Dissertations / Theses on the topic 'Paludisme – Transmission – Burkina Faso'

Le virus de l'immunodéficience humaine (VIH) est caractérisé par une grande diversité génétique. Deux types de virus ont été identifiés : les VIH-1 et 2. Au Burkina Faso, pays où se situe notre étude, aucune description de la diversité des souches circulantes n'a été entreprise. Nos objectifs étaient d'évaluer l'influence des sous-types du VIH-1 sur le sérodiagnostic de l'infection et sur la transmission du virus de la mère à l'enfant. Les outils utilisés pour décrypter la diversité du VIH-1 étaient un test de sérotypage par compétition de peptides en phase liquide et la technique génétique de mobilité des hétéroduplexes (HMA). Une évaluation de tests commerciaux de sérodiagnostic de l'infection par le VIH a été réalisée au Burkina Faso afin de proposer une stratégie nationale simple, fiable et peu onéreuse. Le sérotypage des échantillons positifs aux tests ELISA évalués dans cette étude a montré que les réponses en densité optique aux tests ELISA étaient très élevées quel que soit le sérotype du VIH infectant. Une surveillance répétée de la fiabilité des tests utilisés en fonction de l'introduction des nouvelles souches de VIH a été recommandée. Un essai clinique évaluant la tolérance à la zidovudine et au chlorure de benzalkonium chez des femmes enceintes infectées par le VIH-1, a été réalisé. Des souches de génotype A et G ont été identifiées par HMA. Ces résultats suggèrent que la technique de sérotypage utilisée n'est pas un outil contributif pour le sous-typage du VIH-1 au Burkina Faso. Les résultats du suivi biologique des mères et de leurs enfants ont montré que les génotypes A et G ne sont pas des déterminants de la transmission verticale du VIH-1, d'un taux bas de lymphocytes CD4 maternels, ni d'une charge virale maternelle élevée. La réalisation de ce type d'étude dans des pays où d'autres sous-types sont prédominants a été recommandée, afin d'avoir une vision plus large de l'influence des sous-types du VIH-1 sur la transmission verticale du virus.

La mise en œuvre des objectifs du millénaire (OMDs) a permis de réaliser des progrès importants, mais irréguliers entre les pays. Les pays de l’Afrique sub-saharienne restent caractérisés par des proportions élevées d’enfants non scolarisés de mortalité infantile et un poids élevé de maladies transmissibles dans la charge globale de la maladie, dont le paludisme. A cela, s’ajoute un niveau de fécondité élevé avec ses conséquences économiques potentielles. Les Objectifs de Développement Durable, ciblent également le paludisme pour une élimination à l’horizon 2030 et prônent une éducation de qualité à tous, y compris l’encadrement de la petite enfance qui avait été occulté lors des OMDs. Cette thèse s’attache à analyser des aspects du développement liés à ces enjeux globaux. Le premier chapitre analyse l’impact des campagnes de lutte contre le paludisme sur la fécondité au Mali en utilisant les données d’Enquêtes Démographiques et de Santé de 2006 et 2012 et celles de Malaria Atlas Project de la même période. Les résultats montrent que le paludisme a un effet négatif sur la fécondité (-0,24 enfants). Parmi les mécanismes qui expliquent cet effet (décès infantiles, avortements), l’éducation des mères est le mécanisme le plus important. Le deuxième chapitre s’intéresse au lien entre le paludisme, le revenu du ménage et l’investissement dans l’éducation à travers un essai randomisé contrôlé dans un village du Mali. Des enquêtes ont été réalisées en juillet et décembre 2016 auprès des mêmes ménages, avec un dépistage du paludisme par la microscopie chez les enfants de 3 mois à 5 ans. Les résultats montrent que le relâchement des contraintes de pertes économiques liées au paludisme (coûts directs, dépenses de soins, et/ou perte de productivité) permettait aux ménages d’épargner 3194 F CFA (5 euros) et de faire des dépenses supplémentaires de 2863 F CFA (4 euros) dans l’éducation des enfants. Le troisième chapitre, un essai randomisé contrôlé également, analyse l’effet de messages de rappels et d’informations aux chefs des ménages sur l’utilisation et l’adoption de la stratégie moustiquaire imprégnée en utilisant une plateforme de téléphonie mobile à Bobo Dioulasso au Burkina Faso. Des enquêtes ont été réalisées en 2013, 2016 et 2017 pour recueillir les données auprès des mêmes ménages. Les résultats montrent que le problème d’utilisation inappropriée des soins préventifs du paludisme, peut être résolu au moyen de la méthode classique de sensibilisation en santé ou en diffusant des messages d’information auprès des chefs de ménages à travers leur diffusion par une plateforme de téléphonie mobile. L’effet était entre 4,6 et 6 points de pourcentage respectivement pour les messages textes et vocaux. Le quatrième chapitre analyse l’impact et le coût d’un ensemble de stratégies en santé et éducation (micronutriments, CPS, déparasitage) sur l’amélioration du développement de la petite enfance. Il s’agissait d’un essai randomisé contrôlé avec comme unité de randomisation des villages, réalisé en 2016 dans une zone de forte transmission du paludisme et de prévalence élevée de l’anémie, à Sikasso au sud du Mali. Le coût des différentes stratégies a été évalué dans la perspective du fournisseur pour un horizon relativement court. Les stratégies intégrées n’ont pas eu d’impact sur le développement de la petite enfance. Le coût de la mise en œuvre de ces stratégies était cependant limité. En conclusion, le paludisme constitue un poids pour le développement économique, à travers des effets sur la fécondité et le revenu, pénalisant ainsi potentiellement l’investissement dans l’éducation. Nos résultats contribuent donc à la littérature existante sur l’effet du paludisme sur le développement économique<br>The implementation of the Millennium Development Goals (MDGs) has led to significant but uneven progress between countries. Sub-Saharan African countries continue to be characterized by high proportion of out-of-school children, high child mortality and a high burden of communicable diseases in the overall disease burden, including malaria. Added to this is a high fertility level with its potential economic consequences. The Sustainable Development Goals also target malaria for elimination by 2030 and advocate for quality education for all, including early childhood care, which had been overlooked in the MDGs. This thesis focuses on analysing aspects of development linked to these global challenges. This thesis focuses on analyzing aspects of development related to these global challenges.The first chapter analyses the impact of malaria control campaigns on fertility in Mali using data from the Demographic and Health Surveys of 2006 and 2012 and those of the Malaria Atlas Project for the same period. The results show that malaria has a negative effect on fertility (-0.24 children). Among the mechanisms that explain this effect (infant deaths, abortions), mother’s education is more important. The second chapter examines the relationship between malaria, household income and investment in education through a randomized controlled trial in a village in Mali. Surveys were conducted in July and December 2016 within the same households, with microscopic screening for malaria in children aged 3 months to 5 years. The results show that relaxing the constraints of economic losses linked to malaria (direct costs, care expenses, and/or loss of productivity) allowed households to save 3194 F CFA (5 euros) and to make additional expenditures of 2863 F CFA (4 euros) in children's education. The third chapter, also a randomized controlled trial, analyses the effect of reminder messages and information to household heads on the use and adoption of the ITN strategy using a mobile phone platform in Bobo Dioulasso, Burkina Faso. Surveys were conducted in 2013, 2016 and 2017 to collect data within the same households. The results show that the problem of inappropriate use of preventive malaria care can be solved by using the traditional method of health awareness or by disseminating information messages to heads of households through a mobile phone platform. The effect was between 4.6 and 6 percentage points for text and voice messages respectively. The fourth chapter analyses the impact and cost of a set of health and education strategies (micronutrients, CPS, deworming) on improving early childhood development. This was a randomized controlled trial with villages as the randomization unit, conducted in 2016 in an area of high malaria transmission and high prevalence of anaemia, in Sikasso in southern Mali. The cost of the different strategies was evaluated from the provider's perspective for a relatively short time horizon. The integrated disease control strategies, the implementation of Early Childhood Development Centres and parental education did not have an impact on early childhood development. However, the cost of implementing these strategies was limited.In conclusion, malaria is a burden on economic development through its effects on fertility and income, potentially penalising investment in education. Our results therefore contribute to the existing literature on the effect of malaria on economic development

L’anémie est un problème de santé publique très répandu, avec des conséquences majeures sur la santé humaine et le développement économique et social. Elle affecte avec prédilection les jeunes enfants et les femmes enceintes. Ce travail avait pour objectifs d’analyser la situation de l’anémie chez les enfants âgés de 6-23 mois du district rural de Kongoussi (Burkina Faso), et de tester l’efficacité de stratégies intégrées de lutte. Il a consisté en deux enquêtes transversales et deux études d’intervention en population, menées entre janvier 2004 et juin 2006.<p><p>La prévalence (IC à 95%) de l’anémie était de 98,8% (97,6 ;99,9) parmi ces enfants, et la prévalence (IC à 95%) de l’anémie sévère de 29,5% (23,9 ;35,0). Parmi les enfants présentant une anémie, 65,1% avaient une anémie hypochrome.<p>Les enfants ne présentant pas de retard de croissance avaient un taux moyen (ES) d’hémoglobine plus élevé que les enfants présentant un retard de croissance :81,1 (2,6) contre 77,2 (2,8) g/L, (p=0,026). La prévalence (IC à 95%) du retard de croissance était de 35,8% (29,4 ;41,1). Le retard de croissance était associé aux pratiques d’alimentation de complément chez les enfants âgés de 12-23 mois. L’indice z-score de la taille pour l’âge était en moyenne (DS) de -1,33 (0,63), -1,61 (0,30), et -2,11 (0,32) chez les enfants pour lesquels étaient utilisées des céréales fortifiées, chez les enfants pour lesquels étaient utilisées des céréales non fortifiées, et chez les enfants qui ne recevaient pas d’aliments de complément, respectivement (p=0,018).<p>L’infection à Plasmodium falciparum était présente chez 52,6% des enfants, 25,6% étant non fébrile et 27,0% fébrile. En comparaison aux enfants non infectés, les enfants ayant une infection fébrile, mais aussi ceux ayant une infection non fébrile avaient un taux d’hémoglobine plus faible, les différences (ES) étant de 7,86 (1,75) g/L avec p<0,001 et de 3,52 (1,74) g/L avec p=0,044, respectivement.<p><p>Dans un contexte de prise en charge préventive et curative du paludisme et des géohelminthases, la supplémentation en fer pendant 6 mois a conduit à une augmentation moyenne (DS) du taux d’hémoglobine de 16,3 (13,6) g/L (p<0,001), alors que cette augmentation a été de 22,8 (14,6) g/L (p<0,001) pour la supplémentation en micronutriments multiples, soit une différence (IC à 95%) de 6,5 (2,0 ;11,1) avec p=0,003. La supplémentation en fer conduisait à une réduction de la prévalence de l’anémie de 40,6%, alors que cette réduction était de 62,0% avec la supplémentation en micronutriments multiples, soit un ratio ajusté de prévalences de guérison [PRR (IC à 95%)] de 1,62 (1,22 ;2,15), p<0,001.<p>Une farine améliorée à été produite à partir d’ingrédients disponibles localement ;elle se composait de petit mil (51,7%), haricots (8,8%), arachide (7,8%), malt de sorgho rouge (9,0%), soumbala (9,3%), sucre (12,7%), et de sel iodé (0,8%). La bouillie améliorée préparée avec cette farine avec une consistance de 120 mm/30 s (distance d’écoulement dans un consistomètre de Bostwick) avait une densité énergétique de 103 kcal/100 g, une teneur en fer de 2,6 mg/100 kcal, et une teneur en zinc de 1,2 mg/100 kcal. La production de la farine et la préparation de la bouillie étaient reproductibles par les ménagères.<p>La consommation de bouillie à chaque session était en moyenne de 29 ou 28 g/kg de poids corporel/repas, correspondant à 108 ou 105% de la consommation souhaitée, alors que la présence au centre de nutrition ouvert dans le village n’était que de 68 ou 58%, dans le groupe consommant la bouillie sans supplément de micronutriments et le groupe consommant la bouillie avec un supplément de micronutriment multiples, respectivement.<p>Dans un contexte de prise en charge préventive et curative du paludisme et des geohelminthases la consommation de la bouillie améliorée sans supplément de micronutriments conduisait à une augmentation du taux d’hémoglobine de 14,8 (11,8) g/L (p<0,001), et la consommation de la bouillie améliorée avec des suppléments de micronutriments multiples entraînait une augmentation de 17,3 (15,8) g/L (p<0,001), soit une différence (IC à 95%) de 3,5 (-1,0 ;8,1) g/L (p=0,13). La prévalence de l’anémie en fin d’intervention était de 67,9% et de 55,6% dans les groupes BA et BAM, respectivement (p=0,13)<p><p>Ces résultats soulignent la nécessité de mesures permettant de réduire rapidement la prévalence de l’anémie chez les enfants âgés de 6-23 mois de ce district. La stratégie de supplémentation en micronutriments multiples combinée à la prise en charge préventive et curative du paludisme et des géohelminthiases est la stratégie à préférer. <p>La supplémentation en micronutriments multiples pourrait être relayée progressivement par la stratégie basée sur une alimentation de complément améliorée au niveau des ménages, toujours dans un contexte de prise en charge préventive et curative du paludisme et des géohelminthases. Intégrés dans la routine des ménages et soutenus par une formation et une éducation nutritionnelles, les procédés de production de farine puis de bouillie améliorée devraient avoir une plus grande portée sur la prévention de l’anémie à moyen et long termes.<p><p>Anaemia is a widespread public health problem with major consequences for human health as well as social and economic development. Pregnant women and young children are the most affected. This work aimed at 1) analysing the anaemia situation among children aged 6-23 months of the rural district of Kongoussi (Burkina Faso), and 2) assessing the efficacy of integrated strategies. Two cross-sectional and two randomised, population-based studies were conducted over the January 2004-June 2006 period.<p><p>The prevalence (95% CI) of anaemia was 98.8% (97.6 ;99.9); that of severe anaemia was 29.5 (23.9 ;35.0). Hypochromia was retrieved in 65.1% of anaemic children.<p>Mean (SE) haemoglobin concentration was higher in non-stunted children [81.1 (2.6) g/L] than in their stunted counterparts [77.2 (2.8) g/L], p=0.026. The prevalence (95% CI) of stunting was 35.8% (29.4 ;41.1). After adjustment for children, mothers and household characteristics, and for current and past breastfeeding patterns, the height-for-age z-score (HAZ) remained associated with the mode of complementary feeding among children aged 12-23 months. The adjusted mean HAZ (SE) was –1.33 (0.63), -1.61 (0.30), and –2.11 (0.32) among children consuming fortified cereals, unfortified cereals, or no complementary food, respectively (p=0.018)<p>Plasmodium falciparum infection was noted in 52.6% of children with 25.6% being afebrile and 27.0% being febrile. Compared to uninfected children, children with febrile infection and those with afebrile infection had lower haemoglobin concentration, the differences (ES) being 7.86 (1.75) g/L (p<0.001) and 3.52 (1.74) g/L (p=0.044), respectively.<p><p>Combined with malaria and geohelminths preventive and curative care, daily iron supplementation for 6 months led to a mean increase (SD) of haemoglobin concentration of 16.3 (13.6) g/L (p<0.001), whereas the increase was 22.8 (14.6) g/L (p<0.001) with daily multiple micronutrients supplementation. The difference (95% CI) of haemoglobin concentration at the end of intervention was of 6.5 (2.0 ;11.1), p=0.003. Iron supplementation reduced the prevalence of anaemia by 40.6%, while the reduction was of 62.0% with the multiple micronutrients supplementation. The prevalence rate ratio [PRR (95% CI)] of children who were cured from anaemia at the end of intervention was 1.62 (1.22 ;2.15), p<0.001.<p>A new, local-ingredient-based flour was developed to prepare an improved mush for children. It was composed of pearl millet (51.7%), beans (8.8%), peanuts (7.8%), malted red sorghum (9.0%), soumbala (9.3%), sugar (12.7%) and iodized salt (0.8%). When this improved mush was prepared with a consistency of 120 mm/30 s (Bostwick flow distance), its volumetric mass, energy density, iron content and zinc content are 103 g/100 ml, 103 kcal/100 g, 2.6 mg/100 kcal, and 1.2 mg/100 kcal respectively. The flour production and mush preparation were reproducible by rural housewives.<p>The average mush consumption was 29 and 28 g/kg body weight/meal, corresponding to 108 and 105% of the desired consumption, whereas the child’s presence at the nutrition centre that was opened in his village was 68 and 58%, in the group consuming the mush without micronutrient supplement (MG) and that consuming the mush with a multiple micronutrients supplement (MMG). Mean (SD) haemoglobin concentration increased of [14.8 (11.8) g/L, p<0.001] in the MG and [17.3 (15.8) g/L, p<0.001] in the MMG. The between group difference (95% CI) of 3.5 (-1.0 ;8.1) g/L in mean (SD) endpoint haemoglobin concentration was not significant (p=0.13). The prevalence of anemia at the end of intervention was 67.9% and 55.6% in the MG and MMG, respectively (p=0.13)<p><p>These results underline the need of urgent actions to rapidly reduce the prevalence of anemia. The multiple micronutrients supplementation combined with malaria and geohelminths preventive and curative care is the strategy to prefer. However, this strategy could be progressively replaced by that including complementary feeding improvement. To increase the mush consumption and better meet the needs of young children, flour and mush production must enter the routines of individual households. If this integration is to succeed, it should be supported by a large-scale program of training and nutrition education.<p><br>Doctorat en sciences médicales<br>info:eu-repo/semantics/nonPublished

L'etude de la resistance aux insecticides apporte des informations sur les mecanismes evolutifs permettant aux insectes de s'adapter aux modifications de leur environnement, mais elle presente egalement un interet pratique majeur en matiere de lutte. Notre etude a porte sur deux especes de moustiques d'interet majeur en sante publique, anopheles gambiae s. L. Et culex pipiens quinquefasciatus. Nous avons caracterise les mecanismes de resistance et etudie certains facteurs qui permettent d'analyser les situations observees en afrique de l'ouest et dans une certaine mesure d'en prevoir l'evolution. En cote d'ivoire et au burkina faso les populations de c. P. Quinquefasciatus sont a des degres divers resistantes aux principales familles d'insecticides chimiques. Cette resistance est associee a plusieurs mecanismes (metabolique, modification de la cible), qui en fonction de leur distribution locale permettent d'envisager differentes strategies de lutte. L'etude du polymorphisme des genes neutres a montre qu'au sein d'une meme ville les populations de c. P. Quinquefasciatus ne sont pas differenciees. Au contraire, a l'echelle des deux pays etudies, elles apparaissent fortement differenciees et ce d'autant plus que les villes sont geographiquement eloignees les unes des autres. Toutefois, l'existence de flux geniques permet d'expliquer la dispersion des genes de resistance d'une ville a l'autre. Dans plusieurs pays d'afrique de l'ouest, nous avons mis en evidence une resistance aux pyrethrinoides d'an. Gambiae s. S. , vecteur majeur du paludisme. Cette resistance est associee a une mutation de la cible de ces insecticides (gene kdr). Une analyse de l'impact de cette mutation sur le comportement des moustiques en presence d'insecticides a montre que cette resistance ne devrait probablement pas constituer un obstacle majeur a la mise en place de programmes de lutte bases sur l'utilisation de moustiquaires impregnees de pyrethrinoides. La poursuite de ces recherches au plan operationnel devrait permettre de preciser les modes de circulation des genes de resistance dans le but d'ameliorer les strategies de lutte contre les moustiques, vecteurs de maladies tropicales. En ce sens, elles s'integrent dans le cadre des objectifs scientifiques du futur centre de biologie et de gestion des populations.

Between 1994 to 1998 the ANRS 049a DITRAME trial was conducted during which a short regimen of ZDV demonstrated for the first time acceptability, tolerance and efficacy on reduction of mother-to-child transmission (MTCT). Our major aim was to analyze certain virological characteristics of infected women in this cohort and their association to HIV-1 transmission. On the one hand, we analyzed the HIV-1 replication capacity in different physiological compartments :blood, vaginal fluids (VF) and breast milk (BM) related to MTCT were investigated by nested case control studies in the DITRAME cohort. We demonstrated the relationship between plasma viral load (VL), at 34 weeks of amenorrheae and at Day 8 post partum, and MTCT in Africa where the probability to be exclusively breastfed for an one year infant is 46.6%. We also analyzed relationship between plasma VL and ZDV treatment. Additionally, we demonstrated that MTCT is essentially the consequence of a high proviral load in VF in our context. Moreover, reduced levels of HIV-1 RNA in milk at Day 8 were observed in mothers receiving ZDV therapy rather than in mothers under placebo. For the first time, the association between BMVL and postnatal transmission has been studied. We observed a highly significative difference between BMVL of women who transmitted the virus and those who did not. Moreover, univariate and multivariate analyzes clearly indicated that early breastfeeding log10 HIV-RNA at Day8 is an independent factor significatively associated to MTCT. Decreased median BMVL from 1608 copies/mL (c/ml) at Day8 to 346 c/ml at Day45 were found for mothers who transmitted the virus during the postpartum and who received placebo. Nevertheless, for those who received ZDV, median BMVL increased from 56 c/ml at Day8 to 470.5 c/ml at Day45. This marked trend to a rebound effect of BMVL could be the consequence of the treatment withdrawal as observed for adults at HAART withdrawal. <p>On the other hand, we studied the variability of HIV and its association with MTCT. First, we analyzed HIV-1 diversity in African women in France and Burkina Faso. In a second step, we demonstrated that HMA was an adapted tool for co and super-infections studies for adults. By this way, we identified two superinfections among 147 women within our commercial sex workers cohort. Additionally, we used this tool to analyze children of the DITRAME cohort who were infected in utero and who could be superinfected during the delivery or later by breastfeeding. We identified seven children, among 18 who were infected in utero, displaying HMA profiles suspicions for co-infections, and who had a more important mortality rate than normally. Their proviral env sequences are currently analyzed. <p>Moreover, we confirmed the fact that the rate of vitamin A has no influence on MTCT.<p><p>De 1994 à 1998, s’est déroulé l’essai clinique DITRAME ANRS 049a qui a démontré, pour la première fois, l’acceptabilité, la tolérance et l’efficacité d’un traitement court de zidovudine (ZDV) sur la diminution de la TME. Notre travail s’est inscrit dans le cadre de cet essai et a eu pour but d’en analyser certains des aspects virologiques et leur rapport avec la transmission de la mère à l’enfant du VIH (TME). D’une part, nous avons analysé les niveaux de réplication virale dans différents compartiments physiologiques :le sang, les sécrétions cervico-vaginales (SCV) et le lait maternel (LM) et leur rapport avec la transmission, par des études cas-témoins nichées dans la cohorte DITRAME. Nous avons démontré le rapport entre la charge virale libre (CV) dans le plasma à 34 semaines d’aménorrhée et à J8 postpartum et la TME dans le contexte africain où la probabilité d’avoir un allaitement exclusif à un an est de 46,6%, et analysé leur rapport avec le traitement ZDV. Nous avons également démontré que la TME est essentiellement due à une charge provirale plus élevée dans les SCV dans notre contexte. De plus, grâce à la mise au point d’une technique, nous avons démontré que la ZDV avait un effet global marqué sur la diminution de la CV libre dans le LM. Il s’agit de la première étude mettant en relation la CV dans le lait avec la transmission postnatale. De même, nous avons observé une différence très hautement significative entre les charges virales libres des femmes ayant transmis le VIH et les non transmettrices. De plus, nos analyses univariée et multivariée démontrent que la CVlm mesurée en log10 de la lactation précoce (J8) est un facteur indépendant très significativement associé à la TME. Chez les femmes ayant transmis le virus durant le post-partum et non traitées à la ZDV, la CVlm médiane a décru de 1608 copies/mL (c/ml) à J8 à 346 c/ml à J45. Par contre, chez les femmes ayant transmis le virus mais ayant reçu un traitement ZDV, la CVlm médiane évolue de 56 c/ml à J8 à 470,5 c/ml à J45. Cette tendance marquée à un effet rebond de la CVlm à J45 laisse penser que la TME qui a lieu chez les femmes traitées à la ZDV pourrait être une conséquence de l’arrêt de ce traitement, comme observé chez les adultes après arrêt du traitement HAART.<p><p>D’autre part, nous avons étudié la variabilité du VIH en fonction de la TME. Dans un premier temps, nous avons analysé la diversité du VIH-1 chez des mères africaines vivant en France, et par après au Burkina Faso. Ensuite, grâce à l’élaboration d’une nouvelle technique, nous avons démontré que le HMA pouvait être un outil adapté à l’étude des co- et sur-infection chez l’adulte. Nous avons identifié de cette manière deux surinfections parmi 147 femmes analysées au sein d’une cohorte de femmes à haut risque de surinfection. Nous avons ensuite utilisé ce moyen pour étudier des enfants de la cohorte DITRAME infectés in utero qui auraient pu se surinfecter durant le peripartum ou ensuite par l’allaitement. Sept enfants parmi 18 analysés, présentant des profils HMA à suspicion de coinfection et qui présentaient un taux de mortalité plus élevé que la normale, ont été identifiés. Leurs séquences provirales env sont en cours d’analyse actuellement. <p><p>Par ailleurs, nous avons confirmé le fait que le taux de vitamine A n’a pas d’influence sur la TME.<p><br>Doctorat en Sciences agronomiques et ingénierie biologique<br>info:eu-repo/semantics/nonPublished

La virescence florale du cotonnier, encore appelée phyllodie, est une maladie qui affecte les plantations au Burkina Faso. Avec le développement de la culture cotonnière, elle a pris une certaine extension et des flambées d'allure épidémique peuvent se produire et affecter assez sérieusement la production dans certaines zones. Elle débute par un verdissement des boutons floraux (virescence), se développe avec la transformation progressive des structures florales en lames foliacées, accompagnée parfois de jaunissement foliaire, et évolue vers le stade phyllodie, avec prolifération dense de petites feuilles portées par des rameaux grêles. La plante devient stérile et inapte à toute production. La maladie est associée à la présence d'organismes de type mycoplasme, et c'est le premier cas de ce genre décrit en Afrique. Les travaux exposés dans la présente étude ont permis de mettre en évidence le rôle vecteur d'Orosius cellulosus (Homoptera, Cicadellidae) dans la transmission de la maladie, et de préciser le rôle de Sida cordifolia et de S. Rhombifolia (Malvaceae) comme plantes-hôtes et possibles sources d'inoculum. Le rôle d'un certain nombre d'autres plantes-hôtes ou plantes refuges (Mitracarpus scaber, Sesamum sp. ) est également discuté. A la suite des essais de transmission inter et intraspécifiques, l'existence d'un même mycoplasme responsable de la virescence florale du cotonnier et de celle de Sida sp. Est envisagée. L'étude des modalités de transmission de la maladie montre que les deux sexes sont aptes à la transmission mais pas les larves. La biologie et la dynamique des populations d'O. Cellulosus sont décrites, et les variations de sex-ratio observées chez le vecteur en fonction des plantes-hôtes sont étudiées<br>The floral virescence of cotton, also called phyllody, is a disease which affects cotton fields in Burkina Faso (Former Upper Volta). With the development of cotton growing, it has taken a certain extent and epidemic strokes may happen and affect seriously cotton production in some areas. The disease starts with a greening of floral buds (virescence), followed by a progressive transformation of floral structures into foliar like elements and by a dense proliferation of small leaves (phyllody). Foliar yellowing may happen. Cotton plant becomes sterile and unable to produce. The disease is associated with the presence of MLO (mycoplasma like organisms) and is the first of this kind to be described in Africa. The present study establishes the responsibility of Orosius cellulosus (Homoptera, Cicadellidae) in the disease transmission, and the role of Sida cordifolia and S. Rhombifolia (Malvaceae) as host-plants and inoculum reservoir is discussed, as well as the presence of other plants such as Mitracarpus scaber and Sesamum sp. Through various transmission tests, the existence of a common MLO in both diseases of cotton and Sida sp. Is considered. The study of the different aspects of the transmission of the disease shows that both sexes are able to transmit, but not nymphs. Biology and dynamics of populations of O. Cellulosus are described, and differences in sex-ratio according to various host-plants are discussed

La tuberculose est une maladie infectieuse et contagieuse, dont l'agent pathogène principal est l'espèce Mycobacterium tuberculosis. Cette thèse a pour objectif principal d'étudier la tuberculose par une approche d'épidémiologie génétique dans deux pays à forte incidence, Djibouti et le Burkina Faso, et une zone à faible incidence, Montpellier et sa région. Ce travail permet de mieux comprendre la propagation de cette maladie infectieuse dans ces régions et de donner des informations indispensables pour les services de santé publique. Pour chacune de ces régions, ce sont les premières études du genre et cette thèse représente donc un travail original et informatif. Les objectifs spécifiques sont : (i) d'étudier la diversité génétique, les relations phylogénétiques entre les souches et la structure des populations de M. Tuberculosis dans ces trois zones ; (ii) de comprendre la dynamique de transmission de la tuberculose dans ces trois régions ; (iii) de tenter d'identifier des facteurs de risque impliqués dans la transmission de la tuberculose ; (iv) enfin par une approche globale de comparer les résultats obtenus pour ces trois régions et de les confronter avec les données de la littérature. Les isolats ont été prélevés par les services de santé publique de chacun des pays concernés et ont été cultivés et/ou stockés au laboratoire de bactériologie du CHU de Montpellier (un total de 320 souches). La caractérisation génétique des échantillons est réalisée par 2 marqueurs moléculaires complémentaires reconnus pour le génotypage de M. Tuberculosis : le spoligotypage et les MIRU-VNTR (Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit Variable Number of Tandem Repeats). La caractérisation génétique a permis d'identifier 247 souches comme appartenant à des familles déjà décrites dans la littérature et 73 souches présentant des nouveaux génotypes. Une grande hétérogénéité génétique observée dans l'échantillon de Montpellier reflète le niveau endémique et le bon contrôle de cette maladie dans cette région de faible incidence (6,6 cas pour 100000 habitants). Cette étude permet d'identifier que la majorité des cas sont dus à des réactivations endogènes. Néanmoins, les données mettent en évidence des cas de transmission récente familiale et des cas de tuberculose importés. Au Burkina Faso, pays présentant une incidence élevée (163 cas pour 100000 habitants), les points importants sont : un faible nombre de cas résistants aux antituberculeux et non impliqués dans les cas de transmission récente ; une diversité génotypique relativement élevée reflétant l'existence d'une prise en charge de la maladie ; l'infection par le VIH ne constitue pas un facteur de risque de transmission récente malgré une incidence du VIH élevée ; on observe l'émergence de la famille LAM10 déjà décrite au Cameroun appelée famille Cameroun. Cette famille est responsable de la majorité des nouveaux cas de tuberculose au Burkina Faso. A Djibouti, pays présentant la plus forte incidence de tuberculose au niveau mondial (733 cas pour 100000 habitants), on observe une structuration remarquable de la population de M. Tuberculosis en 3 lignées bien individualisées, proches des familles EAI, T et CAS. La diversité génétique observée dans ce pays apparaît élevée en dépit d'un taux de transmission récente important. Ceci suggère l'ancienneté de ces lignées dans ce pays en accord avec les données de la littérature. Les études génétiques apportent non seulement des informations fondamentales pour l'épidémiologie de la tuberculose mais également sur la structure des populations, base indispensable pour appréhender la lutte et le contrôle d'un organisme pathogène. La comparaison des données obtenues dans ces trois pays d'incidences différentes et la mise en regard avec les données de la littérature permettent d'identifier des profils épidémiologiques et génétiques observés classiquement pour cette maladie infectieuse, mais également des caractéristiques spécifiques à chacun des pays d'étude. En conclusion, ces études réalisées à un niveau local mais également abordées d'un point de vue global permettent de définir quelles sont pour chacune des zones d'études les perspectives de recherche et les stratégies à développer pour le contrôle de la tuberculose.

Notre travail a montré qu’un système de surveillance épidémiologique (SEpi), comme ceux basés sur la téléphonie mobile, doit être obligatoirement intégré au système national. Souvent les acteurs extérieurs imposent et décident de la mise en place d’un système d'information (SI), sans réelle concertation avec les utilisateurs et responsables, sans intégration au système national, sans réflexion à long terme, sur le fonctionnement, les coûts, les développements. Les utilisateurs et les responsables doivent s’approprier le dispositif, tant dans sa mise en place que dans le maintien, le développement et l’analyse. L’exemple de la variation spatio-temporelle du paludisme a montré que des facteurs non sanitaires, en l’occurrence environnementaux, impactent sur la survenue d’épidémies. Il est donc nécessaire, pour avoir une vision de la situation épidémiologique dans un contexte de décision nationale, d’intégrer ces facteurs pour optimiser l’analyse et la SEpi. Il est indispensable, pour une analyse utile d’une situation épidémiologique, d’avoir, en temps réel, des échelles spatiales et temporelles très fines. Le succès du développement d’un SI réside principalement dans l’implication des autorités à chaque niveau hiérarchique. Sans politique de SIS décidée au plus haut niveau, structurée et activement coordonnée, toute mise en œuvre d’un nouvel outil (tablette, téléphone etc.) est vouée à l’échec, quel que soit le budget alloué.Il faut sortir de la tradition de bilan/rapport annuels qui n’analyse que des informations agrégées passées, déconnectées du SI national, pour entrer dans la SEpi 2.0 en temps réel, réactive, intégrée dans un SIS structuré et coordonnée nationalement<br>Our work has shown that an epidemiological surveillance system (SEpi), such as those based on mobile phones, must be integrated into the national system. Often external actors impose and decide on the implementation of an information system (IS), without real consultation with users and managers, without integration into the national system, without long-term reflection on the functioning, costs and developments. Users and managers must take ownership of the system, both in its implementation and in its maintenance, development and analysis. The example of the spatial and temporal variation of malaria has shown that non-health factors, in this case environmental factors, have an impact on the occurrence of epidemics. It is therefore necessary, in order to have a vision of the epidemiological situation in a national decision-making context, to integrate these factors to optimize the analysis and the SEpi. It is essential, for a useful analysis of an epidemiological situation, to have, in real time, very fine spatial and temporal scales. The success of IS development depends mainly on the involvement of authorities at each hierarchical level. Without an SIS policy decided at the highest level, structured and actively coordinated, any implementation of a new tool (tablet, mobile phone, etc.) is doomed to failure, regardless of the budget allocated.It is necessary to move away from the tradition of annual review/reporting, which only analyses past aggregated information, disconnected from the national IS, to enter SEpi 2.0 in real time, reactive, integrated into a structured and nationally coordinated SIS

Malgré les progrès dans la lutte contre le paludisme au Burkina Faso, il reste la plus importante maladie à transmission vectorielle dans le pays. P. falciparum est le plus répandu et le plus mortel au Burkina Faso. Les facteurs liés à ce fardeau élevé sont l’inaccessibilité (financière et géographique) aux soins de santé, l’insuffisance dans le diagnostic et la prise en charge adéquate et précoce des cas de paludisme. La réalisation de l'Objectif du Développement Durable 3 au Burkina Faso repose sur une mise en œuvre réussie d'un ensemble d'interventions de prévention, de gestion des cas et de surveillance épidémiologique du paludisme. L'objectif de réduire le taux de létalité lié au paludisme à 1 % en 2020 n'a pas été atteint, il est donc nécessaire de réaliser une évaluation de l’efficacité des programmes de lutte antipaludique (utilisation des MILDA, utilisation des CTA, la politique de gratuité des soins de santé) surtout au niveau infranational, utile pour orienter la prise de décision à des échelles géographiques plus petites. Les données cliniques sur le paludisme collectées en routine peuvent fournir des informations indispensables pour l’évaluation de la variation inter et intra mensuelle/annuelle de l’effet des interventions de lutte antipaludique et du risque de paludisme à l'échelle nationale et infranationale chez les enfants de moins de cinq ans. Au Burkina Faso, une quantité importante de données a été régulièrement collectée par le biais du système de transmission des données en ligne via le « District Health Information System 2 (DHIS2) ». Toutefois, leur utilisation pour évaluer l’effet des interventions de lutte sur la dynamique spatio-temporelle du risque de paludisme à l’échelle locale (district) reste limitée au Burkina Faso. Dans cette recherche, nous avons développé des modèles spatiaux et spatio-temporels implémentés dans un cadre hiérarchique bayésien pour (I) évaluer l’effet des interventions de lutte sur la dynamique spatio-temporelle de la morbidité et de la létalité dues au paludisme sur la période 2013-2018 chez les enfants de moins de 5 ans au Burkina Faso et (II) détecter les districts sanitaires (spatio-temporelle) qui ne parviennent pas à atteindre les objectifs du PNLP en termes de morbidité/létalité. Ces modèles utilisent l’Approximation Intégrée de la Laplace (INLA), un algorithme déterministe qui est une méthode appropriée pour analyser les données de routine du paludisme corrélées à la fois dans l’espace et dans le temps. Nous avons observé que la mise en œuvre de la politique de gratuité des soins de santé était significativement associée à une augmentation du nombre de cas rapportés de paludisme testés et confirmés par rapport à la période précédant sa mise en œuvre. Cet effet était cependant hétérogène dans les districts de santé. De plus, nous avons constaté que le taux mensuel de létalité du paludisme était en baisse au cours de la période 2013-2018. Cette réduction était significativement associée à la disponibilité des tests de diagnostic rapide du paludisme et du traitement. Aussi, nous avons observé que le risque de décéder du paludisme chez les enfants de moins de 5 ans était plus faible au cours de la période suivant la mise en œuvre de cette politique par rapport à la période précédente. Nous avons également identifié des districts sanitaires avec un taux de létalité du paludisme élevé dans les parties nord, nord-ouest et sud-ouest du pays. Nos résultats appellent à un effort soutenu et renforcé pour tester tous les cas suspects afin que, parallèlement à l’amélioration de la prise en charge précoce des cas, le fardeau du paludisme chez les enfants de moins de cinq ans soit connu avec précision (voir l'hippopotame presque entièrement). De plus, ils ont mis en évidence les districts sanitaires qui ont le plus besoin d'interventions ciblées et la nécessité de maintenir et de renforcer les programmes de santé en cours pour réduire davantage les décès dus au paludisme au Burkina Faso.<br>Despite progress in the fight against malaria in Burkina Faso, malaria remains the most important vector-borne disease in the country, and P. falciparum is the most widespread and deadly pathogen in the area. The factors linked to this high burden are the inaccessibility (financial and geographical) to health care, insufficient diagnoses, and inadequate/late management of malaria cases. The achievement of Sustainable Development Goal 3 in Burkina Faso is based on the successful implementation of a set of interventions for the prevention, case management, and epidemiological surveillance of malaria. The objective of reducing the case fatality rate linked to malaria to 1% by 2020 has not been reached. It is, therefore, necessary to carry out an evaluation of the effectiveness of malaria control programs (the use of long-lasting insecticidal nets, the use of Artemisinin-based combination therapy, and free health care policies), especially at the sub-national level, which will be useful for guiding decision-making at smaller geographic scales. Routinely collected clinical data on malaria can provide essential information for the assessment of inter- and intra-monthly/annual variation in the effects of malaria control interventions and the risk of malaria at the national and subnational levels among children under five. In Burkina Faso, a significant amount of data is regularly collected through the online data transmission system via the “District Health Information System 2 (DHIS2)”. However, the use of these data to assess the effects of control interventions on the spatio-temporal dynamics of malaria risk at the local (district) level remains limited in Burkina Faso. In this research, we developed spatial and spatio-temporal models implemented in a Bayesian hierarchical framework to (i) assess the effects of control interventions on the spatio-temporal dynamics of morbidity and lethality due to malaria in the period of 2013–2018 in children under 5 in Burkina Faso and (ii) detect health districts (spatio-temporal) that fail to achieve the PNLP objectives in terms of morbidity/lethality. These models use Laplace Integrated Approximation (INLA), a deterministic algorithm that provides an appropriate method for analyzing routine malaria data correlated in both space and time. We observed that the implementation of the free health care policy was significantly associated with an increase in the number of reported cases of malaria tested and confirmed compared to the period before its implementation. This effect was, however, heterogeneous in the health districts. In addition, we found that the monthly malaria case fatality rate declined during the period of 2013–2018. This reduction was significantly associated with the availability of rapid diagnostic tests for malaria and treatments. We also observed that the risk of dying from malaria in children under 5 years old was lower during the period following the implementation of this policy compared to the previous period and identified health districts with a high case fatality rate from malaria in the northern, northwestern, and southwestern parts of the country. Our results call for a sustained and strengthened effort to test all suspected cases so that, along with improving early case management, the burden of malaria in children under five can be known with precision. In addition, our results highlight the health districts in greatest need of targeted interventions, as well as the need to maintain and strengthen ongoing health programs to further reduce malaria deaths in Burkina Faso.<br>Doctorat en Sciences de la santé Publique<br>info:eu-repo/semantics/nonPublished

L’apparition de nouveaux rythmes de comportement de piqûre des anophèles suite à la pression des insecticides utilisés aussi bien en santé humaine qu’en agriculture est inquiétante pour la lutte contre le paludisme. En effet, la menace de la sélection de populations de vecteurs capables de se soustraire de la barrière physico-chimique des MILD et piquant lorsque les personnes ne sont pas protégées demeure. Il est connu que bon nombre de rythmes de vie des anophèles sont gouvernés par une horloge endogène dite circadienne qui permet leur organisation temporelle. En outre, plusieurs stimuli environnementaux biotiques (résistance physiologique, état nutritionnel, parasitisme, compétition) ou abiotiques (le cycle lumière-obscurité, la température, humidité) peuvent moduler les rythmes de comportement des insectes. Dans le cadre d’une meilleure compréhension du comportement agressif décalé des anophèles vecteurs observé sur le terrain et des déterminants qui peuvent y être impliqués, nous avons entrepris des études expérimentales sur le rythme journalier d’activité locomotrice des populations d’anophèles vecteurs de Plasmodium et impliquée dans la transmission du paludisme au Burkina Faso<br>The appearance of new patterns in Anopheles biting behavior following the universal coverage of LLINs is worrying for malaria control. Indeed, the meticulous selection of vector populations that are able to escape the physical-chemical barrier of LLINs and bite when people are not protected is still ongoing. It is known that many Anopheles life rhythms are governed by an endogenous clock known as circadian which allows their temporal organization. In addition, several biotic (physiological resistance, nutritional status, parasitism, competition) or abiotic (light-dark cycle, temperature) environmental stimuli can modulate the insects’ behavioral rhythms. As part of a better understanding of the shifted aggressive behavior observed in the field among malaria vector, and the determinants that may be involved, we have undertaken experimental studies on the daily rhythm flight activity of population of vectors that are involved in the transmission of malaria in Burkina Faso

La lutte antivectorielle est le moyen général le plus efficace pour prévenir la transmission du paludisme en Afrique sub-saharienne. La résistance aux insecticides pyréthrinoïdes (mutation kdr) est apparue et évolue parmi les vecteurs, essentiellement An. Gambiae s. L. L'efficacité des moustiquaires imprégnées de pyréthrinoïdes semble être menacée par la présence de la résistance et la recherche d'alternatives aux pyréthrinoïdes est donc une priorité. Au laboratoire comme dans les populations naturelles, l'étude des caractéristiques et de la dynamique de la mutation de l'acétylcholinestérase (ace-1R) qui confère la résistance aux carbamates et aux organophosphorés (insecticides proposés comme alternatifs aux pyréthrinoïdes) nous révèle qu'elle confère un avantage aux moustiques An. Gambiae s. S. Qui la portent en présence d'insecticide. Cet avantage se manifeste chez les hétérozygotes du fait de la dominance partielle du gène et il varie selon les insecticides. En absence d'insecticide il existe un coût génétique qui affecte des traits d'histoire de vie du moustique résistant diminuant ainsi ses chances de reproduction. Ce coût génétique est probablement dû à la forte diminution d'activité totale de l'enzyme codée par ace-1R. La mutation ace-1R est déjà présente à des fréquences élevées dans les populations naturelles de l'Afrique de l'Ouest. Elle résulte d'une mutation unique qui s'est propagée sur l'ensemble des sites que nous avons étudiés probablement par migration. Sa présence chez les deux formes S et M d'An. Gambiae s. S. Est due à une introgression. Elle est présente sous forme de deux allèles : un allèle résistant ace-1R constitué d'une copie du gène ace-1 portant la mutation G119S et un allèle « dupliqué » Ag-ace-1D qui porte une copie sensible et une copie G119S du gène ace-1 liées sur le même chromosome. Cette duplication pourrait diminuer le cout associé à la résistance et rendre ainsi inopérantes certaines stratégies de lutte par alternance d'insecticides. Ces trois allèles sont maintenant en compétition dans les populations naturelles d'An. Gambiae vecteur majeur du paludisme en Afrique de l'Ouest. Au Bénin, l'étude des mécanismes de résistance dus à la modification de la cible chez An. Gambiae s. L et Culex quinquefasciatus nous révèle que beaucoup de populations sont résistantes au DDT et à la perméthrine. Chez An. Gambiae, la comparaison des résultats de mortalité obtenus avec le DDT et la perméthrine indique que la résistance observée est en majeure partie due à la mutation kdr. La distribution de la mutation kdr est cependant inégale sur l'ensemble des sites. Deux espèces du complexe (An. Gambiae s. S. Et An. Arabiensis) ont été retrouvées soit seules, soit en sympatrie. Au sein de l'espèce An. Gambiae s. S. , la forme moléculaire S est présente dans presque toutes les localités prospectées tandis que la forme M n'a une forte proportion qu'au Sud et au nord. Notre étude a montré un fort lien entre la fréquence de la mutation kdr et l'usage agricole des insecticides contre les ravageurs du coton. Toutefois très peu d'échantillons des deux espèces (An. Gambiae et Cx. Quinquefasciatus) ont été trouvés résistants aux carbamates et organophosphorés testés, et la fréquence de la mutation ace-1R est encore faible. Ceci indique que l'usage des carbamates et des organophosphorés pourra être encore envisagé dans l'élaboration d'une stratégie de gestion de la résistance. Ces travaux offrent des perspectives de recherches intéressantes sur les plans fondamental et opérationnel en matière de lutte contre les vecteurs du paludisme. En effet ils permettent d'améliorer nos connaissances sur la biologie et l'écologie du vecteur et sur leurs mécanismes de résistance. En vue d'une meilleure lutte antivectorielle, il serait intéressant que les scientifiques des pays développés qui étudient la génomique travaillent en étroite collaboration avec les scientifiques des aires impaludées et avec les institutions locales<br>Vector control is one of the most effective methods of malaria prevention in sub-Saharan Africa. Resistance to pyrethroid insecticides (kdr mutation) has appeared in vectors of malaria, especially in An. Gambiae s. L. The effectiveness of pyrethroid-treated nets seems to be threatened by this resistance and the search for alternative insecticides is a priority. In the laboratory, as in field studies, the presence of an acetylcholinesterase mutation (ace-1R), which confers resistance to carbamates and organophosphates (insecticides proposed as alternatives to pyrethroids), provides an advantage to An. Gambiae s. S. In contact with the insecticide. This advantage is shown in heterozygotes by measuring the partial dominance of the gene. In the absence of insecticides, a genetic cost affects some life history traits of resistant mosquitoes, reducing their chances of reproduction. This genetic cost is probably due to the important reduction of enzymes activity coded by ace-1R. The ace-1R mutation is already present in high frequencies in natural populations of West Africa. This distribution results from a single mutation event that has been spread across our study sites by migration. Its presence in M and S forms of Anopheles gambiae s. S. Is due to a introgression phenomenon. The mutation is present in the two alleles : one ace-1R resistant allele made of a copy of the ace-1 gene carrying the G119S mutation, and one duplicated allele, Ag-ace-1D, that carries one susceptible and one resistant G119S copy linked on the same chromosome. This duplication might reduce the cost associated with the resistance and impair vector control strategies based on alternating insecticides. These alleles are in competition in natural populations of Anopheles gambiae, the primary vector of malaria in West Africa. In Benin, two species of the An. Gambiae complex (An. Gambiae s. S. And An. Arabiensis) were found either alone or in sympatry. In An. Gambiae s. S. , the S molecular form is present in almost all localities, whereas the M form was found in high proportions only in the south and the north. The study of resistance mechanisms due to target site modification in Anopheles gambiae s. L. And Culex quinquefasciatus reveal that many populations are resistant to DDT and permethrin. In Anopheles gambiae, the comparison of mortality with DDT and permethrin indicates that the resistance is due in large part to the kdr mutation. However, the distribution of this mutation is variable between sites. Our study showed a strong link between the frequency of the kdr mutation and agricultural use of insecticide against cotton pests. In all cases, very few samples of the two species (An. Gambiae and Cx. Quinquefasciatus) were found to be resistant to the carbamates and organophosphates used. The frequency of the ace-1R mutation was also small. This indicates that the use of carbamates and organophosphates might still be used in a resistance management strategy. These studies offer interesting perspectives on the possibilities of vector control for prevention of malaria. In fact, they allow improving our understanding of the biology and ecology of the vector and on the resistance mechanisms. In the pursuit of a better vector control strategy, it would be interesting for scientists in developed countries studying genomic to work in collaboration with scientists in areas where malaria is present and with local institutions

Sur la période 2006-2008, les prix de la plupart des produits agricoles ont connu une hausse spectaculaire. Un des facteurs explicatifs de cette flambée des prix est le changement climatique. En effet, l’instabilité pluviométrique et les températures extrêmes affectent négativement les récoltes agricoles et entraînent une baisse de l’offre alimentaire sur les marchés internationaux qui contribue à la hausse des prix agricoles. La flambée des prix agricoles et le changement climatique soulèvent de sérieuses préoccupations en ce qui concerne l’inflation et le bien être des populations dans le monde et surtout dans les pays pauvres dépendants des marchés internationaux. Dans un premier chapitre, nous montrons à partir de modèles économétriques sur séries temporelles que la hausse du prix du pétrole et les fluctuations du dollar américain sont les principaux facteurs de la hausse des prix internationaux agricoles. Dans un deuxième chapitre, à l’aide d’un modèle de cointégration non linéaire, nous mettons en évidence le fait que les hausses du prix du riz sur le marché international se transmettent plus rapidement aux marchés intérieurs du Burkina Faso que les baisses. Dans un troisième chapitre, nous montrons que la hausse du prix international du riz a un effet négatif sur la pauvreté et les inégalités de revenu au Burkina Faso. Le quatrième chapitre met en évidence l’effet négatif et significatif de la variabilité climatique sur la sécurité alimentaire dans les pays en développement. Cet effet apparait plus élevé dans les pays africains. Il ressort de cette thèse que les pays en développement et plus particulièrement les pays africains sont fortement vulnérables aux chocs de prix alimentaires et au changement climatique. Cette vulnérabilité s’explique par le fait que ces pays dépendent des importations alimentaires et ont un secteur agricole sensible au climat. Des initiatives de protection sociale des populations pauvres sont nécessaires compte tenu de l’accès limité à la nourriture engendré par la flambée des prix alimentaires. Des investissements viables pour une croissance agricole soutenue sont aussi nécessaires. Il peut s’agir d’investissements pour l’amélioration des infrastructures rurales et des services agricoles ainsi que pour la recherche de nouvelles pratiques agricoles moins sensibles aux aléas climatiques<br>Over the period 2006-2008, the prices of most of agricultural commodities considerably increased. One of the explanatory factors of this surge in prices is climate change. Indeed, rainfall instability and extreme temperatures negatively affect agricultural crops and lead to reduced food supply in international markets, which contributes to the rise in food prices. Soaring food prices and climate change raise serious concerns regarding inflation and welfare of households in the world and especially in poor countries that depend on food imports. In a first chapter, using econometric models applied to temporal series, we show that rising oil prices and fluctuations in the U.S. dollar are the main causes of the rise in world food prices. In a second chapter, using the threshold cointegration tests, we highlight the fact that the imported rice prices in the local markets of Burkina Faso respond more rapidly to increases than to decreases in the world price. In a third chapter, we show that the increase in the world rice price has a negative effect on poverty and income inequality in Burkina Faso. The effect is lower in the rice-producing areas but remains negative. The fourth chapter highlights the significant and negative effect of climate variability on food security in developing countries. The effect is higher in African countries than in other countries. The main message of this thesis is that developing countries and especially African countries are highly vulnerable to food price shocks and to climate change. This vulnerability might be explained by the fact that these countries depend on food imports and have an agricultural sector sensitive to climate variability. Initiatives for the social protection of poor households are required due to limited food access caused by soaring food prices. Investments for sustained agricultural growth are also required. These are for example investments for the improvement of rural infrastructure and agricultural services as well as development of new agricultural practices less sensitive to climate

Contexte. Le paludisme provoque annuellement le décès d’environ 25 000 enfants de moins de cinq ans au Burkina Faso. Afin d’améliorer un accès rapide à des traitements efficaces, les autorités burkinabées ont introduit en 2010 la prise en charge du paludisme par les agents de santé communautaires (ASC). Alors que son efficacité a été démontrée dans des études contrôlées, très peu d’études ont évalué cette stratégie implantée dans des conditions naturelles et à l’échelle nationale. Objectif. L’objectif central de cette thèse est d’évaluer, dans des conditions réelles d’implantation, les effets du programme burkinabé de prise en charge communautaire du paludisme sur le recours aux soins des enfants fébriles. Les objectifs spécifiques sont : (1) de sonder les perceptions des ASC à l’égard du programme et explorer les facteurs contextuels susceptibles d’affecter leur performance ; (2) d’estimer le recours aux ASC par les enfants fébriles et identifier ses déterminants ; (3) de mesurer, auprès des enfants fébriles, le changement des pratiques de recours aux soins induit par l’introduction d’une intervention concomitante – la gratuité des soins dans les centres de santé. Méthodes. L’étude a été conduite dans deux districts sanitaires similaires, Kaya et Zorgho. Le devis d’évaluation combine des volets qualitatifs et quantitatifs. Des entrevues ont été menées avec tous les ASC de la zone à l’étude (N=27). Des enquêtes ont été répétées annuellement entre 2011 et 2013 auprès de 3002 ménages sélectionnés aléatoirement. Les pratiques de recours aux soins de tous les enfants de moins de cinq ans ayant connu un récent épisode de maladie ont été étudiées (N2011=707 ; N2012=787 ; N2013=831). Résultats. Les résultats montrent que le recours aux ASC est très modeste en comparaison de précédentes études réalisées dans des milieux contrôlés. Des obstacles liés à l’implantation du programme de prise en charge communautaire du paludisme ont été identifiés ainsi qu’un défaut de faisabilité dans les milieux urbains. Enfin, l’efficacité du programme communautaire a été négativement affectée par l’introduction de la gratuité dans les centres de santé. Conclusion. La prise en charge communautaire du paludisme rencontre au Burkina Faso des obstacles importants de faisabilité et d’implantation qui compromettent son efficacité potentielle pour réduire la mortalité infantile. Le manque de coordination entre le programme et des interventions locales concomitantes peut générer des effets néfastes et inattendus.<br>Context. In Burkina Faso, malaria causes approximately 25,000 deaths every year in children under five. In 2010, national health authorities introduced case management of malaria by community health workers (CHWs) as a way to increase prompt access to effective treatments. While this strategy’s efficacy has been demonstrated in controlled studies, very few studies evaluated its effectiveness under real-world and nation-wide conditions of implementation. Objective. The overarching aim of this thesis is to evaluate the effects of the Burkinabè program on treatment-seeking practices in febrile children. The specific objectives are: (1) to examine CHWs’ perceptions and investigate the contextual factors likely to affect their performance; (2) to estimate the use of CHWs in febrile children and its determinants; (3) to evalauate changes in treatment-seeking practices induced by the introduction of a concomitant intervention – the removal of user fees at health centres. Methods. The study was conducted in two similar health districts, Kaya and Zorgho. The evaluation design integrates quantitative and qualitative components. Interviews were carried out with all CHWs in the study area (N=27). Surveys were repeated every year from 2011 to 2013 in 3002 randomly selected households. Treatment-seeking practices of all children with a recent sickness episode (N2011=707; N2012=787; N2013=831) were examined. Results. Results show that the use of CHWs is really low in comparison to previous controlled studies. Feasibility issues in urban areas and barriers to implementation of the community case management of malaria programme were identified. Moreover, its effectiveness in rural areas was challenged by the removal of user fees at health centres. Conclusion. In Burkina Faso, community case management of malaria faces serious challenges of feasibility and implentation. These challenges compromise the programme’s potential to reduce child morbidity and mortality. The lack of integration between the programme and local concomitant interventions can generate unpredicted adverse effects.

Depuis plusieurs décennies, des études empiriques réalisées sur plusieurs pays développés ou en émergence ont montré que la baisse de la taille de la famille favorise l’investissement dans l’éducation des enfants, expliquant qu’un nombre élevé d’enfants a un effet d’amenuisement des ressources familiales. Les retombées positives de la baisse de la fécondité sur l’éducation sont largement étudiées et connues. En dépit des résultats controversés des premières études portant sur les pays de l’Afrique de l’Ouest, les récentes études empiriques tendent à confirmer l’effet positif de la baisse de la taille de la famille dans le contexte africain, du moins en milieu urbain. Par contre, jusqu’à présent, très peu d’études semblent intéressées à analyser la répartition de ces retombées entre les enfants, et encore moins à comprendre comment ces dernières affecteraient la structure des inégalités éducatives existantes. Notre étude s’intéresse à explorer la potentielle dimension démographique des inégalités socioéconomiques, notamment les inégalités éducatives dans le contexte de la baisse de la fécondité. Elle vise à apporter des évidences empiriques sur le lien entre la réduction de la taille de la famille et les inégalités éducatives au sein des ménages dans le contexte d’Ouagadougou, Capitale du Burkina Faso, qui connait depuis quelques décennies la chute de la fécondité. Elle analyse aussi l’effet de cette réduction sur la transmission intergénérationnelle des désavantages éducatifs. Pour ce faire, nous proposons un cadre conceptuel pour comprendre les mécanismes par lesquels la relation entre la réduction de la taille de la famille et les inégalités éducatives se tisse. Ce cadre conceptuel s’appuie sur une recension des écrits de divers auteurs à ce sujet. Par la suite, nous procédons à des analyses empiriques permettant de tester ces liens en utilisant les données du projet Demtrend collectées. Les résultats empiriques sont présentés sous forme d’articles scientifiques. Les conclusions du premier article indiquent que la relation entre le nombre d’enfants de la famille et l’éducation varie selon le contexte socioéconomique. En effet, pour les générations qui ont grandi dans un contexte socioéconomique colonial et postcolonial, où le mode de production était essentiellement agricole et l’éducation formelle n’était pas encore valorisée sur le marché du travail, la relation est très faible et positive. Par contre, pour les récentes générations, nous avons observé que la relation devient négative et fortement significative. De plus, les résultats de cet article suggèrent aussi que la famille d’origine des femmes a une incidence significative sur leur comportement de fécondité. Les femmes dont la mère avait un niveau de scolarité élevé (et étaient de statut socioéconomique aisé) ont moins d’enfants comparativement à celles dont leurs parents avaient un faible niveau de scolarité (et pauvres). En retour, leurs enfants sont aussi les plus éduqués. Ce qui sous-tend à un éventuel effet de levier de la réduction de la taille de la famille dans le processus de transmission intergénérationnelle des désavantages éducatifs. Le second article fait une comparaison entre les ménages de grande taille et ceux de petite taille en matière d’inégalités éducatives entre les enfants au sein des ménages familiaux, en considérant le sexe, l’ordre de naissance et les termes d’interaction entre ces deux variables. Les résultats de cet article montrent que généralement les enfants des familles de petite taille sont plus scolarisés et atteignent un niveau d’éducation plus élevé que ceux des grandes familles. Toutefois, les filles ainées des petites familles s’avèrent moins éduquées que leurs pairs. Ce déficit persiste après avoir considéré seulement les ménages familiaux monogames ou encore après le contrôle de la composition de la fratrie. L’émancipation des femmes sur le marché du travail résultant de la réduction de la taille de la famille et la faible contribution des pères dans les activités domestiques expliqueraient en partie cette situation. Malheureusement, nous n’avons pas pu contrôler l’activité économique des mères dans les analyses. Finalement, dans le cadre du troisième et dernier article, nous avons examiné l’effet d’avoir été confié par le passé sur les inégalités éducatives au sein de la fratrie, en comparant ceux qui ont été confiés aux autres membres de leur fratrie qui n’ont jamais été confiés. Dans cet article, nous avons considéré l’aspect hétérogène du confiage en le différenciant selon le sexe, la relation de la mère avec le chef du ménage d’accueil et l’âge auquel l’enfant a été confié. Les résultats montrent qu’avoir été confié dans le passé influence négativement le parcours scolaire des enfants. Cependant, cet effet négatif reste fort et significatif que pour les filles qui ont été confiées après leurs 10 ans d’âge. Un profil qui correspond à la demande de main-d’œuvre en milieu urbain pour l’accomplissement des tâches domestiques, surtout dans le contexte de la baisse de la taille de la famille et l’émancipation des femmes sur le marché du travail.<br>The relationship between the family size decline and children human’s capital investment has been well-studied for several decades. In most developed and emergent countries, several studies showed that the reduction in family size seems to increase the investment in the children’s education, arguing the dilution effect of each additional child on family resources. More recently, empirical studies shows this reduction tends also to improve substantially schooling levels in Sub-Saharan Countries, mostly in urban areas. Nevertheless, little is known about the distribution of these potential benefits neither how that may affect existing educational inequalities, particularly in the context of urban sub-Saharan Africa. Our study focuses on exploring the demographic dimension of educational inequalities in the context of Ouagadougou, Capital of Burkina Faso, where the fertility transition is actually ongoing. More precisely, this study seeks to understand the effect of reduction in family size on intra-family inequalities in education and secondly, on the reproduction of educational inequalities over time and generations. For that purpose, we developed on one hand a conceptual framework to understand the mechanism by which reduction in family could influence on education inequalities. Secondly, we have undertaken empirical analysis to test our hypotheses. The empirical results are presented in three scientific papers, which based on data from the Demographic Surveillance System and Health and Dentrend project. Findings from the first paper suggest that the relationship between the family size and education has shifted over time, according to the socioeconomic context. Indeed, the generations that are grown in a socioeconomic context where formal education was not valued in the labor market and the economic contributions of children were substantial as farm laborer, the relationship was very low, positive, and not statistically significant. By contrast, for recent generations, we observed that the relationship is negative and highly significant. In addition, the results of this paper also suggest that the family of origin impacts on the women’s reproductive behavior. Those whose original family was not poor and well-educated have smaller families. In turn, their children are also more educated. That suggests a potential leverage effect of the reduction in family size on the intergenerational transmission of socioeconomic disadvantages, particularly in terms of education. The second paper takes a look at intra-family inequalities in education in Ouagadougou. Do all the children in a family benefit equitably from the improved conditions brought about by limiting their number? The results suggest that generally smaller families allow more investment in children’s education. Nonetheless, oldest girls are less educated than their peers. The deficit remains even after considering only monogamous family households or after controlling the composition of the sibling. The absence of the mothers at home eased by the reduction in family size and the men’s failure to share household chores could explain this situation. Unfortunately, we were unable to control for economic activity of mothers. Finally, in the last paper, we evaluated the net impact of having been fostered in the past on the education of young adolescents (16-20 years old), comparing those who have been fostered to their sibling who has never been fostered. In this article, contrary to previous studies, we have considered the heterogeneous aspect of fostering by differentiating by sex, the mother's relationship with the host household and the age at the time of fostering. The results show a negative impact of child fostering on education, even after controlling for the endogeneity problem. However, this negative effect is greater on girls. The life’s conditions of fostered girls in host household could explain this differential effect. Finally, in the third and final article, we examined the effect of having been entrusted the education of children, comparing those who have been entrusted to other members of their siblings who have never been entrusted. In this article, contrary to previous studies, we have considered the heterogeneous aspect of fostering by differentiating by sex, the mother's relationship with the host and the ages at which the child has been entrusted. The results show that having been given in the past adversely affects the schooling of children. However, after considering some interacting variables, this negative effect remains strong and significant only for adolescent girls. These girls seem to fit the profile of additional hands for household chores, which are needed due the demographic deficits consequent to the reduction in family size in urban areas.