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Dissertations / Theses on the topic 'Petits ruminants'
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Tounkara, Kadidia. "Epidémiologie d'une maladie transfrontalière des petits ruminants (Pestes des Petites Ruminants) à fort impact au Mali." Thesis, Montpellier, 2018. http://www.theses.fr/2018MONTT068/document.
Full textAbstract:
La peste des petits ruminants (PPR) et la Pleuropneumonie Contagieuse Caprine (PPCC) causées respectivement par un Morbillivirus (Virus de la Peste des Petits Ruminants) et un mycoplasme (Mycoplasma capricolum subsp. Capripneumoniae) sont deux maladies respiratoires très contagieuses des petits ruminants. La PPR est présente en Afrique, en Asie, au Moyen Orient, et depuis peu en Europe. Sur le continent africain, notamment en Afrique de l’Ouest, elle est en expansion et représente un facteur majeur d’insécurité alimentaire pour la population agricole. La PPCC identifiée au Niger en 1995 n’est que suspectée au Mali sur la base de résultats sérologiques.La PPR est un modèle pour l’étude des maladies transfrontalières car sa diffusion est très étroitement liée aux mouvements régionaux d’animaux vivants. La compréhension de cette diffusion est une condition essentielle à la mise en place de mesures de contrôle efficaces (vaccination, contrôle aux frontières etc.).La thèse a pour ambition de clarifier la situation épidémiologique de la PPR et de la PPCC au Mali, notamment pour savoir si ces deux maladies coexistent, afin d’en évaluer le risque pour les filières de production de caprins et de proposer des stratégies de contrôle adaptées. Nous n’avons pas réussi à mettre en évidence la présence de la PPCC au Mali. Pour la PPR, l’objectif de la thèse est de caractériser la diversité génétique de souches collectées en Afrique de l’Ouest et plus particulièrement au Mali en utilisant en première instance le gène partiel de la nucléoprotéine du virus. Nous avons ensuite estimé la diversité et le taux d’évolution du PPRV dans la région à partir de séquences génomiques complètes. Notre étude a montré qu’au Mali ainsi que dans les autres pays de l’Afrique de l’Ouest, trois lignées génétiques du PPRV circulent dont l’une d’elles, la lignée II est dominante dans la région et est caractérisée par une grande diversité génétique transfrontalière. Cette étude démontre également une progression de la lignée IV dans l’Afrique de l’Ouest et la persistance au Mali et au Niger de la lignée I (au moins jusqu’en 2001). Ces résultats reflètent par rapport aux données précédentes connues de la répartition des lignées de PPRV, une intensification des mouvements du bétail dus à l’échange et au commerce de ces animaux, flux qui n’est pas contrôlé entre tous les pays de l’ouest africain. Au Mali, il n’existe aucun moyen de contrôle, de traçabilité et d’identification animale. L’utilisation de la diversité génétique comme marqueur épidémiologique serait un moyen d’améliorer notre connaissance de la diffusion de la PPR et de là son contrôle, plus particulièrement dans les pays d’Afrique de l’OuestPeste des petits ruminants (PPR) and Contagious caprine pleuropneumonia (CCPP) caused respectively by a Morbillivirus and a mycoplasma (Mycoplasma capricolum subsp. Capripneumoniae) are two highly contagious respiratory diseases of small ruminants. PPR is present in Africa, Asia, Middle East, and has just entered Europe. On the African continent, particularly in West Africa, it is emerging and is a major factor of food insecurity for low-income farmers. CCPP, identified in Niger in 1995, is only suspected in Mali on the basis of serological results.PPR is a model for the study of transboundary diseases because its diffusion is closely linked to regional movements of livestock. Understanding this diffusion is an essential condition for the implementation of effective control measures (vaccination, border control, etc.).The aims of our study is to clarify the epidemiological situation of PPR and the CCPP in Mali, including whether these two diseases coexist in order to assess the risk for goat production chains and propose appropriate control strategies.We did not succeed in confirming the presence of the CCPP in Mali. PPR has already been identified in Mali. The aim of our study for PPR is to characterize the genetic diversity and therefore the different lineages that circulate in Mali and, more generally, in the West African sub region by using at first the partial gene of Nucleoprotein of PPRV. We then estimated more accurately the diversity and rate of evolution of the virus in the region from PPRV genomic sequences. Our studies showed that three lineages of PPRV are circulating in Mali and West Africa. The lineage II is dominating and is characterized with a wide genetic diversity and extensive transboundary circulation. We also demonstrate the progression of lineage IV in West Africa and the persistence of lineage I in Mali and Niger (at least until 2001). These results reflect the large flow of uncontrolled livestock trade between all West African countries. In Mali, there is no means of control, traceability and animal identification. The use of genetic diversity as an epidemiological marker is an effective means of controlling the spread of PPR in these West African countries
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Nikmal, Azizi Ahmad Farid. "Peste des petits ruminants in Afghanistan." Kansas State University, 2010. http://hdl.handle.net/2097/6823.
Full textAbstract:
Master of ScienceDepartment of Clinical Sciences
David S. Hodgson
Peste des petits ruminants (PPR) is an economically important and highly contagious disease of sheep and goats. It is characterized by enteritis, stomatitis, pneumonia, and discharge from the nose and eyes. This report contains a review of PPR and its epidemiology in Afghanistan and other PPR- endemic countries followed by recommendations for dealing disease in Afghanistan. Studies showed that PPR is still endemic in Afghanistan’s neighboring countries including Pakistan, Iran, Tajikistan, and China. From January of 2009 to January of 2010, 852 outbreaks of PPR were reported to the OIE from 24 different countries. However, this study focuses on Afghanistan and some neighboring countries (Iran, Tajikistan). Animal clinics and Veterinary Field Units (VFUs) reported 7,741 cases of PPR from 2008 to 2009 in different parts of Afghanistan. A study by the Food and Agriculture Organization (FAO) in 2009 showed that PPR is endemic in various parts of Afghanistan. Seroprevalence of PPR varied from 0% in Kapisa to 48% in Herat province of Afghanistan. The last chapter of this report includes recommendations and guidelines regarding prevention and eradication of PPR from Afghanistan. These recommendations could help improve animal health and the economy of Afghanistan in the future.
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Zemirline, Ridha. "Occlusion duodenale experimentale chez les petits ruminants." Paris 6, 1987. http://www.theses.fr/1987PA066671.
Full text
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Zemirline, Ridha. "Occlusion duodénale expérimentale chez les petits ruminants." Grenoble 2 : ANRT, 1987. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37610868d.
Full text
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Srour, Ghassan Marie Michel. "Amélioration durable de l'élevage des petits ruminants au Liban." Vandoeuvre-les-Nancy : INPL, 2006. http://www.scd.inpl-nancy.fr/theses/2006_SROUR_G.pdf.
Full text
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Lancelot, Renaud. "Croissance pondérale et mortalité des petits ruminants domestiques en Afrique subsaharienne : modélisation statistique." Montpellier 2, 2002. http://www.theses.fr/2002MON20194.
Full text
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Srour, Ghassan. "Amélioration durable de l'élevage des petits ruminants au Liban." Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 2006. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/INPL/2006_SROUR_G.pdf.
Full textAbstract:
Une enquête menée auprès de 129 éleveurs de petits ruminants (représentant 5% du cheptel national) répartis sur tout le territoire libanais a permis, à l'aide d'une classification hiérarchique, d'identifier cinq systèmes d'élevage: i)- Zéro-pâturage (troupeaux de 15 à 95 têtes de caprins de race étrangère) très gourmand en intrants; ii)- Sédentaire (100 à 400 têtes) pâturant sur des parcours communaux ou privés aux alentours des villages; iii)- Transhumance Verticale (majoritairement caprins de race locale " Baladi ") se déplaçant en montagne de faible à haute altitude selon la saison; iv)- Transhumance Horizontale (troupeaux mixtes ovins et caprins) se déplaçant en région de plaine (de 100 à 150 Km); et v)- Semi-Nomade (troupeaux > 400 têtes) se déplaçant avec leur famille sur 200 à 300 Km. L'évaluation de la durabilité a été exécutée à l'aide d'un outil dérivé de la méthode IDEA qui évalue les trois composantes agro-écologique, socio-territoriale et économique de la durabilité. L'analyse multivariée des 39 indicateurs a permis de montrer que les systèmes ayant un potentiel diversifié (présence d'animaux et de végétaux), notamment sédentaire et transhumance horizontale, ont un score élevé de durabilité et que la vente directe des produits au consommateur permet d'améliorer la durabilité économique des systèmes transhumance verticale et zéro-pâturage. Les voies d'amélioration de cet élevage passent par la réhabilitation des parcours, l'amélioration de la productivité des races locales, et la mise en place d'une AOC ou d'un label permettant la protection des produits typiques sur le marché. L'historique sur dix années et la trajectoire de la durabilité des systèmes ont été analysés sur 60 de ces exploitations. Ce travail a permis d'hiérarchiser les exploitations selon leur degré de durabilité et de proposer des pistes de progrèsA survey carried out on 129 small ruminant farming systems (accounting for 5% of the national livestock) all over the Lebanese territory identified through a cluster analysis five different systems: (i) Zero-Grazing (15 to 95 head flocks of foreign goat breeds), with high inputs; (ii) Sedentary (100-400 head), grazing on communal or private rangelands around the village; (iii) Vertical Transhumance (mainly Baladi goat flocks), moving from low to high altitude depending on season; (iv) Horizontal Transhumance (mixed goat and sheep flocks), moving from 100 to 150 km in the plain; (v) Semi-Nomadic (flocks > 400 head), moving with all their family over 200 to 300 km. Farms sustainability assessment was carried out using a tool built on the IDEA method, which covers agro-ecological, socio-territorial and economical dimensions of sustainability. The multivariate statistical analysis of the 39 indicators showed that systems with diversified potential (presence of animals and plants), specially sedentary and horizontal transhumance, have high scores of sustainability and that economical return was higher in the vertical transhumance and zero-grazing systems in which dairy products are sold directly to the consumers. Improvement of these systems in Lebanon depends on the rehabilitation of rangelands, the improvement of the productivity of the local breeds, and the protection of the typical products on the market through labelling schemes. The history over ten years and the sustainability's trajectory was carried using 60 of these farms. This work typifies farms according to their sustainability and proposes tracks for progress
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Lerondelle, Catherine. "Les infections mammaires à lentivirus chez les petits ruminants." Lyon 1, 1992. http://www.theses.fr/1992LYO10210.
Full textAbstract:
La mammite a lentivirus se manifeste sous deux formes: une forme clinique aigue lors de la mise-bas puis une forme subclinique chronique, la plus frequente. Dans les deux cas, la production est diminuee, voire annulee et le lait reste d'aspect normal. La numeration cellulaire, un mois apres la mise-bas, est peu modifiee. Le virus est mis en evidence a partir des cellules du lait. Les lesions de mammite interstitielle sont observees meme chez les chevrettes de trois mois et les agnelles de 100 jours. Dans les explants de tissu mammaire, la presence du virus est suspectee dans les cellules epitheliales mammaires par apparition de formations syncitiales. Le virus s'exprime dans les macrophages du lait au moment de la mise-bas. L'induction de lactation par injections d'hormones steroides permet de reproduire cette excretion virale dans les cellules du lait. Chez une brebis seropositive, le virus peut etre excrete dans les macrophages du lait d'une demi-mamelle et pas de la seconde. Lors de l'expression du virus, a la mise-bas, le lait contient plus de leucocytes, plus de lymphocytes et en particulier plus de lymphocytes cd8. L'augmentation du nombre de lymphocytes est plus precoce chez les brebis multipares que chez les primipares
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Hammami, Pachka. "Peste des petits ruminant en Afrique subsaharienne : modélisation et analyse des stratégies de vaccination dans un contexte de bien public mondial." Thesis, Montpellier, 2016. http://www.theses.fr/2016MONTT136/document.
Full textAbstract:
La peste des petits ruminants est une maladie infectieuse animale très contagieuse. Largement répandue en Afrique, au Moyen Orient, et en Asie, elle fait des ravages dans les élevages ovins et caprins. Les petits ruminants représentent une ressource nutritionnelle et économique essentielle dans les pays en développement, notamment pour les communautés rurales les plus pauvres. En Afrique sub-saharienne, l'impact de la maladie est d'autant plus élevé que les mouvements des animaux sont compliqués à contrôler (transhumance, commerce illégal, zones de conflits, etc.) et les contrôles sanitaires difficiles à organiser. Une coalition internationale a décidé de prendre en main le contrôle de cette maladie ravageuse en élaborant avec l'OIE et la FAO une stratégie mondiale de contrôle progressif et d'éradication de la maladie.La stratégie est basée sur la vaccination de masse mais les protocoles de vaccination ont principalement été élaborés sur des bases empiriques. Après une campagne de vaccination, la dynamique démographique entraînant le renouvellement du cheptel, la proportion d'individus immunisés au sein de la population (taux d'immunité) est amenée à diminuer au cours du temps (entrées d'animaux non vaccinés, e.g. les naissances, et sorties d'animaux vaccinés, e.g. les ventes). La décroissance du taux d'immunité permet d'évaluer l'efficacité de la vaccination à moyen terme. Si le taux d'immunité est assez élevé, le virus n'a plus d'hôte pour se propager. Le renouvellement du cheptel est délicat à estimer et varie d'un système d'élevage à l'autre. Ce manuscrit présente une méthode d'optimisation des protocoles de vaccination pour obtenir la meilleure couverture immunitaire possible.Un modèle dynamique de prédiction du taux d'immunité dans des élevages de petits ruminants d'Afrique sub-saharienne au cours d'un programme de vaccination pluri-annuel a été développé en utilisant la théorie des modèles démographiques matriciels. Cet outil a été utilisé pour évaluer différents protocoles proposés pour les zones sahéliennes arides / semi-arides et les zones sub-humides / humides. Les paramètres des modèles ont été estimés à partir des données disponibles et d'une revue exhaustive de la littérature.Des indicateurs synthétiques de l'efficacité des protocoles ont été calculés (persistance du niveau protecteur, taux d'immunité moyen, etc.), puis comparés.L'étude a confirmé la pertinence des protocoles proposés par l'OIE et la FAO, apportant des précisions pour les divers scénarios. Les couvertures vaccinales atteintes doivent être très élevées (>80%) pour permettre la protection d'un troupeau pendant toute la durée du programme. En zone sahélienne, les troupeaux doivent être vaccinés au plus tôt après la saison des pluies pour optimiser la portée de la vaccination. L'étude révèle aussi que le pic d'exploitation des mâles, dû à la Tabaski, et la situation épidémiologique initiale du troupeau influent peu sur la dynamique du taux d'immunité.L'outil développé au cours de cette thèse peut être utilisé pour toute maladie infectieuse pour laquelle on dispose d'un vaccin efficace à long terme et toute population domestique dont on connaît la dynamique. Il pourrait cependant être amélioré par l'intégration de la dynamique de la maladie et de la répartition spatiale des élevages sous forme de méta-communautéPeste des petits ruminants is a highly contagious animal disease. Widespread in Africa, the Middle East and Asia, it has a devastating effect on small ruminants. Small ruminants are essential to sustainable livelihood in developping countries, especially in rural communities. In western Africa, the disease incidence is higher because of the difficulty to control animals movements (transhumance, illegal trade, conflicted areas, etc.) and to settle adapted sanitary actions.A global strategy for the progressive control and the eradication of the disease has been developed by the OIE and FAO. It is based on mass vaccination, with vaccination protocols defined on empirical basis.After a vaccination campaign, the population dynamics is responsible for herd renewal, the proportion of protected individuals (post-vaccinal immunity rate) in the population is decreasing over time (entries of non-vaccinated animals and exits of vaccinated ones). The immunity rate decrease allows to assess to the efficiency of employed vaccination strategies in term of immunity coverage. From a given threshold, the immunity rate can stop the viral transmission. The population renewal has to be estimated carrefully because it varies from one farming system to another. The work described in this manuscript provides an optimization tool of vaccination strategy, supporting decision markers in the formulation of vaccination protocole achiving the best possible immunization coverage in a given socio-economical context.Using the demographic matrix model theory, we developed a seasonal model predicting the immunity rate dynamics in traditional small ruminants livestock of Western African during a vaccination program. We used this model to evaluate different vaccination protocols proposed for Sahelian arid and semi-arid areas, and Soudano-guinean sub-humid and humid areas. Model parameters were estimated from the available data and an exhaustive review of literature.Synthesising indicators of the protocoles efficiency were computed (length of protective immunity, average immunity rate, etc.) and compared.The work described in the manuscript broadly confirmed the protocols proposed by the OIE and FAO. Additionally, this work provides details for the various scenarios. Very high vaccination coverage (>80%) should be reached to protect the population during the whole program. In the Sahelian zone, herds should be vaccinated at the earliest possible from September to optimize the scope of vaccination. We also show that the males offtake increase due to Tabaski and the initial epidemiological situation poorly influences the immunity rate dynamics.Our tool is generic. I can be applied to any infectious disease which has a vaccine providing a lifelong immunity and for which the population dynamics is known. Nevertheless, it could be improved by implementing spatial analysis and disease dynamics
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Dash, Pradyot. "Development of reverse genetics for Peste des Petits Ruminants Virus." Thesis, Royal Veterinary College (University of London), 2003. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.522189.
Full text
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Rolland, Morgane. "Etude des relations phylogénétiques entre les lentivirus des petits ruminants." Bordeaux 2, 2003. http://www.theses.fr/2003BOR21029.
Full textAbstract:
Les lentivirus des petits ruminants ou SRLV ("small ruminant lentivirus") correspondent au virus mae͏̈di visna ou MVV, qui infecte les moutons, et au virus de l'arthrite-encéphalite caprine ou CAEV ("caprine arthritis-encephalitis Virus"), qui infecte les chèvres. Pour faciliter l'étude des SRLV, nous avons immortalisé des cellules GSM ("goat synovial membrane") par l'expression ectopique de la télomérase. La lignée cellulaire GSM T a proliféré à un rythme constant avec plus de 160 passages en culture, tout en conservaNt la morphologie des cellules GSM primaires. De plus, les cellules GSM T peuvent être infectées soit par le CAEV soit par le MVV et elles reproduisent des phénotypes cytopathiques différents de la souche virale infectante. En parallèle, nous avons optimisé des protocoles de PCR qui permettent d'amplifier l'intégralité de génomes SRLV d'origines caprine et ovine. Pour étudier les relations entre les SRLV à l'échelle mondiale, nous avons effectué des analyses phylogénétiques extensives en ajoutant aux séquences disponibles celles que nous avons caractérisées en Irlande et en Espagne. Le lentivirus irlandais, bien qu'isolé chez une chèvre, est plus proche des souches ovines MVV prototypes. Les séquences des quare lentivirus ovins espagnols se répartissent en trois clades, ce qui reflète la diversité génétique majeure des SRLV observées en Espagne. Les analyses phylogénétiques dans les régions gag, pol et env ont permis de reconsidérer la classification des SRLV, qui se répartissent en cinq clades au lieu des six précédemment décrites. Comme les SRLV ne peuvent pas être distingués phylogénétiquement en fonction de leur hôte, nous proposons d'abandonner la classification MVV/CAEV et de regrouper les lentivirus d'origines caprine et ovine sous le seul terme de SRLVTo facilitate the study of SRLV, we established a GSM T ("goat synovial membrane") cell line by the ectopic expression of telomerase. Cultures of GSM T cells have been passaged over 160 times without showing any phenotypic difference from the original primary GSM cells. Moreover, the immortalized GSM T cells were susceptible to infection by both CAEV and MVV and were able to propagate these viruses. We also optimized a PCR protocol to amplify the SRLV genome as a whole or with two overlapping fragments. To address the genetic diversity and relatedness among SRLV strains worldwide, we applied extensive phylogenetic methods to the sequences available together with our newly characterized sequences from Ireland and Spain. The Irish lentivirus strain, which was isolated from a goat, was more closely related to the lentivirus that infects sheep : MVV. The four Spanish ovine isolates fell in three distinct clusters, which clearly depicted the major genetic variability seen in Spain. Based on the phylogenetic analyses in the gag, pol and env regions, we revise the classification of the SRLV, which could be confidently classified into five clades rather than six as it was previously suggested. Furthermore, we observed that MVV and CAEV sequences could not be phylogenetically distinguished according to their host. Therefore, we propose to group the two viruses more appropriately as SRLV
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Mahieu, Maurice. "Gestion du parasitisme gastro-intestinal des petits ruminants en zone tropicale humide." Thesis, Université de Lorraine, 2014. http://www.theses.fr/2014LORR0230/document.
Full textAbstract:
L'élevage de petits ruminants est majoritairement représenté dans les pays tropicaux et subtropicaux. Le parasitisme par des nématodes gastro-intestinaux (NGI), transmis via le pâturage, est une des principales causes de pertes de production en ovins comme en caprins. Depuis le milieu du XXème siècle, la généralisation de l'emploi des anthelminthiques s'est accompagnée d'une augmentation marquée de la productivité. Cependant, la sélection et la diffusion progressive de souches parasitaires résistant aux anthelminthiques rendent cette méthode de contrôle de moins en moins efficace. Ainsi, une enquête récente en Guadeloupe montre que 100% des populations de NGI sont résistantes aux benzimidazoles et que la majorité l'est à plusieurs familles d'anthelminthiques. Nous développons, à partir des connaissances acquises sur l'épidémiologie des NGI et sur les relations entre hôtes et parasites, des systèmes de contrôle intégré des parasites. Le premier élément en est l'utilisation de méthodes de traitement ciblé, à l'échelle de l'élevage entier. Ainsi, la méthode Famacha nous a permis, en constituant un refuge estimé à 50 à 80% des NGI, de réduire le risque de sélection de NGI résistants sans pénaliser la production. Les autres éléments ont pour objectif de diminuer le niveau global d'infestation du troupeau, en combinant des méthodes visant à renforcer les capacités de défense des animaux (alimentation adaptée, amélioration génétique…) et à diminuer le risque de rencontre hôte – parasite (gestion du pâturage, association d'espèces d'herbivores, utilisation des métabolites secondaires des plantes…). Le choix des différents éléments de contrôle intégré des NGI devra se baser sur leur faisabilité, en termes d'investissements matériels et humains, sur leur compatibilité avec le système d'élevage, et sur leur efficacité. Les développements futurs devront permettre d'évaluer les interactions entre ces éléments afin de pouvoir optimiser les choix des éleveursMost of the sheep and goats are reared in tropical and subtropical countries. Gastrointestinal nematode parasites (GIN), which are transmitted through the pastures, are among the main causes of production losses for small ruminant farmers. Since the 1940's the pharmaceutical industry has provided very efficient anthelmintics which allowed easy to run and profitable worm control. Unfortunately the systematic use of anthelmintics has resulted, within few years, in an increasing number of anthelmintic resistant (AR) nematode strains. As example, a survey in Guadeloupe (F. W. I.) revealed that all goat farms have to face at least resistances to benzimidazoles, and most of them must deal with resistances to 2 or 3 drug families. We are building up integrated systems to manage GIN infection, by seeking to slow down the spreading of AR strains of GIN and to reduce anthelmintic dependency. Firstly we propose targeted selective treatment methods (or any method allowing the survival of untreated GIN in refugia) and secondly a panel of methods to reinforce host defences (mainly through nutrition and genetic improvement) and to decrease the probability of host-parasite encounter through grazing man-agement, association of herbivore species with different specific parasites, use of plant secondary metabolites with anthelmintic properties... The choice of methods to be combined must be based on their feasibility in terms of human and material resources, compatibility with the farming system and effi-ciency. Future developments would address the evaluation of interactions between components of GIN integrated systems of management, in order to optimize the farmer choices
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Gebreegziabher, Berhe. "Development of dual vaccines for the control of peste des petits ruminants and capripox infections of small ruminants." Toulouse, INPT, 2006. http://ethesis.inp-toulouse.fr/archive/00000442/.
Full textAbstract:
L'objectif de cette thèse était de développer des vaccins bivalents qui pourraient contribuer à une baisse du coût des campagnes de vaccination contre la PPR et la variole des petits ruminants et thermotolérants, caractéristique liée au virus capripox. Nous avons inséré dans le génome d'une souche vaccinale de virus capripox, la souche KS1, l'ADN complémentaire (ADNc) des gènes des protéines vaccinantes du virus de la PPR, la protéine de fusion (F) et l'hémagglutinine. Les virus capripoxvirus sont très spécifiques de leurs hôtes, les bovins, les chêvres et les moutons. Ils ne sont pas pathogènes pour l'homme et constituent ainsi un vecteur idéal pour le développement de vaccins recombinants destinés à lutter contre les maladies de ruminants.
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Gebreegziabher, Berhe Picavet Dominique-Pierre. "Development of dual vaccines for the control of peste des petits ruminants and capripox infections of small ruminants." Toulouse : INP Toulouse, 2007. http://ethesis.inp-toulouse.fr/archive/00000442.
Full text
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Cann, Paul. "Étude des mécanismes de réception des phéromones mâles chez les petits ruminants." Thesis, Lille, 2020. http://www.theses.fr/2020LILUS115.
Full textAbstract:
Chez les petits ruminants (mouton et chèvre) la reproduction est saisonnée, c’est-à-dire qu’il y a alternance de période de repos et d’activité sexuelle. Ces deux périodes se caractérises chez les femelles par deux états physiologiques différents : en période d’activité sexuelle, le cycle ovarien des femelles est actif (oestrus) et la reproduction est possible, alors qu’en période de repos sexuel elles sont en anoestrus profond. Dans le but d’induire l’oestrus chez des femelles en repos sexuelle, les éleveurs ont le plus souvent recours à des hormones exogènes. Ces hormones sont de moins en moins acceptable pour le bien-être de l’animal et du consommateur. Cependant la réception d’odeurs émises par un mâle sexuellement actif peut réactiver l’axe gonadotrope des femelles en anoestrus en fin de période de repos sexuel, aboutissant dans la majorité des cas à l’ovulation. Ce phénomène naturel est appelé effet mâle. Les odeurs des béliers et des boucs agissent alors comme des phéromones modificatrices. La plupart des études menée sur l’effet mâle se sont concentrées sur les modifications neuroendocrines induites par la réception des phéromones du mâle, mais l’importance de la plasticité du sécrétome olfactif a longtemps été sous-estimée. De précédentes recherche menée par notre équipe ont montré que chez le porc, le sécrétome olfactif (ensemble des protéines sécrétées dans le mucus nasal) est principalement composé d’isoformes d’OBP (Odorant-Binding Proteins) générées par des modifications post-traductionnelles de type phosphorylations et glycosylations. La composition du sécrétome olfactif est sous contrôle hormonal et dépend du stade physiologique des animaux. Le but de cette thèse est de déterminer sur le sécrétome olfactif de brebis et de chèvre est lui aussi modifié par des facteurs endogènes (hormones) et exogènes (odeurs du mâle), montrant ainsi une adaptation des outils sensoriel des femelles. Nous avons collecté de manière non invasive le mucus nasal des mêmes brebis et de chèvre en période de repos et d’activité sexuelle. Le sécrétome olfactif de 3 femelles de chaque espèce a été analysé par électrophorèses 2D puis par spectrométrie de masse haute résolution. Nos résultats suggèrent que le profil et la composition du sécrétome olfactifs est un marqueur du stade physiologique des femelles, et constitue un phénotype des capacités olfactives. De plus, la réception d’odeurs émise par un mâle induit des changements dans le sécrétome olfactif, démontrant l’effet de facteurs exogène sur celui-ciSmall ungulates (sheep and goat) display a seasonal breeding characterised by successive periods of sexual activity and sexual rest. During these two periods females are in two different physiological status: in sexual activity, the female ovarian cycle is active (oestrus) and ready for reproduction, whereas females are in deep anoestrus during the sexual rest period. In order to induce oestrus in female during the sexual rest periods, breeders are mostly using exogenous hormones. These hormones are less and less acceptable regardless to animal and consumer’s welfare. However, the perception of odours emitted by a sexually active male can reactivate the gonadotropic axis of anoestrus female in the late sexual rest period, leading in most cases to ovulation. This natural process is called “the male effect”. Ram and goat odours act as primer pheromones.Most of studies on male effect focused on the neuroendocrine modifications induced by the reception of male pheromones, but the plasticity of the olfactory system at the peripherical level was underestimated. Previous work of my research team has shown that in pig, the olfactory secretome (secreted proteome) is mainly composed of Odorant-Binding Proteins (OBP) isoforms generated by post-translational modifications, phosphorylation and glycosylation. The composition of this secretome is under hormonal control and depends on the physiological status of animals. The aim of my work is to determine whether the olfactory secretome of ewe and goat is also modified by endogenous factors (hormones) and exogenous factors (male odours), showing an adaptation of the sensory equipment of female. In a first step, we followed the same flocks of ewe and goat during several sexual cycles, and collected their nasal mucus by a non-invasive sampling method. The olfactory secretome of 3 females of each species was analysed by 2D-electrophoresis followed by high-resolution mass spectrometry. Our results suggest that the olfactory secretome profile and its composition is a marker of the physiological status, and constitutes a phenotype of the female receptivity. Furthermore, the males’ odours reception induces changes in the olfactory secretome, demonstrating that exogenous factors can modifies the olfactory equipment of females
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Martrenchar, Arnaud. "Les pneumopathies des petits ruminants au Nord Cameroun : Investigations étiologiques et prophylactiques." Toulouse, INPT, 2001. http://www.theses.fr/2001INPT006A.
Full textAbstract:
L'objectif de l'étude était de préciser l'étiologie des pneumopathies des petits ruminants au Nord Cameroun et de proposer des méthodes de lutte. Les analyses effectuées sur de nombreux échantillons pulmonaires ont permis l'isolement des germes suivants : Mycoplasma (M. ) mycoides subsp. Mycoides LC (MmmLC), M. Ovipneumoniae (Mo), M. Agalactiae, M. Sp. Type 2D et M. Arginini. L'infection experimentale de caprins par MmmmLC a entrainé la mort des animaux inoculés avec des symptômes de pneumonie, d'arthrite et de mammite. En revanche, Mo s'est révélé être non pathogène malgré sa mult^plication dans les sinus. Une enquête sérologique effectuée sur 900 animaux a montré que la prévalence de la peste des petits ruminants (PRV) était de 64 p. Cent dans la province de l'Extrème-Nord et de 14 p. Cent dans la province du Nord. Par contre, le suivi n'a pas permis de mettre en évidence l'existence de la pleuro-pneumonie contagieuse caprine. Afin de mesurer l'impact de la première séroconversion vis-à-vis de la PPR et des capripoxvirus chez les jeunes animaux en milieu traditionnel, un suivi sérologique couplé a un suivi clinique a été mis en place. Les retards de croissance ont été significativement liés à la séroconversion vis-à-vis des capripoxvirus et du virus de la peste des petits ruminants. L'efficacité d'un vaccin mixte contre la peste des petits ruminants (souche homologue) et les capripoxvirus (souche de clavelée RM 65) a été étudiée expérimentalement sur des caprins. Les animaux vaccinés ont été protégés cliniquement contre une épreuve virulente à l'aide d'une souche de PPR. La dose minimale protectrice était d'au moins 10 0. 8 Dose Infectieuse Cytotoxique 50. En revanche, la valence RM 65 n'a pas protégé les animaux vis-à-vis d'une souche virulente de la variole caprine. L'intérêt de l'utilisation du vaccin homologue PPR sur le terrain a été démontré en comparant les taux de mortalité sur un an entre des troupeaux vaccinés et des troupeaux témoins.
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Desoutter, Denise. "Les pneumopathies des petits ruminants au Sénégal : étude séro-épidémiologique et biogéographique." Paris 12, 1994. http://www.theses.fr/1994PA120059.
Full textAbstract:
Une enquete sero-epidemiologique longitudinale a ete mise en place pour etudier les pneumopathies des petits ruminants au senegal. Associant, pendant 2 annees, suivi serologique vis-a-vis des principaux agents microbiens pneumotropes et suivi clinique respiratoire, cette etude a montre, qu'a l'exception des mycoplasmes a pouvoir pathogene primaire, tous les autres agents sevissent avec des prevalences elevees et que leurs modes de circulation sont regis par la duree de l'immunite qu'ils induisent, par les conditions environnementales et par la pression en virus respiratoires. Malgre la frequence des infections sequentielles par les agents impliques dans la pneumonie enzootique, le suivi clinique revele que seule une faible proportion de ces infections initie effectivement des pneumonies enzootiques. Il montre, par contre, que les infections virales seules s'accompagnent regulierement de symptomes respiratoires benins mais bien reels dont le poids economique, du fait de leur extreme frequence, pourrait etre majeur et justifier une prophylaxie qui devrait prendre en compte le role essentiel des facteurs climatiques dans l'exteriorisation clinique de ces infections
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Salami, Habib. "Diffusion d'un virus et évolution de son génome dans les populations de ruminants domestiques : application à l'épidémiosurveillance de la "Peste des petits ruminants"." Thesis, Montpellier, 2015. http://www.theses.fr/2015MONTS155/document.
Full textAbstract:
La peste des petits ruminants (PPR), causée par un Morbillivirus, est l'infection virale la plus grave des caprins et ovins. Elle est largement répandue en Asie, au Moyen Orient et en Afrique. En Afrique elle est en émergence au nord et au sud du continent et représente un facteur majeur d'insécurité alimentaire pour la population agricole (70% des populations pauvres des régions considérées). La PPR est un modèle d'étude des maladies transfrontalières ; sa diffusion est très liée aux mouvements régionaux d'animaux vivants. La compréhension de cette diffusion est une condition essentielle à la mise en place de mesures de contrôle efficaces (vaccination, quarantaine, contrôle aux frontières,…). A notre connaissance aucune étude n'a été entreprise pour connaître l'ampleur de la diversité génétique du PPRv au cours d'infections naturelles de petits ruminants et l'accumulation des mutations virales dans un circuit de diffusion. Or dans les pays d'élevages extensifs tropicaux l'identification et la traçabilité animale sont inexistantes, ce qui rend difficile reconstruction des circuits de diffusion des animaux et du virus. Dans ces conditions, la diversité génétique du virus peut être utilisée comme marqueur de diffusion épidémiologique. L'objectif de cette thèse est d'utiliser la variabilité génétique du PPRV pour caractériser les lignées virales circulantes et retracer les processus de transmission du virus à travers un large territoire centré sur le Sénégal. En analysant 2 gènes de PPR nous avons estimé la vitesse d'évolution du virus sur une période de 4 années comprise en 2010 et 2014.Les résultats montrent que les premières souches de la lignée 2 de PPRv ont été introduites en 2005 au Sénégal et dans les pays voisins. L'horloge moléculaire et l'arbre phylogéographique rapportés ici indiquent clairement que la lignée II maintenant enzootique en Afrique de l'ouest prend son origine au Nigeria. Les mouvements trans-africains à l'origine du déplacement est-ouest de la lignée II trouvent leur origine dans le commerce de bétail à la croisée des frontières, une évidence économique et culturelle en Afrique de l'Ouest.Mots clés : peste des petits ruminants ; gène viral ; mutation virale ; circuit de transmission ; phylogénie ; phylogéographie ; surveillance épidémiologique, SénégalPeste des petits ruminants (PPR), caused by a Morbillivirus is one of the most important viral infections in sheep and goats. It is widely spread in Asia, Middle East and Africa. In Africa, it is an emerging disease in the north and the south of the continent. It is a major factor of food insecurity for the farming population (70% of the poor population in the tropical regions). PPR is a study model of transboundary diseases; its spread is highly related to regional movements of livestock. Understanding the spread of PPR is an essential condition for the implementation of efficient control measures (vaccination, quarantine, border controls etc.). Up to our knowledge, no studies have investigated the range of genetic diversity of PPR virus (PPRv) during natural infections in small ruminants and the accumulation of virus mutations during its spread. Further on, in tropical countries with extensive farming, animal identification and traceability are a current problem. In such conditions, the genetic diversity of the PPRv can be used as a marker of animal movement and spread of the virus. The objective of this study was to investigate the genetic diversity of the PPRv in order to characterise the actual viral lineages and to retrace the transmission of the virus in Senegal and its surrounding countries. Analyzing two complete viral genes of the PPR, we have estimated the rate of evolution of this virus, in a four year period, between 2010 and 2014. The results of the study show that the first strains of lineage II of PPRv have been introduced in 2005 in Senegal and its surrounding countries. Molecular clock analysis and phylogeographical reconstitution of the PPRv indicate that the lineage II, actually enzootique in western Africa, has its origins in Nigeria. This viral introduction from the direction east towards west, corresponds to the transboundary movement and commerce of livestock in the countries of western Africa, which represents the economic and cultural tradition of the people of this region.Key words: Peste des petits ruminants, viral gene, virus mutation, transmission, phylogeny, phylogéographie, epidemiosurveillance, Senegal, West Africa
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Assoumaya, Caroline. "Etude des facteurs limitant l'ingestibilité chez des petits ruminants valorisant des fourrages tropicaux." Phd thesis, AgroParisTech, 2007. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00003787.
Full textAbstract:
L'objectif de l'étude était d'analyser l'impact relatif des phénomènes physiques, biologiques et biochimiques sur le déterminisme de l'ingestibilité et la digestion des fourrages tropicaux. Les hypothèses de travail étaient que : 1) valorisés à des stades physiologiques assez précoces, l'ingestibilité et la digestion des fourrages tropicaux pouvaient être significativement améliorées, 2) la capacité cellulolytique du rumen ne serait pas le premier facteur limitant l'ingestibilité et la digestion des fourrages, 3) la résistance à la mastication et en conséquence la vitesse de réduction de taille des particules alimentaires (comminution) serait le premier facteur limitant l'ingestibilité. Dans un premier temps, une méta-analyse des données de la littérature a été réalisée. Dans un deuxième temps, 2 groupes d'expérimentations ont été menés afin: 1) de définir les conditions d'étude du deuxième groupe expérimental, 2) de valider nos hypothèses de travail. Les résultats de la synthèse bibliographique ont confirmé que les fourrages tempérés étaient significativement mieux ingérés que les fourrages tropicaux (68.70 vs 57.83 g/PM ; P<0.001). De plus, la méta-analyse a mis en évidence que le travail masticatoire fourni pour valoriser 1kg de MS de fourrage tropical était deux fois plus important qu'avec un fourrage tempéré. Les résultats des expérimentations à but « méthodologique » ont prouvé : 1) l'efficacité de l'apport d'une mixture d'enzyme fibrolytique exogène (dégradabilité 24h d'un fourrage haché de 56j : 32.14 vs 39.25% en absence ou en présence d'enzyme, respectivement; P<0.0001) ; 2) que certains paramètres digestifs et ingestifs étaient différents selon la fréquence des repas (contenu total ruminal avec un fourrage de 21j : 1.01 vs 0.77 g/g MSI avec 4 ou 2 repas / jour, respectivement; P<0.001) ; 3) que certains paramètres digestifs et ingestifs étaient différents selon la période du nycthémère (index de mastication avec un fourrage de 56 jours : 1.07 vs 1.52 durant la période diurne ou nocturne, respectivement; P<0.05). Ainsi au cours du deuxième groupe expérimental, l'étude des dynamiques digestives a été réalisée en distribuant 2 repas par jour, les mesures ont été effectuées sur le nycthémère et l'étude en condition enzymatique non limitante, a été effectuée en apportant de l'enzyme fibrolytique exogène. Les résultats du 2ème groupe expérimental ont montré que 1) l'ingestibilité et la digestibilité diminuaient significativement avec le vieillissement du fourrage (MSI était de 86.69, 83.10, 69.37, 59.29, 50.60 g/PM respectivement pour les fourrages âgés de 14, 21, 28, 42 et 56 jours ; P<0.02) ; 2) l'ingestibilité n'était pas fonction de l'activité cellulolytique (P>0.4) ; 3) l'ingestibilité était inversement proportionnelle à l'index de mastication (MSI (g/PM)= 125 - 65.3 IdMast ; P<0.03). En conclusion, il apparaît que les jeunes fourrages tropicaux (<28j) présentent de bonnes valeurs nutritives, que le potentiel cellulolytique ne serait pas le premier facteur limitant l'ingestibilité, et qu'il s'agirait plutôt de la vitesse de communition. L'impact important de la variabilité individuelle sur l'ingestibilité, observé au cours de nos expérimentations, reste à confirmer.
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Waret, Agnès. "Surveillance et contrôle de la Peste des Petits Ruminants : apports de la modélisation." Thesis, Montpellier 2, 2011. http://www.theses.fr/2011MON20207/document.
Full textAbstract:
La Peste des Petits Ruminants est une maladie contagieuse virale négligée affectant principalement les caprins et les ovins et qui continue son expansion malgré l'existence de moyens de diagnostic et de vaccins efficaces. Le développement d'approches épidémiologiques et économiques avec des outils d'aide à la décision tels que les modèles semble indispensable dans ce contexte si on vise à l'amélioration de sa surveillance et de son contrôle, ainsi qu'à la mobilisation des bailleurs. L'objectif de ce travail est d'y apporter une contribution originale dans un contexte africain où les données ne sont pas toujours disponibles ou faciles à collecter. Plusieurs approches de modélisation complémentaires sont abordées dont un modèle déterministe à compartiments (SEIR), un modèle de régression logistique et un modèle basé sur la théorie des réseaux sociaux. La pertinence de très hauts niveaux de vaccination et d'une surveillance active par sérologie telle qu'habituellement préconisée dans les pays du ‘Sud', dont les systèmes de production sont les seuls véritablement menacés, est discutée. Dans le cas de l'Ethiopie, un système de surveillance passif syndromique est envisagé avec une concentration possible des efforts de sensibilisation à la maladie au niveau des points de pâturages. Concernant la répartition temporelle et spatiale du niveau vaccinal à appliquer, la mise en place de ‘barrières' vaccinales en lien avec la géographie du pays est suggérée comme pouvant optimiser la pratique actuelle de vaccination en urgence autour des foyers déclarés lorsque les ressources sont disponibles. L'intégration de l'écologie de la maladie et l'utilisation complémentaire aux modèles mathématiques de l'analyse phylogéographique offrent des perspectives intéressantes mais restent encore un défi ; la prise en compte de critères socio-économiques est par contre une priorité pour parfaire notre approchePeste des Petits Ruminants (PPR) is a neglected viral contagious disease of sheep and goats. It has a widespread distribution that continues to expand despite good diagnostic tests and vaccines. Considering this and with the aim to improve surveillance and control of the disease and to attract funding for this, it would be necessary to develop epidemiological and economic approaches including decision tools such as models. The objective of this work is to contribute to such improvements in an African context where data are hardly available or collecting them is a challenge. Various complementary modeling approaches are reported among which a compartmental model (SEIR), a logistic model and a model based on social network theory. The relevance of very high vaccination levels and of active surveillance based on serology as usually recommended worldwide is discussed for developing countries which are the only ones truly threatened by PPR. In the case of Ethiopia, a passive syndromic surveillance system is being considered, enhancing disease awareness at grazing points. Regarding the spatial and temporal distribution of the vaccination level to be administered, ring vaccination making the best use of the country's topography is suggested to enhance effectiveness of the actual practice that consists of outbreak emergency vaccination when resources are available. Including the ecology of the disease and linking phylogeographical analysis to the existing mathematical models offers interesting perspectives but remains a challenge. However, taking into account socio-economic criteria should be a priority to fine-tune our approach
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Hasna, Jamal. "Estimation chez les petits ruminants de la valeur azotée des aliments traités chimiquement." Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 1990. http://www.theses.fr/1990INPL037N.
Full textAbstract:
Ce travail a été entrepris pour estimer la valeur azotée d'une paille de blé ou d'un ensilage de maïs ayant subi des traitements chimiques. Le traitement d'une paille de blé avec des solutions (4 p. 100 de ms) d'urée ou d'éthylènediamine a augmenté la teneur en matières azotées totales et la teneur en azote liée aux parois totales et à la lignocellulose. Les teneurs en parois totales (NDF) et en lignocellulose (ADF) ont été diminuées par rapport à la paille non traitée. La majeure partie de l'azote apporté par les traitements est sous forme soluble. Les mesures réalisées in vitro puis in vivo par la méthode des sachets dans le rumen et avec des sachets mobiles dans l'intestin a permis d'une part, d'étudier les effets des traitements sur la cinétique de disparition des pailles et du maïs traité dans le rumen et l'intestin, d'autre part d'évaluer leur valeur PDIA. Les mesures de flux réalisées sur chèvres au niveau du duodénum, de l'iléon et des fèces ont permis d'estimer la digestibilité globale des constituants de ces aliments et leur digestibilité dans les différents segments du tube digestif. Elles ont également conduit 0 l'estimation de la synthèse microbienne, la mesure de la digestion de l'azote alimentaire, l'estimation de la valeur Pdi
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Diaw, Alioune. "La filière des petits ruminants du Nord Sénégal : compétences et efficacité des acteurs." Dijon, 1999. http://www.theses.fr/1999DIJOE017.
Full textAbstract:
Ce travail effectué sur la filière des petits ruminants dans la moitié nord du Sénégal est une contribution aux divers travaux de recherche conduits en milieu producteur. Elle répond aux voeux; (a) de l'état sénégalais et des institutions de Bretton Woods d'améliorer les connaissances sur le cheptel local et d'atteindre l'autosuffisance en moutons de tabaski, (b) d'utiliser des modélisations économétriques dans l'approche opérationnelle de l'analyse filière. L'introduction des outils statistiques permettrait de récuser l'idée d'une approche filière non scientifique et (ou) trop intuitive. Pour catalyser l'intérêt, il était indispensable d'intégrer les compétences dans les processus d'arrangements (négociation commerciale) des participants aux objectifs et perceptions différents. L'analyse opérationnelle de la filière des petits ruminants au Sénégal sur l'axe nord vers Dakar a montré l'existence de deux types de circuits : les circuits réguliers ou permanents et les circuits "tabaski". Ces derniers se superposent aux précédents à l'occasion de la commémoration musulmane de l'Aid-El-Kebir. La filière des petits ruminants est hiérarchisée en niveaux, qui partent des marchés hebdomadaires ruraux vers les centres urbains. Elle enregistre un grand nombre de groupes de compétences (producteurs, dioula, tefanke, convoyeurs, dibitiers, consommateurs, etc. ). En conséquence, l'échange direct producteur - consommateur est peu développé. L'absence d'entreprises multifonctionnelles, intégrant les fonctions de production, de collecte et de redistribution aux consommateurs, explique le caractère encore traditionnel et non officiel de cette filière. Ce système est l'objet de critiques diverses qui ne résistent pas à l'observation objective et à l'usage rigoureux d'outils économiques contextualisés. Dans sa forme actuelle, la filière montre des signes d'une bonne adaptation aux conditions économiques sahéliennes et n'engendre presque pas de charges pour l'Etat.
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Guan, Guiquan. "Caractérisation biologique et moléculaire de Babesia spp. Infectant les petits ruminants en Chine." Rennes 1, 2009. http://www.theses.fr/2009REN1S130.
Full textAbstract:
La babésiose ovine est une maladie transmise par les tiques, due à un hémoprotozoaire du genre Babesia. Dans cett étude, les isolats chinois de babesia ovines, Babesia sp. BQ1 (Lintan) et Babesia sp. Xinjiang ont été caractérisés d'un point de vue biologique et moléculaire. Les séquences des gènes Hsp90 et les réactions croisées montrent que ces babésies peuvent être séparées en deux groupes : le groupe Babesia sp. Xinjiang et le groupe B. Motasi-like, celui-ci étant lui-même divisé en deux sous-groupes, le groupe « pathogène » et le groupe « non pathogène ». Les expériences de transmission ont montré que les tiques vectrices de Babesia sp. BQ1 (Lintan) sont haemaphysalis qinghaiensis et H. Longicornis et celle de Babesia sp. Xinjiang est Hyalomma anatolicum anatolicum. D'après les données biologiques et moléculaires, Babesia sp. Xinjiang peut être considéré comme une nouvelle espèce de babésie ovine. Les études de la sensibilité de deux races de moutons à babesia sp. BQ1 (Lintan) et à B. Divergens ont montré que la résistance génétique des hôtes et la sensibilité des individus sont liées à la capacité des éthrocytes à multiplier le parasite. L'étude de la réponse immunitaire révèle que l'IFNγ est associé à la faible invectivité de B. Divergens et l'IL10 à la capacité plus importante de Babesia sp. BQ1 (Lintan) à infecter les moutons. Trois méthodes de détection des infections à babesia sp. BQ1 (Lintan) ou à Babesia sp. Xinjiang ont été développées, chacune apportant des renseignements différents sur le stade de l'infection. Des anitgènes potentiels identifiés, comme BQHsp90, Bqp35, Hsp70, p200, sont prometteurs pour le développement de sero-diagnostic dans le futurOvine babesiosis caused by genus Babesia, is it a tick-born haemoprotozoan disease. In this study, Chinese ovine Babesia strains, especially Babesia sp. BQ1 (Lintan) and Babesia sp. Xinjiang have been characterized biologically and molecularly. Based on Hsp90 gene sequences and cross-reactions, these babesias could be separated into two groups, Babesia sp. Xinjiang group and B. Motasi-like group which could be further divided into two subgroups, pathogenic subgroup and non-pathogenic subgroup. Experimental transmissions verify that vector ticks of Babesia sp. BQ1 (Lintan) are Haemaphysalis qinghaiensis and H. Longicornis and that of Babesia sp. Xinjiang is Hyalomma anatolicum anatolicum. On the basis of evidence from molecular phylogeny and biological characteristics, Babesia sp. Xinjiang should be a new Babesia species. Studies of susceptibility of two sheep breeds to each Babesia sp. BQ1 (Lintan) and B. Divergens indicated that host genetic resistance and individual susceptibility to Babesia spp. Have a relationship with ability of erythrocytes to sustain multiplication of the parasites. Test of immune responses reveals IFNγ is associated with lower infectivity of B. Divergens and IL10 with higher infectivity of Babesia sp. BQ1 (Lintan) to sheep. Three detection methods for babesia sp. BQ (Lintan) or Babesia sp. Xinjiang infection have been developed, in vitro culture, Loop-mediated Isothermal Amplification (LAMP) and indirect Ezyme-Linked ImmunoSorbent Assay (ELISA) that could provide different information about the infection. Potentially diagnostic antigens indentified, such as BQHsp90, Bqp35, Hsp70, p200, are promising in application of seriological diagnosis in future
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Bourzat, Daniel. "Les petits ruminants dans les systèmes de production des zones aride et semi-aride de Somalie et du Burkina Faso." Paris 12, 1989. http://www.theses.fr/1989PA120032.
Full textAbstract:
Les enquetes, menees aupres de 361 exploitations de la somalie centrale et de 131 concessions du yatenga, ont permis d'etablir une typologie des unites de production agro-pastorales. Les performances des petits ruminants somaliens sont significativement liees aux conditions climatiques: l'age a la premiere parturition est superieur a deux ans; l'intervalle de mise-bas avoisine 14 mois; la fecondite est faible: 62% chez les ovins et 65% chez les caprins; la mortalite est elevee chez les jeunes animaux avant sevrage (13 a 51%). Les releves barymetriques et la description des robes (4653 animaux) ont permis la caracterisation des populations ovines et caprines. Chez les ovins et les caprins mossi et peul, les parametres zootechniques sont les suivants: l'age a la premiere parturition est de 15,0 mois chez les mossi, et de 13,9 et 14,7 mois chez les ovins et caprins peul; l'intervalle de mise-bas est de 9,4 et 9,5 mois chez les deux especes mossi et de 9,6 et 10,9 mois chez les brebis et chevres peul; le taux de reproduction annuel est de 1,36 et 1,51 chez les petits ruminants mossi et 1,33 et 1,7 chez les brebis et chevres peul; le taux de mortalite atteint 17,1% chez les agneaux et 20,6% chez les chevreaux. L'evolution des donnees ponderales et les effets des facteurs de variations sont analyses et discutes. Les resultats de la simulation demographique et economique confirment l'augmentation sensible de revenu net par reproductrice grace a la mise en uvre des techniques suivantes: plan de prophylaxie, enrichissement des sous-produits de recoltes a l'uree, supplementation minerale, embouche intensive des jeunes ovins males, choix des reproducteurs, controle de l'abreuvement. Les structures de developpement, capables de gerer ces techniques nouvelles, pourraient etre des associations de paysans ou d'eleveurs
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Cumer, Tristan. "Etude des variants structuraux génomiques pour comprendre les processus démographiques et adaptatifs impliqués dans la domestication des petits ruminants." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2017. http://www.theses.fr/2017GREAV075/document.
Full textAbstract:
Les variants structuraux génomiques (SVs) composent une large part du polymorphisme observable entre les individus mais leurs impacts sur les processus micro-évolutifs restent mal connus et leur étude à large échelle est rare.La première partie de ce manuscrit est une étude de la bibliographie portant sur les SVs décrits chez les animaux domestiques. Cette partie met en avant l'importance des SVs dans la modification des gènes ou de leur régulation, impactant un grand nombre de traits sélectionnés lors de la domestication, en lien avec la productivité, la morphologie ou encore le comportement.Basée sur l’étude de données de reséquençage de 500 génomes complets de petits ruminants sauvages et domestiques, la seconde partie, ciblant trois SVs décrits dans la bibliographie, a permis (i) de réfuter l’hypothèse d’amplification en lien avec la domestication des copies endogènes protectrices du retrovirus JSRV situées dans la région 6q13 du mouton, (ii) d’identifier des duplications entourant et affectant le gène ASIP qui seraient impliquées dans les modifications de coloration du pelage en lien avec la domestication des petits ruminants, ainsi que (iii) de montrer un potentiel rôle adaptatif d'un haplotype du locus de la beta-globine lié au climat aride chez le mouton.La troisième partie se base sur une recherche sans a priori de l’ensemble des SVs présents dans des génomes complets. Au travers du développement d’une méthode de détection des SVs et de son application, cette partie permet de décrire environ 50k et 20k SVs dans les génomes des Ovis et des Capra. Parmi ces SVs, 135 chez Ovis et 70 chez Capra semblent liés à la domestication et affectent des gènes impliqués dans l’amélioration, l’immunité, la reproduction ou la survie. De plus, les distributions de 130 SVs pour les moutons et 35 SVs pour les chèvres covarient avec des variables environnementales au Maroc. Certains affectent des gènes impliqués dans la morphologie, l’immunité et le métabolisme.Ce travail met ainsi en avant de nombreux variants qui peuvent impacter des gènes et qui ont pu être ciblés lors la domestication initiale, des étapes d’amélioration ultérieure ou de l’adaptation locale des petits ruminants. Il démontre l'importance de prendre en compte les variants structuraux dans les études génomiques visant à décrire les bases génétiques de la domesticationGenomic structural variations (SVs) account for a large part of the polymorphism between individuals, but their impacts on micro-evolutionary processes remain poorly known and large-scale studies are scarce.The first part of this manuscript is a bibliographic study of SVs in domestic animals. This part highlights the importance of SVs in modifying genes or their regulation, impacting a large number of traits selected during domestication and linked to productivity, morphology or behaviour.Based on the study of resequenced data from 500 whole genomes of wild and domestic small ruminants, the second part, targeting three SVs described in the bibliography, allowed (i) to refute the hypothesis of a link between the domestication of sheep and the amplification of endogenous protective copies of the JSRV retrovirus located in the 6q13 region, l, (ii) to identify duplications surrounding and affecting the ASIP gene that could be involved in the coat color changes related to the domestication of small ruminants, as well as (iii) highlight a potential adaptive role to arid climate of an haplotype of beta-globin locus in sheep.In the third part, we conducted a whole genome survey of SVs . Through the development of a SVs detection method and its application, we could detect about 50k and 20k SVs in Ovis and Capra. Of these SVs, 135 and 70 in Ovis and Capra, respectively, appear to be linked with domestication and affect genes involved in improvement, immunity, reproduction or survival. In addition, in Morocco, the distributions of 130 SVs for sheep and 35 SVs for goats covariate with environmental variables. Some of them affect genes involved in morphology, immunity and metabolism.This work highlights that many variants impacting genes might have been targeted during initial domestication and subsequent improvement steps or during the local adaptation of sheep and goats. It demonstrates the importance of considering structural variants in genomic studies to describe the genetic basis of domestication
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Gopilo, Abraham. "Epidemiology of peste des petits ruminants virus in Ethiopia and molecular studies on virulence." Phd thesis, Toulouse, INPT, 2005. http://oatao.univ-toulouse.fr/7414/1/gopilo.pdf.
Full textAbstract:
Peste des petits ruminants (PPR) is an acute and highly contagious viral disease of small ruminants, which is characterised by high fever, ocular and nasal discharge, pneumonia, necrosis and ulceration of the mucuous membrane and inflammation of the gastro-intestinal tract leading to severe diarrhoea and high mortality. In Africa, goats are severely affected while sheep undergo a mild form or rarely suffer clinical disease. PPR is one of the most important economical diseases in Ethiopia. Clinical PPR is confirmed in Ethiopian goats, however, its circulation in other animals has never been described. In the present work, we showed that the antibody seroprevalence in camel, cattle, goat and sheep confirmed natural transmission in these animals without clinical disease. The apparent absence of pathogenicity in these animals may have been due to host resistance or loss of virulence of the virus strain. We have further investigated the latter point by in vitro studies on PPRV comparing strains from Ethiopia and other countries with the vaccine strain which has been attenuated after several cell culture passages. In a first approach, virulence of PPRV was monitored in cell culture system and the use of virus specific monoclonal antibodies enabled to detect differences in virulence between PPRV and RPV. Vero (primate origin) and 293T (human) cell lines supported virus replication permitting the in vitro growth of both PPRV and RPV. In contrast to RPV, B95a (marmoset B) cells infected with PPRV were non permissive. The capability of cells to support active virus replication, which may result in intercellular spread and induce damages in infected cells, has implications on the pathogenesis and epidemiology. Cellular receptors are major determinants of host range and tissue tropism of a virus. The difference in infectivity of PPRV and RPV may have depended on the H protein epitopes and their cellular receptors. Therefore, we decided to compare the amino acid epitope of H protein of PPRV with that of other morbilliviruses. As part of our investigation of virulence factors, we have sequenced and compared genome and antigenome promoters of a vaccine strain with field strains of PPRV. The promoters contain the polymerase binding sites to initiate and generate the positive-strand replication and transcription of mRNAs. Nucleotide base change differences between vaccine strain and field strains would provide molecular basis for attenuation. Alignment of the genome promoter sequences revealed seven nucleotide mutations at certain positions. Our finding on nucleotide mutation on PPRV are in agreement with the nucleotide changes in rinderpest virus and other morbillivirus promoter regions between vaccine strain and wild type virus. Certain mutations were specific to PPRV. The promoter sequences were clustered around the geographic origin of the viruses and were lineage specific. Phylogenetic analysis of PPRV promoters was used for PPR phylogeograhy, and for comparison with other paramyxoviruses. The thesis is divided in 6 chapters. The first chapter deals with the natural history of PPR including the virus, the genome, epidemiology, transmission, clinical signs, immunology, diagnosis, control and its economic cost in the low income subsistence farming systems in sub-Saharan Africa. The second chapter is about comparative biology of PPRV with regard to other groups of morbillivirus genus in the Paramyxoviridae family. The third chapter deals with field study and observations on epidemiology of PPR in Ethiopia. In chapter four, PPRV virulence was monitored in cell culture system and comparison of H protein epitopes. In chapter five, sequence analysis of genome and antigenome promoters of PPRV was described In chapter six, general discussion and recommendations were forwarded.
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Buczkowski, Hubert. "Development of marker vaccines for rinderpest (RPV) and peste des petits ruminants (PPRV) viruses." Thesis, Royal Veterinary College (University of London), 2010. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.558958.
Full text
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Benjelloun, Badr. "Diversité des génomes et adaptation locale des petits ruminants d’un pays méditerranéen : le Maroc." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2015. http://www.theses.fr/2015GREAV011/document.
Full textAbstract:
Les progrès technologiques récents nous permettent d'accéder à la variation des génomes complets ce qui nous ouvre la porte d'une meilleure compréhension de leur diversification via des approches de génomique des populations et de génomique du paysage. Ce travail de thèse se base sur l'analyse des données de génomes complets (WGS) pour caractériser la diversité génétique des petits ruminants (chèvre et moutons) et rechercher les bases génétiques d'adaptations locales.Dans un premier temps, ce travail appréhende un aspect méthodologique et examine la précision et le biais de différentes approches d'échantillonnage des génomes pour caractériser la variabilité génétique, en les comparant aux données WGS. Nous mettons en évidence un fort biais des approches classiques (i.e. puces à ADN, capture de l'exome) ainsi que des séquençages de génomes à faibles taux de couverture (1X et 2X), et nous suggérons des alternatives basées sur un échantillonnage aléatoire de marqueurs dont la densité est variable selon les objectifs d'étude (évaluation de la diversité neutre, déséquilibre de liaison, signatures de sélection). Le jeu de données produit a permis d'évaluer l'état des ressources génétiques de différentes populations domestiques (races locales marocaines, iraniennes, races industrielles) et sauvages (aegagre, mouflon asiatique). Nous relevons une très forte diversité génétique dans les populations indigènes et sauvages qui constituent des réservoirs d'allèles et peuvent jouer un rôle important pour préserver le potentiel adaptatif des petits ruminants domestiques dans un contexte de changement climatique. L'étude plus approfondie des populations de chèvres du Maroc montre une forte diversité génétique faiblement structurée géographiquement, et met en évidence des portions de génome présentant des signaux de sélection. Leur étude montre l'existence de mécanismes adaptatifs potentiellement différents selon les populations (e.g. transpiration/halètement dans l'adaptation probable à la chaleur).Enfin, nous explorons les bases génétiques de l'adaptation locale à l'environnement chez les moutons et chèvres via une approche de génomique de paysage. En scannant les génomes de 160 moutons et 161 chèvres représentant la diversité éco-climatique du Maroc, nous identifions de nombreux variants et gènes candidats qui permettent d'identifier les voies physiologiques potentiellement sous-jacentes à l'adaptation locale. En particulier, il apparait que les mécanismes respiratoires et les processus cardiaques joueraient un rôle clé dans l'adaptation à l'altitude. Les résultats suggèrent que les chèvres et moutons ont probablement développé différents mécanismes adaptatifs pour répondre aux mêmes variations environnementales. Cependant, nous identifions plusieurs cas probables de voies adaptatives communes à plusieurs espèces. Par ailleurs, nous avons caractérisé les patrons de variations du niveau de différenciation de régions chromosomiques sous sélection en fonction de l'altitude. Cela nous permet de visualiser la diversité des réponses adaptatives selon les gènes (par exemple, sélection de variants à faible et/ou haute altitude). Ainsi, ce travail pose les bases de la compréhension de certains mécanismes d'adaptation localeRecent technological developments allow an unprecedented access to the whole genome variation and would increase our knowledge on genome diversification using population and landscape genomics. This work is based on the analysis of Whole Genome Sequence data (WGS) with the purpose of characterising genetic diversity in small ruminants (sheep and goats) and exploring genetic bases of local adaptation.First, we addressed a methodological aspect by investigating the accuracy and possible bias in the widely used genotyping approaches to characterize genetic variation in comparison with WGS data. We highlighted strong bias in conventional approaches (SNP chips and exome capture) and also in low-coverage whole genome re-sequencing (1X and 2X), and we suggested effective solutions based on sampling panels of random markers over the genome depending the purpose of the study (assessing neutral diversity, linkage disequilibrium, selection signatures). The various datasets produced allowed assessing genetic resources in various domestic (Moroccan and Iranian indigenous breeds and industrials) and wild populations (bezoars and Asiatic mouflons). We identified a very high diversity in indigenous and wild populations. They constitute a reservoir of alleles allowing them to play a possible key role in the preservation of these species in the context of global changes. The deep study of Moroccan goats showed a high diversity that is weakly structured in geography and populations, and highlighted numerous genomic regions showing signatures of selection. These regions identified different putative adaptive mechanisms according to the population (e.g. panting/sweating to adapt to warm/desert environment).Then, we explored genetic bases of local adaptation to the environment in sheep and goats using a landscape genomics framework. We scanned genomes of 160 sheep and 161 goats representing the eco-climatic Moroccan-wide diversity. We identified numerous candidate variants and genes, which allowed for identifying physiological pathways possibly underlying local adaptation. Especially, it seems that respiration and cardiac process have key roles in the adaptation to altitude. Our results suggest dissimilar adaptive mechanisms for the same environment in sheep and goats. However, we highlighted several cases of common metabolic pathways in different species. Moreover, we characterized some patterns for the variation of genetic differentiation in some candidate genomic regions over environmental gradients. This allowed us to visualise different adaptive reaction depending genes. This work points the way towards a better understanding of some mechanisms underlying local adaptation
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Leroux, Caroline. "Hétérogénéité et variabilité génomiques des lentivirus des petits ruminants au cours de l'infection naturelle." Lyon 1, 1995. http://www.theses.fr/1995LYO1T209.
Full text
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Da, Silva Teixeira Maria Fatima. "Réplication in vitro des lentivirus des petits ruminants dans des lignées fibroblastiques caprines immortalisées." Lyon 1, 1996. http://www.theses.fr/1996LYO1T157.
Full text
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Denoyelle, Laure. "Mécanismes génétiques et épigénétiques sous-jacents aux relations phénotype - environnement chez les petits ruminants." Thesis, Université Grenoble Alpes, 2020. http://www.theses.fr/2020GRALV045.
Full textAbstract:
Les organismes vivants peuvent être confrontés à des variations plus ou moins importantes de leur environnement (qu’il soit climatique, sanitaire, etc…). En réponse à ces variations, trois types de mécanismes peuvent être mis en place pour ajuster leur phénotype et l’environnement : le choix d’un habitat favorable, l’adaptation et l‘acclimatation. Dans le cas des animaux domestiques, le choix de de l’habitat n’est pas possible mais les deux derniers mécanismes peuvent être mis en évidence en étudiant respectivement la présence de marques génétiques et épigénétiques dans le génome des individus. Le but de cette thèse a été de mettre en évidence ces deux types de mécanismes chez les petits ruminants (chèvres et moutons) en rapport avec l’histoire des races et leur environnement.Dans un premier temps, nous avons analysé des données de génomes complets pour chercher des signatures de sélection chez onze races caprines françaises. Cette analyse nous a d’abord permis d’explorer leurs histoires, de comprendre les croisements possibles entre elles et de confronter ces résultats aux données historiques collectées. De plus des gènes sous sélection en rapport avec des caractères d’intérêt agronomique tels que la production laitière (21 gènes), la reproduction (14 gènes), l’immunité (11 gènes), ainsi que des caractères morphologiques spécifiques aux races étudiées (28 gènes) ont été mis en évidence.Dans un second temps, nous avons étudié les deux types de mécanismes chez des chèvres et des moutons marocains qui ont été choisis pour former deux groupes à chaque extrémité d’un gradient de variation de températures. L’analyse des différences génétiques entre les deux groupes, pour chaque espèce, nous a permis de localiser des régions sous sélection en relation avec des gènes impliqués dans la perception de l’environnement (5 gènes), l’immunité (4 gènes), la reproduction (8 gènes) et la production (11 gènes). Nous avons aussi séquencé les régions du génome portant des groupements méthyles chez ces mêmes animaux. L’analyse des régions différentiellement méthylées (DMR) entre les deux groupes nous a permis de trouver 2 DMRs (une chez chaque espèce) en relation, entre autre, avec la production et la qualité du lait. Cette étude des mécanismes d’adaptation et d’acclimatation chez les petits ruminants marocains est la première à chercher des marques épigénétiques en relation avec l’environnement chez des animaux d’élevage et à les comparer avec les marques génétiques présentes chez ces mêmes animaux. Au vu de nos résultats nous supposons que la variation de températures pourrait avoir deux types d’effet sur les animaux pouvant impacter les voies biologiques que nous avons détectées. Un premier effet, direct, qui influencerait les mécanismes de thermorégulation, et un second effet, indirect, en relation avec la quantité et la qualité des ressources alimentaires disponibles. La comparaison entre les deux mécanismes et les deux espèces nous a permis de trouver des voies biologiques impactées similaires, mais aucun gène en commun.Ces résultats montrent le rôle des mécanismes génétiques et épigénétiques dans l’ajustement des phénotypes à l’environnement. Dans un contexte de changements climatiques, il semble important de les prendre en compte pour développer des stratégies d’élevage en lien avec ces variationsOrganisms can be confronted with more or less important variations in their environment (climate, health, etc...). In response to these variations, three types of mechanisms can be put in place to adjust their phenotype with the environment: choice of a favorable habitat, adaptation and acclimatization. In the case of domestic animals, the choice of habitat is not possible, but the last two mechanisms can be revealed by studying the presence of respectively genetic and epigenetic markers in the genome of individuals. The aim of this thesis was to highlight these two types of mechanisms in small ruminants (sheep and goats) in relation to the breeds history and their environment.First, we analyzed whole genome data to search selection signatures in 11 French goat breeds. On one hand, this analysis allowed us to explore their histories, to understand possible crossbreeding between them and to compare these results with the historical data collected. On the other hand, selected genes related to agronomic traits of interest such as milk production (21 genes), reproduction (14 genes), immunity (11 genes), as well as morphological traits specific to the breeds studied (28 genes) were highlighted.In a second step, we studied the two types of mechanisms in Moroccan goats and sheep which were chosen to form two groups at each end of a temperature variation gradient. The analysis of genetic differences between the two groups, for each species, allowed to locate selected regions in relation to genes involved in environmental perception (5 genes), immunity (4 genes), reproduction (8 genes) and production (11 genes). We have also sequenced regions of the genome bearing methyl groups in these same animals. Analysis of the differentially methylated regions (DMRs) between the two groups allowed to find 2 DMRs (one in each species) in relation, among other things, to milk quality and production. This study of adaptation and acclimatization mechanisms in Moroccan small ruminants is the first to look for epigenetic marks in relation to the environment in farm animals and to compare them with genetic marks present in these same animals. Based on our results, we hypothesize that temperature variation could have two types of effects on animals that could impact the biological pathways we detected. A first effect, direct, which would influence the thermoregulation mechanisms, and a second effect, indirect, in relation to the quantity and quality of available food resources. The comparison between the two mechanisms, and the two species, allowed to find similar impacted biological pathways, but no gene in common.These results show the role of genetic and epigenetic mechanisms in the adjustment of phenotypes to the environment. In a context of climate change, it seems important to take them into account to develop breeding strategies related to these variations
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Sanz, Bernardo Beatriz. "Control of host innate immune (interferon) responses by peste des petits ruminants virus (PPRV)." Thesis, St George's, University of London, 2015. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.703281.
Full textAbstract:
Peste des petits ruminants virus (PPRV) produces clinical disease in goats and sheep. PPRV is a morbillivirus, others of which are known to affect the activation of the innate immune response by the actions of their accessory proteins (V&C). A crucial part of normal activation is the induction of interferon β (IFNβ) after pathogen recognition by pattern recognition receptors (PRRs). The presence of viral RNA can be sensed by the cytosolic proteins MDA-5 and RIG-I, starting a signalling cascade that leads to the activation of the IFNβ promoter and the synthesis of IFNβ. The production of IFNβ is a defence mechanism to control the spread of infection to neighbouring cells. Many viruses have evolved to antagonize this cell response. In this thesis I present a study of the induction of IFNβ following PPRV infection in both goat and primate cells, and the effects of infection with PPRV on the induction of IFNβ following MDA-5 and RIG-I mediated activation. Using both reporter assays and direct measurement of IFNβ mRNA, I found that PPRV infection does not induce IFNβ and can block the activation of expression of IFNβ. A study of the interaction of the PPRV accessory proteins with MDA-5 and RIG-I was carried out, including the cloning of goat RIG-I and LGP2. I also generated mutant viruses that lack expression of either accessory protein to characterize the role of these proteins in IFNβ induction during virus infection. Overexpression of V blocks MDA-5 mediated induction of IFNβ, but PPRV lacking V can still block MDA-5 mediated activation of IFNβ. PPRV C bound to neither MDA-5 nor RIG-I, but PPRV lacking C lost the ability to block MDA-5 and RIG-I mediated activation of IFNβ. These results shed new light on the inhibition of the induction of IFNβ by PPRV.
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Gopilo, Abraham Picavet Dominique-Pierre. "Epidemiology of peste des petits ruminants virus in ethiopia and molecular studies on virulence." Toulouse : INP Toulouse, 2006. http://ethesis.inp-toulouse.fr/archive/00000226.
Full text
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Mantip, Samuel Elias Lashat. "Molecular characterisation of peste des petits ruminants viruses in sheep and goats from Nigeria." Diss., University of Pretoria, 2013. http://hdl.handle.net/2263/40708.
Full textAbstract:
Peste des petits ruminants virus (PPRV) belongs to the family Paramyxoviridae and genus
morbillivirus. It is a highly contagious, fatal and economically important viral disease of small
ruminants that is still endemic and militate against the production of sheep and goats in
Nigeria. It is a notifiable disease according to the World Organization for Animal Health
(Office International des Epizooties). In this study, a molecular analysis of PPRV from sheep
and goats from recent outbreaks across the different regions of Nigeria was carried out. The
aim was to describe the viral strains and the movement of the virus within the country
compared to other endemic areas of the world. This was carried out through tissue and
swab samples collected from sheep and goats in various agro-ecological zones of
Nigeria.The evolution and relationship of earlier PPRV strains/isolates and those circulating
and causing recent outbreaks was determined by sequencing of the nucleoprotein (N)-gene.
Twenty tissue and swab samples from apparently healthy and sick sheep and goats were
collected randomly from each of three states of each of the six agro-ecological zones visited.
A total of 360 samples were collected. A total of 35 samples of 360 (9.7 %) tested positive by
RT-PCR, of which 25 were from oculo-nasal swabs and 10 were from tissue samples (Table
4.2). Phylogenetic analysis was carried out using the N-gene sequences of the PPRV amplicons.
Alignment of the sequences and related sequences from GenBank and neighbor-joining
phylogenetic analysis using PAUP identified four different lineages, i.e. lineages I, II, III and
IV. Interestingly, the Nigerian strains described in this study grouped in two separate major
lineages i.e. lineages II and IV. Strains from Sokoto, Oyo, Plateau and Ondo states grouped
according to the historical distribution of PPRV together with the Nigerian 75/1 strain of
lineage II, while other strains from Sokoto, Oyo, Plateau, Akwa-Ibom, Adamawa, Kaduna,
Lagos, Bauchi, Niger and Kano states grouped together with the East-African and Asian
strains of lineage IV. This finding suggests that both lineages II and IV strains of PPRVs are circulating presently in Nigeria, contrary to an earlier publication which indicated that only
strains of lineage II were circulating in the country (Shamaki, 2002).Dissertation (MSc)--University of Pretoria, 2013.
gm2014
Veterinary Tropical Diseases
unrestricted
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Woma, Timothy Yusufu. "Epidemiology of peste-des-petits-ruminants virus in sheep goats and camels in Nigeria." Thesis, University of Pretoria, 2015. http://hdl.handle.net/2263/53316.
Full textAbstract:
Peste-des-petits-ruminants (PPR), caused by the peste-des-petits ruminants virus (PPRV) is endemic in Nigeria and is a major constraint to the improvement of small ruminant production, thereby affecting the rural poor who depends on these livestock species as their source of livelihoods.
The major objectives of this work were: 1) to conduct a seroprevalence of PPRV in camels, sheep and goats in Nigeria; 2) to isolate PPRV from naturally infected animals; and 3) to characterize the isolates using molecular techniques and compare the profile of the current isolates with the worldwide vaccine (Nig75/1) and other existing strains from other parts of the world.
The major contribution of this work to current knowledge were: finding that more than one lineage of PPRV was circulating in Nigeria, the emerging Asian lineage IV gradually replacing the traditional lineage II in the country; the isolation in cell cultures and full genome sequencing of current field viruses which was last done in 1976; the unique amino acid residues in the individual proteins of the various lineages of PPRV were identified and used to develop a lineage-specific diagnostic test for the virus; and the current seroprevalence report of PPR in camels, sheep and goats from all the agro-ecological zones of the country. This work has also increased the sequences of PPRV available in GenBank.
A total of 6,065 field serum samples from camels (1,517), goats (3,489) and sheep (1,059) were collected from all the six agro-ecological zones of Nigeria. The study subjects cut across all ages and sexes. The samples were subjected to both the N and H protein based c-ELISA.
In addition, 140 clinical samples from 16 sheep and 63 goats with symptoms suggestive of PPRV infection were collected from different (15) states of Nigeria during a four year period (2010 2013). Published primers were used to amplify a 351 bp segment of the PPRV nucleoprotein (N) gene and a 370 bp segment of the fusion (F) gene. Monkey CV 1 cell line expressing the sheep-goat SLAM protein was used to isolate PPRV from RT-PCR positive samples. Thirty primer pairs were used to amplify and sequence two full genome isolates of the current circulating PPRV in Nigeria. Primer express software was used to develop a lineage-specific real time PCR for PPRV. The overall prevalence estimate of serum positive results for PPRV in sheep and goats was 23.16 % (n = 1,018/4,548, 95 % confidence interval [CI]: 21.79 - 24.57. There were significant differences in prevalences between the states (p = 0.001), zones (p = 0.058) and age (p = 0.032). Taraba State had the highest seroprevalence rate of 27.97 % while the lowest rate of 14.76 % was observed in Cross River State. There were no significant differences in the PPRV prevalences between male and female animals (p = 0.571) and between species (p = 0.639). The overall prevalence in camels was 3.36 % (51/1517, 95 % CI: 2.51 4.39). There were no significant differences in prevalences between states (p = 0.892) and between male and female camels (p = 0.742). The prevalence differed significantly (p < 0.001) by body condition scores - camels with poor body condition score have a higher (16.67 %) antibody seroprevalences to PPRV compared to those with fair and good body condition scores. There was a statistically significant difference between camels aged ? 5 years and those > 5 years (p = 0.004).
The clinical samples subjected to RT-PCR showed that 33 (42 %) animals were positive for PPRV nucleic acid, which included two sheep (13 %) and 31 goats (49 %). The amplicons were sequenced and phylogenetic analysis using the neighbour joining, maximum parsimony and Bayesian analysis of the sequences with those available in GenBank showed that isolates from the current study belonged to lineage II and lineage IV. The lineage II viruses from this study grouped into two clades, one closely related to the vaccine virus (Nigeria75/1) and the other clade group with other wild-type viruses from Mali, Senegal and Sierra Leone. The lineage IV isolates also grouped into two sub-clades, one closely related to a 2011 strain from Gabon and the other closely related to a 1997 strain from Cameroon.
Analysis of two full genomes of PPRV from Nigeria representing the two lineages of the virus circulating currently in the country showed that the lineage II representative isolated in 2012 has an identity of 96 % at the nucleotide level with the lineage II Nigeria75/1 virus isolated in 1975 and used as a vaccine. The lineage IV representative isolated in 2013 revealed an identity of 96 % with Sungri/96 from India. The unique amino acid residues in the individual proteins of the various lineages of PPRV were identified and used to develop a one-step TaqMan® real-time RT-PCR assay targeting the H gene of PPRV.
This study reports for the first time, the presence of PPRV lineage IV, the Asian lineage in Nigeria. As part of the study, a lineage-specific assay was also developed, which once validated, could be included in the panel of assays recommended by the World Organization for Animal Health (OIE). The seroprevalence studies showed occasional transient PPRV infection of camels and the current antibody seroprevalence to PPRV in the small ruminants population in Nigeria. There is the need to include camels among species to be studied in elucidating the epidemiology of the disease in sheep and goats. The seroprevalence studies may be helpful in reaching a decision on the vaccination strategy for the control of the disease in the country.Thesis (PhD)--University of Pretoria, 2015.
tm2016
Veterinary Tropical Diseases
PhD
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Leignel, Vincent. "Diversité génétique et résistance aux benzimidazoles chez ""Teladorsagia circumcincta" (Nematoda, Trichostrongylidea) parasite de petits ruminants." Montpellier 2, 2000. http://www.theses.fr/2000MON20142.
Full textAbstract:
Mes travaux de these s'inserent dans le cadre general des recherches developpees sur la resistance aux benzimidazoles (bzs) chez teladorsagia circumcincta, trichostrongle parasite de petits ruminants. Dans une premiere partie, une etude sur la diversite genetique a tout d'abord montre que t. Circumcincta est en fait un complexe d'especes qui regroupe au moins deux especes distinctes t. Circumcincta et t. Goat. Elle a aussi mis en evidence chez t. Circumcincta (espece la plus frequente du complexe), une absence de structuration des populations a l'echelle regionale (< 200 km) et une faible structuration a plus large echelle. Compte tenu des caracteristiques des elevages caprins etudies et des parametres demographiques de t. Circumcincta, ce resultat traduit l'existence d'une faible derive genetique qui permet le maintien d'alleles rares (dont les alleles de resistance) dans les populations parasites. Dans une seconde partie, ces travaux se sont interesses a l'influence de differents types de traitement anthelminthiques sur la selection des genotypes resistants et aux consequences de l'acquisition de la resistance aux bzs sur certains traits de vie des parasites. En absence de traitement, la proportion des genotypes reste constante ce qui indique que le succes reproductif des genotypes resistant et sensibles est semblable. La resistance aux bzs augmente proportionnellement avec le nombre de traitements aux bzs. Il est donc tres difficile de combattre la resistance, lorsque les premiers genotypes resistants sont apparus dans la population parasite.
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Raoul, Jérôme. "Utilisation d'un panel SNPs très basse densité dans les populations en sélection de petits ruminants." Thesis, Toulouse, INPT, 2017. http://www.theses.fr/2017INPT0128/document.
Full textAbstract:
Les programmes de sélection visent à produire des reproducteurs de bonnes valeurs génétiques pour la filière. La connaissance de marqueurs moléculaires du génome des individus et de mutations d’intérêt ouvrent des perspectives en termes d’organisation de la sélection. A l’aide de simulations déterministes et stochastiques, l’intérêt technique et économique de l’utilisation d’un panel de marqueurs moléculaires très basse densité a été évalué dans les populations ovines et caprines en sélection et permis d’obtenir les résultats suivants : i) utiliser un tel panel pour accroître, quand elle est limitée, la quantité de filiations paternelles n’est pas toujours rentable, ii) la stratégie de gestion des gènes d’ovulation qui maximise la rentabilité économique du plan de sélection a été déterminée par optimisation et des stratégies simples à implémenter, qui donnent des rentabilités proches de la rentabilité maximale, ont été proposées, iii) un programme de sélection génomique basé sur un panel très basse densité, permet à coût constant une efficacité supérieure aux programmes basés actuellement sur le testage sur descendance des mâlesBreeding programs aim to transfer high genetic value breeding stock to the industry. The knowledge of molecular markers of individual’s genome and causal mutations allow to conceive new breeding program designs. Based on deterministic and stochastic simulations, the technical and economic benefits of using a very low density molecular markers panel were assessed in sheep and goat populations. Following results were obtained: i) using such a panel to increase female paternal filiations in case of incomplete pedigree is not always profitable, ii) a method of optimization has been used to derive the maximal profits of managing ovulation genes, and practical management giving profits close to the maximal profits have been determined, iii) at similar cost, a genomic design based on a very low density panel is more efficient than the current design based on progeny testing
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Das, Subash Chandra. "Studies on chimeric rinderpest-peste des petits ruminants (RP-PPR) viruses produced using reverse genetics." Thesis, Royal Veterinary College (University of London), 2000. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.327035.
Full text
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Libeau, Geneviève. "Le diagnostic differentiel experimental de la peste bovine et de la peste des petits ruminants." Paris 6, 1998. http://www.theses.fr/1998PA066216.
Full textAbstract:
Le controle de la peste des petits ruminants (ppr) et de la peste bovine (rp) repose sur un diagnostic efficace et rapide de la maladie. Cependant les deux morbillivirus responsables sont les seuls du genre dont le spectre d'hotes est identique. Les deux maladies sont egalement remarquablement similaires en termes de signes cliniques. Afin d'etre operationnels, les laboratoires doivent disposer de methodes sensibles, specifiques et rapides, pour confirmer un diagnostic clinique provisoire. En combinant les nouvelles technologies issues de differentes disciplines, comme l'immunologie et la biologie moleculaire, ce travail a permis de contribuer a l'elaboration de nouveaux tests developpes sous forme de kits. Vingt-neuf anticorps monoclonaux (acm) diriges contre des souches vaccinales du virus rp et une souche virulente du virus ppr ont ete caracterises. Certain definissent, soit des sites antigeniques communs, soit des sites specifiques a chacun des virus. Trois d'entre eux sont choisis pour etre inclus dans deux tests elisas. Le test elisa immunocapture permet d'identifier et de differencier sans equivoque le virus rp de celui de ppr. Il utilise un acm de capture et deux acm de detection diriges contre des domaines antigeniques non chevauchants de la nucleoproteine (n). Le test permet de detecter cette proteine dans le surnageant de cellules infectees ou directement a partir des echantillons biologiques, issus de l'animal, avec une bonne sensibilite (virus rp : 10 3 , 5 ou ppr : 10 1 , 9 tcid50/ml). Le test elisa de competition (c-elisa) permet la detection specifique des anticorps anti-ppr. Il est base sur l'association d'un acm et de la nucleoproteine recombinante de la souche virale ppr nig 75/1 obtenue par le systeme d'expression du baculovirus. L'atout de la proteine n majoritaire et tres immunogene des morbillivirus, est d'etre exprimee en grande quantite et de constituer un bon antigene. Compare au test de reference, la seroneutralisation, le c-elisa est d'egale efficacite pour le diagnostic : le taux de correlation, r = 0,94, la sensibilite = 94,5% et la specificite relatives = 99,4%. Grace a sa facilite d'emploi, cet elisa permet de traiter des echantillons en grand nombre par une procedure standardisee. La technique de transcription reverse-amplification genique (rt/pcr) a ete simplifiee et evaluee pour la detection et l'identification du virus ppr. Combinee a une sonde non-radioactive, la sensibilite de la rt/pcr permet la detection de faibles concentrations de virus (2 10 4 molecules d'arn genomique). Elle constitue par sa grande efficacite, une methode complementaire a celles precedemment decrites. Nous avons exprime chez le baculovirus l'hemagglutinine de la souche virale rp saudi et par comparaison une forme tronquee de cette proteine. Les proprietes antigeniques de la forme tronquee, qui est elle, secretee, permet d'envisager son utilisation a des fins diagnostiques. Les elisas developpes ont ete appliques sur le terrain a la surveillance d'un foyer de ppr chez des chevres africaines. Ils demontrent, par l'existence d'infections asymptomatiques, que le pouvoir pathogene du virus peut varier selon la race. Des hypotheses sont formulees sur les interactions epidemiologiques des virus rp et ppr chez les ruminants domestiques lors de vaccination en zone d'enzootie. Les outils de diagnostic developpes au cours de ce travail sont maintenant utilises en routine dans les laboratoires veterinaires nationaux participant aux programmes de lutte contre la peste bovine au travers de la parc et de la sarec. Ils permettent de mener a bien les etudes epidemiologiques visant a etablir les programmes de controle et d'eradication et d'en mesurer l'efficacite.
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Martinez-Ortiz-de-Montellano, Cintli. "Mécanismes d'action de plantes riches en tanins sur les nématodes gastrointestinaux adultes des petits ruminants." Thesis, Toulouse, INPT, 2010. http://www.theses.fr/2010INPT0085/document.
Full textAbstract:
Les nématodes gastro-intestinaux (NGI) représentent un problème sanitaire majeur dans le monde entier en systèmes de production à l’herbe des élevages de moutons et de chèvres. La maîtrise de ces parasites est désormais compliquée par l'apparition de résistances aux anthelminthiques (AH) chez les nématodes. L'utilisation de plantes riches en tanins (PRT) comme AH non conventionnels est une des alternatives possibles au contrôle chimique de ces maladies parasitaires. Cependant, le mécanisme d'action de ces plantes sur les vers adultes demeure inconnu. Cet objectif a constitué le premier but de cette étude en particulier en essayant de déterminer quelle part jouent les effets directs et indirects dans l’action des PRT sur les populations de Nématodes adultes dans le tractus digestif des petits ruminants. Un effet direct correspond à une action de type pharmacologique sur la biologie, la structure et l’ultrastructure des nématodes liés à des composés biochimiques présents dans les PRT. L'hypothèse d’un effet indirect correspondrait une modification de la réponse cellulaire dans les muqueuses gastro-intestinales de l'hôte, affectant la biologie des NGI. Cette thèse est divisée en deux parties: 1) Deux expériences in vivo réalisées respectivement, au Mexique et en France, visant à déterminer les effets directs ou indirects sur la biologie des NGI liés à la consommation de PRT tel le tzalam (Lysiloma latisiliquum), une Légumineuse arbustive du Yucatan, le sainfoin (Onobrychis viciifolia) une Légumineuse fourragère tempérée, et ainsi que le quebracho(Schinopsis spp.), un extrait riche en tannins condensés Les agneaux ont été infestés par Haemonchus contortus (au Mexique) ou H. contortus et Trichostrongylus colubriformis (en France). La consommation de tzalam a provoqué une perturbation de croissance des vers ou de fertilité des femelles d’H. contortus. Selon la durée de consommation, le quebracho a réduit la population de H. contortus et T. colubriformis, et affecte également la fertilité de T. colubriformis. Le sainfoin a affecté la fécondité de H. contortus sans affecter celle de T. colubriformis. Le comptage de cellules effectrices dans les muqueuses pour évaluer l’implication d’un effet indirect n'a pas montré de différences significatives entre les lots recevant ou non des PRT. La seconde partie s’est fondée sur un test in vitro et deux essais in vivo chez des chèvres infestées par H. contortus pour mieux comprendre l'effet de la consommation de PRT (tzalam, au Mexique ou sainfoin, en France) sur la structure et l’ultrastructure d’H. contortus. Les principales altérations ont été trouvées dans la cuticule et la région céphalique des vers. Des agrégats de matériel végétal autour de la vulve n’ont été trouvé qu’in vitro. L’examen de l’ultrastructure des H. contortus a montré des signes de vacuolisation, surtout visible dans les tissus intestinaux et musculaires. Ces lésions suggèrent que des composés secondaires présents dans le feuillage des PRT peuvent être impliqués dans les fonctions vitales d’ H. contortus, telles que la mobilité, la nutrition et éventuellement la reproductionGastrointestinal nematodes (GIN) represent a major health problem worldwide in grazing sheep and goat production systems. The control of these parasites has been complicated by the emergence of nematodes which are resistant to the commercially available anthelmintics (AHs). The use of tannin rich plants (TRP), as non-conventional Ahs, represents an alternative for the control of these parasites. However, the mechanism of action of such plants against adult populations of GIN has not been determined. The objective of the study was to determine the direct and indirect effect of TRP against adult populations of GIN in small ruminants. A direct effect is considered to be any action against the biology, structure and/or ultrastructure of the nematodes which is similar to a chemical AH. The indirect effect is a modification of the immune response of the host at the level of the gastrointestinal mucosa which affects the biology of the GIN. This study is divided into two stages: First stage) Two in vivo experiments conducted in Mexico and France respectively, determined the direct and indirect effects on the biology of GIN due to the consumption of the TRP forage of tzalam (Lysiloma latisiliquum), sainfoin (Onobrychis viciifolia) as well as a tannin-rich quebracho extract (Schinopsis spp). Lambs were artificially infected with Haemonchus contortus (Mexico) or H. contortus and Trichostrongylus colubriformis (France). The consumption of tzalam affected the length and fertility of H. contortus females. Meanwhile, the quebracho extract reduced the population of H. contortus and T. colubriformis also affecting the fecundity of T. colubriformis. The sainfoin affected the fecundity of H. contortus without affecting T. colubriformis. The indirect effect was not evident. Second stage) An in vitro assay and two in vivo experiments with goats infected with H. contortus allowed to identify the effect of the consumption of TRP (tzalam or sainfoin) on the structure and ultrastructure of H. contortus. Alterations in cuticle and cephalic region were found. The aggregates in the vulva were only found in vitro. The ultrastructure of H. contortus showed a vacuolization process in the intestinal and muscular tissues of these nematodes. The lesions suggest that the compounds contained in the foliage of TRP may be involved in vital functions of H. contortus such as mobility, nutrition and possibly reproduction. This study is a contribution towards the understanding the mechanisms of AH action of the TRP against GIN
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Bodjo, Sanne Charles. "Etude de la nucleocapside des virus de la peste bovine et peste des petits ruminants : caractérisation moléculaire des interactions protéiques et des sites antigénique." Montpellier 2, 2007. http://www.theses.fr/2007MON20073.
Full textAbstract:
L'étude des structures antigéniques des nucléoprotéines (N) des virus de la peste bovine et de la peste des petits ruminants a montré que la région N-terminale est immunodominante. Les études de cartographie d’anticorps monoclonaux anti-N ont permis de localiser dans cette région des épitopes communs mais aussi des épitopes spécifiques à chacun des deux virus. Les tests de compétition ELISA (cELISA), développés avec certains de ces monoclonaux spécifiques à chaque virus détectent malheureusement aussi bien des sérums anti-PPR et qu'anti-peste bovine. Ce croisement serait probablement la résultante d’encombrement stérique engendré par des anticorps fixés sur les épitopes communs aux deux virus mais proches des sites spécifiques. Une partie de nos travaux a porté sur l'analyse des interactions protéine-protéine du virus PPR. Ils ont permis de localiser le domaine d'interaction N-N dans la zone couverte par les 240 premiers aminoacides de N. Quatre régions capables de se lier à la protéine M ont été identifiées sur la protéine N. Les séquences de ces zones d’interaction N-M sont conservées au sein groupe Morbillivirus
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El, Balaa Rodrigue. "Durabilité de la filière laitière des petits ruminants au Liban : analyse et signe de qualité label "Baladi"." Thesis, Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 2009. http://www.theses.fr/2009INPL076N/document.
Full textAbstract:
L’objectif de l’étude est d’évaluer la durabilité de la filière laitière de petits ruminants au Liban et d’identifier ses faiblesses afin de proposer des solutions garantissant sa pérennité. Les résultats d’une enquête englobant 129 éleveurs (Srour, 2006) ainsi que de trois enquêtes portant sur 15 transformateurs, 83 distributeurs et 250 consommateurs ont été agrégés en 12 paramètres représentant les trois volets de la durabilité (environnementale, sociale et économique). Les résultats ont été utilisés pour concevoir un cahier des charges englobant des solutions aux problèmes de la durabilité ; celui-ci a été validé auprès de 16 producteurs, 15 transformateurs, 17 distributeurs et 20 consommateurs. Les producteurs sont responsables de l’impact environnemental le plus important de la filière et souffrent d’une fragilité économique élevée. Les transformateurs sont caractérisés par un manque d’investissement et de politique de traitement des déchets, mais présentent les meilleures conditions sociales à leurs employés et sont les plus performants au niveau de la valeur ajoutée malgré un taux faible de croissance. Chez les distributeurs, les épiceries sont en régression face à des grandes surfaces en pleine expansion et offrant de meilleures conditions sociales à leurs employés. Les consommateurs ignorent le concept de la durabilité et basent leur confiance sur les vendeurs pour l’achat des produits traditionnels. La mise en place de cahier des charges est soutenue par son originalité, l’absence de produits similaires et la situation géographique, mais elle doit prendre en considération la réceptivité du marché (local et extérieur) et l’absence d’infrastructure spécialiséeThe aim of this study is to evaluate the sustainability of dairy small ruminant supply chain in Lebanon and to identify its weaknesses in order to suggest solutions guaranteeing its durability. The results relevant to a survey covering 129 breeders (Srour, 2006) and to three other surveys covering 15 processors, 83 distributors and 250 consumers were combined in 12 parameters representing the three facets of sustainability (environmental, social and economical). The results were used to design a labelling scheme containing solutions to sustainability problems; the latter was then validated with 16 breeders, 15 processors, 17 distributors, and 20 consumers. The breeders are responsible for the most important environmental impact of the supply chain and suffer from a high economical fragility. The processors are characterized with a shortage of investment and waste treatment policy but present the best social conditions to their employees and hold the best added value performance despite a weak growth rate. At the distributors’ level, groceries are in regression, facing large retailers in full expansion and offering better social conditions to their employees. The consumers ignore the sustainability concept and base their trust on the salesmen in buying traditional products. The application of the labelling scheme is supported by its originality, the absence of similar products and the geographical situation, but it has to take into consideration the receptiveness of the market (local and foreign) and the absence of specialized infrastructure
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Quijada, Pinango Jessica. "Relation structure/activité de tanins bioactifs contre les Nématodes Gastrointestinaux (Haemonchus contortus) parasites des petits ruminants." Phd thesis, Toulouse, INPT, 2015. http://oatao.univ-toulouse.fr/15130/1/quijada.pdf.
Full textAbstract:
Les nématodes gastrointestinaux (NGIs) représentent une contrainte majeure en élevage des ruminants. Jusqu’à présent, la maîtrise de ces parasitoses a reposé essentiellement sur l’emploi répété de traitements anthelminthiques (AH) de synthèse. Cependant, le développement constant de résistances aux AH dans les populations de nématodes chez les petits ruminants conduit à rechercher des méthodes alternatives ou complémentaires de lutte contre ces parasitoses. Au cours des deux dernières décennies, les données se sont accumulées montrant que certaines plantes étaient dotées de propriétés anthelminthiques, ce qui a été associé à la présence de tannins condensés (TCs) et de flavonoïdes. Ces ressources contenant des TCs, exploitées comme nutricaments, représentent donc une alternative attractive à la chimiothérapie, en combinant des effets bénéfique sur la santé et la nutrition des ruminants. Toutefois, une des difficultés à résoudre, pour un usage pertinent de ces nutricaments, est de comprendre l’origine de la variabilité des résultats observés dans l’activité AH. A côté de facteurs quantitatifs, la qualité (la structure) des TC semble également jouer un rôle dans les propriétés antiparasitaires mais ce facteur demeure peu exploré. En utilisant Haemonchus contortus comme modèle expérimental de nématode et le sainfoin (Onobrychis viciifolia) comme modèle de plantes contenant des tannins, l’objectif général de cette thèse a été de mieux comprendre les relations structure/activité des TCs. Les objectifs spécifiques des diverses études menées ont été 1) d’ examiner in vitro (par la méthode LEIA) l’activité AH de 36 fractions purifiées de TCs présentant une large diversité de caractéristiques structurelles [ex: la taille (mDP), les proportions prodelphinidols /procyanidols (PD/PC) et trans/cis ], et 2) le rôle possible d’interactions entre tannins et flavonoïdes, 3) d’ évaluer et comparer in vivo chez des agneaux, les conséquences sur les populations de vers et sur la résilience de l’hôte de la distribution de 2 ressources contenant des TCs de qualité contrastée pour les valeurs PD/PC [fort PD/PC, sainfoin (O. viciifolia); bas PD/PC, pellicules de noisettes (Corylus avellana)], 4) d’ examiner si les résultats varient en fonction de l’espèce et de la localisation des parasites (abomasum, H. contortus vs intestin grêle, Trichostrongylus colubriformis), 5) d’évaluer les concentrations, la qualité et la bio-disponibilité des TCs le long du tube digestif chez les ovins. Les résultats acquis ont montré: 1) des relations in vitro entre certaines caractéristiques des TCs et l’activité AH : un rapport élevé PD/PC pour les 2 espèces de nématodes auquel s’ajoute un rôle de la taille des tanins (mDP) pour H. contortus sont les facteurs identifiés. De manière générale, H. contortus s’est avéré plus sensible (valeurs EC50 plus faibles) aux effets des diverses ressources que T. colubriformis. Des synergies d’effets AH ont été observés entre tannins et flavonoides (quercétine et lutéoline), tout particulièrement dans le cas de TCs avec un faible rapport PD/PC. Dans l’étude in vivo, les agneaux consommant du sainfoin ont montré des effets AHs et une amélioration de la résilience de l’hôte alors que les effets de la noisette ont été beaucoup plus discrets. Les analyses menées sur les contenus des divers organes digestifs et les fèces, pour les deux types de ressources ont montré de fortes réductions de TCs détectés par rapport aux teneurs initiales dans la ration alors que les caractéristiques de structure étaient globalement préservées au long du tube digestif. En conclusion, le rôle de la qualité (structure) des TCs dans l’activité AH a été confirmé à la fois par les études in vitro et in vivo. Ces résultats suggèrent l’importance de prendre en compte ces facteurs dans la recherche de ressources pouvant être exploitées comme futurs nutricaments chez les ruminants.
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Hoc, Stéphanie. "Etude de la fonction de la protéine Tat des lentivirus de petits ruminants MVV et CAEV." Lyon 1, 2002. http://www.theses.fr/2002LYO10111.
Full textAbstract:
Tous les lentivirus contiennent une phase de lecture ouverte localisée juste en amont, ou même chevauchant le gène env, qui code pour une petite protéine désignée Tat, responsable de l'activation du promoteur qui contrôle la transcription des ARN viraux. Chez les lentivirus de petits ruminants (SRLV) MVV (Maedi Visna Virus) et CAEV (Caprine Arthritis Encephalitis Virus), des résultats quelque peu discordants concernant le niveau d'activation de la LTR par cette protéine ont été obtenus. De plus, une expérience complémentaire utilisant un clone moléculaire de CAEV délété du gène tat a permis de démontrer que la protéine Tat de CAEV n'était pas indispensable pour la réplication virale. Nous avons alors tenté de rechercher la fonction véritable de la protéine Tat des SRLV. Il s'avère que les protéines Tat de Mvv et de CAEV ont un rôle transactivateur faible, voire nul dans le cas de la protéine Tat de CAEV, sur leur propre LTR. Au niveau des gènes cellulaires, comparativement à la protéine Tat d'HIV-1 (Human Immunodéficiency Virus), nos données font apparaître que la protéine Tat de MVV augmente l'expression d'un nombre très restreint des gènes murins ou humains. D'un point de vue structural, nous avons pu découvrir que la protéine Tat des lentivirus de primates présente très peu d'homologies avec la protéine Tat de MVV ou de CAEV, au contraire de la protéine Vpr, protéine accessoire du lentivirus HIV-1. De manière similaire à la protéine Vpr, la protéine Tat des SRLV est associée aux particules virales, semble responsable d'un arrêt des cellules en phase G2 du cycle cellulaire, présente une certaine toxicité. L'ensemble de ces résultats semble donc indiquer que la protéine Tat des SRLV semble apparentée tant par sa structure, sa localisation et sa fonction à la protéine Vpr des lentivirus. Ces données soulèvent donc un certain nombre de questions concernant l'implication d'une protéine apparenté à la protéine Vpr dans la biologie des lentivirus des petits ruminants.
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Rachid, Antoine. "Infections lentivirales chez les petits ruminants domestiques : étude des relations hôte-pathogène et application en diagnostic." Poitiers, 2012. http://theses.univ-poitiers.fr/25342/2012-Rachid-Antoine-These.pdf.
Full textAbstract:
Le terme de lentivirus des petits ruminants (SRLV) désigne deux entités virales, le CAEV et le VMV, responsables d'infections chroniques à évolution lente chez la chèvre et le mouton. La diversité des souches virales couplée à la faible barrière d'espèce constituent un problème majeur en diagnostic et représentent un risque sanitaire potentiel. Pour améliorer la connaissance des souches virales qui circulent en Europe et optimiser les outils de diagnostic, les séquences gag et env d'isolats caprins et ovins circulant en Pologne ont été caractérisées. La co-circulation de sous-types CAEV et VMV a été mise en évidence à la fois chez les chèvres et les moutons et deux nouveaux sous-types (A12 et A13) ont été identifiés. La variabilité antigénique inter- et intra-génotype a été évaluée à l'aide de tests ELISA établis sur de nouveaux antigènes recombinants multi-épitopes Gag/Env représentatifs des deux types viraux. Les résultats ont révélé que les sites antigéniques des protéines MA et CA étaient conservés entre les sous-types d'un même génotype et, à un moindre degré, entre les deux génotypes, alors que la conservation des épitopes de la SU était limitée au génotype, parfois même au sous-type viral. Le risque sanitaire associé aux transmissions inter-espèces a été appréhendé à travers une analyse comparative de paramètres virologiques et sérologiques chez des chèvres et des moutons infectés par la même souche virale. Des interactions hôte-virus spécifiques ont été mises en évidence sur le plan de l'expression du virus dans le sang périphérique, de la cinétique de la réponse immune humorale et du spectre d'activité des anticorps dirigés contre les protéines MA et CA. Sur la base des données acquises, les antigènes multi-épitopes Gag/Env ont été valorisés à travers le développement de tests ELISA de diagnostic et de sérotypage. Ces tests ont conduit à la découverte, pour la première fois, d'une forme recombinante CAEV/VMV circulanteSmall ruminant lentiviruses (SRLV), including CAEV and VMV, cause slow progressive diseases in sheep and goats. The viral diversity, combined with interspecies transmissions, represent a diagnostic drawback and a potential sanitary issue. In order to gain a better understanding of viral strains circulating in Europe and to improve diagnostic tools, gag and env sequences of ovine and caprine isolates from Poland were characterized. The cocirculation of CAEV and VMV subtypes was reported in both sheep and goats, and two new subtypes, designated A12 and A13, were identified. The antigenic variability among SRLV strains was assessed by ELISA using new Gag/Env multi-epitope recombinant antigens representative of CAEV and VMV strains. The results revealed that antigenic sites of the MA and CA proteins were conserved among subtypes within the same genotype, and to a lesser extent between the two genotypes, whereas conservation of SU epitopes was restricted to strains belonging to either the same genotype or subtype. The risk assessment associated with interspecies transmissions of SRLV was carried out by a comparative analysis of virological and serological features in sheep and goats infected with the same viral variant. Specific hostvirus interactions were found in sheep and goats, including virus replication in blood, kinetic of humoral immune response, and pattern of antibody reactivity towards the MA and CA proteins. On the basis of these data, the Gag/Env multi-epitope recombinant antigens were used to establish ELISA tests for diagnostic and epidemiological purposes. Field application of these tests revealed, for the first time, the circulation of a CAEV/VMV recombinant form
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Lacombe, Nicolas. "Les coproduits entre marginalisation et relance. Le cas des viandes de petits ruminants en élevage méditerranéen." Thesis, Corte, 2015. http://www.theses.fr/2015CORT0020/document.
Full textAbstract:
Les viandes d’agneaux et de chevreaux sont une composante de l’identité des systèmes d’élevage de petits ruminants en méditerranée. Ces productions répondent souvent au qualificatif de « coproduit », c’est-à-dire dérivés d’une activité principale orientée par un autre produit avec lequel ils entretiennent une relation d’interdépendance. Leur histoire est pourtant celle de leur effacement, lié à une sectorisation des activités et un processus de découplage entre productions. Notre approche repose sur une analyse comparative entre différentes situations où produits dominants et coproduits sont en tension. Les couples étudiés concernent : i) en Corse, les fromages vs les agneaux de lait et les cabris de lait, ii) en Sardaigne, les fromages vs les agneaux et iii) au Maroc, l’huile d’argan vs le chevreau de l’Arganeraie.Depuis des situations initiales montrant une complémentarité entre les diverses productions d’un même système productif, sont progressivement apparues des concurrences autour de l’usage des ressources laitières ou forestières. Leur appropriation par un produit phare, inscrit dans une logique de spécification (fromage, huile d’argan) puis validé par une indication géographique, a marginalisé les coproduits dans leurs conditions de production et de valorisation. J’ai donc analysé les interactions entre productions interdépendantes au sein d’un même système productif, en focalisant sur l’incidence de la qualification d’un produit phare sur le devenir de son coproduit.Ce travail est une contribution à la géographie agricole centrée sur les relations entre production et territoire, en lien avec le fonctionnement des systèmes productifs. Son originalité réside dans l’échelle d’analyse qui comprend plusieurs produits liés entre eux dans un système productif. L’enjeu a été d’interroger la qualité comme vectrice de frontières sociales et techniques qui peuvent être sources d’exclusions si l’on examine le devenir des coproduits. La reconnaissance d’un produit phare, donnée pour participer à la confortation du territoire, peut contribuer à défaire les liens qui unissent les éléments du système productif et ainsi affaiblir le territoire. Les perspectives ouvertes par mes résultats portent sur la production de territoires multi-situés, dépassant les territorialités classiques construites selon des logiques institutionnelles (indication géographique isolant un produit du reste de son système productif) pour aller vers des fonctionnalités plurielles et imbriquées. En étudiant les relances de coproduits, j’ai pu comprendre les tiraillements autour de l’usage des ressources partagées, les rivalités et conflits, mais aussi les compromis qui peuvent en résulter et participer à des processus de recouplage dans des perspectives de multifonctionnalitéLamb and kid meats are part of the identity of the livestock farming systems of small ruminants in Mediterranean area. But these meats are often qualified as “co-products”, that is to say issued from a main activity dedicated to another product they are linked with by interdependency. Therefore, their history is marked by a progressive disappearance due to the sectorisation of the activities and a decoupling of productions. Our research is based upon a comparative analysis between several situations where a dominant product and its co-product are under tension. The studied couples are: i) in Corsica island, cheeses and milk lambs and kids, ii) in Sardinia island, cheeses and lambs and iii) in Morocco, argan oil and arganian forest kids.From the initial situations showing complementarities between the various productions within a same productive system, we observe a progressive competition around the use of some dairy or forestry resources. The appropriation of such resources by a major product, engaged in a movement of specification (cheese, argan oil) validated by the recognition as geographical indication, marginalized the co-products (lamb and kid meats) weakening their conditions of elaboration and marketing. Thus, I analyzed the interactions between interdependent productions within a same productive system, focusing on the consequences of the recognition of a major product on the future of its co-product.The results are contributing to agrarian geography as a discipline centered on the relationships between production and territory, clarifying the way of functioning of the productive systems. The originality of this work lies on the scale of analysis gathering several products linked together within a productive system. One main stake has been to question the meaning of “quality” as driving social and technical boundaries that become, as general requirements, potential sources of exclusions according to the future of the co-products. The fact to recognize a major product, considered as participating to strengthen the territory, may induce the destruction of the links unifying the elements of the productive system and, by the way, weaken the territory. Such results open perspectives on the production of multi-situated territories, overcoming the classical way to consider this production under institutional logics (ie geographical indication isolating one product from its whole system) for designing plural and interlinked functionalities. Through the study of co-products involved into processes of recovery, I achieved understanding the frictions created around the uses of shared resources, rivalries and conflicts, but also possible resulting compromises that may contribute to processes of recoupling with perspectives of multi-functionality
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Erhouma, Esadk Ali. "Étude génétique des lentivirus des petits ruminants (SRLV) infectant naturellement les bouquetins dans les Alpes française." Lyon 1, 2008. http://www.theses.fr/2008LYO10032.
Full textAbstract:
Les lentivirus des petits ruminants déterminant des infections persistantes chez les moutons et les chèvres domestiques dans le monde entier. Ces virus et d’autres lentivirus comme le virus de l’immunodéficience féline et le virus de l’immunodéficience simienne montrent une tendance à l’infection inter-espèces. Des passages de lentivirus entre le mouton et la chèvre ont été démontrés, cependant des infections par virus apparentés n’ont jusqu’alors pas été décrites chez les petits ruminants sauvages. Dans le but d’évaluer le risque de contamination des petits ruminants sauvages par les SRLV, nous avons étudié l’infection par ces virus chez des bouquetins en interaction avec des troupeaux locaux de chèvres dans les Alpes françaises et chez des hybrides chèvre-bouquetin. Les séquences du gène gag des virus infectant deux bouquetins, les hybrides et une chèvre d’un troupeau local forment un seul groupe cohérent montrant des différences de nucléotides de seulement 1 à 2 %, plus proche du type CAEV que du groupe MVV. Les séquences LTR confirment l’appartenance de ces virus au groupe CAEV, mais, contrairement aux séquences gag, les séquences LTR des bouquetins et des hybrides forment un groupe séparé de celui constitué par les séquences des chèvres du troupeau local et du prototype CAEV-Co. Les similitudes entre les séquences gag des bouquetins, des hybrides et d’une chèvre d’un troupeau sur le même site suggère le passage du virus entre animaux domestiques et sauvages comme cela a été déjà décrit entre chèvres moutons. De plus, des similitudes ont été montrées entre les séquences gag et LTR de deux bouquetins mâles d’un site avec celles d’un bouquetin femelle d’un site distant et l’étude temporelle des séquences gag chez les hybrides ont montré leur évolution du type chèvre vers le type bouquetin. L’ensemble de nos données montrent la première évidence de l’infection des bouquetins par les SRLV et suggère que ces virus pourraient constituer une population distincte circulant chez certains de ces ongulés sauvagesThe small ruminant lentiviruses (SRLV) cause persistent infections in domestic sheep and goats worldwide. These viruses and other lentiviruses such as feline immunodeficiency and simian immunodeficiency show propensity for cross-species infection. Lentivirus passages between sheep and goats were demonstrated, however no related viruses have yet been described as indigenous in populations of wild small ruminants. In order to evaluate the risk of contamination of wild small ruminants by SRLV, we studied natural infection of wild ibexes interacting with local goat herds in French Alpes and of goat/ Ibex hybrids. The sequences of the gag gene from two positive ibexes, the hybrids and one of the local goats clustered into a coherent group with only 1 – 2% nucleotide difference, close to CAEV but more distant from MVV. LTR sequences confirm that the viruses studied belong to the CAEV grouped, but, unlike the gag sequences, the LTR sequences of the hybrids and ibexes group in a distinct branch, separate from the local caprine sequences and CAEV-Co. Similarities between the gag sequences from ibexes and hybrids and the sequences from one goat from the same site, suggest viral transfer between the domestic and the wild species has been previously described between goats and sheep. Futhermore, similarities were shown between ibex gag and LTR sequences from the two males from a site and those from a female from an other distant site and temporal study of the gag sequences from hybrids showed evolution from goat-like sequences towards ibex-like sequences. Together, our data show the first evidence of the presence of SRLV in ibexes and suggest that these viruses could constitute a distinct population circulating in some of these wild ungulates
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Gaudin, Elodie. "Le sainfoin déshydraté - un modèle de nutricament dans la lutte contre les nématodes parasites des petits ruminants." Thesis, Toulouse, INPT, 2017. http://www.theses.fr/2017INPT0042.
Full textAbstract:
Les nématodes gastro-intestinaux (NGIs) sont une contrainte majeure en élevage des ruminants au pâturage. La méthode de lutte usuelle est l’utilisation de traitements anthelminthiques (AH) de synthèse. Cependant, la diffusion constante de résistances aux AHs dans les populations de NGIs chez les petits ruminants impose de rechercher des méthodes alternatives de maitrise. L’exploitation de plantes contenant des métabolites secondaires est une de ces options. Le sainfoin (Onobrychis viciifolia), une légumineuse riche en tanins condensés (TCs), est un modèle pour explorer le concept de nutricament = fourrage associant valeurs nutritionnelles et propriétés sanitaires (AH). Récemment, une filière de production de granulés déshydratés de sainfoin (GDS) s’est construite. Les avantages en sont : cultiver le sainfoin dans les meilleures conditions agronomiques possibles, favoriser la standardisation et la caractérisation des lots avant usage pour assurer leur distribution en élevages voire leur exportation. L’objectif général de cette thèse a été de fournir les informations scientifiques pour favoriser l’utilisation de GDS en élevage de petits ruminants. Il s’est décliné en 3 axes de recherche : Le premier axe visait à valider des méthodes simples de dosage des tanins et de leur activité biologique, pour caractériser des ressources avant usage, en se fondant sur des mesures biochimiques (méthode colorimétrique de Folin- Ciocalteu) et d’activité biologiques (complexation des protéines = méthode de diffusion radiale et activité AH = méthode du dégainement larvaire imitant le processus d’infestation in vivo). Les corrélations entre les diverses mesures montrent un lien entre la quantité de TCs et l’activité AH ainsi que l’intérêt de la méthode NIRS pour caractériser les différentes sources de sainfoin (GDS et fourrages). Le second axe visait à mieux définir sur la base d’études en conditions expérimentales contrôlées, les conditions optimales d’application des GDS en élevage. Une première série d’études a cherché à explorer 1) les effets AH combinés, liés à la concentration en TCs dans la ration et à la durée de distribution, contre divers stades (L3, vers adultes) d’espèces abomasales ou intestinales et 2) l’intérêt d’associer le sainfoin avec un AH de synthèse. Les résultats montrent 1) qu’un seuil minimum de TCs dans la ration doit être atteint et une période minimum de 15 jours de distribution est nécessaire pour altérer la biologie des nématodes (notamment la fertilité des vers femelles de Trichostrongylus colubriformis et le nombre d’Haemonchus contortus) et 2) qu’une utilisation dissociée d’un AH de synthèse (ivermectine par voie orale) est préférable en raison d’interactions négatives. Le dernier axe a visé à comparer la capacité d’ovins ou de caprins à moduler leur comportement alimentaire vis-à-vis de GDS en fonction de leur état parasitaire (capacité d'automédication). L’objectif était de vérifier les hypothèses suivantes : compte-tenu de leur moindre résistance envers les parasites et une plus grande propension à consommer des tanins, les caprins consommeront plus de sainfoin que les ovins ; les animaux fortement parasités exprimeront une préférence pour le sainfoin, et celle-ci augmentera au cours du temps. Les résultats de cet essai ont montré, dans le test de cafétéria, que 1) les chèvres préféraient le sainfoin et 2) une augmentation de la consommation en sainfoin au cours du temps chez les animaux parasités, sans toutefois devenir supérieure à celle des animaux sains. En revanche, ni les animaux parasités, ni les caprins n’ont montré de motivation plus importante pour obtenir la ressource riche en tanins dans le test de conditionnement opérant. Ces résultats montrent l’intérêt de l’utilisation de granulés de sainfoin en élevage, afin de compléter les AHs de synthèse et limiter le développement des résistances à ces molécules chez les NGIsGastrointestinal nematodes (GINs) represent a major threat for grazing ruminants. The traditional mode of control of these parasites mainly relied on the use of synthetic anthelmintics (AHs). However, the repeated use of these molecules has led to resistance against all AH drugs in worm populations of small ruminants. Alternative solutions are needed. Among those, the use of plants that contain plant secondary metabolites, such as condensed tannins (CTs), has been studied for the last 20 years. These CT-containing resources, such as sainfoin (Onobrychis viciifolia) have AH properties and beneficial effects on health and also interesting nutritional values; hence they correspond to the definition of nutraceuticals. Recently, an organization has developed to produce dehydrated pellets of sainfoin. The advantages of such pellets are 1/ to grow sainfoin in the best agronomic conditions; 2/ to better standardize the product; 3/ to evaluate the pellet before use and to facilitate exportation. The general aim of this thesis was to optimize the use of sainfoin pellets in farm conditions. Our first objective was to characterize the CT content and AH properties of sainfoin pellets. For industrial purposes, simple, low cost and repeatable methods to evaluate the CT content and the AH activity are requested in order to rapidly qualify the pellets. The CT content was evaluated by biochemical measurements of total phenols and tannins (Folin-Ciocalteu). This was completed by the measure of the complexation of tannins with proteins (Radial Diffusion) and by development of prediction calibrations using near infra-red spectroscopy (NIRS). The AH evaluation was performed on samples before and after dehydration, using the Larval Exsheathment Inhibition Assay. Calculations of correlations between the different methods showed significant links between the quantity of CT and the AH activity, and the possible use of NIRS to measure the CT content and the AH activity of pellets and forages. The second objective aimed at defining the optimal conditions to use sainfoin pellets on farm, to improve the AH activity. We aimed at analyzing, in experimental conditions, 1) how the combination of 2 factors, namely the CT concentration in feed and the length of distribution, influence the AH efficacy of sainfoin pellets on intestinal and abomasal L3 larvae or adult worms; 2) whether or not the combined use of sainfoin with a chemical AH (oral ivermectine) is beneficial. Results showed that a minimum CT content in sainfoin and a minimum length of distribution of 15 days are mandatory to alter the adult worm and L3 larvae biology of nematodes, particularly the Trichostrongylus colubriformis fertility and the number of Haemonchus contortus. Moreover, the combined use of AH and sainfoin consumption should be avoided because of negative interactions. The last axis aimed at studying the behavior of sheep and goats in relation to sainfoin pellets and their ability to change the feeding behavior according to their parasitic status (self-medication ability). The objective was to verify the following hypotheses: due to their lower resistance against parasites and their higher propensity to eat CTs, goats will eat more sainfoin than sheep, parasitized animals will prefer sainfoin and this preference will increase overtime. The results showed that two of our hypothesis were verified in a cafeteria study: 1) goats preferred sainfoin while sheep preferred alfalfa and 2) the sainfoin consumption increased overtime for infected animals, without being higher than nonparasitized ones. However, nor goat, nor parasitized animals, showed a higher motivation in the operant-conditioning trial to feed on CT rich resources. All the present results showed the interest to exploit sainfoin pellets in farms, as one alternative to AHs molecules in order to limit the development of resistances to these drugs in GIN populations
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Ayari-Fakhfakh, Saïda Emna. "Contribution au développement d’un modèle vaccinal recombinant pour le contrôle des trois infections virales majeures des ruminants, la variole, la PPR et la RVF, adapté à la situation épidémiologique des pays du Maghreb." Thesis, Montpellier 2, 2011. http://www.theses.fr/2011MON20009/document.
Full textAbstract:
L'objectif de cette thèse est le développement d'un vaccin recombinant capripoxvirus protégeant contre la variole des ruminants, la Fièvre de la Vallée du Rift (FVR) et la Peste des Petits Ruminants (PPR) comme modèle vaccinal destiné aux pays atteints par ces infections. Une première partie de ce travail a consisté en une enquête sérologique en Tunisie pour évaluer les prévalences PPR et FVR. L'enquête menée a montré une séroprévalence PPR de 7,6% et l'absence de FVR. Le risque lié à une infection par le virus de la fièvre de la vallée du Rift n'est pas nul en raison de l'identification des vecteurs compétents Culex theileri et Culex pipiens dans les zones échantillonnées. L'élaboration du vaccin capripoxvirus FVR-PPR porte sur l'expression des gènes NSmGN-FVR et H-PPR où chacune des valences est insérée dans le site de la thymidine kinase et le site d'un analogue du récepteur à l'interleukine 8 respectivement. Le vecteur choisi pour la souche vaccinale Kenya Sheeppox-1. Bien que nos travaux aient conduit à l'obtention du capripoxvirus double recombinant, ce dernier n'a pu être purifié. L'alternative a donc été d'évaluer l'effet protecteur et l'immunogénicité induits par le simple recombinant capripoxvirus- NSmGN-FVR, qui est un produit de l'étape intermédiaire dans l'élaboration du double recombinant FVR-PPR. L'effet protecteur de notre construction a été validé par deux expérimentations chez des souris Mus m. musculus MBT/Pas, avec épreuve infectieuse. Le nombre de doses administrées, les voies d'administration ont été déterminants dans cette protection justifiée par l'obtention d'anticorps neutralisants anti-FVR. L'étude de l'immunogénicité a été réalisée sur un modèle caprin sans épreuve infectieuse, une séroconversion FVR a été observée. La lymphoprolifération et le typage des sous populations lymphocytaires ont été analysésThe aim of this thesis was to develop a capripoxvirus based recombinant vaccine against ruminant pox, Rift Valley fever (RVF) and peste des petits ruminants (PPR) considered as a vaccine model for countries affected by these infections. The first part of the work consisted in a serological survey conducted in Tunisia to detect the PPR and RVF presence. A PPR seroprevalence of 7.6% has been found and no antibodies against RVF were detected. However, the risk of infection with rift valley fever virus persists since competent vectors such as Culex pipiens and Culex theileri has been identified in the sampled areas. The development of the RVF-PPR vaccine candidate is based on the NSmGN-FVR and H-PPR gene expression - where each of the genes is inserted into the thymidine kinase and the Interleukin 8 receptor analogue genes, respectively. The vector chosen is the vaccine strain Sheeppox Kenya-1. Although the double recombinant RVF-PPR has been produced, it could not be purified. The alternative was to evaluate the protection and the immunogenicity of the single recombinant capripoxvirus NSmGN-FVR, which is a product of an intermediate step of the process of the double recombinant preparation. The protection of our vaccine candidate has been performed by two mice experiments in Mus m. musculus MBT/Pas, with challenge. The number of doses, the route of administration played a key role in the protection confirmed by the presence of neutralizing anti-RVF antibodies. The study of the immunogenicity of the vaccine candidate was conducted in goats without challenge, RVF seroconversion has been shown. Lymphoproliferation studies and lymphocytes subpopulations typing have been analysed
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Assenza, Fabrizio. "Modelling genetic selection for gastrointestinal parasites resistance in small ruminants." Thesis, Toulouse, INPT, 2014. http://www.theses.fr/2014INPT0074/document.
Full textAbstract:
Les nématodes gastro-intestinaux sont des parasites de la caillette des petits ruminants qui posent des contraintes majeures pour l’élevage de ces animaux dans le monde. Récemment leur impact économique a augmenté notamment à cause de l’apparition de nématodes résistants aux anthelminthiques. La sélection génétique pourrait être une stratégie complémentaire des traitements chimiques. Dans cette thèse, nous avons exploré la variabilité génétique disponible qui permettrait une sélection sur la résistance aux nématodes. Les résultats obtenus en termes d’héritabilités, corrélations génétiques et QTLs, suggèrent que la variation génétique des populations étudiées pourrait satisfaire les requis d’un objectif de sélection permettant à la fois d’améliorer la résistance aux nématodes et la croissance des animaux. En outre, l’identification de loci SNP associés à la variation observée sur les caractères de résistance aux nématodes pourrait nous permettre d’améliorer la réponse à la sélectionAbomasal nematodes are a major constraint to small ruminants industry worldwide. Recently their economic impact has increased due to the recrudescence of anthelmintic resistance among many parasite populations. Genetic selection might be a valid strategy for enhancing the efficacy of anthelmintics. We explored the genetic variability, in both sheep and goat, possibly available for a breeding plan featuring parasite resistance as its breeding goal. The results obtained in terms of heritabilities, genetic correlations and QTLs, suggest that the variation in the genetic pool of the population under study might comply with the requirements of a breeding goal including both parasite resistance and production traits. Furthermore, marker assisted selection could be a feasible option to enhance the selection response