Dissertations / Theses on the topic 'Plantes endémiques'

L'étude des plantes rares des iles de méditerranée occidentale (25% des plantes vasculaires de corse) montre une grande diversité de situations et illustre la complexité de la notion de rareté. Naufraga balearica, paléo-endémique de Majorque. L'analyse (rapd) d'individus issus de plusieurs populations et collections permet de discuter sa spontanéité en corse d'où il est réputé disparu. Centranthus trinervis : les plantes corses et sardes correspondent à deux paléo-endémiques relictuels. L'étude enzymatique souligne que les c. Trinervis et c. Amazonum adoptent une stratégie originale et efficace pour se maintenir avec de très faibles effectifs, respectivement 150 et 30 individus. Colchicum corsicum : la détermination rigoureuse de cet Apo endémique exigeait une révision systématique du genre en méditerranée occidentale. C. Corsicum s'avère localise et non menace en corse mais rarissime en Sardaigne. Par contre d'autres taxons, jusqu'alors inconnus (c. Actupii, c. Arenasii, c. Fharii) ou négligés apparaissent localises, rares voir en péril d'extinction. L'arum maculatum de Corse correspond en fait à a. Cylindraceum, diploïde relictuel. Cette découverte souligne l'importance à accorder aux taxons en limite d'aire. La comparaison de végétaux insulaires rares et/ou endémiques (helicodiceros, genista aetnensis, etc. ), nous conduit à distinguer les espèces originellement rares qui développent des stratégies de survie originales, de celles récemment raréfiées suite à la destruction de la nature par l'homme. Dans ces biotopes, les taxons rares ou communs deviennent menaces. Les théories sur la conservation de la biodiversité doivent s'adapter à chaque espèce dont les problèmes systématiques, écologiques ou biologiques demeurent uniques. On ne peut pas assimiler rare a menace. Soulignons l'importance des recherches de terrains (qui permettent de connaitre le véritable statut conservatoire des espèces) et de systématique, fondamentales pour éviter les fréquentes confusions entre taxons

L’Afrique centrale atlantique (ACA) englobe l’ensemble du domaine bas-guinéen, les îles du Golfe de Guinée et une partie de l’archipel afromontagnard. Plusieurs centres d’endémisme ont été identifiés en son sein et sont généralement considérés comme liés à la présence de refuges forestiers durant les périodes glaciaires. Cependant, l’origine de cet endémisme, sa localisation et les méthodes permettant d’identifier ces centres restent controversées. La localisation de ces zones d’endémisme et des plantes rares qu’elles abritent, est pourtant un prérequis indispensable pour la mise en place de politiques cohérentes de conservation et demeure une priorité pour les organisations privées, institutionnelles ou gouvernementales actives dans la gestion et le maintien durable de la biodiversité.

Cette étude phytogéographique porte sur la famille des Orchidaceae et est basée sur l’analyse de la distribution des taxons endémiques de l’ACA. Elle s’appuie sur un jeu de données original résultant d’un effort d’échantillonnage important au Cameroun et d’un travail d’identification et de localisation de spécimens dans les principaux herbaria européens abritant des collections d’ACA. Durant cette étude, (i) nous avons tout d’abord identifié ces taxons endémiques et documenté leur distribution au travers de plusieurs contributions taxonomiques et floristiques, (ii) nous nous sommes ensuite intéressé aux nouvelles méthodes permettant d’analyser ces données d’herbier de plantes rares et donc pauvrement documentées, testant aussi l’intérêt des Orchidaceae comme marqueurs chorologiques, et finalement, appliquant ces méthodes à notre jeu de données, (iii) nous avons délimité des centres d’endémisme et identifié les territoires phytogéographiques des Orchidaceae en ACA.

(i) Une révision taxonomique des genres Chamaeangis Schltr. et Stolzia Schltr. a été réalisée respectivement. Sept nouveaux taxons ont été décrits: Angraecum atlanticum Stévart & Droissart, Chamaeangis spiralis Stévart & Droissart, Chamaeangis lecomtei (Finet) Schltr. var. tenuicalcar Stévart & Droissart, Polystachya engogensis Stévart & Droissart, Polystachya reticulata Stévart & Droissart, Stolzia repens (Rolfe) Summerh var. cleistogama Stévart, Droissart & Simo et Stolzia grandiflora P.J.Cribb subsp. lejolyana Stévart, Droissart & Simo. Plusieurs notes taxonomiques, phytogéographiques et écologiques supplémentaires ont également été redigées. Au total, nous avons identifié 203 taxons d’Orchidaceae endémiques d’ACA parmi lesquels 193 sont pris en compte pour l’étude des patrons d’endémisme.

(ii) Au Cameroun, les patrons de distribution des Orchidaceae et des Rubiaceae endémiques d’ACA ont été étudiés conjointement. Des méthodes de rééchantillonnage des données (raréfaction) ont été appliquées pour calculer des indices de diversité et de similarité. Elles ont permis de corriger les biais liés à la variation de l’effort d’échantillonnage. Un gradient de continentalité a été observé, les parties côtières étant les plus riches en taxons endémiques d’ACA. Contrairement à la région du Mont Cameroun et aux massifs de Kupe/Bakossi qui ont connu une attention particulière des politiques et des scientifiques, la partie côtière du sud Cameroun, presque aussi riche, reste mal inventoriée pour plusieurs familles végétales.

Cette analyse à l’échelle du Cameroun a également permis de comparer les patrons d’endémisme des Orchidaceae et des Rubiaceae. Les différences observées seraient principalement dues à la présence d’Orchidaceae terrestres dans les végétations basses et les prairies montagnardes de la dorsale camerounaise alors que les Rubiaceae sont généralement peu représentées dans ces habitats. Au sein des habitats forestiers, la concordance entre les patrons d’endémisme des Orchidaceae et des Rubiaceae remet en question l’utilisation des capacités de dispersion des espèces comme critère pour choisir les familles permettant l’identification des refuges forestiers et semble ainsi confirmer la pertinence de l’utilisation des Orchidaceae comme marqueur chorologique.

La distribution potentielle a été utilisée pour étudier en détail l’écologie, la distribution et le statut de conservation de Diceratostele gabonensis Summerh. une Orchidaceae endémique de la région guinéo-congolaise uniquement connue d’un faible nombre d’échantillons. Cette méthodologie semble appropriée pour compléter nos connaissances sur la distribution des espèces rares et guider les futurs inventaires en Afrique tropicale.

(iii) En ACA, les Orchidaceae permettent d’identifier plusieurs centres d’endémisme qui coïncident généralement avec ceux identifiés précédemment pour d’autres familles végétales. Ces constats supportent aussi l’utilisation des Orchidaceae comme marqueur chorologique. La délimitation des aires d’endémisme des Orchidaceae a ainsi permis de proposer une nouvelle carte phytogéographique de l’ACA. Les éléments phytogéographiques propres à chacune des dix phytochories décrites ont été identifiés et leurs affinités floristiques discutées. Les résultats phytogéographiques obtenus (a) soutiennent l’existence d’une barrière phytogéographique matérialisée par la rivière Sanaga entre les deux principaux centres et aires d’endémisme de l’ACA, (b) étendent l’archipel afromontagnard situé principalement au Cameroun au plateau de Jos (Nigeria) et (c) montrent l’importance de la chaîne montagneuse morcelée Ngovayang-Mayombe pour la distribution de l’endémisme en ACA. Cette chaîne de montagne, qui s’étend le long des côtes de l’océan du sud Cameroun au Congo-Brazzaville et qui correspond à plusieurs refuges forestiers identifiés par de nombreux auteurs, est ici considérée comme une seule aire d’endémisme morcelée./

Atlantic central Africa (ACA) covers the Lower Guinean Domain, the four islands of the Gulf of Guinea and a part of the afromontane archipelago. Different centres of endemism have been identified into this area and are usually considered as related to glacial forest refuges. However, the origin of this endemism, the localization of the centres and the methods employed to identify these centres are subject to debate. Yet, the localization of these centres of endemism and the identification of the rare plants they harbor is an essential prerequisite to setting up rational conservation policies, and remains a priority for private, institutional and governmental organizations which are dealing with the sustainable management of biodiversity.

This phytogeographical study focuses on Orchidaceae and analyses the distribution of the taxa endemic to ACA. We use an original dataset resulting from an important sampling efforts and the identification of specimens coming from all the principal herbaria where collections from ACA are housed. During this study, (i) we first identified the taxa endemic to ACA and documented their distribution through several taxonomic and floristic contributions, (ii) we used and developed new methods allowing to correct for sampling bias associated with the use of rare and poorly documented taxa, testing at the same time the use of Orchidaceae as chorological markers, and finally, applying these methods to our dataset, (iii) we delimited the centres of endemism and identified the phytogeographical territories of Orchidaceae in ACA.

(i) A taxonomic revision of Chamaeangis Schltr. and Stolzia Schltr. respectively was carried out. Seven new taxa were described: Angraecum atlanticum Stévart & Droissart, Chamaeangis spiralis Stévart & Droissart, Chamaeangis lecomtei (Finet) Schltr. var. tenuicalcar Stévart & Droissart, Polystachya engogensis Stévart & Droissart, Polystachya reticulata Stévart & Droissart, Stolzia repens (Rolfe) Summerh var. cleistogama Stévart, Droissart & Simo and Stolzia grandiflora P.J.Cribb subsp. lejolyana Stévart, Droissart & Simo. Several additional taxonomic, phytogeographical and ecological notes were also published. We finally identified 203 Orchidaceae taxa endemic to ACA, among which 193 were used to study the patterns of endemism.

(ii) In Cameroon, the distribution patterns of both Orchidaceae and Rubiaceae endemic to ACA were studied. Subsampling methods (rarefaction) were applied to calculate diversity and similarity indices and to correct potential bias associated with heterogeneous sampling intensity. A gradient of continentality was confirmed in Cameroon, the coastal part being the richest in taxa endemic to ACA. The Cameroon Mountain and the Kupe/Bakossi mountain massifs have received a great consideration of politics and scientists. On the contrary, the Southern coastal part of Cameroon, though almost as rich as the Northern part, remains poorly known for several plant families.

This analysis also allowed us to compare patterns of endemism of Orchidaceae and Rubiaceae. The differences observed could be mainly due to the terrestrial habit of some Orchidaceae, which are only found in the grasslands of the highest part of the Cameroonian volcanic line where endemic Rubiaceae are rare. Within forest habitats, the concordance between the patterns of endemism of Orchidaceae and Rubiaceae question the widespread use of dispersal ability as a selection criterion for the families used to identify forest refuges. This also confirms the relevance of Orchidaceae as chorological marker.

Species distribution modelling was used of an in depth study of the ecology, the distribution and the conservation status of Diceratostele gabonensis Summerh. an Orchidaceae endemic to the Guineo-Congolian regional centre of endemism which is only known from very few collections. This method is proved to be appropriate to complete our knowledge on the distribution of rare plant species and to guide the future inventories in tropical Africa.

(iii) In ACA, an analysis of the distribution of endemic Orchidaceae confirmed the presence and location of several centres of endemism previously identified on the basis of other plant families. This result again supports the use of Orchidaceae as a chorological marker. The chorological study of the endemic Orchidaceae allowed us to propose a new phytogeographical map for ACA. Phytogeographical elements for each of the ten phytochoria described were identified and their floristic affinities were also discussed. Our results (a) support the existence of a phytogeographical barrier, materialized by the Sanaga River, between the two main centres and area of endemism of the ACA, (b) extend the limits of the afromontane archipelago to the Jos Plateau in Nigeria and (c) show the importance of the Ngovayang-Mayombe line to explain the distribution of endemism in ACA. This mountainous line, stretching along the ocean coast from Southern Cameroon to Congo-Brazzaville, corresponds to several forest refuges identified by many authors, and is here considered as an unique but discontinuous area of endemism.

Doctorat en Sciences
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Dans le cadre de travaux de recherche d'activités biologiques (antioxydante, antiradicalaire, antifongique, inhibitrice de l'acétylcholinestérase et inhibitrice de la fusion virale) dans des extraits de plantes de la Réunion, une étude bibliographique préliminaire recensant les principes actifs issus de plantes correspondants à ces activités a été réalisée. Afin de mieux comprendre l'action du principe actif, un descriptif des causes (stress oxydatif) et des effets pathologiques des maladies (mycoses, maladie d'Alzheimer et sida) liés à ces activités biologiques recherchées est également présenté (chapitre 1, tome 1). Dans le chapitre 2 (tome 1), 75 plantes endémiques et indigènes de la Réunion ont été sélectionnées pour une recherche de leurs activités biologiques. Deux catégories de tests ont été mises en oeuvre, l'une par chromatographie sur couche mince (tests antiradicalaire, antioxydant, antifongique et inhibition de l'acétylcholinestérase) et l'autre sur microplaques (test antiviral contre le VIH). A partir de 274 extraits polaire (méthanol) et apolaire (dichlorométhane) réalisés, 73% des 274 extraits ont montré une activité antiradicalaire, 32% une activité antioxydante, 14% une activité antifongique et 11% une inhibition de l'acétylcholinestérase (maladie d'Alzheimer). Pour le test VIH, la concentration limite de toxicité et la concentration mesurant 50% d'inhibition ont été déterminées. Trois plantes révélant des activités très fortes pour un ou deux tests ont fait l'objet d'analyses appronfondies : Hypericum lanceolatum, Melicope borbonica et Croton mauritianus. Parallèlement, une recherche de classes spécifiques de molécules dans une sélection de 18 plantes (sur 75) a été réalisée. L'ensemble de ces travaux a nécessité l'utilisation de diverses techniques analytiques comme la chromatographie sur colonne, la chromatographie sur couche mince, la chromatographie liquide haute performance couplée à l'Ultraviolet ou couplée à la spectrométrie de masse, ainsi que la résonance magnétique nucléaire du proton 1H, du carbone 13C monodimensionnelle et bidimensionnelle. Le tome 2 complémentaire du tome 1 regroupe, d'une part, les cinq tableaux du chapitre 1 (tome 1) et d'autre part, les données phytochimiques et botaniques des 75 plantes étudiées dans le chapitre 2 (tome 1)
A previous bibliographic study was realized to review all the active principles for five biological activities : free radical scavenging, antioxidant and antifungal activities, inhibition of acetylcholinesterase and inhibition of viral fusion. In order to understand the reactivity of the active principle, causes (oxidative stress) and pathological effects of diseases (fungal infections, Alzheimer's disease and AIDS) related to these five biological activities, were explained (chapter 1, vol. 1). In the second chapter (vol. 1), 75 plants endemic and indigenous to Reunion Island were selected for a study of their biological activities. Two kinds of tests were realized : on the one hand, by thin layer chromatography for the free radical scavenging, antioxidant and antifungal properties and for the inhibition of acetylcholinesterase ; on the other hand by clusters for the anti-HIV activity. 73% of 274 polar and non-polar extracts reduced free radicals, 32% protected double bonds, 14% inhibit the growth of a fungi and 11% inhibit acetylcholinesterase (Alzheimer's disease). For HIV test, the toxic limit concentration and the medium effective concentration were determined. Three plants exhibited strong activities for one or two tests : Hypericum lanceolatum, Melicope borbonica and Croton mauritianus. In the same time, 18 plants (on 75) were investigated for determination of specific groups of molecules. All these studies were needed uses of analytical techniques as column chromatography, thin layer chromatography, high pressure liquid chromatography coupled with Ultraviolet or coupled with mass spectrometry, and nuclear magnetic resonance 1H 13C, one-dimensional and bi-dimensional. The volume 2 is a complement of vol. 1 and comprises the five tables of the first chapter (vol. 1) and phytochemical and botanical data of the 75 plants studied in the second chapter (vol. 1)

Etant donné la faible connaissance chimique et pharmacologique des plantes vasculaires marquisiennes, un projet scientifique permettant leur inventaire, la mise à jour de leurs usages, ainsi que la détermination de leurcomposition chimique et de leur activité biologique a été mis en oeuvre, afin de déterminer l’effet del’endémisme sur la diversité pharmacochimique de métabolites secondaires. Le criblage des diverses espècesendémiques prélevées aux Marquises a permis d’identifier et de caractériser les ressources végétales marquisiennes à potentialité thérapeutique. Deux plantes d’intérêt biologique ont été retenues: Hernandianukuhivensis et Wikstroemia coriacea. Elles ont fait l’objet par la suite d’une étude plus approfondie de leur composition chimique. L’étude de H. Nukuhivensis a permis de montrer sa forte cytotoxicité à 1 μg/mL et d’isoler 2 alcaloïdes et 7 lignanes présentant des activités biologiques intéressantes. L’étude phylogéniqueassociée à une étude de la variabilité chimique des différents Wikstroemia présents en Polynésie française ont souligné la présence de 2 morphotypes (rampant et arbuste) sur le plateau du Temehani (Raiatea). Les résultats des études phylogéniques n’ont pu être corrélés avec ceux de la phytochimie pour les espèces de Wikstroemia de Polynésie orientale. L’analyse phytochimique de W. Coriacea, qui présente une activité anti-radicalaire (CI50 = 54 μg/mL), a permis l’isolement de 4 sesquiterpénoïdes dont un nouveau (acide oléodaphnoïque), 2 coumarines, 3 dérivés benzéniques dont un nouveau (2-hydroxy-1,5-diphénylpentan-1-one), un triterpénoïde et un lignane. L’analyse de W. Raiateensis a conduit à l’identification de 2 biflavonoïdes
The endemism effect on the chemodiversity of Marquesan vascular flora was investigated by multidisciplinary approach including ethnobotany, phytochemistry, phylogeny and biological activity. The endemic Marquesan species bioprospection allowed to identify and characterize plant resources showing therapeutic potential. Two plants having biological interest have been selected for phytochemical study: Hernandia nukuhivensis and Wikstroemia coriacea. The first species possesses a high cytotoxicity at 1 μg/mL level and is composed of alkaloids and lignanes identified by NMR. Phylogenetic and chemical variability survey of Wikstroemia genus from French Polynesia had underscored two morphotypes (rampant and shrub) in Temehani Plain (Raiatea). Phylogenetic results are not well correlated to phytochemical data. Wikstroemia coriacea extracts showed a significant free radical scavenging activity (IC50 = 54 μg/mL) and so we isolate and identify 4 sesquiterpenes (including 1 new compound: oleodaphnoic acid), 2 coumarins, 3 benzenoids (including 1 new compound: 2-hydroxy-1,5-diphénylpentan-1-one), 1 triterpenoid and 1 lignan. Analysis of W. Raiateensis species yielded isolation and characterization of two biflavonoids

Les patrons de diversité sont des états temporaires d'une dynamique de changements écologiques et évolutifs. Les politiques de conservation doivent intégrer cette dynamique et les priorités de conservation s'orienter vers les processus qui produisent et maintiennent cette diversité. Préserver la biodiversité, sans mesurer toutes ces facettes, nécessite de rechercher des substituts biologiques ou écologiques. Une démarche originale est d'évaluer la capacité de la phylogéographie à définir ces substituts. En effet, la phylogéographie permet de fournir des indices sur les zones de diversification et sur les entités (e.g. evolutionary significant units) qui soutiennent celles-ci au niveau intraspécifique. L'objectif général de ce travail est d'évaluer, en terme de cibles et de substituts, l'apport de la phylogéographie à la conservation de la flore méditerranéenne. Nos analyses s'appuient sur deux zones d'étude en région Provence-Alpes-Côte d'Azur intégrant deux plantes endémiques restreinte: le littoral des Alpes maritimes et l'endémique Acis nicaeensis, la basse Provence calcaire et l'endémique Arenaria provincialis. Chez Arenaria provincialis, les résultats montrent une répartition spatiale des phénomènes de persistance et de divergence et le rôle clé de la phylogéographie dans la recherche des critères optimaux de planification des actions de conservation. L'originalité génétique et écologique des populations d'Acis nicaeensis est mise en exergue à faible échelle. Leurs vulnérabilités face à l'urbanisation appellent à des actions de conservation ciblées sur des surfaces restreintes afin de préserver l'héritage évolutif de l'espèce
Diversity patterns are temporary state in a dynamic continuum of ecological and evolutionary changes. Thus, conservation policies have to integrate this dynamics and Conservation priorities have to be oriented towards the processes which generate and maintain diversity. Conserving biodiversity without needing to measure all its different components, it is necessary to search for biological and ecological surrogates. An original approach is to assess the capacity of phylogeography to define these surrogates. Indeed, the phylogeography allows providing indices for diversification zonation and can be used to delineate the units (e.g. evolutionary significant units) that support diversification at intraspecific level. The main objective of this work is to evaluate, in terms of targets and surrogates, the role of phylogeography for conservation of the Mediterranean flora. We based our analyses on two study areas of the South-East France harbouring two endemic species: the coastal ranges of Maritime Alps where Acis nicaeensis grows, and the calcareous Provence where Arenaria provincialis is found. The phylogeography of Arenaria provincialis revealed a spatial distribution of persistence and divergence. Our study highlights the critical role of phylogeography in the search for optimal criteria for defining the conservation strategies. The marked differences of genetic and ecology in populations of Acis nicaeensis but also in terms of its vulnerability to urbanization are highlighted in a local scale. The results demonstrate the need of conservation actions designed for small areas to avoid the loss of Acis nicaeensis evolutionary legacy

Cette thèse concerne la dégradation de la biodiversité malgache en générale et celle des forêts en particulier. Toute catégorie sociale confondue, les espèces endémiques de Madagascar ont subis ces 10 dernières années une pression énorme d’exploitation sans précédent de la part de la population malgache, situation pouvant ainsi conduire en une extinction de certaines espèces comme les tortues de terre (par exemple, les tortues étoilées), et les bois précieux (par exemple, les palissandres), si les mesures de protection ne seront pas prises à temps. Cette surexploitation se présente sous diverses formes en commençant par une consommation quotidienne jusqu’à une exportation massive (trafic) des espèces. Les causes principales de cette pression sont multiples, à savoir : l’incohérence de la politique de développement adoptée par les dirigeants depuis les années 80, l’abandon total de l’éducation citoyenne en matière de préservation de la nature et de l’environnement, la pauvreté des gens vivant à proximité des écosystèmes forestiers ; la mondialisation et le commerce international. Cette érosion de la biodiversité a pour conséquences : l’appauvrissement progressive des ressources, l’extrême pauvreté des paysans, et enfin une crise écologique inéluctable. Pour faire face à cette situation, nous proposons ce qui suit : Premièrement : réformer la politique et le plan d’action environnemental par la refonte de la législation en matière de la protection et de conservation de la biodiversité, et par la redéfinition des actions et responsabilités des acteurs environnementaux ; Deuxièmement : donner priorité à l’éducation environnementale pour chaque catégorie de personne enfant comme adulte, et intégrer les communautés locales dans la préservation des espèces et leurs habitats pour parvenir à une méthode de conservation acceptée et acceptable par tous les acteurs (paysans, bailleurs de fond, ONG, Etat). Enfin, une étude de cas sur la préservation de la biodiversité forestière a clôturée la thèse en prenant comme exemple le site « Dabotehena Manja Madagascar » où les aspects théoriques et pratiques y sont traités et détaillés
This thesis concerns the loss of biodiversity in general and the Malagasy forests in particular. All social categories, species endemic to Madagascar has suffered over the past 10 years enormous pressure operating unprecedented on the part of the Malagasy population, a situation that could well lead to an extinction of some species such as tortoises (eg , turtles starred), and precious woods (for example, rosewood), if protection measures are not taken in time. This exploitation comes in many forms, beginning with a daily consumption up to a massive export (traffic) in cash. The main causes of this pressure are varied, namely the inconsistency of the development policy adopted by the leaders since the 80's, the total abandonment of civic education in the preservation of nature and the environment, the poverty of people living near forest ecosystems globalization and international trade This erosion of biodiversity has resulted in: the progressive depletion of resources, extreme poverty of the peasants, and finally an ecological crisis inevitable. To address this situation, we propose the following: Firstly, policy reform and environmental action plan for the overhaul of the legislation on the protection and conservation of biodiversity, and the redefinition of actions and responsibilities of environmental;Second: give priority to environmental education for each category of person child as an adult, and integrate local communities in the preservation of species and their habitats in order to achieve an accepted method of preservation and acceptable to all stakeholders (farmers, donors Basically, NGOs, state). Finally, a case study on the preservation of forest biodiversity has closed the thesis using the example site "Dabotehena Manja Madagascar" in which theoretical and practical aspects are addressed and detailed

Parmi les genres néo tropicaux de la famille des moraceae, sorocea a. St. -hil. , clarisia ruiz & pavon et trophis p. Browne, rassemblent trente et huit taxons dont un paléotropical : trophis philippinensis (bureau) corner. Ces genres constituent un groupe remarquablement homogène à l'intérieur de la tribu des moreae. Plusieurs données morphologiques des moraceae ainsi que les caractères principaux des tribus moreae et artocarpeae ont été étudiés. En faisant appel à la notion d'unité biologique fonctionnelle - u. B. F. , 44 de ces unités ont été dénombré dans cette étude. Pour mémoire, une u. B. F. Correspond à un ensemble de spécimens partageant des caractères morphologiques, chorologiques et écologiques. Afin de faire ressortir la constance des caractères morphologiques, des méthodes numériques (analyses factorielles de correspondances) ont été utilisées, ce qui a permis de retenir 38 taxons, les autres s'avérant être des synonymes. Une fois les taxons reconnus, il a été possible de tester leurs rapports phylétiques par une analyse cladistique ; il en ressort que le groupe compose des trois phylums sorocea, clarisia et trophis est monophylétique. Cette analyse m'a apporté des éléments pour élaborer un schéma évolutif probable. L'analyse biogéographique intègre des approches de morphologie et d'écologie adaptatives d'espèces présentes dans les diverses formations végétales du Brésil et des pays limitrophes. Une première hypothèse sur l'origine de la diversification des taxons a été proposée. Les recherches portant sur la biodiversité des moreae et la mise en évidence des centres d'endémisme en rapport avec la distribution géographique contribue à la reconnaissance des domaines phytogéographiques du Brésil. Par la mise en évidence de centres de spéciation et d'endémisme cette thèse apporte des éléments pour une politique de protection de la nature au Brésil, en proposant des zones à protéger en priorité. Un annexe traitant de la taxonomie présente la clef de détermination, les noms valides des taxons avec leur synonymes, la description et la liste des collections étudiées, les critères selon les catégories de l'UICN et les noms populaires

Anthospermum emirnense Baker et Anthospermum perrieri Homolle ex Puff (Rubiaceae) sont des herbacées endémiques des Hautes Terres Centrales de Madagascar, utilisées en médecine traditionnelle pour leurs propriétés dépurative, stomachique, béchique, antiseptique et vulnéraire. Les extractions par solvants, suivies d’isolements à partir des extraits et la détermination structurale des molécules isolées, ont montré la richesse de ces plantes en métabolites secondaires. Des composés appartenant à des familles chimiques variées ont ainsi été isolés : un nouveau glycoside d’iridoïde ainsi que 7 autres iridoïdes connus, un nouvel hétéroside anthraquinonique, 3 quinones et un naphtalène, 2 acides phénols, 3 coumarines, 3 lignanes, 5 flavonoïdes et 2 phytostérols ont été caractérisés. Par ailleurs, les huiles essentielles des parties aériennes d’A. Emirnense et d’A. Perrieri ont été obtenues par hydrodistillation respectivement avec un rendement de 0,03 % et 0,02 % (m/m). Elles possèdent comme constituants majoritaires des sesquiterpènes hydrocarbonés et oxygénés, notamment le β- élémène, le trans-β-caryophyllène, l’oxyde de caryophyllène et le τ-cadinol. Une soixantaine de molécules a été identifiée dans chacune des huiles essentielles. Une quarantaine de composés est commune aux deux espèces. En complément de cette étude chimique, des tests antibactériens ont été effectués d’une part sur les iridoïdes isolés, d’autre part sur les huiles essentielles. Parmi les iridoïdes, deux composés ont montré de bonnes activités sur Alcaligenes faecalis, Comamonas acidovorans, Pseudomonas putida, Serratia marcescens, Achromobacter xylosoxidans denitrificans, Achromobacter xylosoxidans xylosoxidans, Burkholderia cenocepacia, Burkholderia pyrrocinia, Stenotrophomonas maltophilia. Les huiles essentielles ont montré de basses valeurs de CMI sur Bacillus subtilis, Chryseobacterium indologenes, Flavimonas oryzihabitans et Yersinia enterocolitica. L’ensemble de ces résultats constitue les premières données chimiques et biologiques sur le genre végétal Anthospermum, et permet de valider scientifiquement l’utilisation anti-infectieuse traditionnelle de ces espèces
Anthospermum emirnense Baker and Anthospermum perrieri Homolle ex Puff (Rubiaceae) are herbaceous endemic to the Central Highlands of Madagascar, widely used in traditional Madagascan medicine for the treatment of various infectious diseases, including cough, digestive apparatus disorders, and various skin diseases. The extractions by solvents, followed by isolations from extracts and structural determination of the isolated molecules, showed the wealth of these plants on secondary metabolites. So, compounds belonging to varied chemical families were isolated: a new iridoid glycoside as well as 7 other known iridoids, a new anthraquinonique heteroside, 3 quinones and a naphtalen, 2 acids phenols, 3 coumarins, 3 lignans, 5 flavonoids and 2 phytosterols were characterized. Besides, essential oils of the aerial parts of A. Emirnense and A. Perrieri were obtained by hydrodistillation respectively with 0,03 % and 0,02 % (w/w) yield. About sixty molecules were identified in each of the essential oil. The two species showed an important qualitative similarity, with 40 compounds common to A. Emirnense and A. Perrieri, including β-elemene, trans-β-caryophyllene, caryophyllene oxide, and τ-cadinol, which were major components in both cases. As a supplement to this chemical study, antibacterial tests were made on isolated iridoïdes and on the essential oils. Among iridoids, two compounds showed good activities on Alcaligenes faecalis, Comamonas acidovorans, Pseudomonas putida, Serratia marcescens, Achromobacter xylosoxidans denitrificans, Achromobacter xylosoxidans xylosoxidans, Burkholderia cenocepacia, Burkholderia pyrrocinia, Stenotrophomonas maltophilia. Essential oils exhibited interesting minimal-inhibitoryconcentration (MIC) values towards Bacillus subtilis, Chryseobacterium indologenes, Flavimonas oryzihabitans, Yersinia enterocolitica. All these results establish the first chemical and biological data on the genus Anthospermum, and permit to validate scientifically the traditional anti-infective use of these species

L'objectif de ce travail est l'analyse des variations spatiales de la diversite biologique a l'echelle regionale a partir d'une liste d'occurrences d'especes. Le recours aux listes d'occurrences etablies a partir des collections des museums, de la litterature et des releves de terrain est en effet devenu de plus en plus frequent en macro-ecologie, ces donnees permettant d'acceder facilement a l'echelle regionale pour analyser la distribution spatiale de la diversite et apprehender les roles respectifs des facteurs ecologiques, historiques et evolutifs perceptibles a cette echelle. Les forets sempervirentes des ghats occidentaux constitue le cadre de cette etude, et la liste d'occurrences etudiee correspond a la base de donnees constituee a partir des releves de l'institut francais de pondichery, des specimens d'herbiers et des flores pour etablir l'atlas des especes arborescentes endemiques des ghats. Les analyses multispecifiques supposent toutes l'existence d'unites spatiales communes aux differentes especes. Or, la liste d'occurrences est formee d'observations independantes, reperees par leurs propres coordonnees geographiques et associees a une altitude, ce qui imposait une analyse des relations especes-milieu a l'echelle des occurrences. En collaboration avec d. Chessel, j'ai mis au point deux nouvelles methodes d'ordination, l'analyse non symetrique des correspondances (ansc) et l'analyse de correlation canonique (ac) appliquee a un tableau d'occurrences. J'ai mis en evidence une diminution de la richesse specifique avec l'altitude et la longueur de la saison seche, une augmentation de l'amplitude altitudinale moyenne des especes endemiques le long du gradient altitudinal (loi de rapoport), et revele l'importance des phenomenes de vicariances ecologique et geographique. Ces resultats m'ont conduit a privilegier les facteurs historiques et evolutifs pour expliquer la distribution actuelle de la richesse et de l'endemisme dans les ghats occidentaux.

Ce travail de thèse s'attache à identifier des plantes et/ou molécules à activités cytotoxique, antioxydante, anti-inflammatoire et antivirale ciblant le virus du chikungunya (CHIKV) dans le but de trouver des alternatives thérapeutiques vis-à-vis du stress oxydatif et de l'inflammation, mécanismes impliqués dans les maladies chroniques non transmissibles (diabète, obésité…), et de la maladie du chikungunya, maladie vectorielle réémergente. La première partie de ces travaux présente les résultats obtenus lors d'un criblage d'activités biologiques réalisé sur une sélection de dix-huit plantes endémiques et indigènes de La Réunion. Les activités ciblées ont été les activités cytotoxiques sur une lignée cellulaire humaine (cellules THP-1), les activités antioxydantes évaluées par un test in cellulo d'hémolyse et par quatre tests chimiques (TEAC/DPPH/FRAP/ORAC) ainsi qu'une évaluation de la teneur en composés phénoliques (test FOLIN) et les activités anti-inflammatoires testées sur des macrophages murins (cellules RAW-BlueTM). Les résultats obtenus ont permis de mettre, plus particulièrement, en évidence les activités de différents extraits : cytotoxique pour Carissa spinarum, antioxydantes pour Agarista buxifolia et Dryopteris wallichiana et anti-inflammatoire pour Stillingia lineata et Indigofera ammoxylum. La deuxième partie du travail est consacrée à l'étude phytochimique d'une espèce indigène de La Réunion, Stillingia lineata, choisie en raison des résultats obtenus lors de ce criblage biologique préliminaire et de ceux du programme Phytochik. Un fractionnement bioguidé par un test antiviral, réalisé sur des cellules Vero (cellules rénales de singe vert Cercopithecus aethiops) contaminées par le CHIKV, a conduit à l'isolement de trois macrocycles diterpéniques rares de type tonantzitlolone dont l'un présente une structure non caractérisée jusque-là, et d'un pimarane de structure nouvelle. La 4'-acétoxytonantzitlolone a été identifiée comme molécule candidate contre le CHIKV (CE50 = 7 μM). Des relations structure-activité ont pu être définies ; la présence d'un groupement oxygéné sur la chaîne latérale des tonantzitlolones semble jouer un rôle important sur la réponse antivirale de ces squelettes diterpéniques
The aims of this PhD work were to identify plants and/or molecules with cytotoxic, antioxidant, anti-inflammatory or antiviral (chikungunya virus , CHIKV) activities in order to find therapeutic alternatives towards oxidative stress and inflammation, mechanisms involved in chronic noncommunicable diseases (diabetes, obesity ...), and chikungunya disease, reemerging vector-borne disease. The first part of this work presents the results obtained from a biological screening carried out on a selection of eighteen endemic and indigenous plants of La Réunion. The targeted activities were cytotoxicity on a human cell line (THP-1), antioxidant activities evaluated using an in cellulo hemolysis assay and four chemical tests (TEAC / DPPH / FRAP / ORAC) together with an evaluation of the content of phenolic compounds (FOLIN test) and anti-inflammatory activity tested in murine macrophages (RAW cells-BlueTM). The results allowed to highlight activities of different extracts in particular : cytotoxic for Carissa spinarum, antioxidant for Dryopteris wallichiana and Agarista buxifolia and anti-inflammatory for Stillingia lineata and Indigofera ammoxylum.The second part of this work is devoted to the phytochemical study of Stillingia lineata, an indigenous species of La Réunion chosen because of the results obtained in this preliminary biological screening and those carried out in Phytochik programme. Bioassay-guided fractionation performed on Vero cells (green monkey kidney cells Cercopithecus aethiops) infected with CHIKV led to the isolation of three rare macrocycle-type diterpenes called tonantzitlolone and a new pimarane. The 4'-acetoxytonantzitlolone was identified as a candidate molecule against CHIKV (EC50 = 7 μM). Structure-activity relationships have been defined, the presence of an oxygenated group on the side chain of tonantzitlolones seems to play an important role in the antiviral response of the diterpene skeleton

L'objectif de ce travail consiste à analyser la structure et la dynamique des populations de végétaux endémiques méditerranéens, selon différentes échelles spatiales et temporelles. Est examinée l'influence des facteurs de biogéographie historique et des facteurs écologiques actuels. Trois espèces endémiques ont été étudiées. Les données phylogéographiques de Gentiana ligustica, suggèrent l'existence de plusieurs microrefuges et routes de recolonisation. La fragmentation récente des habitats Acis nicaeensis diminue la viabilité des populations, ce qui entraîne un vortex d'extinction. Les perturbations telles que le pâturage ovin ou les incendies, d'intensité et de fréquence moyennes, favorisent la persistance des populations. Dans un contexte de changement global, il apparaît donc nécessaire d'adopter des stratégies de conservation au cas par cas, alliant le maintien des pressions intermédiaires de perturbations, la conservation des habitats, ou la prise en compte de l'histoire des populations et de leur variabilité écogéographique
The aim of this study is to investigate the population structure and dynamic of Mediterranean endemic plants, at different spatial and temporal scales. The influence of historical biogeographic patterns and the current ecological patterns is examined. Three endemic species are studied. Phylogeographic data of Gentiana ligustica combined with glacial history suggest the presence of peripheral microrefugia and the existence of several postglacial migration routes. Recent habitat fragmentation of Acis nicaeensis decreases population viability, which induces an extinction vortex. On the other hand, disturbances characterized by intermediate intensity and frequency, among which cattle grazing and fire favour population persistence. Within a global change context, it appears necessary to propose some specific conservation strategies, including the preservation of intermediate disturbances, habitat conservation, or an assessment of population history and of their ecogeographical variability

Dans le cadre d'une collaboration entre l'Institut Malgache de Recherches Appliquées et l'Institut de Chimie des Substances Naturelles pour la recherche de nouvelles molécules bioactives, l'étude phytochimique de trois plantes endémiques de Madagascar a été entreprise. Ces plantes ont été sélectionnées pour leurs activités biologiques : Apodocephala pauciflora (Asteraceae) plante cytotoxique sur la lignée cellulaire KB, Carphalea madagascariensis (Rubiaceae), plante inhibitrice de l'activité de la protéine kinase DyrK 1A et Garcinia verrucosa subsp. Orientalis (Clusiaceae), plante cytotoxique sur la lignée cellulaire P388. Le fractionnement bioguidé des extraits acétate d'éthyle de différentes parties de ces plantes a conduit à la caractérisation de 24 composés dont 8 nouveaux appartenant à la famille des sesquiterpènes lactones de type hélénanolide, des triterpènes de type 3,4-seco-dammarane, et un phloroglucinol polyisoprénylé. L'activité initialement observée pour ces extraits a été retrouvée dans la plupart des molécules isolées
As part of collaboration between the Institut Malgache de Recherches Appliquées and the Institut de Chimie des Substances Naturelles in the search for new bioactive molecules, the phytochemical study of three endemic plants from Madagascar was undertaken. These plants were selected for their biological activities : Apodocephala pauciflora (Asteraceae), a cytotoxic plant on KB cell line, Carphalea madagascariensis (Rubiaceae), an inhibitor of the activity of Dyrk 1A protein kinase and Garcinia verrucosa subsp. Orientalis (Clusiaceae) a cytotoxic plant on P388 cell line. Bioguided fractionation of ethyl acetate extracts from different parts of the plants led to the characterisation of 24 compounds belonging to the helenanolide-type sesquiterpene lactones family, 3,4-secodammarane type triterpenes family, and a polyisoprenylated phloroglucinol. Among them 8 are new compounds. The initial activity observed for these extracts was found in most of the isolated molecules

L'exsudat résineux de Gardenia aubryi (Rubiaceae) a permis d’obtenir douze composés : neuf triterpènes et trois flavonoïdes polyméthoxylés. Parmi les triterpènes, trois seco-cycloartanes et trois dammaranes sont des composés nouveaux. Les composés de série dammarane méritent ici une attention particulière car il s’agit de la première identification de ce groupe de produits dans le genre Gardenia. Cette étude est complétée par des tests de cytotoxicité in vitro rassurants quant à l’utilisation comme masticatoire qui est parfois faite de cet exsudat. Vingt-sept lignanes et dérivés apparentés ont été isolés des périspermes de sésame. Quatre d’entre eux sont des composés nouveaux : (+)-saminol, (+)-épisésaminone-9-O-b-D-sophoroside, alibabol et (+)-épipipéritolone. De plus, la majorité des composés isolés sont caractérisés pour la première fois dans le genre Sesamum. La présence de néolignanes revêt, en particulier, une importance chimiotaxonomique majeure. D’un point de vue biogénétique, les dérivés isolés ont pu être intégrés, de manière raisonnée, aux différentes voies de biogenèse établies ou proposées pour les lignanes et qui régissent le métabolisme de cette famille chimique. Par ailleurs, la constitution de cette base de données moléculaire, dans une partie non comestible du végétal, offre la possibilité de caractériser par une analyse HPLC, donc de manière rapide, sensible, et spécifique, la teneur des différentes préparations à base de sésame, sous quelque forme que ce soit, destinées à l’alimentation. En effet, certains de ces lignanes, notamment les précurseurs de l’entérolactone et de l’entérodiol, ont fait l’objet d’évaluations biologiques afin de tester leurs activités anti-oxydante, hépatoprotectrice et oestrogénique. Leur quantification dans ces préparations apparaît nécessaire, dans le cadre d’une évaluation raisonnée de la potentialité chimiopréventive traditionnellement accordée au sésame
The chemical study of the aerial parts of Boronella koniambiensis led to the isolation of fifteen compounds from several structural classes, such as lignans, coumarins, steroids, limonoids, amides, and alkaloids. Two of them, cis-1,2-dihydroxy-1,2-dihydromedicosmine and koniamborine, are new natural products, Koniamborine, the first pyrano[3,2-b]indol-4-one alkaloid from natural source, was thoroughly examined by catalytic hydrogenation, in order to establish unambiguously its skeleton and its relationship with 6-methoxy-1-methylisatine, although isolated from the plant material. These investigations confirmed, through the originality and the diversity of its secondary metabolites, the great interest of the Rutaceae family. The chemical study of Gardenia aubryi (Rubiaceae) bud exudate led to the isolation of twelve compounds, nine triterpens and three polymethoxylated flavonoids. Among the triterpens, three seco-cycloartanes and three dammarans are new natural compounds. This is the first report of dammaran-type triterpens in the genus Gardenia. In vitro cytotoxicity evaluation didn’t show any strong activity; this is a good new, as long as this exudate is locally used for chewing, especially by children. Twenty-seven lignans and related compounds have been isolated from sesame perisperm (testa, hull, coat). Four among them are new natural products: (+)-saminol, (+)-episesaminone-9-O-b-D-sophoroside, alibabol and (+)-epipipéritolone. Most of the other compounds were described for the first time in the genus Sesamum. The identification of neolignans should be particularly emphasized on the chemotaxonomic point of view. All these metabolites were rationally integrated to the major lignan biogenetic pathways. As some of them were recently characterized as mammalian lignans precursors, the constitution of a large molecular database from a non-edible part of the plant looks very interesting. On one hand, it is now possible to estimate, by a quick, specific, and sensitive HPLC-analysis, the nature and the concentration of lignans in sesame-containing food preparation. In the other hand, the evaluation of antioxidative and estrogenic activities of this derivates are on progress, in order to determine the basis of the chemopreventive value traditionnaly accorded to sesame

Six espèces endémiques au maquis minier sont choisies pour étudier leur adaptation à Ni. Les conditions optimales de germination et l'effet de Ni sur le développement des semences sont évaluées in vitro. La phyto-toxicité de Ni dépend de l'espèce. L'effet de la forme chimique du sel de Ni est étudié avec 1 espèce. Pour tous les sels des cartographies élèmentaires (MEB) révèlent qu'au niveau des graines en germination, Ni est accumulé dans l'enveloppe séminale. C'est une réponse d'exclusion de Ni qui protège les tissus internes. L'enveloppe contient des cristaux d'oxalate de Ca parfois associés à Ni. Ni induit aussi une concentration en P, Mg, K et Mn au centre de l'albumen. Une culture sur substrats miniers en serre montre que la saprolite est moins favorable que la latérite. La culture sur terreau de 3 ligneuses soumises à des arrosages nickelifères en serre montre que Ni peut être bénéfique à la croissance, et que la distribution du Ni dans les plantes est fonction de l'espèce.

Ce travail est consacré à l'étude phytochimique des feuilles, branches et des écorces de tronc d'Alphitonia xerocarpa et Alphitonia erubescens, ainsi que celle des fruits d'Alphitonia neocaledonica. Cette étude a permis d'isoler et d'identifier 48 composés dont 23 correspondent à de nouvelles molécules. Les composés isolés peuvent être classés en sept groupes : 2 stérols dont un glycosylés, 10 triterpènes, 19 saponosides, 12 flavonoïdes, un lignane glycosylé, trois glycosides phénoliques, et un nucléoside. La détermination structurale des composés isolés a été réalisée à l'aide des techniques spectroscopiques de RMN 1D & 2D et par la spectrométrie de masse ESI-MS.L'évaluation de l'activité anti-oxydante effectuée sur les différents extraits obtenus a montré une bonne activité des extraits hydro-alcooliques, seul l'extrait butanolique des fruits d'A. neocaledonica a donné une activité anti-tyrosinase intéressante dans le domaine dermato-cosmétique.Les tests biologiques menés en bactériologie et en toxicologie cellulaire a conduit à l'identification des composés ayant des activités importantes antibactérienne contre deux bactéries à Gram positif (CMI [4-32 µg/ml]) et antiproliférative contre les cellules KB (CI50 [2,6-7,9 µM/ml]).Ces plantes pourraient donc être une nouvelle source d'exploitation durable néo-calédonienne dans le secteur de l'industrie cosmétique ou/et pharmaceutique, car les composés actifs sont des produits majoritaires provenant des matières végétales régénérables (feuilles, branches et fruits)
A collaborative project between the institute of Molecular chemistry of Reims (ICMR, UMR CNRS 7312) and the laboratory of natural substances in New Caledonia was established with the purpose to improve the phytochemical and biological evaluation of New-Caledonia endemic plants.The purification of the extracts of the leaves, stem bark and branches of A. xerocarpa and these of the fruits of A. neocaledonica led to the isolation of 48 compounds, of which 23 are new ones. The structural elucidation by 1D and 2D NMR confirmed the presence of 2 phytosterols, 19 saponins, 10 triterpens, 12 flavonoids, three glycosylated phenols, an aurone derivative, a glycosylated lignan, and a nucleoside.All hydro-alcoholique extracts showed a good DPPH radical scavenging capacity, only the butanolic extract of the fruits of A. neocaledonica was found to have anti-tyrosinase potential.Other screening tests were performed to evaluate the antibacterial properties of isolated compounds; some of them showed a high antibacterial activity against Gram-positive bacteria with a range of MIC values between (4-32 µg/ml), and a good anti-proliferative activity against KB cells

Le genre Alstonia(Apocynacées) comprend une cinquantaine d'espèces réparties sur toute la zone pantropicale. En Polynésie française, cinq taxons morphologiquement différents ont été recensés A. Costata var costata, A costata var fragrans, A. Elliptica, A "Moorea" dans l' archipel de la Société et A. Marquisensis dans l'archipel des Marquises. Une étude phytochimique d'A. Costata var costata et A. Marquisensis réalisée par bioguidage suivant deux tests d'activités biologiques (antiradicalaire et inhibiteur de l' acéthylcholinestérase) a permis de révéler leur potentiel pharmacologique. Ces activités peuvent être reliés à la présence de molécules de type polyphénolique (flavonoïdes et un dérivé de l'ester de l'acide cinnamique), iridoïde et alcaloïde. Une étude comparative du contenu chimique des cinq taxons a montré une variabilité de composition. Une analyse phylogénétique réalisée sur ces derniers a démontré une forte homogénéité des taxons confirmant la révision botanique les reclassant dans une même espèce avec d'autres espèces du Pacifique. Cependant, l'analyse phytochimique offre un outil qui permettrait de différencier ces taxons désormais considérés comme des morphotypes
The genus Alstonia (Apocynaceae) comprises more than 50 species widely distributed in tropical regions. Five morphologically different Alstonia taxons are found in French Polynesia : A. Costata var costata, A. Costata var fragans, A. Elliptica, A" Moorea" grown in Society archipelago, and A. Marquisensis grown in Marquisesas archipelago. Phytochemical assessment of A. Costata var costata and A. Marquisensis was carried out using two guided bioassays fractionation (radical scavenging and acetylcholinesterase inhibition). This framework led to reveal their pharmacological potential which might be related to the presence of polyphenolic constituents (flavonoids and cinnamic esters derivatives), iridoid and alkaloid components. Comparison of chemical composition of the five Polynesian Alstonia taxons showed some chemical variability. Phylogenetic assessment carried on these taxons revealed their great similarity and homogeneity and so confirm the botanical revision which had been realized by gathering them in a same species along other species from pacific region. However, phytochemical analysis offer a tool which may help to discriminate these Alstonia taxons now considered as morphotypes

Pour éviter la disparition d'une espèce menacée, l'augmentation des effectifs par transfert d'individus d’une population source à la population cible (renforcement) et la création de populations nouvelles (réintroduction), constituent des instruments clés des stratégies de conservation. Cependant le transfert d’individus dans un contexte d’adaptation locale peut aboutir à une mal-adaptation des individus transférés dans leur environnement d’introduction. Par ailleurs les descendants des croisements entre individus natifs et individus transplantés peuvent présenter une valeur sélective réduite consécutive à la dépression hybride. Intégrer les notions d’adaptation locale et de dépression hybride en biologie de la conservation suscite de nombreuses interrogations, quant à la mise en évidence des adaptations locales, les mesures de distances entre populations, le choix des populations cibles dans un protocole de renforcement ou de réintroduction. La présente thèse s’inscrit dans un projet de conservation d’une espèce micro-endémique menacée, la Biscutelle de Neustrie. Elle s’attache à prendre en compte l’adaptation locale et ses conséquences dans les protocoles de renforcement de l’espèce. Cette thèse comporte trois volets : (1) l’étude de la dépression hybride en lien avec la distribution géographique de l’espèce, en conditions environnementales contrôlées et en sites d’introductions (2) l’étude de la différenciation écologique des populations en termes d’habitats et de traits d’histoire de vie ainsi que le patron d’adaptation locale des plantes à leur environnement naturel (3) la comparaison de deux stratégies conservatrices de renforcement : l’auto- et l’allo-renforcement. La synthèse de ces trois volets a permis d’élaborer un protocole de conservation pour l’espèce et plus largement d’identifier les paramètres à intégrer pour réussir un transfert d’individus chez les espèces menacées ou d’en comprendre les échecs
In conservation management of threatened populations or species, reintroduction and reinforcement procedures constitute essential tools. However, transplanted individuals may either establish in the introduction site or be poorly adapted to it. Moreover outcrosses may either increase or decrease outbred progeny fitness, by heterosis or outbreeding depression respectively. In this context, understanding the pattern of genetic and adaptive differentiation between populations is essential for the elaboration of conservation strategies. The objective of the present study is to apply this proposition in the context of the conservation program of Biscutella neustriaca, a declining species. First, we investigated progeny fitness from crosses between populations at distinct geographic scales. Second, we examined ecological differences between habitats, genetic differences in life-history traits between populations and the pattern of local adaptation in greenhouse and in introduction sites. Third, we compared the efficiency of two conservative reinforcement strategies. Finally after a synthesis of these three parts we developed a protocol for the conservation of B. neustriaca and more widely we identified the parameters to include for a successful transfer of individuals in threatened species or for a better understanding of failed attempts

Les forts taux d'espèces dioïques sur les îles ont longtemps fasciné les biologistes. Or le fonctionnement de la dioécie en milieu insulaire a été peu abordé. Les variations dans l'expression de la dioécie et du dimorphisme sexuel de la taille des fleurs sont aujourd'hui examinés dans l'archipel des Mascareignes. À la réunion, les espèces unisexuées du genre "Dombeya" (sterculiacées) sont dioïques cryptiques mais présentent une variabilité dans l'expression de la dioécie. Certaines espèces strictement dioïques constituent de grandes populations en altitude alors que les espèces partiellement dioïques forment de petites populations à basse altitude. Par ailleurs, l'hybridation entre espèces strictement dioïques et partiellement dioïques semble engendrer des taxons hermaphrodites autocompatibles. Ces résultats demandent confirmation par une étude moléculaire plus poussée, mais l'hybridation en milieu insulaire semble être un processus évolutif important dans ce genre. Nos résultats montrent que le dimorphisme sexuel de la taille des fleurs de la flore unisexuée indigène de la Réunion est un phénomène largement répandu. Le biais observé est souvent en faveur des individus mâles, ce qui peut être corrélé à la zoogamie, fréquente sur cette île. Le dimorphisme est plus abondant chez les espèces endémiques que chez les taxons indigènes et est variable entre les espèces apparentées. Un modèle allométrique est proposé pour illustrer ces variations au sein du genre "Dombeya". Cette thèse apporte les connaissances de base sur la biologie du genre "Dombeya" à la Réunion dont certaines espèces constituent les éléments clés des forêts primaires et d'autres sont des espèces rares des milieux fragmentés.

La perte d'habitat et la déforestation sont les principales menaces qui pèsent sur la biodiversité Malgache. Ces processus sont responsables du déclin d'un nombre important d'espèces. Cependant, les mécanismes de ce déclin ne sont pas encore complètement élucidés. En utilisant la roussette malgache (Rousettus madagascariensis) comme un modèle d'organisme, nous nous sommes attachés à étudier les réponses écologiques et génétiques de cette espèce dans des paysages naturels et des paysages modifiés par l'homme et présentant divers types de caractères physico-climatiques à Madagascar. Ayant une large distribution, cette espèce est endémique à Madagascar et assure potentiellement un rôle important dans la régénération naturelle des forêts malgaches. A partir de l'utilisation de la radio télémétrie, d'analyses des matières fécales, d'études moléculaires et de mesures morphométriques nous avons pu examiner le mode de dispersion et l'écologie de cette espèce. L'observation des animaux en volière a fourni des informations importantes sur son choix alimentaire entre plantes autochtones et celles à valeur économique. Dans cette étude, nous avons ainsi mis en évidence : i) que Rousettus madagascariensis utilise les habitats forestiers et ceux modifiés par l'homme pour s'alimenter ; ii) qu'elle a une préférence plus marquée envers les espèces forestières et pionnières qu'envers celles d'importance commerciale ; iii) qu'elle présente une faible mais significative structuration génétique ; iv) mais une variation morphométrique, qui est dépendante de la latitude et de l'altitude
Forest habitat loss and associated changes in floristic composition are the major threats to the Malagasy terrestrial biodiversity. These processes are responsible for the decline of numerous species. However, for the vast majority of taxa, the mechanisms triggering these declines are poorly understood. Using the Malagasy rousette (Rousettus madagascariensis) as our model organism, we examine different genetic and ecological aspects of how this animal lives in natural habitats and copes with human modified landscapes of different physical and bioclimatic characteristics. This endemic species has a broad distribution, and appears to play a role in the regeneration of native forest. Through radio telemetry, faecal sample analysis, molecular genetics, and morphometric data, we were able to understand different aspects of the life-history traits and dispersal patterns of this taxon. Observations of wild animal placed in flight cages provided important inference on its feeding preferences between native and introduced plants, with economic value. Results indicate that R. Madagascariensis i) uses both: the forest and human modified habitats while foraging; ii) it has a feeding preference for fruits of forest and pioneers species, as compared to plants of commercial importance; iii) it shows weak genetic structure, which is not associated with geographical distance; iv) and morphological variation that correlates with clines in altitude and latitude

Dans cette thèse, nous décrivons la synthèse de N-phényleéthyl-2-phényl-décahydroquinoléin-4-ones énantiomériquement enrichies par cycloaddition du 1-(1-triméthylsiloxyéthényl) cyclohexène et des benzylidène-1-phenyléthylamines (R) et (S), en présence d'acides de Lewis. Les cycloadduits exo et endo, obtenus après hydrolyse du milieu réactionnel par une solution aqueuse de NaHCO30,1M, sont traités par un mélange MeOH / ET3N et conduisent aux cétones exo et endo à jonction de cycle cis et endo à jonction de cycle trans. Une étude RMN 1H et une analyse RX permettent l'attribution de la structure des deux cétones exo et endo à jonction de cycle cis majoritairement formées. De ce fait, la structure des quatre autres cétones diastéréoisomères a pu être déduite. La régiosélectivité de la cycloaddition est très élevée ; en revanche, la sélectivité exo / endo est très faible ou nulle, quelles que soient les conditions expérimentales. En présence d'un acide de Lewis chiral dérivé du (R)-Binol, la stéréosélectivité faciale, notable pour l'approche exo [76/24 pour l'imine (R) et 81/19 pour l'imine (S), devient très élevée pour l'approche endo 92/8 pour l'imine (R) et 93/7 pour l'imine (S). La deuxième partie de ce travail concerne vingt-quatre plantes médicinales endémiques et indigènes de l'île de la Réunion, jusque là non étudiées. Elles ont été sélectionnées après un criblage chimique au cours duquel des tests de caractérisation de divers composés ont révélé la présence d'alcaloïdes. Notre étude a consisté en l'identification, la préparation à l'extraction, puis l'extraction de diverses parties de plantes. Les extraits alcaloïdes totaux finalement obtenus ont été fractionnés et étudiés par CPG/SM. Les études RMN ont permis d'identifier un certain nombre de composés prépondérants, qui n'étaient pas des alcaloïdes : des dimethoxy- et furocoumarines, communes à la plupart des plantes. Des alcaloïdes quinolizidiniques ont été également mis en évidence chez plusieurs espèces, ainsi que des furoquinoléines chez deux espèces de la famille des Rutaceae. Les tests biologiques, pratiqués sur une partie des extraits, n'ont pas permis, à ce jour, de révéler une activité biologique importante pour ces plantes médicinales. (Quatrième de couverture)

Chez les espèces sexuées, les systèmes de reproduction et la dispersion peuvent jouer un rôle important dans la viabilité des petites populations en ayant un impact direct sur les succès reproducteurs des individus. Chez les plantes, la reproduction et la dispersion sont principalement des processus passifs et dépendent donc de la densité locale en partenaires, de l’isolement entre populations et des relations génétiques entre individus. Chez Biscutella neustriaca, une espèce végétale micro-endémique de la vallée de la Seine, nous mettons en évidence une forte isolation génétique entre populations, corroborée par la fragmentation de l’habitat et les faibles capacités de dispersion de l’espèce. Nous déterminons également, par des approches moléculaires et phénotypiques, que B. neustriaca est strictement auto- incompatible. Dans un tel contexte d’isolement et de structuration spatiale de la diversité génétique, nous nous demandons dans quelles mesures la dispersion et l’auto-incompatibilité ont un impact sur les succès reproducteurs des individus. Par une approche expérimentale ex situ, nous mettons en évidence les effets de la limitation pollinique et une diminution de la disponibilité en partenaires compatibles sur la diminution du succès reproducteur maternel. Dans quatre populations naturelles, nous identifions le potentiel reproducteur individuel et la densité locale en partenaires disponibles comme les principaux facteurs expliquant la variabilité des succès reproducteurs mâle et femelle. Des facteurs génétiques tels que la consanguinité et l’auto-incompatibilité semblent également influencer les succès reproducteurs dans certaines populations. Nous discutons de l’importance de prendre en compte un grand nombre de facteurs lors d’actions de conservation menées dans une population, de la nécessité de connaître le système de reproduction et les capacités de dispersion de l’espèce, indissociables d’un suivi des populations ciblées, où les effets de ces facteurs ne seront détectables qu’à certaines échelles spatiales et temporelles. Nous illustrons nos travaux par une action de renforcement dans l’une des populations étudiées
In sexual species, reproduction systems and dispersal could involve in viability of small populations by having directly an impact on individuals’ reproductive success. In plants, reproduction and dispersal are mainly passive processes and thus depend of local density in mates, isolation between populations and genetic relationships among individuals. In Biscutella neustriaca, a micro-endemic plant of the Seine river valley, we highlight a strong genetic isolation between populations corroborated by habitat fragmentation and low dispersal abilities of the species. By using phenotypic and molecular approaches, we determine that B. neustriaca is strictly self-incompatible. In this context of isolation and spatially structured genetic diversity, we wonder to what extent dispersal and self-incompatibility impact individuals’ reproductive successes. Through an ex situ experiment, we highlight both effects of pollen limitation and decrease in local density of compatible mates on maternal reproductive success decrease. In four natural populations, we identify individual reproductive potential and local density of available mates as main factors explaining male and female reproductive successes variability. Genetic factors as inbreeding depression and self-incompatibility also seem to evolve in reproductive successes in some populations. We discuss about importance of considering many factors when acting for conservation in a threatened population, the need to know the reproductive system and dispersal abilities of the species, inseparable from a monitoring of targeted populations, where effects of these factors are only detectable at certain temporal and spatial scales. We illustrate our works by a concrete conservation action in one of the studied populations

Les travaux de thèse présentés dans ce manuscrit portent sur l’étude chimique de plantes du genre Psiadia. Trois axes de recherche ont été menés parallèlement à savoir (1) une étude chimiotaxonomique à partir de 11 espèces du genre Psiadia endémiques de La Réunion, (2) un criblage biologique réalisé sur 16 espèces du genre Psiadia dont 11 endémiques de La Réunion et 5 endémiques de Maurice et (3) une étude phytochimique ciblée sur l’espèce Psiadia arguta endémique de Maurice. Le premier axe comportant l'étude chimiotaxonomique menée par une approche métabolomique avait pour objectif d'identifier des marqueurs chimiotaxonomiques. Cette étude a été effectuée à partir des analyses CG-SM et CG-DIF des composés volatils et des analyses RMN 1H des composés non volatils de 11 espèces endémiques de La Réunion récoltées sur différents lieux géographiques et au cours des saisons estivale et hivernale. Une analyse intra-espèce a permis d'étudier la variabilité saisonnière et/ou géographique de la composition chimique de chaque espèce. Une analyse inter-espèces a conduit à deux classifications différentes des 11 espèces selon leur composition en métabolites volatils et non volatils. Le deuxième axe avait pour objectif d'identifier parmi 11 espèces du genre Psiadia endémiques de La Réunion et 5 espèces endémiques de Maurice, les espèces présentant une ou des activités biologiques prometteuses. Les cibles biologiques choisies ont été le parasite Plasmodium falciparum responsable du paludisme, la lignée cellulaire humaine cancéreuse HeLa responsable du cancer du col de l'utérus et l'enzyme HRP (Horseradish peroxydase) intervenant dans la réponse inflammatoire. À l'issue de ce criblage, 5 espèces se sont révélées prometteuses : les espèces réunionnaises P. amygdalina et P. anchusifolia et les espèces mauriciennes P. arguta et P. lithospermifolia pour l'activité antiplasmodiale, ainsi que l'espèce réunionnaise P. dentata pour les trois activités testées. Le troisième axe consacré à une étude phytochimique de P. arguta réalisée par un fractionnement bioguidé de l'extrait brut a conduit à l'isolement et à l'identification de 16 terpénoïdes : 2 triterpènes et 14 diterpènes de structure labdane dont 4 sont de structure nouvelle. Cinq diterpènes se sont révélés particulièrement actifs contre le parasite P. falciparum : l'acétate de labda-13(E)-en-8α-ol-15-yle, l'acétate de labdan-8α-ol-15-yle, le 13-épi-sclaréol, le labda-13(E)-ène-8α,15-diol et le (8R,13S)-labdane-8,15-diol. Par ailleurs, une étude métabolomique menée par RMN 1H sur des plantules de P. arguta cultivées in vitro et acclimatées a permis l'étude des facteurs influençant la production de ces composés bioactifs
The present work describes the chemical composition of the plant genus Psiadia and focuses on three research topics: (1) a chemotaxonomic study of 11 species endemic to Reunion island, (2) a biological screening of 16 Psiadia species among which 11 are endemic to Reunion and 5 are endemic to Mauritius and (3) a phytochemical investigation of Psiadia arguta, endemic to Mauritius. The aim of the chemotaxonomic study was to identify chemical markers by a metabolomic approach using GC-MS and GC-FID for volatiles compounds and 1H NMR for non-volatiles compounds. The 11 studied species were harvested in different locations and seasons in order to analyze the seasonal or geographical variability of the chemical profile of each species. This study led to two classifications of the 11 species in terms of the composition of volatiles and non-volatiles compounds. The objective of the second research topic was to identify within 11 species endemic to Reunion island and 5 species endemic to Mauritius, the most active species for the biological activities tested. The targeted activities were antiplasmodial against Plasmodium falciparum, anticancer against the human cancer cell lines HeLa and anti-inflammatory through the inhibition of the enzyme HRP (Horseradish Peroxidase). Four species, P. amygdalina and P. anchusifolia, endemic to Reunion, and P. arguta and P. lithospermifolia, endemic to Mauritius, were particularly active against P. falciparum. Besides, P. dentata (endemic to Reunion) displayed interesting antiplasmodial, anticancer and anti-inflammatory activities. The third research topic was devoted to a phytochemical investigation of P. arguta by a bioguided fractionation and led to purification and identification of 16 terpenoids: 2 triterpenes and 4 diterpenes including 4 new compounds. The evaluation of the antiplasmodial activity of all isolated compounds allowed to highlight activities of five diterpenes: labda-13(E)-en-8α-ol-15-yle acetate, labdan-8α-ol-15-yle acetate, 13-epi-sclareol, labda-13(E)-ene-8α,15-diol and (8R,13S)-labdane-8,15-diol. Furthermore, in order to identify factors influencing the production of bioactive compounds, P. arguta has been multiplicated using in vitro culture techniques and micropropagated plants were acclimatized

La flore de Corse est riche en plantes aromatiques et médicinales, pouvant être à l'origine de produits à forte valeur ajoutée (huiles essentielles, extraits, résines...) qui se présentent presque toujours comme des mélanges complexes dont il convient de déterminer la composition chimique avant leur éventuelle valorisation. La méthodologie adoptée au laboratoire pour l'identification des constituants est basée sur la complémentarité de diverses techniques : CC, CPG/Ir, CPG/SM-IE et RMN du carbone-13. L'objectif de notre travail est double : - objectif méthodologique, par la contribution à l'enrichissement de nos bibliothèques de référence et par l'évaluation et l'intégration de la CPG/SM en mode « Ionisation Chimique » dans la méthodologie d'analyse du laboratoire, - objectif finalisé, par la caractérisation de trois plantes de la région méditerranéenne : Cistus albidus, Eupatorium cannabinum subsp. corsicum et Doronicum corsicum, à travers l'étude de la composition chimique de leurs huiles essentielles, en adaptant la méthodologie d'analyse en fonction des résultats recherchés. L'huile essentielle de Cistus albidus de Provence s'est avérée différente de celles des autres espèces de Cistes par une proportion importante de sesquiterpènes à squelette bisabolane et par une faible abondance des monoterpènes et des diterpènes à squelette labdane. L'étude de deux plantes endémiques de Corse de la famille des Asteraceae, a permis de mettre en évidence : - pour l'huile essentielle de parties aériennes d'Eupatorium cannabinum subsp. corsicum, une prédominance des composés hydrocarbonés mono et sesquiterpéniques alors que, dans l'huile essentielle de racines, les composés oxygénés monoterpéniques dominent. - pour l'huile essentielle de Doronicum corsicum, une composition chimique originale par la présence, parmi les constituants majoritaires, de composés « inhabituels » dérivés du thymol non décrits dans la littérature. Ces huiles essentielles se caractérisent par la présence de nombreux esters et bi-esters monoterpéniques de thymyle, -de 8,9-déhydrothymyle, - de 8,9-époxythymyle, -de bornyle, -de néryle, -de lavandulyle dont nous avons, pour certains, réalisé l'hémisynthèse, et par celle de sesquiterpènes tricycliques. L'étude de ces esters en CPG/SM-IC nous a permis de mettre en évidence les mécanismes de réactions et de fragmentations se produisant en ICP et ICN avec différents gaz réactants (CH4 et NH3). Enfin, par l'utilisation combinée de la CPG/SM-(IE et IC) et de la RMN du carbone-13 nous avons pu identifier, dans ces huiles essentielles, de nombreux composés absents des différentes bibliothèques de référence.

Les champignons mycorhiziens à arbuscules (AMF) sont des symbiotes nécessaires au développement d’environ 80% des plantes vasculaires (Brundrett 2009). Leur impact sur l’adaptation et la croissance des plantes est essentiel, en particulier dans les milieux pauvres comme les maquis miniers de Nouvelle-Calédonie. Les études réalisées jusqu’à présent en Nouvelle-Calédonie sur ce sujet ont démontré l’importance de ces symbiotes dans les maquis miniers et leur rôle dans la nutrition des plantes endémiques et plus généralement dans l’adaptation aux contraintes multiples de ces milieux (Amir et al. 1997 ; Perrier et al. 2006 ;Amir et al. 2007 ; Amir et al. 2008 ; Lagrange 2009 ; Amir et Ducousso 2010). La maîtrise de la symbiose plante/AMF dans ces écosystèmes est essentielle à la mise au point de méthodes de restauration écologique des terrains miniers dégradés, d’autant que les AMF sont des symbiotes non spécifiques et que le même champignon peut être utilisé pour mycorhizer de nombreuses espèces végétales. Toutefois nos connaissances actuelles restent insuffisantes, notamment en ce qui concerne la biodiversité de ces AMF et les mécanismes de leurs effets positifs sur la plante
In New Caledonia (NC), restoration of open-cat mining sites is far from being mastered. It still needs work, to be improved, especially in plants - soil - microorganisms relationships. These works have focus on description of arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) diversity and role in the adaptation of plants to ultramafic constraint, with plant growth promoting rhibzobacteria (PGPR). The diversity of AMF is analyzed on two plant genera with species on ultramafic soils, nickel hyperaccumulat ing or not, and on volcano-sedimentary soils. The analysis of this diversity shows that community composition is contrasted between the two types of soil. Some of AMF taxa seem to be specific to ultramafic soils and some even to be specific to nickel hyperaccumulator species. For the role in adaptation of plants to ultramafic constraints, greenhouse experiments on three endemic species (Alphitonia meocaledonica, Carpolepis laurifolia and Costularia comosa) have shown that naturally brings mycorrhiza improved growth, mineral nutrition, water and Ca /Mg ration. Phosphorus additions seem to change these effects with different consequences on growth according to the host plant. Finally, the use of PGPR alone or with AMF showed that the effect depends on host plant species and bacterial strain, but usually leads to improved growth and plant nutrition. These studies have shown the importance of AMF in ultramafic soils NC

Depuis quelques décennies, la communauté scientifique s'intéresse de plus en plus à la recherche de nouvelles levures pour de nouvelles applications dans le domaine des biotechnologies blanches. De l'étude de la biodiversité à l'étude des propriétés métaboliques, les recherches visant à sélectionner de nouvelles levures avec des propriétés intéressantes pour l'industrie se sont intensifiées. Localisées dans le Sud-Ouest de l'océan Indien, les îles de La Réunion et de Madagascar sont aujourd'hui considérées comme des Hot Spot de la biodiversité. La grande diversité de plantes et de fruits tropicaux fournis des habitats naturels pour la propagation de nombreux microorganismes tels que les levures. A l'instar de ce qui se passe chez les plantes endémiques, nous avons formulé l'hypothèse que certains microorganismes ne peuvent être trouvés nulle part ailleurs que dans ces îles tropicales. 101 souches de levures réparties en 26 espèces différentes ont ainsi été isolées dans cette étude à partir de 13 fruits tropicaux récoltés aléatoirement dans les régions d'Antsirabe à Madagascar et de St-Paul à La Réunion. L'identification des espèces a été réalisée par analyse des séquences des domaines D1/D2 de la grande sous-unité des gènes de l'ARN ribosomique (ARNr). Les souches caractéristiques ont ensuite fait l'objet d’une analyse systématique par micro-extraction en phase solide couplée à une analyse chromatographique en phase gazeuse et couplé à un spectromètre de masse (ET-MEPS-CPG/SM) pour déterminer leurs capacités à produire des arômes. Parmi elles, deux souches isolées sur le fruit du poc-poc (Physalis peruviana) et sur le cacao (Theobroma cacao var. Criollo) semblent appartenir à de nouvelles espèces, probablement endémiques de la zone géographique étudiée. En effet, ces souches, EGPOC17 et EB23, présentent un faible pourcentage d'identité avec les séquences de l'ARNr des levures Rhodotorula mucilaginosa (97,1% d'identité) et Candida pararugosa (97,4% d'identité). 52 composés organiques volatiles (COVs) différents, classés en cinq grandes classes de molécules, les acides, les alcools, les aldéhydes, les cétones et les esters ont ainsi été identifiés. Une analyse statistique a ensuite été réalisée pour tenter de classer ces souches par catégories en fonction de leurs caractéristiques métaboliques. Avec une production de 32 molécules différentes sur les 52 identifiées, la levure Saprochaete suaveolens (anciennement connue sous le nom de Geotrichum fragrans) est de loin la souche produisant le plus grand nombre de composés d'arômes, en particulier d'esters et de composés insaturés. D'autres souches comme Candida quercitrusa, Debaryomyces nepalensis, Pichia kluyveri et Sporidiobolus pararoseus semblent également être intéressantes pour la production d'acides, d'alcools et de cétones. Parmi les COVs identifiés, des composés comme le 2 méthylbut-2-énoate d'éthyle (tiglate d'éthyle), le 2-méthylbut-2-énoate de 3 méthylbutyle (tiglate d'isoamyle), le 2-méthylbut-2-énoate de butyle (tiglate de butyle), 3-méthylbut-2-énoate d'éthyle, 2-méthylbut-2-énoate de 2-méthylpropyle et le but-2-énoate d'éthyle ont été retrouvés spécifiquement chez la levure Saprochaete suaveolens. La présence de ces molécules, très peu décrites chez les levures dans la littérature, suggère des relations taxonomiques de type «arôme-espèce» ou «arôme-genre » chez les levures
In recent years, there has been an increasing interest in identifying and characterizing the yeast ecosystems associated with diverse types of habitat because of the many potential desirable technological properties of these microorganisms, especially in food applications. In this study, a total of 101 yeast strains were isolated directly from the skins of tropical fruits collected in several locations in the South West Indian Ocean (in the regions of Anstirabe in Madagascar and Saint Paul in Reunion Island). Species identification was determined by sequence analysis of the D1/D2 domains of the large subunit (LSU) ribosomal RNA gene. The strains were classified into 26 different species and tested for their potential to produce aromatic flavouring compounds. Among the isolated strains, two species isolated from the skins of Cape gooseberry and Cocoa beans appeared to represent putative new yeast species. Strains EGPOC17 and EB23 showed LSU D1/D2 sequence homologies of only 97.1% and 97.4% with the yeasts Rhodotorula mucilaginosa and Candida pararugosa, respectively. In total, 52 Volatile Organic Compounds (VOCs) were detected by Head Space Solid Phase Micro Extraction coupled to Gas Chromatography and Mass Spectroscopy (HS-SPME-GC/MS) analysis and these were classified into five main groups, namely, acids, alcohols, aldehydes, ketones and esters. In order to classify and discriminate the yeast biodiversity, statistical analysis was performed which allowed the yeasts to be categorized according to their flavour production. With a production of 32 compounds among 52 VOCs, Saprochaete suaveolens (Geotrichum fragrans) seemed to be the best producer of flavour compounds, especially esters and unsaturated compounds. Other yeast species including Candida quercitrusa, Debaryomyces nepalensis, Pichia kluyveri and Sporidiobolus pararoseus also appeared of potential interest based on their abilities to produce acid, alcohol and carbonyl compounds. Among the VOCs detected, 6 uncommon compounds namely ethyl but-2-enoate, ethyl 2-methylbut-2-enoate (ethyl tiglate), ethyl 3-methylbut-2-enoate, 2-methylpropyl 2-methylbut-2-enoate, butyl 2-methylbut-2-enoate and 3 methylbutyl 2-methylbut-2-enoate were identified as possible yeast species specific flavour markers

B. V. Maritima, B. V. Adanensis, B. Macrocarpa 2X et B. Macrocarpa 4X appartiennent à la section Beta, genre Beta (Amaranthaceae) dont l'aire de diversification s'est concentrée dans le bassin méditerranéen. La diversité des répartitions géographiques et des traits d'histoire de vie au sein de cette section engendre la possibilité d'étudier la phylogénie d'espèces proches, les effets des oscillations climatiques du Pléistocène et les événements de spéciation en sympatrie et en système insulaire. Une phylogénie de la section a été construite afin d'appréhender la diversité génétique de chaque espèce et sous-espèce et les relations qu'elles partagent. De grandes différences de niveaux de diversité entre les taxons autogames (B. V. Adanensis et B. Macrocarpa 2X) et allogame (B. V. Maritima) et une relation étroite entre B. V. Maritima et B. V. Adanensis ont été observés. Les patrons de variabilité intraspécifique ont été examinés en détail chez l'espèce cosmopolite côtière B. V. Maritima et des hypothèses quant à la localisation et au nombre de zones refuges ont été testées. Les résultats indiquent que B. V. Maritima a probablement subi une contraction de son aire de distribution qui s'est ainsi restreinte à trois principales zones refuges puis s'est étendue vers le Nord, pour s'établir dans les régions qu'elle occupe actuellement. Dans un de ces refuges potentiels, sur la péninsule ibérique, deux espèces diploïdes de la section, B. Macrocarpa et B. V. Maritima, sont trouvées en sympatrie. L'espèce allogame montre une structure génétique de ses populations très faible et de hauts niveaux de diversité génétique comparativement à l'espèce autogame chez laquelle la structuration génétique est très marquée et la diversité génétique très faible. II a d'autre part été montré l'existence de plantes intermédiaires génétiquement entre les deux espèces, suggérant des événements rares d'hybridation en conditions naturelles. Enfin, l'étude suggère une origine multiple de la forme allotétraploïde de Beta macrocarpa, une espèce de betterave endémique des Canaries qui dérive d'un croisement naturel entre ces deux espèces diploïdes continentales : B. V. Maritima et B. Macrocarpa.

Cette étude propose une mise au point sur l'entomofaune phytophage associée à la flore indigène de l'Île de la Réunion. Son objectif vise à une meilleure compréhension de l'origine, du développement et de la biodiversité de l'île. Trois modèles ont été sélectionnés : Lépidoptères Sphingidae et Geometradae, Hémiptères Fulgoromorphes (Achilidae, Cixiidae, Derbidae, Delphacidae, Flatidae, Issidae, Kinnaridae, Meenoplidae, Tropiduchidae, Ricaniidae) et Coléoptères Curculionidae. 146 taxons botaniques dont 64 endémiques ont été étudiés sur lesquels 161 espèces de phytophages ont été sélectionnés. Pour la plupart des insectes, les plantes-hôtes et les stades larvaires sont signalées ou décrits pour la première fois ; plusieurs taxons sont nouveaux pour la Réunion ou pour la science. - On observe une répartition plus large que prévue pour les Lépidoptères qui ont su s'adapter à des biotopes de forêts mésotherme hygrophile. - Quelque soient les biotopes étudiés, les fulgoromorpha sont mieux représentés que les Cicadomorpha. En général, leur régime alimentaire apparaît plus stricte et des relations trophiques préférentielles entre des taxons familiaux ou spécifiques de Fulgoromorpha et des taxons bien définis de plantes sont mises en évidence (Achilidae : Paraphypia et Deltometopus sur Myrtacea, Derbidae et monocotylédones, Delphacidae et commelinanae : Myndus sur Arecaceae et Eumyndus sur Pandanaceae,. . . ). - Hormis quelques espèces, les Cratopus ( Curculionidae) sont polyphages et non restreint à la flore indigène. Les modèles des geometridae et des Fulgomorpha apparaissent fournir les meilleures informations quant à la qualité de conservation des écosystèmes de la Réunion. Ils montrent en effet une forte corrélation avec leurs plantes-hôtes endémiques. À ce titre ils pourraient constituer des bioindicateurs pertinents pour mieux évaluer la struture et l'évolution des milieux indigènes afin d'assurer dans l'avenir le maintien du caratère original de la biodiversité de l'Île de la Réunion.

L’étude chimique de l’exsudat glutineux recouvrant les bourgeons et la base des feuilles de Gardenia urvillei Montrouz. et Gardenia oudiepe Vieill., Rubiaceae endémiques de Nouvelle-Calédonie, a conduit à la détermination structurale de douze cycloartanes, neuf seco-cycloartanes, huit dammaranes et sept flavonoïdes. Parmi ces métabolites secondaires, six cycloartanes, quatre seco-cycloartanes et deux dammaranes sont des composés originaux. Les évaluations biologiques sur différentes cibles, notamment la recherche de propriétés anti-angiogéniques par déplacement du VEGF de son récepteur VEGF-R1 ou par inhibition de la polymérisation de la tubuline, ayant montré des résultats encourageants, une chimiothèque d’analogues a été hémisynthétisée. A cette fin, les composés majoritaires en séries cycloartane, dammarane, et flavonoïde, respectivement l’oudiépone A, l’hydroxydammarénone II, la santine, la 5,7-dihydroxy-3,3’,4’,5’,6-pentaméthoxyflavone et le kaempférol ont servi de points de départ à des modifications structurales ayant permis d’accéder à douze cycloartanes, deux seco-cycloartanes, trois dammaranes, un seco-dammarane et huit flavonoïdes supplémentaires. Un début de relation structure-activité a ainsi pu être décrit dans les domaines mentionnés précédemment
Phytochemical studies of glutinous exudate covering the buds et the leaf base of Gardenia urvillei Montrouz. et Gardenia oudiepe Vieill., Rubiaceaeous species endemic to New Caledonia, have led to the identification of twelve cycloartanes, nine seco-cycloartanes, eight dammaranes et seven flavonoids. Among these secondary metabolites, six cycloartanes, four seco-cycloartanes et two dammaranes are original natural products. Biological evaluations, such as search for anti-angiogenic properties or inhibition of tubulin polymerization, have shown promising results. In order to establish the structure-activity relationships for these activities, twenty-six analogs were semisynthesized from the major isolated compounds, oudiépone A, hydroxydammarénone II, santin, 5,7-dihydroxy-3,3’,4’,5’,6-pentamethoxyflavone et kaempferol

L'implication des polyamines dans le développement précoce sous contraintes environnementales a été étudiée chez la crucifère endémique subantarctique, Pringlea antiscorbutica, et la plante modèle Arabidopsis thaliana. Une relation causale est mise en évidence entre polyamines et plasticité du développement précoce. La tolérance des plantules de P. Antiscorbutica au froid positif (chilling) est associée à de fortes teneurs en polyamines, en particulier en agmatine; leur diminution est associée à la sensibilité au froid dans les plantules d'A. Thaliana. Les niveaux de polyamines sont chez P. Antiscorbutica des marqueurs de la contrainte imposée, comme le froid ou la salinité, et le double rôle des polyamines, de protection et de régulation, est montré lors de carences nutritives. L'étude des gènes codant l'Arginine Décarboxylase, impliqués dans la synthèse des polyamines, montre que la tolérance au froid est liée à une expression différente des paralogues ADC.

Dans une époque dominée par de fortes transformations anthropiques, la recherche de nouvelles approches pour concilier les activités humaines et les écosystèmes naturels devienent de plus en plus importants. En ce sens, les concepts de « Services Ecosystémiques »et de « Systèmes Socio-Ecologiques » sont de plus en plus utilisés dans différentes disciplines scientifiques et sont pris en compte dans les sphères politiques pour attirer l'attention sur les bénéfices que les humains tirent des écosystèmes. Ces concepts conduisent à l'étude des liens complexes entre la société et la nature, où la dimension spatiale et les caractéristiques du paysage ont une forte influence. Cependant, peu d'études ont été appliquées dans le cadre d'une approche spatiale.Cette thèse présente une recherche sur la dimension spatiale des Services Ecosystémiques, en particulier ceux des forêts tempérées des montagnes à la périphérie du Mexico DF. Les écosystèmes jouent un rôle important dans le bien être humaine par le biais de nombreux services écosystémiques. Ces Services Ecosystémiques sont le résultat des interactions complexes entre la nature et la société.Le Valle Central (zone centrale) du Mexique en particulière est un espace prioritaire pour la conservation de la biodiversité du fait du haut degré d’endémisme des espèces de faune et de flore présente. Dans cette zone où se situent plusieurs aires naturelles protégées, une initiative publique-privée cherche à créer une nouvelle catégorie de conservation qui inclut la gestion de toutes ces aires. Cette initiative est connue sous le nom de « Bosque de Agua » (Foret d’eau). Or, au « Bosque de Agua » les enjeux spatiaux entre nature et société font l’objet de pressions anthropiques fortes qui sont dues aux activités minières et agricoles et à l’étalement urbain des grandes conurbations. Dans cet espace, ces pressions entraînent la dégradation des écosystèmes naturels. Des recherches sont nécessaires pour analyser la dimension spatiale des interactions entre la nature et la société, en étudiant la synergie entre les Systèmes-Socio-Ecologiques et Services Ecosystémiques.La thèse introduit le cadre conceptuel utilisé pour étudier les liens entre les Services Ecosystémiques et les Systèmes Socio-Ecologiques. On considère dans cette recherche que les Services Ecosystémiques se trouvent au centre du Système Socio-Ecologique « Bosque de Agua ».Dans la partie sur modélisation spatiale ont été évalué quatre services (la provision d’eau, la provision de bois, la provision de nourriture et la régulation du climat local). Les résultats de cette partie incluent une carte des Services Ecosystémiques en identifiant les zones sensibles « points chauds » (hotspots) des Services Ecosystémiques. Ces résultats rendent explicite dans l'espace, par le biais de régressions pondérées géographiquement, l'impact des caractéristiques du paysage sur les Services Ecosystémiques.Par ailleurs, la cohérence spatiale des aires naturelles protégées et la distribution spatiale des services écosystémiques ont été évaluées en termes de superficie. L'objectif est de créer une typologie des zones naturelles en fonction de la surface des points chauds des Services Ecosystémiques protégés et non protégés.Finalement, un troisième résultat porte sur la perception qu’ont les habitants locaux de la capacité intrinsèque du « Bosque de Agua » de fournir des Services Ecosystémiques. Ce capacité perçu a été évalué par le biais des photoquestionaires effectué sur le terrain
In an era dominated by strong anthropogenic transformations, the search for new approaches to reconcile human activities and natural ecosystems is becoming increasingly important. In this sense, the concepts of "Ecosystem Services" and "Socio-Ecological Systems" are increasingly used in different scientific disciplines and are taken into account in political spheres to draw attention to the benefits that humans derive from ecosystems. These concepts lead to the study of complex links between society and nature, where the spatial dimension and landscape characteristics have a strong influence. However, few studies have been applied in a spatial approach.This thesis presents a research on the spatial dimension of Ecosystem Services, in particulary those of the temperate forests of the mountains on the periphery of Mexico City. Ecosystems have an important role to the human well-being through many ecosystem services. These Ecosystem Services are the result of complex interactions between nature and society.The Central Valley (central zone) of Mexico is a priority area for biodiversity conservation due to the high degree of endemism of the fauna and flora species present. In this zone where several protected natural areas are located, a public-private initiative is seeking to create a new conservation category that includes the management of all these areas. This initiative is known as the "Bosque de Agua" (Water Forest). However, in the "Bosque de Agua" the spatial stakes between nature and society are subject to strong anthropic pressures which are due to mining and agricultural activities and to the urban spread of large conurbations. In this space, these pressures lead to the degradation of natural ecosystems. Research is needed to analyse the spatial dimension of interactions between nature and society, by studying the synergy between Socio-Ecological Systems and Ecosystem Services.The thesis introduces the conceptual framework used to study the links between Ecosystem Services and Socio-Ecological Systems. It is considered in this research that Ecosystem Services are at the centre of the "Bosque de Agua" Socio-Ecological Ecological System.In the spatial modelling section, four Ecosystem Services were evaluated (water supply, wood supply, food supply and local climate regulation).The results of this section include a map of Ecosystem Services by identifying hotspots of Ecosystem Services. These results make explicit in space, through geographically weighted regressions, the impact of landscape characteristics on Ecosystem Services.In addition, the spatial coherence of protected natural areas and the spatial distribution of Ecosystem Services were assessed in terms of area. The objective is to create a typology of natural areas according to the surface area of protected and unprotected Ecosystem Services hotspots.Finally, a third result relates to the perception of local inhabitants of the intrinsic capacity of the "Bosque de Agua" to provide Ecosystem Services. This perceived capacity was assessed through field photo questionnaires

Le présent travail consiste en une analyse de la biologie et de l'écologie de l'endémique corso sarde littorale sabulicole, Anchusa crispa, dans un but de conservation, scientifiquement fondées. Ce taxon est en effet rare et protège au niveau national et classe dans la liste des espèces prioritaires de la directive européenne habitats. Anchusa crispa est localisée dans 3 entités géographiques distinctes : 14 sites sur la cote nord-ouest de la Sardaigne et 7 sites en corse (5 sur la cote occidentale, dans le golfe du Valinco et 2 sur la cote orientale). Des mesures morphologiques et moléculaires effectuées sur diverses populations de corse et de Sardaigne ont montre des différences nettes entre les 3 entités géographiques. En revanche, il n'existe pas de différences notables au sein et entre les populations de chaque entité. Des expériences d'auto- et d'allo-pollinisation in situ et en serre ont permis de montrer qu'Anchusa crispa est auto-compatible et autoféconde. La mesure de la performance des individus issus de ces pollinisations sur 2 générations a mis en évidence l'existence d'une dépression d'allo-fécondation. Les akenes d'anchusa crispa sont dissémines sur de courtes distances par les fourmis et la dissémination sur de longues distances, par voie d'eau, est un événement exceptionnel. Il existe, de plus, une banque de graines. Le stade critique pour la survie de l'espece ainsi que son cycle phenologique ont été détermines a la suite d'un suivi demographique de 3 ans. Ces différents résultats permettent de préconiser des mesures de conservation et de gestion des populations naturelles d'Anchusa crispa.

Zelkova sicula di pasquale, garfi et quezel est un taxon relique de la flore tertiaire. Tres repandu en europe en milieux hygro-mesophiles pendant le miocene et le pliocene, le genre zelkova a progressivement disparu suite aux changements climatiques pliocenes superieurs (etablissement d'un climat de type mediterraneen) et pleistocenes (cycles glaciaire/interglaciaire). Ces evenements sont probablement responsables des modifications caryologiques qui ont affecte z. Sicula, engendrant sa condition actuelle de triploide et une sterilite gametique. La multiplication vegetative constitue a present le seul mode de reproduction connu. Les potentialites reiteratives de z. Sicula jouent un role primordial dans ses strategies de vie. De fait, cette espece montre une plasticite phenotypique remarquable, lui permettant de reparer des dessechements partiels (petits rameaux et brindilles) ou totales (tiges) de l'appareil epige, occasionnes par l'impact des constraintes physiques (stress hydrique) et biotiques (paturage) de son habitat actuel. Il est possible que cette aptitude opportunste, notamment au niveau de la reiteration regenerative, ait ete amplifiee par la polyploidisation. Cependant, tout en restant un caractere de resistance, ce comportement reflete aussi une adaptation typique des populations regressives, incapables de se reproduire par voie sexuee. L'activite cambiale de z. Sicula parait relativement bien adaptee a la rythmicite du climat mediterraneen. Mais, a la difference des taxa eumediterraneens typiques, il n'est pas capable d'exploiter la totalite des ressource hydriques stockees dans le sol durant la periode automne-hiver. Seules les pluies des mois proches ou contemporaines de la phase d'activite vegetative et celles de septembre ont une influence positive sur la croissance. En revanche, des temperatures excessives en mai, accelerant le taux d'evapotranspiration, sont susceptibles de stopper precocement l'activite cambiale. De plus, leur persistance pendant les mois d'ete peut produire des phenomenes de descente de cime. La niche tres specialisee ou la population actuelle est confinee et certaines potentialites adaptatives developpees par cette espece constituent vraisemblablement les elements avant permis son maitien jusqu'a nos jours.

La connaissance de la distribution spatiale des espèces et leurs déterminants constituent les principaux thèmes de la biogéographie et de l’écologie. Cette thèse a été réalisée sur les Fabaceae de l’Afrique Centrale :Burundi, République Démocratique du Congo et Rwanda. Composées de trois sous-familles (Caesalpinioideae, Faboideae et Mimosoideae), les Fabaceae sont présentes dans tous les biomes terrestres du monde. La présente étude a pour objectif d’évaluer et localiser la diversité spécifique, déterminer les zones de conservation des Fabaceae, identifier leur modèle de distribution spatiale et examiner l’impact potentiel de la déforestation sur les espèces indicatrices de cette famille. Les facteurs environnementaux déterminant la distribution des espèces endémiques de Fabaceae, les zones favorables à leur présence et l’évaluation de leur état de conservation ont également été analysés. L’étude a consisté à vérifier et à digitaliser tous les échantillons d’herbiers des Fabaceae conservés au Jardin Botanique National de Belgique et à l’Université Libre de Bruxelles. Les Systèmes d’Information Géographique ont été largement utilisés. Les analyses spatiales ont montré une distribution non uniforme de la diversité spécifique des Fabaceae. Les zones où la diversité spécifique coïncide avec celle des espèces endémiques ont été suggérées comme prioritaires pour la conservation. L’analyse de groupement appliquée sur le jeu de données des Mimosoideae a mis en évidence trois régions floristiques majeures. Ces trois régions correspondent aux régions phytogéographiques définies par White (1979, 1983). L’étude des Caesalpinioideae a confirmé l’existence d’espèces indicatrices de territoires phytogéographiques de Ndjele (1988). L’étude de cas réalisée au Katanga (R.D. Congo) a montré que la déforestation constitue une menace potentielle pour ces espèces, les plus vulnérables étant inféodées aux habitats forestiers. La distribution potentielle des espèces endémiques de Fabaceae (Caesalpinioideae) a montré une convergence entre les cartes de la distribution actuelle et celles issues de la distribution potentielle. Des sites où les espèces n’ont jamais été signalées ont été identifiés. La distribution potentielle a démontré le rôle des déterminants environnementaux dans la distribution des espèces endémiques. Cette étude a également prouvé que d’importantes proportions des zones de diversité des espèces endémiques ne sont pas couvertes par la conservation actuelle de l’Afrique Centrale. Cette thèse confirme que l’Afrique Centrale est une zone importante de conservation de la biodiversité. L’étude devrait être poursuivie en étendant la distribution potentielle aux Fabaceae non endémiques afin de définir leurs aires de distributions, critère indispensable pour évaluer le degré de vulnérabilité d’une espèce. La création de nouvelles aires protégées renforcerait le système actuel de conservation dans cette région./Knowledge of the spatial distribution of species and its determinants constitutes a principal theme in biogeography and ecology. This dissertation focused on the Fabaceae family of Central Africa: Burundi, the Democratic Republic of the Congo and Rwanda. Composed of three subfamilies (Caesalpinioideae, Faboideae and Mimosoideae), Fabaceae species are present in all terrestrial biomes of the world. The current study aimed to assess and locate Fabaceae species diversity, to determine potential conservation zones, to identify the spatial distribution pattern and to examine the potential impact of deforestation on some indicator species of this family. The environmental factors driving the distribution of endemic Fabaceae have been identified, as well as the potential areas of occurrence; their conservation status in the region has also been studied. The current study has verified and digitized all the herbarium samples kept at the National Botanical Garden of Belgium and the Université Libre de Bruxelles regarding the Fabaceae family. Geographic Information Systems have been used frequently. Spatial analysis showed an uneven distribution of Fabaceae species diversity. The zones where species richness depends on endemic species diversity are suggested to have priority for conservation. A cluster analysis applied to the dataset of Mimosoideae has highlighted three major floristic regions. These three regions correspond to existing phytogeographical regions defined by White (1979, 1983). A study on Caesalpinioideae species of Central Africa has confirmed the existence of indicator species of phytogeographic territories of Ndjele (1988). A case study conducted in Katanga (D.R Congo) showed that deforestation constitutes a potential threat for these species, the most vulnerable being those strictly confined to forest habitats. The potential distribution of endemic Fabaceae (Caesalpinioideae) showed a clear convergence between the current distribution maps and the potential distibutions. Sites where those species had not been reported before have been identified. The potential distribution enabled to identify the importance of the different environmental factors for each endemic species’ distribution. This study also showed that large regions characterized by important endemic species diversity are not covered by current zones of conservation in Central Africa. This dissertation confirms Central Africa as an important zone for biodiversity conservation. The current research should be completed by the potential distribution of non endemic Fabaceae species of Central Africa, an important criterion to evaluate their degree of vulnerability. Creation of new protected areas would reinforce the current status of conservation in the region.
Doctorat en Sciences
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Depuis le Néolithique, les activités anthropiques ont fortement impacté la persistance et l’évolution des espèces méditerranéennes, avec des effets variés sur la biodiversité, notamment son érosion et son homogénéisation. Composé seulement de trois à cinq espèces, le genre méditerranéen et Sud-asiatique Arundo L. (Poaceae) illustre bien les interactions Homme-Biodiversité. Tout d’abord, l’imprécision des statuts taxonomiques pour la plupart de ces espèces dessert autant la conservation des populations françaises protégées d’A. plinii Turra s.l. que la lutte contre l’invasive mondiale A. donax L. Suite à la révision systématique du complexe circumméditerranéen A. plinii Turra s.l., trois taxons ont été distingués, élevant les populations françaises au rang d’endémique ligure, A. donaciformis (Loisel.) Hardion et al. Cette dernière s’est différenciée en marge de son espèce-sœur, l’Italo- Balkanique A. plinii s.s., sous les effets conjugués de la polyploïdie et des oscillations climatiques du Pléistocène. La forte clonalité du genre et la formation récente d’A. donaciformis ont réduit son potentiel adaptatif. Malgré une persistance ancienne au sein d’un paysage agricole, son actuelle position urbaine sur la Côte d’Azur la menace fortement. Enfin, l’origine perse d’A. donax et l’hypothèse de son statut d’archéophyte en Méditerranée illustre l’intérêt primordial de ce genre lors du développement des civilisations antiques
Human activities have scrambled biodiversity persistence and evolution of Mediterranean species since the Neolithic, inducing various impacts on biodiversity, from reduction to homogenisation. With only three to five species, the Mediterranean and South- Asian genus Arundo L. (Poaceae) well illustrate these Human-Biodiversity interactions. First, the taxonomic mess for almost all Arundo taxa harms the conservation of protected French populations of A. plinii Turra s.l. as much as the biological control of the worldwide invasive A. donax L. The systematic revision of the circum-Mediterranean A. plinii complex in three distinct taxa has distinguished French populations as a Ligurian endemic species, A. donaciformis (Loisel.) Hardion et al. This species was differentiated from its nearest relative, the italo-balkan A. plinii s.s., under the coupled effects of polyploidy and Pleistocene climatic variations. The dominating clonality of the genus and the recent speciation of A. donaciformis have reduced its adaptive potential. Despite its ancient persistence under farmlands, its current urban position on the French Riviera threatens this protected species. Finally, the Persian origin of A. donax and its hypothetic status of archeophyte in the Mediterranean show the essential usefulness of this genus during the development of antic civilisations