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Dissertations / Theses on the topic 'Inférence sélective'

Author: Grafiati
Published: 9 November 2024
Last updated: 31 July 2025

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1

Yadegari, Iraj. "Prédiction, inférence sélective et quelques problèmes connexes." Thèse, Université de Sherbrooke, 2017. http://hdl.handle.net/11143/10167.

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Abstract:
Nous étudions le problème de l'estimation de moyenne et de la densité prédictive d'une population sélectionnée, en obtenant de nouveaux développements qui incluent l'analyse de biais, la décomposition du risque et les problèmes avec restrictions sur les paramètres (chapitre 2). Nous proposons des estimateurs de densité prédictive efficaces en termes de pertes Kullback-Leibler et Hellinger (chapitre 3) améliorant les procédures de plug-in via une perte duale et via une d'expansion de variance. Enfin, nous présentons les résultats de l'amélioration de l'estimateur du maximum de vraisemblance (EM
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Hivert, Benjamin. "Clustering et analyse différentielle de données d'expression génique." Electronic Thesis or Diss., Bordeaux, 2024. http://www.theses.fr/2024BORD0171.

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Abstract:
Les analyses des données d’expression génique issues du séquençage de l’ARN (RNA-seq) en masse (bulk RNA-seq) ou en cellule unique (scRNA-seq) sont devenues courantes dans les études immunologiques. Elles permettent entre autres une meilleure compréhension de l’hétérogénéité présente dans les réponses immunitaires, qu’elles soient en réponse à la vaccination ou face à des maladies. Les analyses de ces données se font souvent selon deux étapes : i) d’abord une classification non supervisée, ou clustering, utilisant l’ensemble des gènes pour regrouper les échantillons en sousgroupes distincts et
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Enjalbert, Courrech Nicolas. "Inférence post-sélection pour l'analyse des données transcriptomiques." Electronic Thesis or Diss., Université de Toulouse (2023-....), 2024. http://www.theses.fr/2024TLSES199.

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Abstract:
Dans le domaine de la transcriptomique, les avancées technologiques, telles que les puces à ADN et le séquençage à haut-débit, ont permis de quantifier l'expression génique à grande échelle. Ces progrès ont soulevé des défis statistiques, notamment pour l'analyse d'expression différentielle, visant à identifier les gènes différenciant significativement deux populations. Cependant, les procédures classiques d'inférence perdent leurs garanties de contrôle du taux de faux positifs lorsque les biologistes sélectionnent un sous-ensemble de gènes. Les méthodes d'inférence post hoc surmontent cette l
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4

Durand, Jean-Baptiste. "Modèles à structure cachée : inférence, estimation, sélection de modèles et applications." Phd thesis, Université Joseph Fourier (Grenoble), 2003. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00002754v3.

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5

Caron, François. "Inférence bayésienne pour la détermination et la sélection de modèles stochastiques." Ecole Centrale de Lille, 2006. http://www.theses.fr/2006ECLI0012.

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Abstract:
On s'intéresse à l'ajout d'incertitudes supplémentaires dans les modèles de Markov cachés. L'inférence est réalisée dans un cadre bayésien à l'aide des méthodes de Monte Carlo. Dans un cadre multicapteur, on suppose que chaque capteur peut commuter entre plusieurs états de fonctionnement. Un modèle à saut original est développé et des algorithmes de Monte Carlo efficaces sont présentés pour différents types de situations, prenant en compte des données synchrones/asynchrones et le cas binaire capteur valide/défaillant. Le modèle/algorithme développé est appliqué à la localisation d'un véhicule
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6

Guilloux, Agathe. "Inférence non paramétrique en statistique des durées de vie sous biais de sélection." Rennes 1, 2004. http://www.theses.fr/2004REN10058.

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7

Delattre, Maud. "Inférence statistique dans les modèles mixtes à dynamique Markovienne." Phd thesis, Université Paris Sud - Paris XI, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00765708.

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Abstract:
La première partie de cette thèse est consacrée à l'estimation par maximum de vraisemblance dans les modèles mixtes à dynamique markovienne. Nous considérons plus précisément des modèles de Markov cachés à effets mixtes et des modèles de diffusion à effets mixtes. Dans le Chapitre 2, nous combinons l'algorithme de Baum-Welch à l'algorithme SAEM pour estimer les paramètres de population dans les modèles de Markov cachés à effets mixtes. Nous proposons également des procédures spécifiques pour estimer les paramètres individuels et les séquences d' états cachées. Nous étudions les propriétés de c
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Karmann, Clémence. "Inférence de réseaux pour modèles inflatés en zéro." Thesis, Université de Lorraine, 2019. http://www.theses.fr/2019LORR0146/document.

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Abstract:
L'inférence de réseaux ou inférence de graphes a de plus en plus d'applications notamment en santé humaine et en environnement pour l'étude de données micro-biologiques et génomiques. Les réseaux constituent en effet un outil approprié pour représenter, voire étudier des relations entre des entités. De nombreuses techniques mathématiques d'estimation ont été développées notamment dans le cadre des modèles graphiques gaussiens mais aussi dans le cas de données binaires ou mixtes. Le traitement des données d'abondance (de micro-organismes comme les bactéries par exemple) est particulier pour deu
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Gallopin, Mélina. "Classification et inférence de réseaux pour les données RNA-seq." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2015. http://www.theses.fr/2015SACLS174/document.

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Abstract:
Cette thèse regroupe des contributions méthodologiques à l'analyse statistique des données issues des technologies de séquençage du transcriptome (RNA-seq). Les difficultés de modélisation des données de comptage RNA-seq sont liées à leur caractère discret et au faible nombre d'échantillons disponibles, limité par le coût financier du séquençage. Une première partie de travaux de cette thèse porte sur la classification à l'aide de modèle de mélange. L'objectif de la classification est la détection de modules de gènes co-exprimés. Un choix naturel de modélisation des données RNA-seq est un modè
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Karmann, Clémence. "Inférence de réseaux pour modèles inflatés en zéro." Electronic Thesis or Diss., Université de Lorraine, 2019. http://www.theses.fr/2019LORR0146.

Full text
Abstract:
L'inférence de réseaux ou inférence de graphes a de plus en plus d'applications notamment en santé humaine et en environnement pour l'étude de données micro-biologiques et génomiques. Les réseaux constituent en effet un outil approprié pour représenter, voire étudier des relations entre des entités. De nombreuses techniques mathématiques d'estimation ont été développées notamment dans le cadre des modèles graphiques gaussiens mais aussi dans le cas de données binaires ou mixtes. Le traitement des données d'abondance (de micro-organismes comme les bactéries par exemple) est particulier pour deu
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Maurent, Eliott. "Des forêts tropicales et des humains dans les Amériques : trajectoires de réponse aux perturbations anthropiques de la diversité et de la composition des arbres. Of tropical forests and humans in the Americas : response trajectories of tree diversity and composition to anthropogenic disturbances." Electronic Thesis or Diss., Paris, AgroParisTech, 2023. http://www.theses.fr/2023AGPT0014.

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Abstract:
Les forêts tropicales sont confrontées à des perturbations anthropiques fréquentes et intenses, telles que l'exploitation sélective - l'abattage de quelques arbres dans des forêts anciennes, tandis que le reste du peuplement se régénère naturellement. De nombreuses études ont été menées sur la reconstitution des stocks de carbone et de bois, en raison d'un intérêt pour l'atténuation du changement climatique et la rentabilité de l'exploitation. Malgré le rôle crucial de la biodiversité pour le maintien et le fonctionnement des écosystèmes - et sa valeur intrinsèque - peu d'études ont été menées
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Haury, Anne-Claire. "Sélection de variables à partir de données d'expression : signatures moléculaires pour le pronostic du cancer du sein et inférence de réseaux de régulation génique." Phd thesis, Ecole Nationale Supérieure des Mines de Paris, 2012. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00818345.

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Abstract:
De considérables développements dans le domaine des biotechnologies ont modifié notre approche de l'analyse de l'expression génique. En particulier, les puces à ADN permettent de mesurer l'expression des gènes à l'échelle du génome, dont l'analyse est confiée au statisticien.A partir de ces données dites en grande dimension, nous contribuons, dans cette thèse, à l'étude de deux problèmes biologiques. Nous traitons ces questions comme des problèmes d'apprentissage statistique supervisé et, en particulier, de sélection de variables, où il s'agit d'extraire, parmi toutes les variables - gènes - à
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Caruana, Emmanuel. "Développement d'une nouvelle mesure d'équilibre pour l'aide à la sélection des variables dans un modèle de score de propension." Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2017. http://www.theses.fr/2017USPCC134/document.

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Abstract:
Le score de propension s'est progressivement imposé comme l’une des méthodes de référence dans l'analyse des données observationnelles afin de prendre en compte le biais potentiel lié à l’existence de facteurs de confusion dans l'estimation de l'effet du traitement sur le critère de jugement. Parmi les recommandations de bonnes pratiques d'utilisation, le processus de sélection des variables à inclure dans le score final utilisé est essentiel, ainsi que l'évaluation de l'équilibre obtenu sur les covariables après appariement ou pondération sur ce score. Dans l'objectif de prioriser l'inclusion
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Diallo, Alpha Oumar. "Inférence statistique dans des modèles de comptage à inflation de zéro. Applications en économie de la santé." Thesis, Rennes, INSA, 2017. http://www.theses.fr/2017ISAR0027/document.

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Abstract:
Les modèles de régressions à inflation de zéros constituent un outil très puissant pour l’analyse de données de comptage avec excès de zéros, émanant de divers domaines tels que l’épidémiologie, l’économie de la santé ou encore l’écologie. Cependant, l’étude théorique dans ces modèles attire encore peu d’attention. Ce manuscrit s’intéresse au problème de l’inférence dans des modèles de comptage à inflation de zéro.Dans un premier temps, nous revenons sur la question de l’estimateur du maximum de vraisemblance dans le modèle binomial à inflation de zéro. D’abord nous montrons l’existence de l’e
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Dufournet, Marine. "Quantification du biais de sélection en sécurité routière : apport de l’inférence causale." Thesis, Lyon, 2017. http://www.theses.fr/2017LYSE1244/document.

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Abstract:
Les principaux facteurs de l'insécurité routière sont connus, et l'enjeu réside aujourd'hui dans la mesure de l'effet d'un facteur, et la hiérarchisation de l'ensemble des causes intervenant dans la survenue de l'accident. Toutefois, les données disponibles concernent généralement que des accidentés. En l'absence de non-accidentés, l'épidémiologiste du risque routier se heurte à une sélection extrême. Une des solutions classiques est d'utiliser des analyses en responsabilité, et de mesurer l'effet causal d'un facteur sur le risque d'être responsable d'un accident. Néanmoins, la validité des an
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Vasseur, Yann. "Inférence de réseaux de régulation orientés pour les facteurs de transcription d'Arabidopsis thaliana et création de groupes de co-régulation." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017SACLS475/document.

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Abstract:
Dans cette thèse, nous cherchons à caractériser les facteurs de transcription de la plante Arabidopsis thaliana, gènes importants pour la régulation de l'expression du génome. À l'aide de données d'expression, notre objectif biologique est de classer ces facteurs de transcription en groupes de gènes co-régulateurs et en groupes de gènes co-régulés. Nous procédons en deux phases pour y parvenir. La première phase consiste à construire un réseau de régulation entre les facteurs de transcription. La seconde phase consiste en la classification des facteurs de transcription selon les liens de régul
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Le, Floch Edith. "Méthodes multivariées pour l'analyse jointe de données de neuroimagerie et de génétique." Phd thesis, Université Paris Sud - Paris XI, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00753829.

Full text
Abstract:
L'imagerie cérébrale connaît un intérêt grandissant, en tant que phénotype intermédiaire, dans la compréhension du chemin complexe qui relie les gènes à un phénotype comportemental ou clinique. Dans ce contexte, un premier objectif est de proposer des méthodes capables d'identifier la part de variabilité génétique qui explique une certaine part de la variabilité observée en neuroimagerie. Les approches univariées classiques ignorent les effets conjoints qui peuvent exister entre plusieurs gènes ou les covariations potentielles entre régions cérébrales.Notre première contribution a été de cherc
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Tournebize, Rémi. "Influence des variations spatio-temporelles de l’environnement sur la distribution actuelle de la diversité génétique des populations." Thesis, Montpellier, 2017. http://www.theses.fr/2017MONTT140.

Full text
Abstract:
Ce projet vise à comprendre comment la structure génétique intra-spécifique d'espèces végétales tropicales emblématiques et de l’espèce humaine a été affectée par les variations spatio-temporelles de l’environnement actuel et passé. Nous avons développé une approche d’inférence génétique basée sur la théorie de la coalescence pour évaluer l’influence potentielle des changements climatiques passés sur l’évolution de la distribution géographique et de la diversité génétique neutre et/ou adaptative d’Amborella trichopoda Baill. en Nouvelle-Calédonie (espèce-sœur des angiospermes, données NGS et m
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Patin, Etienne. "Influences du mode de vie sur la diversité génétique des populations humaines." Paris 6, 2008. http://www.theses.fr/2008PA066214.

Full text
Abstract:
Afin de tester si les changements de mode de vie des populations humaines ont modifié leur démographie et les pressions sélectives qu’elles ont subies, j’ai porté mes recherches sur deux modèles différents. Premièrement, l’étude de la diversité génétique mondiale de NAT2 - une enzyme qui détoxique un large spectre de xénobiotiques - a montré que sa forme non fonctionnelle a été sélectionnée positivement chez les populations agricultrices au cours des 6500 dernières années. Deuxièmement, l’étude de la variation génétique non-codante des populations de chasseurs-cueilleurs Pygmées et d’agriculte
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Kere, Eric Nazindigouba. "Analyse économétrique des décisions de production des propriétaires forestiers privés non industriels en France." Thesis, Université de Lorraine, 2013. http://www.theses.fr/2013LORR0052/document.

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Abstract:
La production de bois intègre notamment des enjeux économiques, climatiques et énergétiques. En France, selon les données de l'Institut National de l'Information Géographique et Forestière, l'accroissement biologique de la forêt est largement supérieur aux prélèvements de bois. C'est pourquoi l'État français a fixé l'objectif de prélever 21 millions de m3 supplémentaires de bois d'ici 2020 (Grenelle de l'environnement, 2007). Cependant, la forêt française appartient majoritairement à des propriétaires forestiers privés qui ont des préférences à la fois pour le revenu issu de la vente de bois e
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Le, Goff Line. "Formation spontanée de chemins : des fourmis aux marches aléatoires renforcées." Thesis, Paris 10, 2014. http://www.theses.fr/2014PA100180/document.

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Abstract:
Cette thèse est consacrée à la modélisation de la formation spontanée de chemins préférentiels par des marcheurs déposant des traces attractives sur leurs trajectoires. Plus précisément, par une démarche pluridisciplinaire couplant modélisation et expérimentation, elle vise à dégager un ensemble de règles minimales individuelles permettant l'apparition d'un tel phénomène. Dans ce but, nous avons étudié sous différents angles les modèles minimaux que sont les marches aléatoires renforcées (MAR).Ce travail comporte deux parties principales. La première démontre de nouveaux résultats dans le doma
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Gabrielli, Maëva. "Histoires évolutives et spéciation chez les Zostérops des Mascareignes (Zosteropidés)." Thesis, Toulouse 3, 2020. http://www.theses.fr/2020TOU30055.

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Abstract:
Comprendre la formation des espèces constitue un enjeu majeur en biologie évolutive. Avec l'essor des techniques de séquençage, cette question peut maintenant être adressée à une échelle génomique. En particulier, l'identification des régions génomiques sous sélection positive et qui pourraient agir comme des barrières au flux de gènes revêt une importance particulière puisque ces régions pourraient être impliquées dans l'édification de l'isolement reproducteur, conduisant à terme à la spéciation. Les Zostérops des Mascareignes fournissent un système de choix pour comprendre les processus impl
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Le, floch Edith. "Méthodes multivariées pour l'analyse jointe de données de neuroimagerie et de génétique." Thesis, Paris 11, 2012. http://www.theses.fr/2012PA112214/document.

Full text
Abstract:
L'imagerie cérébrale connaît un intérêt grandissant, en tant que phénotype intermédiaire, dans la compréhension du chemin complexe qui relie les gènes à un phénotype comportemental ou clinique. Dans ce contexte, un premier objectif est de proposer des méthodes capables d'identifier la part de variabilité génétique qui explique une certaine part de la variabilité observée en neuroimagerie. Les approches univariées classiques ignorent les effets conjoints qui peuvent exister entre plusieurs gènes ou les covariations potentielles entre régions cérébrales.Notre première contribution a été de cherc
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Duchemin, Quentin. "Growth dynamics of large networks using hidden Markov chains." Thesis, Université Gustave Eiffel, 2022. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-03749513.

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Abstract:
La première partie de cette thèse vise à introduire de nouveaux modèles de graphes aléatoires rendant compte de l'évolution temporelle des réseaux. Plus précisément, nous nous concentrons sur des modèles de croissance où à chaque instant un nouveau noeud s'ajoute au graphe existant. Nous attribuons à ce nouvel entrant des propriétés qui caractérisent son pouvoir de connectivité au reste du réseau et celles-ci dépendent uniquement du noeud précédemment introduit. Nos modèles de graphes aléatoires sont donc régis par une dynamique markovienne latente caractérisant la séquence de noeuds du graphe
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Lohier, Théophile. "Analyse temporelle de la dynamique de communautés végétales à l'aide de modèles individus-centrés." Thesis, Clermont-Ferrand 2, 2016. http://www.theses.fr/2016CLF22683/document.

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Abstract:
Les communautés végétales constituent des systèmes complexes au sein desquels de nombreuses espèces, pouvant présenter une large variété de traits fonctionnels, interagissent entre elles et avec leur environnement. En raison de la quantité et de la diversité de ces interactions les mécanismes qui gouvernent les dynamiques des ces communautés sont encore mal connus. Les approches basées sur la modélisation permettent de relier de manière mécaniste les processus gouvernant les dynamiques des individus ou des populations aux dynamiques des communautés qu'ils forment. L'objectif de cette thèse éta
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Bellot, Benoit. "Améliorer les connaissances sur les processus écologiques régissant les dynamiques de populations d'auxiliaires de culture : modélisation couplant paysages et populations pour l'aide à l'échantillonnage biologique dans l'espace et le temps." Thesis, Rennes 1, 2018. http://www.theses.fr/2018REN1B008/document.

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Abstract:
Une alternative prometteuse à la lutte chimique pour la régulation des ravageurs de culture consiste à favoriser les populations de leurs prédateurs en jouant sur la structure du paysage agricole. L'identification de structures spatio-temporelles favorables aux ennemis naturels peut se faire par l'exploration de scénarios paysagers via une modélisation couplée de paysages et de dynamiques de population. Dans cette approche, les dynamiques de populations sont simulées sur des paysages virtuels aux propriétés structurales contrôlées, et l'observation des motifs de populations associés permet l'i
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Jaureguiberry, Xabier. "Fusion pour la séparation de sources audio." Thesis, Paris, ENST, 2015. http://www.theses.fr/2015ENST0030/document.

Full text
Abstract:
La séparation aveugle de sources audio dans le cas sous-déterminé est un problème mathématique complexe dont il est aujourd'hui possible d'obtenir une solution satisfaisante, à condition de sélectionner la méthode la plus adaptée au problème posé et de savoir paramétrer celle-ci soigneusement. Afin d'automatiser cette étape de sélection déterminante, nous proposons dans cette thèse de recourir au principe de fusion. L'idée est simple : il s'agit, pour un problème donné, de sélectionner plusieurs méthodes de résolution plutôt qu'une seule et de les combiner afin d'en améliorer la solution. Pour
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Jaureguiberry, Xabier. "Fusion pour la séparation de sources audio." Electronic Thesis or Diss., Paris, ENST, 2015. http://www.theses.fr/2015ENST0030.

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Abstract:
La séparation aveugle de sources audio dans le cas sous-déterminé est un problème mathématique complexe dont il est aujourd'hui possible d'obtenir une solution satisfaisante, à condition de sélectionner la méthode la plus adaptée au problème posé et de savoir paramétrer celle-ci soigneusement. Afin d'automatiser cette étape de sélection déterminante, nous proposons dans cette thèse de recourir au principe de fusion. L'idée est simple : il s'agit, pour un problème donné, de sélectionner plusieurs méthodes de résolution plutôt qu'une seule et de les combiner afin d'en améliorer la solution. Pour
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Alquier, Pierre. "Inférence Adaptative, Inductive et Transductive, pour l'Estimation de la Regression et de la Densité." Phd thesis, 2006. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00119593.

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Abstract:
Cette thèse a pour objet l'étude des<br />propriétés statistiques d'algorithmes d'apprentissage dans le cas de<br />l'estimation de la régression et de la densité. Elle est divisée en<br />trois parties.<br /><br />La première partie consiste en une généralisation des théorèmes<br />PAC-Bayésiens, sur la classification, d'Olivier Catoni, au cas de la régression avec une fonction de perte<br />générale.<br /><br />Dans la seconde partie, on étudie plus particulièrement le cas de la<br />régression aux moindres carrés et on propose un nouvel algorithme de<br />sélection de variables. Cette métho
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Gagnon, Philippe. "Sélection de modèles robuste : régression linéaire et algorithme à sauts réversibles." Thèse, 2017. http://hdl.handle.net/1866/20583.

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Parto, Sahar. "Bayesian codon models for detecting convergent molecular adaptation." Thèse, 2017. http://hdl.handle.net/1866/21190.

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Elgbeili, Guillaume. "Probabilité et temps de fixation à l’aide de processus ancestraux." Thèse, 2013. http://hdl.handle.net/1866/10438.

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Abstract:
Ce mémoire analyse l’espérance du temps de fixation conditionnellement à ce qu’elle se produise et la probabilité de fixation d’un nouvel allèle mutant dans des populations soumises à différents phénomènes biologiques en uti- lisant l’approche des processus ancestraux. Tout d’abord, l’article de Tajima (1990) est analysé et les différentes preuves y étant manquantes ou incomplètes sont détaillées, dans le but de se familiariser avec les calculs du temps de fixa- tion. L’étude de cet article permet aussi de démontrer l’importance du temps de fixation sur certains phénomènes biologiques. Par la
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