Academic literature on the topic 'Métabolites – Stabilité'

The participation of microbiota in myriads of physiological, metabolic, genetic and immunological processes shows that they are a fundamental part of human existence and health maintenance. The efficiency of drugs’ absorption depends on solubility, stability, permeability and metabolic enzymes produced by the body and gut microbiota. Two major types of microbiota-drug interaction have been identified; direct and indirect. The use of antibiotics is a direct means of targeting intestinal microbes and short-term use of antibiotic can significantly alter the microbiome composition. It is noteworthy that not every microbial drug metabolism is of benefit to the host as some drugs can shut down microbial processes as observed in the co-administration of antiviral sorivudine with fluoropyridimide resulting in a toxic buildup of fluoropyridimide metabolites from blockade of host fluoropyridimide by the microbial-sorivudine metabolite. It has been reported that many classes of drugs and xenobiotics modify the gut microbiome composition which may be detrimental to human health. Microbiome-drug interaction may be beneficial or detrimental resulting in either treatment success or failure which is largely dependent on factors such as microbial enzymes, chemical composition of candidate drug, host immunity and the complex relationship that exists with the microbiome. The effects of microbiota on pharmacology of drugs and vice versa are discussed in this review.Keywords: microbiome; pharmacokinetic, pharmacodynamic, drug, xenobiotic English Title: Microbiome: pharmacocinétique, pharmacodynamique et interactions médicamenteuses/xénobiotiquesLa participation du microbiote à des myriades de processus physiologiques, métaboliques, génétiques et immunologiques montre qu’ils sont un élément fondamental de l’existence et du maintien de la santé de l’être humain. L’efficacité de l’absorption des médicaments dépend de la solubilité, de la stabilité, de la perméabilité et des enzymes métaboliques produites par le corps et le microbiote intestinal. Deux types principaux d’interaction microbiote-médicament ont été identifiés; direct et indirect. L'utilisation d'antibiotiques est un moyen direct de cibler les microbes intestinaux et une utilisation à court terme d'antibiotique peut modifier de manière significative la composition du microbiome. Il est à noter que tous les métabolismes de médicaments microbiens ne sont pas bénéfiques pour l'hôte, car certains médicaments peuvent arrêter les processus microbiens observés lors de l'administration concomitante d'antiviral sorivudine et de fluoropyridimide, ce qui entraîne une accumulation toxique de métabolites de fluoropyridimide résultant du blocage du fluoropyridimide par l'hôte. métabolite microbien-sorivudine. Il a été rapporté que de nombreuses classes de médicaments et de xénobiotiques modifiaient la composition du microbiome intestinal, ce qui pourrait nuire à la santé humaine. Une interaction médicamenteuse-microbiome peut être bénéfique ou préjudiciable, entraînant le succès ou l'échec du traitement, qui dépend en grande partie de facteurs tels que les enzymes microbiennes, la composition chimique du médicament candidat, l'immunité de l'hôte et la relation complexe qui existe avec le microbiome. Les effets du microbiote sur la pharmacologie des médicaments et inversement sont discutés dans cette revue.Mots-clés: microbiome; pharmacocinétique, pharmacodynamique, médicament, xénobiotique

Le phénomène de déficit en vitamine D a pris une grande ampleur aujourd’hui, ce déficit connaît un effet de « pandémie » mondiale, il n’épargne aucune frontière ni catégorie d’âge. Les connaissances de la physiologie de cette vitamine ont progressé de manière considérable, faisant passer sa conception d’une hormone purement osseuse à une hormone ayant un rôle sur la santé globale. En effet, son double rôle d’immunomodulateur et de contrôle de la prolifération cellulaire est possible grâce à son métabolite actif secrété de façon autocrine par certains tissus, et la répartition ubiquitaire de ses récepteurs. En plus de cette description d’effets pléiotropes à la fois dans des modèles cellulaires, expérimentales et cliniques, de plus en plus d’études épidémiologiques ont montré l’importance de la carence en vitamine D dans la population générale, adulte, comme pédiatrique. Sur le plan diagnostic, la mesure du taux de la 25-hydroxy-vitamine D (25-OHD) est une méthode très fiable pour évaluer les réserves. D’autre part, beaucoup de facteurs de risque ont été mis en évidence et des populations à risque ont été identifiées. En ce qui concerne la supplémentation, il a été récemment suggéré que la stabilité de la concentration de la 25-OHD ne peut être obtenue lors de la supplémentation intermittente que si l’espacement entre les prise est inférieur à 3 mois (de l’ordre de 1 mois) . Quelques travaux récents montrent, que l’utilisation de doses journalières modérées de vitamine D plutôt que de fortes doses administrées de manière intermittente serait à privilégier.

Les études sur la digestion et le métabolisme des camélidés ont bénéficié au cours des quinze dernières années des progrès techniques et méthodologiques issus des travaux conduits chez les ruminants. On dispose aujourd’hui d’éléments scientifiques fiables qui permettent de comparer les aptitudes digestives et métaboliques respectives de ces deux types d’animaux. L’anatomie des pré-estomacs ainsi que le comportement alimentaire des animaux sont très différents entre camélidés et ruminants. De telles différences ont des conséquences sur la transformation des aliments dans le tube digestif. Bien que la population microbienne soit qualitativement la même, l’activité cellulolytique des bactéries est plus importante dans les pré-estomacs des camélidés et le temps de séjour moyen des particules solides y est plus long. L’évolution de ces deux paramètres est à l’origine d’une meilleure digestion de la matière organique et de la fraction cellulosique des rations. Grâce à un meilleur pouvoir tampon des digesta, l’ajout important d’amidon à une ration à base de fourrage n’a pas les effets négatifs observés sur la cellulolyse chez les ruminants. Par ailleurs, les camélidés excrètent moins d’azote dans l’urine et recyclent efficacement l’urée via la muqueuse des pré-estomacs. Cette épargne de l’azote leur permet de maintenir une production minimum de protéines microbiennes dans le cas de régimes carencés en azote. En revanche, les camélidés sont beaucoup plus sensibles que les ruminants à des risques d’intoxication dus à des excès d’azote soluble dans les rations. Des besoins d’entretien en énergie réduits et un meilleur rendement de transformation de l’énergie métabolisable en énergie nette, vont dans le sens d’une meilleure utilisation de l’énergie ingérée par les camélidés. Une plus grande stabilité des conditions physico-chimiques (pH, NH3) du milieu fermentaire dans le compartiment C1 des camélidés après le repas, ainsi qu’une vitesse de vidange plus élevée de la phase liquide, sont des éléments favorables au développement et à l’activité des microorganismes.

L’objectif de ce travail de thèse est de développer une base de données spectrale pour faciliter l’annotation et l’interprétation biologique des jeux de données d’analyse métabolomique obtenus en utilisant la chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse. Deux approches ont été utilisées : l’identification par comparaison aux spectres de masse de composés de références et l’identification directement à partir des données biologiques. Pour la première approche une chiomiothèque de métabolite a été constituée et analysée. L’identification à partir de données biologiques a été réalisée sur une cohorte de volontaires de 227 individus travaillant au CEA. 244 métabolites ont ainsi été identifiés dans les urines humaines, donc 78 jamais été décrits comme faisant parti du métabolome urinaire. 139 métabolites ont également était caractérisés sur la base de leur masse précise mais sans identification formelle. Ces 383 métabolites représentent environ 1000 ions dans chacun des modes d’ionisation. Les variations physiologiques au sein de la cohorte, en fonction de l’âge, du poids et du genre, de ces différents métabolites ont été étudiées afin de construire une base de données relationnelle. Enfin, le métabolome urinaire pouvant être affecté par les conditions de prélèvement des échantillons d’urines, nous avons réalisé des études de stabilité dans les conditions de prélèvement des métabolites précédemment caractérisés. Ces études nous ont permis de proposer des recommandations en termes de conditions de prélèvement et de stockage à court terme des urines et de mesurer l’impact de la contamination bactérienne sur les concentrations de différents métabolites urinaires

Les phénylpropanoïdes (PPs) constituent l'une des familles les plus abondantes des métabolites secondaires dans le règne végétal. Ils protègent les plantes contre les stress biotiques et abiotiques. De nos jours, les études portent sur l'utilisation des PPs comme alternatifs aux agents antimicrobiens, antioxydants et anti-inflammatoires de synthèse pour leur incorporation dans la formulation des produits alimentaires et pharmaceutiques. Cependant, l'utilisation de PPs est généralement limitée en raison de leur faible solubilité, stabilité et volatilité. L'objectif de notre travail a été d'encapsuler sept PPs dans des molécules cages, les cyclodextrines (CDs), en vue de développer des systèmes naturels et éco-compatibles ayant des applications potentielles dans les domaines alimentaire et pharmaceutique. Trois axes ont été abordés. Le premier axe a porté sur la préparation et la caractérisation des complexes d'inclusion CD/PP en solution et à l'état solide. Les techniques d'"headspace" couplé à la chromatographie en phase gazeuse (HS-CG), spectroscopie UV-visible, ¹H RMN, (2D) ROESY RMN, FTIR, DSC et de la modélisation moléculaire ont été utilisées comme outils pour la caractérisation des complexes obtenus. Des études de phase de solubilité ont été également réalisées. Le deuxième axe a porté sur l'évaluation de l'effet des CDs sur la photostabilité et la vitesse de libéralisation des PPs. Le dernier axe a été orienté vers l'étude des activités anti-radicalaire, antibactérienne et antifongique des complexes d'inclusion CD/PP. Les résultats montrent que les CDs sont capables d'encapsuler les PPs étudiés, réduire leur volatilité, augmenter leur solubilité et photostabilité ainsi que de générer des systèmes de libération prolongée. De plus, l'encapsulation conserve les propriétés antioxydante, antibactérienne et antifongique des PPS. Les résultats de cette étude suggèrent que les complexes d'inclusion des PPs avec les CDs peuvent être considérés comme outils prometteurs pour l'optimisation des formulations alimentaires et pharmaceutiques
Phenylpropanoids (PPs) are one of the largest families of plants secondary metabolites. They protect plants against biotic and abiotic stresses. Nowadays, extensive research has been dedicated to PPs aiming their use as natural alternatives to synthetic antimicrobial, antioxidant and anti-inflammatory agents in food and pharmaceutical formulations. However, PPs suffer from a low water solubility, high volatility, high light and thermal sensitivity that limit their further use. This current study aimed to encapsulate seven PPs in host cage molecules, cyclodextrins (CDs), in order to develop natural and biocompatible formulation that may find applications in food and pharmaceutical fields. It focused on three main research axes. The first part dealt with the preparation and the characterization of CD/PP inclusion complexes both in solution and in solid state. Characterizations were performed with Static-Headspace-Gas Chromatography (SH-GC), UV-Visible, ¹H NMR, (2D) ROESY NMR, FTIR, DSC and molecular modeling. These investigations were complemented with phase solubility studies. The second part was devoted to the evaluation of the effect of CDs on the PPs photostability and controlled release. The last part aimed to evaluate the CD/PP inclusion complexes as radical scavengers, antibacterial and antifungal agents. Results showed that CDs could successfully encapsulate PPs, reduce their volatility, enhance their solubility and photostability and generate controlled release system. In addition, encapsulation maintained the antioxydant, antibacterial and antifungal properties of PPs. Thus, the CD/PP inclusion complexes could be considered as a promising tool for formulation optimization

L'objectif de ce travail de thèse est de développer une base de données spectrale pour faciliter l'annotation et l'interprétation biologique des jeux de données d'analyse métabolomique obtenus en utilisant la chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse. Deux approches ont été utilisées : (i) l'identification par comparaison aux spectres de masse de composés de références et (ii) l'identification directement à partir des données biologiques. Pour la première approche une chiomiothèque de métabolite a été constituée et analysée. L'identification à partir de données biologiques a été réalisée sur une cohorte de volontaires de 227 individus travaillant au CEA. 244 métabolites ont ainsi été identifiés dans les urines humaines, donc 78 qui n'avaient jamais été décrits comme faisant parti du métabolome urinaire.139 métabolites ont également était caractérisés sur la base de leur masse précise mais sans identification formelle. Ces 383 métabolites représentent environ 1000 ions dans chacun des modes d'ionisation. Les variations physiologiques au sein de la cohorte, en fonction de l'âge, du poids et du genre, de ces différents métabolites ont été étudiées afin de construire une base de données relationnelle. Enfin, le métabolome urinaire pouvant être affecté par les conditions de prélèvement des échantillons d'urines, nous avons réalisé des études de stabilité dans les conditions de prélèvement des métabolites précédemment caractérisés. Ces études nous ont permis de proposer des recommandations en termes de conditions de prélèvement et de stockage à court terme des urines et de mesurer l'impact de la contamination bactérienne sur les concentrations de différents métabolites urinaires.