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Dissertations / Theses on the topic 'Pectate lyase'

Author: Grafiati

Published: 4 June 2021

Last updated: 11 March 2023

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1

Allen, Caitilyn. "Evolution of a gene for pathogenicity: endo-pectate lyase." Diss., Virginia Polytechnic Institute and State University, 1987. http://hdl.handle.net/10919/82610.

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Abstract:

Erwinia carotovora subsp. Carotovora (Ecc) and Erwinia carotovora subsp. Atroseptica (Eca) are plant pathogenic bacteria that cause soft rot disease of many plant species and blackleg disease of potatoes, respectively. Ecc and Eca attack plants by means of a group of extracellular plant tissue-degrading enzymes. which rapidly breaks down the pectic polymers that form a structurally important part of the plant cell wall, is considered central to soft rot pathogenesis. In this work, I isolated and studied the genes encoding this enzyme from Ecc and Eca. A clone library of Ecc strain EC14 was con

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2

MariÌn-RodriÌguez, MariÌa Celia. "Investigation of the role of pectate lyase in banana fruit softening." Thesis, University of Greenwich, 2001. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.399345.

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3

To, Teng Teng. "Structural studies of three enzymes : telomerase, the methyltransferase CobJ and pectate lyase." Thesis, Queen Mary, University of London, 2011. http://qmro.qmul.ac.uk/xmlui/handle/123456789/691.

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Abstract:

This thesis investigates the structure and function of three enzymes of biotechnological and biomedical interest: telomerase from Caenorhabtidis elegans, pectate lyase from Bacillus subtilis and the methyltransferase CobJ from Rhodobacter capsulatus. Telomerase is a ribonucleoprotein found in all eukaryotes and its function is to maintain telomere length, sustain chromosome integrity and circumvent the end-replication problem. The protein requires two subunits to function, telomerase reverse transcriptase (TERT), the catalytic component, and an intrinsic RNA template (TR). The TR makes telomer

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4

Hounsa, Charlemagne-Gilles. "Optimisation en milieu minimum de la production d'une pectate lyase de bactéroïdes clonée chez Escherichia coli." Lille 1, 1994. http://www.theses.fr/1994LIL10006.

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Abstract:

L'etude a porte sur l'optimisation en milieu minimum de la production d'une pectate lyase (ec 4. 2. 2. 2) de bacteroides thetaiotaomicron 217 clonee chez escherichia coli hb101 (pbt4). Cette etude nous a conduit, a partir de l'utilisation de deux types de plans d'experiences factoriels a deux niveaux inspires du modele de box-wilson (1951), a rechercher les facteurs pouvant influencer la production de l'enzyme. Nos resultats ont montre que l'extrait de caseine, le glucose et le magnesium sont les constituants du milieu les plus influants sur la production de pectate lyase. Ces deux plans ont e

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5

Ladjama, Ali. "Isolement, purification et caractérisation d'une endopectate lyase d'une souche de streptomyces." Paris 5, 1991. http://www.theses.fr/1991PA05P611.

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6

Duprey, Alexandre. "Régulation de la transcription des gènes de virulence bactériens : dynamique des complexes nucléoprotéïques." Thesis, Lyon, 2016. http://www.theses.fr/2016LYSE1201/document.

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Abstract:

Les bactéries sont en permanence confrontées à des changements d'environnements. La régulation transcriptionnelle joue alors un rôle majeur dans l'adaptation des bactéries. En particulier, la bactérie phytopathogène D. dadantii s'est récemment adaptée à l'hôte végétal. Elle produit en particulier des pectate lyases (Pel) qui dégradent la pectine, ciment des parois végétales, et jouent un rôle majeur dans le développement de la maladie. Les gènes pelD et pelE, malgré la forte divergence dans leur expression, sont issus d'un transfert horizontal suivi d'une duplication récente. La question de l'

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7

Lyall, Mandy Marie. "The biochemical and structural analysis of two pectate lyases from polysaccharide lyase families 9 and 10 and a glycoside hydrolase belonging to family 73." Thesis, Northumbria University, 2008. http://nrl.northumbria.ac.uk/7748/.

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8

Othman, Babul Airianah. "Diverse mechanisms of pectic polysaccharide degradation distinguished in fruit cell walls in vivo." Thesis, University of Edinburgh, 2012. http://hdl.handle.net/1842/7878.

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Abstract:

Cell wall loosening and degradation are important processes in major stages of plant development including fruit ripening. Three main mechanisms have been proposed to contribute towards cell wall polysaccharide degradation in vivo: enzymic hydrolysis by endopolygalacturonase (EPG), enzymic elimination by pectate lyase (PL), and non-enzymic scission by hydroxyl radicals (•OH). However, little idea as to which of these three mechanisms predominates in homogalacturonan degradation especially during fruit ripening. This study presents an attempt to discover the respective contribution of those thr

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9

PISSAVIN, CHRISTINE. "Étude d'un locus de la bactérie phytopathogène erwinia chrysanthemi 3937 codant une pectate lyase et une peptidyl Prolyl cis-trans iosmérase." Paris 7, 1997. http://www.theses.fr/1997PA077265.

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Abstract:

Erwinia chrysanthemi est une enterobacterie phytopathogene responsable de la pourriture molle de nombreux vegetaux. Son pouvoir pathogene est du essentiellement a la production de pectinases et cellulases parmi lesquelles 8 pectate lyases (pels) sont des determinants majeurs. La plupart des pels et la cellulase celz sont exportees dans le periplasme ou elles acquierent une structure repliee grace a des catalyseurs de repliement tels que les disulfure isomerases et, probablement, des peptidyl prolyl cis-trans isomerases. L'etude de la region adjacente au locus pelb-pelc, codant deux pels, nous

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Walter, Monika. "Die parallele beta-Helix der Pektat-Lyase aus Bacillus subtilis : Stabilität, Faltungsmechanismus und Faltungsmutanten." Phd thesis, Universität Potsdam, 2002. http://opus.kobv.de/ubp/volltexte/2005/147/.

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Abstract:

Die Pektat-Lyasen gehören zu einer Proteinfamilie, die meistens von pflanzenpathogenen Mikroorganismen sekretiert werden. Die Enzyme katalysieren den Abbau von Polygalakturonsäure, einem Hauptbestandteil in <br /> pflanzlichen Mittellamellen und Primärzellwänden. Der Abbau der alpha-1,4-verbrückten Galakturonsäurereste erfogt durch eine beta-Eliminierungsreaktion, dabei entsteht ein Produkt mit einer ungesättigten C4-C5 Bindung am nicht reduzierenden Ende, das durch spektroskopische Messungen beobachtet werden kann. Für die enzymatische Reaktion der Pektat-Lyasen ist Calcium nötig und das pH-O

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11

Drone, Jullien. "Synthèse sélective d'oligosaccharides : utilisation de glycosidases obtenues par mutagenèse ponctuelle et par évolution dirigée : tentatives de création d'une activité hydratase à partir d'une pectate lyase." Nantes, 2006. http://www.theses.fr/2006NANT2038.

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Abstract:

L'objectif de cette thèse est, d'une part, axée sur les glycosidases modifiées pour la synthèse d'analogues de l'antigène H-1 et, d'autre part, de créer une activité hydratase à partir d'une pectate lyase. A cet effet, nous avons évalué trois glycosynthases et des transglycosidases. Nos résultats montrent que les glycosynthases permettent d'obtenir des disaccharides avec des rendements quasi quantitatifs. De plus, les transglycosidases permettent la synthèse de composés de transglycosylation avec des rendements de 60 à 75% selon l'accepteur utilisé. La modification de la pectate lyase de Therm

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Larsson, Malin, and Annie Nilsson. "Förädling av stjälkfibrer för fler naturliga fiberalternativ : Enzymbehandling för avlägsnande av pektin i stjälkfibrer för ökad spinnbarhet." Thesis, Högskolan i Borås, Akademin för textil, teknik och ekonomi, 2015. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:hb:diva-295.

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Abstract:

Grewia optiva är en utav många outnyttjade stjälkfibrer som skulle kunna bidra till ökandet utav de naturliga fiberalternativen. Fibern har idag inte så många användningsområden på grund utav dess hårda och styva uppbyggnad, vilket gör den svår att spinna till garn. På uppdrag av organisationen Bhartiya Gramotthan Sanstha (BGS) har i detta projekt en redan befintlig metod utvecklats för att förädla fibern. Vad som främst eftersöktes var nedbrytandet av pektin som är en av de faktorer som bidrar till fiberns hårda och styva struktur. I metoden användes biologiskt nedbrytbara enzym som katalysat

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Crézé, Christophe. "Études fonctionnelles et structurales de la nucléoline en complexe avec des acides nucléiques structurés en G-quartet et de la pectate-lyase PelI de la bactérie phytopathogène Erwinia chrysanthemi." Lyon 1, 2008. http://www.theses.fr/2008LYO10064.

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Abstract:

La nucléoline est une protéine nucléolaire servant de marqueur des cellules cancéreuses et qui interagit avec des acides nucléiques. Le protocole de purification de divers fragments de cette protéine a été optimisé afin de l’adapter aux exigences d’une étude cristallographique. Une analyse de l’interaction de ces fragments avec diverses séquences d’ADN structurées en G-quartet a été réalisée par des méthodes biophysiques. Parallèlement, des essais de cristallisation ont été menés sur ces fragments seuls et en complexe avec des acides nucléiques. La structure d’un ADN structuré en G-quartet a é

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Fassoni, Andréia Cnossen. "A pectato liase codificada pelo gene pecCl1 é importante para agressividade de Colletotrichum lindemuthianum." Universidade Federal de Viçosa, 2012. http://locus.ufv.br/handle/123456789/5364.

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Abstract:

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:51:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 952076 bytes, checksum: 7fbcb43414ecacd3439620826b6172cd (MD5) Previous issue date: 2012-07-20<br>Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico<br>Colletotrichum lindemuthianum is the causal agent of common bean anthracnose. Genes that encode cell wall-degrading enzymes are essential for the development of this disease. The pectinases are characterized as the most important group of cell wall- degrading enzymes produced by phytopathogen fungi. The gene coding for pectate lyase, pe

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Quajai, Sirisart, and soj@kmitnb ac th. "Biopolymer Composite based on Natural and Derived Hemp Cellulose Fibres." RMIT University. Applied Sciences, 2006. http://adt.lib.rmit.edu.au/adt/public/adt-VIT20061222.111612.

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Abstract:

The aim of this research was to study the effect of pre-treatment and modification processes on the properties of hemp cellulose fibre for biopolymer composites application. Hemp fibres have been modified by various extraction, swelling, chemical and enzymatic treatments. The morphology and mechanical properties of the modified fibres have been measured. Biopolymer composites have been prepared using the modified fibres and matrices of cellulose acetate butyrate and cellulose solutions derived from hemp. The first fibre treatment employed was acetone extraction and mercerization. A low press

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Fiedler, Christian. "Die Strukturbildung der beta-Helix in der Pektatlyase Pel-15." Phd thesis, Universität Potsdam, 2010. http://opus.kobv.de/ubp/volltexte/2010/4725/.

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Abstract:

Pektatlyase (Pel-15) aus dem alkalophilen Bodenbakterium Bacillus spec. KSM-P15 ist mit 197 Aminosäuren eines der kleinsten, bekannten β-3-Solenoidproteine. Sie spaltet Polygalakturonsäurederivate in einem Ca2+-abhängigen β-Eliminierungsprozess. Wie bei allen Proteinen dieser Enzymfamilie ist auch die Polypeptidkette von Pel-15 zu einer einsträngigen, rechtsgängigen, parallelen β-Helix aufgewunden. In diesem Strukturmotiv enthält jede Windung drei β-Stränge, die jeweils durch flexible Schleifenbereiche miteinander verbunden sind. Insgesamt acht Windungen stapeln sich in Pel-15 übereinander und

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Brown, Ian Edward. "The biochemical and structural analysis of two family 10 pectate lyases." Thesis, University of Sunderland, 2002. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.268977.

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Parisot, Judicaël. "Production d'oligomères d'acides uroniques catalysée par les glycuronidases et les pectate-lyases." Nantes, 2002. http://www.theses.fr/2002NANT2049.

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Abstract:

Les oligosaccharides acides possèdent un grand intérêt biologique et présentent de nombreuses applications thérapeutiques. La synthèse in vitro de ces composés est indispensable car ceux-ci sont présents en faible quantité dans la nature et leur purification par extraction du milieu naturel est délicate. Leur synthèse chimique régiosélective est fastidieuse du fait du grand nombre d'étapes de protection-déprotection nécessaires et de la formation de structures furaniques et pyraniques. Les enzymes, par leur sélectivité, peuvent réduire considérablement l'ensemble de ces manipulations. Les lyas

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Carrillo, Olga Mayans. "Crystallographic studies on the specificity and catalytic mechanism of pectin and pectate lyases." Thesis, University of Reading, 1998. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.297622.

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Bourson, Claude. "Etude de la régulation du gène pelA codant pour une des pectate lyases chez Erwinia chrysanthemi." Lyon 1, 1992. http://www.theses.fr/1992LYO10231.

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Abstract:

Erwinia chrysanthemi est une bacterie phytopathogene responsable de la pourriture molle de nombreux vegetaux. La pathogenicite de cette bacterie est essentiellement due a la production et a la secretion de pectate lyases, codees par les genes pel. Nous nous sommes interesses a une de ces pectate lyases, pela, codee par le gene pe/a. Nous avons determine la sequence du gene pe/a et etudier l'expression de ce gene grace a une fusion pela::uida. Les genes impliques dans les relations plante-bacterie sont frequemment induits par des molecules vegetales. Nous avons demontre que les genes pel d'e. C

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Ji, Jingwei. "Etude physiologique et génétique de la sécrétion des pectate-lyases chez une bactérie phytopathogène : Erwinia Chrysanthemi." Lyon, INSA, 1988. http://www.theses.fr/1988ISAL0008.

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Abstract:

La porriture molle de végétaux provoquée par Erwinia cluysanthemi est due à la sécrétion dans le milieu extracellulaire d'enzymes lytiques : pectinases, cellulases, protéases. Huit mutants (outJ) dans lesquels les pectate-lyases et les cellulases ne sont plus sécrétées dans le milieu extérieur mais retenues dans le périplasme ont été isolés, par mutagenèse chimique ou par insertion de phage Mu-lac. L'étude cinétique de la sécrétion de pectate-lyasés montre que le périplasme semble être un compartiment obligatoire pour la sécrétion. Les mutations outJ sont localisées dans un même locus sur le c

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Guo, Wenjin. "Studies of pectate lyases from fusarium solani F. SP. PISI as virulence factors in fungal disease /." The Ohio State University, 1996. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=osu1487941504295317.

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Ji, Jingwei. "Etude physiologique et génétique de la sécrétion des pectate-lyases chez une bactérie phytopathogène, Erwinia chrysanthemi." Grenoble 2 : ANRT, 1988. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb376145378.

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Reverchon-Pescheux, Sylvie. "Etude génétique des pectates lyases d'une bactérie phytopathogène, ERWINIA CHRYSANTHEMI et transformation de cette bactérie." Lyon, INSA, 1985. http://www.theses.fr/1985ISAL0031.

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Abstract:

Le but poursuivi dans ce travail était de préciser au niveau moléculaire les déterminants du pouvoir phytopathogène de l'entérobactérie Erwinia chrysanthemi et d'aborder l'analyse des mécanismes de régulation intervenant dans l'expression de cette pathogénicité. E. Chrysanthemi produit des enzymes pectinolytiques qui sont les principales responsables de l'activité macératrice sur les végétaux. Une banque génomique de cette bactérie a d'abord été construite dans laquelle nous avons identifié une région pe1 composée de trois gènes distincts pe1A, pe1D, pe1E codant pour trois pectinases. La carac

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Trigui, Sameh. "Etude de la régulation des gènes de pectate lyases de la souche phytopathogène et psychotrophe Erwinia carotovora subsp. Caratovora MFCL0 par la température de croissance et la source de carbone." Rouen, 2006. http://www.theses.fr/2006ROUES016.

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Abstract:

Erwinia carotovora subsp. Carotovora MFCL0 est une souche bactérienne phytopathogène isolée de la surface de céleris-raves conservés en chambre froide. Psychotrophe, elle est capable de se développer dans une large gamme de température (0°C à 37°C). Il a été montré que des pectate lyases (Pels), enzymes sécrétées par cette bactérie et impliquées dans la dégradation du tissu végétal, sont produites de façon maximale à une température de croissance inférieure à sa température optimale de croissance (28°C). Dans ce travail, l’implication de l’expression des gènes spécifiques des endo-pectate lyas

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Rouanet, Carine. "Investigation du mécanisme d'action du système de régulation impliquant PecS chez la bactérie phytopathogène Erwinia chrysanthemi." Paris 7, 2002. http://www.theses.fr/2002PA077167.

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SAUVAGE, CHRISTEL. "Le fer chez erwinia chrysanthemi 3937 : etude du gene fct codant le recepteur de la ferrichrysobactine, et role du fer dans la regulation de l'expression des pectate lyases." Paris 6, 1995. http://www.theses.fr/1995PA066725.

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Abstract:

L'enterobacterie erwinia chrysanthemi souche 3937 provoque le symptome de pourriture molle sur son hote saintpaulia ionantha. Le developpement de la maladie requiert la production d'enzymes pectinolytiques, notamment cinq pectate lyases (pla a ple), et un systeme d'assimilation du fer a haute affinite base sur la production d'un siderophore de type catechol, la chrysobactine. L'operon fct-cbsceba code le recepteur de membrane externe de la ferrichrysobactine (fct) et des enzymes de biosynthese de la chrysobactine. Cette bacterie produit un second siderophore, l'achromobactine. Les mutants de t

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FAVEY, BEL SYLVIE. "Etude de la pectase lyase de point isoelectrique acide, pla, et d'une hemoproteine, pecx, de la souche 3937 d'erwinia chrysanthemi : role de ces deux proteines dans le pouvoir phytopathogene de la bacterie." Paris 11, 1991. http://www.theses.fr/1991PA112262.

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Abstract:

Le gene pela de la souche 3937 d'erwinia chrysanthemi qui code une pectate lyase de point isoelectrique acide, a ete sequence et caracterise. Le gene de structure est constitue d'une phase ouverte de lecture de 1179 bp codant un polypeptide de 41555 daltons, qui possede une sequence signal. Le clonage du gene pela derriere le promoteur de lacz du vecteur ptz19r a permis la surproduction de pla dans une souche deletee de ces autres genes pel construite a partir de la souche 3937. La proteine mature a ete purifiee et obtenue en grande quantite a partir du surnageant de cette souche. Ses propriet

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Chang, Hui-Wen, and 張惠雯. "Molecular Characterization of pelB Gene Coding for a Secondary Pectate lyase, PelB." Thesis, 2005. http://ndltd.ncl.edu.tw/handle/77580467216152008565.

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Abstract:

碩士<br>國立中興大學<br>分子生物學研究所<br>93<br>Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc) is a Gram-negative bacterium causing black rot in cruciferous plants. The virulence of Xcc depends on a number of pathogenic genes and virulent factors including the exopolysaccharide and extracellular enzymes such as proteases, endoglucannases, and pectinases. It is known that extracellular enzymes in various Gram-negative bacteria are secreted by type II secretion pathway using PilD as the signal pepetidase for N-terminus processing. A pilD mutant, MC1220 (pilD::pSMP104), has previously been constructe

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WANG, SONG-YU, and 王崧瑜. "A study of gene regulation of pectate lyase in tomato (Solanum lycopersicum)." Thesis, 2018. http://ndltd.ncl.edu.tw/handle/35m3x2.

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Abstract:

碩士<br>國立高雄師範大學<br>生物科技系<br>106<br>Plants can't move freely like animals, When the environment is not suitable for survive, plants must start various mechanisms to protect itself from the stresses. Plant stress mainly divided into biological stress, such as herbivores and pathogens attack, and abiotic stress, such as high/low temperature, sunlight, flooding and drought. Salicylic acid, jasmonic acid and ethylene are plant hormones which activate, and promote defense system to achieve disease- and insect-resistant ability. Pectate lyase was first discovered in the cultures of Erwinia carotovora

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Lee, Chien-ming, and 李健銘. "Studies on expression and characteristics of PelE pectate lyase of bacterial soft rot pathogen of Phalaenopsis, Erwinia chrysanthemi." Thesis, 2007. http://ndltd.ncl.edu.tw/handle/09830818852858374774.

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Abstract:

碩士<br>輔仁大學<br>生命科學系碩士班<br>95<br>Phalaenopsis soft rot bacterium, Erwinia chrysanthemi produces several pectic enzymes. Pectate lyases (Pels) the main E. chrysanthemi enzyme, depolymerize pectic substances of plant cell walls. The degradation products, unsaturated oligogalacturonates, have been proposed to induce plant defence reactions. If healthy plants are treated with Pels or oligosaccharides to make them produce defence reactions or resist soft rot pathogen. Constructed E. coli BL21 (DE3) and E. coli Rosetta (DE3) pLysS E.coli strains could express PelE and PelZ. Purified 47.4 kDa PelE and

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陳冠蓓. "Identificaiton and molecular typing of white flowered calla lily soft rot pathogen, and pectate lyase gene expression and application." Thesis, 2004. http://ndltd.ncl.edu.tw/handle/22848390864199779399.

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Abstract:

碩士<br>輔仁大學<br>生命科學系碩士班<br>92<br>Soft rot symptoms on white flowered calla lily (Zantedeschia aethiopica) were found in some nurseries in the Yang Ming Shan area, Taipei, Taiwan. Isolations from diseased flower stems consistently yielded bacterial colonies. Koch's postulates were completed by injecting bacterial suspensions (108 CFU/ml) into stems of white flowered calla lily. Control plants were inoculated with sterile distilled water. Symptoms developed 1-2 days in all inoculated plants and appeared to be identical to those observed on diseased material in nurseries. All of the control plants

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Chan, K., H. Kher, Chien-Yi Chang, W. Yin, and K. Tan. "Analysis of pectate lyase genes in Dickeya chrysanthemi strain L11, isolated from a recreational lake in Malyasia: a draft genome sequence perspective." 2015. http://hdl.handle.net/10454/15106.

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Abstract:

Yes<br>Dickeya chrysanthemi is well known as a plant pathogen that caused major blackleg in the European potato industry in the 1990s. D. chrysanthemi strain L11 was discovered in a recreational lake in Malaysia. Here, we present its draft genome sequence.<br>University of Malaya High Impact Research (HIR) Grants UM C/625/1/HIR/MOHE/CHAN/01 (grant no. A-000001-50001) and UM C/625/1/HIR/MOHE/CHAN/14/1 (grant no. H-50001-A000027)

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Chebli, Youssef. "Cell wall composition regulates cell shape and growth behaviour in pollen tubes." Thèse, 2012. http://hdl.handle.net/1866/8988.

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Abstract:

L’une des particularités fondamentales caractérisant les cellules végétales des cellules animales est la présence de la paroi cellulaire entourant le protoplaste. La paroi cellulaire joue un rôle primordial dans (1) la protection du protoplaste, (2) est impliquée dans les mécanismes de filtration et (3) est le lieu de maintes réactions biochimiques nécessaires à la régulation du métabolisme et des propriétés mécaniques de la cellule. Les propriétés locales d’élasticité, d’extensibilité, de plasticité et de dureté des composants pariétaux déterminent la géométrie et la forme des cellules lors d

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Maher, Eileen Anne. "Analysis of pectate lyases produced by Erwinia carotovora as a basis for determining their roles in pathogenesis." 1988. http://catalog.hathitrust.org/api/volumes/oclc/20317325.html.

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