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Abed, Amina. "Exploration des approches pangénomiques en amélioration variétale chez l'orge à six rangs dans l'Est du Canada." Doctoral thesis, Université Laval, 2019. http://hdl.handle.net/20.500.11794/37563.
Full textAbstract:
L’émergence du génotypage à haut débit et le développement de méthodes statistiques reliant le génotype au phénotype ont donné lieu à des approches pangénomiques, c’est-à-dire à l’échelle du génome entier, exploitables en sélection des plantes. Ces approches ont d’abord permis d’examiner l'association entre génotype et phénotype via des analyses d'association pangénomique (GWAS en anglais) afin d’identifier des loci de caractères quantitatifs (« quantitative trait loci », QTL) utiles en sélection assistée par marqueurs (SAM). Plus récemment, ces approches ont été explorées pour la prédiction génomique, laquelle vise, d’une part, à identifier les croisements les plus prometteurs (la sélection des croisements), et d’autre part, à identifier les individus les plus prometteurs au sein d’une descendance (la sélection génomique). Dans les deux cas, ces prédictions reposent sur un modèle statistique reliant le génotype et le phénotype au sein d’une population de référence. Ces approches pangénomiques offrent un grand potentiel, mais sont encore émergentes et de nombreuses questions se posent encore chez l’orge. Notre étude s’intéresse à certaines de ces interrogations et elle est divisée en quatre volets de recherche. Les approches pangénomiques nécessitent un nombre important de marqueurs moléculaires de type SNP (« single nucleotide polymorphism »). Ainsi dans le premier volet nous avons optimisé le protocole de génotypage par séquençage. Ce volet détaille tout le processus, de la préparation des librairies de séquençage jusqu’à la production d’un catalogue de SNP de haute qualité. À titre d’illustration, nous avons généré un catalogue de 30 000 SNP ayant une distribution chromosomique intéressante et une grande exactitude des génotypes. Dans le deuxième volet, en utilisant les données phénotypiques et génotypiques d’une population d’amélioration, nous avons comparé l’efficacité de trois approches GWAS (Uni-SNP, Multi-SNP et Haplotypique) pour détecter des QTL pour des caractères agronomiques importants. Les approches Multi-SNP et Haplotypique ont identifié plus de QTL que l’approche Uni-SNP. Le chevauchement entre les approches était limité, chaque approche découvrant un sous-ensemble différent de QTL.Dans le cadre du troisième volet, nous avons étudié l’impact de trois facteurs sur la justesse de la sélection génomique : (1) la performance de différents modèles statistiques (incluant ou non l’épistasie), (2) le nombre de marqueurs employés ainsi que (3) leur localisation (génique/nongénique). Le modèle qui intègre les effets additifs et épistatiques a montré les meilleures performances même si les différences entre les modèles étaient modestes. Jusqu’à 2K SNP, la justesse de la sélection génomique est restée comparable à celle basée sur le catalogue entier (35K), mais une diminution significative été observée à 500 SNP. Dans la plupart des cas, l’utilisation de SNP présents dans les régions géniques, voire codantes, n’a pas apporté une amélioration significative. Enfin, dans le quatrième volet, nous avons exploré la sélection génomique et la sélection des croisements. En premier lieu, nous avons constitué une population de référence pour bâtir un modèle de sélection génomique et prédire les performances de 350 descendants développés dans un programme d’amélioration. A partir des prédictions, 35 lignées ont été sélectionnées et testées au champ afin d’examiner la corrélation entre les performances prédites et observées. Les corrélations étaient satisfaisantes pour la résistance à la fusariose et le rendement. Ensuite, sur la base de ce modèle, nous avons prédit la moyenne (μ) ela variance génétique (Vg) de chacune des descendances simulées issues de tous les croisements possibles (30 000). La validation de ces prédictions a été réalisée rétrospectivement sur un sous-ensemble de croisements précédemment réalisés, en examinant leur persistance dans le processus de sélection. Tel qu’attendu les croisements les plus persistants (>F9) ont présenté des μ supérieures, mais des Vg modérées. Même si la résistance à la fusariose et le rendement sont corrélés défavorablement, nous avons pu identifier des croisements (650) où cette corrélation était rompue. Parmi ces croisements, certains (40) auraient un réel potentiel avec des performances égales ou supérieures à des lignées témoins performantes. Au terme de ce projet, nous avons démontré l'efficacité d'une procédure GWAS combinant des approches uni- et multi-locus à disséquer des caractères complexes et à détecter des QTL clés utilisables en SAM. Nous avons aussi démontré que la prédiction génomique peut être optimisée et efficacement intégrée en sélection génétique chez l’orge à six rangs pour identifier les meilleurs descendants, mais surtout pour identifier des croisements prometteurs.
Finally, in the fourth part, we explored genomic selection and genomic mating in a breeding program. First, we established a training population to build a genomic selection model and to predict the performance of 350 progeny developed in a breeding program. Based on these predictions, 35 lines were selected and tested in the field to examine the correlation between predicted and observed performances. The correlations were satisfactory for Fusarium head blight (FHB) resistance and yield. Then, based on this model, we predicted the mean (μ) and the genetic variance (VG) of each simulated progeny from all possible crosses (n = 30,000) between lines of the training population. The validation of these predictions was carried out retrospectively on a subset of previously performed crosses by examining their persistence in the selection process. As expected, the most persistent crosses (> F9) displayed high μ but moderate VG. Although resistance to FHB and yield are unfavorably correlated, we could identify crosses (650) where this correlation was weakened. Among these crosses, some (40) are predicted to offer equal or better performance than current checks. Through this project, we demonstrated the efficiency of a GWAS procedure combining single- and multi-locus approaches to dissect complex characters and to detect key QTLs that can be used in MAS. We also demonstrated that genomic prediction can be optimized and efficiently integrated in genetic improvement of six-row barley to identify the best progeny but also to identify promising crosses.
The emergence of high-throughput genotyping and the development of statistical methods linking genotype to phenotype have led to pangenomic approaches, performed on a genome-wide scale, exploitable in plant breeding. First, these approaches were used to examine the association between genotype and phenotype in genome-wide association studies (GWAS) in order to identify quantitative trait loci (QTLs) useful in marker-assisted selection (MAS). More recently, these approaches have been explored in genomic prediction which aims, on the one hand, to identify the most promising crosses (genomic mating), and on the other hand, to identify the most promising lines within a set of progeny (genomic selection). In both cases, these predictions are based on a statistical model linking genotype to phenotype in a training population. These genome-wide approaches offer great potential but are still emerging and many questions remain unanswered in barley. Our study focuses on some of these questions and is divided into four areas of research. Genome-wide approaches require a large number of single nucleotide polymorphism (SNP) markers. Thus, in the first part of this project, we optimized the protocol of genotyping by sequencing (GBS). This part details the entire process, from the preparation of GBS libraries until the production of a high-quality SNP catalog. As an illustration, we generated a catalog of 30,000 SNPs with a broad chromosome distribution and high genotype accuracy. In the second part, using phenotypic and genotypic data from a breeding population, we compared the effectiveness of three GWAS approaches (Single-SNP, Multi-SNP and Haplotype-based) to detect QTLs for important agronomic traits. The Multi-SNP and Haplotype-based approaches identified more QTLs than the Single-SNP approach. The overlap between the approaches was limited, as each approach uncovered a different subset of previously validated QTLs. In the third part we studied the impact of three factors on the accuracy of genomic selection: (1) the performance of different statistical models (including epistasis or not), (2) the number of SNP markers included in the model as well as (3) their localization (genic/non-genic regions). The model that incorporates both the additive and epistatic effects of SNPs showed the best performance even though the differences between the models were modest. With as few as 2K SNP, the accuracy of genomic selection remained comparable to that based on the entire catalog (35K), while a significant decrease in accuracy was observed at 500 SNPs. In most cases, the use of SNPs located in genic regions, even coding regions, did not provide a significant improvement.
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Bélanger, Sébastien. "Caractérisation génomique et transcriptomique de la microspore embryogénique chez l'orge." Doctoral thesis, Université Laval, 2019. http://hdl.handle.net/20.500.11794/33304.
Full textAbstract:
L’androgenèse est une biotechnologie végétale utilisée pour fixer le bagage génétique des plantes en une seule génération. Elle repose sur la capacité d’un grain de pollen immature, la microspore, à restaurer sa totipotence cellulaire végétale et se dédifférencier puis s’engager dans la voie de l’embryogenèse. Or, on observe que la capacité de la microspore à s’engager dans l’embryogenèse est génétiquement variable. En dépit des nombreux avantages qu’elle présente, l’androgenèse entraîne souvent une conséquence indésirable, soit une distorsion de la ségrégation (DS) chez les populations issues de cette biotechnologie. Ma thèse porte sur l’étude (i) du transcriptome de la microspore en transition entre la voie de développement du grain de pollen et celle de l’androgenèse et (ii) de la DS pour déterminer quand la DS survient dans le processus et où elle affecte le génome. J’ai utilisé l’orge comme espèce modèle pour mon étude. L’analyse transcriptomique a été réalisée sur la microspore isolée de l’anthère à trois stades, soit avant (jour 0) et immédiatement après (jours 2 et 5) l'application d'un traitement de stress visant à induire la voie de l’androgenèse. Je me suis intéressé à deux catégories de gènes; soit les gènes exprimés exclusivement à un stade précis et les gènes exprimés différemment lors de l’initiation de l’androgenèse. J’ai pu identifier des gènes exprimés exclusivement dans la microspore au jour 0 (11), 2 (34) ou 5 (367). Au jour 5, j’ai constaté l’induction de nombreux gènes codant pour des FT et des gènes impliqués dans la synthèse ou la transduction du signal de nombreux régulateurs de croissance. L’analyse des gènes exprimés différemment m’a permis d’identifier certains processus métaboliques qui sont activés/réprimés lors du passage de la microspore du jour 0 au jour 2 et du jour 2 au jour 5. Les gènes exprimés exclusivement à un stade précis du développement pourraient servir de marqueurs moléculaires indicateurs de la performance en androgenèse pour optimiser les protocoles de culture. Ensuite, la DS a été étudiée par une approche de génotypage à l’échelle génomique. J’ai d’abord développé une méthodologie d’analyse génotypique novatrice, reproductible et précise pour étudier la fréquence allélique sur un échantillon en composite. Cette méthode m’a permis d’étudier la fréquence allélique chez 1) des échantillons de microspores (avant et après l’application d’un stress), 2) des embryons et 3) des plantes régénérées. J’ai montré que la DS survenait à la fois lors du développement des embryons et la régénération des plantes. Aucune DS n’a été observée chez les échantillons de microspores. Mes résultats montrent que la sélection engendrant la DS s’opère au cours de la culture in vitro. Toujours à l’aide de cette méthode de génotypage en composite, j’ai identifié et comparé la fréquence et l’étendue de la DS chez 12 populations de lignées haploïdes doublées (HD). Dans cette seule étude, un plus grand nombre de populations de lignées HD (12) ont été caractérisées que ce qui avait été fait dans la somme de toutes les études antérieures dans la littérature scientifique. Nous avons montré que les régions de distorsion de ségrégation différaient beaucoup quant à leur position, leur étendue et l’amplitude de la distorsion d’un croisement à l’autre. La connaissance de ces allèles permettrait de prédire le potentiel androgénique des génotypes dans un programme de sélection. Mes travaux de thèse élèvent à l’ère des «omics» la recherche chez la microspore d’orge dans le système de l’androgenèse. À une échelle sans précédent, mon étude transcriptomique explore et décrit les changements d’expression génique au cours de la transition développementale de la microspore. Mon étude génomique identifie quand s’exerce la sélection engendrant la distorsion de la ségrégation des allèles dans ce système et décrit quelles régions chromosomiques sont affectées par cette distorsion. À la lumière de mes résultats, dans le dernier chapitre, je propose certaines pistes de recherche pour poursuivre l’étude des mécanismes moléculaires dirigeant la transition développementale de la microspore en androgenèse et pour développer des outils de génotypage afin d’utiliser la DS comme un outil d’amélioration génétique.Androgenesis is a plant biotechnology used to fix the genetic background of plants in a single generation. This is based on the ability of an immature pollen grain, the microspore, to restore its totipotency, to dedifferentiate and then to engage in the path of embryogenesis. However, it is observed that the ability of the microspore to engage in embryogenesis is genetically variable. Despite the many desirable attributes of androgenesis, an undesirable side - effect is the segregation distortion (SD) encountered in populations resulting from this biotechnology. My thesis focuses on (i) the study of the transcriptome of microspores undergoing a developmental transition from the pollen - grain pathway towards embryogenesis and (ii) to identify when SD arises in the process and in which genomic regions it occurs. I used barley as a model species for my studies. Transcriptomic analysis was performed on microspores isolated from anthers at three stages corresponding to the microspore before (day 0) and immediately after (days 2 and 5) the application of a stress treatment aimed at inducing embryogenesis. I was interested in two categories of genes: those expressed exclusively at a specific stage of microspore development and those that were differentially expressed during the initiation of androgenesis. I was able to identify genes expressed exclusively in the microspore on day 0 (11), 2 (34) or 5 (367). On day 5, I found the induction of many genes encoding transcription factors (T Fs) in addition to genes involved in the synthesis or signal transduction of many growth regulators. The analysis of differentially expressed genes allowed me to identify certain metabolic processes that were activated/repressed during microspore development from day 0 to 2 and from day 2 to 5. Genes expressed exclusively at a specific stage of development could serve as molecular markers indicative of the performance in androgenesis to optimize isolated microspore culture protocols. Then, SD was studied using a whole - genome genotyping approach. I first developed an innovative, reproducible and accurate genotypic analysis methodology to determine allelic frequency on pooled samples. This method was then used to estimate allelic frequencies in samples of microspores (before and after the application of stress), embryos and regenerated plants. I showed that SD arises during both the development of embryos and the regeneration of plants. No SD was observed in samples of microspores. My results show that the selective forces promoting SD act during in vitro culture. Still using the same genotyping method performed on pooled samples, I identified and compared the frequency and extent of SD in 12 populations of doubled haploid lines (DH). A greater number of DH (12) populations were characterized in my study alone than the sum of all previous studies in barley. I showed that segregation distortion regions greatly differ in their position, extent, and magnitude in different DH populations. Knowledge of these alleles would be useful to predict the androgenic potential of a genotype in a breeding program. My dissertation has allowed research into barley microspores, or more widely androgenesis, to enter into the “omics” era. On an unprecedented scale, my transcriptomic study explores and describes the gene expression changes that occur during the developmental transition that the microspore undergoes in the course of androgenesis. My genomic study identifies when the selection (producing SD) arises in this system and describes which chromosomal regions are affected by this distortion. In light of my findings, in the final chapter I propose some lines of research to further study the molecular mechanisms driving the developmental transition from microspores to embryos and to develop genotyping tools to use SD as a genetic improvement tool.
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Kovacevic, Dragan. "Phototransformation de la protochlorophyllide en chlorophyllide et les effets des facteurs externes chez des feuilles d'orge étiolées /." Montréal : Université du Québec à Montréal, 2005. http://accesbib.uqam.ca/cgi-bin/bduqam/transit.pl?&noMan=24249680.
Full text
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Arabi, Mohamad Imad Eddin. "Amélioration de la résistance génétique de l'orge à Drechslera teres (Sacc. ) Shoem. Par hybridation et mutation." Toulouse, INPT, 1991. http://www.theses.fr/1991INPT003A.
Full textAbstract:
La variation du pathogenicite des souches de drechslera teres f. Maculata (s) et d. Teres f. Teres f. Teres (r) a ete evaluee. Les cultivars issus du proche-orient (arrivate, 79-s10-10) et la lignee ethiopienne ci-5791 sont resistantes a toutes les souches excepte r5 et s5. Le comportement des cultivars a l'encontre des deux formes du pathogene est correle positivement. Une technique de disque foliaire est developpee. La resistance au d. Teres dans des croisements reciproques entre neuf genotypes d'orge est determinee par les tests de jeune plantule, plante adulte ainsi que la technique de disque foliaire. Les analyse dialleles montrent une aptitude generale et specifique a la combinaison (agc, asc) elevee avec l'absence d'un effet maternel. Nous avons determine l'agc et l'asc pour le rendement, le pourcentage de proteines, le poids de 1000 grains, le rendement proteique et non proteique des plantes saines et attaquees par d. Teres. Les resultats montrent une variabilite genetique elevee pour les caracteres etudies; le rendement non proteique et le poids 1000 grains sont significativement diminues chez les plantes inoculees, alors que le rendement proteique n'est- pas influence. Les valeurs de l'agc et de l'asc sont significatement modifiees dans quelques cas en presence du d. Teres. Les plantes haploides doublees (hd) sont obtenues et utilisees comme production rapide de recombinants d'orge resistants au d. Teres. Plusieurs lignees hd sont selectionnees et leur gain genetique est evalue. Des semences d'orge irradiees par rayonnments gamma (#6#0co), montrent que les doses 15 et 20 gy diminuent la sensibilite de l'orge ua d. Ters f. Maculata. Une selection pour la resistance a ce pathogene est faite dans la population m2 et des mutants m4 tolerants et presentant plusieurs caracteres agronomiques modifies sont testes
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Cregut, Mickaël Benizri Emile Piutti Séverine. "Caractérisation de la communauté bactérienne impliquée dans la minéralisation du soufre organique dans les rhizosphères de colza et d'orge." S. l. : S. n, 2009. http://www.scd.inpl-nancy.fr/theses/2009_CREGUT_M.pdf.
Full text
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Moniod, Olivier. "Etude d'une étape du maltage des grains d'orge conduisant à leur germination : la trempe, son influence sur les activités amylasiques et la présence de composés de type phénolamidique." Dijon, 1987. http://www.theses.fr/1987DIJOS013.
Full textAbstract:
Etude de la possibilité de malter des grains d'orge dormants. Un système de trempe expérimentale permet d'obtenir des conditions proches de celles requises en malterie industrielle. Ce système de trempe améliore la germination des grains d'orge, par rapport aux tests de germination traditionnels en boite de petri. GA3 ne peut cependant pas provoquer la germination de tous les grains du lot dormant, lors de leur trempe. Les activités amylasiques, notamment alpha-amylasiques, des grains d'orge dormants sont promues de façon très sensible, à l'issue de la trempe dans l'eau distillée, et plus encore dans GA3 à une certaine dose. Le développement des activités alpha-amylasiques des grains d'orge dormants peut alors devenir supérieur à celui des grains d'orge non dormants. L'étude de la composition en diverses substances des extraits phenolamidiques des grains d'orge dormants et non dormants et de leurs eaux de trempe, conduit a envisager la possibilite d'un marquage de la dormance des grains d'orge par certains de ces composes. Parmi eux, les composes "x" et "e" ont deja servi a l'elaboration d'un marquage de la dormance des semences de certaines lignees de petunia. La teneur en "x" et "e" des grains d'orge, evolue au cours de leur trempe, differemment selon qu'ils sont dormants ou non. Le metabolisme de ces composes, sensible a ga3, semble etre lie a la dormance et aux metabolismes contemporains de la germination. La possibilite d'une action directe ou indirecte de ces composes sur la germination, sur la dormance et sur l'evolution des activites amylasiques, est discutee. Le compose "x", extrait des grains d'orge, semble etre de meme nature que celui extrait des semences dormantes de petunia. Sa masse avoisinerait 1000 daltons. Il est constitue d'une partie phenolique liee au tryptophanamide, et d'une troisieme composante qui n'est pas encore identifiee, et qui pourrait conferer au compose "x" sa solubilite dans l'eau. En outre, ce compose presenterait un groupement carboxylique. C'est la première fois que la présence du tryptophanamide est signalée chez les végétaux supérieurs.
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Nguyen, Van Cuong. "Exploration de la cartographie par analyse d'association («Association Mapping») chez l'orge (Hordeum vulgare L.)." Thesis, Université Laval, 2012. http://www.theses.ulaval.ca/2012/29300/29300.pdf.
Full text
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Esteves, Patricio. "Optimisation de la culture de microspores isolées chez les orges de printemps à six rangs." Thesis, Université Laval, 2014. http://www.theses.ulaval.ca/2014/30476/30476.pdf.
Full textAbstract:
Les plantes haploïdes doublées (HD) sont des individus complètement homozygotes qui peuvent être obtenus via l’androgenèse in vitro. Les HD sont très appréciés comme outils de recherche en génétique et en amélioration végétale. La culture de microspores isolées (CMI) est le moyen le plus efficace de produire des HD. Malheureusement, les orges de printemps à six rangs, le type prédominant cultivé dans l’Est du Canada, sont considérées comme récalcitrantes à cause d’une faible embryogenèse et d’une propension à l’albinisme. Notre objectif était de développer un protocole CMI adapté à ce type d’orge. Nous avons entamé des travaux exploratoires sur quatre cultivars : ACCA et Léger (six rangs, printemps), Gobernadora (deux rangs, printemps) et Igri (deux rangs, hiver). Dans une première phase, nous avons évalué l’impact de quatre facteurs physiques. Nous avons trouvé que l’optimisation du stade de récolte des tiges pouvait augmenter de 2 à 4 fois la récolte de microspores embryogéniques. Deuxièmement, deux des prétraitements (0,3 M mannitol pendant 2 jours et une combinaison de froid et de chaleur pendant 15 jours) ont tous deux été significativement plus productifs qu’un prétraitement très largement employé (28 jours à 4 °C). Troisièmement, l’ajout de mannitol au milieu d’induction a permis de doubler le nombre de plantes vertes obtenues. Finalement, la densité des microspores à l’étalement a eu un impact significatif sur l’obtention de plantes vertes, 106 microspores/ml s’étant avéré optimal. Dans une deuxième phase, nous avons exploré l’utilisation de régulateurs de croissance alternatifs tant dans le milieu d’induction (thidiazuron et dicamba) que de régénération (meta-topoline). Comparativement à des milieux témoins contenant principalement la 6-benzyl-aminopurine, nos milieux d’induction ont produit 5,1 fois plus de plantes vertes, principalement par réduction de l’albinisme. Notre milieu de régénération amélioré a permis d’obtenir 2,9 fois plus de plantes vertes que le témoin. Finalement, ces résultats ont été validés avec succès sur des génotypes F1 d’un programme d’amélioration. Au terme de ce travail, nous avons ainsi réussi à améliorer substantiellement l’efficacité de la CMI chez les orges de printemps à six rangs.Doubled haploid (DH) plants are completely homozygous individuals that can be generated via in vitro androgenesis. DHs are useful as research tools both for genetic studies and in plant breeding. Isolated microspore culture (IMC) is the most efficient way to produce DHs. Unfortunately, six-row spring barley genotypes, the main type produced in Eastern Canada, are considered recalcitrant because of a low embryogenesis and a high rate of albinism. Our objective was to develop an IMC protocol more suitable to this type of barley. We carried out exploratory work on four barley cultivars: ACCA and Léger (six-row, spring), Gobernadora (two-row, spring) and Igri (two-row, winter). In a first phase, we explored four factors. First, we found that a 2-4-fold increase in the yield of embryogenic microspores is possible by optimizing the harvest stage for each genotype. Second, two pretreatments (0.3M mannitol for 2 days or a combination of cold and heat over 15 days) both performed significantly better than the commonly used cold pretreatment (28 days at 4°C). Third, an induction medium containing mannitol doubled green plant regeneration. Fourth, we observed a marked effect of microspore plating density on the number of green plants obtained, with 106 microspores/ml yielding the best results. In a second phase we explored the use of alternative growth regulators both in the induction medium (thidiazuron and dicamba) and in the regeneration medium (meta-topoline). Compared to control media containing 6-benzyl-aminopurine, our improved induction medium lead to a 5.1-fold increase in green plant production, mainly achieved by reducing albinism. Similarly, our regeneration medium yielded 2.9-fold more green plants than the control. Finally, these results were successfully validated using F1 genotypes from a breeding program. On the whole, we have succeeded in substantially improving the efficiency of IMC in this type of recalcitrant barley.
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Barrault, Gérard. "L'helminthosporiose de l'orge causée par Dreschlera teres." Toulouse, INPT, 1989. http://www.theses.fr/1989INPT010A.
Full textAbstract:
Apres avoir presente l'orge et le pathogene, nous avons conduit une etude analytique et evolutive des symptomes causes par les deux formes du pathogene (maculata et teres) et montre que leur morphologie differente est en relation avec la localisation du mycelium du parasite. La forme maculata determine des symptomes tres polymorphes susceptibles d'etre confondus avec d'autres pathogenes dont certains ont ete decrits pour la premiere fois en france. Par ailleurs, l'etude biologique fait ressortir que ces deux formes ont les memes exigences a l'egard d'un certain nombre de facteurs abiotiques (t#o, ph, lumiere, humidite) et qu'il n'y a a pas d'antagonisme entre celles-ci. Ces resultats ne sauraient donc expliquer leur importance et leur repartition geographique differentes. Apres avoir precise les facteurs qui concourent a l'optimisation de la biosynthese du complexe toxique, nous avons montre que les phytotoxines sont largement impliquees dans l'expression des composantes du symptome mais qu'elles ne semblent pas responsables du pouvoir pathogene. Ensuite l'etude de la sensibilite des differents cultivars d'orge a la maladie a revele que la plupart de ceux cultives en france sont sensibles a tres sensibles. Les principaux geniteurs de resistance proviennent des centre d'origine de l'orge cultivee. Enfin une etude qualitative et quantitative des differents facteurs agissant sur les diverses formes du pathogene (impliquees dans les sequences de l'epidemie) a ete realisee. Elle permet de mettre en exergue l'importance des pailles d'orge dans l'exteriorisation des formes de conservation et de dissemination, de mieux comprendre le developpement de la maladie a l'echelon de la parcelle, et d'entrevoir une modelisation de celui-ci dans le cadre d'une lutte rationnelle
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El, Id Zibo. "Nouvelle méthode de détection de l'Helminthosporium Teres Sacc. Sur semences d'orge et ses applications." Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 1990. http://www.theses.fr/1990INPL108N.
Full textAbstract:
Helminthosporium teres Sacc. , forme conidienne de Pyrenophora teres Drechs. , agent fongique d'une maladie foliaire de l'orge, est présent dans toutes les régions tempérées et humides du monde. Les méthodes habituelles de détection du parasite sur semences d'orge sont nombreuses. Elles présentent, cependant, un certain nombre d'inconvénients selon les techniques utilisées. Ces défauts sont détaillés et développés dans des études expérimentales. Ils sont, par la suite, corrigés, du moins en partie, par la nouvelle méthode que nous avons mise au point dite "des cloches", qui favorise l'expression du pathogène. Cette nouvelle technique, employée telle quelle ou après une légère modification, favorise, également, la mise en évidence d'autres parasites transmis par des semences d'orge et de blé, à savoir : Helminthosporium gramineum sur semences d'orge, Fusarium roseum sur semence de blé, Septoria nodorum sur semences de blé. La méthode est aussi utilisée avec succès dans les domaines suivants : - tester l'efficacité de certains fongicides systèmiques vis-à-vis de l'Helminthosporium teres, et l'effet de ces produits sur le développement de jeunes plantules d'orge ; - étudier l'effet d'un saprophyte "Penicillium" sur l'évolution des symptômes provoqués par Fusarium roseum sur semences et jeunes plantules de blé
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Ajandouz, El Hassan. "Mode d'action des alpha-amylases d'orge et de pancréas de porc sur les substrats nitrophényles. Détermination des énergies de fixation des résidus de glucose aux sous-sites du centre actif." Aix-Marseille 3, 1993. http://www.theses.fr/1993AIX30059.
Full textAbstract:
L'alpha-amylase est une endoglycanase de la classe des hydrolases. Largement representee chez les animaux, chez les vegetaux et chez les micro-organismes, elle catalyse l'hydrolyse de l'amidon et du glycogene. Bien que les alpha-amylases de differentes origines ont tres peu de sequences d'acides amines identiques, leur structure tridimensionnelle et l'organisation de leur site actif sont similaires. Leur chaine polypeptidique est organisee en trois domaines, dont l'un (domaine a) forme un tonneau de huit segments beta entoures par huit helices alpha. Leurs sites actifs sont constitues d'un ensemble de sous-sites pouvant accueillir chacun un residu glucose et dont le nombre varie selon l'origine de l'enzyme. Trois formes enzymatiques de l'amylase d'orge d'une part et deux formes enzymatiques de l'amylase pancreatique de porc d'autre part ont ete etudiees. Les produits d'hydrolyse d'oligosaccharides nitrophenyles de differentes longueurs (2 a 7 residus glucose) ont ete analyses par chromatographie (hplc). Les frequences des produits et les efficacites catalytiques des differentes formes enzymatiques, determinees dans des conditions ou les reactions bimoleculaires sont negligeables, ont finalement ete determinees, elles nous ont permis de calculer les energies d'interaction de diverses paires de substrats et par difference, de calculer l'energie d'interaction des divers sous-sites. Dix sous-sites sont detectes chez les trois formes enzymatiques de l'amylase d'orge dont l'un (sous-site catalytique) a une energie defavorable a la fixation. Les deux formes de l'amylase pancreatique de porc contiennent cinq sous-sites a energies favorables entoures de part et d'autre par deux sous-sites a energie defavorable
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Sanvicente, Patricia. "Incidence de l'adjonction d'imazaquine à des substances de croissance sur la morphogenèse et la nutrition azotée de l'orge d'hiver (Hordeum Vulgare L. ) : conséquences sur la production et la qualité des grains." Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 1999. http://www.theses.fr/1999INPL035N.
Full textAbstract:
Des orges d'hiver de la variété Plaisant et Labéa sont cultivées en pot et au champ afin de mettre en évidence le rôle de l'imazaquine dans l'association chlorméquat chlorure-éthéphon (= Concord®), tant au niveau morphologique et physiologique qu'au plan agronomique. Les substances de croissance marquées au 14C sont appliquées sur la sixième feuille du maître-brin afin d'étudier l'absorption de l'éthéphon en présence et en absence d'imazaquine. Durant les 24 heures qui suivent le traitement, la pénétration de 1'éthéphon, dans la feuille, est réduite en' présence d'imazaquine. L'application au stade "2 noeuds" de Concord et Ranfor réduit la longueur des trois entre nœuds supérieurs et plus particulièrement celle de la hampe; elle provoque aussi une augmentation de la densité de la partie médiane de la tige. Des modifications de diamètre du système vasculaire sont notées, sans conséquence sur le transfert des assimilats vers les grains et sans effet sur le rendement. Ranfor et Concord sont susceptibles de modifier la cinétique de prélèvement et de remobilisation de l'azote. Toutefois, ces modifications n'altèrent pas la teneur en protéines des grains.
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Hanifi, Leïla. "Contribution à l'étude de l'hétérosis et de l'interêt des F1, F2 et lignées haploïdes doublées chez l'orge." Lille 1, 1999. https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/Th_Num/1999/50376-1999-465.pdf.
Full textAbstract:
Différents aspects de la production des HD par la méthode bulbosum, de la génétique des hordéines et de l'hétérosis chez l'orge (Hordeum vulgare) ont été abordés, mais parmi ces trois thèmes, l'hétérosis en est le principal, et il est vu sous l'angle de l'amplitude et de la prédiction. L'étude des facteurs de production des HD a montré l'influence des génotypes d'H. Vulgare et d'H. Bulbosum sur les taux de nouaison et d'embryons. La période optimale de pollinisation va du 10 au 30 avril. Les analyses caryologiques effectuées vérifient l'état haploïde et haploïde double de notre matériel végétal. L'étude comparée des profils polypeptidiques en SDS-PAGE de 46 grains F2 et de grains 40 HD (cv Motan x CM 67) montre que l'allèle du locus Hor 1 est identique chez les deux parents et leurs descendants, que les allèles des loci Hor 2 et Hor 3 sont différents, indépendants, et ne sont pas sélectionnés par la technique bulbosum. Quant à l'hétérosis, onze caractères sont évalués au champ sur un croisement diallèle 8 x 8. L'hétérosis moyen est faible pour les caractères agronomiques au niveau de la plante. Par contre au niveau du maître-brin, il apparaît bien une vigueur hybride pour le rendement en grain (13%) et ses composantes. Des croisements hétérotiques pour le rendement en grain et en paille sont observés avec une influence de la distance génétique entre parents. Cependant, l'hétérosis économique est très faible pour les principaux caractères agronomiques (3% pour le rendement en grain). Les analyses de Griffing, Hayman et l'étude des corrélations montrent une forte additivité pour différents caractères. Pour un croisement étudié, il apparaît que les lignées HD peuvent être un moyen rapide d'obtention de lignées aussi bonnes que la F1 pour la plupart des caractères. Les tests au niveau des lignées HD montrent un effet d'épistasie pour de nombreux caractères liés au rendement. Des effets de compétition sont aussi apparus dans tous les tests impliquant la F2.
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Ribot, Pascale. "Déterminisme physiologique et génétique de la protéogénèse en vue de la sélection d'orges de qualité (Hordeum vulgare L. )." Toulouse, INPT, 1990. http://www.theses.fr/1990INPT017A.
Full textAbstract:
L'etude des facteurs physiologiques de la proteogenese, de la composition proteique des grains et de la structure de la plante conditionne la selection d'orges productives de qualite. Le determinisme genetique de ces caracteres est apprecie par des croisements dialleles en f1, et leur cinetique etablie de la floraison a la maturite. Les criteres morphologiques ont un determinisme surtout additif. Une croissance tardive et importante des entre-nuds superieurs est liee a la productivite. La photosynthese nette presente de la dominance et des interactions non-alleliques, tandis que la surface foliaire et sa duree de vie ont une additivite preponderante. Ces caracteres antagonistes sont lies a la teneur en proteines, mais leur produit l'est au rendement. Les rendements en grains et azotes ont des determinismes genetiques semblables (forte dominance, interactions non-alleliques), alors que la teneur en proteines a une additivite elevee. La vitesse de remobilisation et de senescence foliaire (eau, contenu en azote) est differente selon les varietes. La selection d'orges fourrageres riches en proteines requiert l'accumulation d'alleles recessifs. Cette richesse est liee a une synthese precoce abondante d'albumines. Les orges de brasseries au contraire doivent privilegier l'accumulation d'amidon par rapport aux proteines de reserve. La quantite d'azote des tiges a floraison va dans ce sens. Un deficit precoce d'hordeines chez bomi 1508 retentit sur la production d'amidon, tandis qu'un deficit tardif chez karl par l'absence d'effet sur l'amidon lui donne une faible teneur en proteines
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Sangaré, Mahamadou. "Optimisation de la culture d'anthères chez l'orge de printemps à six rangs (Hordeum vulgare)." Thesis, Université Laval, 2008. http://www.theses.ulaval.ca/2008/25691/25691.pdf.
Full textAbstract:
Huit régimes hormonaux ont été comparés en culture d’anthères chez deux génotypes d’orge de printemps à six rangs. Quatre paramètres ont été notés : le nombre de cals, d’embryons, de plantes vertes et d’albinos. L’analyse de la variance a montré que les génotypes (G), les traitements (T), le rang de récolte des épis (R) et l’interaction R x G avaient des impacts significatifs sur les paramètres à l’étude. Le génotype Altona s’est montré beaucoup plus prolifique que le génotype C97-21-38-3 (19,6 vs 1,3 plantes vertes par 100 anthères). Les traitements 3 (0,1 mg/L de BAP ; 0,1mg/L de 2,4-D) et 6 (0,3 mg/L de BAP ; 0,3 mg/L de 2,4-D) ont permis d’obtenir entre 2 et 3 fois plus de plantes vertes que les traitements témoins. Finalement, chez Altona, les deuxième et troisième épis ont produit significativement plus de plantes vertes, alors que chez C97-21-38-3 aucune différence n’a été observée.Eight hormonal regimes were compared in anther culture on two genotypes of six-row spring barley. Observations were made on four parameters: the number of calli, embryos, green plants and albinos. An analysis of variance showed that the genotype (G), the treatment (T), the harvest rank of the spike (R) and the R X G interaction all had significant impacts on the studied parameters. Altona proved much more productive in anther culture than C97-21-38-3 (19.6 vs 1.3 green plants per 100 anthers). Treatments 3 (0.1 mg/L BAP; 0.1mg/L 2,4-D) and 6 (0.3 mg/L BAP; 0.3 mg/L 2,4-D) yielded between 2 and 3-fold more green plants than the control treatments. Finally, whereas the second and third spikes produced significantly more green plants than the first spike with Altona, no such difference was observed with C97-21-38-3.
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Mille, Bruno. "La rhynchosporiose de l'orge à Rhynchosporium secalis (Oud. ) DAVIS : élaboration de nouvelles stratégies de lutte, importance relative des différentes sources d'inoculum." Paris 11, 1989. http://www.theses.fr/1989PA112110.
Full textAbstract:
De nouvelles stratégies de lutte contre la rhynchosporiose de l'orge sont proposées et certaines caractéristiques épidémiologiques de l'agent pathogène Rhynchosporium secalis (Oud. ) Davis, notamment le rôle des semences, précisées en révélant directement la présence du champignon sur ces dernières, ou indirectement lors d'essais au champ. Une première méthode d'analyse, "classique", comprend une désinfection préalable des grains d'orge (éthanol, hypochlorite de sodium et solution antibactérienne et antifongique), avant leur dépôt sur un milieu électif ("orge") et sélectif (terramycine + iprodione + procymidone + 2,4 D). Son taux de réussite est toutefois relativement faible. La deuxième, par immunofluorescence, permet l'analyse de routine des lots de grains. Une plus grande spécificité des immunsérums est obtenue lors de protocoles d'immunisation complexes faisant intervenir des formes antigéniques différentes (spores, mycélium). Les essais de traitements chimiques des semences et de pulvérisations de produits antifongiques sur le sol permettent d'estimer l'importance relative des types d'inoculum "semence" et "sol". Ils démontrent également l'intérêt de telles interventions en tant que techniques culturales. Les mélanges de variétés enfin peuvent aussi constituer une stratégie limitant l'extension de la maladieNew cultural practices against barley scald disease were proposed and some epidemiological characteristics of the fungal pathogen Rhynchosporium secalis (Oud. ) Davis, especially importance of seeds, assessed both directly showing its presence and indirectly by field trials. The first analysis method, a "classical" one, associated barley seeds disinfection with ethanol, sodium hypochlorite and bactericidal and fungicidal solution, before placing them on the elective ("barley") and selective medium (terramycine + iprodione + procymidone + 2,4 D). But the experiments were not adequatly successful. The second method, immunofluorescence, allowed routine analysis of seeds samples. Moreover, a higher specificity of immunsera was obtained by complex immunization procedures including different antigenic forms. The chemical treatments of seeds and sprayings of fungicides on the soil that were tested allowed estimation of the comparative importance of "seeds" and "soil" inoculum. They also demonstrated that such applications can be useful as cultural techniques. Lastly, varietal mixtures can be used as a strategy to limit disease spreading in the crop
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Chain, Florian. "Caractérisation et analyse de la durabilité de la résistance de deux lignées de blé au virus PAV de la jaunisse nanissante de l'orge." Rennes, Agrocampus, 2005. http://www.theses.fr/2005ENSARC79.
Full textAbstract:
La jaunisse nanissante de l'orge (JNO) est une grave maladie des céréales causée par un complexe d'espèces virales (B/CYDV, Luteoviridae) transmis par pucerons sur le mode persistant et dont l'espèce BYDV-PAV est majoritaire en France. Afin de proposer une alternative à la stratégie de lutte actuelle basée sur des traitements aphicides, deux gènes de résistance provenant de Thinopyrum intermedium ont été introduits dans le blé pour obtenir les lignées Zhong Zh et TC 14. Leurs capacités à limiter la progression de l'infection d'isolats de BYDV-PAV ont été évaluées à l'aide d'essais de suivi d'infection. Elles présentent des caractéristiques de résistance partielle et pourraient altérer le transport à distance des particules virales dans la plante. Par ailleurs, leurs durabilités de résistance ont été analysées en conditions contrôlées. Une centaine de passages en série a permis de forcer la réplication d'un isolat de BYDV-PAV dans chacune des lignées. Les isolats issus de passages en hôte résistant contournent les résistances dès le passage 5 et induisent des dégâts plus importants que les isolats de référence sur hôtes résistants et sensibles. Les isolats issus des passages en série ont ensuite été testés en conditions naturelles afin de vérifier la stabilité de leurs propriétés. Les résultats de 3 années d'essais en champ confirment que les isolats issus de passages en série sur Zhong ZH ou sur TC14 induisent des pertes de rendement plus importantes que les isolats de référence. En conclusion les deux gènes peuvent être contournés. Néanmoins leur exploitation pour l'amélioration du blé contre la JNO peut être poursuivie. En effet, les conditions écologiques rencontrées par le virus dans la nature (alternance d'hôte obligatoire) diffèrent de celles des essais en laboratoire et pourraient ralentir le contournement. Enfin l'association des gènes dans une lignée permettrait d'obtenir une résistance plus forte et plus durable que celles qu'ils procurent pris isolémentBarley yellow dwarf disease (BYDD) is an important cereal disease caused by a complex of viruses (B/CYDV, Luteoviridae) aphid-transmitted in a persisten manner. The BYDV-PAV species based on aphicid treatments two resistance genes deriving fro mThinopyrum intermedium have been itrogressed in wheat to produce Zhong ZH and TC14 lines. Those lines have been evaluated for their ability to limit the infection progression of BYDV-PAV isolates by monitoring viral infection. Both lines show partial resistance properties and could interfere with mechanisms of viral particles in plant. In other respects, durabilities of resistance of these lines have been analysed in laboratory conditions. A hundred serial passages enables a forced replication of one BYDV-PAV isolate in each line. Isolates resulting from passages on resistant hosts overcame partial resistance at passge 5 and induced increased damages when compared to reference isolates, both on susceptible and resistant hosts. These isolates have then been tested in natural conditions to assess the stability of these propoerties. Resuslts from a three-year field trial indicate that isolates issued from passages on Zhong ZH or on TC14 induce more severe yield losses than reference isolates. As a conclusion both resistance genes may be overcome. However their use in wheat breeding against BYDD may be pursued. Indeed, ecological conditions encountered by the virus in nature (obligatory host change) differ from those on the laboratory and could prevent the overcoming. Finally the association of both genes in one line could enable to obtaining of a stronger and more durable resistance than those they individually provide
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Kandil, Mostafa. "Hérédité épigénique de vitro-variants obtenus par haplodiploïdisation chez l'Orge (Hordeum Vulgare) : analyse des croisements diallèles et de leurs descendances par autofécondation." Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 1990. http://www.theses.fr/1990INPL058N.
Full textAbstract:
Ce travail porte sur les impacts de l'haploïdisation par culture in vitro androgenèse et gynogenèse chez Hordeum Vulgare. Après quatre générations d'autofécondation des haplodiploïdes variants et du témoin, Les études biométriques du végétal et les analyses biochimiques du grain, montrent que la variabilité observée, après culture in vitro, est transmise d'une génération à l'autre de façon stable génétiquement. Après croisement diallèle, entre haplodiploïdes et avec le témoin, les données biométriques sont traitées par le modèle de GRIFFING. Outre les forts effets d'AGC, exprimant la transmissibilité héréditaire des caractères marquants, il apparait des effets d'intéraction très nets dans certains cas (ASC significative). Par ailleurs il faut signaler des dissymétries de transmission, ARG et ARS significatives. Les comparaisons des moyennes amènent à des effets maternels, paternels et de transgression. Cette étude est suivie de l'autofécondation des produits de croisements. L'homogénéité génétique de ces descendances permet d'éliminer toute hypothèse d'hétérozygotie due à une double mutation chez les parents variants. Cet ensemble amène à proposer l'intervention d'un système héréditaire, dit épigènique qui ne ségrégue pas. La dernière partie fait l'objet de l'application de notions relatives à la variabilité liée à la culture in vitro, dans le cadre d'une contribution à la création in vitro d'Orge (marocaines) résistantes au sel en exerçant des pressions de sélection par le chlorure de sodium sur des cals issues de culture du gamétophyte mâle
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Desseaux, Véronique. "Structure et fonction des [alpha]-amylases de porc et d'orge : étude par protéolyse limitée et action des anticorps polyclonaux." Aix-Marseille 3, 1991. http://www.theses.fr/1991AIX30036.
Full textAbstract:
Les alpha-amylases catalysent l'hydrolyse des liaisons alpha-1,4 internes de l'amidon et de ses derives. Nous nous sommes attaches a comprendre les evenements moleculaires qui precedent (attachement, introduction dans le site catalytique), et suivent l'hydrolyse proprement dite. La structure de l'amylase de porc est connue a 2-2,9 a de resolution. Cette molecule (55 kd) comprend un corps central ab(tonneau) et un petit domaine c distinct. Le tonneau contient le site catalytique. Le domaine c participe avec (a) a un 2eme site de fixation du substrat (site surface). Notre but a ete d'etudier le role du site surface et du domaine c dans l'action amylolytique. Nous avons utilise 3 approches: 1) l'etude de la vitesse d'hydrolyse du p. Nitrophenylmaltoside en fonction du ph; 2) la proteolyse; 3) l'effet des anticorps sur l'activite enzymatique. Nos resultats sont en faveur de la participation de residus carboxylates au site catalytique. L'amylase d'orge est plus resistante a la proteolyse que l'amylase de porc. La coupure proteolytique ne se fait pas a la charniere comme attendu mais sur la derniere boucle du tonneau. La proteolyse provoque une perte d'activite et les fragments separes sont inactifs. Des anticorps anti-domaine c et anti-ppa ont ete purifies. Les anti-ppa inhibent l'hydrolyse des longs substrats tandis que l'hydrolyse du p. Nitrophenylmaltose n'est pas inhibee. Notre conclusion est que l'attaque proteolytique peut modifier l'environnement du site surface et la structure du centre actif. L'inhibition par les anticorps indique l'importance du site surface dans l'hydrolyse des chaines polyglucosidiques devant se fixer avant de se positionner correctement au centre actif. Cette etude montre egalement que les deux domaines aba et c sont fortement lies
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Caredda, Stéphane. "Androgénèse et Albinisme chez l'Orge (Hordeum vulgare L. )." Reims, 2000. http://www.theses.fr/2000REIMS008.
Full textAbstract:
L'androgénèse est une technique permettant de produire des lignées haploi͏̈des doublées à partir de microspores initialement destinées à produire des grains de pollen. Chez l'orge (Hordeum vulgare L. ), cette technique induit la régénération de plantules albinos en proportion importante constituant un frein à son exploitation industrielle. Notre étude à reposé sur un double objectif fondamental et appliqué, visant 1/ à comprendre les mécanismes gouvvernant la formation de plantules albinos en s'intéressant principalement à la structure des plastes et 2/ à optimiser le pourcentage de plantules androgénétiques chlorophyliennes chez le cv. D'hiver modèle Igri et chez 5 cvs. De printemps. Ce travail est basé sur la comparaison du déroulement de l'androgénèse entre le cultivar d'hiver Igri régénérant principalement des plantules chlorophyliennes et le cultivar de printemps Cork ne donnant que des plantules albinos. Au stade de prélèvement des anthères 15,3±2,7% des plastes des microspores du cv. D'hiver Igri contiennet encore de l'ADN contre 1,7±0,47% pour le cv. De printemps Cork. Après la phase de prétraitement et durant la phase d'induction, cette différence se retrouve au plan structural. Les plastes des embryons du cv. Igri suivent une voie de différenciation en chloroplastes alors que ceux du cv. Cork accumulent simplement de l'amidon en grande quantité, des plastoglobules et des corps prolamellaires. Le cv. Igri fournit une majorité de plantules (108,7 plantules régénérées pour 100 anthères répondantes) avec un G/A égal à 9,4. Le cv. Cork fournit le même nombre de plantules androgénétiques qui sont albinos à 99,7%. Il ressort de cette étude que le programme plastidial des microspores des 2 cvs. Est différent dès le stade de prélèvement des anthères. La phase de prétraitement réoriente bien le programme nucléaire des 2 cvs. Vers un programme sporophytique. Par contre, seul le génome plastidial des cvs. De printemps ne semble pas, dans nos conditions de culture, pouvoir se réorienter vers un programme chlorophylien. Le prétraitement est plus important que la phase d'induction quant à la production de plantules chlorophyliennes. Un prétraitement au mannitol (3,2%) à 4°C durant 3 jours (au lieu d'un prétraitement parle froid à 4°C durant 28 jours. )
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Schalk, Catherine. "Mise en évidence de nouveaux marqueurs de qualité de l'orge brassicole par électrophorèse bidimensionnelle des protéines." Strasbourg 1, 2005. http://www.theses.fr/2005STR13228.
Full textAbstract:
Dans le but de mettre en évidence des marqueurs de la qualité brassicole des orges, une étude comparative par électrophorèse bidimensionnelle des protéines a été réalisée sur 25 cultivars d’orge. Les profils électrophorétiques des grains crus et maltés ont été comparés sur deux plans : entre des cultivars de bonne et de mauvaise qualité brassicole et entre des cultivars liés par croisement génétique. L’étude a également impliqué l’analyse de grains d’orge traités par des phytohormones au cours de leur maltage. Au total, 276 spots se sont révélés variables dans l’ensemble de ces comparaisons, dont 89 présentent une récurrence forte. Sur la base des profils électrophorétiques et de données bibliographiques et brassicoles, quatre protéines et trois familles de protéines ont été sélectionnées pour que leur lien avec la qualité soit validé par un crible immunochimique sur un nouveau pool de 100 cultivars et par des études in planta réalisées grâce à la transgénèse de l’orgeIn order to reveal malting quality markers for barley, a two-dimensional electrophoresis comparative study has been carried out on 25 cultivars. The electrophoretical patterns of barley and malt have been compared on two levels: between cultivars of good and bad malting quality and between cross breeding related cultivars. This study has also integrated the analysis of barley malted in the presence of phytohormones. Finally, considering all comparisons together, 276 spots have shown variations in their intensities and 89 among them are strongly recurrent. On the basis of these electrophoretical patterns and of litteratural and brewing knowledges, four proteins and three protein families have been selected in order to confirm their link with quality using an immunological screening of a new set of 100 cultivars and in planta studies by barley transformation
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Robert, Xavier. "Etude cristallographique et fonctionnelle des isoenzymes de l'α-amylase d'orge : leurs structures 3D en action révèlent des modes distincts de reconnaissance des polysaccharides et de nouvelles molécules inhibitrices." Lyon 1, 2002. http://www.theses.fr/2002LYO10059.
Full textAbstract:
Le grain d'orge contient deux isoenzymes de la famille des alpha-amylases (AMY1 et AMY2) qui sont impliqués dans la dégradation de l'amidon nécessaire à la croissance de l'embryon de plante. La structure tridimensionnelle de AMY2 (résolue par cristallographie et diffraction des rayons X) est connue dans son état natif, mais aussi en complexe, d'une part avec l'acarbose (un pseudo-tétrasaccharide inhibiteur) et d'autre part avec l'inhibiteur protéique bifonctionnel endogène BASI. Malgré leur très grande similitude de séquence, AMY1 et AMY2 se distinguent à plusieurs niveaux : point isoélectrique, stabilité à pH acide ou à haute température, affinité pour les ions calcium et pour les substrats solubles, efficacité différente pour l'hydrolyse des granules d'amidon. Enfin, seul AMY2 est inhibé par BASI. Cette étude présente la structure native de AMY1, résolue par cristallographie, et l'analyse comparée des deux isoenzymes, en vue d'expliquer leurs remarquables différences de propriétés. La résolution des structures des complexes avec l'acarbose et des analogues de substrat fournit également des informations sur les mécanismes d'hydrolyse et d'inhibition de AMY1. De plus, la structure d'un complexe entre AMY1 et un substrat naturel (maltoheptaose) nous a permis d'étudier en détail les différents sous-sites de fixation du substrat à l'enzyme et d'identifier un nouveau site de surface pouvant lier des polysaccharides. Ce site, présent uniquement chez AMY1, révèle pour la première fois, le rôle du domaine C d'une alpha-amylase. Enfin, la découverte d'une nouvelle classe potentielle d'inhibiteurs de glycosidases de type polyamine est présentée. Un complexe AMY1/spermidine a montré que la polyamine se fixait préférentiellement dans le site actif, même en présence d'acarbose. Cette propriété semble pouvoir s'étendre à d'autres alpha-amylases (notamment humaine) et servir de base à la conception de nouveaux inhibiteurs à visées thérapeutiques.
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Gilabert, Aude. "Caractérisation des populations de Rhopalosiphum padi à deux échelles géographiques : Application à la prévision des risques dus à la Jaunisse Nanissante de l’orge (JNO)." Rennes, Agrocampus Ouest, 2009. http://www.theses.fr/2009NSARA066.
Full textAbstract:
La lutte intégrée contre les ravageurs vecteurs de virus nécessite de connaître l’écologie de ces organisms. La jaunisse nanisante de l’orge (JNO), prncipale maladie virale des céréales, est essentiellement transmise par le puceron Rhopalosiphum padi en automne. Les objectifs de cette thèse sont d’étudier les aspects de la biologie et de l’écologie de R. Padi pouvant influencer l’épidémiologie de la JNO aux échelles régionale et paysagère Ce puceron à parthénogénèse cyclique. Plusieurs types de lignées investissant à divers degrés dans la reproduction sexuée coexistent et sont sélectionnées par le climat hivernal. A l’automne, les lignées « sexuées » investissent uniquement dans la reproductino sexuée qui a lieu sur le merisier à grappe, et ne contribuent pas à l’épidémiologie de la maladie. A l’inverse, les lignées « essentiellement asexuées » peuvent se reproduire partiellement ou totalement par parthénogénèse sur différentes plantes hôtes de la famille des Poaceae. La contribution relative de deux types de lignée varie avec le climat de l’hiver précédent. Nos analyses mettent en évidence la prédominance des lignées « essentiellement asexuées » dans la motié nord de la France et parmi ces lignées, de quelques génotypes particulièrement abondants.
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Singla, Sabine. "Contribution à l'étude de l'interaction hôte-parasite : Hordeum vulgare L. - Drechslera teres (Sacc.) Shoemaker." Toulouse, INPT, 1986. http://www.theses.fr/1986INPT015A.
Full textAbstract:
Des observations relatives à la complexité de la symptomatologie et à l'existence d'une sensibilité variétale différentielle ont débouché sur la nécessité d'une étude en microscopie photonique de l'interaction Hordeum vulgare-Drechslera teres. Cette étude cinétique menée comparativement sur plantes sensibles et résistantes en utilisant des souches agressives isolées à partir de deux types de facies nécrotiques, ont mis en évidence la relation entre, d'une part la localisation du parasite, la nature des modifications histologiques, le développement des structures infectieuses et, d'autre part, la forme et l'intensité de l'expression symptomatique
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Gojon, Alain. "Étude de la contribution des racines à la réduction des nitrates." Montpellier 2, 1987. http://www.theses.fr/1987MON20049.
Full textAbstract:
La contribution des racines a la reduction du nitrate par de jeunes plantes de mais et d'orge est etudiee au moyen de marquage **(15)n et de mesures de l'activite de la nitrate reductase. Les resultats indiquent que les racines sont le siege principal de la reduction du nitrate au cours de la periode d'induction de la nitrate reductase. Au contraire, lorsque cette induction est achevee, le role des racines devient minoritaire. La contribution des racines a l'assimilation du nitrate par la plante semble augmentee lorsque l'ammonium est absent du milieu nutritif, ou lorsque ce dernier ne contient qu'une faible concentration de nitrate. Dans ce dernier cas, c'est la freinage de l'exportation du nitrate vers les parties aeriennes qui semble limiter leur assimilation. La mesure de l'intensite de cette limitation de la reduction dans les parties aeriennes par le flux de nitrate qui leur parvient peut donc constituer une approche interessante pour caracteriser la disponibilite du nitrate dans le milieu, et la contribution des racines a son assimilation par la plante
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Devaux, Pierre. "Les plantes haploïdes chez l'orge, avec extension au blé : méthodes d'obtention et relations avec l'organisation de leur génome." Lille 1, 1998. https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/Th_Num/1998/50376-1998-153.pdf.
Full textAbstract:
Notre recherche a ete realisee sur les haploides doubles d'orge et, dans une moindre mesure, sur ceux du ble tendre. Pour assurer la production reguliere de plantes haploides doublees d'orge a partir d'un fond genetique et environnemental variable, il est demontre que les techniques d'haplodiploidisation, que sont le croisement interspecifique avec hordeum bulbosum l. (methode h. Bulbosum) et la culture d'antheres, sont a utiliser en parallele. Chez le ble, par contre, le croisement intergenerique avec le mais a montre un avantage extraordinaire. Cette technique peut donc etre utilisee seule pour une production importante d'haploides doubles. Cette premiere partie methodologique nous a amene a approfondir les deux methodes d'haplodiploidisation chez l'orge en tant que systeme genetique dans trois domaines de la genetique moleculaire, la mutation, la methylation de l'adn et la cartographie comparee. Le taux de mutation ponctuelle induit lors de la production des haploides doubles est inferieur a 0,25 10##5. Par contre, le niveau de methylation de l'adn est altere dans les lignees haploides doublees obtenues par culture d'antheres et, a un moindre degre, dans celles issues de la methode h. Bulbosum. La cartographie comparee d'haploides doubles obtenus par voie male (culture d'antheres) et femelle (methode h. Bulbosum) degage un exces de recombinaison dans la meiose male par rapport a la meiose femelle. Nous avons enfin montre que les phases de culture in vitro agissent sur la distribution des genotypes de gametophytes a la suite de la selection gametophytique et/ou sporophytique. En effet, les lignees haploides doublees obtenues par culture d'antheres presentent davantage de segregations deviees que celles obtenues par la methode h. Bulbosum. Dans le contexte de l'amelioration, ce phenomene nous apparait comme indesirable, mais il nous a permis d'identifier des marqueurs moleculaires de genes intervenant dans l'aptitude a la culture d'antheres chez l'orge.
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Belayachi, Larbi. "Pâtes à papiers chimiques blanchies de plantes annuelles sans chlore ni soufre : cas de l'orge et du sorgho sucrier." Toulouse, INPT, 1995. http://www.theses.fr/1995INPT006A.
Full textAbstract:
Le travail propose concerne la valorisation papetiere de pailles de cereales et de bagasses de sorgho sucrier. Quelques donnees bibliographiques comparatives sur la structure du bois et des plantes annuelles notamment la paille de cereale et la bagasse du sorgho sucrier (disponibilite, production, utilisation), sur le marche mondial des pates a papiers, leur fabrication par les procedes alcalins, et les nouvelles sequences de blanchiment a base de l'ozone et de peroxyde d'hydrogene sont rapportes dans le premier chapitre. Le second chapitre porte sur la mise au point de conditions originales de blanchiment de pates chimiques de paille d'orge obtenues par des procedes alcalins sans l'emploi de soufre et de chlore. L'ozone est le principal agent de blanchiment. Son utilisation necessite la mise au point de conditions operatoires satisfaisantes pour obtenir une reactivite optimale. La selectivite s'est amelioree par le recours aux pretraitements acides notammant l'acide acetique couple a l'acide ethylene diamine tetra-acetique. Le peroxyde d'hydrogene est utilise en phase finale de blanchiment pour son caractere selectif et delignifiant quand l'ozone devient inefficace. Le troisieme chapitre est consacre a l'etude et la mise au point de la cuisson de bagasse desucree et demoellee de sorgho sucrier, par le procede soude-anthraquinone associe au blanchiment de la pate ecrue par l'ozone et le peroxyde d'hydrogene. La pate ecrue presente des caracteristiques physico-chimiques equivalentes voire superieures a celles de pates chimiques de bois ou de plantes annuelles. Le blanchiment de cette pate chimique par le couple ozone - peroxyde avec pretraitement acide confirme l'excellente qualite papetiere de cette matiere pour l'industrie papetiere
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Jamai, Aziz. "Transporteurs membranaires de dipeptides et de glutathion chez les végétaux." Poitiers, 1996. http://www.theses.fr/1996POIT2318.
Full textAbstract:
La distribution des assimilats chez les vegetaux depend du fonctionnement de transporteurs catalysant les echanges de substances carbonees et azotees reduites. Les connaissances relatives aux transporteurs de nutriments majeurs (saccharose, acides amines) ont progresse rapidement ces dernieres annees. Le transport des peptides, qui en plus de leur role nutritif, peuvent aussi assurer d'autres fonctions physiologiques, est beaucoup moins connu. Notre travail a precise les modalites d'absorption de peptides proteiques (gly-gly, leu-leu) ou non proteiques (glutathion) dans les tissus foliaires adultes de feve (vicia faba l) et dans les protoplastes, les vesicules de plasmalemme et les vacuoles qui peuvent en etre prepares. Nous avons mis en evidence l'existence, sur la membrane plasmique des cellules foliaires, d'un transporteur de di- et tripeptides de specificite large, dont les capacites d'absorption sont au moins equivalentes a celles des transporteurs d'acides amines deja connus. Les proprietes de ce transporteur (sensibilite au ph, specificite de substrat) montrent qu'il est different des transporteurs d'acides amines, et egalement different du seul transporteur de peptide decrit auparavant chez les vegetaux, dans le scutellum de mais. Les etudes de flux de protons, les etudes electrophysiologiques et l'utilisation de vesicules de plasmalemme demontrent que ce transporteur fonctionne par cotransport avec des protons, comme dans les cellules animales. La fonction du transporteur, redondant avec les transporteurs d'acides amines, n'est pas claire dans des tissus foliaires adultes. Il presente neanmoins des proprietes potentiellement interessantes dans le domaine agronomique. En effet, par analogie a ce qui est connu chez les animaux, ou de nombreux medicaments possedant une structure peptido-mimetique sont absorbes par un transporteur de peptides, on peut supposer que le transporteur vegetal peut intervenir dans l'absorption de toxines biologiques ou de xenobiontes. Au niveau du tonoplaste, l'absorption de gly-gly est catalysee par le meme transporteur que celui assurant l'absorption des acides amines, qui est active par l'atp. Par consequent, il n'y a pas de transporteur specifique des peptides sur le tonoplaste. Le glutathion intervient dans la nutrition soufree de la plante, et joue un role important dans les phenomenes de detoxification vis a vis des stress oxydatifs ou chimiques. Notre travail demontre l'existence, sur la membrane plasmique, d'un transporteur specifique du glutathion, different du transporteur de peptide decrit ci-dessus. Ce transporteur, qui fonctionne aussi par cotransport avec des protons, possede une affinite plus forte pour le glutathion oxyde (hexapeptide), ou conjugue a des xenobiontes, que pour le glutathion reduit (tripeptide). Il peut intervenir dans le recyclage du glutathion oxyde dans l'espace parietal, et dans la detoxification precoce de certains xenobiontes, avant meme qu'ils aient ete absorbes par la cellule
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Jacquard, Cédric Clément Christophe. "Embryogenèse pollinique chez l'orge (Hordeum vulgare L.) : importance du prétraitement." Reims : S.C.D. de l'Université, 2007. http://scdurca.univ-reims.fr/exl-doc/GED00000737.pdf.
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Toubia-Rahme, Hala. "Effet de l'environnement chimique sur le développement de Drechslera teres (sacc. ) shoem. , parasite de l'orge." Toulouse, INPT, 1992. http://www.theses.fr/1992INPT035A.
Full textAbstract:
L'etude de l'action in vitro d'un certain nombre de matieres actives utilisees dans le cadre d'une culture intensive d'orge, sur les differentes sequences biologiques de drechslera teres, montre que l'effet de ces produits varie selon la nature et la concentration de la matiere active, ainsi que la forme et la sequence biologique du pathogene. L'etude de l'effet du glyphosate et du paraquat a revele que ces herbicides ont une action inhibitrice sur la morphogenese des organes sclerotioides de d. Teres sur paille, aux concentrations preconisees au champ. Leur morphologie et leur myceliogenese en est affectee. L'etude in vivo en conditions controlees, fait ressortir que la majorite des matieres actives testees favorisent le developpement de la maladie et/ou la sporulation. Nous avons ensuite conduit une etude sur l'action de certaines matieres actives sur la biosynthese de phytotoxines de d. Teres et montre que le carbendazime semble stimuler la production des toxines chez la forme teres. Enfin, l'etude en plein champ montre que les produits etudies n'ont pas d'effet significatif sur le developpement de la maladie a l'exception du 2,4-d et du terpal ayant un effet inhibiteur de la forme maculata. Cependant, on observe une stimulation non significative de la maladie et de la sporulation ainsi qu'une reduction de la phase de latence avec le carbendazime. Le benomyl et le mcpp ont egalement un effet stimulateur non significatif sur la sporulation chez les deux formes du pathogene, ainsi que le soufre chez la forme teres
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Bendahmane, Boubekeur Seddik. "Contribution à la lutte chimique contre drechslera teres (Sacc. ) shoem. , agent de l'helminthosporiose de l'orge." Toulouse, INPT, 1992. http://www.theses.fr/1992INPT010A.
Full textAbstract:
L'helminthosporiose de l'orge est une maladie fongique causee par drechslera teres (sacc. ) amorphe de pyrenophora teres drechs. Apres avoir fait une etude bibliographique sur le binome orge/d. Teres, nous avons realise une etude de l'action in vitro de plusieurs fongicides sur plusieurs sequences du pathogene. A l'issue du screening, nous observons que les fongicides de contact sont efficaces sur la germination des conidies, les fongicides systemiques sur la croissance mycelienne, la soporulation de la f. Teres et, preventivement sur la morphogenese des organes sclerotioides. L'experimentation in vivo en chambre de culture et en plein champ demontre une inefficacite des fongicides de contact quand ils sont appliques preventivement plus de 48 h avant la contamination. En revanche le prochloraze montre une excellente action preventive en chambre de culture et au champ, mais son efficacite baisse sensiblement au champ sur la f. Maculata. Une etude de la localisation de d. Teres dans la semence, montre que le pathogene peut coloniser les differentes parties de la graine. L'expression de la maladie a partir de l'inoculum seminicole est sous l'influence de la temperature et de l'humidite. La f. Maculata exprime des symptomes coleoptilaires, la f. Teres des symptomes coleoptilaires mais surtout foliaires, celle-ci peut etre systemique. Enfin aucun fongicide teste n'est efficace en traitement de semences sur le pathogene
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Maglione, Rémi. "Étude de l'intégrité du génome chloroplastique de l'orge (Hordeum vulgare) en culture de microspores isolées." Master's thesis, Université Laval, 2016. http://hdl.handle.net/20.500.11794/26919.
Full textAbstract:
Un enjeu actuel en biotechnologie est d'obtenir des plantes haploïdes doublées par la technique de la culture de microspores isolées (CMI). Pourtant, la CMI génère parfois une proportion importante de plantes albinos, laquelle peut atteindre 100 % chez certains cultivars. Des travaux antérieurs ont indiqué que des remaniements du génome chloroplastique seraient à l'origine de cet albinisme. Afin de mieux comprendre ce processus menant à l'albinisme, nous avons entrepris d'étudier l'intégrité du génome chloroplastique au sein de microspores d'orge et de plantes albinos via une approche de séquençage à grande échelle. L'ADN total extrait de microspores à un stade précoce de la CMI, d'une feuille de la plante-mère (témoin), et de feuilles albinos, a été séquencé et les séquences chloroplastiques ont été analysées. Ceci nous a permis de documenter pour la première fois une diminution de l'ADN chloroplastique chez les microspores. De plus une étude de variations structurales a démontré un abaissement généralisé de la quantité de génomes chloroplastiques chez les microspores. Enfin, d'importants remaniements du génome chloroplastique ont été observés chez les plantes albinos, révélant une forte abondance de génomes chloroplastiques altérés de forme linéaire.
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Zwickert-Menteur, Sophie. "Polymorphisme en iso-électrofocalisation et étude génétique des activités d'enzymes-clés du maltage chez l'orge (Hordeum vulgare L. )." Paris 6, 1996. http://www.theses.fr/1996PA066446.
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Dedourge, Odile. "Impact de l'effet rhizosphère du colza et de l'orge sur la dynamique du soufre dans le sol." Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 2003. http://www.theses.fr/2003INPL010N.
Full textAbstract:
La présente étude a montré que les microorganismes sous culture de colza immobilisent moins de soufre que ceux sous culture d'orge. En revanche, ils présentent une activité arylsulfafuse par Unité de biomasse microbienne supérieure. Le sol sous friche génère un niveau supérieur de biomasse microbienne-S et d'activité arylsulfatase, illustrant le rétablissement de la fertilité du sol suite à une période de friche. Une étude plus fine a montré que les propriétés physiques et chimiques du sol, aussi bien que la qualité et la quantité des rhizodépôts, affectent profondément la dynamique du soufre. Concernant la comparaison de l'effet d'un précédent cultural sur la biodisponibilité en soufre pour la culture suivante, nous avons mis en évidence le rôle bénéfique d'un précédent colza sur la culture d'orge, non seulement dans la dynamique du soufre mais aussi dans la mise à disposition de composés carbonés et azotés facilement mobilisables.
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Dineley, Merryn. "Barley, malt and ale in the Neolithic /." Oxford : J. and E. Hedges, 2004. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb39145126s.
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Lamara, Mebarek. "Analyse comparative de la diversité génétique et de la structure des populations chez l'orge (Hordeum vulgare L.) à l'aide de marqueurs SSR, DArT et du pedigree." Thesis, Université Laval, 2010. http://www.theses.ulaval.ca/2010/27341/27341.pdf.
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Rakotomanga-Rasolonjatovo, Vololonirina. "Incidences des traitements pesticides sur les grains de pollen de Tradescantia et de l'orge : Aspects cellulaires et moléculaires." Toulouse, INPT, 1995. http://www.theses.fr/1995INPT019A.
Full textAbstract:
L'incidence des pesticides sur la qualite pollinique et sur le metabolisme fondamental du gametophyte male en formation a ete etudiee chez le tradescantia bracteata l. Et chez l'hordeum vulgare l. Les pesticides affectent la qualite pollinique et les alterations induites dans les grains de pollen sont dose-dependantes. Le nombre de grains de pollen qui germent diminue et l'elongation du tube pollinique est ralentie. La viabilite pollinique a ete reduite chez le tradescantia lors des traitements par contact direct ou par voie vasculaire. Dans le cas de l'orge seuls les traitements repetitifs affectent le taux de pollen viable. Les noyaux des cellules polliniques et des cellules tapetales constituent une cible pour l'action des pesticides. En effet, la morphologie de la chromatine, la teneur en adn ainsi que la synthese d'adn du pollen ont ete modifiees. Par ailleurs, chez le tradescantia traite par l'herbicide, la teneur en adn des cellules tapetales a ete egalement reduite. Les pesticides ont modifie un nombre limite de proteines polliniques et tapetales, les changements des profils proteiques pouvant se resumer par l'induction ou l'inhibition de la synthese des proteines et par l'accumulation ou de la degradation des proteines pre existantes. Les traitements pesticides ont induit chez les deux plantes la synthese d'un polypeptide de 25/26 kda dans les grains de pollen et celle d'un polypeptide de 32 kda dans les microsporocytes. De plus des proteines specifiques du stade et du traitement apparaissent et/ou disparaissent. Chez l'orge, la synthese d'un polypeptide de 18 kda a ete induite a tous les stades de developpement et quel que soit le traitement. Chez le tradescantia, l'apparition d'une proteine de 62 kda dans le tapis a ete reliee au traitement a l'herbicide. Chez les deux especes, la comparaison des sequences des proteines accumulees avec celles des banques de donnees a permis d'identifier en particulier une proteine ayant une homologie de sequence avec les histones h3. 3 d'arabidopsis thaliana
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Pascal, Marie-France. "Étude de critères morphophysiologiques en vue de création variétale, chez l'orge Hordeum vulgare L." Toulouse, INPT, 1985. http://www.theses.fr/1985INPT008A.
Full textAbstract:
Le but de ce travail est de determiner des criteres de selection indirecte et simultanee du rendement et de la teneur en proteines, chez l'orge. Une premiere etude physiologique a montre la variabilite genetique de criteres morphophysiologiques. Une deuxieme etude genetique a permis de determiner l'heritabilite et les correlations genetiques et environnementales entre ces criteres et le rendement ou la teneur en proteines
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Youcef, Benkada Mokhtar. "Etude de l'inoculum séminicole de Drechslera teres (Sacc. ) Shoem. Et caractérisation de souches par l'utilisation de profils protéiques et isoenzymatiques." Toulouse, INPT, 1994. http://www.theses.fr/1994INPT029A.
Full textAbstract:
L'etude de la localisation de drechslera teres au niveau des semences d'orge montre que lorsque la contamination a lieu a la floraison, toutes les parties du caryopse y compris l'embryon sont infectees par les deux formes du pathogene. Les investigations sur le role de certains facteurs abiotiques, permettent de mettre en evidence l'influence de l'humidite du sol et de la temperature sur l'expression des symptomes primaires causes par les deux formes teres et maculata du pathogene. Les degats les plus importants sont observes en sol sec (pf 4,2) et a des temperatures de l'ordre de 12c. Sur jeunes plantules, l'inoculum seminicole est a l'origine des symptomes coleoptilaires avec la souche maculata. En revanche, il induit des symptomes coleoptilaires mais surtout foliaires avec la souche teres. Les phenotypes culturaux, notamment l'aspect du mycelium et la croissance mycelienne de meme que la capacite de sporulation n'ont pas permis de discriminer les deux formes de d. Teres. A l'inverse, ces caracteres observes chez drechslera graminea pourraient distinguer ces deux especes. L'analyse des proteines myceliennes par electrophorese sur gel de polyacrylamide en conditions denaturantes montre que les proteines solubles ne permettent pas de distinguer les differentes souches de drechslera. En revanche, les bandes polypeptidiques specifiques observees a travers l'etude des proteines parietales, ont permis non seulement de discriminer d. Teres f. Teres de d. Teres f. Maculata, mais egalement d. Teres de d. Graminea. Enfin l'etude des profils isoenzymatiques fournit egalement des marqueurs biochimiques tres interessants. Les -esterases permettent de differencier les souches appartenant a la forme teres de celles appartenant a la forme maculata. Les -esterases et les phosphoglucoisomerases offrent la possibilite d'une distinction interspecifique entre d. Teres et d. Graminea
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Negri, Diana. "Embryogenèse somatique chez l'orge (Hordeum vulgare L. ) : application aux cultures de cellules et de protoplastes." Paris 11, 1989. http://www.theses.fr/1989PA112300.
Full textAbstract:
This study deals with experiments about callogenesis and morphogenie potential of barley (Hordeum Vulgare L. ) tissue cultures. In this purpose, different genotypes and explants have been studied. The effect of medium composition has been also investigated. From immature embryo explants, high rates of callogenesis and in vitro plant regeneration has been obtained. Strong genotypic and medium composition effects have been also noticed on rate of callogenesis, type of callus and in vitro regenerative ability. Histological examinations of callus tissues have shown cellular proliferation primarily originating from the scutellum of young embryos. Subsequent differentiation of callus led to the formation of somatic embryos which have been histologically characterized. Organogenesis (root and apical meristem) was also obvious. For initiation of barley cell suspensions, pieces of embryogenie calluses have been selected. After dissociation and filtration procedures, rapidly growing and homogeneous cell lines which consisted of highly-cytoplasmic rich cells, have been obtained. In a third step, investigations on protoplast culture have been carried out with callus and suspension materials. Only cell suspension in exponential growth stage was suitable for protoplast culture. The isolated protoplasts were able to divide and produced numerous microcolonies which have developed into well growing indifferentiated calluses. Plating efficiency was also greatly affected by enzymatic solution composition. The use of this in vitro system in genetic manipulations such as transformation experiments is discussedL'étude du potentiel de régénération de plantes des cultures de tissus d'orge(Hordeum vulgare L. ) a fait l’objet de la première partie de ce mémoire. L'expérimentation a porté d’une part sur le choix de l'explant (origine développement) et d'autre part sur les conditions de culture (composition du milieu de culture). Des cals présentant un pouvoir élevé de néoformation de plantes ont été obtenus à partir d'embryons immatures. Le potentiel de régénération de plantes dépend du génotype, du milieu de callogénèse ainsi que de la durée de culture in vitro. Une étude histologique à permis de localiser au niveau du scutellum des embryons immatures les centres de prolifération cellulaire et de caractériser le mode de néoformation (embryogenèse somatique et organogenèse). L'étudedes conditions d'établissement de suspensions cellulaires est présentée dans la seconde partie. Les suspensions cellulaires isolées par dissociation et filtration de cals embryogènes se sont révélées non morphogènes. L'utilisation de suspensions cellulaires a permis l'obtention: populations de protoplastes aptes à se diviser. Les conditions isolement de protoplastes influent sur le taux de formation microcolonies. Leur culture a conduit à la formation microcolonies qui se développent jusqu'au stade cal indifférencié. L'utilisation de ces techniques de culture in vitro est discutée dans le cadre des manipulations génétiques telles les transformations dans le contexte des Graminées et notamment, des céréales
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Hamdan, Lama. "Caractérisation de la communauté fongique impliquée dans la minéralisation du soufre organique dans les rhizosphères de colza et d'orge." Thesis, Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 2010. http://www.theses.fr/2010INPL067N/document.
Full textAbstract:
En Europe de l’Ouest, S est devenu un élément limitant pour la croissance des plantes. Ainsi, des carences en S apparaissent de plus en plus fréquemment sur des cultures tel que le colza. Dans le sol, 95% de S est sous formes organiques, non disponibles pour les plantes. L’intervention de la microflore est indispensable pour assurer la minéralisation du S organique en sulfates, assimilables par la plante. Nos objectifs ont été de caractériser la communauté fongique impliquée dans la minéralisation des esters de S, forme majoritaire de S organique, via une activité arylsulfatase (ARS), dans les rhizosphères de colza et d’orge. La communauté fongique est composée de plusieurs genres affiliés principalement aux Ascomycètes. Chez les souches fongiques isolées de la rhizosphère de colza et d’orge, une activité ARS a été détectée dans différents compartiments cellulaires. La régulation de ces activités ARS semble dépendante du taxon considéré. Nous avons par ailleurs montré que l’environnement rhizosphérique n’influence pas toujours la taille de la communauté fongique ARS. Dans les sols, si les activités ARS totale et intracellulaire semblent négativement corrélées avec les quantités de sulfates, l’activité ARS extracellulaire semble indépendante de la disponibilité en sulfates. En conclusion, l’ensemble des expérimentations suggère que la communauté fongique fonctionnelle joue un rôle dans la dynamique du S dans les sols agricoles. Des approches d’écologie fonctionnelle permettraient de mieux cerner leur implication dans la disponibilité en S minéral pour la planteIn Western Europe, sulfur (S) deficiency occurs in certain crops, including crucifers and cereals. Therefore, S becomes limiting for crop production and plants exhaust S mainly from soil organic S. In soil, 95% of S is in organic form that is not readily available for plants. This organic form containing principally ester S requires microbial mineralization to sulfate by arylsulfatase (ARS) enzyme. Our objectives were to characterize the fungal community having the ARS activity in the rhizosphere of rape versus that of barley. Functional fungal community comprised several genera principally belonging to Ascomycota. In different fungal strains, ARS activity was detected in different cellular compartments. The regulation of ARS was mostly dependent on microbial taxa. The density of the functional fungal community was not influenced by rhizospheric compartment.In soils, total and intracellular ARS activities were negatively correlated with soil sulfates whereas soil extracellular ARS activity was independent of sulfates. The overall results suggest that the functional fungal community could play a role in the dynamics of S in agricultural soils. Further approaches should be developed to allow a better understanding of their potential involvement in S nutrition of crops
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Martel, Claude. "Étude du caryopse de l'orge au cours du développement, de la maturation et du maltage : évolution des amyloplastes et de l'amidon." Nancy 1, 1988. http://www.theses.fr/1988NAN10386.
Full textAbstract:
La caractérisation, in vivo, de la matière première au cours de son développement, jusqu'à maturation, a été effectuée sur des variétés cultivées en champs dans les conditions agronomiques actuelles. L'étude de sa transformation en malterie a été menée sur des échantillons prélevés directement au cours d'un maltage industriel. Les techniques d'observation structurale et ultrastructurale ont permis de situer les amyloplastes dans leur environnement, au sein du caryopse : répartition cellulaire des différentes populations d'amyloplastes et matériel intersticiel et/ou adhérent. Ces techniques ont, par ailleurs, permis le suivi des modifications morphologiques intervenant au cours de la "germination" induite par le maltage. Ensuite, l'évolution du taux d'amidon, de l'amylose et de l'amylopectine a été suivie tout au long du développement du grain d'orge, de la maturation, puis au cours des étapes de maltage. Cette étude a été effectuée par dosage colorimétrique et adaptation de la chromatographie de perméation de gel. Enfin, on a déterminé la localisation des enzymes amylolytiques (alpha et beta-amylases) à des stades donnés du développement du grain d'orge et au cours des différentes étapes de sa transformation en malt
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Avila, Ospina Liliana Astrid. "Autophagie, sénescence et remobilisation de l'azote chez l'orge." Thesis, Paris 11, 2014. http://www.theses.fr/2014PA112167/document.
Full textAbstract:
L’orge (Hordeum vulgare L.) est l'une des céréales les plus importantes du monde et l’une des premières cultures domestiquées. Elle a été utilisée pendant des siècles pour l'alimentation humaine. Comme toutes les autres plantes, l'orge est dépendante de l'azote inorganique. L’efficacité de remobilisation de l'azote est donc très importante pour le remplissage des grains et pour la teneur en protéines du grain. L'objectif de ce travail est de donner une image du métabolisme des feuilles sénescence chez l'orge lorsque les plantes sont cultivées dans des conditions limitantes ou non en nitrates. Les analyses biochimiques, physiologiques et moléculaires de la sénescence des feuilles d'orge ont été réalisées. La gestion de l'azote pendant la sénescence des feuilles a été suivie par l'évolution des différents composés azotés au cours du vieillissement de la feuille. Une étude de profilage métabolique a été effectuée afin de déterminer les caractéristiques métaboliques de la sénescence des feuilles dans l'orge. En parallèle, les enzymes impliquées dans la remobilisation de l'azote ont été étudiées. Leurs activités et les niveaux de leurs transcripts ont été mesurés. Une attention particulière a été portée aux glutamine synthétases et asparagine synthétases et aux protéines de la machinerie de l'autophagie, processus connus pour jouer un rôle dans la remobilisation de l'azote pendant la sénescence des feuilles. A partir de toutes les données de séquences disponibles, ADNc, EST et séquences génomiques, cinq gènes codant pour les isoformes de glutamine synthétase cytosoliques (GS1), cinq gènes codant pour les isoformes d’asparagine synthétase (AS) isoformes et 19 gènes codant pour des protéines de la machinerie de l'autophagie ont été identifiés. Les expressions de tous les gènes identifiés ont été suivies au cours de la sénescence des feuilles et en fonction de l'alimentation en nitrates. La plupart de ces gènes sont sur-exprimés dans les feuilles sénescentes et de façon différentielle en fonction des conditions de nutrition. Toutes les données de séquences fournies par ce travail seront utiles à d'autres études translationelles et d'association génétiqueBarley (Hordeum vulgare L.) is one of the most important cereals in the world. It was one of the first domesticated crops and was used for centuries for human food. As all plants, barley has a fundamental dependence of inorganic nitrogen and nitrogen remobilization efficiency is very important for grain filling and grain protein content. The aim of this work was then to give a picture of the leaf-senescence metabolism in barley leaves when plants are grown under low or high nitrate conditions. Biochemical, physiological and molecular analyses of barley leaf senescence were performed. Nitrogen management during leaf senescence was monitored measuring changes in the different nitrogen pools during leaf ageing. In addition a large metabolite profiling study was performed in order to determine the metabolic hallmarks of leaf senescence in barley. In parallel enzymes involved in nitrogen remobilization were studied measuring their activity and the transcript levels of their coding genes. There was a special focus on glutamine synthetase and asparagine synthetase enzymes and for autophagy machinery that are known to play a role in nitrogen remobilisation during leaf senescence.From all the sequences data available, cDNA, EST and genomic sequences, we could identified five genes coding for cytosolic glutamine synthetase (GS1), five genes coding for asparagine synthetase (AS) and 19 genes coding for autophagy machinery proteins. Transcript levels of all the genes identified were monitored during leaf senescence and depending on nitrate nutrition. Most of these genes were over-expressed in senescing leaves and differentially expressed depending on nitrate conditions. In addition to the characterization of autophagy, GS1 and ASN genes, phylogenic and gene structures were analysed. All the sequences data provided by this work will be helpful to further translational and genetic association studies
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Corre-Hellou, Guénaëlle. "Acquisition de l'azote dans des associations pois - orge (Pisum sativum L. - Hordeum vulgare L. ) en relation avec le fonctionnement du peuplement." Angers, 2005. http://www.theses.fr/2005ANGE0030.
Full textAbstract:
Les associations céréale-légumineuse connaissent un regain d’intérêt en Europe dans des systèmes à faibles intrants. Face à la variabilité de leurs performances, ce travail a cherché à approfondir les connaissances sur les interactions entre espèces en particulier pour la ressource azotée dans une association-modèle composée de pois et d’orge. Le travail a mis en évidence l’importance de la compétition pour l’azote du sol entre espèces et ses interactions dynamiques avec la fixation symbiotique, l’expansion foliaire et la croissance aérienne. La compétition pour l’azote apparaît peu affectée par les écarts d’enracinements entre espèces mais davantage par les écarts de demande en azote en relation avec la disponibilité en azote du milieu. Ce travail a aussi apporter des outils méthodologiques : mise au point de méthodes simples de caractérisation au champ de l’enracinement d’espèces associées et adaptation d’un modèle de culture pour simuler le fonctionnement de ces associationsCereal-legume intercrops are gaining increasing interest in Europe in low-input systems. Face with the large variability of performance the aim of this works is to increase knowledge on interactions between species especially for nitrogen in pea-barley intercrops. This work reveals the major role of the competition for soil nitrogen between species and its dynamic interactions with N2 fixation, leaf expansion and aerial growth. Competition for soil nitrogen appears little affected by differences in root growth between species but more by differences in nitrogen demand in relation to soil nitrogen availability. This works also provides methodological tools: simple root methods for assessing root growth of associated species and adaptation of a crop simulation model for pea-barley intercrops
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Gauthier, Mélanie. "Le déséquilibre de liaison chez l'orge (Hordeum vulgare L.) : une fenêtre d'observation sur les effets de la sélection." Thesis, Université Laval, 2010. http://www.theses.ulaval.ca/2010/27330/27330.pdf.
Full text
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Majdoub, Linda. "Orientation propionique du profil fermentaire ruminal : conséquences sur le métabolisme splanchnique des nutriments énergétiques et sur la fourniture et l'utilisation du glucose par le muscle chez l'agneau recevant du fourrage vert." Rennes, ENSA, 2002. http://www.theses.fr/2002NSARB142.
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Lefebvre, Eric. "Etude de la variabilité de la teneur en bêta-glucanes de l'orge (Hordeum vulgare L. ) par voies physico-chimique, biochimique et biologique." Montpellier 2, 1990. http://www.theses.fr/1990MON20185.
Full textAbstract:
Pour definir l'influence du genotype et de l'environnement sur la teneur en beta-glucanes de l'orge, nous avons analyse differentes varietes cultivees dans diverses conditions. Elles ont ete analysees par hydrolyse enzymatique ou par spectrophotometrie proche infrarouge. Avec ces deux methodes, nous avons montre que le taux de beta-glucanes totaux de l'orge depend plus des facteurs genotypiques qu'environnementaux. Les poids de grain et taux de proteines n'apparaissent pas etroitement lies aux taux de beta-glucanes. Toutes les varietes recommandees par les malteurs francais presentaient de faibles teneurs en beta-glucanes. Les valeurs les plus elevees ont ete trouvees chez les orges nues waxy. Bien que les orges nues apparaissent plus riches en beta-glucanes que les orges vetues, nous avons trouve des varietes presentant des teneurs en beta-glucanes comparables a celles des orges brassicoles. Utilisee pour estimer la qualite nutritionnelle de differents aliments, la larve de tenebrio molitor n'est pas affectee par l'ajout de beta-glucanes a son regime. Elle s'est montree sensible a d'autres antinutritionnels tels que les proanthocyanidines de l'orge
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Gbongue, Made Anatole. "Contribution à l'étude de l'extraction de l'acide phytique de l'orge et du malt." Nancy 1, 1988. http://www.theses.fr/1988NAN10269.
Full textAbstract:
Phénomènes qui gouvernent l'extraction, par les solvants aqueux, de l'acide phytique des grains d'orge ou de malt. La première partie étudie la méthode néphélométrique proposée par Phou. On utilise le phytate de sodium pour établir la courbe d'étalonnage de l'acide phytique. L'utilisation de la technique du microdosage colorimétrique proposée par macheboeuf est nécessaire, du fait que l'acide phytique, en se dégradant, libéré du phosphate inorganique. L'enregistrement de la réaction de coloration a été possible, de sorte que nous puissions suivre instantanément et avec précision, la formation du bleu franc qui se stabilise très vite : les proportions des réactifs ont été déterminées. La deuxième partie est consacrée à l'étude des facteurs d'extraction de l'acide phytique. Il faut en retenir l'importance de la finesse de la mouture, de la force ionique et du ph du tampon. La troisième partie tente de s'opposer à l'hydrolyse de l'acide phytique dans l'extrait effectué au tampon oxalique. De nombreux inhibiteurs existent pour limiter l'effet d'hydrolyse des phosphatases. On utilise l'ion F**(-) avec succès. L'hydrolyse n'est jamais complète, même en l'absence d'addition d'inhibiteur extérieur. Ceci suggère que le phosphore inorganique dans l'extrait inhibe la réaction. La quatrième partie est le suivi de l'effet de traitements thermiques des grains de malt sur la solubilisation de l'acide phytique par la méthode néphélométrique. Elle rend compte du fait que l'acide phytique, a la cuisson du moût participe à la coagulation thermique. Le taux de l'acide phytique dans l'extrait est toujours très faible, ce qui ne permet aucune exploitation pour le contrôle des conditions de travail en malterie. On tente d'expliquer le mécanisme de la réaction d'hydrolyse de l'acide phytique montrant qu'il possède 2 paires d'esters phosphates en position transéquatoriale à proximité d'un groupe hydroxyle. Ceci justifie l'affinité de l'acide phytique pour les protéines et son hydrolyse par deux phytases différentes
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Beillouin, Damien. "Conception et évaluation d’idéotypes variétaux et culturaux en orge d’hiver brassicolepour des conduites culturales à bas niveau d’intrants : approche par expérimentation et modélisation." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017SACLA027/document.
Full textAbstract:
La France est l’un des premiers producteurs européens d’orge brassicole (Hordeum vulgare L.) et le premier exportateur mondial de malt. La production d’orge brassicole repose actuellement sur une utilisation massive d’intrants de synthèse et entraîne comme d’autres grandes cultures des impacts négatifs sur l’environnement et la santé des consommateurs. Ce travail a pour objectif de concevoir et d’évaluer des variétés et des itinéraires techniques pour cette espèce permettant une production quantitative et qualitative élevée avec un moindre recours aux intrants de synthèse. À partir d’un réseau d’essai multilocal, nous montrons que la teneur en protéines et le rendement calibré (poids des grains >2.5 mm) des orges brassicoles doivent être spécifiquement améliorés pour les conduites techniques en bas niveau d’intrants. Sur cette base, nous avons identifié les caractéristiques variétales favorables à une faible perte de teneur en protéines et de rendement calibré en situation de stress azoté.Puis, après avoir développé un modèle de culture adapté à cette espèce, nous avons identifié des stratégies de fertilisation azotées offrant les meilleurs compromis entre production quantitative et qualitative, tout en minimisant les pertes en azote vers l’environnement. Grâce à une caractérisation précise des environnements de production français, les meilleures stratégies de fertilisation azotée ont été identifiées localement. Enfin, nous avons identifié de nouvelles combinaisons de caractéristiques variétales permettant d’optimiser la production d’orge dans des situations d’intrants réduits. Nous montrons in silico, qu’adapter simultanément les caractéristiques variétales et de l’itinéraire technique permet d’atteindre des performances comparables aux variétés actuelles dans des itinéraires techniques avec recours intensif aux intrants. Nous discutons des méthodes de sélection adaptées pour identifier les variétés les plus performantes dans des situations d’intrant réduit. Enfin, nous revenons sur la démarche de conception mobiliséeFrance is the largest European producer of malting barley (Hordeum vulgare L.) and the leading exporter of malt worldwide, accounting for 20% of world trade. French barley production has relied heavily on the use of synthetic inputs and has led, as other arable crops, to considerable environmental damage. The aim of this study is to design and evaluate crop and management ideotype adapted to a lower use of synthetic fertilizer. From a multi-environment trial, we conclude that the grain protein content and the calibrated yield (weight of grains >2.5 mm) have to be specifically improved in low-input management systems. We experimentally identified genotypic characteristics adapted to a low grain protein content loss and calibrated yield loss under N stress. With a crop model we adapted to malting barley, we also identified optimal N fertilization strategies allowing to reach high quantitative and qualitative performances whilst minimizing N losses toward the environment. Based on a precise characterization of environments the French barley belt, the best N fertilization strategies were identified for different regions. Finally, we identified new combinations of genotypic characteristics optimizing quantitative and qualitative performances in low management system. We showed that, in silico, a simultaneous adaptation of genotypic characteristics and optimization of N fertilization management allowed to reach similar performances as current genotypes in high-input management systems. We discuss methods to breed genotypes with high performances in low-input systems and the method used for innovative design of new management and barley malting cultivars adapted to low-input systems
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Millet, Marie-Odile. "Etude du caractère agrégatif des protéines de l'orge : relations avec la qualité malticole et brassicole." Montpellier 2, 1991. http://www.theses.fr/1991MON20087.
Full textAbstract:
Les proteines de reserve du grain d'orge sont organisees en multicouches concentriques, situees essentiellement dans la zone sub-aleurone. Chacune de ces couches presente un pic d'accumulation d'un type proteique defini, et un mode d'association specifique. La mise en place des etats d'agregation est discutee a partir d'une etude des orges en cours de maturation. L'agregation de type disulfure semble etre posterieure a la synthese des hordeines b, tandis que l'agregation de type hydrophobe semble intervenir au contraire a un stade precoce de la maturation. L'epaisseur et l'interpenetration de ces differentes couches proteiques, varient principalement en fonction de la variete, mais egalement en fonction du lieu et de l'annee de culture au sein d'une meme variete (bien que le facteur variete soit preponderant). Cette repartition entre les elements proteiques, respectivement hydrophiles et hydrophobes, permet une sorte de cloisonnement du grain, et semble determinante pour l'aptitude de chacune des varietes au maltage, en gerant notamment la qualite des mouvements d'eau centripetes, qui ont lieu au moment de la trempe