisms. Ecotoxicological studies on these organisms remain too scarce, and it is imperative to develop research in this field, to participate effectively in the assessment of environmental risk
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Ramirez, Alexa. "Patch reefs in Biscayne National Park, FL : sediments, foraminiferal distributions and a comparison of three biotic indicators of reef health." [Tampa, Fla] : University of South Florida, 2008. http://purl.fcla.edu/usf/dc/et/SFE0002518.
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Pihan, François Gomot Lucien. "Caractérisation de mollusques gastéropodes terrestres en tant que bioindicateurs de la contamination polymétallique (Al, Cr, Mn, Fe, Ni, Zn, Cu, Cd et Pb)." [S.l.] : [s.n.], 2001. ftp://ftp.scd.univ-metz.fr/pub/Theses/2001/Pihan.Francois.SMZ0139.pdf.
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Jandry, Joëlle. "Proposition d'indicateurs de la qualité du milieu pour la préservation et la réintroduction d'Austropotamobius pallipes : éphémères et matière organique." Thesis, Poitiers, 2012. http://www.theses.fr/2012POIT2315/document.
Full textAbstract:
L'Ecrevisse à pattes blanches ou Austropotamobius pallipes est un des organismes sentinelles des rivières françaises dont le déclin accompagne la dégradation progressive des masses d'eau superficielle. Les programmes de repeuplement pour la conservation de l'espèce s'inscrivent dans le cadre de la restauration écologique et de la surveillance de la bonne qualité des milieux. Pour leur réussite, il est nécessaire de pouvoir évaluer le potentiel d'un site à être repeupler. En ce sens, le présent travail a proposé l'emploi des éphéméroptères et de la matière organique comme indicateurs. L'étude a été menée sur des ruisseaux de têtes de bassin des Deux-Sèvres qui constituent encore des sites à A. pallipes. La présence de certaines familles d'éphéméroptères (Leptophlebiidae) est corrélée avec la présence de cette écrevisse. Ces indicateurs biologiques ont prouvé leur efficacité dans le cadre de campagne de repeuplements réussis. Les propriétés de fluorescence de la matière organique expriment le fonctionnement des milieux et par extension leur qualité. Un modèle statistique bâti sur ces propriétés permet également de prédire la probabilité de présence ou d’absence d’A. pallipes pour un site donné. Les deux indicateurs proposés dans ce travail ont montré leur potentiel pour servir d'outil à la réintroduction de cette espèceWhite-clawed crayfish (Austopotamobius pallipes) is a sentinel organism in French rivers. Its decline follows the progressive degradation of the masses of water surfaces. Restocking programs for the conservation of this species take place in the frame of ecological restoring and monitoring of good environment quality. For their success, it is necessary to evaluate the potential of a site to be repopulated. In this sense, the present work proposes the use of Ephemeroptera (Leptophlebiidae) and Organic Matter as indicators. This study was conducted in headwater streams of the Deux-Sèvres region (France), which are suitable sites for A. pallipes. The presence of certain species of mayflies is correlated with the presence of this white-clawed crayfish. This biological indicator had proven its efficiency under a succeeded restocking campaign. The fluorescence properties of the Organic Matter express the functionning of the sites and by expansion their quality. A statistical model built on these properties also allows to predict the probability of a site for the presence or absence of A. pallipes. Two indicators proposed in this work have shown their potential toserve as a tool for the reintroduction of this species
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Signoret, Jonathan Müller Serge. "Etude de la qualité de l'air en Lorraine-Nord par les lichens contribution en tant que bioindicateurs écologiques, bioaccumulateurs d'éléments chimiques et biomarqueurs du stress oxydant /." Metz : Université Metz, 2008. ftp://ftp.scd.univ-metz.fr/pub/Theses/2002/Signoret.Jonathan.SMZ0213.pdf.
Full text
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Quemeneur, Marianne. "Les processus biogéochimiques impliqués dans la mobilité de l’arsenic : recherche de bioindicateurs." Thesis, Nancy 1, 2008. http://www.theses.fr/2008NAN10088/document.
Full textAbstract:
Les bactéries jouent un rôle majeur dans la mobilité de l’arsenic (As) dans l’environnement. L’objectif de cette thèse était d’identifier les acteurs bactériens clés de la biotransformation de l’As pouvant être utilisés comme bioindicateurs du devenir de l’As dans les sites pollués. De nouveaux outils moléculaires ont été développés sur les gènes aoxB, codant la sous-unité catalytique de l’AsIII-oxydase, et validés pour analyser qualitativement et quantitativement les communautés AsIII-oxydantes. La pertinence de l’usage de ce gène comme marqueur fonctionnel a été démontrée par sa détection exclusive chez toutes les bactéries AsIII-oxydantes testées et une phylogénie AoxB cohérente et similaire à celle de l’ARNr 16S. Les approches de DGGE et de PCR en temps réel appliquées aux gènes aoxB ont permis d’évaluer rapidement et sensiblement les variations de communautés AsIII-oxydantes associées à différentes teneurs et spéciations d’As dans des eaux. La coexistence de diverses bactéries AsIII-oxydantes et AsV-réductrices a également été démontrée dans des sols industriels et agricoles. La microflore indigène est ainsi capable d’influencer la spéciation/mobilité de l’As initialement présent et/ou adsorbé sur des oxy-hydroxydes de fer selon les conditions redox du milieu. L’usage des gènes fonctionnels aoxB et arrA, marqueurs des bactéries AsIII-oxydantes et respirant l’AsV, est pertinent pour évaluer les transformations potentielles de l’As. L’effet de bactéries agissant indirectement sur la mobilité de l’As a également été révélé. La détection de ces activités bactériennes à l’aide d’outils moléculaires est prometteuse pour évaluer la mobilité de l’As dans un écosystème donnéBacteria can play a major role in the environmental mobility of arsenic (As). The aim of this study was to identify key bacterial players involved in the biotransformation of As and to use them as bioindicators or predictive tools of As behaviour in polluted sites. Novel molecular tools were developed based on the aoxB gene which encodes the catalytic subunit of AsIII-oxidase, and validated for use in the qualitative and quantitative analysis of the AsIII-oxidizing bacterial community. The aoxB gene was exclusively detected in all tested AsIII-oxidizing bacteria and AoxB and 16S rRNA gene phylogenies were broadly coherent, demonstrating the usefulness of the aoxB gene as a powerful functional marker. The application of DGGE and real-time PCR on aoxB genes allowed the rapid and sensitive evaluation of changes in the AsIII-oxidizing community as a function of As speciation and pollution level in surface and groundwaters. AsIII-oxidizers and AsV-reducers were found to coexist in tested soils. The crucial role of indirectly As-mobilizing bacteria was also revealed. Indigenous microflorae affected the speciation and mobility of As inherent within the environmental matrix and/or adsorbed on iron oxy-hydroxydes, according to redox conditions. The relevance of the use of aoxB and arrA genes, as functional markers of AsIII-oxidizers and AsV-reducers, respectively, to evaluate potential As transformation was demonstrated. The detection of these bacterial communities using molecular tools was shown to have great promise in the prediction of As mobility in the environment
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Pihan, François. "Caractérisation de mollusques gastéropodes terrestres en tant que bioindicateurs de la contamination polymétallique (Al, Cr, Mn, Fe, Ni, Zn, Cu, Cd et Pb)." Metz, 2001. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/UPV-M/Theses/2001/Pihan.Francois.SMZ0139.pdf.
Full textAbstract:
L'évaluation du niveau ce contamination polymétallique en écosystème terrestre nécessite le choix d'organismes bioindicateurs pertinents. Cette étude valide la capacité bioindicatrice des gastéropodes terrestres. Helix aspersa aspersa et Cepaea nemoralis présentent des capacités de niveau équivalent. Une grille d'évaluation de la contamination polymétallique avec 4 classes pour 8 métaux a été proposée. L'usage de Helix pomatia nécessitera des recherches ultérieures avec établissement d'une grille spécifique. Le choix de Helix aspersa aspersa en biosurveillance active est justifiée par la possibilité d'obtenir un élevage contrôlé des individus exempts de contamination métallique après amélioration de l'aliment. L'étude des niveaux de bioaccumulation atteints pour 8 métaux, dans des conditions variées (animaux d'élevage, animaux autochtones ou transférés), sur sites non contaminés ou contaminés (proximité autoroutière, trafic urbain, ancienne mine de cuivre, CET remédié, aciérie électrique), a permis de valider la grille d'évaluation du niveau de contamination en conservant 4 classes pour Cu, Mn, Cd, Ni et 5 classes pour Fe, Zn, Cr et Pb. Pour le plomb, la distinction entre le plomb d'origine pédologique et le plomb provenant des activités anthropiques peut être réalisée par l'étude des rapports isotopiques entre [exposant]206Pb, [exposant]Pb207 et [exposant]208Pb qui permet de distinguer le pôle « essence-trafic », pôle « industrie » et le pôle « nature ». Une étude ultrastructurale et microanalytique du néphrocyte a mis en évidence l'existence d'un ergastoplasme ondulé original et celle de la production de concrétions majoritairement constituées de silice amorphe. La biominéralisation à base de calcium (pyrophospathes) a été vérifiée ainsi que son rôle de piégeage. Cette biominéralisation représente une voie importante de décontamination pour l'organisme, mais aussi pour l'écosystèmeThe evaluation of the level of the polymetallic contamination in ground ecosystem requires the choice of relevant bioindicator organisms. This study confirms the bioindicative capacity of ground gastropods. Helix aspersa aspersa and Cepaea nemoralis present capacities of equivalent level. A grid of evaluation of the polymetallic contamination with 4 or 5 classes for 8 metals was proposed. The use of Helix pomatia wil require later researches with establishment of a specific grid. Helix aspersa aspersa choice in active biosurvey is justified by the possibility of obtaining a controlled farming by the individuals exempt from metal contamination after improvement of the food. The study of the levels of bioaccumulation reached for 8 metals, in varied conditions (farming animals, autochtonous or transfered animals), on not contamined or contamined sites (motorway, urban traffic, old coppermine, THC, electric steelworks), allowed to validate the grid of evaluation of the level of contamination by keeping 4 classes for Cu, Mn, Cd, Ni and 5 classes for Fe, Zn, Cr et Pb. For the lead, the distinction between the lead of pedogeological origin and the lead resulting from anthropogenic activities cand be realized by the study of the pole "petrol-trafic", the pole "industry" and the "wild" pole. An ultrastructural and microanalytical study of the nephrocyte put in evidence the existence of an original wavy ergastoplasm and that of a production of concretions mainly constituted by amorphous silica. The biomineralization on base of calcium (pyrophosphates) was verified as well as its role of trap. This biomineralization represents an important way of decontamination of the organism, but also likely for the ecosystem
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Lemesle, Stéphanie. "Bioindicateurs du milieu marin : utilisation des macroalgues comme outil d’évaluation de la qualité biologique des eaux marines : réponse à une problématique d’échouages d’algues." Caen, 2015. http://www.theses.fr/2015CAEN2028.
Full textAbstract:
Afin de limiter et prévenir la dégradation des écosystèmes côtiers, il est nécessaire de développer des outils efficaces d’évaluation et de suivi de la qualité des milieux. Le potentiel de bioindication de la qualité des eaux par les algues a été évalué dans un contexte d’échouages d’algues à Grandcamp-Maisy et Courseulles-sur-Mer (Calvados). Ces accumulations estivales se caractérisent par une grande hétérogénéité qualitative (Rhodophyta, Phaeophyta, Chlorophyta) et quantitative et sont le fait de la proximité de platiers rocheux colonisés par les algues. Cependant leur biodiversité s’est avérée relativement pauvre en raison de la faible bathymétrie des estrans et de la présence de larges plages sableuses. L’évaluation de l’état des peuplements à partir de l’indicateur REBENT «macroalgues intertidales» a révélé une qualité «Moyenne» des eaux due en grande partie à la spécificité des estrans plats du Calvados. Un protocole d’évaluation plus adapté (QUEROSA) a donc été mis au point. Un suivi in situ à fine échelle des paramètres biologiques (δ15N, contenu N, δ13C) de six macroalgues a été réalisé sur les 2 sites d’échouage en 2012 et 2013. Contrairement aux points de référence océanique (Chausey) et fortement anthropisé (Seine), une variation saisonnière de la signature isotopique δ15N a été mise en évidence sur les 2 sites avec des δ15N faibles au printemps suggérant une entrée d’azote agricole et élevés en fin d’été liés à une entrée d’azote régénéré issu de la décomposition des algues épaves. La comparaison in situ du δ15N des différentes algues couplée à une étude in vitro ont permis de montrer la pertinence de l’utilisation de chaque espèce comme bioindicateurTo limit and prevent the degradation of the coastal ecosystems, it is necessary to develop tools for monitoring the quality of marine environment. The potential of seaweeds for coastal water quality bioindication was evaluated in the context of seaweed beachings in Grandcamp-Maisy and Courseulles-sur-Mer (Calvados). These summer season accumulations are heterogenous in quantity and quality (a mixture of Rhodophyta, Phaeophyta and Chlorophyta species) and are originated from large rocky shores highly colonized. However, the algal biodiversity of these rocky plateaus was relatively poor due to the low bathymetry and to the wide sandy beaches. The assessment of the state of algal communities with the REBENT indicator « intertidal macroalgae » revealed a “Medium” quality of coastal waters largely due to the specificity of Calvados shores. An evaluation of coastal water quality protocol more suitable named QUEROSA, was also developed. An in situ fine-scale survey of biological parameters (δ15N, nitrogen content, δ13C) of six seaweeds species was conducted on the two stranding sites in 2012 and 2013. In contrast to oceanic (Chausey archipelago) and highly anthropized (Seine estuary) reference points, a similar temporal dynamics of δ15N signatures has been highlighted at the two study sites with low δ15N in spring suggesting inputs of agricultural nitrogen and high δ15N in late summer linked to inputs of regenerated nitrogen from decomposition of seaweed beachings. The comparison of in situ δ15N of different seaweeds species coupled with an in vitro study have shown the relevance of using each algal species as bioindicator of nitrogen pollution
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Charvet, Stéphane. "Intégration des acquis théoriques récents dans le diagnostic de la qualité écologique des cours d'eau à l'aide des bioindicateurs invertébrés." Lyon 1, 1999. http://www.theses.fr/1999LYO10069.
Full textAbstract:
Depuis longtemps les organismes aquatiques ont ete utilises afin d'evaluer l'etat de sante des hydrosystemes. Toutefois les indices biologiques classiques ne permettent pas de diagnostiquer les types de pollution, et integrent mal les variations naturelles, temporelles ou spatiales, des communautes. Le but de cette these est donc d'utiliser les traits biologiques des organismes afin de tester leur pertinence dans un diagnostic de qualite ecologique. Ce document presente la base de donnees invertebres qui a toujours servi de support de travail pour toutes nos interrogations. Cette base de donnees permet de stocker et d'interroger des dizaines de milliers de donnees reparties sur un tiers du territoire national. Elle constitue un outil indispensable. Le document decrit ensuite le premier test des traits biologiques sur un cas concret de pollution par effluent de station d'epuration. Cette etude a montre que les traits biologiques etaient robustes face a la variabilite saisonniere des communautes et face a l'effort d'echantillonnage, et que parallelement ils etaient tres sensibles au facteur pollution. De plus la discrimination des sites etait meilleure que celle donnee par l'analyse des abondances taxonomiques seules. La confirmation de cette sensibilite nous a ensuite conduit a rechercher les structures fonctionnelles de reference pour des stations exemptes de pollution. Ainsi, l'etude de 124 echantillons repartis sur la france a montre que presque tous les traits biologiques et ecologiques etaient stables face a la variabilite spatiale naturelle des communautes. Ceci nous a permis d'obtenir des distributions frequentielles de reference pour l'ensemble des traits. Enfin, nous avons applique les traits biologiques et ecologiques a des stations polluees, et nous avons compare les resultats obtenus aux stations de reference precedentes. Ceci a demontre que les traits biologiques etaient capables de separer entre eux les grands types de pollution. Donc, les traits biologiques representent un outil extremement interessant pour la bioindication qui est a la fois robuste temporellement et spatialement, et sensible aux pollutions. C'est un outil general relie a des concepts theoriques qui est tres largement applicable, et ceci bien au-dela de nos frontieres.
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Carravieri, Alice. "Seabirds as bioindicators of Southern Ocean ecosystems : concentrations of inorganic and organic contaminants, ecological explanation and critical evaluation." Thesis, La Rochelle, 2014. http://www.theses.fr/2014LAROS026/document.
Full textAbstract:
L’océan Austral est soumis à la redistribution globale des contaminants par les voies atmosphérique et océanique. Cependant, la contamination des écosystèmes austraux est très peu connue, en particulier dans le secteur Indien. De par leur toxicité, leur mobilité et leur capacité à se bioaccumuler dans les tissus des organismes et à se bioamplifier dans les réseaux trophiques, le mercure (Hg) et les polluants organiques persistants (POPs) comptent parmi les contaminants les plus préoccupants. Du fait de leur position élevée dans les réseaux trophiques, les oiseaux marins sont exposés à de grande quantités de contaminants par la voie alimentaire. En conséquence, ils sont souvent utilisés comme bioindicateurs de l’état de contamination des écosystèmes, par le biais des plumes et du sang, qui peuvent être échantillonnés de façon non destructive. Ma thèse s’est intéressée aux nombreuses espèces d’oiseaux marins (plus de 40) qui nichent au sein des Terres Australes et Antarctiques Françaises, au sud de l’Océan Indien, afin de décrire et expliquer les niveaux de contaminants le long d’un large gradient latitudinal, de l’Antarctique à la Zone Subtropicale, et d’identifier les meilleures espèces bioindicatrices pour un suivi à long terme de la contamination de ces écosystèmes. Au cours d’une première étape méthodologique, les manchots et les poussins de toutes les espèces ont été identifiés comme de bons bioindicateurs de contamination puisque, à la différence de la plupart des oiseaux adultes, ils présentent une faible variabilité des niveaux de contaminants dans les plumes. Au cours d’une seconde étape explicative, l’effet de facteurs intrinsèques (traits individuels) et extrinsèques (écologie alimentaire déduite grâce à la méthode des isotopes stables) sur les niveaux de contaminants a été évalué dans les plumes des oiseaux de la communauté de Kerguelen (27 espèces) et dans le sang du grand albatros de Crozet (180 individus dont les traits de vie sont connus). L’écologie alimentaire s’est avérée être le principal facteur explicatif des niveaux de contaminants, tandis que l’âge, le sexe, la phylogénie et le statut reproducteur jouent un rôle mineur. La classe d’âge est néanmoins un facteur à prendre en compte, puisque les poussins montrent souvent des concentrations inférieures aux adultes. Au cours d’une troisième étape, les variations spatio-temporelles de la contamination ont été étudiées en utilisant une sélection d’espèces bioindicatrices et en tenant compte de leur écologie alimentaire. Plusieurs résultats portant sur différentes espèces (oiseaux océaniques) et populations (poussins de skua) ont montré que, contrairement aux prédictions, l’exposition des oiseaux au Hg augmente graduellement des eaux antarctiques aux eaux subantarctiques puis aux subtropicales, alors que l’exposition aux POPs, en accord avec la théorie de la distillation globale, montre la tendance inverse. D’autre part, la comparaison des concentrations en Hg dans les plumes de manchot, effectuée entre des spécimens de musée et des échantillons actuels, indique que leur exposition au Hg n’a pas changée depuis les années 1950-1970. Toutefois, des espèces subantarctiques montrent une tendance à la hausse. De futures études devraient viser à l’utilisation des plumes comme tissu de référence pour l’évaluation et le suivi de la contamination des écosystèmes, en particulier en ce qui concerne les POPs. Parmi les nombreuses espèces étudiées au cours de ces travaux de thèse, les bioindicateurs les plus pertinents se révèlent être le manchot empereur et le pétrel des neiges (Antarctique), le manchot royal, le pétrel bleu et l’albatros à sourcil noirs (subantarctique), le gorfou sauteur subtropical et l’albatros à bec jaune (subtropical). Le suivi à long terme de ces espèces permettra d’évaluer l’évolution temporelle de l’état de contamination de l’océan AustralAntarctic and subantarctic marine environments are reached by inorganic and organic contaminants through ocean circulation and atmospheric transport. Yet, environmental contamination is poorly known in the Southern Ocean, in particular in the Indian sector. Among environmental contaminants, mercury (Hg) and persistent organic pollutants (POPs) are primarily of concern, because they are toxic, highly mobile, and they bioaccumulate in the tissues of living organisms and biomagnify up the food web. Seabirds, as upper predators, are exposed to large quantities of contaminants via food intake and have widely served as biomonitors of marine contamination, notably through the non-destructive sampling of their feathers and blood. My doctoral work has focussed on the abundant and diverse seabird species (more than 40) breeding in the French Southern and Antarctic Lands, southern Indian Ocean, in order to describe and explain contaminant concentrations over a large latitudinal gradient, from Antarctica to the subtropics, and to identify the best bioindicator species for contaminant biomonitoring. In a first methodological step, seabirds with synchronous moult of body feathers (adult penguins and chicks of all species) were recognised as good candidates as bioindicators, because, unlike most adult birds, they present low within-individual variation in feather contaminant concentrations. In a second explanatory step, the influence of intrinsic (individual traits) and extrinsic factors (feeding ecology inferred from the stable isotope method) driving variation in contaminant concentrations was evaluated in feathers of the large avian community of the Kerguelen Islands (27 species) and in blood of wandering albatrosses from the Crozet Islands (180 birds of known individual traits). Feeding ecology was the main factor driving variation in contaminant concentrations of blood and feathers, both at the community, population and individual levels, whereas age, sex, phylogeny and breeding status played a minor role. Age-class was however an important intrinsic factor to consider, with chicks usually having lower concentrations than adults. In a third step, spatio-temporal patterns of contamination were studied through selected bioindicator species and by taking into account their feeding habits. Results from different species (oceanic seabirds) and populations (skua chicks) showed that, contrary to predictions, Hg exposure gradually increases from Antarctic to subantarctic and subtropical waters, whereas, in accordance with the global distillation theory, POPs exposure has the opposite pattern. Comparisons between penguin feathers from museum collections and contemporary samples showed that bird exposure to Hg is overall not different today when compared to 50-70 years ago, but subantarctic species are possibly experiencing an increasing trend. Future research efforts should be focussed on the use of feathers as biomonitoring tools, in particular for POPs determination. The best recommended bioindicator species include the emperor penguin and snow petrel (Antarctic), king penguin, blue petrel and black-browed albatross (subantarctic), and northern rockhopper penguin and Indian yellow-nosed albatross (subtropical). Future biomonitoring studies on these species will give invaluable insights into the poorly-known temporal trends of environmental contamination in the Southern Ocean
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Signoret, Jonathan. "Etude de la qualité de l'air en Lorraine-Nord par les lichens : contribution en tant que bioindicateurs écologiques, bioaccumulateurs d'éléments chimiques et biomarqueurs du stress oxydant." Metz, 2002. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/UPV-M/Theses/2002/Signoret.Jonathan.SMZ0213.pdf.
Full textAbstract:
L'objectif de cette thèse a été de contribuer à une meilleure compréhension de l'impact des pollutions sur les lichens dans des conditions éxpérimentales de terrain (région Lorraine, France). Les techniques d'analyses des aires d'échantillonnage des lichens épiphytes en bioindication étaient peu développées. Sans une méthode précise et une validation solide des choix de la surface d'échantillonnage, l'analyse des relevés reste subjective et les études comparatives et les hypothèses testées approximatives. Pour examiner ce problème, nous avons testé une technique opérationnelle d'échantillonnage et d'analyse spatiale, basée du recouvrement et de la fréquence lichénique. La transplantation est une technique de terrain utilisée pour l'étude des effets de la pollution de l'air et de l'accumulation d'éléments chimiques sur la symbiose lichénique. Nous l'avons utilisé pour étudier les effets des polluants gazeux et des éléments chimiques de l'air sur la physiologie de lichens exposés ou non à des précipitations. Pour analyser ces interactions, le lichen Hypogymnia physodes a été transplanté pendant l'été 2001 dans 5 sites de la vallée de la Moselle présentant des niveaux différents de pollution atmosphèrique. Dans chacun de ces sites, 6 dispositifs de transplantation, permettaient la fixation des lichens, respectivement à l'abri ou non des précipitations. Des échantillons de lichens ont été récoltés à la fin de chaque période d'exposition pour déterminer les concentrations en éléments chimiques, en chlorophylles et en malondialdéhyde, ainsi que le rapport de phéophytinisation. Des analyses de variances et en composantes principales entre les paramètres biologiques, les bioconcentrations chimiques du lichen et des paramètres statistiques de polluants gazeux ont été réalisées pour tester les relations significatives
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Mitiku, Addisu Asefa. "Afromontane avian assemblages and land use in the Bale Mountains of Ethiopia : patterns, processes and conservation implications." Diss., University of Pretoria, 2013. http://hdl.handle.net/2263/79782.
Full textAbstract:
Although protected areas have been used as principal conservation tools, most of them are suffering from human-induced threats. Consequently, a good understanding of such human-driven threats on biodiversity and identifying early warning systems for habitat change in protected areas is necessary for effective conservation of natural resources. To examine the impact of human disturbance on avifaunal assemblages and to assess the potential application of birds as bioindicators of forest health monitoring in the Afromontane forest of the Bale Mountains of Ethiopia, I recorded birds and habitat variables in three protected and three unprotected forests using a point transect method in 2009 and 2012. The two land use types differ in disturbance levels (higher in the unprotected areas), vegetation structure and bird assemblages. Species richness of entire bird guild, open woodland and open land habitat guilds, granivore and insectivore feeding guilds, and shrub layer and ground layer foraging substrate guilds of birds were significantly higher in the unprotected areas than the protected areas. Abundances of guilds of birds mostly followed a similar trend with species richness. However, densities of overall and forest-specialist bird guilds were higher in the protected area and vice versa for the other guilds. In general, the protected area assemblages were dominated by forest-specialist species, while those of the unprotected areas were dominated by openland and shrubland species. The implication is that disturbance had caused encroachment of non-native species (openland, open woodland and shrub land species) while negatively affecting native species (forest species, particularly tree canopy foragers). These assemblage differences are linked to changes in vegetation structure caused by disturbance. Thus, further forest degradation in the protected area should be avoided in order to maintain native/forest-specialist species. Given the differences in bird assemblages between the two land use types, there is a high likelihood that bioindicator species (i.e. indicator species - those 'characteristic' of a particular habitat - and detector species - those occurring in the different habitats considered but with moderate indication value) can be identified, therefore providing a useful tool to monitor ecosystem health of the forests. Four and nine species were identified as appropriate indicator species (i.e. species with indicator values > 60% and fulfilling biological and niche history criteria used in selection) in the protected and unprotected areas, respectively. In addition, nine species were identified as detectors of habitat change in the protected areas. These bioindicators provide a useful tool for managers of Afromontane forest in the Bale Mountains, as well as similar habitats elsewhere, for long term monitoring of ecosystem health of the forests.Dissertation (MSc)--University of Pretoria, 2013.
DST/NRF Centre of Excellence
Zoology and Entomology
MSc
Unrestricted
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Bourgeois, Emilie. "Contribution au développement de bioindicateurs microbiens pour l'évaluation de l'impact de pratiques agricoles sur les sols." Thesis, Dijon, 2015. http://www.theses.fr/2015DIJOS063/document.
Full textAbstract:
Le sol représente le support de la production agricole. A l’interface avec les autres compartiments de la biosphère, il remplit de nombreuses fonctions essentielles à la fourniture de services écosystémiques nécessaires au bien-être de nos sociétés. C’est aussi une ressource non renouvelable dont les propriétés physicochimiques et biologiques ont été altérées par le développement de l’agriculture intensive. La prise de conscience actuelle de cet état de fait a révélé la nécessité de définir de nouveaux modes de gestion adaptés à la préservation et à l’utilisation durable des sols. Elle a ainsi marqué l’entrée dans l’ère de l’agroécologie qui prône un modèle de production optimisant notamment les services rendus par la biodiversité afin de réduire le recours aux intrants et à l’utilisation d’énergie. Pour atteindre cet objectif, le développement d’une gamme d’indicateurs permettant d’évaluer les pratiques/systèmes agricoles en rendant compte de la qualité biologique du sol est donc indispensable. Cette thèse, dont l’objectif est de contribuer au développement de bioindicateurs microbiens de la qualité du sol, s’inscrit dans ce contexte agroécologique. Le choix de travailler sur les communautés microbiennes se justifie pleinement dans cette problématique car elles sont (i) présentes avec une forte densité et diversité dans tous les environnements, (ii) fortement impliquées dans le fonctionnement biologique et les services rendus par le sol, et (iii) elles répondent de façon très sensible aux changements des conditions environnementales en termes de modification de biomasse, de structure/diversité et d’activité. Elles offrent donc un potentiel important en termes de développement de bioindicateurs. Ce travail a porté plus précisément sur l’évaluation de deux indicateurs complémentaires : (i) la biomasse moléculaire microbienne et (ii) la diversité taxonomique microbienne. Dans une première partie nous avons éprouvé la robustesse de ces deux indicateurs en évaluant les biais associés à chacune des étapes techniques des procédures mises en œuvre pour leur mesure. Nous avons ensuite utilisé ces deux indicateurs dans différents contextes agronomiques pour évaluer leur pertinence. Un premier travail a ainsi consisté à suivre la réhabilitation du patrimoine microbien, par l’implantation d’une culture à vocation énergétique, d’un sol pollué irrigué pendant une centaine d’années par des eaux usées. Une seconde application a porté sur l’étude de l’impact de différentes pratiques agricoles sur les communautés microbiennes selon l’intensité du travail du sol (labour vs. travail réduit), la gestion des résidus de culture (export vs. restitution), et le type de culture (annuelle vs. pérenne).Les résultats montrent que la biomasse moléculaire microbienne et la diversité taxonomique obtenue par séquençage massif sont deux bioindicateurs robustes et sensibles pour décrire la qualité microbiologique des sols agricoles dans des contextes très variés. Ces deux indicateurs permettent de mettre en évidence aussi bien des perturbations des sols que l’impact positif de pratiques innovantes. Ils peuvent donc représenter des outils performants pour l’évaluation des systèmes agricoles, aidant à une amélioration de leur mode de gestion et, à long terme, permettant une utilisation durable des ressources fournies par ces solsSoil is the support of agricultural production. It performs many functions essential to the provision of ecosystem services necessary for the well-being of our societies. Soil physicochemical and biological properties have been altered by the development of intensive agriculture while it is a non-renewable resource, revealing the need to develop new management practices suitable for the sustainability of soil quality. This also marked the entry into the “Agroecology” era, which promotes the development of new agricultural systems optimizing services provided by biodiversity to reduce the use of inputs and energy use. To achieve this aim, the development of a range of indicators to assess the impact of agricultural practices on the biological quality of the soil is essential. This thesis, which aims to contribute to the development of microbial bio-indicators of soil quality, is a part of this agroecological context. The choice to work on microbial communities is fully justified because they are (i) present with a high abundance and diversity in all environments, (ii) heavily involved in biological functioning and the soil ecosystem services, (iii) they respond very sensitive to changes in environmental conditions in terms of biomass, diversity and activity. They therefore have significant potential in terms of bio-indicators of development. This work has focused specifically on the evaluation of two complementary bioindicators: (i) the microbial molecular biomass and (ii) the microbial taxonomic diversity. In a first part we tested the robustness of these two bioindicators by assessing the biases associated with each of the procedure technical steps used for their measurement. We then used these bioindicators in different agricultural contexts to assess their sensitivity. A first work has followed the rehabilitation of microbial patrimony of a polluted soil irrigated for a hundred years by sewage, by implanting a bioenergy crop. A second application has focused on the impact of different agricultural practices on microbial communities depending on the intensity of tillage (tillage vs. reduced tillage), management of crop residues (export vs. restitution), and the crop type (annual vs. perennial). Results highlighted that microbial molecular biomass and microbial taxonomic diversity achieved by high throughput sequencing are both robust and sensitive bioindicators to describe the microbiological quality of agricultural soils in very different contexts. Both bioindicators allow evidencing soil disturbances but also the positive impact of innovative practices. They may therefore represent powerful tools for the assessment of agricultural systems, helping to improve their long term management, allowing a sustainable use of resources provided by soils
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Chevremont, Anne-Celine. "Optimisation multivariée d’un traitement des eaux usées par DEL-UV en vue d’une réutilisation pour l’irrigation Multivariate optimization of fecal bioindicator inactivation by coupling UV-A and UV-C LEDs Effect of coupled UV-A and UV-C LEDs on both microbiological and chemical pollution of urban wastewaters Impact of watering with UV-LED-treated wastewater on microbial and physico-chemical parameters of soil Fate of carbamazepine and anthracene in soils watered with UV-LED treated wastewaters." Thesis, Aix-Marseille, 2012. http://www.theses.fr/2012AIXM4735.
Full textAbstract:
Le développement de nouvelles technologies pour le recyclage des eaux usées est une priorité pour les régions arides et semi-arides tels que les pays du bassin méditerranéen. L'objectif de ce travail a été, dans un premier temps, de développer un système de traitement tertiaire des eaux usées en testant l'efficacité de diodes électroluminescentes émettant des UV-A et/ou des UV-C (DEL-UV) sur l'inactivation de souches bactériennes indicatrices de pollution fécale (Escherichia coli et Enterococcus faecalis) puis sur des effluents urbains, en étudiant la diminution des pollutions microbiennes et chimiques. Cette première étape a mis en évidence l'efficacité accrue du couplage UV-A et UV-C, permettant d'obtenir une eau de qualité répondant aux exigences législatives relatives à la réutilisation des eaux usées pour l'irrigation. La deuxième partie de ce travail était l'étude de l'impact de l'arrosage avec des eaux usées traitées par DEL-UV sur les paramètres du sol et sur le devenir de certain polluant aromatiques dans les sols (anthracène et carbamazépine). L'arrosage avec des eaux usées traitées par DEL-UV ne modifie pas la composition chimique de la matière organique de sol, l'activité catabolique globale des microorganismes, et le nombre et la diversité de bactéries indicatrices de pollution fécale par rapport au sol arrosé avec de l'eau d'irrigation. Certaines activités enzymatiques liées à la dégradation de la matière organique augmentent dans les sols arrosés avec des eaux usées traitées par DEL-UV, montrant que la matière organique apportée par l'effluent est activement dégradée par les microorganismesThe development of new technologies for wastewater reuse is a priority for arid and semi-arid areas such as Mediterranean countries. The objective of this work was, firstly, to develop a system for tertiary treatment of wastewaters testing LEDs emitting UV-A and / or UV-C (UV LEDs) on fecal indicator inactivation (Escherichia coli and Enterococcus faecalis) and then on urban effluents, by studying the decrease in both microbial and chemical pollution. This first step has highlighted a higher efficiency of this system when UV UV-A and UV-C are coupled. Wasterwaters with quality meeting the statutory requirements for the reuse of wastewater for irrigation were obtained and used in the second part of this work was to study the impact of watering with UV-LED- treated wastewaters on soil parameters and on the fate of pollutants (anthracene and carbamazepine) in soils. Watering with UV-LED treated wastewater does not change the chemical composition of soil organic matter, the global catabolic activity of soil microorganisms, and the number and diversity of fecal indicators compared to control (irrigation water). Certain enzymatic activities related to the degradation of organic matter increased in soil watered with UV-LED treated wastewater, showing that the organic matter added by the effluent is actively degraded by microorganisms. In addition, aromatic pollutants are oxidized two to three times faster in soils watered with UV-LED treated wastewater
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Gassiole, Gilles. "Diatomées épilithiques des cours d’eau pérennes de l’île de la Réunion : taxinomie - écologie." Thesis, Bordeaux, 2014. http://www.theses.fr/2014BORD0024/document.
Full textAbstract:
La Réunion est une île volcanique du Sud-Ouest de l’Océan Indien, située à 800 km à l’Est de Madagascar et appartenant à l’archipel des Mascareignes, avec Maurice et Rodrigues. Ce territoire est un département français d’outremer et par conséquent les lois européennes sur la qualité des eaux des cours d’eau s’y appliquent. La chimie de l’eau n’étant pas suffisante pour surveiller la qualité des eaux, les bio-indicateurs peuvent compléter le diagnostic. Dans cette thèse, les diatomées ont été choisies pour évaluer la qualité des eaux courantes. Les diatomées de La Réunion ne sont connues que par des articles épars avec la description de nouvelles espèces. Pendant quatre ans, six campagnes de prélèvements ont été menées sur les rivières pérennes. Ce travail a permis d’acquérir des connaissances sur la flore diatomique épilithique des cours d’eau pérennes de La Réunion et par conséquent sur la biodiversité de ces milieux. De plus, l’écologie des diatomées a été étudiée statistiquement, avec les arbres de régression multivariable (ARM), l’IndVal et ses extensions et les moyennes pondérées, ce qui a permis d’acquérir des connaissances sur l’écologie des communautés, l’autoécologie des espèces et donc sur la qualité de l’eau des rivières. Les résultats intégrés de cette thèse ainsi que les travaux réalisés dans le cadre d’une collaboration avec l’Irstea, ont abouti à une nouvelle méthode indicielle, l’Indice Diatomique Réunion ou IDR, permettant d’évaluer la qualité écologique des cours d’eauThe volcanic Réunion Island is situated in the southwest Indian Ocean, 800 km to the east of Madagascar; it belongs to the Mascarene archipelago with Mauritius and Rodrigues. This territory is a French oversea department and therefore follows EU laws rivers water quality. The water chemistry is not enough to monitor the quality of water and bioindicators can complete the diagnosis. In this thesis, diatoms have been choosen to assess the quality of the running waters. The diatoms of Réunion Island are only known through scarce articles with bthe description of new species. During four years, six sampling campaigns were conducted on the perennial rivers. The gain of this work is the knowledge of the epilithic diatom flora of Réunion Island perennial rivers and therefore the biodiversity of these environments. Moreover, the study of the diatom ecology by statistics, like Multivariable regression trees (MRT), IndVal and these extensions, Weighted Average (WA) allows acquire knowledge about their community ecology, their autoecology and accordingly on the quality of the river water. The results included in this thesis as well as the work done in collaboration with Irstea, led to a new index method, the Diatomic Index Réunion or IDR, to assess the ecological quality of rivers
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Elie, François. "Effet d'un prélèvement de biomasse ligneuse accru et d'une compensation minérale par apport de cendres sur la biodiversité des sols forestiers." Thesis, Normandie, 2019. http://www.theses.fr/2019NORMR040/document.
Full textAbstract:
Dans le contexte énergétique actuel, les pouvoirs publics s’engagent à réduire la consommation des énergies fossiles et à développer le marché des énergies renouvelables afin de diminuer les émissions de CO2 et de faire face à la raréfaction des sources d’énergie fossile. La demande en bois-énergie, notamment de plaquettes forestières, est appelée à s’accroître dans les années à venir. Afin d’augmenter la production forestière une exploitation des résidus de coupe de diamètre inférieur à 7 cm, appelés rémanents forestiers, est envisagée. De plus, pour compenser la perte de matière organique exportée avec les rémanents, une compensation minérale sous forme de cendres provenant des chaufferies est envisagée. Cependant, l’impact de telles pratiques de gestion sur les écosystèmes forestiers tempérés ne sont que très peu étudiés. Les objectifs de cette thèse étaient donc d’étudier l’impact d’un export des rémanents forestiers et d’une compensation par les cendres sur la biocénose du sol à différentes échelles et de tenter d’identifier des indicateurs biologiques pouvant mettre en lumière les perturbations de l’écosystème créées par ces gestions. Dans un premier temps, l’étude de la macrofaune et de la mésofaune du sol à une échelle régionale puis nationale a permis de mettre en avant l’importance de l’essence dominante (hêtre ou chêne) dans la réponse du macrofaune à l’export de rémanents. Cette partie a aussi montré que l’export de la totalité des rémanents et de la litière a un impact négatif sur toute la communauté de la faune du sol et que l’apport de cendres ne compensait pas, voire aggravait, l’effet de l’export de rémanents. Dans un second temps, une étude en mésocosme d’un double gradient de quantité de rémanents et de cendres a mis en avant l’importance de la fertilité minérale du sol dans la réponse de l’interface sol-végétation. Dans un sol neutre, l’export des rémanents ou l’apport de cendres ne présentait pas d’impact sur l’interface sol-plante au contraire du sol acide. De plus, dans le sol acide, une importante modification structurelle de la communauté microbienne a été mise en avant lors du mélange entre les rémanents et les cendres. Pour finir cette étude a permis de mettre en lumière les ordres des Lithobiomopha et des Geophilomorpha comme potentielles sources de bioindicateurs des perturbations des réseaux trophiques dans le cadre d’une gestion des rémanents ou d’un apport de cendresIn the current contextof energetic transition, public policies commit to reduce fossil fuel consumption and develop renewable energies in order to reduce CO2 emission. Woody biomass can be one of the solutions in order to increase the share of renewable energu ressources in energetic mix. In order to increase woody biomass production, an export of logging residues (under 7 cm of diameter) is investigated. Furthermore, in order to offset th export of organic matter with logging residue, mineral compensation by wood ash application is investigated. Nevertheless, the effect of such management practices on temperate forest ecosystem were understudied. The aims of this thesis were to study the impact of logging residues management intensity and wood ash offset on soil biota and to investigate potential bioindicators of disturbance led by these practices. First, the study on macrofauna and mesofauna at various scales (regional then northen French) highlited the importance of tree species (oak or beech) the response of soil biota to logging residue export. Furthermore, this first part showed a strong negative impact on the whole soil community when logging residues and litter were exported and wood ash application did not compensate the impacts of logging residues export on macro and mesofauna. Second, a mesocosm study with a cross-gradient of logging residue and wood ash input highlighted the importance of mineral fertility in the response of soil-plant interface. In neutral soil, logging residue export or wood ash application did not impact soil-plant interface, conversely to acidic soil. Furthermore, in acidic soil, a strong structural disturbance of microfloral assemblage was showed when logging residue and wood ash were added together. Third, this thesis highlighted Litobiomorpha and Geophilomorpha orders as potential sources of bioindicators of disturbance of trophic networks in logging residue export and wood ash offset context of forest management practices
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Cellamare, Maria. "Évaluation de l’état écologique des plans d’eau aquitains à partir des communautés de producteurs primaires." Thesis, Bordeaux 1, 2009. http://www.theses.fr/2009BOR13920/document.
Full textAbstract:
En raison de leur importante capacité de réponse aux changements environnementaux, les producteurs primaires sont depuis longtemps utilisés comme indicateurs biologiques de la qualité des milieux aquatiques. La Directive Cadre Européenne sur l’Eau (2000/60/CE) préconise ainsi l’utilisation du phytoplancton, du phytobenthos et des macrophytes afin de mesurer l’état écologique des écosystèmes lacustres. Dans cette étude, ces trois compartiments ont été utilisés pour déterminer l’état écologique de cinq lacs localisés dans la région Aquitaine (Sud-Ouest de la France), lacs ayant la particularité de présenter des niveaux trophiques différents. Les résultats ont montré qu’au niveau intra-lac la composition floristique dépend fortement des variables physiques dans la plupart des systèmes tandis qu’au niveau inter-lac celle-ci dépend du niveau trophique. Le phytoplancton s’est révélé être l’indicateur de qualité le plus performant et le seul utilisable dans les eaux ouvertes, et le plus précis dans les systèmes où les macrophytes submergés étaient absents. Cependant, dans les lacs humiques, les assemblages phytoplanctoniques semblent répondre davantage à la turbidité et aux brassages fréquents de la colonne d’eau qu’aux nutriments. Dans de telles conditions, afin de mieux caractériser la qualité de l’eau, l’utilisation complémentaire du phytobenthos et des macrophytes se révèle plus pertinente. En conclusion, considérant les trois compartiments biologiques, la présente étude permet une approche complémentaire de l’état écologique des systèmes lacustres. Certaines des méthodes appliquées ici représentent un outil potentiel de détermination de la qualité de l’eau selon les exigences de la DCE, mais elles nécessitent d’être affinées pour une meilleure évaluation de l’état écologique des lacs français. Une attention particulière a été portée aux taxa exotiques observés dans ces lacs tempérés, et cet aspect doit être pris en considération lors de l’évaluation écologique. En effet, ces espèces sensiblement avantagées par les conséquences du changement climatique, peuvent altérer la structure et le fonctionnement des écosystèmes aquatiques en place, et aboutir à une perte de diversitéDue to their important ability to respond to environmental changes, primary producers have been used for a long time as biological indicators of water quality. The Water Framework Directive (2000/60/EC) recommends the use of the phytoplankton, phytobenthos (diatoms) and macrophytes in the ecological status assessment of lakes. In this study, these three compartments have been used to determine the ecological status of five lakes located in the Aquitaine region (southwest of France) with different trophic status. The results showed that within lakes, the floristic composition in most of the systems strongly depends on physical parameters whereas among lakes it depends on the trophic status. The phytoplankton proved to be the most powerful indicator of quality in open-water areas as well as in systems where submerged macrophytes are absent. However, in the humic lakes, the phytoplankton assemblages seem to respond more to turbidity and mixing than to nutrient load. Under such conditions, water quality could be underestimated and the complementary use of phytobenthos and macrophytes appears more appropriated. In conclusion, considering the three biological elements, the present study allows a complementary approach of the ecological status of the lakes. Some of the methods applied here represent a potential tool for the assessment of the ecological status in the context of WFD, but they need to be refined to assess more properly the ecological status of French lakes. A special attention was paid to exotic taxa observed in these temperate lakes, and this aspect must be taken into account in the ecological assessment. Indeed, these species favoured by the consequences of the climate change, can modify the structure and functioning of the aquatic ecosystems, and lead to a loss of diversity
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Makwela, Maria Mammolawa. "Biodiversity of predatory beetle groups, carabidae and coccinellidae and their role as bioindicators in wheat agroecosystems." Diss., 2019. http://hdl.handle.net/10500/26902.
Full textAbstract:
Predatory Ground beetles (Coleoptera: Carabidae) and Lady beetles (Coleoptera: Coccinellidae) are two of the most diverse groups found in wheat agroecosystems, globally. These groups are important from both an economic and ecological perspective due to their natural services provision. The effect of wheat agroecosystem management on species diversity, abundance, biomass and composition in South Africa is not yet documented, and there is no existing data indicating which predatory carabid and coccinellid species provides essential ecosystem services and bioindicator roles. Therefore, we examined the effects of organic, conventional and intercropped agroecosystems on ground beetle and lady beetle abundance, dried weight (biomass), composition and diversity. Sampling of wheat agroecosystems was conducted in three systems i.e. organic, conventional and organic intercropped. Post-hoc Tukey test indicated a statistically significant difference between species diversity, biomass and abundance in organic and intercropped systems compared to the conventional systems. Regression analysis indicated significant positive correlation between aphid’s density and predatory carabid and coccinellid beetles in the intercropped systems. Amongst the weather factors temperature influenced aphid density and carabid and coccinellid beetles’ abundance. PCA (Principal Component Analysis) revealed significant positive correlation between individual biomass and cropping system. Conventional system showed a negative correlations with carabid and coccinellid individual biomass. We found that some carabid and coccinellid species can be used to measure the quality of agroecosystems. This study provides a fundamental basis for identification and monitoring of carabid and coccinellid species and their role as bioindicators of ecological disturbance. The identified bioindicator species in this study can assist in developing conservation and biomonitoring strategies within agroecosystems.Agriculture and Animal Health
M. Sc. (Agriculture)
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"INDICATOR INVERTEBRATES: DETERMINING CHANGE IN BENTHIC MACROINVERTEBRATE COMMUNITIES DUE TO DEPOSITED SEDIMENT IN THE NORTHERN GREAT PLAINS." Thesis, 2015. http://hdl.handle.net/10388/ETD-2015-04-2220.
Full textAbstract:
Excessive sedimentation is a major stressor to ecosystem health in freshwater systems globally. Benthic macroinvertebrates are excellent bioindicators of ecosystem health because they have a range of environmental tolerances and are typically associated with certain substrate types. This study tested the hypothesis that sedimentation is a driver of benthic macroinvertebrate communities by determining their responses to increased deposited sediment levels in the Northern Great Plains using both experimental and survey approaches. In both approaches, the effects of deposited sediment were isolated, the responses of specific indicator invertebrates were characterized and finally, indices that commonly respond to deposited sediment were analyzed for their sensitivity. At the community level, the overall multivariate redundancy model was not significant and deposited sediment accounted for only 0.2% of the total variation in species composition in the river survey. Indicator species analysis identified taxa that were associated with sediment impairment classes in both studies. Index sensitivities indicated that Percent Swimmers responded to sediment and can potentially be used as an index of deposited sediment in this region, however this index was not sensitive to sediment in the landscape-scale survey. Although individual taxa that responded to sediment deposition may be used as bioindicators of sediment impairment in further studies, the relatively small effect of sediment at the community level and on univariate composition metrics suggests benthic macroinvertebrate communities are adapted to deposited sediment in the Northern Great Plains.
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Cohen, Risa A. "Physiological responses of a bloom-forming macroalga to eutrophic conditions implications for use as a bioindicator of freshwater and nutrient influx to estuarine areas /." 2003. http://catalog.hathitrust.org/api/volumes/oclc/55525896.html.
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Hack, Lisa Adelheid. "Development and validation of the marine benthic copepod Robertsonia propinqua as a bioindicator to monitor estuarine environmental health : a thesis submitted in partial fulfilment of the requirements for the degree of Doctor of Philosophy at Lincoln University, New Zealand /." Diss., 2008. http://hdl.handle.net/10182/307.
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Maas, Bea. "Birds, bats and arthropods in tropical agroforestry landscapes: Functional diversity, multitrophic interactions and crop yield." Doctoral thesis, 2013. http://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0022-5E77-5.
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