Academic literature on the topic 'Instrumentation for life-sciences'

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Journal articles on the topic "Instrumentation for life-sciences"

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Patou, François, Maria Dimaki, Anja Maier, Winnie E. Svendsen, and Jan Madsen. "Model-based systems engineering for life-sciences instrumentation development." Systems Engineering 22, no. 2 (2018): 98–113. http://dx.doi.org/10.1002/sys.21429.

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Griffin, Philippa C., Jyoti Khadake, Kate S. LeMay, et al. "Best practice data life cycle approaches for the life sciences." F1000Research 6 (August 31, 2017): 1618. http://dx.doi.org/10.12688/f1000research.12344.1.

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Abstract:
Throughout history, the life sciences have been revolutionised by technological advances; in our era this is manifested by advances in instrumentation for data generation, and consequently researchers now routinely handle large amounts of heterogeneous data in digital formats. The simultaneous transitions towards biology as a data science and towards a ‘life cycle’ view of research data pose new challenges. Researchers face a bewildering landscape of data management requirements, recommendations and regulations, without necessarily being able to access data management training or possessing a clear understanding of practical approaches that can assist in data management in their particular research domain. Here we provide an overview of best practice data life cycle approaches for researchers in the life sciences/bioinformatics space with a particular focus on ‘omics’ datasets and computer-based data processing and analysis. We discuss the different stages of the data life cycle and provide practical suggestions for useful tools and resources to improve data management practices.
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Griffin, Philippa C., Jyoti Khadake, Kate S. LeMay, et al. "Best practice data life cycle approaches for the life sciences." F1000Research 6 (June 4, 2018): 1618. http://dx.doi.org/10.12688/f1000research.12344.2.

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Abstract:
Throughout history, the life sciences have been revolutionised by technological advances; in our era this is manifested by advances in instrumentation for data generation, and consequently researchers now routinely handle large amounts of heterogeneous data in digital formats. The simultaneous transitions towards biology as a data science and towards a ‘life cycle’ view of research data pose new challenges. Researchers face a bewildering landscape of data management requirements, recommendations and regulations, without necessarily being able to access data management training or possessing a clear understanding of practical approaches that can assist in data management in their particular research domain. Here we provide an overview of best practice data life cycle approaches for researchers in the life sciences/bioinformatics space with a particular focus on ‘omics’ datasets and computer-based data processing and analysis. We discuss the different stages of the data life cycle and provide practical suggestions for useful tools and resources to improve data management practices.
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Sadrozinski, Hartmut F. W. "Radiation effects in life sciences." Nuclear Instruments and Methods in Physics Research Section A: Accelerators, Spectrometers, Detectors and Associated Equipment 514, no. 1-3 (2003): 224–29. http://dx.doi.org/10.1016/j.nima.2003.08.109.

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Leapman, RD. "Nanoscale Elemental Analysis by EELS in the Life Sciences." Microscopy and Microanalysis 14, S2 (2008): 1378–79. http://dx.doi.org/10.1017/s143192760808238x.

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Borst, Jan Willem, and Antonie J. W. G. Visser. "Fluorescence lifetime imaging microscopy in life sciences." Measurement Science and Technology 21, no. 10 (2010): 102002. http://dx.doi.org/10.1088/0957-0233/21/10/102002.

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Williams, Robert E. A., David W. McComb, and Sriram Subramaniam. "Cryo-electron microscopy instrumentation and techniques for life sciences and materials science." MRS Bulletin 44, no. 12 (2019): 929–34. http://dx.doi.org/10.1557/mrs.2019.286.

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Kano, Hideaki, Hiroki Segawa, Masanari Okuno, Philippe Leproux, and Vincent Couderc. "Hyperspectral coherent Raman imaging - principle, theory, instrumentation, and applications to life sciences." Journal of Raman Spectroscopy 47, no. 1 (2015): 116–23. http://dx.doi.org/10.1002/jrs.4853.

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Jakůbek, J. "Semiconductor Pixel detectors and their applications in life sciences." Journal of Instrumentation 4, no. 03 (2009): P03013. http://dx.doi.org/10.1088/1748-0221/4/03/p03013.

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Mancuso, Joel, Kirk Czymmek, and Alexandra F. Elli. "Tools for 3D Electron in Life Sciences – Generate meaningful statistics from 3DEM Data Microscopy." Microscopy and Microanalysis 25, S2 (2019): 2676–77. http://dx.doi.org/10.1017/s1431927619014119.

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Dissertations / Theses on the topic "Instrumentation for life-sciences"

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Khayat, Fahad Ali Abdulghany. "Detection of Abnormal Milk with Impedance Microbiology Instrumentation." DigitalCommons@USU, 1986. https://digitalcommons.usu.edu/etd/5332.

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Abstract:
Mastitic milk was detected by obtaining conductance measurements using an impedance microbiology Bactometer® 120 SC instruments. Conductance readings taken after 30 min at 25'C separated normal and abnormal milks when readings differed by more than 3% from the variance among instrument module wells. Samples blended from four quarters of a cow indicated milk from one quarter was abnormal if the salt level in the abnormal quarter raised the blend conductivity above that of normal samples and variance among the wells. Either solid or liquid substrates that contained bacterial stimulants could be used to accelerate bacterial acid production or to reduce impedance detection times, each without adversely affecting the ability to detect abnormal milk. However, measurements with liquid substrates varied with the volume of sample in the well. Results suggested that a fixed volume of one ml be used. Such a volume would allow simultaneous detection of abnormal milk and bacterial load on the same sample.
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Moatamri, Nader. "De l'analyse du pilotage d'un décanteur centrifuge à son instrumentation." Phd thesis, ENSIA (AgroParisTech), 2003. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00003701.

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Abstract:
Le travail mené dans cette thèse concerne la maîtrise des décanteurs centrifuges. L'instrumentation étant limitante, nous proposons, sur la base de l'analyse des modes de pilotage de l'opération la définition de l'instrumentation et la réalisation et la validation des capteurs nécessaires. La recherche a été effectuée en trois volets distincts. • L'analyse bibliographique a permis de caractériser les différents mécanismes qui permettent la déshydratation mécanique des boues urbaines par les centrifugeuses. Les boues présentent une grande variabilité et leur caractérisation n'est pas toujours facile. Il ressort de cette étude que l'empirisme l'emporte sur les travaux de compréhension du procédé : aucun modèle de génie des procédés ne donne entière satisfaction. Une nouvelle approche d'étude est indispensable. • L'analyse du pilotage des centrifugeuses est ensuite proposée. Cette analyse, effectuée par entretiens avec des experts, amène une réponse à la question « Que mesurer ? ». Ainsi, nous avons déterminé le nombre minimal et la nature des paramètres à connaître pour piloter la machine. La synthèse de la connaissance des experts a permis de fournir et valider un outil simple d'aide à la décision. Afin de pouvoir implanter ce module en ligne pour le pilotage automatique, nous avons étudié l'instrumentation possible du procédé. • Plusieurs instruments présents sur le marché ont été testés pour déterminer leurs caractéristiques métrologiques. Ces capteurs servent à déterminer la concentration du centrat et la siccité des boues déshydratées. Plus spécifiquement, un capteur de mesure de la concentration des matières en suspension du centrat, reposant sur l'analyse des données spectrophotométriques, a été développé. Ce capteur présente l'avantage, par la mise en œuvre que nous avons réalisé, d'être sans contact avec le produit. Ceci évite les problèmes de colmatage, fréquents dans les stations d'épuration. Le signal de mesure est traité de plusieurs manières et des corrélations sont obtenues. Une validation sur site industriel est discutée.
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Douiri, Imen. "Instrumentation d'un four pilote pour la cuisson de génoise." Phd thesis, ENSIA (AgroParisTech), 2007. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00004531.

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Abstract:
La cuisson de produits céréaliers provoque des transformations physicochimiques dans la pâte pour lui conférer une structure, une texture, une forme, une couleur et un goût désirés. Un four pilote électrique avec circulation d'air chaud a été instrumenté pour suivre en continu la cuisson d'un produit type génoise (700g) placé dans un moule : perte de poids, profil de température interne et température de surface, pression interne. A travers une fenêtre dans la paroi isolée du moule des images ont été enregistrées pour suivre le gonflement. L'évolution de masse volumique a été déduite. Des mesures de flux de chaleur radiatif et convectif reçus par la surface du produit ont contribué à expliquer la coloration de la surface et la forme du produit cuit. Des cuissons à 160, 180, 220°C ont été réalisées avec une perte de masse constante (eau) de 6% durant la période de chauffage, avec des temps de chauffage respectivement de 81, 71, 52 min. Durant cette période la pâte se transforme en croûte colorée sèche en surface, et mie humide. La période de refroidissement contrôlé avec ventilation d'air (90min) conduit à une perte additionnelle de poids de 6% et représente une phase importante pour stabiliser la structure.
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Diaz, Gilberto. "Spectroscopie optique multi-modalités in vivo : instrumentation, extraction et classification diagnostique de tissus sains et hyperplasiques cutanés." Phd thesis, Institut National Polytechnique de Lorraine - INPL, 2009. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00440463.

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Abstract:
L'incidence des cancers cutanés est en constante progression. Leur diagnostic précoce et leur caractérisation in vivo constituent donc un enjeu important. Notre approche multi-modalités non invasive en spectroscopie fibrée résolue spatialement vise à coupler des mesures d'AutoFluorescence (AF) et de Réflectance Diffuse (RD). L'instrumentation développée permet des mesures co-localisées en multiple excitation d'autofluorescence (7 pics d'excitation centrés à 360, 368, 390, 400, 410, 420 et 430 nm) et en réflectance diffuse (390 à 720 nm) résolues spatialement à 5 distances inter-fibres (271, 536, 834, 1076, 1341 µm). Le protocole d'étude expérimental a porté sur les stades précoces de cancers cutanés UV-induits sur un modèle pré-clinique. L'analyse histopathologique a permis de définir 4 classes (états) de référence de tissus cutanés : Sain (S), Hyperplasie Compensatoire (HC), Hyperplasie Atypique (HA) et Dysplasie (D), menant à 6 combinaisons de paires histologiques à discriminer. Suite au prétraitement des spectres bruts acquis (suppression des artefacts, moyennage, filtrage, correction spectrale), puis à l'extraction, la sélection et la réduction de jeux de caractéristiques spectroscopiques les plus discriminantes, les performances de trois algorithmes de classification supervisée ont été comparées : k-Plus Proches Voisins (k-PPV), Analyse Discriminante Linéaire (ADL) et Machine à Vecteur de Support (MVS). Les contributions des différentes modalités ont également été évaluées : mono-excitation d'AF seule, Matrices d'Excitation-Emission en AF seules (EEMs), réflectance diffuse (RD) seule, couplage EEMs – RD et couplage EEMs – RD résolue spatialement. L'efficacité finale de notre méthode diagnostique a été évaluée en termes de sensibilité (Se) et de spécificité (Sp). Les meilleures résultats obtenus sont : Se et Sp ≈ 100% pour discriminer CH vs autres ; Sp ≈ 100% et Se > 95% pour discriminer S vs AH ou D ; Sp ≈ 74% et Se ≈ 63% pour discriminer AH vs D.
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Abeille, Fabien. "Automatisation et intégration d'un réacteur de culture cellulaire pour un fonctionnement en continu." Thesis, Grenoble, 2014. http://www.theses.fr/2014GRENS036/document.

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Abstract:
Au cours des six dernières décennies, la culture cellulaire est devenue une pratique courante. Elle est un outil majeur de la recherche biologique pour la compréhension du vivant, l'étude de maladies et la découverte de nouveaux médicaments. Elle représente un outil très répandu dans de nombreuses industries étant impliquées dans la production de produits alimentaires, cosmétiques et pharmaceutiques.Cependant, les cultures cellulaires en recherche et en industrie sont aujourd'hui confrontées à des limites et soulèvent des besoins à satisfaire. Elles sont toutes deux associées à des coûts élevés du fait des ressources nécessaires (cellules, réactifs, opérateurs qualifiés). Plus précisément, la culture en recherche est caractérisée par le faible débit des expériences, une variabilité importante et un risque de contamination due à la répétition d'opérations manuelles. De plus, les expériences de culture sont effectuées dans des conditions statiques et sur des modèles (cultures 2D, animaux...) relativement éloignés de la physiologie humaine. La culture cellulaire industrielle, quant à elle, a besoin de systèmes miniaturisés qui miment les procédés des bioréacteurs à grande échelle et qui offrent des possibilités de criblage plus élevés.Les systèmes de culture microfluidique représentent un outil prometteur pour résoudre ces problèmes et ces besoins. Le changement de comportement de la physique à petite échelle dans ces dispositifs permet de contrôler temporellement et spatialement le microenvironnement des cellules. Ce qui n'est pas possible avec des méthodes de culture classiques. Le degré d'automatisation et d'intégration permet une nette augmentation du nombre d'expériences par système et la réduction conséquente de la consommation de ressources. Ainsi, de nombreuses petites architectures 3D cellulaires cultivées dans des conditions dynamiques et à haut débit ont été réalisées et ont démontré leur capacité à recréer rapidement des environnements plus physiologiques. En ce qui concerne la culture industrielle, des cultures miniaturisées ont déjà montré leur capacité à reproduire les caractéristiques observées dans les macrobioreactors avec des possibilités de criblages élevées.Dans ce contexte, un bioréacteur microfluidique de paillasse, se conformant aux formats standards utilisés dans le laboratoire d'accueil, a été fabriqué avec succès au cours de cette thèse pour effectuer des cultures cellulaires en continu. Des solutions intégrées ont été mises au point pour fournir de façon continue les conditions adéquates pour la prolifération cellulaire (perfusion, régulation de température…). Des études ont également été menées afin d'automatiser la récolte des cellules avec pour but final de cultiver ces cellules sur du long terme dans le bioréacteur.Le système fabriqué garantit ainsi des conditions stériles pour les cultures sur un simple banc de laboratoire. En outre, ces cultures ont été réalisées de façon autonome sans utiliser un incubateur encombrant. Dans ces conditions, le bioréacteur permet de réaliser des cultures en continu de divers types cellulaires sur plusieurs jours: des cellules d'insectes ont été cultivées pendant 5 jours et des cellules de mammifère pendant 3 jours. En ce qui concerne les cultures de cellules de mammifère, une avancée majeure a été effectuée par rapport aux cultures réalisées dans les systèmes microfluidiques en utilisant comme support de culture des microporteurs (diam. : 175 µm).Bien que la culture de cellules sur microporteurs soit réalisée en routine dans l'industrie, aucun système de culture microfluidique autonome n'a encore intégré ce type de culture. Ce genre de miniaturisation est une avancée majeure pour des applications en bioprocédés où il devrait permettre de raccourcir et réduire les coûts associés au développement de bioproduits
Over the past six decades, cell culture has become a common practice. It is a major tool in biological research for the understanding of life science, such as the study of disease and the discovery of new drugs. It plays an important role in many industries since it is involved in the production of many food, cosmetic, and pharmaceutical products.However, Research and the industry are now facing some limits and are expressing needs to be addressed. They are both associated with high costs due to a large consumption of resources (cells, reagents, qualified operators). More specifically, cell culture in research is characterized by low throughput of experiments, important variability and risk of contamination due to the recurrent manual operations performed by operators. Additionally, experiments are performed in static conditions and on models (2D cultures, animals…) which poorly resemble the human physiology. Industrial cell culture needs miniaturized systems that mimic the large scale bioreactors and offer higher screening possibilities.Microfluidic cell culture systems represent a promising tool to address the aforementioned issues and needs. The change of physical behaviors at the small-scale in microfluidic devices allow controlling temporally and spatially the cell microenvironment, unattainable with conventional cell culture methods. The level of automation and integration allows the substantial increase of the number of experience per system and considerable reduction of resource consumption. Thus, many small cellular 3D architectures grown under dynamic conditions and in high-throughput have been performed and have demonstrated their ability to quickly re-create more physiological environments. Regarding the industrial culture, miniaturized cultures have already shown their ability to reproduce the characteristics of the culture observed in macrobioreactors with higher screening capabilities.In this framework, a benchtop microfluidic bioreactor, complying with the standard microfluidic platform and format used in the host laboratory, has been successfully fabricated to perform continuous cell cultures. Integrated solutions were developed to provide continuously the adequate conditions for cell proliferation (perfusion, thermal regulation…). Integrated cell harvest was also performed with the final goal to achieve long-term cell culture in the bioreactor.The fabricated system proved to guarantee sterile conditions for cell cultures on a regular lab bench. Moreover, these cultures were achieved autonomously without requiring a cumbersome incubator. In these conditions, the bioreactor demonstrated the possibility to perform continuous cell cultures of various cell types during several days: insects cells were cultured during 5 days and mammalian cells during 3 days. Regarding the mammalian cell cultures performed, a breakthrough has been achieved compared to the cultures performed in microfluidic systems since microcarriers (diam.:175 µm) were used as growth support.Although microcarrier cell culture is routinely performed in the industry, no autonomous microfluidic culture system has addressed this type of culture yet. Such a miniaturization is a major step forward for bioprocess applications where the need to develop scale-down bioreactors that mimic large scale operation has been clearly identified to shorten and reduce the costs associated to bioproduct development
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Huisman, Maximiliaan. "Vision Beyond Optics: Standardization, Evaluation and Innovation for Fluorescence Microscopy in Life Sciences." eScholarship@UMMS, 2019. https://escholarship.umassmed.edu/gsbs_diss/1017.

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Abstract:
Fluorescence microscopy is an essential tool in biomedical sciences that allows specific molecules to be visualized in the complex and crowded environment of cells. The continuous introduction of new imaging techniques makes microscopes more powerful and versatile, but there is more than meets the eye. In addition to develop- ing new methods, we can work towards getting the most out of existing data and technologies. By harnessing unused potential, this work aims to increase the richness, reliability, and power of fluorescence microscopy data in three key ways: through standardization, evaluation and innovation. A universal standard makes it easier to assess, compare and analyze imaging data – from the level of a single laboratory to the broader life sciences community. We propose a data-standard for fluorescence microscopy that can increase the confidence in experimental results, facilitate the exchange of data, and maximize compatibility with current and future data analysis techniques. Cutting-edge imaging technologies often rely on sophisticated hardware and multi-layered algorithms for reconstruction and analysis. Consequently, the trustworthiness of new methods can be difficult to assess. To evaluate the reliability and limitations of complex methods, quantitative analyses – such as the one present here for the 3D SPEED method – are paramount. The limited resolution of optical microscopes prevents direct observation of macro- molecules like DNA and RNA. We present a multi-color, achromatic, cryogenic fluorescence microscope that has the potential to produce multi-color images with sub-nanometer precision. This innovation would move fluorescence imaging beyond the limitations of optics and into the world of molecular resolution.
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Kalyagina, Nina. "Imagerie endoscopique de réflectance diffuse pour le diagnostic des pré-cancers et cancers précoces de la vessie : instrumentation, modélisation et validation expérimentale." Phd thesis, Université de Lorraine, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00743605.

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Abstract:
L'objectif de cette thèse est d'évaluer les performances d'une méthode d'imagerie optique non-invasive pour la détection de précancers et cancers précoces de la vessie, à l'aide d'une analyse de lumière laser rétro-diffusée. L'analyse de la distribution spatiale de la lumière à la surface de fantômes multi-couches imitant l'épithelium de vessie avec différentes propriétés d'absorption et de diffusion nous a permis de montrer les modifications de ces propriétés optiques entraînent des changements de la taille de la surface du spot de lumière rétro-diffusée, mesurables par une caméra vidéo. La méthode développée est également sensible à l'accumulation d'un photosensibilisateur et est applicable aussi bien pour des études en réflectance diffuse qu'en fluorescence induite. Les paramètres optiques des fantômes synthétiques tri-couches imitant différents états des épithéliums de vessie ont été calculés à partir de la théorie des ondes électromagnétiques appliquée aux diffuseurs sphériques sans et avec une couche. Ces paramètres ont servi comme entrées aux simulations de Monte Carlo qui ont permis d'obtenir les matrices des distributions d'intensité de réflectance diffuse. Notre étude démontre que les mesures en imagerie de réflectance diffuse non-polarisée permettent de fournir des informations utiles au diagnostic tissulaire.
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Pery, Emilie. "Spectroscopie bimodale en diffusion élastiqueet autofluorescence résolue spatialement :instrumentation, modélisation des interactions lumière-tissus et application à la caractérisation de tissus biologiques ex vivo et in vivo pour la détection de cancers." Phd thesis, Institut National Polytechnique de Lorraine - INPL, 2007. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00199910.

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Abstract:
L'objectif de ce travail de recherche est le développement, la mise au point et la validation d'une méthode de spectroscopie multi-modalités en diffusion élastique et autofluorescence pour caractériser des tissus biologiques in vitro et in vivo. Ces travaux s'organisent en quatre axes.
La première partie des travaux présente l'instrumentation : développement, réalisation et caractérisation expérimentale d'un système de spectrométrie bimodale multi-points fibrée permettant l'acquisition de spectres in vivo (distances variables, acquisition rapide).
La deuxième partie porte sur la modélisation des propriétés optiques du tissu : développement et validation expérimentale sur fantômes d'un algorithme de simulation de propagation de photons en milieux turbides et multi-fluorescents.
La troisième partie propose une étude expérimentale conduite ex vivo sur des anneaux artériels frais et cryoconservés. Elle confirme la complémentarité des mesures spectroscopiques en diffusion élastique et autofluorescence et valide la méthode de spectroscopie multi-modalités et l'algorithme de simulation de propagation de photons. Les résultats originaux obtenus montrent une corrélation entre propriétés rhéologiques et optiques.
La quatrième partie développe une seconde étude expérimentale in vivo sur un modèle pré-clinique tumoral de vessie. Elle met en évidence une différence significative en réflectance diffuse et/ou en autofluorescence et/ou en fluorescence intrinsèque entre tissus sains, inflammatoires et tumoraux, sur la base de longueurs d'onde particulières. Les résultats de la classification non supervisée réalisée montrent que la combinaison de différentes approches spectroscopiques augmente la fiabilité du diagnostic.
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Boitte, Jean-Baptiste. "Contribution à l'étude de systèmes divisés alimentaires par observation de microstructures au cours de traitements thermo-mécaniques." Phd thesis, AgroParisTech, 2012. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-01059705.

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Abstract:
Pour mettre en relation les propriétés rhéologiques et la structure méso/microscopique d'un système modèle ou complexe, l'utilisation de la rhéo-optique est indispensable. Nous avons donc développé une cellule d'observation sous cisaillement adaptée à la microscopie confocale. Ce dispositif, breveté et nommé RheOptiCAD®, permet le cisaillement contrôlé d'un échantillon quelconque placé entre 2 plans parallèles en translation. Grâce à un système à dépression, la mise en place de l'échantillon est simple et rapide tout en assurant des propriétés optiques répétables et reproductibles (planéité, parallélisme). Par ailleurs, la température au sein de l'échantillon peut être régulée de façon à imposer une contrainte thermique, cause de nombreuses modifications de la mésostructure d'un système alimentaire. La cellule d'observation sous cisaillement permet donc de suivre l'évolution et la dynamique des changements de structures conséquences d'un traitement thermo-mécanique imposé. Un logiciel de pilotage et d'acquisition des données a été développé pour rendre son utilisation plus conviviale. La validation du fonctionnement de l'outil et de ses fonctionnalités a tout d'abord été réalisée sans échantillon puis à l'aide d'un système modèle contenant des particules fluorescentes dont le mouvement était suivi. Par la suite, dans le but de tester les potentialités de ce nouvel outil tout en développant la méthodologie de son utilisation, et en particulier l'équilibre entre propriétés optiques et mécaniques des échantillons, nous avons travaillé avec de la pâte de farine. Ce système alimentaire bien connu et maîtrisé d'un point de vue rhéologique au laboratoire présente des caractéristiques intéressantes dans ce cadre. L'évolution du réseau de gluten au cours d'un cisaillement oscillatoire en fonction de la formulation de la pâte a été étudiée. Grâce à une analyse d'image basée sur la morphologie mathématique, nous avons pu mettre en évidence des changements de structures au cours du temps. De même, à l'aide des capacités thermiques de la cellule de cisaillement, nous avons étudié le positionnement et le mouvement des lipides endogènes à l'interface air-protéine lors de la fermentation. Notre cellule d'observation sous cisaillement constitue donc un nouvel outil de caractérisation dynamique de systèmes complexes couplant rhéologie et microscopie. Son optimisation principale réside dans la mise en place d'un capteur de force, mesurant les contraintes mises en jeu lors des déformations imposées.
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Liu, Honghui. "Caractérisation de tissus cutanés superficiels hypertrophiques par spectroscopie multimodalité in vivo : instrumentation, extraction et classification de données multidimensionnelle." Phd thesis, Université de Lorraine, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00745202.

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Abstract:
L'objectif de ce travail de recherche est le développement, la mise au point et la validation d'une méthode de spectroscopie multi-modalités en diffusion élastique et autofluorescence pour caractériser des tissus cutanés cicatriciels hypertrophiques in vivo. Ces travaux sont reposés sur trois axes. La première partie des travaux présente l'instrumentation : développement d'un système spectroscopique qui permet de réaliser des mesures de multimodalités in vivo de manière automatique et efficace. Des procédures métrologiques sont mise en place pour caractériser le système développé et assurer la repétabilité les résultats de mesure. La deuxième partie présente une étude préclinique. Un modèle animal et un protocole expérimental ont été mises en place pour créer des cicatrices hypertrophiques sur lesquelles nous pouvons recueillir des spectres à analyser. La troisième partie porte sur la classification des spectres obtenus. Elle propose des méthodes algorithmiques pour débruiter et corriger les spectres mesurés, pour extraire automatiquement des caractéristiques spectrales interprétables et pour sélectionner un sous-ensemble de caractéristiques "optimales" en vue d'une classification efficace. Les résultats de classification réalisée respectivement par trois méthodes (k-ppv, ADL et RNA) montrent que la faisabilité d'utiliser la spectroscopie bimodale pour la caractérisation de ce type de lésion cutané. Par ailleurs, les caractéristiques sélectionnées par notre méthode montrent que la cicatrisation hypertrophique implique un changement de structure tissulaire et une variation de concentration de porphyrine
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Books on the topic "Instrumentation for life-sciences"

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Anjana, Sharma, ed. Introduction to instrumentation in life sciences. CRC Press, 2013.

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Cheng, Ping-chin. X-ray Microscopy: Instrumentation and Biological Applications. Springer Berlin Heidelberg, 1987.

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3

R, Briggs, and International Association on Water Quality., eds. Instrumentation, control and automation of water and wastewater treatment and transport systems 1997: Selected proceedings of the 7th International Workshop on Instrumentation, Control and Automation of Water and Wastewater Treatment and Transport Systems, held at Brighton, UK, 6-9 July 1997. Pergamon, 1998.

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4

Qingjun, Liu, and SpringerLink (Online service), eds. Biomedical Sensors and Measurement. Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2011.

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5

Ciofalo, Michele. Nanoscale fluid dynamics in physiological processes: A review study. WIT Press, 1999.

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service), ScienceDirect (Online, ed. Biophysical tools for biologists: In vivo techniques. Elsevier Academic Press, 2008.

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7

G, Richard Michael, Daigger Glen T, and Jenkins David 1935-, eds. Manual on the causes and control of activated sludge bulking, foaming, and other solids separation problems. 3rd ed. Lewis Publishers, 2004.

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8

Bisen, Prakash Singh. Introduction to Instrumentation in Life Sciences. CRC Press, 2012. http://dx.doi.org/10.1201/b12910.

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9

Natural Products Analysis Instrumentation Metods And Applications. John Wiley & Sons Inc, 2014.

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10

Cell Biology and Instrumentation: UV Radiation, Nitric Oxide and Cell Death in Plants: Volume 371 NATO Science Series: Life and Behavioural Sciences (Nato ... Series, Life and Behavioural Sciences). IOS Press, 2006.

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Book chapters on the topic "Instrumentation for life-sciences"

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"- Centrifugation." In Introduction to Instrumentation in Life Sciences. CRC Press, 2012. http://dx.doi.org/10.1201/b12910-10.

Full text
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2

"- Electrophoresis." In Introduction to Instrumentation in Life Sciences. CRC Press, 2012. http://dx.doi.org/10.1201/b12910-11.

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3

"- X-Ray Microanalysis." In Introduction to Instrumentation in Life Sciences. CRC Press, 2012. http://dx.doi.org/10.1201/b12910-12.

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4

"- Techniques with Radioisotopes." In Introduction to Instrumentation in Life Sciences. CRC Press, 2012. http://dx.doi.org/10.1201/b12910-13.

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5

"- Fermentation." In Introduction to Instrumentation in Life Sciences. CRC Press, 2012. http://dx.doi.org/10.1201/b12910-14.

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6

"Conductivity Meters." In Introduction to Instrumentation in Life Sciences. CRC Press, 2012. http://dx.doi.org/10.1201/b12910-15.

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7

"- Microscopy." In Introduction to Instrumentation in Life Sciences. CRC Press, 2012. http://dx.doi.org/10.1201/b12910-5.

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8

"- Micrometry." In Introduction to Instrumentation in Life Sciences. CRC Press, 2012. http://dx.doi.org/10.1201/b12910-6.

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9

"- Electrochemical Techniques." In Introduction to Instrumentation in Life Sciences. CRC Press, 2012. http://dx.doi.org/10.1201/b12910-7.

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10

"- Chromatography." In Introduction to Instrumentation in Life Sciences. CRC Press, 2012. http://dx.doi.org/10.1201/b12910-8.

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Conference papers on the topic "Instrumentation for life-sciences"

1

Hines, John W., and Robert D. Ricks. "Sensors 2000: advanced biosensor systems for space life sciences." In SPIE's 1994 International Symposium on Optics, Imaging, and Instrumentation, edited by Nona K. Minnifield. SPIE, 1994. http://dx.doi.org/10.1117/12.188817.

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2

Roth, Martin M., Karl Zenichowski, Nicolae Tarcea, et al. "The ERA2 facility: towards application of a fibre-based astronomical spectrograph for imaging spectroscopy in life sciences." In SPIE Astronomical Telescopes + Instrumentation, edited by Ramón Navarro, Colin R. Cunningham, and Eric Prieto. SPIE, 2012. http://dx.doi.org/10.1117/12.925340.

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3

Zhilyakova, Elena, Nabel Mohamad, Abdulhadi Bakri, Denis Naplekov, and Diana Martseva. "Validation of Quantitative Determination Methods for Fexofenadine Hydrochloride and Cyanocobalamine in Separate Ophthalmological Dosage Forms Using UV-Spectrophotometry Instrumentation." In Proceedings of the 1st International Symposium Innovations in Life Sciences (ISILS 2019). Atlantis Press, 2019. http://dx.doi.org/10.2991/isils-19.2019.90.

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