Dissertations / Theses: 'Polymorphisme génétique'

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Monteil-Ganiere, Catherine. "Mercaptopurine et polymorphisme génétique." Nantes, 2003. https://archive.bu.univ-nantes.fr/pollux/show/show?id=6d743aea-4878-4f8f-a5a1-0dbe73f78509.

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Abstract:

Le polymorphisme génétique de l'activité thiopurine-méthyltransférase (TPMT), enzyme qui catabolise les thiopurines, a des répercussions importantes en clinique. Le génotype et l'activité TPMT ont été déterminés chez 304 adultes donneurs de sang, 147 enfants et 18 nouveaux-nés (sang de cordon) tous Caucasiens. L'activité TPMT varie de 0,43 à 30,38 U/mL PRBC chez l'adulte, de 8,25 à 30,0 U/mL PRBC chez l'enfant et 9,24 à 22,79 U/mL PRBC pour les sangs de cordons. Il n'y a pas de différence significative entre les activités TPMT des sangs de cordon et des adultes (p = 0,424). Mais on retrouve une activité légèrement plus faible chez l'enfant que chez l'adulte (p = 0,016). Dans le groupe constitué d'enfants et nouveaux-nés, nous n'avons pas mis en évidence de corrélation significative entre l'activité TPMT et l'âge (p = 0,127), ce qui indique que l'activité TPMT est déjà mature à la naissance. Dans l'ensemble de la population, 91,9% sont homozygotes sauvages, 7,9% hétérozygotes et 0,2% homozygote muté. La fréquence des allèles mutés est 3,0% pour TPMT*3A, 0,7% pour TPMT*2 et 0,4% pour TPMT* 3C. Pour les valeurs d'activité TPMT proches de l'antimode, il existe un chevauchement entre les sujets homozygotes et hétérozygotes concernant 4,5% de la population. Les conséquences du polymorphisme de la TPMT ont été étudiées chez 54 enfants leucémiques traités par 6-mercaptopurine (6-MP) au cours de la phase de maintenance. 39 (90,7%) génotypes TPMT sont homozygotes *1/*1 et 4 (9,3%) hétérozygotes *1/*3A. L'activité TPMT au diagnostic est 20,4% plus faible que celle de la population d'enfants de référence. Pendant la maintenance, l'activité TPMT est 27,4% plus élevée que pour la population de référence. Nos résultats montrent une corrélation inverse entre l'activité TPMT et les TGNs intraérythrocytaires, métabolites actifs de la 6-MP, responsables, au moins en partie, de l'effet antileucémique. L'enzyme TPMT joue donc un rôle majeur au niveau de la métabolisation de 6-MP et de la réussite du traitement
TPMT genotype and activity were determined in 304 adult blood donors, 147 children and 18 newborns (cord bloods), all Caucasian. TPMT activity ranged from 0. 43 to 30. 38 U/mL PRBC in adults, from 8. 25 to 30. 0 U/mL PRBC in children and from 9. 24 to 22. 79 U/mL PRBC in cord bloods. There was no significant difference between cord bloods and adults (p = 0. 424). But we found a slightly lower TPMT activity in children than in adults (p = 0. 016). In the children and cord bloods group, no significant correlation was evidenced between TPMT and age (p = 0. 127): TPMT is already mature at birth. In the whole population, 91. 9% was homozygous wild-type, 7. 9% heterozygous and 0. 2% homozygous and 0. 2% homozygous mutant. The frequency of mutant allele was 3. 0% for TPMT/*3A, 0. 7% for TPMT*2 and 0. 4% for TPMT*3C. For TPMT activities close to the antimode value, there was an overlap between homozygous and heterozygous subjects concerning 4. 5% of subjects. Consequences of TPMT polymorphism were studied in 54 leukemic children treated with 6-MP during maintenance phase. 39 (90. 7%) TPMT genotypes were homozygous *1/*1 and 4 (9. 3%) heterozygous *1/*3A. Diagnosis TPMT activity is 20. 4% lower than in the reference children population. During maintenance, TPMT activity was 27. 4% higher than the reference population. Our results showed an inverse correlation between TPMT activity and red blood cells TGNs, which are 6-MP active metabolites, responsible, at least in part, for the anti-leukemic effect. TPMT enzyme plays a major role for 6-MP metabolisation and treatment success

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Vayron, de la Moureyre-Spire Catherine. "Polymorphisme génétique de la thiopurine S-méthyltranférase (TPMT)." Lille 2, 2004. http://www.theses.fr/2004LIL2S007.

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Peltier, Didier. "Utilisation de fragments d'ADN polymorphes amplifies au hasard (RAPD) pour la réalisation d'une cartographie génétique de Petunia Hybrida Hort. Et d'une phylogénie du genre Petunia." Dijon, 1993. http://www.theses.fr/1993DIJOS037.

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Abstract:

Une carte génétique ordonnée de P. Hybrida contenant 42 marqueurs a été construite. 35 des marqueurs utilisés sont des fragments d’ADN polymorphes amplifiés au hasard. Le relevé des fragments amplifiés avec 17 amorces oligonucléotidiques de 10 bases et le relevé des fragments homologues révèle après hybridation par les fragments de référence ont été utilisés pour calculer des matrices de distance génétique (distance de Nei, distance deJaccard) entre espèces du genre Petunia et lignées de P. Hybrida. Des réseaux phylogéniques ont été construits en utilisant le principe de parcimonie ou la neighbor joining method. Nous précisons les modalités et limites d'utilisation du polymorphisme RAPD pour établir des phylogénies. Nous analysons la structuration de la variabilité d'origine introgressive chez P. Hybrida

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Di, Nino Fiorant. "Phénoplasticité, polymorphisme génétique, gestion conservatoire du genre Elodea." Thesis, Metz, 2008. http://www.theses.fr/2008METZ036S/document.

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Abstract:

Le Nord-Est de la France comporte deux espèces d élodées invasives : Elodea nuttallii et Elodea canadensis, apparues respectivement aux XIXe et XXe siècles en Europe. La présente recherche a pour but de contribuer à l'amélioration des connaissances sur ces espèces. Tout d'abord, une approche cytologique a permis le dénombrement de 52 chromosomes pour Elodea nuttallii et Elodea canadensis. Cela conduirait à soumettre une nouvelle hypothèse concernant le nombre chromosomique de base du genre. Ensuite, une étude génétique par AFLP en Europe et en Amérique a mis en évidence qu'il existe une forte reproduction clonale au sein des populations européennes. Mais que ces dernières présentent une distance génétique importante avec les populations indigènes. Contre toute attente, nous avons également mis en évidence une forte variabilité génétique au sein des populations d'Elodea nuttallii nouvellement signalées. Par ailleurs, une approche morphométrique a mis en évidence une forte variabilité au sein des populations d'Elodea nuttallii, entre les aires d introduction et les aires d'indigénat, laissant apparaître que les populations nord-américaines sont moins vigoureuses que les populations européennes. Ensuite, la mesure de la plasticité morphologique d'Elodea nuttallii, au sein d une population clonale, a mis en évidence une grande plasticité de l'espèce. Enfin, le suivi de la phénologie d'Elodea nuttallii dans l'Est de la France a permis de mettre en évidence une stratégie de colonisation du milieu efficace
The north-eastern part of France has been invaded by two different Elodea species : Elodea nuttalli and Elodea canadensis, which emerged in Europe respectively during 19th and 20th centuries. This research aims to improve the knowledge about such species. First of all, a cytological approach has enabled us to count 52 chromosomes for the very first Elodea nuttalli and Elodea canadensis that appeared in France and might lead us to propose a new hypothesis regarding the base number of chromosomes. Then, a genetic study by AFLP procedure showed, an important clonal reproduction among European population. And it presents an important genetic distance with the native population, probably linked to an important bottleneck that came into play when the species were introduced. Unexpectedly, the newest Elodea nuttalli in Europe presents a high genetic variability, as a result of recent multiple sources introduction. Furthermore, another study compares the morphological variation of native and introduced populations of Elodea nuttallii in the field. The results show that introduced plants can be very distinct in their growth form and size from conspecifics in the native range. Moreover, we investigated the phenology and the phenotypic variation of genetically uniform populations of Elodea nuttallii. A significant difference in morphological traits appeared among the dates and among the sites. This capacity to respond to environmental quality has been interpreted as an expression of foraging behaviour. Finally, different methods to control the spread have been evaluated, especially manual harvesting

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Khiar-Berrahmoune, Hind. "Les déterminants environnementaux et génétiques de phénotypes intermédiaires de l'inflammation dans la cohorte STANISLAS." Nancy 1, 2006. http://www.theses.fr/2006NAN10229.

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Abstract:

L'inflammation est une voie métabolique clé de la formation, de la progression et de la rupture des plaques athéromateuses. De plus, plusieurs molécules inflammatoires émergent comme marqueurs potentiels de diagnostic ou de pronostic des pathologies cardio-vasculaires. Cependant, leurs variations physiopathologiques étant importantes, elles doivent être mieux définies pour affiner les limites de décision des données pathologiques. Nous avons donc entrepris durant cette thèse l'étude de la variabilité des phénotypes intermédiaires de l'inflammation due à la génétique et aux facteurs constitutionnels et environnementaux (individuels et familiaux), ainsi que par rapport à des facteurs dits classiques du risque cardio-vasculaire. Ces études ont été menées sur différents sous-échantillons de la cohorte STANISLAS, une cohorte familiale d'individus supposés sains. Ainsi, nous avons mis en évidence les facteurs constitutionnels et environnementaux impliqués dans la variabilité inter-individuelle des concentrations plasmatiques en IL-8 et MCP-1 (2 chimiokines) ainsi que EGF et VEGF (2 facteurs de croissance) chez 304 enfants et 540 adultes. De plus, les valeurs de référence pour ces 4 molécules ont été déterminées. Nous avons trouvé que la concentration en hs-CRP, était corrélée avec le nombre de leucocytes et de plaquettes ainsi qu'avec les concentrations en orosomucoïde, haptoglobine, IL-6 et ICAM-1 mais pas avec celles de l'IL-8, l'IL-18, MCP-1, EGF, VEGF, IGF-1, IGFBP-3, TNF-a, TNF-RII et des sélectines E, L et P ; formant ainsi 2 groupes qui pourraient apporter des informations complémentaires concernant le risque cardio-vasculaire. Nous avons montré que l'évolution de la concentration des protéines de phase aiguë sur 5 ans était significativement associée à celle de l'IMC (D IMC £0 Kg/m2, 0< D IMC <1,6 Kg/m2 et D IMC ³1,6 Kg/m2) chez tous les individus de la famille. Les études en génétique ont permis de montrer que (i) les polymorphismes LTA 252A>G et TNF --308G>A sont associés à une augmentation de la concentration plasmatique en MCP-1, et que (ii) le nombre d'allèles e4 du gène APOE était négativement associé à la concentration sérique de la hs-CRP. Par ailleurs, nous avons montré que dans cette même population il existe une ressemblance familiale de la concentration de l'IL-8, MCP-1, EGF, VEGF et la hs-CRP. Les études de décomposition de la variance montrent que (i) les héritabilités générales de l'IL-8 et EGF sont de 16% et 26,9%, respectivement, et seraient totalement expliquées par l'environnement familial, (ii) la génétique expliquerait 60,6% de la variance de la concentration de VEGF et la totalité de son héritabilité générale, et que (iii) les héritabilités générales de la hs-CRP aux 2 points de recrutement sont de 13% et de 11%, respectivement et seraient totalement expliquées par l'environnement familial. Tous ces résultats confirment la complexité de la régulation du processus inflammatoire, mais peuvent déjà servir à mieux interpréter les résultats biologiques des patients et de comprendre la régulation de la concentration de ces molécules inflammatoires à l'état sain.

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Gligorov, Joseph. "Polymorphismes et traitements néoadjuvants des cancers du sein : efficacité du docétaxel et polymorphisme d’ABCB1/MDR1." Paris 6, 2012. http://www.theses.fr/2012PA066082.

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Abstract:

Dans le cancer du sein non métastatique, l’approche néoadjuvante permet d’étudier les paramètres liés à la tumeur et/ou à l’hôte influençant l’efficacité des traitements. Les protéines de la famille MDR et plus particulièrement ABCB1 sont impliqués dans les mécanismes de résistance aux anthracyclines et taxanes. Les corrélations entre efficacité (réponse histologique), polymorphisme d’ABCB1 (patientes et tumeurs) et pharmacocinétique de la doxorubicine et du docétaxel ont été étudiées dans le cadre d’un essai thérapeutique. Dans cette étude, le polymorphisme de l’exon 26 d’ABCB1 (rs1045642) est le seul qui influence la pharmacocinétique du docétaxel et ceci uniquement chez les patientes non ménopausées. Les patientes porteuses du génotype CC (40%) ont une valeur moyenne de l’AUC du docétaxel statistiquement inférieure à celles porteuses des génotypes CT (45%) et TT (15%) (p<0. 0001). Par ailleurs il a été constaté chez les patientes non ménopausées une corrélation statistiquement significative entre des taux d’AUC bas du docétaxel et le diplotype 2677GG-3435CC ainsi que l’haplotype 61AA-1236CC-2677GG-3435CC. Il n’a pas été trouvé de lien entre les différents polymorphismes d’ABCB1 et la pharmacocinétique de la doxorubicine. Il existe par ailleurs une relation négative entre l’AUC du docétaxel et l’obtention d’une réponse complète histologique. Il semble exister donc une valeur minimale d’AUC du docétaxel afin d’obtenir une réponse. Par ailleurs, nous avons retrouvé un lien entre réponse tumorale et le polymorphisme d’ABCB1 (génotype C3435T, TT vs CT et CC)
In non-metastatic breast cancer, neoadjuvant treatment allows to study the parameters influencing their effectiveness, related to the tumor and / or the host. The MDR family proteins, especially ABCB1 are involved in the mechanisms of resistance to anthracyclines and taxanes. The correlations between efficiency (histological response), ABCB1 polymorphism (patients and tumors) and pharmacokinetics of doxorubicin and docetaxel have been studied in the context of a therapeutic trial. In this study, polymorphism in exon 26 of ABCB1 (rs1045642) is the only that influences the pharmacokinetics of docetaxel and this only in premenopausal patients. Patients carrying CC genotype (40%) have an average value of the AUC of docetaxel significantly lower than those carrying genotypes CT (45%) and TT (15%) (p <0. 0001). Moreover it was found in premenopausal patients a statistically significant correlation between low rates of docetaxel AUC and diplotype 2677GG-3435CC and 1236CC haplotype-61AA-2677GG-3435CC. It has not been found a link between ABCB1 polymorphisms and the pharmacokinetics of doxorubicin. There is also a negative relationship between AUC of docetaxel and pathological response. There seems therefore that a minimum value of AUC of docetaxel is necessary to obtain a response. Furthermore, we found an association between tumor response and polymorphism of ABCB1 (C3435T genotype, CT and TT vs. CC)

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Lejeune, Julien. "Génétique et génomique des récepteurs de faible affinité pour le IgG - Implications pour le développement et l'analyse de la variabilité des effets des anticorps thérapeutiques." Thesis, Tours, 2010. http://www.theses.fr/2010TOUR3140/document.

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Abstract:

Les récepteurs Fc jouent un rôle important en permettant aux cellules de l’immunité d’interagir avec lesanticorps, notamment thérapeutiques. Dans cette thèse, nous montrons que des mécanismes de recombinaisonhomologue, de knock-in par insertion rétrovirale et de duplication segmentale ont permis l’acquisition chez lesPrimates (FCGR2A) puis chez les Hominidés (FCGR2C et FCGR3B) de gènes codant des récepteurs Fc ayantde nouvelles propriétés, tout en rendant instable ce cluster (variation de nombre de copies), et très complexeson analyse chez l’Homme. Grâce à une approche originale de pyroséquencage, nous sommes parvenus àétudier simultanément le polymorphisme allélique ORF/STOP du FCGR2C, ainsi que son nombre de copies.Nous avons ainsi révélé de nouveaux déséquilibres de liaison, s’ajoutant au déséquilibre FCGR3A-FCGR2Adont nous avons montré l’importance d’une prise en compte adaptée dans les études d’association avec laréponse aux anticorps thérapeutiques. Ces résultats devraient contribuer à améliorer le développement préclinique(pertinence des modèles animaux) et clinique (variabilité des effets) des anticorps thérapeutiques
Fc receptors play an important allowing connexion between immune cells and antibody notably therapeutic. Inthis thesis, we have shown that homologous recombination events, knock-in by retroviral insertion andsegmental duplication led to the acquisition in primates (FCGR2A) then in Hominids (FCGR2C and FCGR3B)of genes coding for Fc receptors with new properties, led to genomic instability of the cluster (copy numbervariation) and to complex analysis in human. Through a original pyrosequencing approach, we have studiedsimultaneously ORF/STOP polymorphism and copy number variation of FCGR2C. We have also revealed newlinkage disequilibrium, additionnaly to FCGR3A-FCGR2A disequilibrium which we have shown theimportance of a suitable methdology in association studies with responses to therapeutic antibodies. Theseresults contribute to improve pre-clinical (of animal models) and clinical (variability effects) development oftherapeutic antibodies

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Benyamina, Amine. "Dépendance au cannabis : rôle du polymorphisme génétique de l'ABCB1." Paris 6, 2009. http://www.theses.fr/2009PA066345.

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Abstract:

Le cannabis reste la substance illicite la plus consommée dans le monde. Ces 30 dernières années ont vu un intérêt croissant pour les troubles liés à la consommation du cannabis. La pharmacogénétique pourrait jouer un rôle important dans la genèse des dépendances au cannabis. Au niveau de l’organisme, l’ABCB1 (ou la P-glycoprotéine) est responsable de l’efflux d’une grande variété de substrats surtout lipophiles. Non seulement l’efflux protège l’organisme d’un certain nombre de toxines, mais il modifie la cinétique des substances thérapeutiques. Par sa nature lipophile, le delta-9 THC est un substrat potentiel de l’ABCB1. Dans un modèle chez la souris, nous avons démontré que le delta-9 THC est un substrat et que l’ABCB1 pourrait être impliquée dans sa cinétique (PMID : 18331373). Nous avons effectué une étude d’association entre un polymorphisme de l’ABCB1, le C3435T, et la dépendance au cannabis. Dans l’échantillon de 40 patients versus 40 témoins, nous avons montré une association significative entre l’allèle C, génotype CC et la dépendance au cannabis (PMID : 19625010). Notre hypothèse est que l’allèle C est responsable d’une accélération de la cinétique du delta-9 THC et donc, la substance agirait alors comme une substance fortement addictogène chez certains consommateurs. D’autres études sont nécessaires pour étayer cette hypothèse et pour l’étendre à d’autres substances. Cette étude ne peut pas exclure un déséquilibre de liaison avec un autre polymorphisme proche soit au niveau de l’ABCB1 ou de l’ABCB4. D’autres études des blocs haplohaplotypiques devraient affirmer ou infirmer cette implication.

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Allayous, Clara. "Recherche de nouveaux marqueurs de la variabilité d'expression clinique de la drépanocytose : pour la définition de profils de patients." Antilles-Guyane, 2007. http://www.theses.fr/2007AGUY0179.

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Abstract:

La drépanocytose se caractérise par un polymorphisme et une variabilité clinique. Les bases moléculaires et cellulaires de cette variabilité restent inconnues. Aussi, avons-nous souhaité mieux comprendre le mécanisme en cause par la recherche de facteurs discriminants permettant la mise en évidence de profils de patients. Pour cela, l'utilisation des techniques de bio-mathématiques et biostatistiques telles que la classification, les arbres de décision ou l'ANOVA nous ont permis de souligner l'importance de l'adhésion vasculaire ainsi que le role amplificateur de l'inflammation dans ces phénomènes. Ainsi, nos travaux nous ont permis de caractériser comme marqueurs spécifiques de cette variabilité HNE et Lf, deux protéines sécrétées par les neutrophiles et impliquées dans les processus inflammatoires. De plus, nos travaux portant sur le dosage plasmatique de ces deux protéines dans le cadre de différentes complications et les recherches de polymorphismes associés indiquent que ces deux protéines sont impliquées dans l'apparition de complications spécifiques, de par leur concentration plasmatique, mais également leur structure particulière. Les perspectives de ce travail sont nombreuses sur le plan médical notamment, en utilisant des outils d'aide à la décision et au diagnostic à l'origine d'un suivi plus personnalisé des patients. De plus, les résultats obtenus permettront une meilleure vision de la dynamique structurale et fonctionnelle de l'HNE et de la Lf, afin de mieux comprendre leurs rôles physiologiques et les mécanismes associés, d'un point de vue physiopathologique
Sickle cell disease is characterized by a polymorphism and a clinical variability. Molecular and cellular bases of this variability are unknown. We wanted to have a better understanding of the present mechanism by searching for discriminant factors that allowed patients' profiles to be revealed. For that purpose, the use of biomathematical and biostatistical methods such as classification, decision trees or ANOVA helped us lay emphasis on the importance of vascular adhesion, as weil as the amplifying role of inflammation in these phenomena. In this way, our studies have enabled us to characterize as specifie markers of this variability, HNE and Lf, which are two proteins released by neutrophils and involved in inflammatory processes. Moreover, our studies are based on determining plasmatic levels of both proteins in the case of different complications and the research of associated polymorphisms. Owing to their plasmatic levels and particular structures, both HNE and Lf are involved in the occurence of specifie complications. The prospects of this study are numerous in the medical sphere also, by using diagnosis and decision-making tools which are responsible for a more individualized follow-up for sickle cell patients. In addition, the results observed will give a better idea of functional and structural dynamics of HNE and Lf, in order to have a better knowledge of their physiological roles and of the associated mechanisms, from a pathophysiological point of view

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Repoila, Francis. "Etude du polymorphisme génomique chez les bactériophages T-pair." Toulouse 3, 1995. http://www.theses.fr/1995TOU30268.

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Abstract:

Les phages t-pair partagent des caracteristiques morphologiques et serologiques. Nous avons defini des criteres genetiques qui attestent de liens phylogenetiques et avons initie l'etude des variations de sequences de six regions genomiques. Deux types de polymorphisme ont ete identifies. Quatre de ces regions se distinguent par la presence ou l'absence de cadres de lecture ouverts. Les deux autres loci, dits ip, varient par le nombre et la nature des genes (ip) presents. Nous avons decouvert l'existence de dix genes ip differents qui codent pour des proteines (ips) contenues dans les virions. Chaque cadre de lecture ip est flanque d'une sequence d'environ 70bp repetees directement. Ces sequences intergeniques pourraient etre impliquees dans le polymorphisme observe. D'apres les observations concernant ip1, nous pensons que les ips determineraient, en partie, l'etendue du spectre d'hotes. Nous avons egalement recherche des elements genetiques capables de modifier au travers de leur variation, l'etendue du spectre d'hotes des phages t-pair. Nos etudes ont concerne le gene 31 (g31) et le gene 37 (g37). G31 code pour gp31, proteine essentielle qui interagit avec la proteine bacterienne groel. Nous avons montre que gp31 est extremement conservee chez les t-pair. Cette conservation pourrait refleter une contrainte selective vers un consensus fonctionnel optimal face a une diversite du partenaire groel. G37 est responsable de la specificite d'adsorption du phage t4 a la surface de la bacterie. Habituellement t4 se multiplie sur e. Coli et shigella, nous avons selectionne des virions qui infectent yersinia. L'analyse de ces phages a montre qu'il devait exister un mecanisme generateur d'une diversite de la portion des fibres impliquee dans la reconnaissance specifique de la bacterie par le phage

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Sibert, Alexandre. "Héritabilité non génétique de la fécondité : effets sur le polymorphisme." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2002. http://www.theses.fr/2002MNHN0017.

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Abstract:

La transmission de la fécondité d'une génération à la suivante est un phénomène connu. Jusqu'à présent, la génétique des populations a produit un grand nombre de modèles en supposant que le support de cette transmission est génétique. Toutefois, une héritabilité non génétique de la fécondité a été mise en évidence dans certaines populations humaines, mais son effet sur la diversité génétique est encore mal connu. Cette thèse présente une extension échangeable du modèle de Wright-Fisher pour des populations asexuées, qui permet d'intégrer tout mode d'héritabilité de la fécondité pour en étudier les effets. Après en avoir décrit le principe - qui repose sur la notion de probabilité de fécondité des individus - un algorithme est proposé pour simuler la transmission de la fécondité des parents aux enfants, dans une population de taille constante. L'étude des propriétés démographiques et généalogiques de ce modèle montre que les effets de l'héritabilité non génétique de la fécondité sont originaux : ils ne sont réductibles à aucun phénomène modélisé jusqu'ici (sélection, variations de taille, etc. ). De plus, l'étude précise de la diversité génétique confirme ces résultats et montre que paradoxalement, les tests utilisés actuellement pour mettre en évidence un écart au modèle standard ne permettent pas de distinguer l'héritabilité non-génétique de la fécondité de certains types de sélection ou d'expansion démographique. La possibilité de détecter l'héritabilité de la fécondité à partir du polymorphisme génétique observé reste donc une question ouverte
The transmission of fertility from one generation to the next is well documented. Several population genetics models integrate this phenomenon, assuming a genetic basis. Nevertheless, non-genetic inherance of fertility was described in some Human populations, whose subtle effects on genetic diversity are unknown. The present work describes an extension of the Wright-Fisher model for axesual populations, suitable for the simulation of any kind of fertility inherance. The probability of fertility is introduced as a key notion, and an algorithm for the simulation of fertility transmission from parents to their offspring is developed for a constant size population. The demographic and genealogical properties of this model show that the effects of fertility inheritance cannot be compared with any of the various models studied until now (selection, size variations, ect. ). The careful study of genetic diversity confirms these results and paradoxically shows that current neutrality tests do not allow one to distinguish between fertility inheritance and some types of selection or population expansion. Therefore, the detection of fertility inheritance from observed polymorphism data remains an open question

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Barral, Véronique. "Identification, relations phylétiques, processus d'isolement et divergences inter-populations chez les schistosomes : Approche par l'étude de marqueurs génomiques (RAPD)." Perpignan, 1996. http://www.theses.fr/1996PERP0243.

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Abstract:

La problematique de notre travail repose sur trois ensembles de questions touchant a la diversite genetique et aux processus de differenciation spatio-temporelle des schistosomes. Nous avons principalement applique la technique des marqueurs rapd (random amplified polymorphic dna) pour resoudre ces problemes. Le probleme de l'identification des especes de schistosomes et de leurs hybrides semble resolu par la technique. Des marqueurs du sexe ont ete egalement detectes. L'etude des relations de parente entre les especes a montre des resultats coherents avec les hypotheses d'une coevolution des schistosomes avec leur mollusque vecteur et avec les hypotheses de transferts lateraux d'especes de schistosomes des animaux a l'homme. Nous proposons de nouvelles hypotheses sur l'histoire evolutive des especes de schistosomes, notamment les especes africaines et indiennes parasites d'ongules. Il n'existe pas d'isolement de nature pre-zygotique entre les especes voisines s. Mansoni et s. Rodhaini. Cependant, des ecarts a la segregation mendelienne pour certains marqueurs nous permettent de suggerer une distorsion de segregation et la non viabilite genetique des hybrides. L'absence d'isolement reproducteur entre les populations allopatriques s. Mansoni d'amerique et d'afrique permet de valider l'hypothese de l'introduction recente de l'espece au nouveau monde. Une etude de la diversite genetique, effectuee au sein des infrapopulations et des populations naturelles de l'espece s. Mansoni dans un foyer de transmission particulier de l'arriere mangrove guadeloupeenne, montre une tres grande diversite genetique a l'interieur des infrapopulations de rats rattus rattus et une faible differenciation entre les populations locales de parasites. Le rat semble donc responsable d'une grande diversite genetique entre les parasites et de l'homogeneisation des populations locales, du fait de recrutements successifs et diversifies de cercaires genetiquement differentes

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Zaiou, Mohamed. "Apolipoproteine A-IV : part de la génétique et de l'environnement dans sa variabilité physiopathologique." Nancy 1, 1993. http://www.theses.fr/1993NAN12449.

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Prevost, Gaëtan. "L'implication du Récepteur des Produits Avancés de Glycation (RAGE) dans les complications du diabète : approches génétique et pharmacologique." Lille 2, 2006. http://www.theses.fr/2006LIL2S040.

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Abstract:

Les produits avancés de la glycation (AGE) sont impliqués dans les complications micro et macro vasculaires du diabète. Leur toxicité est partiellement médiée par une interaction avec des récepteurs dont le mieux caractérisé est appelé RAGE (Receptor for Advanced Glycation Endproducts). Notre travail évalue l'implication de RAGE dans les complications du diabète tout particulièrement dans la néphropathie diabétique via une approche génétique et dans la dysfonction endothéliale via une approche mécanistique et pharmacologique. Premièrement, nos résultats ont confirmé l'existence de polymorphismes sur l'exon 3 du gène en soulignat l'intérêt de l'utilisation de la technique Denaturant gradient Gel Electrophoresis. Deuxièmement, en dépit d'un déséquilibre de liaison avec certains haplotypes HLA de classe II, nous n'avons pas observé d'association entre le polymorphisme du gène RAGE et la susceptibilité au diabète de type I (DT1). Troisièmement, sur une large étude de type " cas-témoins ", nous rapportons une association entre le variant allélique 82 Sérine et le stade d'insuffisance rénale dans la néphropathie diabétique suggérant que le polymorphisme du gène RAGE pourrait influencer la progression de la néphropathie chez les patients caucasiens DT1. L'implication des AGE et de RAGE dans les anomalies de vasomotricité est peu documentée et fait l'objet de résultats contradictoires. Sur des souris C57Black rendues diabétiques par injection de streptozotocine, nous avons décrit la cinétique de la dysfonction endothéliale par analyse de la vasomotricité aortique en chambre d'organe isolé. Conjointement, nous avons pratiqué des dosages d'AGE sériques (ELISA) et avons évalué l'expression de RAGE (Western Blot) sur des broyats aortiques. La diminution de la vasorelaxation endothélium dépendante observée après 4 semaines de diabète (-24% vs contrôles, p<0,01), est associée à une augmentation significative des AGE sériques et de l'expression de RAGE. Les anomalies fonctionnelles vasculaires liées au diabète sont associées à des anomalies histologiques significatives : augmentation de l'épaisseur intima-média, désorganisation des fibres élastiques, accentuation du collagène de type III, désorganisation du réseau de l'actine lisse. L'utilisation de l'aminoguanidine, puissant inhibiteur des AGE, permet d'une part de prévenir les anomalies de vasomotricité observées chez les souris diabétiques de 4 semaines en réduisant l'expression de RAGE et d'autre part améliore significativement les anomalies histologiques vasculaires. L'ensemble de ces résultats suggère une forte implication de la voie des AGE et de RAGE dans les complications du diabète. L'utilisation de molécules anti AGE ou inhibiteurs de l'interaction AGE-RAGE ouvre des perspectives thérapeutiques intéressantes
Advanced glycation endproducts (AGE) are implicated in diabetic micro- but also macrovascular complications of diabetes mellitus. AGE toxicity is partially mediated via receptor dependant pathway especially via the RAGE (Receptor for Advanced Glycation Endproducts). The RAGE implication in the genetic of diabetic nephropathy and in the endothelial dysfunction has been investigated. First, the polymorphisms of exon 3 has been analysed by Denaturant Gradient Gel Electrophoresis. Although no association of this RAGE gene polymorphisms with type 1 diabetes susceptibility was found, we reported a strong linkage disequilibrium between the variant carrying the serine amino acid at position 82 and HLA class II genes. Finally, in a case control study, we reported an association between the 82 serine variant and advanced nephropathy in type I diabetic patients. This suggests that some RAGE gene polymorphisms may be associated with progression to diabetic advanced nephropathy in Caucasian type 1 diabetic patients. Thus, AGE have been implicated in diabetic endothelial dysfunction as vascular hyperpermeability and procoagulant and inflammatory states. However, the link between AGE and the endothelium dependent vasorelaxation impairment is still controversial. Vascular relaxation response to acetylcholine was tested in isolated segments of phenylephrine precontracted mice aorta at several stages of streptozotocin-induced diabetes. Blood levels of AGE (ELISA) and aortic tissue RAGE expression (Western Blot) were simultaneously quantified. Compared to control mice, significant impairment of endothelium dependant relaxation occurred four weeks after diabetes induction (-24% vs control, P<0,01) and was more severe eight weeks later. Simultaneously, blood AGE concentrations and RAGE aortic expression were significantly increased. Moreover, vasorelaxation impairment was associated with induced diabetic structural changes in the wall of aorta : intima-media thickening, disorganization of elastin lamina and actin network, increased amount and disorganization of the type III collagen. Four weeks after diabetes induction, aminoguanidine, AGE inhibitor, completely prevented the diabetes-induced decrease of relaxation to acetylcholine by decreasing AGE blood levels and RAGE expression. Moreover, aminoguanidine treatment significantly improves the induced diabetic structural changes. In conclusion, our work is in favour of a strong implication of the AGE pathway both in diabetic complications as nephropathy and vasorelaxation impairment. The use of anti AGE or AGE-RAGE inhibitors could be attractive therapeutics

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Mangin, Irène. "Typage moléculaire de souches du genre bifidobacterium : polymorphisme génétique intraspécifique et intragénérique." Nancy 1, 1994. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/SCD_T_1994_0123_MANGIN.pdf.

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Abstract:

L'identification des espèces ou des souches bactriennes repose sur la mise en évidence du polymorphisme génétique interspécifique et intra générique. Le but de ce travail a donc été de rechercher diverses méthodes de révélation du polymorphisme génétique, applicables au genre bifidobacterium. La réalisation de profils de restriction a d'abord permis une caractérisation des différentes souches du laboratoire, comprenant des souches de collection, des souches industrielles ainsi que des souches d'origine humaine provenant d'une expérience clinique. Cette première méthode révèle un polymorphisme de la taille des fragments de restriction aussi bien interspécifique qu'intra spécifique chez ce genre bactérien. Par ailleurs, une comparaison plus rapide des souches a été réalisée en utilisant une sonde nucléique spécifique des gènes d'ARN ribosomiques. Les profils obtenus ont notamment permis de caractériser toutes les souches de bifidobacterium et de procéder à des regroupements en espèces. Nous rapportons également l'identification de quatre espèces de bifidobacterium par la sélection de sondes nucléiques spécifiques d'espèces, isolées des mini-banques d'ADN des souches b. Adolescentis cip64. 59t, b. Animalis atcc25527#t, b. Bifidum cip64. 65 et b. Longum atcc15707#t. La spécificité d'espèce de ces fragments a été testée par hybridation sur les ADN natifs des souches du genre. Le polymorphisme de restriction existant entre les différentes souches de la même espèce a ensuite été visualisé par hybridation du fragment cloné sur les profils de restriction de l'ADN total. Ainsi, la sonde l6/45, spécifique de 13 des 15 souches classées dans l'espèce b. Longum uniquement, est répétée chez certaines de ces souches. Le séquençage de ce fragment a mis en évidence une partie d'orf. La séquence protéique déduite de cette orf présente des similarités significatives avec une classe de recombinases site-spécifiques représentées par la protéine Int du bactériophage lambda.

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Carteau, Isabelle. "Recherche de gènes de susceptibilité dans le syndrome autistique." Tours, 2005. http://www.theses.fr/2005TOUR3304.

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Abstract:

L'autisme est un syndrome neurodéveloppemental avec une importante prédisposition génétique. Cinq gènes candidats situés sur des régions liées à l'autisme sur les chromosomes 2, 7, 16, 17 et X ont été étudiés par des études d'association, puis par des études de transmission intra-familiale (TDT). Le gène OMGP (17q11. 2) code une protéine impliquée dans la voie de signalisation Ras. Nous avons observé une association significative entre l'allèle A du polymorphisme codant G62A et un sous-groupe de patients autistes. Le TDT effectué sur 455 familles montre une transmission de l'allèle G des parents aux enfants atteints. L'expression des formes avec et sans le domaine C-terminal d'OMGP dans des cultures de cellules souches neurales de rat n'a pas montré de succès. Le gène UBE2H (7q32) code une enzyme du système de dégradation ubiquitine-protéasome. L'allèle G du polymorphisme silencieux A336G présente une fréquence plus élevée dans un sous-groupe de patients autistes que dans un groupe témoin. Le TDT montre une tendance à la transmission préférentiellle de l'allèle A dans la population italienne. Ce polymorphisme semble être impliquée dans le mécanisme d'épissage. Les gènes UBE2E3, UBE2I et UBE2A codent des enzymes de conjugaison à l'ubiquitine. La recherche de mutations de ces trois gènes indique la présence de polymorphismes dans un groupe de patients autistes. Le criblage de mutations de tous les gènes étudiés est concordant avec la théorie polygénique de l'autisme. Nous soulignons l'importance de la maturation post natale et de la voie de l'ubiquitine dont le rôle dans le développement du système nerveux central reste à élucider
Autism is a neurodevelopmental disorder with a strong genetic component. Five candidate genes, located on regions linked to autism on chromosomes 2, 7, 16, 17 and X, have been studied by association studies and transmission disequilibrium test (TDT). OMGP gene (17q11. 2) encodes a glycoprotein involved in the Ras signalisation pathway. We found a significant association between the A allele of the coding polymorphism G62A and a subgroup of autistic patients. The TDT on 455 families schowed a preferential transmission of the G alle le from parents to affected children. The expression of two forms of OMGP (with and without C-terminal domain) in rat neural stem cells didn't succeed. UBE2H gene (7q32) encodes an enzyme involved in the ubiquitin-dependant degradation pathway. We observed an increased frequency of the G allele of the silent polymorphism A336G in an autistic subgroup compared to a control population. Using TDT, we schowed a trend of preferential transmission of the A allele from italian parents to affected sibs. This polymorphism seems to be involved in ARNm splicing. UBE2E3, UBE2EI and UBE2A genes encode ubiquitin-conjugating enzymes. Mutation screening in those three genes dHPLC technique revealed polymorphisms in a group of autistic patients. Screening those five genes is in agreement with a polygenic model of autism. We underlined the importance of the post-natal maturation period and we focused on the ubiquitination pathway, which rule in the central nervous system development needs to be clarified

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Khiar-Berrahmoune, Hind. "Les déterminants environnementaux et génétiques de phénotypes intermédiaires de l'inflammation dans la cohorte STANISLAS." Nancy 1, 2006. http://www.theses.fr/2006NAN12505.

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Abstract:

L'inflammation est une voie métabolique clé de la formation, de la progression et de la rupture des plaques athéromateuses. De plus, plusieurs molécules inflammatoires émergent comme marqueurs potentiels de diagnostic ou de pronostic des pathologies cardio-vasculaires. Cependant, leurs variations physiopathologiques étant importantes, elles doivent être mieux définies pour affiner les limites de décision des données pathologiques. Nous avons donc entrepris durant cette thèse l'étude de la variabilité des phénotypes intermédiaires de l'inflammation due à la génétique et aux facteurs constitutionnels et environnementaux (individuels et familiaux), ainsi que par rapport à des facteurs dits classiques du risque cardio-vasculaire. Ces études ont été menées sur différents sous-échantillons de la cohorte STANISLAS, une cohorte familiale d'individus supposés sains. Ainsi, nous avons mis en évidence les facteurs constitutionnels et environnementaux impliqués dans la variabilité inter-individuelle des concentrations plasmatiques en IL-8 et MCP-1 (2 chimiokines) ainsi que EGF et VEGF (2 facteurs de croissance) chez 304 enfants et 540 adultes. De plus, les valeurs de référence pour ces 4 molécules ont été déterminées. Nous avons trouvé que la concentration en hs-CRP, était corrélée avec le nombre de leucocytes et de plaquettes ainsi qu'avec les concentrations en orosomucoïde, haptoglobine, IL-6 et ICAM-1 mais pas avec celles de l'IL-8, l'IL-18, MCP-1, EGF, VEGF, IGF-1, IGFBP-3, TNF-a, TNF-RII et des sélectines E, L et P ; formant ainsi 2 groupes qui pourraient apporter des informations complémentaires concernant le risque cardio-vasculaire. Nous avons montré que l'évolution de la concentration des protéines de phase aiguë sur 5 ans était significativement associée à celle de l'IMC (D IMC £0 Kg/m2, 0< D IMC <1,6 Kg/m2 et D IMC ³1,6 Kg/m2) chez tous les individus de la famille. Les études en génétique ont permis de montrer que (i) les polymorphismes LTA 252A>G et TNF --308G>A sont associés à une augmentation de la concentration plasmatique en MCP-1, et que (ii) le nombre d'allèles e4 du gène APOE était négativement associé à la concentration sérique de la hs-CRP. Par ailleurs, nous avons montré que dans cette même population il existe une ressemblance familiale de la concentration de l'IL-8, MCP-1, EGF, VEGF et la hs-CRP. Les études de décomposition de la variance montrent que (i) les héritabilités générales de l'IL-8 et EGF sont de 16% et 26,9%, respectivement, et seraient totalement expliquées par l'environnement familial, (ii) la génétique expliquerait 60,6% de la variance de la concentration de VEGF et la totalité de son héritabilité générale, et que (iii) les héritabilités générales de la hs-CRP aux 2 points de recrutement sont de 13% et de 11%, respectivement et seraient totalement expliquées par l'environnement familial. Tous ces résultats confirment la complexité de la régulation du processus inflammatoire, mais peuvent déjà servir à mieux interpréter les résultats biologiques des patients et de comprendre la régulation de la concentration de ces molécules inflammatoires à l'état sain.

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Mazalrey, Simon. "Facteurs de pathogenèse au cours des infections à virus BK : polymorphisme génétique viral et réponse immunitaire antivirale." Thesis, Nantes, 2016. http://www.theses.fr/2016NANT1007/document.

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Abstract:

Le polyomavirus BK (ou BKPyV) est un virus ubiquitaire qui infecte plus de 80% de la population adulte. Asymptomatique chez le sujet immunocompétent, il peut être la cause de cystites hémorragiques chez les greffés de cellules souches hématopoïétiques ou de néphropathies interstitielles après transplantation rénale. Parmi les facteurs de risques impliqués dans le développement des néphropathies à BKPyV, nous nous sommes intéressés à l’étude de la variabilité de la région régulatrice non codante (NCCR) du génome viral et à la réponse immunitaire cellulaire spécifique anti- BKPyV en post-greffe. La région NCCR du BKPyV est caractérisée par l’apparition de réarrangements (rrNCCR) chez certains patients présentant une virémie intense et prolongée. Ces réarrangements sont également observés in vitro au cours de la multiplication virale sur cellules permissives. Dans le but de caractériser les rrNCCR et d’étudier leur impact sur la réplication virale, nous avons étudié l’émergence de ces réarrangements in vitro et in vivo sur des échantillons cliniques d’une cohorte de transplantés du rein du CHU de Nantes. Par ailleurs, nous avons étudié la réponse spécifique anti-BKPyV dans les premiers mois postgreffe dans une cohorte prospective de patients adultes transplantés de rein. Nos résultats montrent une augmentation du taux des anticorps au cours de l’infection, et l’absence de valeur prédictive de la réponse médiée par les lymphocytes T sur la survenue d’une infection active à BKPyV. L’ensemble de ces résultats contribue à une meilleure compréhension des mécanismes en jeu au cours des infections à BKPyV en transplantation rénale
The BK polyomavirus is ubiquitous and infects the majority of the adult population. It is not associated with any specific disease in immunocompetent individuals, but can be responsible for hemorrhagic cystitis after stem cell transplantation or interstitial nephropathy after kidney transplantation. Among the different risk factors involved in the development of such opportunistic diseases, we focused on the genetic polymorphism of the non coding control region of the viral genome (NCCR) and on the specific immune responses directed against BKPyV after kidney transplantation. The NCCR region is characterized by the emergence of rearrangements in vitro on permissive cells, and in vivo in case of prolonged infection and high viral loads. We described the emergence of such rearranged strains in vitro, correlated them with increased viral replication and transcription, and compared these sequences with clinical strains obtained from kidney transplanted patients. Our second objective was to study the specific immune responses in the first months following kidney transplantation. We showed that the active infection was associated with an increase in the anti-BKPyV IgG levels, and that the detection of a CD4+ or CD8+ mediated response was not predictive of a protection toward viral reactivation. Our results contribute to a better understanding of the different factors involved in the pathogenesis of BKPyV infections

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Triques, Karine. "Diversité génétique du VIH-1 : impact sur le diagnostic moléculaire et la variabilité génétique intra-patient." Montpellier 2, 1999. http://www.theses.fr/1999MON20129.

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Abstract:

Le vih-1, caracterise par une importante diversite genetique, est subdivise en trois groupes m, n et o. Le groupe m, qui regroupe les principaux virus responsables de l'epidemie mondiale du sida, est compose de dix sous-types genetiquement differents (a a j), avec une repartition geographique tres heterogene, et une diversification considerable en afrique. L'analyse de plusieurs souches africaines, preliminairement classees dans le sous-type f, a revele une tres grande divergence au sein du sous-type f, caracterise dorenavant par deux sous-groupes f1 et f2. Cette etude a egalement permis de caracteriser un nouveau sous-type : le sous-type k (triques et al. , 1999a ; 1999b). Les consequences de la diversite genetique sur le diagnostic moleculaire et sur la progression de la maladie ont ete abordees. La diversite genetique du vih-1 diminue l'efficacite de certains tests de detection et de quantification de l'arn viral plasmatique de plusieurs souches, notamment les souches de sous-types a. La performance d'un nouveau test (version 1. 5 du test amplicor hiv-1 monitor) a ete verifiee sur plusieurs souches de sous-types a a g. Cette etude a permis de confirmer l'efficacite maximale de ce test (triques et al. , 1999c). Le sous-type genetique, soupconne egalement d'influencer la transmissibilite et la pathogenicite du virus, pourrait agir sur l'heterogeneite de la population virale au sein de l'individu infecte. Dans le cadre d'un suivi de cohorte de patients infectes par differents sous-types, aucune correlation n'a ete obtenue entre l'appartenance du virus a un sous-type et sa variabilite intra-patient, par contre une correlation entre le phenotype si des souches vih-1 et l'augmentation de l'heterogeneite de la population virale intra-patient a ete observee. Triques k et al. 1999a. Virology. 20 ; 259(1) : 99-109. Triques k et al. 1999b. Aids res. Hum. Retroviruses. Sous presse. Triques k et al. 1999c. J. Clin. Microbiol. 37(1) : 110-116.

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Plesník, Jiri. "Polymorphismes génétiques et perception gustative des lipides alimentaires chez les sujets obèses." Thesis, Bourgogne Franche-Comté, 2017. http://www.theses.fr/2017UBFCI004/document.

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Abstract:

L'obésité est devenue l'un des problèmes de santé publique les plus importants de ce siècle. Un certain nombre de facteurs génétiques et environnementaux contribuent au développement de cette pathologie. L'apport alimentaire quotidien est également l'un des facteurs cruciaux. Une consommation excessive de graisse alimentaire a été jugée essentielle dans le développement de l'obésité. Au cours des deux dernières décennies, plusieurs études ont montré que la détection de graisse orale joue un rôle important dans le développement de l'obésité. Pour prouver une relation entre l'obésité, la détection de graisse orale et les polymorphismes génétiques, nous avons recruté des enfants, des adolescents et des sujets adultes de trois populations différentes. À ce jour, le gène CD36 code le récepteur du goût gras le plus prometteur. De plus, nous avons étudié une relation possible entre le goût gras et le goût amer. Les résultats globaux montrent que les goûts amers et gras sont modifiés chez les personnes obèses. De plus, les polymorphismes CD36 ont une influence significative à la fois, la détection orale et l'obésité. Nos résultats pourraient aider à mieux comprendre une relation entre l'obésité, le goût et les polymorphismes génétiques
Obesity has become one of most important public health issue in this century. A number of genetic and environmental factors contribute to development of this pathology. Daily dietary intake is also one of the crucial factors. Excessive dietary fat intake has been shown to be critical in the development of obesity. In the last two decades, several studies have shown that oral fat sensing plays an important role in the development of obesity. To prove a relationship between obesity, oral fat sensing and genetic polymorphisms, we recruited children, adolescents and adult subjects from three different populations. To date, CD36 gene encodes the most promising fat taste receptor. Furthermore, we studied a possible relationship between fat taste and bitter taste. Overall results show that bitter and fat tastes are altered in obese individuals. Moreover, CD36 polymorphisms have a significant influence in both, oral sensing and obesity. Our results might help better understand a relationship between obesity, taste and genetic polymorphisms

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Antoniou, Eric. "Etude du polymorphisme génétique chez les bovins : application à la recherche de marqueurs de sexe et de race." Limoges, 1993. http://www.theses.fr/1993LIMO0245.

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Abstract:

Notre objectif etait l'isolement de sequences d'a. D. N. Specifiques du chromosome y bovin ou caracteristiques de certaines races bovines. Ce sont les techniques des empreintes genetiques et de l'amplification au hasard de fragments d'a. D. N. Polymorphes (random amplified polymorphic d. N. A. Ou r. A. P. D. ) qui ont ete choisies afin d'analyser cette variabilite genetique. Quatre fragments d'a. D. N. Specifiques du y sont identifies et deux ont ete clones et caracterises. Cinq fragments sont eux caracterises par leurs frequences alleliques nettement plus elevees dans la race charolaise que dans la race limousine

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Lasne, Yves. "Contribution à la mise en évidence et à l'interprétation de la microhétérogénéité des protéines." Lyon 1, 1988. http://www.theses.fr/1988LYO10024.

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Colmin, Catherine. "Polymorphisme génétique et typage moléculaire chez la bactérie streptococcus salivarius subsp. Thermophilus." Nancy 1, 1991. http://www.theses.fr/1991NAN10135.

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Abstract:

La réalisation de profils de restriction de l'ADN a permis de mettre en évidence l'existence d'un polymorphisme génomique intraspécifique chez streptococcus salivarius subsp. Thermophilus. A partir de l'ADN de la couche nst7, un fragment de 4,2 kb appelé i21 a été cloné dans le plasmide pbr322. Utilisé comme sonde sur des profils de restriction NDEII et HAEIII des ADN des 28 souches, ce fragment permet de révéler le polymorphisme génomique. Sur la base de ces résultats, il est possible de classer ces souches en 10 groupes dont 5 ne comprennent qu'une seule souche. La nature polymorphe du locus i21 a été mise en évidence : le génome de toutes les souches examinées ne contient pas la totalité de ce fragment. Des hybridations ont été réalisées en utilisant séparément comme sonde trois parties de ce fragment. Ces expériences ont permis de montrer que pour les 8 souches examinées, il existe au moins 7 situations différentes caractérisées chacune par une structure particulière de cette région du génome. Un deuxième fragment d'ADN qui semble affecté par le même type de phénomène a été mis en évidence. D'autre part, la partie c du fragment i21 contient une séquence de taille inferieure ou égale a 1 kb qui est répétée dans les génomes de toutes les souches de s. Salivarius subsp. Thermophilus examinées. Le degré de spécificité de la sonde pnst21 a été testé par hybridation sur les ADN de 34 souches appartenant à 19 espèces différentes de s. Salivarius subsp. Thermophilus et cette sonde s'est révélée être spécifique de l'espèce s. Salivarius. La sonde pnst21 a été hybridée sur les ADN de 107 souches de s. Salivarius subsp. Thermophilus appartenant a la collection du CNRZ. Des ribotypes des souches de la collection du laboratoire ont également été réalisés. Ils permettent de caractériser de manière unique un plus grand nombre de souches. Enfin, une estimation du pourcentage de divergence nucléotidique existant entre les régions ribosomiques des génomes de ces souches a été réalisée

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Chevalier, Dany. "Mise en évidence et caractérisation du polymorphisme génétique de la thromboxane synthase (CYP5A1) et de la prostacycline synthase (CYP8A1)." Lille 2, 2001. http://www.theses.fr/2001LIL2P009.

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Chapuis, Julien. "Identification de déterminants génétiques impliqués dans la composante vasculaire de la Maladie d'Alzheimer, par analyses transcriptomiques, génétiques et moléculaires." Lille 2, 2008. http://www.theses.fr/2008LIL2S013.

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Abstract:

La maladie d'Alzheimer (MA) est une maladie dégénérative du cerveau qui provoque la démence, avec une perte graduelle de mémoire, du jugement, et des fonctions cognitives. Cette maladie apparaît généralement chez les personnes âgées de plus de 65 ans, mais certaines formes moins fréquentes peuvent apparaître plus précocement. Les bases génétiques et moléculaires de la MA sont encore mal connues. L'hérédité des formes à début précoce est liée à des mutations dans trois gènes différents: le gène du précurseur de la protéine amyloïde (APP) sur le chromosome 21, le gène de la préséniline 1 (PS1) sur le chromosome 14 et le gène de la préséniline 2 (PS2) sur le chromosome 1. Cependant, ces mutations expliquent moins de 1% des cas de MA. Dans la grande majorité des cas, la génétique apparaît beaucoup plus complexe car résultant de l'interaction entre des facteurs environnementaux et divers gènes de susceptibilité. Malgré le consensus sur l'importance de la composante génétique de la MA, seul l'allèle ε4 du gène de l'apolipoprotéine E (APOE) a été retrouvé comme un facteur constant de vulnérabilité. Toutefois, plus de 200 gènes ont déjà été proposés comme déterminants génétiques de la MA, mais aucun consensus n'a pu être obtenu pour l'un d'entre eux en raison du manque de robustesse des associations observées au sein de populations indépendantes. Tout d'abord, nous avons cherché à reproduire l'association entre la MA et des polymorphismes localisés dans 3 gènes candidats (VEGF, PON1 et GAB2). Deuxièmement, afin la sélection de nouveaux gènes candidats, nous avons combiné les informations issues de carte génétique avec le profil d'expression de gènes. Cette stratégie résulte de deux grandes observations: (i) l'expression de nombreux gènes est modifiée au cours de l'étiologie de la MA, (ii) les polymorphismes dans les promoteurs de l'APOE, PS1, PS2 et APP gènes ont été associés à l'apparition de la MA. Par conséquent, nous avons supposé que les gènes situés dans les régions chromosomiques définies par des études de liaisons génétiques et présentant une expression différentielle entre des patients et des témoins, pourraient constituer des gènes candidats implique dans la MA. Nous avons effectué l'analyse transcriptomique de 2741 gènes situés dans les régions chromosomiques d'intérêt définies dans le cadre de la MA. Les niveaux de l'expression génique ont été évalués à partir d'ARN totaux provenant de tissus cérébraux post-mortem de malades et de témoins. Cent six gènes ont été retrouvés différentiellement exprimés. Ensuite, nous avons évalué, au sein de ces gènes, l'impact de polymorphismes sur le risque de développer la MA. Le polymorphisme le plus intéressant, situé sur le gène IL33, a été associé à la MA dans 3 populations cas-témoins indépendantes. En outre, nous avons pu montrer une implication de ce gène dans un processus physiopathologie touchant le réseau vasculaire cérébral au cours de la MA. De façon intéressante, IL33 est préférentiellement exprimé dans les cellules vasculaires. En effet, un nombre croissant de données suggèrent un rôle central des facteurs de risque cardiovasculaire, de la modification des parois artérielles, amenant à une hypoperfusion chronique du cerveau et au développement de la physiopathologie de la maladie. Ces données sont basées sur des études épidémiologiques, physiopathologiques, de neuro-imagerie, de neuropathologiques et d'études pharmacologiques. Toutes ces observations indiquent qu' une altération du réseau vasculaire pourrait être un facteur important dans le processus conduisant à la neurodégénérescence chronique dans la MAbz

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Garcia, Guerreiro Maria del pilar. "Polymorphisme d'insertion de différents éléments transposables dans une population naturelle de D. Melanogaster." Lyon 1, 1994. http://www.theses.fr/1994LYO10303.

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Le but de cette these est d'etudier le polymorphisme d'insertion de trois elements transposables: copia, mdg3 et gypsy dans une population naturelle de drosophila melanogaster. Les differentes methodes de croisement ont ete testees et les criteres de choix explicites. Nos analyses ont montre que la distribution des elements transposables sur l'ensemble des sites ne suit pas une distribution de poisson. Ces resultats suggerent que la distribution de chaque element sur chaque bras est liee a la sequence du site cible, l'accessibilite des differentes regions de l'adn a l'insertion d'un element mobile, ou bien aux caracteristiques de l'element telles que le taux de transposition. Les valeurs du taux d'heterozygotie observe pour tous les elements, excepte mdg3, revelent une deviation par rapport aux valeurs attendues a partir des frequences d'insertion par site, ce qui suggere l'existence d'un certain taux de consanguinite dans la population. La non deviation observee pour mdg3, peut etre le reflet d'un fort taux de cet element peu avant l'experience dans la population naturelle. Differents modeles de biologie des populations des elements mobiles ont ete testes. L'element copia suit un modele de selection contre les effets deleteres des insertions, mdg3 un modele neutre avec un equilibre entre taux de transposition et taux d'excision

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Tournel, Gilles. "Analyse du profil d'expression des gènes impliqués dans le métabolisme et le transport des xénobiotiques dans les tissus broncho-pulmonaires humains : identification d'un polymorphisme génétique du cytochrome P450CYP2F1." Lille 2, 2006. http://www.theses.fr/2006LIL2S049.

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Abstract:

Afin d'analyser l'expression de protéines impliquées dans le métabolisme ou le transport des xénobiotiques dans les tissus broncho-pulmonaires sains et tumoraux, nous avons confronté deux approches méthodologiques d'analyse de l'expression des gènes à haut débit, l'un faisant appel à la technologie des biopuces à oligonucléotides (oligomicroarrays), l'autre basée sur le principe de la RT-PCR quantitative en temsp réel (TaqManTM Low Density Arrays). La comparaison des données obtenues par ces deux techniques a révélé des discordances importantes, posant certaines interrogations sur la qualité des données générées par les microarrays. A l'aide des TaqManTM Low Density Arrays, nous avons pu établir le profil d'expression précis d'une centaine de gènes d'EMX de phase I, de phase II et de transporteurs cellulaires dans les tissus broncho-pulmonaires humains sains (muqueuse bronchique et parenchyme pulmonaire) et tumoraux (de type adénocarcinome et de type épidermoïde). Ce travail a permis également de montrer l'existence de variations d'expression intertissulaire relativement importantes, à la fois entre les tissus sains et entre les tissus sains et les tissus tumoraux correspondants, apportant des informations essentielles sur la capacité métabolique de chacun des tissus broncho-pulmonaires et sur leur susceptibilité aux composés chimiques inhalés ainsi qu'aux pathologies liées à l'environnement. Comme certains EMX et transporteurs exprimés dans le poumon sont également impliqués dans le métabolisme de médicaments et en particulier d'agents anticancéreux ; la caractérisation de ces protéines dans les différents tissus tumoraux fournit des renseignements non négligeables pour expliquer les phénomènes de chimiorésistance rencontrés fréquemment dans le cadre du traitement des cancers du poumon. Bien que ces données ouvrent des perspectives intéressantes, des investigations supplémentaires, réalisées sur un plus grand nombre d'échantillons sont indispensables pour affirmer ou infirmer les tendances que nous avons observées sur les quelques patients testés. Des variations interindividuelles d'expression ont également été mises en évidence par les TaqManTM Low Density Arrays pour certains gènes exprimés dans le poumon humain, et en particulier pour celui du cytochrome P450 CYP2F1. L'analyse des séquences promotrice et codante de ce gène a confirmé l'existence d'un polymorphisme génétique fonctionnel relativement fréquent dans la population caucasienne. Ce polymorphisme génétique est soumis à d'importantes variations interethniques puisque sa fréquence est doublée dans les populations noires africaines. Comme le CYP2F1 est exprimé de façon quasi-exclusive dans le poumon et qu'il participe à la bioactivation de plusieurs composés carcinogènes pneumotoxiques, nous avons comparé la distribution des mutations affectant son gène entre des populations de patients atteints de cancer du poumon et de sujets contrôles. Les données statistiques obtenues n'apportent, à ce jour, aucun élément en faveur d'une influence du polymorphisme génétique CYP2F1 sur le risque de développer un cancer broncho-pulmonaire. Une étude épidémiologique à plus grande échelle semble nécessaire afin d'aboutir à dezs conclusions définitives statistiquement significatives.

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Audibert, Céline. "Polymorphisme des régions génomiques liées à la virulence chez Helicobacter pylori." Poitiers, 2000. http://www.theses.fr/2000POIT1805.

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Bouvagnet, Patrice. "Polymorphisme de la myosine et étude de la régulation de sa transcription." Montpellier 2, 1989. http://www.theses.fr/1989MON20112.

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Abstract:

Avec des anticorps monoclonaux specifiques de la chaine lourde de myosine cardiaque humaine, nous avons mis en evidence 3 isoformes: alpha, beta et beta. Nous avons localise les epitopes de ces anticorps par western blot et microscopie electronique et montre la presence de regions specifiques et non-specifiques s'isoforme ainsi que l'existence d'heterodimeres. Nous etudions la distribution de ces isoformes dans l'oreillette et le ventricule de curs humains normaux, hypertrophies et au cours du developpement. Certains de ces anticorps detectent des fragments de myosine chez des patients souffrant d'infarctus du myocarde. La cinetique de la liberation de ces fragments est decrite. Pour determiner les sequences qui sont impliquees dans la regulation de la transcription du gene squelettique embryonnaire de chaine lourde de myosine de rat, nous avons construit une serie de plasmides minigenes et avec le gene cat. Des elements 5 multiples (positifs et negatifs) et un element specifique du tissu controlent l'expression specifique de tissu de ce gene

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Cheyssac, Claire. "Etude de deux gènes candidats du DT2 : EIF4A2 : candidat positionnel au locus 3Q27 et PTPN1/PTP1B : cible pharmacologique dans la sensibilité à l'insuline." Lille 2, 2006. http://www.theses.fr/2006LIL2S009.

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Abstract:

Le diabète de type 2 (DT2) représente la forme la plus commune de diabète touchant plus de 170 millions de personnes dans le monde. Les mécanismes physiopathologiques à l'origine de l'hyperglycémie chronique associent des défauts de sécrétion de l'insuline et de son action sur des organes cibles déterminés par des interactions entre des facteurs de risuqe génétiques et environnementaux. Plusieurs gènes responsables de formes monogéniques de diabète ont été identifiés; toutefois, les déterminants génétiques influençant la prédisposition aux formes communes du DT2 sont encore peu connus. Afin d'identifier de nouveaux variants de susceptibilité, nous avons utilisé deux types d'approches: - une analyse d'association familiale de variants de gènes candidats positionnels au locus 3q27 au sein de familles présentant une liaison génétique avec le DT2 apparaissant avant 45 ans; - et l'exploration d'un gène candidat physiologique , PTPN1, par une étude cas-contrôlés dans plusieurs cohortes de sujets diabétiques et obèses. L'étude du locus 3q27 dans les 148 familles françaises à forte agrégation de DT2 (432 sujets diabétiques et 129 sujets normoglycémiques) a permis de confirmer la liaison génétique ave cl'âge d'apparition du diabète. Deux gènes ont été explorés: KNG1 codant pour kininogène, le précurseur de la bradykinine, et EIF4A2, un facteur d'initiation de la synthèse protéique négativement régulé par le glucose dans des cellules -pancréatiques de rat (INS832/13). Un variant (SNP rs266714 C/T), localisé en amont du gène EIF4A2, a montré une association au DT2 et à l'âge de survenue du diabète au sein des familles. Les paires d'atteints porteuses d'au moins un allèle T à risque montrent un lod-score de 5. 24 pouvant expliquer la liaison au DT2. De plus, ce variant explique en partie la liaison génétique avec l'âge de survenue du diabète. Le SNP rs266714 pourrait modifier le niveau d'expression du facteur EIF4A2 qui module la traduction de certains ARN messagers ainsi que le taux de synthèse protéique notamment dans les cellules -pancréatiques. Le gène PTPN1 code pour la protéine tyrosine phosphatase 1B, régulateur négatif des voies de signalisation de l'insuline et de la leptine. Une association au DT2 et à l'obésité modérée est observée pour un variant au locus du gène PTPN1. Chez 736 sujets normoglycémiques non obèses, 2 SNP introniques sont associés à des variations de traits quantitatifs du métabolisme glucido-lipidique : augmentation du HOMA-B et des triglycérides, diminution du HDL-cholestérol suggérant un rôle possible dans la survenue du syndrome métabolique. Ce type d'approche génétique permet d'améliorer nos connaissances des voies de signalisation pouvant être impliquées dans le développement du DT2 et de proposer de nouvelles cibles thérapeutiques
Type 2 diabetes (T2D) is the most common form of diabetes affecting more than 170 million people worldwide. The T2D pathophysiological mechanisms are characterized by defects of insulin secretion and insulin action leading to chronic hyperglycaemia determined by interactions between genetic and environmental risk factors. Although many genes responsible for monogenic forms of diabetes were identified, genetic determinants influencing T2D predisposition are still largely unknown. To identify new susceptibility variants, we used two approaches : - a familial association study of positional candidate gene variants at the 3q27 locus in falilies showing linkage to T2D with onset before 45 years ; and the exploration of a physiological candidate gene, PTPN1, through case-control analyses in different groups of subjects with type 2 diabetes or obesity. The analysis of the 3q27 locus in French families with strong T2D aggregation (432 diabetes subjects and 129 normoglycaemic subjects) confirmed of a genetic linkage with T2D age-of-onset. Two genes were investigated : KNG1, coding for kininogen, the bradykinin precursor, and EIF4A2 coding for the Eukaryotic Translation Initiation Factor 4 alpha 2, a translation initiation factor involved in protein synthesis which is down-regulated by glucose in rat pancreatic beta cells (INS832/13). A variant (rs266714), located upstream of the EIF4A2 gene showed association with T2D and T2D age-of-onset in the families. Affected sib-pairs sharing at least one at risk T allele showed a LOD-score of 5. 24 which could explain the T2D linkage. Moreover, this variant partly explains the age-of-onset linkage. The rs266714 SNP could modify the expression level of the eIF4A2 factor which modulates mRNA translation and protein synthesis rates in pancreatic beta cells. The PTPN1 gene codes for the protein tyrosine phosphatase 1B, a negative regulator of the insulin and leptin signalling pathways. An association with T2D and moderate obesity is observed for a variant at the PTPN1 gene locus. In 736 normoglycaemic non obese subjects, 2 intronic SNPs associate with variations of quantitative traits of glucose and lipid metabolism : increased HOMA-B and triglycerides, decreased HDL-cholesterol, which suggests a possible role in metabolic syndrome. This genetics approach contributes to an improved understanding of the pathways involved in the development of T2D and to propose new therapeutic targets

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Stevanovitch, Alain. "Polymorphisme de l'ADN mitochondrial dans quelques populations anciennes et actuelles du pourtour méditerranéen." Aix-Marseille 2, 2001. http://www.theses.fr/2001AIX22091.

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Cocuau, David. "Les empreintes génétiques en odontologie légale." Bordeaux 2, 2009. http://www.theses.fr/2009BOR20036.

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Abstract:

L’odontologie légale est une branche de la médecine légale s’intéressant à l’étude des dents et des maxillaires. Elle utilise les caractéristiques des dents humaines dans l’identification d’individus. L’expert odontologiste est un auxiliaire de justice qui participe à l’identification des sujets découverts morts et dont l’identité est inconnue, ou de ceux pour lesquels une identification pour les proches ou par les empreintes digitales est impossible. Il interviendra indifféremment, que la cause soit naturelle ou suspecte, que le sujet ait été découvert individuellement ou qu’il s’agisse d’une catastrophe de masse. Les empreintes génétiques sont définies comme le profil spécifique d’une personne obtenu à partir de son ADN par amplification des séquences polymorphiques pour la population générale. Ce travail présente les différents types d’empreintes génétiques, leur intégration dans le domaine médico-légal, les différentes sources d’ADN utilisable dans le processus d’identification des personnes, en détaillant l’intérêt présenté par l’ADN d’origine buccal. En effet, les analyses génétiques à partir des échantillons d’ADN d’origine buccale c’est à dire provenant des cellules jugales, des cellules présentes dans la salive, ou la salive de la pulpe dentaire, sont devenues incontournables.

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Bonnet-Dupeyron, Marie-Noëlle. "Recherche de nouvelles anomalies en cause dans les leucodystrophies d'origine indéterminée." Clermont-Ferrand 1, 2008. http://www.theses.fr/2008CLF1MM12.

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Abstract:

Les maladies génétiques qui touchent la myéline du système nerveux central (SNC), ou leucodystrophies, sont responsables de tableaux cliniques extrêmement variés. Dans ce travail, nous nous sommes intéressées aux formes avec paucité de la myéline, ou hypomyélinisation, impliquant le gène PLP1 (Xq23) codant pour les protéines majeures constitutives de la myéline du SNC : PLP et DM20. Les "PLP-pathies" se traduisent par un déficit moteur variable selon les différentes mutations allant des formes sévères de la maladie de Pelizaeus-Merzbacher (PMD) à des formes modérées et tardives de paraplégie spastique (SPG2). Cependant, pour une grande partie des patients souffrant de PMD et de SPG2, l'implication du gène PLP1 n'a pas pu être montrée suggérant soit une hétérogénéité génétique soit des mécanismes mutationnels alternatifs de PLP1. Cette cohorte de patients, dénommée PMLD(Pelizaeus Merzbacheer like disease), a fait l'objet de cette étude. Nous avons, d'une part testé plusieurs gènes candidats dont le gène MBP, codant pour la 2ème protéine constitutive majeure de la myéline du SNC, le gène GPM6B et le gène OLIG2 codant pour un facteur de transcription, puis d'autre part recherché des méchanismes mutationnels alternatifs de PLP1 en recherchant des remaniements intragéniques et en explorant les régions non codantes et le niveau d'expression de PLP1 par l'étude des transcrits PLP et DM20 à partir des fibroblastes. Si nous avons pu montrer que les gènes candidats testés ainsi que les remaniements intragéniques de PLP1 ne sont pas majoritairement impliqués dans ce groupe de leucodystrophie, l'étude des transcrits a montré, en revanche, l'intérêt de l'utilisation des fibroblastes comme modèle d'étude de l'épissage et du niveau d'expression de PLP1 et a permis de suggérer qu'une anomalie de régulation de l'expression de PLP1 pourrait être impliquée chez certains patients PMLD
Genetic diseases affecting primarily the myelin of the central nervous system (CNS), or leucodystrophies, include a large variety of phenotypes. The aims of this work lead with hypomyelinating forms, displaying a defect in myelin production and implicating the PLP1 gene which encodes the major proteins of CNS myelin, i. E. PLP and DM20. "PLP-pathies" are characterized by motor development impairment and encompass a wide continuum spectrum extending from severe forms of Pelizaeus-Merzbacher disease (PMD) to relatively mild late onset spastic paraplegia (SPG2). However, a large proportion of patients presenting with a PMD or a SPG2 phenotype remains without identified PLP1 mutations suggesting either genetic heterogeneity or PLP1 gene alternative mutational mechanisms. This cohort of patients, called PMD like (PMLD), has been studied in this work to test both hypotheses. First, different candidate genes have been tested, including MBP which encodes the second major proteins of CNS myelin; GPM6B, which present close similarities with DM20 and OLIG2 which encodes a transcription factor oligodendrocyte specific. Secondly, the existence of PLP1 alternative mutational mechanisms has been evaluated by looking for small intragenic rearrangements, and for qualitative and quantitative abnormalities analyzing PLP and DM20 transcripts from patients' fibroblasts. Obtained results have excluded the implication of the tested candidate genes as well as PLP1 small intragenic rearrangements in the aetiology of PMLD. On the other hand, qualitative and quantitative analysis of PLP/DM20 transcripts from fibroblasts have demonstrated their usefulness and suggested that a PLP1 gene expression dysregulation could be involved in a subset of PMLD patients

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Morel, Carole. "Facteurs génétiques et environnementaux dans la modulation nicotinique du système dopaminergique." Paris 6, 2013. http://www.theses.fr/2013PA066559.

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Abstract:

Les neurones dopaminergiques (DA) de l’aire tegmentale ventrale ont un rôle majeur dans le renforcement aux stimuli naturels et aux drogues. L’augmentation de l’activité phasique des neurones DA induit une forte libération de DA dans le striatum qui sous-tendrait la mise en place de l’addiction. La nicotine agit sur ce système via les récepteurs nicotiniques qu'elle détourne de leur fonction physiologique. Durant ma thèse j'ai étudié la réponse électrophysiologique des neurones DA à la nicotine, et sa modulation par un facteur génétique et par le stress. Récemment, un lien entre la substitution D398N de la sous-unité α5 du récepteur nicotinique et le développement d’un fort tabagisme et du cancer des poumons a été identifié. Nous avons établi qu’α5 détermine la sensibilité du système DA aux effets renforçants de la nicotine et que le polymorphisme D398N diminue cette sensibilité. En conséquence, de plus fortes doses de nicotine sont nécessaires pour établir une auto-administration chez la souris. La répétition d'un stress social induit de profonds changements de l'activité DA et l'expression d’un comportement d'évitement social. Nous avons montré que les récepteurs des glucocorticoïdes exprimés dans le striatum sont essentiels à l'augmentation du tonus DA suite à un stress social répété. Les récepteurs nicotiniques α7 seraient également nécessaires à l'établissement de ces modifications. Enfin le stress induit une diminution de l'amplitude d'activation des neurones DA en réponse à la nicotine. Ces travaux révèlent que α5 et α7 ont respectivement un rôle indispensable dans la sensibilité du système DA à la nicotine et dans son adaptation suite à un stress social
Ventral tegmental midbrain dopaminergic cells (DA) are crucial in the reinforcing properties of naturals reward and many drugs of abuse including nicotine. Transition of DA cells to bursting activity triggers an increase of dopamine release in the striatum, underlying drug addiction. Nicotine hijacks the dopaminergic system by activating nicotinic receptors on DA cells. Using transgenic mice, I have recorded the responses of DA cells to nicotine and analyzed the effects of genetic and environmental factors. Recently human genetic studies have revealed a strong link between a human polymorphism of α5 subunit, leading to a D398N substitution, and vulnerability to develop tobacco dependence and lung cancer. We established that α5 determines the sensitivity to nicotine of DA cells, and thus the reinforcing doses; and that the human polymorphism D398N decreases the sensitivity to nicotine of DA cells, leading to an increase of nicotine consumption in self-administration task. Repeated social defeat stress changes spontaneous DA cells activity and social behaviors. We show that glucocorticoid receptors in dopaminoceptive neurons trigger the increase of DA cells firing and bursting activity in response to a social defeat stress. The basal dopamine rate increase is critical in the expression of social avoidance behavior after stress repetition. The α7 nicotinic receptors are necessary in this DA cells adaptation. Moreover, we describe a decreased effect of nicotine-induced activation of DA cells. This work highlights a specific role for α5 and α7 subunits respectively in the sensitivity to nicotine of DA cells, and in their stress-induced adaptation processes

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Pomente, Dominique. "Étude expérimentale génétique, écologique et écophysiologique du polymorphisme végétal : chémotypes et formes sexuelles du thym." Montpellier 2, 1987. http://www.theses.fr/1987MON20058.

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Mariotti, Martine. "Polymorphisme individuel du gène albumine humaine étudié par séquençage." Paris 7, 1985. http://www.theses.fr/1985PA07F078.

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Abstract:

Trois clones d'ADNc, représentant 90% de la complexité de l'ARNm, ont été utilisés pour permettre une étude comparative, sur environ 1200pb, de la séquence du gène de l'albumine humaine avec celles du mçeme gène, déjà publiées par deux autres groupes. Les différentes parties de ce travail sont les suivantes : détermination d'une stratégie de séquence sur nos propres clones ; établissement de cette séquence ; comparaison de notre s&quence avec celles déjà publiées dans la littérature et calcul du taux de variation individuel la concernant. 1 Stratégies de séquences : les trois clones pHASA 36H1. 59B3 et 68B12 sont insérés au site Pst 1 de pBR 322. Après digestion Pst 1 les extré-mités 3' ainsi libérées sont marquées au 32P et les fragments de restriction marqués ainsi obtenus sont coupés par Hinf I : ceci constitue une première stratégie qui a été utilisée pour les trois clones. Après la même digestion initiale par Pst 1, la seconde stratégie utilisée consiste à recouper l'insertion par Hinf 1, à marquer ensuite les fragments de restriction 5' au 32P et à séparer les deux brins (cas du clone 68B12). 2 Etablissement de la séquence : la séquence partielle du gène albumine a été établie, par la technique de MAXAM-GILBERT, pour 1053 pb de la partie traduite et 120 pb de la partie 3' non-traduite. 3 Comparaison avec les deux autres séquences déjà publiées : par comparaison il a pu être mis en évidence 13 substitutions de bases dans la région traduite au niveau des codons : 54 (A➙T). 92 (G ➙A), 97 (G➙A), 216 (G➙A), 268 (G➙A), 327 (C➙T), 344 (G➙A), 381 (G➙A), 391 (C➙T), 396 (A➙G), 407 (G➙A), 462 (G➙A) et 552 (A➙T). Cinq d'entre elles seulement aboutissent à un changement de l'acide aminé correspondant : codons 92 (Ala➙Thré), 97 (Gly➙Ac Glu), 381 et 462 (Val➙Mét) et 396 (Lys➙Ac Glu). Trois changements de bases surviennent dans la partie non-traduite : au niveau de la 4e base une délétion d'un T, une insertion d'un T au niveau de la 80e base et une substitution G➙A au niveau de la 91e base. Pour les 1053 pb de la région traduite le taux de variation à ce gène est de 1,23% (soit 1,07% en valeur corrigée).

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Namour, Bernard. "Phénotypes et concentrations relatives des isoprotéines de la transcobalamine II rapportés au polymorphisme Arg/Pro du codon 259." Nancy 1, 1999. http://www.theses.fr/1999NAN19901.

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Marteau, Jean-Brice. "Etude des interactions gène-environnement dans la régulation de la pression artérielle : E-sélectine et P-sélectine." Nancy 1, 2005. http://www.theses.fr/2005NAN10213.

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Abstract:

L'hypertension est un facteur de risque cardiovasculaire important. Après avoir rassemblé les gènes et leurs polymorphismes susceptibles de moduler l'hypertension, y compris ceux impliqués en pharmacogénétique, nous avons approfondi dans ce travail un groupe de gènes et de leurs produits, les sélectines. Les sélectines (E-sélectine, P-sélectine et L-sélectine) sont des molécules d'adhésion localisées à la surface des cellules endothéliales activées et en surface des leucocytes. Elles participent à l'étape initiale du recrutement des leucocytes circulants qui précède leur migration vers la zone inflammatoire. Les sélectines sont impliquées dans de nombreuses pathologies parmi lesquelles les maladies cardio-vasculaires, les maladies inflammatoires et auto-immunes. Certains polymorphismes génétiques de la E-sélectine et de la P-sélectine sont associés à ces diverses pathologies. De même, les concentrations sanguines de ces molécules, reflet de leur expression cellulaire, sont augmentées en conditions pathologiques. Au sein d'une large population supposée saine (Cohorte Stanislas) nous avons montré que les facteurs environnementaux tels que l'âge, le sexe, la surcharge pondérale, et l'alcool sont susceptibles de modifier l'impact de polymorphismes de la E-sélectine sur la définition des niveaux de pression artérielle. Dans un second temps, nous avons étudié l'influence des polymorphismes génétiques de la E-sélectine et de la P-sélectine sur leur taux circulants. Bien qu'aucun des polymorphismes G98T, Serl28Arg et Leu554Phe, n'influencent le taux de E-sélectine, nous avons montré que les polymorphismes 599Val/Leu, 715 Thr/Pro, et N562D du gène de la P-sélectine influencent fortement la concentration en P-sélectine. Dans un troisième temps nous avons démontré qu'il existe des ressemblances familiales des concentrations en E-sélectine et P-sélectine, suggérant un rôle majeur de la génétique et de l'environnement partagé dans la régulation des concentrations de ces molécules d'adhésion. Enfin, nous avons débuté des études de transcriptomique et pour ce faire nous avons réalisé une banque de sang et de lymphocytes. L'ensemble de ces résultats permet de mieux comprendre la régulation physiologique de la E- sélectine et de la P-sélectine ainsi que les facteurs à prendre en compte lors d'études cliniques et pharmacologiques impliquant ces molécules. L'approche transcriptomique devrait par ailleurs renforcer la connaissance actuelle du lien entre le gène et la protéine.

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Schaffner, Francis. "Systématique du complexe Claviger (Diptera, Culicidae, Anopheles) : morphologie, génétique & biologie." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2002. http://www.theses.fr/2002STR13150.

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Abstract:

Le complexe Claviger est composé de deux espèces jumelles : Anopheles claviger s. S. Et An. Petragnani. Un vaste échantillonnage dans 14 pays d'Europe a permis de réunir 264 échantillons de stades immatures, dont 62 sont considérés dans cette étude comme des populations (30 individus issus du même gîte larvaire). Dans le but de mieux comprendre l'histoire de ces taxons, sont étudiées les différenciations morphologiques et génétiques, les particularités bioécologiques et la distribution. Chez la larve et chez la nymphe, la différenciation morphologique des espèces jumelles est confirmée et précisée. Des analyses ACP et des comparaisons des moyennes permettent de relativiser certains caractères considérés jusqu'à présent comme discriminants, et de décrire de nouveaux caractères statistiquement plus fiables. La différenciation génétique est décrite pour la première fois sur l'analyse des séquences ITS2 de l'ADN ribosomal ; elle permet la mise au point d'un test PCR particulièrement utile pour l'identification des imagos. La différenciation génétique est confirmée par l'étude du polymorphisme électrophorétique. En biologie, les principales spécificités résident dans le comportement hématophage et dans certaines caractéristiques des gîtes larvaires. Chez An. Claviger s. S. , deux entités génétiques distinctes (groupes I et II) sont révélées par l'étude du polymorphisme électrophorétique, et confirmées par une différenciation morphologique. Elles trouvent probablement leur origine dans un isolement au sein de refuges méridionaux pendant les périodes froides du Quaternaire. La recolonisation des territoires du nord de l'Europe par les entités allopatriques a généré une zone hybride dans l'Est de la France. Nos observations suggèrent que l'histoire récente de ce taxon pourrait être un début de spéciation. Chez An. Petragnani, deux entités morphologiques sont également mises en évidence ; leur origine pourrait être liée à un isolement de même nature
The Claviger complex includes two sibling species: Anopheles claviger s. S. And An. Petragnani. A large sampling programme throughout 14 European countries gathered 264 immature stages samples. Sixty-two samples were considered in this study as populations (30 individuals collected in the same breeding place). In order to better understand the history of these taxa, morphological and genetic differentiations were investigated, as well as bio-ecological and distribution specificities. The morphological differentiation of the two species was confirmed and clarified for larvae and pupae. ACP analysis and mean comparisons allowed to reconsider some characters used up to now as diagnostic, and to identify and describe new ones statistically more reliable. Genetic differentiation is described for the first time on the ITS2 ribosomal DNA sequence analysis. A PCR-based diagnostic test that allows for quick and reliable differentiation of the sibling species is provided, especially useful for adults. An investigation of allozyme loci polymorphism confirmed the genetic differentiation between the two species. The main biological specificities are host preferences and breeding sites characteristics. Distribution areas of the two species showed a large sympatry zone. Within An. Claviger s. S. , two genetically distinct groups (group I and group II) were identified on allozyme loci polymorphism. Comparing these populations groups, differences were observed in morphology but not in bio-ecological aspects. The origin of the groups is probably related to an isolation in southern refugia during the Quaternary cold periods. The northern territories' re-colonisation provided an hybrid zone in eastern France. Our observations suggest that the recent taxa history could be related to the onset of speciation. Within An. Petragnani, two morphological entities are likewise observed, the origin of which could be related to a similar isolation

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Corne, Philippe. "Épidémiologie génétique des agents pathogènes : le cas du complexe Mycobactérium tuberculosis." Montpellier 1, 1998. http://www.theses.fr/1998MON11093.

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Afridi, Sarwat. "Influence de variants génétiques candidats sur des phenotypes liés au paludisme à Plasmodium falciparum et effet fonctionnel du polymorphisme NCR3-412 associés au paludisme." Thesis, Aix-Marseille, 2012. http://www.theses.fr/2012AIXM4037.

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Abstract:

Le paludisme est une cause majeure de morbidité et de mortalité, plus particulièrement en Afrique sub-saharienne. De très nombreuses observations sont en faveur de l'existence de facteurs génétiques contrôlant le devenir de l'infection palustre. Il est très probable que certains variants génétiques de gènes candidats du paludisme affectent la résistance du paludisme à travers leur effet sur la réponse immunitaire acquise. Afin de vérifier cette hypothèse, nous avons étudié, dans une population vivant au Burkina Faso, des variants génétiques de HBB, IL4, IL12B, TNF, LTA, FCGR2A et NCR3 dont l'association avec des phénotypes liés à la résistance au paludisme a été publiée; nous avons évalué leur influence sur les niveaux d'IgG dirigés contre les antigènes de Plasmodium falciparum en utilisant un test d'association basé sur les familles. Ainsi, nous avons détecté, l'effet de l'hémoglobine C, FCGR2A-H131, le TNF-857T, et TNF1304A sur les niveaux des sous-classes d'IgG anti-P. falciparum. Ces résultats constituent une base utile pour des études ultérieures du contrôle génétique de la réponse immunitaire chez des individus vivant dans une zone d'endémie. Un autre projet a porté sur l'étude fonctionnelle du polymorphisme NCR3-412, dont nous avions montré l'association avec les accès palustres simples. Nos résultats basés sur des techniques moléculaires montrent l'effet de ce polymorphisme situé dans le promoteur sur la liaison de protéines nucléaires
Malaria is the major cause of morbidity and mortality especially in the Sub-Saharan Africa. There is a growing body of evidence for genetic factors controlling the outcome of malaria infection. It is thought that some genetic variants of malaria candidate genes affect malaria resistance through their effect on the acquired immune response. In order to verify this hypothesis, we worked on genetic variants of HBB, IL4, IL12B, TNF, LTA, FCGR2A and NCR3, which have been associated with malaria resistance phenotypes, to determine their influence on levels of anti-P. falciparum IgG in urban population of Burkina Faso. Using family-based association analysis, we detected the effect of Hemoglobin C, FCGR2A-H131, TNF-857T, and TNF1304A on the levels of anti-P. falciparum IgG. This study can pave the way towards further comprehension of genetic control of an individual's immune response against malaria. Another project focused on functional study of polymorphism NCR3-412, which has already been associated to mild malaria. We investigated the functional effect of this polymorphism located in the promoter by using molecular techniques and showed the effect of this polymorphism on the binding of nuclear proteins

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Jubin, Claire. "Caractérisation et analyse bioinformatique comparative des profils génomiques de mutagénèse chez Saccharomyces cerevisiae." Paris 6, 2013. http://www.theses.fr/2013PA066515.

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Abstract:

Des altérations de l'ADN se produisent en conditions physiologiques normales au cours du cycle cellulaire. Des systèmes de maintien de l’intégrité de l’ADN contiennent ces altérations qui représentent une menace pour la cellule, voire l’organisme. Les gènes impliqués dans ces processus ont un rôle dans des fonctions de réplication, réparation et recombinaison de l’ADN (fonctions 3R). Ces fonctions fondamentales confèrent aux gènes qu’elles impliquent un pouvoir potentiellement « mutateur » intervenant précocement dans le processus d’accumulation de mutations de la tumorigenèse qui a lieu dans les cancers. Dans le projet « MUTome », 11 mutants de délétion de Saccharomyces cerevisiae ont été construits pour des gènes impliqués dans des fonctions du cycle cellulaire et des fonctions 3R. Le séquençage à haut débit de lignées d’accumulation de mutations de ces mutants, suivi de l’analyse bioinformatique, a permis d’établir des spectres de mutations relatifs à des substitutions de base, des insertions/délétions et à des variations structurales. Parce que les répétitions génomiques bruitent les analyses, j’ai développé une stratégie bioinformatique qui aborde ce problème. J’ai identifié dans la séquence de référence les régions répétées, sources d’alignements multiples. Dans ces régions j’ai établi la liste des polymorphismes de substitution de base intra-génomiques qui existent entre répétitions non exactes. L’utilisation de cette liste est le principe de base du filtre « g-deNoise » que j’ai développé. Appliqué aux données du MUTome, il a permis d’identifier des SNP robustes dans les régions génomiques uniques mais aussi dans des régions répétées comme les gènes multi-copies
DNA mutations arise during the cell growth, even under normal physiological conditions. Processes related to the maintaining of DNA integrity prevent appearance of mutations that represent a threat for the cell life and even for the whole organism. Genes implied in these processes play a role in DNA replication, recombination and reparation (3R functions). They also potentially play a role in the early stage of tumorigenesis occurring in cancers. In the “MUTome” project 11 mutants of Saccharomyces cerevisiae were deleted for genes implicated in the 3R and cell cycle functions. High throughput sequencing of these accumulation mutation lines followed by bioinformatics analysis permitted to define the catalogue of DNA alterations induced by gene inactivation in the 11 mutants, related to base substitution, insertions/deletions and structural variations. Because genomic repetitions noise analyses, I set up a strategy to address this problem. To do so, I first identified in the reference sequence of S. Cerevisiae, the repetitive regions, covered by multi-aligned reads after the reads mapping step. In these repetitive regions, I identified intra-genomic base substitution polymorphisms existing between near exact repetitions. Consecutively, I developed an alignment filter, named “g-deNoise”, that uses information of intra-genomic polymorphism. This filter applied to MUTome data allowed SNP identification in unique genomic regions, but also in polymorphic repeated regions such as multicopy genes

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Hue, Isabelle. "Contribution à l'analyse structurale des gènes codant pour le récepteur Alpha-Beta des lymphocytes T de souris." Aix-Marseille 2, 1990. http://www.theses.fr/1990AIX22002.

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Abstract:

L'etude des rearrangements geniques alpha et beta d'un cone t de souris a montre que l'un des alleles alpha presente un rearrangement aberrant nouveau: un segment j alpha s'y trouve accole a une sequence atypique, presente en situation germinale a une kilobase en amont d'un segment v2 (article 1). L'absence de sequences consensus au site de recombinaison rapprocherait ce rearrangement de ceux decrits pour des souris scid ou des tumeurs t humaines. Il apparait donc que le locus alpha presente frequemment deux alleles rearranges a la meme position et que les exclusions d'alleles aux loci alpha et beta reposent sur des mecanismes differents. Dans un deuxieme temps, nous avons determine l'organisation generale du locus alpha/delta de souris en utilisant la cartographie des deletins de segments v survenues sur des lymphomes t et le clonage direct de segments v. Il est alors apparu que le locus alpha/delta est organise en unites repetees dans lesquelles les segments v de sous-familles differentes sont interdigites. Les implications de ces donnees structurales quant a l'expression des segments v alpha et v delta sont discutees dans l'article 2

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Chami, Ibtissam. "Contribution à l'étude du polymorphisme génétique des hémoglobines humaines et du mécanisme de l'induction par l'hydroxyurée du gène gamma de globine chez les patients drépanocytaires." Paris 12, 1998. http://www.theses.fr/1998PA120069.

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Abstract:

Une mutation de l'hemoglobine (hb) peut etre caracterisee par un systeme d'identification combinant six methodes electrophoretiques associees ou non a l'etude structurale du variant et a ses proprietes fonctionnelles et physicochimiques. De nombreux variants de l'hb ont ete ainsi identifies et caracterises dans les groupes ethniques nord africain (algerie, maroc et tunisie) et francais. L'analyse de la diversite de ces variants et l'etude de leur repartition geographique dans les contextes respectifs maghrebin et francais ont montre que les flux migratoires ont conduit a l'apparition dans ces regions de variants pouvant etre consideres comme des marqueurs anthropologiques (hb setif, hb j broussais). Cette etude a permis d'apprecier le polymorphisme important de l'hb dans ces populations. Certains variants en s'associant a la drepanocytose conduisent a l'apparition de syndromes drepanocytaires majeurs dont la pathologie est similaire a la drepanocytose. La reactivation du gene de globine par l'hydroxyuree est une approche therapeutique de cette hemoglobinopathie. En raison de l'heterogeneite de la reponse clinique et de l'induction de l'hbf des patients traites, nous avons mis en place une methodologie d'interet clinique qui a permis de determiner un parametre predictif : la sensibilite in vitro en presence d'hu des progeniteurs erythroides de patients drepanocytaires. Dans l'etude du mecanisme d'action de l'hu dans la reactivation du gene , nous avons montre dans la lignee erythroide une correlation sous l'effet de l'hu, entre la variation de l'expression du gene p21 et la variation de la synthese de l'hbf. Cette correlation peut expliquer l'effet hypomethylant de l'hu au niveau du gene de globine.

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Ruffel, Sandrine. "Résistances récessives aux potyvirus chez les solanacées et facteurs du complexe d'initiation de la traduction." Aix-Marseille 2, 2004. http://www.theses.fr/2004AIX22076.

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Aubert, Hélène. "Mise en évidence du déterminisme génétique du taux plasmatique de TAFI : Etude de la contribution du TAFI au risque thrombotique artériel." Aix-Marseille 2, 2003. http://www.theses.fr/2003AIX22063.

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Bouzekri, Nourdine. "Etude de polymorphismes génomiques chez l'homme ; application de leur étude à la génétique de populations et à la génétique du diabète insulino-dépendant." Toulouse 3, 1997. http://www.theses.fr/1997TOU30157.

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Abstract:

Plusieurs types de polymorphismes d'adn existent : variants de sequence de gene, polymorphisme de restriction de taille, insertion ou deletion, sequences repetees etc. Ces polymorphismes peuvent etre utilises comme marqueurs dans de nombreuses categories d'etudes. Parmi celles-ci, les etudes de maladies genetiques et les etudes de populations tiennent une part preponderante. Dans une premiere partie, nous nous sommes interesses a l'analyse et l'utilisation d'un certain type de polymorphisme d'adn repete, un minisatellite sur le chromosome y, dans les etudes de population et d'evolution humaine. Ce minisatellite est analyse par la technique de minisatellite variant repeat (mvr) qui permet d'obtenir une cartographie specifique pour chaque individu et ainsi de rendre possible les etudes de diversite genetique humaine. Nous avons mis en evidence un phenomene d'homogeneisation d'une nouvelle mutation tout le long du minisatellite. Ceci nous a permis de mettre au point une nouvelle mvr pour etudier la distribution de cette mutation dans une etude de population : cette mutation est specifique d'un groupe de chromosomes y d'origine africaine. Cette approche permet egalement de mieux comprendre les processus de mutation au niveau d'un minisatellite et de proposer un modele de mutation pour ce locus haploide : echange inegal de chromatides soeurs avec un processus de reparation biaise aboutissant a l'homogeneisation de cette mutation tout au long du minisatellite. Dans une deuxieme partie, nous avons analyse leurs apports dans le cas du diabete insulino-dependant (did) ou diabete de type 1, maladie auto-immune caracterisee par la destruction selective des cellules productrices d'insuline au niveau du pancreas. Cette pathologie est sous l'influence de facteurs genetiques et environnementaux. La composante genetique est plurigenique : le locus majeur de susceptibilite se trouve dans le complexe majeur d'histocompatibilite (cmh) sur le bras court du chromosome 6, un deuxieme locus se trouve dans la region du gene de l'insuline sur le chromosome 11, d'autres genes sont localises dans diverses regions du genome. Nous avons utilise un minisatellite decrit dans la region du gene de l'insuline ou nous avons participe a la localisation du locus de susceptibilite au niveau du minisatellite en 5' du gene de l'insuline ; ensuite nous avons montre un phenomene de transmission preferentielle d'alleles particuliers selon l'origine parentale ; cette etude d'epidemiologie genetique a ete realisee sur la population genetiquement homogene du sud-ouest de la france (basques, bearnais). Enfin nous avons explore certains microsatellites de la region centrale du cmh pour caracteriser des haplotypes hla, notamment un haplotype connu comme etant associe au did.

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Braconnot, Sabine. "Structure génétique de Parnassius apollo Linné (Lépidoptera, Papilionidae) en France : étude du polymorphisme enzymatique." Aix-Marseille 1, 1997. http://www.theses.fr/1997AIX11058.

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Abstract:

Parnassius apollo, espece menacee des milieux montagnards ouverts, est protege par les conventions de washington et de berne et la legislation francaise. La variation geographique de ses dessins alaires a donne lieu a la description de nombreuses sous-especes, de valeur controversee. Afin de preciser la variation geographique de la structure genetique des populations de cette espece, nous avons entrepris l'analyse electrophoretique du polymorphisme enzymatique chez 30 populations francaises, 2 populations espagnoles et un echantillon turc. Sept loci se sont reveles variables et interpretables ; 47 alleles ont ete detectes. Les populations se sont revelees generalement en equilibre de hardy-weinberg et n'ont que rarement montre un desequilibre de liaison significatif. Fait exception une population alpine qui connait des hybridations frequentes avec l'espece voisine p. Phoebus. Le niveau de polymorphisme general est comparable a celui d'especes voisines. Les populations nombreuses et continues possedent une diversite nettement plus elevee que celles qui sont petites et isolees. Les indices de fixation (fst et ) suggerent un niveau de subdivision modere, caracteristique de la variation intraspecifique. Le calcul des flux geniques revele un isolement par la distance a grande et petite echelle geographique, mais non a echelle moyenne. Les analyses hierarchiques et les ordinations en espace reduit distinguent bien les populations des grandes regions, espagne en particulier ; elles regroupent assez bien les populations proches geographiquement ; l'echelle intermediaire est plus confuse. Cette structure peut etre interpretee en tenant compte des connexions qui ont pris place pendant la glaciation wurmienne et les phases froides et ensoleillees qui l'ont suivie. Demographiquement comme genetiquement, les populations des massifs moyens (jura, massif central) apparaissent tres vulnerables ; celles des alpes et des pyrenees, grandes et bien connectees, ne sont pas actuellement menacees.

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Della-Chiesa, Emmannuelle. "Contraintes génomiques et évolution des caractères quantitatifs." Paris 11, 2004. http://www.theses.fr/2004PA112235.

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Abstract:

Parmi tous les gènes gouvernant l'expression des caractères quantitatifs, ceux qui sont impliqués dans l'évolution sont ceux qui sont polymorphes. Ce polymorphisme est susceptible d'évoluer sous l'effet de différentes pressions évolutives. Mieux comprendre comment ces pressions évolutives agissent sur ce polymorphisme permettrait de mieux appréhender le déterminisme génétique de ces caractères qui est pour l'instant mal connu. De plus, cela permettrait de pouvoir mieux prédire la réponse d'une population à la sélection. Le but de cette étude était de caractériser, par simulation et pour des systèmes multilocus, l'évolution au cours du temps de la répartition spatiale du polymorphisme le long du génome. Partant de populations initialement polymorphes, on montre que les locus qui restent polymorphes le plus longtemps se trouvent dans des clusters de locus liés et conduisent à une agrégation spatiale du polymorphisme. Cette agrégation est mesurée à travers l'indice ICS, qui permet de faire des comparaisons entre populations et entre générations. Cette structuration du polymorphisme dans le génome est corrélée à l'existence de déséquilibres de liaison entre les locus. Elle disparaît à l'équilibre mutation-sélection-dérive. Cette répartition spatiale non aléatoire du polymorphisme peut être observée à différentes échelles génomiques: au niveau du polymorphisme nucléotidique le long d'une séquence d'ADN ou au niveau du polymorphisme de locus le long d'un chromosome. Elle peut apparaître sous l'effet de la dérive génétique seule, ou sous l'effet conjoint de la dérive et de la sélection. Elle semble surtout caractéristique de populations hors d'un état d'équilibre. Enfin, les implications de l'agrégation du polymorphisme sur le déterminisme génétique apparent de caractères mesuré à travers des expériences de détection de QTL ont été étudiées. On montre en particulier que le nombre de locus polymorphes que l'on peut s'attendre à trouver à l'intérieur d'un segment chromosomique compris entre 2 marqueurs génétiques dépend de l'histoire sélective des lignées parentales du croisement étudié
Among all genes ruling the expression of quantitative traits, those involved in evolution are the polymorphic ones. Polymorphism may evolve under different selective pressures. A better understanding of how these selective pressures influence polymorphism could lead to a better understanding of the genetic determinism of these traits, which is not very well known yet. Moreover, it would lead to a better prediction of the response to selection of a population. This study aimed at characterizing, by simulations and for multilocus systems, the evolution through time of the spatial distribution of polymorphism along the genome. Starting with an initially polymorphic population, I showed that the loci that stayed polymorphic longer are to be found within clusters of linked loci and lead to a spatial clustering of polymorphism along the genome. The amount of clustering is measured with the ICS index which allowed for comparisons between populations and between generations. The spatial clustering of polymorphism along the genome is related to linkage disequilibrium between the loci. It disappears at mutation-selection-drift equilibrium. This non-random distribution was predicted at different genomic scales: nucleotide polymorphism along a DNA sequence or locus polymorphism along a chromosome. It can appear due to genetic drift alone, or due to the joint effect of drift and selection. Hence, this clustering of polymorphic loci is rather a signature of populations being outside equilibrium conditions. Lastly, the implication of the clustering of polymorphism into the supposed genetic determinism of traits, found during QTL mapping experiments, was studied. In particular, I showed that the number of polymorphic loci which can be expected inside a chromosomic fragment delimited by two genetic markers depends on the selective history of the parental lines of the studied cross

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Pagès, Jean-René. "Variabilité génétique et hybridations chez les Schistosomes : le modèle Schistosoma intercalatum et espèces voisines." Montpellier 2, 1988. http://www.theses.fr/1988MON20065.

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Abstract:

Variabilite genetique de schistosoma intercalatum etudiee par la morphologie et la biometrie des oeufs, la chronobiologie des emissions cercariennes et le developpement intramolluscal; divergence entre les souches camerounaises et zairoises

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Dissertations / Theses on the topic 'Polymorphisme génétique'

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