Dissertations / Theses: 'Poissons – Populations'

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Thiaw, Modou. "Dynamique des ressources halieutiques à durée de vie courte : cas des stocks de poulpe et de crevettes exploités au Sénégal." Rennes, Agrocampus Ouest, 2010. http://www.theses.fr/2010NSARH079.

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Abstract:

Le Sénégal possède des eaux à très forte productivité dont le potentiel halieutique est exploité depuis plus d’une cinquantaine d’année. L’exploitation des ressources halieutiques s’est intensément accrue au cours des trois dernières décennies, conduisant ainsi à des changements écologiques dans la composition des peuplements marins. On a notamment assisté à l’effondrement de certains stocks de poissons démersaux au profit d’autres espèces, à durée de vie plus courte, telles que les poulpes et les crevettes. Ces stocks, devenus aujourd’hui les enjeux majeurs de la filière pêche en Afrique de l’Ouest, présentent cependant des dynamiques beaucoup plus rapides et plus instables que celles des stocks de poissons. Leur exploitation durable implique donc un aménagement des pêches adapté, tenant compte de leurs dynamiques particulières. Le travail de thèse a pour objectif principal, de comprendre la dynamique des populations de poulpe et de crevettes en vue de consolider les bases scientifiques des plans d’aménagement des pêches
Senegalese waters presented high fish productivity and stocks are exploited since more than about fifty year. Exploitation intensely increased over the last three decades, inducing ecological changes in the composition of marine populations. Some demersal stocks collapsed to the advantage of other species, characterized by shorter life, such as the octopus and shrimps. Today, these stocks are becoming major stakes of fishing. But short-lived species exhibit rapid and unstable dynamics, and their potential for production varies widely from year-to-year. So, their sustainable exploitation implies an adapted fisheries management, taking into account these specific dynamics. The main objective of the present PhD thesis was to understand the octopus and shrimps stocks’ dynamics, in order to improve the scientific bases of fisheries management plans

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Perodou, Jean-Bernard. "Dynamique de la population exploitée de vivaneau rouge (Lutjanus Purpureus) de Guyane : complémentarité des analyses globale et structurale." Lille 1, 1994. http://www.theses.fr/1994LIL10054.

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Abstract:

La dynamique de la population de vivaneau rouge de guyane, exploitee par une flottille de ligneurs venezueliens, est etudiee en utilisant a la fois l'approche globale puis l'approche analytique. Enfin la complementarite des deux analyses est examinee via l'estimation du coefficient de capturabilite. Le traitement des pue par une modele multiplicatif a trois facteurs apporte en sortie trois types de donnees elaborees: les puissances de peche des navires, les abondances des strates spatio-saisonnieres et les abondances annuelles. Les navires forment un ensemble homogene vis-a-vis de leur pouvoir de capture. Une augmentation d'abondance en fonction de la profondeur est observee dans les strates spatio-saisonnieres. L'indice annuel d'abondance subit une baisse au cours des cinq annees d'observations (1987-1991) dont la cause principale est attribuee a l'augmentation correlative de l'effort de peche. Dans l'analyse structurale, la dynamique du stock est etudiee a partir d'une composition en taille des captures. Les taux de mortalite par peche et les effectifs de survivants sont estimes a l'aide de la technique de l'analyse de population virtuelle sur les tailles. La fonction de rendement par recrue indique que toute augmentation du taux d'exploitation actuel provoquerait a l'equilibre une baisse de rendement par recrue. Le coefficient de capturabilite varie en fonction du bateau, de la strate spatio-saisonniere et de la classe de taille du poisson. Pour s'affranchir de cette variabilite, les previsions de capture sont faites dans des conditions standards, en faisant varier l'effort de peche standard. Sur un plan pratique, un diagnostic de l'etat d'exploitation est presente: la ressource apparait comme stable, surexploitee et en phase transitoire. Si l'effort de peche se maintenait au niveau actuel, il faudrait prevoir dans les annees a venir une baisse importante de la production.

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Chatain, Béatrice. "Estimation et amélioration des performances zootechniques de l'élevage larvaire de Dicentrachus labrax et de Sparus auratus." Aix-Marseille 2, 2010. http://www.theses.fr/1994AIX22099.

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Eppe, Robin. "Structuration génétique des populations de poissons d'eau vive : comparaison de l'influence respective de l'hydrographie et des traits biologiques chez l'ombre commun et le chabot." Lyon 1, 2001. http://www.theses.fr/2001LYO10071.

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Abstract:

En deçà du niveau taxonomique de l'espèce, la gestion du patrimoine piscicole dans une perspective de "conservation de la biodiversité" nécessite d'appréhender le fonctionnement de ses composantes populationnelles et évolutives en fonction des contraintes physiques inhérentes au réseau hydrographique et des réponses biologiques développées par les espèces, l'ensemble se traduisant directement en termes de structures génétiques et flux géniques. Ces relations ont été abordées par l'électrophorèse des protéines chez deux espèces d'eau vive aux stratégies biologiques contrastées, le chabot (Cottus gabio s. L. ) et l'ombre commun (Thymallus thymallus). Le chabot présente de fréquentes fixations alléliques différentielles entre populations qui se traduisent par des distances de Nei intra bassin atteignant 0,22 dans un petit bassin comme celui de l'Hérault et de 0,43 dans celui de la Loire. Les distances inter bassins peuvent quant à elles dépasser 0,76. L'ombre commun, montre des distances près de deux fois moindres en inter bassin, et jusqu'à dix fois moindres en intra bassin (0,032 dans le bassin ligérien). À l'échelle du bassin, la variabilité intra population apparaît deux fois plus faible que la variabilité inter population chez le chabot (14,7% de la variabilité totale contre 30,1%), alors que la tendance inverse est observée chez l'ombre (37,4% contre 18%). Ces différences peuvent être reliées aux caractéristiques biologiques de ces espèces. Le chabot, beaucoup plus sédentaire et bien moins fécond, a une taille efficace de ses populations réduite d'autant, d'où une baisse de la diversité intra population et une divergence rapide des populations. En conséquence, alors que l'unité fonctionnelle et évolutive est de l'ordre du bassin hydrographique chez l'ombre commun, elle ne dépasse guère la rivière ou même le tronçon de rivière chez le chabot.

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Duhamel, Guy. "Ichtyofaune des secteurs Indien occidental et Atlantique oriental de l'Océan Austral : biogéographie, cycles biologiques et dynamique des populations." Paris 6, 1987. http://www.theses.fr/1987PA066349.

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Abstract:

Après avoir souligné le caractère complexe du système hydrologique régnant dans le secteur indien occidental de l'océan austral, l'auteur présente une synthèse biogéographqiue de l'ichtyofaune présente dans ce secteur. Puis l'étude est restreinte aux espèces abondantes du plateau de Kerguelen (Nototheniidae et channichthyidae) afin de déterminer les caractéristiques biologiques de ces espèces, leur place dans l'écosystéme péri-insulaire et d'envisager leur distribution spatio-temporelle surce plateau isolé au sein de l'océan austral. Le derneir aspect concerne la dynamique des populations et les structures démographiques. L'analyse des tendances dans l'évolution est importante du point de vue de l'économie des pêches et pour leur rôle dans les ecosystèmes marins antarctiques.

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Renaud, François. "Biologie et évolution des populations d'Helminthes parasites : le modèle Helminthes-Téléostéens." Montpellier 2, 1988. http://www.theses.fr/1988MON20127.

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Abstract:

L'evolution des associations interspecifiques est envisagee, dans les populations, sous la forme d'un jeu evolutif simple s'appuyant sur le principe de la theorie des jeux. Les solutions du jeu revelent l'existence de deux equilibres evolutifs bases l'un sur le conflit et l'autre sur la cooperation. Les differentes strategies que peuvent adopter les partenaires sont examinees au travers de plusieurs exemples pris dans le monde du parasitisme. La biologie et l'evolution des coupes helminthes-teleosteens sont etudiees par differentes approches: le role respectif des strategies de la reproduction et de la transmission parasitaire; les phenomenes de speciation et de specificite analyses a l'aide de trois modeles diplozoon (monogenea); bothrimonus (cestoda) et bothriocephalus (cestoda) revelent l'existence de relations etroites qui lient les couples hotes-parasites. A partir de la divergence genetique observee au niveau de 12 loci, une phylogenie de huit especes de bothriocephales (cestoda) est etablie. La comparaison de cette phylogenie a celle des especes hotes permet de discuter des concordances phylogenetiques hotes et parasites

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Renno, Jean-François. "Génétique des populations et biogéographie de l'ichtyofaune néotropicale : le modèle Leporinus de Guyane." Montpellier 2, 1989. http://www.theses.fr/1989MON20219.

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Abstract:

Les causes de la diversite de l'ichtyofaune neotropicale sont abordees a travers plusieurs niveaux de perception: genetique, morphologie, ecologie et zoogeographie, dans l'etude du genre leporinus (anostomidae). L'isolement reproductif entre sept especes de leporinus a ete confirme en guyane. L'etude intraspecifique a ete entreprise ches l. Friderici, espece largement distribuee en amerique du sud. Cette espece constitue un groupe monophyletique dans le genre leporinus en guyane, mais apparait comme un groupe paraphyletique a l'echelle de l'amerique du sud. La differenciation genetique (electromorphes de proteines et patrons de restriction de l'adn mitochondrial) a ete confrontee a la differenciation morphologique de l. Riderici. En guyane, la structure genetique intraspecifique de l. Friderici est en accord avec la structure zoogeographique de deux grandes familles de poissons neotropicaux, les serrasalmides et les anostomides et celle de groupes d'organismes autres que les poissons. La faune est structuree en deux ensembles: un ensemble oriental qui est sous l'influence de la faune amazonienne et un ensemble occidental dont l'endemisme est plus prononce. Les resultats mis en evidence par les differentes approches sont congruents et renforcent l'hypothese de l'existence de refuges aquatiques, qui auraient joue un role dans la speciation de l'ichtyofaune neotropicale lors des bouleversements paleoecologiques durant l'ere quaternaire. Un guide dans la constitution des souches d'elevage est propose base sur l'analyse de la structure genetique de l. Friderici espece d'interet aquacole

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Hugueny, Bernard. "Biogéographie et structure des peuplements de poissons d'eau douce de l'Afrique de l'ouest : approches quantitatives." Paris 7, 1989. http://www.theses.fr/1989PA077198.

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Abstract:

En faisant appel à trois principaux domaines de l'écologie théorique (biogéographie insulaire, zones refuges forestières et river continuum concept) et a l'aide d'outils statistiques et quantitatifs, une étude de la biogéographie et de la structure des peuplements de poissons d'eau douce d'Afrique de l'ouest a été entreprise, afin de rechercher certaines lois générales de leur organisation. L'étude a été faite a trois niveaux de perception géographique emboites. Au premier niveau (Afrique de l'ouest dans son ensemble), on s'est intéresse a la richesse spécifique des fleuves, a la délimitation de régions biogéographiques et a la mise en évidence de centres d'endémisme. Les résultats sont discutes en fonction de la biogéographie insulaire et de l'histoire climatique de l'Afrique au cours du pléistocène. Dans un contexte de biogéographie insulaire, les études réalisées au second niveau de perception géographique (région sahélo-soudanienne) sont centrées sur le rôle des processus d'immigration et d'extinction dans la mise en place des peuplements. Dans le niandan (affluent du haut Niger), troisième niveau de perception géographique, les études ont porte essentiellement sur la modification de la richesse et de la composition (spécifique et trophique) des peuplements selon la taille de la rivière et selon les caractéristiques locales du milieu (nature du substrat et vitesse du courant). Les caractéristiques de la zonation longitudinale mise en évidence sont discutées en fonction du river continuum concept

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Guissi, Abderrafie. "Influence des facteurs écologiques sur des populations larvaires de loup "Dicentrarchus labrax" (L. ) et de daurade "Sparus auratus" (Poissons Téléostéens) en élevage intensif." Montpellier 2, 1988. http://www.theses.fr/1988MON20239.

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Abstract:

L'influence de la salinite, de la temperature, du regime alimentaire, de l'intensite lumineuse et de la dimension des bassins d'elevages sur des populations larvaires du loup dicentrarchus labrax elevees dans differentes conditions hydrodynamiques sont etudiees. Ces facteurs manifestent de fortes interactions. L'influence comparative de la salinite sur les larves de loup et de daurade sparus auratus a ete etudiee. Les series experimentales menees a l'echelle pilote sur les larves de loup ont montre que les meilleurs resultats d'elevage sont obtenus dans les lots, eleves en eau courante et en grand bassin, maintenus a une temperature de 16#oc et a une salinite de 10-18& durant les 14 premiers jours et a 22c et 34& ensuite. Ceci a une intensite lumineuse constante des le stade embryonnaire. Une formule alimentaire impliquant des proies peu mobiles et un aliment compose a permis le sevrage des animaux au 20eme jour d'elevage. L'osmoregulation et le mecanisme d'inflation de la vessie natatoire ont ete examines. La dynamique des populations larvaires a ete abordee et un modele bioeconomique de gestion est propose

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Guillemot, Nicolas. "Les peuplements de poissons récifaux et leur exploitation dans la zone de Voh-Kone-Pouembout (Nouvelle-Calédonie) : Caractérisation, indicateurs et enjeux de suivie." Rennes, Agrocampus Ouest, 2009. http://www.theses.fr/2009NSARH078.

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Abstract:

D’importants développements humains et économiques sont attendus à court terme dans la zone rurale de Voh-Koné-Pouembout (Nouvelle Calédonie) suite à l’installation d’un complexe minier, avec pour conséquence probable une augmentation rapide et significative de la pression de pêche sur les ressources ichtyologiques. Face à cette perturbation à venir, il est nécessaire d’envisager de manière appropriée le suivi et la gestion de ces ressources sur le long terme. A partir de campagnes de comptages en plongée d’une part, et d’enquêtes de pêche d’autre part, la première phase de ce travail a permis de caractériser les peuplements ichtyologiques, en focalisant sur leur dynamique spatio-temporelle, et leur niveau d’exploitation par la pêche (de manière spatialisée et détaillée par espèces, familles, engins de pêche et localités de résidence). Il résulte de l’analyse des enquêtes que la pression de pêche estimée sur la zone est spatialement très hétérogène (de 0 à 50 kg. Ha-1. An-1) et les pratiques très diversifiées, en lien avec les spécificités socio-économiques des populations locales. Les peuplements ichtyologiques sont spatialement structurés selon les grands ensembles géomorphologiques récifaux et leur éloignement des passes. Ils présentent des variations interannuelles importantes, notamment en raison d’une perturbation cyclonique majeure survenue en 2003 et de ses conséquences sur les habitats coralliens. Cette première phase de travail constitue un état des lieux des ressources et de leurs usages avant l’apparition de changements majeurs, et permet de souligner les principaux enjeux de gestion et de suivi soulevés par l’augmentation démographique à venir
Development of mining complex has recently begun in the rural area of Voh-Koné-Pouembout (New Caledonia). As a consequence, significant human and economic developments are expected ; and fishing pressure on local reef fish resources is likely to increase. In this context, it appeared necessary to develop and appropriate baseline for the establishment of long term monitoring and management systems for reef fish resources and fishing activities. As a first step underwater and management systems for reef fish resources and fishing activites. As a first step, underwater visual censuses (UVC, six-year survey) and fisher interviews were used to characterise both reef fish assemblages (focusing on their spatio-temporal dynamics) and their exploitation (with spatially-explicit results, detailed by fish species and families, as well as fishing gear used and fisher’s locality of residence). Analyses of UVC data showed that reef fish assemblages are spatially structured based on reef geormophology and distance to passes. They further showed significant inter-annual variations, particularly due to a major cyclonic event that significantly impacted reef habitants in 2003. Interview results demonstrated that (i) fishing pressure was spatially heterogeneous (ranging from 0 to 50 kg. Ha-1. Yr-1), and (ii) fishing practices very diverse, depending on fishers” local socio-economic background. This first step allowed the development of a baseline of reef fish resources and their levels of exploitation prior to major development in the area. It also permitted for key management and monitoring issues to be highlighted in a context of a fast growing population

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Chevalier, Mathieu. "Changements globaux et poissons d'eau douce : déterminants et implications de variations démographiques." Toulouse 3, 2014. http://thesesups.ups-tlse.fr/2629/.

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Abstract:

Les changements climatiques on fait l'objet d'une attention grandissante, mais leurs influences sur les dynamiques de populations restent mal appréhendées. Nos résultats montrent que la température influence les dynamiques de populations de plusieurs espèces de poissons d'eau douce en France. Bien que des mécanismes communs aient été mis en évidence, les dynamiques de populations varient fortement en fonction des conditions environnementales locales. Les caractéristiques intrinsèques des espèces, au contraire de leur histoire évolutive, apparaissent comme des déterminants importants des dynamiques observées. Ces résultats pourraient permettre de mettre en place des mesures de gestion adaptées pour ces espèces, visant à réduire l'impact des changements environnementaux à venir
Climate change has been a subject of great interest across the past few years but its influence on population dynamics has seldom been considered. In this thesis, we demonstrate that climatic factors and in particular water temperatures have an influence on population dynamics of several freshwater fish species found in French rivers. Although common mechanisms acting at large spatial scales have been identified for the different species, considerable variations among populations have been revealed due to spatial heterogeneity of environmental conditions. Intrinsic characteristics of species appeared as important determinants of interspecific differences in population dynamics, contrary to their evolutionary history. Our results could be used to set up management conservation planning to limit the consequences of climate warming on freshwater fish species

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Tejerina, Garro Francisco Leonardo. "Etude des relations habitat-poissons dans les eaux courantes de Guyane française pour l'évaluation de la qualité du milieu aquatique." Montpellier 2, 2001. http://www.theses.fr/2001MON20164.

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Charrier, Grégory. "Structure génétique des populations de poissons dans l'Atlantique Nord-Est : Approche multi-spécifique." Brest, 2005. http://www.theses.fr/2005BRES2014.

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Abstract:

Afin d'explorer les mécanismes de structuration génétique des poissons dans l'Atlantique Nord Est, quatre espèces ont été étudiées en parallèle : merlan, lieu jaune, baudroie blanche et baudroie noire. D'une part, l'étude de la diversité mitochondriale, au niveau de l'extrémité 5'de la région de contrôle, a montré l'impact des évènements anciens sur la diversité génétique actuelle des baudroies, avec notamment, une expansion démographique rapide semblant s'être déroulée au cours de la première moitié du Pléistocène. Une différenciation génétique a été observée entre les populations atlantique et méditerranéenne seulement chez la baudroie noire et cela pourrait être dû (i) à l'impact de phénomènes de vicariance anciens et (ii) à une limitation actuelle des flux géniques par le front Alméria-Oran. L'absence de différenciation génétique chez la baudroie blanche entre la Méditerranée et l'Atlantique suggère une (re)colonisation plus récente de la Méditerranée par ce taxon. D'autre part, l'utilisation de microsatellites a souligné l'influence de facteurs hydroclimatiques actuels sur la structure génétique du lieu jaune et du merlan. La différenciation génétique significative observée chez le merlan en Mer du Nord et entre le sud du Golfe de Gascogne et les Iles Britanniques, ainsi que la structure détectée chez le lieu jaune entre la Manche Ouest—Mer d'Iroise et le Golfe de Gascogne, semblent liées à des systèmes de rétention limitant la dispersion passive des œufs et larves pélagiques. De plus, la structure des populations de merlan semble liée à un comportement de " homing " acquis. Enfin, la fragmentation de l'habitat du lieu jaune apparaît peu structurante
In order to explore the mechanisms of genetic structuring of marine fish in the North East Atlantic, four species were studied in parallel : whiting, pollack, white anglerfish and black anglerfish. First, the analysis of the mitochondrial variability , at the 5' end of the control region, showed the impact of historical events of the present-day genetic structure of anglerfish. Notably, this underlined a rapid demographic expansion that may have taken place during the first part of the Pleistocene. A significant genetic structure was observed between Atlantic and Mediterranean populations only in black anglerfish and this may be due to (i) the impact of ancient vicariant processes and (ii) to a contemporary reduction of gene flow with the Almeria-Oran oceanographic front. The lack of significant genetic differentiation observed in white anglerfish between Mediterranean and Atlantic suggests a more recent (re)colonisation of the Mediterranean by this species. Secondly, the use of microsatellites underlined the influence of contemporary hydroclimatical processes on the genetic structure of Pollack and whiting. The significant genetic differentiation observed in whiting whitin the North Sea and between the southern Bay of Biscay and British Iles waters, as the differentiation detected between pollack populations from western Channel –Iroise Sea and from the Bay of Biscay, are probably due to the existence of retention systems limiting passive dispersal of pelagic eggs and larvae. Furthermore, a learned homing behavior has been suggested as a structuring factor of whiting populations. Finally, the fragmentation of Pollack habitat does not appear as a structuring factor

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Blanc, Guillaume. "Biologie du cycle d' Anguillicola crassus (Nematoda, dracunculoidae) : contrôle thérapeutique de ses populations." Perpignan, 1994. http://www.theses.fr/1994PERP0184.

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Abstract:

Le nematode a. Crassus, parasite de la vessie gazeuse de l'anguille japonaise, a recemment contamine l'anguille europeenne. Les modalites de son expansion rapide dans la plupart des cours d'eau europeens ont ete precisees. Les limites septentrionales de son expansion geographique ont ete definies. Diverses caracteristiques ayant trait a la morphologie (structure des teguments et importance des reserves de l'uf et du stade libre), au developpement (brievete du temps minimal de developpement chez l'hote intermediaire ainsi que de la periode prepatente), et a la biologie (duree de la survie de l'uf et du stade libre, temps de generation compris entre 30 et 45 jours) favorables a son expansion demographique ont ete mises en evidence. Une compatibilite elevee dans le compartiment hote intermediaire ainsi que l'utilisation massive et diversifiee de la paratenese lui assure une transmission efficace vers l'hote definitif. Les roles respectifs des hotes intermediaires et parateniques dans la transmission du parasite vers son hote definitif ont ete discutes. Des mecanismes regulateurs de type ii dans le compartiment hote intermediaire et de type iii chez les hotes parateniques et definitif (fecondite densite dependante ainsi qu'un faible succes des infestations secondaires) ont ete caracterises. Ces mecanismes contribuent a la stabilite du cycle. L'importance de cette parasitose justifie la mise en place d'un traitement. Les biodisponibilites immediate et orale du levamisole caracterisant son absorption, sa distribution et son elimination chez l'anguille europeenne sont compatibles avec son utilisation par voie orale en anguilliculture a des fins therapeutiques

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Nikolic, Natacha. "Diversité génétique et taille efficace chez les populations de poissons sauvages : le cas du saumon atlantique un poisson migrateur amphihalin menacé." Toulouse 3, 2009. http://thesesups.ups-tlse.fr/576/.

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Abstract:

Ces travaux de thèse se sont intéressés principalement à la diversité génétique et à la taille efficace (Ne) de stocks de poissons sauvages amphihalins migrateurs en danger, le Saumon atlantique (Salmo salar). Pour cela, quatre populations ont été choisies en Europe du Nord (Ecosse) et en Europe du Sud (France) pour leurs différences de structure et de mode de gestion. Ces travaux ont abouti au développement de deux nouveaux modèles. DemoDivMS prédit la diversité génétique d'une population dont le scénario évolutif, donné par l'utilisateur, décrit des variations de Ne au cours des générations antérieures. VarEff cherche à estimer les tailles efficaces, au moment de l'échantillonnage et passées, en s'appuyant sur des calculs analytiques directs raccourcissant les temps de calculs
This thesis was concerned mainly with the genetic diversity and the effective size (Ne) of wild fish stocks of diadromous migratory endangered Atlantic salmon (Salmo salar). For this, four populations were chosen in the northern (Scotland) and southern (France) part of Europe for their differences in their structure and management. This work led to the development of two new models. DemoDivMS predicted genetic diversity of a population whose evolutionary scenario, given by the user, describes variations of Ne during the previous generations. VarEff tries to estimate the effective sizes, sampling time and pasts, based on direct analytical calculations to shorten the time of calculations

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Berrebi, Patrick. "Génétique des populations marines : le modèle "flet" (Platichthys flesus L. 1758, Téléostéen, Pleuronectidé)." Montpellier 2, 1988. http://www.theses.fr/1988MON20073.

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Carette, Valérie. "Amélioration de la représentation géométrique 2D et 3D des agrégations de poissons en support à l'étude de leur évolution spatio-temporelle." Thesis, Université Laval, 2008. http://www.theses.ulaval.ca/2008/25876/25876.pdf.

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Abstract:

Les systèmes d’information géographique (SIG) constituent des outils performants pour la gestion, l’analyse et la représentation de données spatiales. Ils sont utilisés dans de nombreux domaines dont en biologie marine. Parmi les phénomènes spatiaux étudiés en milieu marin, la dynamique des poissons fait l’objet de nombreuses recherches, étant donné l’importance des pêches dans l’économie des régions côtières et la nécessité de gérer ces ressources de façon durable. Un comportement clé des poissons est leur capacité à se regrouper pour former des agrégations. Une compréhension de ces agrégations est nécessaire afin d’établir des stratégies de reconstruction efficaces des ressources halieutiques en déclin. Cependant, les méthodes existantes utilisées pour représenter les agrégations de poissons ne modélisent pas ces agrégations explicitement en tant qu’objets spatiaux. De plus, malgré les capacités intéressantes offertes par les SIG actuels, ces outils sont limités en raison de la nature tridimensionnelle, dynamique et floue des agrégations de poissons dans le milieu marin. L’objectif principal de ce mémoire est de proposer de nouvelles approches pouvant permettre d’améliorer l’identification et la représentation spatiale des agrégations de poissons à des échelles régionale et locale. En 2D, l’approche proposée repose sur les modèles d’objets spatiaux flous découlant de la théorie des ensembles flous. Elle utilise une structure de données vectorielle pour représenter les limites des étendues minimale et maximale des agrégations de poissons et une structure de données matricielle pour modéliser la transition graduelle existant entre ces limites. Par ailleurs, en 3D, l’approche développée se base sur la triangulation Delaunay 3D et dynamique ainsi que sur l’algorithme de clustering 3D des α-shapes. Elle permet de détecter les agrégations contenues dans un jeu de données et de les reconstruire sous la forme d’objets 3D afin de pouvoir en étudier, par exemple, les propriétés morphologiques. L’application des approches proposées à des données halieutiques révèle plusieurs avantages et limitations qui sont discutés tout au long du mémoire.
Geographic information systems (GIS) are powerful tools to manage, analyse and represent spatial data. They are used in various disciplines, including marine biology. One of the most important phenomena intensively studied by marine biologists is the dynamics of fish. This is partly because there is an increasing need for sustainable management of fisheries which are very important in the economy of coastal zones. Fish aggregations are a fundamental component of these dynamics and should be better understood to establish efficient recovery strategies in the context of declining aquatic resources. However, the traditional representations of fish aggregations do not model those aggregations explicitly as spatial objects. Moreover, despite many interesting capabilities of current GIS, these tools are unable to handle the tridimensional, dynamic and fuzzy nature of fish aggregations. The main objective of this thesis is to propose new approaches to improve the representation of fish aggregations at the regional and local scales. In 2D, the proposed approach is based on the fuzzy spatial objects models, which are based on the fuzzy sets theory. It uses a vector data structure to delineate the maximal and minimal extents of fish aggregations and a raster data structure to model the gradual transition which exists between these boundaries. In 3D, the proposed approach for the representation of fish aggregations is based on the dynamic Delaunay tetrahedralisation and the 3D α-shapes clustering algorithm. The integrated algorithm allows automatic detection of the fish aggregations contained in a dataset. 3D models also allow amongst other things the study of the morphological properties of the different aggregations. Testing these approaches with fisheries data (e.g. datasets from scientific surveys, acoustic datasets) revealed several benefits and limitations which are discussed throughout this thesis.

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Allain, Valérie. "Écologie, biologie et exploitation des populations de poissons profonds de l'Atlantique du nord-est." Brest, 1999. http://www.theses.fr/1999BRES2023.

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Abstract:

Au cours des années 70-80 la pêche connaît une crise grave ; les professionnels français chalutent plus profond (1400m) à l'ouest des îles britanniques. Des pêcheries étrangères plus anciennes ont montrées la fragilité de cette ressource. Des campagnes de pêche ont permis de recenser 54 à 86 taxons. Les populations de poissons profonds sont organisées en peuplements selon la profondeur et la latitude, avec 1 a 3 espèces dominantes, le grenadier y est majoritaire. De fortes longévités ont été déterminées : 38 ans pour Alepocephalus bairdii, 54 pour Coryphaenoides rupestris et 43 pour Helicolenus dactylopterus. Mais des problèmes d'interprétation existent sur l'âge qui n'a pas été validé. Leur croissance est lente. La comparaison des structures en taille avec des données historiques révèle une diminution de la taille de A. Bairdii et de C. Rupestris depuis 1989. Ces espèces ont une maturité tardive (14-16 ans) et une période de reproduction de 10-12 mois. H. Dactylopterus a une maturité précoce (3-4 ans), les mâles maturent plus tôt, ils inséminent les femelles en automne, elles stockent les spermatozoïdes dans leurs ovaires et pondent au printemps. Ces espèces ont des fécondités annuelles indéterminées et des stratégies démographiques de type K. La flottille française profonde est composée de 50 bateaux débarquant par an 19000 t de poissons profonds. Les CPUE ont diminué depuis 1989. 8 espèces sont débarquées à 100%, 1 espèce est débarquée et rejetée : le grenadier avec un taux de rejet de 23%. 42 espèces sont rejetées à 100%. Les rejets représentent 52% du poids des captures et augmentent avec la profondeur. Les rejets totaux ont été estimés à 17500 t. Des estimations de stocks ont été réalisées sur A. Bairdii et le grenadier donnant des valeurs indicatives. Les résultats doivent inciter à la prudence. Si la mise en place de quotas ne semble pas être envisageable, une réglementation serait l'utilisation d'engins de pêche plus sélectifs.

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Faye, Ngor. "Microsporidies des poissons des côtes sénégalaises : faunistique, biologie, ultrastructure." Montpellier 2, 1992. http://www.theses.fr/1992MON20086.

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Abstract:

2312 poissons des cotes senegalaises, appartenant a 162 especes, ont ete examines. Cette prospection revele que 26 especes de ces poissons hebergent des microscoporidies. Ces microsporidies provoquent la formation de xenomes au niveau des organes parasites. Leurs caracteres distinctifs tels qu'ils sont actuellement connus sont resumes dans les fiches faunistiques que nous avons etablies. L'analyse ultrastructurale du cycle evolutif nous a permis de decrire 5 especes nouvelles de microsporidies: pleistophora senegalensis, nosemoides syaciumi, nosemoides brachydeuteri, nosemoides zeusi et microfilm lutjani, espece-type du genre microfilum que nous avons cree en raison de l'originalite de son cycle et du filament polaire de la spore; leurs hotes respectifs sont: sparus aurata, syacium micrurum, brachydeuterus auritus, zeus faber et lutjanus fulgens. Les 21 autres microsporidies sont momentanement placees parmi les microsporidium. L'une d'elles, trouvee chez chloroscombrus chrysurus, se singularise par les caracteres de son cycle et l'envahissement du tissu-hote par des vacuoles extra-xenomiques contenant les stades parasitaires; nous l'avons provisoirement nommee microsporidium chloroscombri. Une etude comparative des xenomes a ete abordee et le caractere pathogene de certaines especes de microsporidies mis en evidence. Les spores de microfilum jutjani peuvent s'ouvrir a l'interieur meme du xenome. L'ecoulement du sporoplasma dans le canal que constitue le filament polaire evagine a ete nettement observe

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Vermard, Youen. "Comportement de pêche et gestion : l’exemple de la pêcherie pélagique du Golfe de Gascogne." Rennes, Agrocampus Ouest, 2009. http://www.theses.fr/2009NSARH077.

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Abstract:

Dans le contexte actuel de la gestion des pêches, les modèles de simulation sont requis afin de permettre l’évaluation de scénarios de gestion. Ces modèles doivent permettre la description de processus clés du système pêche tels que : la dynamique des populations, la dynamique des flotilles, les règles de décisions des gestionnaires et les interactions de ces trois éléments. La majorité desmodèles existants se sont concentrés dans la modélisation des processus biologiques, de la dynamique des populations et des interactions avec l’écosystème. Cependan, un certain nombre d’échecs en terme de gestion des pêches ont été plus résulté d’une méconnaissance des comportements de pêche que d’un manque de connaissances sur la biologie des espèces. Il a par exemple été montré que dans un système exploité, le comportement spatial d’exploitation influence autant les résultats d’une politique de gestion que les facteurs biologiques et écologiques. Les objectifs de ce travail sont de décrire et de modéliser les comportements de pêche afin de povoir les prende en compte lors de l’évaluation des mesures de gestion. Ces comportements de pêche peuvent être décrits à plusieurs échelles. Le comportement à court terme décrit lamanière dont les pêcheurs vont se comporter au sein de la marée. Le comportement à moyen terme décrit, lui, la manière dont ils allouent leur efforts sur les différents métiers et zones de pêches et enfin, le comportement à long terme décrit la manière dont la capacités de pêche évoluent au cours des années. Ce travail de thèse se concentrera sur les processus à court et moyen terme
In the current context of fisheries management, simulation models are required to support the evaluation of management scenarios. The models should include the key process of the fishery system : stock dynamics fleet dynamics, manager decision-making, and the interactions between these three elements. Most of the existing models have concentrated on the modelling of biological processes, population dynamics, and ecosystem interactions. However, a number of fisheries management failures could have resulted from a misunderstanding of fishers behaviour rather than from limited knowledge of the status of fishery resources. It has for example been showed that in an exploited system, fishers’ spatial behaviour influences the predicted outcomes of management policies, just as importantly as biological and ecological factors. The objective of the work is to describe and model fishers behaviour in order to be able to take it into account while evaluating management measures. Fishing behaviour can be described at three different scales. Short term behavior describes how fishermen behave during a fishing trip. Mid term behaviour describes how they allocate their fishermen behave during a fishing trip. Mid term behavior describes how they allocates their fishing effort among available metiers and fishig areas. And long term behavior describes how fishing capacity evolutes over the years. The present PhD focused on short and mid-term behaviour

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Martin-Vandembulcke, Delphine. "Dynamique de population de la grande alose (Alosa Alosa. L. 1758) dans le bassin versant Gironde-Garonne-Dordogne (France) : analyse et prévision par modélisation." Toulouse, INPT, 1999. http://www.theses.fr/1999INPT012A.

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Abstract:

La population de grande alose (alosa alosa) du bassin versant Gironde-Garonne-Dordogne est la seule a être encore à un niveau d'abondance important et à ne pas montrer de signes de déclin. Notre travail a consisté à élaborer un modèle décrivant globalement le fonctionnement de cette population, nous en avons également extrait un sous modèle plus immédiatement opérationnel permettant de prévoir les effectifs de géniteurs devant entrer dans le bassin une année donnée à partir de ceux des juvéniles ayant quitté le bassin les années précédentes. L'élaboration de ces modèles a nécessité une analyse et une traduction quantitative des principaux processus de la dynamique de cette population. Les paramètres permettant de modéliser ces processus ont été estimés à partir des effectifs de juvéniles et de géniteurs des années 1989-1996, ainsi que des structures des flux de géniteurs, estimées par échantillonnage au cours des années 1994-1996. Nous avons établi le premier modèle global décrivant le fonctionnement de cette population, il est déterministe, non stochastique, spatialisé et structuré en âge et en sexe. Sa simulation de calibrage présente un état d'équilibre, dont les effectifs et les structures s'avèrent équivalents à la moyenne de ceux observés dans la réalité durant la période prise en compte. Les valeurs des paramètres de calage sont donc considérées comme plausibles. Le modèle prédictif juvéniles-géniteurs, parvient à simuler les effectifs de géniteurs observés. On peut donc penser sous réserve d'une validation, qu'il pourrait permettre de prévoir les variations majeures des effectifs de géniteurs ce qui pourrait être un élément important de la gestion de cette population. Cette première exploration par un modèle du fonctionnement d'une population de grande alose permet de dégager des priorités parmi les connaissances à acquérir, il s'avère notamment essentiel de vérifier l'unicité de la population à l'échelle du bassin et de préciser le comportement des alosons.

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GAERTNER, JEAN-CLAUDE. "Organisation des assemblages demersaux dans le golfe du lion : structures spatiales et stabilite temporelle." Aix-Marseille 2, 1997. http://www.theses.fr/1997AIX22067.

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Abstract:

L'analyse de l'organisation des assemblages demersaux du golfe du lion, a plusieurs echelles spatiales et temporelles, s'appuie sur les resultats de deux series de campagnes de chalutages d'evaluation directe entreprises entre 1983 et 1992. La mise en oeuvre de techniques recentes d'analyses de donnees multivariees, peu employees en ecologie, a permis une etude detaillee des structures spatiales et de leur stabilite dans le temps. Nos resultats montrent que les assemblages demersaux du golfe du lion presentent une forte structuration spatiale, principalement orientee selon un gradient d'eloignement a la cote. La grande stabilite temporelle des principales structures spatiales, observee a plusieurs echelles, suggere un fort determinisme de l'organisation de ces assemblages d'especes. Les facteurs d'origine abiotique (bathymetrie, caracteristiques de l'habitat, influence rhodanienne, upwellings) semblent jouer un role preponderant dans la formation et le maintien des assemblages demersaux de cette region. De plus, la mise en evidence d'une organisation spatiale simple et tres stable peut contribuer a alleger les plans d'echantillonnage, et a reduire le cout des campagnes d'evaluation directe. Enfin, en proposant une technique couplant les logiques de l'analyse des correspondances (afc) et celle de statis, cette etude a permis d'enrichir le champ d'application de la famille des analyses a tableaux multiples. Cette technique fournit une representation synthetique de la dynamique spatio-temporelle des assemblages d'especes. Elle rend possible l'apprehension simultanee, dans un referentiel unique, des notions de persistance, de resistance, de resilience et de variabilite, des populations et des peuplements.

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Monteiro, Analbery. "Biologie et pêche des Aiguilles Hemiramphus brasiliensis (Linnaeus, 1758) et Hyporhamphus unifasciatus (Ranzani, 1842) (Poissons - Téléostéens - Hemiramphidae) dans la région Nord-Est de Brésil." Brest, 2003. http://www.theses.fr/2003BRES2007.

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Abstract:

Les Aiguilles Hyporhamphus unifasciatus et Hemiramphus brasiliensis sont des poissons d'importance économique dans la région Nord-Est du Brésil. La réduction des captures des Aiguilles à Pernambuco et l'absence d'études sur ces espèces dans la région avaient motivé la réalisation de ce travail. Des statistiques annuelles de captures étaient disponibles, les deux espèces confondues. Afin d'avoir des informations sur la pêche de chaque espèce, le suivi des débarquements a été réalisé au nord de Pernambuco entre 1998-1999, ainsi que la collecte de matériel biologique pour l'étude de la reproduction et de la croissance. Les deux espèces semblent avoir des pontes sériées : elles pondent toute l'année avec une période plus concentré après la saison des pluies. Une fécondité partielle relative très faible est observée : 29 oeufs/g de poisson pour H. Unifasciatus et 16 œufs/g pour H. Brasiliensis. L'étude de la croissance a été fait à travers l'interprétation des microstructures des sagittae chez H. Unifasciatus. Les lapilli ont été interprétés sans difficultés chez les deux espèces. Chez H. Unifasciatus la durée de vie estimée d'environ un an pour des individus de 24 cm (validé). Les paramètres de Von Bertalanffy sont : Lao=30,4 cm, to=17,0 cm et k=0,004 j-'. Chez Hemiramphus brasiliensis seul des otolithes des individus adultes étaient disponibles. Une courbe de croissance moyenne a été établie à partir du rétro-calcul : Loo=24,0 cm, t0=6,09 cm et k=0,009 j-'. Un individu de 20 cm compte 246 microstructures, moins de 1 an (pas validé). L'analyse des statistiques de pêche pour la période 1980-2000 suggère une diminution des captures pour certains Etats de la région Nord-Est. L'analyse des données des débarquements montre une faible productivité de cette pêche artisanale (captures en général inférieures à 20 Kg/sortie). Les résultats de cette étude suggèrent que l'hypothèse d'une surexploitation peut être écartée : les bateaux sont peu nombreux et de puissance de pêche réduite
The halfbeak Hyporhamphus unifasciatus and Hemiramphus brasiliensis are fsh of economic importance in the north-eastern Brazil. Decrease of captures in Pemambuco and the absence of studies for these species in the region justified the realisation of this work. Only annual statistics were available for each state, combined landings. In order to have detailed information on the fishing of each species, landings folllow-up was carried out in the north of Pernambuco between 1998 and 1999, while biological material was collected for reproduction and growth study. Reproduction results suggest that these species are multiple spawners : they spent throughout the year, with one period more concentrated after the rainy season. A low batch fecundity is observed : 29 eggslg H. Unifasciatus and 16 eggs/g for H. Brasiliensis. Otoliths were used for growth studies. Sagittae microincrements interpretation was possible only for H. Unifasciatus. Lapilli microincrements were easily interpreted for both species. Microincrements daily deposition was validated by tetracycline marking for H. Unifasciatus. Individuals around 24 cm are about one year old. Von Bertalanffy growth parameters are : Lao=30. 4 cm, To=17,0 cm and k=0,004 j-'. Only adults H. Brasiliensis were available so individual growth was estimated for seven individuals from retrocalculation and a mean growth curve was established (1-00=24. 2 cm, t0=16,09 cm and k=0,009 j'. For an individual of 20 cma total of 246 microincrements were observed. The captures by state are in general of the order of 50-100 tons/year, while in Pernambuco and Rio Grande do Nortethey are superior of 110 tons/year. The analyses of statistics of fishing data for the period 1980-2000 suggests a reduction in the capture for certain states of the North-eastern region. Landings data analysis show a low productivity for this artisanal fishery, in general lower than 20 kglfishing cruise. This study suggets that the assumption of an overexploitation can be discarded. Few boats, of short operating range and reduced power fishing are used

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Patty, Wilhelmina. "Déterminisme de la répartition spatio-temporelle des populations de poissons pélagiques à partir d'observations acoustiques et environnementales." Brest, 1996. http://www.theses.fr/1996BRES2043.

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Abstract:

Le determinisme du comportement des bancs de poissons pelagiques est etudie a partir de donnees de prospection acoustique et en utilisant des facteurs environnementaux, geographiques et biologiques. On etait en droit de penser que ces facteurs jouaient un role important sur les fluctuations de disponibilite du poisson et sur la variabilite spatio-temporelle de son organisation dans l'espace en bancs. Les observations faites au coup de quatre annees dans le golfe de gascogne montrent que les descripteurs pertinents de bancs tels que: nombre de bancs, surface, energie, forme et position dans la tranche d'eau varient de facon significative selon l'annee et la saison. On note egalement que les bancs de poissons sont distribues geographiquement de facon anisotrope. La taille moyenne des structures homogenes differe selon les descripteurs et l'annee. Nous tentons dans cette etude d'identifier une relation eventuelle entre la variation des formes, de la densite, de la taille et de la distribution des bancs et les facteurs environnementaux. Ce travail a ete realise en utilisant les methodes d'acp, d'ace et le modele lineaire general. La forme et la distribution des bancs varient d'une part, en fonction des especes qui les constituent, d'autre part avec les facteurs environnementaux. La variabilite des bancs situes entre deux eaux (dits pelagiques) est expliquee par la temperature de surface, la profondeur du fond et le gradient vertical de temperature, tandis que celle des bancs situes pres du fond (dits demebaux) est plus liee a la temperature au fond

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Fievet, Eric. "Crevettes (Decapoda, Caridea) et poissons amphidromes des cours d'eau aménagés de Guadeloupe : exemple de relation dynamique aval-amont." Lyon 1, 1999. http://www.theses.fr/1999LYO10172.

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Baran, Eric. "Dynamique spatio-temporelle des peuplements de poissons estuairiens en Guinée : relations avec le milieu abiotique." Brest, 1995. http://www.theses.fr/1995BRES2004.

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Abstract:

Cette etude porte sur le peuplement de poissons de l'estuaire du fleuve fatala, situe en zone de mangrove sur une cote a forte pluviometrie (3500 mm d'eau/an) et a marnage important. L'echantillonnage, base sur deux engins principaux (senne tournante coulissante et filets maillants), a permis de decrire la composition du peuplement, de mettre en evidence la variation de sa structure spatiale au cours d'un cycle annuel et de coupler la dynamique spatio-temporelle de ce peuplement a celle des principaux parametres abiotiques du milieu. A cet effet plusieurs methodes recentes d'analyses multivariees sont utilisees: statis, afc de foucart, acpvi. La repartition des principales ecophases et les regimes alimentaires des especes dominantes en fatala sont analyses afin de preciser les strategies developpees au sein du peuplement. Le compartiment ichtyoplanctonique est egalement evoque. Trois composantes fondamentales du peuplement (continentale, estuarienne stricte, estuarienne et cotiere) sont ainsi mises en evidence et detaillees, en integrant leurs strategies vitales respectives. La comparaison de la nature et de l'abondance de l'ichtyofaune entre l'estuaire et un bras de mer proche conclut a la similitude des communautes en depit de la difference de conditions de milieu. L'etude conduit a formuler les hypotheses d'un estuaire cotier le long du littoral guineen, et d'une redondance fonctionnelle au sein du peuplement, les especes se remplacant activement au cours du temps et dans l'espace lorsque varient les conditions de milieu. A l'echelle regionale, une analyse des peuplements estuariens d'afrique de l'ouest permet de distinguer les estuaires inverses et rias (sine-saloum, casamance, rio buba), les estuaires vrais (gambie, fatala) et les estuaires soumis a de fortes variations hydrologiques (senegal), en faisant neanmoins apparaitre une unite structurelle globale, basee sur une trentaine d'especes ubiquistes. Les perspectives conceptuelles ouvertes par la richesse specifique et fonctionnelle de ces milieux d'interface sont enfin evoquees

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Rahardjo, Mohammad Fadjar. "Écobiologie et dynamique des populations de poissons dans le réservoir Bening, Java de l'Est, Indonésis." Toulouse, INPT, 1987. http://www.theses.fr/1987INPT006A.

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Abstract:

Le but de la présente étude est de comprendre la situation écobiologique et la dynamique des populations piscicoles dans ce réservoir, notamment chez l'espèce Oreochromis mossambicus qui y domine. Nous avons divisé cette présentation de la façon suivante : Une première partie évoque le réservoir Bening où nous avons travaillé puis, quelques réservoirs indonésiens qui ont été bien étudiés, et dit comment on les a aménagés. Nous avons essayé de comparer entre eux ces différents réservoirs. La communauté piscicole est présentée ensuite. La troisième partie concerne l'écobiologie chez quelques espèces. On y trouvera la description de la reproduction et du régime alimentaire. Enfin, nous abordons la dynamique des populations, particulièrement la croissance et la mortalité chez certaines espèces. Dans une conclusion générale, nous proposons un aménagement piscicole adapté au réservoir Bening.

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De, Buron-Brun Isaure. "Biologie des populations d'Acanthocéphales : étude du complexe Acanthocephaloides propinquus, parasite de Poissons marins et lagunaires." Montpellier 2, 1986. http://www.theses.fr/1986MON20205.

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Abstract:

L'etude morphoanatomique et du polymorphisme enzymatique montre qu'il s'agit d'un complexe d'especes. Une approche de la dynamique des populations montre l'importance relative de differents poissons hotes au cours du cycle biologique de l'acanthocepale. La localisation dans l'intestin de l'hote et la mode d'attachement sont observes ainsi que les modes d'infestation. Une nouvelle espece de microsporidie parasite des acanthocephales est signalee

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Deschênes, Julie. "Analyses hiérarchiques des communautés et des populations de poissons fluviatiles en fonction du contexte environnemental /." Thèse, Trois-Rivières : Université du Québec à Trois-Rivières, 2007. http://www.uqtr.ca/biblio/notice/resume/30002769R.pdf.

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Abstract:

Thèse (Ph.D.) - Université du Québec à Trois-Rivières, 2007.
En-tête de titre : Université du Québec à Trois-Rivières en association avec Université du Québec à Montréal. Le corps du travail est rédigé en anglais, sous forme d'articles scientifiques. CaQTU Comprend des réf. bibliogr. Également disponible en format microfiche et PDF. CaQTU

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De, Buron-Brun Isaure. "Biologie des populations d'acanthocéphales étude du complexe acanthocéphaloïdes propinquus, parasite de poissons marins et lagunaires." Grenoble 2 : ANRT, 1986. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37596604j.

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Rahardjo, Mohammad Fadjar. "Ecobiologie et dynamique des populations de poissons dans le réservoir Bening, Java de l'est, Indonésie." Grenoble 2 : ANRT, 1987. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb376091313.

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Deschênes, Julie. "Analyses hiérarchiques des communautés et des populations de poissons fluviatiles en fonction du contexte environnemental." Thèse, Université du Québec à Trois-Rivières, 2007. http://depot-e.uqtr.ca/1196/1/030002769.pdf.

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Tirard, Claire. "Biodiversité et biogéographie évolutive dans les systèmes hôtes-parasites : le modéle Gadiformes (Téleostéens) - Copépodes et Monogènes." Montpellier 2, 1991. http://www.theses.fr/1991MON20140.

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Abstract:

L'analyse de la speciation et de la specificite chez des monogenes (diclidophora) nous permet de reconsiderer non seulement la taxonomie, mais aussi l'histoire evolutive de leur groupe hote (trisopterus). Cependant, si une evolution de type phylogenetique est mise en evidence dans les associations trisopterus-diclidophora, l'etude concernant les populations de copepodes du genre lernaeocera (parasites du meme groupe hote) nous amene a decrire un phenomene de capture. Nous discutons de la repartition et de la structure des populations hotes (trisopterus luscus et merluccius merluccius) en atlantique et dans le nouvel environnement mediterranee et de leur role dans la dispersion des parasites (lernaeocera). Nos resultats montrent que l'hote de capture, m. Merluccius, est devenu, de par sa biologie particuliere, l'hote de capture, m. Merluccius, est devenu, de par sa biologie particuliere, l'hote preferentiel et largement majoritaire du copepode en mediterranee. Tous ceci se rapporterait a un phenomene d'effet de bascule (switching), consecutif aux variations de la disponibilite de l'hote d'origine (t. Luscus) dans les differentes zones geographiques (atlantique et mediterranee). Si la specialisation des monogenes diclidophora semble imposee par des contraintes phylogenetiques (nature physiologique et biochimique de l'hote), la specialisation des especes du genre lernaeocera pourrait dependre davantage de parametres ecologiques (abondance relative et/ou disponibilite des ressources)

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Lorance, Pascal. "Ecologie des poissons profonds, des individus aux peuplements." Brest, 2007. http://www.theses.fr/2007BRESA001.

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Abstract:

Les poissons de la pente occidentale sont étudiés à trois niveaux : les individus, les populations et les peuplements. La distribution de ces espèces est agrégée ou dispersée. Ici, les observations par engins sous-marins suggèrent que l'empereur, espèce connue pour se concentrer dans des habitats particuliers, utilise des zones abritées du courant pendant des phases de repos. Au contraire, le petit anguilliforme, Synaphobranchus kaupii est dispersé à grande échelle ; il semble préférer des habitats sédimentaires où ses proies s'accumulent et éviter les zones sans courant. Les comportements des poissons profonds sont diversifiés, liés à leurs stratégies alimentaires et flexibles selon les conditions environnementales. Du fait de leurs traits vitaux, ces poissons ne peuvent supporter que des taux d'exploitation modérés. Des problèmes d'estimation (âge, tendance des CPUE) et la méconnaissance de la structure en populations gênent l'évaluation des stocks dont plusieurs ont été surexploités dans l'Atlantique Nord-Est ; le cas de la dorade rose est développé. L'échantillonnage des grandes espèces mobiles au chalut de type commercial indique sur la pente une diversité spécifique et taxonomique supérieure et structurée différemment de celle du plateau. Les observations visuelles qui échantillonnent bien les petites espèces benthiques complètent l'estimation de la composition du peuplement. Enfin, les observations à bord des chalutiers confirment qu'une seule espèce cible, le grenadier, est en partie rejetée et montrent l'impact de la pêche. Elles permettent d'identifier, dans les CPUE, des facteurs inacessibles dans les statistiques de pêches et campagnes scientifiques

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Pialot, Daniel Paul Marc. "Analyse des données de milieu en hydrobiologie : apport des techniques d'analyse multivariées." Lyon 1, 1985. http://www.theses.fr/1985LYO11680.

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Grimardias, David. "Rôle de l’hétérogénéité de l’habitat sur les tactiques alternatives de reproduction du saumon atlantiques (Salmo salar L. )." Pau, 2009. http://www.theses.fr/2009PAUU3030.

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Abstract:

La complexité de l’habitat sur les sites de frai pourrait favoriser le succès reproducteur des mâles précoces furtifs de saumon atlantique. Cette hypothèse a été testée, grâce à une approche multi-disciplinaire, en milieu naturel et en conditions expérimentales, où le comportement ainsi que la contribution des géniteurs (anadromes comme tacons précoces) ont été étudiés en relation avec la structure de l’habitat. La diversité en abris sur les frayères semblerait jouer un rôle important dans la compétition intrasexuelle qui existe entre mâles précoces plutôt que sur la compétition avec les mâles anadromes, permettant à un plus grand nombre de géniteurs précoces de féconder les œufs. L’effet de la complexité de l’habitat est discuté en relation avec le rôle des mâles précoces dans les petites populations de saumons atlantiques et le maintien d’une diversité génétique élevée
The habitat complexity in the spawning environment may favour the reproductive success of sneaking precocious males of Atlantic salmon. This hypothesis was tested with a multidisciplinary approach, both in the natural environment and in experimental conditions. The behaviour as well as reproductive success of breeders (anadromous and precocious male parr) were studied in relation to the structure of the spawning habitat. The diversity in shelters around redds has an important role in the intrasexual competition among mature male parr, rather than in the competition with anadromous males. It allows precocious breeders to be more numerous to fertilize eggs. The effect of habitat complexity has to be considered in relation to the role of precocious males in small populations and the maintenance of high genetic variability

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Belkessam, Djamila. "Structure des peuplements de poissons de cours d'eau du nord ouest de la France : degré de saturation, interactions biotiques et variabilité temporelle." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2001. http://www.theses.fr/2001MNHN0010.

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Abstract:

Connaître les facteurs et les processus responsables des variations de la structure spatio-temporelle des peuplements, s'impose comme une nécessité fondamentale pour l'étude de la biodiversité et la mise en place d'outils de gestion. Ce travail est consacré à l'étude de la structure des peuplements de poissons de cours d'eau du nord-ouest de la France. Il révèle les caractéristiques suivantes : 1- à l'échelle régionale (d'un bassin versant), la richesse spécifique des peuplements de poissons est régulée, en partie, par le jeu des processus d'extinction et de colonisation, et ne semble pas, à priori, limitée par la diversité de l'habitat. 2- à l'échelle locale les peuplements sont insaturés en espèces et en individus. Les interactions biotiques, n'ont pas un effet prépondérant sur leur structure. Celle-ci serait régulée par des processus s'opérant à une échelle spatiale plus large, tel que la colonisation à partir de sites voisins. Ces résultats soulignent l'importance des facteurs régionaux dans la régulation des peuplements locaux. 3- on note un maintien de la composition spécifique des peuplements (persistance) et une relative stabilité de leur structure temporelle. En revanche, les populations sont fortement fluctuantes. Cette instabilité est déterminée, en partie, par les importantes variations stochastiques des conditions hydroclimatiques. 4- l'influence des facteurs hydroclimatiques sur les populations dépend de leurs positions sur le bassin versant, de même que des stratégies démographiques des espèces vis à vis des contraintes abiotiques. La stochasticité environnementale tend à modifier les interactions inter-spécifiques et intra-spécifiques (densité-dépendance) de même que la configuration des peuplements. Enfin,

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Penven, Pierrick. "Étude numérique de la circulation dans le sud-benguéla avec une application au recrutement des poissons." Brest, 2000. http://www.theses.fr/2000BRES2057.

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Carrel, Georges. "Caractérisation physico-chimique du Haut-Rhône français et de ses annexes : incidences sur la croissance des populations d'alevins." Lyon 1, 1986. http://www.theses.fr/1986LYO19009.

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Abstract:

Etude des caracteristiques physico-chimiques de certaines unites fonctionnelles du haut-rhone francais et a la dynamique de leur population d'alevins. Les principaux ions majeurs, les parametres associes (ph et conductivite) et ceux susceptibles d'influer sur les equilibres chimiques de l'eau et sur la vie aquatique (t**(o), oxygenation, matieres en suspension et chlorophylle a) ont ete regulierement enregistres au cours d'un cycle annuel dans trois stations d'etude

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Horri, Khaled. "Effets d’une exposition alimentaire chronique à un mélange environnemental de PCB et PBDE sur les traits d’histoire de vie, la bioénergétique et la dynamique des populations de poissons." Thesis, Normandie, 2018. http://www.theses.fr/2018NORMLH09/document.

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Abstract:

Les polychlorobiphényles (PCB) et les polybromodiphényléthers (PBDE) sont deux familles de composés hydrophobes partageant certaines propriétés physico-chimiques. Des travaux antérieurs ont montré que ces composés pouvaient affecter les traits d’histoire de vie des poissons. Il s’avère cependant que les études approchant des situations environnementales sont rares. Cette thèse se divise en trois parties. La première partie s’est attachée à évaluer les effets d’une exposition à un mélange réaliste de PCB et de PBDE sur les traits d’histoire de vie du poisson-zèbre. Les résultats ont montré une taille asymptotique plus élevée, une probabilité de ponte retardée chez les individus exposés et une faible survie des larves F1 en situation de jeûne issues des pontes précoces des individus exposés. La seconde partie a cherché à identifier, sur la base d’un modèle bioénergétique (DEB), les modes d’action physiologique (PMoA) de PCB et PBDE. Deux PMoAs probables ont été révélés: le premier est lié à l’augmentation de la fraction d’énergie allouée à la maintenance et la croissance somatique et le deuxième est lié à l’augmentation des coûts de production d’un œuf. La troisième partie de la thèse s’est intéressée à évaluer les conséquences de la contamination sur la dynamique de population de poissons. Les résultats ont montré une réduction de l’abondance numérique, une augmentation de la biomasse et un grand risque de surexploitation chez la population exposée, Les résultats de cette thèse pourraient constituer un outil d’aide à une gestion durable des stocks halieutiques qui prennent en compte les effets de multiples contaminations qui se surajoutent à la pression de pêche
Polychlorinated biphenyls (PCBs) and polybrominated diphenyl ethers (PBDEs) are two families of hydrophobic compounds sharing some similar environmental properties. Previous studies have demonstrated that these compounds could affect fish life-history traits. However, few studies have focused on environmental situations. This thesis is divided into three parts. The first part aimed to evaluate the effects of a realistic mixture of PCBs and PBDEs on the life-history traits of zebrafish. The results showed a slower growth, but to a larger asymptotic length, and delayed spawning probability in exposed fish. In addition, offspring issued from early spawning events of exposed fish exhibited a lower larval survival under starvation condition. The second part aimed to identify, on the basis of a bioenergetic model (DEB), the physiological modes of action (PMoA) of PCBs and PBDEs. Two potential PMoAs have been revealed: the first one was through an increase of the fraction of energy allocated to somatic maintenance and growth and the second one was through an increase of the cost of production of an egg. The third part focused on the population dynamical consequences of the individual life-history effects of PCBs and PBDEs. The results showed a lower abundance, a higher biomass and a higher risk of overexploitation in exposed population compared to control population. The results of this thesis could be a helpful tool for sustainable management of fish stocks that take into account the effects of multiple contaminations that are added to the fishing pressure

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Dupuy, Célie. "Réponses de populations de poissons au stress chimique en milieux estuariens : intégration des réponses moléculaires, biochimiques et immunotoxicologiques." Phd thesis, Université de Bretagne occidentale - Brest, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00951704.

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Abstract:

Les milieux côtiers et estuariens sont aujourd'hui particulièrement impactés par les activités anthropiques qui se traduisent par des stress multiples s'exerçant sur les populations aquatiques (stress chimique, thermique, hypoxique,...). La présence de cocktails de polluants complexes dans les eaux peut avoir des conséquences non seulement sur les écosystèmes aquatiques, mais également sur les populations humaines situées au sommet de la chaîne trophique. Au cours de ce travail de thèse, deux études ont été menées parallèlement en France et au Québec, sur deux poissons considérés comme des espèces sentinelles en milieux estuariens, respectivement le flet (Platichthys flesus) et le poulamon (Microgadus tomcod). Une batterie de biomarqueurs a été mise en œuvre, en considérant différents niveaux d'organisation biologique, c'est-à-dire en analysant les réponses au stress chimique du niveau moléculaire au niveau individuel (expression de gènes, activité de détoxification, fonctionnement du système immunitaire, métabolisme énergétique, indices de condition). L'objectif principal de cette étude était de rechercher les biomarqueurs les plus pertinents pour évaluer la qualité des écosystèmes estuariens, en prenant en compte les spécificités des milieux contaminés et des espèces sentinelles.Dans un premier temps, la réponse du flet a été explorée en conditions contrôlées, après une contamination de 29 jours avec un cocktail de HAPs et PCBs à des doses environnementales, suivie de 14 jours de récupération. Le cocktail de polluants, administré par l'alimentation, affecte le système immunitaire et induit des processus de détoxification et des dommages à l'ADN. L'augmentation de l'expression du composant C3 du complément et du TNF-receptor suggère que les polluants provoquent une réponse inflammatoire au niveau du foie. La mesure du lysozyme apparait comme l'un des marqueurs les plus sensibles du système immunitaire face aux contaminants. Enfin, cette étude met en évidence une corrélation entre l'expression du gène Cytochrome P450 1A1 et les dommages à l'ADN.Ces marqueurs ont été dans un second temps mis en œuvre dans l'analyse des réponses de populations naturelles de flet puis de poulamon à la contamination chimique. Il apparait dans ces deux études que la réponse du système immunitaire est complexe, certaines fonctions étant inhibées (capacité de phagocytose) alors que d'autres sont activées en présence de polluants (expression du C3 et du TNF-R, prolifération lymphocytaire). De plus, l'approche multiparamètres confirme que certains marqueurs testés en laboratoire peuvent être également pertinents pour diagnostiquer la qualité des milieux estuariens. Les études réalisées sur les populations de flet et de poulamon montrent un différentiel entre sites contaminées versus sites témoins, au niveau de plusieurs biomarqueurs (métabolisme énergétique, activités de détoxification, réponses immunitaires, indices de condition), selon les sites échantillonnés et l'âge des poissons (cohortes 0+ ou 1+).

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Ruchon, François. "Lipophrys pavo (Risso 1810) (Pisces, Blenniidae). Biologie d'une population lagunaire (stratégies et tactiques adaptatives)." Aix-Marseille 3, 1995. http://www.theses.fr/1995AIX30025.

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Abstract:

La population de blennies (lipophrys pavo) de la lagune de mauguio (golfe du lion, mediterranee) est sedentaire. Le regime alimentaire est compose essentiellement d'amphipodes, d'isopodes et de mercierella enigmatica tres abondants dans ce milieu. La predation semble reduite. La longevite est de trois ans au maximum. La structure en taille et en age, l'importance des recrutements et la taille des recrues varient considerablement selon l'annee. La croissance est importante durant les periodes chaudes et en dehors de la reproduction. Chaque femelle pond de nombreux lots d'ovocytes au maximum d'avril a septembre, le debut de la ponte dependant de la taille de la femelle. L'effort reproducteur est intense et mobilise l'ensemble des reserves energetiques disponibles. La maturite sexuelle est atteinte a un an environ. Le rgs, les fecondites absolues et relatives, la taille des ovocytes evoluent au cours de la reproduction et en fonction de la taille et de l'age des femelles. Trois types de males ont ete identifies, les males nidificateurs qui gardent les nids dans lesquels sont pondus les ufs, les males cleptogames qui pratiquent le vol de paternite et les males non-fonctionnels qui ne participent pas a la reproduction. Les nids potentiels, des cavites dans des blocs de pierre ou des massifs de m. Enigmatica, sont assez rares dans la lagune. La concurrence entre les males pour leur possession est intense. Elle est accrue par le comportement des femelles qui pondent preferentiellement dans des nids a entrees etroites et qui contiennent deja des ufs. Nous essayons de montrer comment ces caracteristiques peuvent etre induites par la vie en milieu lagunaire et en quoi elles peuvent faciliter la survie dans ce milieu

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Danancher, Delphine. "Apports de l'écologie comportementale à la conservation d'un poisson en voie de disparition : l'apron du Rhône (Zingel Asper)." Lyon 1, 2005. http://www.theses.fr/2005LYO10228.

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Abstract:

L'apron (Zingel Asper), poisson endémiquedu bassin du Rhône, est menacé de disparition. L'adaptation des modèles de capture-marquage-recapture (CMR) à l'étude de ses préférences de micro et de méso-habitat (faciès) ainsi que les travaux de génétique (relations d'apparentement, dispersion juvénile) ont révélé l'importance des déplacements, de l'hétérogénéité spatiale des habitats et du système d'appariement dans le maintien d'une des dernières populations viable d'apron (rivière Beaume, Ardèche). Le protocole de CMR a également permis l'estimation des rythmes de croissance et leur validation. Les résultats acquis au cours de ce travail ont été discutés en fonction des perspectives de conservation de l'espèce

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Juncker, Matthieu. "Approvisionnement en larves de poissons du lagon de Wallis (Pacifique Sud)." Nouvelle Calédonie, 2005. http://portail-documentaire.univ-nc.nc/files/public/bu/theses_unc/TheseMatthieuJuncker2005.pdf.

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Abstract:

L’étude de l’approvisionnement du lagon de Wallis en larves de poisson a été effectuée entre juin 2002 et juin 2003 à l’aide de filets stationnaires. Au total, 158 espèces appartenant à 42 familles/taxons ont été identifiées au cours de 299 pêches. L’ensemble des 110959 larves capturées était composé principalement de Pomacentridae (34,8%), de leptocéphales (27,7%) et de Ptereleotridae (23,7%). Le suivi temporel, mené au nord de Wallis, a permis de montrer qu’à l’échelle des quartiers de lune et des mois lunaires, la richesse et la composition spécifique étaient peu variables. En revanche, d’importantes variations de l’abondance ont été décelées sur ces échelles de temps. A l’échelle de l’année, aucune tendance n’a pu être extraite des séries temporelles. La plupart des espèces abondantes ont suivi un schéma annuel de colonisation. Ces résultats suggèrent l’absence d’une forte saisonnalité de la colonisation du lagon nord de Wallis probablement liée à l’absence de saisonnalité de la reproduction. Le suivi spatial, mené au nord, à l’est et au sud de Wallis a montré, pour la majorité des espèces étudiées (75%), l’existence de corrélations positives entre les abondances des sites les plus rap- prochés (est et sud, distants de 8 km ou nord et est, distants de 1 5 km). Ce résultat suggère que les événements de colonisation s’opèrent à une échelle spatiale de l’ordre de 8-15 km plutôt qu’à l’échelle de 20 km. Les variations spatiales de la colonisation ont été persistantes à plusieurs échelles temporelles (quartier de lune, mois lunaire et année). Les trois sites ont été colonisés par des assemblages de larves distincts. La sélection active d’un habitat par les larves de poissons, ou l’influence des facteurs hydrodynamiques, pourraient expliquer cette structuration. Le processus de colonisation larvaire n’est pas indépendant des conditions environnementales. Globalement, les liens entre l’approvisionnement larvaire et les variables environnementales (la couverture nuageuse, les précipitations, la vitesse et la direction du vent, la hauteur et la direction moyenne des vagues) ont été significatifs mais faibles. Ces liens apparaissent plus fort lorsque les variations d’abondances sont étudiées par espèce. Il est probable qu’au moment de coloniser, les larves réagissent spécifiquement avec leur environnement selon leurs caractéristiques phénotypiques et ontogéniques

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Bozec, Yves-Marie. "Les poissons des récifs coralliens de Nouvelle-Calédonie : estimations d'abondance, relations habitat-poissons, interactions trophiques et indicateurs écologiques." Paris 6, 2006. http://www.theses.fr/2006PA066010.

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Castellanos, gell Jessy. "Structure génétique des populations de trois espèces de poissons de récifs cubains : Stegastes partitus, haemulon flavolineatum et acanthurus tractus." Phd thesis, Université Paris Sud - Paris XI, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00713528.

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Abstract:

La dispersion des poissons des récifs coralliens dépend, pour une large part, de l'existence de larves pélagiques qui peuvent être transportées au sein des courants marins loin de la population source. De l'efficacité de ce transport dépendra l'existence de populations formant un continuum, plus ou moins connectées, tout le long des zones de récifs. Toutefois, ce phénomène de dispersion est complexe et il implique aussi d'autres facteurs, physiques et biologiques, qui influent sur la dispersion de ces organismes.L'objectif de cette thèse a été d'étudier les effets des caractéristiques géographiques de l'archipel cubain et de la biologie des espèces sur la structure génétique et la connectivité des populations de poissons de récifs en utilisant comme modèle trois espèces présentant des traits d'histoire de vie différents : Stegastes partitus, Haemulon flavolineatum et Acanthurus tractus.Nous avons échantillonné des individus adultes dans cinq localités situées autour de l'archipel cubain pendant la période 2005-2010. Le polymorphisme de marqueurs microsatellites a été étudié chez S. partitus et H. flavolineatum, celui de la région non codante de l'ADNmt chez les trois espèces et celui du gène cytb chez A. tractus.L'analyse de la diversité génétique des locus microsatellites révèle des taux d'hétérozygotie observés (Ho) et attendus (He) élevés à chaque locus et pour les deux espèces, mais elles présentent différents patrons d'organisation de la diversité génétique. Chez S. partitus, la comparaison des localités prises deux à deux nous montre une différentiation exprimée par des valeurs de FST très faibles mais significatives, alors que chez H. flavolineatum aucune structuration géographique n'est observée. Ces résultats sont confirmés au niveau de l'ADN mitochondrial, lequel indique aussi une absence de différentiation d'A. tractus pour l'ensemble des localités étudiées. Les différences de structuration génétique des espèces étudiées pourraient être le résultat des effets des courants marins autour de l'ile qui agissent de façon différente sur la dispersion des espèces en fonction de leur comportement reproducteur (e.g. sites de fraie, œufs pélagiques ou benthiques et capacité des larves de rester prêt des récifs natals ou d'être transportés au loin).Pour les marqueurs mitochondriaux, nous avons obtenu des valeurs élevées de diversité haplotypique pour les trois espèces, mais la diversité nucléotidique est très différente selon les espèces, faible chez S. partitus, grande chez H. flavolineatum, et très grande chez A. tractus. La distribution du nombre de différences entre les séquences suggère que ces populations sont passées par des périodes d'expansion démographique. Ceci est confirmé par les estimations des paramètres de tests de neutralité. Les paramètres caractérisant la croissance des populations qui ont été obtenus pour les trois espèces ne sont pas semblables, ce qui suggère que le temps et l'ampleur des événements d'expansion ont été différents pour les trois espèces.L'analyse du gène cytb nous a permis d'identifier des haplotypes chez A. tractus qui n'avaient été observés préalablement que chez A. bahianus. L'aire de répartition de cette dernière espèce a été récemment restreinte à l'Atlantique Sud sur la base de la divergence génétique avec A. tractus et de la séparation géographique qui est maintenu par la barrière que constitue l'embouchure des rivières Orénoque et Amazone. La présence d'haplotypes du sud à Cuba suggère que des individus du sud ont été capables de traverser cette barrière.

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Brehmer, Patrice. "Analyse comparée des caractéristiques dynamiques et spatiales des bancs de Sardinella aurita (Valenciennes, 1847) de diverses populations : adaptations comportementales face à l'environnement et à l'exploitation : effet sur la capturabilité." Rennes, Agrocampus Ouest, 2004. http://www.theses.fr/2004NSARH055.

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Abstract:

Le comportement des bancs de poissons, unité fonctionnelle sur laquelle s’exerce la pression de pêche en général, est à l’origine du biais majeur des indices d’abondance fournis par les méthodes d’évaluation de stock directe et indirecte. Ce travail s’attache à mesurer les relations possibles entre effort de pêche et l’évitement des bancs. Dans ce but nous avons réalisé une approche comparative à partir de trois stocks génétiquement indépendants de Sardinella aurita, avec un environnement similaire mais une exploitation historique différente. Ce comportement d’évitement, généré par la perception dynamique du navire, se mesurant en particulier par la cinématique des bancs in situ, nous avons développé un logiciel (Infobancs) dédié à l’exploitation des données délivrées par un sonar omnidirectionnel, et une méthodologie d’observation, avec et sans perturbations engendrées par un navire en route. L’environnement (biotique, abiotique et anthropique) et les caractéristiques intrinsèques de la population ont un impact direct sur ce comportement, qui s’exprime par une déformation des bancs et trois vagues distinctes d’évitement. Nous posons l’hypothèse d’un déterminisme inné et/ou acquis de la réaction d’évitement. Nos résultats montrent, pour un même effort, des prises plus importantes au Venezuela qu’au Sénégal et en Côte d’Ivoire. De plus les observations spatiales et cinématiques in situ des bancs montrent un comportement d’évitement différent au Venezuela, comparé aux deux stocks africains. Ceci confirme l’existence d’un lien entre effort et évitement, donc d’une réponse adaptative à la pression de pêche. Cette adaptation comportementale est issue d’un processus de sélection darwinienne et/ou d’un apprentissage des populations de sardinelles à l’exploitation par pêche. Pour mesurer le biais dû à l’évitement sur la gestion des stocks, nous discutons de la conception de bancs virtuels et de la possibilité d’un enregistrement continu tridimensionnel de l’évitement
The behaviour of fish school, functional unit on which the fishing pressure focus in general, is the major source of bias of the biomass index obtained by the methods of stock assessment (echo-integration, scientific fishing etc. . ). This work, want to measure the possible relation between the fishing effort and the fish school avoidance reaction. In this goal, we have made a comparative approach from three genetically independent stock of Sardinella aurita, with a similar environment but a different historical fishing exploitation. The avoidance behaviour generated by the boat perception (acoustic, visual and tactile), can be measured by the in situ school kinematic. We have developed Infobancs software for the exploitation of omnidirectional sonar data and an observation methodology, considering the boat in cruise or in drift. The environment, (biotic, abiotic) and the intrinsic characteristics of the population have a direct impact on this behaviour, which is expressed by morphological deformation and three distinct wave of avoidance. We present the hypothesis of a innate of acquired of the avoidance reaction. Our results show for a same fishing effort, catches more important in Venezuela than in Senegal and Ivory Coast. More over the spatial and kinematics in situ observations of school show an avoidance behaviour different in Venezuela, in front of the two Africans stocks. This indicate the existence of a link between fishing effort and the avoidance, and so the adaptative response to the fishing pressure. This behavioural adaptation comes from a Darwin selection process and/or a learning of the Sardinella aurita populations to the fishing exploitation. In order to measure the bias engendered by the avoidance on the stock management, we discuss of the conception of virtual fish school and the possibilities of a continuous three-dimensional recording of the avoidance reaction

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Blanquer, Anne. "Phylogéographie intraspécifique d'un poisson marin, le flet Platichthys flesus L. (Heterosomata) : polymorphisme des marqueurs nucléaires et mitochondriaux." Montpellier 2, 1990. http://www.theses.fr/1990MON20015.

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Abstract:

Le polymorphisme genetique et la structure geographique des populations de flets platichthys flesus l. , ont ete etudies a partir de resultats obtenus par deux techniques d'analyse, l'electrophorese des proteines enzymatiques et le plfr de l'adn mitochondrial. Ces deux techniques permettent d'obtenir des informations complementaires provenant de deux compartiments du genome ayant des caracteristiques evolutives differentes (adn mit. Transmis maternellement). Nous cherchons a determiner des unites genetiques et a proposer des hypotheses sur leur origine et leur maintien, en relation avec les facteurs biologiques, environnementaux et biogeographiques. Huit locus enzymatiques polymorphes et 80 fragments de restriction ont ete analyses. Trois sous-unites genetiques ont ete mises en evidence: le golfe du lion, la region du portugal, et l'ensemble mer du nord-manche-kattegat. En desaccord avec les predictions, les divergences genetiques revelees par electrophorese des proteines sont plus importantes que celles montrees par les marqueurs mitochondriaux. Nous discutons les caracteristiques et l'utilisation de ces marqueurs et proposons une hypothese paleographique sur l'origine des populations de flets en europe

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Samba, Alassane, and Francis Laloë. "La pêche artisanale au Sénégal : ressource et stratégie de pêche." Paris 11, 1989. http://www.theses.fr/1989PA112153.

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Abstract:

Les eaux du plateau continental sénégalo-mauritanien sont enrichies par un upwelling côtier qui leur assure une forte productivité. Nous avons décrit la mise en place d'un système d'enquêtes pour la pêche artisanale (plan stratifié avec plusieurs niveaux dans chaque strate) et discuté les principales sources d'erreurs. L'augmentation du nombre de strates conduirait à celle de la variabilité de leur taille, vu l'aptitude des unités de pêche à changer de tactique selon les circonstances. Nous avons analysé les données recueillies sur les sorties de pêche et leurs résultats à Saint-Louis et à Kayar, en considérant 3 périodes entre 1975 et 1987. Cette étude montre une importante variabilité inter et intra-annuelle des diverses observations et indique de profondes modifications de la distribution et des schémas d'exploitation de certains stocks au cours des 15 dernières années. Nous avons ensuite discuté des caractéristiques de modèles de dynamique des populations en examinant leur aptitude à rendre compte des changements observés. Nous avons plus particulièrement étudié une formulation adaptée aux pêcheries de rayon d'action limité. Nous avons présenté les approches multispécifiques et multiengins en insistant sur celles décrivant la dynamique des flottilles. Nous avons présenté un modèle de simulation et nous l'avons utilisé pour comparer l'activité et les résultats de deux pêcheries. La première est semblable à la pêcherie artisanale sur la côte nord du Sénégal, la seconde en diffère par un choix plus limité de tactiques à la disposition de chaque unité de pêche. Les résultats obtenus permettent d'aborder l'analyse des problèmes d'aménagement des pêcheries artisanales
In Senegal, waters of the continental shelf are very productive, due to a seasonal upwelling responsible of fish stocks migrations. The progressive setting up of a stratified sampling system (with subsampling in each stratum) for collecting a great number of parameters takes into account the main artisanal fishery characteristics. Data processing gives up results on fishing effort, catch per unit of effort and total landings. Methodological tests are periodically conducted to improve sampling design. The main source of bias is discussed. This enhances the fact that increasing the strata number would lead to a variability of their size, due to the capacity of fishing units to alter their tactics according to circumstances. We deeply study fishing outings and results in Saint-Louis and Kayar by using statistical analysis and considering 3 periods between 1975 and 1987. We notice an important interannual variability in fishing effort characteristics and levels, and in catch per outing. We also show seasonal and annual variations in resource availability and landings related to upwelling dynamics. We then study population dynamics models through their ability to account for the main changes that have been noticed. We pay particular attention to the potential impact of a restricted access to the resource and to the models applying to the dynamics of the fishing fleet. We then suggest a simulation showing the evolution of a fishery similar to the artisanal fishery in Senegal, the fishing units of which have a strategy with a range of available tactics and a selection rule. We then study a fishery that would differ by its lesser adaptability. This finally allows us to deal with the analysis of artisanal fisheries planning problems

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Laloë, Francis, and Alassane Samba. "La pêche artisanale au Sénégal : ressource et stratégie de pêche." Paris 11, 1989. http://www.theses.fr/1989PA112154.

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Abstract:

Les eaux du plateau continental sénégalo-mauritanien sont enrichies par un upwelling côtier qui leur assure une forte productivité. Nous avons décrit la mise en place d'un système d'enquêtes pour la pêche artisanale (plan stratifié avec plusieurs niveaux dans chaque strate) et discuté les principales sources d'erreurs. L'augmentation du nombre de strates conduirait à celle de la variabilité de leur taille, vu l'aptitude des unités de pêche à changer de tactique selon les circonstances. Nous avons analysé les données recueillies sur les sorties de pêche et leurs résultats à Saint-Louis et à Kayar, en considérant 3 périodes entre 1975 et 1987. Cette étude montre une importante variabilité inter et intra-annuelle des diverses observations et indique de profondes modifications de la distribution et des schémas d'exploitation de certains stocks au cours des 15 dernières années. Nous avons ensuite discuté des caractéristiques de modèles de dynamique des populations en examinant leur aptitude à rendre compte des changements observés. Nous avons plus particulièrement étudié une formulation adaptée aux pêcheries de rayon d'action limité. Nous avons présenté les approches multispécifiques et multiengins en insistant sur celles décrivant la dynamique des flottilles. Nous avons présenté un modèle de simulation et nous l'avons utilisé pour comparer l'activité et les résultats de deux pêcheries. La première est semblable à la pêcherie artisanale sur la côte nord du Sénégal, la seconde en diffère par un choix plus limité de tactiques à la disposition de chaque unité de pêche. Les résultats obtenus permettent d'aborder l'analyse des problèmes d'aménagement des pêcheries artisanales
In Senegal, waters of the continental shelf are very productive, due to a seasonal upwelling responsible of fish stocks migrations. The progressive setting up of a stratified sampling system (with subsampling in each stratum) for collecting a great number of parameters takes into account the main artisanal fishery characteristics. Data processing gives up results on fishing effort, catch per unit of effort and total landings. Methodological tests are periodically conducted to improve sampling design. The main source of bias is discussed. This enhances the fact that increasing the strata number would lead to a variability of their size, due to the capacity of fishing units to alter their tactics according to circumstances. We deeply study fishing outings and results in Saint-Louis and Kayar by using statistical analysis and considering 3 periods between 1975 and 1987. We notice an important interanual variability in fishing effort characteristics and levels, and in catch per outing. We also show seasonal and annual variations in resource availability and landings related to upwelling dynamics. We then study population dynamics models through their ability to account for the main changes that have been noticed. We pay particular attention to the potential impact of a restricted access to the resource and to the models applying to the dynamics of the fishing fleet. We then suggest a simulation showing the evolution of a fishery similar to the artisanal fishery in Senegal, the fishing units of which have a strategy with a range of available tactics and a selection rule. We then study a fishery that would differ by its lesser adaptability. This finally allows us to deal with that analysis of artisanal fisheries planning problems

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Dissertations / Theses on the topic 'Poissons – Populations'

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