Academic literature on the topic 'Indices de sélection (Amélioration des plantes)'

Un travail d’évaluation de la qualité du fourrage a été effectué sur vingt lignées de mil (Pennisetum glaucum L.) de la collection de l’Institut des Régions Arides de Médenine en Tunisie. L’objectif était de regrouper ces lignées selon leurs richesses en éléments nutritifs. Les analyses suivantes ont été effectuées sur les feuilles, les tiges et la plante entière : taux de matière sèche (MS); taux de matière minérale (MM); teneurs en matières azotées totales (MAT); teneurs en cellulose brute (CB); teneurs en bres insolubles dans les détergents neutres "Nutrient Detergent Fibre" (NDF) et teneurs en fibres insolubles dans les détergents acides, ‘Acid Detergent Fibre’ (ADF). Les analyses statistiques ont permis de regrouper les lignées en quatre groupes. Les lignées 3, 10, 14, 18, 64 et 75 sont les moins riches en ADF, NDF, CB, MAT, MM des tiges et MM des feuilles, tandis que les lignées 19, 46, 49, 107, 125 et 167 ont les teneurs les plus élevées en MATF, MMT et MATT. En outre, les plantes des lignées 49 et 167 présentent des valeurs plus élevées pour l’ADF et le MS des tiges, or que les plantes des lignées 49 et 125 sont beaucoup plus riches en CB des tiges que le reste des lignées. Les lignées 49, 125 et 167 seront maintenues comme des élites et elles seront soumises à des générations de fécondations libres pour tester leur aptitude à la combinaison générale, rechercher l’hétérosis maximale et sélectionner les meilleurs parents jusqu’à l’obtention d’une variété synthétique qui aurait un rendement en fourrage plus élevé que les cultivars couramment utilisés et mieux adaptée au milieu et aux techniques culturales des paysans des régions arides tunisiennes.Mots clés: amélioration génétique, sélection, variété synthétique

Allanblackia floribunda est un arbre des forêts denses humides tropicales valorisé pour la teneur élevée en acides gras de ses graines, essentiellement constitués d’acides stéarique et oléique dont l’efficacité dans la réduction du mauvais cholestérol de l’organisme humain a été prouvée. Pour cette raison, les graines de A. floribunda collectées en milieu naturel sont commercialisées. Toutefois, les travaux sur la culture de cette espèce sont encore à leur phase initiale. Nous avons déterminé la possibilité d’amélioration génétique de cette espèce en échantillonnant 17 à 40 fruits par arbre de 70 arbres distribués sur quatre sites en milieu naturel. La matière grasse a été extraite des graines, et les teneurs en acides stéarique et oléique estimées à l’aide de méthodes développées au cours de cette étude. La variation phénotypique des traits des fruits et des graines a été caractérisée dans et entre les arbres, et entre les sites. Les estimations de répétabilité des caractères mesurés ont été effectuées. Des corrélations phénotypiques entre les traits étudiés ont aussi été estimées, et quatre traits ont été retenus pour effectuer la sélection multi-caractère de 20 arbres-plus qui constitueront la population d’amélioration de cette espèce pour la production des graines. Nous avons par la suite isolé 10 marqueurs moléculaires de type microsatellite polymorphes à partir de A. floribunda, et sept de ces marqueurs étaient polymorphes à la fois chez Allanblackia gabonensis et Allanblackia stanerana. La variation de huit loci microsatellites a permis de caractériser la structure génétique neutre de 10 populations de A. floribunda de zone de forêt naturelle du Cameroun, puis d’inférer l’histoire récente des forêts humides d’Afrique Centrale. Aucune différence significative n’a été observée entre les paramètres génétiques de la population d’amélioration et celle existant en milieu naturel indiquant qu’une amélioration de cette espèce à partir des 20 arbres sélectionnés ne réduirait pas sa diversité génétique neutre. Toutefois, une légère augmentation du taux de consanguinité a été observée dans la population d’amélioration, et des recommandations sont formulées pour la conservation des ressources génétiques durant l’amélioration de A. floribunda.
Allanblackia floribunda or tallow tree is a tropical forest-tree species that is valued for its seeds, which are rich in hard fat consisting mostly of stearic and oleic acids, reported to lower plasma cholesterol levels, thus reducing the risks of heart attack. Owing to this fat profile, Allanblackia oil is used for margarine production and in soap and ointments manufacture, and seeds extracted from Allanblackia fruits by local communities are traded. We determined whether the species could be genetically improved for fruit/seed production by sampling 17 to 40 fruits from each of 70 trees that were distributed among four sites in wild stands. Fat was extracted from the seeds, and stearic and oleic acid content of the fat was estimated using methods developed in this study. Phenotypic variation in fruit/seed traits was assessed within- and among-trees, and among sites. Repeatabilities were estimated for measured characters, and relationships between these characters investigated. Twenty “plus trees” were selected for breeding, and implications for improvement discussed. Then we isolated and characterized ten microsatellite primer pairs for A. floribunda. Seven of these microsatellite loci were polymorph for both Allanblackia gabonensis and Allanblackia stanerana species as well. Using eight informative microsatellite loci, we have characterized the genetic structure of A. floribunda natural populations from Cameroon, and inferred the recent history of rainforests from Central Africa. No significant difference was identified in genetic parameters between wild stands and the breeding population, indicating that breeding A. floribunda from 20 trees would not reduce nuclear genetic diversity. However, a slight increase in inbreeding was observed in the breeding population, and recommendations for genetic diversity conservation during tree improvement in the species are made.

Le bilan de dix années de recherches en génétique appliquée à l'amélioration du mil (Pennisetum typhoïdes) a été dressé par l'auteur. Prenant la suite de plusieurs autres programmes exécutés au Sénégal avant 1976, le travail présenté a tout d'abord procédé à l'analyse de la valeur du matériel hérité et des variétés qui en sont issues avant d'aborder la question majeure qui se posait alors à savoir le problème du type de mil à créer. L'étude de la structure des futures variétés GAM, a mis en évidence l'intérêt des tests d'aptitude à la combinaison entre les structures parentales. Les résultats obtenus montrent que les lignées héritées des programmes précédents pour être utilisables doivent être élargies à d'autres constituants. La voie de sortie pour constituer des variétés a finalement été celle d'une confrontation des effets d'hétérosis et des observations visuelles effectuées sur le terrain. On a ainsi pu constater que dans tous les croisements choisis, l'un au moins des parents possédait une bonne valeur d'aptitude générale à la combinaison, ce qui a permis d'utiliser un nombre de structures F1 plus important pour poursuivre la création variétale. Parmi les variétés d'un type particulier élaborées, GAM 8301, GAM 8201 et GAM 8501 ont été respectivement élargies aux populations 3/4 africaines : 3/4 Ex. Bornu, 3/4 Souna et ¾ Haini Kirei. Avec ces variétés, le remplissage de l'épi a été considérablement amélioré. Parallèlement, une autre variété de structure plutôt consanguine, la GAM 8203 ou H7-66 s'est montrée performante et stable par comparaison à des structures normalement plus hétérogènes : témoins locaux et variétés synthétiques (IBV 8001 et IBV 8004) de I'ICRISAT. La variété GAM 8203 ou H7-66, conserve sa productivité dans la zone centrale de Bambey si l'on maintient en même temps la taille optimale. L'étude des relations entre l'architecture et le rendement sur une collection de mils de formes et d'origines variées a montré que les conditions environnementales sont largement impliquées dans les variations du rendement. La productivité d'un mil cultivé au Sénégal se réalise invariablement et globalement au niveau de deux caractères importants : le poids des épis et le poids de 1. 000 grains. Cependant la plante développe des stratégies différentes d'une zone à l'autre. Les résultats obtenus pour respectivement, la zone sèche de Louga (isohyètes inférieures à 400 mm/an), la zone de Barn­ bey centrale (isohyète de 400 à 600 mm/an) et la zone plus humide de Nioro au Centre Sud (isohyète de 700 à 850 mm/an) reposent le problème de la généralisation du mil nain pour le Sénégal et celui de la valeur du gène D2 d2. Si ce type d'architecture semble être une bonne solution pour la zone plus sèche, il ne peut être utilisé pour les zones plus humides où la production de paille est importante pour accroître la productivité des plantes. Le nanisme qui semble convenir aux zones sèches passe par une diminution du nombre d'entrenœuds. Les indices de sélection sont formulés pour les trois zones écologiques. Ce travail a en outre mis en évidence la nécessité de la diversification de la base génétique du matériel végétal de travail et la nécessité de l'organisation et de la conservation de ces ressources pour développer un programme d'amélioration du mil. Au total sept nouvelles variétés qui sont à différents niveaux de vulgarisation ont été créées et ce pour la première fois depuis 1969.

On estime les composantes de la variance dans un modele mixte par la methode du maximum de vraisemblance. On utilise comme index le meilleur predicteur lineaire sans biais. Le critere de qualite propose est un estimateur sans biais du risque quadratique n'exigeant pas d'hypotheses fortes. Dans le cadre du schema de selection classique applique au soja, on etudie par simulation une situation proche de celle rencontree aux generations f6 et suivantes. A partir des descendances de 3 croisements, le critere permet de mettre en evidence les meilleures indices de selection precoce sur plante f5 pour 2 caracteres: rendement, precocite

La diversité génétique du cacaoyer (Theobroma cacao L. ) existant dans les plantations paysannes et dans les banques de gènes au Cameroun, a été étudiée à l’aide de 12 marqueurs microsatellites et par des évaluations phénotypiques de caractères d’intérêt agronomique. Les connaissances des producteurs sur le matériel végétal collectées dans le cadre d’un programme de sélection participative, ont été comparées avec les données moléculaires phénotypiques. La caractérisation moléculaire de ce matériel montre que les accessions des producteurs et des banques de gènes sont génétiquement proches. Les accessions des banques de gènes appartiennent à trois grands groupes génétiques de l’espèce, à savoir les Forastero haut-amazoniens (HA), les Forastero bas-amazoniens (BA) et les Trinitario (Tr). Six groupes de référence (Amelonado, criollo, Nana, Iquitos Mixed Calabacillo, Parinari et Scavina) supposés être à l’origine des cacaoyers cultivés au Cameroun, expliqueraient la quasi-totalité de la diversité génétique des accessions des poducteurs. Les gènes du groupe Amelonado étaient les plus représentés dans le matériel des producteurs. Très peu d’allèles spécifiques aux Scavina et Criollo ont été détectés dans ce matériel. La forte diversité moléculaire et phénotypique et la présence d’allèles uniques parmi les accessions des producteurs montrent l’existence d’un potentiel de sélection dans ce matériel. Ce potentiel a été mis en évidence par l’identificatin de plusieurs génotypes résistants à la pourriture des fruits, contrainte majeure de la cacaoculture au Cameroun. L’évaluation de la résistance à cette maladie suggère également que les connaissances des producteurs sur le niveau de résistance au champ de leurs cacaoyers, peuvent être exploitées efficacement dans la sélection participative
Génétic diversity of cacao (Theobroma cacao L. ) accessions in farmers’ field and genebanks in Cameroon was studied with 12 microsatellite markers and several phenotypic traits of agronomic interest. Knowledge of farmers on their planting material was collected within the framework of a participatory selection programme, and subsequently compared with molecular and phenotypic data. The molecular assessment of the arm accessions are closely related. GA beong to three main genetic groups of the cacao species : Upper Amazon Forastero (UA), Lower Amazon Forastero (LA) and Trinitario (Tr). The genetic diversity among FA could be largely explained by the contribution of six reference genomes (Amelonado, Criollo, Iquitos Mixed Calabacillo, Nanay, Parinari and Scavina) supposed to be at the origin of cultivated cacao populations in Cameroon. The genes from the Amelonado group predominated in the FA whereas those from Scavina and Criollo were less represented. The large molecular and phenotypic diversity and the presence of private alleles among FA show the potential for selection of this material. This potential was further demonstrated by the identification of several resistant genotypes among FA tested for resistance to Phytophtora pod rot (Ppr), the major cacao production constraint in the country. The results from Ppr evaluations suggest also that farmers’ knowledge on the field resistance of individual cacao trees might be exploited efficiently in the participatory breeding programme

Dans la plupart des régions cotonnières d'Afrique de l'ouest et du centre où la culture est essentiellement pluviale, l'étalement croissant des dates de semis du coton entraîne une diversification des itinéraires techniques. Pour produire du matériel végétal adapté, la sélection cotonnière doit diversifier ses objectifs de création variétale. Nous avons donc étudié les stratégies de mise en place de la production chez différentes variétés de cotonnier Gossypium hirsutum L afin d'en identifier les plus productives de les traduire en critères de sélection et de mettre au point des stratégies efficaces pour l'amélioration du rendement dans plusieuers situations de culture pluviale. Quatre essais conduits entre 2002 et 2003 dans deux localités cotonnières du Bénin ont permis de comparer dix variétés à trois densités et à deux dates de semis. Les observations ont porté sur la phénologie et la floraison, l'architecture, la rétention et la répartition des capsules. Ces observations ont été mises en relation avec le rendement et ses composantes. Dans ce travail, nous avons défini un nouvel indicateur de fin de floraison la date de la dernière fleur en première position de branche fructifère et proposé une méthode simplifiée pour l'estimer. Cet indicateur a permis de calculer plus précisément le temps de floraison utile (TFU) qui a bien discriminé le matériel génétique étudié. Nous avons constaté que le retard de semis de l'augmentation de la densité ont des effets similaires : ils retardent l'apparition de la première fleur, raccourcissent le temps de floraison utile, réduisent le développement végétatif de la plante, diminuent la production et le taux de rétention de capsules. La production capsulaire est concentrée sur les parties basses du plant
In most cotton areas of Western and Central Africa cotton is primarily rainfed and sowing dates are more and more spread out in time. Such changes need the develoment of new cropping systems and new genetic material to fit them. The cotton breeding programs have to diversity their breeding objectives in order to develop the varieties adapted to later sowing dates and increased plant stands. In this work we studied the production strategies of several varieties of cotton Gossypium hirsutum L. In order to identify the most productive strategies, to translate them into selection criteria and to develop effective strategies for yield improvement in rainfed cluture. Four trials were carried out between 2002 and 2003 at Parakou and Bohicon (Benin). They compared ten varieties under three densities and two sowing dates. The observatins focused on phenology and flowering, architecture, bool retention and distribution. They were related to yield and its components. We could test a new indicator of the cut-out status of a plant, the date of the last flower giving rise to a first-position bool on fruiting branches (LFP1), and we put-up a simplified method to estimate it. This indicator made it possible to estimate the effective flowering time (EFT) of each variety. We noted that late sowing and high stads have similar effects : they delay first flower opening date (FF), shorten EFT, reduce the vegetative growth and decrease the production as opening date (FF), shorten EFT, reduce the vegeetative growth and decrease the production as well as the bolls retention rate

Le rosier cultivé. Posa hybrida L. , tétraploi͏̈de (2n = 4x = 28) a été haploi͏̈disé au cours de la dernière décennie. Les formes dihaploi͏̈des obtenues ont été au cours de cette étude hybridées avec des espèces sauvages diploi͏̈des aux ressources génétiques peu exploitées. Des analyses moléculaire, cytologique et morphologique de descendances issues de ces croisements ont permis d'aboutir à une meilleure connaissance de : - la reproduction sexuée des dihaploi͏̈des et de leurs hybrides. L'étude de la gamétogenèse a mis en évidence la production, par les dihaploi͏̈des, de gamètes mâles et femelles 2n de types SDR-CO, SDR-NCO, FDR-CO et FDR-NCO. Les proportions produites d'un type ou d'un autre de gamètes 2n sont génotype-dépendantes. Cette aptitude à produire des gamètes 2n est transmise à la descendance, permettant ainsi un retour au niveau tétraploi͏̈de. Les conséquences génétiques des différents types de gamètes produits ont été étudiées, notamment quant aux niveaux d'hétérozygotie parentale transmis dans les descendances. - la génétique du genre Rosa. Trois caractères qualitatifs et un caractère quantitatif ont été suivis en ségrégation dans les descendances diploi͏̈des. La duplicature de la corolle et la non remontance sont contrôlées par un gène dominant, la couleur rosé de la fleur par deux gènes complémentaires dominants. Un déterminisme oligogénique a été mis en évidence concernant la quantité d'épines sur les tiges. - l'organisation et du fonctionnement du génome du genre Rosa. A partir d'une descendance diploi͏̈de issue du croisement entre un dihaploi͏̈de et R. Wichuraiana, deux cartes génétiques, mâle et femelle, ont été construites à l'aide de marqueurs AFLP. Les gènes responsables de la duplicature et de la non remontance ont été positionnés sur les cartes mâle et femelle, les marqueurs les plus proches étant situés à 4,7 et 0 cM, respectivement. Concernant la quantité d'épines, un QTL majeur et un QTL mineur ont été localisés sur la carte mâle
The tetraploid (2n = 4x = 28) cultivated rose, Rosa hybrida L. , has been haploidized in the last decade. The dihaploids thus have been utilized in this study as they can be hybridized with wild diploid species which genetic resources have seldom been exploited. They also contibute, when used as progenitors, to the simplifying of hereditary transmissions. Molecular, cytological and morphological analyses of offsprings resulting from these crosses have lead to a better understanding of: - sexual reproduction of the dihaploids and their derivated hybrids. The study of gametogenesis has shown that the dihaploids produce unreduced 2n male and female gametes of SDR-CO, SDR-NCO, FDR-CO and FDR-NCO types. The proportions of the different produced gamete types are genotype-dependent. This ability to produce 2n gametes is transmitted to the progenies, thus enabling a return to the tetraploid level. The genetic consequences of the different gamete types produced have been studied, especially regarding the levels of parental heterozygosity transmitted to the progenies. - the genetics of Rosa. Three qualitative characters and a quantitative one have been observed in segregation in the diploid offsprings. Double corolla and single blooming habit are controlled by a dominant gene, pink flower colour is controlled by two complementary dominant genes. An oligogenic determinism controls thorn quantity on the stems. - organisation and functioning of Rosa genome. Using the diploid offspring resulting from a cross between a dihaploid rose and R. Wichuraiana two genetic maps, male and female, have been established with AFLP markers. The genes controlling double corolla and single blooming habit have been located on the male and female maps. The most proximal corresponding markers were at 4. 7 and 0 cM distances, respectively. Concerning thorn quantities, a major and a minor QTL were located on the male map

Les classifications morpho physiologiques et enzymatique de l'espèce O. Sativa distinguent deux grands ensembles distants génétiquement dénommés indica et japonica. L'amélioration variétale du riz pluvial par hybridation s'intéresse prioritairement à ce dernier ensemble qui comprend la grande majorité des variétés adaptées à ce type de riziculture. Afin d'acquérir une maîtrise affinée du tri variétal avant hybridation, une étude diallèle utilisant les modèles de Griffing et de Hayman a été réalisée à partir de six parents aussi représentatifs que possible de l'ensemble japonica au sens large. Huit caractère quantitatifs ont été analysés : cycle semi épiaison, hauteur de la plante, tallage utile, longueur paniculaire, égrenage, longueur et poids du grain, taux de glumelles ouvertes. L'additivité apparaît largement prépondérante pour les huit caractères : les coefficients d'héritabilité sont très élevés et il existe une liaison significative entre les valeurs de chaque parent et leur AGCI. Le choix des géniteurs se justifie donc pleinement afin d'obtenir des descendances allant dans le sens recherché. Sur le plan descriptif, l'étude diallèle met en évidence la diversité des déterminismes génétiques contrôlant chaque caractère chez les parents de l'essai. L'analyse des composantes principales des individus parentaux et hybrides F1 fait ressortir le peu de variabilité créée par croisements entre les groupes japonica G2 ou pluviaux et la recombinaison parfaitement intermédiaire des hybrides entre ces groupes.

La sécheresse est une contrainte multiforme s'exprimant â différents niveaux d'organisation du végétal. Ce travail vise une intégration des connaissances réalisée sur la base d'expérimentations conduites au Sénégal dans le cadre dun programme de sélection pour l'augmentation du rendement de l'arachide en zone sèche. Le premier chapitre analyse un plan de croisement en demi diallèle réalisé sur une population en cours d'amélioration par sélection récurrente sur la hase de caractères d'adaptation à la I sécheresse. Un calcul d'index de sélection, réalisé au moyen du logiciel de génétique quantitative DIOGENE. A permis d'estimer les J espérances de gains génétiques relatives aux cinq principaux caractères agronomiques en fonction de la pression de sélection. Dans le deuxième chapitre. La variabilité de caractères phénologiques, agronomiques et physiologiques, a été étudiée sur une gamme réduite de cinq nouvelles variétés précoces. La période de mesure la plus favorable à la détection des différences variétales a été précisée pour ces caractères. Les indices de réponse au déficit hydrique en termes de rendement et les coefficients de partitions de matière sèche des nouvelles variétés ont été supérieurs à ceux du témoin. Le troisième chapitre approfondit cette étude de variabilité en la ciblant sur du nouveau matériel génétique à variabilité génétique étroite constitué par deux séries de lignées quasi-isogéniques. Létude a montré qu'une variabilité génétique s'exprimait sur certains caractères malgré le fort niveau d'apparentement de ces lignées. Certaines corrélations statistiques entre caractères physiologiques, notamment les paramètres de la fluorescence chlorophyllienne, et rendements en gousses ont été significatives mais non stables en fonction des années et du traitement hydrique. Ces résultats indiquent que les stratégies d'adaptation de l'arachide au champ sont dif'férentes selon l'intensité du déficit hydrique et l'origine génétique des lignées. Une étude physiologique réalisée sur quatre cultivars (cv) en conditions de déficit hydrique précoce en serre a mis en évidence les stratégies d'adaptation observées au champ. La première stratégie fait appel à une fermeture tardive des stomates accompagnée d'une résistance protoplasmique forte et la deuxième permet le maintien d'un statut hydrique élevé durant le stress. Cette dernière stratégie parait moins efficace que la première en terme de productivité au champ chez l'arachide. Ce travail a été poursuivi à l'échelle moléculaire sur les mêmes cvs. [ cinétiques de l'expression des gènes (transcrits), obtenus par RT-PCR en conditions de déficit hydrique croissant, ont montré que la sécheresse induit une stimulation d'une phospholipase D et d'une cystéine protéase chez le cv le plus sensible alors que le gène de LEA est plus stimulé chez le résistant. Ces expérimentations L interconnectées conduites aux différentes échelles d'organisation de la plante ont permis de proposer un modèle méthodologique général et de créer des cvs améliorés répondant à la demande sociale.