Academic literature on the topic 'Poissons rares – Atlantique (océan ; nord-est)'

Le peuplement ichtyologique d'un marais littoral endigué, géré en eau douce, a été étudié sur une zone de 2 700 ha, située au nord du marais Breton-Vendéen (Loire-Atlantique, France). Le réseau hydraulique, qui représente près de 16 % de cette surface, se compose, d'environ 91 m de linéaire de fossés par ha (en tout 234 km) et de bassins présents uniquement dans la partie d'origine salicole du marais. Les hauteurs d'eau, l'envasement et le recouvrement par la végétation aquatique dépendent de la gestion humaine et sont très variables (moyennes respectives : 42 cm; 43 cm; 70 %). Cela se traduit par un morcellement spatial de l'habitat pour les poissons. La stratégie d'échantillonnage adoptée, qui tient compte de cette hétérogénéité, a permis de décrire un peuplement comportant 21 espèces. Dominé par les poissons-chats et par les anguilles, ce dernier est caractéristique de la zone à brèmes des cours d'eau. Les abondances sont relativement élevées (en moyenne 315 kg/ha et 11 460 poissons/ha), mais elles sont très hétérogènes. L'évolution qualitative et quantitative de la répartition spatio-temporelle est décrite à l'aide d'une analyse factorielle des correspondances portant sur 74 échantillons prélevés par pêche électrique entre 1987 et 1989. Bien que l'approche de ce milieu soit complexe et les références bibliographiques relativement rares, l'analyse des premières données permet d'ores et déjà d'identifier quelques problèmes de gestion ayant des répercussions directes sur le peuplement piscicole de cette zone.

Au cours des années 70-80 la pêche connaît une crise grave ; les professionnels français chalutent plus profond (1400m) à l'ouest des îles britanniques. Des pêcheries étrangères plus anciennes ont montrées la fragilité de cette ressource. Des campagnes de pêche ont permis de recenser 54 à 86 taxons. Les populations de poissons profonds sont organisées en peuplements selon la profondeur et la latitude, avec 1 a 3 espèces dominantes, le grenadier y est majoritaire. De fortes longévités ont été déterminées : 38 ans pour Alepocephalus bairdii, 54 pour Coryphaenoides rupestris et 43 pour Helicolenus dactylopterus. Mais des problèmes d'interprétation existent sur l'âge qui n'a pas été validé. Leur croissance est lente. La comparaison des structures en taille avec des données historiques révèle une diminution de la taille de A. Bairdii et de C. Rupestris depuis 1989. Ces espèces ont une maturité tardive (14-16 ans) et une période de reproduction de 10-12 mois. H. Dactylopterus a une maturité précoce (3-4 ans), les mâles maturent plus tôt, ils inséminent les femelles en automne, elles stockent les spermatozoïdes dans leurs ovaires et pondent au printemps. Ces espèces ont des fécondités annuelles indéterminées et des stratégies démographiques de type K. La flottille française profonde est composée de 50 bateaux débarquant par an 19000 t de poissons profonds. Les CPUE ont diminué depuis 1989. 8 espèces sont débarquées à 100%, 1 espèce est débarquée et rejetée : le grenadier avec un taux de rejet de 23%. 42 espèces sont rejetées à 100%. Les rejets représentent 52% du poids des captures et augmentent avec la profondeur. Les rejets totaux ont été estimés à 17500 t. Des estimations de stocks ont été réalisées sur A. Bairdii et le grenadier donnant des valeurs indicatives. Les résultats doivent inciter à la prudence. Si la mise en place de quotas ne semble pas être envisageable, une réglementation serait l'utilisation d'engins de pêche plus sélectifs.

La compréhension des interactions liant la répartition des espèces, la biodiversité, les habitats marins et le changement climatique est nécessaire voire fondamentale pour la mise en oeuvre d’une gestion efficace de la conservation, par exemple la mise en place d’aires marines protégées. Dans cette étude, nous avons travaillé sur l’évolution de richesse de 89 espèces de poissons notées «rares» ou «exotiques» (observées en dehors de leur aire de répartition connue) lié au changement climatique. Nous avons modélisé et prédit leur distribution saisonnière par le modèle SIG en fonction de leurs niches écologiques (déterminée dans cette étude). En superposant tous les modèles en fonction du temps, cette approche permet d’identifier des zones d’occupation préférentielle de forte biodiversité (hotspots). La méthode offre une alternative pour mesurer la richesse d’espèces de façon saisonnière dans des zones peu connues, et de suivre leur mouvement au cours de temps, puis avoir information de base sur l’efficacité de positionnement des aires marines protégés liées à ces zones hotspots. La zone d’étude s’est située dans trois grands écosystèmes marins : le courant des Canaries, le plateau sud de l’Atlantique Européen et les mers celtiques. La région centrale est une zone de transition (entre les eaux tropicales et tempérés) connue pour sa sensibilité aux effets du changement climatique. De 1982 à 2012, la SST augmente constamment au fil du temps, avec des tendances et des magnitudes qui varient selon l’écosystème. Une augmentation du nombre d'espèces dans un écosystème dans une période a été généralement suivie par une tendance à la baisse ou à la hausse dans des écosystèmes adjacents. Les niches écologiques des espèces étudiées ont été estimées par l’extraction des valeurs environnementales à l’échelle mondiale au point d'occurrence au moment de l'observation. Les résultats de niches sont cohérents avec ceux obtenus à partir d’études observationnelles ou expérimentales. La flexibilité du modèle SIG nous a permis de suivre l'évolution saisonnière de distribution des espèces au fil du temps. En général, les espèces montrent une tendance à élargir leur distribution vers le nord, montrant l'effet du réchauffement de l'océan sur la distribution des poissons marins. L’approche de modèle peut être utilisée pour modéliser la distribution des espèces moins connues, ou dans des zones où les données d’occurrences sont peu nombreuses, ainsi que pour prédire le modèle de distribution future. L'analyse spatiale de la superficie des AMPs (Aires Marines Protégées) par pays appartenant à la zone d'étude, montre que le Royaume-Uni puis la France possèdent le plus grand nombre d'AMP ainsi que les superficies totales protégées les plus importantes. La fréquence à laquelle les AMPs (Aires Marines Protégées) sont touchées par les zones de hotspots est fortement influencée par les variations de l’environnement, les zones favorables évoluant alors au fil des saisons. Ainsi, il est important de prendre en compte les variations saisonnières pour la création des AMPs afin de préserver les capacités adaptative des espèces soumises au changement global<br>Understanding connectivities among species distributions, biodiversity, marine habitats and climate change is necessary for the design of an effective conservation management, such as in the implementation of marine protected area (MPA). In this study, we observed the richness of 89 "rare" or "exotic" fish species (observed outside their known distribution range) related to climate change. We modeled and predicted their seasonal distributions according to the species ecological niches (determined in this study) using the GIS model. Superposing the models of all species using GIS, we determined the preferential zones or zones of high biodiversity (hotspots) over time. The GIS approach offers an alternative to measure seasonal species richness in poor-data areas. This approach allowed also species track movement over time. This information could be then used to measure the effectiveness of MPA positioning related to the hotspot areas. Our study area covers a wide latitudinal range of the Eastern Atlantic waters, from the warm tropical/subtropical waters to the temperate waters. This area is located in three large marine ecosystems: the Canary current, the South European Atlantic Shelf and the Celtic Seas. The transitional zone in the central region has well known for its sensitivity to the detection of climate change. From 1982 to 2012, the SST in all of studied ecosystems has increased consistently over time, with magnitude and trend varied among ecosystems. The change of number of species in each decadal period differed among ecosystems. Increasing number of species in an ecosystem was generally followed by decreasing trend in adjacent ecosystems. Species ecological niches were obtained by extracting the environmental values in the location of species occurrence at the time of observation. The environmental data and the occurrence records used were at global scale, and the methods yields coherent results with the results obtained from observational studies. The flexibility of GIS Model used in this study allowed us to follow the evolution of species seasonal distribution over time. Generally, most of the studied species showed a northbound trend in their distribution. These northbound tendencies were more evident in the middle region, confirming the effect of global warming in shifting marine species distribution. This approach provides an alternative of measuring seasonal richness of poor-known species and/or modeling in poor-data areas. The results present a complete picture of predictive number of species in an area over time. MPAs superficial analysis by country (countries lying in the study area) showed that UK has the highest number of MPA and the largest protected areas, following by France and Mauritania. Frequencies of the MPAs touched by the hotspot were strongly influenced by seasonal variations. Thus, considering seasonal variations in a conservation effort could preserve species adaptive variation under environmental changes. Overall, our works provide several alternative methods for species distribution studies and for studies poor-known species in data-poor area. The results provide evidences of ocean warming effect in shifting marine fish distribution

La propriete la plus importante et inattendue des ecosystemes du milieu profond est la tres forte diversite specifique des communautes benthiques. De nombreux concepts tendent a definir les parametres contribuant au maintien de cette diversite biologique de la faune benthique profonde, sans toutefois reellement considerer le facteur ressource et sa variabilite. Aujourd'hui, les nombreuses donnees obtenues au cours du programme pluridisciplinaire eumeli dans l'atlantique tropical nord-est ont permis d'analyser la structure et la diversite des peuplements profonds dans trois stations aux conditions bathymetriques, physiques et trophiques contrastees. Les densites des differentes categories dimensionnelles suivent un gradient decroissant avec l'augmentation de la profondeur decrivant une diminution d'abord tres rapide jusqu'a 3100m, induite par la forte reduction des apports trophiques et une diminution plus faible jusqu'aux profondeurs abyssales. Les peuplements de megafaune deviennent importants lorsque les compartiments macro et meiobenthiques sont bien developpes dans le milieu. Il existe donc une strategie dans l'installation des differents groupes faunistiques sous controle des apports trophiques. L'analyse detaillee des peuplements de polychetes, taxon dominant la macrofaune, a permis de mettre en evidence le role des conditions environnementales sur la structure de ces peuplements. Cette influence de l'habitat se traduit par des assemblages d'especes plus ou moins specialisees et par la variation des modes de dispersion spatiale des individus, la dispersion aleatoire remplacant au fur et a mesure de l'eloignement de la cote la forme agregative des peuplements. La diversite specifique des peuplements de polychetes s'avere particulierement elevee sur la pente continentale par le jeu d'interactions production-perturbation ou les facteurs physiques permettent la reduction de l'exclusion competitive. En revanche, les peuplements de la station abyssale vraie sont faiblement diversifies en reponse a un milieu contraignant et plus particulierement a une ressource trophique tres limitee. La station a 3000m presente une diversite intermediaire liee a l'effet combine de flux organiques consequents et de facteurs physiques moderes. Il existe en region tropicale, un gradient parabolique de la diversite des polychetes depuis la cote jusqu'a la plaine abyssale, avec une diversite maximale vers 2000m de profondeur. L'elargissement de l'etude a deux regions temperees de l'atlantique souligne la forte variabilite regionale de la diversite des polychetes. En zone temperee, la diversification, plutot moderee des peuplements, resulte de l'interaction entre les evenements physiques non predictibles lies a la proximite de la marge et d'un flux de carbone relativement important mais tres concentre dans le temps. Enfin, la diversite biologique analysee pour une quinzaine de groupes d'invertebres benthiques a revele de fortes variations entre les groupes independamment de la distinction en categorie dimensionnelle. A l'inverse des polychetes, les isopodes, les aplacophores et les bivalves sont plus diversifies vers 3000m de profondeur ou les parametres de l'environnement sont relativement homogenes. Tandis que la plupart des taxons de la megafaune sont peu diversifies tout en etant bien representes sur la pente continentale, les holothuries preferent les environnements physiques moins perturbes plus profond

Les poissons de la pente occidentale sont étudiés à trois niveaux : les individus, les populations et les peuplements. La distribution de ces espèces est agrégée ou dispersée. Ici, les observations par engins sous-marins suggèrent que l'empereur, espèce connue pour se concentrer dans des habitats particuliers, utilise des zones abritées du courant pendant des phases de repos. Au contraire, le petit anguilliforme, Synaphobranchus kaupii est dispersé à grande échelle ; il semble préférer des habitats sédimentaires où ses proies s'accumulent et éviter les zones sans courant. Les comportements des poissons profonds sont diversifiés, liés à leurs stratégies alimentaires et flexibles selon les conditions environnementales. Du fait de leurs traits vitaux, ces poissons ne peuvent supporter que des taux d'exploitation modérés. Des problèmes d'estimation (âge, tendance des CPUE) et la méconnaissance de la structure en populations gênent l'évaluation des stocks dont plusieurs ont été surexploités dans l'Atlantique Nord-Est ; le cas de la dorade rose est développé. L'échantillonnage des grandes espèces mobiles au chalut de type commercial indique sur la pente une diversité spécifique et taxonomique supérieure et structurée différemment de celle du plateau. Les observations visuelles qui échantillonnent bien les petites espèces benthiques complètent l'estimation de la composition du peuplement. Enfin, les observations à bord des chalutiers confirment qu'une seule espèce cible, le grenadier, est en partie rejetée et montrent l'impact de la pêche. Elles permettent d'identifier, dans les CPUE, des facteurs inacessibles dans les statistiques de pêches et campagnes scientifiques

Afin d'explorer les mécanismes de structuration génétique des poissons dans l'Atlantique Nord Est, quatre espèces ont été étudiées en parallèle : merlan, lieu jaune, baudroie blanche et baudroie noire. D'une part, l'étude de la diversité mitochondriale, au niveau de l'extrémité 5'de la région de contrôle, a montré l'impact des évènements anciens sur la diversité génétique actuelle des baudroies, avec notamment, une expansion démographique rapide semblant s'être déroulée au cours de la première moitié du Pléistocène. Une différenciation génétique a été observée entre les populations atlantique et méditerranéenne seulement chez la baudroie noire et cela pourrait être dû (i) à l'impact de phénomènes de vicariance anciens et (ii) à une limitation actuelle des flux géniques par le front Alméria-Oran. L'absence de différenciation génétique chez la baudroie blanche entre la Méditerranée et l'Atlantique suggère une (re)colonisation plus récente de la Méditerranée par ce taxon. D'autre part, l'utilisation de microsatellites a souligné l'influence de facteurs hydroclimatiques actuels sur la structure génétique du lieu jaune et du merlan. La différenciation génétique significative observée chez le merlan en Mer du Nord et entre le sud du Golfe de Gascogne et les Iles Britanniques, ainsi que la structure détectée chez le lieu jaune entre la Manche Ouest—Mer d'Iroise et le Golfe de Gascogne, semblent liées à des systèmes de rétention limitant la dispersion passive des œufs et larves pélagiques. De plus, la structure des populations de merlan semble liée à un comportement de " homing " acquis. Enfin, la fragmentation de l'habitat du lieu jaune apparaît peu structurante<br>In order to explore the mechanisms of genetic structuring of marine fish in the North East Atlantic, four species were studied in parallel : whiting, pollack, white anglerfish and black anglerfish. First, the analysis of the mitochondrial variability , at the 5' end of the control region, showed the impact of historical events of the present-day genetic structure of anglerfish. Notably, this underlined a rapid demographic expansion that may have taken place during the first part of the Pleistocene. A significant genetic structure was observed between Atlantic and Mediterranean populations only in black anglerfish and this may be due to (i) the impact of ancient vicariant processes and (ii) to a contemporary reduction of gene flow with the Almeria-Oran oceanographic front. The lack of significant genetic differentiation observed in white anglerfish between Mediterranean and Atlantic suggests a more recent (re)colonisation of the Mediterranean by this species. Secondly, the use of microsatellites underlined the influence of contemporary hydroclimatical processes on the genetic structure of Pollack and whiting. The significant genetic differentiation observed in whiting whitin the North Sea and between the southern Bay of Biscay and British Iles waters, as the differentiation detected between pollack populations from western Channel –Iroise Sea and from the Bay of Biscay, are probably due to the existence of retention systems limiting passive dispersal of pelagic eggs and larvae. Furthermore, a learned homing behavior has been suggested as a structuring factor of whiting populations. Finally, the fragmentation of Pollack habitat does not appear as a structuring factor

Ce travail propose d'analyser la potentialite de traceurs pour quantifier des processus de transports d'elements dans la colonne d'eau. La quantification de ces processus est non seulement d'interet academique mais permet aussi d'estimer l'importance de l'ocean sur des problemes d'environnement. Nous proposons de combiner les spectres de rees et les compositions isotopiques (c. I. ) du nd comme traceurs. Les concentrations de rees, d'al, de th et de mn, et les c. I. Du nd dans l'eau de mer, les suspensions filtrees (> 0,65 m) et les grosses particules ont ete analysees (programme eumeli, france-jgofs : sites eutrophe, mesotrophe et oligotrophe, 20n, 18w 21w). Les parametres utilises revelent 7 points suivants : 1) les matieres en suspension sont le terme cle de la soustraction et de l'echange des rees entre la fraction dissoute et les particules. 2) les oxydes de mn, et plus generalement les oxydes de metaux sont les porteurs privilegies des rees authigenes aux sites eumeli. 3) l'anomalie positive de ce dans les particules marines est formee par une oxydation in situ du ce. Son evolution en profondeur est provoquee par desorption preferentielle de ses voisins trivalents. 4) les grosses particules acquierent un signal authigene en surface par agregation des matieres en suspension et le preservent en profondeur. 5) les constantes d'agregation et de desagregation estimees sont respectivement 0 30 a#-#1 et 0 700 a#-#1. 6) 10 a 90% du nd particulaire est echange avec l'eau de mer environnante. 7) le temps de residence du nd au site oligotrophe est 1000 ans, alors qu'il est 6 fois plus court au site mesotrophe. La globalisation des resultats obtenus aux sites eumeli montre que la zone du talus continental prend en compte 40% du flux particulaire de nd, bien que sa contribution a la surface de l'ocean soit seulement 10%. L'ensemble de nos resultats montre que les rees et les isotopes du nd sont des traceurs oceaniques interessants. Nos resultats soulignent l'importance des regions caracterisees par des forts flux de matiere sur les cycles globaux des elements.

Il est probable que le changement climatique influence la distribution spatiale et temporelle des espèces de thonidés de par son impact sur les bas niveaux trophiques. L’objet de cette thèse est donc (1) de déterminer quelles sont les principales variables environnementales définissant l’habitat des thonidés, (2) de définir les gammes de préférence, tolérance et rejet pour ces mêmes variables et (3) d’étudier, à différentes échelles, l’effet de l’environnement sur la distribution spatiale et temporelle des thonidés et poissons à rostre de l’Atlantique. Des modèles additifs généralisés (GAM) ont donc été mis en place afin de déterminer quelles sont les variables environnementales définissant le mieux l’habitat des thonidés à l’échelle mondiale. Pour chacune des espèces le meilleur modèle incluait toutes les variables environnementales considérées : température, salinité, oxygène dissous, anomalie du niveau de la mer, profondeur de la couche de mélange et concentration en chlorophylle. Les GAMs ont révélé que la plupart des espèces sont principalement liées à la température de surface, l’oxygène et l’anomalie du niveau de la mer. L’analyse des quotients a par ailleurs été utilisée pour définir les gammes de préférence et rejet des thonidés pour les différentes variables environnementales. Les espèces tropicales préfèrent des eaux plus oxygénées, plus chaudes et moins productives que les espèces tempérées. La deuxième partie de cette thèse a permis de démontrer que la migration saisonnière du germon et du thon rouge vers le Golfe de Gascogne est plus précoce dans les années 2000 de respectivement 2 et 5,6 jours par décennie que lors des années 1960 et 1980. Ce changement phénologique est corrélé avec l’évolution de la température sur les mêmes périodes. De plus, la température, notamment la latitude de l’isotherme 17 °C, a également montré une corrélation avec la latitude de capture des germons dans les eaux adjacentes au Golfe de Gascogne. Celle-ci a également évolué de 2,5° vers le nord sur les 40 dernières années. On a enfin pu montrer que le changement de régime de l’Atlantique Nord à la fin des années 1980 a eu une influence sur la migration de ces deux espèces. Finalement, une synthèse de toutes les études locales concernant les thonidés et poissons à rostre de l’Atlantique Nord et Sud a été adressée par le biais d’une méta-analyse. Le résultat général indique que la distribution latitudinale de l’ensemble des espèces ne semble pas présenter de corrélation avec la température. Cependant, la corrélation générale est positive si on ne s’intéresse qu’à l’hémisphère Nord. Les latitudes de captures des différentes espèces présentent de plus fortes corrélations avec l’oscillation Nord Atlantique et l’oscillation du Sud qu’avec la température. Ces différents résultats laissent penser qu’à l’échelle locale la température pourrait être un facteur déterminant de la distribution des espèces tandis qu’une plus grande partie des processus physiques de l’océan doivent être pris en considération pour comprendre la dynamique spatiale des thonidés à l’échelle de l’océan<br>Climate change may affect spatial and temporal distribution of tuna species due to its impact on lower trophic levels. Hence, the aims of this thesis are (1) to determine the main environmental variables that define tuna habitat (2) to define the ranges of preference, tolerance and avoidance for these variables and (3) to study, at different scales, the effect of environment on spatiotemporal distribution of tuna and billfish of the Atlantic. Generalized additive models (GAM) were carried out to determine the environmental variables defining global tuna habitat. For each species the best model included all environmental variables considered i. E. Temperature, salinity, dissolved oxygen, sea level anomaly, mixed layer depth and chlorophyll. GAMs revealed that for most species surface temperature, dissolved oxygen and sea level anomaly were variables explaining most of CPUE deviance. Besides, the quotient analysis was used to define tuna ranges of preference, tolerance and avoidance for different environmental variables. It appeared that tropical species prefer warmer, less productive, and more oxygenated waters than temperate species. The second part of this thesis revealed that albacore and bluefin tuna seasonal movements to the Bay of Biscay appeared earlier in the 2000s than in the 1960s and 1980s, respectively. The rate of change was 2 and 5. 6 days for decade, respectively. This change was correlated with phenological changes in temperature over the same periods. Moreover, the temperature, latitude of 17 °C isotherm in particular, also showed a correlation with albacore catch latitude in adjacent waters of the Bay of Biscay. It also moved 2. 5 ° northwards over the last 40 years. Lastly, we showed that the late 1980s regime shift of the North Atlantic had an influence on the migration of these two species. Finally, a synthesis of all local studies on tuna and billfish in North and South Atlantic was addressed in a meta-analytic framework. The overall result indicates that species distribution do not correlate with temperature. However, the overall correlation was positive in the northern hemisphere. Species catch latitude showed stronger correlations with the North Atlantic Oscillation and the Southern Oscillation than with temperature. These different results suggest that temperatures could be a factor determining species local distribution whereas some ocean physical processes should be considered in order to understand tuna spatial dynamics across oceans