Dissertations / Theses: 'Infection – Dissertations universitaires'

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Beshara, Ranin. "Impact d’une infection par le virus grippal de type A sur la myélopoïèse." Thesis, Lille 2, 2018. http://www.theses.fr/2018LIL2S016/document.

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Abstract:

L’infection par le virus de la grippe, ou le Myxovirus influenzae de type A (IAV), constitue l'une des causes les plus importantes de maladies des voies respiratoires dans le monde. Elle conduit également à des épidémies récurrentes avec des taux élevés de morbidité et de mortalité. Des surinfections bactériennes, principalement causées par Streptococcus pneumoniae (pneumonie), sont souvent associées à la grippe et contribuent de manière significative à l’excès de mortalité. La perturbation de l'intégrité des tissus pulmonaires et la diminution de l'immunité antibactérienne au cours de l'infection par IAV sont à l’origine de la colonisation et à la dissémination des bactéries.L'infection grippale entraîne une altération profonde du compartiment de cellules myéloïdes pulmonaires caractérisée par une altération numérique ou fonctionnelle des cellules sentinelles - les macrophages alvéolaires et les cellules dendritiques conventionnelles (cDC) - et par un recrutement de cellules myéloïdes inflammatoires -les neutrophiles, les monocytes inflammatoires ou encore les cellules dendritiques inflammatoires.Les cellules myéloïdes sont originaires de la moelle osseuse (MO). Lors d’infections, la myélopoïèse peut être profondément affectée afin de maintenir la production et la mobilisation de cellules myéloïdes inflammatoires au niveau du site d’infection. A l’heure actuelle, les conséquences de l’infection grippale sur la myélopoïèse restent encore mal connues.Dans notre projet, nous rapportons que l'infection grippale conduit à une diminution transitoire du nombre de cDC (cDC1 et cDC2) dans les poumons qui coïncide avec une chute dans la MO, du nombre de progéniteurs/précurseurs impliqués dans la génération des cDC (CDP, pre-cDC et plus particulièrement les pre-cDC1). Cette diminution de la "DCpoïèse" est associée à une accélération de la génération des monocytes, i.e. monopoïèse. La différenciation altérée des cDC est indépendante des cytokines pro-inflammatoires et n'est pas due à un dysfonctionnement intrinsèque des précurseurs de cDC. De façon intéressante, nous rapportons que ces altérations au niveau de la MO sont associées à une diminution de la production de Flt3-L ou Fms-like tyrosine kinase 3 ligand, un facteur crucial pour la différenciation des DC. La supplémentation en Flt3-L au cours de la grippe rétablit la différenciation des progéniteurs de cDC dans la MO et restaure le compartiment des cDC pulmonaires. De façon intéressante, cette restauration s’accompagne d’une protection partielle contre l’infection pneumococcique secondaire caractérisée par une réduction de la charge bactérienne, une amélioration de la pathologie pulmonaire et une survie prolongée
Influenza type A virus (IAV) infection, is one of the most important causes of respiratory diseases worldwide. It also leads to recurrent epidemics with high rates of morbidity and mortality. Secondary bacterial infections, mainly caused by Streptococcus pneumoniae (pneumonia), are often associated with influenza and contribute significantly to excess mortality. Disruption of lung tissue integrity and impaired antibacterial immunity during IAV infection participate in bacterial pulmonary colonization and dissemination out of the lungs.Influenza infection leads to a profound alteration in the pulmonary myeloid cell compartment characterized by numeric or functional alteration of sentinel cells (alveolar macrophages and conventional dendritic cells (cDC)) and recruitment of inflammatory myeloid cells (neutrophils, inflammatory monocytes and inflammatory dendritic cells).Myeloid cells originate from the bone marrow (BM). During infections, myelopoiesis may be profoundly affected in order to maintain the production and mobilization of inflammatory myeloid cells to the site of infection. At present, the consequences of influenza infection on myelopoiesis remain poorly understood.In our project, we report that influenza infection leads to a transient decrease in the number of Cdc (cDC1 and cDC2) in the lungs, and severely impairs the number of BM progenitors committed to the DC lineage (CDP, pre-cDC and, most importantly, the cDC1-biased pre-DC lineage). This reduction was associated with an increase in the production of monocytes in the BM (monopoiesis). The altered cDC differentiation was independent of pro-inflammatory cytokines and was not due to an intrinsic dysfunction of cDC precursors. Defective DC genesis during influenza was associated with a decrease in the production of the key cDC differentiation factor, Fms-like tyrosine kinase 3 ligand (Flt3-L). Importantly, Flt3-L overexpression during influenza restores the differentiation of BM progenitors into cDC - a phenomenon associated with repopulation of cDC in the lungs. The restoration of pulmonary cDC associates with a partial protection against secondary pneumococcal infection characterized by reduced bacterial loads, improved pathological outcomes and prolonged survival

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Zinzendorf, Nanga Yessé. "Infection expérimentale par des bactéries à developpment intracellulaire. Régulation du TNF-α et de ses récepteurs." Reims, 2002. http://www.theses.fr/2002REIMP202.

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Abstract:

@Dans le premier modèle les cellules monocytaires humaines sont infectées par quatre souches de R. Equi qui diffèrent par leur sensibilité aux b-lactamines. Les souches régulent différemment la production de TNF-a. Les messagers du TNF-a sont réprimés et la production de TNF-a est inhibée dans le cas de l'infection des monocytes par les souches résistantes aux b-lactamines. En outre, la présence de surnagent de culture de la souche résistante aux b-lactamines affecte négativement l'expression des messagers et la production du TNF-a chez la cellule infectée par la souche sensible. Dans le second modèle, les cellules monocytaires humaines sont infectées par deux souches de L. Monocytogenes, la souche sauvage EGD et son mutant non hémolytique. Les souches régulent différemment l'expression des messagers des récepteurs du TNF-a (TNF-R) et l'activité du TNF-a. La souche hémolytique réprime l'expression des messagers du TNF-RI, induit celle du TNF-RII et la solubilisation du TNF-RI
@In the first model, human monocytic cells were infected with 4 R. Equi strains differing in b-lactamin resistance. These strains regulate differently TNF-a production. The b-lactam resitant strains do not induce any measurable TNF-a mRNA expression and TNF-a secretion upon infection. The supernatant from b-lactam resitant R. Equi cultures promoted an inhibition of the induction of both TNF-a expression and release by the macrophages infected by the b-lactam susceptible strains. In the second model, human monocytic cells were infected with two strains of L. Monocytogenes, a hemolytic strain EGD and a non hemolytic mutant. These two strains regulate differently TNF-a activity and TNF-a receptors (TNF-R) mRNA expression. The hemolytic strain down-regulates TNF-RI mRNA expression, up-regulates TNF-RII mRNA expression, inhibits TNF-a activity and induces the release of soluble TNF-RI

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Benkahla, Mehdi Ayech. "Infection à entérovirus in vitro et in vivo." Thesis, Lille 2, 2016. http://www.theses.fr/2016LIL2S053/document.

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Abstract:

Le genre Enterovirus comporte de nombreux virus à ARN non enveloppés regroupés en espèces EV-A-J et Rhinovirus A-C. Les coxsackievirus B (CV-B) appartiennent à l’espèce EV-B. Le rôle des CV-B et notamment de CV-B4 dans la pathogenèse du diabète de type 1 (DT1) est fortement suspecté. Coxsackievirus-B4 E2 (CV-B4 E2) isolé à partir du pancréas d’un patient souffrant de DT1 est capable d’induire une hyperglycémie chez des souris. Les mécanismes de la pathogenèse entérovirale du diabète ne sont pas encore bien connus. Il a été montré que les monocytes humains sont infectés par CV-B4 in vitro grâce à des anticorps anti-VP4 formant des complexes avec le virus, et que les macrophages humains également sont infectés par CV-B4 in vitro. Les études réalisées in vitro sont riches d’informations mais des modèles d’infection in vivo sont nécessaires pour explorer d’avantage les mécanismes des infections à entérovirus. Malgré l’impact des entérovirus en pathologie les moyens de lutte contre ces virus sont limités.Nos principaux objectifs étaient i) d’étudier l’infection à CV-B4 E2 chez la souris et de déterminer si les monocytes/macrophages sont des cibles du virus in vivo ii) de mettre en œuvre un modèle de diabète induit par CV-B4 E2 chez la souris iii) d’étudier l’activité anti-CV-B4 de diverses molécules in vitro iiii) de mettre en évidence la survenue d’infections entérovirales naturelles chez des animaux.L'ARN viral est présent in vivo dans les monocytes (CD14+) et macrophages (F4/80+) de la rate et dans les cellules de la moelle osseuse de souris ICR-CD1 inoculées avec CV-B4 E2. In vitro, CV-B4 E2 infecte les cellules CD14+ et les cellules F4/80+ de la rate. Les macrophages dérivés de la moelle osseuse cultivés en présence de M-CSF sont infectés par CV-B4 in vitro. Le sérum de souris infectée par CV-B4 E2 facilite l’infection in vitro des cellules spléniques par CV-B4 E2, mais pas celle des macrophages dérivés de la moelle osseuse. Chez des souris ICR-CD1 préalablement traitées par des doses sub-diabétogènes de streptozotocine β (STZ), l’inoculation de CV-B4 E2 provoque une hyperglycémie associée à une hypo-insulinémie. La charge virale du pancréas évaluée par RT-PCR quantitative n’est pas différente chez les animaux diabétiques (STZ/CV-B4 E2) par rapport aux animaux inoculés avec le virus mais non diabétiques. L'analyse histologique du pancréas d’animaux diabétiques (STZ/CV-B4 E2) met en évidence des foyers d’inflammation au niveau des ilots de Langerhans. Des dérivés de pirodavir, molécules qui se fixent à la capside des entérovirus inhibent l’infection à echovirus 7 et 11 mais pas à CV-B4 E2 in vitro. Par contre la fluoxétine a fait preuve d’un effet anti-CV-B4 E2 dans un modèle de culture de fragments de pancréas et de cellules béta pancréatiques murins. La détection d’anticorps sériques anti-VP4 par ELISA, à l’aide d’un peptide de 50 acides-aminés de la protéine VP4 d’EV-G1 (un entérovirus porcin), a été appliquée à la mise en évidence de l’infection de jeunes porcs par des entérovirus. Une homologie de 88% de la séquence du peptide VP4 d’EV-G1 avec celle des protéines VP4 d’ autres EV-G suggère que des anticorps dirigés contre ces virus distincts d’EV-G1 puissent être détectés.En conclusion, CV-B4 E2 peut infecter les monocytes et les macrophages in vitro et in vivo dans un système murin, et le virus peut provoquer un diabète chez des souris préalablement exposées à de faibles doses de STZ. La fluoxétine inhibe l’infection à CV-B4 E2 de cellules pancréatiques in vitro. La détection d’anticorps anti-VP4 d’EV-G1 a permis de mettre en évidence des infections naturelles à entérovirus chez des jeunes porcs. Ce modèle porcin pourrait être mis à profit pour étudier la physiopathologie des infections à entérovirus et tester des moyens de lutte contre ces virus
Enterovirus genus encompasses a number of non-enveloped RNA viruses grouped into 12 species, EV-A-J and Rhinovirus A-C. Group B coxsackieviruses (CV-B) belong to the EV-B species. CV-B and particularly CV-B4 is thought to be involved in the development of chronic diseases like type 1 diabetes (T1D). A strain of CV-B4 (CV-B4 E2) was isolated from the pancreas of a patient with T1D, and was able to induce a hyperglycemia in mouse. The mechanisms of the enteroviral pathogenesis of T1D are not well known yet. It has been observed that the infection of human monocytes with CV-B4 E2 in vitro can be enhanced by anti-VP4 antibodies bound to the virus, and human macrophages are also infected by CV-B4 in vitro. The in vitro studies are rich with information but in vivo infection models are needed to better understand the mechanisms of enterovirus infections. Despite the effect of enterovirus on health, the means in the fight against these viruses are limited.Our main objectives were i) to investigate CV-B4 E2-infection in mice and to determine whether monocytes / macrophages are targets of the virus in vivo ii) to implement a CV-B4 E2-induced diabetes model in mice iii) to study the anti-CV-B4 activity of various molecules in vitro iiii) To highlight the natural occurrence of enterovirus infections in animals.Viral RNA was found in vivo in monocytes (CD14+) and macrophages (F4/80+) of the spleen and in bone marrow cells of ICR-CD1 mice inoculated with CV-B4 E2. In vitro, CV-B4 E2 infected the CD14+ and the F4/80+ cells of the spleen. Bone marrow-derived macrophages (BMDM) were infected by CV-B4 in vitro. The serum of CV-B4 E2- infected mice enhanced in vitro the infection of spleen cells by CV-B4 E2 but not the infection of BMDM. ICR-CD1 mice, treated with a sub-diabetogenic dose of Streptozotocin β (STZ), and afterwards inoculated with CV-B4 E2 developped hyperglycaemia and hypoinsulinemia. The viral load of pancreas assessed by quantitative RT-PCR was not different in diabetic animals (STZ/CV-B4 E2) compared to non-diabetic animals inoculated with CV-B4 E2. Histological analysis of diabetic animals highlighted an inflammation of pancreas isletsPirodavir-derived molecules, which bind to the enteroviruses capsid, inhibited the infection with echovirus 7 and 11 but not the infection with CV-B4 E2 in vitro. On the other hand, it was displayed that an anti-CV-B4 E2 effect of fluoxetine in cultures of mouse pancreas fragments and mouse beta cells. The detection of anti-VP4 antibodies in serum by ELISA using a 50 amino acids peptide of VP4 from EV-G1 (a porcine enterovirus) was applied to piglets to highlight enterovirus infections. A strong sequence homology (88%) between the VP4 of EV-G1 and of other EV-G suggests that antibodies directed against viruses other than EV-G1 can be detected.In conclusion, CV-B4 E2 can infect monocytes and macrophages in vitro and in vivo in a murine system, and the virus can cause diabetes in mice previously exposed to low doses of STZ. Fluoxetine inhibits the infection of pancreatic cells with CV-B4 E2 in vitro. The detection of anti-EV-G1-VP4 antibodies highlighted natural enterovirus infections in young pigs. This porcine model could be used to study the pathophysiology of enterovirus infections and to evaluate approaches aimed to fight these viruses

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Bouam, Samir. "Aide à la décision pour la surveillance des infections nosocomiales et la sélection de l'antibiothérapie empirique : adaptation d'un modèle conceptuel pour l'implémentation et l'évaluation d'un système intégré au SIH." Paris 5, 2002. http://www.theses.fr/2002PA05CD10.

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Abstract:

Lorsqu'ils sont intégrés au système d'information hospitalier (SIH), les systèmes d'aide à la décision clinique (SADCs) semblent pouvoir contribuer à l'amélioration de la qualité des soins. Cependant, peu de systèmes sont opérationnels et à ce jour aucun modèle standard n'a été proposé. Les 2 principaux objectifs de cette thèse sont : (1) la modélisation d'un SADC dans le domaine du contrôle des infections ; (2) le développement et l'évaluation d'un système intégré à un SIH réel, à partir d'un modèle dégradé. En utilisant des méthodes d'Intelligence Artificielle, nous avons conçu en langage UML (Unified Modeling Language), un modèle conceptuel composé de 2 sous-modèles : l'un pour la détection des infections nosocomiales et des germes multirésistants et de l'autre pour la sélection de l'antibiothérapie empirique. Le premier est basé sur une approche " systèmes experts ", alors que le second repose sur une approche prédictive. GermWebServer est le système que nous avons développé pour le module de surveillance des infections. Basé sur des techniques d'ingénierie des Bases de Données, ce système nous a permis une opérationalisation de notre démarche par l'utilisation d'un SADC en pratique clinique de routine avec une amélioration des performances de détection des infections nosocomiales. Par ailleurs, les résultats obtenus pour le module de sélection de l'antibiothérapie empirique semblent favoriser un modèle prédictif basé sur la méthode de régression logistique, puisqu'il semble mieux adapté qu'un modèle de réseau de neurones artificiel. GermWebServer constitue aujourd'hui une plate-forme pour de nouvelles applications telles que : l'identification des anciens porteurs du GMRs dès leur admission à l'hôpital ou le contrôle des prescriptions d'antibiotiques.

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Alidjinou, Enagnon Kazali. "Infection à coxsackievirus B4, inflammation et persistance." Thesis, Lille 2, 2016. http://www.theses.fr/2016LIL2S022/document.

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Abstract:

Les coxsackievirus du groupe B (CVB) sont des petits virus à ARN appartenant à au genre Enterovirus et à la famille des Picornaviridae. Chez, l’homme, les CVB sont responsables de nombreuses infections aiguës bénignes ou sévères. Ils sont également incriminés dans le développement de maladies chroniques telles que le diabète de type 1 (DT1). En effet, plusieurs données épidémio-cliniques sont en faveur d’un lien entre les entérovirus et notamment les CVB et le DT1. Deux mécanismes majeurs ont été proposés pour expliquer cette pathogenèse entérovirale du DT1. Il s’agit de l’activation « en passant » d’un environnement inflammatoire et la persistance virale qui concourent à l’initiation du processus auto-immun. Les études présentées dans cette thèse visent à comprendre les caractéristiques et conséquences de l’infection à CVB qui pourraient expliquer l’implication de ces mécanismes. Les résultats obtenus suggèrent que CVB4 (utilisé comme modèle des CVB) est un virus inflammatoire. In vitro, il induit la production de grandes quantités d’IFNα par les cellules mononuclées du sang (CMN). Néanmoins cette induction d’IFNα n’est possible qu’en cas de facilitation de l’infection par des anticorps non neutralisants, qui se traduit par une entrée importante du virus dans les cellules. Dans nos travaux, l’IFNα a été détecté dans le plasma de sujets diabétiques, et fréquemment associé à la présence d’ARN entéroviral. De même, parmi les CMN, les monocytes ont été identifiés comme les principales cellules cibles du virus. En dehors de l’IFNα, nous avons montré que CVB4 peut induire la synthèse de plusieurs autres cytokines pro-inflammatoires notamment l’IL-6 et le TNFα. De façon intéressante, l’infection des cellules n’est pas indispensable car cette induction est possible par des particules non infectieuses. Cette production de cytokines pro-inflammatoires par les CMN peut également être amplifiée par la facilitation de l’infection en présence de particules infectieuses de CVB4. Nous avons montré que les macrophages, cellules effectrices importantes de l’immunité innée au niveau tissulaire, peuvent produire en présence de CVB4 de l’IFNα et d’autres cytokines pro-inflammatoires. Les macrophages dérivés de CMN en présence de M-CSF (mais pas de GM-CSF) sont infectables par CVB4 et le virus peut persister dans ces cellules. CVB4 peut également établir une infection chronique productive de type « état porteur » dans des cellules canalaires pancréatiques. Les cellules chroniquement infectées peuvent être guéries grâce à un traitement par de la fluoxétine. Cette molécule utilisée dans le traitement de troubles psychiatriques, présente in vitro une activité antivirale vis-à-vis de certains entérovirus, et permet d’éliminer complètement en quelques semaines le virus des cellules chroniquement infectées par CVB4. Des modifications cellulaires ont été observées au niveau des cellules chroniquement infectées notamment une diminution de l’expression de PDX-1, une résistance à la lyse au cours d’une réinfection par CVB4, ainsi qu’une diminution très importante de l’expression du récepteur CAR. Ces modifications cellulaires acquises au cours de l’infection chronique pouvaient persister après l’élimination du virus. Les cellules chroniquement infectées présentent également un profil de microARNs très différent de celui des cellules non infectées. Une évolution du virus a été également observée avec des changements phénotypiques et génotypiques. L’ensemble de nos observations montre que les caractéristiques de l’infection à CVB4 sont compatibles avec les mécanismes évoqués dans la pathogenèse entérovirale du DT1 et renforcent l’hypothèse de l’implication des CVB dans cette maladie
Group B coxsackieviruses (CVB) are small RNA viruses belonging to Enterovirus genus and to the Picornaviridae family. In humans, CVB can cause numerous mild and severe acute infections. They are also thought to be involved in the development of chronic diseases such as type 1 diabetes (T1D). Several epidemiological and clinical data support a link between enteroviruses, especially CVB and T1D. Two main mechanisms have been described to explain this enteroviral pathogenesis of T1D including a “bystander activation” of an inflammatory environment and viral persistence. These mechanisms contribute to initiation of the autoimmune process. Our studies aimed to understand the features and outcomes of CVB infection that could explain their involvement in these mechanisms. The results suggest that CVB4 (used as CVB model) is an inflammatory virus. CVB4 induces in vitro the production by peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) of high amounts of IFNα. However this induction is only possible when CVB4 infection is enhanced by non-neutralizing antibodies, resulting in increased viral entry in cells. We also reported detection of IFNα in plasma of T1D patients, commonly associated with enteroviral RNA. In addition, monocytes have been identified as major targets of enteroviruses among PBMCs. Besides IFNα, CVB4 can induce the synthesis of other proinflammatory cytokines, mainly IL-6 and TNFα. Interestingly, infection is not needed, since inactivated viral particles can induce these proinflammatory cytokines. In addition, the enhancing of CVB4 infection in PBMCs results in increased production of these cytokines. We have shown that macrophages that are known as major innate immunity effectors can produce IFNα and other proinflammatory cytokines upon infection with CVB4. Macrophages derived from PBMCs in presence of M-CSF (but not GM-CSF) can be infected by CVB4, and the virus can persist in these cells. CVB4 can also establish a productive, carrier-sate persistent infection in pancreatic ductal-like cells. The virus can be completely cleared from chronically-infected cells using fluoxetine. This molecule already used in the treatment of depression and other mental disorders, has displayed antiviral activity against many enteroviruses, and can completely clear CVB4 from chronically-infected cells within few weeks. Cellular changes have been observed during chronic infection including a reduced expression of PDX-1, a resistant profile to lysis upon superinfection with CVB4, and an important decrease of CAR expression. These changes can linger even after the clearance of CVB4. In addition the miRNA profile in chronically-infected ductal-like cells was clearly different from that of mock-infected cells. Some phenotypic and genotypic changes were also observed in the virus derived from chronic infection. Altogether, these findings show the features of CVB4 infection are compatible with mechanisms reported in the enteroviral pathogenesis of T1D, and support the hypothesis of involvement of CVB in this disease

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Caufour, Philippe. "Implication des lymphocytes T CD8+ dans la physiopathologie de l'infection par le virus de l'immunodéficience humaine : étude de la primo-infection du macaque par le virus de l'immunodéficience simienne." Paris 5, 1999. http://www.theses.fr/1999PA05CD06.

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Abstract:

Du fait de la position privilégiée occupée par les lymphocytes T CD8+ au sein de la réponse immune anti-VIH, il apparaît nécessaire d'analyser l'évolution spatio-temporelle de l'activité antivirale CD8+ et ses mécanismes de régulation. Le modèle expérimental du macaque infecté par le SIV offre la possibilité unique d'aborder en détail cette problématique, en particulier, au cours de la primo-infection dont l'étude chez l'homme se heurte à des restrictions d'ordre éthique et pratique. Nous avons démontré que, dès les premières semaines de l'infection, des perturbations précoces affectaient les lymphocytes T CD8+ ; ces modifications varient selon la localisation anatomique considérée. Ces changements au sein du compartiment CD8 sont concomitants de modifications du niveau d'expression des messagers codant les cytokines IL-7, IL-15, IL-16 et MIP-1a. La simultanéité de ces deux phénomènes et les propriétés des cytokines étudiées, laissent supposer que ces cytokines participent aux phénomènes de prolifération/recrutement observés au sein des tissus et à l'installation de la réponse immune. L'expression des messagers de l'IL-16, qui suit une cinétique inverse à l'évolution de la charge virale, suggère que cette cytokine participe au contrôle de la réplication virale. Au cours des infections par un virus atténué ou par un virus pathogène, nous avons mis en évidence dans les tissus pulmonaires, une augmentation des chimiokines MIP-1a , MIP-1ß et RANTES ; l'augmentation significativement plus importante de RANTES au cours de l'infection par le virus atténué suggère que cette chimiokine pourrait prendre part à l'installation de la réponse immune singulière existant chez ces animaux.

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Josse, Jérôme. "Impact de l'infection à Staphylococcus aureus sur le microenvironnement osseux." Thesis, Reims, 2016. http://www.theses.fr/2016REIMP204/document.

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Abstract:

Les infections ostéo-articulaires à Staphylococcus aureus sont des pathologies fréquentes dont les conséquences peuvent aller de la simple altération cellulaire à un retard de la réparation osseuse ou une réponse inflammatoire excessive. Afin d’étudier ce phénomène, nous avons, dans un premier temps, développé deux modèles d’infections in vitro faisant interagir Staphylococcus aureus et des cellules osseuses primaires issues d’explants chirurgicaux humains. Ces cellules ont été préalablement cultivées dans un milieu standard ou un milieu ostéogénique afin d’obtenir 2 populations à des stades de maturation différents. L’étude de l’internalisation de Staphylococcus aureus, de la mortalité cellulaire et de la production de médiateurs inflammatoires pour ces 2 populations a permis d’établir si l’impact de Staphylococcus aureus variait en fonction de la maturation cellulaire. Dans un second temps, nous avons étudié l’impact de Staphylococcus aureus sur des cellules souches mésenchymateuses dérivées du cordon ombilical. En effet, dans le cadre d’une régénération osseuse en site infecté, les cellules souches mésenchymateuses pourraient être amenées à interagir avec Staphylococcus aureus. Nous avons donc caractérisé la capacité de ces cellules à internaliser Staphylococcus aureus, à survivre face à l’infection et à produire des médiateurs inflammatoires dans notre modèle in vitro d’infection aiguë. Ce projet nous a permis de valider nos modèles d’infection in vitro et de caractériser l’impact de Staphylococcus aureus sur différentes cellules du microenvironnement osseux, donnant ainsi de nouvelles pistes pour le développement de stratégies pour la lutte antibactérienne et l’ingénierie tissulaire osseuse
Staphylococcus aureus-related bone and joint infections are common diseases whose consequences can range from simple cell damage to delayed bone repair or excessive inflammatory response. To study this phenomenon, we have developed two models of in vitro infection with Staphylococcus aureus and primary bone-forming cells derived from human surgical explants. These cells have been previously cultured in a standard medium or osteogenic medium to obtain two populations at different stages of maturation. The study of Staphylococcus aureus internalization, cell death and production of inflammatory mediators in these 2 populations allowed us to establish whether the impact of Staphylococcus aureus varied depending on cell maturation. We also studied the impact of Staphylococcus aureus on mesenchymal stem cells derived from umbilical cord. In case of bone regeneration in infected site, mesenchymal stem cells may have to interact with Staphylococcus aureus. Therefore, we characterized the ability of these cells to internalize Staphylococcus aureus, to survive against the infection and to produce inflammatory mediators in our in vitro model of acute infection. This project allowed us to validate our in vitro infection models and to characterize the impact of Staphylococcus aureus on different cells in the bone microenvironment, providing new approaches for the development of antibacterial strategies and bone tissue engineering

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Porte, Rémi. "Caractérisation des propriétés anti-infectieuses de la flagelline, agoniste du Toll-like receptor 5." Thesis, Lille 2, 2015. http://www.theses.fr/2015LIL2S065/document.

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Abstract:

De par sa capacité à détecter les microorganismes et à mettre en place une défense anti-infectieuse rapide, l’immunité innée représente la première ligne de défense de l’hôte. La réponse immunitaire innée est déclenchée par des motifs microbiens moléculaires universels et conservés reconnus par des récepteurs innés parmi lesquels les "Toll-like Receptors" (TLR). L’activation de ces récepteurs induit une inflammation locale et une réponse antimicrobienne adaptée au pathogène. Ces propriétés biologiques ont permis de d’envisager l’utilisation des TLR comme cible thérapeutique antiinfectieuse. Dans ce contexte il a été montré que la flagelline, le composant majeur des flagelles bactériens et le seul agoniste de TLR5 décrit à ce jour, possédait des propriétés anti-infectieuses. Des études chez la souris ont montré que la flagelline induisait une forte production, par des cellules lymphoïdes innées, d’IL-22, une cytokine impliquées dans la protection des muqueuses. Par ailleurs, la forte expression de TLR5 par les cellules épithéliales laisse présager un rôle de ces cellules dans les propriétés anti-infectieuses de la flagelline. Toutefois, les mécanismes moléculaires et cellulaires effecteurs responsables des effets antimicrobiens de l’agoniste de TLR5 restent à définir.Au cours de ce travail de thèse, nous avons étudié les capacités anti-infectieuses de la flagelline dans deux modèles infectieux chez la souris. Nous avons tout d’abord montré que l’administration systémique de flagelline, en prophylaxie c’est-à-dire préalablement au challenge infectieux, permettait de protéger d’une infection intestinale par Yersinia pseudotuberculosis. La protection induite par la flagelline est observable lors d’une infection par la voie muqueuse mais est absente lors d’un challenge infectieux par la voie systémique, démontrant ainsi le caractère muqueux de la protection. L’effet protecteur de la flagelline dans notre modèle est dépendant de l’expression de TLR5 et indépendant de l’IL-22. Cette étude suggère donc un mécanisme original de protection médié par la flagelline, indépendant de l’IL-22.Nous avons également analysé la capacité anti-infectieuse de la flagelline dans un modèle murin d’infection respiratoire à Streptococcus pneumoniae. Nous avons notamment montré que la flagelline pouvait être utilisée en thérapeutique lorsqu’elle était associée à un antibiotique. En effet, l’association d’amoxicilline ou de co-trimoxazole avec la flagelline (voie intranasale) a permis de protéger des souris infectées par une dose létale de S. pneumoniae comparativement à l’antibiotique seul. L’efficacité de cette thérapie est dépendante de l’activation de TLR5 et est associée à une infiltration pulmonaire importante de polynucléaires neutrophiles. Ce traitement combinatoire améliore également la protection dans un modèle de surinfection pneumococcique post-grippale. Ces résultats montrent que la combinaison agoniste de TLR5/antibiotique améliore la réponse anti-infectieuse pulmonaire et permettent d’envisager de nouvelles stratégies antibactériennes dans le cas d’infections où les antibiotiques montrent leurs limites (infections nosocomiales, bactéries multirésistantes…)
With its ability to sense micro-organisms and to induce a rapid defense against infections, innate immunity represents the first line of host’s defense. The innate immune response is triggered by universal and conserved microbial molecular patterns recognized by innate receptors including the Toll-like receptors (TLRs). Activation of these receptors induces local inflammation and antimicrobial response against pathogens. These biological properties have allowed considering the use of TLR as anti-infective therapeutic target. In this context it has been shown that flagellin, the major component of bacterial flagella and the agonist of TLR5, had anti-infectious properties. It was shown that flagellin induces a strong production by innate lymphoid cells of IL-22, a cytokine involved in the protection of mucosa. Furthermore, the strong expression of TLR5 by epithelial cells suggests a role for these cells in the anti-infectious properties of flagellin. However, the molecular and cellular mechanisms responsible for the antimicrobial effects of the TLR5 agonist remained to be defined.In this thesis, we studied the anti-infectious properties of flagellin in two infectious murine models. We first showed that systemic administration of flagellin, prior to infectious challenge, protect against an intestinal infection with Yersinia pseudotuberculosis. The protection induced by flagellin is observable upon infection by mucosal route but is absent during a challenge by the systemic route, thus demonstrating the role of the mucosa for the protection. The anti-bacterial effect in this model is dependent on the expression of TLR5 and independent of the innate lymphoid cells’ IL-22 production. This study suggests a novel mechanism of flagellin-mediated protection, independent of the IL-22.We also analyzed the anti-infectious abilities of flagellin in a murine model of respiratory infection by Streptococcus pneumoniae. In particular, we showed that flagellin could be used in therapy when combined to an antibiotic. Indeed, the combination of amoxicillin or co-trimoxazole with flagellin protected mice infected with a lethal dose of S. pneumoniae compared to antibiotic standalone. The effectiveness of this therapy was dependent on the activation of TLR5 and was associated with pulmonary infiltration of neutrophils. This combinatory treatment also improved the protection in a model of post-influenza pneumococcal superinfection. These results show that the combination of TLR5 agonist / antibiotic ameliorates pulmonary anti-infectious response and allow to consider new antibacterial strategies against infections when antibiotics reach their limits (nosocomial infections, multiresistant bacteria ...)

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Maillet, Séverine. "Étude de l'expression des gènes IE110 et LAT (Latency Associated Transcript) du virus herpes simplex de type 1 (HSV1) lors de la phase de latence dans le modèle murin de primo-infection herpétique orale." Paris 11, 2005. http://www.theses.fr/2005PA114829.

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Wakrim, Lahcen. "Développement d'un modèle d'infection du macaque par le virus de l'immunodéficience humaine de type 2 : approche physiopathologique et vaccinale." Paris 5, 1996. http://www.theses.fr/1996PA05A002.

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Abstract:

Devant l'expansion incontrôlée de la pandémie du syndrome de l'immunodéficience humaine, seule la mise au point d'un vaccin efficace contre son agent étiologique, le VIH, permettra d'en limiter l'ampleur. La mise au point d'un tel vaccin passe nécessairement par le développement d'un modèle animal reproduisant l'infection et la maladie observées chez l'homme. Le seul modèle pouvant reproduire de façon systématique l'infection et le développement des manifestations cliniques comparables au SIDA chez l'homme, est l'infection du macaque par le virus de l'immunodéficience simienne (SIV). Cependant, les résultats obtenus à partir des stratégies vaccinales utilisant ce modèle ne pourront pas être directement transposables à l'infection de l'homme par le VIH. La modèle d'infection du macaque par le VIH-2 permet de reproduire l'infection chronique mais les animaux ne développent pas de maladie de façon systématique. Le but de notre travail a été, d'une part de développer ce modèle pour l'étude des mécanismes physiopathologiques associés à l'infection par le VIH, et d'autre part d'évaluer la capacité de l'infection du macaque par le VIH-2 à protéger cet animal vis-à-vis d'une surinfection par voie muqueuse par un isolat pathogène de SIV. Pour augmenter le pouvoir pathogène du VIH-2 chez le macaque, nous avons effectué 5 passages séquentiels, in vivo. Les résultats que nous avons obtenus suggèrent que le pouvoir infectieux du virus augmente lors des premiers passages. Cependant, bien que des signes cliniques aient été observés chez certains animaux, aucune relation n'a pu être mise en évidence entre l'augmentation du pouvoir pathogène du virus et le nombre de passages effectués. Le faible pouvoir pathogène du VIH-2 pour le macaque suggère que ce virus pourrait être considéré comme étant " atténué " pour cette espèce. Ce modèle d'infection pourrait donc constituer une approche vaccinale, à l'image des stratégies utilisant des virus vivants atténués. Malgré la forte homologie de séquences entre le VIH-2 et le SIV et la réactivité croisée entre leurs antigènes, nos résultats montrent que l'infection chronique du macaque par le VIH-2 n'a pas pu prévenir la surinfection des animaux par le SIV. Ces résultats soulignent la difficulté d'élaborer un vaccin efficace contre l'infection par le VIH.

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Ayari, Asma. "Rôle du tissu adipeux dans les infections respiratoires par le virus Influenza ou la bactérie streptococcus pneumoniae." Thesis, Lille 2, 2018. http://www.theses.fr/2018LIL2S009/document.

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Abstract:

Longtemps décrit comme un simple tissu de réserve énergétique, le tissu adipeux blanc est, depuis l’identification de la leptine en 1994, considéré comme un véritable organe endocrine. En effet, ce tissu secrète de nombreuses hormones et cytokines agissant de manière paracrine et endocrine pour contrôler le métabolisme énergétique. Par ailleurs, en plus des préadipocytes et des adipocytes, le tissu adipeux blanc contient également des cellules immunes innées et adaptatives ; lui conférant ainsi un rôle important dans le développement et le contrôle de l’immunité. Cependant, le rôle joué par le tissu adipeux blanc dans les infections - notamment pulmonaires - reste encore peu étudié. C’est dans ce cadre général que s’est inscrit ce travail de Thèse. La susceptibilité accrue des individus obèses (expansion du tissu adipeux blanc) à l’infection par le virus de la grippe (influenza) est largement étayée dans la littérature. Nous avons évalué l’impact de l’infection par le virus influenza sur le tissu adipeux blanc, chez des souris minces et des souris obèses. Nos résultats montrent que, de manière inattendue, le virus est détecté dans les tissus adipeux, sous-cutané (inguinal) et viscéral (périgonadique), de souris infectées par voie intra-nasale (détection du génome viral par RT-qPCR). La présence de virus dans le tissu adipeux est associée à l’augmentation de la sécrétion de cytokines pro- et anti-inflammatoires, à la diminution de l’expression de gènes impliqués dans la lipolyse et la lipogénèse, et à l’augmentation de l’expression des gènes impliqués dans l’induction d’une réponse immune anti-virale. De manière intéressante, l’infection par le virus influenza est associée au brunissement du tissu adipeux sous-cutané chez les souris minces. Chez les souris obèses, l’infection par le virus de la grippe n’induit pas l’effet dépôt spécifique observé chez la souris mince et ne montre pas de brûnissement au niveau du tissu adipeux sous-cutané 7 jours p.i. In vitro, nous montrons que le virus influenza peut infecter les préadipocytes et les adipocytes (lignée murine et cellules primaires humaines). Cependant, alors que le virus effectue la totalité de son cycle dans l’adipocyte, le préadipocyte libère très peu, voire pas, de nouveaux virions infectieux (PCR, transcriptomique, technique de plages de lyse, microscopie confocale et électronique). Ainsi nos résultats, très originaux, identifient le tissu adipeux blanc comme un nouveau tissu cible de l’infection par le virus de la grippe, in vivo. Au sein de ce tissu, les préadipocytes et les adipocytes sont potentiellement infectés par le virus, comme le montrent nos données in vitro, les adipocytes seuls permettant la production de nouvelles particules infectieuses.Contrairement à l’infection grippale, les données épidémiologiques et/ou expérimentales concernant la susceptibilité des obèses à l’infection par la bactérie Streptococcus pneumoniae sont contradictoires, du fait de l’utilisation de différents modèles d’obésité d’origine génétique et de sérotypes de pneumocoques. Dans ce projet, nous avons utilisé un modèle d’obésité d’origine nutritionnelle ; le modèle de souris nourries par un régime enrichi en lipides. Nous montrons que les souris obèses infectées (sérotype Sp1) développent un syndrome de type méningite, mortel, tandis que les souris minces contrôlent l’infection. Si les réponses pulmonaires à l’infection sont comparables entre les souris minces et obèses (dénombrement des colonies bactériennes, histologie, PCR, ELISA, cytométrie en flux), le nombre de bactéries dans le cerveau est significativement plus élevé chez les souris obèses, associé à une altération de la perméabilité de la barrière hématoencéphalique [...]
Since the identification of leptin in 1994, the white adipose tissue (WAT) is no longer considered to solely be an inert tissue storing fat. As an endocrine organ, the adipose tissue synthesizes and secretes several hormones and cytokines involved in the control of whole-body metabolism. In addition, besides preadipocytes and adipocytes, WAT also contains innate and adaptive immune cells; thereby contributing to the development and control of immunity. However, the role played by the adipose tissue during infections - notably during pulmonary infections, such as those resulting from influenza virus or Streptococcus pneumoniae infections - has barely been investigated. This defines the general scope of this work. Epidemiological and experimental data convincingly report that obese individuals are more susceptible to influenza infection. During this project, we therefore questioned whether influenza infection may impact on adipose tissues, both subcutaneous (inguinal, SCAT) and visceral (perigonadal, EWAT) depots, in lean and high-fat diet-induced obese mice. We unexpectedly showed that influenza virus is detected in SCAT and EWAT (quantification of the viral genome by RtqPCR) and that this was associated with drastic changes in the tissue such as: increased secretion of pro- and anti-inflammatory cytokines, decreased expression of genes involved in lipogenesis and lipolysis, as well as increased expression of genes related to the induction of anti-viral immunity. Interestingly enough, influenza infection was associated with the development of brown-like adipocytes in the SCAT, only in lean animals. Moreover, we demonstrated in vitro that preadipocytes and adipocytes (murine cell-line and human primary cells) are permissive to infection, yet with different outcomes. Indeed, only adipocytes allowed the release of new infectious particles (RtqPCR, transcriptomics, quantification of infectious particules on MDCK cells, confocal and transmission electron microscopy). Altogether, our findings revealed, for the first time, that the white adipose tissue, an organ at the crossroads of metabolism and immunity, is deeply affected by influenza infection and might thus be undervalued in influenza pathophysiology.In opposite to influenza infection, the impact of obesity on the outcome of Streptococcus pneumoniae (S.p.) infection remains uncertain, due to the different models (genetically-based obesity, and bacterial strains) used. During this work, we investigated S. pneumoniae (Sp1 strain, sublethal dose) infection in lean and high-fat diet-induced obese mice. We showed that obese mice died from sublethal S. pneumoniae infection, compared to lean animals. The increased mortality induced by infection did not result from impaired pulmonary response but rather from the development of a meningitis-like syndrom likely resulting from an increased bacterial dissemination through the bloodbrain barrier into the brain. We propose that the model of dietary obesity induced by consumption of fat-enriched diet, may be envisaged as a novel and valuable experimental model of memingitis to study Streptococcus pneumoniae travel through the blood-brain barrier and the subsequent immune consequences

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Hassane, Maya. "Etude des lymphocytes T gamma-delta producteurs d'interleukine-17 au cours des infections respiratoires." Thesis, Lille 2, 2016. http://www.theses.fr/2016LIL2S034/document.

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Abstract:

Le développement de la réponse immunitaire innée de l’hôte au cours des infections respiratoires nécessite la mise en place rapide d'un réseau moléculaire et cellulaire relativement complexe ayant pour but de contrôler la croissance microbienne ainsi que permettre son éradication. Dans certaines circonstances, et malgré l’existence de vaccins et d'antibiotiques efficaces, l’infection par Streptococcus pneumoniae peut aboutir à des pathologies graves telles qu'une pneumonie, une méningite et/ou une septicémie. Ainsi, à l'heure actuelle, les maladies associées au pneumocoque sont encore loin d'être sous contrôle. Dans ce contexte, une meilleure compréhension de la réponse immunitaire innée de l’hôte contre ce pathogène est nécessaire.Mes travaux de thèse ont permis pour la première fois de mettre en évidence la fonctionnalité et la relevance biologique de l’inflammasome NLRP3 au sein des neutrophiles pulmonaires in vivo dans un modèle d’infection respiratoire par S. pneumoniae.Ainsi, de façon inattendue, les neutrophiles jouent un rôle accessoire original à des temps précoces de l’infection via leur capacité à produire de l’IL-1β. Cette synthèse protéique est possible grâce à la combinaison de 2 signaux à la fois dérivés de l’hôte (TNF-α des macrophages alvéolaires) et de la bactérie (toxine). Ces deux signaux permettent l’assemblage et l’activation de l’inflammasome NLRP3 neutrophilique. D’un point de vue translationnel, nous avons été capables de démontrer un mécanisme similaire avec des neutrophiles humains.Cette production d’IL-1β par les neutrophiles participe à l’activation des lymphocytes T γδ producteurs d’IL-17; une cytokine essentielle dans le contrôle de l’infection bactérienne via sa capacité à induire rapidement le recrutement d’une deuxième vague de neutrophiles participant directement à l’élimination et la clairance bactérienne.Sur la base de ces travaux fondamentaux, nous avons émis l’hypothèse qu’une augmentation du pool de cellules innées sécrétrices d’IL-17A pourrait avoir un effet bénéfique sur le contrôle d’une infection respiratoire à pneumocoque. Ainsi via l’administration prophylactique et locale d’IL-7, nous avons été capables d’augmenter la fréquence et le nombre de lymphocytes innés producteurs d’IL-17A résultant en un meilleur contrôle de la charge bactérienne pathogène associée à une augmentation du recrutement neutrophilique. A ce stade, ces résultats encourageants, nous pousse à mieux comprendre les mécanismes moléculaires et cellulaires associés à cet effet dans l’éventualité de proposer à terme une nouvelle approche thérapeutique dans le contrôle des infections respiratoires pulmonaires basée sur la manipulation de la biologie de l’IL-7
The mounting of an appropriate host innate immune response in the lungs requires the rapid establishment of a complex cellular and molecular networking that allows the containment and clearance of pathogens during respiratory infections. Both neutrophils and γδT cells are central players in the host response during mucosal infections. Using a model of invasive pneumococcal disease, we illustrated a role for Interleukin-17A in controlling neutrophil recruitment, bacterial loads and survival. Following Streptococcus pneumoniae infection, we defined pulmonary γδT cells, especially the lung resident Vγ6Vδ1+ subset, as the primary source of IL-17A in an IL-23/IL- 1β-dependent manner. Using gene-targeted mice, we demonstrated that γδT cells largely contributed to neutrophilia and to the control of the pathology. Furthermore, we now defined a second and unexpected early role for neutrophils as accessory cells in γδT17 cell activation through IL-1β secretion. Neutrophil-derived IL-1β was dependent on NLRP3 inflammasome activity and required alveolar macrophage-secreted TNF-α for priming and bacterial pneumolysin for NLRP3- dependent caspase-1 activation. This report thus brings to light the sequential molecular/cellular events leading to γδT17 cell activation and highlights the existence of a biologically relevant and fully functional NLRP3 inflammasome in pulmonary neutrophils that regulates a key immune axis in the development of protective innate response to respiratory bacterial infection.Based on these observations, we hypothesized that an increase in the pool of IL-17A-producing innate-like T lymphocytes might play a protective role during pneumococcal infection. As recently suggested, we demonstrated that intranasal IL-7/M25 complex administration into naïve mice allowed the expansion of the cellular pool of innate immune cells presenting a Th17-like phenotype in the lungs especially T cells. Moreover, we showed during S. pneumoniae infection that prophylactic IL-7/M25 treatment increased the capacity of Vγ6Vδ1+ T cells to produce IL-17A. Interestingly, this phenotype led to higher neutrophil recruitment and a better control of bacterial burden in the lungs as well as systemic dissemination. Thus, we report a critical role of IL-7 in creating an IL-17-enriched microenvironment which improves the early development of host innate immune response to respiratory bacterial infection. This observation might pave the way to the development of future innovative cytokine/cell-based strategies against Streptococcus pneumoniae

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Haddadi, Ahmed Zine El Abidine. "Construction d’un score prédictif du risque nosocomial pour des patients de réanimation." Thesis, Lille 2, 2013. http://www.theses.fr/2013LIL2S039/document.

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Abstract:

Les infections nosocomiales demeurent un véritable défi de santé publique en dépit des progrès techniques considérables enregistrés. Inhérentes à la prise en charge de soins, se sont les services de réanimation qui comptabilisent les plus fort taux de prévalence. En effet, quelle que soit leur orientation (chirurgicale, médicale ou mixte), ces services, ont pour mission la prise en charge des patients dont le processus vital est menacé par la survenue brutale d’une ou de plusieurs défaillances organiques nécessitant un arsenal diagnostic et/ou thérapeutique souvent invasif.Parmi les conséquences induites par ces infections ; i) l’allongement de la durée de séjour, ii) le surcoût, iii) une augmentation de la mortalité, et iv) la résistance bactérienne.Pouvoir anticiper en amont et en aval cette problématique aux motifs complexes et aux conséquences parfois fatales serait un atout majeur au profit des patients et un outil stratégique pour les équipes soignantes.Organisée autour de trois étapes charnières, la présente étude s’est d’abord attelée à la phasede l’identification des facteurs de risque de l’évènement nosocomial et de mortalité au service de réanimation ou s’est passé l’étude –prise en compte du case-mix du service de réanimation CHU la TIMONE-. Réalisée grâce à deux méthodes statistiques différentes à savoir la régression logistique et la méthode des risques compétitifs. L’étape suivante a consisté dans un premier temps à comparer les capacités prédictives des scores APACHE II, LOD, SOFA et SAPS II chez ces patients -hospitalisés en réanimation-ayant développé un épisode nosocomial. Dans un second temps de déterminer si la variation des scores LOD, SOFA, APACHEII et SAPS II est un facteur pronostique du risque nosocomial. Les résultats obtenus révèlent que la meilleure performance prédictive est objectivée au profit du SOFA et que seule la variation de ce même score entre le premier jour d’hospitalisation et celui du diagnostic de l’infection nosocomiale mesurée grâce à l’AUC est prédictive du risque nosocomial.À l’issue de ces étapes et au moyen des résultats obtenus une construction d’un score prédictif est réalisée grâce à la méthode de régression logistique. L’objectif de ce score est d’éclairer voire d’influencer le prescripteur lors de ses prises de décisions ou d’éventuelle démarche d’ajustement de ses conduites thérapeutiques
Limiting nosocomial infections is still a health challenge although the technical development has improved. They are inherent in medical care and the health care services have the highest prevalence. Indeed, whatever the service (surgical, medical or both), the patients life-giving process is under attack because of the emergence of one or several organ faillures;This generates a diagnostic and therapeutic arsenal which is often invasive.Among the consequences resulting from these infections we will take into account :i) a longer stay in hospitalii) an extra costiii) a higher mortality rateiv) bacterial resistance .If we could anticipate upstream and downstream this issue with complex origins and sometimes fatal consequences, it would be a major asset for patients and a strategic tool for medical teams.The present study is organized in three parts, and first focusses onto the identification of the nosocomial event and death risk factors in intensive care where the study took place. We took into account the the case-mix of the intensive care unit in the TIMONE University Hospital. The study was made with two different statistic methods that is logistic regression and the competitive risks method.The next step first consisted in comparing the predictive capacities of the APACHE II, LOD, SOFA and SAPS II scores in nosocomial patients hospitalized in intensive care . Then it tried to determine if the variation of the LOD, SOFA, APACHEII and SAPS II scores was a prognostic risk factor.Results showed that the best predictive performance was objectively measured by the SOFA and that only the variation of this score between the first day in hospital and the day of the diagnosis of a nosocomial infection, calculated thanks to the AUC, could be predictive of a nosocomal risk. After these steps, and with the results calculated , the construction of a predictive score could be established thanks to the logistic regression method. The objective of this score is to help, or even influence the prescribing doctors when they take decisions or when they try to adjust their therapeutic practices

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Béraud, Guillaume. "Modelling infectious agent transmission using social mixing data." Thesis, Lille 2, 2015. http://www.theses.fr/2015LIL2S040/document.

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Abstract:

L'évaluation économique de nouveaux vaccins exige de modéliser la transmission infectieuse au sein de la population, et donc des hypothèses sur la structure et la répartition des contacts. Les matrices de contact obtenues à partir d’enquête de population ont été déterminées pour 8 pays européens. Mais aucune donnée de ce type n'existe à ce jour pour la France. L’étude ComesF (Contact Matrix Estimation – France) vise à combler cette lacune.MéthodologieL'enquête s’est effectuée sur 3 périodes (Février-Mars, Avril, Mai-Avril) avec 278 participants communs à la première et dernière période. Les participants devaient rapporter tous leurs contacts au cours de 2 jours consécutifs dans un journal, avec l'âge, le sexe, l'endroit, la fréquence, le type et la durée du contact.En combinant des enquêtes sérologiques de 2009 et 2013 et les données de couverture vaccinales, nous avons modélisé la séroprévalence de la rougeole, des oreillons et de la rubéole; puis extrapolé la susceptibilité selon l’âge par département à l'année d'intérêt (2016) ; enfin le potentiel épidémique et l'incidence relative selon l’âge d'une future épidémie ont été estimés.Nous avons analysé l'influence de conditions météorologiques sur les variations temporelles des matrices de contact. La population de l'étude a été analysée selon le jour et la météorologie pour estimer le nombre moyen de contacts et le potentiel de transmission estimée avec le R0. Nous avons effectué une revue systématique de la littérature sur les différences selon le genre pour la grippe, la rougeole, les oreillons et la rubéole, puis exploré l'impact du genre sur les matrices de contact et la modélisation des maladies infectieuses.Résultats2033 participants ont rapporté 38881 contacts (médiane pondérée [premier quartile-troisième quartile] : 8 [5–14] par jour) et 54378 contacts avec les contacts professionnels supplémentaires (9 [5–17]). Contrairement à l'âge, le genre, la taille du foyer, les vacances scolaires, le week-end et l'activité professionnelle, la période de l'année influait peu le nombre de contacts ou les schémas de contact. Les schémas de contact étaient influencés par l'âge indépendamment du lieu de contact, et par le genre, les femmes ayant 8 % plus de contacts que les hommes. La plupart des contacts avaient lieu à la maison et à l'école, mais l'ajout des contacts professionnels modifiait la structure des schémas de contact. Les vacances scolaires et les week-ends réduisaient le nombre de contacts, et le R0 de 33 % et de 28 %, respectivement. Le risque pour les Oreillons et la Rubéole concerne surtout le Sud Est et le Centre de la France, alors que le risque pour la rougeole est plus dispersé. Le risque varie avec le genre pour la Rougeole et la Rubéole. Outre les bébés < 1 an, l’épidémie toucherait surtout les adolescents et les jeunes adultes.Les conditions météorologiques influençaient les schémas de contact différemment entre les jours de semaine ou les weekends. La correction pour analyse répétée limitait le nombre de résultats significatif, mais la tendance pour un effet de la météorologie variant entre les jours de semaine et le week-end restait.Les différences de genre dans le schéma de contact pourraient expliquer en partie les différences de genre dans l'épidémiologie des maladies infectieuses. L'utilisation de données spécifiques par genre avait un impact significatif sur le résultat de la modélisation du risque d’une épidémie.Les matrices de contact françaises partageaient de nombreux points communs avec les autres matrices européennes, notamment avec un impact substantiel des fermetures d’école en cas d’épidémie sur la progression de l’épidémie. Le risque d'une nouvelle épidémie de rougeole persiste, mais prédomine pour les oreillons. L'effet des conditions climatiques sur les schémas de contact était modeste, voire négligeable. L’utilisation des données spécifiques par genre est à considérer en modélisation
The economic evaluation of new vaccines requires the modeling of infectious disease transmission within a population, which in turn requires some assumption of specific mixing patterns. Matrixes generated from social contact studies were determined for 8 European countries. To date, no such data exist for France. The ComesF study (Contact Matrix Estimation – France) aimed to fill this gap.MethodologyThe survey was carried out over 3 different periods (Feb-Mar, Apr, Apr-May) with 278 participants common to the first and the last periods. Participants had to list all their contacts for 2 consecutive days in a diary, with the age, sex, location, frequency, type and duration of the contact, from which we estimated French contact matrixes.Combining cross-sectional serological surveys from 2009 and 2013 and vaccine coverage information, we have determined an optimal model for the serology of measles, mumps and rubella for the year of the data collection; age-dependent susceptibility by department was then derived to the year of interest (2016), and effective reproduction number and age-dependent relative incidence of a potential outbreak were estimated using the French contact matrixes.We analysed the influence of meteorological conditions on the temporal variations in mixing patterns. The population of the study was split according to the day and the weather at the time when the diary was filled in. The mean number of contacts and the potential for transmission summarized with R0 were calculated for type and location of contact under different weather conditions.We conducted a systematic review on gender differences in infection focusing on influenza, measles, mumps and rubella. Finally, we provided an exploration of the impact of gender on mixing patterns, and eventually the potential implication for modelling.ResultsThe 2033 participants reported 38 881 contacts (weighted median [first quartile-third quartile]: 8[5–14] per day), and 54 378 contacts with supplementary professional contacts (9[5–17]). Contrary to age, gender, household size, holidays, weekend and occupation, the period of the year had little influence on the number of contacts or the mixing patterns. Contact patterns were highly assortative with age, irrespective of the location of the contact, and gender, with women having 8% more contacts than men. Although most contacts occurred at home and school, the inclusion of professional contacts modified the structure of the mixing patterns. Holidays and weekends reduced the number of contacts dramatically, and as proxies for school closure, reduced R0 by 33% and 28%, respectively.The risk for Mumps and Rubella mainly concerned southeastern and south central France, while the risk for measles was more scattered over the country. Risk differed with gender for Measles and Rubella. Besides infants under 1, the highest share of participation would concern teenagers and young adults.The weather had a differential effect on social mixing according to the type of day, notably weekdays and weekend. But correction for repeated analysis made some results no more significant, although the trend for a differential effect between weekdays and weekend remained.Gender differences in social mixing might explain some gender differences in infectious disease epidemiology. Using gender-specific susceptibility and gender-specific contact matrixes had a significant impact on the result of the modeling. Despite the differences, French contact matrixes shared many aspects with those of other European countries. Notably, school closures were likely to have a substantial impact on the spread of close contact infections in France. While the risk of a new Measles outbreak persists, it predominates for Mumps. The effect of weather on social mixing was mild, if not negligible. Gender differences in modelling should be emphasized

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Cian, Amandine. "Epidémiologie, circulation, colonisation du parasite entérique unicellulaire Blastocystis sp." Thesis, Lille 2, 2016. http://www.theses.fr/2016LIL2S029/document.

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Abstract:

Les protozooses digestives restent une des premières causes de morbidité, de malnutrition et de mortalité dans le monde. Cependant, la biologie de certains protozoaires entériques comme Blastocystis est mal connue et il reste négligé par les autorités sanitaires. Ce parasite colonise le tractus intestinal de l’Homme et de nombreux animaux. Son principal mode de transmission est la voie oro-fécale et sa prévalence peut dépasser 50% dans les pays en développement. Il présente une large diversité génétique avec 17 sous-types (STs) identifiés à ce jour. Un large faisceau de données récentes suggère que l’infection à Blastocystis est associée à une variété de troubles gastro-intestinaux et de l’urticaire.Dans le cadre de ma thèse, des études épidémiologiques ont été menées dans différents pays (Liban, Sénégal, France) afin de déterminer la prévalence de ce parasite dans la population humaine et identifier des facteurs de risque d’infection. En parallèle, à travers une enquête dans des zoos français, des réservoirs animaux de transmission zoonotique du parasite ont été proposés. D’autre part, les mécanismes impliqués dans la colonisation de l’hôte par Blastocystis ont été étudiés.Dans le cadre des enquêtes épidémiologiques, le parasite a été recherché dans les selles par PCR en temps réel et l’amplicon obtenu séquencé pour le sous-typage. La première étude menée au Liban a montré une prévalence de 19% dans la population générale mais cette prévalence atteint 60% dans une population d’écoliers vivant dans la même région. Une prévalence de 100% a été obtenue dans une cohorte d’enfants sénégalais. Ces fortes prévalences s’expliquent par des conditions d’hygiènes très précaires. Le ST3 était prédominant dans ces deux pays suivi des ST1 et ST2. Dans une étude multicentrique menée en France, une prévalence globale de 18,3% a été obtenue avec une prédominance du ST3 suivi des ST1, ST4 et ST2. Cette distribution est aussi celle observée dans une majorité de pays européens. Dans l’étude française, des variables (voyage récent, âge, saison) ont été identifiés comme des facteurs de risque de transmission du parasite. Le contact avec des animaux peut représenter un autre facteur de risque du fait du potentiel zoonotique du parasite. Dans une large étude épidémiologique réalisée dans deux zoos français sur plus de 160 espèces animales, la prévalence globale de Blastocystis dépasse 30% avec des variations importantes selon les groupes d’animaux. En comparant la distribution des STs entre l’Homme et les différents groupes d’animaux, les primates, les artiodactyles (bovins et cochons) et les oiseaux représenteraient les principaux réservoirs potentiels d’infection pour l’Homme.Une association entre l’infection à Blastocystis et l’appendicite a été mise en évidence chez une enfant au Maroc confirmant la pathogénie et le potentiel invasif et inflammatoire du parasite. De plus, 26 autres membres de sa famille ont présenté des symptômes digestifs suggérant une épidémie de blastocystose d’origine hydrique. L’hypothèse d’une relation entre ST de Blastocystis et pouvoir pathogène a été émise d’où l’intérêt d’une étude de génomique comparative afin d’identifier des facteurs de virulence pouvant être spécifiques d’un ST. A ce jour, aucune différence n’a pu être mise en évidence entre le génome de ST4 séquencé durant ma thèse et celui de ST7 disponible dans les bases de données alors qu’ils présentent une virulence différente in vitro. Enfin, l’impact de la colonisation par Blastocystis sur la composition du microbiote intestinal humain a été évalué. Une approche par séquençage à haut-débit a permis de comparer les compositions des microbiotes de patients infectés ou non par Blastocystis montrant une diversité bactérienne plus élevée chez les patients colonisés par le parasite. Ces données suggèrent que la colonisation par Blastocystis ne serait pas associée à une dysbiose intestinale généralement observée dans les maladies infectieuses intestinales
Digestive protozoan infections are a major cause of morbidity, malnutrition and mortality worldwide. However, the biology of some enteric protozoa as Blastocystis is not well known and these microorganisms remain still neglected by the health authorities. Briefly, this parasite colonizes the intestinal tract of humans and various animals. Its main mode of transmission is the fecal-oral route and its prevalence can exceed 50% in developing countries. It exhibits a large genetic diversity with 17 subtypes (STs) identified to date. Recent data suggest that infection with Blastocystis is associated with a variety of gastrointestinal disorders and urticaria. As part of my thesis, epidemiological studies have been conducted in different countries (Lebanon, Senegal, France) to determine the prevalence of this parasite in the human population and identify risk factors for infection. In parallel, through a survey in French zoos, animal reservoirs of zoonotic transmission of Blastocystis have been proposed. Moreover, mechanisms involved in the colonization of the host by the parasite were studied.As part of, epidemiological, the parasite was identified in faecal samples by real-time PCR and the resulting amplicon was sequenced for subtyping. The first study conducted in Lebanon in the Tripoli area showed a prevalence of 19% in the general population but this prevalence reached 60% in a population of school children living in the same region. A prevalence of 100% was obtained in a cohort of Senegalese children. The high prevalence observed in these countries can be explained by poor hygiene conditions in connection with the faecal peril. In terms of distribution of STs, the ST3 was predominant in both countries followed by ST1 and ST2. In a multicenter study conducted in France, an overall prevalence of 18.3% was obtained with a predominance of ST3, followed by ST1, ST2 and ST4. This distribution is quite similar to that observed in most European countries. In the French study, parasite prevalence was significantly higher in summer than in winter. Other variables such as a recent trip and age have been identified as risk factors for transmission of the parasite. The contact with animals may represent another risk factor because of the zoonotic potential of the parasite. In a large epidemiological study conducted in two French zoos and including over 160 animal species, the overall prevalence of Blastocystis exceeds 30% with significant variations between animal groups. By comparing the distribution of STs between humans and different groups of animals, primates, artiodactyls (cattle and pigs) and birds represent major potential reservoirs of infection for humans.An association between infection with Blastocystis and appendicitis was demonstrated in a child in Morocco confirming the pathogenicity and invasive and inflammatory potential of the parasite. In addition, 26 other family members presented digestive symptoms suggesting waterborne outbreak of blastocystosis. The hypothesis of a relationship between Blastocystis ST and pathogenicity was suggested hence the interest of a comparative genomics study to identify virulence factors that may be present or absent for some STs. No difference was found between the ST4 genome sequenced during my thesis and the ST7 genome available in the database while these STs have different virulence in vitro. Finally, the unknown impact of colonization by Blastocystis on the composition of the human intestinal microbiota was evaluated. The compositions of the bacterial microbiota of 96 patients infected or not by Blastocystis were obtained by high-throughput sequencing and compared. A higher bacterial diversity was found in colonized patients compared to non-infected patients. These data suggest that colonization by Blastocystis would not be associated with dysbiosis generally observed in intestinal infectious diseases but rather to a healthy intestinal microbiota

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Huck, Olivier. "Infection et stimulation de cellules endothéliales par Porphyromonas gingivalis et son lipopolysaccharide : lien entre maladies parodontales et athérosclérose." Thesis, Strasbourg, 2013. http://www.theses.fr/2013STRAJ021.

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Abstract:

Depuis plusieurs années, l’influence des pathologies parodontales sur certaines pathologies systémiques, notamment les maladies cardio-vasculaires et l’athérosclérose apparait de plus en plus évidente. Dans notre étude, nous nous sommes intéressés à l’évaluation des effets induits par Porphyromonas gingivalis, une des principales bactéries parodontopathogènes, et son lipopolysaccharide sur les cellules endothéliales, qui forment une interface entre le flux sanguin et la paroi vasculaire, d’où un rôle important dans l’initiation et le développement de la plaque d’athérome. Nous avons surtout ciblé les effets induits sur la cathepsine B, une protéase impliquée dans le développement de la plaque d’athérome, et sur l’inflammasome, un complexe impliqué dans la production d’IL-1beta. Les résultats de nos travaux montrent que l’infection par Porphyromonas gingivalis et la stimulation par son LPS sont capables d’induire une augmentation de l’activité enzymatique de la cathepsine B, ceci suivant différentes cinétiques. Dans les deux cas, ces augmentations d’activité se font sans modifications de la synthèse d’ARNm, ni de la concentration protéique de l’enzyme. Nos résultats démontrent également que l’infection par Porphyromonas gingivalis entraine une augmentation de l’expression ARN de l’inflammasome NLRP3, mais celle ci n’est pas observée au niveau protéique du fait d’un processus de protéolyse de la protéine NLRP3 suite à l’infection. Dans un deuxième temps, nous avons développé un modèle de parodontite expérimentale, fiable et reproductible, nous permettant d’envisager une expérimentation in vivo afin d’observer les interactions à distance entre maladies parodontales et athérosclérose sur dessouris apolipoprotéine-E -/-
Periodontal diseases have been linked to systemic diseases especially cardiovascular diseases and atherosclerosis. In our study, we investigated the effects induced by an infection with Porphyromonas gingivalis, a major periodontal pathogen, and stimulation by its lipopolysaccharide on endothelial cells at the interface between the inner part of arteries and blood flow. We focused on the effects induced on cathepsin B, a protease involved in atherosclerosis and on the activation of inflammasome, an intracellular complex linked to secretion of IL-1beta. Results showed that infection with Porphyromonas gingivalis and stimulation by its lipopolysaccharide increase enzymatic activity of cathepsin B with different kinetics. These modifications are observed without any modifications of RNAm expression and protein concentration. We also showed that infection with Porphyromonas gingivalis increases RNAm expression of NLRP3 but this increase at the RNAm level is not associated with an increase of the protein concentration due to an induced proteolysis. Furthermore, we developed a reliable model of experimental periodontitis that will be used to analyze interactions between periodontitis and systemic diseases in vivo, especially in apolipoprotein-E -/- mice

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Surdeau, Natacha. "Biofilms et infections nosocomiales : évaluation de l'efficacité d'un nouveau désinfectant OXSIL® 320N." Reims, 2004. http://www.theses.fr/2004REIMO201.

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Abstract:

@On appelle infections nosocomiales, les maladies infectieuses contractées au cours d'une hospitalisation qui n'étaient ni en incubation ni présentes à l'admission du patient. Elles peuvent être d'origine endogène ou exogène : le patients lui-même, le personnel, le matériel, les surfaces et l'environnement. Cette contamination peut résulter d'un manque d'efficacité des procédures de nettoyage-désinfection, déficience souvent attribuée à l'état dans lequel se trouve ces germes indésirables (biofilms). Pour réduire ces risques de contamination deux axes ont été abordés : d'une part les prédictions d'adhésion entre le support en acier inoxydable AISI 304 (constituant majeur du matériel en bloc opératoire) et quatre souches responsables d'infections nosocomiales (E. Coli, S. Aureus, P. Aeruginosa et E. Hirae) et d'autres parts, l'évaluation de l'efficacité ainsi que les conditions d'utilisation d'un nouveau désinfectant OXSILÒ 320N sur des cellules planctoniques et des biofilms. L'étude physicochimique a montré toute la complexité des interactions impliquées dans la phase initiale d'adhésion. Si en théorie, il est possible d'enrayer l'adhésion bactérienne à un support en modifiant ses caractéristiques de surface, notre étude montre qu'il est impossible de limiter l'adhésion simultanée des 4 souches bactériennes étudiées au support AISI 304. Face à une telle situation, il est donc impératif d'optimiser les procédures de nettoyage-désinfection. OXSILÒ320N possède une activité de spectre 4 selon la norme AFNOR NF T 72-150 sur des cellules planctoniques à la concentration de 3,13%. Par contre les biofilms sont plus résistants que leurs homologues planctoniques. Ceci serait dû à la présence de mécanismes de défense connus. Selon les recommandations d'utilisation de SODIFRA les conditions optimales pour obtenir un niveau "zéro" de contamination sont : 12,52% d'OXSILÒ320N et un temps de contact de 10 min évitant tout risque infectieux entre deux opérations de courtes ou de longues durées en blocs opératoires. Ces résultats ont mis en évidence la nécessité d'utiliser ce désinfectant à une concentration appropriée et de ne pas négliger les conséquences d'une utilisation en infradose même si celle-ci autorise selon les normes AFNOR une activité bactéricide
@Nosocomial infections are hospital acquired infections. They are not present or incubating when the patient is admitted to the hospital, and are either endogenous or exogenous. Endogenous ones are caused by organisms present in the patient own flora and exogenous infections are caused by organisms originating from medical devices, hospital staff, or environment. This contamination might be the result of a lack of efficiency in cleaning and disinfection procedures, those deficiencies being often attributed to the state in which these harmful microorganisms are found (biofilms). To reduce the risks of contamination, two parts have been developed in this thesis: at first, predictions of adhesion between stainless steel AISI 304 (major component of equipment in operating room) and four nosocomial strains (E. Coli, S. Aureus, P. Aeruginosa et E. Hirae), and in the second part, we determine, the efficient concentration of a new disinfectant OXSILÒ 320N in order to eliminate biofilms. Physico-schemical studies demonstrated the complexity of interactions involved in the initial phase of adhesion. We suggest that a change of the stainless steel surface properties could theoretically limit bacterial adhesion. However it was nearly impossible to limit adhesion between the four studied bacterial strains and the support AISI 304. It is then necessary to optimise preventive hygienic conditions. The bactericidal concentration of OXSILÒ 320N against planktonic cells, according to AFNOR Norm NF T 72-150, was 3,13%. Furthermore, biofilms were commonly more resistant than their planktonic counterparts due to the presence of known resistance mechanisms. According to the SODIFRA recommendations, the optimal conditions, required to avoid any contamination, were a concentration 12,52% and 10 min contact. These conditions can eliminate infection risks during short or long laps between two interventions in an operating room. These results revealed the necessity to use this disinfectant at appropriate concentration and but also the consequences of using it in infradose, although this concentration is considered as an efficient concentration by AFNOR Norm

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Bustamante, Jacinta Cecilia. "Défaut héréditaire de CYBB et prédisposition mendélienne aux infections mycobactériennes." Paris 5, 2007. http://www.theses.fr/2007PA05A003.

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Abstract:

Le syndrome de susceptibilité mendélienne aux infections mycobactériennes (MSDM) est un syndrome rare caractérisé par une susceptibilité accrue à des germes intracellulaires peu virulents (bacille de Calmette-Guérin, mycobactéries environnementales) sans évidence d'autre infection (sauf des infections à salmonelles). Des mutations causales de six gènes affectent la boucle d'activation IL12/IL23-IFNγ. Nous avons étudié quatre hommes d'une famille non consanguine ; avec des infections mycobactériennes récurrentes. Nous avons identifié deux régions d'intérêt sur le chromosome X avec un LOD score maximum de 1,93. Une mutation, Q231P, a été retrouvée sur le gène CYBB chez ces patients. CYBB, élément essentiel du système NADPH dans les phagocytes, est responsable d'un autre déficit immunitaire, la granulomatose septique chronique. Cette mutation affecte uniquement l'explosion oxydative dans les macrophages dérivés in vitro. Ce travail permet de définir une nouvelle forme liée au chromosome X du MSMD, et il indique que l'explosion oxydative est importante pour l'immunité antimycobactérienne dans les macrophages tissulaires chez l'homme
Mendelian susceptibility to mycobacterial disease (MSMD) is a rare syndrome conferring predisposition to clinical disease caused by weakly virulent mycobacteria (bacille Calmette Guérin vaccines and environmental mycobacteria), as well as more virulent. M. Tuberculosis and salmonella. Mutations found in six genes involved IL12/IL23-IFNγ mediated immunity. We studied a multiples family in which four otherwise healthy adult males show mycobacterial diseases (BCG-osis and tuberculosis). By multipoint linkage analysis, a maximal Lod score of 1. 93 was found for two candidate regions on X-chromosome. The patients harbor a novel mutation in CYBB (Q231P), which abolishes the respiratory burst in monocyte-derived macrophages. This gene is an essential component of NADPH in phagocytes. Germline CYBB mutations are commonly associated with chronic granulomatous disease. The MSMD-causing mutation in CYBB selectively affects the respiratory burst in macrophages. This experiment of nature indicates that the pathway in human macrophages is crucial for protective immunity to mycobacteria

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Griseri, Thibault. "Rôle immunorégulateur des lymphocytes TNK dans le diabète de type 1 et les infections virales." Paris 5, 2006. http://www.theses.fr/2006PA05N24S.

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Abstract:

Les lymphocytes TNK sont des lymphocytes T non conventionnels. Ils expriment un TCR avec une chaîne α invariante Vα14 et des marqueurs associés aux cellules NK. Ils reconnaissent la molécule de classe I non-classique CD1d qui présente des glycolipides endogènes et exogènes. Fonctionnellement, ils sont capables de sécréter rapidement de grandes quantités de cytokines comme l’IL-4 et l’IFNγ et possèdent des capacités immunostimulatrices et immunosuppressives. Les lymphocytes TNK sont impliqués dans les réponses anti-infectieuses et anti-tumorales. Ils jouent également un rôle protecteur dans plusieurs maladies autoimmunes. Le diabète de type 1 est une maladie autoimmune qui est associée à la destruction des cellules pancréatiques productrices d’insuline par des lymphocytes T autoréactifs. Plusieurs travaux ont rapporté un effet protecteur des lymphocytes TNK dans le diabète de type 1, dans le cadre de modèles polyclonaux ou d’un modèle monoclonal CD4. Dans la première partie de cette thèse, nous avons étudié l’influence des lymphocytes TNK dans le cadre d’un transfert monoclonal de lymphocytes T CD8 anti-îlots. Les lymphocytes TNK dans ce modèle ne sont pas capables d’inhiber la réaction autoimmune, mais au contraire ils aggravent la maladie en stimulant la réponse destructrice des lymphocytes T CD8 anti-îlots
Invariant natural killer T (iNKT) cells can prevent type 1 diabetes by impairing T cell responses to pancreatic β cells. As iNKT cells can also promote T cell responses to pathogens, and as viruses can trigger autoimmune diabetes, we investigated the effect of iNKT cells on virus-induced diabetes. Mice expressing the lymphochoriomeningitis virus (LCMV) nucleoprotein (NP) in their pancreatic β cells develop diabetes after LCMV infection. Here, we show that although iNKT cells promote systemic anti-LCMV CD8 T cell responses, theyn also completely abolish LCMV-induced diabetes. Locally in the pancreas, iNKT cells induced the production of large amount of antiviral cytokines inhibiting LCMV replication

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Logez, Hélène. "Influence des acides gras polyinsaturés n-3 sur la réponse inflammatoire et la résistance à l'agression pulmonaire à Pseudomonas aeruginosa chez les souris sauvages et mutées pour le gène CFTR." Lille 2, 2008. http://www.theses.fr/2008LIL2S045.

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Abstract:

L'inflammation pulmonaire chronique, quelle soit préexistante à l'infection ou exacerbée lors de surinfections broncho pulmonaires à Pseudomonas aeruginosa, est un des éléments essentiels du pronostic de la mucoviscidose (CF). Lors de travaux précédents nous avons démontré qu'un régime enrichi en acides gras poly-insaturés à longue chaîne de la série oméga 3 (AGPI Lc n-3) administré pendant 5 semaines à des souris C57BL/6 augmentait leur résistance à une infection chronique à P. Aeruginosa. Le but de notre travail est d'expliquer ce bénéfice et d'explorer l'impact de ce régime sur l'induction de la réponse pro et anti-inflammatoire au cours des 16 premières heures de l'infection. Nous avons également vérifié si les AGPI Lc n-3 régime avaient un rôle bénéfique dans la résistance des souris cftr knockout (cftr-/-) soumises à cette agression pulmonaire. La cinétique d'expression de différents marqueurs pro et anti inflammatoires a été étudiée par RT-PCR à œ, 1, 2, 4, 8, 16 h après l'infection. Leur production a été vérifiée par ELISA et western blot. Pour les souris cftr-/-, la réponse inflammatoire n'a été analysée que 24h après l'infection. Les conséquences de la nutrition sur le pronostic dans ces deux modèles ont été évaluées à partir du taux de suivie et de la mesure des lésions pulmonaires. Les AGPI-Lc n-3 (EPA et DHA) modulent la cinétique de la réponse pro et anti-inflammatoire avec deux composantes principales: une réponse pro-inflammatoire atténuée et retardée pendant les premières heures et une réponse pro- et anti-inflammatoire exacerbée à 8h par rapport à une alimentation standard. Cette modulation est associée à une diminution des lésions pulmonaires et à une accélération de sa résolution et de la clairance bactérienne. Les souris cftr-/- sont plus sensibles à l'infection pulmonaire à P. Aeruginosa que les souris sauvages, mais cette sensibilité concerne surtout les souris femelles. Les bénéfices des AGPI Lc n-3 sont de même plus importants pour les souris femelles. Leur taux de survie est significativement plus élevé et la lésion pulmonaire est plus faible par rapport aux souris cftr-/- recevant le régime standard. L'augmentation de la résistance à l'infection est associée à une augmentation significative de leur poids, à une augmentation de l'afflux des polynucléaires et des macrophages dans le liquide de lavage broncho-alvéolaire et une diminution de la production d'Il-6. Ces modulations inflammatoires améliorent la clairance bactérienne. En conclusion, un régime enrichi en AGPI Lc n-3 améliore le pronostic de l'infection pulmonaire à P. Aeruginosa chez les souris sauvages et cftr-/-. Son impact sur la modulation de l'induction de la réponse pro et anti inflammatoire pourrait être un mécanisme majeur responsable de leurs propriétés anti-inflammatoires. Il représente une piste thérapeutique non agressive administrable sur une longue période pour prévenir et diminuer la réponse inflammatoire pulmonaire dans la mucoviscidose

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Jacobelli, Simon. "Rôle du système immunitaire dans le contrôle des infections par les papillomavirus humains." Paris 5, 2011. http://www.theses.fr/2011PA05T037.

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Abstract:

Le rôle du système immunitaire, en particulier de l’immunité cellulaire T, est particulièrement important dans la défense contre les papillomavirus humains (HPV). L’incidence et la prévalence des pathologies induites par les HPV sont élevées chez les sujets immunodéprimés, qu’elles soient liées à des HPV cutanés ou muqueux, oncogènes ou non oncogènes. Dans ce travail, l’immunité T anti-HPV a été étudiée dans 2 modèles d’infection par HPV : 1. Des phénocopies d’épidermodysplasie verruciforme associées à l’infection par le VIH, à partir des caractéristiques cliniques, virologiques et immunologiques d’une série de patients. Le rôle du nadir de lymphocytes T CD4+, de l’intensité et de la durée du déficit immunitaire T CD4+ sur les lésions cliniques induites par les HPV cutanés du genre bêta mais aussi d’autres HPV muqueux associés a été montré. L’inefficacité du traitement antirétroviral sur les lésions induites par les HPV suggère l’absence de restauration de réponses T anti-HPV efficaces. 2. Des couples dont la femme a une néoplasie intraépithéliale vulvaire classique à HPV16 et dont le partenaire masculin est asymptomatique, suivis longitudinalement pendant 18 mois. Les réponses immunitaires T contre la protéine précoce E2 sont un marqueur de contrôle de la maladie liée à l’HPV, après traitement des lésions chez la femme et spontanément chez l’homme. La protéine E2 étant absente de la particule virale, la présence de réponses T anti-E2 chez les hommes est la preuve indirecte de leur infection avec réplication virale. Ces résultats renforcent l’idée qu’une vaccination prophylactique des hommes pourrait diminuer la diffusion des HPV génitaux dont ils sont le réservoir
T cell immunity is involved in the defense against human papillomaviruses (HPV). Incidence and prevalence of HPV-induced clinical lesions are high in immunocompromised patients and concern oncogenic and/or non oncogenic cutaneous and mucosal HPV. In this work, T-cell immunity against HPV was studied in 2 models of HPV infection: - Epidermodysplasia verruciformis-like eruptions in the setting of HIV infection: clinical, virological et immunologic features were studied in a series of patients. The nadir of CD4+ T lymphocytes, the intensity and the length of T CD4+ deficiency were related on the development of clinical lesions induced by both bêta HPV or alpha HPV. The inefficacy of antiretroviral therapy on HPV-induced clinical lesions suggests that anti-HPV T-cell responses were ineffective. - Couples with women presenting with HPV16-induced classic vulvar intraepithelial neoplasia and their healthy male partners, who were longitudinally followed for 18 months. Anti-E2 protein T-cell responses are a marker of efficient control of HPV infection, either after treatment in women, or spontaneously in men. Since E2 protein is absent from viral particles, the presence of anti-E2 T-cell responses in healthy male partners indirectly proves that they have been infected by replicative HPV16. These results provide a strong argument in favor of prophylactic HPV vaccination of young men to decrease the spread of mucosal HPV diseases

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Chasseigneaux, Stéphanie. "Analyse moléculaire des interactions hôte-prions en systèmes cellulaires." Paris 5, 2006. http://www.theses.fr/2006PA05N20S.

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Abstract:

Des analyses de CGH array menées chez des clones de N2a non infectés, sensibles ou résistants à la souche de prion 22L, ont révélé desmodifications chromosomiques mais aucune altération génomique récurrente associée au phénotype. L’analyse de l’expression de 29 gènes candidats a mis en évidence des profils transcriptionnels particuliers entre clones. L’analyse du transcriptome des cellules N2a5822L par biopuces a mis en évidence l’expression différentielle de gènes contrôlant l’efficacité de la transcription et la dynamique du cytosquelette. La mesure de l’expression de 38 gènes dans N2a5822L ainsi que dans trois autres clones sensibles et dans un clone résistant a montré une diversité de la réponse transcriptionnelle face à l’infection. L’étude de la PrPSc chez un patient atteint de MCJ et portant la mutation p. V180I a révélé l’absence de l’isoforme bi-glycosylée et serait révélatrice d’une conversion préférentielle des formes mono- et non-glycosylées mutées en formes pathologiques
CGH array analysis of uninfected N2a sublines, susceptible or resistant to 22L prion strain, revealed chromosomal imbalances but did not demonstrate any characteristic profile of genomic alterations linked to phenotype. Likewise, sublines phenotype did not depend on the expression of Prnp nor PrPC. Analysis expression of a set of 29 genes revealed distinct transcriptional profiles in the N2a sublines. Transcriptional analysis of N2a5822L cells using microarrays demonstrated differential expression of genes implicated in transcription efficiency and cytoplasmic dynamics. Expression levels of a set of 38 genes in N2a5822L, in three susceptible sublines and in a resistant subline revealed diversity in transcriptional response to prion infection. Finally, study of PrPSc in a CJD patient harbouring the p. V180I mutation revealed the absence of the diglycosylated isoform supporting the evidence of the conversion of mono- and un-glycosylated mutated forms into the pathogenic mutant PrPSc180I

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Aubron, Cécile. "Diversité métabolique au sein de l'espèce Escherichia coli : implications dans les capacités d'adaptation et la virulence." Paris 5, 2009. http://www.theses.fr/2009PA05T041.

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Abstract:

Nous effectuons une étude de la diversité métabolique de divers isolais de E. Coli afin (i) d'établir un lien entre métabolisme et virulence et, (ii) de mieux comprendre la physiopathologie des infections urinaires (IU). Les activités enzymatiques spécifiques d'enzymes du métabolisme central sont mesurées à la phase exponentielle dans 4 milieux pour 5 souches. Une diversité intra espèce du métabolisme et des capacités d'adaptation est mise en évidence. Elle peut être rattachée au phénotype pathogène ou commensal et à la niche. E. Coli CFT073, uropathogène, favorise le métabolisme de l'acétate et les voies de biosynthèse dans l'urine. L'évaluation de l'homéostasie redox de 8 souches montre que la phase exponentielle, par rapport à la phase stationnaire de la croissance dans l'urine, est associée à un déséquilibre de l'homéostasie redox. Un stress systémique modifie la composition de l'urine, favorisant la croissance de E. Coli qui pourrait participer à la survenue d'IU en réanimation
We carry out a study of the metabolic diversity for some strains of E. Coli, in order to (i) point out a link between metabolism and virulence and, (ii) improve our understanding of urinary tract infections (UTI). The specific activity of some enzymes from the central metabolism was measured for 5 strains yielded in 4 mediums. We highlight a metabolic diversity, which could be linked to strain's habitats or pathovars. The uropathogenic strain, E. Coli CFT073, favours acetate metabolism and neoglucogenesis during growth in urine. The study of redox homeostasis for 8 E. Coli strains shows an unbalance during exponential phase by comparison with stationary phase. A systemic stress, such as a polytraumatism, is responsible for changes in urine composition, which could be a risk factor of UTI occurrence in unwell intensive care patients

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Mogrovejo, Valdivia Alejandra. "Conception et évaluation d'un pansement à libération de deux principes actifs pour le traitement des plaies chroniques." Thesis, Lille 2, 2018. http://www.theses.fr/2018LIL2S046.

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Abstract:

Les plaies chroniques présentent un risque d’infection entrainant un retard de la cicatrisation et des douleurs intenses. Ils restent un problème de santé publique car leur prise en charge génère un coût élevé. Les pansements à base d’argent sont largement utilisés pour traiter les plaies déjà infectées ou présentant un risque infectieux. Néanmoins, les effets toxiques de l’argent envers les fibroblastes et les kératinocytes entraînent une perception limitée de l’efficacité remettant en cause leur bénéfice. Dans ce contexte, le projet de thèse a consisté en la conception d’un pansement à libération de deux principes actifs : un sel d’argent pour traiter l’infection et de l’ibuprofène pour soulager la douleur. Le pansement est enrobé par un système multicouches (PEM) afin de ralentir la diffusion de l’argent vers la plaie et au même temps fournir un environnement humide. Dans un premier temps, un textile en polyester a d’abord été fonctionnalisé soit par le chitosan, soit par la β-cyclodextrine tous les deux réticulés par l’acide citrique afin de former des charges négatives en surface du polyester, pour ensuite charger l’argent dans le textile. Puis le système PEM a été construit par la technique de « dip-coating » en utilisant le chitosan comme polyelectrolyte positif et la poly-cyclodextrine comme polyelectrolyte négatif. Après, un traitement thermique a été réalisé pour stabiliser les assemblages. Le système PEM a présenté une évolution linéaire en terme de gain de masse en fonction du nombre de couches déposées. La quantité d’argent et d’ibuprofène chargé sur les supports a été de 240 μg/cm2 et de 200 μg/cm2, respectivement. D’autre part, le profil de libération de l’argent atteint 3 μg/cm2 à 72 heures tandis que la libération de l’ibuprofène est prolongée jusqu’à 6 heures dans le PBS, sous conditions statiques. Les études biologiques ont montré la cytocompatibilité du pansement vers les cellules épithéliales embryonnaires de poumon humain (lignée L132) et une excellente activité antibactérienne contre les souches S. aureus et E. coli. Finalement, une étude préliminaire a été réalisée in vivo chez la souris C3H/HE présentant une plaie infectée par E. coli. Les pansements testés ont été appliqués sur les plaies et maintenus pendant 3 jours. Seul le pansement ne contenant pas d’argent (contrôle négatif) présentait encore une colonisation par E. coli
Chronic wounds present a risk of infection, delaying the healing process and leading to severe pain. Chronic wounds represent a public health problem that generates high costs. Silver dressings are widely used to treat wounds already infected or with a risk of infection. Nevertheless, the toxic effect of silver toward fibroblasts and keratinocytes generates a perception lack of efficacy and cost effectiveness, and question their effectiveness as well as its safety. The goal of this work was to design a wound dressing releasing two active ingredients: a silver salt to treat the infection and ibuprofen to relieve the pain. The dressing was coated by a layer-by-layer (L-b-L) system to slow down silver diffusion into the wound and at the same time provide a moist environment to the wound. First, a nonwoven polyester textile was functionalized by chitosan or by β-cyclodextrin polymer, both crosslinked with citric acid under curing conditions to form a thermofixed negatively charged layer at the surface textile to then loaded silver onto the textile. Next, a L-b-L system was built on the support by alternating self-deposition of CHT as cationic polyelectrolyte and cyclodextrin polymer as anionic polyelectrolyte. A curing process was applied to stabilize the L-b-L system. L-b-L system showed a linear evolution of the weight gain in relation to number of layers formed. Loaded silver and ibuprofen reached up to 240 μg/cm2 and 200 μg/cm2 respectively. Silver was released up to 3 μg/cm2 after 3 days in PBS under static conditions, and ibuprofen was released up to 6 hours under the same parameters. Biological studies proved the dressing cytocompatibility using human lung normal cell lines (L132). In vitro microbiological evaluation showed greater antibacterial activity of the dressing against S. aureus and E. coli. Finally, a preliminary in vivo study was performed in C3H/HE mice with a wound infected by E. coli. The dressings tested were applied to the wounds and were maintained for 3 days. Only the free silver-dressing (negative control) showed a colonization by E. coli

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Georgel, Anne-France. "Analyse des réponses anti-bactériennes et anti-virales respiratoires induites par les agonistes des récepteurs de l’immunité innée." Thesis, Lille 2, 2018. http://www.theses.fr/2018LIL2S053.

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Abstract:

Les infections virales et bactériennes pulmonaires représentent un problème de santé publique majeur. Les approches thérapeutiques actuelles par antibiotique ont montré leur efficacité mais également leur limite notamment dans des cas de micro-organismes multirésistants ou dans le traitement de patients atteints de pathologies aggravantes. La stimulation de l’immunité innée pourrait représenter une voie thérapeutique complémentaire aux traitements actuels. En effet, l’activation du système immunitaire inné induit la production locale de molécules antimicrobiennes et le recrutement de cellules effectrices qui interviennent dans le contrôle de l’infection.Les « Toll-like receptors » (TLR) sont des senseurs de l’immunité innée. Leur activation entraîne une cascade de signalisation qui module la transcription de gènes de l’immunité comme ceux codant certaines cytokines. TLR5 reconnaît la flagelline, protéine structurale des flagelles bactériens. TLR5 est exprimé à la surface des macrophages, des cellules dendritiques et des cellules épithéliales.Dans la première partie de travail, nous avons évalué la capacité de la flagelline à contrôler la réplication du virus de la grippe A H3N2. Nous avons tout d’abord montré que l’administration intranasale ou systémique de flagelline était capable d’activer des gènes antiviraux au niveau pulmonaire. L’administration de la flagelline conduit à une diminution de la réplication virale chez les souris infectées par le virus de la grippe A H3N2. Cet effet est également observé chez les souris Il22-/- et Ifnar-/- suggérant un mécanisme indépendant de l’interféron de type I et de l’IL-22. Enfin, nous avons également montré que l’association de la flagelline à l’oseltamivir (inhibiteur de neuraminidase) était plus efficace que les traitements administrés séparément.La deuxième partie de ce travail correspond à l’étude clinique ASTRAL qui évalue la capacité des cellules mononucléées sanguines à répondre à différents agonistes de TLR chez des patients atteints de pneumonie franche lobaire aiguë. Cette étude a démarré en octobre 2017 et prévoit d’inclure 38 patients. L’objectif est d’observer la réponse induite par des agonistes de TLR à travers des analyses transcriptionnelles et des dosages de cytokines. Les premiers résultats (analyse chez 7 patients) montrent que les cellules mononucléées sanguines peuvent être activées par des agonistes de TLR dans le contexte de pneumonie
Viral and bacterial infections remain a burden for health care systems. The current therapeutic approaches by antibiotic have shown their effectiveness but also their limit especially in cases of multidrug-resistant microorganisms or in the treatment of patients with aggravating pathologies. Stimulation of innate immunity could be a complementary therapeutic approach to current treatments. Indeed, the activation of the innate immune system induces local production of antimicrobial molecules and the recruitment of effector cells involved in controlling infection.The Toll-like Receptors (TLRs) are innate sensors that trigger signaling cascades and promotes the archetypal pro-inflammatory responses involved in antimicrobial defense. TLR5 recognizes flagellin, the structural protein of bacterial flagella. TLR5 is expressed on the surface of macrophages, dendritic cells and epithelial cells.In the first part of the work, we assessed the ability of flagellin to control the replication of influenza A virus H3N2. We first showed that intranasal or systemic administration of flagellin activated transcription of anti-viral genes in lung tissue. Administration of flagellin reduced viral replication in the lung of mice infected with H3N2 IAV. This effect is also observed in Il22-/- and Ifnar-/- mice suggesting a mechanism independent of type I interferon and interleukin 22 signaling. Finally, we also showed that the combination of flagellin with oseltamivir (neuraminidase inhibitor) was more efficacious than standalone treatments.The second part of this work is the ASTRAL clinical study, which assesses the ability of blood mononuclear cells to respond to different TLR agonists in patients with acute lobar pneumonia. This study started in October 2017 and plans to include 38 patients. The objective is to observe the response after TLR agonist stimulation by transcriptional analysis and cytokine assays. The first results (analysis of 7 patients) show that blood mononuclear cells can be activated by TLR agonists in the context of pneumonia

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Medjahed, Halima. "Développement d'outils génétiques pour étudier la virulence de Mycobacterium abscessus." Paris 7, 2010. http://www.theses.fr/2010PA077077.

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Abstract:

Mycobacîerium abscessus est un pathogène émergent responsable d'infections respiratoires sévères chez les patients atteints de la mucoviscidose. Cette espèce est également responsable d'infections extra-pulmonaires, notamment en cas de transplantation, et se caractérise par une faible susceptibilité aux antibiotiques. Le génome de cette mycobactérie a été séquence et des puces à ADN ont été développées. Des études effectuées sur des variants naturels lisses et rugueux montrent que les isolats rugueux sont hypervirulents. Ces isolats ne produisent pas de glycopeptidolipides (GPL), un métabolite lipidique de surface. On peut donc se demander si l'absence de ce lipide est responsable de cette hypervirulence. La première partie de ma thèse a été de développer des outils génétiques adaptés à M. Abscessus. En utilisant le système dit de « recombineering », nous avons construit une souche mutante caractérisée par sa faible production des GPL (AmmpL4b). Afin de prouver le rôle de ce gène dans un phénotype donné, nous avons aussi adapté un système de complémentation à M. Abscessus en testant des plasmides réplicatifs et intégratifs ayant démontré leur efficacité chez d'autres espèces. Dans ce travail, nous avons montré que la production des GPL engendre des modifications de surface de la cellule comme la mobilité par glissement. La virulence des souches (sauvage, mutante et complémentée) a été évaluée in vitro dans des modèles cellulaires et in vivo dans des modèles murins. Ces tests de virulence montrent que ce n'est pas que l'absence des GPL qui est impliquée dans la virulence de M abscessus. Nous privilégions à l'heure actuelle l'hypothèse qu'un autre facteur intervient directement ou indirectement dans cette virulence. Dans le futur, la caractérisation de la virulence de cet organisme ouvra la voie au développement de nouvelles drogues ou vaccins contre ce pathogène émergent
Mycobacterium abscessus is a rapidly growing mycobacterial species that can be involved in pulmonary and disseminated infections in immunosuppressed or young cystic fibrosis patients. It is an emerging pathogen and has attracted recent attention due to the numerous cases of infection; furthermore, genomic tools have been developed for this species. Nevertheless, the study of this species has until now been limited to spontaneous variants. We have compared three different mutagenesis Systems : the ts-sacB, the phage, and the recombineering Systems, and show that there are important differences in their efficiency for the construction of allelic-exchange mutants. We show, using the mmpL4b gene of the glycopeptidolipid pathway as a target, that allelic-exchange mutants can be constructed with a reasonable efficiency ( 7%) using the recombineering System. Studies on this species were limited so far to natural spontaneous variants. These studies have nevertheless showed that the Rough variants of M abscessus which are characterized by a low production of glycopeptidolipids are hypervirulent in human and also in in vivo models. Interestingly, these highly virulent isolates strongly induce TNF-α secretion by macrophages. However, the mechanism of the higher virulence process is currently unknown. The mutant constructed in this study, which is low glycopeptidolipids producer, is unable to slide and it loss the ability to form biofilms. These confirm the role of glycopeptidolipids in the modification of cell surface. Using in vivo model the virulence of this mutant has been tested. This study shows that other factor is involved with the lack glycopeptidolipids in the virulence of M abscessus. The study of the mechanism of the virulence of M abscessus is a pre-requisite to develop new drugs or vaccine candidates against this emerging pathogen

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Matheux, Franck. "Thérapie génique de l'infection à VIH via l'expression constitutive de l'IFN-β : approche expérimentale dans le modèle du macaque infecté par le SIV." Paris 5, 1999. http://www.theses.fr/1999PA05CD07.

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Abstract:

Les interférons de type I, auxquels appartient l'IFN-ß, sont des molécules antivirales naturelles connues pour inhiber le réplication du VIH. Plusieurs étapes du cycle réplicatif du VIH sont affectées dans les cellules traitées par l'IFN : la pénétration des particules virales, la transcription inverse du génome ARN en ADN, la synthèse des protéines virales, l'encapsidation et le relarguage des virions matures. De plus, les virions relargués par des cellules traitées par les IFN sont 100 à 1000 fois moins infectieux. Toutefois, l'action des IFN semble limitée, notamment vis-à-vis du VIH, du fait d'une induction trop faible de leur expression dans les lymphocytes CD4+ infectés et les monocytes/macrophages, principales cellules cibles du virus. Les techniques de transfert de gènes pourraient palier cette déficience en conférant aux cellules cibles du VIH, par la synthèse constitutive d'IFN-ß, un état antiviral permanent. Cependant, compte tenu des risques liés à la transduction par des vecteurs viraux et des conditions de leur utilisation dans un organisme chroniquement infecté par le VIH et immunocompromis, ce type d'approche nécessite une évaluation préalable dans un modèle animal. Le macaque infecté par un isolat pathogène du SIVmac251 reproduit les événements physiopathologiques observés chez l'homme au cours de l'infection par le VIH et développe en 6 à 36 mois un SIDA en tous points comparable à la maladie humaine. L'objectif général de ce travail a été d'évaluer, à l'aide de ce modèle animal, la capacité d'une synthèse constitutive d'IFN-ß à protéger les lymphocytes périphériques d'une infection par le VIH. Pour cela, nous avons transduit des cellules mononucléées du sang périphérique (CMSP) de macaques sains au moyen d'un vecteur rétroviral dérivé du virus leucémogène murin de Moloney, permettant d'insérer ainsi dans l'ADN de l'hôte le gène de l'IFN-ß de macaque, placé sous le contôle du promoteur murin H2Kb. Ce système conduit à une expression constitutive mais faible du gène thérapeutique dans les cellules transduites. Nos résultats montrent que la transduction de 9 % des cellules suffit pour protéger les CMSP infectées in vitro par le SIVmac251. La réinjection des cellules exprimant de manière constitutive l'IFN-ß, à des macaques sains, ne s'accompagne pas d'effets secondaires majeurs. Cependant, la présence de ces cellules n'a pas pu prévenir d'une infection d'épreuve des macaques par le SIVmac251. En revanche, la charge virale plasmatique de ces animaux, au cours de la primo-infection, semble réduite par comparaison à celle des animaux témoins.

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Gretteau, Paul-Antoine. "Identification d’échanges génétiques modulaires entre des populations d’ARN complets ou tronqués en région 5’non codante d’Entérovirus du groupe B dans des cardiomyocytes humains primaires : impact sur la pathogénèse des cardiomyopathies dilatées inexpliquées chez l’Homme." Thesis, Reims, 2018. http://www.theses.fr/2018REIMM203.

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Abstract:

Les entérovirus du groupe B (EV-B) sont une cause majeure de myocardite aiguë, précurseur de la myocardite chronique et de la cardiomyopathie dilatée (CMD) chez l’homme. Les mécanismes moléculaires viraux impliqués dans la progression de la myocardite aiguë vers la phase chronique et la CMD restent inconnus. En utilisant une approche NGS, nous avons détecté des populations persistantes majoritaires d’EV-B tronquées en extrémité 5’, associées à des formes complètes mineures dans des cas de CMD. Afin évaluer leur impact sur la fonctionnalité des cardiomyocytes, nous avons transfecté dans des cardiomyocytes primaires (HCM) des ARN viraux clonés et identiques à ceux détectés dans les cas de CMD. Les formes EV-B majoritaires tronquées en extrémité 5’, seules ou associées à des populations complètes « auxiliaires » pourraient altérer les fonctions des HCM par des activités de la P2A virale. L'existence de mécanismes de recombinaison génomique entre les populations virales persistantes tronquées et complètes a été étudiée par un test de recombinaison d’ARN EV-B défectifs transfectés dans des HCM. Cette approche in vitro a produit majoritairement des recombinants non-homologues caractérisés par des échanges génétiques dans la région 5’NC (spacer1/2). Nos résultats indiquent l’existence d’événements de recombinaison génomique en région 5’ entre les populations d’EV-B tronquées et complètes qui pourraient contribuer au développement de la CMD. Une meilleure compréhension des mécanismes de persistance virale permettra le développement de nouvelles stratégies thérapeutiques pour lutter contre les infections chroniques par les EV-B
Group-B Enteroviruses (EV-B) are a common cause of human acute myocarditis, a disease that is a precursor of chronic myocarditis and dilated cardiomyopathy (DCM). However, the viral molecular mechanisms involved in the progression of acute to chronic myocarditis and subsequently to DCM remain unknown. Using NGS approach, we detected persistent major EV-B populations characterized by 5’ terminal genomic deletions ranging from 17 to 50 nucleotides associated with minor complete viral forms in explanted hearts of DCM cases. To assess their impact on cardiomyocyte functions, we transfected viral RNA clones mimicking the viral genomes found in patients’ tissues into primary human cardiomyocytes (HCM). Our findings demonstrated that the major persistent 5’ deleted viral forms alone or associated with full-length populations of helper RNAs could impair cardiomyocyte functions by viral 2Apro activities in EV-DCM cases. To assess the existence of genomic recombination mechanisms between persistent deleted and full-length viral helper populations, we used a recombination assay based on the rescue of non-replicative EV-B RNAs transfected in HCM. This in vitro approach produced major (75%) non-homologous recombinants that nucleotides sequencing characterized modular exchanges into the spacers 1 & 2 of the 5’NC region. Our findings indicate the existence of genomic recombination events through which, 5’ deleted and complete collaborative EV-B populations could significantly contribute to the pathogenesis of unexplained DCM cases. A better understanding of these viral persistence mechanisms will stimulate new therapeutic strategies research for chronic infections caused by EV-B

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Verneuil, Laurence. "L' apoptose caspase-dépendante dans les interactions hôte / virus et en immunopathologie." Paris 7, 2007. http://www.theses.fr/2007PA077200.

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Abstract:

L'apoptose est un processus physiologique actif de mort cellulaire impliquant un programme génétiquement contrôlé d'autodestruction de la cellule. Deux voies effectrices de l'apoptose sont décrites, la voie des récepteurs membranaires de mort cellulaire se liant à un ligand et la voie mitochondriale impliquant le relarguage de molécules effectrices pro-apoptotiques. Ces deux voies activent en aval les caspases effectrices de l'apoptose. Un dysfonctionnement des mécanismes régulateurs de l'apoptose peut engendrer des pathologies. Nos travaux ont exploré un rôle possible de l'induction de l'apoptose et les mécanismes moléculaires impliqués, dans l'infection par le cytomégalovirus (CMV) et la GVHD aiguë (maladie du greffon contre l'hôte). Des protéines anti-apoptotiques du CMV humain sont connues, en revanche aucune protéine pro-apoptotique n'a été décrite. Dans un modèle cellulaire, in vitro, nous avons montré que, l'expression du récepteur viral de chimiokines US28, produit d'un gène du CMV, induisait une apoptose caspase dépendante de manière constitutive (indépendante d'un ligand), et indépendante de la voie mitochondriale et de celle des récepteurs de mort. Dans le contexte de la greffe de moelle osseuse, la GVHD correspond à une réponse allogénique par les lymphocytes T d'un donneur contre des cellules cibles épithéliales d'un receveur. Dans un modèle murin de GVHD aiguë, in vivo, nous avons montré une apoptose des cellules endothéliales précédant l'induction de l'apoptose des cellules épithéliales dans la muqueuse orale, dépendante de l'expression de FasL (ligand du récepteur de mort Pas) par les lymphocytes T activés du donneur, sans conditionnement préalable
Apoptosis is an active physiological process involving a genetically regulated cell suicide process. Two effector cytolytic pathways of apoptosis are involved: one is triggered by the engagement of cell-surface death receptors of the Fas/tumor necrosis factor receptor (TNFR) family, and the other is the mitochondrial pathway, which involves released of pro-apoptotic effectors. These two pathways trigger the effector caspases activation. A deregulation of apoptosis control mechanisms can provide some pathologies. We investigate a possible implication of apoptosis induction and the molecular mechanisms involved in the cytomegalovirus infection and in the acute graft versus host disease (GVHD). HCMV (human cytomegalovirus) encodes proteins with antiapoptotic properties but no proapoptotic protein is known. Here we show, in vitro, that the G protein coupled receptor (GPCR), US28 encoded by HCMV, constitutively induced a caspase-dependent apoptosis but independent of the mitochondrial pathway activation and of cellular TNF family death receptor activation. In the context of allogeneic bone marrow grafting, the GVHD corresponds to an allogeneic response of donor effector cells against recipient epithelial target cells. In a murine model of acute GVHD, in vivo, our results shown that endothelial cell death precedes the induction of epithelial cell death in the oral mucosa and that FasL expression by allogeneic actived lymphocytes T is required, in the absence of any conditioning treatment

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Hammoumi, Saliha. "Etude des facteurs susceptibles de favoriser ou de limiter l'infecton des cellules humaines par le virus de l'encéphalomyocardite." Paris 7, 2006. http://www.theses.fr/2006PA077210.

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Abstract:

Dans le but d'évaluer le risque de transmission de l'EMCV de l'animal, en particulier le porc, à l'homme, notamment lors de xénotransplantations, nous nous sommes intéressés aux facteurs susceptibles de favoriser ou de limiter cette transmission par l'étude de l'interaction du virus avec des cellules humaines. Des outils permettant la mise en évidence de la multiplication du virus aux différentes étapes de l'infection ont été développés. Notamment, pour le suivi de la synthèse des protéines, un virus recombinant exprimant l'EGFP a été créé. Celui-ci, était pathogène pour la souris, à l'instar du virus parental. L'EGFP a pu être détectée par autofluorescence in vitro dans les cellules infectées et in vivo sur des empreintes de cerveaux de souris. Le pouvoir infectieux de différentes souches virales sur des lignées et des cellules primaires humaines, reflétant le tropisme du virus chez l'animal, a été analysé. Les résultats montrent que l'infection des cellules dépend du type cellulaire et de la souche virale et que l'adsorption varie essentiellement en fonction des souches. Par comparaison des séquences de capside, des acides aminés jouant un rôle probable dans cette adsorption ont été mis en évidence. L'analyse des partenaires cellulaires impliqués dans l'attachement a permis de montrer que l'adsorption de la souche 1086C est dépendante des acides sialiques et que la lysine 231 de VP1 jouerait un rôle important dans cette liaison. Par ailleurs, l'adsorption de la souche B279/95 est indépendante des acides sialiques mais dépend des héparanes sulfates. Ceci suggère l'utilisation probable de co-récepteurs portant des héparanes sulfates ou des acides sialiques
In order to evaluate the transmission risk of EMCV, from animal, mainly pig, to human, especially during xenotransplantations, we were interested in factors likely to support or limit this transmission by studying the interaction of EMCV with human cells. Tools allowing the detection of the virus multiplication at the various stages of the infection were developed. In particular, for the follow-up of the proteins synthesis, a recombinant EMCV expressing EGFP was created. The recombinant virus was pathogenic for mouse like the parental virus. EGFP could be detected by autofluorescence in vitro in infected cells and in vivo on prints of mouse brains. The infectious power of various viral strains on human cell lines and primary cells, reflecting the tropism of the virus in animal, was analysed. The results indicated that the infection of the cells depends on the cellular type and the viral strain and that adsorption varies primarily according to the strains. By comparison of the sequences of capsid, amino acids playing a probable part in this adsorption were highlighted. The analysis of the cellular partners implied in the attachment made it possible to show that the adsorption of the strain 1086C is dependent on sialic acid and that lysine 231 of VP1 would play an important part in this connection. In addition, the adsorption of the B279/95 strain is independent of sialic acid but depends on heparanes sulfates. This suggests the probable use of co-receptors carrying heparane sulfates or sialic acids

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Rolloy, Caroline. "Altération de la voie du TGF-β par la protéine E6 de papillomavirus humain cutané de type 5." Paris 7, 2011. http://www.theses.fr/2011PA077045.

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Abstract:

Les papillomavirus humains (HPV) sont de petits virus icosaédriques à ADN. Plus de 150 génotypes ont été identifiés et sont pour la plupart responsables de lésions hyperprolifératives bénignes cutanées ou muqueuses. L'infection par certains génotypes considérés à haut risque (HPV-HR) est associée à la transformation maligne comme les cancers anogénitaux (HPV16, 18) dans la population générale ou les carcinomes cutanés (HPV5, 8) dans le contexte d'une génodermatose autosomique récessive l'épidermodysplasie verruciforme (EV). Leur potentiel oncogène repose principalement sur l'activité des oncoprotéines E6 et E7. L'activité transformante des protéines E6 des HPV muqueux à haut risque met enjeu la dégradation du suppresseur de tumeur p53. En revanche, peu de données sont disponibles concernant les propriétés des protéines E6 des HPV cutanés oncogènes. 11 a été montré précédemment dans le laboratoire que l'oncoprotéine E6 de HPV5 (5E6) interagit avec la protéine SMAD3 de la voie de signalisation du TGF-beta. Cette cascade est impliquée dans de nombreux processus cellulaires tels que la prolifération, la différenciation, l'apoptose et est connue pour être dérégulée dans de nombreux cancers. L'objectif de cette thèse était de comprendre les mécanismes d'inhibition de la voie du TGF-beta par la protéine 5E6. Nous avons tout d'abord caractérisé le domaine minimal d'interaction de SMAD3 sur 5E6. Puis des études interactomiques ont mis en évidence le ciblage redondant de la voie du TGF-β par 5E6 en interagissant non seulement avec SMAD3 mais aussi avec deux régulateurs clés de la voie : SnoN et Arkadia. Une méthode de détection de complexe ternaire développée au laboratoire nous a conduit à montrer qu'en plus de la dégradation protéasome-dépendante du complexe SMAD3/SMAD4, 5E6 parvient à recycler la répression transcriptionnelle induite par SnoN au profit du virus. Nos résultats suggèrent que l'inhibition de cette voie, favorisant la prolifération cellulaire des kératinocytes en voie de différenciation, facilite le cycle viral et contribue au potentiel oncogène des HPV cutanés
Human papillomaviruses (HPVs) are non-enveloped DNA viruses of icosahedral symmetry. More than 150 HPVs genotypes have been described so far. Most of them cause benign skin or mucosal hyperproliferative lesions. Infections with certain genotypes of HPVs are associated with malignant transformation such as ano-genital cancer (HPV 16, 18) in the general population or cutaneous carcinoma (HPV 5, 8) in the context of the inherited disorder epidermodysplasia verruciformis (EV). These HPVs are considered as "high-risk" genotypes because of their tight association with cancer. Their oncogenic potential mainly relies on the activity of the two early viral oncoproteins, E6 and E7. The transforming activity of E6 protein of mucosal high-risk HPVs clearly implicates the tumor suppressor p53 degradation. In contrast, little is known on the functional properties of E6 oncoproteins from oncogenic cutaneous HPVs. Previous studies in the laboratory had shown the interaction between oncogenic HPV5 E6 (5E6) and the SMAD3 protein of the TGF-beta signalling pathway. This pathway is involved in many cellular events as control of cellular prolifération, differentiation, apoptosis and is known to be misregulated in numerous cancers. Our goal in this thesis was to dissect TGF-beta pathway rewired by E6 protein from oncogenic HPV 5. Combining deletion mutagenesis and linker scanning approaches we mapped on E6 N-terminal half the SMAD3 interacting area. Then, interactomic studies showed a redundant targeting of the TGF-beta by 5E6 that not only interact with SMAD3 but also with SnoN and Arkadia, two key regulators. To better understand the consequences of these interactions, we developed a ternary complex detection assay that leads us to show that besides proteosomal degradation of SMAD3/4 complexes, 5E6 also recycles SnoN-mediated repression to rewire the TGF-beta signaling pathway for viral benefit. Our results support the hypothesis that inhibition of this pathway, by eliciting cell proliferation in differenciating layers of epidermis, facilitates the viral cycle and accordingly, contributes to the oncogenic potential of E6 proteins from cutaneous HPVs

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Rigaud, Stéphanie. "Identification et caractérisation d'un nouveau syndrome lymphoprolifératif lié à l'X causé par des mutations dans le gènes BIRC4 codant la molécule anti-apoptopique XIAP." Paris 5, 2008. http://www.theses.fr/2008PA05T041.

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L'homéostasie des lymphocytes au cours de la réponse immunitaire est un mécanisme soumis à une régulation très fine. Chez l'homme, des défauts d'homéostasie lymphocytaire conduisent à de nombreuses maladies. Le syndrome de Purtilo ou syndrome lymphoprolifératif lié à l'X (XLP) est une immunodéfïcience primaire rare caractérisée par une sensibilité accrue des patients à l'infection par le virus Epstein-Barr. La majorité des patients souffrent d'une mononucléose infectieuse sévère associée à un syndrome d'hémophagocytose. Le gène responsable de 80% des formes de XLP a été identifié en 1998, il s'agit du gène SH2D1A qui code pour SAP, une protéine adaptatrice de signalisation. Mon travail de thèse a consisté à étudier les formes de XLP sans mutation de SAP. Les résultats obtenus au cours de cette étude ont permis d'identifier le gène BIRC4 codant pour XIAP, et d'analyser et de caractériser les défauts moléculaires, cellulaires et fonctionnels associés à des mutations dans ce gène
The homeostasis of the immune response requires tight regulation of the proliferation and apoptosis of activated lymphocytes. In humans, defects in immune homeostasis result in lymphoproliferation disorders. The X-linked lymphoproliferative syndrome (XLP) is a rare, inherited immunodeficiency that is characterized by lymphohystiocytosis, hypogammaglobulinaemia and lymphomas, and that usually develops in response to infection with Epstein-Barr virus (EBV). Mutations in the signalling lymphocyte activation molecule (SLAM)-associated protein SAP, a signalling adaptor molecule, underlie 80% of cases of familial XLP. During my PhD, we identify mutations in the gene that encodes the X-linked inhibitor-of-apoptosis XIAP (also termed BIRC4) in patients with XLP from three families without mutations in SAP. By identifying an XLP immunodeficiency caused by mutations in XIAP, we show that XIAP is a potent regulator of lymphocyte homeostasis in vivo

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Jean, Baptiste Elixène. "Amélioration des propriétés antibactériennes et anticoagulantes des prothèses vasculaires en polyester par immobilisation et libération contrôlée de principes actifs." Thesis, Lille 2, 2012. http://www.theses.fr/2012LIL2S043/document.

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Abstract:

Les prothèses et les endoprothèses vasculaires, une fois implantées dans le corps humain, sont sujettes à un certain nombre de complications. Les infections, les thromboses précoces et les occlusions tardives sont les plus fréquentes, générant des conséquences cliniques très souvent délétères et parfois létales. Les difficultés de prise en charge de ces complications sont à l’origine des efforts déployés dans la recherche de solutions visant à améliorer les matériaux prothétiques. Aucune avancée clinique majeure n’a jusque-là été notée. Des études réalisées antérieurement dans notre laboratoire ont permis de développer des prothèses vasculaires en polyester dotées d’un revêtement de polymère d’hydroxypropyl-β-cyclodextrine capable d’adsorber puis de libérer de manière prolongée divers antibiotiques. Au cours des présents travaux nous avons déterminé les conditions optimales pour une libération effective de trois antibiotiques à partir de ces prothèses revêtues d’hydroxypropyl-β-cyclodextrine. Nous en avons testé l’efficacité dans des modèles in vitro et in vivo d’infections vasculaires. Nous avons eu recours à neuf souches pathogènes parmi les plus fréquemment rencontrées dans ce contexte en pathologie humaine. Nous avons parallèlement évalué in vivo l’innocuité, la tolérance tissulaire et la biocompatibilité de ces prothèses dans la perspective d’une application clinique. Le système développé s’est avéré efficace en libérant in situ sur une huitaine de jours les molécules antibactériennes sélectionnées. Les concentrations requises des solutions ainsi que le temps nécessaire d’imprégnation des prothèses étaient compatibles avec la pratique chirurgicale. Une activité bactéricide par réduction significative de l’adhésion, de la croissance et de la prolifération bactérienne a été observée comparativement aux témoins dans les différents modèles d’infections testés. Nos résultats démontrent aussi la possibilité d’utiliser ces molécules seules ou en association sans qu’il y ait d’antagonisme. Il deviendra ainsi possible de moduler et d’adapter le traitement antibiotique local, délivré in situ, en ciblant les divers pathogènes rencontrés dans le cadre d’infections mono ou polymicrobiennes. Les prothèses revêtues d’hydroxypropyl-β-cyclodextrine ont démontré in vivo une bonne intégration tissulaire et une excellente tolérance locale sans signe de toxicité systémique. [...]
Synthetic vascular prosthesis likewise vascular endoprosthesis are prone to several complications after implantation into the human body. Infections, thromboses and late occlusions are the most challenging and the most common, leading to serious clinical consequences that are sometimes lethal. Management of those complications is still fraught with tremendous difficulties justifying the economic burden and the continuous efforts in research development for improving vascular prosthetic materials. This research investment is, however, yet to yield any great clinical advance. Previous studies conducted in our research laboratory have led to the development of polyester vascular prostheses coated with a polymer of hydroxypropyl-β-cyclodextrin. This was achieved in order to increase the loading and eluting capacities of these vascular prostheses towards several antibiotics. In the current works, we sought to determine the optimal conditions for effective controlled release of three antibiotics from those prosthetic platforms. We have also evaluated their efficacy in both in vitro and in vivo models of vascular infections. This was carried-out against nine different bacteria strains that are among the most common in human vascular infections. Moreover, we have assessed in vivo their safety, their healing properties, their systemic toxicity and their biocompatibility in the prospect of clinical application.The above-mentioned drug delivery system has been proved to be effective in releasing in situ the selected antibacterial agents over a seven-day desorption period in human plasma. Optimal batch concentration and time for prosthetic immersion into the antibiotic solutions were well compatible with current surgical practice standards. A bactericidal activity evidenced by significant reduction of bacterial adhesion, growth and proliferation was revealed when compared to appropriate controls in the various tested vascular infection models. We have also studied antibacterial molecules alone or in combination. In this latter setting, no antagonistic effects were depicted. This provides a unique opportunity to customize local antibiotic treatment delivered in situ from vascular device fabrics and to adapt it to the evolving ecology of both monomicrobial and polymicrobial vascular prosthetic infection. The polyester vascular prostheses coated with a polymer of hydroxypropyl-β-cyclodextrin were proved in vivo safe and demonstrated excellent biocompatibility, healing properties and tissue integration without any signs of systemic toxicity. [...]

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Vessière, Aurélia. "Caractérisation virologique des doubles infections et des formes recombinantes par les VIH-1 du groupe M et du groupe O au Cameroun : conséquences épidémiologiques, diagnostics et thérapeutiques." Paris 5, 2009. http://www.theses.fr/2009PA05T062.

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Abstract:

Le VIH-1 est divisé en 4 groupes : M (major), O (outlier), N (non-M non-O) et P. Au sein de ces groupes, la recombinaison est un phénomène extrêmement fréquent qui joue un rôle majeur dans la diversification de l’épidémie du VIH. La recombinaison résulte de phénomènes de sauts de matrice entre les 2 molécules d’ARN du virus pendant l’étape de reverse transcription. Ainsi les infections multiples, en générant des virions hétérodiploïdes, sont le pré-requis indispensable à la recombinaison. En Afrique Centrale et au Cameroun en particulier, tous les groupes du VIH-1 circulent et des cas de doubles infections VIH-1 M+O ont été rapportés. Malgré la grande divergence génétique entre les deux groupes, 3 cas de recombinaison M/O ont été mis en évidence chez des patients camerounais sans lien épidémiologique. Pour deux d’entre eux, la recombinaison impliquait le gène vpr, qui pourrait représenter une région privilégiée pour la recombinaison inter-groupe M/O. La capacité de transmission et de circulation de telles formes, qui apparaissent extrêmement rares, n’est pas connue. L’objectif de ce travail était de mettre au point et de valider des outils sérologiques et moléculaires pour la détection des recombinants M/O dans le gène vpr chez les patients doublement infectés par un VIH-1 de groupe M (VIH-M) et de groupe O (VIH-O) au Cameroun. Le dépistage des doubles infections reposait sur une stratégie de sérotypage utilisant deux antigènes gp120/V3 représentatifs des groupes M et O. Pour les échantillons doublement réactifs, un test de compétition (GSEIA) a été mis au point afin d’éliminer les réactivités croisées non spécifiques. La présence des génomes VIH-M et VIH-O a été confirmée à l’aide de PCR spécifiques de groupe ciblant les régions pol et env. Enfin, une PCR spécifique de groupe encadrant le gène vpr a été développée pour la recherche des recombinants. Cet algorithme mis en place au Centre Pasteur du Cameroun nous a permis d’identifier 5 recombinants M/O, avec un point de recombinaison dans vpr pour 4 d’entre eux. Trois recombinants vpr étaient associés à une double infection VIH-M+O ou à une infection par un VIH-M. Des recombinants M/O ont été détectés sans double infection associée, dont un chez une patiente Camerounaise vivant en France, suggérant des cas de recombinants transmis. Ce travail souligne la complexité du dépistage des formes recombinantes M/O qui nécessite la combinaison d’outils sérologiques et moléculaires ciblant différentes régions du génome, notamment dans le cas des recombinants transmis. Les résultats confirment l’importance du gène vpr dans les phénomènes de recombinaison M/O. La grande variabilité génétique des souches du groupe O pourrait avoir des conséquences en termes de prise en charge thérapeutique des patients infectés par un recombinant M/O. Enfin, le risque d’émergence de formes recombinantes circulantes M/O doit être évalué à travers une surveillance épidémiologique au Cameroun mais également dans les pays ayant un lien avec cette région
HIV-1 is divided into 4 groups: M (major), O (outlier), N (non-M non-O) and P. Among these groups, recombination is an extremely frequent phenomenon, playing a major role in the diversification of the HIV epidemic. Recombination results from strand switching between the two viral RNA molecules during the reverse transcription step. Thus, multiple infections, by generating heterodiploïd virions, are the prerequisite to recombination. In Central Africa and in Cameroon in particular, all HIV-1 groups circulate and M+O dual infections have been reported. Despite the great genetic divergence between the two groups, three cases of M/O recombinants were described in Cameroonian patients with no epidemiological link. For two of them, recombination involved the vpr gene that could represent a preferential site for M/O intergroup recombination. The transmission and circulation capacities of such forms, that appear to be extremely rare, are unknown. The objective of this work was to develop and validate serological and molecular tools for the detection of M/O recombinants in the vpr gene in patients dually infected by HIV-1 group M (HIV-M) and HIV-1 group O (HIV-O) in Cameroon. Dual infections were screened using a serotyping strategy bases on two gp120/V3 antigens representative of groups M and O. For dually reactive samples, a competitive assay (GSEIA) was developed to eliminate non specific cross-reactivities. Presence of HIV-M and O genomes was confirmed with group specific PCRs targeting the pol and env regions. Finally, a group specific PCR flanking the vpr gene was developed to detect recombinants. This algorithm implemented at Centre Pasteur du Cameroun allowed us to identify 5 M/O recombinants, with a vpr breakpoint for 4 of them. Three vpr recombinants were associated with a HIV-M+O dual infection or a HIV-M infection. Some M/O recombinants were detected in the absence of associated dual infections, of which one in a Cameroonian patient living in France, suggesting transmitted cases. This work underlines the complexity of the detection of M/O recombinants that requires the combination of serological and molecular tools targeting different regions of the genome, in particular for transmitted recombinants. Our results confirm the importance of the vpr gene in M/O recombination phenomena. The great genetic variability of HIV-O strains could have consequences on therapeutic management of patients infected with a M/O recombinant. The risk for emergence of M/O circulating recombinant forms has to be evaluated through an epidemiological surveillance in Cameroon but also in countries having a link with this region

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Andréoletti, Olivier. "Pathogenèse de la tremblante des ovins : effet du génotype PRP sur la dissémination tissulaire de la PrPsc, la contamination placentaire et les modalités de transmission périnatale." Paris 11, 2006. http://www.theses.fr/2006PA114846.

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Abstract:

Dans ce travail, nous avons développé et validé des techniques immunoistochimiques de détection de la PrPsc et d'antigènes cellulaires permaettant une cyto-localisation précise de la protéine rpion anormale chez les ovins. Ces outils et un modèle naturel ovin d'infection ont été utilisés afin d'établir le schéma de dissémination de la PrPsc dans l'organisme et les relais cellulaires mis en jeu, entre la contamination initiale et le déclenchement des signes cliniques. L'effet du polymorphisme monoallélique A136/V136 sur la pathogénie de la maladie naturelle a été établi. Nous avons également étudié le phénomène de contamination périnatale des ovins afin de confirmer ou d'infirmer la possibilité d'une contamination verticale, et de préciser le rôle du placenta dans la dissémination de l'agent infectieux. Parallèlement nous nous sommes intéressés, dans différents modèles murins et naturels d'ESTs, aux relations entre la neuro-invasion et la suvenue d'un stress oxydatif cérébral.

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Micol, Romain. "Infections à Cryptococcus neoformans, à cytomégalovirus, au virus de l'hépatite B au sein d'une cohorte (2004-2007) de sujets cambodgiens infectés par le VIH : prévalence, morbidité et mortalité." Paris 5, 2010. http://www.theses.fr/2010PA05T018.

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Abstract:

Afin de démontrer l’utilité du diagnostic précoce de la cryptococcose, des diagnostics de l’infection par le cytomégalovirus (CMV), et de l’infection par le virus de l’hépatite B (VHB) au cours de l’infection par le VIH au Cambodge, une cohorte de 441 patients cambodgiens infectés par le VIH a été mise en place en 2004 et suivie jusqu’en 2007 à Phnom Penh, au sein des programmes d’accès aux antirétroviraux de Médecins Sans Frontières et de Médecins Du Monde. Les prévalences, morbidité et mortalité ont été estimées. Nous avons retrouvé une prévalence élevée (59/327 ; 18,0% ; IC95%=13,9%-22,2%) de la cryptococcose chez les patients avec moins de 200 lymphocytes T CD4+/mm3, et démontré l’intérêt clinique de la détection systématique de l’antigénémie cryptococcique permettant un traitement précoce de l’infection (28,8% des cas de cryptococcose ayant été diagnostiqués grâce à la détection systématique de l’antigénémie cryptococcique). Une étude coût efficacité (coûts en 2009)comparant deux stratégies interventionnelles de prévention de la cryptococcose chez les patients avec moins de 100 CD4+/mm3 a montré que la détection de l’antigénémie cryptococcique avec traitement des cas positifs présentait un meilleur ratio coût efficacité (180 Dollar par année de vie gagnée) que la prophylaxie primaire par le fluconazole (comparée à l’absence d’intervention). De plus la prophylaxie présentait un ratio coût efficacité raisonnable (511 Dollar par année de vie gagnée) comparée à la détection de l’antigénémie. Les proportions de patients vivants à un an étaient de 71,9% et 70,0% respectivement comparées à 60,7% en l’absence d’intervention. L’infection par le CMV (infection opportuniste négligée dans les pays pauvres du fait de la quasi absence de diagnostic et de traitement) a été très fréquemment retrouvée (par PCR temps réel) chez les patients avec moins de 50 lymphocytes T CD4+/mm3 (133/224 ; 59,4% ; IC95%=52,9%-65,8%) et indépendamment associée à une augmentation de la mortalité (risque de décès le plus élevé pour une PCR CMV ≥4,2 log10 copies/ml=3,6 ; IC95%=2,0-6,8). Pour rechercher une base physiopathologique à ces résultats, nous avons étudié la réplication du HHV-6 par PCR quantitative et la détection de la protéine cmvIL-10 par un ELISA quantitatif pour les infections à C. Neoformans (absence d’association entre réplication à HHV-6 et infection cryptococcique) et à CMV (corrélation négative entre la quantité de cmvIL-10 et le nombre de CD4+/mm3) respectivement. Enfin nous avons estimé la proportion de patients présentant une hépatite chronique active B (45/319 ; 14,1% ; IC95%=10,3%-17,9%) puis modélisé l’émergence de souches résistantes à la lamivudine dans la population infectée par le VIH (7,8% chez les adultes co-infectés) et en population générale
In order to demonstrate the practical value of early diagnosis of cryptococcosis, cytomegalovirus (CMV) infection, and hepatitis B virus (HBV) infection during HIV infection in Cambodia, a cohort of 441 Cambodian HIV-infected patients was recruited in 2004 and followed until 2007 in Phnom Penh, in the context of Médecins Sans Frontières and Médecins du Monde antiretroviral drug access programmes. Prevalences, morbidity and mortality were estimated. A high prevalence (59/327; 18. 0%; 95%CI = 13. 9%-22. 2%) of cryptococcosis was observed in patients with a CD4+ T lymphocyte count less than 200/mm3, and the clinical value of systematic screening for cryptococcal antigenemia was demonstrated, as it allows early treatment of infection (28. 8% of cases of cryptococcosis were diagnosed as a result of systematic screening for cryptococcal antigenemia). A cost-effectiveness study (costs in 2009) comparing two cryptococcosis intervention strategies in patients with CD4+ count < 100/mm3 showed that screening for cryptococcal antigenemia and treatment of positive patients presented a better cost-effectiveness ratio (Dollar 180/life year gained) than primary prophylaxis with fluconazole (compared to the absence of intervention). Furthermore, primary prophylaxis presented a reasonable cost effectiveness ratio (Dollar 511/life year gained) compared to the screening. The proportion of patients alive at one year was 71. 9% and 70. 0%, respectively, compared to 60. 7% in the absence of intervention. CMV infection (an opportunistic infection often neglected in poor countries due to the almost complete absence of diagnosis and treatment) was very frequently detected (by real-time PCR) in patients with CD4+ count < 50/mm3 (133/224; 59. 4%; 95%CI = 52. 9%-65. 8%) and was independently associated with excess mortality (highest risk of death for CMV PCR ≥ 4. 2 log10 copies/ml = 3. 6; 95%CI = 2. 0-6. 8). To investigate a pathophysiological basis for these results, HHV-6 replication was studied by quantitative PCR and protein cmvIL-10 screening was performed by quantitative ELISA for C. Neoformans (no association between HHV-6 and cryptococcal infections) and CMV infections (negative correlation between cmvIL-10 level and CD4+ count), respectively. Finally, the proportion of patients presenting active chronic hepatitis B was estimated (45/319; 14. 1%; 95%CI = 10. 3%-17. 9%) and the emergence of lamivudineresistant strains was modelled in the HIV-infected population (7. 8% in co-infected patients) and in the general population

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Vaca, Flores Claudia Cecilia. "Substituts osseux hybrides (polymère / bio céramiques) à libération prolongée d'antibiotiques pour le traitement des infections osseuses." Thesis, Lille 2, 2015. http://www.theses.fr/2015LIL2S072.

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Abstract:

A ce jour l’os est le tissu le plus greffé au monde et les défets osseux suite à une ostéoporose, cancer et fractures restent problématiques avec un risque d’infections élevé. L’administration d’antibiotiques par voie systémique n'est pas satisfaisante car leur diffusion dans l'os est très faible, une administration locale est donc nécessaire. La stratégie de cette thèse est de développer deux substituts hybrides (hydroxyapatite/hydrogel), l'un massif, l'autre injectable, pour l'administration d'une association d'antibiotiques (ciprofloxacine/gentamicine). Un double système à libération sera ainsi développé pour traiter au long terme l'infection, l'un permettra une libération rapide (via la diffusion dans l'hydrogel), l'autre permettra une diffusion lente (via des microparticules). La première partie a permis de développer des microparticules de PLGA chargées de gentamicine (GM) par la technique de double émulsion par évaporation du solvant. La méthode de préparation des microparticules a été optimisée pour obtenir des microparticules de 50 à 80 µm, compatible avec la macroporosité de l'hydroxyapatite (HA) et une libération prolongée pendant 25-30 jours. Ainsi le temps de sonification de la première émulsion a été fixé à 2 minutes pour obtenir une efficacité d'encapsulation maximale et la vitesse de rotation de la seconde émulsion fixée à 700 rpm pour obtenir des microparticules d'environ 60 µm. Les microparticules ont été analysées par DSC, ATG et MEB. L'activité antibactérienne des microparticules chargées de GM a été démontrée sur le S. aureus (CIP224).La seconde partie a permis de développer un scaffold où l'hydrogel de chitosan (CHT) se formera in situ dans la macroporosité d'une pièce tridmensionnelle en HA. Cet hydrogel a été obtenu par voie chimique avec un agent réticulant (genipine) pour permettre une injection et une gélification relativement lente. Le suivi de la formation de l'hydrogel de CHT (2%-wt) par spectrophotométrie et rhéologie a permis d'optimiser le temps (24 heures) et la température (40°C) de gélification ainsi que la concentration de génipine (0.05%-wt). L'étude de la cinétique de libération de la ciprofloxacine (CFX) incorporée dans l'hydrogel lors de la formulation (0.1; 0.5 et 1%) a montré une libération rapide (<5 heures) en flux dynamique (30 ml/min). L'ajout de cyclodextrine(CD) dans la formulation pour ralentir la diffusion de la CFX n'a pas montré d'amélioration, elle est même responsable d'un ralentissement de la gélification par inclusion de la génipine dans la CD. Finalement l'hydrogel a été incorporé dans la macroporosité de l'HA avant la gélification; les études biologiques ont montré sa cytocompatibilité et une activité antibactérienne de 24 heures sur E. coli.La dernière partie a permis de développer un hydrogel injectable où les particules d'HA (90 µm) ont été incorporées dans l'hydrogel pendant la préparation. Cet hydrogel est obtenu par voie physique avec le polymère de cyclodextrine (PCD) pour une gélification rapide (<10 sec.) évitant la sédimentation de l'HA. Une étude plus approfondie a permis de montrer qu'une proportion d’au moins de 3% de CHT et d’au moins 3% de PCD était nécessaire pour la formation de l'hydrogel. Les études du gonflement et des propriétés rhéologiques ont montré l’impact du ratio PCD/CHT, de la forme soluble et insoluble du PCD et l'ajout d'HA sur la formation de l'hydrogel. Après lyophilisation, l'éponge a été hydratée dans une solution de CFX (2 mg/ml); les études biologiques n'ont pas montré de cytotoxicité et l'évaluation microbiologique a montré une activité prolongée (72 heures) sur E. coli [...]
Bone is the most transplanted tissue in the world and bone defects after osteoporosis, cancer and fractures remain problematic with a high level of infections. Systemic drug delivery is not efficient due to a low migration of drug into the bone, a local administration is necessary. The strategy of this thesis is to develop two hybrid substitutes (hydroxyapatite / hydrogel), the first one could be injectable and the other one could be directly implanted for the release of a combination of antibiotics (ciprofloxacin / gentamicin). A dual release system will be developed to treat long term infection with a rapid release (via diffusion into the hydrogel) and a slow release (via microparticles).In the first part, gentamicin (GM)-loaded PLGA microparticles were prepared by double emulsion with evaporation of the solvent. The microparticle preparation method has been optimized to obtain a size of microparticles compatible with the macroporosity of the hydroxyapatite (HA) and a sustained release over 25-30 days. Thus, the time of sonification of the first emulsion was set at 2 minutes in order to obtain a maximal efficacy of encapsulation. The speed of rotation of the second emulsion was fixed at 700 rpm to obtain a 60µm-diameter size of microparticles. The microparticles were analyzed by DSC, TGA and SEM. The antibacterial activity of gentamicin loaded microparticles was demonstrated on S. aureus (CIP224).In the second part we developed a bone substitute where chitosan (CHT) hydrogel was formed in situ in the macroporosity of a tridimensional hydroxyapatite printed piece. This hydrogel was obtained chemically with a crosslinking agent (genipin) to allow injection and a relatively slow gelation. The formation of the CHT hydrogel (2%-wt) was analyzed by UV-Vis spectrophotometry and rheology to optimize the time (24 hours), the temperature (40°C) and the concentration of genipin (0.05%-wt). The study of the release kinetics of ciprofloxacin (CFX) incorporated into the hydrogel (0.1; 0.5 and 1%) showed rapid release (<5 hours) in dynamic system (30 ml/min). The addition of cyclodextrin (CD) in the formulation did not shown a prolonged release of CFX, itself responsible to an increase of the gelation time due to an inclusion of genipin in the CD. Finally the hydrogel was incorporated in the macroporosity of HA before the gelation. Biological evaluation showed its cytocompatibility and antibacterial activity up to 24 hours on E. coli._x000D_In the last part, we developed an injectable bone substitute where HA particles (90 microns) were incorporated into the hydrogel during the preparation. This hydrogel was obtained by a physical way with an anionic polymer of cyclodextrin (PCD) for a fast gelation time (<10 seconds) avoiding sedimentation of the HA. Further study showed that a proportion of at least 3% of CHT and at least 3% of PCD was required for the formation of the hydrogel. Swelling and rheological properties showed the impact of the ratio PCD / CHT, the soluble and insoluble form of the PCD and the addition of HA on the formation of the hydrogel. After lyophilization, the sponge was hydrated in a solution of CFX (2 mg/ml). Biological studies did not shown cytotoxicity and microbiological evaluation showed a prolonged antibacterial activity up to 72 hours on E. coli.In conclusion, this thesis allowed the development of two hybrid bone substitutes for rapid release of CFX (<72 hours) and slow release of gentamicin-loaded microparticles (25-30 days). The incorporation of gentamicin loaded microparticles was possible in both bone substitutes allowing an antibacterial activity until 3 days against S. aureus and E. coli

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Alard, Jeanne. "Sélection in vitro et in vivo de souches probiotiques ayant des propriétés bénéfiques contre l’inflammation, les infections et l’obésité." Thesis, Lille 2, 2017. http://www.theses.fr/2017LIL2S014.

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Abstract:

Des études récentes ont montré que le microbiote participe à l’homéostasie intestinale en contribuant au développement morphologique, à l’éducation du système immunitaire, aux mécanismes de défense de l’hôte et à la régulation du métabolisme. Une dysbiose de ce microbiote ainsi qu’une réduction de la diversité bactérienne a été observé dans diverses pathologies chroniques telles que les maladies inflammatoires chroniques (MICI) et l’obésité. Le microbiote constitue donc une cible thérapeutique de choix dans la prise en charge de ces maladies chroniques. Les probiotiques, microorganismes bénéfiques pour l’hôte représentent une alternative intéressante, mais dont les critères de sélection nécessitent d’être améliorés.Dans une première étude, nous avons pu mettre en évidence les propriétés bénéfiques d’un mélange de deux probiotiques comprenant un bifide et un lactobacille dans un modèle murin d’obésité résultant d’une alimentation riche en graisses (Alard et al, 2016). Ce mélange probiotique a réduit significativement la prise de poids, amélioré les paramètres inflammatoires et métaboliques dont l’insulino-résistance, et augmenté l’expression intestinale des récepteurs aux acides gras à chaine courte (AGCC). Il a également favorisé dans un système d’intestin artificiel la production de butyrate et propionate ; principaux AGCCs. Les effets protecteurs ont été associés à l’amélioration de la dysbiose du microbiote, notamment la restauration de l’abondance d’Akkermansia muciniphila.L’objectif principal de cette thèse a été ensuite de sélectionner au sein d’une collection de 23 souches bactériennes provenant de la société PiLèJe, une ou plusieurs souche(s) probiotique(s) possédant des propriétés protectrices contre les MICI et l’obésité. Les propriétés immuno-modulatrices des souches ainsi que leur capacité à renforcer la barrière intestinale ont été étudiées in vitro à l’aide cellules mononuclées sanguines humaines, puis dans un modèle in vitro de perméabilité membranaire, induite par la sensibilisation d’une monocouche de cellules Caco-2 par de l’eau oxygénée. Six souches ont été sélectionnées, cinq souches induisant de forts niveaux de la cytokine anti-inflammatoire IL-10 et capables de restaurer la barrière intestinale et une souche capable de renforcer fortement cette barrière. Ces souches ont été ensuite évaluées en modèles in vivo de colite chronique et aigüe induite par du TNBS (2,4,6 trinitrobenzene sulfonic acid). De façon intéressante les souches protégeant en colite aigüe ne protègent pas aussi efficacement en colite chronique et inversement.Nous avons poursuivi la sélection de souches ou mélanges de souches dans le contexte de l’obésité et des maladies métaboliques associées. Nous avons utilisé les mêmes critères que précédemment (capacités anti-inflammatoires et à restaurer la barrière intestinale) complétés par l’étude de la capacité des souches à limiter l’accumulation des lipides dans un modèle in vitro de différenciation adipocytaire basé sur l’utilisation de la lignée 3T3-L1 et à induire la sécrétion de peptides entéro-endocrines impliqués notamment dans la satiété par l’utilisation de la lignée murine de cellules entéro-endocrine STC-1. Trois mélanges de souches et une souche seule ont été sélectionnées et évaluées dans un modèle murin d’obésité induite par un régime hyperlipidique à 45% de gras. Nous avons pu mettre en évidence des capacités positives d’un mélange de deux souches et d’une souche seule à réduire la prise de poids, ainsi que l’inflammation dans le tissu adipeux.Ces résultats indiquent que des criblages in vitro basés sur l’étude des propriétés immunomodulatrices, des capacités à restaurer la barrière, à diminuer l’accumulation des lipides et à induire des peptides de satiété, permettent une pré-sélection de souches ou mélanges de souches ayant un effet protecteur et démontrent à nouveau que les capacités bénéfiques des probiotiques sont souche-dépendantes et spécifiques des modèles ciblés
Recent studies have reported that the microbiota is involved in intestinal homeostasis by contributing to the morphological development, the education of the immune system, the mechanisms of defense, and to metabolic regulation. Dysbiosis of this microbiota as well as reduction in bacterial diversity has been observed in various chronic pathologies such as chronic inflammatory diseases (IBD) and obesity. The microbiota thus constitutes a therapeutic target of choice in the management of these chronic diseases. Probiotics, which are beneficial microorganisms for the host represent therefore an interesting alternative, however their selection criteria need to be improved.In a first study, we were able to highlight the beneficial properties of a mixture of two probiotics comprising a bifidobacteria and a lactobacilli, in a murine model of high fat diet (HFD)-induced obesity (Alard et al., 2016). This probiotic mixture significantly reduced weight gain, improved inflammatory and metabolic parameters including insulin resistance, and increased intestinal expression of receptors involved in short-chain fatty acid (AGCC) recognition. It also promoted in an artificial intestinal system the production of butyrate and propionate, the two main AGCCs. The protective effects were associated with the improvement of microbiota dysbiosis, in particular the restoration of the abundance of Akkermansia muciniphila.The main objective of this thesis was then to select within a collection of 23 bacterial strains provided by PiLèJe, one or more probiotic strain (s) possessing protective properties against IBD and obesity. Immunomodulatory properties of the strains and their ability to strengthen the intestinal barrier were studied in vitro using human mononuclear blood cells and an in vitro model of epithelial permeability induced by the sensitization of a Caco-2 cells monolayer with hydrogen peroxide. Six strains were selected, five strains inducing high levels of the anti-inflammatory cytokine IL-10 and capable of restoring the intestinal barrier and a strain capable of strongly reinforcing this barrier. These strains were then evaluated in in vivo models of TNBS (2,4,6 trinitrobenzene sulfonic acid)-induced chronic and acute colitis. Interestingly, strains able to rescue mice from acute colitis did not protect as efficiently in chronic colitis and vice versa.The selection of strains or mixtures was then pursued in the context of obesity and associated metabolic diseases. We used the same criteria as previously (anti-inflammatory capacities and to restore the intestinal barrier) in addition with the capacity of the strains to limit the accumulation of lipids in an in vitro model of adipocyte differentiation based on the use of the 3T3-L1 cell line and to induce the secretion of entero-endocrine peptides, notably involved in satiety, by the use of the murine STC-1 entero-endocrine cell line. Three mixtures and one single strain were selected and evaluated in a mouse model of obesity induced by 45% HFD diet. We demonstrated the positive capacities of a mixture composed of two strains and the single strain to reduce weight gain, as well as adipose tissue inflammation.These results indicate that in vitro screenings based on the immunomodulatory properties, the capacity to restore the gut barrier, to decrease lipid accumulation and to induce gut peptides allow pre-selection of strains or mixtures exhibiting protective effects and demonstrate that the beneficial capacities of probiotics are strain-dependent and specific to the targeted models

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Dussaix, Élisabeth. "Interféron-alpha et infections virales du système nerveux central." Paris 11, 1993. http://www.theses.fr/1993PA114837.

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Abou, Kais Rabih. "Nouvelles stratégies diagnostiques et thérapeutiques des pathologies vasculaires intracrâniennes." Thesis, Lille 2, 2019. http://www.theses.fr/2019LIL2S034.

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Abstract:

La prise en charge des pathologies vasculaires intracrâniennes reste complexe et nécessite une équipe multidisciplinaire spécialisée. Les nouvelles approches diagnostiques en biologie, imagerie et neurosonologie ainsi que l’amélioration des techniques thérapeutiques microchirurgicales et neuroradiologiques interventionnelles et l’organisation d’une surveillance adaptée permettent d’optimiser le devenir des patients.La première étude a concerné l’apport de l’anastomose temporo-sylvienne chez les patients adultes atteints d’un syndrome de Moya-Moya. Les résultats ont montré une amélioration de la perfusion cérébrale et l’intérêt d’une évaluation par Doppler trans-crânien, scintigraphie et IRM pré et postopératoire. Une meilleure sélection du greffon dans le but de réaliser l’anastomose pourrait certainement améliorer les résultats à long terme.Nous nous sommes ensuite intéressés aux pontages carotido-sylviens à haut débit dans le traitement des anévrysmes intracrâniens géants ou complexes dans le cadre d’une coopération entre les CHU d’Anvers et de Lille. Notre étude a montré les possibilités d’exclusion chirurgicale de ce type d’anévrysme le plus souvent inaccessible au traitement endovasculaire et le rôle protecteur de l’anastomose temporo-sylvienne contre l’ischémie cérébrale. Le choix du greffon semble être un paramètre important pour adapter le débit sanguin de suppléance et restaurer les conditions physiologiques optimales.Enfin, nous avons déterminé le rôle de l’infection bactérienne dans la physiopathologie du développement et de la rupture des anévrismes intracrâniens. Contrairement à l’étude finlandaise, nous n’avons pas détecté de présence bactérienne dans la paroi des anévrismes intracrâniens dans une cohorte de patients opérés dans notre institution. Ces résultats pourraient expliquer l’incidence plus élevée de rupture anévrismale dans la population finlandaise.Nos travaux montrent l’importance du développement de nouvelles stratégies multidisciplinaires diagnostiques et thérapeutiques permettant d’optimiser la prise en charge des patients présentant une malformation vasculaire intracrânienne. Le but est de mieux comprendre la physiopathologie et de mieux choisir l’indication thérapeutique neurovasculaire pour offrir au patient une efficacité thérapeutique optimale pour un niveau de risque procédural minimal
The management of intracranial vascular diseases remains complex and requires a specialized multidisciplinary team. The new diagnostic approaches in biology, imaging and neuro-sonology as well as the improvement of interventional microsurgical and neuroradiological therapeutic techniques and the organization of an adapted monitoring make it possible to optimize the outcome of the patients.The first study demonstrated the benefit of superficial temporal artery-middle cerebral artery anastomosis in adult patients with Moya-Moya syndrome. The results showed an improvement in cerebral perfusion and highlighted the benefit of pre and post-operative evaluation using transcranial Doppler, scintigraphy and MRI. Moreover, a better selection of the graft for performing the anastomosis could certainly improve the long-term results.We then studied the high flow carotido-sylvian bypass in the treatment of giant or complex intracranial aneurysms in collaboration between the Antwerp and Lille university hospitals. Our study reported the potential surgical exclusion of this type of aneurysm, which is often inaccessible to endovascular treatment, and the protective role of superficial temporal artery-middle cerebral artery anastomosis against cerebral ischemia. The choice of the graft appears to be an important parameter to adapt the flow and restore optimal physiological conditions.Finally, we determined the role of bacterial infection in the pathophysiology of development and rupture of intracranial aneurysms. In contrast to the Finnish study, we did not detect bacterial presence in the wall of intracranial aneurysms in a cohort of patients operated in our institution. These findings may explain the higher incidence of aneurysmal rupture in the Finnish population.Our works demonstrates that the development of multidisciplinary diagnostic and therapeutic strategies improves the management of patients with intracranial vascular malformation. The goal is to better understand the physiopathology and to better choose the neurovascular therapeutic indication to offer the patient an optimal therapeutic efficacy with a minimum level of procedural risk

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Martin-Latil, Sandra. "Interaction des rotavirus avec les cellules intestinales : conséquences fonctionnelles." Paris 11, 2004. http://www.theses.fr/2004PA114834.

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Abstract:

Les rotavirus sont l'agent étiologique majeur des gastroentérites infantiles. La première partie porte sur les mécanismes d'entrée des rotavirus. Nous proposons qu'il s'agit d'un système itératif impliquant un fort couplage entre la diminution de la [Ca2+] intraendosomale, la décapsidation du virion et la perméabilisation de la membrane endosomale qui permet la libération des DLP transcriptionnellement actives dans le cytoplasme. La deuxième partie porte sur les mécanismes à l'origine de la diarrhée osmotique. Nous montrons qu'une voie de signalisation AMPc-PKA-dépendante est activée lors de l'infection des cellules Caco-2 par le rotavirus et qu'elle induit l'altération de l'adressage de la saccharase-isomaltase et de la désorganisation des cytokératines. Nous montrons également que le rotavirus altère l'activité de la lactase et de SGLT1 sans diminution de leur expression apicale. Leur altération est probablement due à la fixation d'une protéine virale ou de la particule virale
Rotaviruses are the leading cause of infantile viral gastroenteritis worldwide. In the first part, we studied the mechanisms of rotavirus entry. We propose that, after infectious rotavirus enters into endosomal vesicles, the progressive decrease of endosomal [Ca2+] favors progressive virion decapsidation and subsequent permeabilization of endosomal membrane. This three-step process would be reiterated until the transcriptionnally active DLP is delivered into the cytoplasm. In the second part, we studied the pathophysiologic mechanisms accounting for osmotic diarrhoea. We show that a cAMP-dependent PKA mechanism impairs sucrase-isomaltase targeting and cytokeratins organisation in Caco-2 cells infected by rotavirus. We also show that rotavirus induces a decrease in activity of brush border-associated lactase and cotransporter SGLT1 in Caco-2 cells. Their alteration, which is not due to a decrease in apical expression, could involve the binding of viral proteins or viral particle

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Franrenet, Sandra. "L' information dans les recherches sur la personne doit-elle évoluer ? : Le contexte de deux cohortes de patients infectés par le virus de l’immunodéficience humaine (VIH)." Paris 5, 2011. http://www.theses.fr/2011PA05T033.

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Abstract:

L’information des participants de la recherche relève d’un principe éthique fondamental. Celle délivrée à l’inclusion est essentielle pour que la personne s’engage dans la recherche de manière éclairée. Elle a de facto fait l’objet de nombreuses recommandations et guides qui décrivent son contenu. La considération d’un retour d’information après l’inclusion est en revanche beaucoup plus récente alors qu’elle répond à un devoir de respect des participants. Elle a par ailleurs été principalement envisagée sous l’angle du retour des résultats globaux de la recherche à l’issue de celle‐ci. Dans certains contextes, tels que celui des cohortes et des études de longue durée, la nécessité de délivrer une information générale pendant le déroulement de la recherche afin de tenir les participants informés de la progression de celle‐ci et de ses évolutions commence cependant à émerger. Ce travail de thèse a exploré le point de vue des principaux protagonistes intéressés par la question de l’information post‐inclusion (participants, professionnels et associations de patients) dans le contexte deux cohortes de patients infectés par le VIH promues par l'Agence française Nationale de Recherches sur le Sida et les hépatites virales (ANRS) : les cohortes AQUITAINE et COPILOTE. Des entretiens semi‐directifs ont été menés avec : 1) les membres du groupe TRT‐5 (un groupement d'associations de lutte contre le sida travaillant étroitement avec l'ANRS pour améliorer l'accès aux données de recherche), 2) des professionnels des deux cohortes et 3) un représentant de l'ANRS désigné par le directeur de l'agence. Les participants des deux cohortes ont de leur côté été interrogés par questionnaire. Onze représentants associatifs, 16 professionnels (investigateurs principaux, cliniciens, chercheurs et le représentant de l'ANRS) et 134 participants ont participé à ce travail de recherche. Une analyse qualitative des entretiens a été réalisée au regard des réponses des participants au questionnaire. Nos résultats ont montré que les supports écrits d'information représentent des outils pertinents qui : 1) contribuent à combler un manque global d’information ressenti, 2) participent à l’éducation des participants, 3) aident à faire la distinction entre le soin et la recherche et 4) motivent les professionnels à communiquer sur cette dernière. Malgré tout leur intérêt, ces outils ne doivent en aucun cas se substituer à une information orale, mais au contraire venir la compléter. L’information orale permet en outre de mieux répondre à la nature hétérogène des attentes des participants. Ce travail supporte l’idée que le développement d’outils permettant de délivrer une information générale sur les recherches en cours, même si cela ne correspond pas nécessairement au mode privilégié par les participants, est essentiel au nom du respect qui leur est dû, pour susciter leur intérêt et leur engagement dans la recherche et enfin pour provoquer une information orale des professionnels. Bien que le contexte particulier de notre travail (les participants inclus dans la recherche sont des patients suivis dans le cadre soin) rende difficile la généralisation des résultats, nous pensons qu’il est essentiel de partager les initiatives et les études empiriques telles que celle réalisée ici afin de mieux cerner le contenu de l’information qui peut ou doit être délivrée durant la recherche ainsi que son mode de diffusion. Ceci doit en effet être mis en balance avec les difficultés que représente l’élaboration d’une telle information pour les professionnels
Informing research participants is a fundamental ethical principle. . While information delivered during the inclusion in research has been described in numerous recommendations and guides, initiatives for providing general information during the course of research are more rarely considered whereas it represents a duty to respect the participants. When it exists, post-inclusion information is mainly seen in terms of return of the overall results at the end of the research. In some contexts, such as cohorts and long-term studies, the need to disclose general information during the course of research, in order to keep participants informed of the progress of the research and its developments, begins to emerge. The goal of this study was to explore the viewpoints of patient representatives, research professionals and patient groups affected by the question of information after inclusion, in the context of two cohorts of HIV-infected patients (AQUITAINE and COPILOTE) from the French Agency for Research on AIDS and Viral Hepatitis (ANRS). Face to face semi-direct interviews were conducted with 1) members of the TRT-5 group, a coalition of HIV patient associations working close with the ANRS to improve access to research information; 2) professionals of two cohorts (AQUITAINE and COPILOTE) identified with the help of the principal investigators and 3) a representative of the ANRS designated by the head of the agency. The interviews were fully transcribed and citations that may highlight clues to improving the process of information are reported. Patient groups were interviewed by questionnaire. Eleven patient representatives; 16 professionals (principal investigators, clinicians, researchers and the representative of the ANRS) and 134 patients agreed to participate. A qualitative analysis of interviews was conducted and compared to patient’s responses to the questionnaire. The results showed that written information is a relevant tool which: 1) helps to palliate the perceived lack of information; 2) participates in the education of participants; 3) helps to distinguish between the care and the research and 4) motivates professionals to communicate about research. Despite this relevance, written information should not be a substitute for verbal information, but should complete the latter. Oral information helps, indeed, to better address the heterogeneous nature of participants' expectations. This work supports the idea that the development of tools aiming the delivering of general information on ongoing research, even if it does not necessarily correspond to the preferred approach of participants, is essential to show them respect, to stimulate their interest and commitment in research and finally to initiate spoken information from professionals. Although the specific context of the work (the participants are patients followed by professionals in the field of medical care) makes it difficult to generalise the results, it is believed that it is essential to share initiatives and empirical studies such as that carried out here to better understand the content of information that can, or should be issued during the research and its dissemination. This must indeed be balanced with the difficulties of developing such information for professionals

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Filipe, Santos Orchidée. "Défauts héréditaires en Cis et en Trans de la production de l'IL-12 et de l'IL-23 chez l'homme." Paris 5, 2006. http://www.theses.fr/2006PA05N19S.

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Abstract:

Le syndrome de susceptibilité mendélienne aux infections mycobacteriennes (MSMD, MIM 209950) est un syndrome clinique rare qui se caractérise par des infections sévères et récurrentes à des souches peu virulentes de mycobactéries, tells que les mycobactéries environnentalles (EM) et le vaccin vivant du Bacille de Calmette et Guérin (BCG). Les patients atteints de MSMD sont porteurs de mutations dans l’un des cinq gènes autosomiques impliqués dans la production (IL12RB1 et IL12B) ou la réponse (IFNGR1, IFNGR2 et STAT1) à l’IFN-γ. Différentes mutations sur les cinq gènes autosomiques (dominant/récessive,nulle/hypomorphe, avec/sans expression) sont responsables de 12 maladies génétiques
Mendelien susceptibility to mycobacterial disease (MSMD, MIM 209950) is a rare clinical syndrome characterized by severe and recurrent infections to poorly virulent mycobacteria' species, as environmental mycobacteria (EM) and living BCG vaccine. Mutations in 5 autosomic genes were identified in patients with MSMD, genes implicated in the production (fLl2RBl and fLl2B) or response (fFNGRl, fFNGR2 and STATl) to IFN-y. The X-linked recessive (XR) form of the MSMD syndrome was clinically described at the first time in 1994 as a trans defect of IL-I2 production. We identified mutations in NEMO gene

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Levert, Maxime. "Compréhension de la diversité génotypique et phénotypique générée chez Escherichia coli lors des infections extraintestinales." Paris 5, 2010. http://www.theses.fr/2010PA05S002.

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Abstract:

Ce travail a consisté à obsever et étudier les mécanismes responsable de la diversification génotypique et phénotypiques des clones d'E. Coli lors des infections extraintestinales. Plusieurs polymorphismes phénotypiques s'expliquent par des niveaux différents de la protéine RpoS dans les isolats. L'étude fine des isolats d'un patient n'a pas permis de détecter de mutations dans le gène RpoS mais le séquençage de quatre de ces souches a permis de découvrir au moins six mutations ponctuelles, une délétion et une insertion d'élément IS;. La moitié présentant un lien direct avec l'expression de certaines protéines differentiellement exprimées. En utilisant un modèle murin d'infection extraintestinale, nous avons observé que ces 8 isolats se partagent en 4 groupes de virulence significativement distincts. Les résultats montrent qu'il est possible que de multiples génotypes et phénotypes bactériens soient générés à partir d'une population clonale dans les infections extraintestinales à E. Coli|
This work consisted to observe and study the mechanisms responsible for the genotypic and phenotypic diversification of clones E. Coli in extraintestinal infections. Several phenotypic polymorphisms are explained by different levels of RpoS protein in the isolates. The detailed study of isolates from one patient failed to detect mutations in the gene RpoS but four of these strains revealed at least six point mutations, a deletion and an insertion of IS element; half of the mutations are linked with the expression of certain proteins differentially expressed. Using a mouse model of extraintestinal infection, we observed that these 8 isolates were divided into 4 groups of significantly different virulence. The results show that it is possible that multiple bacterial genotypes and phenotypes are generated from a clonal population in extraintestinal infections E. Coli

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Mazzolini, Julie Emilie. "Etude des mécanismes moléculaires de la phagocytose dans les macrophages et de sa perturbation par le VIH-1." Paris 5, 2011. http://www.theses.fr/2011PA05T001.

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Abstract:

La phagocytose est un mode d'internalisation de microorganismes et de débris qui conduit à la formation d'une vacuole intracellulaire de taille supérieure à 0,5 microns. Ce mécanisme est initié par l'activation de récepteurs présents à la surface des phagocytes professionnels comme les macrophages et dépend d'une intense polymérisation d'actine et d'une réorganisation de la membrane plasmique faisant intervenir une exocytose à partir de compartiments intracellulaires. Les endosomes de recyclages marqués par AP1, VAMPS et le TNFa, ainsi qu'une sous-population d'endosomes tardifs marqués par VAMP7, participent à cette exocytose. Nous avons étudié les localisations respectives de l'actine polymérisée et des ompartiments vésiculaires, par microscopie à onde évanescente. Nous avons utilisé un système de phagocytose frustrée où la cellule « phagocyte à l'infini » et s'étale sur des ligands des récepteurs phagocytaires, ainsi qu'un nouveau système que nous avons développé pour étudier la fermeture des phagosomes. D'après nos observations, l'actine-F s'accumule en périphérie de la cellule et dans les extrémités des pseudopodes alors que l'actine se dépolymérise au centre et dans la coupe phagocytaire, lieu où le trafic vésiculaire est plus actif. Ce modèle est à compléter pour préciser les acteurs moléculaires impliqués dans les étapes de progression et de fermeture des phagosomes. Le virus de l'immunodéficience humaine de type 1 (VIH-1) infecte les macrophages, ce qui provoque une déficience de phagocytose de ces cellules. Un des facteurs de virulence majeur du VIH-1 est la protéine Nef (Facteur négatif) connue pour perturber l'organisation du cytosquelette d'actine ainsi que le trafic subcellulaire. Nous avons observé que l'infection par le VIH-1 et l'expression de Nef en particulier inhibe la phagocytose par divers récepteurs des macrophages. La protéine Nef altère fortement le recrutement à la coupe phagocytaire des endosomes de recyclage porteurs d'AP1, de VAMPS et du TNFa. À contrario, Nef ne perturbe pas l'accumulation de VAMP7 ni celui de l'actine-F. Pour inhiber la phagocytose Nef requiert son site de myristylation et ses motifs LL, DD et PXXP. Enfin, nous avons constaté que Nef interagit avec AP1 via son motif LL, ce qui conduit sans doute à la perturbation des réorganisations membranaires nécessaires pour une phagocytose efficace, alors que l'actine n'est pas altérée. Mon travail de thèse a permis d'apporter des éléments nouveaux sur les mécanismes cellulaires et moléculaires de la phagocytose et de mieux comprendre les dysfonctionnements observés chez les macrophages de patients infectés par le VIH
Phagocytosis is a mechanism of internalization of microorganisms and debris that leads to the formation of an intracellular vacuole larger than 0. 5 microns. This mechanism is initiated by the activation of receptors on the surface of professional phagocytes such as macrophages and depends on an intense actin polymerization and reorganization of the plasma membrane involving exocytosis from intracellular compartments. Recycling endosomes bearing AP1, VAMPS and TNFa, and a subpopulation of late endosomes bearing VAMP7, participate in the exocytosis. We investigated the respective locations of the polymerized actin and vesicular compartments, by evanescent wave microscopy. We used the "frustrated phagocytosis" system where cells try to "phagocyte to infinity" and spread on the ligands of phagocytic receptors, as well as a new system that we developed to study the step of phagosome closure. According to our observations, F-actin accumulates in the cell periphery and in the tips of pseudopodia while actin depolymerizes in the center of the phagocytic cup, where vesicular trafficking is more active. This model is to be completed to clarify the molecular players involved in the different stages of progression and closure of phagosomes. The human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) infects macrophages, which causes a déficience of phagocytosis of thèse cells. One of thé major virulence factors of HIV-1 is thé Nef (négative factor) protein, known to disrupt thé organization of thé actin cytoskeleton and subcellular trafficking. We observed that infection with HIV-1, and expression of Nef in particular, inhibits phagocytosis by différent receptors in macrophages. Nef protein significantly alters thé recruitment at thé phagocytic cup of recycling endosomes bearing AP1, VAMPS and TNFa. In contrast, Nef does not interfère with thé accumulation of VAMP7 nor that of F-actin. To inhibit phagocytosis Nef requires its myristoylation site and thé LL, DD and PXXP motifs. Finally, we found that Nef interacts with thé AP1 motif via thé LL motif, probably leading to thé disruption of membrane reorganization required for efficient phagocytosis, whereas actin is not altered. My thesis work helped bring new éléments on thé cellular and molecular mechanisms of phagocytosis and to better understand thé dysfunctions observed in macrophages of HIV-1-infected patients

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Kervella, Michèle. "Identification de protéines externes impliquées dans la fixation de "Campylobacter jejuni", "Campylobacter coli" aux cellules épithéliales humaines." Paris 11, 1990. http://www.theses.fr/1990PA114855.

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Ku, Cheng-Lung. "Human IRAK-4 deficiency and invasive pneumococcal disease." Paris 5, 2007. http://www.theses.fr/2007PA05T019.

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Abstract:

The susceptibility to severe Streptococcus pneumoniae is associated with a variety of human primary immunodeficiencies. Previous studies in human inherited defects showed several immune responses that were critical for this protection: antibody- and complement-mediated opsonization, the spleen and NF-KB-mediated immune responses. Recently, human Interleukin-l-receptor-associated-kinase-4 (IRAK-4) deficiency which presented a complete impairment in most Toll-like receptors' (TLRs) signaling was found and patients suffered from mostly pyogenic bacterial infections, especially caused by S. Pneumoniae. To provide a global view, we diagnosed up to 28 patients with IRAK-4 deficiency and assessed blood TLRs responses and the production of multiple cytokines in individual leukocyte subsets, which revealed a multi-cytokines and —leukocytes impairment upon TLRs activation. Most patients (22/28, 79%) suffered from invasive pneumococcal disease, often recurrent (13/22, 59%). Other infections were rare, with the exception of severe staphylococcal disease. Almost half the patients died (12/28, 43%). No death or invasive infection occurred in patients over 8 and 14 years of age, respectively. The TIR-1RAK-4 pathway is therefore vital for childhood immunity to pyogenic bacteria and plays a non-redundant role in the immunity against S. Pneumoniae. LRAK-4-dependent human TLRs appear to be less important in protective immunity to most infections, at most limited to childhood immunity to some pyogenic bacteria.

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Perrier, Anabelle. "Etude du trafic intracellulaire de la protéine M du coronavirus du syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS-CoV)." Thesis, Lille 2, 2019. http://www.theses.fr/2019LIL2S018.

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Abstract:

Les coronavirus sont une famille de virus émergents, comme l’ont montré les émergences récentes des coronavirus SARS-CoV (Severe acute respiratory syndrome coronavirus) et MERS-CoV (Middle-East respiratory syndrome coronavirus), pathogènes pour l’homme. Nous ne disposons ni d’antiviraux spécifiques ni de vaccins pour lutter contre les coronavirus.Des quatre protéines structurales du virus, la protéine M est le moteur de l’assemblage viral. Exprimée seule en cellules, elle peut dépasser le site d’assemblage dans la voie de sécrétion. Nous avons confirmé la localisation de MERS-M dans le TGN(trans-golgi network) et identifié deux signaux dans son domaine C-terminal impliqués dans son trafic : un signal DxE d’export du réticulum, et un signal KxGxYR de rétention dans le TGN. Le signal DxE avait déjà été identifié sur une autre protéine virale, tandis que le signal KxGxYR est un nouveau motif. Pour confirmer son rôle nous avons construit des chimères entre MERS-M et la protéine M du coronavirus IBV (Infectious bronchitis virus), localisée dans le compartiment intermédiaire entre le RE et le Golgi (ERGIC), et démontré que pour les deux protéines le domaine C-terminal est déterminant pour leur localisation spécifique.Un second projet de caractérisation de l’activité antivirale de la digoxigénine contre le HCoV-229E a été initié. Nous avons démontré que cette drogue inhibe le virus à une étape post-entrée, avec une concentration inhibitrice médiane (IC50) de 250nM, et qu’elle n’est pas toxique pour les cellules à cette concentration. Elle inhibe aussi l’infection par le virus de l’hépatite C, et elle semble cibler une étape précoce de la réplication des virus RNA (+)
Coronaviruses are an important family of emerging pathogens, as shown by therecent emergence of pathogenic SARS-CoV (Severe acute respiratory syndromecoronavirus) and MERS-CoV (Middle-East respiratory syndrome coronavirus) in the lasttwo decades. There are still some knowledge gaps concerning the biology ofcoronaviruses and we do not have any specific treatment or vaccine.Among the four structural proteins of the virus, the M protein is considered to bethe motor of viral assembly. Expressed alone in cells, M proteins can go beyond theassembly site of the virus (Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment,ERGIC) in the secretory pathway. We confirmed MERS-M localization in the Trans-Golginetwork (TGN) and identified two signals involved in its intracellular trafficking in its Cterminaldomain: a DxE ER export signal, and a KxGxYR TGN retention signal. The DxEsignal was already identified on another viral protein, whereas the KxGxYR signal is anew motif. To confirm the role of KxGxYR signal in TGN retention, we constructedchimeras between MERS-M and the protein M of the Infectious bronchitis virus (IBV),located in the ERGIC. Our results suggest that for both MERS-M and IBV-M the Cterminaldomain is determinant for the specific localization of the proteins.We also initiated a project on the characterization of the antiviral activity ofdigoxigenin against HCoV-229E. Our results demonstrated that it inhibits HCoV-229E ata post-entry step, with an IC50 of 250nM, and that it is not toxic at this concentration.Digoxigenin also inhibits hepatitis C virus (HCV) and likely has an effect on an early stepof replication of RNA (+) viruses

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Pierre-Audigier, Catherine. "Développement et applications de l'amplification génique au diagnostic d'infections à Mycobacterium tuberculosis." Paris 11, 1992. http://www.theses.fr/1992PA114801.

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Vitour, Damien. "Interaction de la protéine non structurale NSP3 de Rotavirus avec la protéine cellulaire RoXaN." Paris 11, 2005. http://www.theses.fr/2004PA114845.

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Abstract:

Avec environ 500 000 décès annuels, les rotaviroses représentent l'une des causes majeures de gastroentérites infectieuses dans le monde. L'agent étiologique virale de ces infections, le rotavirus, code pour six protéines structurales (VP) et six protéines non structurales (NSP). Parmi celles-ci, la protéine NSP3 interagit avec l'ARN viral et le facteur de traduction eIF4G, et joue un rôle central dans la traduction des ARNm viraux. Un nouveau partenaire pour NSP3, la protéine cellulaire RoXaN (Rotavirus X protein associated with NSP3), a été identifiée. Ce travail avait pour objet l'étude de l'interaction NSP3-RoXan et la caractérisation des propriétés de la protéine RoXan. Les domaines d'interaction ont été identifiés sur les deux protéines. Ils impliquent la région centrale de NSP3 (aa 170-234), prédite en coiled-coil, et un domaine putatif Ld présent dans la région amino-terminale de RoXan (aa 255-279). RoXan a une distribution nucléo-cytoplasmique dans la cellule. Par ailleurs, nous avons pu montrer qu'elle était phosphorylable et que l'extrémité amino-terminale (aa 1-174), qui contient un domaine tétratricopeptidique (TPR), co-localisait partiellemnt avec le réseau de vimentine. L'existence, enfin, d'un complexe ternaire RoXan-NSP3-eIF4G, et la co-immunoprécipitation ARN-dépendante de la poly(A)-binding protein (PABP) avec la région carboxy-terminale de RoXan suggèrent un rôle traductionnel pour cette dernière. Cette hypothèse requirt cependant des investigations supplémentaires et ne permet pas d'écarter une ou plusieurs autres fonctions pour la protéine.

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Dissertations / Theses on the topic 'Infection – Dissertations universitaires'

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