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Dissertations / Theses on the topic 'Muscles – Évolution'

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Dayraud, Cyrielle. "Origine et évolution des muscles et du système neuro-musculaire : approches morpho-anatomique et moléculaire chez le cténaire Pleurobrachia pileus." Paris 6, 2011. http://www.theses.fr/2011PA066474.

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Abstract:
L’acquisition de la cellule musculaire et de la cellule nerveuse constitue deux évènements majeurs de l’évolution des animaux. Les cténaires, en raison de leur position phylogénétique et de leur morpho-anatomie originale et complexe, constituent un phylum crucial pour comprendre l’origine et l’évolution de ces structures fondamentales. Cette thèse s’inscrit dans une démarche d’anatomie comparée et se propose de décrire la musculature des cténaires à travers des approches multiples. Ce travail mené chez Pleurobrachia pileus, m’a conduit à proposer la racine tentaculaire comme un modèle dynamique de myogenèse. L’analyse comparée de l’expression de gènes de cnidaires, de Bilateria et de cténaires, permet d’aborder la question de l’homologie des muscles et son évolution à grande échelle évolutive. Une approche phylogénomique nous a conduit à proposer : d’une part, l’hypothèse d’une convergence du muscle strié des métazoaires et d’autre part, que l’acquisition de la boite à outils moléculaire caractéristique du muscle a été acquise bien avant l’origine de la cellule musculaire. Les relations entre les systèmes nerveux et musculaires sont également abordées dans une perspective évolutive
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Condamine, Thomas. "Étude comparative d'expression de gènes chez un scyphozoaire (Aurelia aurita) et un hydrozoaire (Clytia hemisphaerica) : nouvelles perspectives sur certaines innovations évolutives qui caractérisent leurs stades méduse." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2018. http://www.theses.fr/2018SORUS384.

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Abstract:
Trois des cinq classes de cnidaires présentent des méduses pélagiques, classiquement tenues pour homologues, issues de l'acquisition d'un stade planctonique chez l’ancêtre des médusozoaires. Des différences anatomiques fondamentales opposent pourtant les hydroméduses aux cubo- et scyphoméduses, concernant leurs systèmes nerveux locomoteurs, leurs organes sensoriels, leur ontogenèse. Y aurait-il eu plusieurs acquisitions convergentes d’un stade méduse ? Les présents travaux s’appuient sur l’étude comparative de caractères d’une hydroméduse (Clytia hemisphaerica) et d’une scyphoméduse (Aurelia aurita), via des phylogénies de gènes et le suivi de l’expression de gènes par RNA-seq, hybridation in situ, et qPCR. Ils ont visé (i) une meilleure caractérisation du système tentaculaire de Clytia ; et la comparaison entre ces deux méduses (ii) du déploiement d’acteurs clés du développement et de la morphogenèse chez les animaux, et (iii) de protéines associées aux muscles striés (absents chez les polypes et convergents avec ceux des bilatériens). La comparaison de l'expression des Wnt soutient une conservation chez les cnidaires des rôles de voies de signalisation en aval de ces ligands dans l’organisation de l'axe oral-aboral et d’éléments du système nerveux, et une possible absence d'homologie des tentacules et de la symétrie tétraradiaire entre hydro- et scyphoméduses. Les recrutements indépendants de formes de tropomyosine spécifiques des muscles striés plaident en faveur d’acquisitions convergentes du muscle strié, donc de la locomotion pélagique, entre hydro- et scyphoméduses. Ces données remettent en question le scénario d'acquisition unique de la méduse chez les cnidaires
Three of the five classes of cnidarians possess pelagic medusae. The latter are classically considered homologous, i.e. inherited from a planktonic stage acquired in the ancestor of all medusozoans. However, an impressive array of fundamental differences opposes hydromedusae to cubomedusae/scyphomedusae, e.g. concerning their locomotory nervous systems, sensory organs, and ontogeny. Could there have been several convergent acquisitions of a medusa stage? The research presented here is based on comparative study of a hydromedusa (Clytia hemisphaerica) and a scyphomedusa (Aurelia aurita), involving gene phylogenies, and gene expression surveys using RNA-seq, in situ hybridisation, and qPCR. The main objectives were (i) an improved characterisation of the Clytia tentacle system; and comparisons between these two medusae, of (ii) the deployment of key actors in animal development and morphogenesis, and of (iii) some proteins associated with striated muscles which are absent in polyps and convergent with those of bilaterians. Comparison of Wnt expressions supports conservation among cnidarians of the roles held by several signalling pathways downstream of the Wnt ligands, in the organisation of the oral-aboral polarity and of some elements of the nervous system, and suggests that tentacles and tetraradial symmetry may not be homologous between hydro- and scyphomedusae. Independent recruitments of tropomyosin forms specific to the striated muscles strongly advocate convergent origins of striated muscles and thereby of pelagic locomotion between hydro- and scyphomedusae. These findings challenge the classical scenario of a single medusa acquisition during cnidarian evolution
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Ilharramounho, Patricia. "Les rhabdomyosarcomes de l'enfant : données cliniques, paracliniques, thérapeutiques et évolution : à propos de onze patients." Bordeaux 2, 1990. http://www.theses.fr/1990BOR25126.

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Desvigne, Nicolas. "Détermination de la concentration en Insulin-like Growth factor-I dans le secteur interstitiel musculaire chez l'homme : aspect méthodologique et évolution avec l'exercice musculaire." Saint-Etienne, 2004. http://www.theses.fr/2004STET005T.

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Abstract:
L’Insulin-like Growth Factor-I (IGF-I) est un peptide possédant un rôle facteur de croissance et un rôle mimétique de l’insuline. Sa concentration plasmatique provient essentiellement d’une synthèse hépatique. Il existe également une sécrétion autocrine – paracrine dans la plupart des tissus dont le muscle. Afin d’étudier son évolution au cours de l’exercice dans le liquide interstitiel musculaire (LECM), nous avons mis en œuvre une technique de microdialyse. Nous avons réalisé des sondes résistant aux contractions musculaires et permettant la dialyse de l’IGF-I. Nous avons mis au point et validé in vitro et in vivo la « méthode des pentes » pour calibrer les sondes. Cette méthode permet de déterminer la concentration précise de différentes molécules dont l’IGF-I à partir de dosages de lactate dans chaque dialysat recueilli à l’exercice. Au repos chez de jeunes adultes, la concentration en IGF-I libre du LECM ([IGF-I]LECM) est 20 fois supérieure à celle du plasma. Dans le LECM [IGF-I] diminue au début d’un exercice d’endurance, simultanément à une accumulation de glucose, puis retourne en 15 min à son niveau de repos, avant d’augmenter en récupération. Après un exercice en résistance, [IGF-I]LECM est augmentée seulement 3h30 après l’exercice puis revient à la valeur de base à 4h45. Il existe une relation entre l’évolution moyenne d’IGF-I plasmatique et interstitielle des sujets au cours des phases d’exercices, mais pas durant leur récupération immédiate. La mise en oeuvre de la microdialyse musculaire à l’exercice chez l’homme avec la méthode des pentes met en évidence une évolution d’[IGF-I]LECM différente de celle retrouvée dans le secteur plasmatique.
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Doutreloux, Jean-Paul. "Contribution à l'étude du muscle : évolution de l'architecture du muscle penne au cours du développement post-embryonnaire : exemple des muscles crural et droit antérieur du lapin (Oryctolagus cuniculus)." Bordeaux 2, 1992. http://www.theses.fr/1992BOR28192.

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Abstract:
Nous avons étudié l'évolution de l'architecture de deux muscles pennes de la cuisse de lapin durant la période de développement post-embryonnaire comprise entre la naissance et la maturité sexuelle a l'aide de quatre moyens d'investigations complémentaires : une analyse comportementale des animaux dans leur cadre de vie, la dissection de 96 membres inférieurs, la mesure des paramètres architecturaux et la réalisation de coupes histologiques. Les mesures biométriques sont toujours effectuées dans les mêmes conditions grâce a la mise au point d'une position musculaire de référence correspondant a la longueur minimale in situ du muscle au repos. Nous montrons que la morphologie des deux muscles étudiés ici ne subit pas de métamorphose, et que leur allongement qui se réalise à des vitesses différentes correspondant a des changements alimentaires et moteurs, est principalement le fait de l'hypertrophie des éléments tendineux qui semblent jouer un rôle complémentaire a celui de l'os, et terminer leur mission d'organisation et d'arrangement des fibres musculaires entre elles, débutée lors de la période embryonnaire. Nos résultats suggèrent également que le développement des différentes parties d'un même muscle se réalise à des vitesses différentes en raison de la variation régionale de l'angle de pennation des fibres musculaires
We have studied the architectural evolution of two rabbit pinnate muscles, between birth and sexual maturity, according to four different approches : the behavior of the animals in their life rearing context, the dissection of 96 hindlimbs, the measure of architectural parameters and the realisation of histological crosssections. The biometrics measures have benn always made in the same conditions thanks to the choice of a reference position corresponding to the minimal length of the resting muscle "in situ". The morphology of the two muscles doesn't undergo metamorphis ; their lengthening happens at different rates, corresponding to both alimentary and motricity changes. Lengthening is firstly the result of hypertrophy of tendinous sheets which seems to contribute to the bone action and to finish the muscle fibers organisation and arrangement iniciated during the embryonary period of development. We suggest that the different parts of a single muscle grow at different rates because of the regional variation of the angle of the muscular fibers
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Bruas-Reignier, Françoise. "Relations entre conditions de production, composition chimique et évolution post-mortem des viandes de jeunes bovins." Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 1996. http://www.theses.fr/1996INPL041N.

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Abstract:
Afin de mieux connaitre les effets de la maturation sur les viandes de jeunes bovins laitiers abattus dans un abattoir industriel, ont été étudiées l'évolution de la composition chimique et de la structure myofibrillaire de muscles soumis à une conservation sous vide à 4°C jusqu'à 14 jours post-mortem. La variabilité entre les muscles Longissimus dorsi (LD), Triceps brachii caput longum (TBCL) et Rectus femoris (RF), et la variabilité entre individus ont été étudiées. L’influence de facteurs zootechniques a été abordée. Dans un premier essai, 13 animaux ont été étudiés. Les teneurs en eau et en azote total n'évoluent pas au cours de la conservation. L’azote non protéique (ANP) augmente. La teneur en azote protéique soluble (APS) augmente entre 3 et 7 jours puis chute jusqu'à 14 jours. L’index de fragmentation myofibrillaire (IFM) augmente avec un pallier atteint vers 7 jours post-mortem. Les variations de l'ANP, l'IFM et l'APS ne sont pas corrélées. La composition chimique n'influe pas sur le développement de la maturation. La variation d'ANP est liée au poids de carcasse. Dans un deuxième essai, les relations entre composition chimique, structure, protéolyse et état de maturation ont été étudiées sur le muscle LD de 32 animaux issus de 5 élevages. La composition chimique, l'IFM, la longueur de sarcomères sont liés aux caractéristiques des animaux. Une discrimination des 5 élevages par la composition chimique du LD, les caractéristiques des carcasses et la différence entre les valeurs de force de compression à 20% à 10 et 3 jours est mise en évidence. L’état de maturation est très variable entre individus à 3 jours, mais semble atteindre une même valeur seuil à 10 jours. Les estimateurs de protéolyse, de fragmentation et de maturation ne sont pas liés et sont indépendants de la composition chimique. Dans un troisième essai, les relations entre cinétiques de chute de pH post-mortem ont été abordées sur 6 individus de l'essai 1 et 9 de l'essai 2. La vitesse et l'amplitude de chute du pH ne sont pas liées aux caractéristiques des carcasses. Les modèles de prévision établis montrent que la maturation est liée aux caractéristiques des animaux (poids et âge) et de façon moins nette aux conditions d'entrée en rigor.
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Hédoux, Patrick. "Détermination de paramètres biomécaniques personnalisés à partir d'imagerie médicale : application aux sujets hémiplégiques." Valenciennes, 2004. http://ged.univ-valenciennes.fr/nuxeo/site/esupversions/165e1b0d-7270-4dd2-9d42-f5d3c856ab44.

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Abstract:
L'étude du mouvement humain nécessite la connaissance de données anthropométriques. Certaines sont facilement mesurables tandis que les inerties sont évaluées classiquement à l'aide de tables ou de modèles basés sur des moyennes de population. Il s'avère donc nécessaire de concevoir une méthode d'analyse individualisée. Ce travail propose une méthode automatique de détermination personnalisée des paramètres géométriques et inertiels des segments corporels à partir d'imagerie médicale tridimensionnelle IRM. La reconnaissance des tissus est réalisée à l'aide de différentes techniques de segmentation, dont une est basée sur la logique floue, cette dernière donnant les meilleurs résultats en terme d'efficacité et de robustesse. A partir des images segmentées, les paramètres biomécaniques des segments sont calculés. La précision de la détermination a été évaluée à l'air de pièces numériques étalons et les résultats obtenus comparés aux méthodes classiquement utilisées
The study of kinematics and human kinetics requires knowledge of anthropomorphic data such as the dimensions and inertia moments of body segments. Dimensions are easily measured whereas inertia moments are classically evaluated from tables or from modelling methods based on population averages. So an individualized analysis method is necessary. This thesis work proposes an automatic method for the personalized determination of geometrical and inertial parameters of body segments from 3D medical images. MRI was selected for this research. Recognition of tissue types is performed with several image segmentation techniques. An original segmentation method using fuzzy logic was developed and yields better results in terms of efficacy and robustness. Geometric and inertial parameters were calculated for each body segment. The precision of the determination was studied on virtual images and standard anatomical pieces. The results were also compared to those of methods classically used
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Derothe, Jean-Marc. "Parasitisme et évolution hôte : approche expérimentale de la susceptibilité des hybrides entre les souris "Mus musculus musculus" et "Mus musculus domesticus"." Montpellier 2, 1999. http://www.theses.fr/1999MON20120.

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Abstract:
Les deux sous-especes de souris mus musculus musculus et mus musculus domesticus se rencontrent le long d'une zone d'hybridation qui s'etend du danemark a la bulgarie. L'introgression limitee entre les deux genomes a conduit a considerer cette zone comme une zone de tension, c'est a dire que les hybrides seraient contre selectionnes par rapport aux individus parentaux. Le seul indicateur d'une telle contre-selection est une charge parasitaire en helminthes intestinaux superieure chez les individus hybrides. L'hypothese proposee pour expliquer ce phenomene est compatible avec la theorie des zones de tension, c'est a dire que cette susceptibilite hybride serait le resultat d'une rupture de coadaptation genomique au niveau du systeme immunitaire. Dans ce travail, nous nous sommes donc attaches a caracteriser l'origine et l'etendue de la susceptibilite hybride. D'une part, nous avons infeste, de maniere controlee, des hybrides experimentaux avec l'oxyure aspiculuris tetraptera afin de determiner si la recombinaison etait a l'origine de la susceptibilite hybride. D'autre part, nous avons infeste des souris parentales et introgressees avec deux autres parasites : le trypanosome trypanosoma musculi et la coccidie sarcocystis muris. Il ressort de ce travail que la susceptibilite hybride, bien qu'elle ne puisse etre generalisee a tous les parasites, ne concerne pas uniquement les helminthes intestinaux. De plus, ce phenomene ne semble pas etre la consequence directe d'une rupture de coadaptation, mais semble du a un effet de pleiotropie antagoniste particulier a la zone hybride. Ces resultats affinent notre perception de la zone d'hybridation entre les deux sous-especes de souris et du role que jouent les parasites dans son evolution.
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Belkhir, Khalid. "Différenciation chromosomique et évolution chez "Mus musculus domesticus" : cas des souris robertsoniennes d'Alsace." Montpellier 2, 1991. http://www.theses.fr/1991MON20161.

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Abstract:
L'etude chromosomique de souris domestiques (mus musculus domesticus) de la region d'alsace a ete realisee, permettant de mettre en evidence l'existence d'une population robertsonienne a fort polymorphisme chromosomique. D'autre part, l'etude de la structure de ces populations a nombre de chromosomes reduit a ete abordee par l'analyse de variants geniques par electrophorese enzymatique. A partir de ces donnees nous avons essaye, de facon analytique et a l'aide de simulations sur ordinateur, de tester la validite certaines hypotheses pour expliquer la fixation de remaniements sous-dominants dans le cas des souris. Une importance particuliere a ete donnee au facteur temps de fixation necessaire au deroulement de ce processus. De facon experimentale, nous avons teste l'existence d'une distorsion meiotique en faveur des chromosomes metacentriques, en croisant des souris alsaciennes ayant fixe deux fusions et segregeant pour une troisieme: aucune transmission preferentielle du chromosome fusionne n'est venue confirmer l'hypothese d'une action importante de la distortion meiotique dans la fixation successive des fusions rb. A partir de ces resultats, nous discutons des modeles de speciation chromosomique, et notamment du modele stasipatrique de white
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Ivantcheva, Aglika. "Le rôle des mécanismes comportementaux dans l'isolement reproductif et la spéciation des souris sauvages "Mus musculus musculus", "Mus macedonicus" et "Mus spicilegus"." Montpellier 2, 1997. http://www.theses.fr/1997MON20026.

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Abstract:
Nous avons analyse les mecanismes comportementaux qui maintiennent la divergence entre trois especes de souris sauvages. Les relations socio-sexuelles qui sont a la base de leur isolement reproductif sont variables. Les individus modifient leurs comportements en fonction de l'espece du protagoniste. Les particularites ethologiques observees sont expliquees a la lumiere de l'histoire de l'espece et de leurs zones de contact. La discrimination comportementale est la base de l'isolement reproductif. Chez les especes apparues recemment (us spicilegus et us ace onicus) la discrimination s'effectue sur un ensemble de traits presents chez les protagonistes, et pas seulement sur des stimulis heritables (odeurs). L'effet de l'impregnation joue un role principal sur la discrimination comportementale. Par ailleurs, nous avons analyse les interactions entre les mecanismes selectifs et les traits soumis a la selection qui auraient pu intervenir dans la speciation des especes. Nous constatons que les odeurs, considerees comme des traits apparents chez la souris, ne sont pas toujours la base des interactions sociales. D'autres stimulis, notamment moteurs (comportementaux) peuvent etre primordiaux pour l'etablissement des mecanismes comportementaux (preferences associatives). Nous proposons un scenario evolutif concernant la speciation des trois especes dans lequel les interactions entre les facteurs correles (mecanisme/trait de selection) constituent la base des evenements evolutifs
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Boyas, Sébastien. "Analyse des évolutions du signal électromyographique en vue de la prédiction de l'endurance limite lors de taches mono- et multi-segmentaires." Nantes, 2007. http://www.theses.fr/2007NANT2116.

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Abstract:
Ces travaux visent à analyser les évolutions du signal électromyographique (EMGs) afin de prédire l’endurance limite (tlim) de tâches sous-maximales menées jusqu’à épuisement. Nos études sur la tâche multi-segmentaire rapportent que la prédiction du tlim dans ces conditions est limitée car probablement influencée par la mise en place de coordinations musculaires entre les synergistes, et ce plus particulièrement pour des sujets entraînés. En condition mono-segmentaire, une intensité d’exercice plus élevée semble favoriser la prédiction du tlim. L’augmentation de l’intensité réduirait l’influence des facteurs centraux et psychologiques dans la performance et limiterait les stratégies de coordination musculaire qui peuvent perturber la prédiction du tlim. La variation de l’angle articulaire a peu d’effet sur la prédiction du tlim. Les évolutions de l’énergie contenue dans la bande de fréquences basses (6-30 Hz), caractérisées par l’area ratio, seraient à privilégier en vue de la prédiction de l’endurance limite. La prédiction du tlim pourrait être utile lors de l’évaluation des capacités musculaires de sportifs, ou de sujets pathologiques, en réduisant la durée d’effort et les risques délétères inhérents aux exercices menés jusqu’à épuisement
This work aims to analyse the changes in the electromyographic signal (sEMG) in order to predict the endurance time (tlim) of submaximal tasks sustained to exhaustion. Our studies focused on multi-segmental task indicate that the prediction of the tlim in these conditions is limited, and probably influenced by the development of muscular coordination between synergists, particularly for trained subjects. In the mono-segmental condition, higher exercise intensity seems to improve tlim prediction. Increasing exercise intensity may reduce the influence of central and psychological factors in performance and may limit muscular coordination strategies which alter tlim prediction. Changes in articular angle seem to not influence the prediction ability. Prediction would be useful during the testing of muscular capacities of sportsmen, or pathologic, subjects in limiting exercise time and therefore the deleterious risks associated to exercises lead to exhaustion
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Izem, Lahoucine. "Étude enzymologique et histologique de l'AMP désaminase de muscle de deux espèces de sélaciens (Scyliorhinus canicula et Raja clavata) : une approche des mécanismes de son évolution." Brest, 1993. http://www.theses.fr/1993BRES2020.

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Abstract:
L’AMP désaminase a été purifiée a partir du muscle squelettique deux poissons sélaciens présentant des activités enzymatiques différentes: la roussette (Scyliorhinus canicula) et la raie bouclée (Raja clavata). Les effets du pH, des cations monovalents, du phosphate inorganique, des nucléotides (atp, adp et gtp), de la température, de l'edta ainsi que la spécificité vis-à-vis du substrat ont été étudiés sur les deux préparations enzymatiques. La masse moléculaire a été estimée par deux méthodes: une filtration sur gel de sépharose (CL6B) et par une électrophorèse en milieu dénaturant sur gel de polyacrylamide-sds. Au moment ou les propriétés physico-chimiques et régulatrices de l'AMP désaminase de raie sont très similaires a celles de la forme musculaire des vertèbres supérieurs, l'enzyme de roussette montre des propriétés de la forme non musculaire des vertèbres supérieurs. Ces résultats ont été discutes a la lumière des événements génétiques qui ont conduit a l'apparition des différentes formes d'AMP désaminase a partir d'un gène ancestral commun. De plus, l'étude histologique du muscle squelettique chez la roussette et la raie a montre l'existence d'un changement dans l'organisation des différents types de fibres musculaires, changement qui aurait sans doute accompagne les variations enzymatiques de l'AMP désaminase.
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Vanlerberghe, Flavie. "Histoire évolutive de la zone d'hybridation naturelle entre les deux sous-espèces de souris européennes Mus musculus domesticus et Mus musculus musculus : dynamique de l'introgression de gènes autosomaux, de l'ADN mitochondrial et du chromosome Y." Montpellier 2, 1988. http://www.theses.fr/1988MON20001.

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Abstract:
Discrimination des genomes des sous especes m. M. Domesticus et m. M. Musculus etudie a l'aide de differents marqueurs genetiques, locus autosomaux, chromosome y et adn mitochondiral; mise en evidence d'une zone d'hybridations entre ces especes
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Cantereau, Anne. "Étude, par imagerie confocale de fluorescence, de la dynamique spatio-temporelle du Ca2+ libre intracellulaire et de son évolution au cours de la différenciation des cellules musculaires squelettiques de rat in vitro." Bordeaux 2, 1997. http://www.theses.fr/1997BOR28493.

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Fontugne, Jacqueline. "Basal/Squamous Subtype of Bladder Cancer : Mechanisms of Progression, Transcriptional Regulators and New Therapeutic Strategies A Consensus Molecular Classification of Muscle-invasive Bladder Cancer Gene Expression Dynamics During Progression to Basal/Squamous Bladder Cancer in the BBN Mouse Model Reveals a Switch From EGFR to FGFR1 Dependency in Sarcomatoid Tumors Enhancer Profiling of Bladder Cancer Reveals a Candidate Basal/Squamous-Specific Core Regulatory Circuitry Tertiary Lymphoid Structures Marker CXCL13 Is Associated With 1 Better Survival for 2 Patients With Advanced-Stage Bladder Cancer Treated With Immunotherapy." Thesis, université Paris-Saclay, 2020. http://www.theses.fr/2020UPASL030.

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Abstract:
Le cancer de la vessie est de mauvais pronostic au stade infiltrant le muscle (TVIM). Les TVIM de sous-type basal/squameux (Ba/Sq) peuvent évoluer vers le variant sarcomatoïde et sont de très mauvais pronostic.Les mécanismes de progression des tumeurs non invasives vers une TVIM basale sont difficiles à étudier chez l’homme du fait de son caractère agressif. Dans une première partie, nous avons donc utilisé un modèle murin carcinogène-induit de TVIM Ba/Sq pour étudier l’évolution de l’expression génique depuis les stades pré-invasifs menant au TVIM Ba/Sq et au variant sarcomatoïde. Nous avons déterminé que les tumeurs précoces présentent d’emblée des caractères du phénotype Ba/Sq et qu’il existe des groupes de gènes d’évolution coordonnée au cours de la progression, avec une pertinence en pathologie humaine. L’étude des cas sarcomatoïdes a révélé une ressemblance au variant sarcomatoïde humain et l’existence d’une bascule de signalisation de l’EGFR vers une activation de la voie de FGFR1 lors de la dé-différenciation sarcomatoïde, corrélée à la transition épithélio-mésenchymateuse (TEM). Ce résultat indique un potentiel bénéfice des inhibiteurs des FGFRs pour les tumeurs sarcomatoïdes, avec TEM et/ou exprimant fortement FGFR1.De plus, les régulateurs transcriptionnels clés du phénotype Ba/Sq sont méconnus. Une méthode pour identifier de tels régulateurs consiste en l’identification d’un circuit de facteurs de transcriptions (FT) auto-régulés et contrôlés par des super-enhancers (SE), larges régions génomiques régulatrices jouant un rôle dans l‘identité cellulaire. Dans une deuxième partie, nous avons identifié les régions SE dans des tumeurs primaires et des lignées de cancer de vessie, y compris du sous-type Ba/Sq, par la réalisation d’une ChIP-seq H3K27ac, modification d’histone caractéristique des régions SE. Nous avons démontré que le profil chromatinien H3K27ac est associé aux sous-types moléculaires et avons identifié les SE spécifiques du sous-type Ba/Sq. En utilisant l’algorithme CRCmapper, nous avons identifié des FT candidats pouvant réguler le phénotype basal, tels que RUNX2 ou KLF7. Une validation de ces candidats dans des lignées cellulaires de cancer de vessie sera nécessaire.Ce travail permet de mieux caractériser le sous-type Ba/Sq des cancers de vessie et ouvre la voie à de nouvelles stratégies thérapeutiques
Bladder cancer is frequent, with poor prognosis at the muscle-invasive stage (MIBC). The basal/squamous (Ba/Sq) subtype of MIBC can progress to the sarcomatoid variant and has very poor outcome.Owing to their aggressive phenotype, Ba/Sq tumors are often diagnosed at advanced stages, hampering the study of disease progression in humans. In a first part, we thus utilized a carcinogen-induced mouse model of Ba/Sq MIBC to explore the molecular changes occurring from pre-invasive stages, to Ba/Sq MIBC, to the sarcomatoid variant. We determined that pre-invasive stages already harbor Ba/Sq features and identified clusters of genes with co-expression changes during progression, with relevance to human disease. A focus on sarcomatoid cases revealed their close resemblance to the human sarcomatoid counterpart. We identified an EGFR/FGFR1 switch during sarcomatoid dedifferentiation, correlated with epithelial-mesenchymal transition (EMT). This finding indicates that patients with sarcomatoid, EMT- or FGFR1-high tumors may benefit from FGFR inhibitors.Additionally, the master transcription factors (TFs) controlling the Ba/Sq phenotype are poorly understood. One approach to identify such TFs is to pinpoint to those forming a core regulatory circuitry (CRC) driven by super-enhancers (SE), i.e., large genomic regulatory domains with a major role in cell identity. In a second part, we identified such SEs by performing ChIP-seq for H3K27ac, a typical histone modification found in SE regions, in bladder cancer primary tumors and cells lines, including of Ba/Sq subtype. We determined that distinct H3K27ac profiles are associated with molecular subtypes and identified subtype-specific SEs. CRC analysis using the CRCmapper algorithm nominated potential master TFs driving the Ba/Sq phenotype, including RUNX2 and KLF7. Further functional validation of these candidates in bladder cancer cell lines is necessary.Overall, this work furthers our understanding of Ba/Sq MIBC and provides potential new therapeutic strategies
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Krummen, Stéphane. "Évolution de la nature et de l'efficacité du facteur hyperpolarisant dérivé de l'endothélium (EDHF) au cours du vieillissement associé ou non à l'hypercholestérolémie dans les artères de résistance du muscle squelettique de la souris." Thèse, 2004. http://hdl.handle.net/1866/15767.

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