To see the other types of publications on this topic, follow the link: Pathovar.
Dissertations / Theses on the topic 'Pathovar'
Create a spot-on reference in APA, MLA, Chicago, Harvard, and other styles
Consult the top 40 dissertations / theses for your research on the topic 'Pathovar.'
Next to every source in the list of references, there is an 'Add to bibliography' button. Press on it, and we will generate automatically the bibliographic reference to the chosen work in the citation style you need: APA, MLA, Harvard, Chicago, Vancouver, etc.
You can also download the full text of the academic publication as pdf and read online its abstract whenever available in the metadata.
Browse dissertations / theses on a wide variety of disciplines and organise your bibliography correctly.
1
Malik, A. N. "Genetic studies with Pseudomonas syringae pathovar pisi." Thesis, University of Greenwich, 1985. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.354390.
Full text
2
BERTHIER, YVETTE. "Caracterisation de xanthomonas campestris pathovar dieffenbachiae : etude serologique et moleculaire." Paris 11, 1993. http://www.theses.fr/1993PA112289.
Full textAbstract:
Xanthomonas campestris pv dieffenbachiae, (x. C. D. ) pathogene de plantes de la famille des aracees est un facteur limitant de la production d'anthurium dans de nombreuses regions tropicales. Il appartient a l'espece campestris qui regroupe plus de 140 pathovars distincts par leur hote d'origine. Afin de clarifier la position taxonomique de ce groupe et d'etudier sa variabilite interne nous avons utilise deux sondes: la sonde rarn 16+23s d'e. Coli marquee a l'acetylaminofluorene et une sonde repetee isolee du genome de x. Campestris pv. Dieffenbachiae, is 1051. Par ribotypage cinquante-six souches de x. Campestris pv. Dieffenbachiae representatives de la variabilite de ce pathovar ont ete analysees. Huit profils ont ete obtenus: 4 correspondent aux souches d'anthurium, les 4 autres representent des souches d'autres aracees. Le profil majoritaire regroupe 34 des 43 souches d'anthurium analysees. Ces profils ont ete compares a ceux de 4 souches de pseudomonas, 3 souches de xylophilus ampelinus, 28 souches de differentes especes de xanthomonas, et 156 souches appartenant a 14 pathovars de l'espece campestris. Des profils majoritaires se degagent de l'analyse des souches de x. Albilineans, x. Campestris pv begoniae, malvacearum et manihotis. Une analyse de ces profils fait apparaitre le regroupement des pathovars de l'espece campestris. L'etude de la variabilite genetique a ete approfondie avec la sonde is 1051. Cette sonde est une sequence d'insertion de la famille des is 5. C'est un element de 1158 pb borne par 2 sequences repetees inversees de 15 pb. Les profils rflp obtenus permettent de distinguer les origines geographiques et les plantes hotes. L'is 1051 est un element genetique assez conserve au sein des xanthomonas. Des profils d'hybridation ont ete obtenus avec des souches d'autres especes (x. Fragariae, x. Axonopolis, x. Oryzae) et avec des souches appartenant a 11 pathovars de l'espece campestris. La detection de la bacterie a ete etudiee par voies serologique et moleculaire. Un serum polyclonal a ete produit. Il detecte en elisa les souches de x. Campestris dieffenbachiae d'anthurium avec une sensibilite de 10#4b/ml. Des oligonucleotides internes a is 1051 ont ete testes pour la detection par pcr. Le couple y5 y9 amplifie 1 a 2 ng d'adn de souches isolees d'anthurium provenant d'origines geographiques differentes et representatives des differents profils d'hybridation
3
Atherton, G. T. "The genetics of host specificity and pathogenicity of Pseudomonas syringae pathovar pisi." Thesis, University of the West of England, Bristol, 1987. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.379473.
Full text
4
Smith, Samantha Gillian. "An investigation of aspects of oxidative stress in Xanthomonas campestris pathovar campestris." Thesis, University of East Anglia, 1995. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.296866.
Full text
5
Mur, Luis Alejandro Jose. "The molecular genetics of race 2 specificity in Pseudomonas syringae pathovar pisi." Thesis, University of the West of England, Bristol, 1991. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.303616.
Full text
6
Santos, Kelly. "Caracterização bioquimica de aminopeptidases de Xylella fastidiosa e Xanthomonas axonopodis pathovar citri." [s.n.], 2006. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/314240.
Full textAbstract:
Orientador: Francisco Javier Medrano MartinTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-08-08T07:29:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Santos_Kelly_D.pdf: 4767617 bytes, checksum: 886f6b5d543544a3913da5d9e5dae0bb (MD5) Previous issue date: 2006
Resumo: Aminopeptidases realizam a clivagem de resíduos de aminoácidos de peptídios e proteínas. Elas estão presentes em todos os organismos e desempenham importantes papéis em processamento de alimentos, maturação de proteínas pela eliminação do resíduo de metionina Nterminal, patogenicidade e muitos outros processos celulares. Neste trabalho foi realizada a clonagem, expressão, purificação e caracterização de uma prolina iminopeptidase de Xylella fastidiosa(Xf1510) e de uma aminopeptidase de Xanthomonasaxonopodispv. citri (Xac2987). Estes dois genes foram anotados como prováveis prolina iminopeptidases. Ambos foram clonados em vetor de expressão pET15b, expressados em Escherichiacoli, e purificados na fração solúvel em um passo por cromatografia a metal imobilizado (IMAC). Ensaios de atividade enzimática confirmaram que a Xf1510 é uma prolina iminopeptidase, e que a Xac2987 é uma aminopeptidase de amplo espectro e não uma prolina iminopeptidase como foi anotada no banco de dados, sendo capaz de catalisar a remoção de diferentes aminoácidos de substratos sintéticos. Os espectros de dicroísmo circular das enzimas mostram que ambas podem ser incluídas na família das a/ß a/ß hidrolases e que estão enoveladas. A proteína Xf1510 apresenta maior atividade na faixa de pH entre 7,5 e 8,5. A temperatura ótima para hidrólise de prolina foi 45ºC. O pH ótimo para a atividade enzimática da proteína Xac2987 foi encontrado na faixa de pH de 6,5 e 7,5; sendo o pH ótimo 6,6. Neste pH a temperatura ótima para a hidrólise de alanina foi encontrada à 40ºC. Estudos estruturais com relação ao pH e estabilidade térmica das proteínas foram acompanhados por dicroísmo circular. Estudos de desnaturação térmica e química indicam que as proteínas Xf1510 e Xac2987 apresentam estados intermediários antes de atingirem o desenovelamento máximo
Abstract: Aminopeptidases release the Nterminal amino acid residue from polypeptides and proteins. They are present in all organisms and play several important roles in food processing, maturation of proteins by elimination of the Nterminal methionine, pathogenicity and many other cellular processes. We report here, the cloning, expression, purification and characterization of a proline iminopeptidase from X.fastidiosa(Xf1510) and a broad specificity aminopeptidase from X.axonopodispv. citri(Xac2987). These two genes have been annotated as putative proline iminopeptidase. Both genes were cloned into the pET15b expression vector, expressed in Escherichia coli, and purified to apparent homogeneity in one step by IMAC. The protein was expressed in the soluble fraction and could be purified in one step by IMAC. Enzymatic assays confirmed Xf1510 as a PIP, and Xac2987 as a broad spectrum aminopeptidase, being able to catalyze the removal of different synthetic substrates. The circular dichroism spectrum allowed us to classify the proteins as part of the a/ß hydrolyses family. Structural studies with pH dependence and thermal stability were preformatted by circular dichroism. The Xf1510 protein presents greater activity in the range of pH between 7,5 and 8,5. The optimum temperature for prolina hydrolysis was 45ºC. The pH optimum for the enzymatic activity of the Xac2987 protein was found in the range of pH of 6,5 and 7,5; being pH optimum 6,6. In this pH the temperature for alanine hydrolysis was found to 40ºC. Structural studies with regard to pH and thermal stability of proteins had been followed by circular dichroism. Studies of thermal and chemical denaturation indicate that the proteins Xf1510 and Xac2987 present intermediate states before reaching the maximum unfolding
Doutorado
Bioquimica
Doutor em Biologia Funcional e Molecular
7
Cunty, Amandine. "Caractérisation de Pseudomonas syringae pv. actinidiae l’agent responsable de l’émergence d’une épidémie de chancre bactérien du kiwi en France et description de Pseudomonas syringae pv. actinidifoliorum, agent causal de taches foliaires sur kiwi." Thesis, Angers, 2015. http://www.theses.fr/2015ANGE0018/document.
Full textAbstract:
La bactérie responsable de chancre sur bois, Pseudomonas syringae pv. actinidiae (Psa), a causé trois épidémies depuis les années 1980 et se décline en trois biovars. La plus récente et dévastatrice (causée par Psa biovar 3), a été détectée pour la première fois en 2008 en Italie et s’est rapidement répandue dans la majorité des pays producteurs de kiwi, dont en France en 2010. Nous avons analysé la diversité de 280 souches de P. syringae isolées de kiwi en France. La caractérisation biologique et l’analyse phylogénétique des souches par MLSA ont révélé que les biovars 1, 2 et 3 appartenaient à une même lignée génétique, groupant également P. s. pv. theae. Les souches de biovar 4 constituent un ensemble de 4 lignées génétiques distinctes qui ont été rassemblées au sein d’un nouveau pathovar (Pseudomonas syringae pv. actinidifoliorum (Psaf)). Ces souches sont caractérisées par une pathogénie réduite (taches foliaires mais pas de chancre). Cette nouvelle classification permet une meilleure gestion des épidémies de chancre bactérien du kiwi. Le développement d’un schéma MLVA composé de 11 VNTRs a permis d’étudier la structuration génétique de populations de Psa biovar 3, de révéler de la diversité au sein de ce pathovar et d’identifier l’origine italienne de l’épidémie en France. Le séquençage du génome de cinq souches de Psaf et la comparaison de ces séquences avec celles d’autres génomes de Psa et Psaf, disponibles sur NCBI, a permis le développement d’un nouvel outil de détection par PCR temps réel, plus spécifique de chaque biovar de Psa et de Psaf. La MLVA et la PCR temps réel développées ici contribueront à l’amélioration de la surveillance de Psa dans le mondeThe causal agent of bacterial canker, Pseudomonas syringae pv. actinidiae (Psa),has been responsible ofthree epidemics since 1980’s.Psa is divided in three biovars. The most recent and severe outbreak (causedby Psa biovar 3) was detected for the first time in Italy in 2008. It has spread very quickly in the main kiwifruit producing countries, as in France in 2010. We analyzed the diversity of 280 strains of P. syringae isolated fromkiwifruit in France. The biological characterization and the phylogenetic analysis of the strains by MLSArevealed that the biovars 1, 2 and 3 belong to the same genetic lineage, which include P. s. pv. theae, as well.The biovar 4 strains, which are structured in 4 distinct genetic lineages, have been grouped in a new pathovar(Pseudomonas syringae pv. actinidifoliorum (Psaf)). These strains are characterized by a low virulence (onlyspots on leaves and no canker on wood). This new classification help with the management of the bacterialkiwifruit canker outbreaks. The development of an MLVA scheme composed of 11 VNTRs allowed to studythe genetic structuration of Psa biovar 3 populations, to reveal the diversity within this pathovar and to identifythe Italian origin of the epidemic in France. The genome sequencing of five Psaf strains and the comparisonbetween these sequences and those of Psa and Psaf genomes already available on NCBI, allowed thedevelopment of a new detection tool by real-time PCR, specific of each Psa biovar and of Psaf. The MLVA andthe real-time PCR based detection technique developed here will contribute to the improvement of the monitoringof kiwifruit bacterial canker around the world
8
Bavage, Adrian Daryl. "The plasmids of Pseudomonas syringae pathovar pisi : involvement in pathogenicity and race-specificity." Thesis, University of the West of England, Bristol, 1990. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.278054.
Full text
9
Orvis, Julie Dawn. "An investigation into the specificity of race 3 of Pseudomonas syringae pathovar pisi." Thesis, University of the West of England, Bristol, 1992. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.315474.
Full text
10
Gibbon, Marjorie Jane. "Molecular characterisation of an avirulence gene from race 2 of Pseudomonas syringae pathovar pisi." Thesis, University of the West of England, Bristol, 1994. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.385396.
Full text
11
ROSSIER, OMBELINE. "Etude du systeme de secretion de type iii chez la bacterie phytopathogene xanthomonas campestris pathovar vesicatoria." Paris 7, 1999. http://www.theses.fr/1999PA077222.
Full textAbstract:
L'interaction entre la bacterie a gram negatif xanthomonas campestris pathovar vesicatoria (xcv) et ses plantes-hotes, le poivron et la tomate, est controlee par les genes bacteriens hrp (hypersensitive reaction and pathogenicity). Ces genes, situes dans une region chromosomique de 25 kb et organises en 6 operons, sont essentiels pour la pathogenie chez les plantes sensibles et l'induction d'une reaction de defense, la reaction d'hypersensibilite (hr), chez les plantes resistantes. Dix proteines hrp sur 22 sont homologues a des constituants de systemes de secretion de proteines, dits de type iii, chez des bacteries pathogenes de mammiferes et de vegetaux. Au debut de la these, nous avons fait l'hypothese que les genes hrp codent un systeme de secretion de facteurs de virulence. La construction de souches exprimant constitutivement les genes hrp a permis d'etablir des conditions de culture induisant la secretion de proteines. Au moins douze genes hrp participent a la formation de ce systeme de secretion. Cinq proteines induisant specifiquement la hr chez des plantes resistantes, les proteines d'avirulence avrbs3, avrbs3-2, avrrxv, avrbst et avrbs1, sont secretees par cette voie. Le systeme hrp de xcv secrete aussi les proteines popa et avrb respectivement issues des agents phytopathogenes ralstonia solanacearum et pseudomonas syringae, et, de maniere plus inattendue, la cytotoxine yope de la bacterie pathogene de mammiferes yersinia pseudotuberculosis. Enfin, deux proteines codees par les genes hrp, hrpb2 et hrpf, sont secretees par la voie de type iii de xcv. Nos resultats indiquent que hrpb2 serait necessaire a la secretion des proteines par la voie hrp, tandis que hrpf serait necessaire a leur transfert dans la cellule vegetale. Le systeme de secretion etabli permettra la decouverte de nouveaux facteurs de virulence impliques dans l'interaction entre xcv et ses plantes-hotes.
12
Delannoy, Etienne. "Caractérisation de péroxydases associées à la défense du cotonnier ("Gossypium hirsutum") contre "Xanthomonas campestris" pathovar "Malvacearum"." Montpellier 2, 2003. http://www.theses.fr/2003MON20175.
Full text
13
Gangadharan, Anju. "Characterization of defense pathways and genes involved in host-pathovar level resistance using Arabidopsis-Pseudomonas system." The Ohio State University, 2014. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=osu1387815106.
Full text
14
Homeier-Bachmann, Timo. "Der GimA-Lokus von Extraintestinal-pathogenen E. coli (ExPEC) : reduktive Evolution in Abhängigkeit von Habitat und Pathovar /." Berlin : mbv, 2009. http://d-nb.info/1000289737/04.
Full text
15
Boulanger, Alice. "Analyse d'un nouveau système CUT impliqué dans l'acquisition et l'utilisation du N-acétylglucosamine par Xanthomonas campestris pathovar campestris." Toulouse 3, 2009. http://thesesups.ups-tlse.fr/738/.
Full textAbstract:
Le N-acétylglucosamine (GlcNAc) est un sucre aminé ayant un rôle important dans de nombreux processus cellulaires chez les cellules procaryotes et eucaryotes. La plupart des bactéries marines et des bactéries pathogènes d'insectes ont développé des mécanismes sophistiqués permettant le catabolisme de la chitine, un homopolymère de GlcNAc. La chitine est le second biopolymère le plus abondant dans la nature après la cellulose. Une bactérie non-chitinolytique rencontre-t-elle du GlcNAc dans l'environnement ? Et si oui, quelle est la source naturelle de cette molécule ? Les données obtenues au cours de ma thèse suggèrent que la bactérie phytopathogène Xanthomonas campestris pv. Campestris (Xcc), l'agent responsable de la pourriture noire chez les Brassicacées, rencontre et exploite du GlcNAc provenant de la plante, au cours de l'infection. La caractérisation de la voie d'utilisation du GlcNAc chez Xcc et de son réseau de régulation a permis l'identification de particularités par rapport aux autres bactéries, et notamment en ce qui concerne la source de GlcNAc. En effet, le GlcNAc utilisé au cours de l'infection par Xcc semble provenir de la dégradation des glycanes des glycoprotéines végétales. Nous avons montré qu'un transporteur de la membrane externe, ainsi que des glycosides hydrolases jouent un rôle direct dans la génération du GlcNAc in plantaN-acetylglucosamine (GlcNAc) is an amino sugar that carries out important roles in a broad range of cells from bacteria to plants and animals. Most marine bacteria and insect pathogens have developed sophisticated mechanisms for the catabolism of the second most abundant biopolymer in nature, chitin, which is a GlcNAc homopolymer. However, whether non-chitinolytic bacteria find GlcNAc in their environment and what is the natural source of this molecule remain obscure. The data presented here suggest that the plant pathogenic bacterium Xanthomonas campestris pv. Campestris (Xcc), the causal agent of black rot disease of Brassicaceae, encounters and exploits GlcNAc of plant origin during infection. Characterization of the Xcc GlcNAc utilization pathway and its complex regulatory network led to the identification of specific traits as compared to other bacteria and most notably the source of GlcNAc, i. E. Glycans from plant glycosylated proteins. An outer membrane transporter and glycoside hydrolases belonging to the Xcc GlcNAc utilization pathway were shown to play a direct role in the generation of GlcNAc in planta
16
Homeier-Bachmann, Timo [Verfasser]. "Der GimA-Lokus von Extraintestinal-pathogenen E. coli (ExPEC): Reduktive Evolution in Abhängigkeit von Habitat und Pathovar / Timo Homeier-Bachmann." Berlin : Freie Universität Berlin, 2010. http://d-nb.info/1024004783/34.
Full text
17
Horvais, Alain. "Détection de bactéries par sondes nucléiques : application au diagnostic de salmonelles, de clavibacter michiganensis et de pseudomonas syringae pathovar tomato." Angers, 1993. http://www.theses.fr/1993ANGE0003.
Full textAbstract:
Des sondes nucléiques spécifiques de bactéries ont été recherchées à partir de régions variables de l'ARNR 16s et l'ADNR, et des techniques rapides de diagnostic utilisant ces sondes ont été mises au point. Ces méthodes ont été appliquées, dans le cadre de projets industriels, au dépistage des salmonelles, des clavibacter michiganensis et du pseudomona syringae pathovar tomato. Les travaux sur salmonelles ont permis de mettre au point d'une technique de recherche systématique de sondes nucléiques spécifiques, à partir des régions variables définies, applicables à tous les micro-organismes, en dehors des virus. Ils ont aussi permis de tester différentes méthodologies de détection par hybridation sur membrane, à l'aide de sondes marquées radioactivement ou non. Bases sur ces résultats, les travaux portant sur le dépistage des deux autres bactéries ont ensuite abouti à la mise au point d'un test de diagnostic par PCR, spécifique, sensible et rapide de ces deux bactéries.
18
Büttner, Daniela [Verfasser], Ulla [Akademischer Betreuer] Bonas, Petra [Akademischer Betreuer] Dersch, and Jürgen [Akademischer Betreuer] Heesemann. "Kontrolle der Typ III-abhängigen Proteinsekretion im pflanzenpathogenen Bakterium Xanthomonas campestris Pathovar vesicatoria / Daniela Büttner. Betreuer: Ulla Bonas ; Petra Dersch ; Jürgen Heesemann." Halle, Saale : Universitäts- und Landesbibliothek Sachsen-Anhalt, 2010. http://d-nb.info/1031189955/34.
Full text
19
Jalloul, Ai͏̈da. "La peroxydation des lipides : origine et rôle dans la mort cellulaire hypersensible du cotonnier (Gossypium Hirsutum) à Xanthomonas Campestris (Axonopodis) Pathovar Malvacearum." Montpellier, ENSA, 2002. http://www.theses.fr/2002ENSA0005.
Full text
20
YESSAD, SAMIRA. "Etude de la relation entre le pouvoir pathogene et l'aptitude epiphyte de pseudomonas syringae pathovar syringae, agent du dessechement bacteren du poirier." Paris 11, 1992. http://www.theses.fr/1992PA112297.
Full textAbstract:
Le dessechement bacterien du poirier du a p. S. Pv. Syringae est frequemment observe dans les principales zones productrices de poires. Bien que n'entrainant qu'exceptionnellement la mort de son hote, cette bacterie, de type necrogene, est neanmoins responsable de nombreuses lesions necrotiques sur feuilles, fleurs et fruits ainsi que de chancres sur rameaux. Deux caracteristiques essentielles de p. S. Pv. Syringae ont ete analysees: le pouvoir pathogene et la capacite epiphyte. Bien que considere comme pouvant infecter une large gamme d'hotes, le pv. Syringae a montre une specificite au niveau de son pouvoir pathogene: seules les souches isolees de poirier peuvent induire des symptomes sur cet hote. L'etude en conditions controlees du comportement epiphyte de souches pathogenes et non pathogenes a souligne l'importance du facteur humidite dans la survie epiphyte de p. S. Pv. Syringae; la faculte de survie sous des conditions defavorables apparait plus marquee pour les souches pathogenes que pour les souches non pathogenes. L'etude de l'interaction entre les deux caracteres epiphyte et pathogene d'une souche de p. S. Pv. Syringae isolee du poirier a ete entreprise par le biais d'une mutagenese aleatoire a l'aide du transposon tn5. A l'issue de cette mutagenese, 60 mutants presentant un pouvoir pathogene altere ont ete selectionnes. L'etude de l'aptitude epiphyte de quelques mutants non pathogenes caracterises par des phenotypes differents: agress#-, dsp#-, hrp#- et tox#-, a montre que quel que soit le phenotype des mutants, l'alteration du pouvoir pathogene entraine systematiquement une alteration de l'aptitude epiphyte. Cette etude a donc permis de montrer qu'il existe une relation etroite entre le pouvoir pathogene et l'aptitude epiphyte de p. S. Pv. Syringae sur le poirier
21
Sayegh, Majd. "La résistance du cotonnier Gossypium hirsutum à la bactériose causée par Xanthomonas campestris pathovar malvacearum : rôle du gène GhLOX1 dans la réaction hypersensible." Thesis, Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 2009. http://www.theses.fr/2009INPL077N/document.
Full textAbstract:
La RH est une réaction de défense. L’interaction entre G.hirsutum et Xcm repose sur le concept gène-à-gène. L’infection du cultivar Réba B50 possédant les gènes R B2B3 par Xcm18 conduit à une RH associée à une activité LOX, responsable de la peroxydation des lipides, et à la transcription du GhLOX1. Premièrement, 6 génotypes de G.hirsutum contenant divers gènes R ont été retenus pour analyser la variabilité de la réponse LOX suite à l’infection par Xcm1, 18 ou 20. Notre étude a porté sur plusieurs critères, le phénotype, la perte en eau, l’activité LOX et la transcription du GhLOX1. Les résultats montrent une variabilité du phénotype RH en fonction des sources de résistances. Pour chaque type d’interaction incompatible, l’activité LOX et la transcription du GhLOX1 révèlent une augmentation significative corrélée à l’apparition des symptômes RH et à la diminution de la teneur en eau. La réponse LOX est conservée lors de la RH, quelle que soit la race de Xcm ou le génotype. Le GhLOX1 considère comme un marqueur moléculaire de la résistance spécifique du cotonnier à Xcm. Deuxièmement, le rôle du GhLOX1dans la mise en place de la RH en analysant sa fonction potentielle par surexpression. Des cotylédons ont été transformés avec la séquence codante GhLOX1 fusionnée au CaMV35S. Ces cotylédons transformés ont révélé (i) une activité LOX significativement supérieure à celle des cotylédons témoins montrant que le GhLOX1 code pour une protéine active et (ii) un phénotype sans modifications apparentes par rapport à celui des cotylédons non transformées, sauf dans certains contextes d’interactions cotonnier/Xcm où la surexpression de ce gène induit l’apparition de symptômes de type RH. L’effet de l’agro-infiltration sur l’expression de certains gènes pendant la transformation a révélé l’induction précoce et non spécifique de l’expression de gènes de défense. Ces travaux constituent une première étape dans l’analyse fonctionnelle du GhLOX1 dans la résistance spécifique du cotonnier à XcmThe HR is a defense strategy. The interaction between G.hirsutum and Xcm is governed by the gene-for-gene concept. The infection of the cultivar Reba B50 that contains B2B3 R genes by race Xcm18 leads to a HR associated with a LOX activity response involved in peroxidation of lipids and with transcription of GhLOX1. First, 6 genotypes of G. hirsutum containing various R genes were tested to analyze the variability of the LOX response following the infection by Xcm1, 18 or 20. Several criteria were investigated including the phenotype, the water loss, the LOX activity and GhLOX1 transcription. The results showed variation in HR phenotype according to the tested R genes. For each type of the incompatible interaction, LOX activity and transcription of GhLOX1 were always significantly increased paralleled the apparition of the HR symptoms and the decrease in the water content. LOX response (enzymatic activity and GhLOX1 transcription) is associated with HR whatever the genotype of both Xcm races and cotton plant. Thus, the GhLOX1 consider as a molecular marker of the cotton specific resistance to Xcm. Second, the role of the GhLOX1 gene in the execution of the cotton HR to Xcm by analyzing its possible function by over-expression, the cotyledons were transformed with the GhLOX1 coding sequence fused to the CaMV35S. These transformed cotyledons revealed (i) a LOX activity significantly higher than that detected in the control, showing that the GhLOX1 encodes for an active protein and (ii) that the phenotype of these cotyledons was indistinguishable as compared to the non transformed cotyledons, except when the HR symptoms were induced in some GhLOX1-over-expressed cotyledons. The effect of agro-infiltration on expression of some plant genes during the transformation revealed early and nonspecific induction of the expression of defense genes. This work constitutes a preliminary investigation for the functional analysis of the GhLOX1 in order to assess its role in the cotton specific resistance to Xcm
22
Rahmouni, Oumaïra. "Portage fécal du pathovar Escherichia coli adhérent et invasif (AIEC) chez des patients atteints de maladies inflammatoires chroniques de l’intestin et des témoins sains." Thesis, Lille 2, 2018. http://www.theses.fr/2018LIL2S012/document.
Full textAbstract:
L’étiologie exacte des maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI) reste actuellement méconnue. Mais un déséquilibre de la flore bactérienne, plus connu sous le nom de dysbiose et se traduisant par une augmentation de bactéries potentiellement pathogènes versus une diminution de bactéries bénéfiques, est démontré en permanence. De précédentes études ont permis de mettre en évidence la présence de souches pathogènes d’E. coli chez les patients atteints de la maladie de Crohn (MC). Ces souches appartiennent au pathovar Adherent Invasive E. coli (AIEC) et sont caractérisées par leur capacité à adhérer et à envahir les cellules épithéliales intestinales, à survivre et à se multiplier dans les macrophages en induisant une synthèse intense de TNF. La mise en évidence de ce pathovar a essentiellement été réalisée sur des biopsies de patients présentant une MC. Et bien que les mécanismes de pathogénicité et de virulence de la souche AIEC soient clairement déterminés, il n’existe pas d’études approfondies sur la prévalence des AIEC au niveau des matières fécales chez les patients atteints de MICI en comparaison à des individus sains. Ainsi, ce projet de thèse s’inscrit dans une meilleure compréhension de l’implication de ce pathovar AIEC dans les MICI au niveau luminal. Cette thèse cible différents points: prévalence et détection des AIEC, leur proportion relative par rapport à la flore E. coli totale, leur capacité d'invasion, leur phylogroupe ainsi que leur transmissibilité. A l’issue de ce travail, nous montrons que les AIEC sont retrouvés au niveau luminal chez les patients atteints de la MC mais également chez les patients présentant une rectocolite hémorragique, avec une détection des AIEC chez 33% et 2% respectivement. En outre, ces études ont permis de montrer une prévalence plus forte de ce pathovar dans les matières fécales d’individus sains (51%) en comparaison aux patients atteints de MICI. Et lorsque les AIEC sont présents, que ce soit chez les patients atteints de MICI et chez les témoins, ils représentent en moyenne 20 à 30% de la flore E. coli. Nous avons également pu montrer qu’il n’existe pas de différences significatives des scores d’invasion des isolats AIEC chez les patients atteints de MICI et chez les sujets sains. Certaines souches d’AIEC, isolées chez les patients atteints de MC et chez les sujets sains, ont été caractérisées génétiquement par la technique d’électrophorèse sur gel en champ pulsé. Sur ces souches, différents profils génétiques ont été obtenus attestant de la forte variabilité intra- et interindivuelle des AIEC. En conclusion, les AIEC, au vue de leur forte prévalence chez des sujets en bonne santé, seraient plutôt à reconsidérer comme des pathobionts ce qui définit un symbionte pouvant acquérir des propriétés virulentes chez un hôte prédisposé génétiquement en raison de facteurs environnementaux et/ou diététiques et ainsi favoriser l’inflammation intestinaleMany studies have reported an imbalance of bacterial flora in patients with inflammatory bowel disease (IBD), which includes Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC), defined as a dysbiosis, and resulting in an increase in potentially pathogenic bacteria versus a decrease in beneficial bacteria. Previous studies have highlighted the presence of pathogenic strains of E. coli in patients with CD. These strains belong to the pathovar Adherent Invasive E. coli (AIEC) and are characterized by their ability to adhere and invade intestinal epithelial cells, to survive and to multiply in macrophages by inducing an intense synthesis of TNF. In recent years, many studies established a link between AIEC pathovar and CD. Many of these studies have been performed on biopsies of patients with CD. And although the mechanisms of pathogenicity and virulence of the AIEC strain are clearly determined, there are no in-depth studies on the prevalence of AIEC in feces in IBD patients in comparison to healthy individuals. Thus, the goal of this thesis project is to better understand the involvement of AIEC pathovars in IBD at the luminal level. This thesis is based more precisely on the study of the prevalence of AIEC in feces of patients with IBD in comparison to healthy subjects, targeting different points: prevalence and detection of AIEC, their relative proportion compared to total E. coli flora, their invasion capacity, their phylogroup as well as their transmissibility. AIEC are found at luminal level in patients with CD but also in patients with UC, with detection of AIEC in 33% and 2% respectively. In addition, a higher prevalence of these pathovar is present in the feces of healthy individuals (51%) compared to patients with IBD. And when AIEC are present, both in IBD patients and in controls, they represent on average 20 to 30% of the E. coli flora. We have also been able to show that there are no significant differences in AIEC invasion scores in patients with IBD and in healthy subjects. Some AIEC strains, isolated in patients with CD and in healthy subjects, have been genetically characterized by pulsed-field gel electrophoresis. Different genetic profiles have been obtained attesting the high intra- and interindividual variability of AIEC strains. In conclusion, because of their high prevalence in healthy individuals, AIEC should be reconsidered as pathobionts, which defines a symbiont acquiring virulent properties in a genetically predisposed host due to environmental and / or dietary factors and thus promoting intestinal inflammation
23
Monnier, Éric. "Contribution à l'étude épidémiologique de Xanthomonas campestris pathovar citri (X. C. Pv. C. ) (Hasse, 1915, Dowson, 1939) Dye, 1978 : agent causal du chancre citrique dans le cadre de l'ile de la Réunion." Paris 11, 1987. http://www.theses.fr/1987PA112337.
Full textAbstract:
L'île de la Réunion, qui a servi de cadre à nos travaux, est la seule région du territoire français où sévit le chancre citrique, maladie causée par une bactérie Xanthomonas campestris pathovar citri (X. C. Pv. C. ). L'objet de notre travail étant une meilleure compréhension de l'épidémiologie de cette maladie, nous avons, dans un premier temps, recherché une méthode fiable de détection et d'identification de l'agent pathogène sur les hôtes qu'il contamine. L'étude biochimique et cytologique de soixante-dix-neuf souches de X. C. Pv. C. A révélé que l'hydrolyse et l'assimilation de l'amidon ainsi que l'ouverture du cycle B-lactarne de certains antibiotiques, étaient des caractères communs à toutes les souches. Ceci, nous a amené à élaborer le milieu L. P. A'A, qui ralentit le développement des bactéries saprophytes. L'utilisation de ce milieu en association avec une batterie de 17 tests permet une bonne identification de l'agent causal. Au cours de l'étude épidémiologique, nous avons vérifié que l'infection se produisait, chez les jeunes feuilles, surtout par les stomates et, chez les feuilles matures, plus résistantes, plutôt par blessures. Cependant, aucune subtance inhibitrice de la croissance de X. C. Pv. C. N'a été mise en évidence au sein d'organes résistants. Quatre stades ont été définis au cours de l'évolution des symptômes et l'apparition des deux premiers apparatt liée à la sensibilité de l'hôte. Le diamètre des lésions, observé sur un hôte et en un lieu donné, ne montre pas de différence d'agressivité entre plusieurs souches. Celle-ci serait mieux exprimée par le nombre total de symptômes observés. Sur l'arbre, la progression de la maladie se fait de la base vers le sommet du jeune rameau, et les vents dominants influent sur sa propagation au niveau du verger. Les essais comparatifs de pulvérisation en vergers de diverses molécules chimiques n'ont pas donné de résultats satisfaisants en matière de maîtrise de la maladie. Toutefois, l'hypochlorite de sodium reste un bon désinfectant de surface et son application sur fruits permet d'éviter la dissémination de X. C. P. V. C. Après récolteReunion island, where our work took place, is the only french citrus aera where citrus canker occurs. This disease is caused by a bacterium: Xanthomonas campestris pathovar citri (X. C. Pv. C. ). The aim of the present study was a better understanding of the epidemiology of the disease, so, we have, first, researched a reliable detection and identification method of the causal agent on contaminated host tissues. The biochemical and cytological study of seventy-nine strains of X. C. Pv. C. Showed hydrolysis and assimilation of starch and opening the B-lactam cycle of some antibiotics as constant properties of all the strains. That lead us to develop the semi-selective medium L. P. A’. A. Which hinders the development of saprophytic bacteria. Its use combinated with a complementary bank of seventeen bioassays allows a good identification of the causal agent. During the epidemiological study, we have checked the infection took place, in young leaves, specially by wounds. Nevertheless, no ground inhibitor of X. C. Pv. C. Has been discovered in some resistant host parts. Four stages have been described in the symptom evolution and the appearance of the two first seems to be in relation with host sensibility. The diameter of lesions, observed on the same host and in a given aera, does not show difference of aggressivity between several strains. That would be better express by the total number of lesions. On the tree, the disease progress from bottom to top of the young twig and strong winds have an effect upon its spread in an orchard. Orchard spaying comparative assays with some chemicals do not yield satisfying results to contain the disease. However, sodium hypochlorite remains a good surface desinfectant and its application on fruits avoids the post-harvest spread of X. C. Pv. C
24
Monnier, Eric. "Contribution à l'étude épidémiologique de Xanthomonas campestris, Pathovar citri (X.c.pv.c.) (Hasse, 1915) (Dowson, 1939) Dye, 1978, agent causal citrique, dans le cadre de l'Ile de la Réunion." Grenoble 2 : ANRT, 1987. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37608188t.
Full text
25
Daniel, Jean-François. "Contribution a l'etude de la biologie de xanthomonas campestris pathovar manihotis (arthaud-berthet et bondar) starr agent responsable de la bacteriose vasculaire du manioc, manihot esculenta crantz." Paris 11, 1991. http://www.theses.fr/1991PA112120.
Full textAbstract:
L'etude de la microflore bacterienne de la phyllosphere de plants de manioc dans des plantations contaminees par la bacteriose vasculaire du manioc permet de mettre en evidence la presence epiphylle de x. C. Pv. Manihotis. La capacite de cette bacterie d'avoir une phase epiphyte au cours du cycle de la maladie contribue a la formation de l'inoculum necessaire au declenchement de la maladie, a l'installation du pathogene au niveau de la plantation et favorise la survie. Les mecanismes intervenant dans la conservation de la bacterie permettent d'expliquer le caractere endemique de la maladie et son apparition dans des zones indemnes. Deux mecanismes sont essentiels: la capacite du pathogene d'avoir une phase epiphyte et sa conservation dans les tissus de l'hote. La quantite de bacteries epiphylles peut etre limitee par le niveau de resistance de l'hote. Ainsi, le niveau des populations presentes sur les cultivars tolerants (mb 27 et mb 38) ne different pas significativement de celui detecte sur les cultivars sensibles (mpembe et maloenda), mais est plus faible sur le cultivar resistant tms 30555. Chez le manioc, la resistance peut etre associee a la fois a une limitation des populations epiphylles et a une reduction de la multiplication de la bacterie dans les tissus foliaires. Cependant, d'autres mecanismes doivent intervenir comme le seuil d'infection, la sensibilite des tissus, la limitation de la colonisation du systeme vasculaire. La distribution lognormale des populations du pathogene a la surface des feuilles permet d'etablir une relation quantitative entre le niveau des populations epiphylles et l'incidence de la maladie. Ainsi, au debut du cycle cultural (cultivar mpembe, saison des pluies), le seuil de 10#4 ufc par feuille est en relation avec l'incidence de la maladie. Ce seuil n'est pas constant pour un couple cultivar-bacterie, mais depend des conditions environnementales et de la sensibilite
26
Alizadeh-Aliabadi, Ali. "La Strie bactérienne des céréales causée par différents pathovars de Xanthomonas campestris en Iran : identification, répartition et étude génétique." Toulouse, INPT, 1995. http://www.theses.fr/1995INPT002A.
Full textAbstract:
L'objectif de ce travail concerne l'identification de 45 souches responsables de la strie bacterienne de l'orge et de ble et certaines graminees sauvages en iran, et l'etude genetique sur le comportement de certains cultivars d'orge et de ble vis-a-vis de ces souches. L'identification des souches, par l'etude des caracteres biochimiques, physiologiques, la gamme d'hotes et l'analyse d'electrophoretique des proteines totales et membranaires montrent que les agents responsables de cette maladie appartiennent a trois pathovars de xanthomonas campestris. La comparaison des souches iraniennes avec 17 souches de reference par la technique du polymorphisme de la longueur des fragments de restriction (rflp) confirme l'existence de trois groupes. Les souches du groupe i (pv. Hordei) ne peuvent infecter que l'orge, celles du groupe ii (pv. Undulosa) infectent l'orge, le ble, le seigle, agropyron repens, bromus inermis et lolium elongatum. La gamme d'hote des souches du groupe ii et celle du groupe iii (pv. Cerealis) sont identiques mais l'agressivite des souches du groupe iii est tres faible sur les hotes sus-nommes. L'etude de la variabilite genetique pour la resistance partielles d'orge et de ble vis a vis des souches bacterienne, montre une difference significative entre les cultivars d'orge et de ble iraniens. La variabilite genetique des souches bacteriennes concernant l'agressivite est importante. Les valeurs de l'aptitude generale a la combinaison de 7 cultivars d'orge etudies sont significatives. Ce qui prouve l'importance des effets additifs des genes dans controle genetique de la resistance a cette maladie. Les deux cultivars morex et iran 3a peuvent donc etre consideres comme de bons geniteurs dans l'amelioration de cette espece
27
Gilmartin, Caroline Ruth. "The detection and characterisation of avirulence genes in Pseudomonas syringae pathovars." Thesis, University of the West of England, Bristol, 1997. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.387993.
Full text
28
Brault-Hernandez, Marianne. "L' orobanche rameuse en France : le couple orobanche ramosa L. / Nicotiana tabacum L. : biologie, spécificité et méthodes de lutte." Paris 6, 2006. http://www.theses.fr/2006PA066151.
Full textAbstract:
En France, Orobanche ramosa L. Est en constante extension dans les cultures de colza d’hiver, de tabac et de chanvre textile. Après avoir montré les capacités d’adaptation du parasite à de nombreuses cultures, une corrélation a été mise en évidence entre les principaux stades de développement de l’orobanche sur tabac et la "somme des températures". La spécificité de la relation hôte/parasite étant une notion très complexe, des recherches analytiques ont été menées sur les exsudats racinaires produits par l’hôte et sur la virulence du parasite. L’utilisation de marqueurs RAPD a révélé une importante variabilité génétique entre trois populations d’O. Ramosa récoltées sur trois hôtes différents (colza, tabac et chanvre), suggérant l’existence de trois pathovars au sein de l’espèce. Un protocole de traitement par l’hydrazide maléique, à la fois efficace sur le niveau de l’infestation et sur la viabilité des graines d’orobanche produites durant l’année de culture, a été mis au point.
29
Elamri, Nuria Ali. "Strain diversity and identification of Pseudomonas syringae pv. maculicola and related pathovars." Thesis, University of the West of England, Bristol, 2001. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.365189.
Full text
30
Boudon, Sylvain. "Biologie évolutive des pathovars de "Xanthomonas arboricola", agent causal de phytobactérioses émergentes." Montpellier 2, 2005. http://www.theses.fr/2005MON20199.
Full text
31
Saunier, Monique. "Contribution à l'étude sérologique et taxonomique de certains pathovars de p. Syringae." Angers, 1992. http://www.theses.fr/1992ANGE0010.
Full textAbstract:
L'ensemble des travaux rapportés concernent essentiellement les pseudomonas phytopathogènes, au travers des espèces p. Cichorii, p. Viridiflava, et p. Syringae, plus spécialement les pathovars aptata, helianthi, lacrymans, morsprunorum persicae, phaseolicola, pisi, porri, savastanoi, syringae, tabaci, et tomato. La notion de profil sérologique obtenu en immunodiffusion y est définie et présentée comme un mode de lecture de la structure des chaines latérales du lipopolysaccharide. Une vingtaine de sérogroupes sont mis en évidence à l'aide d'une batterie de 24 sérums différentiels parmi un ensemble de 1250 souches. Les résultats sérologiques confirment les liens sérologiques des nombreux pathovars de p. Syringae et avec l'espèce p. Viridiflava. Cependant, des groupes sérologiques sont clairement définis, qui sont spécifiques d'un ou d'un nombre réduit de pathovars. Le pathovar syringae est un cas à part. On y trouve à des fréquences variables, l'ensemble des profils définis pour les autres pathovars de p. Syringae. L'espèce p. Viridiflava offre un cas similaire. La méthode d'étude du profil d'assimilation en api150 est optimisée. La prise en compte des cinétiques de croissance et les traitements de ces données par des méthodes à fondement mathématique issues de l'analyse des données (distance euclidienne et agrégation selon la variance) permettent d'étudier précisément le profil d'assimilation des différents groupes de souches et de mettre en évidence précisément le profil d'assimilation des différents groupes de souches et de mettre en évidence des sous-groupes biochimiques résultant d'une analyse multidimensionnelle qui pourraient répondre à la notion de biovars. Les résultats biochimiques confirment l'isolement des espèces p. Cichorii, p. Viridiflava, et du pathovar syringae. La majorité des autres pathovars étudiés sont caractérisés par un profil d'assimilation spécifique. La synthèse des résultats montre que la plupart des pathovars étudiés de l'espèce p. Syringae (hormis pv syringae) tels qu'ils sont définis actuellement, se présentent comme des écotypes biochimiquement et sérologiquement caractérisés.
32
Abusada, Gabi M. (Gabi Michael). "Studies on the Mechanism of Protection by Carotenoids Against Photodynamic Killing in Curtobacterium Flaccumfaciens Pathover Poinsettiae." Thesis, University of North Texas, 1992. https://digital.library.unt.edu/ark:/67531/metadc332581/.
Full textAbstract:
The mechanism of protection by carotenoids against photodynamic killing in Curtobacterium flaccumfaciens pathover poinsettiae (C. poinsettiae) was studied using pigment mutants isolated by treatment with nitrosoguanidine and DNA gyrase inhibitors. Growth rates, pigment composition, pigment levels and the ultrastructure of the wild-type streptomycin resistant strain of G. poinsettiae (wt-str) and all mutants were compared. One mutant, NTG-1, lacked colored carotenoids, and another, NTG-2, was a slow growing mutant containing low levels (14%) of wild-type carotenoid pigments. Except for NTG-1, the other pigment mutants had different proportions of the same pigments found in the wild type as determined by high performance liquid chromatography (HPLC). Only NTG-2 was morphologically distinct at the ultrastructural level.
33
Guillorit, Christiane. "Contribution à l'étude antigénique de quatre pathovars de Pseudomonas syringae, intérêt sérologique du lipopolysaccharide." Grenoble 2 : ANRT, 1986. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37598109c.
Full text
34
Ah-You, Nathalie. "Taxonomie et classification en pathovars des Xanthomonas associés aux Anacardiacées par une approche polyphasique." La Réunion, 2007. http://elgebar.univ-reunion.fr/login?url=http://thesesenligne.univ.run/07_17_ah_you.pdf.
Full textAbstract:
La maladie des taches noires du manguier, maladie fortement dommageable pour l’industrie de la mangue, est causée par une bactérie du genre Xanthomonas, désignée sous le nom de X. Campestris pv. Mangiferaeindicae. Des Xanthomonas ont également été isolés sur plusieurs autres genres de plantes de la famille des Anacardiacées. L’ensemble de ces bactéries est regroupé au sein du pathovar mangiferaeindicae, malgré l’existence d’une grande variabilité entre ces souches. De plus, ces souches n’ont jamais été incluses dans les dernières études taxonomiques du genre Xanthomonas. L’objectif de ce travail a été de clarifier la classification en pathovar et d’examiner la position taxonomique de ces Xanthomonas associées au Anacardiacées, en utilisant une approche polyphasique. L’utilisation de l’AFLP et de tests de pouvoir pathogène ont permis de mettre en évidence une séparation des Xanthomonas des Anacardiacées en trois lignées distinctes génétiquement et par leur spécificité d’hôte, constituant trois pathovars : mangiferaeindicae, anacardii et spondiae. Ces trois pathovars sont génétiquement proches de représentants de l’espèce Xanthomonas axonopodis sensu Vauterin. La taxonomie de ces souches associées aux Anacardiacées a été étudiée par une analyse combinant données AFLP et MLSA, comparées à des valeurs d’hybridations ADN/ADN et des valeurs de stabilité thermique. Cette étude a révélé que les Xanthomonas des Anacardiacées sont des pathovars de la nouvelle espèce Xanthomonas citri. L’apport des techniques AFLP et MLSA comme techniques alternatives aux hybridations ADN/ADN, pour la taxonomie des Xanthomonas a été évaluée. Notre approche polyphasique illustre la non-congruence entre les classifications basées respectivement sur la phylogénie et sur le pouvoir pathogèneBacterial black spot, caused by Xanthomonas campestris pv. Mangiferaeindicae is an important disease of mango. Several plant genera of the Anacardiaceae family are hosts for xanthomonads. Despite the existence of a great variability between these xanthomonads, these strains are assigned in the single pathovar mangiferaeindicae. Moreover Xanthomonads causing disease on Anacardiaceae were not included in any recent taxonomic studies on the genus Xanthomonas. Our aim was to use a polyphasic approach to resolve the complexity of pathovar mangiferaeindicae, and to define the taxonomic position of strains isolated from Anacardiaceae. Both AFLP and pathogenicity tests allow the separation of these xanthomonads in three lineages, distinct genetically and distinct by their host specificity, supporting the classification in three pathovars, genetically closed to strains representative of Xanthomonas axonopodis sensu Vauterin: mangiferaeindicae, anacardii et spondiae. The polyphasic characterization using AFLP and MLSA approaches compared to DNA / DNA hybridization and thermal stability values indicated that Xanthomonads associated to Anacardiaceae are pathovars of the new species Xanthomonas citri. The contribution of AFLP and MLSA techniques as an alternative to DNA / DNA hybridization is evaluated for genus Xanthomonas taxonomy. Our polyphasic approach shows the incongruence between classifications based respectively on phylogeny, and on pathogenicity
35
Guillorit, Christiane. "Contribution à l'étude antigénique de quatre pathovars de pseudomonas syringae : intérêt sérologique du lipopolysaccharide." Angers, 1986. http://www.theses.fr/1986ANGE0001.
Full text
36
Soylu, Soner. "Analysis of the responses of Arabidopsis Thaliana to infection by Albugo Candida and Pathovars of Pseudomonas Syringae." Thesis, Imperial College London, 1998. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.298860.
Full text
37
Fargier, Emilie. "L'etude de la pathologie de Xanthomonas campestris et de la structure génétique de ses pathovars a permis l'amélioration de la détection du pathogéne dans les semences de Brassicacées." Phd thesis, Université d'Angers, 2007. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00345821.
Full textAbstract:
Les Xanthomonas campestris induisent des maladies sur les plantes de la famille des Brassicacées. l'une de ces maladies la nervation noire est considérée comme l'une des plus dommageables des brassicacées. Cette espèce comprend six pathovars, définis en fonction du type de symptômes provoqués et de la plante hôte d'isolement. Cependant, des doutes ont été emis sur la synonymie de certain de ces pathovars, or il est indispensable de pouvoir identifier sans ambig¨uité ces pathovars afin de mettre en place des stratégies de luttes contre ces bactérioses. Bien que les sources de contamination soient multiples, la semence reste la cause principale de l'infection des plantes. S'assurer de leur qualité sanitaire est le moyen de lutte le plus efficace contre les bactérioses. L'objectif de ce travail était de clarifier la pathogénie et la structure génétique de cette espèce, puis de proposer un nouvel outil de détection fiable et rapide des X. campestris vivantes dans les semences. L'étude de la pathologie de l'espèce X. campestris indique qu'il existe trois pathovars capables de provoquer une maladie, X. c. pv. campestris provoque la nervation noire, X. c. pv. raphani induit la maladie des taches foliaires, X. c. pv. incanae engendre la maladie du dépérissement des giroflées. Nous discutons la taxonomie des espèces du genre Xanthomonas par une approche MLSA. Notre analyse génétique MLSA/MLST révèle que l'espèce X. campestris est particulierement complexe et polymorphe. Cette diversité aurait deux origines d'importance similaire, la recombinaison et les mutations. L'espèce semblerait néanmoins conserver une structure clonale en raison d'une étroite communauté d'hôte. Les pathovars ne forment pas des lignées génétiques identifiées, toutefois ils ne sont pas mélangés entre eux et partagent des séquences proches. Nous avons mis au point une méthode de détection de X. campestris vivant dans les semences par BIO-PCR. Elle permet de détecter jusqu'à 10 ufc/ml de macérat de semence.
38
Fargier, Emilie. "L' étude de la pathologie de Xanthomonas campestris et de la structure génétique de ses pathovars a permis l'amélioration de la détection du pathogéne dans les semences de Brassicacées." Angers, 2007. http://www.theses.fr/2007ANGE0008.
Full textAbstract:
Les Xanthomonas campestris induisent des maladies sur les plantes de la famille des Brassicacées. L'une de ces maladies la nervation noire est considérée comme l'une des plus dommageables des brassicacées. Cette espèce comprend six pathovars, définis en fonction du type de symptômes provoqués et de la plante hôte d'isolement. Cependant, des doutes ont été emis sur la synonymie de certain de ces pathovars, or il est indispensable de pouvoir identifier sans ambig¨uité ces pathovars afin de mettre en place des stratégies de luttes contre ces bactérioses. Bien que les sources de contamination soient multiples, la semence reste la cause principale de l'infection des plantes. S'assurer de leur qualité sanitaire est le moyen de lutte le plus efficace contre les bactérioses. L'objectif de ce travail était de clarifier la pathogénie et la structure génétique de cette espèce, puis de proposer un nouvel outil de détection fiable et rapide des X. Campestris vivantes dans les semences. L'étude de la pathologie de l'espèce X. Campestris indique qu'il existe trois pathovars capables de provoquer une maladie, X. C. Pv. Campestris provoque la nervation noire, X. C. Pv. Raphani induit la maladie des taches foliaires, X. C. Pv. Incanae engendre la maladie du dépérissement des giroflées. Nous discutons la taxonomie des espèces du genre Xanthomonas par une approche MLSA. Notre analyse génétique MLSA/MLST révèle que l'espèce X. Campestris est particulierement complexe et polymorphe. Cette diversité aurait deux origines d'importance similaire, la recombinaison et les mutations. L'espèce semblerait néanmoins conserver une structure clonale en raison d'une étroite communauté d'hôte. Les pathovars ne forment pas des lignées génétiques identifiées, toutefois ils ne sont pas mélangés entre eux et partagent des séquences proches. Nous avons mis au point une méthode de détection de X. Campestris vivant dans les semences par BIO-PCR. Elle permet de détecter jusqu'à 10 ufc/ml de macérat de semenceXanthomonas campestris causes diseases on Brassicaceae family including black rot that is considered as the most important diseases of cruciferous plant. This bacterial species groups six pathovars defined according to the type of symptoms that they induce to the host plant from which they were isolated and according to their host range. However doubts have been expressed about the synonymy of some pathovars within X. Campestris. It has been necessary to identify pathovars without ambiguity in order to improve strategies against these pathogens. Although sources of contamination are various, seeds constitute the primary inoculum and their sanitary control thus appears as the most efficient disease control strategy. Our objectives have been to clarify the pathogenicity and the genetic structure of the species then to propose a new diagnostic tool that permits the fast and valuable detection of viable X. Campestris in seeds. Pathogenicity study of X. Campestris species revealed the existence of only three pathovars that can induce disease, X. C. Pv. Campestris causes the black rot disease, X. C. Pv. Raphani induces the leaf spots disease and X. C. Pv. Incanae causes the bacterial blight of garden Stocks. We discussed on the Xanthomonas genus taxonomy based on MLSA data. Our genetic analysis shows how particularly complex and polymorphic is X. Campestris. This diversity is the consequence of two evolutionary forces, recombination and mutation, with equally importance. However, this species keeps a clonality structure owing to a tightly host communality within Brassicaceae host. Pathovars are not genetic lineage, but there are not shuffled and share close sequences. We have set up a detection method of viable X. Campestris in seeds by BIO-PCR. The BIO-PCR can detect until 10 ufc/ml in seed extract
39
Zhao, Yuqi. "Molecular genetic characterization of a pathogenicity-attenuated mutant of Pseudomonas syringae pathovar syringae." Thesis, 1991. http://hdl.handle.net/1957/37468.
Full textAbstract:
A pathogenicity locus of Pseudomonas syringae pv.
syringae identified by Tn5 mutagenesis was investigated.
The mutant strain PS9024 is attenuated for disease
expression in its host, Phaseolus vulgaris, but produces
the hypersensitive reaction (HR) in the nonhost, tobacco
(Nicotina tabacum). A cosmid clone carrying 16 kilobases
(kb) of contiguous genomic DNA partially complements this
mutant. Altered growth of the mutant in planta was also
partially restored. Marker exchange mutagenesis with Tn3-
HoHo1 at two other sites within this locus results in
mutants with attenuated and severely reduced
pathogenicity. The locus is complex and contains
repetitive DNA sequences. Northern analysis reveals that
this locus is expressed in planta, but is not expressed in
a rich growth medium, and the transcript is larger than 10
kb, suggesting that the locus is transcribed as a
polycistronic mRNA. Comparison of total cellular protein
profiles of R32 and PS9024 using SDS-PAGE analysis further
reveals that at least nine protein bands ranging from
approximately 100 kD or above in size are present in the
wild type strain R32, but absent from the mutant.
Additionally, a protein of approximately 45 kD is absent
from the mutant. The site of Tn5 insertion has been
partially sequenced. The initial search of the data banks
suggested a gene or genes related to the ornithine
biosynthetic pathway map to this locus. Further study
strongly suggest a gene that encodes a membranceassociated
protein and under the control of a promoter
identical to appA gene promoter maps at this site and it
is involved in the process of pathogenesis.Graduation date: 1991
40
Chang, Ju-Chen, and 張如珍. "Characterization of the role of rpf cluster in flagellar biogenesis in Xanthomonas campestris pathovar campestris." Thesis, 2008. http://ndltd.ncl.edu.tw/handle/95395550449553164170.
Full textAbstract:
碩士亞洲大學
生物科技學系碩士班
96
Xanthomonas campestris pathovar campestris (Xcc) is a Gram-negative bacterium and the causal agent of black rot disease in cruciferous plants. The exopolysaccharides (EPS) are one of the important virulence factors, whose biosynthesis is regulated by the rpf (regulation of pathogenicity factors) genes cluster. Mutants of rpfB、rpfF、rpfG and rpfC were constructed by insertional mutagenesis. It has previously been shown that rpfF、rpfC and rpfG mutants are avirulent and exhibit a decreased level of EPS. Nevertheless, a rpfB mutant displays little phenotypical change. Xcc is motile by using a single polar flagellum. In this work, experiments were carried out to elucidate the role of rpf genes on the bacterial motility as well as on the expression of flagellar genes in the transcriptional and translational level. The results showed that, 1) electron microscopy demonstrated that rpfC and rpfF mutants have no flagellum and rpfB, rpfG mutants have single flagellum. 2) Spot test result demonstrated that a rpfF mutant become resistant to the infection of bacteriophage L7. 3) In the transcriptional level, rpfC、rpfG and rpfF genes positively control the expression of flagellar genes flgG、flhF、fliC、fliQ、fliE and fliL promoter activity. rpfB positively regulate the promoter activity of flgB、fliQ、fliC and flhF genes and rpfC、rpfF positively regulate the promoter activity of flgB. 4) In the translational level, rpfC positively regulates the expression of FliC and FliA; rpfF positively regulates the expression of FliA、FliC and FlhF; rpfG positively regulates the expression of FliC and FliA.