Dissertations / Theses: 'Physiologie végétale et développement'

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Saya, Rachel Aubain. "Amélioration de la croissance et du développement de pousses feuillées de bananier (Musa acuminata AAA) : passage du stade hétérotrophe "in vitro" au stade autotrophe "ex vitro"." Aix-Marseille 1, 1991. http://www.theses.fr/1991AIX11382.

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Abstract:

Ce travail a pour objectif de determiner les meilleures conditions microclimatiques (lumiere, temperature) de chambre climatisee permettant de produire des vitroplants de qualite (les plus vigoureux et les plus homogene possible), en vue de les preparer a l'autrophie stricte de la phase de sevrage. Le niveau optimum de 70 w. M##2 pour la croissance in vitro du bananier (musa acuminata aaa) a une temperature de chambre de culture de 271c est mis en evidence. Le suivi du bilan de carbone au cours d'un cycle photoperiodique de 16 h de lumiere et 8 h d'obscurite permet de noter la dominance de l'heterotrophie des plants bananier, et cette heterotrophie qui persiste jusqu'a la fin de la phase de croissance in vitro est accentuee par de forts eclairements. Le fait de faciliter les echanges gazeux entre le conteneur de culture et la chambre climatisee favorise le developpement des vitroplants (importante rhizogenese, accroissement de la surface foliaire), mais ne permet pas de produire des organes (feuilles et racines) fonctionnels au sevrage. Il apparait que l'ethylene est le principal inhibiteur du developpement des vitroplants, mais que sa presence permet aux plantes, tout en limitant leur developpement in vitro, d'accumuler des sucres, ce qui leur permet d'avoir une meilleure organogenese adventive en acclimatation, donc de mieux s'acclimater. Les radiations rouge clair et rouge sombre favorisent aussi l'heterotrophie des vitroplants de bananier, tout en ameliorant legerement la production de matiere seche in vitro, mais n'ont pas d'incidence sur l'acclimatation, tout au moins dans la limite du temps que dure l'etape au cours de laquelle interviennent ces radiations, c'est-a-dire la phase de croissance in vitro. Les teneurs en co#2 des conteneurs de culture sont de l'ordre de 3 a 6 % en fin de nuit, et la totalite par une periode d'obscurite de 4 h apres 6 h d'eclairement pour permettre le recyclage du carbone contenu dans le flacon de culture, ne permet pas d'ameliorer significativement la croissance in vitro, ni de faciliter l'acclimatation

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Dumont, Valérie. "Développement de méthodes de dosage et de caractérisation de sphingolipides végétaux et microbiens." Toulouse, INPT, 1995. http://www.theses.fr/1995INPT020G.

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Abstract:

Des 1991, la moelle epiniere bovine, jusqu'alors source de choix pour l'extraction de sphingolipides destines aux formulations cosmetiques, a ete ecarte. Les recherches se sont alors orientees vers les sources vegetales et microbiennes. La premiere partie de ce travail a consiste en l'etablissement d'une methode de dosage des sphingolipides par l'intermediaire des sphingosines qui sont les structures communes a tous les sphingolipides. Apres hydrolyse des lipides et extractions specifiques, elles sont dosees par chromatographie sur couche mince (ccm) couplee a la densitometrie. Cette methode a ete applique a differentes sources potentielles. Une souche de levure (pichia membranefaciens) a ete retenue. La seconde partie concerne l'optimisation de la production de biomasse en fermenteurs. Dans une troisieme partie l'identification des sphingolipides a ete realisee par ccm. L'etude structurale faisant intervenir des techniques chromatographiques sur colonne ouverte, en phase gazeuse (cpg), cpg couplee a la spectrometrie de masse (ms), et en phase liquide ionique a haute performance (cihp) a permis la proposition d'une formule

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Desclos, Marie. "Modifications physiologique et protéomique associées à la remobilisation de l'azote foliaire au cours de la sénescence séquentielle chez le colza (Brassica napus L. )." Caen, 2008. http://www.theses.fr/2008CAEN2078.

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Abstract:

Plante de grande culture, le colza (Brassica napus L. ) présente une faible efficience d’utilisation de l’azote (EUA) due à une mauvaise remobilisation de l’azote (N) au cours de la sénescence foliaire. Afin de caractériser les mécanismes clés susceptibles d’améliorer l’EUA, les objectifs visaient à identifier les processus physiologiques, protéomiques et moléculaires impliqués dans la remobilisation du N au cours de la sénescence foliaire et de déterminer l’impact de bas intrants azotés sur ces processus. Les jeunes feuilles de colza privées en nitrate présentent un ralentissement de la sénescence concomitant à l’accumulation d’un inhibiteur de protéases correspondant à BnD22 (Brassica napus Drought 22 kDa), une protéine capable de se lier aux chlorophylles. La double fonction de BnD22 interviendrait dans la protection des tissus juvéniles en maintenant l’intégrité des protéines et la capacité photosynthétique en réponse aux stress abiotiques. L’analyse des événements physiologiques et protéomiques associés à la remobilisation du N et à la sénescence foliaire a montré l’implication de protéines du métabolisme énergétique, de réponse aux stress et de protéolyse. Une protéase chloroplastidiale FtsH, une protéase à aspartate, une sous-unité du protéaosome et une protéase à cystéine SAG12 sont successivement induites au cours de la sénescence. La privation en N accélère l’entrée en sénescence mais n’affecte pas la séquence des événements. Le faible niveau de N résiduel observé dans les feuilles chutées de colzas privés en N s’explique par la conjonction d’une sénescence précoce, d’une protéolyse rapide, et d’une augmentation de la durée et de l’intensité du recyclage du N
Senescence, the faster proteolysis, and the increase of duration as well as intensity of N recycling. Brassica napus L. (oilseed rape) is an important crop plant with low nitrogen use efficiency (NUE) due to a weak remobilization of nitrogen (N) during leaf senescence. In order to characterize the key processes able to improve the NUE, the objectives were to identify the physiological, proteomics and molecular events implied in N remobilization during leaf senescence, and to determine whether low mineral N availability impact on these events. Young leaves of nitrate-deprived plants presented a delay of senescence concomitant with the accumulation of a trypsin inhibitor corresponding to BnD22 (Brassica napus Drought 22 kDa), a protein capable of binding chlorophylls. The dual function of BnD22 could be involved in the protection of younger tissues by maintaining protein integrity and photosynthesis capacity in response to abiotic stresses. The analysis of proteomics and physiological events associated with N remobilization and leaf senescence revealed the involvement of proteins acting in energy metabolism, plant stress response and proteolysis. A chloroplastidial protease FtsH, an aspartic protease, a proteaosome subunit and a cysteine protease SAG12 were successively induced during leaf senescence. The N starvation led to accelerate the onset of leaf senescence but did not affect the sequence of events. The weak level of residual N observed in fallen leaves of oilseed rape deprived in N was explained by the premature

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Bréchignac, François. "Photosynthèse et photorespiration chez la macroalgue marine Chondrus crispus : substrat carboné absorbé et nature de la prise d'oxygène." Paris 7, 1985. http://www.theses.fr/1985PA077013.

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Abstract:

Conçu pour le milieu aquatique, un dispositif expérimental permet la quantification continue et en conditions contrôlées de la photosynthèse, de la photorespiration et de la respiration chez la macroalgue marine Chondrus crispus (Rhodophycées, Gigartinales). Mesurée au moyen d'une colonne d'échanges, l'évolution de la concentration en CO₂ dissous en régime stationnaire indique l'existence d'une importante résistance aux transferts de CO₂ à l'interface air-eau, et l'absorption préférentielle du carbone inorganique externe sous forme HCO⁻₃. La forte affinité apparente de la photosynthèse pour le CO₂ (Km (CO₂) ≃ 1 µM) est la conséquence de l'absorption directe de HCO⁻₃ laquelle concentrerait le carbone inorganique dans l'espace intracellulaire. Mesurée par la méthode à 1'18O₂, la photoconsommation d'O₂ présente une faible amplitude en conditions standard, peu de sensibilité au CO₂ et une vitesse supérieure à la respiration nocturne quand le CO₂ est sursaturant. Elle s'avère par ailleurs sensible à 1'O₂ (Km (O₂) ≃ 4 à 16%), comme la photosynthèse nette (40 à 70% d'effet Warburg), quand la concentration n'excède pas 30%. Suggérée par ces résultats, la nature composite de la photoconsommation d'O₂ est confirmée par l'influence de l'intensité lumineuse, de la température et de quelques inhibiteurs : maintien sous lumière de la respiration mitochondriale, implication de la voie du glycolate à 45% au mieux dans la prise totale d'O₂, qui résulte alors surtout de la réaction de Mehler, voire d'une chlororespiration.

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Morel, Alexandre. "Physiologie moléculaire du développement des embryons somatiques de pin maritime (Pinus pinaster Ait.) : approches transcriptomique et protéomique." Phd thesis, Université d'Orléans, 2014. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01069408.

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Abstract:

Chez le pin maritime l'embryogenèse somatique, méthode de multiplication végétative performante, n'est pas optimisée la limite étant le contrôle du développement des embryons somatiques (ES). Nos objectifs ont été 1) d'étudier les mécanismes physiologiques, cellulaires et moléculaires précoces contrôlant la différenciation des ES en réponse à une disponibilité en eau réduite 2) d'évaluer pour l'ES cotylédonaire de 12 semaines son état de maturité, son protéome afin de les comparer à l'embryon zygotique (EZ). 1) Pour le 1er objectif, le rapprochement de données de transcriptomique et de protéomique a été entrepris. Nous avons observé une réponse physiologique et moléculaire ABA-dépendante entrainant une transition précoce de la prolifération vers la différenciation des ES (surexpression de protéines impliquées dans la division cellulaire, l'embryogenèse et la synthèse de l'amidon). Une protéine de type germine et une ubiquitine ligase apparaissent comme marqueurs potentiels de l'embryogenèse somatique précoce du pin maritime, alors que la protéine phosphatase 2C marque la réponse adaptative à l'environnement de culture. 2) La maturité de l'ES cotylédonaire a été étudiée aux niveaux physiologiques (masse sèche, teneur en eau) et biochimiques (teneur en protéines totales, en sucres solubles). Des ES de 10, 12 ou 14 semaines se révèlent semblables. Une méthode de classification hiérarchique ascendante basée sur 9 variables explicatives, montre que l'ES est similaire à l'EZ cotylédonaire frais (protéomes présentant 94% d'homologie). Parmi les protéines communes, 3 familles ont été identifiées (protéines de réserve, protéines de réponse au stress HSP, protéines LEA) ainsi que l'aldose réductase et l'adénosine kinase. Nous les proposons comme marqueurs génériques du stade cotylédonaire de l'embryogenèse tardive du pin maritime. L'ensemble des résultats contribue à une meilleure compréhension de l'embryogenèse somatique du pin maritime.

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Dechaumet, Sylvain. "Dissection métabolique de la sénescence foliaire et de la remobilisation des nutriments chez le colza (Brassica napus)." Thesis, Rennes, Agrocampus Ouest, 2018. http://www.theses.fr/2018NSARC133/document.

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Abstract:

Le colza est une culture oléagineuse très exigeante en intrants azotés associée à une faible efficience d’usage de l’azote (EUA). Le défi majeur vise à améliorer le bilan agroenvironnemental du colza par une optimisation de l’EUA, notamment en condition où l’azote est limitant dans le sol. L’EUA est limitée par une faible efficience de remobilisation de l’azote (ERA) lors de la sénescence des feuilles. L’objectif de ce travail de thèse a consisté à rechercher, chez le colza, la topologie et l’orientation des attributs métaboliques associées à l’ERA pendant la sénescence foliaire.Les résultats montrent que le métabolome des feuilles évolue tout au long de leur développement végétatif, de leur croissance à leur chute. Il est spécifique à chaque étage foliaire et traduit des relations trophiques et environnementales particulières liées au positionnement des feuilles dans le couvert végétal. Ces spécificités sont associées à des variations de teneurs en glucides, d’acides aminés,de glucosinolates et de coumarines en lien étroit avec la régulation phytohormonale du développement foliaire et avec leur translocation dans le phloème. Le cas de la Proline a été plus particulièrement approfondi et l’activation de son catabolisme sous régulation circadienne dans les tissus sénescents a été mise en évidence. Une approche combinée de transcriptomique et de métabolomique a permis de démontrer une variabilité génotypique importante dans les processus de dégradation et de transport des protéines, glucides et acides aminés entre deux génotypes à forte ERA. De la même manière, des relati
Oilseed rape is a very demanding oleaginous crop for nitrogen inputs associated with a low nitrogen use efficiency (NUE). The main challenge to improve the agri-environmental balance of oilseed rape is to optimize the NUE, especially under nitrogen deprivation. The NUE is limited by a low nitrogen remobilization efficiency (NRE) during leaf senescence. The aim of this thesis was to define the metabolome topology and orientation associated with NRE during leaf senescence in oilseed rape.The results show that leaf metabolome dynamically evolves throughout their vegetative growth, until their fall. Metabolome was found specific to each leaf rank, reflecting the trophic and environmental relationships related to the leaf positioning in the canopy. These specificities are associated with variations in carbohydrates, amino acids, glucosinolates and coumarins contents in close connection with the phytohormonal regulation of leaf development and with their translocation in the phloem.In particular, the activation of Proline circadian-controlled catabolism in senescent tissues was demonstrated. Finally, significant variations in the degradation and transport of proteins, carbohydrates and amino acids between two highly efficient NRE genotypes were highlighted using a combined transcriptomic and metabolomic approach. Similarly, a close relationship has been described between the genes expression levels and the metabolic content involved to increase NRE under low nitrogen input.The results are discussed regarding nitrogen remobilization improvement and more generally nutrients i

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Zaïdi, Leïla. "Étude anatomique et physiologique de la "bourse" fruitière du poirier (Pyrus communis L. C. V. Conférence)." Nancy 1, 1996. http://www.theses.fr/1996NAN10334.

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Abstract:

Le bourgeon mixte du poirier donne naissance à une inflorescence qui évolue par-delà la fructification pour donner la bourse dont la croissance en épaisseur est remarquable et dépasse largement celle d'un rameau court ou long du même âge. Elle acquiert sa structure adulte très précocement et porte de nombreuses productions avec lesquelles elle pourrait constituer une unité fonctionnelle quasi-autonome, dans laquelle elle serait plus particulièrement chargée d'assurer une fonction spécifique de stockage et de redistribution des éléments de réserves. Plusieurs arguments appuient cette hypothèse : l’existence de ponctuations larges et nombreuses chez les cellules des parenchymes de réserves, laissant présumer une communication intense. La présence de parois épaissies pour lesquelles l'interprétation la plus répandue est en faveur d'une forme particulière de réserves. L’évolution des glucides au cours d'un cycle annuel de végétation laissant prévoir une activité métabolique importante.

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Carnero, Diaz Le Disquet Isabel. "Étude du rôle du partenaire fongique dans l'absorption, le transport et le stockage des cations chez les ectomycorhizes." Nancy 1, 1997. http://www.theses.fr/1997NAN10298.

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Abstract:

Le rôle du partenaire fongique dans la protection des racines a été étudié dans le cas d'un excès cationique. Pour cela un modèle ectomycorhizien (corylus avellana/tuber melanosporum) a été expérimentalement mis en présence de divers cations, dans des conditions physiologiques et toxiques. Les voies de transport et de stockage des cations ont été définies dans les tissus racinaires et ectomycorhiziens. Pour cela, les organes ont été incube en présence de marqueurs cationiques (cérium et lanthane). Il a ainsi été démontré que les cations sont transportes radialement dans les tissus fongiques, vers la racine par les voies apoplasmiques et symplasmiques. Le mycélium exerce une action régulatrice dans la quantité et la qualité des cations qu'il transmet à son partenaire végétal. Le champignon exerce cette régulation tout au long des différents stades ponctuant la vie d'une mycorhize (stade jeune, mature et sénescent). Il a été mis en évidence expérimentalement que le mycélium truffier agit en diminuant la quantité de cations (la3+, ce3+, ca2+, cu2+, hg2+) parvenant a la racine. Pour cela, il procède à un important stockage des métaux dans ses structures. Une relation a donc été établie entre les degrés de tolérance et de résistance fongiques et ses capacités de détoxication des métaux au regard de la plante. Toutefois, ce mode d'action n'est pas général à toutes les mycorhizes, puisque l'étude expérimentale du modèle pinus pinaster/hebeloma cylindrosporum, montre que le mycélium peut également permettre le développement des végétaux en milieu toxique en favorisant sa nutrition minérale plutôt qu'en en limitant l'accès. Une étude réalisée sur le terrain révèle que le mycélium peut développer un troisième mécanisme de détoxication des métaux vis-à-vis de la plante. En effet, certains champignons possèdent une faible capacité à absorber les métaux, diminuant ainsi la quantité parvenant à la plante tout en évitant de les stocker de façon importante dans ses tissus.

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Chavanelle, Vivien. "Effets de deux modalités d'entraînement et d'une complémentation à base d'extraits végétaux sur le développement du diabète de type 2 : Physiologie." Thesis, Université Clermont Auvergne‎ (2017-2020), 2018. http://www.theses.fr/2018CLFAS021.

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Abstract:

Le diabète de type 2 (DT2) représente l’un des principaux défis de santé du XXI ème siècle. En 2015, 415 millions de personnes dans le monde étaient touchées tandis que 318 millions de plus présentaient un prédiabète, un stade défini comme à haut risque de développer la pathologie, mais encore réversible. Les recommandations hygiéno-diététiques (activité physique et alimentation) constituent la première ligne d’intervention dans le cadre de la lutte contre l’apparition du diabète de type 2. L’objectif de cette thèse était d'évaluer l’effet de deux stratégies interventionnelles inscrites dans les mesures hygiéno-diététiques sur le développement du DT2. L’étude 1 visait à comparer l’effet de deux modalités d’exercice chronique (continu à intensité modérée vs. intermittent de haute intensité) sur le développement du DT2 de jeunes souris db/db. L’étude 2 s’attachait à mesurer les effets d’un mélange de 5 extraits de plantes (Composition brevetée Totum-63,) sur le développement du DT2 à partir de deux modèles du prédiabète : la jeune souris db/db et la souris rendue insulinorésistante suite à un régime riche en graisses. Dans la 1 ère étude, l’entrainement intermittent de haute intensité a amélioré le contrôle glycémique indépendamment d’une adaptation de la fonction mitochondriale via notamment une augmentation du contenu musculaire en Glut4. Dans notre seconde étude, Totum- 63 a entrainé une amélioration du contrôle glycémique et de la sensibilité à l’insuline dans nos deux modèles. Plusieurs mécanismes sur différents tissus impliqués dans la physiopathologie du DT2 ont été mis en évidence, suggérant une action pléiotrope de Totum-63. En conclusion, ces résultats soutiennent l’intérêt de ces deux approches non-médicamenteuses dans le cadre de la lutte contre le développement du DT2. L’étude de l’action de l’activité physique combinée à celle de Totum-63, présente un intérêt supplémentaire et constitue un prolongement possible des travaux de cette thèse
Type 2 diabetes (T2D) represents one of the main challenges for the 21 st century. In 2015, 415 million people in the world were diabetic and 318 million more showed signs of prediabetes, a condition defined by a high risk of developing T2D, though still reversible. Lifestyle recommendations (physical activity and diet) form the first line of intervention for T2D prevention. The objective of this thesis was to measure the effects of two lifestyle-based therapeutic strategies on T2D development. Study 1 aimed at comparing the effects of two chronic exercise modalities (moderate-intensity continuous training vs. high-intensity interval training) on the progression of T2D of young db/db mice. Study 2 was focused on assessing the effects of a blend of 5 plants (patented formula Totum-63) on the development of T2D of two murine models of prediabetes: young db/db mice and high-fat diet induced insulin resistance mice. In study 1, high-intensity interval training improved glycaemic control maybe through enhanced muscular Glut4 content despite no adaptation of mitochondrial function. In study 2, Totum-63 supplementation improved glycaemic control and insulin sensitivity in both models of prediabetes. Several mechanisms in tissues involved in T2D physiopathology were unveiled, suggesting a pleiotropic action of Totum-63. In conclusion, this work supports the interest of these two lifestyle- based interventions for preventing T2D development. Future prospects include the study of the combined action of chronic exercise and Totum-63

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Meridja, Samir. "Approche biophysique des processus de développement et de croissance des couverts végétaux : Interaction avec le stress hydrique et optimisation des pratiques culturales en climat méditerranéen." Phd thesis, AgroParisTech, 2011. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00776775.

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Abstract:

Cette étude présente un modèle biophysique de fonctionnement de culture capable de traduire la dynamique de l'évolution de tout couvert végétal, sous différentes conditions abiotiques du milieu (température, eau et rayonnement) mais aussi de sols et de climats. L'approche développée pour le suivi de la cinétique de croissance et de développement des couverts reste très proche de la réalité physiologique de leurs fonctionnements mais aussi de celle liée aux interventions humaines qui se trouve alors compatible avec l'échelle de notre modélisation. Alors que l'utilisation d'une simple loi linéaire d'action de la température par les modèles de fonctionnements des cultures permet de prendre en partie l'effet de l'action de la température sur une gamme assez limitée de température active des espèces végétales, l'approche, assez originale, adoptée dans ce modèle permet l'utilisation d'une vraie loi d'action de la température sur les différents processus biologiques liés au développement et à la croissance, valable sur toute la gamme des températures biologiquement actives. Aussi, cette approche très générique permet de suivre la cinétique des vitesses d'évolution de toutes entités d'une plante, quelque que soit l'espèce ou la variété, et de travailler à n'importe quelle échelle de temps (jour, heure). L'adaptation du modèle logistique (largement utilisé pour décrire les processus biologiques) au contexte physiologique des plantes a permis une description assez originale de la dynamique de la croissance en fonction du développement, prenant en compte à tout moment l'effet d'une contrainte du milieu et sa rétroaction sur la dynamique d'évolution du couvert. La régulation de la croissance a été possible dans ce modèle de développement-croissance à travers la modulation de sa vitesse de croissance (processus le plus sensible au stress) en fonction de deux stress les plus importants chez les végétaux, soit l'eau et le rayonnement. A partir d'un petit nombre de paramètres facilement abordable en bibliographie, il est possible de caractériser la dynamique d'évolution de tout type de couvert végétal évaluant en conditions de sol et de climat variés. Couplé au modèle de bilan hydrique Bilhyna, ce dernier est capable de fonctionner sous différentes situations du milieu, conditions pluviales limitantes notamment, et de gérer ainsi le manque d'eau avec des apports possibles par irrigation de complément où limitées aux besoins tout au long de la croissance intègre alors la rétroaction d'une contrainte du milieu sur la dynamique de l'évolution du couvert. Pour étudier notre modèle, nous avons confronté dans un premier temps les sorties du modèle de loi d'action de la température sur les vitesses de développement aux résultats expérimentaux concernant les cultures du Lin, du maïs et du blé, issus de plusieurs travaux d'auteurs assez connus et tirés de la bibliographie. La confrontation des résultats modèle-mesures a donné des résultats très satisfaisants. Nous avons dans une seconde partie confronté les sorties de l'ensemble du modèle biophysique couplé à bilhyna aux mesures expérimentales que nous avons réalisé au champ sur une période de cinq années, et portant sur deux cultures : le sorgho et du blé. Nous avons ainsi suivi l'évolution de la dynamique de ces couverts à travers leurs trois composantes (LAI, la hauteur du couvert et la profondeur de ses racines) de même que celle des stocks d'eau du sol durant toute la période de la croissance des cultures. Les résultats de la confrontation des sorties du modèle avec les mesures expérimentales ont été assez satisfaisants. [Suite et fin du résumé dans la thèse].

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Tubeileh, Ashraf. "Photosynthèse, répartition des assimilats et rhizodéposition chez le maïs (Zea Mays L. ) soumis à la compaction du sol." Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 2000. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/INPL_T_2000_TUBEILEH_A.pdf.

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Abstract:

L'objectif de ce travail a été d'étudier l'effet de la compaction du sol sur l'activité photosynthétique, la répartition des assimilats et la morphologie du maïs en phase de croissance végétative, jusqu'à la sortie de la panicule mâle. Nous nous sommes en particulier intéressés à la rhizodéposition du carbone et à ses conséquences sur la biomasse microbienne du sol. Nous avons comparé des plantes cultivées dans des pots contenant un mélange de terre et de sable (2/1) présentant deux densités apparentes : 1,45 g cm-3 pour le sol compacté et 1,30 g cm-3 pour le témoin. Les expériences ont été conduites dans un phytotron pendant 21 à 42 jours. La répartition du carbone a été établie à l'aide des techniques de marquage court au 14 C. La densité apparente élevée du sol induit une diminution de l'activité photosynthétique et de la quantité de carbone fixée. La compaction du sol provoque un ralentissement du rythme d'émission foliaire, réduisant ainsi la hauteur des plantes, la biomasse des parties aériennes et la surface foliaire. La biomasse et la longueur racinaires sont inférieures chez les plantes subissant la compaction du sol. Simultanément, une forte augmentation de la rhizodéposition est observée dans le sol compacté. Ainsi, la biomasse microbienne du sol augmente fortement grâce à l'abondance de substrats, carbonés et à la protection physique que la compaction assure à la microflore en réduisant la porosité du sol. Pour expliquer ces résultats, nous avons émis trois hypothèses : 1- une diminution du potentiel hydrique ou une limitation de la force de puits. Des racines est à l'origine de la baisse de l'activité photosynthétique, 2- l'expansion du diamètre racinaire permet de surmonter la résistance du sol à la pénétration et 3- l'augmentation de la libération du carbone dans le sol réduit les effets de la contrainte mécanique. Les effets de la compaction persistent avec l'âge des plantes bien qu'ils diminuent en termes de pourcentage entre les deux traitements
The objective of this work was to investigate the effects of soil compaction on carbon assimilation, photosynthate partitioning, and morphology of corn plants during vegetative growth period up to tassel initiation. We were particularly interested in carbon input into the soil and soil microbial biomass. Corn plants were grown in culture pots containing compacted soil (bulk density of 1. 45 g cm-3 ) or loose soil (bulk density of 1. 30 g cm-3). Experiments were conducted in a growth chamber and lasted for 21 to 42 days. Carbon partitioning in the plant-soil system was evaluated using 14C pulse-labeling techniques. The increase in soil bulk density decreased carbon assimilation rate and total carbon fixation. Furthermore, soil compaction delayed leaf appearance rate decreasing therefore plant height, shoot dry weight, and leaf area. In addition, root biomass and root elongation were also inferior when plants were grown in compacted soil and root length appeared to be the most sensible parameter to high soil mechanical resistance. Simultaneously, a great increase in carbon input into the soil occurred to the detriment of root carbon. Soil microbial biomass increased considerably in compacted soil thanks to this increase in carbon substrates and to physical protection provided for soil microflora as a result of the reduced porosity in compacted soil. Three hypotheses were formulated to explain these results: 1- a decrease in soil or root water potential or a sink limitation induces a down-regulation of photosynthetic activity, 2- the increase in root diameter decreases soil mechanical resistance, and 3- the increase in carbon rhizodeposition alleviates the effects of mechanical constraint. The effects of soil compaction persisted with plant age although the difference between the two treatments decreased in terms of percentage

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Petit, Jean-Michel. "Régulation de l'expression des gènes de ferritines végétales en réponse à des signaux de l'environnement et du développement." Montpellier 2, 2000. http://www.theses.fr/2000MON20231.

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Abstract:

Le fer essentiel pour de nombreuses fonctions metaboliques est potentiellement toxique. Les ferritines, capables de stocker le fer sous une forme non toxique et remobilisable, remplissent les fonctions de reserve et de detoxication du fer dans les plastes. Il a ete montre que l'expression du gene zmfer1 de ferritines de mais est activee par une surcharge en fer et inhibee par des traitements antioxydants dans des suspensions cellulaire de mais. Une analyse fonctionnelle du promoteur du gene zmfer1 par des experiences d'expression transitoire dans des cellules bms de mais, revele qu'une region de 15 paires de bases nommee idrs est impliquee dans la derepression de l'expression du gene zmfer1 lors d'une surcharge en fer. De plus des experiences de retard de migration montre qu'une proteine (ou un complexe de proteines) se fixe specifiquement a cet element. Par contre l'idrs ne semble pas implique dans la regulation redox de ce gene. L'element idrs est egalement present sur le promoteur du gene atfer1 de ferritines d'arabidopsis thaliana. Des experiences d'expression transitoire ainsi que des observations realisees avec des plantes transformees de maniere stables montrent que l'idrs du gene atfer1 est egalement fonctionnelle. L'analyse de la localisation de l'expression du gene atfer1 grace a un gene rapporteur gus montre que le gene atfer1 est exprime principalement au niveau des vaisseaux conducteurs, des antheres et de l'endoderme. Les ferritines etant codees par une famille multigenique l'expression de quatre genes de ferritines d'arabidopsis a ete analysee au cours du developpement de la plante et correlee avec la synthese de ferritines afin de mieux comprendre la fonction des differents genes in planta. Nous avons aussi montre que l'expression des genes atfer1, atfer3 et atfer4 est induite par le fer. L'expression du gene atfer1 est egalement activee par le peroxyde d'hydrogene et celle du gene atfer2 est regulee par l'aba.

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Cazaux, Edwige. "Isolement et culture des protoplastes d'"Hevea brasiliensis" : facteurs physiologiques et biochimiques impliqués dans la récalcitrance." Montpellier 2, 1993. http://www.theses.fr/1993MON20023.

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Abstract:

Deux types de materiel de depart ont ete utilises pour l'isolement et la culture des protoplastes. D'une part des organes tels les tiges, les petioles et les feuilles d'autre part des cals embryogenes de tegument interne de graine immature. L'optimisation des conditions de maceration conduit a l'obtention d'un nombre eleve de protoplastes viables quel que soit le materiel de depart. Parmi les methodes de culture, l'utilisation de la technique d'inclusion dans l'alginate conduit a l'obtention de quelques divisions sporadiques chez les protoplastes de tige et de petiole. Ces divisions s'arretent au stade de deux cellules. Des stress oxydatifs intervenant au cours de la maceration et de la culture de meme qu'une production d'ethylene lors de la culture pourraient etre en partie responsables de la recalcitrance des protoplastes de tige. La culture des protoplastes de cals friables embryogenes necessite leur inclusion dans l'alginate et la presence de cellules nourrices de tabac en division actives. L'effet benefique des cellules nourrices de tabac serait du a la presence de plusieurs facteurs inducteurs. La densite de culture des cellules nourrices, de meme que le temps de contact determine l'intensite de la reponse. Dans ces conditions, des microcals ont ete obtenus a partir des protoplastes de cal du clone pr107. Cependant des brunissements interviennent limitant le developpement ulterieur des microcals

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Rollion-Bard, Claire. "Variabilité des isotopes de l'oxygène dans les coraux Porites : développement et implications des microanalyses d'isotopes stables (B, C ET O) par sonde ionique." Nancy 1, 2001. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/INPL_T_2001_ROLLION-BARD_C.pdf.

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Abstract:

Des mesures des compositions isotopiques de bore, de carbone et d'oxygène par sonde ionique ont été développées sur des carbonates avec des reproductibilités internes de l'ordre 0,2 ‰ et des reproductibilités externes de l'ordre de 0,9 ‰ pour le bore, 0,65 ‰ pour le carbone et 0,4 ‰ pour l'oxygène. Les volumes analysés sont compris entre 3,5. 10-7 et 58,9. 1 0-7 mm³. Les coraux fournissent un enregistrement des conditions chimiques et physiques de l'eau de mer environnante au moment de la précipitation de leur squelette carbonaté. Leurs δ¹³C et δ¹⁸0 apparaissent en déséquilibre par rapport aux fractionnements isotopiques entre l'aragonite inorganique et l'eau. Cet écart est appelé effet "vital". Les mécanismes actuellement proposés pour expliquer cet effet "vital" sont, pour l'oxygène, une variation de pH dans le fluide de calcification (Adkins, 2000) ou un effet cinétique lors de la précipitation de l'aragonite du squelette (McConnaughey, 1989), et pour le carbone, un effet cinétique ou une forte contribution de C02 métabolique venant de la respiration du corail qui est appauvri en ¹³C. Les résultats pour les compositions isotopiques de bore, carbone et d'oxygène à l'échelle micrométrique ont plusieurs implications. Le déséquilibre des mesures de 8¹³C reflète sans doute le mélange des deux sources dont provient le CID (Carbone Inorganique Dissous) : le C02 métabolique issu de la respiration du corail et le CID venant directement de l'eau de mer. Les variations du δ¹⁸O à échelle micrométrique sont le résultat de plusieurs processus : (1) des variations de pH de l'ordre de 1 unité montrées par les données de δ¹¹ß; (2) un processus qui fractionnerait les isotopes de l'oxygène et qui s'exprimerait plus à pH basique qu'à pH acide ; (3) des changements biologiques liés à la mise en place des dissépiments ; (4) des hétérogénéités des δ¹⁸O au niveau des différentes parties du squelette avec notamment les synapticules avec un δ¹⁸O plus appauvri que les trabécules.

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Garnier-Petit, Agathe. "Purification et caractérisation de la glutamate déshydrogénase à NAD chez le basidiomycète ectomycorhizien Laccaria bicolor : régulation de son activité chez le champignon en culture pure et dans deux associations ectomycorhiziennes." Nancy 1, 1998. http://www.theses.fr/1998NAN10312.

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Abstract:

La GDH à NAD du champignon ectomycorhizien Laccaria bicolor a été purifiée à homogénéité électrophorétique. Le protocole de purification comporte trois étapes simples, une précipitation au sulfate d'ammonium, une chromatographie échangeuse d'anions et une filtration moléculaire. La GDH à NAD a été purifiée 410 fois avec un rendement de 40%. La masse moléculaire de l'enzyme native est de 470 kDa, celle des sous-unités de 116 kDa suggérant que la GDH à NAD est un tétramère. L’enzyme est spécifique pour le NAD(H). Les pH optimums sont de 7,4 et de 8,8 pour les réactions d'amination et de désamination respectivement. L’addition de sulfate d'ammonium permet une bonne stabilité de l'activité enzymatique. La GDH à NAD est stimulée par le calcium, le magnésium, fortement inhibée par le cuivre et légèrement par les nucléotides AMP, ADP et ATP. Les constantes d'affinité pour le NAD, NADH, α-cétoglutarate et l'ammonium sont de 282 µM, 89 µM, 1,35 mM et 37 mM respectivement. Le rôle physiologique de la GDH à NAD a été étudié chez Laccaria bicolor cultive sur différentes sources azotées. Une régulation différente des deux GDHS est mise en évidence sur milieu nitrate et ammonium, conséquence de leur fonction métabolique distincte. La GDH à NAD et la GS ont un rôle assimilateur tandis que la GDH à NAD possède une fonction déprédative. La source et la concentration en azote régule fortement la GS et la GDH à NAD. Ces enzymes sont réprimées par les fortes teneurs en azote, en relation avec la teneur en ammonium intracellulaire. La GDH à NAD est nettement moins influencée par le statut azoté cellulaire. L’effet des sources carbonées sur les activités GDH à NAD et GDH à NADP caractérise une simulation de ces deux enzymes sur un milieu contenant du succinate et du fumarate. La GDH à NAD est plus fortement stimulée. Ceci suggère un contrôle de ces enzymes par le circuit carboné. L’étude de l’expression de la GDH à NAD dans deux ectomycorhizes montre une répression de l’isoforme fongique tandis que l’isoforme racinaire est conservée. Dans les ectomycorhizes de Douglas / Laccaria bicolor, la GDH à NADP fongique est active tandis que dans l’association Eucalyptus globulus / Laccaria bicolor, elle est réprimée.

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Ripoll, Camille. "Modèles compartimentaux de cellules végétales : influence de la croissance sur les flux." Rouen, 1986. http://www.theses.fr/1986ROUES010.

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Abstract:

On propose un modèle approché d'efflux qui se réduit au modèle classique quand le taux de croissance est nul. Les relations exactes de calcul des paramètres cellulaires dans le modèle classique sont également établies. On montre que l'utilisation habituelle de relations approchées est source d'erreurs numériques qui peuvent dans certains cas, être supérieures aux incertitudes expérimentales. Les flux unidirectionnels sont calculés dans le domaine de validité des relations linéaires flux-forces. Ces résultats permettent d'interpréter avec succès nombre de mesures expérimentales de l'influx initial en fonction de la concentration extérieure

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Maillard, Patrick. "Influence de l'éthylène sur la croissance, la physiologie et le métabolisme d'haematococcus pluvialis." Compiègne, 1993. http://www.theses.fr/1993COMP0581.

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Abstract:

Toutes les souches de cyanobacteries (11 souches) et toutes les algues (56 souches dont 38 souches d'algues unicellulaires) peuvent produire de l'ethylene, dans nos conditions de culture. Chez haematococcus pluvialis, une variabilite intraspecifique existe pour la production d'ethylene et la synthese d'astaxanthine. La voie de biosynthese de l'ethylene chez haematococcus pluvialis est identique a celle des vegetaux superieurs. L'emission d'ethylene est fonction du flux lumineux et de la qualite de la lumiere. Il y a une stimulation par la lumiere verte. La production depend certainement d'un systeme phytochrome. La production d'ethylene est stimulee par les auxines, la cytokinine et par l'ion cobalt et elle est inhibee par l'ion cuivrique. L'action des ions metalliques est differente de celle observee chez les vegetaux superieurs. Le complexe enzymatique mis en jeu serait donc different. La production d'ethylene decroit avec l'enkystement le rougissement des cellules. Cependant, il existe un rythme circadien de production de l'ethylene et de synthese d'astaxanthine en fonction du cycle circadien naturel

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Pelosse, Perrine. "Rôle des compromis évolutifs dans la spécialisation et la coexistence d'espèces compétitrices : développements théoriques et expérimentaux chez les insectes parasitoïdes." Phd thesis, Université Claude Bernard - Lyon I, 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00369569.

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Abstract:

Les compromis évolutifs ou trade-offs occupent une place centrale dans l'évolution des traits d'histoire de vie car ils contraignent l'univers des possibles. Les trade-offs dans l'allocation d'énergie vers la reproduction et la maintenance sont essentiellement liés, chez les insectes parasitoïdes, à la disponibilité en hôtes et en nourriture de l'environnement et au nombre d'œufs dont disposent les femelles. Nos expériences relevant de l'écologie comportementale et de l'éco-physiologie démontrent, chez le parasitoïde Venturia canescens, (i) que les caractéristiques de l'environnement sélectionnent une allocation différentielle des ressources vers la fabrication des œufs et la mise en place des réserves énergétiques pendant la phase larvaire ; et (ii) qu'un ajustement des stratégies d'allocation d'énergie en réponse à la disponibilité en hôtes existe pendant la phase adulte. Nos travaux théoriques révèlent le rôle central de la qualité de la nourriture dans l'évolution du trade-off entre recherche d'hôtes et de nourriture, et suggère son importance dans la structuration des communautés de parasitoïdes.

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Aubert, Serge. "Effets multiples du glycérol sur le métabolisme de la cellule végétale non chlorophyllienne." Université Joseph Fourier (Grenoble), 1994. http://www.theses.fr/1994GRE10217.

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Abstract:

Nous avons étudié les effets du glycérol sur la croissance et le métabolisme des cellules végétales non chlorophylliennes, en utilisant des cellules isolées d'érable sycomore (Acer Pseudoplatanus, l. ) et d'Echinochloa. Le glycérol pénètre dans les cellules par diffusion. Il est ensuite phosphoryle en SN-glycérol-3-P qui alimente la respiration, via les réactions terminales de la glycolyse. La néoglucogenèse est impossible car le SN-glycérol-3-P est un inhibiteur compétitif de la glucose-6-phosphate isomérase. Ainsi, la synthèse de saccharose, d'amidon et de composes pariétaux s'arrête. De plus le cycle oxydatif des pentoses cesse d'être alimente, ce qui entraine un arrêt de la synthèse des pentoses et de la réduction des nitrates. Lorsque le glycérol est utilise comme seule source de carbone, la croissance des cellules est alors stoppée. Pourtant le seul fonctionnement de la respiration mitochondriale suffit à entretenir durant plusieurs semaines la survie des cellules, qui ne présentent aucun signe d'autophagie. Par contre, une carence de glycérol entrainera brutalement le processus autophagique. Par ailleurs, nous avons observe que le glycérol entraine l'accumulation d'oligopolysaccharides de types B-1,3 et de phosphohomoserine (un intermédiaire de la synthèse d'isoleucine, issu de l'aspartate) lorsque le milieu de culture contient du saccharose. En utilisant l'homosérine (dont nous avons caractérise le transport actif dans les cellules et la métabolisation) et les herbicides inhibant l'acétolactate synthase, nous avons montre que le site principal de régulation de la synthèse in vivo de l'isoleucine est situe au niveau de la thréonine déshydratase. Une observation a été mentionnée en annexe : l'induction de la respiration insensible au cyanure par les inhibiteurs de l'acétolactate synthase

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Puga, Freitas Ruben, and Freitas Ruben Puga. "Effet du ver de terre Aporrectodea caliginosa sur la croissance des plantes, leur développement et leur résistance aux pathogènes : réponse physiologique et moléculaire de la plante à l'émission de molécules-signal." Phd thesis, Université Paris-Est, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00804633.

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Abstract:

Les plantes se développent et évoluent en interaction avec les organismes du sol. L'impact des vers de terre sur la croissance des plantes, généralement positif, a été attribué à des modifications physiques, chimiques ou biochimiques du sol, souvent sans démonstration rigoureuse. Dans ce travail, les techniques développées en sciences du végétal (culture in vitro, utilisation de mutants et transcriptomique) ont été utilisées afin de comprendre les mécanismes à l'origine de l'effet des vers de terre sur les plantes. Nos résultats apportent de nouvelles connaissances fondamentales: (1) la production de molécules-signal à l'intérieur des déjections de vers de terre a un impact significatif sur la croissance d'Oryza sativa et Lolium perenne. (2) Ces molécules agissent sur la voie de signalisation fortement liée à l'auxine, comme suggéré par l'effet significatif du ver de terre sur la croissance du double mutant d'A. thaliana aux1-7;axr4-2. (3) L'abondance de ces molécules-signal en présence de vers de terre pourrait être liée à la stimulation de certaines populations bactériennes capables de synthétiser de l'auxine. (4) Le ver de terre induit une accumulation de transcrits pour des gènes sous contrôle de l'acide jasmonique et de l'éthylène. Ces hormones sont notamment impliquées dans un mécanisme de résistance systémique induite (ISR), connu pour être induit par certaines rhizobactéries promotrices de la croissance des plantes. Enfin, (5) le piétin échaudage, maladie due à un champignon pathogène, déclenche chez le blé (Triticum aestivum) une réaction d'hypersensibilité et une modification de la signalisation hormonale, qui sont considérées comme des mécanismes de contrôle du métabolisme de la plante qui facilitent l'infection du pathogène. La sévérité de cette maladie est réduite en présence de vers de terre. La synthèse de ces résultats indique que les vers de terre, comme d'autres organismes du sol, modifient l'équilibre hormonal de la plante. L'homéostasie hormonale apparaît comme un élément incontournable pour prédire l'issue des interactions multiples que les plantes entretiennent avec les organismes du sol

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Verpraet, Jacques. "Localisation et caractérisation des isoformes de la Glucose 6-phosphate déshydrogénase chez l'Épicéa (Picea abies L. Karsten)." Nancy 1, 1996. http://www.theses.fr/1996NAN10274.

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Abstract:

La glucose 6-phosphate déshydrogénase catalyse la première réaction du cycle des pentoses phosphate. Elle est l'enzyme clé de cette voie métabolique. Lors de ce travail, une première étape a consisté à mettre au point le milieu permettant d'extraire l'enzyme des aiguilles d'épicéa. L’utilisation de nombreux protecteurs et de NADP+, stabilisant la protéine est indispensable. Chez les végétaux, l'enzyme est localisée dans le cytosol et dans le chloroplaste. Des chloroplastes d'aiguilles ont ainsi été séparés, puis la purification et la caractérisation des deux formes a été entreprise. Il a été possible de purifier les formes cytosolique (74 x) et chloroplastique (2 x). Le ph optimum de la forme cytosolique est large, de 7 a 10, alors qu'il est très aigu (ph 8,2) pour la forme chloroplastique. La forme cytosolique a beaucoup plus d'affinité pour le g6p et le NADP+ (140 et 13 m) que la forme chloroplastique (270 et 65 m). La forme cytosolique présente une coopérativité positive vis a vis du NADP+. Une approche de la régulation des deux formes a été entreprise. L’iso enzyme cytosolique est régulée par une retro inhibition du NADPH et par l'atp principalement. La forme chloroplastique (moins de 1% du total) est régulée par la lumière, via un phénomène redox mime par le DTT et probablement via un système d'accrochage et de relargage des membranes. L’influence de fortes concentrations en ozone et/ou en dioxyde de carbone a été étudiée. L’O3 provoque une forte augmentation de l'activité sans doute liée à la mise en place de systèmes de détoxification, et de systèmes de défense de la plante. Le CO2 stimule moins fortement l'activité de la G6PDH, qui semble participer à l'utilisation du surplus de photoassimilats produits. Par contre, le CO2 combine a l'O3 ne semble pas pouvoir diminuer efficacement l'impact négatif de l'O3 sur le métabolisme des plantes.

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Roscher, Albrecht. "Étude du métabolisme énergétique végétal par RMN d'échange chimique du 31P : développement et application de la technique 2D EXSY." Université Joseph Fourier (Grenoble ; 1971-2015), 1997. http://www.theses.fr/1997GRE10059.

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Abstract:

L'etude de l'echange chimique par resonance magnetique nucleaire (rmn) est un outil unique pour suivre in vivo des cinetiques enzymatiques a l'etat stationnaire. Nous proposons d'utiliser la spectroscopie d'echange bidimensionnelle (2d exsy) du 31p pour etudier le metabolisme energetique des pointes de racines de mais excisees et perfusees. Le systeme de perfusion utilise est decrit. Nous mesurons d'abord les vitesses de relaxation longitudinale des aimantations 31p in vivo, puisque l'exsy en depend de facon critique. Nous perfectionnons la methode de mesure, et nous montrons par des mesures precises comment elles dependent des parametres physiologiques (croissance, oxygenation, temperature). L'exsy 31p permet d'identifier 10 reactions enzymatiques unidirectionnelles : synthese d'atp par phosphorylation oxydative, hydrolyse d'atp, formation en deux etapes de phosphoenolpyruvate a partir de 3-phosphoglycerate lors de la glycolyse et vice versa, tous les echanges entre hexoses phosphate (uridinediphosphoglucose, glucose-1-phosphate, glucose-6-phosphate et fructose-6-phosphate) lors du metabolisme des sucres. Les parametres experimentaux sont optimises en fonction des vitesses de relaxation precedemment mesurees afin d'obtenir le meilleur rapport signal-sur-bruit : temps de melange, temps de repetition, effet noe1h-31p et filtrage adapte de la dimension indirecte pendant l'acquisition. Nous abordons la quantification des flux d'echange a partir de spectres exsy. Celle-ci necessite un developpement theorique de l'echange chimique hors-equilibre, mais en etat stationnaire avec un flux net, tel que nous l'observons in vivo. Nous utilisons des courbes de croissance pour verifier le modele et nous demontrons la possibilite de quantifier des echanges a partir d'un seul spectre en utilisant des parametres exterieurs (vitesses de relaxation ou aimantations a l'equilibre). Enfin, les resultats des mesures de flux d'echange chimique en fonction de parametres physiologiques (oxygenation, temperature) sont presentes et la question d'une enzymologie in vivo est discutee.

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Bittar, Eric. "Modèles déformables surfaciques, implicites et volumiques, pour l'imagerie médicale." Phd thesis, Grenoble 1, 1998. https://theses.hal.science/tel-00004869.

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Abstract:

Les progrès des dispositifs d'imagerie médicale permettent l'obtention d'images volumiques, qui contiennent une grande quantité d'information. Une approche efficace de traitement de ces images consiste à utiliser la connaissance a priori de la forme des objets à analyser, et à employer des méthodes intrinsèquement tridimensionnelles. Les modèles déformables répondent à ces deux critères. Nous proposons de formaliser les modèles déformables et leur évolution dans une image dite de données, en distinguant cinq composantes : caractéristiques de liaison, représentation géométrique, déformation, déformabilité, et contrôle. Nous décrivons trois modèles déformables. Nous employons le modèle surfacique des delta-snakes pour reconstruire des objets à partir de points répartis sur leur surface. Nous approximons cette surface par une carte de distance octree-spline. Nous avons mis au point des outils interactifs pour compléter des données manquantes ou déformer directement la surface. Nous proposons ensuite pour ce même type d'application un modèle implicite à base de primitives générant un champ potentiel local. Les primitives sont placées interactivement, ou automatiquement sélectionnées dans l'axe médian discret des données. L'optimisation des paramètres des primitives mène à une représentation compacte des objets. Nous reconstruisons par ces deux modèles des objets numérisés par des capteurs de distance ou segmentés dans des images volumiques. Notre dernier modèle est volumique. Sa déformation hiérarchique par un octree-spline minimise la distance généralisée entre ses caractéristiques et celles des données, sous le contrôle de l'algorithme de Levenberg-Marquardt, et dans les limites imposées par une fonction de régularisation. Nous avons établi un algorithme de calcul de distance généralisée itérée dans un arbre k-d. Nous appliquons ce modèle à la segmentation d'images volumiques. D'autres types d'applications ont également été réalisées.

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Cornel, Daniel. "Etude des propriétés électrophysiologiques des protoplastes et des vacuoles libres d'Acer Pseudoplatanus L." Paris 7, 1985. http://www.theses.fr/1985PA077112.

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Refeno, Germain. "Contribution a l'étude de la méristogénèse chez Vanilla planifolia Andr. (orchidée) et de ses applications." Strasbourg 1, 1986. http://www.theses.fr/1986STR13172.

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Abstract:

Mise au point de deux méthodes de multiplication végétative in vitro, à haut rendement : l'une à partir d'axilla foliaires de la liane, l'autre utilisant les bourgeons des extrémités des racines aériennes. Mise en évidence de potentialités, non réalisées dans les conditions normales, au niveau du méristème terminal des racines adventives

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Gueyrard, David. "Le couple glucosinolate-myrosinase : études et applications." Orléans, 2000. http://www.theses.fr/2000ORLE2042.

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Abstract:

Les glucosinolates sont des composés thio-B-D-glucopyranosiques anioniques de structure originale présents dans de nombreux végétaux de la famille des crucifères. Ils sont aisément hydrolisés par une enzyme appelée myrosinase (thioglucoside glucohydrolase E. C. 3. 2. 3. 1). Ce travail consiste en l'étude de ce couple enzyme-substrat à différents niveaux. Nous avons imaginé, synthétisé et évalué différents mimes de substrats (analogues C-glucosidiques, mime de la fonction thiohydroximate ou encore du groupement sulfate) pour apporter des informations supplémentaires sur le mécanisme moléculaire d'action de la myrosinase. Par ailleurs, nous avons engagé deux programmes de valorisation de végétaux contenant des glucosinolates. Tout d'abord, après l'isolement du glucosinolate issu de Moringa oleifera, arbre poussant dans les régions tropicales, nous en avons proposé une synthèse rapide et efficace. Cette voie a été étendue à la préparation d'analogues artificiels. D'après une étude préliminaire, le glucosinolate naturel et ses analogues glycosylés ont des propriétés protectrices potentielles vis-à-vis de l'inflammation. Le second projet engagé est un programme de valorisation non alimentaire de Crambe abyssinica, plante oléagineuse de la famille des Brassicacées. Nous avons décrit la préparation de synthons chiraux par hydrolyse enzymatique de l'epi-progoitrine, glucosinolate très majoritaire dans ce végétal. Selon ce procédé utilisant une myrosinase immobilisée sur nylon, il est notamment possible de préparer à l'échelle de plusieurs grammes la (5R)-5-vinyl-1,3-oxazolidine-2-thione. A partir de ce composé, nous avons engagé une large exploration chimique. Nous avons ouvert plusieurs pistes tant pour la synthèse de précurseurs chiraux de composés d'intérêt biologique que pour l'utilisation des 1,3-oxazolidine-2-thiones comme agents acylants ou comme copules homochirales en synthèse stéréocontrôlée.

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Ben, Driss Amraoui Mohammed. "Absorption, assimilation et transport de l'azote inorganique (NO : :(3-) et NH::(4+)) chez le hêtre (Fagus Sylvatica L.)." Nancy 1, 1988. http://www.theses.fr/1988NAN10075.

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Abstract:

Étude des mouvements d'azote entre les racines et les organes photosynthétiques. La fonction d'assimilation de NO::(3-) et de NH::(4+) est assurée par la racine mais la compartimentation cellulaire et le devenir des produits de l'assimilation primaire différents. En nutrition ammoniacale il existe un pool racinaire d'exportation de l'azote constitué essentiellement d'asparagine, arginine et glutamine, distinct du pool d'aminoacides de la racine. Au contraire, la nutrition nitrique entraîne une forte dépendance de la sève vis-à-vis d'une source d'azote réduit, préalablement stocké dans la racine

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Viaud-Massuard, Marie-Claude. "Synthèse de glucosinolates naturels et artificiels." Orléans, 1991. http://www.theses.fr/1991ORLE2057.

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Turbant, Amélie. "Modification des pectines et développement de la graine d'Arabidopsis thaliana." Amiens, 2014. http://www.theses.fr/2014AMIE0115.

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Abstract:

La paroi primaire des cellules végétales est composée majoritairement de polysaccharides, notamment de microfibrilles de cellulose et d'hémicelluloses maintenues dans une matrice de pectines (Cosgrove, 2001). Parmi ces dernières, les homogalacturonanes (HG) qui sont les plus abondants peuvent être modifiés par des enzymes pariétales à l'origine de changements de structure de la paroi (Yadav et al. , 2009). Les gènes codant certaines de ces enzymes sont exprimés dans la graine d'Arabidopsis thaliana, suggérant un rôle de celles-ci dans le développement de la graine. L'étude de mutants d'insertion obtenus pour certains de ces gènes a mis en évidence un rôle de la pectine méthylestérase 58 (PME58) dans la structuration du mucilage. Le mucilage est une matrice riche en pectines produite par les cellules épidermiques du tégument de la graine et libérée lors de leur imbibition. Notre étude a montré que la PME58 est impliquée dans la déméthylestérification des HG présents dans le mucilage, dont la majorité provient probablement de la fragmentation des parois primaires des cellules épidermiques lors de l'extrusion du mucilage. L'étude des mutants pme58 par des approches analytiques et par immunodétection a montré que la PME58 est impliquée dans la régulation de la structuration et de la cohésion du mucilage, via la modulation des interactions entre les composants pectiques et cellulosiques

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Perez-Guevara, Fermin. "Production de schizosaccharomyces pombe. Physiologie et paramètres de culture." Toulouse, INPT, 1992. http://www.theses.fr/1992INPT053G.

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Abstract:

Afin d'etablir les conditions les plus favorables pour la production de la levure schizosaccharomyces pombe, son comportement a basses concentrations en glucose a ete etudie. Les modeles proposes pour la croissance de cette levure ont ete compares aux donnees experimentales relevees dans la litterature. Cette analyse montre que l'hypothese de l'existence d'une limitation dans la capacite respiratoire de la levure doit etre retenue. Les modeles prevoient correctement le comportement de la levure dans les milieux synthetiques non limitants; par contre, la croissance dans des milieux complexes n'est pas bien representee. Aussi, l'effet de la composition du milieu en culture discontinue a ete etudie. Le rapport extrait de levure/sucre semble avoir un role determinant dans l'efficacite de la conversion du substrat en biomasse. Les experiences conduites en discontinu alimente confirment le role important de l'extrait de levure et la necessite d'un rapport equilibre avec le glucose. Sur ce milieu complexe, les caracteristiques de culture (rendement, vitesse) sont comparables a celles obtenues sur le milieu non limitant utilise au laboratoire, bien que les cinetiques soient differentes. Ainsi, l'utilisation de l'extrait de levure se justifie pour des milieux industriels economiques, sous reserve de garder un rapport equilibre avec le substrat carbone

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Martinez, Jacques. "Approche génétique et physiologique de la croissance et du développement à basse température chez quelques "Lycopersicon"." Montpellier 2, 1992. http://www.theses.fr/1992MON20234.

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Abstract:

Une variabilite genetique a ete revelee dans le genre lycopersicon pour la croissance et le developpement a basses temperatures au stade jeune plant. Les ecotypes la 1777 et pi 127832 de l. Peruvianum presentent un bon niveau de performance pour les caracteres de croissance et de developpement a 10c en chambre climatisee. Dans ces conditions, certaines varietes de l. Esculentum dont pi 174263 et pi 120256 ont un developpement rapide. Il n'a pas ete possible de conclure definitivement a une meilleure stabilite des ecotypes sauvages face aux variations de temperatures. Les racines de la 1777 sont moins sensibles au froid et cette moindre sensibilite est favorable a la croissance de la partie aerienne. La mesure de l'absorption d'eau et/ou l'estimation visuelle de la masse racinaire doivent etre retenues comme criteres de selection. La mesure de la fluorescence variable de la chlorophylle et le dosage des chlorophylles n'ont pas pu etre utilises comme criteres de selection. L'ecotype la 1777 ne peut pas constituer un ideotype physiologique puisque certaines de ses adaptations sont de type extensif. L'etude, a basse temperature de disjonctions aux niveaux f2 et f3, montre que les caracteres, hauteur de la plante, poids de matiere seche et nombre de feuilles produites au froid sont transmissibles et peuvent etre selectionnes. Lorsque le froid est applique a toute la plante, la croissance du systeme racinaire est tres correlee au poids de matiere seche de la partie aerienne. Il n'apparait pas de relation entre racine et croissance en chauteur. Les coefficients de piste sont utilises pour decrire l'ensemble des correlations observees entre les caracteres a basse temperature dans les familles f3 selectionnees

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Herman, Jean-Paul. "Greffes intracérébrales de neurones dopaminergiques : effets comportementaux, physiologie et développement." Bordeaux 2, 1988. http://www.theses.fr/1988BOR22024.

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Garcia, Darras Carolina. "Conception et développement d'un microcalorimètre pour l'étude de l'oxydation d'une huile végétale." Thesis, Bordeaux 1, 2012. http://www.theses.fr/2012BOR14517/document.

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Abstract:

L’oxydation des lipides est un phénomène complexe qui génère de nombreux produits qu’il est nécessaire de caractériser de manière précise afin de prévenir leur apparition. Parmi les méthodes pour analyser les produits d’oxydation, l’analyse thermique différentielle, basée sur la mesure différentielle du flux de chaleur dissipé au cours des réactions d’oxydation, est intéressante car elle n’utilise pas de solvant organique. De plus, elle peut être corrélée à l’apparition de produits primaires ou secondaires d’oxydation. Dans ce contexte, nous avons conçu et développé un microcalorimètre basé sur le principe de l’analyse thermique différentielle mais plus adaptable dans la mesure où il permet l’analyse de plusieurs échantillons simultanément dans des coupelles d’analyse de dimensions variables (variation du rapport surface/volume en relation avec les phénomène de diffusion de l’oxygène). Pour le développement du microcalorimètre, les thermopiles sont utilisées dans la configuration adiabatique. Le système de mesure des flux est stable et possède une sensibilité élevée. La validation de la méthode est réalisée par effet Joule et par comparaison des points de fusion de paraffines en calorimétrie différentielle classique. La modélisation des réactions d’oxydation est réalisée afin de mettre en évidence l’influence de l’oxygène sur les cinétiques. Pour une huile riche en acides gras polyinsaturés (huile de cameline), l’enthalpie de la réaction d’oxydation (en début de cinétique) obtenue en condition isotherme (100°C) est corrélée avec la mesure des diènes conjugués (produits primaires d’oxydation). Dans l’ensemble, le microcalorimètre développé est suffisamment sensible et fiable pour mesurer les enthalpies de réactions d’oxydation des lipides des huiles alimentaires
Lipid oxidation results of many reactions generating numerous oxidation products that are worth characterizing in fats and oils. Among the analysis methods available, differential scanning calorimetry, based on the differential measurement of heat flux dissipated during the oxidation reactions, is convenient because it avoids the use of organic solvents. In this context, we have conceived and developed a microcalorimeter that allows the analysis of up to 5 samples simultaneously, in containers of variable sizes (allowing to vary the surface/volume ratio). For the conception of the microcalorimeter, the thermopiles are used in adiabatic configuration. The system is very stable and allowed flux measurement with a high sensitivity. The validation of the method is performed by Joule effect and by comparison of melting points of paraffins with classical differential scanning calorimetry. The modelization of the oxidation reaction is performed to point out the influence of oxygen on the kinetics. For a polyunsaturated oil (cameline oil), the enthalpy values obtained, at the beginning of the oxidation process, under isothermal condition (100°C) are correlated with the diene conjugated hydroperoxide amount. On the whole, the developed device provided an adaptable, sensitive, solvent-free and low cost method for the measurement of lipid oxidation, particularly suitable for the fast screening of a large set of samples

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Nehr, Zofia. "Analyse génétique et fonctionnelle du mutant de morphogenèse étoile de l'algue brune ectocarpus siliculosus." Paris 6, 2013. http://www.theses.fr/2013PA066766.

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Abstract:

Les Phaeophyceae ont acquis la multicellularité indépendamment des autres lignées multicellulaires, elles offrent donc la possibilité d’étudier des mécanismes de développement nouveaux et originaux. Ectocarpus siliculosus est l’espèce modèle pour les algues brunes, et les étapes de développement du sporophyte ont été décrites précisément. Pour comprendre leurs bases génétiques et moléculaires, une approche de génétique directe a été adoptée. Le mutant étoile est le premier mutant de morphogenèse décrit de manière exhaustive, sa mutation, simple locus et récessive, découple le tempo et la position de ramification en raison d’un défaut de différenciation cellulaire qui conduit à la sur-ramification. Le rhizoïde du gamétophyte est lui aussi affecté, il rappelle le phénotype du sporophyte. Les deux phénotypes semblent génétiquement liés, et il est probable qu’ils soient dus à la mutation etl. Le locus ETL a été identifié par une approche de clonage positionnel. Le génome du mutant étoile a été séquencé (illumina) ce qui a permis par comparaison avec le génome du sauvage de prédire les mutations candidates dans le locus ETL. La seule mutation non-silencieuse affecte une protéine avec deux domaines fonctionnels : un domaine BAR/IMD et un domaine RhoGAP. Les domaines BAR sont impliqués dans la reconnaissance des membranes et sont capables d’inhiber les domaines RhoGAP qui sont des régulateurs des RhoGTPases. Ce gène s’exprimant dans les cellules apicales du filament de l’algue, il pourrait maintenir la croissance apicale polarisée par l’interaction, aux apex, entre ses deux domaines protéique. Le gène ETL est le premier gène de morphogenèse cloné chez E. Siliculosus, il ouvre d’immenses perspectives en terme de caractérisation fonctionnelle et d’approches « evo-devo »
Multicellularity has occurred independently in Phaeophyceae and in other multicellular lineages. Therefore these organisms offer the opportunity to study novel and alternative developmental processes. Ectocarpus siliculosus is the model species for brown algae and the development of its early sporophyte has been described precisely. To understand the genetic and molecular basis of this development, a forward genetic approach has been carried out. The mutant étoile is the first morphogenetics mutant exhaustively described. Its single locus and recessive mutation, leads to a defect in cell differentiation that decouples branching tempo and position leading to a hyperbranched phenotype. Gametophyte rhizoïde is modifoed as well, it resembles the étoile early sporophyt phenotype. The two phenotypes are genetically linked and thought to be induced by the etl mutation. The ETL locus has been identified by a map-based approach. The illumina sequencing of the mutant genome allowed to propose candidate mutations. The only non-silent mutation affects a protein with two functional domains: a BAR/IMD domain and RhoGAP domain. BAR/IMD domains can recognize lipid membranes and are able to inhibit RhoGAP domains which are regulators for RhoGTPases. As ETL is expressed in the filamentous apical cells, it could maintain tip-growth in the apices through interaction between its two domains. ETL gene is the first morphogenetic gene that has been cloned, and hence it opens hudge perspectives for functional characterization and evo-devo studies

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Vital-Durand, François. "Le système visuel du singe : anatomie, physiologie, développement et manipulations précoces." Lyon 1, 1986. http://www.theses.fr/1986LYO19008.

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Badot, Pierre-Marie. "Approche cellulaire du mécanisme du mouvement révolutif des tiges volubiles : Étude de quelques paramètres physico-chimiques." Besançon, 1987. http://www.theses.fr/1987BESA2032.

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Abstract:

Le mouvement révolutif serait la conséquence du déplacement circulaire d'une onde d'enrichissement en potassium qui induit avec un certain déphasage une onde de turgescence. Le mouvement serait donc le résultat d'un processus cellulaire marqué par un déséquilibre hydrique constamment entretenu

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Brand, Débora. "Physiologie de croissance et de sporulation des champignons nématophages cultivés en milieu solide." Aix-Marseille 1, 2006. http://theses.univ-amu.fr.lama.univ-amu.fr/2006AIX11039.pdf.

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Abstract:

L'objectif de ce travail a été d'étudier l'utilisation de sous-produits agricoles comme substrat de faible coût pour la production de spores de champignons filamenteux nématophages en fermentation en milieu solide (EMS) et vérification de la virulence des produits fermentés. La physiologie de la croissance et de la sporulation de champignons nématophages des genres paecilomyces et verticillium ont été étudiées. Trois milieux de culture géloses ont été utilisés pour déterminer la vitesse de croissance apicale et la production de biomasse. Les cinétiques de sporulation de ces souches ont été suivies en FMS, dans un sporulateur à disques et en flacons Erlenmeyer. Plusieurs résidus agricoles comme la bagasse de manioc ou celle de canne à sucre, le tourteau dégraissé de soja, et également les déchets de crevettes, ont été utilisés seuls ou en combinaison, pour la production de spores de P. Lilacinus LPB-PL-01. Ces substrats ont été choisis selon leur respective composition, de manière à donner un produit final virulent avec une quantité importante de spores. Le produit fermenté choisi a été constitué de coques de café et de tourteau dégraissé de soja (1:1). L'influence de la quantité de produit fermenté inoculé en plants de tomates contaminés avec M. Incognita race 1 a été vérifié : 0,175 % du produit entraine une réduction de 98 % du nombre de femelles de ce nématode et sans nuire le système racinaire. Le produit final a été séché avec la circulation d'air en différentes températures : température ambiante, 28° , 32°et 35°C. L'effet du traitement de séchage sur la viabilité des spores a été déterminé jusqu'à 150 jours de stockage

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Blondelle, Jordan. "Rôle de Hacd1 dans le développement et la physiologie des cellules musculaires." Paris 6, 2013. http://www.theses.fr/2013PA066261.

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Abstract:

Chez l’Homme et l’animal, les myopathies centronucléaires (CNMs) sont caractérisées par faiblesse musculaire et une hypotrophie des myofibres. Chez le Labrador retriever, une mutation dans le gène HACD1/PTPLA, codant une 3-hydroxyacyl-CoA déshydratase impliquée dans l’élongation des acides gras à très longue chaîne (AGTLC, C≥18), conduit à une CNM. Ce travail a consisté à caractériser le rôle de HACD1 dans le développement et la physiologie musculaires. Notre étude réalisée sur des cellules déficientes pour HACD1 a montré que l’activité enzymatique de HACD1 était nécessaire à la fusion des myoblastes lors de la différenciation musculaire, via la régulation de l’équilibre lipidique et de la fluidité de la membrane. Chez les chiens atteints de CNM, l’absence de HACD1 entraînait une diminution du diamètre des fibres musculaires ainsi que des anomalies de régénération musculaire suggérant que le défaut de fusion contribue à l'hypotrophie des myofibres. Par ailleurs, les souris mutées pour Hacd1 développaient des défauts du métabolisme glucidique ainsi que des défauts de l’activité rétinienne, révélant ainsi deux nouveaux rôles à l’échelle de l’organisme pour HACD1
Human and animal centronuclear myopathies (CNMs) are characterized by muscle weakness and myofiber hypotrophy. In Labrador retriever, a mutation in HACD1/PTPLA gene, encoding a 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase involved in very long chain fatty acid elongation (C≥18), leads to a CNM. This work aimed at characterizing the function of HACD1 in muscle development and physiology. Using HACD1-deficient cells, we show that HACD activity was necessary for myoblast fusion during muscle differentiation through the regulation of lipid balance and membrane fluidity. In CNM-affected dogs, the absence of HACD1 led to a decrease in myofiber diameter and an impairment in muscle regeneration. This result suggests that a fusion defect may participate to myofiber hypotrophy. Moreover, Hacd1-deficient mice developed troubles in glucose metabolism and retina function, thus revealing new roles for HACD1 at the organism level

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Robert, Christine. "Le brunissement enzymatique chez le palmiste rouge des Bas (Acanthophoenix rubra) : purification et caractérisation du système polyphénoloxydasique." La Réunion, 1995. http://elgebar.univ-reunion.fr/login?url=http://thesesenligne.univ.run/95_S002_Robert.pdf.

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Abstract:

L'objectif de ce travail était l'étude du système polyphénoloxydasique du palmiste rouge des bas (Acanthophoenix Rubra) responsable du brunissement enzymatique de ce végétal. Pour cela, nous avons été amené à purifier la polyphénoloxydase, principale enzyme impliquée dans ces réactions d'oxydations. Le protocole de purification que nous avons mis au point fait intervenir une chromatographie d'hydrophobicité, une chromatographie d'échange d'ions et un tamisage moléculaire. Nous avons, grâce à ce protocole, différencié deux isoformes majoritaires. Celles-ci présentent un point isoélectrique et un poids moléculaire très proches. Elles se différencient par leur comportement au cours de la chromatographie d'interactions hydrophobes. Nous avons réalisé diverses études cinétiques permettant de préciser la spécificité de la PPO vis à vis de 9 substrats phénoliques. La meilleure efficacité catalytique a été observée pour le 4-Méthylcatechol. Les valeurs des Km des substrats dépendent de leur structure. Une étude plus précise de l'effet du PH sur les paramètres Km et Vm a été menée dans le cas du 4-Methylcatechol, l'acide chlorogénique, la (+)-catéchine et l'acide caféique. L'étude de la dénaturation thermique de la PPO de palmiste a permis de mettre en évidence un mécanisme d'inhibition à deux étapes, avec passage par un intermédiaire plus stable selon le schéma: N ý X ý D. Un mécanisme d'inhibition analogue à également été démontré dans le cas de l'action directe de la L-Cystéine sur la PPO. Les conditions d'inhibition du brunissement enzymatique par des composés réducteurs, des halogénures et des acides carboxyliques ont été étudiées. Des inhibitions compétitives, non-compétitives et mixtes ont été observées. Le fluorure de sodium et l'acide cinnamique se sont révélés les meilleurs inhibiteurs de la PPO de palmiste. L'effet du PH sur l'inhibition provoquée par les halogénures et les acides carboxyliques de molécules a montré une amélioration de l'inhibition aux PH acides. Enfin, l'analyse de la composition en phénols du palmiste a permis de montrer la teneur élevée en acide chlorogénique et en Catéchines, substrats phénoliques responsables en premier lieu du brunissement enzymatique.

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Louvet, Romain. "Approches biochimique et moléculaire du développement de la silique chez Arabidopsis thaliana (L. ) : Régulation et fonctions des Pectine MéthylEstérases." Amiens, 2008. http://www.theses.fr/2008AMIE0109.

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Abstract:

La paroi végétale est composée de polymères complexes de nature protéique, phénolique et polysaccharidique. Ces derniers se répartissent en trois catégories, les celluloses, les hémicelluloses et les pectines. Les homogalacturonanes (HG), composant majeurs des pectines, peuvent être déméthylestérifiés par des enzymes pariétales, les pectine méthylestérases (PMEs, E. C. 3. 1. 1. 11), qui constituent, chez Arabidopsis thaliana une famille multigénique de 66 membres. Au cours de cette étude, nous avons analysé de manière quantitative et qualitative les modifications des composés polysaccharidiques pariétaux au cours du développement de la silique chez Arabidopsis. La maturation de la silique se caractérise notamment par une diminution du degré de méthylestérification des HG et une augmentation de l’activité PME, ce qui nous a conduit à quantifier par RT-qPCR l’expression des 66 gènes codant ces enzymes putatives lors de ce processus de développement. Ceci a permis de mettre en évidence cinq groupes d'expression, et d'isoler plusieurs gènes présentant un profil intéressant sur lesquels la localisation tissulaire de l’expression a été réalisée grâce à des constructions entre leur promoteur et le gène codant la β-glucuronidase. Parmi ceux–ci, le gène At5g47500 est exprimé dans le méristème apical caulinaire et coexprimé dans de nombreux tissus avec le gène At5g20740 codant un inhibiteur de PME putatif. Une approche du rôle de AT5G47500 dans le fonctionnement du méristème a été menée, permettant de montrer que cette protéine joue effectivement un rôle dans le contrôle du degré de méthylestérification des pectines de celui-ci. La modification de la structure pariétale pourrait participer à l'émergence des primordia
Plant cell wall is a complex network which consists of phenolic, proteic and polysaccharadic compounds. The latter comprises notably cellulose, hemicelluloses and pectins. Homogalacturonans, which are one of the main pectic compounds, can be demethylesterified by cell wall bases enzymes, pectin methylesterases (PMEs, EC 3. 1. 1. 11), a multigenic family of 66 members in Arabidopsis thaliana. In this study, we have quantitatively and qualitatively analysed the cell wall polysaccharides composition during silique development in Arabidopsis. The decrease in the degree of methylesterification of homogalacturonan and the increase of total PME activity during silique maturation has lead us to investigate the variation in the expression of the 66 PMEs genes, using RT-qPCR, during this developmental process. Our results showed that PME gene expression can be clustered into five groups, and allowed some gene of interest to be chosen for further analysis. For several candidates, the precise tissue localization was realised using promoter::GUS fusions. This showed that one PME gene, At5g47500, is expressed in the shoot apical meristem and is coexpressed in many tissues with the At5g20740 gene, which encodes a putative PME inhibitor. A functional genomic approach showed that the function of AT5G47500 might be related to the fine tuning of the degree of methylesterification in meristematic tissues, which could play a role in the changes in cell wall structure leading to primordia emergence

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Vandecasteele, Guénin Stéphanie. "Rôle des pectines méthylestérases dans la régulation de l'élongation de l'hypocotyle et de la rhizogenèse adventive chez Arabidopsis thaliana." Amiens, 2013. http://www.theses.fr/2013AMIE0104.

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Abstract:

Chez les plantes, la paroi primaire est composée d'un réseau de cellulose et d'hémicellulose dans une matrice pectique et protéique. Les homogalacturonanes (HG), composants majeurs des pectines, peuvent être déméthylestérifiés par des enzymes pariétales, les pectines méthylestérases (PME, EC 3. 1. 1. 11), qui constituent chez Arabidopsis une famille multigénique de 66 membres. Elles jouent un rôle très important dans le remodelage de la paroi. Le but de l'étude était de caractériser la fonction de deux gènes PME, PME36 et PME3 qui ont des expressions bien distinctes ; PME36 est exprimé pendant la maturation de la silique, la graine mature et les premiers stades de germination tandis que le gène PME3 est exprimé de manière ubiquitaire dans les tissus vasculaires. Nous avons montré qu'une diminution de l'activité PME totale chez le mutant pme3 entraîne une augmentation du DM et du nombre de RA sur l'hypocotyle [1]. D'autre part, dans le mutant pme36, l'activité PME totale augmente jusqu'à 48H de germination à l'obscurité entraînant une baisse du DM des pectines et du nombre de RA dans ce mutant. Ceci confirme une corrélation positive entre DM et rhizogenèse adventive. Ces résultats mettent en lumière également l'existence d'un mécanisme de surcompensation en l'absence de la protéine PME36 dans les hypocotyles de pme36. Nous avons mis en évidence que ce système de surcompensation implique une régulation transcriptionnelle des gènes PME surexprimés dans l'hypocotyle de pme36. De plus, en regardant les niveaux d'hormones et l'expression des gènes impliqués dans les voies de signalisation hormonale contrôlant la rhizogenèse adventive, nous avons montré une forte altération dans l'homéostasie des hormones dans les hypocotyles de pme36. L'ensemble des résultats indique que la rhizogenèse adventive et l'élongation de l'hypocotyle sont contrôlés par un réseau de régulation impliquant la signalisation hormonale et l'activité PME, modulé par un mécanisme de compensation déclenché par des variations de DM des pectines
In plants, the primary cell wall consists of a network of cellulose microfibrils and xyloglucan cross-links embedded in a complex pectic and protein matrix. Homogalacturonans, which are one of the main pectic compounds, can be demethylesterified by cell wall bases enzymes, pectin methylesterases (PME, EC 3. 1. 1. 11), a multigenic family of 66 members in Arabidopsis. Thus, PMEs are likely to play major roles in pectin remodelling in muro. Our work aims at characterizing the function of two genes coding pectin methylesterase that was shown to be expressed during seed maturation and in the early stages of germination for PME36 gene while PME3 gene is expressed ubiquitously in the vascular tissues. We showed that the decreased PME activity in Arabidopsis pme3 mutant led to increase the degree of methylesterification (DM) of pectins as well as the adventitious root formation in hypocotyl [1]. Unexpectedly, 48 hours after germination, PME activity in dark-grown hypocotyls of pme36 was higher than in the wild-type. This led to a decrease in the DM of pectins and in the number of adventitious roots in the mutant. While confirming the positive correlation between DM of pectins and adventitious rooting, these results highlight the existence of a mechanism overcompensating the absence of the PME36 protein in pme36 hypocotyls. We found that this compensatory mechanism involved transcriptional regulation, i. E. Other PME genes being overexpressed in pme36 hypocotyl. In addition, looking at hormone content and assessing the expression of genes involved in the hormone signaling pathways shown to control adventitious rooting, we found a strong alteration in hormone homeostasis in pme36 hypocotyls. Taken together these results suggest that adventitious rooting and hypocotyl elongation are controlled by a regulatory network involving crosstalk between hormone signaling and PME activity, which is modulated through a compensatory mechanism triggered by variations in DM of pectins

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Bittar, Eric. "Modèles déformables surfaciques, implicites et volumiques, pour l'imagerie médicale." Phd thesis, Université Joseph Fourier (Grenoble), 1998. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00004869.

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Abstract:

Les progrès des dispositifs d'imagerie médicale permettent l'obtention d'images volumiques, qui contiennent une grande quantité d'information. Une approche efficace de traitement de ces images consiste à utiliser la connaissance a priori de la forme des objets à analyser, et à employer des méthodes intrinsèquement tridimensionnelles. Les modèles déformables répondent à ces deux critères. Nous proposons de formaliser les modèles déformables et leur évolution dans une image dite de données, en distinguant cinq composantes : caractéristiques de liaison, représentation géométrique, déformation, déformabilité, et contrôle. Nous décrivons trois modèles déformables. Nous employons le modèle surfacique des delta-snakes pour reconstruire des objets à partir de points répartis sur leur surface. Nous approximons cette surface par une carte de distance octree-spline. Nous avons mis au point des outils interactifs pour compléter des données manquantes ou déformer directement la surface. Nous proposons ensuite pour ce même type d'application un modèle implicite à base de primitives générant un champ potentiel local. Les primitives sont placées interactivement, ou automatiquement sélectionnées dans l'axe médian discret des données. L'optimisation des paramètres des primitives mène à une représentation compacte des objets. Nous reconstruisons par ces deux modèles des objets numérisés par des capteurs de distance ou segmentés dans des images volumiques. Notre dernier modèle est volumique. Sa déformation hiérarchique par un octree-spline minimise la distance généralisée entre ses caractéristiques et celles des données, sous le contrôle de l'algorithme de Levenberg-Marquardt, et dans les limites imposées par une fonction de régularisation. Nous avons établi un algorithme de calcul de distance généralisée itérée dans un arbre k-d. Nous appliquons ce modèle à la segmentation d'images volumiques. D'autres types d'applications ont également été réalisées.

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Betron, Cyrille. "Développement et fonctionnalisation d'huiles végétales pour la plastification et la réticulation d'élastomères." Thesis, Lyon, 2016. http://www.theses.fr/2016LYSE1054/document.

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Abstract:

L'objectif de ces travaux de thèse consiste à étudier la faisabilité du remplacement des huiles issues des ressources fossiles par des huiles végétales dans des matrices polymères. La première partie étudie la diffusion des huiles dans les matrices EPDM et PVC, en confrontant le modèle théorique des paramètres de solubilités de Hansen à des tests de diffusions suivis par rhéologie. Les résultats ont été analysés afin de mettre en évidence les avantages et les faiblesses de ce type de modèle. Dans un second temps, nous avons formulé une matrice élastomère en utilisant des plastifiants à base d'huiles végétales et vérifié avec différents tests l'efficacité de ces plastifiants. Les résultats ont mis en évidence des problèmes d'incompatibilité entre la matrice EPDM et les huiles agrosourcées. Une méthode de modification in situ a donc été utilisée sur de l'huile de Tung afin de fixer l'huile végétale dans la matrice. Enfin dans une dernière partie nous avons apporté différentes propriétés de réticulations à l'huile de Tung. Nous avons développé deux systèmes de réticulations basés sur des molécules di-fonctionnelles, le 2-furanmethanethiol et le 3-mercaptopropyltriethoxysilane. Au cours d'un procédé continu de mélangeage, nous avons greffé le 2-furanmethanethiol sur la matrice et sur l'huile végétale grâce à une réaction thiol-ène et une réaction de Diels-Alder, ce qui nous a permis de réticuler le système. Nous avons également étudié une autre molécule capable de créer des noeuds siloxanes à partir de réactions d'hydrolyse-condensations de fonctions alkoxysilanes après greffage sur la matrice EPDM et sur l'huile par réaction thiolène. Les résultats obtenus ont montré des propriétés similaires à un système de réticulation classique avec du dicumyl peroxide (DCP)
The aim of the thesis is to study the feasibility of replacing the fossil oils by vegetable oils in polymer matrices.The first section discusses the diffusion of oil in EPDM and PVC matrices. This study was carried out by confronting the theoretical model of the Hansen solubility parameters to experiment rheology tests. The results were analyzed to highlight the strengths and weaknesses of this model.In second part, we used an elastomer formulation based on vegetable oils plasticizers. The effectiveness of these plasticizers has been verified using different tests. The results showed the problems of incompatibility between the EPDM matrix and the bio-based oils. In situ modification method was therefore used on Tung oil to fix the vegetable oil into the matrix.Finally, in a last part we studied different properties of the crosslinked material. We have developed two crosslinking systems based on di-functional molecules, the 2-furanmethanethiol and 3-mercaptopropyltriethoxysilane

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Wehrkamp-Richter, Sophie. "Développement d'outils pour mesurer et augmenter les fréquences de recombinaison chez le maïs et Arabidopsis thaliana." Clermont-Ferrand 2, 2008. http://www.theses.fr/2008CLF21896.

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Abstract:

L'objectif de ce travail de thèse était de développer des outils pour mesurer et augmenter les fréquences de recombinaison chez une plante d'intérêt agronomique, le maïs. La plante modèle Arabidopsis thaliana a été également utilisée pour valider plus rapidement les vecteurs développés. Différents construits rapporteurs ont été testés dans ce but : le rapporteur pPNP et un rapporteur GUS/GFP qui permet de distinguer les mécanismes de recombinaison homologue et illégitime. La capacité de détection de ces deux mécanismes a été validée à la fois chez A. Thaliana et le maïs. Les fréquences de recombinaison ont été augmentées en créant des cassures double brin (CDB) grâce à la méganucléase de levure I-Scel. Une augmentation de la RH a été obtenue chez A. Thaliana, par expression du gène I-Scel mais pas chez le maïs. En effet, il est mal exprimé dans cette plante, ainsi une version du gène optimisée pour l'expression chez le maïs a été utilisée. Ces travaux constituent une première approche, pour réaliser à terme, du ciblage de gène par recombinaison homologue chez le maïs

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Evrard, Adeline. "Développements de la spectroscopie RMN en biologie structurale et métabolique : études de la protéine SiR-FP60 et du métabolisme végétal." Université Joseph Fourier (Grenoble), 1999. http://www.theses.fr/1999GRE10070.

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Abstract:

Ce travail se divise en deux parties distinctes, rmn structurale a une dimension et rmn metabolique a une et deux dimensions. Dans une premiere partie, une analyse quantitative de spectres phosphores de la proteine sir-fp60 native et dans des etats redox connus nous a permis d'ebaucher une structure du site actif de la nadp sulfite reductase (sir). Dans une deuxieme partie, la quantification des spectres d'extraits acides cellulaires de pointes de racines de mais excisees et l'analyse quantitative d'experiences in-vivo nous ont permis d'etudier le signal-sucre et la transition normoxie-anoxie chez les cellules vegetales. Nous avons confirme le role actif des hexokinases dans la reponse adaptative des pointes de racines de mais au manque de substrats carbones exogenes. Nous avons egalement decrit un systeme experimental pour l'utilisation d'un tube rmn de diametre 5 mm. Ce systeme nous a permis d'isoler completement les resonances du lactate, de l'alanine et des lipides qui ont des frequences de resonance proton trop proches a une dimension pour etre totalement separees. Les milieux interne et externe ont ete analyses par spectroscopie proton a une dimension pour suivre la transition brutale vers l'anoxie. Les experiences rmn a deux dimensions se sont revelees indispensables pour l'identification de metabolites dans des extraits acellulaires (cas du glucose-1-phosphate ou du lactate par exemple). Dans une troisieme partie, les proprietes des sequences 2d utilisables in-vivo ont ete analysees et, nous avons montre l'interet de la sequence coloc pour la mesure de la variation de quantite de glucose-1-phosphate, impossible par rmn a une dimension.

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Ravaz, Nathalie. "Croissance de populations levuriennes mixtes : effet Killer : analyse et modélisation." Toulouse, INPT, 1992. http://www.theses.fr/1992INPT058G.

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Abstract:

Ce travail porte sur l'etude de populations levuriennes constituees de souches differentes. Il a pour objectif d'analyser les interactions entre ces souches, et de proposer un modele qui represente ces interactions. Une premiere partie developpe la methodologie mise en uvre, et en particulier, les problemes poses par l'identification de souches differentes sont analyses. Un modele d'etude est constitue par un couple levure killer/levure sensible. Des cultures avec differents pourcentages initiaux des deux souches ont ete realisees, et l'effet killer analyse du point de vue cinetique et qualitatif. Les observations physiologiques effectuees ont permis de proposer un modele mathematique traduisant l'effet killer. Ce modele simule convenablement le comportement de la souche sensible soumise a un effet killer; son extension a d'autres situations est discutee. Ce travail presente un double interet: un interet fondamental, puisqu'une meilleure connaissance des interactions permettra une meilleure comprehension de l'ecologie des levures, et un interet industriel par son application aux problemes d'implantation de souches dans des milieux non steriles, cas typique en oenologie

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Had, Laurence. "Tropomyosines et développement du système nerveux." Montpellier 2, 1994. http://www.theses.fr/1994MON20051.

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Abstract:

Dans le systeme nerveux du rat, de nombreuses isoformes de tropomyosine, proteine qui stabilise les microfilaments d'actine, ont ete caracterisees au niveau de leur messager. Nous avons montre, par northern blot d'arn extraits de cultures pures, la presence d'un equipement en tropomyosine particulier dans chaque type de cellule du systeme nerveux, neurone (tm-4, tmbr-3), astrocyte (tm-4, tm-1, tm-2, tm-5a, tmbr-1 et tmbr-2) et oligodendrocyte (tm-4, tmbr-2). L'expression de ces isoformes est regulee de facon differentielle pendant la maturation. Dans les neurones, in vitro comme in vivo, tm-4 est surtout exprimee au cours des stades immatures, tmbr-3 est caracteristique des neurones differencies. Le dibutyryl-ampc et la cytochalasine d, qui induisent sur les astrocytes en culture une reorganisation du cytosquelette d'actine et un changement de la morphologie vers une forme etoilee, modifient fortement la concentration du messager de l'actine-beta et des 6 messagers de tropomyosine. Le dibutyryl-ampc reprime et la cytochalasine d stimule l'expression de l'ensemble de ces messagers. La coexpression des tropomyosines et de l'actine-beta semble indiquer une regulation parallele ou sequentielle de l'expression des proteines constitutives des microfilaments. Un antipeptide dirige contre tm-4 montre dans les neurones en culture un marquage des cones de croissance et dans le systeme nerveux du jeune rat un marquage transitoire des neurites. Chez l'animal mature, les terminaisons post-synaptiques sont marquees. Un antipeptide anti-tmbr-3 marque, au contraire, les terminaisons pre-synaptiques. Tm-4 interviendrait dans la poussee des prolongements neuronaux et, peut etre, dans les phenomenes de plasticite chez l'adulte. Tmbr-3 pourrait jouer un role dans le maintien des neurones dans leur forme mature et dans la liberation des neurotransmetteurs

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Ponomarenko, Alexandre. "Ecoulements critiques et plantes." Phd thesis, Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00833463.

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Abstract:

Dans cette thèse de physique appliquée à la physiologie végétale nous nous intéressons à deux phénomènes liés aux plantes. L'ascension capillaire dans des coins et la verse des céréales et des arbres. Lorsque les plantes sont soumises à de forts stress hydriques, des bulles de gaz apparaissent dans leur sève, c'est l'embolie. Il y a des situations avec interfaces sève/air dans les plantes. De plus nous observons sur les coupes anatomiques des plantes des géométries en forme de coin. Ces géométries et la présence d'interfaces liquide/vapeur permettraient l'ascension capillaire de la sève. Ceci pourrait réparer les embolies soit en remplissant les vaisseaux qui se sont vidés de leur sève, soit en assurant un flux de sève de secours, le temps que de nouveaux vaisseaux remplis de sève soient formés. Nous avons caractérisé la dynamique de l'ascension capillaire dans des géométries en forme de coin et nous l'avons appliquée à l'ascension capillaire dans des rameaux embolisés. La verse est la chute des plantes, elle est causée entre autre par le vent. Elle apparaît tous les ans dans les champs de céréales, détruisant en moyenne 30% des récoltes. Les forêts en sont aussi victimes lors des grandes tempêtes, on pense à Lothar et Martin en 1999 et Klaus en 2009 pour la France. La comparaison entre la vitesse des vents et le pourcentage d'arbres cassés indique une vitesse critique de 150 km/h pour laquelle presque tous les arbres sont détruits. En nous intéressant aux effets de la géométrie des plantes et à leur caractère fragile nous avons déterminé des critères de rupture et notamment retrouvé une vitesse critique proche de 150 km/h pour laquelle les arbres sont versés

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Rao, Hongwei. "Développement postnatal des centres végétatifs bulbaires : synaptogénèse et maturation de la neurotransmission glutamatergique : étude neuroanatomique chez le rat." Aix-Marseille 3, 1996. http://www.theses.fr/1996AIX30029.

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Abstract:

Le noyau du tractus solitaire (nts) et la formation reticulee ventrolaterale (rvl), sont deux regions bulbaires impliquees dans le controle des fonctions vegetatives. Nous avons analyse, chez le rat, certains aspects du developpement postnatal de ces regions. Nous avons dans un premier temps etudie les recepteurs au glutamate du nts et de la rvl en utilisant les techniques de binding sur coupes de bulbe rachidien. Les resultats obtenus montrent une augmentation du nombre de recepteurs et une diminution de leur affinite au cours du developpement postnatal. Puis, nous avons etudie dans les memes regions, la mise en place des terminaisons presynaptiques par immunohistochimie de la synaptophysine et de la gap-43. On observe, entre la naissance et l'age adulte, une augmentation considerable de l'immunomarquage a la synaptophysine accompagnee par une diminution de l'immunoreactivite a la gap-43. Ces resultats indiquent que la majorite des synapses presentes chez l'adulte, dans le nts et la rvl, seraient en fait formees en periode postnatale et qu'une partie de ces synapses, mises en place tardivement, seraient des synapses glutamatergiques

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Moncousin, Charles. "Évolution de l'AIA, des composés phénoliques, de l'activité spécifique des péroxydases et de la production d'éthylène, au cours de la rhizogénèse, sur des microboutures de vigne (V. Riparia Michx. X V. Rupestris Scheele)." Nancy 1, 1987. http://www.theses.fr/1987NAN10216.

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Abstract:

L'étude de la thizogénèse adventive d'un clone de vigne, cultivé in vitro est menée conjointement par histocytologie et par le suivi de l'évolution temporelle de divers marqueurs métaboliques. Les phénomènes sont étudiés sur des boutures monomodales pourvues ou non de feuilles et dans le segment de tige placé au-dessus ou en-dessous du noeud. . .

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Dissertations / Theses on the topic 'Physiologie végétale et développement'

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