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Dissertations / Theses on the topic 'Macroinvertébés'

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Vanden, Bossche Jean-Pierre. "Typologie et qualité biologique du réseau hydrographique de Wallonie basées sur les assemblages des macroinvertébrés." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2005. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/210955.

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Abstract:
<p align="justify"><i>Typologie des cours d’eau en Wallonie et caractérisation par la faune invertébrée</i><br>Vingt-cinq types de cours d’eau ont été définis en Wallonie d’après les termes de la Directive Cadre pour l’Eau en tenant compte des facteurs obligatoires et optionnels rassemblés sous trois critères :la taille (du « ruisseau » à la « très grande rivière »), la pente (faible, moyenne et forte), et cinq régions naturelles (la région limoneuse, le Condroz, la Famenne, l’Ardenne et la Lorraine belge, résumant les facteurs obligatoires altitude, latitude, longitude et géologie). Une approche par analyses multivariées appliquées à un grand nombre d’échantillons (listes taxonomiques) a permis de définir de façon plus précise certains types de rivières et de distinguer sept groupes typologiques montrant des assemblages faunistiques similaires.</p><p><p align="justify"><i>Conditions de référence types et définition de l’état écologique des rivières en Wallonie à l’aide de métriques biocénotiques basées sur les invertébrés</i><br> Les listes faunistiques et les valeurs métriques de l’IBGN (Indice biologique global normalisé) issues du réseau d’évaluation de la qualité biologique en Wallonie ont été utilisées pour discriminer les types de rivières et pour définir les sites de référence, les conditions de référence et les limites des classes des états écologiques. Au sud du sillon Sambre et Meuse, impliquant quatre groupes typologiques de rivières, les valeurs de référence et la définition des états écologiques ont été basées et calculées sur un réseau de référence de sites de très bon état. Les « valeurs de conditions de référence » ont été définies par les médianes des métriques des sites de « très bon état ». Lorsque aucun site de très bon état n’était disponible, c’est-à-dire pour les groupes typologiques au nord du sillon Sambre et Meuse et pour la Meuse et la Sambre, les conditions de référence (ou le « potentiel écologique maximal ») et les limites de classes ont été basées sur des coefficients appliqués aux sites de « bon état » et sur jugement d’expert.</p><p><p align="justify"><i>Exercice pilote d’inter-étalonnage</i><br> Cinquante échantillons ont été sélectionnés parmi les rivières du type d’inter-étalonnage européen R-C3 (petite taille, altitude moyenne, substrat siliceux) en Wallonie (correspondant aux « ruisseaux ardennais ») dans toute la gamme de qualités écologiques, du « très bon » au « mauvais » état. Chaque métrique de l’indice « Intercalibration Common Metrics » (ICM) a été comparée (par régression linéaire et polynomiale) aux valeurs de l’IBGN. La plus forte corrélation a été établie avec l’indice synthétique de l’ICM dont le R² très élevé (0,95) permet un inter-étalonnage précis et fiable. A un EQR (Equivalent Quality Ratio) de l’IBGN = 1 correspond un indice ICM très proche (= 1,004). En conséquence, la métrique « cote de l’IBGN » est proposée comme métrique pour l’évaluation de l’état écologique de la faune invertébrée en Wallonie.</p><p><p align="justify"><i>Espèces exotiques et invasives</i><br>L’ouverture récente du canal à grand gabarit Main – Danube en 1992 et la navigation qui en résulte a permis à plusieurs espèces de macroinvertébrés ponto-caspiennes d’envahir successivement les bassins du Rhin et de la Meuse. De 1998 à 2000, le réseau de mesure a enregistré quatre nouvelles espèces exotiques dans la Meuse en Belgique :une polychète (<i>Hypania invalida</i>) et trois crustacés (<i>Hemimysis anomala, Dikerogammarus villosus, D. haemobaphes</i>). Peu avant, en 1995, le bivalve asiatique <i>Corbicula fluminea</i> et l’amphipode nord-américain <i>Crangonyx pseudogracilis</i> ont également été enregistrés pour la première fois. La dynamique des invasions a été étudiée et discutée.</p><p><p align="justify">L’<i>état biologique actuel</i> (2000-2002) des masses d’eaux de surface en Wallonie et l’évolution des états biologiques sur une décennie (1990-2002) figurent dans l’étude et sont discutés. Une amélioration globale de la qualité de 6 % est enregistrée pour cette période. L’amélioration de la qualité se manifeste principalement pour les états « mauvais » et « médiocre » s’élevant à l’état « moyen ».</p><p><p><b>Abstract</b><p><p><p align="justify"><i>River typology in Wallonia and invertebrate fauna characterization</i><br>Twenty-five river-types in Wallonia were defined according to the Water Framework Directive taking into account obligatory and optional factors gathered in three criteria: the size (from “brook” to “very large river”), the slope (gentle, medium and strong) and five natural regions (Loess, Condroz, Famenne, Arden and Jurassic summarising the obligatory altitude, latitude, longitude and geology factors). A multivariate approach applied to a large amount of samples (i.e. taxa lists) led to give a more accurate definition of some river-types and to discriminate seven river-type groups exhibiting similar faunal assemblages.</p><p><p align="justify"><i>Type-specific reference conditions and ecological status definition of rivers in Wallonia using invertebrate biocenotic metrics</i><br> Faunal lists and IBGN (i.e. "Standardized Global Biological Index IBGN") metric values, evolving from the biological quality assessment network in Wallonia, were used to discriminate the river types and to define the reference sites, the reference conditions and the status class limits. South of the axis made by the Sambre & Meuse Rivers, involving four river-type groups, reference values and ecological status definition were based and calculated on a reference network of sites of high status. The "reference condition values” were defined as the median values of the metrics in all “high status” sites. Where no site of high status was available, i.e. in the others river-type groups north of the same axis and in the Rivers Sambre and Meuse themselves, reference conditions (or maximum ecological potential) and class limits were based on coefficients applied to “good status” sites and on expert judgement.</p><p><p align="justify"><i>Intercalibration pilot exercise</i><br> Fifty samples were selected from R-C3 rivers (i.e. small, mid-altitude, siliceous) in Wallonia (corresponding to the “Arden’s brooks”) showing the widest range of ecological quality from high to bad status. Each Intercalibration Common Metric (ICM) was compared (linear and polynomial regression) to IBGN scores. The highest correlation was found with the synthetic ICM index, whose high R² (0.95) allows accurate and reliable intercalibration. To IBGN EQR (i.e. Equivalent Quality Ratio) = 1 corresponds a very close ICM index value (= 1.004). Consequently, the metric IBGN score is being proposed to act as the metric for the assessment of the invertebrate fauna ecological status in Wallonia, Belgium.</p><p><p align="justify"><i>Exotic and invasive species</i><br> The recent opening of the canal Danube – Main in 1992 and the subsequent navigation allowed several Ponto-Caspian macroinvertebrate species to invade successively the Rhine and the River Meuse basins. From 1998 to 2000, the monitoring network recorded four new alien species in the River Meuse in Belgium: one Polychaeta (<i>Hypania invalida</i>) and three Crustacea (<i>Hemimysis anomala, Dikerogammarus villosus, D. haemobaphes</i>). Earlier, in 1995, the Asian Bivalvia <i>Corbicula fluminea</i> and the North American Amphipod <i>Crangonyx pseudogracilis</i> were also recorded for the first time. The invasions’ dynamics were studied and discussed.</p><p><p align="justify"><i>Present biological status</i> (2000-2002) of surface water-bodies in Wallonia and biological status evolution over a one-decade period (1990-2002) is included and discussed in the study. A global quality improvement of 6 % is recorded for the period. Quality improvement concerns mainly the “bad” and “poor” status raising up to “moderate” status.</p><p><p><br>Doctorat en sciences, Spécialisation biologie animale<br>info:eu-repo/semantics/nonPublished
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Flüeler, Marie-Josèphe. "Etude des macroinvertébrés -surtout des diptères- pour trois ruisseaux de plaine." Grenoble 1, 1986. http://www.theses.fr/1986GRE10045.

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Abstract:
Pour 3 ruisseaux lents de plaine dans le departement de l'isere, les caracteres du milieu et la composition de la faune sont indiques. Les principaux facteurs qui determinent la repartition des especes sont examines
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Boiché, Anatole. "Conséquences de l'introduction de deux espèces végétales aquatiques exotiques (Elodea nuttallii et Elodea canadensis) sur les interactions plantes-macroinvertébrés." Thesis, Metz, 2010. http://www.theses.fr/2010METZ009S.

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Abstract:
Nous avons utilisé comme modèle biologique Elodea nuttallii et Elodea canadensis, plantes originaires d'Amérique du Nord et présente en France depuis le dix-neuvième siècle (E. canadensis) et les années 1950 (E. nuttallii). E. nuttallii est actuellement en phase d'expansion tandis que E. canadensis est considérée comme naturalisée en Europe. Notre objectif principal consiste à étudier les conséquences de l’invasion de E. nuttallii sur les communautés de macroinvertébrés. Nous avons d'abord étudié le rôle d'habitat de E. nuttallii et des plantes indigènes Ranunculus peltatus et Callitriche platycarpa pour les macroinvertébrés dans des ruisseaux qui diffèrent par leurs niveaux de trophie. Le principal résultat obtenu montre que le niveau de trophie des cours d'eau est le principal facteur influençant la répartition des invertébrés, l'espèce de macrophyte étant secondaire. E. nuttallii accueille des communautés d'invertébrés à la composition et à la structure intermédiaire par rapport à R. peltatus et C. platycarpa. Les propriétés architecturales des trois macrophytes auraient un rôle dans la répartition des invertébrés entre les différents herbiers. Parmi les invertébrés peuplant les macrophytes, les gammares ont un régime généraliste. Nous avons d'abord validé l’utilisation de Gammarus roeseli comme modèle pour tester l’appétence des macrophytes. Nous avons ensuite évalué l'évolution saisonnière de l'appétence des élodées et mis en évidence les mécanismes évolutifs qui permettent à une espèce invasive de proliférer et de s'intégrer dans les écosystèmes. E. canadensis alloue son énergie à la défense tandis que E. nuttallii a une stratégie de croissance végétative<br>We used the exotic macrophytes Elodea nuttallii and Elodea canadensis originating from North-America and introduced in France during the nineteenth century (E. canadensis) and during the 1950s (E. nuttallii). Elodea nuttallii is currently actively spreading whereas E. canadensis is now integrating most of the hydrosystems in Europe. Our main objective was to study the consequences of the invasion of E. nuttallii on the macroinvertebrate communities. We first studied the role of macrophytes as habitat with E. nuttallii and the indigenous species Ranunculus peltatus and Callitriche platycarpa in Northern Vosges streams that differ in their trophic levels. Our main result was that the trophic level had a greater influence than the plant species in the repartition of the macroinvertebrates. The macroinvertebrate community hosted by E. nuttallii was intermediate between the communities hosted by R. peltatus and C. platycarpa. Plant structural complexity appears to play a role in the repartition of the macroinvertebrates. Among the macroinvertebrates associated with the macrophytes, the gammarids have a broad generalist diet. We first validated the use of Gammarus roeseli as herbivores to assess plant palatability. Then, we measured the seasonal variations of the palatability of E. canadensis and E. nuttallii and the different evolutionary strategies that the plants had developed to invade or to integrate the ecosystems. E. canadensis allocates increased resource to defence whereas E. nuttallii allocates its resources mainly to vegetative growth
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Doledec, Sylvain. "Les peuplements de macroinvertébrés benthiques du cours inférieur de l'Ardèche : dynamique spatio-temporelle." Lyon 1, 1986. http://www.theses.fr/1986LYO19003.

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Abstract:
Principales caracteristiques physico-chimiques des eaux de l'ardeche et leurs variations saisonnieres. Nature des peuplements de macroinvertebres benthiques, succession temporelle, distribution spatiale des organismes
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Cellot, Bernard. "Dérive et flux du matériel organique, notamment des macroinvertébrés, dans une grande rivière européenne." Lyon 1, 1996. http://www.theses.fr/1996LYO10002.

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Abstract:
Ce travail, presente sur publications, fait le bilan de 15 annees de recherche sur la structure et le fonctionnement d'une grande riviere medio-europeenne dans le cadre des theories ecologiques modernes appliquees aux eaux courantes. La prise en compte des matieres organiques en suspension (dissoutes et particulaires) et de la derive des organismes vivants (notamment des macroinvertebres benthiques) a permis d'obtenir des resultats originaux. Ceux-ci concernent: (i) la variabilite spatiale et temporelle des ecosystemes lotiques, (ii) la relation entre derive et benthos en place, ainsi que (iii) la connectivite et les flux dans le cours principal du rhone. L'etude de la variabilite spatio-temporelle a ete effectuee a deux echelles. La relation entre la derive et le benthos a ete etudiee pour 3 elements differents. L'hypothese de connectivites fonctionnelles a ete testee sur la derive et les flux du materiel organique. Dans le cadre du river continuum concept (rcc), le rhone s'inscrit en definitive dans un fonctionnement controle en priorite par l'amont, avec une relative independance des connectivites laterales, ses plaines d'inondation ne constituant pas apparemment une source de matieres organiques a l'echelle de nos mesures. Les flux de derive demontrent neanmoins, dans le contexte du patch dynamics concept (pdc), le role fonctionnel des rives dans l'organisation des communautes et des populations de macro-invertebres benthiques des ecosystemes lotiques de grands fleuves
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Guérold, François. "L'acidification des cours d'eau : impact sur les peuplements de macroinvertébrés benthiques : application au massif Vosgien." Metz, 1992. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/UPV-M/Theses/1992/Guerold.Francois.SMZ9243.pdf.

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Abstract:
L'acidification des eaux de surface, conséquences des émissions anthropiques de SO2 et NOX a été appréhendée dans le massif Vosgien. Deux approches ont été adoptées. Une étude spatiale du phénomène, comprenant un descriptif des facteurs physico-chimiques et des peuplements de 34 cours d'eau, et un suivi de l'évolution temporelle des paramètres chimiques et des peuplements. Il a ainsi été mis en évidence que de nombreux ruisseaux présentent des chimismes atypiques soit temporairement soit en permanence. Les ruisseaux acides sont caractérisés par des concentrations élevées en protons et en aluminium une alcalinite résiduelle ou nulle et des eaux très faiblement mineralisées. Dans de tels cours d'eau, les peuplements de macroinvertébrés benthiques sont profondement modifiés. Tous les groupes faunistiques majeurs sont affectés. Mollusques, crustacés et éphéméroptères disparaissent totalement en milieu acidifié. Diptères, coléoptères et trichoptères affichent une réduction significative des richesses et abondances, tandis que les plécoptères, bien que moins diversifiés peuvent être dominants avec les oligochètes. Au total de 50 à 70% des taxa ne sont plus retrouvés dans les ruisseaux acidifiés. Une approche écophysiologique a montré que les mécanismes de régulation ionique sont perturbés chez certaines espèces sensibles<br>The acidification of streamwaters has been investigated in the Vosges Mountains in terms of physico-chemical characteristics and macroinvertebrates communities. A spatial as well as temporal survey of streams has shown that acid waters are charactized by very low alcanity, low pH, low mineralisation and high Al concentrations. In such stream all the major faunistic groups are affected. Molluscs, crustaceans and ephemeroptera have completely disappeared, diptera, trichoptera and coleoptera abundances and richnesses are strongly reduced. Plecoptera richness is lower but this group may be on the most abundant in acid waters. We have demonstrated that some sensitive species show osmoregulatory failures
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Berrahou, Ali. "Répartition longitudinale des macroinvertébrés benthiques du Rhône français et sa relation avec les principaux affluents." Lyon 1, 1993. http://www.theses.fr/1993LYO10178.

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Abstract:
Le present travail s'interesse aux peuplements de macroinvertebres du rhone francais depuis geneve jusqu'a arles, en relation avec ses principaux affluents. Il porte une attention particuliere a la typologie et a la possibilite d'influence des dix principaux affluents. L'etude est basee essentiellement sur les analyses multivariees des donnees faunistiques recueillies au cours de trois campagnes (avril-mai, juillet-aout et aout-septembre 1991) au moyen de deux techniques de prelevement (epuisette et substrats artificiels). Dans le cadre amont-aval du systeme rhone-affluents, le haut rhone demeure assez proche des affluents lotiques. Apres la confluence de la saone, le fleuve semble acquerir de facon quasi definitive les caracteristiques faunistiques de la saone. Il est ensuite peu influence par ses affluents, meme les plus rhithroniques comme l'eyrieux et la drome. En definitive, la tendance generale evolue dans un sens lenitique de l'amont vers l'aval. Trois secteurs amorcent une faible tendance inverse: jons sous l'effet des apports a tendance rhithronique du guiers et de l'ain, pont-saint-esprit sous l'influence de l'ardeche et tarascon par un appauvrissement faunistique, en particulier des taxons limnophiles
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Mathuriau, Catherine. "Les macroinvertébrés des cours d'eau andins du Sud-Ouest de la Colombie : écologie et bioindication." Toulouse 3, 2002. http://www.theses.fr/2002TOU30237.

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Fruget, Jean-François. "L'aménagement du bas-Rhône : évolution du fleuve et influence sur les peuplements de macroinvertébrés benthiques." Lyon 1, 1989. http://www.theses.fr/1989LYO10206.

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Abstract:
Une revue de l'influence de l'amenagement du bas-rhone, sur les differentes composantes de l'hydrosysteme, de lyon a beaucaire-tarascon, a ete realisee. L'analyse de cartes dressees a differentes epoques et l'examen des paysages fluviaux actuels permettent de retracer leur evolution morphologique et dynamique. L'examen de divers parametres physico-chimiques laisse apparaitre une evolution inverse au cours du temps des apports organiques et mineraux, les premiers diminuant tandis que les seconds augmentent (en particulier les formes de l'azote et les phosphates). L'amenagement a toutefois induit des variations significatives du regime thermique du fleuve, variables selon l'echelle consideree: intra-amenagement, inter-amenagement, intra-ensemble fonctionnel. Les peuplements macrobenthiques du chenal des differentes unites fonctionnelles apparaissent composes d'especes potamo-lenitiques, ainsi que d'especes plus eurytopes et polluotolerantes. Le bas-rhone a ainsi derive vers un type potamique lent a la suite de l'uniformisation des conditions mesologiques des differents briefs, de facon similaire a de nombreux grands cours d'eau medio-europeens en particulier. Les variations de la composition faunistique des differents secteurs revelent des modifications locales, mais pas de maniere suffisante pour mettre en evidence un changement structurel longitudinal de grande ampleur. Ce sont surtout des modifications de proportions des especes qui sont enregistrees. L'etude temporelle d'un amenagement precis a revele l'existence de trois periodes biologiques distinctes
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Nadon, Daniel. "Abondance et spectre de taille des macroinvertébrés benthiques lotiques en relation avec l'abondance du périphyton." Thesis, University of Ottawa (Canada), 1993. http://hdl.handle.net/10393/6876.

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Abstract:
Twelve streams of the Ottawa-Hull area were sampled between May 9, 1990 and August 1, 1991 to examine how benthic macroinvertebrate biomass and size spectra varied in relation to periphyton biomass. Among sites, non-filter-feeding macroinvertebrate biomass is correlated positively to periphyton biomass. This relation is defined by the regression equation: Log(BNF) = 1.64 + 0.41*Log(peri) (r$\sp2$ = 0.50, F = 9.9, p = 0.01, S$\sp2$ = 0.15, n = 12). The logarithm of the mean annual periphyton biomass explains 50% of the variance encountered in the logarithm of the mean annual non-filter-feeding macroinvertebrate biomass. This figure goes up to 70% if only samples collected between mid-July and mid-August are considered. The normalized size spectra of all benthic macroinvertebrates from city streams is shifted to the right along the abcissa compared to the normalized size spectra of other streams. This shift indicates a greater individual average weight for macroinvertebrates in city streams compared to macroinvertebrates from Gatineau Park. This shift is not solely related to the eutrophic level of the stream. Other studies in controlled environments will be needed to determine the cause of this shift.
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Floury, Mathieu. "Analyse des tendances d'évolution de peuplements de macroinvertébrés benthiques dans un contexte de réchauffement des eaux." Phd thesis, Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00844377.

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Abstract:
Les effets du changement climatique sur la biodiversité à l'échelle du globe sont maintenant sans équivoque. Parmi les écosystèmes affectés, les cours d'eau sont particulièrement vulnérables aux fluctuations du climat. Les modifications de structure et de composition des communautés aquatiques constituent alors un signal intégrateur des réponses écologiques à ces changements climatiques. Dans certaines circonstances, ce signal peut également être exacerbé, modéré ou potentiellement masqué par d'autres variations abiotiques.L'objectif de ce travail de thèse était donc d'évaluer l'effet relatif de différents facteurs de forçage sur les tendances d'évolution à long-terme des communautés de macroinvertébrés benthiques de grands cours d'eau, dans un contexte de changement climatique global. Nos investigations ont ciblé plus spécifiquement la Loire moyenne car, en tant que grande rivière de plaine, elle est particulièrement concernée par les problèmes liés aux stress multiples. En ce qui concerne le choix du compartiment biologique, la faune benthique a été sélectionnée pour son intérêt reconnu en bioévaluation des cours d'eau, notamment grâce à une grande diversité de réponses potentielles aux perturbations environnementales et à un certain nombre d'avantages méthodologiques.Dans un premier temps, nous nous sommes appliqués à caractériser les modifications temporelles de dix paramètres abiotiques majeurs sur trois décennies (1977-2008). Nous avons notamment mis en évidence le réchauffement graduel de la Loire (c. +1,2°C en moyenne annuelle sur les trois décades), couplé à une réduction significative du débit moyen (c. -25%), les deux tendances étant exacerbées en période chaude (mai-août). Dans le même temps, alors que ces modifications étaient susceptibles de provoquer une augmentation du niveau trophique du fleuve, nous avons souligné l'existence d'un effet confondant de l'amélioration des traitements d'épuration (i.e. réduction des apports en phosphore), se traduisant principalement par la baisse des concentrations en phosphates et la limitation des organismes phytoplanctoniques.Dans un second temps, nous nous sommes intéressés aux réponses structurelles et fonctionnelles long-terme (i.e. 30 ans) des invertébrés de la Loire à ces deux évolutions concomitantes majeures. En premier lieu, nous avons constaté que le réchauffement et, dans une moindre mesure, la réduction du débit sont impliqués dans la disparition ou le déclin progressif de taxons rhéophiles et psychrophiles (e.g. Chloroperlidae). En parallèle, ces modifications hydroclimatiques expliquent une majeure partie de l'apparition et de la colonisation de taxons limnophiles et thermophiles, comprenant certaines espèces invasives (e.g. Corbicula sp.). En termes de réponses fonctionnelles, ces changements s'illustrent par une évolution adaptative des profils de traits biologiques cohérente avec les prédictions a priori qu'il est possible de faire dans un cadre théorique. Toutefois, cette dérive progressive vers un assemblage généraliste et polluotolérant est partiellement confondue par l'amélioration de la qualité d'eau, qui explique l'apparition de nouveaux taxons polluo-sensibles lors des dernières années (e.g. Philopotamidae). Bien qu'aucune résilience taxonomique ou fonctionnelle ne soit constatée, cette tendance se manifeste, via les traits biologiques, par un transfert probable des ressources trophiques depuis les organismes phytoplanctoniques vers des biofilms épibenthiques et des macrophytes.Pour finir, nous avons exploré la variabilité spatiale multi-sites de ces tendances biotiques et abiotiques et montré que l'ensemble de ces résultats, qui corrobore déjà un certain nombre d'observations en Europe, constitue également un patron homogène le long de la Loire moyenne (sur près de 300 km) et entre différents hydrosystèmes (e.g. Loire, Seine, Meuse).
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Gaschignard-Fossati, Odile. "Répartition spatiale des macroinvertébrés benthiques d'un bras vif du Rhône : rôle des crues et dynamique saisonnière." Lyon 1, 1986. http://www.theses.fr/1986LYO19029.

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Abstract:
Etude realisee dans un bras amenage du haut-rhone francais, le canal de minibel (ain) de nov. 81 a nov. 82. La 1**(e)re partie situe le travail dans le cadre geographique et presente une rapide synthese des resultats connus concernant les impacts observes en aval des barrages. Apres une etude faunistique decrivant les repartitions transversales et verticales des macroinvertebres et l'effet des crues, la derniere partie compare les principaux resultats obtenus aux donnees anterieures concernant la macrofaune du rhone
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Sor, Ratha. "Modélisation des changements spatio-temporels des communautés de macroinvertébrés benthiques dans les rivières d'Asie et d'Europe." Thesis, Toulouse 3, 2017. http://www.theses.fr/2017TOU30148/document.

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Abstract:
Objectifs généraux: les systèmes fluviaux tropicaux et tempérés d'eau douce sont connus pour soutenir différentes communautés biotiques. Dans cette étude, menée dans une région d'Asie tropicale et dans une région d'Europe tempérée, j'ai étudié la composition et la diversité de la communauté des macro-invertébrés benthiques ainsi que leurs variations spatiales et temporelles. J'ai également examiné les influences des variables physico-chimiques de la qualité de l'eau sur les variations et la diversité de la composition de la communauté et j'ai modélisé l'occurrence d'espèces sélectionnées. Localisation géographique: Asie tropicale: le bassin aval du Mékong (LMB), couvrant une superficie de 609 000 km2; Europe tempérée: Europe occidentale, fleuves flamands (Belgique), couvrant une superficie de 13 787 km2. Matériel et méthodes: Pour le LMB, les données recueillies de 2004 à 2008 ont été utilisées et les valeurs médianes de cette période ont été analysées. Pour les rivières flamandes, les données collectées de 1991 à 2010 ont été utilisées. Les données ont été divisées en 4 périodes: D1: 1991-1995, D2: 1996-2000, D3: 2001-2005 et D4: 2006-2010. Les médianes de chaque période ont été utilisées pour des analyses spatiales détaillées. Des analyses multivariées ont été appliquées pour relier la composition et la diversité de la communauté aux variables physico-chimiques. Cinq techniques de modélisation, à savoir la régression logistique (LR), les Random Forest (RF), le Support Vector Machine (SVM), les réseaux de neurones artificiels (ANN) et les arbres de classification (CT) ont été utilisées pour modéliser l'occurrence desespèces sélectionnées. Principaux résultats: Variations de la composition des communautés, diversité et relation avec les variables environnementales Dans le cours aval du Mékong LMB, 299 taxons de macro-invertébrés distribués dans 196 genres et 90 familles ont été identifiées; dont 131 insectes, 98 mollusques, 38 crustacés et 32 annélides<br>Overall aims: Freshwater tropical and temperate river systems are known to support different biotic communities. In this study, I investigated benthic macroinvertebrate community composition and diversity and its spatial and temporal variation both in tropical Asian and temperate European regions. I also examined the influences of physical-chemical water quality variables on community composition, variations and diversity, and modelled the occurrence of selected species. Locations: Tropical Asia: the Lower Mekong Basin (LMB), covering an area of 609,000 km2; Temperate Europe: Western Europe, Flemish rivers (Belgium), covering an area of 13,787 km2. Materials and Methods: For the LMB, data collected from 2004 to 2008 were used, and median values of this period were analysed. For Flemish rivers, data collected from 1991 to 2010 were used. The data were divided into 4 periods: D1: 1991-1995, D2: 1996-2000, D3: 2001-2005 and D4: 2006-2010. The medians of each period were used for detailed spatial analyses. Multivariate analyses were applied to relate community composition and diversity to physical-chemical variables. Five modelling techniques namely Logistic Regression (LR), Random Forest (RF), Support Vector Machine (SVM), Artificial Neural Network (ANN) and Classification Tree (CT) were used to model the occurrence of selected species. Main results: Community composition variations, diversity and relationship with environmental variables From the LMB, 299 macroinvertebrate taxa belonging to 196 genera and 90 families were identified: 131 insects, 98 molluscs, 38 crustaceans, and 32 annelids
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Tenkiano, Nathalie Sia Doumbou. "Macroinvertébrés benthiques et hyphomycètes aquatiques : diversité et implication dans le fonctionnement écosystémique des cours d'eau de Guinée." Thesis, Toulouse 3, 2017. http://www.theses.fr/2017TOU30143/document.

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Abstract:
Macroinvertébrés benthiques et hyphomycètes aquatiques représentent une part importante de la biocénose des cours d'eau de tête de bassin. D'un point de vue écologique, ils participent au recyclage du carbone organique à travers leur implication dans certaines fonctions écosystémiques telles que la décomposition de la litière. Ce processus est vital pour les cours d'eau forestiers ou bordés de ripisylve. Si celui-ci est aujourd'hui bien étudié en milieu tempéré, la contribution des deux types de décomposeurs (champignons et invertébrés) reste mal comprise en milieu tropical du fait de la variabilité éco-géographique prononcée de ce biome. Cette thèse qui concernait deux régions de Guinée jusque-là inexplorées, la Guinée Forestière et la Haute-Guinée, avait un double objectif. D'une part, il s'agissait de documenter la diversité taxonomique et trophique des communautés de macroinvertébrés benthiques et la composition des assemblages d'hyphomycètes aquatiques. D'autre part, la thèse visait à caractériser le processus de décomposition de la litière et les communautés de décomposeurs associés, notamment dans une perspective de quantification de la contribution de chacun des deux groupes. Cette dernière étude répondait ainsi à l'hypothèse d'une plus grande importance des décomposeurs fongiques aux faibles latitudes en comparaison des latitudes élevées où l'activité des décomposeurs invertébrés est prépondérante. Une étude exploratoire menée sur 12 rivières a révélé une diversité de 45 taxons correspondant à la faune macrobenthique de l'Afrique de l'Ouest, et incluant un nouveau taxon de crustacé pour la Guinée. Les deux régions d'étude se différenciaient dans la composition des groupes trophiques : les déchiqueteurs, essentiellement représentés par les crevettes, étaient dominants dans les cours d'eau de Guinée Forestière, et les racleurs abondaient dans ceux de savane en Haute-Guinée, caractérisés par une faible densité de la végétation riveraine. Par ailleurs, les prélèvements d'eau et d'écume ont décelé la présence de 29 espèces d'hyphomycètes aquatiques. A ces espèces viennent s'ajouter 9 autres identifiées sur les litières lors des expériences de décomposition portant ainsi à 38 le nombre d'espèces identifiées pour la Guinée au cours de cette thèse, dont 12 sont nouvelles pour le continent africain. Les expériences menées dans les deux régions montrent une décomposition rapide, probablement en partie liée à la forte teneur en nutriments des litières, et une faible diversité des décomposeurs associés. Dans les deux cours d'eau temporaires de savane étudiés, les invertébrés associés aux litières étaient absents. Comme une compensation, l'activité des champignons était accrue, lesquels accumulaient une biomasse mycélienne très élevée. La présence de déchiqueteurs potentiels a été notée dans les deux cours d'eau étudiés de Guinée Forestière mais leurs densités étaient faibles. Dans les deux régions, la différence entre les taux de décomposition totale et microbienne était faible, soulignant une importance minime des invertébrés et un rôle majeur des champignons et confirmant notre hypothèse. Il a également été montré au cours de cette thèse que les asséchements des cours d'eau avaient peu d'influence sur le taux de décomposition de la litière. Par ailleurs, une faible diversité des organismes décomposeurs, invertébrés et hyphomycètes aquatiques, ne semble pas altérer le processus de décomposition. Ainsi les lois générales basées sur les facteurs déterminants de la décomposition des litières tels que la qualité du matériel végétal ou un rôle équilibré entre les deux types de décomposeur, ne sont pas nécessairement transposables aux milieux tropicaux. Enfin, les résultats de cette thèse suggèrent que les conséquences du changement climatique sur le recyclage du carbone organique dans les eaux d'Afrique de l'Ouest, région prédite comme très affectée, pourraient être tempérées par la prédominance d'organismes peu vulnérables<br>Benthic macroinvertebrates and aquatic hyphomycetes are major components of the biocenosis of headwater ecosystems. Both of them contribute to essential ecosystem functions like leaf litter decomposition as part of the organic carbon cycling. Such a process is vital for woodland streams or riparian tree-lined rivers. While this process is very well documented for temperate regions, the contribution of both types of decomposers, i.e. fungi and invertebrates, remains poorly understood in the tropics partly due to the large ecogeographic variability prevailing in this biome. The present thesis dealt with two unexplored regions of Guinea (Forested Guinea and Upper Guinea) and was motivated by a double objective. First, it aimed at documenting the taxonomic and trophic diversity of benthic macroinvertebrate communities together with the composition of aquatic hyphomycete assemblages. The second objective was to characterize leaf litter decomposition and leaf-associated decomposers, particularly in the perspective of quantifying the relative contribution of both decomposer types. The latter study specifically addressed the hypothesis of a greater importance of fungal decomposers at low latitudes compared to higher latitudes where the activity of invertebrate decomposers prevails. An exploratory survey conducted in 12 streams revealed the occurrence of 45 taxa belonging to the macrobenthic fauna of West Africa and including a new genus, Asellus, which completes the list of known crustacean taxa of Guinea. Both regions differed in the importance of the Functional Feeding Groups: shredders, mainly consisting in shrimps, dominated in Forested Guinea whereas scrapers were abundant in the savannah streams of Upper Guinea, which were characterized by scarce riparian vegetation. In stream water and foam, a total of 29 species of aquatic hyphomycetes were identified. Moreover, 9 additional species were found as sporulating on leaves in litter decomposition experiments, which led to a total of 38 species for Guinea with 12 being new for Africa. This thesis thus substantially expanded the list of known species for Africa. The experiments carried out in both regions showed a fast leaf litter decomposition, likely partly due to the high nutrient contents in litter, and a low diversity of leaf-associated decomposers. In the two studied temporary savannah streams, no leaf-associated invertebrates occurred. The latter was apparently compensated by a strong fungal activity as illustrated by very high mycelial biomass accrual. In the two studied streams of Forested Guinea, the occurrence of Caridina africana (Atyidae crustacean) as potential shredder could explain the leaf mass loss due to invertebrates, even though their density remained low. In both regions, the discrepancies between total and microbial decomposition rates were weak, highlighting a minute contribution of invertebrates and a major role of fungi thus supporting our hypothesis. The present results suggest that droughts resulted in low effects on the rate of leaf decomposition. Furthermore, leaf decomposition did not seem to be affected by the poor diversity of decomposers, i.e. invertebrates and aquatic hyphomycetes. Overall, the principles of leaf decomposition control by factors like the quality of leaf litter and the balanced involvement of both decomposer types do not appear to be fully applicable to tropical environments. Finally, the findings of this thesis suggest that the consequences of climatic change on the cycling of organic carbon in the aquatic ecosystems of West Africa, i.e. a region predicted to be particularly affected, could be mitigated by the dominance of organisms exhibiting a low vulnerability
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Pallotini, Matteo. "Qualité biologique des eaux douces et impact des métaux lourds sur les populations et communautés de macroinvertébrés." Thesis, Toulouse 3, 2015. http://www.theses.fr/2015TOU30383/document.

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Abstract:
Nous avons étudié les réponses biologiques des individus, populations et communautés d'invertébrés de rivières à la contamination des sédiments par les métaux lourds. Nous avons examiné les malformations du mentum des larves de Chironomus riparius (Insecta-Diptera) pour évaluer l'effet toxique de la contamination d'un cours d'eau, Le Genna (Italie Centrale). L'aire d'étude est soumise à une activité zootechnique intense qui accroit la pollution métallique de la rivière, notamment par le cuivre, le zinc, le cadmium, le chrome et le nickel. La fréquence des malformations larvaires (56%) a été directement liée aux contaminations, ce qui montre quel es malformations du mentum constituent un proxy pertinent des effets toxiques sur les écosystèmes. Nous avons également analysé, dans une aire industrielle d'Italie Centrale, la bioaccumulation de métaux lourds dans les tissus de Procambarus clarkii (Crustacea-Decapoda), une écrevisse allochtone utilisée comme bioindicateur de la santé écologique des eaux douces. L'hépatopancréas, tissus de détoxification, a montré les concentrations de métaux les plus élevées, en comparaison aux muscles abdominaux (tissus non détoxifiant). Ce ratio de concentration entre les deux types de tissus représente un marqueur pertinent du niveau de stress bio-écologique. Le rapport décroit comme suit : Cd (11,7) &gt; Cu (5,5) &gt; Pb (3,6) &gt; Cr (1,5) &gt; Zn (1,0), Ni (1,0). La comparaison des bioaccumulations avec un site de référence non impacté confirme quel es métaux qui s'accumulent de façon significative dans l'hépatopancréas sont le cadmium et le cuivre. A l'échelle des communautés, nous avons étudié les relations entre combinaison de traits fonctionnels des invertébrés et conditions environnementales (24 variables physico-chimiques) à l'échelle du réseau hydrogaphique (bassin du Nestore, Italie Centrale). Les stations de bonne qualité physico-chimique ont montré une plus forte variabilité dans la composition en traits fonctionnels que dans les conditions physico-chimiques. Un résultat inverse a été observé aux sites pollués, où les traits biologiques sont peu diversifiés et stables dans l'espace et dans le temps, en relation avec la chute de diversité taxonomique liée aux perturbations anthropiques. Enfin, les traits fonctionnels se sont avérés plus efficaces quel es analyses physico chimiques pour détecter des changements de fonctionnement écologique lors que les concentrations en polluants sont faibles. Les cartes auto-organisatrices de Kohonen (SOM, réseaux de neurones) ont permis de modéliser plus en détailla distribution spatio-temporelle des divers taxons en relation avec la variabilité environnementale naturelle et le niveau de pollution chimique (nutriments et métaux lourds). Nous avons enfin développé et validé un indice multimétrique basé sur les communautés d'invertébrés, pour évaluer la santé écologique des cours d'eau d'Italie Centrale en terme d'écart à la référence. Sur 71 métriques biologiques testées, nous n'avons retenues que celles qui présent le meilleurs compromis en terme d'efficacité de discrimination, de faible spécificité et de faible redondance, et montrant une grande stabilité en conditions de référence. Ces métriques, qui renseignent sur la diversité, l'abondance, le rôle fonctionnel et la tolérance des organismes sont : l'indice de Margalef, le score "Biological Monitoring Water Pollution", le nombre de familles et la richesse relative des déchiqueteurs. Cet indice, qui satisfait les pré requis de la Directive Cadre sur l'Eau de l'Union Européenne, répond de façon significative à la pollution des eaux douces et à la contamination des sédiments par les métaux lourds<br>We studied the biological responses of individuals, populations and invertebrate communities to river sediment contamination by heavy metals. We examined the deformities of the mentum of Chironomus riparius larvae (Insecta, Diptera) to assess toxic effect of contamination of streams, the Genna (Central Italy). The study area is subjected to intense livestock activity that increases the metal pollution of the river, including copper, zinc, cadmium, chromium and nickel. The frequency of larval malformations (56%) was directly related to contamination, which shows that malformations of the mentum form a relevant proxy of toxic effects upon ecosystems. We also analyzed, in an industrial area of Central Italy, the bioaccumulation of heavy metals in the tissues of Procambarus clarkii (Crustacea-Decapoda), a non-native crayfish used as a bio-indicator of the ecological health of freshwaters. The hepatopancreas, a detoxifying tissue, showed the highest metal concentrations compared to the abdominal muscles (non detoxifying tissue). This concentration ratio between the two types of tissues is a relevant marker of bio-ecological stress. The ratio decreased as follows: Cd (11.7) &gt; Cu (5.5) &gt; Pb (3.6) &gt; Cr (1,5) &gt; Zn (1.0), Ni (1.0). Comparison of bioaccumulations with a non-impacted reference site confirms that those metals that significantly accumulate in the hepatopancreas are cadmium and copper. At the community level, we studied the relationships between the combination of invertebrate functional traits and environmental conditions (24 physical-chemical variables) across the stream system (Nestore Basin, Central Italy). Stations with a good physical-chemical status showed higher variability in their composition of functional traits than in their physical-chemical variables. An opposite trend was observed in the polluted sites, where biological traits are poorly diversified and stable in space and in time, in relation to the decrease in taxonomic diversity linked to human disturbance. Finally, functional traits have proven more effective than physical-chemical analyzes in detecting changes in ecological functioning of streams when contaminant concentrations are low. The self-organizing map algorithm (SOM neural networks) was used to further model the spatial and temporal distribution of the various taxa in relation to the natural environmental variability and the level of chemical pollution (nutrients and heavy metals). Finally we have developed and validated a multimetric index based on invertebrate communities, to assess the ecological health of rivers of Central Italy in terms of deviation from a reference state. Out of 71 tested biological metrics, we retained those metrics that showed the best compromise in terms of discrimination efficiency, low specificity and low redundancy, and higher stability under reference conditions. These metrics, which provide information on the diversity, abundance, functional role and tolerance of organisms are: the Margalef index, the "Biological Monitoring Water Pollution" score, the number of families and the relative richness of shredders. This index, which complies with the prerequisites of the Water Framework Directive of the European Union responds significantly to freshwater pollution and sediment contamination by heavy metals
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Wiederkehr, Juliane. "Estimation des incertitudes associées aux indices macroinvertébrés et macrophytes pour l'évaluation de l'état écologique des cours d'eau." Thesis, Strasbourg, 2015. http://www.theses.fr/2015STRAH001/document.

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Abstract:
L’évaluation de l’état écologique des rivières est régie par l’application de protocoles sur le terrain et au laboratoire. Ceux-ci induisent de nombreuses incertitudes tant naturelles qu’humaines. L’objectif de cette thèse est (1) d’étudier l’impact de certaines incertitudes sur les indices biologiques basés sur les macroinvertébrés et les macrophytes en rivière, (2) de les estimer et (3) d’observer leur propagation jusqu’à l’évaluation de la qualité écologique des rivières. Pour les macroinvertébrés, nous nous sommes intéressés à l’impact de la variation intra-substrat et à l’effet des variabilités liées aux compétences de l’opérateur dans les indices IBGN, IBG DCE et I2M2. Pour les macrophytes, nous nous sommes focalisés sur l’effet opérateur dans l’IBMR. Des variations des indices ont été observées jusqu’à conduire à une évaluation globale erronée. Des solutions correctives peuvent être proposées afin de réduire les effets des sources de variabilités étudiées<br>Ecological status assessment in waterbodies depends on standards application in the field and in the laboratory. They induce many uncertainties associated to natural or human variabilities. The aim is (1) to study the effect of some uncertainties on french indices based on macroinverterbrates and macrophytes, (2) to estimate them, and (3) to observe their propagation on final ecologica lstatus. Concerning macroinvertebrates, we are interested in the intrasubstrate variability and the surveyor effect in IBGN, IBG DCE and I2M2. Concerning the macrophytes, we focus on surveyor impact in IBMR. Indices variation appears and could lead to ecological status changes. Control quality approach could be proposed to reduce uncertainties effects
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Piscart, Christophe. "Rôle de la salinité dans la dynamique et la régulation de la biodiversité des communautés de macroinvertébrés dulçaquicoles." Metz, 2004. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/UPV-M/Theses/2004/Piscart.Christophe.SMZ0427.pdf.

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Abstract:
Un intérêt croissant est porté aux conséquences des modifications du climat et de la température sur les milieux aquatiques continentaux. Une augmentation de la salinité des eaux est envisagée dans un contexte de changements globaux, due en particulier à l'augmentation de l'évaporation, la remonté du niveau marin et des aquifères souterraines, les changements d'occupation des sols et les processus d'érosion des bassins versants. Malgré cette perspective, le rôle de la salinité dans les écosystèmes d'eaux douces est mal connu, en particulier au niveau d'écosystèmes situés en climat tempéré. L'objectif principal de ce travail doctoral est de contribuer à une meilleure connaissance du rôle et des conséquences de l'augmentation de la salinité sur la faune des eaux. Des spécificités régionales ont permis d'étudier in situ, le rôle de la salinité dans la régulation de la biodiversité des communautés de macroinvertébrés d'une rivière, la Meurthe, présentant sur une faible distance géographique (environ 19 Km) un important gradient de salinité (0,2 à 2,6 g. L-1). La première partie de ce travail documente nos connaissances sur l'évolution des communautés de macroinvertébrés le long du gradient de salinité en terme de biodiversité et de structure mais aussi en termes de caractéristiques bio/écologiques des peuplements macrobenthiques. L'impact de la salinité a été mis en évidence à partir d'une concentration en sels supérieure à 1,4 g. L-1 avec, notament, l'installation d'espèces exotiques. Dans une seconde partie, des études aux niveaux populationnel et individuel ont permis d'expliquer les changements observés à l'échelle communautaire, notamment par l'intermédiaire de tests de tolérance à la salinité réalisés en conditions contrôlées sur 60 taxons appartenant à l'ensemble des groupes faunistiques. Plusieurs outils diagnostiques tels que l'utilisation d'habitats sentinelles et de substrats artificiels adaptés à l'étude de la salinisation ont été développés au cours de ce travail. Des investigations originales ont également été réalisées sur la possibilité d'utiliser des mesures d'asymétrie fluctuante en tant qu'indicateur d'instabilité de développement des populations naturelles soumises à un stress salin<br>One of the consequences of the climat changes and rising temperatures on continental aquatic environments will be an increase their salinity levels. This salinization process is due to multiple factors such as an increase of evaporation, a rise of the sea level and the subterranean aquifers or a change of land use and erosonial process of drainage basins. In spite of its importance, the role of the salinity in freshwater ecosystems is poorly known, in particular in temperate ecosystems. The main objective of this sudy is to improve our knowledge of the role and consequences of a rising salinity on the freshwater biota. A particular section of the Meurthe River allowed us to study on the field the role played by the salinity in the regulation of biodiversity of the macroinvertebrate community. This section of 19 Km presents a salinity gradient ranging from 0. 21 to 2. 60 g. L-1. The first part of this study document our knowledge on the change of macroinvertebrate communities along a salinity gradient in term of biodiversity and structure but also in terms of bio/ecological characteristics of macroinvertebrate assemblages. In the second part, the study is focused on the populationnal and individual scales to explain the observed changes in community scale, especially by using some laboratory tests of the salinity tolerance of 60 taxa belonging to all faunistic groups. From a practical point of view, we explored several bioassessment tools adapted to the study of salinization process such as the bused of sentinel substrate and artificial substrates. Some inovative investigations have also been realized on the use of fluctuating asymmetry to highlight developmental instabilities in natural population submitted to a salinity stress
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Martel, Nicolas. "Réponses des communautés de macroinvertébrés des ruisseaux aux activités forestières et au contexte environnemental à différentes échelles spatiales." Thèse, Université du Québec à Trois-Rivières, 2006. http://depot-e.uqtr.ca/1922/1/000133211.pdf.

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Crespin, de Billy Véronique de. "Régime alimentaire de la truite (Salmo trutta L. ) en eaux courantes : rôles de l'habitat physique et des traits des macroinvertébrés." Lyon 1, 2001. http://www.theses.fr/2001LYO10173.

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Abstract:
Comprendre les fluctations d'abondance de la truite (Salmo trutta L. ) nécessite de déterminer les facteurs limitant sa production. Par exemple, la modification de l'habitat peut altérer la survie de cette espèce et modifier la disponibilité (abondance) et la qualité (vulnérabilité) des ressources trophiques. Dans ce contexte, j'ai étudié comment les caractéristiques des habitats et des proies (invertébrés aquatiques et terrestres) modifient les régimes alimentaires des truites. J'ai collecté des données de benthos, dérive et contenus stomacaux de truites, dans trois tronçons de cours d'eau des Pyrénées dont deux soumis à un débit réservé. Les résultats montrent que si la quantité de proies consommées varie à large échelle (tronçon: 10 au cube par m ), la composition des régimes change en fonction des conditions locales du milieu (macro-habitat: 10 au carré par m). Pour comprendre ces variations, j'ai analysé la vulnérabilité potentielle des proies face à un prédateur, en cochant leurs traits écologiques, comportementaux et morphologiques. J'ai ainsi observé que 1) les traits des proies potentielles (invertébrés benthiques) varient essentiellement avec les paramètres hydrauliques, et la quantité des ressources trophiques tend à augmenter avec la vitesse du courant ; 2) malgré les différences de régimes observées entre les habitats, la truite sélectionne les proies les plus vulnérables (ex : exposées au courants, mobiles, flexibles, tailles entre 8 et 16 mm); et 3) le rôle des traits des proies sur les régimes augment avec la diminution des caractéristiques torrentielles du milieu. Ainsi, l'utilisation des traits codant la vulnérabilité potentielle des proies est pertinente dans la compréhension des régimes alimentaires des truites, notamment dans les milieux aux faibles contraintes hydrauliques (débits réservés). Dans le cadre de l'évaluation de la qualité des milieux, ceux-çi devraient constituer un véritable complément aux outils de gestion déjà existants.
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Castella, Emmanuel. "Apport des macroinvertébrés aquatiques au diagnostic écologique des écosystèmes abandonnés par les fleuves : recherches méthodologiques sur le haut-Rhône français." Lyon 1, 1987. http://www.theses.fr/1987LYO10111.

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Abstract:
Mise au point d'une methode d'evaluation des ecosystemes aquatiques abandonnes par les fleuves utilisant 6 groupes d'invertebres (mollusques, crustaces, ephemeropteres, odonantes, coleopteres, trichopteres)
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Bouzidi, Abdelhamid. "Recherches hydrobiologiques sur les cours d'eau des massifs du Haut-Atlas (Maroc) : bio-écologie des macroinvertébrés et distribution spatiale des peuplements." Aix-Marseille 3, 1989. http://www.theses.fr/1989AIX30022.

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Abstract:
La comparaison de la richesse taxonomique des peuplements lotiques du haut-atlas avec celle des autres reseaux europeens montre que la diversite specifique est faible, que l'habitat preferentiel est souvent deplace vers les secteurs amont des reseaux, que les especes, en l'absence de concurrentes congeneres, presentent un spectre ecologique plus etendu et que les formes stenothermes d'eau froide sont cantonnees dans les sources sur le versant sud, alors qu'elles occupent un habitat plus large sur le versant nord. L'etude biocenotique met en evidence une succession de quatre groupements faunistiques caracteristiques de quatre zones ecologiques distinctes
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Coulaud, Romain. "Modélisation et changements d'échelles pour l'évaluation écotoxicologique : application à deux macroinvertébrés aquatiques, Gammarus fossarum (crustacé amphipode) et potamopyrgus antipodarum (mollusque gastéropode)." Thesis, Lyon 1, 2012. http://www.theses.fr/2012LYO10018/document.

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Abstract:
Les réglementations conduisent à multiplier les évaluations du risque écologique lié au rejet des substances chimiques dans les milieux aquatiques avec pour objectif de protéger les populations naturelles. Cependant, ce niveau de protection visé ne peut être utilisé facilement pour établir un lien direct entre une contamination et ses effets. Pour palier cette difficulté, les approches multi-échelles basées sur l'étude des effets des contaminations sur des marqueurs individuels puis sur l'extrapolation de ces effets au niveau des poipulations à partir de modèles de dynamique de population représentent des démarches prometteuses et commencent à être bien acceptées dans les démarches prédictives.Cependant, leur utilisation pour le diagnostic de la qualité des milieux aquatiques reste pour le moment très rare, d'une part en raison de la forte variabilité des réponses des marqueurs individuels in situ liée à l'influence de divers facteurs environnementaux confondants pour l'évaluation de la toxicité, et d'autre part à cause du manque de pertinence environnementale des modèles actuellement proposés. Centré sur l'utilisation de deux espèces couramment observées dans les cours d'eau européens et présentant des caractéristiques écologiques et phylogéniques contrastées : le crustacé Gammarus fossarum et le mollusque Potamopyrgus antipodarum, ce travail doctoral a permis : 1- de proposer une méthodologie pour prendre en compte l'influence des facteurs de confusion dans le but d'améliorer la lecture des bioessais in situ basés sur la mesure des marqueurs individuels sur des organismes encagés et 2- de développer des modèles de dynamique de population écologiquemnt pertinents<br>The regulatory framework lead to increase the assessments of the ecological risk linked to the dischaarge of chemical substances in aquatic environment with the aim to protect natural populations. However, this target level of protection cannot be used so easily to etablish a direcet link between a contamination and its effects. In order to overcome this difficulty, the multi-scale approaches based on the study of the effects of the contaminations on individual markers and then on the extrapolation of these effects at the population level with population dynamic models reprensent promising tools and start to bewell accepted in predictive processes. Yet, their use for the diagnosis of water quality remainsrare for the moment, on the one hand, because of the important varaibility of answers of individual makers in situ linked to the influence of diverse confounding environmental factors for the assessments of toxicity and, on the other hand, because pf the lack of environmental relevance of models currently proposed. Focused on the use of 2 species widely observed in European rivers and presenting contrastingecological and phylogenetic characteristics : the Grammar fossarum crutacean and the Potamopyrgus antipodarum mollusc, this doctoral degree first propose a methodology to consider the influenceof confounding factors in order to improve the reading of biological in situ tests based on the measurment of individual markers on caged organisms and second, to develop ecologically relevant population models. Thus, this work allowed to underline the importance of the consideration of confounding factors (i.e. temperature), in different in situ tests based on the measurment of individul markers on caged organisms. Moreover, population models for both species have been defined in order to test the influence of life histories and seasonal variations on demographic sensitivity of populations
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Bernadet, Caroline. "Biodiversité des communautés de macroinvertébrés benthiques de la Martinique : conception d'un indice de qualité biologique des rivières et écologie fonctionnelle des bioindicateurs." Toulouse 3, 2013. http://thesesups.ups-tlse.fr/2580/.

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Abstract:
Suite à l'adoption de la Directive Cadre Européenne (DCE) par le Parlement et le Conseil européen en 2000, de nombreux états membres de l'Union Européenne ont dû modifier ou créer des méthodes de biosurveillance permettant d'atteindre un objectif de " bon état écologique ", mais aussi de préservation et de restauration des eaux superficielles. Les directives européennes s'appliquent aux départements d'Outre-Mer des Antilles avec les mêmes objectifs et échéances que la France métropolitaine, même si ceux-ci ont connu quarante ans de retard dans la mise en œuvre de politiques de l'eau, et ont reçu peu d'attention scientifique. En particulier, il n'existait pas d'outil de bioévaluation de la qualité écologique des cours d'eau adapté aux milieux insulaires tropicaux des Antilles, tandis que la faune aquatique régionale a été largement sous-étudiée aux plans de l'écologie, de la biologie et de la systématique. Dans ce contexte, l'objectif principal de ce travail de thèse était la création d'un indice de bioévaluation de la qualité écologique des cours d'eau adapté à la Martinique et répondant aux critères de la DCE. En parallèle, la biodiversité et l'écologie des macroinvertébrés benthiques des Antilles françaises ont été étudiées. Nous avons en premier lieu dressé un inventaire actualisé de la faune des macroinvertébrés benthiques des Antilles françaises et quantifié les préférences écologiques des macroinvertébrés benthiques dominants à l'échelle du microhabitat (substrats et vitesse de courant préférentiels) et à l'échelle régionale le long du gradient altitudinal. Une biotypologie des communautés nous a permis de dégager des patrons d'organisation des communautés en relation avec les conditions environnementales. Enfin, l'étude des réseaux trophiques benthiques par l'analyse des isotopes stables apporte des informations nouvelles sur l'écologie trophique des communautés de macroinvertébrés. Malgré un pool d'espèces pauvre comparé à ce qui est observé sur les continents, la faune macroinvertébrée des Antilles françaises est l'une des plus diversifiée des îles des Petites Antilles, et compte un nombre important d'espèces endémiques. Peu d'espèces ont une distribution altitudinale étroite et des préférences de microhabitats strictes. Malgré cela, la distribution de cette faune largement ubiquiste s'explique par des gradients environnementaux, les facteurs géomorphologiques étant des plus déterminants. A partir des patrons de distributions dégagés et de l'identification de stations de référence non impactées (ou subissant un impact négligeable), un indice multimétrique de qualité biologique des rivières, mesurant l'écart à la référence, a pu être créé. Cet indice prend en compte la diversité et l'abondance des taxons, ainsi que certains traits biologiques. Il répond ainsi autant que possible aux exigences de la DCE compte tenu de l'état actuel des connaissances de la faune régionale. Les réseaux trophiques montrent une omnivorie généralisée, si bien qu'il est difficile de catégoriser les taxons en groupes fonctionnels ou en guildes trophiques, utiles à la compréhension du fonctionnement écologique des communautés en milieux naturels et perturbés. Il est donc important de poursuivre l'effort d'acquisition de connaissances fondamentales sur la faune régionale, et plus largement sur la faune des Petites Antilles<br>The implementation of the European Water Framework Directive (WFD) in 2000 led many European states to modify or create biomonitoring methods directed towards the achievement of a 'good ecological status' of surface waters, as well as their preservation and restoration. The Directive applies to overseas territories such as the West Indies, with the same objectives and deadlines as in continental Europe, despite a forty-year delay in the implementation of water policies in these tropical areas and little scientific attention paid to freshwater ecosystems. In particular, there was no tool bioassessment of the ecological quality of rivers adapted to tropical Caribbean island environments, while the regional fauna has been largely understudied in terms of ecology, biology and systematics. In this context, the main objective of this thesis was to design a biotic index to assess the ecological quality of rivers in Martinique, according to the criteria of the WFD. In parallel, the biodiversity and ecology of benthic macroinvertebrates inhabiting the French Antilles were studied. We first established an updated inventory of the benthic macroinvertebrate fauna of the French Antilles and quantified the ecological preferences of the dominant benthic macroinvertebrates at the microhabitat scale (substrates and current preferential rate) and at the regional scale along the altitudinal gradient. A biotypology of communities enabled us to bring out patterns in community structure in relation to environmental conditions. Finally, a stable isotope approach to food webs analysis provides new information on the trophic ecology of macroinvertebrate communities. Despite a poor species pool compared to the continent, the macroinvertebrate fauna of the French Antilles is one of the most diverse of the Lesser Antilles, and has a large number of endemic species. Only a few taxa show a narrow altitudinal range and strict microhabitat preferences. Despite this, this largely ubiquitous fauna shows clear distribution patterns along environmental gradients, geomorphological factors being the most significant controlling factors. Based on these distributions patterns and the identification of unimpacted reference stations, we created a multimetric index of biological quality of rivers measuring the deviation of community diversity from the reference conditions. This index takes into account the diversity and abundance of taxa, as well as some biological traits. Thus, it meets as much as far as possible the requirements of the WFD, given our current knowledge of the local fauna. Food webs show a generalized omnivory, so it is difficult to categorize taxa into functional groups or trophic guilds which would be useful to understand the ecological functioning of communities under natural and disturbed conditions. Future research should thus enhance fundamental knowledge on the biology and ecology of the regional fauna, and more broadly on the fauna of the Lesser Antilles
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Mary, Nathalie. "Caractérisations physico-chimique et biologique des cours d'eau de la Nouvelle-Calédonie. Proposition d'un indice biotique fondé sur l'étude des macroinvertébrés benthiques." Pacifique, 1999. http://portail-documentaire.univ-nc.nc/files/public/bu/theses_unc/These1999NathalieMary.pdf.

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Quarante et une stations situees sur 14 rivieres reparties sur l'ensemble de la nouvelle-caledonie ont ete periodiquement echantillonnees d'octobre 1996 a octobre 1997. Des prelevements d'invertebres benthiques ont ete effectues sur chacune des stations, puis identifies et comptes en laboratoire. Parallelement, des echantillons d'eau ont ete analyses sur chaque station d'etude. La nature physico-chimique des eaux des rivieres de la grande terre est fortement influencee par les substrats geologiques draines. Les pollutions organiques sont globalement peu importantes sur le territoire, les concentrations les plus importantes en nitrates, ammonium et matieres organiques sont mesurees dans les cours d'eau situes a proximite de certains villages, tribus ou villes, dans l'agglomeration de noumea et au niveau des cours inferieurs des rivieres de la cote ouest. Une typologie physico-chimique des stations de l'etude fondee sur leur localisation geographique, l'occupation des sols et la nature geologique des roches a ete mise en evidence a l'aide d'analyses multivariees. La macrofaune benthique des rivieres est dominee par les insectes. Les milieux les plus propices au developpement de la macrofaune benthique et qui presentent la diversite specifique maximale sont les ruisseaux forestiers. A l'oppose, les cours d'eau drainant des peridotites alterees et eloignees de toute occupation humaine se caracterisent par des peuplements benthiques moins diversifies et moins abondants dus a leur faibles teneurs en matieres organiques. En outre, certains taxons presentent un endemisme generique et specifique lie au substrat peridotitique a l'instar des insectes terrestres. Une biotypologie des stations d'etude a ete definie, fondee sur les memes criteres que ceux de la typologie physico-chimique. L'occupation des sols, la vegetation rivulaire et la nature geologique des bassins versants representent les principaux facteurs expliquant la repartition et la distribution de la macrofaune benthique des rivieres. Un indice biotique original specifique aux rivieres de nouvelle-caledonie est propose dans ce travail. L'indice biotique de nouvelle-caledonie (ibnc) permet de detecter des pollutions organiques en milieu courant. Il se refere a 62 taxons frequents et d'identification simple auxquels il a ete attribue un score en fonction de leur sensibilite aux matieres organiques.
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Kengne, Fotsing Joséphine. "Bio-évaluation des cours d’eau de la région Ouest du Cameroun à l’aide des macroinvertébrés benthiques et construction d’un indice multimétrique régional." Thesis, Lille 1, 2018. http://www.theses.fr/2018LIL1R067/document.

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Abstract:
Les macroinvertébrés benthiques sont depuis toujours reconnus comme d’excellents outils de bio-évaluation de la qualité des eaux, que ce soit dans les milieux tropicaux que tempérés. L’objectif principal de cette thèse était de faire un état de lieu de la qualité des eaux de la région Ouest du Cameroun, sans cesse dégradée par des activités anthropiques diverses et multiples. En s’appuyant sur les communautés benthiques présentes et leurs préférences écologiques à l’échelle du mésohabitat, nous avons abouti à la construction d'un indice régional de bio-évaluation de la qualité écologique des cours d'eau. A partir des analyses multivariées, une biotypologie des cours d’eau a été dégagée au sein des stations échantillonnées, aboutissant à différents patrons de distribution avec d’une part les stations de référence et d’autre part les stations impactées, sur la base du niveau d’urbanisation et la nature des effluents dans les différents sous-bassins versants. Un indice multimétrique (IMMOC), mesurant l'écart à la référence, a pu être créé à partir de ces lots de stations. Parmi les 18 métriques candidates (transformées en Ratio de Qualité Écologique), nous avons sélectionné les métriques présentant une forte efficacité de discrimination et un faible coefficient de variation en condition de référence. L’indice le plus performant se compose de 2 métriques à savoir l’indice de Shannon et la métrique 1–GOLD. A partir d’un jeu de données test indépendant du jeu de données d’apprentissage, nous avons vérifié que l’IMMOC était stable en condition de référence et sensible à la gamme de pressions anthropiques présentes dans cette région, confirmant ainsi son caractère généraliste<br>Benthic macroinvertebrates have always been recognized as better tools for bio-assessment of the ecological quality of streams in both tropical and temperate areas. The main objective of this work was to evaluate the water quality of the Western region of Cameroon most degraded by various and multiple anthropogenic activities. From these communities of macroinvertebrates benthic and their ecological preferences at the mesohabitat scale, we resulted to the construction of a bio-assessment index of the ecological quality of streams adapted to this region. From multivariate analyzes, a stream biotypology into the sampled sites, allowed us to identify different distribution patterns, with on the one hand reference sites or non-impacted and the other hand, impacted sites based on the level of urbanization and the nature of the effluents in the different sub-watersheds. A multimetric index of biological quality (MMIWC), measuring the deviation from the reference, could be created, thanks to these two groups of stations. Among the 18 candidate metrics (transformed into Ecological Quality Ratio), we selected metrics with high discrimination efficiency and a low coefficient of variation in the reference conditions. The best performing index include two metrics derived to the taxonomic diversity (Shannon index) and taxonomic composition (1-GOLD). From a test dataset different to learning dataset, we were able to verify that MMIWC was stable in the reference conditions and sensitive to the full range of anthropogenic pressures present in this region, thus confirming its generalist character
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Bady, Pierre. "Modélisation de la relation entre la variabilité de l'habitat et la diversité fonctionnelle : application aux peuplements de macroinvertébrés des grands cours d'eau européens." Lyon 1, 2005. http://www.theses.fr/2005LYO10053.

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Abstract:
Ce travail concerne l'organisation fonctionnelle des peuplements de macroinvertébrés benthiques et reposent sur la quantification par codage flou des traits biologiques pour intégrer la plasticité des caractéristiques biologiques des organismes. Tout d'abord, l'étude fonctionnelle des peuplements de macroinvertébrés est envisagée à travers différentes approches : (1) les méthodes en analyse multivariée (ACF floues, méthodes multitableaux) et (2) l'indice de diversité quadratique basée sur les traits biologiques. Dans une troisième prtie, les modèles polytomiques ont permis de modéliser les profils biologiques de 67 relevés de références répartis sur 8 grands cours d'eau européens. Enfin, il a été montré que plusieurs traits répondent aux modifications chimiques et physiques de l'habitat soulignant l'altération fonctionnelle des peuplements liée aux activités humaines. Ces résultats permettent de définir les principes de la construction d'un outil de bio-évaluation basé sur les traits biologiques
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Galvin, Yannick. "Hydrobiologie d'une rivière aménagée : le moyen Verdon (Alpes de Haute Provence) : hydrochimie et macroinvertébrés benthiques d'un tronçon à débit régulé, impacts de l'aménagement sur l'hydrosystème." Aix-Marseille 3, 1989. http://www.theses.fr/1989AIX30084.

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Abstract:
L'etude hydrobiologique realisee sur le moyen verdon a determine les impacts d'une retenue hydroelectrique sur les caracteristiques biotiques et abiotiques du troncon de riviere en aval de l'amenagement. Un affluent permanent et un autre semi-temporaire ont ete pris comme cours d'eau naturels de reference du secteur. Sept sites de prelevements ont ete prospectes lors de neuf campagnes, couvrant un cycle annuel. L'etude des parametres mesologiques et l'utilisation d'analyses en composantes principales, ont revele que les amenagements modifient, a la fois, les caracteristiques physicochimiques de l'eau et leur evolution spatio-temporelle, faisant du moyen verdon un compartiment de l'hydrosysteme aux caracteristiques propres et au fonctionnement relativement autonome. En absence d'autres perturbations, les modifications mesologiques susceptibles d'influencer la composition et l'organisation des communautes benthiques concernent essentiellement les regimes hydroliques et thermiques de la riviere. Le peuplement benthique est diversifie, typique des grandes rivieres de piemont d'europe meridionale subissant des influences alpines et mediterraneennes. Les modifications des regimes hydrologique et thermique provoquent l'elimination des especes lenitophiles et la selection d'especes rheophiles susceptibles de resister au regime d'eclusees. L'etude biocenotique revele une evolution, vers l'aval, de l'organisation des peuplements qui tendent vers un etat plus proche de l'etat naturel. L'analyse factorielle des correspondances des structures spatio-temporelles decrit l'association d'un degre de perturbation des communautes de macroinvertebres et de leur evolution saisonniere, mettant en evidence une periode estivale critique pour la faune du moyen verdon et, au contraire, le maintien de conditions plus favorables en periode froide. L'importance du facteur hydrologique apparait dans la differenciation des
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Auclerc, Apolline. "Impact d'amendements calco-magnésiens sur la diversité des macroinvertébrés de sols forestiers et sur certains processus fonctionnels associés. Cas du massif vosgien (nord-est, France)." Thesis, Université de Lorraine, 2012. http://www.theses.fr/2012LORR0056/document.

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Abstract:
Le recours à des épandages d'amendements calco-magnésiens dans les forêts acidifiées peut représenter une alternative intéressante pour corriger l'acidification des sols et la perte d'éléments nutritifs engendrés par des décennies de dépôts atmosphériques acides. Dans ce contexte, les objectifs de cette thèse sont d'évaluer les effets d'amendements calco-magnésiens sur (i) la diversité taxonomique et la structure des communautés des macroinvertébrés de sol forestier et sur (ii) deux processus fonctionnels associés notamment à l'activité des vers de terre, tels que la structuration du sol et l'évolution des humus. Au cours de nos travaux, trois sites localisés dans les Vosges (nord-est, France) ont été étudiés : deux massifs forestiers (sur grès et granite) en moyenne montagne, ayant fait l'objet d'amendements aériens en 2003 et la forêt domaniale de Humont située dans les collines sous-vosgiennes, où des amendements en 1991 et 2008 ont été réalisés. Les résultats montrent que 4 ans après amendement sur les bassins versants en moyenne montagne, l'abondance totale de la communauté de macrofaune a diminué, alors que les richesses spécifiques sont similaires. Cependant, la composition des communautés diffère avec moins de 50 % d'espèces communes aux sites amendés et témoins. Une diminution de l'abondance des prédateurs a également été observée alors que la plupart des détritivores ont été favorisés par l'amendement. Les études in vitro montrent également son effet positif sur les activités de structuration du sol par les vers de terre (production de turricules et construction de galeries). En forêt de Humont, les amendements ont eu un effet majeur à moyen terme (4 ans) et à long terme (20 ans) sur la population d'Aporrectodea velox, espèce endémique des Vosges. De part sa biomasse importante, cette augmentation de densité favorise l'amélioration des caractéristiques physico-chimiques du sol forestier tels que la structuration des sols et la morphologie des humus<br>The use of liming (Ca-Mg) on acidified forest can be interesting to counteract soil acidification and loss of nutrients caused by decades of acid atmospheric deposition. In this context, the aims of this work were to assess liming effect on (i) taxonomical diversity and community structure of soil macro-invertebrates and on (ii) two associated functional processes related to earthworms: soil structuration and humus evolution. The PhD project was realised in three sites from the Vosges mountains (North-eastern, France): two forest mountain catchments (one lying on sandstone and the other on granite) limed in 2003 and the public hill forest of Humont at a lower altitude limed in 1991 and 2008. Results showed that 4 years after liming in mountain forest, the total abundance of macro-invertebrates decreased, while the species richness were similar. However, the community structure strongly differed, and less than 50% of the species were common to limed and control sites. Moreover, 43 species appeared to be indicators of liming. Predator taxa abundance decreased whereas the detritivorous were favoured by lime addition. The in vitro experiments showed a positive effect of liming on soil structuration by earthworm activities (cast production and burrowing activities). In the Humont forest, liming at medium-term (4 years) and long term (20 years) have an important effect on the Aporrectodea velox population, an endemic vosgian species. Related to its high biomass, this increase strongly improved soil physicochemical parameters such as soil structure and humus morphology
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Song, Mi-Young. "Ecological quality assessment of stream ecosystems using benthic macroinvertebrates." Toulouse 3, 2007. http://thesesups.ups-tlse.fr/224/.

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Abstract:
Dans cette étude, nous avons appliqué le modèle SOM (Self-Organizing Map) pour une évaluation de la qualité écologique de l'écosystème aquatique en se basant sur les macroinvertébrés benthiques. D'abord, dans le chapitre I, le SOM a été utilisé pour extraire les informations à partir de grandes matrices de données complexes de variables environnementales et des macroinvertébrés benthiques des différents microhabitats. Bien que les échantillonnages aient e��té réalisés dans une zone limitée, le patron des variables environnementales révèle une hétérogénéité spatiale. Les classes de macroinvertébrés dans le modèle SOM ont montré une variation temporelle et permettent l'évaluation de la qualité de l'eau en accord avec les conditions des différents microhabitats. En conséquence, l'hétérogénéité spatiale locale est importante en révélant les dynamiques des communautés et les indices biotiques, particulièrement en rapport avec le processus de restauration des rivières polluées. Dans le chapitre II, les échantillons ont été classés en 3 groupes principaux par le modèle SOM pour distinguer les assemblages EPTC (Ephéméroptères, Plécoptères, Trichoptères, Coléoptères) dans les cours d'eaux du Coteau de Gascogne, tributaires de la Garonne (sud-ouest France). Des faibles richesses et diversités ont été observées dans cette zone affectée par une pratique agricole intensive, caractérisée par de très fortes valeurs de TDS (Total Dissolved Solids), nitrate (NO3) et COD (Chemical Oxygen Demand). Les espèces EPTC tolérantes ont été utilisées comme paramètres de contrôle pour les changements d'assemblage de communautés collectées dans des sites impactés par la pratique agricole. .<br>In this study, we applied the SOM for ecological assessment using benthic macroinvertebrates in aquatic ecosystem. First, Chapter I, SOM was utilized to extract information from complex data of environmental variables and benthic macroinvertebrate communities residing in different micro-habitats. Although the sampling was carried out in a limited area, the patterns of environmental variables revealed spatial heterogeneity. The clustering of benthic macroinvertebrate communities in the trained SOM was efficient in showing temporal variation and evaluating water quality according to the conditions of different micro-habitats. Consequently, local spatial heterogeneity is important in revealing dynamics of community abundance and biotic indices, especially regarding restoration processes in polluted streams. Chapter II, the samples were grouped into three main clusters corresponding to distinc EPTC assemblages in the tributary streams of the Garonne River catchment, southern France. Lower richness and diversity of macroinvertebrates were observed in the areas affected by agricultural land use, being associated with high Total Dissolved Solids (TDS), Nitrate (NO3) and Chemical Oxygen Demand (COD). Tolerant EPTC species were identified as controlling parameters for the changes in the assemblages collected at the agricultural-impacted sites. .
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Perrodin, Yves. "Proposition méthodologique pour l’évaluation de écotoxicologie des effluents aqueux : - mise au point d’un Multi-Test Macroinvertébrés (MTM) : - applications aux lixiviats de décharge et à leurs composants caractéristiques." Lyon, INSA, 1988. http://www.theses.fr/1988ISAL0039.

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Abstract:
Depuis de nombreuses années, les travaux effectués au L. C. P. A. E. Concernent l'élimination et la valorisation des résidus industriels et urbains, et ont notamment trait à l'épuration des effluents de décharges (ou lixiviats) qui doivent être traités et sévèrement contrôlés avant rejet dans les cours d'eau. Mm d'apprécier l'écotoxicité de ces lixiviats au laboratoire, nous avons conçu et mis en œuvre un test biologique original prenant en compte la pollua-sensibilité de dix familles de macro-invertébrés peuplant généralement les rivières (Multi-Test Macro-invertébrés). Dans un premier temps, ce test a été utilisé pour évaluer la toxicité de trois produits chimiques représentatifs des principaux composants des lixiviats: bichromate de potassium, chlorure de sodium et acétate de sodium. Nous l'avons ensuite appliqué à l'étude éco-toxicologique de divers effluents de décharge, avant et après traitement, mettant ainsi en évidence les performances des procédés d'épuration au regard de l'abattement de toxicité. Les résultats obtenus nous ont d'ores et déjà permis d'appréhender l'avantage principal du M. T. M. Par rapport au tests classiques, à savoir l'obtention de données réalistes concernant la toxicité des lixiviats pour la macrofaune benthique des eaux courantes. Ceci laisse bien augurer du développement futur du M. T. M. Pour l'étude éco-toxicologique des nombreux effluents rejetés dans le milieu naturel.
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Beauger, Aude. "Bio-évaluation de la qualité de l'eau : établissement d'un protocole d'échantillonnage simplifié, basé sur la collecte des macroinvertébrés benthiques sur les seuils des rivières à charge de fond graveleuse." Phd thesis, Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00730658.

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Abstract:
Un protocole d'échantillonnage des macroinvertébrés benthiques indicateurs de la qualité des cours d'eau a été mis en place sur le site atelier Allier et un linéaire de la Loire amont. Celui-ci a permis de désigner les unités géomorphologiques seuil comme meilleur lieu d'échantillonnage. Comparativement aux méthodes existant dans divers pays, le protocole MMS-GUR (Macroinvertebrates living in the Mineral Substrates of the Geomorphological Unit Rifle) présente les avantages suivants : 1) Facilité de repérage des seuils et meilleure accessibilité que les autres géoformes. 2) Aire d'échantillonnage réduite. 3) Echantillonnage de surfaces identiques grâce à l'utilisation du filet Surber. 4) Protocole applicable de la source à la disparition des seuils. 5) Gain de temps répercuté sur le coût tant sur le terrain qu'en laboratoire (détermination au genre, mais réduction possible aux EPT) . 6) Possibilité de comparer un ensemble de rivières dans des conditions analogues.
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Cauvy-Fraunié, Sophie Amelie. "Hydro-écologie des communautés d'invertébrés aquatiques dans les rivières glaciaires équatoriennes." Thesis, Paris 6, 2014. http://www.theses.fr/2014PA066547/document.

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Abstract:
Dans les bassins versants montagneux englacés la biodiversité des rivières est fortement influencée par l'hétérogénéité physico-chimique des habitats due aux dynamiques spatio-temporelles des contributions des différentes sources d'eau: la fonte des neiges, de la glace et les eaux souterraines. Un des effets du réchauffement climatique est l'accélération de la fonte des glaciers entraînant la réduction de la contribution en eaux de fonte. Cette modification du régime des eaux va probablement affecter la biodiversité aquatique. Ainsi il est primordial d'identifier les effets de l'influence glaciaire sur les communautés aquatiques afin de pouvoir prévoir l'impact du retrait glaciaire sur la biodiversité aquatique. Dans cette étude nous avons examiné l'effet de l'influence glaciaire sur les macroinvertébrés aquatiques. L'étude a été menée dans 51 sites dans un bassin versant englacé dans les Andes équatoriennes (Antisana, Équateur) où les crues glaciaires ont lieu toute l'année dû au manque de saison. Nos principaux objectifs étaient de déterminer l'influence glaciaire à chaque site, caractériser l'impact de l'influence glaciaire sur les communautés de macroinvertébrés et anticiper la réponse des macroinvertébrés aquatiques face au retrait des glaciers. Pour répondre à ces objectifs, nous avons quantifié l'influence glaciaire à partir de différentes méthodes et testé son effet sur les macroinvertébrés à plusieurs échelles: du cours d'eau au bassin versant. Cette étude nous a permis de mieux comprendre les mécanismes dirigeant la distribution des macroinvertébrés et de déterminer le potentiel risque d'extinction d'espèces due la diminution de la contribution en eau glaciaire<br>In mountainous glacierized catchments, stream biodiversity is strongly influenced by physicochemical habitat heterogeneity linked to the spatio-temporal dynamics of water source contributions from snowmelt, ice-melt and groundwater. One impact of climate change is the rapid shrinking of glaciers, resulting in a reduction in glacial meltwater contribution to river flow in glacierized catchments. These modifications in water regimes are expected to affect the aquatic biodiversity. Thus it is of critical importance to understand the effect of glacial influence on aquatic communities in glacierized catchments to be able to predict the impact of glacier retreat on the aquatic biodiversity. In this study, we investigated the effects of the glacial influence on aquatic macroinvertebrates. The study was conducted in 51 stream sites in a glacierized catchment in the equatorial Andes (Antisana, Ecuador), where glacial floods occur all year round due to the lack of thermal seasonality. Our main objectives were to determine the glacial influence at each stream site; to characterize the impact of the glacial influence on the macroinvertebrate communities; and to anticipate the aquatic macroinvertebrates response to glacier retreat. In order to meet these objectives, we quantified the glacial influence using different methods and test its effects on macroinvertebrates at different scales from the stream reach to the entire catchment. These analyses allowed us to better understand the mechanisms governing macroinvertebrates distribution, and to determine the potential risk of species loss with the diminution of glacial meltwater contribution
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Mondy, Cédric. "De la communauté à l'individu : apport des traits des invertébrés benthiques dans la bio-évaluation des cours d'eau." Thesis, Université de Lorraine, 2012. http://www.theses.fr/2012LORR0221/document.

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Dans le contexte d'un environnement soumis à des pressions humaines de plus en plus importantes, l'évaluation de la qualité écologique des milieux naturels est devenue un enjeu scientifique, politique et sociétal majeur. Au début des années 2000, les méthodes de bio-évaluation existantes se sont révélées insuffisantes au regard des exigences affichées par la Directive Européenne Cadre sur l'Eau de maintenir ou recouvrer le bon état écologique pour les masses d'eau continentales. En parallèle de cette prise de conscience politique de la nécessité d'une amélioration des méthodes de bio-évaluation, un certain nombre d'auteurs ont plaidé pour une prise en compte explicite des caractéristiques biologiques et écologiques des espèces (i.e. leurs « traits ») de façon à mieux comprendre les processus de mise-en-place et d'organisation des communautés en relation avec les caractéristiques de leur habitat. Le but principal de ce travail de thèse a été d'étudier comment les approches « traits », à plusieurs échelles d'organisation biologique, peuvent permettre d'améliorer la bio-évaluation des cours d'eau Français. Pour cela, nous avons étudié dans un premier temps l'application sur les communautés benthiques de l'approche « traits bio-écologiques potentiels » pour l'évaluation (i) de la qualité écologique, (ii) des risques d'altération et (iii) du degré d'homogénéisation fonctionnelle des cours d'eaux. Ensuite, nous avons exploré le potentiel de nouveaux traits (i.e. isotopiques, stoechiométriques et protéomiques) pour la caractérisation des réponses biologiques des invertébrés benthiques soumis à des pressions anthropiques 'simples' (i.e. acidification et contamination organique). Nos résultats ont démontré que les traits bio-écologiques potentiels permettaient d'améliorer de manière significative l'évaluation du statut écologique des cours d'eaux et des pressions anthropiques qu'ils subissent, à large échelle spatiale (e.g. sur les réseaux nationaux de suivi de la qualité de l'eau). Les analyses isotopique et stoechiométrique ont permis également, sur des problématiques plus locales, de relier des informations sur des traits biologiques (régime alimentaire et développement) aux transferts de nutriments et de matière organique réalisés par les communautés benthiques au sein des systèmes lotiques. Enfin, l'analyse protéomique réalisée le long d'un gradient d'acidification ouvre des perspectives intéressantes pour la mise en place d'un « système expert » précoce des effets d'une détérioration de la qualité de l'eau sur les invertébrés benthiques<br>In a global change context, ecosystems are subjected to more and more severe human pressures. In this context, optimizing the biomonitoring of natural ecosystems has become a major scientific, political and societal issue. In the early 2000th, most of the freshwater bioassessment methods did not succeed in fulfilling the requirements of the European Water Framework Directive, for efficiently evaluating the ecological status of rivers with the main objective to maintain or to reach the good ecological status for all the water bodies. In the same time, a major advance in community ecology was the explicit consideration of the biological and ecological attributes of species (i.e. their ?traits?) to better explain the role of habitat characteristics in community assembly. The main goal of this PhD work was to establish how trait-based approaches, at different biological scales, could enhance the bioassessment of French streams. We have first focused on the utilization of potential bio-ecological traits of macrobenthic communities for (i) evaluating the ecological quality of rivers, (ii) assessing the risk of significant alteration of benthic assemblages by specific pressure categories and (iii) appraising the human pressure-drived functional homogenization process in benthic communities. We examined the potential of new traits (derived from stable isotopy, stoichiometry and proteomics) for depicting the benthic invertebrate responses to 'simple' anthropogenic pressures (i.e. acidification and organic contamination). We have demonstrated that using potential bio-ecological traits efficiently enhances the ecological monitoring of wadeable rivers, at large spatial scale (e.g. on National survey networks). The stable isotope and stoichiometry analyses, when applied at reach scale, have allowed to link biological traits (i.e. diet and development) to ecological functions provided by macrobenthic communities, such as nutriment and organic matter flows in rivers. Finally, the proteomic analysis, performed along an acidification gradient, has brought out very interesting perspectives for the development of an integrative ?expert system? that early detects the biological effects of water quality alteration on benthic invertebrate assemblages
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Jabiol, Jérémy. "Biodiversité et décomposition des litières dans les cours d'eau : influence des interactions trophiques." Toulouse 3, 2010. http://thesesups.ups-tlse.fr/1064/.

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L'évaluation des conséquences de l'érosion de la biodiversité sur le fonctionnement de divers écosystèmes est récemment devenue une problématique centrale de l'écologie. Par le biais de 4 expériences réalisées dans des cours d'eau de tête de bassin, nous avons montré que la diversité de la ressource, des organismes décomposeurs, et de leurs prédateurs peuvent altérer le processus de décomposition par le biais de différents mécanismes. Notamment, il est montré que des altérations concomitantes de la biodiversité à plusieurs niveaux trophiques peuvent avoir des conséquences synergiques sur le fonctionnement de ces écosystèmes et l'efficacité de la décomposition des litières. Ces résultats suggèrent que l'évaluation formelle des conséquences de l'érosion de la biodiversité nécessite une prise en compte plus systématique de l'influence de la complexité trophique sur la structuration des communautés et sur le fonctionnement des écosystèmes<br>Evaluating the consequences of biodiversity loss on the functioning of various ecosystems has recently become a central focus of ecology. By means of 4 experiments carried out in headwater streams, we show that the diversity of the resource, of decomposers and their predators can alter decomposition process through different mechanisms. Notably we show that concomitant alterations of biodiversity at several trophic levels can have synergistic consequences on the functioning of such ecosystems and litter decomposition rates. These results suggest that taking into account the influence of trophic complexity on community structure and ecosystem functioning is necessary to evaluate formally the consequences of biodiversity loss at a global scale
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Touron, Poncet Heliott. "Biodiversité des communautés d'invertébrés benthiques des rivières de la Guadeloupe et réponses aux perturbations anthropiques." Toulouse 3, 2014. http://thesesups.ups-tlse.fr/2292/.

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Abstract:
"Les communautés aquatiques (algues, invertébrés, poissons) sont utilisées depuis plusieurs décennies pour évaluer la qualité biologique des cours d'eau. Des méthodes pratiques pour calculer des indices biotiques ont été conçues (ex. Indices basés sur la diversité des macroinvertébrés), et adaptées pour être appliquées en routine par les gestionnaires des milieux aquatiques. Ces méthodes standardisées ne tenaient pas compte d'un référentiel correspondant à l'état "normal" des communautés concernées. Les approches récentes basées sur le concept de l'intégrité de l'écosystème et sur la biodiversité semblent plus prometteuses pour la gestion intégrée de l'eau. Au cours de la dernière décennie, la Directive Cadre Européenne sur l'eau 2000/60/CE (DCE) a ainsi suscité un nombre important de travaux qui ont conduit à une redéfinition d'outils de bioindication prenant en compte la notion d'écart à la référence. Les méthodes de diagnostic écologique à présent en vigueur en Europe continentale ne sont cependant pas directement transférables aux Départements et Territoires d'Outre Mer, où les contextes biogéographiques et climatiques d'une part, et le manque de connaissance de la faune d'autre part, ne permettent pas d'appliquer les protocoles prescrits. Nous avons développé un indice de bioindication DCE-compatible adapté aux rivières de la Guadeloupe. Le développement de cet indice a nécessité plusieurs étapes au préalable, il a fallu approfondir la connaissance de la faune, pour ensuite définir une biotypologie sur la Basse-terre de la Guadeloupe. Nos résultats mettent en évidence l'importance de l'occupation du sol et la géomorphologie dans la définition de trois sous-régions écologiques (clusters) pour les invertébrés benthique. A partir de ce travail, il a été possible de créer un indice multi-métrique (IBMA-971) pour évaluer la qualité écologique des rivières. Parmi 411 métriques (transformées en ratio de qualité écologique), nous avons selectionné les métriques présentant une forte efficacité de discrimination, une faible spécificité et une forte stabilité en condition de référence. Cet indice se compose de 6 métriques issues de la diversité taxonomique, de la richesse, de l'abondance et de la préference pour un substrat. A partir d'un jeu de donnée test, nous avons trouvé que l'IBMA-971 était sensible à un large panel d'impacts anthropiques. Cet indice montre qu'il est applicable aux îles voisines dans la même région biogéographique. En parallèle, une étude de prélèvement alternative des macroinvertébrés a été testée avec cet indice pour la première fois dans les Antilles. Nos résultats mettent en évidence que les substrats artificiels peuvent permettre d'accéder rapidement à la qualité écologique d'une rivière, ce qui peut être une méthode prospective pour des études pilotes. "<br>Aquatic communities (algae, invertebrates, fish) have been used for decades to assess the biological quality of rivers. Practical methods to calculate biotic indices have been designed (e. G. , based on macroinvertebrate diversity indices) to be applied routinely by managers of aquatic environments. These standardized methods did not reflect a repository corresponding to the "reference" state of the communities to be expected under natural conditions. . During the last decade, the European Water Framework Directive 2000/60/EC (WFD) has prompted a large number of works that have led to a redefinition of biomonitoring tools. One of the newer approaches to assessing the ecological quality of rivers within the Framework is the Reference Condition Approach (RCA), where ecological health is defined in terms of similarity to an undisturbed ("reference") state. Although new, RCA-based bioassessment tools are now implemented in continental Europe, these methods are not directly transferable to EU's Overseas Territories, where biogeographic and climatic conditions on the one hand, and lack of knowledge of the fauna on the other hand do not allow to apply current EU standards. We designed a WFD-compliant biomonitoring index adapted to rivers of Guadeloupe (French Lesser Antilles). The development of this index required to deepen our knowledge of the fauna, and then to define a biotypology of rivers. Our results highlight the importance of land use and geomorphology in the definition of three ecological sub-regions (clusters) for benthic invertebrates. Based on this work, it was possible to create a multi-metric index (IBMA-971) to evaluate the ecological quality of rivers. Among 411 metrics (transformed into ecological quality ratio), we selected metrics with a high efficiency of discrimination, poor specificity and high stability under reference conditions. This index consists of 6 metrics derived from taxonomic diversity, richness, abundance and preference for substratum types. From a set of test data, we found that the IBMA-971 was sensitive to a wide range of anthropogenic impacts. This index proved applicable to islands from the same biogeographical region. In addition, an alternative (cost-effective and less time consuming) sampling method for the calculation of the IBMA was tested. Our results demonstrate that artificial substrates allow a quick assessment of ecological quality in Guadeloupe
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Fabrizi, Angelisa. "Biodiversité des communautés d'invertébrés benthiques et réponses aux perturbations anthropiques." Toulouse 3, 2009. http://thesesups.ups-tlse.fr/796/.

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Abstract:
En écologie appliquée, les outils de bioindication restent basés sur les attributs structurels de communautés. Les trois types de perturbations envisagés sont: l'élévation de la charge organique, la réduction des débits par captation d'eau, l'interruption du continuum fluvial. Les invertébrés benthiques font l'objet une double caractérisation, par leur composition taxonomique et par le codage flou de 22 traits biologiques décrivant leurs potentialités écologiques, biologiques et physiologiques. Avec des analyses multivariées, nous cherchons à établir des relations entre les changements des conditions des milieux le long des cours d'eau (amont-aval), la composition des communautés, et leurs potentialités fonctionnelles. De notre travail, il ressort que les combinaisons de traits biologiques et écologiques des invertébrés benthiques répondent aux perturbations anthropiques de façon significative<br>In river ecology, biological assessment tools of water policies rely on structural properties of communities, although the ultimate goal is to preserve and/or restore the functioning of freshwater ecosystems. Three particular anthropogenic perturbations were chosen: the input of organic matter, water captation, interruption of the river continuum. Macroinvertebrate species allowed to analyse, through a fuzzy-coding technique, the specificity of the combinations of the ecological and biological variables of communities which discriminate the different typologies of perturbation and to bring out functional shifts in river communities in relation to community structure and habitat alteration. From our study, it appeared that species traits did well at revealing functional changes within communities subjected to disturbance, as species with certain traits were eliminated and/or replaced by others that are subjected to alterations
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Arevalo, Elorri. "Effets potentiels du changement climatique sur la survie et la croissance de la truite fario (Salmo trutta L.) : conséquences de la température et des crues hivernales sur les jeunes stades." Thesis, Pau, 2017. http://www.theses.fr/2017PAUU3009/document.

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Abstract:
Le changement climatique devrait induire une augmentation des précipitations pendant l'hiver et le printemps dans les régions tempérées et la côte nord de l'Europe. Dans les écosystèmes fluviaux, les précipitations affectent directement le débit des eaux courantes et les rivières subiront des crues plus sévères. En outre, la température de l'air et de l'eau augmenteront à travers le monde. Ces nouvelles conditions environnementales vont avoir des conséquences sur la phénologie des espèces et les interactions prédateurs/proies. Les jeunes truites fario (Salmo trutta L.) commencent leur alimentation exogène en mars/avril. Cette étape critique de leur cycle de vie induit d’importants changements aussi bien physiologiques que comportementaux. Pour permettre un bon développement des individus et un taux de survie élevé, les proies doivent être disponibles et abondantes, en particulier à ce moment de l’ontogénèse où les juvéniles sont vulnérables au manque de nourriture et à la prédation. Des expériences en milieux contrôlés ont été menées pour quantifier la sensibilité à différentes modalités de vitesses de courant de trois espèces d’invertébrés couramment consommées par les salmonidés et pour évaluer l’effet de la température sur le métabolisme d’alevins en situation de jeûne. Des expériences en milieu semi-naturel ont été mises en place pour mieux comprendre les effets d’une crue sur la communauté d’invertébrés et sur la survie, le comportement et la croissance des alevins en première alimentation. Il apparaît que la crue impacte différemment les truites en fonction du moment de la saison auquel elles commencent à s’alimenter (au début ou à la fin du printemps) et de la productivité du système<br>Global Climate Change will increase precipitations in the temperate and Northern coast of Europe during winter and spring. In riverine ecosystems, precipitation affects directly the discharge of running waters and, thus, it is predicted that streams will face more severe floods. Additionally, air and water temperature will increase all over the world. These new environmental conditions can alter the phenology of species and predator/prey interactions. Newborns of brown trout (Salmo trutta L.) start their exogenous feeding in March/April. This stage is a critical step as individuals undergo huge physiological and behavioral changes. To allow a good development and a high survival rate, prey has to be abundant, particularly during early ontogenesis when they are most vulnerable to food scarcity and predation. In this thesis, experiments in controlled-environment were conducted to estimate the effect of water velocity on the preferred prey taxa for salmonids and to understand the effect of temperature on the metabolism of alevins facing starvation. Experiments in semi-natural conditions were set up to better understand the effects of floods on invertebrate communities and on survival, behavior and growth of first-feeding alevins. Our data support that floods affect trout differently depending on when they start feeding (early or late spring) and the availability of prey in their environment
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Jabiol, Jeremy. "Biodiversité et décomposition des litières dans les cours d'eau : influence des interactions trophiques." Phd thesis, Université Paul Sabatier - Toulouse III, 2010. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00741837.

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Abstract:
L'évaluation des conséquences de l'érosion de la biodiversité sur le fonctionnement de divers écosystèmes est récemment devenue une problématique centrale de l'écologie. Par le biais de 4 expériences réalisées dans des cours d'eau de tête de bassin, nous avons montré que la diversité de la ressource, des organismes décomposeurs, et de leurs prédateurs peuvent altérer le processus de décomposition par le biais de différents mécanismes. Notamment, il est montré que des altérations concomitantes de la biodiversité à plusieurs niveaux trophiques peuvent avoir des conséquences synergiques sur le fonctionnement de ces écosystèmes et l'efficacité de la décomposition des litières. Ces résultats suggèrent que l'évaluation formelle des conséquences de l'érosion de la biodiversité nécessite une prise en compte plus systématique de l'influence de la complexité trophique sur la structuration des communautés et sur le fonctionnement des écosystèmes.
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Richert, Caroline. "Comparaison de marqueurs biochimiques chez les poissons (induction de l'activité éthoxyrésorufine-O-deéthylase et inhibition de l'activité acétylcholinestérase) et d'indicateurs écologiques (peuplement de macroinvertébrés) pour le diagnostic in situ de la pollution toxique dans les cours d'eau." Lyon 1, 1994. http://www.theses.fr/1994LYO10356.

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Grelle, Claire. "Impact des métaux lourds sur les peuplements de macroinvertébrés de la faune du sol : influence du cadmium et du plomb sur différents aspects de la physiologie de deux modèles biologiques : Lithobius forficatus (myriapode chilopode) et Eisenia fetida (annelide oligochete)." Lille 1, 1998. https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/Th_Num/1998/50376-1998-293.pdf.

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Abstract:
Dans le cadre du programme de recherches concertees environnement et activites humaines - etude d'un secteur pollue par les metaux mis en uvre par le conseil regional du nord-pas de calais, l'etude de l'etat de la faune invertebree du sol d'une zone polluee par les metaux a ete entreprise. Le suivi annuel de la diversite faunistique de cinq stations presentant des degres divers de pollution ainsi que celui de deux stations temoins a ete realise. Il n'a pas ete mis evidence de distorsion flagrante de la qualite des peuplements dans les zones moyennement polluees. Inversement, la faune de la pelouse metallicole d'auby presente un important deficit en invertebres decomposeurs a mettre en relation avec l'accumulation de litiere observee. Dans un deuxieme temps et dans un souci de developpement d'outil de diagnostic des zones contaminees, l'etude de la physiologie et du stress metallique chez deux modeles biologiques eisenia fetida (annelide, oligochete) et lithobius forficatus (myriapode, chilopode) a ete entreprise. Les dynamiques d'accumulation des metaux ont mis en evidence des strategies opposees de detoxication : eisenia fetida stocke de maniere cumulative le cadmium et le plomb alors que lithobius forficatus apres une breve periode d'accumulation du metal ingere, l'excrete de maniere efficace. Aucun effet des metaux sur differentes cibles enzymatiques, biomarqueurs potentiels n'a ete mis en evidence. La localisation tissulaire des metaux chez les deux modeles a ete tentee par voie d'autometallographie.
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Ruaux, Brigitte. "Les plantes envahissantes des corridors fluviaux : traits biologiques, impacts de Ludwigia peploides et L. grandiflora en Loire moyenne et implications pour la gestion." Phd thesis, Université François Rabelais - Tours, 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00380073.

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Abstract:
En Loire moyenne, deux espèces de Jussies exotiques invasives colonisent principalement les annexes hydrauliques et les grèves du lit endigué. La biologie de ces deux taxons, leurs impacts sur les communautés végétales et animales ont été étudiés. Les résultats des suivis de terrain et des expérimentations in situ et ex situ démontrent en particulier : (i) des différences entre les deux espèces concernant leurs traits reproductifs et leur développement, (ii) la possibilité d'un cycle de reproduction sexuée complet sous le climat ligérien, (iii) un impact nul sur les communautés végétales d'hydrophytes mais qui semble négatif sur les communautés riveraines, (iv) peu de différences entre la diversité et la structuration des communautés d'invertébrés des herbiers de macrophytes autochtones et exotiques. A partir de ces résultats, nous proposons de mettre en oeuvre un protocole de veille et de gestion, en intégrant la nouvelle donnée de forte probabilité de reproduction sexuée.
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Trouilhé, M. C. "Etude biotique et abiotique de l'habitat préférentiel de l'écrevisse à pattes blanches (Austropotamobius pallipes) dans l'ouest de la France. Implications pour sa gestion et sa conservation." Phd thesis, Université de Poitiers, 2006. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00117200.

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Abstract:
De novembre 2002 à décembre 2005, l'habitat préférentiel de l'écrevisse indigène à pattes blanches (Austropotamobius pallipes) a été défini dans le « pays de Gâtine » (Deux-Sèvres, France). Pour cette étude, huit cours d'eau, répartis dans quatre bassins hydrographiques différents, ont été sélectionnés. Sur chaque ruisseau, deux points de prélèvement ont été choisis : le premier, le plus en amont, était situé au niveau de la population d'A. pallipes et le second, 2 à 3 km en aval, était dépourvu d'écrevisse à pattes blanches. Vingt-trois paramètres physico-chimiques, concernant les composantes minérale et organique de l'eau, ont été très régulièrement mesurés et quatre prélèvements de la faune de macroinvertébrés benthiques ont été réalisés. Ce suivi a permis d'acquérir une importante base de données pour caractériser les tolérances d'A. pallipes vis-à-vis de certains paramètres ce qui nous a conduit à discuter son statut de bioindicateur de la qualité des eaux. L'utilisation d'analyses multivariées (Analyse en Composantes Principales majoritairement) a montré (i) que la matière organique serait un des facteurs discriminants dans la présence/absence d'A. pallipes et (ii) que, précisément, la présence d'A. pallipes est associée à celle de familles de macroinvertébrés les plus sensibles aux pollutions organiques. L'ACP a aussi permis de réduire considérablement le nombre de paramètres abiotiques et biotiques informatifs. De plus, l'utilisation de ces paramètres sélectionnés pour modéliser par Réseaux de Neurones Artificiels (RNA) la présence/absence d'A. pallipes a fourni des résultats satisfaisants et prometteurs en terme de gestion et de conservation de cette espèce menacée.
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Monoury, Eve. "Fonctionnement écologique des zones de dépôt dans les ruisseaux : contribution des invertébrés benthiques aux processus de décomposition des litières et de bioturbation." Phd thesis, Université Paul Sabatier - Toulouse III, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00978432.

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Abstract:
Les zones de dépôts des ruisseaux de tête de bassin abritent des communautés macrobenthiques diversifiées. Les caractéristiques physiques de ces habitats permettent l'établissement d'un réseau trophique complexe. De fortes variations saisonnières de ces communautés ont été observées dans les ruisseaux de la Montagne Noire. Le fonctionnement écologique de ces habitats a été étudié via la décomposition des litières et la bioturbation. L'intensité de ces deux processus est régulée par les assemblages d'invertébrés spécialisés : les déchiqueteurs et les remanieurs. Une méthode de quantification du remaniement sédimentaire de surface a été développée permettant l'étude de ce processus dans les ruisseaux. Il existe de fortes différences interspécifiques dans la capacité et le mode de bioturbation chez les remanieurs des ruisseaux. Ce travail contribue à améliorer les connaissances relatives au contrôle biotique sur le fonctionnement écologiques des ruisseaux.
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Crenier, Clément. "Vers une réévaluation des facteurs limitant la production biologique dans les cours d’eau de tête de bassin versant : nutriments, acides gras ou qualité du carbone détritique ?" Thesis, Université de Lorraine, 2017. http://www.theses.fr/2017LORR0361/document.

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Abstract:
Les cours d’eau de tête de bassin versant, malgré leurs tailles réduites, jouent des rôles importants pour le fonctionnement des milieux situés en aval, et rendent de nombreux services écologiques. Depuis l’émergence du River Continuum Concept, le fonctionnement de ces cours d’eau est considéré comme reposant principalement sur les apports allochtones de matière organique détritique par opposition aux écosystèmes aval de plus grande taille dans lesquels la production primaire autochtone est considérée comme prépondérante. Bien que les détritus soient, par définition, des ressources de moindre qualité pour leurs consommateurs que les végétaux vivants, le rôle des facteurs qui limitent la production biologique et les processus fonctionnels dans ces écosystèmes détritiques reste encore peu exploré. Par exemple la carence en éléments minéraux essentiels (notamment en azote et en phosphore) dans les détritus peut limiter le développement des organismes vivants dans les cours d’eau. De ce fait, la disponibilité en éléments minéraux dans la colonne d’eau, en stimulant la croissance, l’activité des décomposeurs et la qualité élémentaire des ressources par le processus d’immobilisation microbienne, pourrait contrôler pour partie les processus écologiques en jeu dans ces écosystèmes. En étudiant in situ la réponse des communautés microbiennes aux nutriments le long d’un gradient d’occupation des sols, nos travaux ont mis en évidence un effet positif des éléments dissous (N et P) sur la décomposition des litières et les activités enzymatiques des décomposeurs, et ce même pour les niveaux en nutriments les plus élevés du gradient, pour lesquels des effets inverses étaient attendus. Indépendamment, dans des cours d’eau anciennement soumis à de forts dépôts acidifiants, nous avons pu observer une récupération du processus de décomposition des litières. Néanmoins, cette restauration s’accompagnant d’un appauvrissement marqué en N, des perturbations du fonctionnement de ces cours d’eau pourrait se manifester à terme. Le rôle de la production primaire dans les cours d’eau de tête de bassin versant a ensuite été questionné. En effet, bien qu’étant mineur quantitativement, l’apport de carbone de forte qualité pourrait jouer un rôle non négligeable sur le fonctionnement des cours d’eau de tête de bassin versant. En particulier, l’importance et le rôle des apports en acides gras polyinsaturés (AGPI) via les biofilms phototrophes ont été questionnés. En se basant sur un suivi de terrain sur 15 cours d’eau des Vosges le long d’un gradient d’acidification, nos recherches ont tout d’abord pu mettre en évidence la présence de biofilms diatomiques riches en AGPI, malgré le caractère très forestier de ces cours d’eau. Dans un second temps, une expérience en conditions contrôlées a permis d’observer le rôle positif des apports, mêmes faibles, de ressources diatomiques sur la croissance et la survie du crustacé amphipode Gammarus fossarum. Sans cet apport, ces organismes se sont avérés incapables de maintenir leurs niveaux internes d’AGPI, suggérant qu’une consommation de producteurs primaires autochtones était indispensable à ces organismes détritivores. Nos résultats ont ainsi pu mettre en évidence les rôles fondamentaux que peuvent jouer la disponibilité en éléments dissous (N et P) et la qualité du carbone dans les ressources sur la production biologique et sur le processus de décomposition des litières dans les cours d’eau de tête de bassin versant. Ces résultats appellent désormais à investiguer plus profondément les interactions entre ces deux facteurs limitants, et à comprendre dans quels contextes l’un des facteurs pourrait suppléer l’autre. En particulier, il sera intéressant de rechercher comment diverses perturbations anthropiques (xénobiotiques, réchauffement climatique etc…) pourraient affecter l’intensité ou la nature de ces limitations<br>Despite their reduced sizes, headwater streams play important roles in the functioning of downstream ecosystems and provide numerous ecological services. Since the River Continuum Concept, the functioning of these streams has been considered as mainly relying on allochthonous supplies of detrital organic matter for their functioning, in contrast with downstream ecosystems of larger size where primary production is considered to be predominant. Despite that detritus represent, by definition, a resource of lower quality for its consumers than living plants, the nature of the factors limiting the biological production and functional processes in these detrital ecosystems remains sparsely explored. First, the lack of essential elements (in particular nitrogen and phosphorus) in detritus could be a major constraint for the development of living organisms in streams. As a result, the availability of mineral elements in the water column, by stimulating the growth and activity of decomposers, but also by increasing the elemental quality of resources through microbial immobilization, could control ecological processes in a higher extent than previously believed in these ecosystems. By studying in situ, the response of microorganisms to nutrients availability along a land-use gradient, our results have shown a positive effect of the dissolved elements (N and P) on the decomposition of leaf litters and the enzymatic activities of the decomposers, even for the highest nutrient levels of the gradient, for which adverse effects were expected. Independently, in streams formerly subjected to acidification, we observed a recovery of the process of leaf litter decomposition. Nevertheless, this recovery was accompanied by a marked N reduction in the ecosystem, huge changes in stream functioning might be expected in the medium to long term. The role of autochthonous primary production was then questioned. Indeed, while being quantitatively minor, this contribution of high quality carbon may play a significant role in the functioning of headwater streams. In particular, the importance and role of polyunsaturated fatty acid (PUFA) intakes via phototrophic biofilms was questioned. Based on a field survey of 15 rivers in the Vosges Mountains along an acidification gradient, our results first showed the presence of diatomic biofilms rich in PUFA, despite these streams are clearly in a forested context. In a second step, an experimentation carried out under controlled conditions permitted to observe the positive role of diatomic resources, even in low concentrations, on the growth and survival of the crustacean amphipod Gammarus fossarum. Without this input, these organisms were unable to maintain their internal levels of PUFAs, suggesting that the consumption of autochthonous primary producers might be essential for these detritivore organisms. All our results permit to highlight the fundamental roles that can be played by the availability of dissolved elements (N and P) and the carbon quality of the resources on the biological production and on leaf litter decomposition in headwater streams. These results stress the need for more profound investigation of the interactions between these two limiting factors, and for understanding in which contexts one factor could supplement the other. In particular, it will be interesting to investigate to what extent various anthropogenic disturbances (xenobiotics, global warming, etc...) could affect the intensity or the nature of these limitations
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Ruaux, Brigitte. "Les plantes envahissantes des corridors fluviaux : traits biologiques, impacts de Ludwigia péploides et L.grandiflora en Loire moyenne et implications pour la gestion." Thesis, Tours, 2008. http://www.theses.fr/2008TOUR4040/document.

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Abstract:
Dans le bassin de la Loire, et plus particulièrement en Loire moyenne, deux espèces de Jussies (Ludwigia peploides (Kunth) Raven subsp. montevidensis (Spreng.) Raven, L. grandiflora (Michx.) Greuter &amp; Burdet subsp. hexapetala (Hook. &amp; Arn.) Nesom &amp; Kartesz) amphiphytes exotiques invasives colonisent principalement les annexes hydrauliques et les grèves du lit endigué. Cette thèse étudie la biologie (reproduction, implantation, dissémination, …) de ces deux taxons, leurs impacts sur les communautés végétales et animales (macroinvertébrés aquatiques) afin de mieux adapter leur gestion. Les résultats des suivis de terrain et des expérimentations in situ et ex situ démontrent en particulier : (i) des différences entre les deux espèces concernant leurs traits reproductifs et leur développement sur les annexes hydrauliques et les grèves, (ii) la possibilité d’un cycle de reproduction sexuée complet sous le climat ligérien, (iii) un impact nul sur les communautés végétales d’hydrophytes mais négatif sur les communautés riveraines étudiées, (iv) peu de différences entre la diversité et la structuration des communautés d’invertébrés dans les herbiers de macrophytes autochtones et exotiques. A partir de ces résultats, nous proposons de mettre en oeuvre un protocole de veille et de gestion des Jussies dans les deux types d’habitats (annexes hydrauliques et grèves), en intégrant tout particulièrement la nouvelle donnée de forte probabilité de reproduction sexuée<br>In the Loire catchment, and particularly in the middle Loire River, two species of water primroses (Ludwigia peploides (Kunth) Raven subsp. montevidensis (Spreng.) Raven and L. grandiflora (Michx.) Greuter &amp; Burdet subsp. hexapetala (Hook. &amp; Arn.) Nesom &amp; Kartesz) which are invading exotic amphiphytes. They, mainly colonize former channels and river banks in the in between-dykes floodplain. This thesis studies the biology (reproduction, establishment, dispersal, …) of those two taxa, their effects on plant and animal communities (aquatic macro-invertebrates) in order to optimize their management. The results of the field surveys as well as in situ and ex situ experimentations show in particular: (i) differences between the two species concerning their reproduction features and their development in former channels and river banks, (ii) the possibility of a complete sexual reproduction cycle in the climatic conditions of the middle Loire River, (iii) the absence of effetcs on hydrophyte communities but a negative one on riparian communities, (iv) few differences between the diversity and the structure of invertebrate communities in stands of both native macrophytes and exotic ones. From those results we suggest a survey and management protocol for water primroses in the two types of habitats (former channels and river banks), including in particular the new piece of data on high probability of sexual reproduction
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Descroix, Aurélie. "Croissance et régime alimentaire des juvéniles de Saumon atlantique (Salmo salar L. ) dans la rivière Allier : origine et transferts des acides gras dans la chaîne trophique." Phd thesis, Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2009. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00725306.

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Abstract:
Ce projet a été conduit dans le contexte général du renforcement de la population naturelle de Saumon atlantique de l'Allier et s'est focalisé sur les modalités de croissance des juvéniles et tacons en grand cours d'eau. Nous nous sommes intéréssés au développement des juvéniles relâchés dans le milieu naturel, avant de considérer ensuite la chaîne trophique dans son ensemble. Notre travail avait plusieurs objectifs : 1-Effectuer une analyse de l'alimentation, de la croissance et du statut nutritionnel des tacons issus d'une salmoniculture, relâchés et recapturés le long du continuum fluvial de l'Allier ; 2-Evaluer si, en raison de compositions en acides gras différentes, les macroinvertébrés pouvaient affecter la croissance des tacons, ainsi que leur survie hivernale ; 3-Déterminer, grâce à une approche par les AG biomarqueurs, l'origine des composés lipidiques retrouvés dans les macroinvertébrés et identifier les sources de C assimilées par ces derniers le long du continuum fluvial.
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Felten, Vincent. "Effets de l'acidification des ruisseaux vosgiens sur la biologie, l'écologie et l'écophysiologie de Gammarus fossarum Koch, 1835 (Crustacea Amphipoda) : Approche intégrée à différents niveaux d'organisation." Metz, 2003. http://www.theses.fr/2003METZ029S.

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Abstract:
De part ses caractéristiques naturelles, le massif vosgien est une zone très sensible au problème d'acidification des eaux de surface. Nos travaux ont essentiellement porté sur l'étude d'un crustacé amphipode acido-sensible, Gammarus fossarum, en optant pour une approche à différents niveaux d'organisation. Nous avons tout d'abord identifié les paramètres physico-chimiques influençant la répartition et l'abondance de l'espèce dans les ruisseaux. Dans un second temps, nous avons évalué l'effet de stress acides épisodiques sur les communautés benthiques en général et plus particulièrement sur G. Fossarum. Un troisième volet a consisté en l'étude des effets de l'acidification sur la physiologie et la survie de G. Fossarum afin de proposer un biomarqueur. Dans un quatrième temps enfin, après avoir précisé certains traits écologiques et biologiques de l'espèce, nous avons tenté de révéler l'effet que peuvent générer des stress acides épisodiques sur ces caractéristiques bio-écologiques<br>Due to its natural characteristics, the Vosges massif is particularly sensitive to the acidic atmospheric depositions, which generates an acidification of forested headwater streams. The present study mainly focuses on the study of an acid-sensitive species Gammarus fossarum by following an approach at different levels of biological organisation. In this context we have first identified the physicochemical parameters influencing the distribution and the density of this species in headwater streams. Secondly, we evaluated the effect of episodic-acid-stresses on benthic communities in general and on G. Fossarum in particular. A third step consisted in studying the effects of the acidification on the ecophysiology and the survival of the amphipod in order to purpose a biomarker (Hemolymph [Na+] and [Cl-]). We also defined several ecological and biological traits of G. Fossarum. Finally, we tried to assess the consequence of acidic stress on these traits
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Staentzel, Cybill. "Dynamique des communautés biologiques dans un contexte de restauration par injection sédimentaire et érosion maitrisée : cas du Vieux Rhin, France." Thesis, Strasbourg, 2018. http://www.theses.fr/2018STRAH004/document.

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Abstract:
Le Rhin a subi d’importantes modifications qui ont altéré la biodiversité de l’ensemble de la plaine alluviale. Des actions de restauration ont été initiées pour lui redonner une part de son fonctionnement hydromorphologique naturel. Le travail de thèse a consisté à évaluer les effets de ces restaurations et à mettre en évidence les processus mis en jeu dans les changements de la biocénose des milieux restaurés. Les résultats ont démontré que les communautés biologiques sont non seulement gouvernées par les modifications physiques post-restauration mais aussi par l’influence discrète de déterminants externes à la restauration tels que les invasions biologiques ou la dynamique interne du fleuve. L’aspect transitoire des bénéfices obtenus a été souligné comme la principale limite de l’injection sédimentaire alors que les épis transversaux artificiels mis en place dans le cadre d’un essai d’érosion maitrisée se sont révélés être les facteurs de durabilité des effets écologiques<br>The Rhine River has undergone major engineering works that led to severe alterations which helped to alter the biodiversity of the entire floodplain. Restoration actions have been initiated to give it back a part of its natural hydro morphological functioning. The thesis consisted in evaluating the effects of these restorations and in highlighting the mechanisms and processes involved in biocoenosis changes of the restored environments. The results also showed that the post-restoration biological community is not only defined by post-restoration physical changes but also by the discrete influence of external determinants of restoration such as biological invasions or the internal dynamics of the river. The transitional aspect of the benefits incurred has been identified as the main limit of the gravel augmentation, while the implementation of transverse artificial groynes in the controlled bank erosion has proved to be factors of sustainability of the ecological effects
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Dézerald, Olivier. "Impacts des changements environnementaux sur la biodiversité néotropicale : réponses structurelles et fonctionnelles des réseaux trophiques faunistiques des broméliacées à réservoirs." Thesis, Guyane, 2015. http://www.theses.fr/2015YANE0003/document.

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Abstract:
Les forêts néotropicales accueillent une importante biodiversité encore méconnue. L’intégrité des écosystèmes naturels est menacée par les changements environnementaux (e.g., réchauffement climatique, destruction des habitats), par conséquent, identifier les facteurs structurants, naturels et anthropiques, du fonctionnement des écosystèmes, représente un défi scientifique crucial. L’inhérente complexité de ces milieux diversifiés pose de nombreux problèmes conceptuels et logistiques comme un échantillonnage exhaustif et/ou l’identification des espèces. Les broméliacées à réservoirs sont des écosystèmes miniatures adéquats pour pallier ces difficultés, car elles retiennent de l’eau de pluie et accumulent de la matière organique au creux de leurs feuilles, permettant ainsi de supporter des réseaux trophiques simples d’invertébrés aquatiques. Elles peuvent être échantillonnées exhaustivement, ont une forte abondance locale, et une large aire de répartition. De l’échelle locale à biogéographique, les travaux de cette thèse visent d’abord à comprendre comment ces communautés se structurent en réponse à l’hétérogénéité naturelle des forêts amazoniennes (e.g., ouverture de la canopée, fluctuations climatiques saisonnières), puis tente de prédire, par le biais d’expérimentations in situ et au laboratoire les réponses structurelles et fonctionnelles de ces communautés à divers scénarios de changement climatique. Une attention particulière a été portée sur l’impact de la température et des précipitations sur la physiologie et le comportement d’espèces clefs, et sur les interactions trophiques au sein des communautés<br>Neotropical forests shelter an astonishing and underrated biodiversity. The integrity and stability of these natural ecosystems are threatened by human-induced environmental changes. Therefore, highlighting the determinants of ecosystem functioning, be they natural or anthropogenic, is a daunting but paramount scientific challenge. The intrinsic complexity of highly diversified ecosystems arouses both conceptual and logistical difficulties, which we handle, by manipulating tiny ecosystems, the tank bromeliads. The leaves of tank bromeliads form wells that hold rainwater and intercept leaf litter, allowing for a simple invertebrate aquatic community to thrive. These plants can be exhaustively sampled, are naturally replicated, and widely distributed.From local to biogeographic scales, this thesis aims at understanding how these communities respond to the natural heterogeneity of Amazonian forests, and at predicting the impacts of human-induced disturbances on the structure and functioning of these communities, using in situ and lab experiments. Particular focus is attributed to the influence of some aspects of climate changes (e.g., warming, and various precipitations scenarios) on individual physiology, behavior, and trophic interactions
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Gocel-Chalté, David. "Déterminants spatio-temporels de la qualité des cours d’eau dans un contexte de déprise et de changement des activités : rôle possible des facteurs du passé." Electronic Thesis or Diss., Université de Lorraine, 2020. http://www.theses.fr/2020LORR0094.

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Abstract:
Au cours de l’holocène, les activités humaines ont continuellement affecté le fonctionnement des écosystèmes naturels et ont aujourd’hui un impact à l’échelle globale. La situation actuelle est notamment préoccupante pour l’état des écosystèmes d’eau douce, mais les activités locales historiques peuvent également toujours avoir un impact sur ces écosystèmes et sont très rarement pris en compte dans la gestion des cours d’eau. Les ruisseaux de têtes de bassin versant, dont le fonctionnement est basé sur les apports de matière organique terrestre, sont particulièrement sensibles aux usages des territoires adjacents et sont donc susceptibles d’être actuellement affectés par des stress d’origine historique. Il semble donc pertinent d’identifier de tels effets des activités passées sur les milieux dulçaquicoles et d’en comprendre les mécanismes (persistance des perturbations dans le paysage, résistance/résilience des milieux naturels). Durant ce doctorat, nous avons mené une étude prospective in situ pour tenter de déterminer si les héritages d’éventuelles activités historiques dans des paysages de tête de bassin versant peuvent influencer la qualité écologique actuelle des ruisseaux locaux. Pour cela, nous avons associé une approche d’écologie historique des paysages (anthracologie, étude de cartes anciennes, …) et une étude des paramètres biotiques et abiotiques des ruisseaux. Respectivement, le premier aspect avait pour but d’étudier l’histoire des écosystèmes forestiers au cours des derniers siècles et de référencer des aménagements anthropiques anciens (zones déboisées, sites de production de charbon, habitations, étangs) dans ces milieux. Le second aspect consistait à déterminer l’état écologique des ruisseaux par une approche multiparamétrique. Les résultats de cette approche menée sur des bassins versant forestiers du massif des Vosges du Nord ont révélé que ces ruisseaux, sur un territoire à la naturalité importante, présentent dans leur ensemble une bonne qualité écologique. Si la présence d’étangs d’âges variables impacte les communautés d’invertébrés benthiques, les écarts au bon état écologique sont très probablement d’origines contemporaines, comme des rejets urbains ou des pluies acides. Néanmoins, l’exploitation de la forêt pour la production de charbon de bois jusqu’au début du XXème siècle a engendré l’existence de milliers de sites de charbonnières qui semblent influencer la disponibilité du phosphore dans l’environnement. De plus, la dynamique forestière semble avoir été conditionnée par la gestion sylvicole, avec par exemple une composition floristique actuelle plus riche en résineux que par le passé (avant le charbonnage). Ces aspects nous amènent à penser que les activités anthropiques ont en partie influencé la composition des apports en matière organique vers les ruisseaux. Nous pouvons conclure que la construction d’étangs et le charbonnage historique réalisés dans ces forêts influent sur les caractéristiques des ruisseaux en parallèles des stress actuels. Ainsi, ce doctorat ouvre des pistes fortes de recherche à propos des flux de nutriments dans les compartiments aquatiques et terrestres, sous influence des charbonnières, pour mieux comprendre l’impact réel de cette pratique au cours du temps<br>Human activities have been continuously affecting natural ecosystems functioning during the Holocene and it actually have an impact at a global scale. There is particular concern over the integrity of freshwater ecosystems, however local past activities can also still impact these ecosystems and are rarely considered for the management of streams. The headwater streams especially, whose functioning is based on terrestrial organic matter inputs, are sensitive to human uses of neighboring lands, and so may be actually affected by stresses of historical origin. It seems pertinent to identify such effects of past activities on freshwater ecosystems and to understand the mechanisms involved in these processes. During this thesis project we conducted a prospective in situ study, to determine the influence of the legacy of potential historical activities on the current ecological quality of headwater catchment streams. We combined an approach of historical ecology of landscapes (anthracology, study of old maps, …) with a study of biotic and abiotic parameters of streams. The first approach aimed to study the woodland composition of last centuries and to georeference old human uses (deforested areas, charcoal production sites, homes, ponds, …). The second aimed to determine the integrity of stream by multiparametric analyses. The results of this study, realized on forested catchments of northern Vosges mountains, revealed that the streams which are situated in a low-impacted landscape, globally have a good ecological quality. Some ponds with different ages have an impact on the composition of aquatic macroinvertebrates communities and deviation to good ecological state, maybe due to urban pollutions or acidic rainfalls. Nevertheless the exploitation of forest for the production of wood charcoal until the beginning of XXth century lead to the creation of thousands of charcoal production sites (CPS) that affect the availability of phosphorus both in environment. Moreover, woodland dynamic seems to have been conditioned by the sylviculture, leading to a higher proportion of coniferous species today than in the past (before the beginning of charcoal production). These aspects lead us to believe that human activities have been influencing organic matter inputs into streams. We can conclude that the historical building of ponds and the charcoal production in these woodlands have an influence on actual characteristics of streams, in parallel to modern stresses. Thus, this project open strong lines of research about the nutrients fluxes in aquatic and terrestrial ecosystems under the influence of charcoal production sites. This could help us to better understand the impact of this activity across history
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