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Dissertations / Theses on the topic 'Maïs – Fléaux – Lutte biologique contre'

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Jabeur, Rania. "Identification et caractérisation de protéines ayant des propriétés entomotoxiques contre deux principaux ravageurs du maïs." Thesis, Université de Montpellier (2022-….), 2022. http://www.theses.fr/2022UMONG004.

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Abstract:
Du fait de leur grande adaptabilité aux méthodes de lutte, les insectes demeurent une menace constante pour les plantes cultivées. Le maïs (Zea mays L.) est la troisième culture la plus importante dans le monde après le riz et le blé. La chrysomèle des racines du maïs (WCR) Diabrotica virgifera virgifera (LeConte, 1868) et la chenille légionnaire d'automne (FAW) Spodoptera frugiperda (J.E. Smith, 1797) sont parmi les ravageurs les plus importants du maïs et sont responsables de fortes pertes de rendement chaque année. Le maïs Bt exprimant des protéines insecticides provenant de Bacillus thuringiensis a été pendant longtemps une bonne alternative aux pesticides. Cependant, leur utilisation massive a conduit à l'apparition de populations de ravageurs résistantes, d'où la nécessité de trouver de nouvelles molécules et stratégies biotechnologiques ou de contrôle biologique pour gérer durablement ces insectes. Mes travaux de thèse s’inscrivent dans cet objectif et visent à trouver de nouvelles solutions contre WCR et FAW. Dans la première partie, je me suis particulièrement intéressée à une protéine binaire appelée GDI0005A/GDI0006A identifié dans un criblage contre des larves de WCR. Ces protéines ont été isolées de la bactérie Chryseobacterium arthrospharae et ont montré une activité insecticide, lorsqu'elles sont exprimées sous forme de protéines recombinantes, contre des population de WCR sensibles et résistantes aux protéines commerciales Cry3Bb1 et Gpp34Ab1/Tpp35Ab1. Ces résultats suggèrent que ces nouvelles protéines insecticides pourraient avoir des modes d’action différents de ceux des protéines Bt actuellement déployées et donc un nouveau mode d'action. Le deuxième membre de la protéine binaire (GDI0006A) est une lipoprotéine membranaire que j’ai purifiée partiellement. Cette propriété a été un facteur limitant pour évaluer le niveau d'activité de la protéine GDI0005A/GDI0006A. Nous avons essayé d'exprimer la protéine binaire en plante en utilisant deux systèmes d'expression : transitoire et stable. Les deux ont montré une faible accumulation de GDI0006A entraînant une perte de l'activité par rapport au essais au labo avec des lysats bactériens. Nous avons également démontré que des cultures de la bactérie d’origine C. arthrosphaerae avait une activité contre WCR ce qui en fait un agent de biocontrôle potentiel contre les chrysomèles.La deuxième partie a été consacrée à l'étude de l’éventuelle synergie entre Junonia coenia densovirus (JcDV) et une protéine insecticide Bt Cry2Ab2 dans une perspective de les combiner pour des applications de biocontrôle. Les deux sont connus pour infecter FAW et perturber la perméabilité intestinale de ce ravageur. Cependant, lorsqu’ils ont été testés ensemble avec des approches ex vivo et in vivo, nous avons plutôt remarqué un antagonisme suggérant une compétition avec les mêmes récepteurs intestinaux. Nous avons aussi vérifié la faisabilité de l'utilisation de VP4, la protéine majoritaire de la capside de JcDV, dans une approche biotechnologique pour améliorer l'activité d'autres protéines insecticides qui ciblent l’intestin. Les résultats préliminaires ont montré une expression importante de VP4 dans les feuilles de Nicotiana benthamiana sans aucun signe de phytotoxicité. Nous avons aussi mis en évidence la capacité de VP4 à s'auto-assembler en pseudo-particules virales (VLP) dans la plante. Ces VLP-VP4 ont été capables de pénétrer dans les cellules intestinales de FAW lorsqu'elles ont été testées ex vivo. Cette preuve de concept sera utile pour explorer les synergies possibles avecdes protéines insecticides qui affectent l’intestin dans le but de créer de nouvelles variétés de maïs transgéniques résistants à FAW
Due to their great adaptability to management strategies, insect pests are a constant threat to crops. Maize is the third most important staple crop in the world after wheat and rice. The western corn rootworm (WCR) Diabrotica virgifera virgifera (LeConte, 1868) and the fall armyworm (FAW) Spodoptera frugiperda (J.E. Smith, 1797) are among the most serious pests of maize and are responsible for massive yield losses every year. Bt maize expressing insecticidal proteins from Bacillus thuringiensis has long been a good alternative to chemicals. However, their overuse has led to the development of resistant populations. Hence, the need to find new compounds and strategies for sustainable control of these insects. In this PhD project, we aimed to develop biotech and biocontrol solutions for both WCR and FAW. In the first part, I was particularly interested in the study of binary insecticidal proteins named GDI0005A/GDI0006A identified by screening bacterial genomes and test against WCR larvae. These proteins were identified in Chryseobacterium arthrosphaerae genome. Heterologous expression of the two components was performed in E. coli system. One of the two components (GDI0006A) was a membrane lipoprotein, and resulted in low amounts successfully purified. Nonetheless, the combination of the two proteins was active against WCR including WCR resistant to the currently marketed Cry3Bb1 and Gpp34Ab1/Tpp35Ab1 proteins. These results suggest that the new binary toxin may have different binding sites and thus a distinct mode of action compared to commercial toxins. The binary proteins were then expressed successfully in plant expression systems. However, the expression at low level of GDI0006A lead to no significant activity in planta. Finally, we tested the bacteria C. arthrospharae and show that it had activity in vitro against WCR, making of it a potential BCA against WCR.The second part was devoted to studying the possible synergy between Junonia coenia densovirus (JcDV) and a Bt insecticidal protein Cry2Ab2 for biocontrol applications. Both are known to infect FAW and disturb the midgut permeability. However, when tested together either with ex vivo or in vivo approaches, we have noticed an antagonism suggesting a competition for the same midgut receptors. We also checked the feasibility of using VP4, the major capsid protein of JcDV in a biotech approach to enhance the activity of other gut binding insecticidal proteins. The preliminary results have shown a good expression of VP4 in Nicotiana benthamiana leaves without any sign of phytotoxicity. We demonstrated the ability of VP4 to self-assemble into virus-like particles (VLPs) in plant. When tested ex vivo, VLP-VP4 were able to penetrate the FAW intestinal cells. This proof of concept will be useful to explore the possible synergies with gut-binding insecticidal proteins to create new generations of transgenic maize resistant to FAW
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2

Benmoussa-Haichour, Dalila. "Relations termites-nématodes entomopathogènes : applications à la lutte biologique." Paris 12, 1999. http://www.theses.fr/1999PA120039.

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Abstract:
Les termites sont des grands ravageurs en afrique sur culture de la canne a sucre. Une nouvelle strategie de lutte preventive s'est averee necessaire contre la caste des sexues, elle est demontree dans ce travail. Les essais de pathogenecite ont montres clairement le potentiel des steinernema e2 et k27 comme agent de controle biologique contre les differentes especes de termite chez les macrotermitinae : ancistrotermes guineensis, pseudacanthotermes spiniger, odontotermes sp. , macrotermes bellicosus et une espece xylophage reticulitermes santoneensis (rhinotermitidae) en provoquant des mortalites de 100% des individus en moins de 20 jours. La souche heterorhabditis bacteriophora s'est revelee la moins efficace. Seule la caste des soldats est la moins sensible aux differentes souches testees. La caste aile presente une forte teneur en lipide et en glucide, compares aux autres castes des differentes especes ce qui permet la multiplication des nematodes entomopathogenes. Steinernema kushidai penetre dans la caste ailee par voie buccale. Les activites heterosidasiques chez le sexue traite chutent par rapport au sexue non traite. Il est montre qu'a de fortes infestations la physiologie digestive est perturbee. La paralysie est observee et la mort survient par septicemie generalisee en 40 heures. Un fort effet pathogene de la souche steinernema carpocapasae est aussi montre par l'essai pilote conduit a la sonasut (tchad) sur les ailes ancistrotermes guineensis, la dose de 1 millions de l3 suffit a provoquer leur mortalite en une semaine. Une multiplication intense en moins de 14 jours est enregistree chez 60% des ailes testes. La sensibilite des nematodes entomopathogenes aux differents produits pesticides utilises a la sonasut (tchad) a permis de confirmer que les heterorhabditis sont plus sensibles aux differents pesticides, alors que les deux souches steinernema carpocapsae et steinernema kushidai permettent la recherche de l'hote et l'infestation apres une immersion de 4 jours dans les produits phytosanitaires. Ainsi un seul traitement au moment de l'essaimage permettrait de limiter l'implantation de nouvelles colonies de termites en afrique.
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Leroy, Valentin. "Décontamination des grains de blé et d'orge par traitements aux ultrasons." Master's thesis, Université Laval, 2017. http://hdl.handle.net/20.500.11794/27917.

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Abstract:
La production céréalière, plus particulièrement le blé et l'orge, subit des pertes importantes de rendement occasionnées par la fonte des semis et les pourritures racinaires. Deux champignons sont majoritairement responsables de ces maladies chez le blé et l'orge : Fusarium graminearum et Bipolaris sorokiniana. L'utilisation des ultrasons comme une alternative « verte » aux fongicides pourrait permettre une culture biologique et minimiser les pertes économiques. L'objectif principal de ce projet consistait à établir les paramètres optimaux (puissance des ultrasons, présence d'éthanol, débit d'oxygène et temps de traitement) afin de réduire la contamination par B. sorokiniana des grains de blé et d'orge sous un seuil de 30 % tout en conservant la germination supérieure au seuil de 85 %. L'ensemble du projet de recherche exploratoire a permis de vérifier l'efficacité de traitements novateurs pour le blé contaminé. Le traitement de ces lots de grains sous forme sèche a révélé un maintien de la germination pour tous les types de traitement (ultrasons 30 W, oxygène en bullage dans l'éthanol et les deux techniques combinées) ainsi qu'une réduction significative du taux de contamination par B. sorokiniana (en moyenne en dessous de 15 %). Pour l'orge, ces traitements semblables ont permis le maintien de la germination ainsi qu'une faible diminution de la contamination par B. sorokiniana. Cette nuance peut être expliquée par la morphologie différente des deux grains. Une réelle avancée dans le domaine du traitement des grains sous forme sèche peut être mise en évidence pour sa rapidité de traitement. Il restera à vérifier l'efficacité du traitement sur d'autres lots et sur des quantités plus importantes pour vérifier la mise à l'échelle du dispositif (supérieure à 100 g). Pour l'avenir, une étude se basant sur le microcalorimétrie sera préconisée pour étudier les prémisses de la germination des grains traités.
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4

Demeule, Elizabeth. "Effet répressif de Bacillus subtilis et de Bacillus pumilus envers Rhizoctonia solani sur tomate et concombre de serre." Master's thesis, Université Laval, 2020. http://hdl.handle.net/20.500.11794/66758.

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Abstract:
Les agents phytopathogènes telluriques constituent un problème majeur touchant les productions serricoles de concombre (Cucumis sativus L.) et de tomate (Solanum lycopersicum L.). Les traitements biologiques efficaces sont limités pour lutter contre ces agents pathogènes. Cette étude avait pour objectifs d’évaluer (1) l’effet antagoniste in vitro de Bacillus pumilus Meyer et Gottheil souche PTB180 et Bacillus subtilis (Ehrenberg) Cohn souche PTB185 envers Rhizoctonia solani J.G. Kühn, Pythium ultimum Trow, Sclerotinia sclerotiorum (Lib.) de Bary, Phytophthora capsici Leonian, Fusarium oxysporum Schltdl. et F. oxysporum f.sp. radicis-lycopersici Jarvis & Shoemaker, (2) l’effet répresseur d’une application préventive des bactéries sur la pourriture du collet et la fonte des semis causées par R. solani, sur concombre ou tomate en serre et (3) l’effet des bactéries sur la croissance et la productivité des plants de tomate cultivés en serre. Lors des essais in vitro, PTB180 et PTB185, utilisés seuls et en mélange (1:1), ont fortement inhibé la croissance mycélienne des six agents phytopathogènes. Sur plantules de concombre et de tomate, le mélange (1:1) des deux souches a permis une réduction significative (p<0,05) de la sévérité des symptômes de la pourriture du collet. PTB185 et le mélange (1:1) des deux souches ont augmenté significativement la hauteur et la masse sèche des plants infectés par R. solani. Les essais sur graines de tomate montrent que PTB180 a augmenté significativement le taux de levée des graines et que PTB185 a réduit significativement la mortalité post-levée tout en favorisant la croissance des plantules. Les tests réalisés sur plants de tomate sains n’ont pas montré d’effet significatif de PTB180 et PTB185 sur la croissance et la productivité des plants. Les bactéries à l’étude pourraient éventuellement représenter une alternative aux fongicides de synthèse pour lutter contre les agents phytopathogènes.
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Munsch, Patricia. "Lutte biologique contre la tache bactérienne du champignon de Paris au moyen de bactériophages : Spécificité et efficacité du bactériophage TO.1." Pau, 1994. http://www.theses.fr/1994PAUU3008.

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Abstract:
Des bactériophages lytiques ont été isolés dans le but de contrôler les populations pathogènes de Pseudomonas tolaasii, responsable de la tache bactérienne du champignon de paris, principal désordre phytosanitaire en champignonnière. Sur la base de caractéristiques biochimiques, de résultats de sensibilité/résistance aux antibiotiques, la population pathogène peut être considérée comme homogène. Cependant, des tests biologiques sur l'hôte ont montré divers degrés d'agressivité. Les résultats d'amplification par PCR au moyen des amorces ERIC et REP révèlent la présence de bandes majeures communes, mais les bandes mineures sont discriminantes à l'échelle de la souche. L'étude des interactions entre la population de bactériophages, composée de TO. 1 à TO. 16, confrontée à des bactéries saprophytes ou pathogènes, appartenant à différents genres et espèces, montre une spécificité étroite. La lysotypie des souches de Pseudomonas tolaasii (des formes pathogènes et variants non pathogènes) a mis une résistance en évidence : les résultats d'induction au moyen des UV et de la mitomycine C suggèrent que dans un cas au moins la résistance est liée à un phénomène de lysogénie. Les bactériophages TO. 1, TO. 3, et TO. 9 appartiennent au groupe morphologique A. 1 de la classification définie par Bradley (1967), Ackermann et Du Bow (1987). Les ADNs phagiques ont une taille qui varie entre 20 et 70 Mda. L'enzyme Hind III met un polymorphisme en évidence au niveau des phages TO. 1,9, 5-6-7-8, et 15 ; de plus, il y a cohérence au niveau de l'étude des ADNs phagiques, basée sur les profils de restriction et les résultats de lysotypie, représentés sous forme de dendogramme. Seul TO. 1 est neutralisé par l'antiserum anti-TO. 1. La compatibilité de la lutte biologique avec des agents phytosanitaires de type insecticides/fongicides a étè vérifiée : les conditions de temperature, de PH requises pour la culture du champignon de Paris ne sont pas non plus contre-indiquées avec la pulvérisation de bactériophages. Sur l'ensemble des essais mis en place à l'INRA, l'efficacité en conditions de culture est comprise entre 30 et 70% : l'utilisation de bactériophages lytiques constitue donc une alternative sérieuse de contrôle de la tache bactérienne dans le cadre d'une champignonnière.
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Bouchard-Rochette, Mathieu, and Mathieu Bouchard-Rochette. "Bacillus pumilus et Bacillus subtilis pour lutter contre la pourriture grise chez la tomate et le concombre de serre." Master's thesis, Université Laval, 2020. http://hdl.handle.net/20.500.11794/38128.

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Abstract:
Cette étude s’inscrit dans le cadre d’un programme de recherche destiné à évaluer le potentiel d’utilisation en horticulture des bactéries Bacillus pumilus souche PTB180 et Bacillus subtilis souche PTB185. Elle avait pour objectifs (1) d’évaluer in vitro l’activité antagoniste contre Botrytis cinerea des souches PTB180 et PTB185, (2) d’estimer leur capacité à survivre sur la phyllosphère de la tomate et du concombre et 3) d’évaluer leur effet sur le développement de la pourriture grise (B. cinerea) sur des plants de tomate et de concombre cultivés en serre. L'activité antagoniste de PTB180 et PTB185 a été évaluée en boîtes de Pétri sur géloses, sur tissus foliaires de tomate et de concombre et sur fruits de tomate. Les deux souches ont inhibé très fortement la croissance mycélienne et la germination des spores de B. cinerea sur géloses. Sur feuilles de tomate et sur disques foliaires de concombre, PTB185 et le mélange (1:1) des deux souches ont réduit significativement (p ≤ 0,01) la croissance mycélienne de B. cinerea comparativement aux témoins. PTB180 a réprimé significativement la croissance mycélienne de B. cinerea sur les fruits de tomate. Afin d'estimer la survie de PTB180 et PTB185 sur la phyllosphère, des plants de tomate et de concombre ont été pulvérisés jusqu'à ruissellement avec une suspension (1×107 unités formatrices de colonies [UFC]/mL) de PTB180, PTB185 ou d'un mélange (1:1) des deux souches. Les populations de chaque souche ont ensuite été suivies au cours du temps sur les feuilles. Les résultats obtenus montrent que les souches survivent au moins 21 jours sur les plants de tomate et de concombre avec un taux de survie variant de 43% à 100%. De plus, pratiquement aucune variation dans les proportions de chaque souche n'a été observée au fil du temps lorsque PTB180 et PTB185 étaient appliquées en mélange. Enfin, l’application foliaire de PTB180, PTB185 et du mélange (1:1) des deux souches a permis une réduction significative de l’incidence et de la sévérité de la pourriture grise chez des plants de tomate et de concombre inoculés avec B. cinerea et cultivés en serre. Les souches PTB180 et PTB185 ont montré au cours de cette étude une forte activité antagoniste envers B. cinerea, la capacité de survivre sur la phyllosphère de plants de tomate et de concombre et de réprimer le développement de la pourriture grise chez ces derniers. Ces souches pourraient éventuellement être utilisées comme agents de lutte biologique contre la pourriture grise du concombre et de la tomate de serre.
Cette étude s’inscrit dans le cadre d’un programme de recherche destiné à évaluer le potentiel d’utilisation en horticulture des bactéries Bacillus pumilus souche PTB180 et Bacillus subtilis souche PTB185. Elle avait pour objectifs (1) d’évaluer in vitro l’activité antagoniste contre Botrytis cinerea des souches PTB180 et PTB185, (2) d’estimer leur capacité à survivre sur la phyllosphère de la tomate et du concombre et 3) d’évaluer leur effet sur le développement de la pourriture grise (B. cinerea) sur des plants de tomate et de concombre cultivés en serre. L'activité antagoniste de PTB180 et PTB185 a été évaluée en boîtes de Pétri sur géloses, sur tissus foliaires de tomate et de concombre et sur fruits de tomate. Les deux souches ont inhibé très fortement la croissance mycélienne et la germination des spores de B. cinerea sur géloses. Sur feuilles de tomate et sur disques foliaires de concombre, PTB185 et le mélange (1:1) des deux souches ont réduit significativement (p ≤ 0,01) la croissance mycélienne de B. cinerea comparativement aux témoins. PTB180 a réprimé significativement la croissance mycélienne de B. cinerea sur les fruits de tomate. Afin d'estimer la survie de PTB180 et PTB185 sur la phyllosphère, des plants de tomate et de concombre ont été pulvérisés jusqu'à ruissellement avec une suspension (1×107 unités formatrices de colonies [UFC]/mL) de PTB180, PTB185 ou d'un mélange (1:1) des deux souches. Les populations de chaque souche ont ensuite été suivies au cours du temps sur les feuilles. Les résultats obtenus montrent que les souches survivent au moins 21 jours sur les plants de tomate et de concombre avec un taux de survie variant de 43% à 100%. De plus, pratiquement aucune variation dans les proportions de chaque souche n'a été observée au fil du temps lorsque PTB180 et PTB185 étaient appliquées en mélange. Enfin, l’application foliaire de PTB180, PTB185 et du mélange (1:1) des deux souches a permis une réduction significative de l’incidence et de la sévérité de la pourriture grise chez des plants de tomate et de concombre inoculés avec B. cinerea et cultivés en serre. Les souches PTB180 et PTB185 ont montré au cours de cette étude une forte activité antagoniste envers B. cinerea, la capacité de survivre sur la phyllosphère de plants de tomate et de concombre et de réprimer le développement de la pourriture grise chez ces derniers. Ces souches pourraient éventuellement être utilisées comme agents de lutte biologique contre la pourriture grise du concombre et de la tomate de serre.
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Desgranges, Catherine. "Contribution à la lutte contre la pyrale du maïs : optimisation d'un procédé de production par fermentation en milieu solide, d'un champignon entomopathogène, Beauveria bassiana." Compiègne, 1991. http://www.theses.fr/1991COMPD428.

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Abstract:
Cette étude a pour but la mise au point et l'optimisation d'un procédé de production d'un biopesticide à base de Beauveria bassiana dirigé contre la pyrale du maïs. Des traitements à base de formulations liquides ou micro-granulées de propagules isolées ou de mycélium pur s'étant avérées peu efficaces, un biopesticide produit par fermentation en milieu solide, et n'ayant subi aucune étape de formulation particulière, pourrait davantage convenir. Le micro-organisme est cultivé sur un micro-granulé d'argile (Super Clean LVM, Laporte) d'une granulométrie moyenne de 500 m, humidifié à une teneur de 40%, avec une solution nutritive composée de saccharose (34 g/L) et de Non Sucre Résiduel (NSR) (111 g/L). Les cultures sont effectuées, sur une hauteur de couche de 50 cm, en réacteur de 1600 L avec le même succès qu'en réacteur de 50 L. Après 48 h d'incubation et 5 jours de séchage, un gramme de granulé est colonisé par environ 50 g de mycélium, capable de générer environ 10 9 conidies par gramme de matière sèche. 25 kg de biopesticide suffisent alors à traiter efficacement 1 ha.
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Bouchard-Rochette, Mathieu. "Bacillus pumilus et Bacillus subtilis pour lutter contre la pourriture grise chez la tomate et le concombre de serre." Master's thesis, Université Laval, 2020. http://hdl.handle.net/20.500.11794/38128.

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Abstract:
Cette étude s’inscrit dans le cadre d’un programme de recherche destiné à évaluer le potentiel d’utilisation en horticulture des bactéries Bacillus pumilus souche PTB180 et Bacillus subtilis souche PTB185. Elle avait pour objectifs (1) d’évaluer in vitro l’activité antagoniste contre Botrytis cinerea des souches PTB180 et PTB185, (2) d’estimer leur capacité à survivre sur la phyllosphère de la tomate et du concombre et 3) d’évaluer leur effet sur le développement de la pourriture grise (B. cinerea) sur des plants de tomate et de concombre cultivés en serre. L'activité antagoniste de PTB180 et PTB185 a été évaluée en boîtes de Pétri sur géloses, sur tissus foliaires de tomate et de concombre et sur fruits de tomate. Les deux souches ont inhibé très fortement la croissance mycélienne et la germination des spores de B. cinerea sur géloses. Sur feuilles de tomate et sur disques foliaires de concombre, PTB185 et le mélange (1:1) des deux souches ont réduit significativement (p ≤ 0,01) la croissance mycélienne de B. cinerea comparativement aux témoins. PTB180 a réprimé significativement la croissance mycélienne de B. cinerea sur les fruits de tomate. Afin d'estimer la survie de PTB180 et PTB185 sur la phyllosphère, des plants de tomate et de concombre ont été pulvérisés jusqu'à ruissellement avec une suspension (1×107 unités formatrices de colonies [UFC]/mL) de PTB180, PTB185 ou d'un mélange (1:1) des deux souches. Les populations de chaque souche ont ensuite été suivies au cours du temps sur les feuilles. Les résultats obtenus montrent que les souches survivent au moins 21 jours sur les plants de tomate et de concombre avec un taux de survie variant de 43% à 100%. De plus, pratiquement aucune variation dans les proportions de chaque souche n'a été observée au fil du temps lorsque PTB180 et PTB185 étaient appliquées en mélange. Enfin, l’application foliaire de PTB180, PTB185 et du mélange (1:1) des deux souches a permis une réduction significative de l’incidence et de la sévérité de la pourriture grise chez des plants de tomate et de concombre inoculés avec B. cinerea et cultivés en serre. Les souches PTB180 et PTB185 ont montré au cours de cette étude une forte activité antagoniste envers B. cinerea, la capacité de survivre sur la phyllosphère de plants de tomate et de concombre et de réprimer le développement de la pourriture grise chez ces derniers. Ces souches pourraient éventuellement être utilisées comme agents de lutte biologique contre la pourriture grise du concombre et de la tomate de serre.
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Barrera, Gaytan Juan Francisco. "Dynamique des populations du scolyte des fruits du caféier, hypothenemus hampei (Coléoptera : Scolytidae), et lutte biologique avec le parasitoi͏̈de Cephalonomia stephanoderis (Hymenoptera : Bethylidae), au Chiapas, Mexique." Toulouse 3, 1994. http://www.theses.fr/1994TOU30085.

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Abstract:
Ce travail porte sur l'etude de la dynamique des populations d'un insecte ravageur du fruit du cafeier hypothenemus hampei (ferrari) (coleoptera: scolytidae), et sa lutte biologique avec le parasitoide cephalonomia stephanoderis betrem (hymenoptera bethylidae) au chiapas (mexique). Ce ravageur, d'origine africaine, a ete observe pour la premiere fois au mexique en 1978. Le memoire comprend trois sections. Sont tout d'abord presentees des generalites sur la region etudiee (le soconusco) la plante-hote (le cafeier) et l'insecte ravageur (le scolyte). Puis, sont abordees des recherches complementaires sur la dynamique des populations d'h. Hampei ; en particulier, le type de reproduction a ete etudie en detail ainsi que le cycle biologique de ce scolyte dans la nature, les relations liant l'infestation et la phenologie du cafeier (coffea arabica l. ), l'effet de l'ombrage sur l'intensite des attaques et la distribution spatio-temporelle de l'infestation durant quatre annees. Une methode d'echantillonnage binomial sequentiel de ce scolyte est proposee pour evaluer ses niveaux de population. La troisieme partie debute par des generalites sur la lutte biologique utilisee contre h. Hampei, insistant particulierement sur c. Stephanoderis, parasitoide introduit au mexique en 1988. Puis, sont presentees des recherches complementaires sur la biologie de ce parasitoide, son acclimatation dans les cafeieres mexicaines, son elevage de masse et son impact sur les populations d'h. Hampei au champ. Enfin, sur la base des resultats obtenus, est suggeree une methode de lutte biologique contre le ravageur pour la region cafeiere du chiapas
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Pichard, Brigitte. "Bacillus polymyxa, inhibiteur de parasites microbiens du chou-fleur." Brest, 1992. http://www.theses.fr/1992BRES2018.

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Abstract:
Des problemes d'ordre phytosanitaire dus a des parasites microbiens se posent constamment en agriculture. Les moyens de lutte actuels sont insuffisants contre la plupart des bacteries phytopathogenes. C'est le cas de xanthomonas campestris pv. Campestris, responsable de la nervation noire du chou-fleur. Une souche de bacillus polymyxa (bp1), isolee de semences de chou-fleur, inhibe in vitro plusieurs micro-organismes phytopathogenes. Elle synthetise des substances antifongiques et antibacteriennes, en quantites variables selon les conditions de culture. La production des premieres est favorisee par un milieu a base de lactose et de soytone, celle des secondes par du lactose et un melange d'acides amines. Les deux antibiotiques antibacteriens produits sont des nouveaux peptides denommes gavaserine et saltavaline, en fonction de leur composition en acides amines. La gavaserine contient egalement un acide gras. Les substances antifongiques sont purifiees par les methodes classiques de precipitation et chromatographies. Leurs identifications sont en cours. La souche bp1, ou du moins les antibiotiques qu'elle produit, peut etre utilisee pour traiter les semences de chou-fleur. Elle protege la plante de la nervation noire due a xanthomonas campestris pv. Campestris et peut en meme temps diminuer les fontes de semis causees par alternaria brassicicola. Elle preserve le pouvoir germinatif et le rendement en matiere fraiche des plantules
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Gravel, Valérie. "Lutte contre Pythium ultimum chez la tomate de serre : une approche microbienne." Thesis, Université Laval, 2007. http://www.theses.ulaval.ca/2007/24523/24523.pdf.

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St-Laurent, Marianne. "Amélioration de la lutte biologique contre le tétranyque à deux points en framboisières sous grands tunnels : essais d'un supplément nutritif, de plantes-réservoirs et de brumisation." Master's thesis, Université Laval, 2017. http://hdl.handle.net/20.500.11794/29866.

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Abstract:
Les grands tunnels procurent de nombreux avantages pour la culture de framboises, dont l’amélioration des rendements et la qualité des fruits. Cependant, ils fournissent également un environnement idéal pour la prolifération du tétranyque à deux points, Tetranychus urticae, un important ravageur. Bien que plusieurs acaricides soient disponibles, les délais avant-récolte et le développement de résistance chez le tétranyque peuvent être problématiques. Les acariens prédateurs phytoséiides, tel Neoseiulus fallacis, sont reconnus pour leur efficacité à contrôler les tétranyques. Toutefois, de nombreuses introductions doivent souvent être faites au cours d’une saison, entraînant des coûts importants. Le principal objectif de cette étude était d’améliorer l’efficacité de la lutte intégrée contre les tétranyques tout en diminuant le nombre d’introductions de prédateurs dans la culture du framboisier sous grands tunnels. Les objectifs spécifiques étaient de déterminer l'efficacité de quatre stratégies de lutte intégrée en framboisière sous grands tunnels et d’estimer le coût ($/ha) de ces stratégies en les comparant à la lutte conventionnelle. Les méthodes de lutte testées combinent les différentes stratégies suivantes : l’introduction des prédateurs Neoseiulus fallacis, l’ajout de la plante-réservoir Sorbaria sorbifolia, l’utilisation du supplément nutritif à base de pollen pour prédateurs « Nutrimite » de Biobest ainsi que la brumisation des tunnels. Les essais se sont déroulés chez deux producteurs de framboises de la grande région de Québec. Les données recueillies par dépistage des tétranyques et des prédateurs ont démontrées que le supplément de pollen a un effet positif sur la capacité de prédation de N. fallacis et que la brumisation tend à diminuer les densités de population de T. urticae.
High tunnels show many benefits for raspberry production, including increased yield and improved fruit quality. However, this crop management approach also provides an environment that fosters outbreaks of the two-spotted spider mite, Tetranychus urticae. Although some miticides are available, pre-harvest application intervals and pesticide resistance development can be problematic. Phytoseiid predatory mites, such as Neoseiulus fallacis, are recognized for their efficacy in controlling spider mites. However, repeated introductions often must be made during a season, resulting in significant cost. To reduce these costs and thereby make biological control more attractive to growers, we tested a food supplement for predators, a banker plant and misting. The main objective of this study was to improve the effectiveness of integrated control against spider mites while decreasing the number of predator introductions in raspberry production under high tunnels. The specific objectives were to determine the effectiveness of four integrated pest management (IPM) strategies in raspberry under high tunnels and estimate their cost ($ / ha) in comparison to conventional control (mitices only) methods. The tested approaches combined different strategies: introduction of Neoseiulus fallacis predators; addition of Sorbaria sorbifolia as a banker plant; use of a pollen-based food supplement for predators, “Nutrimite", from Biobest; and misting. Tests were conducted at two raspberry farms in the greater Quebec City (Quebec, Canada) area. Data collected by monitoring populations of both spider mites and predators show that the pollen supplement has a positive effect on the predatory ability of N. fallacis and that misting tends to reduce T. urticae densities.
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Allaire, Mathieu, and Mathieu Allaire. "Diversité fonctionnelle des Pseudomonas producteurs d'antibiotiques dans les rhizosphères de conifères en pépinières et en milieu naturel." Master's thesis, Université Laval, 2005. http://hdl.handle.net/20.500.11794/18046.

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Abstract:
La production de millions de semis voués à la reforestation est affectée par les problèmes de pourritures racinaires. Afin de développer des agents de biocontrôle adaptés aux pépinières, nous criblons les populations de Pseudomonas spp. des rhizosphères d’épinettes provenant de pépinières et de milieu naturel, pour détecter des gènes de production d’antibiotiques. Nous avons isolé plusieurs souches portant des gènes de production de phloroglucinol, de pyrrolnitrine, de cyanure d’hydrogène et de phénazines. L’analyse de ces gènes montre que pour les producteurs de phloroglucinol, un génotype est dominant dans les pépinières, alors qu’un génotype différent est dominant chez les souches provenant de milieu naturel. Ces dernières possèdent également les gènes de synthèse de la pyrrolnitrine et leur capacité d’inhiber Cylindrocladium floridanum in vitro est supérieur. De plus, en se basant sur la séquence du gène phzC, nous avons isolé trois groupes de producteurs de phénazines, dont deux provenant de milieu naturel et un de pépinière. L’analyse du gène de la portion 16s de l’ARN ribosomal confirme que ces trois groupes appartiennent à différente espèces.
La production de millions de semis voués à la reforestation est affectée par les problèmes de pourritures racinaires. Afin de développer des agents de biocontrôle adaptés aux pépinières, nous criblons les populations de Pseudomonas spp. des rhizosphères d’épinettes provenant de pépinières et de milieu naturel, pour détecter des gènes de production d’antibiotiques. Nous avons isolé plusieurs souches portant des gènes de production de phloroglucinol, de pyrrolnitrine, de cyanure d’hydrogène et de phénazines. L’analyse de ces gènes montre que pour les producteurs de phloroglucinol, un génotype est dominant dans les pépinières, alors qu’un génotype différent est dominant chez les souches provenant de milieu naturel. Ces dernières possèdent également les gènes de synthèse de la pyrrolnitrine et leur capacité d’inhiber Cylindrocladium floridanum in vitro est supérieur. De plus, en se basant sur la séquence du gène phzC, nous avons isolé trois groupes de producteurs de phénazines, dont deux provenant de milieu naturel et un de pépinière. L’analyse du gène de la portion 16s de l’ARN ribosomal confirme que ces trois groupes appartiennent à différente espèces.
Fluorescent Pseudomonas spp. that produce antibiotics such as 2,4-diacetylphloroglucinol and phenazines show biocontrol activity against many important soil borne fungal pathogens. We isolated several strains of Pseudomonas carrying genes for DAPG and PCA synthesis from the rhizosphere of black spruce (Picea mariana) and white spruce (Picea glauca) in two different conifer nurseries and in one natural stand. Sequence analysis of a portion of the phlD gene revealed that one dominant genotype was present in both nurseries and that a different genotype was dominant in the natural forest. Strains from the natural forestwere also found to have the genes for pyrrolnitrin synthesis but lack pyoluteorin biosynthesis genes. Furthermore, in vitro anitfungal assays against Cylindrocladium floridanum showed a much stronger inhibition by strains isolated from natural forest than from nursery. Analysis of phenazine genes revealed 3 groups of phenazines-producers; one from a nursery and two from natural stand.
Fluorescent Pseudomonas spp. that produce antibiotics such as 2,4-diacetylphloroglucinol and phenazines show biocontrol activity against many important soil borne fungal pathogens. We isolated several strains of Pseudomonas carrying genes for DAPG and PCA synthesis from the rhizosphere of black spruce (Picea mariana) and white spruce (Picea glauca) in two different conifer nurseries and in one natural stand. Sequence analysis of a portion of the phlD gene revealed that one dominant genotype was present in both nurseries and that a different genotype was dominant in the natural forest. Strains from the natural forestwere also found to have the genes for pyrrolnitrin synthesis but lack pyoluteorin biosynthesis genes. Furthermore, in vitro anitfungal assays against Cylindrocladium floridanum showed a much stronger inhibition by strains isolated from natural forest than from nursery. Analysis of phenazine genes revealed 3 groups of phenazines-producers; one from a nursery and two from natural stand.
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Gubanti, Paul. "Contribution à l'étude de l'efficacité de la coccinelle aphidiphage Coccinella septempunctata L (Col. Coccinellidae) en culture céréalière sous climat méditerranéen." Aix-Marseille 3, 1988. http://www.theses.fr/1988AIX3A001.

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Abstract:
Description du cycle saisonnier de presence dans le champ de ble. Etude de l'activite diurne de c. S. : type d'activite, lieu d'activite selon la saison et le deplacement des proies, niveau d'activite selon la temperature et le jeune alimentaire. Etude des besoins trophiques: ils sont eleves, aussi bien pour la croissance que pour la reproduction. Des liaisons entre consommation alimentaire et poids des larves et ponte ont ete mises en evidence. Elles permettent de quantifier l'efficacite predatrice de la coccinelle
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Ali-Haimoud, Djamel-Eddine. "Contribution à l'étude de la lutte biologique contre Drechslera teres (Sacc. ) Shoem. , parasite de l'orge." Toulouse, INPT, 1994. http://www.theses.fr/1994INPT007A.

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Abstract:
Les principaux resultats de cette etude preliminaire montrent qu'a partir du phylloplan et des residus de recoltes de l'orge, des antagonistes tres actifs in vitro contre les principales sequences biologiques du pathogene peuvent etre isoles. Ce sont principalement differentes especes de trichoderma qui inhibent totalement la morphogenese des organes sclerotioides sur pailles, leur myceliogenese et egalement l'agressivite du mycelium qui en est issu. Ces antagonistes de meme qu'une espece de cephalosporium et une espece d'acremonium sont egalement tres actifs sur la sporulation du resting mycelium sur paille. Parmi les differentes especes de trichoderma utilisees, t. Koningii et t. Pseudokoningii sont capables egalement de reduire en conditions controlees l'expression de la maladie a partir de l'inoculum seminicole. La germination conidienne de d. Teres semble etre une sequence biologique hautement sensible aux antagonistes, a l'exception de fusarium graminearum, cephalosporium sp et ascochyta sp. Cette etude montre egalement que si certains de ces microorganismes conservent in vivo leur pouvoir de s'opposer au bon deroulement de certaines sequences biologiques et epidemiologiques de d. Teres (tels les trichoderma spp), d'autres au contraire se revelent etre de pietres candidats pour la lutte contre le developpement de la maladie in vivo et en conditions controlees. Ainsi, il semble donc qu'il n'existe pas de methode de screening preponderante par rapport a telle ou telle autre methode et que la multiplication de ces derniers soit une condition sine qua non a un choix exhaustif reel de tous les antagonistes potentiels existant dans un environnement donne. L'etude comparee des deux formes du pathogene montre que ces dernieres reagissent differemment aux traitements a l'aide des antagonistes. Ce comportement a deja ete observe par differents auteurs, notamment concernant l'environnement chimique et pourraient expliquer la soudaine explosion de cette maladie en france, particulierement celle due a la forme maculata, liee a l'inadequation de la lutte chimique actuellement pratiquee. Nos resultats montrent par ailleurs que certains antagonistes agissent en fait par effet synergique car ils inhibent in vitro certaines sequences biologiques du pathogene et induisent l'elicitation de proteines de defenses chez l'hote. Ainsi, l'actinomycete micromonospora 6 induit la production d'une chitinase chez l'orge qui est egalement produite lors de l'attaque par d. Teres. Les pr proteines pourraient constituer un outil efficace de l'amelioration genetique de l'orge si l'on etablit une relation (qualitative ou quantitative) entre leur production et la resistance a l'helminthosporiose
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Cayol, Jean-Pierre. "La mouche méditerranéenne des fruits Ceratitis capitata Wiedemann (Dipteria : Tephritidae) : comportement de régurgitation, lutte par la technique de l'insecte stérile." Aix-Marseille 3, 1995. http://www.theses.fr/1995AIX30024.

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Abstract:
L'étude du comportement de régurgitation chez les adultes de ceratitis capitata wiedemann révèle que ce dernier se produit après absorption d'un liquide, atteignant son maximum à la cinquième heure d'éclairement, et se traduit par le dépôt à la surface du support d'un chapelet de régurgitats de forme majoritairement curviligne ne contenant aucune enzyme. Par ce comportement, son rôle de vecteur d'agents pathogènes de végétaux cultives est démontré en laboratoire. A la faveur de conditions climatiques favorables, la mouche méditerranéenne des fruits peut réapparaitre ponctuellement dans le sud de la France et causer des dégâts importants. Ce fut le cas en 1990 et 1991 dans la région d’Avignon. L'application de la technique de l'insecte stérile, avec lâchers de males seuls, dans le sud de la Tunisie a permis de contrôler les populations sauvages du ravageur, et mit en évidence le rôle prépondérant du lyciet d'europe (lycium europaeum linne) en tant qu'hôte de printemps de c. Capitata
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Lemaire, Émilie. "LA LUTTE BIOLOGIQUE CONTRE LES TÉTRANYQUES DANS LES FRAMBOISIÈRES SOUS TUNNELS : Introduction d’acariens phytoséiides et modèle de simulation dynamique." Thesis, Université Laval, 2012. http://www.theses.ulaval.ca/2012/28742/28742.pdf.

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Abstract:
L’objectif principal du projet était d’évaluer l’efficacité des lâchers d’acariens prédateurs phytoséiides (Neoseiulus fallacis, N. californicus et Phytoseiulus persimilis) à réprimer les tétranyques dans la culture du framboisier remontant sous tunnel. Les résultats suggèrent que l’introduction d’acariens prédateurs est une méthode de lutte contre les tétranyques réaliste permettant de réduire l’utilisation d’acaricide dans ce nouveau système de production sans nuire à la qualité de la récolte. Toutefois, des taux de lâchers suffisamment élevés et des conditions de température et d’humidité appropriés doivent être respectés pour assurer le succès de la lutte biologique et intégrée. L’objectif secondaire était de modéliser l’évolution des populations de tétranyques, afin de mieux comprendre la dynamique des populations observées sous tunnels. Le modèle développé prédit adéquatement l’explosion et l’abondance des populations dans le temps et démontre que l’augmentation de la température sous tunnel est un paramètre critique régissant la prédation et l’accroissement des populations de tétranyques.
The main objective of this project was to evaluate the effectiveness of releases of phytoseiid predatory mites (Neoseiulus fallacis, N. californicus and Phytoseiulus persimilis) to suppress spider mites in high tunnel raspberries. Results suggested that phytoseiid releases are a realistic way to control spider mites and to reduce the use of acaricide in this new production system without compromising the quality of the crop. However, temperature and humidity conditions must be suitable to achieve successful establishment of predators and release rates must be sufficiently high to promote acceptable pest control. The second objective was to model the evolution of mite populations to better understand the dynamics observed under tunnels. The model developed describes the spider mite outbreak and abundance over time with a good fit. It shows that higher temperature under tunnel is a critical parameter governing predation and spider mite population increase.
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de, Ladurantaye Yannick. "Définition des critères d'entreposage, de transport et de distribution au champ du Perillus bioculatus, un prédateur naturel du doryphore de la pomme de terre." Thesis, Université Laval, 2008. http://www.theses.ulaval.ca/2008/25352/25352.pdf.

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Gallet, Jean-Philippe. "Sélection et mode d'action de Trichoderma et de Basidiomycètes lignivores, antagonistes de l'Armillaire (Armillaria ostoyae (Romagn. ) Herink) en vue de leur utilisation comme agents de lutte biologique contre le pourridie du pin maritime." Bordeaux 2, 1994. http://www.theses.fr/1994BOR28322.

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Abstract:
L'amillaire (Amillaria ostoyae) manifeste une activité pathogène vis-à-vis du pin maritime (Pinus pinaster) extrêmement dommageable. Parmi les méthodes de lutte étudiées, la lutte biologique semble être applicable dans le massif forestier de Gascogne. Elle a fait l'objet de notre étude. L'activité antagoniste d'isolats de Trichoderma harzianum a été évaluée vis-à-vis de l'amillaire. Ceux-ci, montrant une certaine efficacité in vitro et in situ, n'assurent qu'une protection temporaire de jeunes pins dans un système d'inoculation contrôlée en pépinière. La recherche de champignons de l'ordre des basidiomycètes, lignivores et antagonistes a été entreprise au niveau du massif forestier. Une campagne de récolte a permis de récupérer divers isolats. Parmi ceux-ci, les basidiomycètes responsables de pourriture blanche manifestant une forte activité lignivore ont été retenus. Une méthode pour quantifier leur activité antagoniste in vitro a été mise au point puis appliquée à l'ensemble des isolats sélectionnés précédemment. Pour les plus efficaces, une étude de leur activité antagoniste en conditions semi-naturelles a été effectuée. Quatre basidiomycètes Bjerkandera adusta, Gymnopilus spectabilis, Hygrophoropsis aurantiaca et Hypholoma fasciculare peuvent coloniser le bois rapidement en conditions non stériles. De plus, ils sont capables d'éliminer l'inoculum d'amillaire présent dans la racine. Les phénomènes intervenant dans l'expression des activités antagonistes et lignivores ont été étudiés. La production d'enzymes, de toxines a été révélée lors de confrontations entre l'amillaire et différents basidiomycètes (Bjerkandera adusta, Coriolus versicolor, Gymnopilus spectabilis et Hypholoma fasciculare en milieu liquide. L'activité mycoparasite de certains de ces isolats vis-à-vis du pourridié a été démontrée. L'étude des activités enzymatiques impliquées dans la dégradation du bois de pin a été effectuée. Pour Bjerkandera adusta, Gymnopilus spectabilis, Hydrophoropsis aurantiaca et Hypholoma fasciculare, les systèmes ligninolytiques sont plus efficaces que ceux de l'amillaire. Le pourridié se caractérise par sa production en activité pectinase supérieure à celle observée chez les autres champignons
Amillaria exerts a powerful, pathogenic action against the maritime pine. Among control methods sudied, biological control seems to be appropriate for use in the forest massif of Gascony. This is the subject of the author's study. The antagonistic action of isolates of T. Harzianum on Amillaria were evaluated. The isolates demonstrating a certain efficaciousness in vitro and in situ provide only temporary protection of young pines in the contex of controlled inoculation in the nursery. The search for fungi of the order Basidiomycetes being wood-degrading and antogonistic was understaken on a forest-wide scale. Intensive collection allowed for obtaining diverse isolates. Among these the white not fungi which demonstrated considerable wood-degrading action were singled out. A method for quantifying antagonistic action in vitro was perfected then applied to the group of isolates previously selected. For the most efficacious among these, a study of their individual antagonistic action in semi-natural conditions was carried out. Four basidiomycetes Bjerkandera adusta, Gymnopilus spectabilis, Hygropsis aurantiaca and Hypholoma fasciculare are able to colonize wood rapidly under non sterile conditions. Additionally, they are capable of eliminating the amillaria inoculum present in the root. The various phenomena present in antagonistic and wood-degrading action were identified. The production of enzymes and of toxins was revealed when amillaria and the different basidiomycetes were paired in a liquid medium. The mycoparasitic action of certain isolates on the root not fungus was demonstrated. The study of enzymatic action inherent in the degradation of the wood was carried out. For B. Adusta ; G. Spectabilis, H. Fasciculare and H. Aurantiaca the lignolytic systems are lire efficacious than these of amillaria. The root bot fungus is characterized by a greater pectinase action than that of the other fungi
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Expert, Jean-Michel. "Lutte biologique contre les attaques précoces de Sclerotinia sclerotiorum du tournesol à l'aide de Pseudomonas spp. Fluorescents et de Bacillus spp." Lyon 1, 1995. http://www.theses.fr/1995LYO10221.

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Abstract:
Une recrudescence des attaques precoces du sclerotinia sclerotiorum sur racines et au collet a ete observee ces dernieres annees en france sur le tournesol, surtout dans les terres lourdes de charentes-poitou et de champagne. Contre ces formes d'attaques, il n'existe pas actuellement de varietes resistantes ni de substances chimiques reellement efficaces. Cependant, depuis la fin des annees 1970, de nombreux travaux ont montre que des rhizobacteries, surtout des pseudomonas fluorescents, pouvaient etre efficaces dans la lutte contre des pathogenes telluriques. Une collection de souches bacteriennes, comprenant des pseudomonas fluorescents et des bacillus spp. Isoles du rhizoplan de diverses plantes et de sclerotes de s. Sclerotiorum lysees, a ete constituee. Ces souches ont ete caracterisees et une etude taxonomique a ete entreprise sur les pseudomonas fluorescents. Cette etude a montre que l'adn de la souche type de p. Fluorescens ne s'hybride pas a plus de 70% avec l'adn des souches de p. Fluorescens de la collection. Ces resultats remettent donc en cause le statut de l'espece p. Fluorescens et souligne la biodiversite de ce groupe bacterien. Des tests d'antagonisme in vitro et des tests d'antagonisme in situ (en conditions controlees et au champ) ont ete effectues en vue de reperer les souches de pseudomonas fluorescents ou de bacillus spp. Efficaces contre les attaques precoces du s. Sclerotiorum. Aucune correlation entre les tests in vitro et in situ n'a pu etre etablie mais une bonne correlation existe entre les tests in situ en conditions controlees et les essais au champ. Dans les tests in situ en conditions controlees, une protection satisfaisante est acquise avec la souche de p. Putida t1-5, en utilisant au moins 1/0#6 bacteries par semence. Les essais au champ ont montre que l'on obtient une protection significative du tournesol par la bacterisation des semences avec des pseudomonas fluorescents
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Omarjee, Jeh-han. "Effets des peuplements de Burkholderia et de nématodes sur la croissance de la canne à sucre." Lyon 1, 2006. http://www.theses.fr/2006LYO10295.

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Abstract:
En culture de canne à sucre, une alternative biologique aux nématicides (chers et toxiques) a été envisagée, utilisant le genre Burkholderia. Les communautés de cette bactérie très commune ont été caractérisées par des méthodes moléculaires dans différents sites du KwaZulu-Natal à la nématofaune connue. Une corrélation est apparue entre B. Tropica et/ou B. Unamae et les nématodes bénins (Helicotylenchus dihystera, Pratylenchus zeae). En serre, la souche fixatrice d’azote LM1-376. 8 (B. Tropica) a réduit les attaques de Meloidogyne et stimulé la croissance de la canne, un effet non confirmé au champ, en raison d’une forte sécheresse. Néanmoins la découverte de souches de B. Tropica endophytes, fixatrices d’azote et antagonistes de pathogènes fongiques et bactériens de la canne laisse espérer un inoculum plus performant combinant toutes les propriétés favorables
Sugarcane root parasitic nematodes cause severe yield loss in KwaZulu Natal and an alternative for toxic nematicides is urgently required. We investigated the possible use of Burkholderia, a common inhabitant of sugarcane roots. Burkholderia communities were characterised using molecular methods in different sites of known nematode fauna. A positive correlation was observed between B. Tropica and/or B. Unamae and a mild pathogenic nematode, Helicotylenchus dihystera. The diazotroph B. Tropica LM1-376. 8 not only reduced Meloidogyne galling but also improved plant growth under greenhouse conditions; nevertheless a field evaluation failed due to several biotic and abiotic factors. Stalk endophytic N2-fixing B. Tropica were also discovered, with a further ability to inhibit fungal and bacterial pathogens. A combination of these traits into one inoculum would provide a potential strategy to control sugarcane pests and promote plant growth
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Marel, Marine. "Lutte biologique contre le tétranyque à deux points (Acari: Tetranychidae) sur le rosier : lâchers de phytoséiides et échantillonnage binominal des tétranyques." Thesis, Université Laval, 2011. http://www.theses.ulaval.ca/2011/27790/27790.pdf.

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Abstract:
Les prédateurs phytoséiides sont encore peu utilisés pour le contrôle des acariens ravageurs en pépinières ornementales. Cette étude portait sur 1) l’efficacité de deux prédateurs, Neoseiulus fallacis Garman et N. californicus Mc Gregor, utilisés seuls et en combinaison, pour la répression du tétranyque à deux points Tetranychus urticae Koch en serre, et 2) le développement d’une méthode de dépistage rapide des tétranyques sur le rosier Rosa rugosa. Nos résultats démontrent que l’efficacité de répression fut équivalente pour les lâchers monospécifiques et pour la combinaison des deux prédateurs. De plus, N. californicus et N. fallacis furent présents en proportion semblable, suggérant leur compatibilité lors de lâchers combinés. Finalement, nos données révèlent que la proportion de folioles infestées par les tétranyques et les densités de tétranyques sont fortement corrélées, ce qui constitue une première étape dans le développement d’une méthode de dépistage binomiale des tétranyques dans le rosier rugueux. Mots-clés : acariens prédateurs, dépistage, ennemis naturels multiples, lutte biologique, méthode d’échantillonnage binomiale, Neoseiulus californicus, Neoseiulus fallacis, pépinières ornementales, Rosa rugosa, Tetranychus urticae, tétranyque à deux points.
Phytoseiid and spider mites are poorly studied in nursery systems. The objectives of this study were 1) to test the efficacy of combined versus single releases of these two predaceous mite species, Neoseiulus fallacis Garman and N. californicus Mc Gregor, for the suppression of the twospotted spider mite, Tetranychus urticae Koch on roses (Rosa rugosa); and 2) to develop a sampling method for spider mites on R. rugosa. The first objective was tested in the greenhouse. Our results showed a similar efficacy for the monospecific releases and the combined releases; and 2) equivalent proportion of occurrence at which N. californicus and N. fallacis were found on individual plants, suggesting that these two predatory species are compatible. The second objective was tested in the field. We found that the proportion of infested rose leaflets was highly correlated with spider mite densities; revealing that a binomial sampling method could be developed in the future. Keywords: acarine predators, binomial sampling, biological control, multiples natural ennemis, Neoseiulus fallacis, Neoseiulus californicus, ornamental nursery, Rosa rugosa, Tetranychus urticae, twospotted spider mites.
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Legnani, Robert. "Analyse, comparaison et exploitation des résistances au virus Y de la pomme de terre (PVY) et au tobacco etch virus (TEV) chez la tomate." Montpellier 2, 1995. http://www.theses.fr/1995MON20240.

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Abstract:
Chez lycopersicon hirsutum pi 247087, la resistance au virus y de la pomme de terre (pvy) et au tobacco etch virus (tev), s'exprime par une forte inhibition de l'accumulation virale dans les feuilles inoculees. Ce mecanisme de resistance n'est pas influence par les differents facteurs biotiques et abiotiques. Il s'exprime vis-a-vis de toutes les souches testees sauf celles appartenant au dernier des sept pathotypes de pvy definis. Chez pi 247087, il y a egalement une inhibition partielle de l'accumulation et de la migration des souches de pvy appartenant a ce dernier. Le nombre de genes reveles controlant la resistance et l'expression de cette derniere se sont reveles variables selon la souche de pvy utilisee. Un des genes controlant la resistance au pvy pourrait egalement controler la resistance au tev
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Akbaraly-Vally, Nourbanou. "Étude d'une polyédrose cytoplasmique chez le foreur ponctué de la canne à sucre Chilo sacchariphagus Boj. à La Réunion." Montpellier 2, 1985. http://www.theses.fr/1985MON20003.

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Abstract:
Dans le cadre d'un programme de lutte biologique contre les insectes foreurs de la canne à sucre à La Réunion, des recherches ont été réalisées sur le cycle de développement du " Foreur Ponctué ", Chilo sacchariphagus (Pyralidae) et la pathogénicité de la polyédrose cytoplasmique (CVP) vis-à-vis de ce Lepidoptère, dans des conditions d'élevage en milieu artificiel à 28% C et dans des conditions naturelles (champs de canne et zone boisée associée). En élevage, dans 90 % des cas, 7 à 8 stades larvaires se succèdent jusqu'à la nymphose obtenue au bout de 41 à 45 jours ; le cycle complet (de l'oeuf à l'adulte) est réalisé en 61 à 65 jours. La pathogénicité du virus est surtout importante aux stades larvaires 1 et 2 où le CPV est la cause d'une mortalité très élevée (doses léthales 50 : respectivement 3 à 25 et 26 à 64 polyédres/larve - doses infectieuses 50 : 8 à 68 et 694 à 1 588 polyèdres-/larve). La chronicité de la maladie ainsi que l'existence de son mode de transmission vertical sont établies. Le virus n'a d'ailleurs que peu d'influence sur les caractéristiques du développement larvaire (stades et durée, paramètres biométriques). Les études d'histologie et de microscopie électronique montrent que la virogénèse est essentiellement localisée dans le tissu épithélial de l'intestin moyen. Dans les conditions naturelles , il est constaté qu'à un taux de polyédrose élevé correspondent une diminution de la population de Foreurs et une réduction importante des dégâts causés à la canne à sucre. Cependant, est simultanément mis en évidence le rôle de 2 autres insectes (Callixena versicolora et Polistes hebraeus) en tant que réservoirs naturels et disséminateurs du virus considéré comme non spécifique de C. Sacchariphagus. (4ème de couverture)
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Haddaoui, Olfa. "Étude d'un concept novateur de culture du fraisier en buttes semi-permanentes : évaluation d'un substrat adapté." Master's thesis, Université Laval, 2020. http://hdl.handle.net/20.500.11794/38151.

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Abstract:
La culture de la fraise est l’une des productions fruitières les plus répandues dans le monde. Ce petit fruit se cultive dans toutes les provinces du Canada et le Québec est considéré comme le leader canadien en matière de production de fraises. En revanche, la présence récurrente de maladies telluriques, comme le flétrissement verticilien (Verticillium dahliae), limite la productivité des fraisiers en plein champ. Les fumigants constituent à ce jour, la solution la plus efficace pour lutter contre cet agent pathogène. Ces biocides affectent toutefois l’équilibre biologique du sol et peuvent être nocifs pour l’environnement et les populations avoisinantes. Afin de surmonter ce problème, la production du fraisier dans des systèmes de culture hors-sol avec des substrats appropriés pourrait permettre d’éliminer l’utilisation de fumigants. Cette étude a été réalisée afin d’évaluer la performance de trois substrats tourbeux pour la culture des fraisiers remontants en hors-sol au champ et de comparer la croissance et la productivité du fraisier cultivé en hors-sol au champ à celles en plein sol après une et deux années d’utilisation du substrat. Les résultats ont démontré qu’il est possible de doubler les rendements pour tous les traitements en horssol comparativement au traitement témoin en sol fumigé. Des différences significatives entre les traitements hors-sols et le témoin ont également été observées pour la croissance des plants de fraisiers. Cependant, aucune différence de croissance n’a été observée entre les trois substrats tourbeux. Des diminutions du rendement total, vendable ainsi que du calibre de fruits ont été mesurées pour les substrats réutilisés plus d’une fois par rapport aux substrats vierges. Cette différence s’explique principalement par des changements des propriétés physiques des substrats. Une diminution de la macroporosité et une augmentation de la capacité en contenant ont été observées avec les substrats réutilisés. Finalement, les substrats utilisés pour la culture hors-sol ont présenté une différence significative par rapport à la culture traditionnel en plein sol pour la majorité des paramètres mesurés.
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Jouy, Nicolas. "Etude de la résistance naturelle de deux Lycopersicon à des ravageurs de cultures maraîchères : identification des substances responsables, les (2,3,4-tri-O-acyl)-}a-D-glucopyranosyl)-(3-O-acyl)-b-D-fructofuranoside." Montpellier 2, 1990. http://www.theses.fr/1990MON20278.

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Abstract:
L'etude de l'origine de la resistance de deux lycopersicon a des ravageurs a ete realisee grace a l'execution en parallele de deux protocoles experimentaux complementaires. Le premier rassemble des techniques physico-chimiques comprenant l'extraction par solvants, le fractionnement des extraits (chromatographie sur colonne ou sur couche mince) puis l'analyse et l'identification (c. P. G. , h. P. L. C. , r. M. N. Et spectrometrie de masse) des substances actives isolees. Le second consiste en la mise au point de tests standardises permettant de quantifier l'activite des differents extraits obtenus, sur plusieurs ravageurs de cultures maraicheres. Nous avons ainsi mis en evidence l'origine purement mecanique de la resistance de lycopersicon hirsutum humb. Et bonpl. A un puceron, aphis gossypii (glober). Par contre, l'etude de l'antibiose chez l. Cheesmanii riley a conduit a isoler et a identifier une famille de substances chimiques - les esters de saccharose- responsables de la resistance de cette plante a lyriomiza trifolii (burgess). Ce point merite d'etre souligne car ces composes n'avaient jamais ete signales dans cette plante auparavant. Les determinations chimiques permettent d'identifier ces esters de saccharose comme etant les (2, 3, 4-tri-o-acyl)-alpha-d-glucopyranosyl)-(3-o-acyl-beta-d-fructofuranoside. Le mode d'action de ces substances est du type anti-appetant. Des tests sur plutella xylostella (l. ) (la teigne des cruciferes) et henosepilachna reticulata (olivier) (coccinelle defoliatrice des cucurbitacees) ont demontre l'efficacite, en pulverisations foliaires, de ces esters de saccharose extraits de l. Cheesmanii
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Dionne, Ariane. "Conception et mise à l'épreuve d'un prototype de pulvérisation de pupes de trichogrammes pour la lutte biologique contre la pyrale dans la culture du maïs sucré." Master's thesis, Université Laval, 2019. http://hdl.handle.net/20.500.11794/33828.

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Abstract:
Le maïs sucré requiert de nombreuses applications d’insecticides pour lutter contre son principal ravageur : la pyrale du maïs (Ostrinia nubilalis) (Lepidoptera: Crambidae). La lutte biologique à l’aide de trichogrammes s’avère une alternative efficace afin de réduire l’usage excessif des pesticides dans la culture du maïs sucré. Toutefois, l’introduction manuelle des trichocartes nécessite beaucoup de temps lorsqu’elle est utilisée à grande échelle et son usage demeure marginal au Québec. La mécanisation des introductions de pupes de trichogrammes à l’aide d’un pulvérisateur à rampe constitue une solution innovatrice et avantageuse pour les producteurs agricoles. L’objectif de cette étude était de concevoir et de mettre à l’épreuve un pulvérisateur pour l’introduction de pupes de Trichogramma ostriniae (Hymenoptera: Trichogrammatidae) sous des conditions réelles au champ. Pour ce faire, des pupes de T. ostriniae ont été pulvérisées à une dose de 800 000 pupes par hectare à l’aide d’un pulvérisateur à rampe conçu au Département des sols et de génie agroalimentaire de l’Université Laval. Des trichocartes ont également été introduites à une dose de 500 000 pupes par hectare. Huit lâchers ont été effectués durant la saison 2016. Les résultats des essais au champ ont démontré une réduction du taux d’émergence des trichogrammes pulvérisés de 17,21% par rapport à celui des trichocartes. La fécondité totale et la longévité des femelles T. ostriniae n’ont pas été négativement affectées par la pulvérisation, ce qui indique que la pulvérisation n’a aucun impact sur leur qualité. Les taux de parasitisme sur les masses naturelles et sur les masses sentinelles ont été comparables pour les deux méthodes d’introduction. Dans les parcelles pulvérisées, toutes les masses naturelles dépistées à partir du cinquième lâcher ont été parasitées tandis qu’aucune masse dépistée avant le cinquième lâcher n’a été parasitée. À la récolte, les traitements par pulvérisation et par trichocartes ont permis un contrôle adéquat de la pyrale du maïs pour la saison 2016 démontrant que les doses utilisées étaient appropriées. De plus, l’introduction de pupes de trichogrammes a été 1,7 fois plus rapide que celle des trichocartes. Toutefois, le coût de pulvérisation par hectare par introduction était 30% plus élevé que celui de l’introduction manuelle de trichocartes en raison des coûts reliés aux gommes de guar et de xanthane qui composent la solution de pulvérisation. En somme, les résultats indiquent que la pulvérisation est une technique prometteuse pour une introduction efficace et viable des pupes de trichogrammes. Des recherches subséquentes sur de plus grandes parcelles avec un fort historique de pyrale du maïs sont recommandées pour optimiser davantage les paramètres de pulvérisation et ainsi rendre son utilisation plus économique. Le système de pulvérisation de pupes de trichogrammes utilisé avec succès dans la culture du maïs sucré pourrait être adapté à d’autres cultures aux prises avec la pyrale telles que celles du poivron, des haricots et de la pomme de terre.
Sweet corn requires many applications of insecticides to control its main pest: the European corn borer (Ostrinia nubilalis) (Lepidoptera: Crambidae). The biological control using Trichogramma is an effective alternative to reduce excessive use of pesticides in sweet corn. However, manual introduction of trichocards is time consuming when used at a large scale and its use remains marginal in Quebec. The mechanized introduction of Trichogramma pupae using a boom sprayer is an innovative and advantageous solution for growers. The objective of this study was to design and test a boom sprayer to introduce Trichogramma ostriniae (Hymenoptera: Trichogrammatidae) pupae under real field conditions. For this purpose, T. ostriniae pupae were sprayed at a rate of 800,000 pupae per hectare using a boom sprayer designed at the Department of Soils and Agri-Food Engineering of Université Laval. Trichocards were also introduced at a rate of 500,000 pupae per hectare. Eight releases were made during the 2016 season. Field trials results showed a reduction of 17.21% in the emergence rate of sprayed Trichogramma pupae compared to that of trichocards. Total fertility and longevity of sprayed T. ostriniae females were not negatively affected by spraying; indicating that spraying does not have any impact on their quality. The parasitism rates observed on natural and on sentinel masses were comparable for both methods. In the sprayed plots, all natural masses detected starting from the fifth release were parasitized whereas no mass detected before the fifth release was parasitized. At harvest, spray and trichocards treatments resulted in an adequate control of the European corn borer during the 2016 season. In addition, spraying was 1.7 times faster than the manual introduction of trichocards. However, the spraying cost per hectare per release was 30% higher than that of the use of trichocards due to the costs associated with the guar and the xanthan gums, the main components of the spray solution. Overall, the results indicate that spraying is a promising technique for an efficient and viable introduction of Trichogramma pupae. More research on larger plots with a strong history of European corn borer is recommended to further optimize the spraying parameters and thus make this technique more affordable. The spraying system successfully used in sweet corn could also be adapted to other crops such as pepper, beans, and potatoes to control the European corn borer.
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Selmi, Hela. "Effet de l'ajout de biochar sur la symbiose tripartite Ensifer meliloti-Rhizophagus irregularis-luzerne (Medicago sativa L.), sur la production d'inocula bactériens et envers la lutte aux agents pathogènes." Master's thesis, Université Laval, 2016. http://hdl.handle.net/20.500.11794/26598.

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Abstract:
L’agriculture durable repose sur l’utilisation de moins d’intrants chimiques et favorise l’utilisation des produits biologiques comme le biochar. Ce dernier, à certaines doses, peut stimuler la fixation biologique d’azote chez les légumineuses. Notre projet vise à étudier l’effet d’un biochar de copeaux de pin pyrolysés à 700 ºC sur la symbiose tripartite Ensifer meliloti-Rhizophagus irregularis-Medicago sativa L., sur la production d’inocula bactériens et envers la lutte contre les agents pathogènes. Une culture de luzerne inoculée avec deux E. meliloti A2 et S14, en présence du Rhizophagus irregularis et dans un sol amendé avec 0, 15 ou 30 % de biochar (v:v) a été réalisée. Une stimulation significative de la mycorhization a été observée en présence de 15 % de biochar, et des souches A2 et S14. Par contre, l’inoculation de la luzerne avec A2 ou S14 n’a pas eu d’effet significatif sur les rendements, indiquant la présence dans le sol de souches efficaces d’E. meliloti. Une étude portant sur la survie des rhizobiums et du Bacillus subtilis MBI 600 menée pendant 120 jours à 4 et 25 °C. Elle a montré que 15 % de biochar favorise significativement la survie des cellules de rhizobiums. Par contre, pour Bacillus subtilis c’est le Pro-mix à 100 % qui supporte mieux la survie des cellules. Ainsi, l’effet de biochar sur la survie des microorganismes dépend de la nature de ces derniers et de la dose utilisée. L’étude de l’effet des trois doses du biochar sur les agents pathogènes a montré qu’à forte dose il pourrait favoriser le développement des pathogènes. Les résultats apportent des pistes pour les modalités d’application de biochar en agriculture. Par contre, notre étude est réalisée avec un seul type de biochar à trois doses. Il sera donc très important de tester d’autres types ainsi que d’autres doses de biochar.
Sustainable agriculture is based on the use of less chemical inputs and promotes the use of biological products such as biochar. Many studies clearly indicate that some biochars can stimulate biological nitrogen fixation in legumes. Our project aims to study the effect of a biochar (Pines, 700ºC) on the tripartite symbiosis Ensifer meliloti-Rhizophagus irregularis-Medicago sativa L., on the production of bacterial inocula and on the fight against pathogens. A culture of alfalfa inoculated with two strains of E. meliloti A2 or S14, in the presence of Rhizophagus irregularis and in a soil amended with 0, 15 or 30% of biochar (vol:vol) was conducted. A significant stimulation of mycorrhization was observed in the presence of 15% biochar and A2 or S14. However, inoculation of alfalfa with A2 or S14 had no significant effect on yields, indicating the presence in soil of effective strains of E. meliloti. A study on survival of rhizobia and Bacillus subtilis MBI 600 at 4°C and 25°C was conducted for 120 days. It showed that biochar (15%, vol:vol) promotes significantly the survival of rhizobial cells but for Bacillus subtilis it is the Pro-mix without biochar which supports better cell survival. Thus, the biochar effect on survival of microorganisms depends on the dose of biochar used. The effect of biochar amendments on P. ultimum and FORL colonization and infection was also evaluated. The study of the effect of three doses of biochar (0, 15, 30%; vol:vol) on pathogens showed that high doses may offer a good environment for pathogens development. Our study was performed using a single type of biochar with three doses. Therefore, it is very important to test other types and doses of biochar to be able to make recommendations.
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Buduca, Cécile. "Etude du comportement alimentaire de "Peregrinus Mai͏̈dis (Ashmead, 1890)" par électropénétrographie, en relation avec la résistance à la mosai͏̈que du mai͏̈s." Montpellier 2, 1995. http://www.theses.fr/1995MON20053.

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Abstract:
Peregrinus maidis (ashmead, 1890) (homoptera: delphacidae), est vecteur sur mais et sorgho de deux virus circulants, le maize mosaic virus (mmv) et la maize stripe virus (mstpv). L'utilisation de la technique d'electropenetrographie (epg) sur le modele peregrinus maidis/mais a permis (i) de decrire le comportement alimentaire de cet insecte sur genotype sensible, et trois classes de signaux (1, 2 et 3) ont ete identifiees et correlees respectivement aux activites de sondage, a l'ingestion dans le xyleme et a l'ingestion dans le phloeme, (ii) d'etudier l'activite alimentaire sur genotypes sensibles et resistants. Sur trois lignees issues du composite virose resistant cvr#3 - c#3 (epi 23 / 3. 7. 2. 1. Et 3. 7. 3. 1. , et a211), p. Maidis effectue une duree totale de sondage, un nombre de piqures individuelles et un temps d'acces au phloeme plus importants que sur genotypes et lignees sensibles dont b73 ; il ne presente pas d'ingestion soutenue dans le phloeme durant les huit premieres heures de contact sur ces lignees resistantes. Sur hi40, lignee resistante au virus s. S. , l'insecte presente un comportement alimentaire identique a celui observe sur genotypes sensibles, tandis que sur l'hybride f#1, resultant du croisement d'a211 par b73, il s'alimente de la meme facon que sur genotypes resistants a la transmission. Ce mecanisme de resistance est donc heritable et a caractere dominant. Cette resistance a la transmission du mmv est contournable par l'augmentation du niveau d'infestation. L'electropenetrogaphie est une excellente methode pour cribler des genotypes presentant ce type de resistance
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Wen, Guoqi. "Étude des effets de la fertilisation azotée sur les concentrations foliaires en sucres, en acides aminés et en glycoalcaloïdes des plants de pommes de terre." Doctoral thesis, Université Laval, 2020. http://hdl.handle.net/20.500.11794/66330.

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Goyette, Marie-Hélène. "Évaluation du silicium (Si) contre le blanc du fraisier dans un système de production commerciale au champ." Master's thesis, Université Laval, 2017. http://hdl.handle.net/20.500.11794/27892.

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Abstract:
Le blanc du fraisier (Podosphaera aphanis) est particulièrement nuisible chez les variétés à jour neutre puisque son cycle est favorisé par le climat présent en août et septembre, occasionnant ainsi, un usage abondant de fongicides. Dans une optique de lutte écologique, le silicium (Si) se démarque par ses propriétés prophylactiques chez plusieurs végétaux. Bien que le Si semble stimuler la résistance des fraisiers (Fragaria × ananassa Duch) au P. aphanis en culture hors-sol, il reste que son efficacité dans un contexte de production commerciale au champ demeure ambigüe. Dans ce projet, l'objectif était d'évaluer l'effet d'amendements en Si sur l'intensité du blanc du fraisier et sur les rendements dans un système de production en champ. Le contenu en Si dans les feuilles, l'intensité de la maladie et les rendements étaient les variables étudiées. Deux types d'amendements ont été évalués : le silicate de potassium, une formulation soluble appliquée en fertigation deux fois par semaine en 2015, et trois doses de silicate de calcium (wollastonite), une forme solide incorporée à la plantation en 2016. De plus, chaque traitement en Si a été mis en interaction avec trois cultivars. En 2015, la silice soluble n'a donné aucune augmentation significative du contenu en Si chez tous les cultivars testés, résultat concordant avec les données de rendements qui se sont avérées similaires chez les témoins et les plants traités. Également, en 2016, pour chacun des cultivars, les contenus en Si dans les plants n'ont pas été influencés par les trois doses de silicate de calcium. Par conséquent, aucun effet n'a été observé tant au niveau des rendements que de la répression du blanc. Nos résultats illustrent bien l'intérêt de valider la disponibilité d'acide silicique lors d'applications de fertilisants à base de Si expliquant ainsi les résultats contradictoires, parfois véhiculés, quant aux bénéfices du Si en agriculture.
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Holguin, Melendez Francisco. "Contribution à la recherche d'une résistance durable du caféier (Coffea spp. ) à la rouille orangée (Hemileia vastatrix Berk. Et Br. ). Etude de la variabilité génétique du pathogène." Montpellier 2, 1993. http://www.theses.fr/1993MON20199.

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Abstract:
L'approfondissement des connaissances relatives aux relations entre coffea spp. Et hemileia vastatrix au moyen de l'etude de la virulence de l'agressivite et de variabilite au niveau de fragments d'adn d'un groupe de 11 isolats du champignon provenant d'afrique, de madagascar et d'indonesie, collectes sur c. Canephora, sur c. Arabica, et sur des derives de l'hybride de timor (catimor), a ete entrepris. L'analyse de la virulence des isolats collectes a permis d'observer une gamme de reactions differentielles sur six clones de c. Canephora. Deux clones de congusta (c. Congensis c. Canephora) ont montre des facteurs de resistance differents de ceux rencontres sur c. Canephora et sur c. Arabica. Les deux isolats provenant d'indonesie et recoltes sur catimor, ont montre le spectre de virulence le plus large, attaquant quelques plantes issues de l'hybride de timor, de catimor et plusieurs differentiels de c. Arabica. Les isolats d'indonesie ont manifeste une agressivite plus grande que la race ii et que les isolats provenant d'afrique. L'etude des fragments d'adn genomique n'a pas permis une distinction entre races. L'importance des resultats pour la distinction de nouveaux differentiels de coffea spp. Sont discutes, ainsi que la qualification de genotypes resistants ou sensibles sur la base de la sporulation
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Paré, François. "Étude de la faisabilité de distribution mécanique de la punaise masquée, Perillus bioculatus, pour le contrôle biologique du doryphore de la pomme de terre, Leptinotarsa Decemlineata (SAY)." Thesis, Université Laval, 2009. http://www.theses.ulaval.ca/2009/26358/26358.pdf.

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Simard, Louis. "Distribution, abondance et écologie saisonnière des principaux insectes ravageurs du gazon sur les terrains de golf du Québec et évaluation du potentiel de contrôle des nématodes entomopathogènes indigènes." Thesis, Université Laval, 2006. http://www.theses.ulaval.ca/2006/24118/24118.pdf.

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Varain, Lauriane. "Transformation avec la bactérie Agrobacterium tumefaciens de deux Ascomycètes Septoria musiva et Septoria populicola, agents phytopathogènes du peuplier." Thesis, Université Laval, 2013. http://www.theses.ulaval.ca/2013/29915/29915.pdf.

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Abstract:
Septoria musiva (téléomorphe Mycosphaerella populorum) est un Ascomycète responsable de chancres sur tronc et jeunes branches en peupleraies et de taches foliaires en peupleraies et forêts. S. populicola (M. populicola) est responsable de taches foliaires sur peupliers. L’objectif de mon projet consiste à mettre en place un système de transformation à l’aide d’Agrobacterium tumefaciens pour ces deux champignons. A. tumefaciens est la bactérie causant la galle du collet, mais qui est utilisée couramment lors de transformation de végétaux et de champignons. Une première expérience a permis d’obtenir des transformants pour S. musiva avec le plasmide pPT1, mais aucun transformant n’a été obtenu pour S. populicola. Par la suite, un autre plasmide a été utilisé : pPL1. Cependant aucune souche transformée n’a pu être obtenue pour S. musiva, et S. populicola, malgré la vérification de différents paramètres. L’absence de transformant chez S. populicola peut être attribuée à un nombre insuffisant de conidies, tandis que pour S. musiva, un nombre insuffisant de bactéries ou un protocole de transformation non optimal pourrait expliquer les échecs successifs.
Seporia musiva (Mycosphaerella populorum) is an Ascomycota which causes canker and leafspot on hybrid poplar. S. populicola (M. populicola) only causes leafspot. The aim of my project was to transform these two fungi with Agrobacterium tumefaciens, a bacterium which causes Crown gall, and is commonly used to transform plant and fungi in laboratory. In a first experiment, transformation using plasmid pPT1 were successful for S. musiva, but not for S. populicola. However, no transformants were obtained from either S. musiva and S. populicola in subsequent experiments in which plasmid pPL1 was used and different parameters were tested. A possible explanation for the inhability to obtain transformants from S. populicola is the low number of conidia available for transformation experiments. In the case of S. musiva, low number of bacterial cells and non optimal protocols might explain negative results observed.
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Lespinasse, Denis. "Cartographie génétique de l'"Hevea (Hevea spp)" et déterminisme de la résistance au champignon pathogène "Microcyclus ulei"." Montpellier 2, 1999. http://www.theses.fr/1999MON20053.

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Abstract:
Le champignon microcyclus ulei represente le principal frein au developpement de l'heveaculture en amerique latine, ainsi qu'une menace potentielle pour l'heveaculture mondiale. Ameliorer la resistance de l'hevea passe par une meilleure comprehension des interactions entre l'hevea et m. Ulei et necessite l'etude des bases genetiques de la resistance. Les premieres cartes genetiques de l'hevea (2n = 36) ont ete realisees a partir d'une descendance de 195 individus issue d'un croisement entre deux parents heterozygotes. Deux cartes parentales ont ete construites grace a une strategie pseudo-testcross. Une carte consensus a ensuite ete elaboree par fusion des cartes parentales, grace a 172 marqueurs communs aux deux cartes, ou marqueurs ponts. La carte consensus est constituee de 717 locus (rflp, aflp, microsatellites, isozymes) repartis sur 18 groupes de liaison. Une segregation disomique des marqueurs a ete observee, et peu de locus dupliques ont ete reveles. L'inoculation de la descendance en conditions controlees par 6 souches differentes de m. Ulei a permis de mettre en evidence 8 qtl repartis sur 7 des 18 chromosomes de l'hevea. Le plus important d'entre eux, detecte avec toutes les souches, explique jusqu'a 36% de la variation phenotypique observee. Il a pu etre montre que presque tous les alleles favorables aux qtl identifies proviennent du parent femelle de ro38, le clone f4542, qui appartient a l'espece sauvage hevea benthamiana et dont la resistance est consideree a ce jour comme jamais mise en defaut. Un seul qtl mineur a pu etre detecte chez le parent sensible appartenant a l'espece cultivee h. Brasiliensis. Ces resultats offrent des perspectives encourageantes pour l'amelioration de la resistance a m. Ulei.
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Prawirosukarto, Sudharto. "Etude d'un virus pathogène de "Setothosea asigna" Van Eecke (Lepidoptera : limacodidae), ravageur du palmier à huile en Indonésie : caractérisation, diagnostic et épidémiologie en plantation." Montpellier 2, 1996. http://www.theses.fr/1996MON20261.

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Abstract:
Un virus fortement pathogene pour les larves de setothosea asigna van eecke qui causent d'importants degats aux palmiers a huile en indonesie a ete isole et caracterise. Avec une capside de symetrie cubique de 35 nm de diametre, un seul polypeptide capsidaire de 55 kda et un genome constitue d'une molecule d'arn monocatenaire lineaire de 6,2 kb, ce virus presente les proprietes essentielles des virus -nudaurelia de la famille des tetraviridae. Par transcription reverse de l'arn viral des fragments d'adnc ont ete obtenus et clones. L'un d'eux de 945 paires de bases a ete sequence. Deux methodes de diagnostic, l'un immunologique: test elisa, l'autre reposant sur l'hybridation du genome viral avec un adnc clone: sonde nucleique non radioactive, ont ete mis au point. Le pouvoir pathogene du virus etudie en laboratoire sur des larves de differents stades s'est avere tres fort quelque soit le stade, les jeunes larves etant les plus sensibles. Les prelevements effectues en plantation et lors d'epizooties naturelles ont montre une incidence importante de la virose sur la dynamique des populations naturelles du ravageur. Le traitement d'une parcelle a base de broyats de chenilles infectees et le suivi pendant deux generations des larves ont montre l'efficacite du virus pour juguler une pullulation du ravageur et les potentialites du virus comme biopesticide
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Nadeau-Thibodeau, Nicolas. "Le chancre causé par l'ophiognomonia clavigignenti-juglandacearum : protection et rétablissement du noyer cendré." Master's thesis, Université Laval, 2015. http://hdl.handle.net/20.500.11794/25821.

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Abstract:
Le chancre du noyer cendré (CNC), causé par l’agent pathogène Ophiognomonia clavigignenti-juglandacearum Broders & Bolands (Oc-j), est la principale cause du déclin de l’espèce en Amérique du Nord. Plus de 200 noyers potentiellement résistants ont été identifiés au Québec. Des inoculations artificielles ont été réalisées sur des semis provenant de quatre sources de noix récoltées sous des noyers cendrés potentiellement résistants, sur 1 lot de semis de noyer cendré dont la résistance des parents n’est pas connue ainsi que chez un hybride (Juglans cinerea x Juglans ailantifolia) réputé résistant au CNC. La sensibilité des différentes familles, évaluée en fonction de la longueur des nécroses internes, indique que trois familles de noyers cendrés présentaient des dimensions de nécroses similaires à l’hybride et qu’elles présentaient donc une certaine résistance au CNC. Chez certains individus, les blessures d’inoculation se refermaient plus rapidement et les parties nécrosées étaient entourées par des tissus de défense que l’on associe au compartimentage. Parallèlement à ces travaux, les cimes de 30 noyers cendrés répartis sur les sites du mont Saint-Bruno et de Saint-Augustin ont été dégagées selon deux traitements de manière à évaluer si un apport de lumière accru permet de stimuler la vigueur des arbres ainsi que d’améliorer l’état de santé du noyer cendré. Les traitements consistaient, d’une part, à tailler les cimes des arbres compétiteurs afin de libérer un rayon de 5 mètres autour de la cime à dégager et d’autre part, à retirer tous les arbres compétiteurs afin de créer un puits de lumière équivalent à environ une fois la hauteur des arbres dominants. Les résultats montrent, 2 et 3 ans après le dégagement, une meilleure croissance radiale chez les arbres traités en position codominante qui est significativement différente des témoins.
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Hernandez-Mendoza, José Luis. "Ecopathologie et dégâts de Spodoptera frugiperda (J. E. Smith) (Lep. Noctuidae) en culture de mai͏̈s au Mexique (Etat de Colima) : possibilité de lutte à l'aide de la bactérie entomopathogène Bacillus thuringiensis." Montpellier 2, 1989. http://www.theses.fr/1989MON20179.

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Abstract:
Une etude ecopathologique a ete realisee sur s. Frugiperda dans l'etat de colima, au mexique. Elle a permis l'observation periodique des phenomenes au sein des populations du mais. Pendant la culture de mais pluvial et de mais irrigue on a etudie sur trois zones ecologiques la population du ravageur, la culture comme plante-hote, l'action des facteurs abiotiques et biotiques de regulation. Les attaques vareient selon la region ecologique et sont surtout liees au stade phenomenologique de la culture. Le mais pluvial a subi les plus fortes infestations. Des protozoaires et des champignons ont ete observes dans les populations larvaires de cet insecte. Des cpv 1 ont egalement ete en quarantaine. Une nematde de la fam des mermithidae (nematoda) est responsable d'une mortalite importante dans la zone nord de l'etat. L'incidence de l'attaque de ce nematode semble etre fortement liee au stade phenomenologique du mais. Des diminutions de rendement ont ete correlees avec le niveau d'attaque. Il parait que l'hybride h-507 utilise pendant l'etude est totalement tolerant a l'attaque de l'insecte, les plantes endommagees presentant une surface foliaire superieure a celle des plantes saines. On a realise une etude de la potentialite d'utilisation de b. Thuringiensis comme technique de lutte biologique contre s. Frugiperda. Elle met en evidence trois souches potentialement utilisables. Dans l'etat de colima une souche du serovar kenyae fut pulverisee sur le mais, on a evalue sa persistance grace a la mortalite des larves neonates de s. Frugiperda
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Vaquié, Agathe. "Diversité intra- et interspécifique dans les systèmes céréaliers et ses effets sur la régulation des ravageurs." Thesis, Paris, Institut agronomique, vétérinaire et forestier de France, 2019. http://www.theses.fr/2019IAVF0008/document.

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Abstract:
Augmenter la diversité végétale au sein même du champ permet de réguler les populations de ravageurs dans de nombreux agroécosystèmes. Les mélanges variétaux (diversité intraspécifique) ou les associations de cultures avec une plante compagne (diversité interspécifique) sont considérées comme des pratiques agroécologiques prometteuses pour les systèmes de culture à bas intrants ou l'agriculture biologique. En effet, ces pratiques favorisent de nombreux services écosystémiques tels que la régulation des ravageurs, des maladies ou des adventices, ainsi que la fertilisation azotée. Cependant, le potentiel de régulation des ravageurs du blé par la combinaison de ces deux pratiques de diversification n'a pas encore été étudié.Nous avons combiné ces deux pratiques dans le cadre d'expérimentations menées en plein champ et sur deux saisons de culture, afin d'examiner leurs impacts sur les populations de pucerons et d'ennemis naturels. Nous avons également évalué le potentiel de régulation des ravageurs en mesurant les taux de prédation de proies sentinelles.La combinaison des diversités intra- et interspécifique n'est pas plus performante pour réduire les populations de pucerons que les pratiques prises séparément. L'association de culture blé-trèfle tend à être moins infestée par les pucerons, tandis que le mélange variétal est plus infesté que la variété la moins sensible. Les variations annuelles des conditions climatiques impactent fortement le développement du blé et du trèfle, ainsi que la date d'apparition du pic de puceron. Le rendement du blé, ainsi que le taux d'azote du grain sont réduits par l'association de culture par 7 à 10%, mais pas par le mélange variétal. La présence d'un couvert de trèfle dans les champs de blé, semble avoir favorisé la biodiversité fonctionnelle, particulièrement les ennemis naturels tels que les carabes, mais pas le mélange variétal. Les résultats sont variables selon la famille d'arthropodes concernée et leur position au sein du couvert végétal (au sol ou dans le feuillage). Le couvert de trèfle et le champ ont influencé la composition de la communauté de carabes prédateurs. Les taux de prédation des proies sentinelles n'ont pas été impactés par les pratiques de diversifications.En laboratoire, nous avons évalué comment l'association du blé avec des légumineuses (trèfle ou pois) pouvait modifier le comportement du puceron du blé Sitobion avenae en terme de location de sa plante hôte et du développement de la population. Les pucerons ont résidé moins de temps sur le blé quand il était associé à du trèfle. Les populations de pucerons se sont moins développées dans les associations du blé avec une légumineuse par rapport à du blé seul, mais si l'on prend en compte la biomasse du blé, seulement l'association blé-trèfle a considérablement réduit les densités de pucerons sur le blé. Ainsi l'espèce associée et sa densité sont des paramètres importants qui devraient être pris en compte dans les études sur la diversité interspécifique, car ils pourraient expliquer la grande variation dans les résultats rapportés par les analyses bibliographiques.Nos résultats suggèrent qu'augmenter la diversité cultivée au sein du champ peut aider à réguler les pucerons dans une certaine mesure, mais la combinaison des deux pratiques de diversification ne résultent pas en un trade-off entre la régulation des ravageurs et les performances agronomiques particulièrement attractifs pour les agriculteurs
Increasing intrafield plant diversity has been shown to regulate pest populations in various agroecosystems. Polyvarietal mixtures of a crop species (intraspecific diversity) or associations of a crop and a companion plant (interspecific diversity) are both considered as promising agroecological practices for low-input or organic agriculture systems by providing several ecosystem services such as pest, disease and weed control, and nitrogen fertilization. However, combining both diversification practices has not been studied yet in perspective of winter wheat pest control.In organic field experiments over two growing seasons, we combined both practices and examined the direct impact on aphid and natural enemy populations and on wheat production. We also investigated the potential pest regulation service through the assessment of the rate of predation by using sentinel preys.Results show that combining intra- and interspecific diversity did not outperform each practice individually in reducing aphid populations, thus not clearly showing synergetic effects. Taken separately, intercropping tended to have lower aphid infestation, while it the cultivar mixtures was more infested by aphids than the least susceptible cultivar. Yearly variation in climatic conditions strongly impacted wheat and clover development, as well as the appearance of aphid peaks. Wheat yields and grain nitrogen content were reduced in intercropping by 7 to 10%, but not in cultivar mixtures. Functional biodiversity, especially natural enemies such as ground beetles, tended to be positively correlated to the presence of a clover cover in the wheat fields (interspecific diversification), but did not respond to the wheat cultivar mixture (intraspecific diversification). Results varied according to the family of arthropods concerned and their position within the vegetation layer (ground dwelling or foliage dwelling arthropods). The cover of white clover and the field context influenced the community composition of predatory ground dwelling beetles. Rates of predation on sentinel preys were not influenced by any of the diversification practices.Under laboratory conditions, we evaluated how combining wheat and legumes (clover or pea) modifies the behaviour of the cereal aphid Sitobion avenae in terms of host-plant location, and population growth. We observed that aphids’ residence time on wheat was decreased when this host-plant was intercropped with clover. At the population level, wheat-legume intercrops reduced the number of aphids on wheat plants compared to wheat sole crops but if we take into account plant biomass, only intercropping clover with wheat significantly reduced aphid densities on wheat. The species used as non-host plants and their density are important parameters that should be taken into account in studies on intercropping systems and that may explain the large variability in the results observed in the literature.Our findings suggest that intrafield diversification may regulate wheat aphids to some extent, but combining the two diversification practices did not result in an interesting trade-off between pest regulation and wheat production in real farming conditions
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Reynaud, Bernard. "Transmission des virus de la striure, du stripe et de la mosai͏̈que du mai͏̈s par leurs vecteurs Cicadulina Mbila (Naude, 1924) et Peregrinus maidis (Ashmead, 1890) (Homoptera) : approches biologique, génétique et épidémiologique de la relation vecteur-virus-plante." Montpellier 2, 1988. http://www.theses.fr/1988MON20223.

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Abstract:
L'importance des degats occasionnes en zone tropicale par le maize streak virus (msv) transmis par cicadulina mbila (naude) et par le maize stripe virus (mstpv) ou le maize mosaic virus (mmv) transmis tous deux par peregrinus maidis (ashmead) a motive la creation de varietes resistantes. A cette fin, des recherches sur la biologie des vecteurs, les modes de transmission et le determinisme genetique de la resistance ont ete entreprises. C. Mbila est plus sensible aux temperatures basses et p. Maidis aux temperatures elevees. Ils sont oligophages. Le mil et le mais doux sont leurs plantes preferentielles respectives. A la reunion, les niveaux de populations augmentent fortement durant la saison chaude. C. Mbila peut accumuler rapidement le msv et le transmettre meme a de tres faibles concentrations. La multiplication du mstpv, mise en evidence par la technique elisa, est possible des l'incubation des ufs. Une barriere a la penetration de la paroi intestinale est mise en evidence pour les trois virus; une seconde barriere limite l'acces aux sites d'inoculation pour le mmv et le mstpv. Enfin, une troisieme barriere affecte la transmission ovarienne de mstpv, des determinismes simples chez l'insecte controlent chacune d'elles. Un gene recessif et deux genes dominants controlent la transmission du mstpv. Le composite irat 297 a exprime une excellente resistance aux trois viroses. Le niveau des resistances partielles polygeniques est tres eleve pour la striure; pour le stripe, la resistance complete, est predominante. L'identification de trois serotypes et de deux groupes de virulences montre la variabilite du msv
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Delplace, David. "Etudes de méthodes de détection de foyers de scolytes, Coleoptera, Curculionidae dans l'Est de la France: comparaison de techniques d'inventaires au sol, de surveillance aéroportée et de télédétection aérienne et satellitaire." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2008. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/210541.

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Abstract:
La détection précoce de foyers de scolytes est une étape déterminante des opérations phytosanitaires qui doivent permettre de réduire l’impact indirect des tempêtes sur les forêts de conifères, en particulier l’impact du typographe sur les pessières. Cette détection doit idéalement être efficace, précise et économique.

La présente thèse portait sur le typographe, Ips typographus, en pessière dans le massif vosgien. Elle visait à étudier et à comparer les performances en termes de précision (détection, localisation et inventaire), de coût et de rapidité de mise en œuvre de différentes méthodes de détection: la surveillance au sol, la détection aéroportée par un observateur embarqué (hélicoptère et ULM), et la télédétection (photographies aérienne infrarouge et imagerie satellitaire à haute et très haute résolution).

Dans le chapitre « techniques de détection au sol », nous avons évalué plusieurs méthodes de suivi (par transects, le long des routes carrossables et chemins forestiers, des courbes de niveau, à partir des foyers antérieurs, le long de parcours conditionnels liés aux foyers observés). Leurs performances ont été estimées via des simulations sous SIG (système d’information géographique) et les trajets qui ont présenté les meilleurs résultats ont ensuite fait l’objet d’une validation sur le terrain. Il en ressort que ce sont les trajets le long des routes carrossables et chemins forestiers ainsi que les trajets conditionnels qui présentent les meilleurs rapports efficacité/rendement dans la détection des foyers de scolytes. Le choix d’une de ces méthodes dépendra de la taille minimum des foyers que l’on veut observer.

Nous avons ensuite évalué, dans le chapitre « détection aéroportée », les performances de techniques d’observations de foyers réalisées par un observateur embarqué à bord d’un hélicoptère et d’un ULM. Une première étape a consisté à optimaliser toute une série de paramètres de vol pour les deux types d’appareils afin de permettre à l’observateur embarqué d’être dans les meilleures conditions d’observation. Ensuite, nous avons évalué la précision de détection en fonction de divers types de trajets en ULM et hélicoptère. D’après nos résultats, les observations recueillies à l’aide des deux sortes appareils n’ont pas permis de détecter de manière satisfaisante les foyers de scolytes quelque soit le type de trajet utilisé. Ces résultats sont sans-doute dus, en partie, à la faible expérience des observateurs embarqués mais également aux caractéristiques spatiales des foyers d’infestation qui ne facilitent pas leur détection par ce genre de méthode.

Enfin, dans le chapitre « télédétection », nous avons évalué les performances qu’offrent (1) des séries temporelles d’images SPOT, (2) la photographie aérienne infrarouge et (3) des images Quickbird dans la détection de foyers de scolytes. Pour tous ces types d’images, nous avons estimé la précision d’une classification automatique des foyers d’infestation, réalisée à partir de leurs caractéristiques spectrales, texturales et environnementales, par rapport aux autres éléments présents sur l’image. Ces analyses ont mis en évidence qu’il est possible d’atteindre une précision de classification relativement bonne (>80%) des foyers d’infestation sur des photographies aériennes et sur des images satellites à très haute résolution spatiale (Quickbird) grâce à des techniques de segmentation et de classification par arbre de décision. Par contre, il ne nous a pas été possible de déterminer de façon satisfaisante la précision de classification des images SPOT (haute résolution spatiale).

Les résultats détaillés de chacune de ces méthodes de détections sont développés dans les différents chapitres de cette thèse. La discussion générale met ceux-ci en relation en abordant leurs avantages et inconvénients respectifs, et aborde les perspectives découlant de nos résultats.


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Koyyappurath, Sayuj. "Étude histo-pathologique et moléculaire de la résistance des vanilliers (Vanilla spp., Orchidaceae) à Fusarium oxysporum f.sp. radicis-vanillae, agent de la pourriture des racines et des tiges." Thesis, La Réunion, 2015. http://www.theses.fr/2015LARE0008/document.

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Abstract:
La production de vanille (Vanilla planifolia, Orchidaceae) est limitée par la pourriture des racines et des tiges (PRT) provoquée par des champignons telluriques du genre Fusarium contre lesquels la lutte chimique ou prophylactique est inefficace. Ce travail décrit finement l'interaction entre les vanilliers et les Fusarium dans le but de développer la lutte génétique. L'analyse moléculaire (gène EF1α et IGS) et la détermination du pouvoir pathogène de 365 souches de Fusarium isolées de vanilliers à La Réunion et à Madagascar ont démontré que les souches pathogènes sur vanillier appartiennent presque toutes au complexe d'espèce F. oxysporum et ont une origine polyphylétique. Les observations en microscopie à champ large et multi-photons démontrent que la colonisation des racines débute au niveau des poils absorbants puis gagne le cortex, mais que le système vasculaire est épargné. Cela conduit à renommer l'agent pathogène en F. oxysporum f. sp. radicis-vanillae (Forv). Dans les interactions incompatibles (souche pathogène et vanillier résistant), l'épaississement et la lignification des parois de l'hypoderme, constitutive et induite par le champignon, joue un rôle significatif dans le blocage de l'invasion mycélienne. Le rôle important des composés phénoliques dans la résistance des vanilliers a été confirmé par les analyses d'expression différentielle de transcrits obtenus de novo par RNA-seq Illumina. Enfin, un test robuste de détermination in-vitro de la résistance à Forv a été validé et de nouvelles sources de résistance génétique à la PRT ont été identifiées. Nos résultats ouvrent des perspectives prometteuses pour la sélection de variétés améliorées de vanilliers
Vanilla is a high value cash crop that is continuously demanded by the agri-food and cosmetics industries for its incomparable flavor. Most of vanilla comes from the cured fruits of V. planifolia G. Jackson, a hemi-epiphytic climbing orchid cultivated in the humid tropics. In all the countries were it is cultivated, the vanilla vines suffer from a root and stem rot (RSR) caused by the soil borne fungus Fusarium oxysporum which dramatically reduces plant production and the durability of plantations. No efficient control method is currently available for this disease. Sources of genetic resistance to RSR exist in few vanilla relatives, but so far no commercial resistant variety has been produced. The purpose of this thesis was to better describe the diversity and histopathology of the causal agent of RSR and to evaluate the potential sources of genetic resistance that could be used in breeding programs. In a first step, a collection of 377 single-spored Fusarium isolates recovered from rotten roots and stems during surveys conducted in 52 vanilla plots from Reunion Island, Madagascar and French Polynesia were characterised. Representative subsets of isolates were genotyped using the Elongation Factor 1α and Intergenic Spacer gene sequences. Their pathogenicity was assayed by root dip inoculation on the susceptible V. planifolia accession pla0001. Results showed that F. oxysporum was the principal species responsible for the disease in the field, although a few F. solani isolates showing slight pathogenicity were also isolated. Fusarium oxysporum isolates were highly polyphyletic regardless of geographic origin or pathogenicity. Remarkably, their pathogenicity varied in gradient between non- pathogenic (about 42% of isolates) to highly pathogenic (14%). In a second step, 254 vanilla accessions comprising 18 species and six types of hybrids were assessed for resistance to RSR in the field (natural inoculum) and in the lab (in-vitro plants inoculated with Fo072). The strong resistance to RSR of all V. pompona accessions and hybrids of V. planifolia X V. pompona or V. phaeantha, were confirmed, and novel sources of resistance to RSR were added including, V. bahiana, V. costariciensis and V. crenulata. Most of the V. planifolia accessions, V. ×tahitensis and V. odorata were susceptible to RSR. However, three inbreeds of V. planifolia showed a high level of resistance to Forv. To our knowledge this is the first report of resistance to RSR in V. planifolia accessions. For the 26 accessions evaluated in both conditions, a strong correlation was observed between long term (9 years) evaluation in the field and ratings on in-vitro plants at 15dpi. Thirdly, we monitored by wide field and multiphoton microscopy the root infection process and the responses of one susceptible accession (V. planifolia pla0001) and two resistant accessions (V. planifolia pla0020 and V. pompona pom0018) to challenge inoculation with the severe isolate Fo072. In the compatible interaction (Fo072 – pla0001) invasion started from penetration of hyphae emitted from germinated conidia in the hairy region of root rapidly colonizing the cortex but never expanded to the vascular bundles up to the 9th dpi. It was therefore suggested to prefix the forma specialis name of the causal agent of RSR with radicis to point out its non-vascular pathogenicity in vanilla. In the two incompatible interactions, the important role played by hypodermis cells for impeding the invasion of the cortex by Fo072 was demonstrated by specific staining and spectral analysis of lignin precursors. Both constitutive and pathogen induced defense mechanism were described in pla0020 and pom0018. The mechanisms included the deposition of lignin in the hypodermal cell wall, entrapment of hyphae in specific hypodemal cells and polyphenolics secretion in intercellular spaces. Further, a de novo transcriptome analysis was experimentedon 8 pooled samples
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Meurisse, Nicolas. "Chemical ecology of rhizophagus grandis (Coleoptera: Monotomidae) and its application to the biological control of dendroctonus micans (Coleoptera: Scolytinae)." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2008. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/210567.

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Abstract:
The Eurasian spruce bark beetle Dendroctonus micans is a major pest of spruce which is expanding its range in France, Turkey, England and Wales. Its monospecific predator Rhizophagus grandis has followed naturally the bark beetle into most areas and, since the 1960s, has also been mass-produced and successfully released within newly infested locations.

In this scope, the development of an effective trapping method would be very useful to assess the bark-beetle presence at previously uninfested sites, or predator establishment after release or natural spread. We demonstrated the efficiency of oxygenated monoterpenes-baited kairomone traps to monitor R. grandis in various epidemiological conditions, including areas localized behind or at the limit of the pest’s distribution, or in areas where artificial releases were performed. Because the predator is strictly species-specific, another exciting possibility offered by the kairomone trapping is the indirect monitoring of the pest itself in areas of unknown status (e.g. areas under colonization, or considered as at risk at medium- term).

R. grandis is also considered as one of the most valuable natural enemies to strike aggressive North-American Dendroctonus species. In this respect, R. grandis has been recently applied in a neo-classical biological program against the red turpentine beetle D. valens, which invaded China from North America in the late 1990’s. In laboratory tests conducted on pine logs in the laboratory, or on living pine trees in the field, we demonstrated that R. grandis adults can successfully enter and reproduce into D. valens galleries.

In Europe, R. grandis is the only species regularly found in the brood systems of D. micans, where adults and larvae attack the gregarious larvae of their prey. In such enclosed systems, R. grandis’ functional response is therefore influenced by various interrelated components, such as the prey density, the predator density, or the prey distribution. Measuring the predator’s success in terms of larval survival and growth rates, we demonstrated the time spent by R. grandis larvae to wound and kill their prey to be the main factor limiting their development. This factor may be considerably influenced by the proportions of diseased, wounded or molting prey rise in the brood system, for instance as a result of an increase in prey density, or due to the presence of conspecific adults (which wound their prey but do not consume them entirely). Furthermore, our tests suggest that no cannibalism or noticeable intraspecific competition occurred between R. grandis larvae, whereas some lighter mode of competition probably took place.

R. grandis also exhibits a reproductive numerical response to prey density, which mainly relies on the perception of chemical stimuli and inhibitors released in the bark beetle brood system. In the current study, we developed a non-destructive approach to follow the dynamics of volatile compound production, using sequential sample collection on SPME fibers. Our tests demonstrated that the larval activity of D. micans or D. valens strongly influences the release of some oxygenated monoterpenes. However, our attempts to correlate the relative quantities of some identified chemicals to offspring production were less successful as it concerns the identification of potential oviposition stimuli and inhibitors.

The problematic rose by the progression of D. micans, as well as detailed results of each of the described above studies are discussed in the two published papers and the three manuscripts forming this thesis. Bringing all these studies together, several perspectives are also presented in the general discussion.

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Ravageur des épicéas, Dendroctonus micans est toujours en voie d’extension en France, en Turquie, en Angleterre et au Pays de Galles. Dans la plupart de ces zones, le dendroctone est accompagné de manière naturelle par son prédateur monospécifique, Rhizophagus grandis. Depuis les années 1960, le prédateur a également fait l’objet d’une production de masse et de programmes de lâchers dans les zones d’arrivée récente du scolyte.

Dans le cadre de la lutte biologique contre D. micans, les gestionnaires forestiers doivent donc estimer au plus tôt la présence du ravageur dans des zones jusque là indemnes, mais également vérifier l’établissement du prédateur par progression naturelle ou résultant d’introductions délibérées. Dans la présente étude, nous avons démontré l’efficacité de pièges d’interception appatés à l’aide de monoterpènes oxygénés pour la capture de R. grandis. Celle-ci s’est faite dans différentes conditions épidémiologiques, incluant notamment des zones situées en arrière du front de progression du scolyte et des zones où des lâchers artificiels ont été réalisés. Comme R. grandis est strictement inféodé au dendroctone, un autre avantage de la technique est la possibilité de réaliser un dépistage indirect du ravageur dans les zones où son statut est incertain (zones en cours de colonisation, ou considérées comme à risque à moyen terme).

Par ailleurs, R. grandis est également considéré comme un des meilleurs ennemis naturels potentiels pour lutter contre d’autres espèces de Dendroctonus aggressifs. Dans cette optique, R. grandis a été récemment utilisé dans un programme de lute biologique contre D. valens, ravageur invasif arrivé en Chine dans la fin des années 1990 en provenance d’Amérique du Nord. Nous avons démontré la capacité de R. grandis à s’introduire et à se reproduire dans les galeries de D. valens lors de tests de laboratoire, mais aussi sur des arbres vivants en pinèdes.

En Europe, R. grandis est strictement inféodé aux galeries de D. micans, où larves et adultes du prédateur s’attaquent aux larves grégaires du scolyte. Dans ce système clos, la réponse fonctionelle de R. grandis est influencée par plusieurs facteurs étroitement corrélés, la densité de proies, la densité de prédateurs, et la distribution des proies. En mesurant l’efficacité de prédation de R. grandis en termes de survie des larves et de taux de croissance, nous avons démontré l’influence sur leur développement du temps passé par les larves à blesser et à tuer leurs proies. Ce facteur est par ailleurs fortement dépendant de la proportion de larves malades, blessées ou en cours de mue au sein du système ;une proportion qui peut augmenter en réponse à une augmentation de la densité de proies, ou lorsque des adultes sont présents (ceux-ci blessent les proies mais ne les consomment pas entièrement). Enfin, nos tests suggèrent qu’il n’existe que peu de cannibalisme ou de compétition intraspécifique entre larves de R. grandis, tandis que des modes de compétition moins importants prennent vraisemblablement place.

R. grandis présente également une réponse numérique reproductive à la densité de proies disponibles, principalement basée sur la perception de stimuli et d’inhibiteurs présents dans les galeries du scolyte. Par la collecte de composés volatils présents dans ces systèmes à l’aide de fibres SPME, nous avons développé une méthode non-destructive pour suivre la dynamique de production des médiateurs chimiques. Nos tests ont démontré que l’activité des larves de D. micans ou D. valens influence fortement la dynamique de production de certains monoterpènes oxygénés. En revanche, il n’a pas été été possible de corréler les différents composés identifiés au nombre de larves de R. grandis présentes dans le système.

La problématique soulevée par la progression de D. micans, de même que les résultats détaillés de chacune des études décrites ci-dessus sont discutés dans les deux papiers publiés et les trois manuscrits formant cette thèse. Les différentes perspectives apportées par ce travail sont également présentées dans la discussion générale.


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Quenouille-Lederer, Julie. "Bases génétiques et fonctionnelles de la durabilité des résistances polygéniques au virus Y de la pomme de terre (PVY) chez le piment (Capsicum annuum)." Thesis, Avignon, 2013. http://www.theses.fr/2013AVIG0650/document.

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Abstract:
Les résistances génétiques permettent une lutte efficace contre les maladies des plantes cultivées mais sont limitées par les capacités d’évolution des bioagresseurs ciblés. Chez le piment, le fonds génétique peut améliorer la durabilité de la résistance au PVY conférée par le gène majeur pvr23. L’objectif de ma thèse était de caractériser les facteurs génétiques de l’hôte conditionnant la durabilité du gène majeur en répondant aux questions suivantes : (i) Quels sont leurs actions sur l’évolution des populations virales ? (ii) Correspondent-ils aux QTL (quantitative trait loci) de résistance partielle ? (iii) Sont-ils répandus au sein des ressources génétiques du piment ? Différentes expérimentations incluant des tests de résistances, d’évolution expérimentale et de compétition entre différents variants viraux, ont montré que les facteurs du fonds génétique augmentant la durabilité de pvr23 agissaient en : (i) diminuant la concentration virale dans la plante, (ii) en réduisant les probabilités de mutations du PVY vers le contournement du gène pvr23 et (iii) en ralentissant la sélection des variants viraux contournants. La détection de QTL et la cartographie des facteurs génétiques affectant la fréquence de contournement de pvr23 (QTL de durabilité) a mis en évidence quatre régions du génome du piment qui, par des effets additifs ou épistatiques, expliquent 70% de la variabilité phénotypique observée. La cartographie comparée montre que trois des quatre QTL de durabilité co-localisent avec des QTL affectant la résistance partielle, suggérant que les QTL de résistance partielle ont un effet pléiotropique sur la durabilité d’un gène majeur de résistance. L’étude d’une collection de 20 accessions de piment, porteuses de pvr23 ou pvr24(allèle très proche de pvr23) dans des fonds génétiques variés, a montré que les fonds génétiques favorables à la durabilité de ces allèles de résistance sont fréquents dans les ressources génétiques du piment. Ces résultats mettent en évidence que la durabilité d’un gène majeur de résistance peut-être fortement augmentée lorsqu’il est associé à des facteurs génétiques réduisant la multiplication du pathogène. De plus, la fréquence de contournement du gène majeur s’est révélée être un caractère très héritable (h²=0.87) et la détection de QTL affectant ce caractère est possible. La sélection directe pour de tels QTL est donc envisageable et ouvre de nouvelles perspectives pour préserver la durabilité des gènes majeurs de résistance utilisés en sélection variétale
Genetic resistances provide an efficient control of crop diseases but are limited by pathogen adaptation.In pepper, the durability of the pvr23 allele, conferring resistance to Potato virus Y (PVY), was demonstrated todepend on the plant genetic background. The aim of my PhD thesis was to characterize the host genetic factorsaffecting the durability of the major resistance gene pvr23 and to answer to the following question s: (i) What istheir action on the evolution of the viral population? (ii) Is there identity between the QTLs (quantitative traitloci) controlling the partial resistance and the QTLs affecting the durability of pvr23? (iii) Are these genetic factorswidespread among the genetic resources of pepper? Various experiments including resistance testing,experimental evolution and competition between various PVY variants, enabled to show that the genetic factorsaffecting the durability of pvr23 acted in: (i) decreasing the viral accumulation, (ii) decreasing the probability ofacquisition of resistance breaking (RB) mutations by PVY and (iii) slowing down the selection of RB variants. QTLdetection and mapping of genetic factors affecting the frequency of pvr23 RB showed that four loci actingadditively and in epistatic interactions explained together 70% of the variance of pvr23 breakdown frequency.Comparative mapping between these QTLs and QTLs affecting partial resistance showed that three of the fourQTLs controlling the frequency of pvr23 RB are also involved in quantitative resistance, suggesting that QTLs forquantitative resistance have a pleiotropic effect on the durability of the major resistance gene. Analysis of acollection of 20 pepper accessions, carrying pvr23 or pvr24 (allele closely related to pvr23) in various geneticbackgrounds, showed that genetic backgrounds favorable to the durability of the pvr2-mediated resistance arewidespread in the genetic resources of pepper. These results highlight that the durability of a major resistancegene can be strongly increased when associated with genetic factors decreasing the pathogen multiplication.Moreover, the frequency of a major gene RB is a highly heritable trait and QTLs detection for this trait isachievable. The direct selection for such QTLs opens new prospects to preserve the durability of major resistancegenes used by breeders
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