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Dissertations / Theses on the topic 'Paramécies'

Author: Grafiati
Published: 4 June 2021
Last updated: 25 May 2024

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BUTLER, ALAIN. "L'heredite macronucleaire chez la paramecie : mise en evidence d'une heredite epigenetique des rearrangements genomiques associes a la differenciation nucleaire." Paris 7, 1993. http://www.theses.fr/1993PA077320.

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Abstract:
La paramecie possede un macronoyau hautement polyploide, siege de toute la transcription cellulaire, et deux micronoyaux diploides, non transcrits pendant la croissance vegetative dont la fonction est de produire les noyaux gametiques qui transmettent le patrimoine genetique de l'espece a la generation suivante. Lors des evenements de reproduction sexuee (conjugaison, autogamie), l'ancien macronoyau est detruit et un nouveau macronoyau se developpe a partir du noyau zygotique par de profonds remaniements reproductibles du genome impliquant des processus d'amplification, de fragmentation de chr
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Lamothe, Claudine. "Influence des complexes protéiques sur la rétention de copies de gène après une duplication de génome." Master's thesis, Université Laval, 2018. http://hdl.handle.net/20.500.11794/34502.

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Abstract:
Les duplications de gènes contribuent grandement à l'augmentation de la complexité des organismes en fournissant du nouveau matériel brut sur lequel agit la sélection naturelle. De ces duplications, c’est la duplication de génome qui a l’impact le plus important dû à la quantité de gènes impliqués. Plusieurs événements de duplication de génome ont eu lieu au fil de l'évolution de nombreuses lignées d'organismes. Une grande partie des gènes dupliqués créés lors de ces événements accumuleront des mutations délétères et seront inactivés ou disparaîtront du génome complètement, mais d'autres seron
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Fisch, Cathy. "Functional analysis of B9-domain proteins in paramecium." Paris 11, 2009. http://www.theses.fr/2009PA112219.

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Abstract:
Les cils sont des organites eucaryotes dont la structure et les fonctions mobiles et sensorielles sont ou ont conservées des organismes unicellulaires à l’homme. L’importance de ces organites s’est manifestée en découvrant que différents syndromes génétiques comme les polykystoses rénales, les syndromes de Bardet-Biedl, de Meckel-Gruber ou de Joubert (pathologies caractérisées par des défauts développementaux du rein, du cerveau et des membres) sont causés par la perte des fonctions ciliaires. Par la suite, l’analyse protéomique du complexe corps basal/cil et la caractérisation génétique des c
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Saudemont, Baptiste. "Contrôle traductionnel de l'épissage." Paris 6, 2011. http://www.theses.fr/2011PA066407.

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Abstract:
Le projet de ma thèse se base sur une observation faite sur la distribution de taille des introns issue des données de séquençage du génome de la paramécie. Ces données montrent que les génomes eucaryotes contre-sélectionnent, au cours de l’évolution, les introns "traductibles", c'est-à-dire qui ne créent pas de codons de terminaison précoces (PTC) en cas de rétention dans l’ARN messager. Ainsi, l’évolution semble avoir façonné les introns de telle manière que les ARNm non épissés ne soient pas traductibles. Cette contre-sélection est intrigante puisqu’elle suggère que les introns sont fréquem
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Galvani, Angélique. "Etude d'un phénomène d'extinction génique dépendant de l'homologie de séquence chez la paramécie." Paris 11, 2002. http://www.theses.fr/2002PA112059.

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Abstract:
L'extinction génique post-transcriptionnelle, ou PTGS, est un phénomène induit après introduction d'ADN ou d'ARN double brin dans une cellule. Il se caractérise par une dégradation séquence-spécifique de tous les ARNm cellulaires homologues à l'acide nucléique étranger. Conservé des plantes aux mammifères, le PTGS constitue une réaction de défense très efficace des organismes qui peut être comparée à une sorte d'immunité génétique. Son rôle naturel serait la protection des génomes contre les éléments invasifs de type virus ou transposons. Les études effectuées jusqu'à présent ont permis de mon
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Damaj, Raghida. "Squelette membranaire chez Paramecium Tetraurelia : analyse structurale et fonctionnelle de la famille multigénique des épiplasmines." Phd thesis, Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00731002.

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Abstract:
Le cortex de la plupart des protistes ciliés contient un squelette membranaire dont le principal élément est l'épiplasme, une structure apposée à la membrane alvéolaire interne. Chez la paramécie, l'épiplasme se présente sous forme d'écailles indépendantes disposées autour de chaque appareil ciliaire ; il est composé d'une famille multigénique de protéines appelées épiplasmines. Nous avons réalisé une étude structurale de cette famille multigénique. L'analyse phylogénétique a permis de confirmer l'existence de 5 groupes d'épiplasmines divisé chacun en deux sous-groupes a et b. L'utilisation de
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Kapusta, Aurélie. "Réarrangements du génome chez Paramecium tetraurelia : ligases ADN et voies de End-Joining." Paris 11, 2010. http://www.theses.fr/2010PA112207.

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Abstract:
De façon spectaculaire, à chaque cycle sexuel, le cilié Paramecium remodèle l'intégralité de son génome somatique. Ce processus implique notamment l'excision de dizaines de milliers de courtes séquences (IES), présentant un dinucléotide 5'-TA-3' à chacune de leurs bornes. Les IES interrompant les séquences codantes, leur élimination précise est nécessaire à la survie de la descendance. Ces réarrangements sont initiés par l'introduction de cassures double-brin (CDB), dont la géométrie de 4 bases sortantes en 5' centrées sur le TA, permettrait un recollement des extrémités suite à une maturation
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Bengueddach, Hakim. "Etude des protéines VFL3 et OFD1 dans le mécanisme d'ancrage des corps basaux chez la paramécie." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2016. http://www.theses.fr/2016SACLS556/document.

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Abstract:
Les cils sont des organites conservés au cours de l’évolution émanant de corps basaux et qui, motiles ou non, jouent des rôles essentiels dans de nombreux processus physiologiques. Leur formation est conditionnée par le positionnement et l’ancrage correct des corps basaux à la surface cellulaire. Chez la paramécie, trois protéines conservées, FOR20, Centrine 2 et Centrine 3 recrutées séquentiellement jouent un rôle dans ce processus d’ancrage. J’ai réalisé l’analyse fonctionnelle de deux autres protéines évolutivement conservées OFD1 et VFL3 susceptibles d’être impliquées dans cet ancrage. L’a
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Denby, Wilkes Cyril. "Ciblage & élimination des transposons et de leurs vestiges lors des réarrangements programmés du génome somatique de la paramécie." Thesis, Paris 11, 2014. http://www.theses.fr/2014PA112306/document.

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Abstract:
Les éléments transposables (ET) ont un impact majeur sur le fonctionnement etla dynamique des génomes, à l’échelle de l’individu et de l’espèce. Le cilié Parameciumest un modèle original pour l’étude des ET. Chaque individu unicellulaire a un génomegerminal qui subit, lors des processus sexuels, des réarrangements massifs, comprenantl’élimination des ET et de leurs vestiges à copie unique, pour former un génome somatiqueoptimisé pour l’expression des gènes. La programmation épigénétique de cesréarrangements implique des petits ARN dans un processus complexe de soustractiongénomique.Au cours de
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Abello, Arthur. "Spécialisation de Ku80c dans le couplage entre coupure et réparation de l’ADN lors des réarrangements programmés du génome chez Paramecium tetraurelia." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019SACLS083.

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Abstract:
Au cours de son cycle sexuel, le cilié Paramecium tetraurelia procède à de massifs réarrangements programmés de son génome (RPG). Ils consistent, entre autres choses, en l’excision de 45 000 séquences précisément délimitées, appelées IES (Internal Eliminated Sequences). La transposase domestiquée Piggymac (Pgm) introduit les cassures double-brin (CDB) à l’extrémité des IES. La réparation très précise de ces dommages est réalisée par la voie de réparation des extrémités non-homologues (NHEJ). Un des acteurs de cette voie est l’hétérodimère Ku70/Ku80. Suite à des duplications globales du génome,
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Lhuillier-Akakpo, Maoussi. "Inactivation des centromères et élimination programmée d'ADN chez le cilié Paramecium tetraurelia." Electronic Thesis or Diss., Paris 6, 2014. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2014PA066160.pdf.

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Abstract:
Chez le cilié Paramecium tetraurelia, la différentiation du génome somatique à partir du génome germinal est caractérisée par la délétion massive et reproductible d'éléments transposables et de 45 000 courtes séquences en copie unique dispersées sur l'ensemble du génome. Des petits ARN non codants produits par la lignée germinale, les scanARN, sont impliqués dans la régulation épigénétique des délétions d'ADN mais les mécanismes sous-jacents sont peu compris. Nous avons montré que la triméthylation de H3 (H3K27me3 et H3K9me3) présente une localisation dynamique pendant le développement du noya
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Arnaiz, Olivier. "Annotation des génomes de paramécies Improved methods and resources for paramecium genomics: transcription units, gene annotation and gene expression The Paramecium Germline Genome Provides a Niche for Intragenic Parasitic DNA: Evolutionary Dynamics of Internal Eliminated Sequences ParTIES: a toolbox for Paramecium interspersed DNA elimination studies." Thesis, université Paris-Saclay, 2020. http://www.theses.fr/2020UPASL046.

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Abstract:
Les nouvelles technologies de séquençage (NGS) ont révolutionné nos approches de la génomique.De nombreux génomes d'organismes ont été séquencés et assemblés.Le décryptage de l'information qu'ils contiennent (annotation) est plus que jamais une étape cruciale.Dans ce manuscrit, je vais me focaliser sur l’impact qu'ont eu les NGS sur l'annotation des génomes de paramécies, et notamment l'annotation de gènes et d'éléments transposables (ET).La paramécie est un eucaryote unicellulaire possédant deux types de noyaux. Un noyau germinal (MIC) utilisé pour transmettre l'information génétique à la gén
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Goût, Jean-François. "Les singularités du génome de la paramécie : un bon révélateur des mécanismes évolutifs à l’œuvre chez les êtres vivants." Thesis, Lyon 1, 2009. http://www.theses.fr/2009LYO10167.

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Abstract:
La publication du génome de la paramécie (Aury, 2006) a révélé une séquence atypique particulièrement intéressante pour les études de génomique évolutive. Au cours de cette thèse, j’ai mené une analyse bioinformatique détaillée de ce génome en me concentrant particulièrement sur les trois points suivants : 1) Le rôle de deux classes distinctes de petits ARN fonctionnels non codants, l’une intervenant dans les processus de régulation de l’expression des gènes tandis que l’autre participe aux réarrangements génomiques (élimination de fragments d’ADN) associés au cycle sexuel de la paramécie. 2)
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Froissard, Marine. "Etude génétique et moléculaire de l'exocytose régulée chez la paramécie." Versailles-St Quentin en Yvelines, 2003. http://www.theses.fr/2003VERS0003.

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Abstract:
L'exocytose est l'étape terminale de fusion entre une vésicule et la membrane plasmique. Certaines molécules conservées interviennent, comme les SNAREs et NSF. L'exocytose se déroule au niveau de microdomaines membranaires. Il existe très peu de données sur l'établissement de la machinerie de fusion au niveau de ces sites, d'autant plus que cette étape est fugace donc difficile à visualiser. La paramécie est un organisme de choix pour étudier ces microdomaines. En effet, ils sont constitués d'une rosette de particules intramembranaires et d'un matériel de connexion reliant la membrane de la vé
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Lhuillier-Akakpo, Maoussi. "Inactivation des centromères et élimination programmée d'ADN chez le cilié Paramecium tetraurelia." Thesis, Paris 6, 2014. http://www.theses.fr/2014PA066160/document.

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Abstract:
Chez le cilié Paramecium tetraurelia, la différentiation du génome somatique à partir du génome germinal est caractérisée par la délétion massive et reproductible d'éléments transposables et de 45 000 courtes séquences en copie unique dispersées sur l'ensemble du génome. Des petits ARN non codants produits par la lignée germinale, les scanARN, sont impliqués dans la régulation épigénétique des délétions d'ADN mais les mécanismes sous-jacents sont peu compris. Nous avons montré que la triméthylation de H3 (H3K27me3 et H3K9me3) présente une localisation dynamique pendant le développement du noya
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Gogendeau, Delphine. "Etude des centrines et des protéines de type SFI1p dans le réseau infraciliaire de paramécie." Paris 11, 2007. http://www.theses.fr/2007PA112161.

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Lepere, Gersende. "Différents types d'ARN non codants impliqués dans les réarrangements génomiques programmés lors du développement macronucléaire chez la paramécie." Paris 7, 2007. http://www.theses.fr/2007PA077143.

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Abstract:
Le génome germinal des ciliés est extrêmement réarrangé durant le développement d'un nouveau macronoyau sornatique provenant du génome rnicronucléaire après les événements sexuels. Chez Paramecium, des séquences uniques (IES) sont excisée de manière précise des séquences codantes et des régions intergéniques. Pour une fraction des IES, l'introduction d'une IES dans ie macronoyau maternel inhibe spécifiquement l'excision de DES homologue zygotique suggérant que la régulation épigénétique de l'excision impliquent une comparaison globale entre les génomes somatique et germinal. Des scanRNAs (scnR
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Krzywicka-Racka, Anna. "Approches génétique et moléculaire de la duplication des corps basaux chez paramecium tetraurelia." Paris 11, 2002. http://www.theses.fr/2002PA112038.

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Abstract:
La paramécie est un organisme recouvert de cils, chacun ancré sur un corps basal, structure polarisée se dupliquant à chaque cycle cellulaire et analogue structural des centrioles du centrosome. Chez le protozoaire Paramécie, plusieurs mutations affectant la duplication ont été décrites. Le mutant kin241-1, présente une hyperduplication des corps basaux, des anomalies de leur polarité et des zones morphogénétiques et de la différenciation nucléaire durant les processus sexuels. Le gène KIN241 a été isolé et cloné par complémentation fonctionnelle. Il code une protéine contenant 4 domaines: une
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Espigat-Georger, Aude. "Analyse protéomique de l'assemblage centriolaire et de ses appendices chez la Paramécie : identification et caractérisation d'une protéine des fibres striées, la striatine 6." Paris 6, 2006. http://www.theses.fr/2006PA066259.

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Shi, Lei. "Dual role of IFT57 in cilia and nucleus in Paramecium." Phd thesis, Université Paris Sud - Paris XI, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00922993.

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Abstract:
My thesis work consisted in the study of cilia and flagella, organelles highly conserved in many eukaryotes, which protrude at the cell surface as a microtubular backbone, the axoneme, bounded by an extension of the plasma membrane. A major interest in the study of cilia is that they are involved in the regulation of many cell events, such as re-entry in the cell cycle, and that their dysfunction in vertebrates provokes multi-symptomatic diseases called ciliopathies. Ciliary growth is under control of IFT (intraflagellar transport) mechanism, first discovered in Chlamydomonas. The IFT complex
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Serrano, Vincent. "Etude du rôle des ARNs non codants dans la régulation épigénétique des réarrangements programmés du génome chez Paramecium tetraurelia." Paris 6, 2007. http://www.theses.fr/2007PA066511.

Full text
Abstract:
Les ciliés sont des eucaryotes unicellulaires qui présentent un dimorphisme nucléaire. Chez Paramecium tetraurelia, le macronoyau polyploïde assure l’essentiel de la transcription nécessaire à la vie de la cellule, alors que le micronoyau diploïde est silencieux et assure une fonction germinale. A chaque cycle sexuel, la paramécie est amenée à fabriquer un nouveau macronoyau somatique à partir d’un micronoyau. Au court de ce processus, le génome du macronoyau en formation est amplifié et réarrangé de manière reproductible. Un ensemble de séquences non codantes, appelées IES, sont alors éliminé
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