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Dissertations / Theses on the topic 'Interactions protéine-protéine – Identification'

Author: Grafiati

Published: 15 June 2024

Last updated: 31 July 2025

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1

Moine-Franel, Alexandra. "Cartographie des poches aux interfaces protéine-protéine et identification de nouvelles cibles thérapeutiques potentielles." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2023. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2023SORUS634.pdf.

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Abstract:

Les interactions protéine-protéine (IPP) représentent une source importante de potentielle cibles thérapeutiques car elles jouent un rôle crucial dans de nombreux et divers processus biologiques, notamment dans le développement de pathologies. Bien que les IPP apparaissent comme des cibles thérapeutiques prometteuses, elles demeurent plus difficiles à étudier que les cibles thérapeutiques conventionnelles. En effet, les IPP connues sont caractérisées par des motifs structuraux particuliers qui limitent leur potentiel « druggable » c’est-à-dire leur capacité à lier et être modulées par une peti

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2

Douguet, Dominique. "Etude des interactions protéine-protéine et protéine-ligand par bio- et chimie-informatique structurale : Identification de petites molécules bio-actives." Habilitation à diriger des recherches, Université de Nice Sophia-Antipolis, 2007. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00320089.

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Abstract:

Mes recherches ont eu pour objectif de concilier deux aspects complémentaires de la bioinformatique structurale : la modélisation de la structure 3D des protéines et la modélisation des petites molécules modulatrices des premières. La connaissance de la structure tridimensionnelle des protéines est un élément déterminant pour la compréhension fine de leur mécanisme d'action et indispensable pour le développement d'approches thérapeutiques rationnelles. Ainsi, l'identification et l'analyse structurale des sites de fixation de leurs ligands (protéine ou petite molécule) permettent d'envisager la

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3

Corsi, Flavia. "Towards the in silico reconstruction of protein interaction networks : identification of DNA- and RNA-protein interfaces, and construction of a database of multiple interactions of proteins." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2019. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2019SORUS452.pdf.

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Abstract:

Cette thèse porte sur la caractérisation et la prédiction des interfaces protéine-ADN et -ARN, et des comparaisons avec les interfaces protéine-protéine. Nous avons créé un ensemble non-redondant et représentatif de 187 complexes protéine-ADN à haute résolution, comprenant aussi les conformations non liées de 82 protéines. Cette base de données peut servir de référence dans le domaine. Nous avons mené une analyse exhaustive des propriétés de séquence et structurels des interfaces protéine-ADN/ARN et nous les avons comparé avec les propriétés des interfaces protéine-protéine et celles des régio

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4

Fradin, Aurelie. "Identification des modifications post-traductionnelles d'Ilf3 (Interleukin enhancer binding factor 3) et de NF90 (Nuclear Factor 90) et étude de leur rôle(s) fonctionnel(s)." Thesis, Paris 6, 2014. http://www.theses.fr/2014PA066222/document.

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Abstract:

Ilf3 et NF90, deux protéines de liaison aux ARN localement structurés en double-brin, sont générées par épissage mutuellement exclusif à partir du gène ILF3. Pour chacune d’entre-elles, un épissage alternatif permet la synthèse de deux isoformes, une longue et une courte, qui diffèrent par la présence ou non d’une séquence de 13 acides aminés localisée à leur extrémité N-terminale et qui correspond à un signal de localisation nucléolaire. La particularité de ces deux protéines est de présenter une forte hétérogénéité avec au moins 20 isoformes produites à partir du même gène, 12 pour Ilf3 et 8

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Viard, Julia. "Identification et manipulation d’interactions protéines - protéines codées par des gènes impliqués dans des synaptopathies." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2016. http://www.theses.fr/2016SACLE033.

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Abstract:

De nombreuses maladies neurodéveloppementales ont une architecture génétique complexe impliquant de nombreux gènes dérégulés et sont caractérisées par des anomalies de la synapse. Afin de mieux caractériser comment ces diverses altérations génétiques résultent dans des phénotypes synaptiques, nous nous sommes intéressés à l’analyse des interactions protéines – protéines codées par ces différents gènes pour tenter d’identifier des voies moléculaires dérégulées au niveau de la synapse.Dans cet objectif, ce travail de thèse s’est intéressé à deux synaptopathies, la déficience intellectuelle dans

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6

Bachiri, Kamel. "Identification des interactions oncogéniques du Polyomavirus à cellules de Merkel." Electronic Thesis or Diss., Université de Lille (2022-....), 2023. http://www.theses.fr/2023ULILS113.

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Abstract:

Le carcinome à cellules de Merkel (CCM) est un cancer de la peau agressif et de très mauvais pronostic. Ce cancer est lié à la présence du Polyomavirus à cellules de Merkel dans 80% des cas. Ce Polyomavirus exprime deux oncoprotéines virales : sT et LT tronquée. L'expression des deux antigènes T est suffisante à l'émergence du cancer et responsable de la perturbation de checkpoints de signalisation, de la modification du profil épigénétique et de l'évasion immunitaire. L'interactomique et la protéomique nous ont permis d'identifier de nombreux facteurs épigénétiques en relation avec les antigè

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7

Ben, Salah Iskandar. "Les mycobactéries du complexe Mycobacterium avium : identification et interactions avec les amibes libres." Aix-Marseille 2, 2009. http://www.theses.fr/2009AIX20682.

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Abstract:

Les amibes libres sont des eucaryotes unicellulaires qui hébergent des mycobactéries environnementales. Cette association permet aux mycobactéries de résister aux conditions défavorables après sélection de stratégies de contournement de la phagocytose au profit des mycobactéries qui utilise les amibes comme “cheval de Troie”. Nous avons montré que 26 espèces de mycobactéries étaient capables de survivre dans les trophozoïtes et dans les kystes d’Acanthamoeba polyphaga. Nous avons ensuite sélectionné les mycobactéries du complexe Mycobacterium avium (MAC) comme prototypes des interactions avec

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8

Verreman, Kathye. "Identification et caractérisation de nouveaux partenaires du facteur de transcription ERM." Thesis, Lille 1, 2009. http://www.theses.fr/2009LIL10057/document.

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Abstract:

ERM est un facteur de transcription de la famille ETS appartenant au groupe PEA3 qui joue un rôle important dans divers processus biologiques dont la tumorigenèse mammaire. La régulation de son activité transcriptionnelle nécessite des modifications post-traductionnelles et des interactions avec des partenaires. Nous avons mis au point différentes techniques de chromatographie d’affinité dans le but d’identifier de nouveaux partenaires d’ERM. Parmi ceux-ci, trois ont été confirmés comme partenaires directs d’ERM : la protéine CoAA (CoActivator Activator) et les protéines MED23 et MED25. MED23

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9

Michaux, Charlotte. "Identification et caractérisation fonctionnelle de petits ARN non codants chez Enterococcus faecalis et analyse d'une protéine "RNA-binding"." Caen, 2013. http://www.theses.fr/2013CAEN2094.

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10

Tahir, Shifa. "A docking-based method for in silico epitope determination." Thesis, Tours, 2018. http://www.theses.fr/2018TOUR4008.

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Abstract:

Le développement des anticorps thérapeutiques s'est rapidement accéléré dans les 10 dernières années et concerne un nombre croissant de pathologies. La connaissance de l'épitope, à savoir la région de la cible à laquelle l'anticorps se fixe, est essentielle pour la compréhension des effets fonctionnels de ce dernier. Nous avons développé une méthode in silico, MAbTope, qui permet une prédiction précise de cet épitope, quand bien même aucune structure 3D de l'anticorps d’intérêt n'est résolue. Cette méthode se base sur une méthode d'amarrage protéine-protéine développée auparavant dans l’équipe

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Guermann, Benoît. "Identification et étude fonctionnelle d'une famille de proréines mitochondriales à motif RRM chez les plantes supérieures." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2004. http://www.theses.fr/2004STR13084.

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Choul-Li, Souhaila. "Le facteur de transcription Ets-1 : identification de nouveaux partenaires protéiques et étude du clivage par les caspases." Thesis, Lille 1, 2009. http://www.theses.fr/2009LIL10099/document.

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Abstract:

Ets-1 est un facteur de transcription qui régule des gènes impliqués dans divers processus physiologiques et pathologiques. Il n’agit pas seul au niveau de ses promoteurs cibles mais en coopération avec une variété de partenaires protéiques. L’identification de nouvelles protéines interagissant avec Ets-1 devrait nous permettre de mieux appréhender certaines de leurs fonctions intrinsèques. Dans ce but, nous avons mis au point une stratégie de purification par affinité des partenaires protéiques d’Ets-1. Ceci nous a permis d’identifier et de confirmer comme partenaires d’interaction d’Ets-1, l

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Bichraoui, Hicham. "Identification de nouveaux déterminants moléculaires de l'interaction du récepteur des dihydropyridines avec le récepteur à la ryanodine." Université Joseph Fourier (Grenoble), 2010. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00615499.

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Abstract:

L'excitation nerveuse d'une cellule musculaire produit une libération massive dans le cytoplasme du Ca2+ stocké dans le réticulum sarcoplasmique (RS). L'augmentation de la concentration cytoplasmique de Ca2+ déclenche la contraction. Ce processus, appelé couplage excitation contraction (CEC), requiert des interactions physiques entre deux canaux calciques: (1) le récepteur des dihydropyridines (DHPR), un canal calcique activé par le voltage ; le DHPR est composé de plusieurs sous-unités, dont la sous-unité α1S, qui forme le canal et le détecteur de potentiel, et la sous-unité ß1a, entièrement

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Bichraoui, Hicham. "Identification de nouveaux déterminants moléculaires de l'interaction du récepteur des dihydropyridines avec le récepteur à la ryanodine." Grenoble 1, 2010. http://www.theses.fr/2010GRENV025.

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Abstract:

L'excitation nerveuse d'une cellule musculaire produit une libération massive dans le cytoplasme du Ca2+ stocké dans le réticulum sarcoplasmique (RS). L'augmentation de la concentration cytoplasmique de Ca2+ déclenche la contraction. Ce processus, appelé couplage excitation contraction (CEC), requiert des interactions physiques entre deux canaux calciques: (1) le récepteur des dihydropyridines (DHPR), un canal calcique activé par le voltage ; le DHPR est composé de plusieurs sous-unités, dont la sous-unité α1S, qui forme le canal et le détecteur de potentiel, et la sous-unité ß1a, entièrement

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Cossé, Mathilde. "Identification et caractérisation d'un nouvel effecteur précoce de Chlamydia trachomatis." Thesis, Paris 6, 2016. http://www.theses.fr/2016PA066083/document.

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Abstract:

C. trachomatis est une bactérie Gram-négative intracellulaire obligatoire et un pathogène humain. Première cause de maladie sexuellement transmissible d'origine bactérienne, elle est également responsable, dans les pays en développement, d'infections oculaires pouvant conduire à la cécité (trachome). Son cycle de développement bi-phasique a lieu au sein d'un compartiment appelé inclusion. Grâce à un système de sécrétion de type 3 (SST3), Chlamydia sécrète des protéines dans le cytosol de la cellule afin de promouvoir sa survie et sa multiplication. Ces protéines sont désignées sous le terme d'

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Desjobert, Cécile. "L'intégrase du virus de l'immunodéficience humaine de type 1 : identification de ligands protéiques et peptidiques : étude de ces interactions physiques et fonctionnelles." Bordeaux 2, 2005. http://www.theses.fr/2005BOR21204.

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Abstract:

Le SIDA est un problème de santé publique mondial. L'intégrase catalyse une étape cruciale du cycle infectieux du VIH-1 : l'intégration de l'ADN viral dans le génome cellulaire. L'IN constitue donc une cible intéressante, qui n'est pas encore utilisée dans les thérapies actuelles. De plus, elle interagit avec des facteurs au sein du complexe de préintégration (CPI), qui optimisent ses activités dans le noyau. Ces partenaires ne sont pas tous identifiés et leur effet sur l'IN n'est pas compris. Nous avons étudié les interactions entre l'IN et la RT, car ces deux enzymes virales sont présentes d

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Cossé, Mathilde. "Identification et caractérisation d'un nouvel effecteur précoce de Chlamydia trachomatis." Electronic Thesis or Diss., Paris 6, 2016. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2016PA066083.pdf.

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Abstract:

C. trachomatis est une bactérie Gram-négative intracellulaire obligatoire et un pathogène humain. Première cause de maladie sexuellement transmissible d'origine bactérienne, elle est également responsable, dans les pays en développement, d'infections oculaires pouvant conduire à la cécité (trachome). Son cycle de développement bi-phasique a lieu au sein d'un compartiment appelé inclusion. Grâce à un système de sécrétion de type 3 (SST3), Chlamydia sécrète des protéines dans le cytosol de la cellule afin de promouvoir sa survie et sa multiplication. Ces protéines sont désignées sous le terme d'

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Bichraoui, Hicham. "IDENTIFICATION DE NOUVEAUX DETERMINANTS MOLECULAIRES DE L'INTERACTION DU RECEPTEUR DES DIHYDROPYRIDINES AVEC LE RECEPTEUR A LA RYANODINE." Phd thesis, Université de Grenoble, 2010. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00615499.

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Abstract:

L'excitation nerveuse d'une cellule musculaire produit une libération massive dans le cytoplasme du Ca2+ stocké dans le réticulum sarcoplasmique (RS). L'augmentation de la concentration cytoplasmique de Ca2+ déclenche la contraction. Ce processus, appelé couplage excitation contraction (CEC), requiert des interactions physiques entre deux canaux calciques : (1) le récepteur des dihydropyridines (DHPR), un canal calcique activé par le voltage ; le DHPR est composé de plusieurs sous-unités, dont la sous-unité α1S, qui forme le canal et le détecteur de potentiel, et la sous-unité β1a, entièrement

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Dreno, Luce. "Identification et caractérisation fonctionnelle de la forme cytosolique de la protéine FKBP7 dans le cancer de la prostate chimiorésistant par une approche cellulaire et structurale." Electronic Thesis or Diss., université Paris-Saclay, 2024. http://www.theses.fr/2024UPASL001.

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Abstract:

La résistance aux chimiothérapies représente toujours un frein dans la prise en charge thérapeutique des stades avancés des cancers de la prostate (CaP). Notre équipe a précédemment identifié la protéine FKBP7, une peptidyl prolyl cis- trans isomérase encore largement méconnue de la famille des FKBPs, comme cible thérapeutique potentielle dans le CaP chimiorésistant. FKBP7 est surexprimée dans les modèles chimiorésistants de CaP et son inhibition diminue la prolifération tumorale in vitro et in vivo. Enfin, elle interagit avec la sous-unité eIF4G du complexe d’initiation de la traduction eIF4F

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Mendes, Tiago. "Identification of the modulators of and the molecular pathways involved in the BIN1-Tau interaction." Thesis, Lille 2, 2018. http://www.theses.fr/2018LIL2S033/document.

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Abstract:

Les principales caractéristiques neuropathologiques de la maladie d’Alzheimer (MA) sont les plaques séniles extracellulaires composées de peptide amyloïde β (Aβ) et les enchevêtrements neurofibrillaires intracellulaires composés de Tau hyperphosphorylé. Les mécanismes conduisant à la formation de ces lésions sont encore peu connus et le laboratoire a récemment caractériser le gène “bridging integrator 1” (BIN1), deuxième facteur de risque génétique le plus associé au risque de MA, comme facteur de risque potentiellement associé à la pathologie Tau. Une interaction entre les deux protéines a ét

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Fournel, Tutik. "Production of recombinant E6 protein of HPV type 16 responsible for cervical cancers : identification and characterization of specific interaction between E6 protein and four-way DNA junctions." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2001. http://www.theses.fr/2001STR13171.

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Lussier, Marc. "Identification et caractérisation de nouveaux partenaires d'intéraction liant le domaine de répétitions similaires à l'ankyrine des TRPCs." Thèse, Université de Sherbrooke, 2008. http://savoirs.usherbrooke.ca/handle/11143/4261.

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Abstract:

Le Ca[exposant]2+ joue un rôle majeur dans la régulation de processus physiologiques et biochimiques de l'organisme. Chez les cellules non-excitables, les TRPCs (transient receptor potential canonical) sont des canaux calciques impliqués dans l'influx de Ca[exposant]2+ à la membrane plasmique. Bien que de nombreux efforts soient déployés, le mécanisme régulant l'activité et le routage des TRPCs est encore mal connu. Au cours des dernières années, l'étude de domaines conservés au sein des protéines a connu un engouement. Tous les TRPCs possèdent un domaine de répétitions similaires à l'ankyrine

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Martin, Sophie. "Le composant des granules de stress G3BP : caractérisation phénotypique de souris KO, et identification de son interactome ribonucléoprotéique dans le cerveau de souris." Thesis, Montpellier 2, 2012. http://www.theses.fr/2012MON20247.

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Abstract:

Les protéines capables de lier des ARNs sont essentielles pour les différentes étapes de maturation de l'ARN messager (ARNm), en dirigeant leur localisation et leur devenir dans la cellule, et en formant avec les ARNs des particules ribonucléoprotéiques (mRNPs). Les mRNPS peuvent former des structures cellulaires dynamiques qui sont adressées vers des fonctions spécifiques. Ces granules, tels que les granules de stress formés suite à un stress cellulaire, contiennent des ARNm dont la traduction est inhibée et qui sont stockés transitoirement. Ma thèse a consisté en la caractérisation fonctionn

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Mirouze, Nicolas. "Identification du produit d'un gène tardif impliqué dans la régulation de la compétence et dans le processing de l'ADN lors de la transformation naturelle chez S. Pneumoniae." Toulouse 3, 2007. http://thesesups.ups-tlse.fr/144/.

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Abstract:

Streptococcus pneumoniae est une bactérie à Gram positif, pathogène de l'homme. Historiquement, elle est l'une des premières bactéries modèles utilisée en microbiologie. C'est par exemple chez S. Pneumoniae que le phénomène de transformation a été mis en évidence pour la première fois. La transformation naturelle représente la capacité qu'ont certaines bactéries à capter de l'ADN exogène dans leur milieu, à le faire entrer dans leur cytoplasme pour enfin l'intégrer dans leur génome. L'ensemble des machineries nécessaires pour le développement de la transformation n'est mis en place que si les

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Avet, Charlotte. "Étude des mécanismes contrôlant l'efficacité et la spécificité de la signalisation du récepteur de la GnRH : identification et rôle de la protéine partenaire SET." Thesis, Paris 11, 2013. http://www.theses.fr/2013PA11T091.

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Abstract:

La fonction de reproduction est sous le contrôle de la neurohormone hypothalamique GnRH qui régule la synthèse et la libération des gonadotropines hypophysaires. La GnRH agit par l’intermédiaire d’un récepteur couplé aux protéines G exprimé à la surface des cellules gonadotropes, le récepteur de la GnRH (RGnRH). Ce récepteur, chez les mammifères, a la particularité d’être dépourvu de queue C terminale ce qui le rend insensible aux systèmes classiques de désensibilisation. Ainsi, les mécanismes qui régulent l’efficacité et la spécificité de sa signalisation demeurent mal connus. Nous avons rech

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Jan, Gaëlle. "Le rôle d'une sérine-thréonine phosphatase de type 2C parasitaire (TgPP2C) dans l'interaction Toxoplasma gondii - cellule hôte : Identification des modules interactifs au sein du tricomplexe actine-toxofiline-TgPP2C et étude de ses propriétés fonctionnelles dans le parasite et la cellule infectée." Phd thesis, AgroParisTech, 2007. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00002663.

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Abstract:

Toxoplasma gondii, le protozoaire intracellulaire obligatoire responsable de la toxoplasmose, fait partie du phylum des Apicomplexa. Comme les autres membres de ce phylum, il a développé des propriétés mobiles particulières qui lui permettent de se déplacer et d'envahir très rapidement la cellule dans laquelle il se multiplie. Ces processus de locomotion et d'invasion sont dépendants du cytosquelette d'actine du parasite. Une protéine, la toxofiline, identifiée uniquement chez T. gondii, a été caractérisée au laboratoire comme étant capable de réguler la dynamique du cytosquelette d'actine. Pl

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Boissel, Laurent. "Étude de la voie de signalisation RalB dans le développement embryonnaire du Xénope : analyse fonctionnelle des domaines protéiques de l'effecteur XRLIP, et identification de ses partenaires." Paris 7, 2002. http://www.theses.fr/2002PA077029.

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Benhenda, Shirine. "Identification de nouveaux partenaires de la protéine HBx du virus de l'hépatite B et étude fonctionnelle de leur interaction avec HBx dans la réplication virale." Paris 7, 2010. http://www.theses.fr/2010PA077228.

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Abstract:

Malgré l'existence de vaccins efficaces, le nombre de patients chroniquement infectés par le virus de l'hépatite B (HBV) est en augmentation et les traitements actuels présentent une efficacité limitée. Parce que la protéine régulatrice HBx intervient dans la réplication virale et dans l'oncogenèse, elle représente une cible thérapeutique stratégique. L'interaction entre HBx et DDB1, une sous-unité du complexe E3 ligase Cul4/DDBl, est essentielle pour les activités d'HBx. Nous avons émis l'hypothèse qu'HBx pourrait détourner la machinerie E3 ligase. Dans un premier temps, nous avons isolé et i

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Delevoye, Cédric. "Identification de protéines sécrétées par Chlamydia et étude fonctionnelle d'une protéine insérée dans la membrane de la vacuole, à l'interface entre les bactéries et leur hôte." Paris 11, 2006. http://www.theses.fr/2006PA112017.

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Abstract:

Les Chlamydia sont des bactéries intracellulaires strictes dont trois espèces sont pathogènes pour l'Homme. Elles sont responsables, selon les souches, d'infections oculaires et génitales et d'infections respiratoires. Après avoir induit leur propre entrée, les bactéries se développent dans un compartiment délimité par une membrane, appelé inclusion. Au cours du cycle infectieux, les bactéries transloquent, par leur appareil de sécrétion de type trois (STT), des protéines dont certaines s'ancrent dans la membrane de l'inclusion où elles sont en contact avec le cytosol de la cellule hôte, les p

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Seissler, Tanja. "Inhibition traductionnelle du facteur de restriction APOBEC3G par la protéine Vif du VIH-1 : rôle d'une uORF dans la 5'-UTR de l'ARNm d'A3G et identification de facteurs cellulaires." Thesis, Strasbourg, 2019. http://www.theses.fr/2019STRAJ028.

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Abstract:

La protéine Vif du VIH-1 contrecarre le facteur de restriction APOBEC3G (A3G) en diminuant son niveau d'expression dans les cellules infectées. Ceci est mis en œuvre entre autres par l'inhibition de sa traduction, un mécanisme encore peu compris. La première partie de ma thèse contribue à la caractérisation d'une petite ORF (uORF) qui se situe dans la 5'-UTR de l'ARNm d'A3G et d'A3F en amont de leurs ORF respectives. Cette uORF s'est révélée cruciale pour la régulation de la traduction d'A3G en présence et absence de Vif. Dans la deuxième partie de cette thèse, différents protocoles ont été mi

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Côté-Martin, Alexandra. "Identification des partenaires protéiques de l'hélicase virale E1 du virus du papillome humain : caractérisation d'une nouvelle interaction avec la protéine à domaines WD p80." Thèse, 2007. http://hdl.handle.net/1866/15251.

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Tarasov, Kirill. "Searching for novel gene functions in yeast : identification of thousands of novel molecular interactions by protein-fragment complementation assay followed by automated gene function prediction and high-throughput lipidomics." Thèse, 2014. http://hdl.handle.net/1866/11824.

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Briot, Julie. "Identification biochimique et fonctionnelle des domaines structuraux d’une sous-unité des canaux calciques." Thèse, 2018. http://hdl.handle.net/1866/21202.

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