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Dissertations / Theses on the topic 'Peptides – Biosynthèse'
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Yan, Kok-Phen. "Mécanismes moléculaires gouvernant la biosynthèse des peptides lasso, peptides bioactifs bactériens : cas de de la microcine J25." Paris 6, 2011. http://www.theses.fr/2011PA066610.
Full textAbstract:
La microcine J25 (MccJ25) est un peptide antimicrobien d'origine bactérienne synthétisé par la voie ribosomique et présentant une topologie particulière appelée "lasso" comprenant un nœud peptidique. Elle consiste en un cycle macrolactame N-terminal et une queue C-terminale piégée irréversiblement dans le cycle par des contraintes stériques. MccJ25 est synthétisée chez Escherichia coli sous forme d’un précurseur peptidique McjA, qui est maturé par deux enzymes, McjB et McjC. L’objectif de ce travail a été d’élucider les mécanismes moléculaires gouvernant la biosynthèse de peptides lasso, en utilisant MccJ25 comme modèle. En adoptant une approche basée sur l’ingénierie peptidique, nous avons montré que la structuration en lasso est déterminée par la taille du cycle et les résidus C-terminaux qui empêchent la queue de sortir du cycle, mais pas par la taille de la boucle. Nous avons caractérisé les enzymes de maturation de MccJ25. L’étude in vivo et in vitro de la maturation de MccJ25 nous a permis de montrer que McjB est une nouvelle protéase à cystéine ATP-dépendante, qui clive le précurseur McjA et possède une forte spécificité de substrat pour les positions P2 et P1’. McjC est une lactame synthétase qui catalyse l’activation du substrat en formant un intermédiaire acyl-AMP et assure la fermeture du cycle. Nos résultats montrent que McjB et McjC sont des enzymes interdépendantes agissant en complexe. Nous avons aussi démontré que la machinerie de biosynthèse de McJ25 peut être utilisée pour produire d’autres peptides lasso et des peptides cycliques branchés, ouvrant ainsi des perspectives quant à l’ingénierie de peptides bioactifs à partir de la structure en lasso
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Leclerc, Grégory. "Nouveaux peptides antibiotiques de champignons trichoderma biosynthèses dirigées isolement, purification et caractérisation de la peptaibol-synthétase de T. Longibrachiatum." Paris 6, 2000. http://www.theses.fr/2000PA066275.
Full textAbstract:
Les champignons microscopiques du genre trichoderma biosynthétisent des peptides antibiotiques actifs contre les bactéries a gram positif et les mycoplasmes, la cible étant la membrane plasmique. Ces peptides linéaires hydrophobes, nommes peptaibols, sont riches en acide alpha-aminoisobutyrique (AIB), bloques par un acétyle n-terminal et un amino alcool c-terminal. Ils résultent d'une voie de biosynthèse non ribosomale utilisant des protéines multifonctionnelles, les peptide-synthétases. Nous avons étudié deus souches : I)- T. Longibrachiatum qui produit des peptaibols de 20 résidus, les longibrachines LGA (GLN 1 8), II)- T. Harzianum qui conduit à des peptaibols neutres de 18 résidus (trichorzines PA) et 14 résidus (harzianines pc). Par RMN et modélisation moléculaire, nous avons montre que la structure tridimensionnelle de la longibrachine LGA i est une hélice droite mixte (alpha/3 1 0), présentant dans la région 10-13 un coude du a la proline 14. Ces hélices amphipathiques sont connues pour s'associer dans les bicouches phospholipidiques. La biosynthèse dirigée in vivo par apport exogène d'acides amines (aib, arg, glu) au milieu standard de culture conduit, pour les deux souches, a la simplification des mélanges peptidiques. T. Harzianum fournit ainsi quatre nouveaux peptaibols, dont les séquences ont été déterminées par spectrométrie de masse. La peptide-synthétase de T. Longibrachiatum a été purifiée en cinq étapes. Pour suivre l'activité enzymatique, nous avons mis au point deux tests reposant sur des mesures de radioactivité, l'échange atp- 3 2pppi et la formation d'un thioester avec la valine tritiee. La longibrachine-synthétase est caractérisée par un point isoélectrique de 5,5 et une masse moléculaire de 1920 KDA déterminée par ultracentrifugation (sédimentation a l'équilibre). Cette enzyme est ainsi la peptide-synthétase de plus haute masse moléculaire isolée et caractérisée jusqu'a présent.
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Vassiliadis, Gaëlle. "Biosynthèse et mécanisme d'action des microcines sidérophores, peptides antibactériens sécrétés par les entérobactéries." Paris 6, 2009. http://www.theses.fr/2009PA066235.
Full textAbstract:
Les microcines sont des peptides antimicrobiens de faible poids moléculaire synthétisés par les entérobactéries et impliqués dans les compétitions microbiennes du microbiote intestinal. La microcine E492 (MccE492) fut le premier peptide sidérophore décrit. En effet, cette microcine porte une modification post-traductionnelle originale apparentée aux sidérophores de type catécholate. Nous avons montré que l’entérobactine est un précurseur de la biosynthèse de la partie sidérophore de MccE492. De plus, deux gènes portés par le système génétique impliqué dans la biosynthèse de MccE492, mceC et mceD, se sont avérés indispensables pour l'acquisition de cette modification post-traductionnelle. Ces résultats nous ont permis d’établir un modèle de biosynthèse de MccE492. D’autre part, deux autres microcines, les microcines MccM et MccH47, ont été isolées et caractérisées. Celles-ci adoptent la même modification post-traductionnelle que MccE492. Ces trois microcines forment par conséquent une nouvelle famille, la famille des microcines sidérophores, agissant sur les bactéries cibles selon un mécanisme dit de « cheval de Troie ».
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Ouelhazi, Lazhar. "Mise en évidence et caractérisation moléculaire d'une protéine cytokinine-dépendante corrélée à la biosynthèse alcaloïque." Tours, 1994. http://www.theses.fr/1994TOUR3808.
Full text
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Beuzelin, Isabelle. "Synthèse peptidique prébiotique à partir de N-carbamoylaminoacides." Montpellier 2, 1998. http://www.theses.fr/1998MON20206.
Full textAbstract:
Le travail presente dans cette these s'inscrit dans le cadre de la chimie de l'evolution et concerne plus particulierement la chimie de l'evolution. Dans la premiere partie de ces travaux, les possibilites competitives de synthese d'-aminoacide et de n-carbamoylaminoacide ont ete analysee. Dans les conditions prebiotiques presumees, l'equilibre resultant du systeme rcho/nh3/hcn entre l'-hydroxynitrile (>99,9%) et l'-aminonitrile (<0,1%) a pu etre cinetiquement deplace vers le precurseur de l'-aminoacide (l'-aminonitrile) dans des conditions diluees extremement douces, selon deux processus catalytiques utilisant le formaldehyde et l'anhydride carbonique. Une etude cinetique du comportement des composes intermediaires de ces deux processus catalytiques a permis de montrer la preeminence des n-carbamoylaminoacides. Dans la deuxieme partie de cette these, le comportement cinetique des -aminoacides en presence de solutions aqueuses de cyanate a ete etudie en prenant en compte les differents processus catalytiques d'hydrolyse des cyanates. La glycine, aminoacide modele dans cette etude, meme a faible concentration (10-3 mol. L-1) est convertie au ph de l'ocean primitif en n-carbamoylglycine. La derniere partie de ces travaux est relative a l'activation chimique des n-carbamoylaminoacides par le systeme gazeux nitrosant no/o2 en phase solide aussi bien qu'en solvant organique. La nitrosation des n-carbamoylaminoacides constitue une voie d'acces simple aux n-carboxyanhydrides avec une tres bonne selectivite et sans rejets autres que n2 et h2o. Cette synthese correspond a une nouvelle voie efficace de preparation des n-carboxyanhydrides, veritables precurseurs peptidiques.
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Mengin-Lecreulx, Dominique. "Étude de la régulation des étapes cytoplasmiques de la biosynthèse du peptidoglycane de Escherichia coli." Paris 11, 1987. http://www.theses.fr/1987PA112207.
Full textAbstract:
Nous avons développé, au laboratoire, l'étude générale des activités enzymatiques qui participent à la phase cytoplasmique du processus de biosynthèse du peptidoglycane chez Escherichia coli. Cette étude ayant pour but principal de mieux cerner les mécanismes de régulation qui contrôlent la biosynthèse de cette macromolécule, nous l'avons orientée suivant deux directions principales :- la première a trait aux caractéristiques biochimiques de ces différents enzymes in vitro : mise au point des essais, recherche d'effecteurs de ces activités, détermination des paramètres cinétiques. - la deuxième approche vise à mieux définir les conditions réelles de fonctionnement de ces activités enzymatiques dans la cellule bactérienne. Cet aspect de notre travail a supposé la détermination des concentrations intracellulaires des substrats, produits et éventuels effecteurs de ces enzymes, nécessitant en particulier la mise au point de nouvelles techniques d'analyse de ces composés. La connaissance de ces concentrations nous a alors permis de préciser le niveau de fonctionnement réel de ces synthétases in vivo et de pouvoir recréer, in vitro, des conditions d'étude de ces enzymes se rapprochant le plus possible de ce qu'elles sont réellement dans la cellule bactérienne. Nous avons alors étudié de façon générale comment varient les différents paramètres de ce système de biosynthèse (teneur cellulaire en peptidoglycane, activités spécifiques des synthétases, concentrations intra-cellulaires de leurs précurseurs) avec les conditions de croissance bactérienne ou lors de perturbations diverses (action d'antibiotiques) affectant cette voie métabolique. L'ensemble des données obtenues à partir de ces expériences, réalisées soit in vitro, soit sur des cellules en croissance, nous apporte alors de nombreuses informations sur les mécanismes de régulation qui contrôlent le flux de précurseurs dans cette séquence réactionnelle.
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Fruitier-Arnaudin, Ingrid. "Les hémorphines : peptides biologiquement actifs issus de l'hémoglobine : détermination d'une voie potentielle de biosynthèse et de dégradation in vivo et mise en évidence de sites récepteurs cibles." La Rochelle, 1999. http://www.theses.fr/1999LAROS039.
Full textAbstract:
Sur la base de leur activité de type opioïde, des peptides ont été isolés à partir de sang bovin traité enzymatiquement et désignés sous le terme d'hémorphines. Les hémorphines semblent pouvoir être libérées in vivo. L’objectif de notre étude est de contribuer à la compréhension des mécanismes cellulaires responsables de leur apparition dans les tissus. Dans un premier temps, l'étude des mécanismes de dégradation de l'hémoglobine par la cathepsine D a été réalisée. Les résultats obtenus (préférence de clivage pour les acides aminés hydrophobes, clivage précoce des liaisons Leu 3 0-Leu 3 1 et Phe 4 0-Phe 4 1 de la séquence de la chaine de l'hémoglobine et résistance de la Vv-hémorphine-7 à l'action prolongée de la cathepsine D) font de cette enzyme un candidat potentiel pour la libération d'hémorphines in vivo. Dans un second temps, l'hypothèse selon laquelle les lysosomes pourraient être le siège d'une libération d'hémorphines a orienté notre recherche vers l'étude du pouvoir proteolytique de cet organite. La détection de séquences peptidiques apparentées aux hémorphines, effectuée à l'aide d'un dosage immunologique spécifique des séquences de type Vv-hémorphine-7, a permis de mettre en évidence la génération très précoce de trois séquences immunoréactives de type Vv-hémorphine-7 confirmant ainsi notre hypothèse. Enfin, la mise en évidence d'une activité de liaison des hémorphines aux récepteurs AT4 renaux et l'inhibition de l'aminopeptidase N démontrent que ces peptides constituent de nouveaux compétiteurs de l'angiotensine IV dans le système renine-angiotensine. Notre travail a donc conduit d'une part à la caractérisation d'enzymes endogènes susceptibles d'être impliquées dans la libération d'hémorphines in vivo et d'autre part à la démonstration qu'une fois libérés, ces peptides pourraient avoir des effets physiologiques.
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Jean, Fabienne. "Incorporation d'un mime de coude β dans deux protéines : études synthétiques, structurales et fonctionnelles." Lille 1, 1997. http://www.theses.fr/1997LIL10215.
Full textAbstract:
Chronologiquement, l'incorporation d'elements non naturels dans les proteines a tout d'abord consiste en l'introduction d'acides amines d, comportant une chaine laterale modifiee, ou d'une liaison chimique mimant la liaison peptidique. Nous proposons de nous placer plus loin dans le domaine de l'ingenierie des proteines en incorporant un element non naturel (mime de coude ) issu de la synthese organique, en remplacement d'un motif structural. L'incorporation de ce mime a structure dibenzofurane (mime-dbf) a ete decrite de facon tres precise dans des peptides et nous voulions etudier son comportement dans un contexte proteique. Dans un premier temps, nous avons etudie une nouvelle approche de synthese du mime-dbf afin de reduire le nombre d'etapes et de permettre sa fonctionnalisation. La nouvelle strategie repose notamment sur une reaction de metallation ou deux groupements ortho-directeurs sont en competition. L'optimisation des parametres temperature, stoechiometrie de l'agent de lithiation, nature et composition du solvant ont permis d'obtenir une bonne regioselectivite en faveur de la position voulue. Le mime-dbf a ete incorpore en utilisant la synthese peptidique en phase solide dans deux modeles proteiques : la scyllatoxine, une toxine de venin de scorpion, et le domaine b1 de la proteine g du streptocoque. Dans les deux cas, la structure tridimensionnelle des proteines modifiees, etudiee par rmn et modelisation moleculaire, est conservee. La scyllatoxine analogue conserve l'activite biologique au niveau des canaux potassium calcium-dependants mais le domaine b1 analogue, quant a lui, ne reconnait pas les immunoglobulines g dans les conditions du test utilise. D'autre part, le travail effectue lors d'un stage dans le laboratoire du professeur ramage a edimbourg est presente.
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Witwinowski, Jerzy. "Caractérisation de voies de biosynthèse de dicétopipérazines chez les actinobactéries." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017SACLS273/document.
Full textAbstract:
Les dicétopipérazines (DKP : diketopiperazines) sont une classe de produits naturels largement utilisée en médecine. Chez les organismes producteurs, elles peuvent servir de facteurs de virulence, de molécules de signalisation ou encore être impliquées dans la concurrence entre (micro-)organismes ou la défense contre les prédateurs, mais souvent leur rôle est inconnu. Elles peuvent être synthétisées par deux voies de biosynthèse principales : soit par des voies dépendant de synthétases de peptides non ribosomiques (NRPS: Non Ribosomal Peptide Synthetase), des complexes enzymatiques de grande taille utilisant comme substrats les acides aminés protéinogènes ou non, soit par des voies dépendant des cyclodipeptide synthases (CDPS), de petites enzymes utilisant comme substrats des ARNt chargés. Je me suis intéressé à ce deuxième type de voie de biosynthèse. J’ai d’abord participé à une étude visant à caractériser la diversité des CDPS et des DKP synthétisées par ces enzymes. Ce travail a permis d’élargir le champ des CDPS caractérisées expérimentalement, de démontrer l’incorporation par ces enzymes de 17 acides aminés dans des DKP et de poser les bases de la prédiction des DKP synthétisées grâce à l’identification dans la séquence protéique des CDPS de motifs de résidus responsables de la sélection du substrat. J’ai ensuite étudié chez Streptomyces venezuelae un cluster de gènes homologues à des gènes essentiels impliqués chez Mycobacterium tuberculosis dans la biosynthèse d’une dicétopipérazine. J’ai enfin identifié chez Streptomyces aizunensis les gènes dirigeant la biosynthèse de la bicyclomycine, un antibiotique de la famille des DKP utilisé en médecine. Je présente la caractérisation complète de la voie de biosynthèse de la bicyclomycine. Cette biosynthèse fait intervenir une CDPS, cinq dioxygénases dépendantes du fer et du 2-oxoglutarate et une monooxygénase de la famille des cytochromes P450. C’est la voie la plus complexe dépendante de CDPS jamais décrite, la seule contenant plusieurs enzymes d’oxydoréduction et la première voie de biosynthèse d’une molécule utilisée en médecine dépendante d’une CDPSDiketopiperazines (DKP) are a class of natural products widely used in medicine. In producer organisms, they may act as virulence factors, signaling molecules or may be involved in competition between (micro-) organisms or defense against predators, but often their role is unknown. They can be synthesized by two main biosynthetic pathways: either by non-ribosomal peptide synthetase (NRPS) dependent pathways, NRPSs being large enzyme complexes using proteinogenic or non-proteinogenic amino acids as substrates, or by Cyclodipeptide synthases (CDPS), small enzymes using loaded tRNAs as substrates. I was interested in this second type of biosynthetic pathway. I first participated in a study having as a goal to characterize the diversity of CDPSs and DKPs synthesized by these enzymes. This work enabled to widen the field of experimentally characterized CDPSs, to demonstrate the incorporation by these enzymes of 17 amino acids in DKPs and to lay the bases for the prediction of the DKPs synthesized thanks to the identification in the protein sequence of CDPSs of residue patterns responsible for substrate selection. I then studied in Streptomyces venezuelae a cluster of genes homologous to essential genes involved in Mycobacterium tuberculosis in the biosynthesis of a diketopiperazine. I finally identified in Streptomyces aizunensis the genes directing the biosynthesis of bicyclomycin, an antibiotic of the DKP family used in medicine. I present the complete characterization of the bicyclomycin biosynthetic pathway. This biosynthesis involves a CDPS, five iron-2-oxoglutarate-dependent dioxygenases and a cytochrome P450 monooxygenase. It is the most complex CDPS-dependent pathway ever described, the only one containing several redox enzymes and the first CDPS-dependent biosynthetic pathway for a molecule used in medicine
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Lecaillon, Jennifer. "Synthèse d'analogues de l'hormone alpha de stimulation des mélanocytes." Montpellier 1, 2008. http://www.theses.fr/2008MON13510.
Full textAbstract:
L’hormone alpha de stimulation des mélanocytes (α-MSH) appartient à la famille des mélanocortines. Celles-ci interagissent avec des récepteurs couplés aux protéines G, les récepteurs aux mélanocortines (MCRs). A ce jour, cinq sous-types de récepteurs ont été identifiés, et sont impliqués dans la régulation de très nombreux processus physiologiques et physiopathologiques comme l’obésité, l’inflammation, l’activité cardiovasculaire ou la mélanogenèse. Au niveau de la peau, l’α-MSH interagit avec le MC1R principalement pour stimuler la mélanogenèse. Le développement d’analogues de l’α-MSH permettrait donc de réguler la pigmentation de la peau. En particulier, un antagoniste de l’α-MSH pourrait constituer un nouvel agent dépigmentant. Cette thèse est consacrée au développement d’analogues peptidiques de l’α-MSH. Des études de relation structure-activité, basées sur des modifications des extrémités N- et C-terminales et la dimérisation de motifs peptidiques, ont conduit à l’obtention d’antagonistes sélectifs du MC1R. Afin d’augmenter la stabilité protéolytique et la sélectivité des antagonistes obtenus, des analogues cycliques ont été conçus. Pour cela, une nouvelle stratégie de synthèse de peptides cycliques a été développée. Enfin, au vu de la structure de certains des analogues, leurs propriétés antibactériennes ont été étudiées.
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Fougère, Cécile. "Nouvelle méthode de synthèse de dérivés phosphiniques : Application à la synthèse de nouveaux biomimétiques dérivés de peptide et de PNA." Paris 13, 2009. http://www.theses.fr/2009PA132017.
Full textAbstract:
L’utilisation de peptides et d’oligonucléotides comme médicaments est une nouvelle approche plus sélective pour le traitement de nombreuses pathologies. Cependant cette nouvelle stratégie se heurte aux problèmes de stabilité de ces macromolécules dans les milieux biologiques. Une solution peut être d’utiliser des mimétiques de peptide et d’oligonucléotides dont les propriétés permettront de pallier ces problèmes. Dans ce travail nous nous sommes intéressés au développement de mimes oligonucléotidiques : les acides peptidiques nucléiques (PNA), ainsi qu’à des mimes de peptides. Nous avons choisi dans ces deux modèles de remplacer certaines liaisons amides de la structure peptidique ou pseudopeptidique par des liens phosphiniques dans le but d’améliorer, pour le peptide la stabilité enzymatique et pour le PNA la solubilité en milieu aqueux. Dans un premier temps nous avons développé une nouvelle méthode de synthèse générale des acides phosphiniques non symétriques (R’P(O)OHR’’). Cette nouvelle méthode utilise des conditions douces qui permettent l’utilisation de substrats fonctionnalisés. Nous avons ensuite appliqué cette méthode pour la synthèse d’un dipeptide simple Gly[P(O)(OH)CH2]Gly, puis d’un dipeptide Ala[P(O)(OH)CH2]Ala et nous avons évalué son incorporation dans la séquence d’un peptide anti-angiogénique (A-p-AWLPPR). Le dernier aspect de ce travail a été d’étudier les stratégies d’obtention d’un synthon dimère PNA phosphinique TpT qui pourrait être incorporé dans diverses positions dans une séquence de PNA (TTTTCTTTT) : la séquence du polypurine tract (PPT) de l’ARN viral du virus HIV-1The use of oligonucleotides and peptides as more selective drug is a new strategy more and more studied to treat several diseases. However the main drawback in the use of these macromolecules as therapeutic agent is their poor stability in biological media. A solution could be to synthesize mimetic with improved properties. In our work we focused on the development of oligonucleotide mimics: peptide nucleic acids PNA and on peptide mimic. For these two mimics we choose to replace amide bond in the peptidic or pseudopeptidic structure by a phosphinic linkage, in order to increase for the peptide the stability towards enzymatic degradation and for the PNA to increase the aqueous solubility. First, we developed a new methodology for the obtaining of asymmetric phosphinic acids (R’P(O)OHR’’). This new synthetic strategy is carry out in mild conditions which allowed the use of functionalized substrates. We then apply this methodology to the synthesis of a simple dipeptide Gly[P(O)(OH)CH2]Gly and secondly of a dipeptide Ala[P(O)(OH)CH2]Ala. We evaluated the incorporation of this later dipeptide in the sequence of an antiangiogenic peptide (A-p-AWLPPR). The last aspect of this work was to study several strategies for the obtaining of a phosphinic dimer synthon of PNA: TpT which could be introduced in diverse position in a PNA sequence (TTTTCTTTT): the sequence of HIV-1 polypurin Tract (PPT) RNA
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Silva, Pires Viviane. "Synthèse, étude structurale et évaluation biologique de peptides et de peptidomimétiques à visée anti-thrombotique." Amiens, 2006. http://www.theses.fr/2006AMIED002.
Full textAbstract:
Ce travail de thèse consistait à synthétiser des peptides et de peptidomimétiques à visée anti-thrombotique. Ces peptides nous ont permis d'étudier l'importance de ces séquences peptidiques ainsi que leurs structurations vis-à-vis de leur reconnaissance par le récepteur TIIICBP. Les octapeptides de référence KBGEBGPK et KPGEPGPK possèdent un activité anti-thrombotique in vitro et in vivo. L'incorporation de ces séquences de référence dans de trimères simples entraîne une augmentation de l'activité anti-thrombotique de ces derniers. Cependant, lorsque l'octapeptide de référence est incorporé dans un peptide mimant la triple hélice du collagène, l'activité anti-thrombotique est supprimée au profit d'une activité pro-thrombotique. L'incorporation d'une sonde type thiouracile sur les chaînes latérales des lysines en position 1 et/ou 3 de la séquence octapeptidique de référence n'entraîne pas de modification majeure de l'activité anti-thrombotique. Ce qui permettra d'utiliser ces peptidomimétiques, par la suite, comme des outils moléculaires capables de caractériser TIIICBPThis doctoral thesis aimed at synthesizing peptides and analogous peptides with an anti-thrombosis activity profile. The peptides allowed us to study the importance of peptide sequences as well as their structure as recognized by the TIIICBP receptor. The KBGEBGPK and KPGEPGPK reference octapeptides show an anti-thrombosis activity in vitro and in vivo. The incorporation of these reference sequences into the simple trimers increases the anti-thrombosis activity of the octapeptide sequences. However, when the reference octapeptide is incorporated into a peptide that mimics the collagen triple helix, the anti-thrombosis activity is suppressed in favor of a pro-thrombosis activity. The incorporation of a thiouracile-type probe into the side chain of the lysines in the positions 1 and/or 3 of the reference octapeptide sequence does not lead to a major change in the anti-thrombosis activity. This will make it possible to use these analogous peptides as a molecular tool to characterize TIIICBP
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Vassaux, Antoine. "Mécanisme de biosynthèse et production de l’astine, un pentapeptide cyclique non-ribosomique de Cyanodermella asteris." Thesis, Lille 1, 2019. http://www.theses.fr/2019LIL1R027/document.
Full textAbstract:
L’astine C est un peptide cyclique assemblé au cours d’un mécanisme nonribosomique par une synthétase dite NRPS (NonRibosomal Peptide Synthetase). Ce peptide nonribosomique possède des propriétés thérapeutiques intéressantes avec notamment des activités anti-tumorale et anti-inflammatoire. Jusqu’ici ce composé était exclusivement extrait à partir des racines d’Aster tataricus, une plante utilisée traditionnellement en médecine japonaise et chinoise. Récemment, une production d’astine C a été mise en évidence chez Cyanodermella asteris, un champignon endophyte de cette plante. Cette découverte ouvre de nouvelles perspectives en matière de production d’astine C, qui reste néanmoins très limitée en raison du faible taux de croissance du champignon endophyte. Au cours de cette étude, deux approches ont été développées parallèlement afin d’augmenter les taux de production de l’astine C. La première stratégie consistait à augmenter les rendements en optimisant la production homologue à partir de C. asteris. Dans cette optique, un système de culture a été établi afin de cultiver le champignon exclusivement sur un support en acier inoxydable. Ce mode de culture a favorisé à la fois le développement de la biomasse fongique et la production du composé d’intérêt. En vue d’optimiser ce procédé, l’impact de plusieurs paramètres de culture (modalité de préparation du support, type d’inoculum, pH de culture, et composition du milieu de culture) sur la production d’astine C a été évalué. Les paramètres de culture optimisés ont permis d’améliorer de nouveau les rendements en astine C, ce qui constitue une première étape dans le développement d’un procédé de production à l’échelle industrielle. En parallèle, des travaux ont été menés afin de développer un système de production hétérologue d’astine C chez la levure. Cette approche n’a pu être considérée qu’après avoir identifié, par le biais d’analyses bioinformatiques, les gènes impliqués dans la voie de biosynthèse de l’astine. Une fois ces gènes identifiés, une revue de la littérature a permis, entre autres, de dresser un bilan des outils moléculaires disponibles pour le clonage des larges séquences nucléiques codant pour les NRPSs, et de sélectionner des hôtes hétérologues appropriés. Des séquences complète ou partielle du gène codant pour l’astine synthétase ont été clonées respectivement chez Saccharomyces cerevisiae et Yarrowia lipolytica. Pour les deux levures considérées, une expression hétérologue a été constatée. Chez S. cerevisiae, la synthèse de la NRPS d’astine n’a pas pu être démontrée. En revanche, pour la première fois, la production d’une structure de type NRPS chez Y. lipolytica a pu être mise en évidence. Bien qu’aucun peptide nonribosomique n’ait été détecté, cette étude a permis de lever une partie des verrous limitant le développement d’un mode de production hétérologue d’astine chez la levureAstin C is a cyclic peptide assembled through a nonribosomal mechanism by a NonRibosomal Peptide Synthetase (NRPS). This nonribosomal peptide displays promising therapeutic properties including anti-tumor and anti-inflammatory activities. For decades, this compound was only extracted from the roots of Aster tataricus, a well-known plant in traditionnal japanese and chinese medicine. Recently, Cyanodermella asteris, a fungal endophyte of this plant, was demonstrated to be able to synthesize astin C. This discovery offers new opportunities for the production of this compound of interest. Nonetheless the very low growth rate of this endophytic fungus is an obstacle limiting the astin C production. In this study, two distinct approaches were conjointly considered to upscale the production rate of this compound. The first strategy was related to an optimization of the homologous production from C. asteris. For this purpose, an innovative cultivation system has been developed enabling to grow the fungus exclusively on a stainless steel support. This cultivation condition turned out to be favorable both for the fungal biomass development and for the astin C production. In order to further optimize this process, the effects of several culture parameters (i.e. support pre-treatment procedure, inoculum type, pH, medium composition) on the astin C production rates was investigated. Under optimized conditions, astin C yields were further enhanced, constituting a first step towards the development of an astin C production process at industrial scale. Meanwhile, a study was conducted in order to develop a heterologous expression system for astin C production in yeast. The identification, through bioinformatics analyses, of the genes involved in the astin biosynthesis was a precondition for the development of this approach. Once these genes have been identified, a literature review has enabled to compile the molecular tools applicable for the cloning of NRPS long lenght sequence, and to select a proper host to heterologously express them. The whole sequence or a truncated one have been transfered respectively to Saccharomyces cerevisiae or Yarrowia lipolytica. In boh considered yeasts, a heterologous expression of the foreign sequences was confirmed. In S. cerevisiae, the synthesis of the astin NRPS could not be demonstrated. On the other hand, in Y. lipolytica, for the first time, the production of a NRPS-type structure was detected. Although no nonribosomal peptide was detected, this study enabled to overcome several of the hurdles limiting the development of a astin heterologous production way in yeast
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Castéra-Guy, Joany. "Etude à l’échelle cellulaire et moléculaire de la synthèse de la mycosubtiline." Thesis, Lille 1, 2013. http://www.theses.fr/2013LIL10015.
Full textAbstract:
Cette thèse a porté sur l’étude de la biosynthèse d’un lipopeptide antifongique, la mycosubtiline, produit par Bacillus subtilis ATCC6633 sous la forme d’un mélange d’isoformes qui varient selon la longueur et l’isomérie de leur chaine d’acide gras. La nature de l’acide gras influence l’activité biologique du lipopeptide. La corrélation entre la synthèse des isoformes de mycosubtiline et d’acides gras cellulaires a été étudiée en faisant varier des conditions de culture telles que l’osmolarité, la température et la source d’azote. Les variations du profil d’acides gras influencent dans la majorité des cas le profil des mycosubtilines obtenues confirmant le rôle important de ces précurseurs pour la synthèse du lipopeptide. Les effets de la modification génétique de deux gènes intervenant dans la synthèse de ces précurseurs ont été également caractérisés. La surexpression du gène ilvA codant pour la thréonine déshydratase et intervenant donc dans la synthèse de l’isoleucine augmente la synthèse de la mycosubtiline anteisoC17 alors que l’interruption d’un gène régulateur pléiotropique codY favorise la formation de la forme isoC16. Une souche monoproductrice constitutive de mycosubtiline, obtenue par optimisation génétique de la souche ATCC 6633 a également été caractérisée. Enfin, une première approche de purification des synthétases impliquées dans la synthèse de la mycosubtiline a été réalisée. Ces études ont contribuées à une meilleure compréhension des paramètres influençant « in vivo » cette synthèse, ainsi qu’à l’amélioration de la production de mycosubtiline, et à la définition des conditions optimales d’obtention des isoformes les plus activesThis thesis is about the study of an antifungal lipopeptide , the mycosubtilin produced by Bacillus subtilis ATCC 6633 as a co-production of isoforms which vary according to the length and the isomery of the fatty acids chain (mostly nC16, isoC16, nC17, isoC17 and anteisoC17). The nature of fatty acid chain influences the biological activity of the lipopeptide. The relationship between the mycosubtilin isoforms synthesis and the fatty acids synthesis was studied by the variation of growth parameters like osmolarity, temperature and nitrogen source. The important role of fatty acids precursors for the lipopeptides synthesis was confirmed by the influence of fatty acids pattern variations on the mycosubtilines pattern. The effects of genetic modification of two genes involved in synthesis of fatty acids precursors were also characterized. The overexpression of ilA coding for threonine deshydratase, involved in isoleucine synthesis increase the mycosubtilin anteisoC17 production while the knock-out of the pleitropic regulator gene codY improves the isoC16 mycosubtilin synthesis. Moreover, a mycosubtilin constitutive monoproductive strain, obtained by genetic optimization of ATCC 6633 strain was also characterized. Then, a preliminary purification approach of synthetases implied in mycosubtilin synthesis was realized. Those studies contribute to a better understanding of parameters influencing in vivo synthesis as well as the improvement of mycosubtilin production and the definition of optimal conditions to obtain the most active isoforms
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Le, Flem Guillaume. "Synthèse d'analogues séquentiels de l'insuline : étude de leur relation strucuture-fonction et de leur activité biologique in vitro." Amiens, 2002. http://www.theses.fr/2002AMIED002.
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Thaler, Jacques-Olivier. "Bases biologiques et biochimiques des barrières microbiennes impliquées dans la monoxénie et la spécificité des symbioses bactério-helminthiques." Montpellier 2, 1995. http://www.theses.fr/1995MON20055.
Full textAbstract:
Le travail de these porte sur les relations ecologiques entre l'helminthe entomophage, steinernema carpocapsae, et sa bacterie associee, xenorhabdus nematophilus. Cette etude est un prealable indispensable a une utilisation raisonnee des nematodes entomopathogenes comme biopesticides. Les resultats obtenus posent les bases biologiques et biochimiques qui permettent d'expliquer d'une part, les phenomenes de competition inter-organismes multiples qui se produisent dans l'insecte parasite et, d'autre part, le maintien de l'association entre le nematode et son symbionte. Trois antibiotiques ont ete mis en evidence. Le premier a ete identifie comme correspondant aux xenocoumacines. Le second est probablement un peptide apparente au groupe des microcines. Le troisieme est une bacteriocine de type queue de phage dont la purification et la caracterisation ont permis de l'identifier comme un nouveau compose: la xenorhabdicine. Cette these a permis d'apporter les bases necessaires a l'identification des genes de synthese des bacteriocines et de mieux comprendre leur role ecologique
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Granger, Isabelle. "Recherche de molécules d'origine végétale à visée cardiovasculaire présentant une affinité pour les récepteurs V1a de la vasopressine." Toulouse, INPT, 1993. http://www.theses.fr/1993INPT034G.
Full textAbstract:
Une recherche de molecules d'origine vegetale a visee cardiovasculaire presentant une affinite pour les recepteurs v1a de la vasopressine (avp) a ete entreprise. Des antagonistes v1a specifiques, non peptidiques et de bas poids moleculaires, pourront servir de point de depart a de futurs medicaments. 251 extraits bruts de plantes choisies selon plusieurs criteres (donnees ethnopharmacologiques, travaux phytochimiques et pharmacologiques connus, disponibilite des vegetaux) ont ete etudies dans le test biochimique in vitro avp(v1a). Ce criblage oriente a eu pour but de selectionner des plantes dont les extraits etaient actifs (eschscholtzia californica, vetiveria zizanioides, ruta graveolens) sur lesquels ont ete engages des travaux de purification de facon a isoler leurs principes actifs: chelerythrine, sanguinarine, khusimol, pheophorbide a. Parallelement, un criblage de 202 molecules naturelles a permis de mettre en evidence 18 molecules actives appartenant a cinq familles chimiques differentes (alcaloides steroidiques, saponines steroidiques, saponines triterpeniques, quinones et derives anthraceniques). Des evaluations biochimiques concernant l'affinite, la competitivite et la selectivite de ces molecules, ont ete realisees. Une serie chimique a permis de contribuer a l'optimisation (grace a des relations structure/activite) de puissants antagonistes v1a non peptidiques de l'avp, actifs in vitro et in vivo, actuellement en cours de developpement preclinique
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Hilbert, Jean-Louis. "Contribution à l'étude des intéractions plantes-champignons ectomycorhiziens : Modifications de la biosynthèse des protéines au cours du développement de la symbiose : eucalyptus globulus-pisolithus tinctorius." Nancy 1, 1989. http://www.theses.fr/1989NAN10062.
Full textAbstract:
Étude du fonctionnement de la symbiose ectomycorhizienne au niveau moléculaire. Effet de la mycorhization sur la biosynthèse des protéines. Étude comparative des cartes polypeptidiques du mycelium libre, des racines non mycorhizées et des ectomycorhizes. Recherches de marqueurs biochimiques de la mycorhization
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Jacques, Isabelle. "Découverte et déchiffrage de nouvelles voies de biosynthèse dépendant des synthases de cyclodipeptides : les clés d’une diversité accrue de dicétopipérazines potentiellement bioactives." Thesis, Paris 11, 2015. http://www.theses.fr/2015PA114838/document.
Full textAbstract:
Malgré l’intérêt et la diversité des propriétés pharmacologiques des 2,5-dicétopipérazines (DKP), les voies de biosynthèse de ces molécules d’origine microbienne sont très peu connues. L’objectif de mes travaux de thèse a été i) de documenter de nouvelles voies de biosynthèse de DKP qui se caractérisent par la présence d’une synthase de cyclodipeptides (CDPS) travaillant souvent de concert avec une ou plusieurs enzymes de modification des cyclodipeptides et ii) d’explorer la diversité chimique codée par ces voies. Dans un premier temps, je me suis intéressée aux CDPS. Après la sélection par bioinformatique de candidats dans les bases de données génomiques, j’ai pu identifier 51 nouvelles CDPS actives et montrer que ces enzymes peuvent incorporer 17 des 20 acides aminés naturels. Par ailleurs, ce travail a permis de mieux caractériser la famille des CDPS, de définir l’existence de plusieurs sous-familles aux signatures fonctionnelles spécifiques et d’établir les premiers éléments d’un code de spécificité pour la synthèse de cyclodipeptides. Dans un second temps, je me suis attachée à caractériser les enzymes de modification associées aux nouvelles CDPS et, en particulier, les dioxygénases dépendant du Fe(II) et du 2-oxoglutarate (OG) qui sont très représentées dans ces voies. J’ai ainsi pu détecter une activité in vivo pour 11 OG et poursuivre la caractérisation in vitro pour l’une de ces OG, ce qui a permis de caractériser les DKP qu’elle synthétise et d’ainsi montrer la complexité des modifications chimiques introduites. L’ensemble de ces travaux a donc permis d’identifier et de caractériser de nouvelles voies de biosynthèse qui donnent accès à une diversité accrue de DKPDespite the interest and diversity of the pharmacological properties of 2,5-diketopiperazines (DKPs), the biosynthetic pathways of these microbial molecules are poorly documented. The aim of my doctoral work was i) to identify new DKP biosynthetic pathways that are characterized by the presence of a cyclodipeptide synthase (CDPS) often associated with one or more cyclodipeptide-tailoring enzymes and ii) to explore the chemical diversity encoded by these pathways. First of all, my study focused on CDPSs. After the bioinformatics-based selection of candidates, 51 novel CDPS were characterized, revealing the incorporation of 17 of the 20 proteinogenic amino acids. Moreover, this work has allowed a better characterization of the CDPS family, by showing the existence of several subfamilies with specific functional signatures and laying the foundations of a specificity conferring code for the synthesis of cyclodipeptides. Second, I characterized the tailoring enzymes associated with the newly identified CDPSs and, in particular, the Fe(II) and oxoglutarate dependent dioxygenases (OGs) that are highly represented in these pathways. I detected the in vivo activity for 11 OGs and characterized the in vitro activity for one of them, showing the complexity of the chemical modifications introduced into the cyclodipeptide. This work has led to identify and characterize novel biosynthetic pathways that provide access to a greater diversity of DKPs
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Benamar, Driss. "Activités et fonctions ionagogues d'analogues synthétiques de la gramicidine A : effets de modifications portant sur la partie C-terminale." Montpellier 2, 1992. http://www.theses.fr/1992MON20093.
Full textAbstract:
Notre travail a apporte une contribution a la comprehension du mecanisme de transport ionique a travers le canal de la gramicidine a. Les resultats de tous les analogues etudies ont fait ressortir plusieurs points: 1) la conductance du canal ne depend pas de la taille des chaines laterales aromatiques; 2) le moment dipolaire lie aux chaines laterales aromatiques est une condition necessaire mais non suffisante pour obtenir des canaux de conductance elevee; 3) l'hydrophobicite des chaines laterales est un facteur important pouvant induire des modifications de leurs orientations, ce qui a pour consequence une modification des hauteurs relatives des barrieres energetiques; 4) l'extremite ethanolamine ne joue aucun role dans le transfert ionique. Ces resultats permettent de classer les differents analogues en deux classes: d'une part les gramicidines dont la conductance est elevee et independante du potentiel et d'autre part les analogues dont la conductance est faible et fortement dependante du potentiel
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Pecher, Julien. "Synthèse, analyse structurale et activité biologique d'insulinomimétiques." Amiens, 2006. http://www.theses.fr/2006AMIED004.
Full textAbstract:
Ce travail de thèse a consisté à synthétiser des peptides à visée antidiabétiques, à déterminer leur structure tridimensionnelle et à étudier leur activité biologique lors de tests biologiques in vitro et in vivo. Les peptides étudiés dérivent soit des chaînes A et B isolées de l’insuline humaine soit de peptides décrits dans la littérature comme ayant une activité biologique. L’effet pharmacologique des peptides a été testé sur des modèles cellulaires et sur un modèle animal. Les études structurales réalisées par RMN, DC et dynamique moléculaire ont permis de proposer un modèle tridimensionnel pour deux de ces peptides. Une approche séquentielle impliquant la reconstruction du pont disulfure à partir du dérivé dithiol a été suivie lors de simulations de l’ordre de la microseconde. Enfin, une méthode générale d’étude de l’impacte de pont disulfure intramoléculaire dans le repliement des peptides a été mise au point par dynamique moléculaire en présence de solvant implicite « GB »This work of thesis consisted in synthesizing antidiabetic peptides with aiming, determining their three-dimensional structure and studying their biological activity during in vitro and in vivo biological essay. Studied peptides derive either from chains A and B isolated from human peptide insulin or described in the literature like having a biological activity. The pharmacological effect of peptides was tested on cellular models and an animal model. The structural studies carried out by NMR, CD and molecular dynamics made it possible to propose a three-dimensional model for two of these peptides. A sequential approach implying the rebuilding of the disulphide bridge starting from derived the sulfhydryl was followed during simulations of about a microsecond. Lastly, a general method of impact study intramolecular disulphide bridge in the folding of peptides was developed by molecular dynamics in the presence of implicit solvent "GB"
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Charli, Jean-Louis. "Biosynthese, liberation et inactivation de quelques peptides dans le systeme nerveux central." Paris 6, 1987. http://www.theses.fr/1987PA066304.
Full text
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Li, Yan. "Cyclodipeptide synthases : towards understanding their catalytic mechanism and the molecular bases of their specificity." Phd thesis, Université Paris Sud - Paris XI, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00868787.
Full textAbstract:
Cyclodipeptides and their derivatives, the diketopiperazines (DKPs), constitute a large class of secondary metabolites with noteworthy biological activities that are mainly synthesized by microorganisms. The biosynthetic pathways of some DKPs contain cyclodipeptide synthases (CDPSs), a newly defined family of enzymes. CDPSs hijack aminoacyl-tRNAs from their essential role in ribosomal protein synthesis to catalyze the formation of the two peptide bonds of various cyclodipeptides. The aim of the work presented in this thesis manuscript is to characterize the CDPS family. At first, the structural and mechanistic characterization of the first identified CDPS, AlbC of Streptomyces noursei, is presented. Then, the results obtained with three other CDPSs, each of which having suitable properties to increase our understanding of the CDPS family, are described. The CDPS Ndas_1148 of Nocardiopsis dassonvillei extends our knowledge of the molecular bases of the CDPS specificity. The CDPS AlbC-IMI of S. sp. IMI 351155 is a good model to analyze the interaction of each of the two substrates required for the formation of a cyclodipeptide. Finally, the characterization of the CDPS Nvec-CDPS2 from Nematostella vectensis provides the first example of enzymes of animal origin involved in nonribosomal peptide synthesis.
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Hindré, Thomas. "Analyses moléculaires de la production de la lacticine 481, un peptide antibactérien de type lantibiotique, synthétisé par Lactococcus lactis." Rennes 1, 2003. http://www.theses.fr/2003REN10036.
Full textAbstract:
La lacticine 481 est un lantibiotique qui résulte de la maturation d'un peptide précurseur synthétisé par voie ribosomique. Le gène de ce précurseur (lctA) est inclus dans un opéron dont les produits sont responsables de la production (lctAMT) de la lacticine 481 et de l'immunité (lctFEG) de la souche productrice vis-à-vis de ce peptide antibactérien. Le rôle du produit de lctT a été démontré en analysant par spectrométrie de masse MALDI-TOF des colonies bactériennes n'exprimant que lctAMFEG. Quatre variants de la lacticine 481 ont été produits en remplaçant lctA au sein de son opéron par des copies mutées. Les deux promoteurs P1 et P3 situés en amont de lctA sont prépondérants pour l'expression des gènes lctAMTFEG et une activité promotrice additionnelle assure celle des seuls gènes lctFEG. La production de lacticine 481 est contrôlée au niveau transcriptionnel et dépend principalement de l'acidification au cours de la croissance de L. Lactis. La comparaison de P1 et P3 avec d'autres promoteurs de L. Lactis régulés par le pH a révélé trois motifs conservés dans leur région -40. Ces motifs sont indispensables à l'activité de P1 qui ne possède pas de séquence -35 consensus.
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Godzaridis, Élénie. "Modélisation bio-informatique du mécanisme d'action d'inhibiteurs de la voie de biosynthèse du peptidoglycane." Master's thesis, Université Laval, 2012. http://hdl.handle.net/20.500.11794/23561.
Full textAbstract:
La résistance développée par les bactéries aux antibiotiques est un problème d'échelle mondiale qui a récemment attiré beaucoup d'intérêt. En effet, particulièrement chez les bactéries à Gram-négatif, on constate une depletion rapide de la quantité d'antibiotiques efficaces. De nos jours, les programmes de recherche de nouveaux antibiotiques commencent souvent par le criblage de cibles cellulaires. Les enzymes Mur, impliquées dans la biosynthèse de la paroi, sont uniques aux cellules bactériennes et nécessaires à leur survie. Le présent mémoire décrit l'utilisation des méthodes de bio-informatique structurale pour mettre en lumière un possible mécanisme d'action pour deux inhibiteurs des Mur ligases précédemment découverts : MurDpl etMurFpl. De plus, les recherches ici présentées ont permis de découvrir une grande similarité entre MurDpl et une famille de peptides antimicrobiens naturels, les tigerinines. Leur capacité à pénétrer les cellules bactériennes et la difficulté pour les bactéries de développer une résistance aux peptides antimicrobiens en général en font des composés de départ prometteurs. Nous suggérons que MurD pourrait être une cible intracellulaire des tigerinines et proposons un mécanisme d'action. De plus, par des moyens informatiques, nous évaluons les possibilités de raffiner MurDpl, MurFpl et les tigerinines de façon à augmenter leur activité.
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Hackl, Stefanie [Verfasser], and Andreas [Akademischer Betreuer] Bechthold. "Untersuchungen zur Biosynthese des nichtribosomalen Peptides WS9326A und zum Einfluss von BldA auf das Transkriptom und Proteom von Streptomyces calvus." Freiburg : Universität, 2017. http://d-nb.info/1155406044/34.
Full text
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MOR, AMRAM. "Etude de la biosynthese de 2 peptides opioides contenant des acides amines de configuration d : la dermorphine et la dermenkephaline." Paris 6, 1990. http://www.theses.fr/1990PA066249.
Full textAbstract:
Au cours de ces vingt dernieres annees, plus d'une quarantaine de peptides biologiquement actifs ont ete isoles a partir de la peau d'amphibiens. Parmi ceux-ci, la dermorphine (tyr-d. Ala-phe-gly-tyr-pro-ser-conh#2), peptide opioide a haute selectivite pour le recepteur morphinique (). Se basant sur la sequence predite d'un des clones des precurseurs de la dermorphine, nous decrivons dans ce memoire l'isolement d'autres peptides opioides contenant un residu d-methionyl en position 2, soit: try-d. Met-phe-his-leu-met-asp-conh#2, ainsi que la forme desamidee et l'isomere l-met#2 de ce peptide. L'analyse des proprietes pharmacologiques de ces nouveaux peptides, baptises dermenkephalines, montre que les isomeres d se comportent comme de puissants agonistes pour les recepteurs enkephaliniques (). Dans un deuxieme temps, nous decrivons aussi l'isolement d'un precurseur proteique (mr=38,500) a l'aide d'une batterie d'anticorps diriges contre des sequences predites de la prodermorphine, et montrons que ce dernier contient deja des residus d'acides amines d incorpores dans sa sequence. Dans un troisieme temps, ce memoire decrit la mise en evidence de ces peptides chez les mammiferes par des techniques immunocytochimiques et biochimiques. La prodermorphine offre donc un exemple unique de precurseur biosynthetique plurifonctionnel, generant des peptides possedant un acide amine d, qui se lient specifiquement a 2 classes de recepteurs opioides. A l'instar des opioides classiques des mammiferes (enkephalines, dynorphines et endorphines) les dermorphines-dermenkephalines representent une quatrieme famille de peptides opioides endogenes, caracterisee par une exceptionnelle puissance et specificite de liaison aux recepteurs opioides
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PARNOT, CHARLES. "De la biosynthese des peptides vasoactifs a l'activation de leurs recepteurs : les exemples de l'endotheline-1 et de l'angiotensine ii." Paris 6, 1999. http://www.theses.fr/1999PA066386.
Full textAbstract:
La comprehension de la fonction des peptides vasoactifs, c'est-a-dire intervenant dans la regulation de la pression arterielle, anime une grande partie de la recherche fondamentale dans le domaine cardiovasculaire. Les peptides vasoactifs ont une structure commune, qui implique des mecanismes de biosynthese similaires, et une fonction commune, qui implique des mecanismes de signalisation cellulaire communs permettant une reponse rapide des vaisseaux. Mais la diversite de leurs modes d'action et leur implication dans d'autres fonctions de l'organisme montre que le concept de peptide vasoactif revet aussi des aspects tres differents. Ainsi, a chaque nouveau peptide vasoactif decouvert, la comprehension du fonctionnement du systeme cardiovasculaire a gagne en profondeur, mais aussi en complexite. Au cours de ce travail de these, deux aspects de la biologie des peptides vasoactifs ont ete abordes, la biosynthese et l'activation des recepteurs des peptides. Le premier aspect a ete etudie en prenant l'exemple de l'endotheline-1 : l'utilisation d'un systeme cellulaire integre pour la detection de la formation du peptide a permis de determiner la localisation de sa biosynthese au niveau subcellulaire. Le deuxieme aspect a ete etudie en prenant l'exemple du recepteur at 1 a de l'angiotensine ii : l'utilisation d'un systeme de criblage original a permis de rechercher parmi 5000 mutants aleatoires les mutants constitutivement actifs, c'est-a-dire actifs meme en absence du peptide, ce qui apporte des informations tres importantes pour la comprehension des relations structure-fonction du recepteur. Ces travaux, par l'etude des mecanismes moleculaires et cellulaires de la biologie des peptides vasoactifs, peuvent ameliorer la connaissance de leur physiologie. Ils permettront aussi de mieux comprendre les pathologies du systeme cardiovasculaire et leur traitement par des molecules interferant avec la biosynthese des peptides ou l'activation de leurs recepteurs.
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Pesset, Bénédicte. "Conception, synthèse et vectorisation d'inhibiteurs potentiels de la protéine bactérienne TonB." Thesis, Strasbourg, 2012. http://www.theses.fr/2012STRAJ089/document.
Full textAbstract:
La multiplication des résistances aux antibiothérapies actuelles et l’utilisation potentielle de bactéries pathogènes dans le cadre d’attentats bioterroristes rendent nécessaire la recherche de nouvelles cibles biologiques et la découverte de nouvelles stratégies antibiotiques. Dans ce contexte, les mécanismes d’assimilation du fer chez les bactéries à Gram négatif sont des cibles particulièrement prometteuses. Le fer est en effet un élément essentiel à la vie, mais peu biodisponible. Les bactéries ont donc développé des mécanismes efficaces pour subvenir à leurs besoins en fer. Ces mécanismes de transport nécessitent un apport d’énergie fourni par une machinerie bactérienne complexe, la machinerie TonB. La protéine TonB, qui joue un rôle central dans le fonctionnement de cette machinerie, est la cible de notre approche. Nous souhaitons séquestrer cette protéine dans le périplasme grâce à des composés peptidiques fonctionnalisés par des hétérocycles de type isoindole ou 1,2,4-triazine. La conception et la synthèse de ces molécules sont présentées dans ce manuscrit, ainsi que leurs perspectives de vectorisation en utilisant une stratégie dite du "cheval de Troie". Notre contribution à la mise au point d’un test d’affinité in vitro est également abordéeThe increasing resistances to the current antibiotherapies, and the potential use of pathogenic bacteria as biological weapons led us to the absolute necessity of discovering new biological targets and new antibiotic strategies. In this context, iron uptake pathways of Gram negative bacteria are promising targets. Indeed, iron is an essential nutrient, but it has a low bioavailability. Bacteria have developed efficient iron uptake pathways in order to proliferate. Iron is transported in the bacterial cell by specific outer membrane transporters and thanks to the energy provided by a complex molecular machinery, called TonB. The TonB protein, which is the keystone of this machinery, is a key target for the development of new antibiotics. We would like to sequester this protein in the periplasm thanks to molecules constituted of a peptidic moiety and a heterocyclic moiety such as isoindole or 1,2,4-triazine. The conception and the synthesis of these compounds are presented in this document, as well as their possibilities to be vectorized using a “Trojan Horse” strategy. Our contribution to the development of an in vitro test of affinity is presented as well
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Ziemert, Nadine. "Identification and characterisation of ribosomal biosynthesis pathways of two cyclic peptides from cyanobacteria." Doctoral thesis, Humboldt-Universität zu Berlin, Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät I, 2009. http://dx.doi.org/10.18452/16029.
Full textAbstract:
Naturstoffe sind eine der wichtigsten Quellen für die Entwicklung neuer Pharmazeutika. Eine Vielzahl von bioaktiven Substanzen mit potentieller Anti-Krebs, Anti-HIV oder antimikrobieller Wirkung wurde aus der Gruppe der Cyanobakterien isoliert. Die meisten dieser Metabolite sind Peptide oder besitzen peptid-ähnliche Strukturen und werden nicht-ribosomal von großen, modular aufgebauten Enzymkomplexen gebildet. Vor kurzem konnte anhand der Patellamide gezeigt werden, dass zyklische Peptide auch ribosomal hergestellt werden können. Microcystis aeruginosa NIES298 produziert eine Reihe von Sekundärmetaboliten, unter anderem die nicht-ribosomalen Peptide Microcystin und Aeruginosin. Zwei weiteren von diesem Stamm produzierten Peptiden, Microcyclamid und Microviridin B, konnten bislang noch keine Gene zugeordnet werden. In dieser Studie wurden ribosomale Biosynthesewege für beide Peptidfamilien identifiziert. Die zur Biosynthese des cytotoxischen Hexapeptids Microcyclamid notwendigen Enzyme zeigen eine hohe Ähnlichkeit zu den Patellamid-Enzymen und weisen auf ähnliche Biosynthesemechanismen hin. Ein völlig neuer Syntheseweg, in dem bis dahin unbekannte ATP-grasp-Ligasen eine Rolle spielen, konnte für den trizyklischen Proteaseinhibitor Microviridin gefunden werden. Die erfolgreiche heterologe Expression dieses Peptids in E. coli bietet die Möglichkeit Bibliotheken von Microviridin-Varianten mit neuen oder verbesserten Bioaktivitäten zu konstruieren. Die systematische Suche nach ähnlichen Biosynthesegenen in Microcystis Laborstämmen und Gewässerproben zeigte eine weite Verbreitung und eine große Diversität der untersuchten Peptidklassen in Cyanobakterien, und stellt die Frage nach der natürlichen Funktion dieser Metabolite. Um erste Hinweise zu erhalten, wurden Trankriptions- und Expressionsstudien der Biosynthesegene durchgeführt. Schließlich konnten, mit Hilfe des so genannten „genome-mining“, neue Varianten der untersuchten Peptidklassen gefunden und aufgeklärt werden.Microbial natural products represent a major source for the development of new therapeutic agents. A diverse array of compounds is produced by cyanobacteria, a heterogenous group of aerobic photoautotrophs. A variety of bioactive metabolites with potential anti-cancer, anti-microbial and anti-HIV activities have been isolated. Most of the compounds are peptides or possess peptidic structures and are usually made by large nonribosomal assembly lines. However, a ribosomal origin has recently been demonstrated for the biosynthesis of patellamides, cytotoxic cyclic peptides produced by cyanobacterial symbionts of ascidians. Microcystis aeruginosa NIES298 produces various peptides including microcystin, aeruginosin, microviridin and microcyclamide. For the latter two classes of peptides ribosomal biosynthesis pathways could be identified in the course of this study. The cytotoxic hexapeptide microcyclamide is formed through the activity of a set of enzymes closely related to those involved in patellamide biosynthesis. The multicyclic microviridin family of protease inhibitors are synthesised from a precursor peptide by a unique pathway involving uncharted ATP-grasp type ligases as well as an N-acetyltransferase and a specialised transporter peptidase. The successful expression of microviridin B in E. coli provides a promising base for engineering novel variants. Screening of Microcystis laboratory strains and field samples revealed a wide-spread occurrence and a great natural variety for both peptide classes, raising the question of the ecological role of such small cyclic peptides. Attempting to obtain some first hints to answer that question, transcription and expression studies of biosynthetic genes were performed. Finally, this work showed that such scanning approaches could lead to the discovery of novel peptide variants and demonstrated new examples of succesful genome mining.
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Brill, Jeanette. "Biosynthese und Anhäufung der osmotischen Schutzsubstanz Prolin mittels De-novo-Synthese und Aufnahme prolinhaltiger Peptide in Bacillus subtilis." [S.l. : s.n.], 2001. http://archiv.ub.uni-marburg.de/diss/z2002/0080/.
Full text
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Hof, Carolin. "Molekularbiologische Untersuchungen zur nicht-ribosomalen Peptid-Synthese in Omphalotus olearius und zur Siderophor-Biosynthese in Magnaporthe grisea." Duisburg Köln WiKu, 2008. http://d-nb.info/991757580/04.
Full text
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Do, Rego Marie Jean Luc. "Contribution à l'étude des mécanismes de régulation de la biosynthèse des neurostéroïdes : effets des endozépines et du GABA." Rouen, 2000. http://www.theses.fr/2000ROUES047.
Full textAbstract:
Nous avons récemment démontré qu'une enzyme clé de la stéroïdogénèse, la 3-hydroxystéroïde deshydrogénase (3-HSD) est exprimée dans le diencéphale de la grenouille et nous avons montré que les explants hypothalamiques synthétisent plusieurs neurostéroïdes. Dans la présente étude, nous avons recherché les effets de deux endozépines, le TTN et l'ODN ainsi que les effets du GABA sur l'activité de la 3-HSD dans le cerveau. Des expériences de double marquage révèlent que les neurones hypothalamiques 3-HSD-positifs contiennent également les récepteurs des benzodiazépines de type périphérique (PBR) ainsi que les sous-unités α3, β2 et/ou β3 des récepteurs GABA A. Nous avons aussi observé que les cellules gliales ODN-immunoréactives jouxtent les neurones 3-HSD-positifs. L'incubation d'explants hypothalamique en présence du TTN induit une stimulation de la production de 17OH-delta5P, 17OH-P et d'un nouveau stéroïde. L'effet du TTN est mimé par le Ro5-4864, un agoniste des PBR, et réduit par le PK11195, un antagoniste des PBR. Nous avons ensuite observé que l'ODN, un ligand endogène des récepteurs des benzodiazépines de type central (CBR), stimule également la biosynthèse des neurostéroïdes. Les β-carbolines β-CCM et DMCM, deux agonistes inverses des CBR, miment l'effet de l'ODN, alors que le flumazénil, un antagoniste des CBR réduit significativement l'effet de l'ODN, du β-CCM et du DMCM. Enfin, le GABA induit une inhibition dose-dépendante de la formation des stéroïdes dans le cerveau. L'effet du GABA est mimé par le muscimol, un agoniste des récepteurs GABA A, et bloqué par la bicuculline et le SR95531, deux antagonistes des récepteurs GABA A. En revanche, le baclofène, un agoniste des récepteurs GABA B, n'a aucun effet sur la synthèse des neurostéroïdes. L'ensemble de ces données démontre pour la première fois que l'activité biologique de la 3β-HSD et du cytochrome P450 C17 dans le système nerveux central des vertébrés est régulée par les endozépines et le GABA via les PBR et les récepteurs GABA A.
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Thibaudeau-Mourer, Murielle. "Modifications de la biosynthèse des protéines lors du développement de l'ectomycorhize Eucalyptus globulus bicostata-Pisolithus tinctorius : Rôle potentiel de la protéolyse dépendante de l'ubiquitine et du protéasome." Nancy 1, 1998. http://www.theses.fr/1998NAN10214.
Full textAbstract:
La formation d'une ectomycorhize Eucalyptus globulus - Pisolithus tinctorius s'accompagne de modifications des profils polypeptidiques des partenaires et notamment de la disparition massive des protéines végétales. Le clonage, la caractérisation de gènes impliqués dans la protéolyse ont fait l'objet de cette thèse. Ainsi, la régulation de deux systèmes protéolytiques complémentaires a été étudiée lors de la formation de l'organe symbiotique. Le premier système correspond a l'ubiquitination des protéines et leur dégradation par le protéasome 26S (« the protein death machine ») tandis que le second fait intervenir des protéases. Lorsque le travail a été initié, aucun gène codant les composants de ces systèmes protéolytiques n'avait été identifié dans le cadre de l'ectomycorhization. Dans un premier temps, nous avons vérifié l'existence du système d'ubiquitination des protéines dans notre système. Les immuno-empreintes électrophorétiques indiquent que l'ubiquitine existe à l'état libre et conjugue à des protéines de différents poids moléculaires chez l'Eucalyptus, le Pisolithe et dans l'ectomycorhize. Cette vérification faite, le clonage des gènes impliqués dans la protéolyse a été initié. Le clonage aléatoire d'étiquettes de séquences exprimées (est) a permis l'identification de 9 gènes codant différents composants des voies protéolytiques. L'expression de 2 enzymes de conjugaison de l'ubiquitine (e2) et d'une sous-unité du protéasome 26S fongiques lors de l'ontogénie de l'ectomycorhize n'est pas modifiée par la symbiose. Par contre, l'expression de la sous-unité du protéasome 26S végétal est stimulée lors du stade de différenciation. La voie protéolytique végétale serait impliquée dans la dégradation massive des protéines d'Eucalyptus. Le travail réalisé sur la métalloprotéase fongique indique que son expression est réprimée au cours de la mycorhizogenèse et qu'elle serait impliquée dans la morphogenèse du champignon.
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Vo, Chau Duy Tam. "Etude biochimique de trois nouvelles protéines impliquées dans la biosynthèse de l’ubiquinone en anaérobie chez Escherichia coli : UbiT, UbiU et UbiV A Soluble Metabolon Synthesizes the Isoprenoid Lipid Ubiquinone Ubiquinone Biosynthesis over the Entire O 2 Range: Characterization of a Conserved O 2-Independent Pathway." Thesis, Sorbonne université, 2019. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=http://theses-intra.upmc.fr/modules/resources/download/theses/2019SORUS401.pdf.
Full textAbstract:
L’ubiquinone, ou coenzyme Q (CoQ ou UQ), est un lipide polyprénylé qui joue un rôle important dans le transport des électrons dans les chaînes respiratoires chez E. coli. La biosynthèse de l'UQ en aérobie chez E. coli nécessite huit réactions et implique au moins douze protéines (UbiA-UbiK et UbiX). Dans ce travail, nous démontrons que les protéines Ubi forment le complexe Ubi, un métabolon stable qui catalyse les six dernières réactions de la voie de biosynthèse. La structure tridimensionnelle du domaine SCP2 d’UbiJ forme une cavité hydrophobe étendue qui lie les intermédiaires de l’UQ à l'intérieur du complexe d’1-MDa. Le complexe Ubi est purifié à partir des extraits cytoplasmiques et la biosynthèse de l'UQ a lieu dans cette fraction, remettant en question l’hypothèse actuelle d'un processus de biosynthèse associé à la membrane. L’UQ est connue pour être synthétisée en aérobie et anaérobie. Nous caractérisons une nouvelle voie de biosynthèse de l’UQ indépendante de l'O2. Cette voie repose sur trois protéines, UbiT, UbiU et UbiV. UbiT possède un domaine de liaison aux lipides SCP2 et est probablement un facteur accessoire de la voie de biosynthèse, tandis qu’UbiU et UbiV (UbiU-UbiV) sont impliqués dans les réactions d'hydroxylation et représentent une nouvelle classe d'hydroxylases indépendantes de l’O2. Nous démontrons qu’UbiU-UbiV d’E.coli forme un hétérodimère, chaque protéine se lie à un centre [4Fe-4S] via des cystéines conservées essentielles à l'activité. De plus, nous montrons qu’UbiU purifié de P. aeruginosa est capable de lier de l’UQ, suggérant un rôle différent d’UbiU et d’UbiV. UbiU et UbiV appartiennent à la famille des peptidases U32, dont la fonction reste discutable. Nous démontrons, par des analyses bioinformatiques, que les protéines U32 sont caractérisées par quatre cystéines conservées très importantes pour leurs activités enzymatiques et par des outils biochimiques, nous confirmons que RlhA et TrhP, deux autres protéines de la famille U32, comme UbiU et UbiV, sont des protéines Fe-SUbiquinone (UQ) is a polyprenylated lipid that plays an important role in electron transport in the respiratory chains of E. coli. The aerobic biosynthesis of UQ in E. coli requires eight reactions and involves at least twelve proteins (UbiA-UbiK and UbiX). In this work, we demonstrate that seven Ubi proteins form the Ubi complex, a stable metabolon that catalyzes the last six reactions of the UQ biosynthetic pathway. The X-Ray structure of the SCP2 domain of UbiJ forms an extended hydrophobic cavity that could bind UQ intermediates inside the 1-MDa Ubi complex. The Ubi complex is purified from cytoplasmic extracts and UQ biosynthesis occurs in this fraction, challenging the current thinking of a membrane-associated biosynthetic process. UQ is reported to be biosynthesized under both anerobic and anaerobic conditions. We characterize a novel, O2-independent pathway for the biosynthesis of UQ. This pathway relies on three proteins, UbiT, UbiU, and UbiV. UbiT contains an SCP2 lipid-binding domain and is likely an accessory factor of the biosynthetic pathway, while UbiU and UbiV (UbiU-UbiV) are involved in hydroxylation reactions and represent a novel class of O2-independent hydroxylases. We demonstrate that UbiU-UbiV from E.coli form a heterodimer, wherein each protein binds a [4Fe-4S] cluster via conserved cysteines that are essential for activity. Moreover, we show that purified UbiU from P. aeruginosa is able to bind UQ, suggesting a different role of UbiU and UbiV. UbiU and UbiV belong to peptidase U32 family whose function remains questionable. By bioinformatic analyses, we demonstrated that U32 proteins were characterized by four conserved cysteines important for their enzymatic activities and by biochemical tools, we confirmed that RlhA and TrhP, two others U32 subfamilies, like UbiU and UbiV, are all Fe-S proteins
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Passaquin, Anne-Catherine. "Interferon et syntheses hormono-inductibles : etude de l'effet de l'interferon sur la synthese de la lactate deshydrogenase inductible par les catecholamines." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 1986. http://www.theses.fr/1986STR13109.
Full text
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Keppi, Elisabeth. "Purification et caracterisation d'une nouvelle famille de peptides antibacteriens induits lors de la reponse immunitaire chez un insecte, phormia terranovae (diptere)." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 1987. http://www.theses.fr/1987STR13099.
Full textAbstract:
Nous avons mis en evidence chez les larves du diptere phormia terranovae que l'injection de faibles doses de bacteries ou une simple piqure induisent l'apparition d'une protection contre l'injection subsequente de doses elevees de bacteries. Nous avons montre que l'apparition de cette protection, que nous qualifions de reponse immunitaire, s'accompagne de la synthese de peptides antibacteriens thermostables et de nature basique. Nous avons pu separer par echangeur cationique six groupes de peptides antibacteriens dans le sang de larves immunisees de phormia. La suite du travail a comporte la purification de trois molecules qui ont presente une activite particulierement elevee vis-a-vis de escherichia coli. Pour ces trois molecules, nous avons obtenu la sequence des 40 premiers acides amines du cote n-terminal. Ces sequences partielles montrent l'existence de tres fortes homologies et indiquent que les trois molecules font partie d'une meme famille: la comparaison avec les donnees de la litterature et des banques de donnees de sequence permet d'affirmer que nous sommes en presence d'une nouvelle famille de molecules que nous nous proposons d'appeler diptericines
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Hamdaoui, Bassou. "Inhibiteurs de la cathepsine D : synthèse et évaluation biochimique de phosphomannosyles associés à la pepstatine A." Montpellier 2, 1993. http://www.theses.fr/1993MON20003.
Full textAbstract:
La cathepsine d est une protease lysosomale dont la surproduction est liee a l'apparition de metastases dans le cancer du sein. Au cours de ce travail nous avons decrit la synthese et l'evaluation biologique de composes bifonctionnels susceptibles d'inhiber la cathepsine d. D'autre part nous avons prepare une neoglycoproteine utilisee comme ligand du recepteur mannose-6-phosphate. Ces composes comportent d'une part le groupement mannose-6-phosphate permettant leur penetration cellulaire par l'intermediaire des recepteurs membranaires et d'autre part la pepstatine puissant inhibiteur de la cathepsine d. Le couplage de la pepstatine a un mannose-6-phosphate a ete realise par amination de la position anomerique du sucre par la pepstatine preassociee au 1,3-diaminopropane utilise comme bras de jonction. La pepstatine couplee a deux entites mannose-6-phosphate a ete preparee reaction de thiocarbamoylation de la diamine peptide (derivee de la pepstatine) par l'isothiocyanate de phenyloxy-mannose-6-phosphate. Ce dernier a ete prepare a partir du p-nitrophenyl-d-mannopy rannose par phosphorylation selective en 6, suivie d'une reduction en amine et transformation de celle-ci en isothiocyanate. La serum albumine bovine (bsa) portant une trentaine de groupements mannose-6-phosphate a ete preparee par traitement de la bsa en milieu alcalin par l'isothiocyanate de phenyloxymannose-6-phosphate. Les produits synthetises ont presente des resultats biologiques significatifs. La pepstatine couplee a deux entites mannose-6-phosphate inhibe la proliferation et le pouvoir invasif des cellules cancereuses. La neoglycoproteine inhibe significativement la migration des cellules metastatiques a travers la membrane basale reconstituee.
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Héron, Antoine. "Préparation et développement de nouveaux antisérums pour l'étude de la synthèse et de la maturation de l'inter-alpha-trypsine inhibiteur humain." Rouen, 1995. http://www.theses.fr/1995ROUES034.
Full textAbstract:
Les protéines humaines de la famille de l'inter-alpha-trypsine inhibiteur (ITI) sont structurées à partir de trois chaînes lourdes H1, H2 et H3 et d'une chaîne légère, la bikunine. Ces chaînes maturent (H→HC) et s'associent par l'intermédiaire d'une chaîne de chondroïtine sulfate pour donner naissance aux formes protéiques pluricaténaires actuellement décrites: l'ITI (HC1+HC2+bikunine), le pré-alpha-trypsine inhibiteur (HC3+bikunine) et le complexe HC2/bikunine. Il apparaît désormais qu'en plus d'une activité antiprotéasique portée par la bikunine, les chaînes lourdes et l'inhabituelle structure protéoglycannique participent aux fonctions physiologiques des protéines de la famille de l'ITI, en particulier dans le cadre de la stabilité de la matrice extracellulaire. Afin d'apporter des résultats précis concernant la localisation de synthèse et les modalités de la maturation de ces protéines dans la cellule, nous avons développé de nouveaux antisérums spécifiques de chacune des chaînes lourdes H1, H2 et H3. Pour cela, nous avons eu recours au développement d'un système d'expression bactérien permettant à partir de l'ADN, l'obtention de peptides immunogènes sous la forme de protéines hybrides, une alternative de choix pour la production d'anticorps spécifiques évitant de recourir à la purification des protéines natives. L'emploi de ces antisérums dans le cadre d'une étude de la maturation de l'ITI dans des modèles cellulaires d'hépatomes humains a apporté des résultats nouveaux. En particulier, les cellules HepG2 synthétisent une protéine dont les caractéristiques électrophorétiques sont semblables à celles de l'ITI plasmatique humain, mais dont les propriétés antigéniques démontrent que cette molécule ne comprend qu'un seul type de chaîne lourde associée à la bikunine (HC2#2+bikunine#2). L'assemblage de cette glycoprotéine ITI est spécifiquement localisé dans le réseau trans de l'appareil de Golgi après l'élongation et la sulfatation des structures O-glycanniques. La N-glycosylation n'intervient pas dans l'assemblage, la maturation et la sécrétion de cette protéine. Par ailleurs, nos antisérums permettent d'analyser spécifiquement les membres de la famille de l'ITI dans un mélange aussi complexe que le sérum. Cette analyse permet de penser qu'existent à côté des formes classiques d'ITI et de HC/bikunine, des espèces homologues comportant les autres chaînes lourdes. Ainsi, chaque chaîne H1, H2 et H3 semble pouvoir participer à l'assemblage de l'ITI comme de HC/bikunine ; les différences observées quant aux taux sériques respectifs de ces formes pourraient résulter de variations de stabilité de chaque structure
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Charpentier, Bruno. "Synthese d'analogues de la cholecystokinine : etudes biochimiques, pharmacologiques et structurales." Paris 6, 1988. http://www.theses.fr/1988PA066136.
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Mouillon, Jean-Marie. "Étude du métabolisme du folate chez les plantes : caractérisation de la 6-hydroxyméthyl-7,8-dihydroptérine pyrophosphokinase /7,8-dihydroptéroate synthase." Grenoble 1, 2000. http://www.theses.fr/2000GRE10015.
Full textAbstract:
L'acide folique est un cofacteur indispensable au transport des groupements monocarbones. Il intervient dans la synthese des acides nucleiques et joue un role important dans le metabolisme de certains acides amines. Les plantes, contrairement aux animaux, sont capables de synthetiser de novo le folate. Toutes les etapes enzymatiques de cette voie de synthese sont localisees dans les mitochondries de feuilles de pois. Nous avons montre que les deux premieres etapes, la dihydropterine pyrophosphokinase (hppk) et la dihydropteroate synthase (dhps) sont portees par une seule enzyme bifonctionnelle. Cette proteine a ete purifiee a partir de mitochondries de feuilles de pois et elle apparait comme une proteine mineure de la matrice mitochondriale. Nous avons isole et analyse l'adnc codant pour la proteine hppk-dhps. La sequence primaire de la proteine revele la presence d'une sequence d'adressage de type mitochondriale. Nous avons ensuite choisi de produire la proteine hppk-dhps de plante dans un systeme procaryote. La proteine hppk-dhps recombinante obtenue presente des proprietes catalytiques comparables a celles observees pour la proteine native. L'etude des proprietes biochimiques de l'activite dhps a montre que cette reaction est regulee par le produit de la reaction, le dihydropteroate, et les autres intermediaries de la voie de synthese du folate comme le dihydrofolate et le tetrahydrofolate. L'etude des proprietes biochimiques de l'activite hppk a egalement permis de mettre en evidence un mecanisme enzymatique sequentiel ordonne de fixation des substrats. Parallelement, nous avons etudie par rmn quels sont les differents donneurs d'unites monocarbonees transportees par le folate. Le catabolisme de la serine initie par l'activite serine hydroxymethyl transferase constitue la principale source des unites monocarbonees au sein des cellules non-photosynthetiques. Ce catabolisme est lie a l'activite glycine decarboxylase presente dans les mitochondries de ces cellules.
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El, Badaoui Khalid. "Contribution à l'étude des protéases de quelques champignons ectomycorhiziens." Nancy 1, 1988. http://www.theses.fr/1988NAN10123.
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Radzom, Markus. "Beiträge zur Biosynthese der antiparasitären Naturstoffe Hormaomycin und Borrelidin sowie Strukturaufklärung von Sekundärmetaboliten aus Actinomyceten." Doctoral thesis, 2006. http://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-AC88-2.
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Helmetag, Verena [Verfasser]. "Biochemische und strukturelle Untersuchungen der Biosynthese unnatürlicher Aminosäuren als Bausteine nicht-ribosomaler Peptide / vorgelegt von Verena Helmetag geb. Pohlmann." 2009. http://d-nb.info/1003965016/34.
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Brill, Jeanette [Verfasser]. "Biosynthese und Anhäufung der osmotischen Schutzsubstanz Prolin mittels De-novo-Synthese und Aufnahme prolinhaltiger Peptide in Bacillus subtilis / vorgelegt von Jeanette Brill." 2001. http://d-nb.info/97279249X/34.
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