Academic literature on the topic 'Nématodes – Analyse'

Abstract Expressed sequence tag (EST) projects offer a rapid route to the discovery of novel genes. Genes expressed in a wide range of parasitic nematodes of medical or veterinary importance have been investigated using EST analysis but these techniques have not yet been applied to plant parasitic nematodes. We describe a small scale EST project using cDNA libraries made from the two species of potato cyst nematode, Globodera rostochiensis and G. pallida, and assess the utility of this approach to identify mRNAs encoding abundantly expressed secreted proteins and other proteins present in the nematode at the onset of parasitism. Approximately 1000 sequences were obtained from G. rostochiensis and 100 from G. pallida. A variety of genes was characterised and approximately 11% of the cDNAs sequenced were apparently PCN specific. Secreted proteins identified included a novel PCN homologue of chorismate mutase, a cDNA recently cloned from the gland cells of Meloidogyne javanica. The results obtained justify a much larger scale application of this technology to these parasites. Utilisation de L'Expressed Sequence Tag pour l'analyse de gènes s'exprimant chez les juvéniles de deuxième stade des nématodes à kyste de la pomme de terre Globodera rostochiensis et G. pallida - l'Expressed Sequence Tag (EST) ouvre une voie rapide vers la découverte de nouveaux gènes. Des gènes s'exprimant chez un large éventail de nématodes parasites d'importance médicale ou vétérinaire ont été étudiés par analyse EST alors que cette technique n'a pas encore été appliquée aux nématodes phytoparasites. Nous décrivons ici un projet EST à petite échelle utilisant les banques d'ADNc constituées à partir de deux espèces de nématodes à kyste de la pomme de terre (PCN), Globodera rostochiensis et G. pallida et nous évaluons l'utilité de cette approche pour identifier les ARNs codant les protéines abondamment sécrétées - et les autres protéines - présentes chez les nématodes lors de l'attaque parasitaire. Mille séquences environ ont été obtenues chez G. rostochiensis et 100 chez G. pallida. Des gènes variés ont été caractérisés et environ 11% des ADNc séquencés sont apparemment spécifiques des PCN. Parmi les protéines sécrétées identifiées figurent un nouvel homologue PCN de la chorismate mutase ainsi qu'un ADNc récemment cloné à partir de cellules glandulaires de Meloidogyne javanica. Les résultats ainsi obtenus justifient une utilisation à plus grande échelle de l'EST pour l'étude de ces parasites.

AbstractTo determine whether embryogenesis of Caenorhabditis elegans is typical for nematodes in general, we started to analyse in comparison several aspects of development in various nematode species. The differences we observed can be subdivided into two classes, those visible in the intact embryo and those requiring experimental interference. Particularly obvious differences of both types were revealed between C. elegans (Rhabditidae) and Acrobeloides nanus (Cephalobidae). Not only does the spatial and temporal pattern of early events differ but also that of intercellular communication and cell specification. Our data suggest that some developmental variations are characteristic for certain nematode groups and therefore may be useful as phylogenetic markers. In contrast, we detected little evidence so far for environmental influence on early developmental processes. Pour déterminer dans quelle mesure l’embryogenèse de Caenorhabditis elegans est une caractéristique générale des nématodes, nous avons commencé l’analyse de plusieurs aspects du développement chez différentes espèces de nématodes. Les différences observées peuvent être divisées en deux catégories: celles observables chez l’embryon intact et celles nécessitant une intervention expérimentale. En particulier, des différences nettes entre les deux catégories ont été mises en évidence chez C. elegans (Rhabditidae) et Acrobeloides nanus (Cephalobidae). Diffèrent non seulement le schéma spatio-temporel des évènements précoces, mais également la communication intercellulaire et la différenciation cellulaire. Nos données suggèrent que certaines variations du développement sont caractéristiques de certains groupes de nématodes et pourraient donc être utiles comme marqueurs phylogénétiques. A contrario, une influence de l’environnement sur les processus précoces du développement n’a pas, jusqu’à présent, été détectée.

Abstract Entomopathogenic nematodes were incubated in a balanced salt solution based on soil water analysis, supplemented with different concentrations of sodium chloride. Two nematode isolates from Malaysia, Steinernema sp. SSL85 (isolate 25) and Heterorhabditis indicus (isolate 11), showed an initial loss of water during the first 6 h of incubation in hyper-osmotic media (200 and 1000 mOsmKg-1) followed by a complete recovery of their water content during the next 18-48 h. A third Malaysian isolate, Steinernema sp. (M1), showed a more limited ability to regulate its water content. Studies on a wild type H. megidis (UK 211) and one desiccation tolerant mutant indicate that the ability for hypo-osmotic regulation does not necessarily involve permeability differences in the cuticle. Régulation hypo-osmotique chez les nématodes entomopathogènes: Steinernema spp. et Heterorhabditis spp. - Des nématodes entomopathogènes ont été mis en incubation dans une solution saline, équilibrée en fonction d'une analyse de l'eau contenue dans le sol, et additionnée de chlorure de sodium en concentration variable. Deux isolats de nématodes provenant de Malaisie, Steinernema sp. SSL 85 (isolat 25) et Heterorhabditis indicus (isolat 11), ont montré une perte initiale d'eau au cours des 6 premières heures d'incubation dans un milieu hyperosmotique (200 et 1000 mOsmKg-1), perte suivie par un rétablissement complet du contenu hydrique au cours des 18 à 48 h suivantes. Un troisième isolat malaisien, Steinernema sp. (M1) a montré une capacité plus limitée à réguler son contenu hydrique. Des études ayant concerné un type sauvage d' H. megidis (UK 211) et un mutant tolérant vis-à-vis de la dessication ont montré que la capacité d'une régulation hypo-osmotique n'infère pas une différence dans la perméabilité de la cuticule.

Une étude parasitologique transversale menée sur 226 échantillons d’origine caprine de la zone périurbaine de Sokodé (région centrale du Togo) a permis le diagnostic de la coccidiose (prévalence de 31 p. 100) et des nématodes gastro-intestinaux (85 p. 100) représentés par Trichostrongylus sp. (29 p. 100), Cooperia sp. (2 p. 100) et Haemonchus sp. (69 p. 100). En outre, des nématodes pulmonaires (Protostrongylus rufescens) ont été rencontrés (36 p. 100), ainsi que le cestode Monieza sp. (3 p. 100). Les trématodes ont été représentés par Paramphistomum sp. (10 p. 100) et Dicrocoelium sp. (un seul échantillon positif). Des trois agents principaux de la gale, seule l’existence de Sarcoptes sp. a pu être confirmée. Les tiques ont été représentées en nombre égal par Amblyomma et Boophilus sp. Des analyses sérologiques ont révélé que 11 p. 100 des animaux étaient séropositifs pour Toxoplasma gondii. La trypanosomose (8 p. 100) demeure la parasitose ayant l’impact le plus important sur les paramètres de santé des caprins, en particulier l’hématocrite. D’autres résultats de cette étude ont été comparés avec ceux des ovins. L’espèce caprine est apparue, d’une manière générale, comme plus rustique et résistante aux pathologies parasitaires rencontrées, notamment la trypanosomose, la toxoplasmose et les nématodoses gastro-intestinales. Plusieurs analyses statistiques qui ont pris en compte des facteurs environnementaux, génétiques et de gestion ont permis d’avoir une meilleure compréhension des interactions hôte-environnement.

AbstractProtein variation and phenetic relationships in four tropical root-knot nematode species were studied by two-dimensional gel electrophoresis (2-DGE). Total soluble protein extracts from white females of Meloidogyne incognita, M. javanica, M. arenaria and M. mayaguensis were separated by electrophoresis, and the two-dimensional (2-D) profiles were compared with a computed analysis system. A four species global comparison allowed detection of 4 and 13 specific proteins for M. arenaria and M. mayaguensis, respectively, among the 498 proteinic spots detected on the synthetic image (or 'master'). Such proteins were not detected for M. incognita and M. javanica. Nevertheless, species discriminative proteins and shared proteins have been identified in all pairwise comparisons between species. In addition, the similarity index and the genetic distances between the different isolates studied were calculated on the basis of homologous polymorphic spots. A dendrogram was constructed according to the UPGMA method. Significance of the results from phenetic study was assessed by bootstrap analysis. M. incognita, M. javanica and M. arenaria showed high similarity. M. mayaguensis was more distant. These results are in agreement with RAPD and RFLP studies.La variabilité protéique et les relations phénétiques de quatre espèces tropicales de nématodes galligènes ont été étudiées par électrophorèse sur gel en deux dimensions (2-DGE). Les protéines solubles totales extraites de femelles blanches de Meloidogyne incognita, M. javanica, M. arenaria et M. mayaguensis ont été séparées par électrophorèse et les profils bidimensionels comparés à l'aide d'un système d'analyse informatisé. Une comparaison globale des quatre espèces a permis de détecter quatre protéines spécifiques pour M. arenaria et 13 pour M. mayaguensis parmi les 498 taches protéiques présentes sur l'image de référence (ou “master”). De telles protéines n'ont été détectées ni pour M. incognita ni pour M. javanica. Néanmoins, des protéines discriminantes et communes ont été identifiées lors de toutes les comparaisons d'espèces deux à deux. De plus, les indices de similarité et les distances génétiques entre les différents isolats étudiés ont été calculés à partir des taches polymorphes homologues. Les dendrogrammes ont été construits selon la méthode UPGMA. La signification des résultats phénétiques a été estimée par une analyse “bootstrap”. M. incognita, M. javanica et M. arenaria sont très proches. M. mayaguensis est plus distant. Ces résultats sont en accord avec ceux d'études en RAPD et RFLP.

Une étude parasitologique transversale menée sur 359 échantillons d’origine ovine de la zone périurbaine de Sokodé (région centrale du Togo) a permis le diagnostic de la coccidiose (prévalence de 33 p. 100) et des nématodes gastro-intestinaux (88 p. 100) représentés par Trichostrongylus sp., Cooperia sp., Oesophagostomum sp. et Haemonchus sp. En outre, des nématodes pulmonaires (Protostrongylus rufescens) ont été rencontrés (16 p. 100), ainsi que le cestode Monieza sp. (8 p. 100). Les trématodes ont été représentés par Paramphistomum sp. (15 p. 100), Fasciola sp. (1 p. 100) et Schistosoma sp. (un seul échantillon positif). Les trois agents principaux de la gale ont été présents (Sarcoptes sp., Psoroptes sp. et Chorioptes sp.). Les tiques ont été représentées par Amblyomma sp. et Boophilus sp. Des analyses sérologiques ont révélé que 22 p. 100 des animaux étaient positifs pour Toxoplasma gondii et que 79 p. 100 étaient positifs pour Oestrus ovis, malgré l’absence des larves (sondage de la cavité nasale). En combinant les effets sur l’hématocrite de différentes classes d’infections parasitaires de la trypanosomose, des nématodes gastro-intestinaux et de leurs infections mixtes, il a été constaté que la trypanosomose (13 p. 100) demeurait la parasitose ayant l’impact le plus important sur les paramètres de santé. Plusieurs analyses statistiques, qui ont pris en compte des facteurs environnementaux, génétiques et de gestion, ont permis d’avoir une meilleure compréhension des interactions hôte-environnement.

AbstractThe conclusions of a collaborative study of the occurrence and importance of root-knot nematodes (RKN, Meloidogyne spp.) and of their control agent, Pasteuria penetrans, in parts of Europe, Africa, South America and the Caribbean are presented. Rootknot nematodes were estimated to reduce the yields of a wide range of horticultural crops by > 25% in Ecuador, Malawi and Tanzania, and by ca 10% in Trinidad and Tobago. The greatest proportion of infected crops were observed in Ecuador (205 of 207) and the least in Trinidad and Tobago (70 of 174). The mean gall index was greatest in Ecuador (5.5). Levels of galling were least in Senegal (1.6), even though 89% of crops were infested and virulent M. mayaguensis was widespread. In all countries, M. incognita and M. javanica were the most abundant species, but M. hispanica occurred widely in Burkina Faso, even in newly cultivated areas in the Sahile. Several new esterase phenotypes were detected, especially in Ecuador and Malawi. Juveniles (J2) collected from the soil during the surveys were examined for attached spores of P.penetrans. It was widespread (20 to 60% of RKN populations), except in Malawi and Tanzania (< 10% were infected), and was found for the first time in Crete (Greece). Generally, < 50% of the J2 carried spores. The occurrence of P.penetrans was sometimes correlated with soil type e.g., in Senegal it was least frequent in sandy soils. Laboratory assays of the binding of spores of isolates of P.penetrans to populations of RKN indicated large variations in specificity and substantial interactions; differences between populations within a species of RKN were sometimes almost as great as those between species. In microplot trials in which an "exotic" isolate of P.penetrans was introduced (ca 103 spores per g soil), its incidence was not increased by increasing the frequency or intensity of the growing of RKN-susceptible crops. However, in two such trials at sites in Tanzania and Ecuador naturally infected with P.penetrans, there were large increases in the proportions of spore-encumbered J2 (up to 100% encumbered) and in the yields of spores (up to 3.3 × 106 spores per mg dry root) in those plots amended with an "exotic" isolate. In these plots, numbers of J2 in the soil were decreased and damage by RKN was suppressed; gall indices were decreased (from > 8 to < 3) and yields were increased (by up to 30%). No such changes were observed in the unamended control plots. Increased suppression of RKN was also observed in a field trial, even in plots where RKN-susceptible and non-host crops were alternated. Increased suppression following amendment with the "exotic" isolate of P.penetrans was not observed at sites not previously infected with P.penetrans. Regression analysis of the results from the microplot and field trials indicated that tomato yields were decreased by > 5% for every increase of one in the gall index. Yields were increased by alternating tomato with leguminous crops in some trials, but not in others. It is proposed that, in natural infections, mutual selection produces a dynamic balance between the P.penetrans and the RKN whereby levels of infection are rarely suppressive. However, the introduction of an "exotic" isolate of P.penetrans, with a different attachment profile, can disturb this balance, resulting in a greatly increased proportion of infected J2 and females, increased yields of spores and more suppression of RKN populations. Importance des nématodes à galles tropicaux (Meloidogyne spp.) et facteurs affectant l'utilité de Pasteuria penetrans, agent de contrôle biologique - Ce travail présente les conclusions d'une étude, menée en collaboration par plusieurs équipes de recherche, sur la présence et l'importance des nématodes phytoparasites du genre Meloidogyne et de leur parasite bactérien, Pasteuria penetrans, dans certains pays d'Europe, d'Afrique, d'Amérique du Sud et des Caraïbes. Les réductions de rendement de cultures maraîchères très diverses dues à ces nématodes atteignent 25% en Equateur, Malawi et Tanzanie, et 10% à Trinidad et Tobago. La plus forte proportion de parcelles infestées a été rencontrée en Equateur (205 sur 207) et la plus faible à Trinidad et Tobago (70 sur 174). C'est en Equateur que l'indice de galles moyen (égal à 5,5) était le plus élevé. Même si cet indice était faible en moyenne au Sénégal (1,6), 89% des cultures étaient infestées dans ce pays, en grande partie par l'espèce virulente M. mayaguensis. M. incognita et M. javanica sont les plus répandues dans tous les pays prospectés. Cependant, M. hispanica est très répandu au Burkina Faso, même dans des zones récemment cultivées en maraîchage en région sahélienne. Plusieurs phénotypes estérasiques nouveaux ont été détectés, spécialement en Equateur et au Malawi. Les juvéniles de second stade (J2) extraits des échantillons de sol collectés lors des prospections ont été examinés pour détecter la présence de spores de P.penetrans sur leur cuticule. Trouvé pour la première fois en Crète (Grèce), P.penetrans est très répandu dans les autres pays prospectés, infestant 20 à 60% des populations de Meloidogyne spp., sauf au Malawi et en Tanzanie où moins de 10% des populations sont atteintes. Le plus souvent, moins de 50% de J2 portent des spores bactériennes. Le taux de parasitisme des J2 par P. penetrans est influencé par les types de sols, comme par exemple au Sénégal où il est très faible dans les sols sableux grossiers. Des expériences en laboratoire portant sur l'attachement de spores de divers isolats de P. penetrans à des populations de Meloidogyne spp. ont révélé une grande variation de la spécificité et des interactions; les différences observées pour diverses populations d'une même espèce de Meloidogyne sont parfois presque aussi marquées que celles observées entre espèces. L'incidence parasitaire d'un isolat "exotique" de P. penetrans introduit dans des microparcelles (ca. 103 sporespar g. de sol) n'a pas été accrue par l'augmentation de la fréquence ou de la densité de plantation des cultures sensibles à Meloidogyne spp. employées. Cependant, dans deux microparcelles natullement infestées en P.penetrans, situées en Equateur et en Tanzanie, l'introduction d'un isolat "exotique" s'est traduite par un accroissement de la proportion de J2 infestés (jusqu'à 100%) et de la production de spores ((jusqu'à 3, 3 × 106 spores par mg [poids sec] de racines), d'une diminution de la population de J2 dans le sol, et d'une disparition des dégâts racinaires; les indices de galles moyens ont diminué (de plus de 8 à moins de 3) et les rendements des cultures ont augmenté (jusqu'à 30%). De tels changements n'ont pas été observés dans des sols non amendés en isolats "exotiques" de P.penetrans. Un meilleur contrôle des populations de Meloidogyne spp. a également été observé au champ, même lorsque la séquence culturale alternait des cultures sensibles et des cultures non-hôtes du nématode. Dans des parcelles non infectées en P.penetrans, la baisse des populations de Meloidogyne spp. n'a pas été observée après introduction d'un isolat "exotique" de la bactérie. Des analyses de régression portant sur les données obtenues en microparcelles ou au champ montrent que les rendements en tomate diminuent de plus de 5% chaque fois que l'indice de galle augmente d'une unité. Ces rendements ont parfois été améliorés lorsque des cultures de légumineuses alternaient les cultures de tomate. Ainsi, sur la base des analyses nématologiques et agronomiques faites en fin de cycles culturaux, il est suggéré que, dans les cas d'infestations naturelles en P.penetrans, des sélections mutuelles entraîneraient un équilibre dynamique entre les populations de la bactérie et celles du nématode, représentatif d'une densité-dépendance retardée. En revanche, l'introduction inondative d'isolats "exotiques" de P.penetrans, aux propriétés parasitaires différentes de celles des populations natives, pourraient rompre temporairement cet équilibre en faveur d'un accroissement de la proportion de nématodes (J2 et femelles) infestés et de la production de spores bactériennes, ainsi qu'un meilleur contrôle des populations de Meloidogyne spp. La capacité des populations de P.penetrans à survivre dans les sols et à contrôler durablement les populations de Meloidogyne spp. dépendraient de la spécificité entre les organismes, des propriétés des sols et des systèmes de culture.

AbstractA brief overview is given of nematode taxonomy since its beginnings in the second half of the 19th century. Most of the work concerned α-taxonomy, but in the thirties and subsequently from the sixties several classifications have been proposed. Since the eighties phylogenetic systematics was introduced as the underlying theory. Due to the pioneering work of several famous nematode taxonomists in the first half of the 20th century an increased interest for the discipline arose. Very unfortunately, this interest decreased in more recent times to an alarming extent. The difficulty to correctly identify and to describe the rapidly increasing numbers of taxa has discouraged many young scientists and diverted them toward more appealing disciplines. Taxonomy provides nevertheless the basic knowledge for studies on biodiversity as well as for analyses of ecological and phylogenetic relationships. Molecular techniques have made systematics again exciting; when combined with the more traditional morphological approach, they will lead to new insights. Hopefully, these will arouse the interest of young scientists. Even then the future of nematode taxonomy will depend on the funding opportunities provided by national and international authorities. La systématique des nématodes est brièvement revue depuis ses origines dans la seconde moitié du 19ème siècle. La plupart des travaux sont relatifs l’ α-taxinomie, mais dans les années trente et ensuite dans les années soixante, plusieurs classifications ont été proposées. Depuis les années 80, la systématique phylogénétique a été introduite comme la théorie sous-jacente. Grâce au travail de pionnier de plusieurs taxinomistes célèbres dans la première moitié du 20ème siècle, un intérêt accru est apparu pour la discipline. Très malheureusement, cet intérêt a décru récemment jusqu’à un niveau alarmant. La difficulté d’identifier correctement et de décrire un nombre de taxons augmentant rapidement a découragé de nombreux jeunes scientifiques et les a poussé vers des disciplines plus attirantes. La taxinomie cependant apporte la connaissance de base tant pour des études de biodiversité que pour des études de relations écologiques et phylogénétiques. Les techniques moléculaires ont rendu la systématique à nouveau attractive; lorsqu’elles seront combinées avec l’approche morphologique plus traditionnelle, elles conduiront à de nouveaux développements. Heureusement, elles vont réveiller l’intérêt des jeunes chercheurs. Malgré cela, le futur de la taxinomie des nématodes dépendra des opportunités de financement par les autorités nationales et internationales.

Les nématodes phytoparasites (NPP) sont des vers ronds microscopiques que l’on retrouve en communautés dans les sols agricoles. Les NPP les plus communs n’occasionnent pas de dégâts sur les cultures. Cependant M. chitwoodi, un NPP règlementé à l’échelle européenne, peut engendrer d’importantes baisses de rendement. Pour caractériser le risque de son implantation, nous nous sommes intéressés aux communautés indigènes en France afin d’identifier celles capables de le limiter suite à une introduction. Nous avons, dans un premier temps, décrit les communautés de NPP à l'échelle d'un paysage agricole, puis à l'échelle de neuf régions françaises. Ces investigations ont montré des communautés peu différenciées en termes de richesse spécifique mais variables en termes d’abondance. Si les variables environnementales expliquent le mieux la structure de ces communautés de NPP à une large échelle géographique, certaines pratiques culturales(labour, application de produits phytosanitaires) influencent fortement les communautés à l’échelle locale. Dans un second volet, nous avons étudié le potentiel de différentes communautés à limiter le développement de M. chitwoodi notamment par la compétition. Il semble que les communautés possédant les plus hauts niveaux d’abondance globale, indépendamment des taxa présents, permettent de diminuer la multiplication de M. chitwoodi. Cette thèse apporte donc des éléments de compréhension sur le fonctionnement des communautés de NPP dans les agrosystèmes français et leur potentiel à limiter le l’établissement de M. chitwoodi pour pouvoir prédire le r
Plant-parasitic nematodes (PPN) are microscopic worms that occur in communities in almost every agricultural soils. Commonly found PPN are usually harmless for the plants. However, M. chitwoodi, a PPN highly regulated in EU can induce important yield losses. In order to improve risk assessment of M. chitwoodi implantation, we studied French native PPN communities to identify those that can limit its establishment shortly after an introduction. We firstly described PPN communities in various agrosystems, at a landscape scale and then in nine French regions. Despite the quite homogeneous species richness observed across the fields sampled, we highlighted strong PPN taxa abundance variations. Environmental variables seemed to mainly drive the PPN communities structure at a large geographic scale but cultural practices(tillage and pesticides uses) seemed to explain the communities variation at the local scale. Secondly, we studied the capacity of different PPN communities to limit M. chitwoodi development through competition. It appeared that PPN communities with high global abundance, regardless of the taxa present, are able to decrease M. chitwoodi multiplication. The results of this PhD thesis bring some elements about the structure and functioning of PPN communities in French fields and their ability to reduce the M. chitwoodi establishment in order to predict its implantation risk

Root-knot nematodes, genus Meloidogyne, are obligate biotrophic parasites. During a compatible interaction, the second stage juveniles (J2) penetrate into the root, migrate intercellularly and become sedentary to initiate the differentiation of a feeding site formed by 5 to 7 giant cells in the vascular cylinder. Secreted proteins play a key role during the plant/nematode interaction. A typical gall is formed around the feeding site. Stylet secretions are produced in oesophageal glands and injected in the root during parasitism. The first objective of this work was the identification of biological functions involved in the adaptation of the parasite to its host environment and in the modulation the host responses. We initiated a differential approach and a candidate gene approach and identified proteins of unknown function, proteases, a putative secreted protein a glutathione S-transferase (GST) and a peroxiredoxine (PRX). The GST was localized in the subventral oesophageal glands of infective J2 and detected in M. Incognita stylet secretions purified from infective J2. The PRX was localised in the excretory pore of infective J2 and in the hypodermis of sedentary stages. The role of these two proteins in parasitism is discussed. Root-knot nematodes have been so far refractory to transformation. Recent works demonstrated the efficiency of RNAi for the silencing of parasitism genes on J2. This strategy is limited by the recovery of targeted transcripts a few days after J2 treatment. In order to ensure a long-lasting silencing we developed a new and original tool, presented in a last chapter
Les nématodes à galle du genre Meloidogyne sont des vers microscopiques biotrophes, endoparasites obligatoires des racines. Lors de l’interaction compatible, la larve de second stade (L2) pénètre dans la racine, migre de façon intercellulaire, se sédentarise et initie la formation d’un site nourricier formé de 5 à 7 cellules géantes dans la zone du cylindre vasculaire. Les protéines des sécrétions des nématodes jouent un rôle majeur lors de l’interaction plante/nématode. Les sécrétions du stylet sont produites dans les glandes oesophagiennes et injectées dans la racine au cours du parasitisme. L’objectif de ce travail était d’abord d’identifier les fonctions biologiques impliquées dans l’adaptation du parasite à l’environnement de la plante et dans la modulation des défenses de la plante. Par une approche différentielle et une approche gène candidat, des protéines de fonction inconnue, des protéases, une protéine potentiellement sécrétée, une glutathion S-transférase (GST) et une péroxirédoxine (PRX) ont été identifiées. La GST, localisée dans les glandes œsophagiennes, est présente dans les sécrétions du stylet de L2 infestantes de M. Incognita. La PRX est localisée au niveau du pore excréteur des L2 et de l’hypoderme des stades sédentaires. Le rôle de ces deux protéines dans le processus parasitaire est discuté. L’analyse fonctionnelle de gènes du nématode est limitée par l’absence d’outils de transformation. L’efficacité transitoire de l’ARN interférence pour inhiber des gènes du parasitisme dans les L2 a été démontrée. Afin de garantir un « silencing » durable, la mise au point d’un nouvel outil sera développée dans une dernière partie

Plus de 25000 cas de trichinellose humaine ont été répertoriés en Chine et la mortalité atteint 1%. La comparaison des isolats de trichine d'origine chinoise et européenne a été faite en utilisant la technique d'amplification aléatoire. Afin d'identifier des gènes codant pour des antigènes immunodominants chez Trichinella une double stratégie a été utilisée. L) La première consistait à identifier des gènes codant pour des protéines conservées en utilisant des amorces dégénérées. Deux gènes ont ainsi été caractérisés. 2) La seconde stratégie a été fondée sur la technique d'hybridation soustractive des stades invasifs précoces de Trichinella (Adulte et L1 nouveaux nées (L1NN)) suivie d'une amplification. Des motifs enzymatiques, des glycoprotéines, des éléments potentiellement structuraux du parasite ont ainsi été sélectionnés. Trois gènes ont été reconstruits dont deux sont spécifiquement exprimés au stade Ad et L1 NN
More than 25000 human trichinellosis cases were reported with a mortality of 1% in China during the last 25 years. Restriction fragment length polymorphism (RFLP) of genomic DNA and random amplified polymorphic cDNA (RAPD) were used to define genetic variability among French and Chinese Trichinella isolates. In order to identify genes encoding immunodominant antigens two strategies were performed 1) conserved gene coding for putative conserved antigen (like HSP) were cloned and analyzed ; two genes were fully characterized 2) Stage specific genes were selected after subtractive hybridization of adult and new born larvae (NBL) stegas with the muscular stage of Trichinella spiralis. Nucleotidic sequences encoding glycoproteins, proteases, transcriptional factors were isolated and the full coding sequences of three genes was analyzed. The putative biological functions in the process of the Nurse cell formation of two NBL stage-specific DNase II genes were suggested and discussed

Face a la pression demographique grandissante, l'amelioration durable de la production agricole constitue aujourd'hui un des plus grands defis de la recherche agronomique dans le monde tropical. La jachere reste le principal moyen de restauration de la fertilite des sols dans les systemes de culture soudano-saheliens. Ce role est cependant compromis par le raccourcissement de la duree et l'exploitation croissante (paturage, coupe de bois) de la jachere. Compte tenu de leur impact potentiel sur les cultures, les nematodes phytoparasites ont fait l'objet d'une etude approfondie. Au plan economique, les deux especes de nematodes considerees comme pathogenes pour les cultures vivrieres de la zone d'etude, scutellonema cavenessi et tylenchorhynchus gladiolatus, ont des effectifs qui decroissent au cours de la jachere. Ces especes sont progressivement remplacees par d'autres especes de nematodes phytoparasites moins pathogenes contribuant a la diminution de la pression parasitaire au cours de la succession. D'un point de vue ecologique, les resultats montrent que les nematodes du sol apparaissent comme de bons descripteurs du fonctionnement de la jachere. Ils refletent l'evolution quantitative et qualitative des ressources, notamment celle de la matiere organique, et leur utilisation au cours de la jachere. L'evolution du peuplement de nematodes met en evidence l'effet des facteurs anthropiques, tels que la gestion des terres et l'exploitation de la jachere, mais aussi celui de facteurs physiques, comme les variations de pluviometrie entre les deux terroirs etudies, sonkorong et sare yorobana, determinant la productivite potentielle de l'ecosysteme. Les nematodes se revelent utiles comme indicateurs pour estimer l'etat de degradation du milieu, elaborer des programmes de gestion des jacheres et ameliorer la productivite potentielle des systemes de culture.

Le nématode à galle, Meloidogyne incognita est un parasite extrêmement polyphage capable d'induire la redifférentiation de cellules racinaires en cellules en cellules nourricières hypertrophiées
The root-knot nematode Meloidogyne incognita is among the most devastating plant pathogens

L'adaptation aux pressions environnementales est caractériseée par l'apparition par mutation de nouveaux états pour un caractère et la sélection de ces états. La résistance aux benzimidazoles (traitement anthelminthique) des nématodes Teladorsagia circuncincta parasites de petits ruminants (ovins) est un cas d'adaptation aux pressions environnementales, pour lequel le déterminisme génétique (un gène à deux allèles) est bien connu, mais où les processus impliqués dans sa sélection demeurent indéterminés. Les premières phases de la sélection de la résistance, qui sont cruciales dans la compréhension de l'émergence de la résistance, restent inaccessibles à l'expérimentateur et le recours à la modélisation est alors nécessaire. L'objectif de cette étude fut de caractériser les processus impliqués dans la sélection de la résistance aux benzimidazoles chez T. Circumcincta. Il a ainsi été possible (i) de préciser la nature des facteurs influençant l'installation du nématode chez l'ovin au moyen d'une meta-analyse (ii) de proposer la loi de Weibull comme distribution plus représentative des fortes abondances de nématodes que la loi binomiale négative et (iii) de déterminer l'effet de l'hypobiose (arrêt du développement) sur la dynamique hôte-parasite. Une approche simulatoire, permettant d'intégrer les connaissances sur l'interaction T. Circumcincta-ovin, a montré le rôle majeur dans la sélection de la résistance aux benzimidazoles (i)de l'agrégation des larves infestantes ingérées dans les premiers stades de la résistance et (ii) des zones refuges constituées, soit par les larves infestantes sensibles sur la parcelle soit par les nématodes sensibles non soumis au traitement dans les ovins. Dans le contexte de la résistance aux anthelminthiques, ces résultats permettent d'envisager des stratégies de gestion, et cette tude pourra être étendue à d'autres nématodes (modification du paramétrage) et complexifiée pour tester l'influence d'autres zones refuges comme l'hypobiose
Mutation of a trait and selection of the new mutant form is the key step of adaptation to environmental selective pressure. The resistance to benzimidazoles (anthelmintic treatments) of the nematodes Teladorsagia circumcincta, parasites of small ruminants (sheep) in a suitable model to study this process. The genetics of the resistance is well documented (one gene with two alleles) but the mechanisms governing selection still need to be disentangled. The early stage of selection of resistant strains cannot be studied experimentally and modelling is the only available approach. To characterize the processes involved in the selection of the resistance to benzimidazoles in T. Circumcicta, (i) we used a meta-analysis to identify the main factors governing the establishment of nematodes in sheep populations, (ii) we promoted the Weibull distribution rather than the Negative Binomial to describe the large numbers of nematodes observed in the most infected hosts and (iii) we investigated the effect of hypobiosis (arrested development) on the host-parasite dynamics. A simulation study, aiming to aggregate the knowledge on the T. Cicumcincta-sheep system, proved that the selection of the resistance to benzimidazoles was mainly affected by (i) the ingestion of clumps of infective larvae in the early stage of resistance selection and (ii) the refuge constituted by susceptible infective larvae remaining on pasture and by susceptible nematodes not exposed to treatments in sheep. We propose management rules in order to maintain selection for resistance as low as possible. It remains to extend this study to other nematodes species by adapting the parameters involved in the models. A further investigation of other potential refuges is also needed, of which refuge-effect of hypobiosis is of particular interest

Les deux principaux objectifs de ce travail sont de proposer des outils pour la selection d'animaux résistants aux strongles gastro-intestinaux, parasites du tube digestif, et de faire progresser la compréhension des mécanismes de résistance chez la chèvre créole. La variabilité génétique du caractère de résistance au parasitisme digestif a été étudiée afin de vérifier quels critères décrivant le mieux la résistance, peuvent être utilisés pour la sélection. L'ensemble des résultats obtenus suggèrent que le critère d'excrétion d'oeufs et le critère d'éosinophilie sont les plus adaptés pour un schéma de sélection puisqu'ils possèdent une héritabillté moyenne et représentent le mieux la résistance. De plus, ils ne semblent pas en opposition avec le poids, principal critère de production. Le déterminisme génétique de la résistance aux strongles gastro-intestinaux a été étudié et a permis de mettre en évidence l'existence d'un gène majeur pour la résistance chez la population de chèvre créole. De plus, la primo-détection de qtl a permis d'identifier 13 régions du génome ayant un effet sur les critères de résistance. Les mécanismes responsables de la résistance aux strongles gastro-intestinaux ont également été à l'étude. L'ensemble des résultats met en évidence le rôle des éosinophiles dans la mise en place de la résistance aux strongles gastro-intestinaux. L'activité des immunogobulines e semblent dirigés vers les larves l3 d'haemonchus contortus et suggère la mise en place d'une réaction protectrice. Chez la chèvre créole. Ces deux mécanismes semblent donc jouer un rôle important dans la mise en place de la résistance aux strongles gastro-intestinaux
The two main objectives of this work are to propose tools for the selection of resistant animals to gastrointestinal nematodes and advance knowledge on mechanisms of resistance of creole goats. this work has analysed the genetic variability of resistance to digestive parasitism in order to determine which criteria best describes the resistance and can be use for selection. the overall results suggest that the egg excretion and the eosinophilia are the criteria most suitable for a breeding scheme because they have moderate heritability estimates and best represent the resistance. moreover, they do not seem in conflict with the weight, the main criterion of production. the genetic determinism of resistance to gastrointestinal parasites has been studied and has highlighted the existence of a major gene for resistance in creole goats. in addition, the primodetection of qtl identified 13 genomic regions that affect the resistance. the mechanisms behind the resistance to gastrointestinal parasites were also studied and first hypothesis regarding the involvment of the immune response in resistance have been made in goats. the overall results highlighted the role of eosinophils in the development of resistance to gastrointestinal nematodes. the activity of immunoglobulin e seems directed toward l3 larvae of haemonchus contortus and may be imply in the establishment of a protective response agasint nematode parasites. in creole goats, these two mechanisms seem to play an important role in the development of resistance to gastrointestinal nematode infections

Chez les petits ruminants, la maîtrise actuelle du parasitisme par des nématodes gastro-intestinaux repose sur l'emploi d'anthelminthiques de synthèse. En raison du développement de résistances à ces molécules, l'utilisation de plantes riches en tannins condensés est désormais explorée comme solution alternative aux anthelminthiques, mais le mode d'action en reste mal connu. L'objectif de cette thèse était de définir les mécanismes d'action des tannins condensés sur les larves infestantes des trichostrongles digestifs. Nous avons d'abord confirmé que la consommation d'une plante riche en tannins condensés affecte l'installation des larves chez l'hôte, puis montré que les perturbations concernent les deux étapes-clefs de l'installation des larves : le dégainement puis la pénétration dans les muqueuses. La mise en évidence de lésions ultra-structurales et des sites de fixation des tannins condensés chez les larves est venu corroborée les résultats des études fonctionnelles, suggérant un mécanisme d'action direct. L'analyse des principaux facteurs modulant les effets constatés a montré qu'ils sont non-spécifiques de l'espèce de nématode mais varie selon la forme des larves (engainées ou dégainées). Par ailleurs, la concentration et la nature des tannins condensés sont les deux principaux facteurs liés à la plante influençant les propriétés anthelminthiques contre les larves. Des hypothèses expliquant les interactions entre les tannins et les molécules des larves infestantes sont proposées
In small ruminants, the current control of gastrointestinal parasitism relies on the use of chemical anthelmintics. However, due to the increasing development of resistances to chemical anthelmintics, the potential use of condensed tannin-rich plants represents an alternative solution to the chemical treatments, although the mode of action remains unknown. The objective of the current work was therefore to define the mechanisms of actions of condensed tannins on the infective larvae of gastrointestinal nematodes. First, we have confirmed that the consumption of a condensed tannin-rich plant decreased the establishment of infective larvae in the host. In a second step, it has been shown that both the exsheathment and the penetration of the larvae in the host mucosae were disturbed after contact with condensed tannins. The observations of the ultra-structural modifications and the fixation of condensed tannins on the larvae have confirmed a direct mode of action. In addition, our results have shown that the effects of condensed tannins were non specific of the nematode species but that differences in susceptibility exist between the ensheathed and exsheathed larvae. The effects were also dependent of the concentration and the biochemical nature of the condensed tannins. Finally, hypotheses on the potential interactions at the molecular level between the condensed tannins and the infective larvae are suggested

Les nématodes à galles sont des parasites telluriques très polyphages contre lesquels les rotations culturales sont peu efficaces. La lutte chimique a montré aussi ses limites par la toxicité des produits utilisés. Sur pomme de terre, Solanum tuberosum, les racines mais aussi les tubercules sont infectés et présentent des galles qui les rendent non commercialisables. L'utilisation de plantes résistantes constitue une alternative de lutte efficace et n on polluante mais à ce jour aucune variété de pomme de terre résistante n'est disponible. Aussi, les ressources génétiques des Solanacées tubéreuses sauvages sont explorées à la recherche de résistances naturelles transférables dans les variétés cultivées. Nous avons étudié les résistances de deux accessions de l'esp èce S. Sparsipilum, respectivement contre les trois espèces majeures de nématodes à galles des régions tropicales, M. Incognita, M. Arenaria et M. Javanica et contre une espèce des régions tempérées, M. Fallax. Nous avons d'abord caractérisé ces résistances à travers l'étude de leur déterminismes génétiques, leurs mécanismes d'action (réactions pré et post infectieuses au n niveau de la plante et influence sur le développement des nématodes) et leur thermo-sensibilité. Les facteurs génétiques (gènes majeurs ou loi à effets quantitatifs) contrôlant ces résistances ont été cartographiés par la suite sur le génome de S. Sparsipilum. Une plante est considérée comme résistante aux nématodes à galles lorsqu'elle inhibe totalement ou diminue fortement la capacité des juvéniles à évoluer au stade femelle
Root-knot nematodes (Meloidogyne spp. ) are telluric plant parasites with a broad host range that limits the use of crop rotation as control strategy. Chemicals are also restricted in practical agriculture due to their toxicity for human health. Besides the roots Meloidogyne species infest and induce galls on the surf ace and necrotic spots in the fesh of tubers of the potato, Solanum tuberosum. Infested tubers are unacceptable for both processing and fresh market and they are putative sources of dissemintatin of these parasites. Genetic resistance is the favoured control strategy in nematode management because it is usually effective and has no deleterious effects on environment but, no resistant potato cultivar is yet available. For breeding purpose, the resistances of two accessionsof nematodes species Meloidogyne incognita, M. Arenaria and M. Javanica and the temperate species M. Fallax have been investigated. Our objectives were to : 1° understand the species M. Fallax have been investigated. Our objectives were to: 1) understand the effects on the feeding and the development of the juveniles, genetic determinism of the resistances); 2) map major gene (s) or quantitative trait loci (QTL) that control the resistance. Compared to susceptible potato plants, both resistant accessions were significantly less infected. This was due to delayed and then arrested penetration of the juveniles in the roots. The accession harbouring the resistance to M. Fallax developed a necrotic reaction at the feeding site of the juveniles and prevented their development to the female stage. A “F1” diploid progeny was obtained using a dihaploid susceptible potato genotype as the female juveniles suggesting a monogenic control of the resistance. However, “necrotic” and “non necrotic” hybrid genetoypes showed a continuous distribution when considering the nematode females developed in their roots