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Dissertations / Theses on the topic 'Ontologie biomédicale'

Author: Grafiati
Published: 4 June 2021
Last updated: 1 February 2022

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Donfack, Guefack Pierre Sidoine V. "Modélisation des signes dans les ontologies biomédicales pour l'aide au diagnostic." Thesis, Rennes 1, 2013. http://www.theses.fr/2013REN1B018/document.

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Abstract:
Introduction : Établir un diagnostic médical fiable requiert l’identification de la maladie d’un patient sur la base de l’observation de ses signes et symptômes. Par ailleurs, les ontologies constituent un formalisme adéquat et performant de représentation des connaissances biomédicales. Cependant, les ontologies classiques ne permettent pas de représenter les connaissances liées au processus du diagnostic médical : connaissances probabilistes et connaissances imprécises et vagues. Matériel et méthodes : Nous proposons des méthodes générales de représentation des connaissances afin de construi
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Donfack, Guefack Sidoine Pierre V. "Modélisation des signes dans les ontologies biomédicales pour l'aide au diagnostic." Phd thesis, Université Rennes 1, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01057310.

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Abstract:
Introduction : Établir un diagnostic médical fiable requiert l'identification de la maladie d'un patient sur la base de l'observation de ses signes et symptômes. Par ailleurs, les ontologies constituent un formalisme adéquat et performant de représentation des connaissances biomédicales. Cependant, les ontologies classiques ne permettent pas de représenter les connaissances liées au processus du diagnostic médical : connaissances probabilistes et connaissances imprécises et vagues. Matériel et méthodes : Nous proposons des méthodes générales de représentation des connaissances afin de construi
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Amdouni, Emna. "Représentation sémantique des biomarqueurs d’imagerie dans le domaine médical." Thesis, Rennes 1, 2017. http://www.theses.fr/2017REN1S124/document.

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Abstract:
En médecine personnalisée, les mesures et les descriptions radiologiques jouent un rôle important. En particulier, elles facilitent aux cliniciens l’établissement du diagnostic, la prise de décision thérapeutique ainsi que le suivi de la réponse au traitement. On peut citer à titre d’exemple, les critères d’évaluation RECIST (en anglais Response Evaluation Criteria in Solid Tumors). De nombreuses études de corrélation en radiologie-pathologie montrent que les caractéristiques d'imagerie quantitative et qualitative sont associées aux altérations génétiques et à l'expression des gènes. Par consé
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Personeni, Gabin. "Apport des ontologies de domaine pour l'extraction de connaissances à partir de données biomédicales." Thesis, Université de Lorraine, 2018. http://www.theses.fr/2018LORR0235/document.

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Abstract:
Le Web sémantique propose un ensemble de standards et d'outils pour la formalisation et l'interopérabilité de connaissances partagées sur le Web, sous la forme d'ontologies. Les ontologies biomédicales et les données associées constituent de nos jours un ensemble de connaissances complexes, hétérogènes et interconnectées, dont l'analyse est porteuse de grands enjeux en santé, par exemple dans le cadre de la pharmacovigilance. On proposera dans cette thèse des méthodes permettant d'utiliser ces ontologies biomédicales pour étendre les possibilités d'un processus de fouille de données, en partic
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Nikiema, Jean. "Intégration de connaissances biomédicales hétérogènes grâce à un modèle basé sur les ontologies de support." Thesis, Bordeaux, 2019. http://www.theses.fr/2019BORD0179/document.

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Abstract:
Dans le domaine de la santé, il existe un nombre très important de sources de connaissances, qui vont de simples terminologies, classifications et vocabulaires contrôlés à des représentations très formelles, que sont les ontologies. Cette hétérogénéité des sources de connaissances pose le problème de l’utilisation secondaire des données, et en particulier de l’exploitation de données hétérogènes dans le cadre de la médecine personnalisée ou translationnelle. En effet, les données à utiliser peuvent être codées par des sources de connaissances décrivant la même notion clinique de manière différ
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Reis, Julio Cesar Dos. "Mapping Adaptation between Biomedical Knowledge Organization Systems." Thesis, Paris 11, 2014. http://www.theses.fr/2014PA112231/document.

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Abstract:
Les systèmes d'information biomédicaux actuels reposent sur l'exploitation de données provenant de sources multiples. Les Systèmes d'Organisation de la Connaissance (SOC) permettent d'expliciter la sémantique de ces données, ce qui facilite leur gestion et leur exploitation. Bénéficiant de l'évolution des technologies du Web sémantique, un nombre toujours croissant de SOCs a été élaboré et publié dans des domaines spécifiques tels que la génomique, la biologie, l'anatomie, les pathologies, etc. Leur utilisation combinée, nécessaire pour couvrir tout le domaine biomédical, repose sur la définit
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Choquet, Rémy. "Partage de données biomédicales : modèles, sémantique et qualité." Phd thesis, Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00824931.

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Abstract:
Le volume de données disponibles dans les systèmes d'information est de plus en plus important et pour autant, nous n'avons jamais autant essayer d'interconnecter cette information pour en extraire de la connaissance sans véritable succès généralisable. L'origine du problème est multiple. Tout d'abord, l'information est représentée dans des structures différentes. Ensuite, les vocabulaires utilisés pour exprimer les données sont hétérogènes. Enfin, la qualité de l'information est souvent trop mauvaise pour utiliser une information et en déduire des connaissances. Ce diagnostic est d'autant plu
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Merabti, Adila Amaria. "Représentation de l'évolution des connaissances : application au domaine biomédical." Rouen, 2015. http://www.theses.fr/2015ROUES025.

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Abstract:
Les connaissances dans le domaine de santé sont en constante évolution ainsi que les ressources qui permettent de les modéliser et les besoins utilisateurs pour lesquelles elles ont été construites. En effet, cette évolution rapide de ces connaissances requiert une mise à jour des documents médicaux correspondants ce qui a motivé beaucoup de travaux de recherche. L’objectif de ces travaux est de proposer une méthode de comparaison qui soit assez générique pour pouvoir étudier l’évolution entre deux versions d’un même document médical indépendamment de sa spécifité. Notre approche de comparaiso
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Annane, Amina. "Using Background Knowledge to Enhance Biomedical Ontology Matching." Thesis, Montpellier, 2018. http://www.theses.fr/2018MONTS032/document.

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Abstract:
Les sciences de la vie produisent de grandes masses de données (par exemple, des essais cliniques et des articles scientifiques). L'intégration et l'analyse des différentes bases de données liées à la même question de recherche, par exemple la corrélation entre phénotypes et génotypes, sont essentielles pour découvrir de nouvelles connaissances. Pour cela, la communauté des sciences de la vie a adopté les techniques du Web sémantique pour réaliser l'intégration et l'interopérabilité des données, en particulier les ontologies. En effet, les ontologies représentent la brique de base pour représe
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Da, Costa Arnaud. "Une approche basée sur le double paradigme « ontologie-architecture de modèles » appliquée au traitement de collections d'images dans le domaine biomédical : XenOnt." Dijon, 2008. http://www.theses.fr/2008DIJOS061.

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Abstract:
Le travail de cette thèse se situe dans le cadre d'applications qui produisent des volumes importants d'images. Les images produites véhiculent une sémantique forte, spécifique au domaine, et leur nature graphique ne permet pas de mettre aisément en oeuvre des outils de segmentation (diversité entre les images du domaine, entre les techniques utilisées pour la génération des images, etc. ). À ce jour, l'annotation est effectuée par des experts du domaine. Le coût engendré par ces annotations fait que beaucoup de collections ne sont pas annotées et sont donc peu ou pas exploitables en dehors du
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Laadhar, Amir. "Local matching learning of large scale biomedical ontologies." Thesis, Toulouse 3, 2019. http://www.theses.fr/2019TOU30126.

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Abstract:
Les larges ontologies biomédicales décrivent généralement le même domaine d'intérêt, mais en utilisant des modèles de modélisation et des vocabulaires différents. Aligner ces ontologies qui sont complexes et hétérogènes est une tâche fastidieuse. Les systèmes de matching doivent fournir des résultats de haute qualité en tenant compte de la grande taille de ces ressources. Les systèmes de matching d'ontologies doivent résoudre deux problèmes: (i) intégrer la grande taille d'ontologies, (ii) automatiser le processus d'alignement. Le matching d'ontologies est une tâche difficile en raison de la l
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Pham, Cong Cuong. "Multi-utilisation de données complexes et hétérogènes : application au domaine du PLM pour l’imagerie biomédicale." Thesis, Compiègne, 2017. http://www.theses.fr/2017COMP2365/document.

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Abstract:
L’émergence des technologies de l’information et de la communication (TIC) au début des années 1990, notamment internet, a permis de produire facilement des données et de les diffuser au reste du monde. L’essor des bases de données, le développement des outils applicatifs et la réduction des coûts de stockage ont conduit à l’augmentation quasi exponentielle des quantités de données au sein de l’entreprise. Plus les données sont volumineuses, plus la quantité d’interrelations entre données augmente. Le grand nombre de corrélations (visibles ou cachées) entre données rend les données plus entrel
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Carvalho, Carina Maris Gaspar. "Análise comparativa entre a ontologia CIPE® 2.0 e a ontologia CIPESC® / Carina Maris Gaspar Carvalho ; orientadora, Marcia Regina Cubas ; coorientara, Andreia Malucelli." reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_PR, 2012. http://www.biblioteca.pucpr.br/tede/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=2367.

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Abstract:
Dissertação (mestrado) - Pontifícia Universidade Católica do Paraná, Curitiba, 2012<br>Bibliografia: p. 86-96<br>Diante da complexidade e do crescimento da Classificação Internacional para a Prática de Enfermagem (CIPE®), a partir de 2005, ela passou a ser desenvolvida por meio de ontologia. Pesquisadoras do grupo de discussão "Sistemas Classificatórios para as Prát<br>Given the complexity and growth of the International Classification for Nursing Practice (ICNP®), from 2005, it began to be developed by ontology. Researchers at the discussion group "Sistemas Classificatórios para as Práticas d
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Alves, Carlos Fernandes. "Ontotransplante : ontologia relacionada à histocompatibilidade /Carlos Fernandes Alves ; orientadora, Andreia Malucelli." reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_PR, 2011. http://www.biblioteca.pucpr.br/tede/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1953.

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Abstract:
Dissertação (mestrado) - Pontifícia Universidade Católica do Paraná, Curitiba, 2011<br>Bibliografia: f. 57-61<br>Equívocos de tradução, grande quantidade de termos e uso inadequado de novos termos dificultam a interoperabilidade entre os laboratórios de histocompatibilidade e grupos transplantadores, assim como entre sistemas de informação, sendo necessário padroniz<br>Translation miscomprehensions, the large number of terms and inadequate use of new terms difficult histocompatibility laboratories and transplant groups interoperability, as between information systems, making it necessary to st
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Miñarro, Giménez José Antonio. "Entorno para la Gestión Semántica de Información Biomédica en Investigación Traslacional." Doctoral thesis, Universidad de Murcia, 2012. http://hdl.handle.net/10803/92299.

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Abstract:
Las investigaciones traslacionales tienen el objetivo de poner a disposición de investigaciones las evidencias obtenidas en investigaciones básicas para ensayos clínicos. Para facilitar la investigación traslacional es necesario relacionar dicha información mediante la integración de repositorios de información biológica y médica. Debido a la complejidad, cantidad, diversidad y rápida evolución de la información biológica, es imposible gestionar los repositorios biológicos de manera manual ya que supondría una gran inversión en tiempo y en esfuerzo. Por lo tanto, cada vez más es necesario dota
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Lossio-Ventura, Juan Antonio. "Towards the French Biomedical Ontology Enrichment." Thesis, Montpellier, 2015. http://www.theses.fr/2015MONTS220/document.

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Abstract:
En biomedicine, le domaine du « Big Data » (l'infobésité) pose le problème de l'analyse de gros volumes de données hétérogènes (i.e. vidéo, audio, texte, image). Les ontologies biomédicales, modèle conceptuel de la réalité, peuvent jouer un rôle important afin d'automatiser le traitement des données, les requêtes et la mise en correspondance des données hétérogènes. Il existe plusieurs ressources en anglais mais elles sont moins riches pour le français. Le manque d'outils et de services connexes pour les exploiter accentue ces lacunes. Dans un premier temps, les ontologies ont été construites
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Zahra, Faruk Mustafa. "Poronto : ferramenta para construção semiautomática de ontologias em português / Faruk Mustafa Zahra ; orientadora, Andreia Malucelli." reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_PR, 2009. http://www.biblioteca.pucpr.br/tede/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1709.

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Abstract:
Dissertação (mestrado) - Pontifícia Universidade Católica do Paraná, Curitiba, 2009<br>Bibliografia: f. 73-79<br>Aprendizagem de ontologias (ontology learning) é definida como um conjunto de métodos e técnicas para a construção semiautomática de uma nova ontologia ou para o enriquecimento de uma já existente. Para construir uma ontologia de maneira semiautomática é<br>Ontology Learning is defined as a set of methods and techniques for the semi-automatic construction of a new ontology or to enrich an existing one. To build an ontology in a semiautomatic way it is necessary to automate the proce
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Silva, Romana Reis da 1984. "Desenvolvimento parcial de uma ontologia para classificação de termos da enfermagem / Romana Reis da Silva ; orientadora, Andreia Malucelli ; co-orientadora, Marcia Regina Cubas." reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_PR, 2009. http://www.biblioteca.pucpr.br/tede/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1455.

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Abstract:
Dissertação (mestrado) - Pontifícia Universidade Católica do Paraná, Curitiba, 2009<br>Bibliografia: f. 71-77<br>A CIPE® (Classificação Internacional para a Prática de Enfermagem) é uma taxonomia, multiaxial, unificada e universal de termos da enfermagem e seu trajeto de construção produziu diferentes versões, sendo que a versão 1.0 refere incluir uma ontologia. A c<br>The ICNP® (International Classification for Nursing Practice) is a multiaxial, unified and universal taxonomy of nursing terms with different versions. Version 1.0 refers to the inclusion of an ontology. The Brazilian contributi
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Mattei, Francine Dutra. "Elaboração de diagnósticos e resultados de enfermagem relacionados ao processo de dor por meio da combinação entre termos da CIPE® e sua inclusão na ontologia CIPESC® / Francine Dutra Mattei ; orientadora, Marcia Regina Cubas ; co-orientadora, Andreia Malucelli." reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_PR, 2011. http://www.biblioteca.pucpr.br/tede/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=1948.

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Abstract:
Dissertação (mestrado) - Pontifícia Universidade Católica do Paraná, Curitiba, 2011<br>Bibliografia: f.115-126<br>Justificativa: Dentre os vários termos classificados no eixo "Foco" da Classificação Internacional para a Prática de Enfermagem (CIPE®), há uma subclasse específica, que inclui conceitos diferenciados, para representar o fenômeno "Dor". A dor é um sintoma<br>Background: Among the various terms classified in the axis "Focus" of the International Classification for Nursing Practice (ICNP®), there is a specific subclass, which includes different concepts, to represent the phenomenon "
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Giacobo, Danilo. "MOBS : metodologia, baseada em ontologias, para registro de observações comportamentais, em pacientes que apresentam transtornos mentais : uma aplicação / Danilo Giacobo ; orientador, Marcos Augusto Shmeil." reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_PR, 2006. http://www.biblioteca.pucpr.br/tede/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=603.

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Abstract:
Dissertação (mestrado) - Pontifícia Universidade Católica do Paraná, Curitiba, 2006<br>Inclui bibliografia<br>A área da Saúde Mental é historicamente marcada por preconceitos, pela subjetividade, pelo sobrenatural e pela interdependência com outras áreas do conhecimento. Essas questões fazem com que muitos trabalhos sejam difíceis de serem desenvolvidos e mensura
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Elbyed, Abdeltif. "ROMIE, une approche d'alignement d'ontologies à base d'instances." Phd thesis, Institut National des Télécommunications, 2009. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00541874.

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Abstract:
L'interoperabilite semantique est une question importante, largement identifiee dans les technologies d'organisation et de l'information et dans la communaute de recherche en systemes d'information. L'adoption large du Web afin d'acceder a des informations distribuees necessite l'interoperabilite des systemes qui gerent ces informations. Des solutions et reflexions comme le Web Semantique facilitent la localisation et l'integration des donnees d'une maniere plus intelligente par l'intermediaire des ontologies. Il offre une vision plus semantique et comprehensible du web. Pourtant, il souleve u
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Drame, Khadim. "Contribution à la construction d’ontologies et à la recherche d’information : application au domaine médical." Thesis, Bordeaux, 2014. http://www.theses.fr/2014BORD0444/document.

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Abstract:
Ce travail vise à permettre un accès efficace à des informations pertinentes malgré le volume croissant des données disponibles au format électronique. Pour cela, nous avons étudié l’apport d’une ontologie au sein d’un système de recherche d'information (RI).Nous avons tout d’abord décrit une méthodologie de construction d’ontologies. Ainsi, nous avons proposé une méthode mixte combinant des techniques de traitement automatique des langues pour extraire des connaissances à partir de textes et la réutilisation de ressources sémantiques existantes pour l’étape de conceptualisation. Nous avons pa
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Canestraro, Josimara. "Sistema de apoio à decisão para atendimento de pacientes em unidades de dor torácica combinando regras e ontologia / Josimara Canestraro ; orientador, João da Silva Dias ; co-orientador, Marcos Augusto H. Shmeil." reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_PR, 2006. http://www.biblioteca.pucpr.br/tede/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=983.

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Abstract:
Dissertação (mestrado) - Pontifícia Universidade Católica do Paraná, Curitiba, 2006<br>Bibliografia: p. 83-89<br>A identificação do Infarto Agudo do Miocárdio (IAM) é um dos inúmeros problemas considerados importantes para a cardiologia, porque muitas vezes essa identificação é lenta e ineficaz em pacientes que apresentam dor torácica. A dor torácica é um dos princi<br>The identification of the Acute Myocardial Infarction (AMI) is one of the numberless problems considered important for the Cardiology, because most of times this identification is slow and ineffective considering the patients wh
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Serique, Kleberson Junio do Amaral. "Anotação de imagens radiológicas usando a web semântica para colaboração científica e clínica." Universidade de São Paulo, 2012. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-10092012-155249/.

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Abstract:
Este trabalho faz parte de um projeto maior, o Annotation and Image Markup Project, que tem o objetivo de criar uma base de conhecimento médico sobre imagens radiológicas para identificação, acompanhamento e reasoning acerca de lesões tumorais em pesquisas sobre câncer e consultórios médicos. Esse projeto está sendo desenvolvido em conjunto com o Radiological Sciences Laboratory da Stanford University. O problema específico, que será abordado nesse trabalho, é que a maior parte das informações semânticas sobre imagens radiológicas não são capturados e relacionados às mesmas usando termos de on
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Mechouche, Ammar. "Représentation et partage de connaissances en neuroanatomie : application à l'annotation sémantique des images IRM du cerveau." Rennes 1, 2009. http://www.theses.fr/2009REN1B123.

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Abstract:
Cette thèse s'inscrit dans le cadre du Web Sémantique biomédical et aborde deux problèmes : le premier est relatif à la représentation et au partage de connaissances en neuroanatomie, et le second concerne l'interprétation et l'annotation sémantique des images IRM du cerveau humain. La thèse propose alors une ontologie de l'anatomie sulco-gyrale du cortex cérébral chez l'adulte, ainsi que son utilisation dans un système d'annotation sémantique des structures anatomiques correspondant aux parties de gyri et de sillons, extraites de régions d'intérêt sélectionnées par l'utilisateur sur des image
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Mary, Melissa. "Intéropérabilité sémantique dans le domaine du diagnostic in vitro : Représentation des Connaissances et Alignement." Thesis, Normandie, 2017. http://www.theses.fr/2017NORMR033.

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Abstract:
La centralisation des données patients au sein de répertoires numériques soulève des problématiques d’interopérabilité avec les différents systèmes d’information médicaux tels que ceux utilisés en clinique, à la pharmacie ou dans les laboratoires d’analyse. Les instances de santé publique, en charge de développer et de déployer ces dossiers, recommandent l’utilisation de standards pour structurer (syntaxe) et coder l’information (sémantique). Pour les données du diagnostic in vitro (DIV) deux standards sémantiques sont largement préconisés : - la terminologie LOINC® (Logical Observation Identi
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Krupaviciute, Asta. "Personalised wearable cardiac sensor services for pervasive self-care." Phd thesis, INSA de Lyon, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00708340.

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Abstract:
The aim of the thesis is to design a web services architecture that shall support the automatic determination of a personalised sensor-system, which is embedded in smart garments, and which shall be used in self-care in order to allow a profane user to record himself a personal electrocardiogram (ECG), at anytime and anywhere. The main challenge consists in the intelligent and dynamic orchestration of context-aware business services that supply the user with an optimal personalised solution, while mastering the system's complexity: context dependent user and system interactions, knowledge extr
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Tavares, Bruno Filipe Gomes Feteira da Costa. "Aplicações com base em ontologias biomédicas: uma abordagem web semântica." Master's thesis, 2011. http://hdl.handle.net/10451/13927.

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Abstract:
Tese de mestrado em Tecnologias da Informação Aplicadas as Ciências Biológicas e Médicas, apresentada à Universidade de Lisboa, através da Faculdade de Ciências, 2011<br>This report presents the work focused on building a BOA (Biomedical Ontology Applications) framework. The BOA research activity of XLDB group of LASIGE aims to investigate and develop applications to efficiently exploit the information contained in biomedical ontologies, such as Gene Ontology (GO) and Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI). BOA offers three web tools for the community: ProteInOn, and CMPSim CESSM. Th
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Martins, Catarina Tavares. "Visualization for biomedical ontologies alignment." Master's thesis, 2016. http://hdl.handle.net/10451/22867.

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Abstract:
Tese de mestrado, Bioinformática e Biologia Computacional (Bioinformática), Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2016<br>Desde o início do século, a investigação biomédica e a prática clínica levaram a uma acumulação de grandes quantidades de informação, por exemplo, os dados resultantes da sequenciação genómica ou os registos médicos. As ontologias fornecem um modelo estruturado com o intuito de representar o conhecimento e têm sido bem sucedidas no domínio biomédico na melhoria da interoperabilidade e partilha. O desenvolvimento desconectado das ontologias biomédicas levou à criaçã
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Oliveira, Daniela Patrícia dos Santos. "Compound matching of biomedical ontologies." Master's thesis, 2015. http://hdl.handle.net/10451/20621.

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Abstract:
Tese de mestrado, Bioinformática e Biologia Computacional (Bioinformática)Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2015<br>As ontologias biomédicas são particularmente bem sucedidas na uniformização do domínio das ciências da vida. Devido à sua recente expansão, a integração de todo o conhecimento que contêm tornou-se uma tarefa extenuante. Desta forma, foram desenvolvidos sistemas de alinhamento de ontologias para lidar com o problema, que alinham uma ontologia com outra e encontram classes que correspondem entre as duas. Contudo, novos desafios para estes sistemas estão a começar a apa
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Pavão, Maria Madalena Ervedosa de Lacerda. "Compound matching for multiple ontologies." Master's thesis, 2019. http://hdl.handle.net/10451/39027.

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Abstract:
Tese de mestrado, Bioinformática e Biologia Computacional (Bioinformática) Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2019<br>As áreas científicas multidisciplinares como a Biomédica, usam normalmente redes de ontologias para suportar aplicações como anotação, integração, pesquisa e análise de dados. Estas redes podem ser construídas usando técnicas de correspondência de ontologias, no entanto a maioria das abordagens existentes é limitada a correspondências entre duas ontologias, sendo a grande maioria das equivalências simples. Em cenários de múltiplos domínios, é necessário encontrar co
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Ruas, Pedro Simões. "Exploring biomedical ontologies, personalized pagerank and semantic similarity in the entity linking task." Master's thesis, 2019. http://hdl.handle.net/10451/39624.

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Abstract:
Tese de mestrado, Bioinformática e Biologia Computacional, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2019<br>A literatura científica está maioritariamente disponível na forma de artigos publicados, que são essenciais para a partilha de conhecimento científico. Contudo, o ritmo de publicação de novos artigos tem aumentado constantemente, excedendo a capacidade humana de gerir e aceder a esta grande quantidade de texto não estruturado: os investigadores despendem mais esforço e tempo a recuperar informação científica e o trabalho dos biocuradores torna-se mais complicado, pois a maior parte
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Neves, Rodrigo David Rodrigues. "Matching Biomedical Knowledge Graphs with Neural Embeddings." Master's thesis, 2020. http://hdl.handle.net/10451/48359.

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Abstract:
Tese de mestrado, Ciência de Dados, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2020<br>Os grafos de conhecimento são estruturas que se tornaram fundamentais para a organização dos dados biomédicos que têm sido produzidos a um ritmo exponencial nos últimos anos. A abrangente adoção desta forma de estruturar e descrever dados levou ao desenvolvimento de abordagens de prospeção de dados que tirassem partido desta informação com o intuito de auxiliar o progresso do conhecimento científico. Porém, devido à impossibilidade de isolamento de domínios de conhecimento e à idiossincrasia humana, graf
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Teixeira, David Carriço. "Understanding ALS patients using Semantic Similarity." Master's thesis, 2019. http://hdl.handle.net/10451/40236.

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Abstract:
Tese de mestrado, Bioinformática e Biologia Computacional, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2019<br>As técnicas clássicas de prospecção de dados têm dificuldades a lidar com dados biomédicos não estruturados/ semiestruturados, pois estes contêm um significado semântico profundamente enraizado em palavras e frases que não é detectado através da extracção e análise diretas de recursos. Uma maneira de formalmente contextualizar dados é anotá-los com ontologias biomédicas e usar semelhança semântica sobre essas anotações para encontrar relações ocultas entre instâncias de dados. De
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Santos, Pedro Jorge Mendes dos. "Validation of automatic similarity measures." Master's thesis, 2020. http://hdl.handle.net/10451/48089.

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Abstract:
Tese de mestrado em Bioinformática e Biologia Computacional, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2020<br>A capacidade para comparar automaticamente duas entidades biomédicas (p. ex. doenças, vias metabólicas ou artigos científicos) permite que os computadores raciocinem sobre o conhecimento científico. Assim sendo, fazer a validação destas medidas é essencial para garantir que os resultados produzidos por elas reflictam o actual conhecimento colectivo sobre o respectivo domínio. Uma das estratégias para avaliar se a medida é precisa e funcional é a validação manual por parte de peri
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