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Dissertations / Theses on the topic 'Metalloenzimi'

Author: Grafiati

Published: 9 March 2023

Last updated: 31 July 2025

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1

ROVALETTI, ANNA. "A computational outlook on the catalysis exerted by the unique active site of MoCu CO dehydrogenases." Doctoral thesis, Università degli Studi di Milano-Bicocca, 2021. http://hdl.handle.net/10281/305403.

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Abstract:

I processi di produzione e consumo negli ecosistemi del suolo contribuiscono ai cicli biochimici globali di molti gas in tracce (CH4, CO, H2, N2O e NO) che sono rilevanti per la chimica atmosferica e il clima. Tali piccole molecole di gas svolgono ruoli diversi nel metabolismo dei microrganismi posti nel suolo che si basano su metalloenzimi specifici per la loro trasformazione. Tra questi, è stato dimostrato che i metalloenzimi a base di molibdeno sono cruciali in tale contesto. In particolare, è stato riportato che un molibdoenzima specifico è coinvolto nell'ossidazione della CO atmosferica.

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2

Kluge, Stefan. "Modellierung sequentieller Metalloenzyme auf Magnesiumbasis." lizenzfrei, 2007. http://www.db-thueringen.de/servlets/DocumentServlet?id=10371.

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3

Kung, Yan. "Structural studies of metalloenzyme complexes in acetogenic carbon fixation." Thesis, Massachusetts Institute of Technology, 2011. http://hdl.handle.net/1721.1/65474.

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Abstract:

Thesis (Ph. D.)--Massachusetts Institute of Technology, Dept. of Chemistry, 2011.<br>Vita. Cataloged from PDF version of thesis.<br>Includes bibliographical references.<br>Acetogenic bacteria use the Wood-Ljungdahl carbon fixation pathway to produce cellular carbon from CO₂. This process requires several metalloenzymes that employ transition metals such as iron, nickel, and cobalt towards the production of acetyl-CoA, the final product. In one stage of the pathway, the cobalt-containing B₁₂ cofactor harbored by the corrinoid iron-sulfur protein (CFeSP) transfers a methyl group from methyltetra

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4

Murray, Jill Isobel. "A metalloenzyme model for the biotransformation of nitroglycerin to nitric oxide." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 2002. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk3/ftp05/MQ63344.pdf.

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5

Schweitzer, Dirk. "Biomimetic models of the active site of the metalloenzyme nitrile hydratase /." Thesis, Connect to this title online; UW restricted, 2001. http://hdl.handle.net/1773/8692.

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6

Neupane, Kosh Prasad. "Nickel superoxide dismutase insight into the metalloenzyme gained from functional metallopeptide models /." abstract and full text PDF (UNR users only), 2009. http://0-gateway.proquest.com.innopac.library.unr.edu/openurl?url_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:dissertation&res_dat=xri:pqdiss&rft_dat=xri:pqdiss:3355593.

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7

Keppetipola, Niroshika. "Characterization of DNA and RNA end modifying enzymes and a triphosphate tunnel metalloenzyme /." Access full-text from WCMC, 2009. http://proquest.umi.com/pqdweb?did=1619359881&sid=5&Fmt=2&clientId=8424&RQT=309&VName=PQD.

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8

Saysell, Colin G. "Reactivity of the copper containing enzyme galactose oxidase." Thesis, University of Newcastle Upon Tyne, 1996. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.307890.

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9

Benini, Stefano. "Structure and function relationships of urease and cytochrome c-553 from Bacillus pasteurii." Thesis, University of York, 2000. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.325599.

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10

Huang, Qiongying. "In Vitro Study of Two Virulence Factors of Listeria monocytogenes: Cytolysin LLO and Metalloenzyme PC-PLC." Thesis, Boston College, 2014. http://hdl.handle.net/2345/bc-ir:103619.

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Abstract:

Thesis advisor: Mary F. Roberts<br>Thesis advisor: Jianmin Gao<br>The research reported in this thesis focused on three proteinaceous virulence factors of the intracellular bacterial pathogen Listeria monocytogenes: listeriolysin O (LLO), broad-range phospholipase C (PC-PLC), and phosphatidylinositol-specific phospholipase C (PI-PLC). Based on sequence homology of LLO with other cholesterol-dependent cytolysins (CDC), the protein has four domains of which domain 4 is thought to anchor the protein to cholesterol-containing surfaces while domain 3 mediates protein-protein binding on the membrane

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11

Akkaya, Engin Umut. "Synthesis and study of cyclodextrin-based metalloenzyme mimics and fluorescence probes of molecular recognition /." The Ohio State University, 1989. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=osu1487599963592456.

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12

Leurs, Melanie [Verfasser], Jörg C. [Akademischer Betreuer] Tiller, and Dieter [Gutachter] Vogt. "Artifizielle Metalloenzyme in organischen Medien / Melanie Leurs ; Gutachter: Dieter Vogt ; Betreuer: Jörg C. Tiller." Dortmund : Universitätsbibliothek Dortmund, 2019. http://d-nb.info/1204636478/34.

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13

Breece, Robert M. "Spectroscopic Characterization of Co(II)-Substituted VanX, a Zn(II)-Dependent Dipeptidase Required for High-Level Vancomycin Resistance." Miami University / OhioLINK, 2004. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=miami1077576564.

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14

Di, Méo Thibault. "Ingénierie de l’architecture protéique artificielle αRep : élaboration de catalyseurs biohybrides par couplage covalent de complexes métalliques". Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017SACLS012/document.

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Abstract:

Le développement d’une nouvelle génération de catalyseurs dits biohybrides est basé sur l’association d’un complexe métallique et d’une protéine. D’un côté, le complexe métallique est responsable de l’activité catalytique ; de l’autre côté, la protéine protège le complexe métallique vis-à-vis de la dégradation en milieu aqueux et fournit également un environnement chiral propice à une catalyse énantiosélective. Ces catalyseurs fonctionnant de manière sélective en milieu aqueux s’inscrivent tout à fait dans les préceptes de la chimie verte.Une nouvelle famille de protéines artificielles, nommée

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ARRIGONI, FEDERICA. "Chemistry and renewable energy: DFT investigation on CO2 reduction and H2 oxidation/production catalyzed by transition metal biomimics." Doctoral thesis, Università degli Studi di Milano-Bicocca, 2017. http://hdl.handle.net/10281/153273.

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Abstract:

My PhD research has been devoted to the investigation of diiron dithiolate compounds, that are structurally and functionally related to [FeFe]-hydrogenase and nitrogenase active sites. DFT computations provided relevant insights for a better comprehension of the chemistry of these systems, at the same time posing new questions and hints for future prospects. The core of the thesis is dedicated to [FeFe]-hydrogenase biomimics, whose structures and reactivity have been theoretically addressed by various standpoints. Several gaps concerning the activity of these systems still need to be filled.

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Dinesh, C. U. "Synthesis of biologically useful compounds employing π- face stereo selection, phosphacumulene ylide and marine metalloenzyme(VPO) mimic". Thesis(Ph.D.), CSIR-National Chemical Laboratory, Pune, 1996. http://dspace.ncl.res.in:8080/xmlui/handle/20.500.12252/2847.

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Xie, Juan. "Synthèse, étude biologique et pharmacologique de nouveaux inhibiteurs des enzymes de dégradation des enképhalines." Paris 5, 1988. http://www.theses.fr/1988PA05P617.

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Debela, Mekdes Haile Mariam. "Crystal structures of the human tissue kallikreins 4, 5, 7, 10, characterisation of their substrate specificity and analysis of their various zinc inhibition mechanisms." München Verl. Dr. Hut, 2007. http://d-nb.info/988422395/04.

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19

Saam, Jan. "Identification of dynamic oxygen access channels in 12/15-lipoxygenase." Doctoral thesis, Humboldt-Universität zu Berlin, Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät I, 2008. http://dx.doi.org/10.18452/15744.

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Abstract:

Zellen enthalten zahlreiche Enzyme, deren Reaktionen von molekularem Sauerstoff abhängen. Oft sind deren aktive Zentren tief im inneren des Proteins verborgen, was die Frage nach spezifischen Zugangskanälen, die den Sauerstoff gezielt zum Ort der Katalyse leiten, aufwirft. In der vorliegenden Arbeit wird dies am Beispiel der 12/15-Lipoxygenase, als ein typisches Beipiel Sauerstoff verbrauchender Enzyme, untersucht. Die Sauerstoffverteilung innerhalb des Proteins wurde bestimmt und mögliche Routen für den Sauerstoffzugang definiert. Zu diesem Zweck wurden theoretische Untersuchu

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20

Nakatani, Naoki. "Theoretical Studies of Photoproteins and Non-Heme Iron Enzymes: Electronic Structures and Reaction Processes." 京都大学 (Kyoto University), 2010. http://hdl.handle.net/2433/120885.

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21

Krystof, Monika [Verfasser], Jürgen [Verfasser] Klankermayer, and Walter [Akademischer Betreuer] Leitner. "Artifizielle Metalloenzyme und heterogenisierte Übergangsmetall-Komplexe mit Triphos-Liganden : Synthese, Kupplungsstrategien und katalytische Aktivität / Monika Krystof, Jürgen Klankermayer ; Betreuer: Walter Leitner." Aachen : Universitätsbibliothek der RWTH Aachen, 2016. http://d-nb.info/1130402843/34.

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22

Urich, Tim. "The sulfur oxygenase reductase from Acidianus ambivalens." Phd thesis, [S.l.] : [s.n.], 2005. https://tuprints.ulb.tu-darmstadt.de/615/1/urich_diss.pdf.

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Abstract:

The microbial oxidation of reduced inorganic sulfur compounds and elemental sulfur to sulfate is one of the major reactions in the global sulfur cycle. Despite its importance, only limited information is available about molecular details of the enzymes involved. The present work was aimed to contribute to the understanding of the underlying molecular mechanisms by investigating the function and structure of the sulfur oxygenase reductase (SOR) from the thermoacidophilic crenarchaeote Acidianus ambivalens. The expression of the sor gene in Escherichia coli resulted in active, soluble SOR and in

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David, Rolf. "Chemins de protonation et réactivité des métalloenzymes : application à la superoxide réductase." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017GREAV087/document.

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Abstract:

L’obtention, dans des conditions douces, sélectives et de chimie durable de molécules ciblées est aujourd’hui un enjeu majeur. Les métalloenzymesartificielles représentent une voie d’investigation importante, car en jouant, par exemple, sur la seconde sphère de coordination,il est possible de modifier fortement la réactivité de ces systèmes bio-inspirés. Le développement de cette chimie suppose une connaissanceapprofondie des différentes étapes du mécanisme de la réaction envisagée. Pour cela, la chimie théorique est essentielle à la rationalisation dela réactivité chimique mais elle souffre e

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Inoue, Takahiro. "Genetic engineering studies of Ni-carbon monoxide dehydrogenase from a thermophilic carboxydotrophic bacterium." Kyoto University, 2014. http://hdl.handle.net/2433/188777.

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Abstract:

Kyoto University (京都大学)<br>0048<br>新制・課程博士<br>博士(農学)<br>甲第18339号<br>農博第2064号<br>新制||農||1023(附属図書館)<br>学位論文||H26||N4846(農学部図書室)<br>31197<br>京都大学大学院農学研究科応用生物科学専攻<br>(主査)教授左子芳彦, 教授澤山茂樹, 教授菅原達也<br>学位規則第4条第1項該当

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Gu, Jiesi. "New applications of immobilised metal ion affinity chromatography for pharmaceutics processing and drug discovery." Thesis, The University of Sydney, 2016. http://hdl.handle.net/2123/16722.

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Abstract:

The development of more efficient extraction methods is the key to improving access to natural products with therapeutic uses. Immobilised metal affinity chromatography (IMAC) has conventionally been used to purify proteins from biological mixtures. This thesis aimed to expand the applications of IMAC beyond protein purification by developing two new innovations of IMAC. First, multi-dimensional IMAC (MD-IMAC) was developed for the simultaneous purification of multiple non-protein-based bacterial secondary metabolites from a single culture. The MD-IMAC system, comprised of two in-series IMAC r

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Pabon, Sanclemente Miguel Alejandro. "A Comparative Study of the Structural Features and Kinetic Properties of the MoFe and VFe Proteins from Azotobacter Vinelandii." DigitalCommons@USU, 2009. https://digitalcommons.usu.edu/etd/233.

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Abstract:

Biological nitrogen fixation is accomplished in the bacterium Azotobacter vinelandii by means of three metalloenzymes: The molybdenum, vanadium, and iron-only nitrogenase. The knowledge regarding biological nitrogen fixation has come from studies on the Mo-dependent reaction. However, the V- and Fe-only-dependent reduction of nitrogen remains largely unknown. By using homology modeling techniques, the protein folds that contain the metal cluster active sites for the V- and Fe-only nitrogenases were constructed. The models uncovered similarities and differences existing among the nitrogenases r

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Blanchard, Vincent. "Synthèse de composés phosphorés chélatants à visée phytosanitaire." Thesis, Montpellier, Ecole nationale supérieure de chimie, 2015. http://www.theses.fr/2015ENCM0020/document.

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Abstract:

La voie de synthèse des acides aminés ramifiés est présente chez les plantes, les bactéries et les champignons mais est absente chez les mammifères. C’est pourquoi il est intéressant de cibler cette voie métabolique par des inhibiteurs spécifiques des enzymes qui la compose afin de développer des herbicides non sélectifs. Une famille d’herbicide déjà commercialisée agit sur la première enzyme de cette chaine enzymatique. Néanmoins des cas de mauvaises herbes résistantes à ces composés sont apparus et leur incidence continue d’augmenter. Il apparait donc important de cibler une autre enzyme de

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McMillen, Lyle, and l. mcmillen@sct gu edu au. "Isolation and Characterisation of the 5'-Nucleotidase from Escherichia coli." Griffith University. School of Biomolecular and Biomedical Science, 2001. http://www4.gu.edu.au:8080/adt-root/public/adt-QGU20030226.153545.

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Abstract:

Escherichia coli 5'-nucleotidase is a periplasmically localised enzyme capable of hydrolysing a broad range of substrates, including all 5'-ribo- and 5'-deoxyribonucleotides, uridine diphosphate sugars, and a number of synthetic substrates such as bis (r-nitrophenyl) phosphate. The enzyme has been shown to contain at least one zinc ion following purification, and to have two metal binding sites in the catalytic cleft. 5'-Nucleotidase activity is significantly stimulated by the addition of particular divalent metal ions, most notably cobalt which results in a 30-50 fold increase in activity.

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Pauff, James Michael. "Structure-Function Studies of Xanthine Oxidoreductase." The Ohio State University, 2008. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=osu1227480976.

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Manesis, Anastasia C. "Bioorganometallic Chemistry within Nickel-Substituted Azurin: From Protein Design to Reactivity." The Ohio State University, 2018. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=osu1542735809462775.

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McMillen, Lyle. "Isolation and Characterisation of the 5'-Nucleotidase from Escherichia coli." Thesis, Griffith University, 2001. http://hdl.handle.net/10072/366487.

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Abstract:

Escherichia coli 5'-nucleotidase is a periplasmically localised enzyme capable of hydrolysing a broad range of substrates, including all 5'-ribo- and 5'-deoxyribonucleotides, uridine diphosphate sugars, and a number of synthetic substrates such as bis (r-nitrophenyl) phosphate. The enzyme has been shown to contain at least one zinc ion following purification, and to have two metal binding sites in the catalytic cleft. 5'-Nucleotidase activity is significantly stimulated by the addition of particular divalent metal ions, most notably cobalt which results in a 30-50 fold increase in activity.

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Commeinhes, Frédéric. "Structure tridimentionnelle de la carboxypeptidase A par diffraction des rayons X." Paris 5, 1994. http://www.theses.fr/1994PA05P019.

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Rondot, Laurianne. "Design de nouvelles métalloenzymes artificielles." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2016. http://www.theses.fr/2016GREAV056/document.

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Abstract:

Dans l’industrie chimique, de nombreux composés organiques sont issus d’étapes d’oxydation, pouvant être énantiosélectives et mettant en jeux des conditions dangereuses et polluantes, comme par exemple l’emploi du tétraoxide d’osmium comme oxydant. Dans un souci de respect de l’environnement, il est alors nécessaire de repenser les procédés de synthèse vers un développement de la chimie verte et durable.Dans cet objectif, mes travaux de thèse consistent à développer des nouveaux catalyseurs d’oxydation de molécules organiques en rassemblant les mondes de la catalyse inorganique et de la biocat

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Lator, Alexis. "Métalloenzymes artificielles et nouvelles réactivitées des complexes de fer." Thesis, Normandie, 2018. http://www.theses.fr/2018NORMC256.

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Abstract:

Les nouveaux aspects économiques et écologiques de la chimie moderne (à savoir la gestion des déchets, l’économie d’atome) font de la réduction de liaisons polarisées C=X (X = O, N) catalysée par des complexes organométalliques, une réaction importante en chimie organique. De plus, ces complexes permettent le contrôle de la stéréo-, régio- et chimiosélectivité de ces réactions. Les complexes de fer tricarbonyle à ligand cyclopentadiènone ont montré ces dernières années une excellente réactivité pour les hydrogénations de liaisons C=O et C=N. Grâce à de précédents travaux réalisés au laboratoir

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Myers, Andrew Ross. "Cloning, Expression, and Sequence Analysis of Camelysin, a Zinc Metalloprotease from Bacillus anthracis and B. cereus." [Tampa, Fla.] : University of South Florida, 2005. http://purl.fcla.edu/fcla/etd/SFE0001218.

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Mei, Xiaonan. "HOW A SILENT MUTATION SUPPRESSES THE ACTIVITY AND IRON INCORPORATION IN SUPEROXIDE DISMUTASE." UKnowledge, 2012. http://uknowledge.uky.edu/chemistry_etds/9.

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Abstract:

A mutation (CTG to TTG) of FeSOD gene was found in Escherichia coli. Since they both encode leucine, it is a silent mutation. Site-‐directed mutagenesis was applied to correct the mutation, and the mutant FeSOD (before gene correction) and wild type FeSOD (after gene correction) were purified. The FeSODs from the two genes were Characterized using different assays and spectroscopic methods including EPR and CD. The requirement for the rare codon TTG may result in slowed translation and heavy demand on a scarce tRNA. Cultures expressing wild type FeSOD are better able to grow for long times af

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Nedonchelle, Elsa. "Les anticorps catalytiques : des outils pour la production et l'étude des anticorps catalytiques semi-synthétiques et auto-immuns." Compiègne, 2000. http://www.theses.fr/2000COMP1320.

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Abstract:

Les anticorps catalytiques associent les propriétés de reconnaissance des anticorps aux propriétés de catalyse des enzymes. Différentes approches ont été envisagées pour leur faire mimer les enzymes : analogues d'états de transition, copie du site actif par le réseau idiotypique, ingénierie des protéines. De nombreuses enzymes s'associent avec des métaux pour assurer leurs fonctions. Le zinc est un élément intéressant dans ce cas car retrouvé dans plus de 300 enzymes. Ces sites de fixation étant bien caractérisés, ils ont pu semir de modèle en biotechnologie dans l'ingénierie des protéines. L'

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TIBERTI, MATTEO. "Computational investigation of structure-function relationship in metalloenzymes." Doctoral thesis, Università degli Studi di Milano-Bicocca, 2014. http://hdl.handle.net/10281/53873.

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Abstract:

Important processes such as carbon dioxide capture, hydrogen evolution and oxidation as well as bioremediation are of paramount importance for the development of an environmental-friendly economy. In nature, the reactions underlying these processes are naturally performed by metalloenzymes. The understanding of how they work will ease the development of important technological and biotechnological applications, such as bioinspired inorganic catalysts or more effective enzymes. In the present work, we have used computational methods to study structure-function relationships in metalloenzymes w

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Jobelius, Hannah. "Etude de la métalloenzyme IspH, une cible pour le développement de nouveaux agents antibactériens." Electronic Thesis or Diss., Strasbourg, 2024. http://www.theses.fr/2024STRAF004.

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Abstract:

IspH est la dernière enzyme de la voie du méthylérythritol phosphate qui produit les deux précurseurs nécessaires à la biosynthèse de tous les isoprénoïdes. Cette métalloenzyme est essentielle à la survie de nombreux microorganismes dont des bactéries pathogènes et le parasite responsable du paludisme. Etant absente chez l’humain, IspH est une cible de choix pour le développement de nouveaux agents antimicrobiens. En utilisant une approche pluridisciplinaire combinant biologie moléculaire, enzymologie, spectroscopies Raman, Mössbauer et cristallographie, l’objectif de cette thèse était d’étudi

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Mulako, Inonge. "Characterization of the Xerophyta humilis desiccation induced-1 (Xhdsi-1voc) gene : a member of the Vicinal Oxygen Chelate (VOC) metalloenzyme superfamily upregulated in X. humilis (BAK) DUR and SCHINZ during desiccation." Doctoral thesis, University of Cape Town, 2008. http://hdl.handle.net/11427/4303.

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Abstract:

Includes abstract.<br>Includes bibliographical references (leaves 172-191).<br>Has accompanying material on CD.<br>The resurrection plant, Xerophyta humilis is used as a model system to identify and characterise genes which play an important role in conferring desiccation tolerance in plants. In this study, the expression of a novel gene named desiccation induced-1 (dsi-1VOC) during desiccation in X. humilis and desiccationsensitive plants is characterised.

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Arndt, Joseph W. "Characterization and structural determination of metalloenzymes DNA polymerase beta, carboxypeptidase, and acetyl coenzyme-A decarbonylase/synthase /." Columbus, OH : Ohio State University, 2003. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc%5Fnum=osu1061312369.

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Abstract:

Thesis (Ph. D.)--Ohio State University, 2003.<br>Title from first page of PDF file. Document formatted into pages; contains xxii, 172 p. : ill., some col. Includes abstract and vita. Advisor: Michael K. Chan, Dept. of Chemistry. Includes bibliographical references (p. 165-172).

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Chan, Alice. "Structure et Mécanisme de la Quinolinate Synthase : enzyme à centre [4Fe-4S]2+ et cible d'agents antibactériens." Thesis, Grenoble, 2014. http://www.theses.fr/2014GRENV036.

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Abstract:

Le Nicotinamide Adénine Dinucléotide (NAD) est un cofacteur clé du métabolisme cellulaire. Synthétisé à partir d'acide quinolinique (QA) chez tous les organismes vivants, la biosynthèse du QA diffère entre les eucaryotes et les procaryotes. Chez les eucaryotes, il est produit à partir de L-tryptophane alors que chez les procaryotes et les plantes, il est synthétisé par l'action concertée de deux enzymes: la L-aspartate oxydase (NadB) qui permet la formation d'iminoaspartate (IA) à partir de L-aspartate et la quinolinate synthase (NadA) qui permet la condensation de deux molécules, la dihydroxy

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Carfi, Andrea. "Étude structurale des métallo-(beta)-lactamases de Bacillus cereus et Bacteroides fragilis : proposition d'un mécanisme enzymatique." Grenoble 1, 1997. http://www.theses.fr/1997GRE10080.

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Abstract:

Le probleme de la resistance des bacteries aux antibiotiques resulte directement de leur faculte d'adaptation. Des le debut du developpement de la penicilline, dans les annees 1940, on a vu l'apparition de bacteries resistantes a cette famille d'antibiotiques. Le mecanisme de resistance le plus courant, resulte de la production par la bacterie des b-lactamases. Ces enzymes hydrolysent le noyau b-lactame de l'antibiotique, ce qui a pour effet de l'inactiver et de rendre la souche resistante. Actuellement, quatre classe de b-lactamases (de a jusqu'a d) ont ete identifiee biochimiquement. Les cla

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Dutoit, Raphaël. "The Paradigm of Self-compartmentalized M42 Aminopeptidases: Insight into Their Oligomerization, Substrate Specificities, and Physiological Function." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2020. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/314337.

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Abstract:

M42 aminopeptidases are dinuclear enzymes widely found in prokaryotes but completely absent from eukaryotes. They have been proposed to hydrolyze peptides downstream the proteasome or other related proteolytic complexes. Their description relies mainly on the pioneering work on four M42 aminopeptidases from Pyrococcus horikoshii. Their quaternary structure consists of twelve subunits adopting a tetrahedral-shaped structure. Such a spatial organization allows the compartmentalization of the active sites which are only accessible to unfolded peptides. The dodecamer assembly results from the self

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Mendonça, Jordana Dutra de. "O estudo da enzima deidroquinato sintase de Mycobacterium tuberculosis H37Rv como alvo para o desenvolvimento de fármacos antituberculose." reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS, 2010. http://hdl.handle.net/10183/25547.

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Abstract:

Apesar da incidência per capita da tuberculose (TB) ter se mantido estável em 2005, o número de novos casos que surgem a cada ano continua a aumentar no mundo todo. De acordo com a Organização Mundial de Saúde, foram estimados 9,4 milhões de novos casos de TB em 2008, dos quais 1,4 milhões eram HIV - positivos, e com 1,8 milhões de mortes - o equivalente a 4.500 mortes por dia. Fatores como migração, privação sócio-econômica, co-infecção TB-HIV e o aparecimento de cepas resistentes contribuíram para o aumento do número de casos de TB no mundo, principalmente nos países onde a TB já foi conside

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Pocquet, Lucrèce. "Ancrage supramoléculaire de complexes organométalliques dans la béta-lactoglobuline pour la catalyse asymétrique dans l'eau. Effet des ligands prochiraux hémilabiles." Thesis, Paris 6, 2017. http://www.theses.fr/2017PA066322/document.

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Abstract:

Ce travail de thèse est consacré à la conception de métalloenzymes artificielles. Un tel concept permet de combiner les avantages des catalyseurs enzymatiques et organométalliques, tels que la sélectivité catalytique élevée et l'efficacité des systèmes enzymatiques et la large portée de substrats des catalyseurs des métaux de transition. Notre approche repose sur l’utilisation de complexes de métaux de transition avec un ligand prochiral hémilabile, qui une fois insérés dans la protéine hôte sera forcé d’adopter une configuration spécifique. La chiralité sera ainsi amenée au plus près du centr

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Esmieu, Charlène. "Etude de la relation structure-activité de complexes bio-inspirés de la réductase de l'oxyde nitreux." Thesis, Grenoble, 2014. http://www.theses.fr/2014GRENV044/document.

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Etude de la relation structure-activité de complexes bio-inspirés de la réductase de l'oxyde nitreux N2O est un puissant gaz à effet de serre et est impliqué dans la destruction de la couche d'ozone, ce qui rend sa dégradation très intéressante. Il s'agit d'un intermédiaire du cycle catalytique de la nitrification bactérienne. En effet, en biologie une métalloenzyme est capable de réduire N2O à deux électrons en N2 et H2O. Le site actif de la réductase de l'oxyde nitreux, le centre CuZ, renferme l'unique association de quatre ions cuivre pontés par un ion sulfure. Afin d'obtenir des complexes

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Alonso, Cotchico Lur. "Computational design of artificial metalloenzymes." Doctoral thesis, Universitat Autònoma de Barcelona, 2018. http://hdl.handle.net/10803/664006.

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Abstract:

El diseño enzimático es el área basada en el descubrimiento y/o optimización de biomoléculas para el desarrollo de reacciones químicas no naturales. Es un área que se encuentra en su mayor crecimiento y constituye uno de los puntos clave en la transición de la química hacia alternativas más ecológicas. Una manera elegante de sintetizar nuevos biocatalizadores es mediante la inclusión de cofactores organometálicos en estructuras biológicas, dando lugar a lo que se conoce como Metaloenzimas Artificiales (ArMs). Estos híbridos combinan la versatilidad catalítica de los compuestos organometálicos

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Montel, Sonia. "La 1-Deoxy-D-Xylulose-5-Phosphate Reductoisomerase, une métalloenzyme cible pour l'élaboration d'inhibiteurs chélatants." Thesis, Montpellier, Ecole nationale supérieure de chimie, 2012. http://www.theses.fr/2012ENCM0013.

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La voie non-mévalonate est fortement présente chez les plantes et les bactéries mais est absente chez les mammifères. C'est pourquoi inhiber la synthèse des isoprénoïdes et identifier un inhibiteur de cette voie enzymatique contribuera grandement à la recherche de nouveaux antibiotiques, antifongiques et herbicides. Les propriétés uniques de la 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomérase (DXR), l'enzyme centrale de cette voie enzymatique, en font une cible très intéressante pour la synthèse de nouveaux composés. La Fosmidomycine agit comme un inhibiteur de la DXR et reste aujourd'hui, avec

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Ceccaldi, Pierre. "Identification des déterminants moléculaires de la réactivité d'une molybdoenzyme modèle : La nitrate réductase A d' Escherichia coli." Thesis, Aix-Marseille, 2013. http://www.theses.fr/2013AIXM4016/document.

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Les molybdoenzymes (MoEs) à bisPGD sont des métalloprotéines dont le site actif est constitué d'un cofacteur à molybdène (Mo) mononucléaire. Elles sont impliquées dans les cycles biogéochimiques de l'azote, du carbone et du soufre et catalysent essentiellement des réactions d'oxydoréduction à 2 e-/2 H+ envers une grande variété de substrats. En dépit de la connaissance de la structure cristallographique de nombreuses MoEs, leur fonctionnement reste encore largement incompris. Ces enzymes présentent un intérêt biotechnologique car certains de leurs substrats sont des composés toxiques notoires,

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