Dissertations / Theses: 'Pomme de terre – Amélioration'

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Fortin, Gabrielle. "Une technologie de génotypage par séquençage (GBS) au service de la sélection de lignées de pommes de terre résistantes au nématode doré (globodera rostochiensis)." Thesis, Université Laval, 2013. http://www.theses.ulaval.ca/2013/30310/30310.pdf.

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Abstract:

Le nématode doré est un endoparasite sédentaire affectant la culture de la pomme de terre. Les populations de ce nématode peuvent être contrôlées par l’utilisation de cultivars résistants. Le gène H1 confère une résistance presque complète. Le projet visait à introduire par rétrocroisement assisté de marqueurs, le gène H1 dans un cultivar aux qualités agronomiques recherchées. Premièrement, des marqueurs moléculaires liés au gène H1 (TG689 et 57R) ont permis de déterminer au sein des descendances de rétrocroisement les individus qui en sont porteurs. Puis, une approche de génotypage par séquençage (GBS) a été utilisée pour caractériser les individus BC1F1 ayant ce gène. Un catalogue de 5745 marqueurs a été obtenu et une validation par séquençage 454 a confirmé 66,1 % des 250 génotypes analysés. Les marqueurs ont permis de sélectionner parmi les descendants BC1F1 ayant le gène H1, ceux ayant la plus faible contribution allélique provenant du parent résistant.

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Couty, Aude. "Impact environnemental de pommes de terre transgéniques, exprimant une lectine contre des pucerons, sur des parasitoïdes de pucerons." Tours, 2000. http://www.theses.fr/2000TOUR4027.

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Abstract:

L'objectif était d'évaluer les risques posés par l'utilisation potentielle de pommes de terre transgéniques exprimant la GNA (galanthus nivalis agglutinin), partiellement résistantes aux pucerons, sur deux espèces de parasitoïdes de pucerons aphidius ervi et aphelinus abdominalis. La recherche des effets potentiels de ces plantes sur les parasitoides adultes et les larves au niveau individuel a été réalisée principalement en utilisant du milieu artificiel pour délivrer la GNA. Une expérience en situation de mesocosmos avec plantes entières a permis l'étude au niveau populationnel. Nous montrons que les risques d'exposition à la GNA chez les parasitoides adultes et les effets toxiques et/ou subégaux qui en découlent dépendent de leur mode de nutrition. La GNA est excrétée en partie dans le miellat des pucerons. L'ingestion de fortes doses de GNA entraine une diminution de la longévité de a. Ervi. En revanche, la fécondité et la longévité de a. Abdominalis se nourrissant de l'hémolymphe des pucerons intoxiques par la GNA ne sont pas affectées. L'étude du développement larvaire, effectuée principalement à l'aide de milieu artificiel montre que la GNA est ingérée par les larves de parasitoides et peut être détectée dans les adultes. Nous montrons aussi que les parasitoides sont affectés indirectement par la GNA via les effets sur la qualité de l'hôte, ou directement par ingestion de la toxine. Ces effets peuvent se répercuter sur la fitness des adultes et sur les générations suivantes, et pourraient ainsi avoir des conséquences négatives sur la dynamique des populations de parasitoides. Les plantes étudiées exprimant peu ou pas la GNA, les hypothèses établies par l'étude au niveau individuel avec GNA délivrée par milieu artificiel n'ont pas pu être vérifiées en situation de mesocosmos. Ces essais biologiques pourront contribuer à une méthodologie d'évaluation des risques posés par les plantes transgéniques résistantes aux ravageurs sur les insectes auxiliaires.

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Simo, Santalla Pablo. "Contribution au développement de techniques pour l'hybridation somatique chez la pomme de terre (Solanum tuberosum) : culture et fusion de protoplastes de clones dihaploïdes, diploïdes hybrides interspécifiques et de l'espèce diploïde S. brevidens." Paris 11, 1988. http://www.theses.fr/1988PA112393.

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Abstract:

Des aspects différents des méthodes d'obtention d'hybrides somatiques de pomme de terre ont été étudiés et développés. Des colonies ont été obtenues à partir de protoplastes de 12 clones diploïdes sur les 13 étudiés. 10 de ces clones ont régénéré des plantes. L'influence de différents facteurs sur la formation de colonies a été mise en évidence: l'osmolarité du milieu pendant l'isolement et la culture; l'emploi de sels pendant l'isolement; la densité de culture initiale; l'emploi d'antibiotiques (en particulier ampicilline); et la composition du milieu de culture. A chaque génotype correspond un type de comportement particulier par rapport à la composition en substances de croissance et à l'utilisation d'acides organiques dans le milieu de culture. Ces comportements sont dépendants de la concentration des macroéléments dans le milieu. Les taux de régénération varient selon le génotype et le milieu choisi. Une variation morphologique relativement importante a été décrite chez des plantes issues de protoplastes de 2 clones différents. Les réponses des clones étudiés aux conditions d'isolement et de culture de protoplastes, ainsi qu'aux milieux de régénération peuvent être utilisées pour la détermination de protocoles de sélection d'hybrides somatiques par complémentation physiologique. Un grand nombre de plantes ont été régénérées à partir d'expériences de fusion par des méthodes chimiques. Une plante présentant des isoestérases caractéristiques des clones parentaux (hybride somatique probable) a été sélectionnée.

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Solano, Solis Jaime hernán. "Etude d'une collection de pommes de terre (Solanum tuberosum spp tuberosum L.) native de Chiloé (Chili) : Conservation in situ, Diversité morphologique et génétique, Comportement vis-à-vis de Phytophtora infestans." Phd thesis, AgroParisTech, 2011. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00910688.

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Abstract:

L'objectif global était d'évaluer la diversité génétique d'une collection de variétés de pommes de terre indigènes originaires de l'île de Chiloé, pour caractériser la résistance de ces variétés au mildiou (Phytophthora infestans) et pour en savoir davantage sur l'état de conservation in-situ. Les sujets suivants a été élaboré: a) la conservation in situ de Solanum indigènes à l'île la grande de Chiloé et son impact sur la diversité, b) l'évaluation de la diversité morphologique des pommes de terre indigènes que nous avons recueillis c) l'évaluation de la diversité génétique par marqueurs microsatellites et AFLP, d) la caractérisation du terrain et des résistances in-vitro au mildiou. Sur la base des résultats des enquêtes, nous pouvons conclure que le maintien in situ de la diversité de pommes de terre indigènes n' est pas bien conservé, en raison des forts changes sociaux et économiques sur l'île de Chiloé. Il y a un processus clair de remplacer les variétés indigènes pour les cultivars commerciaux en réponse aux conditions du marché. Les variétés natives sont présents dans 80,5% des fermes de Chiloé, mais la diversité a été considérablement réduite. Les résultats de la diversité morphologique ont montré la formation de groupes sous le nom populaire et des attributs locaux affectés par les agriculteurs eux-mêmes. L'évaluation moléculaire de la collection (SSRs et AFLP) révèle un haut degré de diversité génétique. Les deux marqueurs ont été uniformes dans la classification Solanum fernandezianum comme le génotype plus éloigné. La SSR a permis l'estimation de la teneur des informations polymorphes pour sept loci dont les valeurs se situaient entre 0,63 à 0,89. Les deux types de marqueurs, n'a pas fourni les mêmes groupes parmi les accessions. L'étude SSR basé a montré une faible différenciation entre les pommes de terre indigènes et l'amélioration des variétés cultivées. L'analyse de la diversité sur la base des AFLP n'était pas incompatible avec ce résultat parce que, malgré contenant un seul cultivar (Désirée), le cultivar a été regroupée avec les variétés indigènes. En ce qui concerne la résistance au mildiou, la plupart des accessions sont dans les rangs modérément résistante à modérément sensible.

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MASSON, JEAN. "Hybridation somatique chez la pomme de terre." Paris 11, 1990. http://www.theses.fr/1990PA112211.

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Abstract:

Un procede de regeneration de plantes a partir de protoplastes de mesophylle de clones diploides a ete mis au point. La culture in vitro des plantes-meres, sous un eclairement d'intensite 120 microe?m##2?s##1, et de photoperiode 13 heures, a permis d'obtenir des taux de division des protoplastes de 50%. Le procede de regeneration fait appel a quatre milieux de culture differents permettant: 1) l'obtention de divisions de protoplastes; 2) le developpement de colonies; 3) le developpement de cals; 4) la regeneration de plantes. La composition de ces differents milieux a ete optimisee. Cette methode a permis la regeneration de plantes a partir de protoplastes pour 17 clones diploides sur les 19 etudies. Des conditions de transfert direct de genes par electroporation de protoplastes ont ete mises au point. Elles permettent l'obtention de frequences de transformation de 0,5% a 2%. Trois clones diploides transformes ont ete regeneres: 217, resistant a la kanamycine, 90, resistant a l'hygromycine, et 71, resistant au chlorsulfuron. Des protoplastes des clones transformes 217 et 90, 217 et 71, 90 et 71 ont ete fusionnes. Des colonies possedant la combinaison des resistances des deux parents ont ete selectionnes. Des plantes tetraploides ont ete regenerees a partir de ces colonies, pour les 3 fusions somatiques. Des hybridations moleculaires avec des sondes portant des sequences codant pour des arn ribosomiques ont montre que les plantes tetraploides etaient des hybrides somatiques

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Bouchard, Édith. "Interaction tritrophique entre une plante de pomme de terre transgénique et Perillus bioculatus, un prédateur du doryphore de la pomme de terre." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 1999. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk2/ftp03/MQ48999.pdf.

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Duceppe, Marc-Olivier. "Protéome et bilan photosynthétique de la pomme de terre (Solanum tuberosum L.) en réponse au doryphore de la pomme de terre (Leptinotarsa decemlineata Say)." Thesis, Université Laval, 2011. http://www.theses.ulaval.ca/2011/27966/27966.pdf.

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Abstract:

Les plantes ont développé, au cours du temps, des mécanismes de protection leur permettant de survivre et de se développer en dépit des nombreux stress biotiques auxquels elles sont soumises. Cette thèse doctorale, en trois volets, visait à caractériser les réponses biochimiques et physiologiques de la pomme de terre (Solanum tuberosum) attaquée par un insecte coléoptère, le doryphore de la pomme de terre (Leptinotarsa decemlineata). Le premier volet du projet visait à caractériser l'impact de l'insecte sur le protéome foliaire de la plante, en utilisant comme modèle des plantes traitées avec des larves de doryphore, des plantes soumises à des blessures mécaniques et des plantes infestées par un insecte suceur, le puceron de la pomme de terre (Macrosiphum euphorbiae). Le second volet visait à caractériser le protéome des sécrétions orales du doryphore, avec pour objectif de cerner l'incidence relative des protéines de l'insecte et de la plante hôte aux sites de blessure générés par l'herbivore. Le troisième et dernier volet visait, enfin, à déterminer l'impact des altérations du protéome foliaire de la plante sur ses capacités photosynthétiques, et à mettre en évidence l'impact possible des composantes moléculaires de la plante sur les réponses observées. En résumé, nos résultats ont démontré que plusieurs protéines des métabolismes primaire et secondaire, incluant des protéines associées à la photosynthèse, sont régulées dans les feuilles en réponse au doryphore de la pomme de terre. L'impact négatif de l'herbivore sur plusieurs protéines photosynthétiques, notamment celles du photosystème I, a toutefois des répercussions négligeables sur la capture de lumière par la plante. La seconde phase du processus photosynthétique, en revanche, est affectée de manière notable par le doryphore, vraisemblablement par l'action de molécules provenant aussi bien de l'insecte que de la plante elle-même. Ces résultats suggèrent, dans l'ensemble, un impact spécifique, mais limité du doryphore de la pomme de terre sur le protéome primaire et les fonctions photosynthétiques de sa plante hôte. Ils suggèrent aussi la mise en place de mécanismes compensatoires in planta et la grande plasticité du métabolisme primaire de la plante en réponse à l'herbivore.
Higher plants have developed, over time, a variety of protection mechanisms allowing them to survive and cope with a variety of biotic stress cues in their surrounding environment. The main goal of this three-part doctoral thesis was to characterize the biochemical and the physiological responses of potato (Solanum tuberosum) to defoliation by the coleopteran insect herbivore Colorado potato beetle (Leptinotarsa decemlineata). The first objective of the project was to characterize the impact of the insect on the host plant's leaf proteome, using as a model plants treated with potato beetle larvae, mechanically wounded plants and plants infested with a sucking/piercing insect, the potato aphid (Macrosiphum euphorbiae). The second objective was to gain some insight about the proteome of potato beetle oral secretions, with the aim of assessing the relative incidence of insect and host plant proteins at wound sites generated during insect feeding. The third objective, finally, was to determine the impact of leaf proteome alterations on photosynthetic capacities of the host plant, and to determine the possible impact of the plant's own molecular constituents on the responses observed. In brief, our results showed that several proteins involved in the primary and the secondary metabolisms, including photosynthesis-related proteins, were regulated in leaves in response to potato beetle feeding. However, the negative impact of the insect on several photosynthetic proteins, notably photosystem I proteins, only had negligible effects on the light capture process by the plant. The second phase of photosynthesis, on the other hand, was significantly affected by the insect, presumably via molecular effectors from both the insect and the host plant itself. These findings suggest, overall, a specific, but somewhat limited impact of Colorado potato beetle larvae on the leaf proteome and photosynthetic capacities of the potato host. They also suggest the possible induction of compensatory mechanisms in planta and the high plasticity of primary metabolism functions in the plant upon herbivore feeding.

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Kröner, Alexander. "Contribution différentielle des réactions de défense générale aux résistances quantitatives de la pomme de terre à Pectobacterium atrosepticum et à Phytophthora infestans." Rennes, Agrocampus Ouest, 2012. http://www.theses.fr/2012NSARC106.

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Abstract:

L’utilisation des résistances génétiques, (en particulier des résistances partielles) est un enjeu scientifique majeur dans le cadre actuel de construction de méthodes de phytoprotection durables et respectueuses de l’environnement. Si les résistances quantitatives sont réputées durables, les mécanismes sous-jascents impliqués ne sont pas encore bien connus. L’objectif de la thèse est de mieux comprendre quels sont les éléments clé à l’origine de ce type de résistance pour promouvoir son utilisation en protection des plantes. Les travaux réalisés partent de l’hypothèse que la résistance quantitative est liée à des différences quantitatives (intensité et/ou cinétique) des réponses de défense de l’hôte induites par des éliciteurs issus du pathogène. Nous avons testé cette hypothèse sur des tubercules de 5 variétés de pomme de terre avec des niveaux de résistance variables à deux agents pathogènes différents taxonomiquement et par leurs processus infectieux: la bactérie nécrotrophe Pectobacterium atrosepticum (agent de pourriture molle), et l’oomycète hémi-biotrophe Phytophthora infestans (agent du mildiou). Un classement de résistance inter-variétale a été établi par mesure de la quantité des symptômes provoqués par ces pathogènes. En parallèle, l’induction des réactions de défense par le lipopolysaccharide (LPS) bactérien et un filtrat de culture concentré (CCF) de l’oomycète a été étudiée par mesure de l’activité de la phénylalanine ammonia-lyase (PAL) et de l’accumulation des composées phénoliques. Les résultats obtenus ont mis en évidence un lien positif entre les niveaux de résistance de la pomme de terre à P. Atrosepticum et l'intensité des défenses induites par le CCF mais un lien négatif pour le pathosystème pomme de terre – P. Infestans. Nous avons également montré que l’accumulation de certains composés phénoliques varie dans le même sens que la résistance. Plusieurs de ces molécules, comme l’acide chorogénique et la rutine, réduisent la croissance des pathogènes in vitro, alors que d’autres, comme la nicotiflorine, n’ont pas d’effet toxique direct. Ceci suggère que l’efficacité des défenses induites s’explique par l’action combinée d’ effets directs et indirects. L’ensemble de ces résultats amène à proposer un modèle mécanistique de résistance partielle plus complexe que celui envisagé dans l’hypothèse initiale, et associant effets physiologiques des résistances induites et traits d’histoire de vie liés aux processus infectieux des agents pathogènes eux mêmes
Using genetic resistance (especially quantitative resistance) is a major challenge for the design of more durable and environmentally friendly strategies in crop protection. If quantitative resistance is considered durable, underlying mechanisms are still poorly understood. The objective of the present work is to identify key elements underlying this type of resistance to favour its integration in crop protection. It started with the hypothesis that quantitative resistance is linked to quantitative differences (intensity and/or timing) of defence responses induced in the host plant by pathogen derived elicitors. We checked this hypothesis on tubers from 5 potato cultivars with variable levels of resistance against two taxonomically distant pathogens with distinct infectious strategies: the necrotrophic bacterium Pectobacterium atrosepticum causing soft rot and the hemi-biotrophic oomycete Phytophthora infestans causing late blight. A resistance ranking between cultivars has been established by quantification of disease symptoms caused by these pathogens. Simultaneously, induction of defence responses by the bacterial lipopolysaccharide (LPS) and by a concentrated culture filtrate (CCF) from the oomycete was studied by measuring the activity of phenylalanine ammonia-lyase (PAL) and the accumulation of phenolic compounds. Results provide evidence for a positive link between the level of quantitative resistance of potato to P. Atrosepticum and the intensity of defence induced by CCF, but a negative link for the pathosystem potato – P. Infestans. We also identified individual phenolic compounds positively linked with resistance level. Some of them (i. E. Chlorogenic acid and rutin) diminish growth of both pathogens in vitro, but others (i. E. Nicotiflorin) have no direct toxic effect. This suggests efficacy of inducible defence to be based on a combined action of direct and indirect effects. Taken together, our results point us to a more complex mechanistic model for quantitative resistance than supposed by our initial hypothesis, integrating physiological aspects of induced resistance with infection linked life history traits of the pathogen

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Pépin, Geneviève. "Résistance au virus Y de la pomme de terre (PVY) chez des lignées transgéniques de pomme de terre exprimant un inhibiteur de protéases de type cystéine." Thesis, Université Laval, 2004. http://www.theses.ulaval.ca/2004/22301/22301.pdf.

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Abstract:

La résistance au PVY chez des lignées transgéniques exprimant un inhibiteur de protéase est due en partie à des changements physiologiques occasionnés par l’inhibiteur recombinant exprimé dans la plante. Après clonage et expression hétérologue des protéases de maturation du PVY, nous avons étudié les interactions entre ces protéases et différentes cystatines végétales, démontrant par des tests in vitro que les protéases du PVY ne sont pas sensibles à l’action des inhibiteurs testés. Nous avons ensuite inoculé le virus sur des lignées transgéniques de pomme de terre exprimant la cystatine II du maïs (CCII) et des lignées transgéniques exprimant un inhibiteur de type aspartate, l’inhibiteur de cathepsine D (CDI) de tomate. Ces deux lignées présentent des altérations aux niveaux de leur métabolisme et étaient résistantes au virus PVY. Ces résultats, suggèrent que les inhibiteurs de protéases CCII et CDI exprimés chez les Solanacées entraînent des changements physiologiques significatifs chez la plante hôte induisant indirectement une résistance partielle ou totale au PVY.

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Painchaud, Jacques. "L'azote du sol et la fertilisation de la pomme de terre." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 1997. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk2/tape16/PQDD_0016/MQ37155.pdf.

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Jobin, Christian. "Les déterminants du marché de la pomme de terre au Québec." Mémoire, Université de Sherbrooke, 1987. http://hdl.handle.net/11143/8641.

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Abstract:

Le marché de la pomme de terre constitue un secteur relativement important de l'économie agricole québécoise. En 1984, les recettes monétaires provenant de cette culture dépassaient les 41.5 millions de dollars, c'est-à-dire, 29 pour cent de toutes les recettes monétaires provenant des opérations agricoles affectées à la production des légumes(1). Compte tenu de son importance, il apparaît essentiel de connaître l'étendue de ce marché, ainsi que le fonctionnement de celui-ci afin de mieux saisir les conséquences possibles d'une perturbation au niveau de ce secteur agricole. De ce fait, cette recherche sur les déterminants du marché de la pomme de terre au Québec aura comme objectif principal de répondre à ces deux éléments. Les travaux déjà consacrés à ce sujet sont peu nombreux. Ceux qui sont accessibles traitent le marché de la pomme de terre de façon à lui donner un aspect national. Contrairement à ces derniers, cette étude revêtira le caractère provincial et celle-ci permettra de mieux saisir les différents intervenants du marché de la pomme de terre au Québec. L'intérêt qui s'y rattache est la possibilité d'aboutir à de nouveaux résultats économiques. Les principales difficultés rencontrées se situent aux niveaux de la collecte des données empiriques et de l'accessibilité de certains documents de travail aptes à améliorer le contenu de cette recherche. L'aspect confidentiel que revêtent certaines statistiques ou tout simplement l'inexistence de celles-ci, limite la précision de résultats empiriques pour ainsi, diminuer la qualité des équations de comportement. De même, l'impossibilité d'accéder à des documents de travail en rapport avec le sujet de cette étude contribue à diminuer le niveau d'information obtenue. Cette étude est constituée de quatre parties distinctes: la première, présente la situation du marché de la pomme de terre au Québec. En plus de décrire les principaux intervenants de ce marché, cette partie analyse les facteurs déterminant le prix québécois de la pomme de terre. La seconde partie de cette étude rappelle certains travaux déjà consacrés au même sujet et s'efforce d'en faire le bilan. La troisième, à caractère plus théorique, démontre certaines règles économiques visant à expliquer le fonctionnement de ce marché. Tout en déterminant le mécanisme des prix, cette partie spécifie les comportements du producteur et du consommateur de cette denrée alimentaire. Compte tenu de l'énoncé de ces résultats théoriques, il importe que ceux-ci correspondent véritablement à la réalité. De ce fait, la dernière partie de ce travail sera un modèle économétrique capable de vérifier quantitativement les résultats avancés auparavant. En plus d'établir un cadre structurel quantitatif du marché de la pomme de terre au Québec, ce modèle économétrique fournira un outil de travail apte à générer des prévisions au niveau de certains comportements de ce marché. Cette étude prend la forme d'une recherche appliquée. Les résultats obtenus peuvent diverger quelque peu de ceux provenant d'autres études. Dans ce cas, il importe de dire que cette recherche n'est qu'une interprétation du marché québécois de la pomme de terre.

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Goulet-Fortin, Jérôme. "Modélisation des rendements de la pomme de terre par réseau de neurones." Thesis, Université Laval, 2009. http://www.theses.ulaval.ca/2009/26556/26556.pdf.

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Provencher, Maryse. "Évaluation spatiale de l'efficacité agronomique du LIOR dans la pomme de terre." Thesis, Université Laval, 2003. http://www.theses.ulaval.ca/2003/21137/21137.pdf.

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Abstract:

La pomme de terre est une culture très exigeante en engrais phosphatés. Au Québec, elle est principalement cultivée dans des sols légers, acides, pauvres en matière organique et réputés pour leur pouvoir fixateur en phosphore très élevé. Dans cette étude, l’utilisation du LIOR, un lisier de porc bio-traité et déshydraté, a permis d’augmenter significativement l’efficacité des engrais phosphatés dans la culture de la pomme de terre tout en ayant l’avantage d’offrir un débouché intéressant pour les surplus de lisier de porc au Québec. C’est à partir de données recueillies lors d’essais de fertilisation réalisés de 1999 à 2002 dans les comtés de Portneuf et de Lotbinière et dans la région de Lanaudière, qu’un modèle de réponse de la pomme de terre aux différentes formulations minérales, organiques et organo-minérales à base de LIOR fut élaboré. À partir de ce modèle et des outils géostatistiques, une scénarisation de l’utilisation du LIOR à l’échelle du champ a amené une augmentation moyenne des rendements totaux de 2,4 Mg ha-1 dans la pomme de terre au-delà de l’erreur expérimentale déterminée dans les essais de fertilisation et dans le modèle de réponse.
Inscrite au Tableau d'honneur de la Faculté des études supérieures

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Boudjeniba, Messaoud. "Contributions à la connaissance du bioessai "Crown-Gall de pomme de terre"." Grenoble 2 : ANRT, 1988. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37612152k.

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Narcy, Agnès. "Intérêt nutritionnel de la pomme de terre pour exercer des effets alcalinisants." Clermont-Ferrand 1, 2007. http://www.theses.fr/2007CLF1MM07.

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Abstract:

Les recherches des dernières décennies ont contribué à établir le rôle majeur joué par l'alimentation dans la prévention de nombreuses maladies. En particulier, l'évolution des régimes occidentaux a été marquée par une diminution de la consommation de produits végétaux, sources de glucides complexes et de micronutriments, et par l'utilisation croissante de produits transformés, ce qui favoriserait le développement de nombreuses pathologies dégénératives. Parmi les boulversements induits par cette "transition nutritionnelle", nous nous sommes intéressés aux conséquences de la diminution des apports de potassium et, en particulier, de sels organiques de potassium aux propriétés alcalinisantes dans un contexte où la charge acide de l'alimentation et les apports de sodium sont très élevés. Ces modifications du rapport Na/K pourraient participer au développement de pathologies chroniques telles que l'hypertension, l'ostéoporose et les lithiases rénales. La pomme de terre, longtemps considérée comme un simple féculent de faible intérêt nutritionnel, est en fait une source majeur de sels organiques de potassium présents principalement sous forme de citrate et de malate. L'intérêt des sels organiques de potassium provient de leur capacité à engendrer, après le métabolisme de leur partie organique, des équivalents bicarbonates de potassium, capables de neutraliser l'excès d'acidité résultant notamment du catabolisme des protéines ou de neutraliser les effets délétères du sel. Ainsi, les travaux menés au cours de cette thèse se sont attachés à mettre en évidence l'effet de la consommation de pomme de terre dans la régulation de l'équilibre acido-basique et minéral de l'organisme chez le rat et chez l'homme. Les résultats de ce travail de thèse ont confirmé que la pomme de terre était susceptible d'affecter favorablement l'équilibre acido-basique et l'homéostasie du calcium et du magnésium pouvant contribuer à limiter les altérations du tissu osseux. Par ailleurs, compte tenu de ses effets bénéfiques sur la citraturie, il est probable qu'elle puisse jouer un rôle dans la prévention des lithiases rénales. Des études à long terme chez l'homme sont toutefois nécessaire pour décrire les conditions dans lesquelles la consommation de pomme de terre peut être pleinement bénéfique via ses effets alcalinisants et sa contribution à la fourniture de glucides
Last decades studies established that the diet plays a major role in the prevention of several diseases. Particularly, Western diets presented a decrease in the consumption of plant foods, which represent a major source of complex carbohydrates and micronutrients, and an increase in processed foods, that may contribute to the development of various degenerative pathologies. Among every changes induced by this "nutritional transition", we studied the impacts of a decrease in potassium consumption, particularly potassium organic salts that present alkalinizing properties, in acid ash and high sodium diet conditions. The change in Na/K ratio may participate to the development of chronic pathologies such as hypertension, osteoporosis and renal lithiasis. Potato, considered for a long time as a starchy food with a poor nutritional interest, is in fact a major source of potassium organic salts present mainly in the form of citrate and malate. Potassium salts have the particularity to yield potassium bicarbonate, through their metabolism, that may neutralise the excess of acidity resulting from protein catabolism or deleterious effects of salt. We decided, thus, to focus in this thesis on the effect of potato consumption in the regulation of acid-base and mineral homeostasis in rats and humans. The results of the present thesis have confirmed that potato may positively affect acid-base and calcium and magnesium homeostasis contributing to limit bone alterations. Furthermore, taking into account the beneficial impact of potato on citraturia, it may play a major role in the prevention of renal lithiasis. Long term studies in humans remain essential in order to describe the conditions in which potato consumption may be effective through its alkalinizing impact and its contribution in carbohydrates supply

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Laissus, Anne. "La Pomme de terre, une "plante utile" aux XVIIème et XVIIIème siècles." Paris 11, 1988. http://www.theses.fr/1988PA114044.

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Boudjeniba, Messaoud. "Contributions à la connaissance du bioessai "Crow-gall de pomme de terre"." Paris 6, 1988. http://www.theses.fr/1988PA066094.

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Abstract:

Ce système est utilisé pour des études fondamentales sur le Crown gall et pour le dépistage de l'activité antitumorale d'extraits végétaux. Les tumeurs dérivent essentiellement du parenchyme périfasciculaire du phloème interne. La présence d'une solution minérale dans le milieu de culture et l'application de GA3 stimulent la croissance des tumeurs. Par contre, l'application d'un produit antigerminatif sur les tubercules, le lavage des explants avant inoculation du DMSO comme solvant des échantillons, réduisent l'apparition des tumeurs. Un gradient longitudinal de sensibilité est mis en évidence.

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Prévost, Karine. "Étude des communautés bactériennes du sol et des tubercules de pomme de terre suite à l'ajout d'agents de lutte biologique contre la gale commune de la pomme de terre." Mémoire, Université de Sherbrooke, 2004. http://savoirs.usherbrooke.ca/handle/11143/4627.

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Abstract:

Au laboratoire, des essais de lutte biologique ont été effectués avec le chitosane et avec la souche EF-76 de Streptomyces melanosporofaciens , un actinomycète producteur de geldanamycine. Le chitosane est connu pour être un éliciteur des mécanismes de défense des plantes et pour favoriser les populations de microorganismes possédant une activité chitosanolytique au niveau du sol. La question à laquelle ce projet a voulu répondre est la suivante: est-ce que l'ajout de biomasse de la souche EF-76 de Streptomyces melanosporofaciens et de chitosane pour contrôler la gale commune de la pomme de terre change de façon significative la microflore indigène du sol et des tubercules? Pour y répondre, l'étude des communautés bactériennes du sol et des tubercules de pomme de terre a été effectuée suite à l'application de différents traitements de lutte biologique. De plus, l'étude des actinomycètes résistants à la geldanamycine (ARG) et la détermination du contenu du sol en chitosane a été effectuée.--Résumé abrégé par UMI.

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Matteau, Jean-Pascal. "Développement d'une approche intégrée d'irrigation en production de pommes de terre." Doctoral thesis, Université Laval, 2021. http://hdl.handle.net/20.500.11794/69585.

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Abstract:

La rareté de la ressource en eau est maintenant reconnue comme une limitation critique à la progression de la production agricole des prochaines décennies. De plus, la demande de nourriture sera sujette à l'augmentation, alors qu'il est attendu que la population mondiale atteigne 8.6 milliards en 2030 et 9.8 milliards en 2050. La pomme de terre est la 4e culture la plus importante au monde derrière le blé, le maïs et le riz. Parmi ces cultures, la pomme de terre est la plus efficace en production de calorie par litre d'eau. Cependant, les rendements de pommes de terre sont reconnus comme sensibles aux manques d'eau. La pression exercée par la production agricole peut aussi compromettre la santé du sol en affectant divers indicateurs tels que la stabilité structurale du sol, la masse volumique, la conductivité hydraulique et le taux de carbone organique. Préserver la santé du sol est un enjeu critique afin de maintenir les services écosystémiques des sols comme la filtration et le stockage de l’eau, le cyclage des nutriments du sol et le stockage du carbone. L'objectif de cette thèse était de concevoir une approche d’irrigation intégrée appliquée à la production de pommes de terre qui permettrait une utilisation efficace de l'eau et l'atteinte de rendements optimaux tout en minimisant les externalités environnementales négatives de l'irrigation. Dans cette étude, les effets de la gestion de l'irrigation sur les rendements de différentes variétés de pommes de terre, sur l'efficacité d'utilisation de l'eau, sur la distribution des tubercules et sur la dynamique du carbone organique ont été analysés et temporalisé. Pour ce faire, six expériences en serre ont été menées à l'aide d’un système d’irrigation automatisé contrôlé à partir des données d’un réseau de tensiomètres. Dans les chapitres deux et trois, l’impact de seuil d'irrigation de précision a été évalué sur les rendements de quatre variétés ayant des classes de maturité différente (Envol : très hâtive, Kalmia : hâtive, Goldrush : mi-saison, et Red Maria : tardive). Une zone de confort hydrique optimale pour les plants de pommes de terre a été identifiée entre−10 et −24 kP a. Les seuils identifiés ne sont pas dépendants de la classe de maturité, de la hauteur des plants ou de la production potentielle de tubercule. Le seuil de −24 kP a est celui qui a permis d’atteindre des rendements maximaux tout en optimisant l’efficacité de l'utilisation de l’eau. Le temps passé dans la zone de confort a aussi été identifié comme critique pour le développement des rendements de la pomme de terre. L'analyse de l'effet temporel des seuils d'irrigation sur les rendements de pomme de terre effectuée dans le chapitre trois a aussi montré qu’une gestion précise de l'irrigation est nécessaire dès le stade du développement foliaire et qu'elle devrait être maintenue jusqu'à la maturité. Une gestion appropriée de l'irrigation a permis une augmentation des rendements entre 25 et 40%. L'impact de quatre seuils de potentiel matriciel (−10, −20, −30, et −45 kP a) sur la distribution spatiale des tubercules a été évalué à l'aide de la tomodensitométrie à rayonX (CT-scan) dans le chapitre quatre. Une relation linéaire entre les seuils d'irrigation et la profondeur des tubercules a été identifiée. Une gestion de l'irrigation à des seuils entre −20 et −30 kP a a permis une profondeur des tubercules optimale permettant une meilleure efficacité de récolte et limitant la prépondérance des maladies en surface. Les seuils de potentiel matriciel utilisé dans cette étude ont influencé le taux de décomposition du carbone organique du sol, évalué dans le chapitre cinq. Une décomposition plus élevée a été observée au seuil de −15 kP a. Les seuils d'irrigation se sont démarqués dans le second quart de la saison de croissance, aux stades d’initiation et de grossissement des tubercules, des stades à forte croissance et de fréquence d’irrigation accélérée. La création d’une approche de gestion de l'irrigation intégrée permettra au producteur de pommes de terre d’adapter leur gestion de l’eau à la ferme et d’intégrer des pratiques plus durables tout en atteignant des rendements plus élevés et une plus grande efficacité de l'utilisation de l'eau. L'amélioration de leur gestion de l'eau du sol pourrait aussi permettre d'optimiser la distribution spatiale des tubercules, d’augmenter l'efficacité de la récolte et de réduire la décomposition du carbone créant un système de culture qui favoriserait une meilleure conservation de la santé du sol.
Water scarcity is increasingly recognized as the most pressing limitation to improvement in agricultural production over the upcoming decades. It is expected that the world population will reach 8.6 billion by 2030 and 9.8 billion by 2050, increasing the demand for both food and agriculture production. Therefore, increasing overall water productivity is one of the most critical challenges of the twenty-first century. Potato isthe fourth most cultivated food crop behind wheat, maize, and rice. Among the major crops, potato is the most efficient in calory production by water liter, but potato yields are recognized as sensitive to water stress. Therefore, the precise control of the amount of irrigation water, water application timing, and prevailing micro-meteorological conditions are critical factors that influence the plant health and yield. However, the increasing pressure on agricultural systems can endanger soil health, as several soil health indicators are affected by agricultural production, like soil structural stability, bulk density, hydraulic conductivity, and soil organic carbon. Maintaining soil healthis critical to preserve soil ecosystemic functions like water infiltration, filtration andstorage, nutrient cycling, and carbon storage, impacting plants productivity, and wateruse efficiency. The objective of this thesis was to create an integrated irrigation approach for the potato crop, allowing optimal potato yield, water use efficiency, and minimizing the environmental impact of irrigation. Through six green house experiments using an automatic irrigation system managed using a soil sensors network, the effect of irrigation management on the potato varieties, potato yield, water use efficiency, tuber spatial distribution, and soil organic carbon dynamics has been analyzed and temporalized. The second and third chapters of this study evaluated the effect of precision irrigation thresholds on the potato yields of four varieties with different maturity classes (Envol: very early, Kalmia: early, Goldrush: mid-season, and Red Maria: mid-late). Anoptimal comfort zone between −10 and −24 kP a has been identified. The optimal irrigation thresholds identified were not dependant on maturity class, plant height, or tuber potential production. The −24 kP a is the precision irrigation threshold that allowed higher yields and water use efficiency. The time spent in the comfort zone was identified as critical for the potato yield. The analysis of the irrigation thresholds'temporal effect made in the third chapter showed that precise irrigation managementis needed early in the season and should be maintained throughout all the growingseason as the critical period identified corresponded to the leaf expansion and tuber initiation stage. An appropriate irrigation management of potato crops has been shownto increase yield by a 25 to 40% margin. The fourth chapter evaluated the impact of four soil matric potential (−10, −20, −30,and −45 kP a) on potato tubers’ spatial distribution using an X-ray CT scanner. Alinear relationship between irrigation thresholds and potato tuber depth was identified.The deepest tuber distribution was observed with the −10 kP a treatment. Potato irrigation management using a SMP threshold between −20 and −30 kP a could reduce the harvest depth. Reducing the harvest depth could decrease the negative impacts of soil disturbance on soil structural stability. In the −45 kP a treatment, the tubers were too close to the soil surface, which could lead to a greater preponderance of tuber diseases like late blight or greening. The precision irrigation threshold used in this study affected the decomposition rate of soil organic carbon, evaluated in the fifth chapter. Faster decomposition of labile organic carbon was promoted by water excess (−15 kP a). The dryer (−30, −45, and −60 kP a) precision irrigation thresholds did not show any differences. The difference between the precision irrigation thresholds was made in the second quarter of the growing season,between 38 and 53 days after planting. This critical period occurred in a stage of strong vegetative growth and rapid irrigation cycles, the tuber initiation and tuber bulking stages. The determination of an integrated irrigation management approach will allow potato growers to adapt their farm management processes to integrate more sustainable water management practices and to achieve higher yields and water use efficiency. Improving soil water management may also optimize tuber spatial distribution, enhance harvest efficiency, reduce greenhouse gas emissions, soil carbon degradation, and soil disturbance in the cropping systems to benefit global soil health conservation.

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LE, ROMANCER MARC. "La maladie des necroses annulaires superficielles des tubercules de la pomme de terre : identification et caracterisation de l'agent pathogene : le variant yntn du virus y de la pomme de terre." Rennes 1, 1993. http://www.theses.fr/1993REN10089.

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Abstract:

La maladie des necroses annulaires superficielles des tubercules est apparue recemment en europe. L'agent causal est un nouveau variant du pvy (pvy-ntn). Son aptitude a infecter capsicum annuum et chenopodium species, sa capacite a contourner ou a abaisser la resistance gouvernee par les genes ny-dms et ry-sto le differencient des autres biotypes de pvy. Le variant y-ntn induit une reaction d'hypersensibilite foliaire et tuberculaire en l'absence de gene specifique de resistance. L'absence de symptomes necrotiques tuberculaires est controlee chez l'hote par un gene dominant. Les sequences nucleotidiques et en acides amines de la region 3 terminale du genome viral presentent une variabilite qui permet de distinguer deux principaux groupes de souches de pvy. Ces groupes correspondent assez bien aux deux serotypes majeurs du pvy. Les methodes d'analyses genomique et serologique devraient permettre de mieux ordonner les differentes populations de pvy infeodees au tabac, au poivron, a la tomate et a la pomme de terre

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Cirou, Amélie. "Développement de stratégies d'anti-virulence ciblant la régulation quorum-sensing chez Pectobacterium atrosepticum, bactérie pathogène de la pomme de terre." Paris 11, 2010. http://www.theses.fr/2010PA112332.

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Abstract:

Chez Pectobacterium, l'expression des facteurs de virulence est contrôlée par la voie de régulation quorum-sensing (QS) qui implique la synthèse et la perception d'une molécule signal appelée N-acylhomosérine lactone (AHL). Ce projet de thèse a exploré une stratégie de lutte contre la virulence de P. Atrosepticum (Pca) avec pour cible la signalisation QS via les AHL. Cette approche consiste à stimuler la croissance de bactéries du sol qui dégradent naturellement les AHLs. Pour cela, 2 molécules naturelles et biodégradables, la γ-caprolactone (GCL) et la γ-heptalactone (GHL) ont été identifiées et permettent de stimuler la croissance de bactéries dégradant les AHLs au sein de consortia bactériens issus du sol. Les consortia bactériens activés en présence de GCL ou GHL présentent une activité de lutte biologique contre Pca lors d'essai sur tubercules de pomme de terre. Au sein de ces consortia, les bactéries dégradant les AHLs et assimilant la GCL et la GHL comme seules sources de carbone appartiennent majoritairement à l'espèce Rhodococcus erythropolis. L'activité biostimulante de la GCL et de la GHL a été testée en système hydroponique et en sol. Afin d'évaluer l'impact environnemental de l'application de GHL et GCL, des analyses globales de la structure des communautés bactériennes (méthodes DGGE et puces taxonomiques ciblant l'ADNr16S), ainsi que le suivi de la GCL et de la GHL introduites et de leurs produits de dégradation (méthode HPLC-MS) ont été réalisés. Pour optimiser ce procédé, le traitement GCL ou GHL a été couplé à l'introduction d'un isolat R. Erythropolis R138 choisi pour ses capacités à dégrader rapidement les signaux QS, croître sur la GCL et la GHL comme source de carbone, et bloquer l'émergence des symptômes induits par Pca
Ln Pectobacterium atrosepticum (Pca), the virulence on potato plants and tubers is modulated by quorum-sensing (QS). N-acylhomoserine lactones (AHL) are QS signal molecules in several phytopathogenic bacteria. This work presents an antivirulence strategy targeting QS, based on AHL degradation. This approach aims at stimulating the growth of bacteria that are naturally able to degrade AHLs. We identified 2 natural and biodegradable molecules, γ-caprolactone (GCL) and γ-heptalactone (GHL), structurally related to AHL, that exhibit such activity. We confirmed that the treated bacterial consortia had a biocontrol activity against P. Carotovorum in maceration assays of Solanum tuberosum tubers. These stimulated bacteria belong mainly to the Rhodococcus genera. Biostimulant activity was tested under hydroponic and soil culture conditions. To evaluate the environmental impact of GCL and GHL treatrnent, microbial diversity analyses (DGGE and taxonomic microarray) as well as the fate of GCL, GHL and their by-products (analysed by HPLC-MS) were investigate. Futhermore, to optimize biocontrol, GHL and GCL treatment were coupled with the inoculation of the strain R. Erythropolis R138 chosen for its ability to inactivated AHLs signal, to grow with GCL or GHL as sole carbon sources and to inhibit the maceration induced by Pca. This coupling process ensures an efficient treatment whatever the bacteria population diversity initially present in the rhizosphere. This strategy was first tested under hydroponic systems and validated on soil culture

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Hassane, Ramatou. "La production de pomme de terre et recompositions socio-économiques dans l'Imanan, Niger." Thesis, Toulouse 2, 2015. http://www.theses.fr/2015TOU20139/document.

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Abstract:

C'est en 1954 que les paysans de la commune rurale d’Imanan, située dans l’Ouest du Niger, ont commencé la pratique de la culture de pomme de terre. D’une simple culture d’appoint associée à d’autres spéculations, la production de pomme de terre fait partie intégrante des systèmes de productions locaux. C’est la principale stratégie adaptative des paysans de l’Imanan pour faire face aux crises alimentaires. Plusieurs facteurs d’ordres économique, social et politique, en lien étroit avec l’évolution et les événements locaux ont contribué à sa diffusion et à son expansion. Culture de rente tournée vers le marché, la pomme de terre permet aux exploitants d’accéder à des revenus contribuant fortement à la subsistance des ménages. Dans un contexte marqué par des différenciations économiques et sociales entre groupes sociaux, la production de pomme de terre, de par les revenus qu’elle procure aux paysans, favorisent l’autonomisation des groupes sociaux défavorisés dont les jeunes et les femmes. Mais seuls les exploitants qui peuvent mobiliser suffisamment de ressources financières peuvent rentabiliser la production. La différence des revenus que tirent les producteurs de la culture de la pomme de terre est notamment liée à l’accès de ceux-ci aux plants, à l’utilisation de la motopompe et à l’emploi d’une main d’œuvre agricole externe. Le manque d’organisation adéquate de la filière pomme de terre conjugué à la faiblesse des alternatives de financement ne permettent pas à certains producteurs de s’en passer des commerçants (Maï Gida) grossistes de la filière pomme de terre. Les producteurs sont contraints de vendre leurs produits aux commerçants du « Petit marché » de Niamey
It is in 1954 when the farmers of the rural district of Imanan, situated in the West of Niger, began the practice of the culture of potato. Of a simple culture of supplement associated with other speculations, the production of potato is an integral part local systems of productions. It is the main adaptive strategy of the farmers of the Imanan to face food crises. Several factors of economic, social and political orders, in narrow link with the evolution and the local events contributed to his distribution and to its expansion. Culture of pension was turned (shot) to the market; the potato allows the developers to reach income contributing strongly to the subsistence of the households (house works). In a context marked by economic and social differentiations between social groups, the production of potato, due to the income which she (it) gets to the farmers, favor the empowerment of the disadvantaged social groups among which the young people and the women. But only the developers who can mobilize enough financial resources can make profitable the production. The difference of the income which pull the producers of the culture of the potato is bound in particular to the access of these to plants, to use of the motor-pump and to employment of an external agricultural workforce. The lack of adequate organization of the sector apple of earth conjugated to the weakness of the alternatives of financing does not allow certain producers to take place storekeeper (Maï Gida) wholesalers of the sector potato. The producers are forced to sell their products to the storekeepers of the " Small market " of Niamey

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Badr, Ashraf. "In vitro and ex vitro potato plantlets (Solanum tuberosum) metabolic response to exogenously supplied sucrose : a metabolomic approach." Thesis, Université Laval, 2011. http://www.theses.ulaval.ca/2011/27937/27937.pdf.

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Ghomari, Fouad. "Matériau en terre crue compactée : amélioration de sa durabilité à l'eau." Lyon, INSA, 1989. http://www.theses.fr/1989ISAL0026.

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Abstract:

La prévision de la durabilité des constructions en béton de terre crue compactée reste jusqu'à présent sujet à controverse. Afin de mieux connaître les limites de ce matériau destiné à L'habitat, nous avons recherché des solutions propres à augmenter sa durée de vie en combinant L'action de bonnes conditions de mise en œuvre à celle de la protection des surfaces exposées aux intempéries. Le programme expérimental consiste à étudier au laboratoire, l'influence de la pression de compactage et de la teneur en eau sur les propriétés mécaniques (résistance à la compression) et de tenue à l'eau (test à la goutte d'eau) pour divers sols. Nous nous sommes également· intéressé à la protection de surface du béton de terre crue compactée par les produits d'imprégnation. Ces résultats sont analysés et comparés à ceux obtenus in situ sur des blocs traités en surface soumis aux conditions climatiques réelles.

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Lavieville, Laurence. "Étude de la microtubérisation in vitro de la Pomme de terre (Solanum tuberosum L. )." Amiens, 1991. http://www.theses.fr/1991AMIE0100.

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Abstract:

La microtubérisation de la Pomme de terre (variétés Bintje, Ténor, Dominor et Brettor) est effectuée à partir de boutures nodales prélevées sur des plantes axéniques cultivées à 24°C et sous une photopériode de 16 heures. Les conditions "standard" de tubérisation sont définies par le maintien des cultures réalisées en bocaux (20 ou 30 nœuds/bocal), à 19°C et à l'obscurité durant 5 semaines. L'influence de l'état physiologique des plantes mères sur la microtubérisation ultérieure est évaluée à partir d'une étude des milieux de multiplication, de l'origine des explants ou de l'âge des cultures. L'apport glucidique du milieu de tubérisation détermine la production de microtubercules qui ne peut être améliorée par l'addition d'autres composés. L'influence du rapport sucre/azote est mis en évidence. L'effet d'un éventuel pouvoir inducteur du saccharose est discuté. Une méthode, simple et rapide, est proposée pour la production massale de microtubercules. Après une phase primaire de multiplication durant 2 semaines, un milieu enrichi en saccharose (130 g/l) est ajouté aux cultures qui sont alors placées à l'obscurité. Les ratios obtenus sont proches de 1, et 85 à 95% des microtubercules présentent un diamètre supérieur à 5 mm. Un suivi de l'évolution des explants en condition de tubérisation est mené sur 92 jours. Une étude cytologique en microscopie photonique, a mis en évidence le "swelling" caractéristique de la tubérisation, et la présence d'amidon et de protéines dès le 4ème jour de culture. Des variations de taux de matière sèche et de teneurs en sucres (doses par HPLC) interviennent également au cours de la culture

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Clément, Chedzer-Clarc. "Lessivage des nitrates en fonction de la fertilisation azotée dans la pomme de terre irriguée et non irriguée au Québec." Doctoral thesis, Université Laval, 2021. http://hdl.handle.net/20.500.11794/69907.

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Abstract:

La gestion de l'azote (N) et de l'irrigation sont des facteurs importants affectant les pertes de N par lessivage de nitrates dans la production de pomme de terre (Solanum tuberosum L.) sur des sols à texture grossière. L'objectif de cette thèse était d'étudier l'effet de la fertilisation azotée (dose et source) sur le lessivage intra-saisonnier et la teneur en nitrates du sol (RSN) ainsi que le rendement total (TY) et commercialisable (MY) dans la pomme de terre irriguée et non-irriguée cultivée en sols sableux. Une expérience de 5 ans (2008-2012) et une autre de 3 ans (2013-2015) ont été menées pour comparer l’application de l’urée enrobée de polymères (PCU) à la plantation avec celle fractionnée d’engrais azotés solubles à plusieurs doses équivalentes. Les résultats ont montré que, lorsque les déficits en eau sont faibles durant la saison de croissance, il ne résulte aucun avantage à apporter de l’eau supplémentaire par irrigation. L'irrigation a augmenté le lessivage intra-saisonnier des nitrates de 52%, mais n'a eu aucun effet sur le TY et le MY. Les rendements total et commercialisable n’ont pas répondu à la fertilisation azotée en raison d’un apport élevé en N du sol. Cependant, l’augmentation de la dose de N a entrainé une augmentation du lessivage intra-saisonnier de nitrates et du RSN. À doses équivalentes, l’apport du PCU a produit un TY et MY similaires par rapport à l’apport fractionné d’engrais conventionnels solubles. Les résultats ont montré que l'efficacité du PCU pour réduire le lessivage intra-saisonnier variait en fonction de la distribution des précipitations et de la période d'irrigation en raison des caractéristiques de libération de l’azote. L’apport du PCU au moment de la plantation était efficace pour réduire le lessivage intra-saisonnier lorsque les précipitations étaient élevées entre la plantation et le buttage. Le mélange PCU + urée appliqué à la plantation a entrainé une réduction du TY et du MY par rapport au PCU et aux engrais conventionnels solubles en raison d'une croissance végétative excessive et d’un retard dans l'initiation des tubercules. Par ailleurs, à doses équivalentes, le PCU+urée a augmenté le lessivage intra-saisonnier des nitrates en comparaison au PCU et aux engrais solubles appliqués. Les résultats ont aussi montré que le RSN était un bon indice du potentiel de lessivage post-récolte des nitrates dans la pomme de terre. Les pertes de N après la saison de croissance étaient plus élevées lorsque le RSN mesuré à l’automne était élevé. Le PCU+urée a été introduit dans le but de diminuer le risque de lessivage post-récolte lié à l’application du PCU. Toutefois, les résultats ont indiqué que l’application du PCU à la plantation, seul ou mélangé avec un engrais soluble, augmentait le risque de lessivage post-récolte par rapport aux engrais solubles. Globalement, les résultats de cette thèse suggèrent que la réduction de la dose de N est plus importante que le choix de la source de N pour minimiser le lessivage des nitrates.
Nitrogen (N) management and irrigation are important factors affecting yield and N losses through nitrate-N (NO3-N) leaching in potato (Solanum tuberosum L.) production on sandy soils. The objective of this thesis was to investigate the effect of N fertilization (rate and source) on total (TY) and marketable (MY) yields, in-season NO3-N leaching, and residual soil NO3-N (RSN) for potatoes grown on sandy soils under two irrigation regimes (irrigated and non-irrigated). Two field experiments were conducted to compare split-applied conventional soluble N fertilizers (ammonium sulfate, ammonium nitrate, and calcium ammonium nitrate) and polymer-coated urea (PCU) products at several N rates during five (2008-2012) and three (2013-2015) years, respectively. The results showed that there was no benefit from additional water by irrigation when water deficits were low. Irrigation increased in-season NO3-N leaching by 52% but had no effect on TY and MY. Results from the 3-year field experiment showed that TY and MY response to N fertilization were not significant when soil N supplied by soil N mineralization was high. However, increasing the fertilizer N rate increased in-season NO3-N leaching and RSN. A single application of PCU resulted in similar TY and MY as split-applied conventional soluble N fertilizers at equivalent N rates. Results from both field experiments suggest that the potential of PCU to reduce in-season NO3-N leaching may vary according to rainfall distribution and irrigation timing due to the N-release characteristics of the PCU. Application of PCU at planting was an effective strategy to reduce in-season NO3-N leaching when there was significant rainfall during the period between planting and hilling. The results also indicated that PCU+urea applied at planting may reduce TY and MY compared to PCU and conventional soluble N fertilizers due to excessive vegetative growth and delayed tuber initiation. Furthermore, PCU+urea increased in-season NO3-N leaching relative to PCU and conventional soluble N fertilizers applied at equivalent N rates. Residual soil NO3-N was an effective index of the potential soil NO3-N losses in the non-growing season, as overwinter NO3-N losses were generally higher with greater RSN. The results indicated that a single application of PCU, alone or mixed with a conventional soluble N fertilizer at planting increases the risk of NO3-N leaching in the non- growing season in comparison to conventional soluble N fertilizers. The overall results suggest that reducing the fertilizer N rate is more important than the choice of N sources to minimize NO3-N leaching from potato production.

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Courteau, Mireille. "Purification des protéases extracellulaires de Streptomyces caviscabiesEF 87, associé à la gale profonde de la pomme de terre." Sherbrooke : Université de Sherbrooke, 1997.

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Turk, Mohammad. "Vers une amélioration du procédé industriel d'extraction des fractions solubles de pomme à l'aide de technologies électriques." Compiègne, 2010. http://www.theses.fr/2010COMP1908.

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Abstract:

L'introduction des champs électriques pulsés à l'échelle industrielle pour la transformation de la pomme en jus repose sur une amélioration de nos connaissances des effets de cette technologie sur la qualité biochimique des jus, les bénéfices quantitatifs et énergétiques. Les essais à l'échelle laboratoire ont permis de mieux décrire l'effet du traitement CEP et du degré de fragmentation sur le rendement d'extraction et la composition des oses simples (fructose, glucose), de l'acide malique et des polyphénols natifs des jus. Nous avons montré que le traitement électrique accentue l'oxydation de ces derniers par la polyphénoloxydase si des mesures de protection n'ont pas été prises pour prévenir les réactions enzymatiques. Nous avons établi une méthodologie d'essai à l'échelle pilote et industrielle de traitement CEP combiné à un pressage continu. Un traitement de faible intensité (E = 650 V/cm) à 4,5 t/h améliore le rendement d'extraction (Y = 5,1 %) du pur jus de pomme par pressage et augmente la matière sèche du marc. La consommation énergétique du traitement électrique (mesurée sur le secteur = 3,5 W. H/kg râpure) est inférieure à l'économie d'énergie réalisée lors du séchage du marc (12,1 W. H/kg râpure). Enfin, l'investissement dans un pilote CEP à l'échelle industrielle est rentable. En effet, le délai de récupération de l'investissement est inférieur à deux ans. Le jus de pomme issu d'un traitement CEP a gardé tous ses attributs qualitatifs. L'analyse sensorielle réalisée par un panel expert a montré une meilleure perception des jus traités électriquement par rapport à un jus non traité. Dans ce travail, nous avons mis au point un nouveau procédé d'extraction par diffusion aqueuse des composés phénoliques de l'épiderme de la pomme par différentes électrotechnologies. Ce procédé a permis un rendement d'extraction en polyphénols natifs supérieur et un temps de diffusion plus court comparé à une extraction classique par solvant hydroalcoolique
Introducing Pulsed Electric Field (PEF) to an industrial scale for apple juice processing needed to improve our knowledge about the effects of this technology on the biochemical quality of juice, the quantitative and the energetic benefits. At the laboratory scale, tests have allowed to better describe the effect of the electric treatment and the degree of fragmentation on the extraction yield and composition of simple sugars (fructose, glucose), malic acid and native polyphenols in juices. We have shown that the electric treatment enhances the oxidation of the phenolic compounds by the polyphenoloxidase when protective measures are not taken against the enzymatic reactions. We established a testing methodology on a pilot scale and industrial treatment combining continuous PEF treatment and apple expression. Low intensity treatment (E = 650 V / cm) at a flow rate of 4. 5 t / h improved the extraction yield (Y = 5. 1%) of apple juice by pressing and increased the dry matter of the pomace. The energy consumption of electric treatment (3. 5 W. H/kg mash) was lower compared to the unconsumed energy during pomace drying (12. 1 W. H/kg mash). Finally investing in a pilot at industrial scale should be profitable. Indeed, the payback period of investment is estimated at less than two years. Apple juice from a PEF treatment kept all its qualitative attributes. The sensory analysis carried out by an expert panel showed a better perception of electrically treated juices compared to control juices. In this work, we developed a novel method of extraction by aqueous diffusion of phenolic compounds, in the epidermis of the apple, by various electrotechnologies. This method showed a higher extraction yield of native polyphenols and a shorter diffusion time compared to conventional extraction with alcoholic solvent

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Lapointe, Claude. "Impact des pratiques agronomiques sur les rendements et la qualité de la pomme de terre." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 1997. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk3/ftp04/mq25641.pdf.

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Dubois, Amaury. "Optimisation et apprentissage de modèles biologiques : application à lirrigation [sic l'irrigation] de pomme de terre." Thesis, Littoral, 2020. http://www.theses.fr/2020DUNK0560.

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Abstract:

Le sujet de la thèse porte sur une des thématiques du LISIC : la modélisation et la simulation de systèmes complexes, ainsi que sur l'optimisation et l'apprentissage automatique pour l'agronomie. Les objectifs de la thèse sont de répondre aux questions de pilotage de l'irrigation de la culture de pomme de terre par le développement d'outils d'aide à la décision à destination des exploitants agricoles. Le choix de cette culture est motivé par sa part importante dans la région des Hauts-de-France. Le manuscrit s'articule en 3 parties. La première partie traite de l'optimisation continue mutlimodale dans un contexte de boîte noire. Il en suit une présentation d'une méthodologie d'étalonnage automatique de paramètres de modèle biologique grâce à une reformulation en un problème d'optimisation continue mono-objectif multimodale de type boîte noire. La pertinence de l'utilisation de l'analyse inverse comme méthodologie de paramétrage automatique de modèles de grandes dimensions est ensuite démontrée. La deuxième partie présente 2 nouveaux algorithmes UCB Random with Decreasing Step-size et UCT Random with Decreasing Step-size. Ce sont des algorithmes d'optimisation continue multimodale boîte noire dont le choix de la position initiale des individus est assisté par un algorithmes d'apprentissage par renforcement. Les résultats montrent que ces algorithmes possèdent de meilleures performances que les algorithmes état de l'art Quasi Random with Decreasing Step-size. Enfin, la dernière partie est focalisée sur les principes et les méthodes d'apprentissage automatique (machine learning). Une reformulation du problème de la prédiction à une semaine de la teneur en eau dans le sol en un problème d'apprentissage supervisé a permis le développement d'un nouvel outil d'aide à la décision pour répondre à la problématique du pilotage des cultures
The subject of this PhD concerns one of the LISIC themes : modelling and simulation of complex systems, as well as optimization and automatic learning for agronomy. The objectives of the thesis are to answer the questions of irrigation management of the potato crop and the development of decision support tools for farmers. The choice of this crop is motivated by its important share in the Haut-de-France region. The manuscript is divided into 3 parts. The first part deals with continuous multimodal optimization in a black box context. This is followed by a presentation of a methodology for the automatic calibration of biological model parameters through reformulation into a black box multimodal optimization problem. The relevance of the use of inverse analysis as a methodology for automatic parameterisation of large models in then demonstrated. The second part presents 2 new algorithms, UCB Random with Decreasing Step-size and UCT Random with Decreasing Step-size. Thes algorithms are designed for continuous multimodal black-box optimization whose choice of the position of the initial local search is assisted by a reinforcement learning algorithms. The results show that these algorithms have better performance than (Quasi) Random with Decreasing Step-size algorithms. Finally, the last part focuses on machine learning principles and methods. A reformulation of the problem of predicting soil water content at one-week intervals into a supervised learning problem has enabled the development of a new decision support tool to respond to the problem of crop management

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Munger, Aurélie, and Aurélie Munger. "Induction et stabilisation de protéines endogènes chez la pomme de terre exprimant une cystatine recombinante." Master's thesis, Université Laval, 2015. http://hdl.handle.net/20.500.11794/26550.

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Abstract:

Tableau d'honneur de la Faculté des études supérieures et postdorales, 2015-2016
Tableau d'honneur de la Faculté des études supérieures et postdorales, 2015-2016
Des cystatines recombinantes employées en phytoprotection dans des variétés végétales transgéniques ont été étudiées pour les effets d’interférence métabolique qu’elles causaient dans la plante hôte. L’objectif de ce projet était d’évaluer ces effets pléiotropiques à l’aide de lignées de pommes de terre (Solanum tuberosum) exprimant des cystatines de céréales de façon constitutive dans l’ensemble des tissus de la plante. Nos résultats ont montré que la cystatine du maïs CCII induit, dans les feuilles, une activation de protéines endogènes reliées au stress, conférant notamment un effet protecteur contre le champignon Botrytis cinerea. La cystatine du riz OCI, exprimée dans les tubercules transgéniques, a engendré un délai de leur germination et une préservation des principaux nutriments en période d’entreposage. En somme, nos lignées de pommes de terre exprimant une cystatine recombinante démontrent des effets d’interférence métabolique à valeur agronomique éventuellement intéressante.
Des cystatines recombinantes employées en phytoprotection dans des variétés végétales transgéniques ont été étudiées pour les effets d’interférence métabolique qu’elles causaient dans la plante hôte. L’objectif de ce projet était d’évaluer ces effets pléiotropiques à l’aide de lignées de pommes de terre (Solanum tuberosum) exprimant des cystatines de céréales de façon constitutive dans l’ensemble des tissus de la plante. Nos résultats ont montré que la cystatine du maïs CCII induit, dans les feuilles, une activation de protéines endogènes reliées au stress, conférant notamment un effet protecteur contre le champignon Botrytis cinerea. La cystatine du riz OCI, exprimée dans les tubercules transgéniques, a engendré un délai de leur germination et une préservation des principaux nutriments en période d’entreposage. En somme, nos lignées de pommes de terre exprimant une cystatine recombinante démontrent des effets d’interférence métabolique à valeur agronomique éventuellement intéressante.

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Coulibali, Zonlehoua. "Modèle de fertilisation NPK localisé de la pomme de terre (Solanum tuberosum L.) au Québec." Doctoral thesis, Université Laval, 2020. http://hdl.handle.net/20.500.11794/66697.

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Abstract:

Les cultures à haute valeur ajoutée comme la pomme de terre (Solanum tuberosum L.), sont de bons candidats pour l'adoption de l'agriculture de précision en raison des coûts de production particulièrement élevés. Les quantités de fertilisants requises alimentent le défi permanent de la recherche de l’optimisation de fertilisation spécifique à chaque agroécosystème. La modélisation fournit une trousse d’outils pour l’aide à la décision. En ce qui concerne la fertilisation, le rendement est habituellement relié à des doses variables d’un fertilisant à l'aide de fonctions simples(quadratique, linéaire ou linéaire-quadratique,Mitscherlich ou autres). Même si ces fonctions ne devraient être utilisées que pour décrire le comportement des données expérimentales, elles ont été largement utilisées pour prédire les doses optimales de fertilisants. Ce projet de recherche a proposé un modèle de recommandation des doses optimales d’azote (N), de phosphore (P) et de potassium (K)pour la culture de pomme de terre en exploitant les techniques d’autoapprentissage. Dans une première partie, il a d’abord été question de regrouper les cultivars sur la base de la composition chimique de la feuille diagnostique en utilisant une classification non supervisée. Ce regroupement a permis de montrer que les cultivars étudiés sont associés à une composition ionomique spécifique. Ensuite, dans une perspective de prédiction de catégories de rendement en fonction de la composition foliaire, les algorithmes des k plus proches voisins (KNN), des forêts aléatoires (RF) et des machines à vecteurs de supports(SVM) ont montré un potentiel de diagnostic acceptable, avec une précision de 70 %,pour détecter un déséquilibre nutritionnel en cours de saison. Enfin, le vecteur de perturbation de l’espace de composition d’Aitchison pourrait être un bon indicateur pour détecter la présence et l’ampleur d’un déséquilibre nutritionnel en cours de saison. Dans la deuxième partie, les modèles d’autoapprentissage utilisant les algorithmes des KNN,des RF, des réseaux neuronaux (NN) et des processus gaussiens (PG), ont prédit le rendement et le poids spécifique en fonction des conditions expérimentales de façon pratiquement similaire avec des coefficients de détermination (R²) supérieurs à celui du modèle de Mitscherlich. Les R² étaient de 0,52 pour les KNN, de 0,59 pour les RF, de 0,49 pour les NN, de 0,58 pour les PG et de 0,37 pour le modèle de Mitscherlich. Les R² des modèles de prédiction de la balance des tubercules de taille moyenne (R² = 0,60 –0,69) et du poids spécifique (R² = 0,58 – 0,67) étaient plus élevés comparés aux R² de la balance des tubercules de grande taille (R² = 0,55 – 0,64) et du rendement vendable. Des dissemblances importantes sont apparues entre les modèles dans le rendu des courbes de réponse et la prédiction des doses agroéconomiques optimales de N, P et K. C'est prédictions étaient spécifiques au site. Les processus gaussiens étaient plus appropriés en raison de leur capacité d’élaborer des surfaces de réponse lisses et des recommandations probabilistes.
High-value crops, like potato (Solanum tuberosumL.), are good candidates for the adoption of Precision Agriculture because of the high cost of inputs.The large amount of potato fertilizers requirement makes it economically and environmentally important for producers to determinate site-specific fertilizers dosages. Crop performance responses to fertilizer inputs have yet been modeled using simple functions like quadratic, linear-plateau or Mitscherlich. Even though they should only be used to describe experimental data, such models are used to predict optimal fertilizer doses considering the cost of the fertilizer and crop sales. As large amounts of data are being assembled in repeated observational data sets, machine learning models can become useful to predict and detect patterns in data without hardly presuming how a response curve should behave.This project generated models recommending optimal economic doses of nitrogen (N), phosphorus (P) and potassium (K) for potato crops using machine learning techniques. We assessed the validity of cultivar grouping as new predictive feature, and predicted potato tuber yields using foliar ionomes. A density-based clustering algorithm (dbscan) failed to delineate groups of high-yield cultivars linked to specific cultivar ionomic composition. Algorithms of k-nearest neighbors (KNN), random forests (RF) and support vector machines (SVM) showed a fair diagnostic potential to detect in-season nutritional imbalance, with practically similar accuracy of 70%. The perturbation vector of Aitchison compositional space appeared a good indicator indetecting the presence and magnitude of a nutritional imbalance. Moreover, machine-learning models using KNN, RF, neural networks (NN) and Gaussian processes (GP) algorithms returned almost similar coefficients of determination (R²) superior to that of the Mitscherlich model. The R² values were 0.52, 0.59, 0.49 and 0.58 respectively for the KNN, RF, ANN,and GP, and 0.37 with the Mitscherlich model to predict marketable yield.The models were somewhat more efficient to predict medium-size tubers (R²= 0.60–0.69) and tuber specific gravity (R²= 0.58–0.67) than large-size tubers (R²= 0.55–0.64) and marketable yield. Disagreements appeared between models in site-specific response curves and optimal economic or agronomic N, P, and K doses prediction. However, GP models stood up as the most promising algorithm due to its built-in ability to develop smooth response surfaces and recommendations within a probabilistic risk-assessment framework.

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Buitenhuis, Rosemarije. "A comparative study of the life history and foraging behaviour of aphid hyperparasitoids." Doctoral thesis, Québec : Université Laval, 2004. http://www.theses.ulaval.ca/2004/21436/21436.pdf.

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Boquel, Sébastien. "Propension vectorielle des pucerons dans l’épidémiologie du virus Y (PVY) en culture de pommes de terre." Amiens, 2011. http://www.theses.fr/2011AMIE0107.

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Abstract:

Le virus Y de la pomme de terre (PVY) est un virus transmis par les pucerons sur le mode non-persistant, capable d’infecter de nombreuses espèces végétales. Un diagnostic conduit en 2006 en région Picardie a montré que 80 à 90 % des pucerons piégés dans les parcelles de pommes de terre correspondaient à des espèces non inféodées à cette plante. Dans ce contexte, l’objectif général de la thèse a été d’évaluer les capacités de différentes espèces de pucerons colonisatrices (Myzus persicae, Macrosiphum euphorbiae) ou non colonisatrices (Aphis fabae, Brevicoryne brassicae, Sitobion avenae, Acyrtosiphon pisum et Rhopalosiphum padi) de la pomme de terre à transmettre le PVY à cette plante. Pour chaque espèce, l’activité vectorielle correspondant aux comportements adaptés à la vection du phytovirus (comportement alimentaire et locomoteur) et l’efficacité vectorielle correspondant à la capacité à acquérir et inoculer le virus à une plante ont été déterminées. L’étude de l’activité vectorielle montre que chez les espèces colonisatrices de la pomme de terre, les individus aptères issus de la colonisation des ailés présentent un comportement sédentaire et que les potentialités de dispersion des ailés sont plus élevées chez M. Persicae que chez M. Euphorbiae. Ces deux espèces ne réalisent pas de déplacements de plantes en plantes contrairement aux pucerons non colonisateurs. L’étude du comportement alimentaire via la technique d’électropénétrographie (EPG) révèle que toutes les espèces réalisent des piqûres intracellulaires nécessaires à l'acquisition et à la transmission du virus. Par ailleurs, l’état infectieux de la plante est susceptible de moduler l’activité vectorielle des pucerons entraînant une forte répercussion dans la dissémination du virus. L'infection d'une plante par le PVY induit un effet phagostimulant chez M. Persicae et S. Avenae et anti-appétant chez M. Euphorbiae, A. Fabae et B. Brassicae. D’autre part, nous avons également mis en évidence une incapacité de ces espèces à discriminer entre une plante saine et une plante infectée par le PVY. L’étude de l’efficacité vectorielle a été mise en œuvre suivant une méthodologie originale, impliquant l'utilisation de vitroplants et la prise en compte de la période d’acquisition du virus, variable suivant les espèces. Les résultats révèlent des taux de transmission élevés pour les pucerons colonisateurs (83 % pour M. Persicae et 27 % pour M. Euphorbiae), moyens à faibles pour A. Pisum, B. Brassicae et S. Avenae (< 20%) et nuls pour A. Fabae et R. Padi. Malgré les taux de transmission élevés observés pour les espèces colonisatrices, leur influence dans le processus épidémiologique du PVY pourrait être surestimée en raison de leur comportement sédentaire. En revanche, certaines espèces non colonisatrices, notamment A. Pisum, B. Brassicae et S. Avenae, présentent une activité vectorielle très favorable à la dissémination du virus et leurs fortes densités de population en parcelles de pommes de terre pourraient compenser leurs plus faibles efficacités vectorielles. Ces travaux soulignant le rôle potentiel des espèces non colonisatrices apportent un nouvel éclairage sur la compréhension des mécanismes régissant la dynamique épidémiologique du PVY
Potato virus Y (PVY) is a phytovirus transmitted in a non-persistent fashion by aphid vectors to a broad range of plants. A diagnosis carried out in 2006 in Picardy showed that 80 to 90 % of aphids trapped in potato fields corresponded to non-colonizing potato aphids. Thus, the main aim of this thesis was to evaluate the ability of different aphid species to transmit PVY to potato plants, whether they were potato colonizing aphids (Myzus persicae and Macrosiphum euphorbiae) or not (Aphis fabae, Brevicoryne brassicae, Sitobion avenae, Acyrtosiphon pisum et Rhopalosiphum padi). For each aphid species, vector activity, corresponding to the behavioural component (feeding and locomotion behaviour) involved in the spreading of phytoviruses and vector efficiency, corresponding to its ability to acquire and inoculate viruses, were determined. The vector activity study showed that in potato colonizing aphids, apterous individuals, born from colonizing alates, exhibit a sedentary behaviour and that alate dispersal ability is higher in M. Persicae than in M. Euphorbiae. Both colonizing species did not realize interplant movements contrary to non-colonizing ones. Through the electrical penetration graph (EPG) technique, the feeding behaviour study revealed that all species performed the intracellular punctures necessary for virus acquisition and inoculation. The infection status of the plant can modulate aphid vector activity and therefore can strongly impact on the PVY spreading. PVY-infected plants induced a phagostimulant effect on M. Persicae and S. Avenae, and a deterrent one in M. Euphorbiae, A. Fabae and B. Brassicae. Furthermore, dual choice bioassays revealed that all the aphid species tested were unable to discriminate between a healthy and a PVY-infected plant. The vector efficiency study was set up according to a novel methodology that involved the use of in vitro plants and the determination of different virus acquisition periods depending on the aphid species considered. Results showed high transmission rates for potato colonizing aphids (83 % for M. Persicae and 27 % for M. Euphorbiae), a medium to low rate for A. Pisum, B. Brassicae and S. Avenae (< 20 %) and no transmission for A. Fabae and R. Padi. Despite the high transmission rates observed for colonizing aphid species, their involvement in PVY epidemiology may be overestimated due to their sedentary behaviour. By contrast, some non-colonizing species, notably A. Pisum, B. Brassicae and S. Avenae, exhibited a vector activity favouring the spread of viruses and their high population densities in potato fields may compensate for their lower vector efficiency. This work highlights the potential role of non-colonizing potato aphid species and brings new insights into our understanding of the mechanisms governing the PVY epidemiological dynamics

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Rolland, Mathieu. "Impact de la capacité nécrogène sur la valeur adaptative du virus Y de la pomme de terre." Rennes, Agrocampus Ouest, 2008. http://www.theses.fr/2008NSARA061.

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Abstract:

Le virus Y de la pomme de terre (PVY, genre Potyvirus), transmis par puceron selon le mode non persistant, est l’un des virus les plus dommageables sur pomme de terre. Les populations naturelles de PVY ont récemment évolué et contiennent une proportion croissante d’isolats nécrogènes (PVYN) particulièrement dommageables. Afin d’améliorer les procédures de contrôle sanitaire, un nouvel outil de détection et de caractérisation des génotypes de PVY a été développé. Pour la première fois, cet outil basé sur la technique SNaPshot, cible des déterminants moléculaires liés à la capacité nécrogène du PVY (Polymorphismes A/G2213 et AC2271) Cet outil innovant i) assure la caractérisation des isolats de PVY sur la base de leur capacité à induire des nécroses, ii) permet la caractérisation des génomes viraux en groupes (PVYo, PVYN) comme en sous-groupes (PVYNTN, PVYN –W) en infection simple ou double et iii) est associé à un seuil de détection particulièrement bas de 10 copies. Afin de comprendre les données épidémiologiques observées, l’impact de l’acquisiation de la capacité nécrogène sur la valeur adaptative du virus a été mesurée. Des isolats naturels ainsi que trois génotypes mutés aux positions 2213 et/ou 2271, ont été utilisés. Cette étude a été conduite au cours d’infections simples, de compétitions entre génotypes viraux, de passages en séries et de transmissions aphidiennes. Les résultats acquis lors de ces expérimentations mettent en évidence i) une plus faible valeur adaptative associée à la capacité nécrogène, ii) un effet fort du fond génétique viral, le génome de l’isolat PVYN-605 étant associé à une plus forte compétitivité que celui de PVYo-139, iii) l’existence d’interactions entre nucléotiques 2213 et 2271 et le fond génétique viral, iv) des effets de compensation hôte dépendants entre les impacts de ces deux facteurs
Potato virus Y (PVY, genus Potyvirus) is transmitted by aphids in a non persistent manner. This constituted by an increasing proportion of the especially damaging necrotic isolates (PVYN). To improve sanitary selection procedures, a new tool allowing the detection and characterisation of PVY genotypes has been developed. For the first time, this tool, based on SNaPshot technology, targelets molecular determinants involved in PVY necrotic ability (polymorphisms A/G2213 and A/C2271). This innovative tool i) allows the characterisations of PVY isolates according to their ability to induce necrosis, ii) allows the characterisation of viral genomes in groups (PVYo, PVYN) and sub-groupes (PVY NTN, PVYN-W) in single or dual interactions and iii) has an especially low detection threshold (10 copies). For a better comprehension of the mechanisms which have led to the epidemiological observations, the impact of the necrotic ability of PVY fitness has been measured. Two isolates and three genotypes mutated at position 2213 and/or 2271 have been used. Experiments were performed during single and mixed infections, serial passages and aphid inoculations. Obtained results show i) a cost of necrosis property of fitness, ii) a serial passages and aphid inoculations. Obtained results show i) a cost of necrosis property on fitness, ii) a serial passages and aphid inoculations. Obtained results show i) a cost of necrosis property on fitness, ii) a major role ov viral genetic background, PVYN-605 genome being associated to a higher competitiveness than major role of viral genetic background, PVY N-605 genome being associated to a higher competitiveness than PVYo-139, iii) interactions between nucleotides 2213 and 2271, and viral genetic background, iv) host dependant compensatory effects between these two factors

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Sene, Ndiaga. "Implication du métabolisme azoté dans la relation plante-insecte : étude des fluctuations des enzymes glutamine synthétase (GS) et glutamate déshydrogénase (GDH) chez le couple Solanum tuberosum-Myzus persicae." Amiens, 2009. http://www.theses.fr/2009AMIE0119.

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Abstract:

Myzus persicae l’un des ravageurs des cultures de pomme de terre, s’alimente exclusivement aux dépens du compartiment phloémien des végétaux. Le phloème est la voie principale pour la translocation à distance des photoassimilats et sa sève est riche en sucres et particulièrement en saccharose. La sève élaborée est composée aussi de nombreux acides aminés libres dont les concentrations relatives sont fortement déséquilibrées avec en particulier une faible proportion d’acides aminés essentiels. Nous avons, dans un premier temps, montré une augmentation des activités enzymatiques de la Glutamine synthétase (GS) et de la Glutamate déshydrogénase (GDH) au cours du développement qui est confirmée par des westerns-blots et des études immunohistochimiques montrant une présence quasi exclusive des protéines GS1 et GDH dans les cellules compagnes de phloème. A la suite de l’étude du statut de ces enzymes à l’échelle de la plante et au cours du développement, nous avons montré un réel effet de l’infestation par Myzus persicae sur la GS et la GDH qui sont deux des enzymes clés impliquées probablement dans la synthèse des acides aminés et dans le contrôle de la réorientation fine des métabolismes carboné et azoté. L’induction de ces enzymes est uniquement locale comparée aux changements observés des métabolites qui sont affectés aussi bien au niveau locale que systémique. L’ensemble des changements induits par les pucerons laisse penser qu’ils sont capables de modifier la composition nutritionnelle du phloème à leur profit en vue d’une augmentation qualitative et quantitative en acides aminés. Nos observations montrent également qu’une altération du métabolisme azoté, induite par transgénèse ou mutagenèse, a un effet net sur le comportement alimentaire des aphides étudiés
Myzus persicae which is one of the potato cultures devastators, feeds exclusively on plants phloem compartment. The phloem is the main route for the long-distance transport of photoassimilates and its sap is rich in sugars, particularly, in sucrose. The elaborated phloem sap is also composed of numerous free amino acids, and the relative concentrations of those are strongly unbalanced, which concerns, in particular, a small proportion of essential amino acids. At first, we have shown an increase in the enzymatic activities of the glutamine synthetase (GS) and the glutamate dehydrogenase (GDH) during the plant development, which has been confirmed by the western-blots and immunohistochemical study. The latter has shown the almost exclusive presence of the GS1 and GDH proteins in phloem companion cells. A study of these enzymes status on the scale of the plant and during plant development has shown a real effect of M. Persicae infection on the GS and GDH, which are two key enzymes probably involved in amino acids synthesis and in the control of fine reorientation of carbon and nitrogenous metabolisms. The induction of these enzymes appears only on the local level as compared to the observed changes of metabolites which are affected on both local and systematic levels. All changes inducted by the aphids suggest that the aphids are able to modify the nutritional composition of phloem in order to gain in qualitative and quantitive increase in amino acids. Our observations have also shown that the change in nitrogenous metabolism, inducted by transgenesis or mutagenesis, has a clear effect on the alimentary habits of the studied aphids

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Kotchi, Serge Olivier. "Détection du stress hydrique par thermographie infrarouge : application à la culture de la pomme de terre." Thesis, Université Laval, 2004. http://www.theses.ulaval.ca/2004/22198/22198.pdf.

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Le déficit hydrique affecte plusieurs variables physiologiques de la plante et est synonyme de baisse de rendement et de qualité pour des végétaux de grande culture tels que la pomme de terre. Dès lors, l’irrigation devient une solution préconisée. Celle-ci doit cependant permettre d’appliquer seulement la quantité d’eau dont la plante a besoin pour éviter le lessivage des fertilisants et pesticides pouvant contaminer la nappe phréatique. Depuis plus de vingt ans, la télédétection infrarouge thermique a permis de développer plusieurs outils de détection du stress hydrique. À travers des indices alliant des capteurs et des modèles tels que le CWSI (Crop Water Stress Index), la télédétection est utilisée pour répondre au besoin de dosage contrôlé des nouvelles pratiques agricoles et assurer une meilleure gestion de l’irrigation. Du fait des portions de sol visibles, les cultures partiellement couvrantes peuvent engendrer des erreurs d’estimation dans l’utilisation de ces indices. L’utilisation de radiomètre imageur allié à l’imagerie visible permet de palier à cette faiblesse. Le but de nos travaux est le développement d’un indicateur de l’état hydrique de la culture, accessible par thermographie infrarouge, permettant la détection précoce et la prévention du stress hydrique. Des mesures de température ont été effectuées en serre sur deux variétés de pomme de terre avec le radiomètre imageur ThermaCAM SC 2000. Des mesures répétées ont été prises sur des plants induits en stress hydrique et des plants témoins à plusieurs stades de développement de la culture. L’étude a montré une détection hâtive du déficit hydrique par thermographie infrarouge ainsi que l’influence du stress sur les variables biophysiques (température foliaire, surface foliaire, photosynthèse et conductance stomatique) et le rendement. La différence de température entre le couvert végétal et l’air (Tc – Ta) est fortement corrélée au stress hydrique. Elle a été associée à la surface foliaire pour développer l’Indice de Stress Hydrique Surfacique (ISHS). Les résultats obtenus avec l’ISHS pour la détection du stress hydrique sont très encourageants.
Water stress affect the yield and the crop quality. For more than twenty years, remote sensing allowed several tools developments to assess water stress detection using sensors and model such as Crop Water Stress Index (CWSI). Sparse crop can generate error in the interpretation of this index. The use of an imaging-radiometer combined to a high spatial resolution visible image help to remove this weakness. This study present a new water stress index based in the use of infrared thermography. A first dataset was taken from greenhouse experimental set up on potatoes species (Highlite and Chieftain) using an hand-held imaging-radiometer (ThermaCAM SC 2000). Repeated measurements were made for water-stress induced plants and for well irrigated plants at different growing stages. The study showed that an early detection of water deficit by infrared thermography is possible as well as the detection of the significant response of plant to heat stress and leaf area change based on water stress intensity. Temperature differences between crop canopy and air (Tc - Ta) are strongly correlated with the water stress. The study has permitted the development of a new index named Area Water Stress Index (AWSI) and the results obtained with this index for water stress detection are very encouraging.

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Beaulieu, Rémi. "Synthèse d’analogues de glycoalcaloïdes aux propriétés aphicides, valorisation des coproduits industriels de la pomme de terre." Amiens, 2012. http://www.theses.fr/2012AMIE0111.

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Abstract:

La gestion des coproduits industriels représente un enjeu environnemental, économique et réglementaire majeur. Le développement de la filière industrielle de la pomme de terre s’est accompagné d'une augmentation des coproduits dont la valorisation se limite aujourd'hui à l'alimentation animale. La chaconine et la solanine, qui sont présentes dans ces déchets, sont deux glycoalcaloïdes impliqués dans la défense naturelle de la pomme de terre. Ils possèdent une partie aglycone commune (la solanidine), mais une partie saccharidique différente. Cette dernière joue un rôle déterminant dans les diverses activités que peuvent avoir la chaconine et la solanine. L'hémisynthèse de glycoalcaloïdes a été réalisée par greffage de la solanidine (issue des coproduits industriels) sur des fractions saccharidiques obtenues par synthèse chimique. Les parties sucres synthétisées sont basées sur le motif chacotriose (présent sur la chaconine). Les atomes d'oxygène des diverses positions anomères ont été, ou non, substitués par des atomes de soufre. Enfin, un bras espaceur a été introduit entre la partie saccharidique et l'aglycone par réaction de « click chemistry ». Le cholestérol et la diosgénine ont servi de modèles pour mettre au point les conditions expérimentales. Des tests in vivo sur Macrosiphum euphorbiae, puceron ravageur des cultures de pommes de terre, ont permis de mettre en évidence une activité aphicide des glycoalcaloïdes synthétisés. Quant aux dérivés glycostéroïdes basés sur le cholestérol et la diosgénine, ils ont fait l'objet d'une étude des propriétés liquides-cristallines
By-products management is an environmental, economic and regulatory issue. The potato industry development leads to an increase of the by-products amount. Nowadays, the valorization of these wastes is restricted to the animal diet. Chaconine and solanine are two glycoalkaloids which are involved in the natural defenses of potato plants and which are present in by-products. They have the same aglycon moiety (solanidine), but the saccharidic moiety is different. This latter plays an important role in the biological activities of chaconine and solanine. Hemisynthesis of glycoalkaloids has been performed, solanidine (extracted from the byproducts) is linked on a saccharidic moiety which is obtained by chemical synthesis. These sugar parts are based on the chacotriose (present on chaconine). Oxygen atoms at various anomeric positions have been replaced, or not, by sulfur atoms. Finally, a spacer has been introduced between the aglycone and the saccharidic moiety by using "click chemistry". Cholesterol and diosgenin have been used as models to develop the experimental conditions. In vivo tests on Macrosiphum euphorbiae (aphid pests of potato plants) have shown the aphicidal properties of our synthetized glycoalkaloids. Furthermore, for glycosteroids based on cholesterol and diosgenin, a study on liquid crystals properties has been performed

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OTTAVIANI, MARIE-PAULE. "Transformation de la pomme de terre par agrobacterium rhizogenes : cotransformation et expression differentielle des genes introduits." Paris 11, 1991. http://www.theses.fr/1991PA112084.

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Abstract:

La capacite d'agrobacterium rhizogenes pour l'introduction de genes originaires de trois t-dnas (tl, tr-dna du pri1855 et tkg-dna du pbi121) dans le genome vegetal a ete etudiee. Plusieurs genes (rol, opine, nptii et gus genes) presents sur ces t-dnas ont ete introduits simultanement dans le genome de la pomme de terre, cultivar bintje. La regeneration de plantes a partir des racines transformees a ete amelioree. La faible capacite de regeneration de ces racines etaient en partie due au desequilibre hormonal cause par l'expression des genes du ri t-dna. La plus grande capacite a regenerer des plantes a partir des racines originaires de nervures de tiges et de feuilles en comparaison avec les racines induites a partir des tubercules a ete attribuee en partie a l'origine cambiale des premieres racines. 100% cointegration du tl- et tkg-dna ont ete obtenus independamment de la presence de kanamycine pendant la formation de racines. La presence de kanamycine pendant la formation de racines a resulte dans l'augmentation du nombre de copies de tl- et tkg-dna dans le genome vegetal. L'absence de gus activite dans trois plantes a ete correlee avec la presence de copies methylees du gene gus. L'activation spontanee et stable du gene gus a ete observee pendant la culture prolongee d'un clone de racine. Cette activation a ete correlee avec la demethylation du gene gus. La demethylation spontanee a ete aussi observee dans les racines des plantes gus negatives alors qu'aucune activite n'a ete detectee dans leurs feuilles. Les analyses sur la stabilite d'expression des genes marqueurs ont ete realisees pendant trois propagations de tubercules. Au total, 1188 observations portant sur l'expression des differents genes marqueurs (exprimes ou non, qui affectent ou non le developpement des plantes), n'ont revele aucun changement d'expression

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Doumbouya, Moussa. "Diagnostic de sol et recommandations potassiques pour la culture de pomme de terre en sol minéral." Master's thesis, Université Laval, 2015. http://hdl.handle.net/20.500.11794/26481.

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Abstract:

Le potassium est l’élément requis en plus grande quantité par la pomme de terre (Solanum tuberosum L.). L’effet de la fertilisation potassique sur la pomme de terre a été largement décrit en bibliographie. Cependant, aucune méta-analyse n’a encore été effectuée sur la base de données québécoise des essais de fertilisation potassique. L’objectif de ce projet est d’évaluer les performances de trois méthodes diagnostiques du potassium du sol en culture de pomme de terre au Québec, à savoir : la méthode du niveau de suffisance de nutriments disponibles (SLAN), la méthode de saturation en base (BCSR) et la méthode d’analyse compositionnelle, centred log ratio (CLR), afin de contribuer à des grilles de fertilisation pour cette culture. Pour ce faire, les résultats de 57 essais de fertilisation potassique réalisés au Québec entre 1970 à 2013 ont été compilés dans une base de données. La réponse de la pomme de terre aux ajouts de potassium a été analysée par la méthode de Cate-Nelson et traitée par méta-analyse. Le diagnostic par suffisance des nutriments du sol (SLAN) et l’analyse compositionnelle, l’indice log centré, étaient les plus précis lors de la répartition Cate-Nelson. Le BCSR s’est montré peu performant. Le SLAN a surévalué les cas de carences en K par rapport à l’indice log centré, soit 32 vrais positifs contre 21, et avait tendance à sous-évaluer les cas de faible réponse au K, avec 10 vs. 23 vrais négatifs. Le SLAN tendait à surévaluer la dose de K dans les sols de teneur intermédiaire en K échangeable par rapport au CLR.L’indice CLR montre une diminution graduelle des besoins en K avec l’augmentation du poids du K dans le ratio, et se prête donc mieux à la modélisation que l’indice SLAN. Il est suggéré que la dose de K dépasse les exportations de K par la récolte lorsque le log centré se situe sous -2,9 et qu’au-delà de -2,9, la fertilisation potassique complète la fourniture du sol. La recommandation potassique de la pomme de terre suggérée par le CRAAQ (2010) pourrait donc être améliorée avec l’indice CLR.
Potassium is the element required in largest quantities by the potato (Solanum tuberosum L.). The effect of potassium fertilization on potato yield and quality has been extensively described in the bibliography. However, no meta-analysis has yet been performed on the Quebec potato database on potassium fertilization trials. The objective of this project was to evaluate the performance of three diagnostic methods for soil potassium to improve fertilizer recommendation for potato in Quebec: the traditional sufficiency level of available nutrients (SLAN), basic catioon saturation ratios (BCSR) and and the new compositional data analysis method of centred log ratios (CLR). The results of 57 trials of potassium fertilization in Quebec between 1970 and2013 were compiled in a database. The database was analyzed by Cate-Nelson method and meta-analysis. Diagnosis by SLAN and CLR were more accurate compared to BCSR. SLAN generated 32 vs. 21true positive specimens compared to CLR but over estimated cases of K deficiency with10 vs. 23 true negative specimens, hence underestimating cases of small response to added K. The SLAN tended to overestimate the K requirements in the intermediate soil K fertility class compared to CLR. It is suggested that the dose of K should exceed K exportations through harvest when CLR is below -2,9 and that, above a CLR value of -2,9, K fertilization should complement soil K supply. The potassium recommendation potato suggested by CRAAQ (2010) could be improved with the index CLR.

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Nechi, Chaima. "Impact de la fertilisation potassique sur le lessivage du potassium sous culture de pomme de terre." Master's thesis, Université Laval, 2016. http://hdl.handle.net/20.500.11794/26640.

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Abstract:

Le potassium (K), le calcium (Ca) et le magnésium (Mg) sont en compétition pour saturer la CEC du sol. Le lessivage du K a été peu documenté. Cette étude porte sur l'effet de la fertilisation potassique sur le lessivage du K en lien avec celui du Ca et du Mg sous culture de pomme de terre en sols sableux. De 2012 à 2014, deux sites par année étaient établis sur des sols de texture sable loameux près de la ville de Québec. Les séries de sols étaient Morin, Orléans et Saint-Nicolas. Chaque site comprenait huit traitements potassiques constitués d’une combinaison de doses et de sources de KCl et de Sul-Po-Mag répétées trois fois. En 2012, le K fut appliqué à quatre doses (0, 70, 140 et 210 kg K2O ha-1). En 2013 et 2014, une dose de plus de K fut ajoutée (105 kg K2O ha-1) ainsi que trois doses de calcium (15, 125, 250 kg Ca ha-1) appliquées sous forme de CaSO4. L’échantillonnage de la solution du sol dans des lysimètres à succion a eu lieu toutes les deux semaines de la plantation à la récolte. Les concentrations en K (SSK), Ca (SSCa) et Mg (SSMg) furent dosées dans la solution du sol. De 2012 à 2014, l’ajout de fertilisants potassiques n’a pas influencé significativement la SSK sauf à des dates précises. La perte du K était plus élevée au début de la saison de culture, ensuite elle diminuait progressivement mais augmentait à la sénescence de la plante. Pour les sites en 2013 et 2014, la SSCa et la SSMg, étaient significativement influencées par les traitements de K et la date d'échantillonnage. La dose de K n’a généralement pas eu d’impact sur le lessivage du K en sol sableux mais a augmenté le lessivage de SSCa et de SSMg.
Quantification of nutrient movement from agricultural soils is important for both fertilizer and environmental management. This study evaluated the impact of potassium (K) fertilization on K leaching in relation to calcium (Ca) and magnesium (Mg) leaching under potato crop in sandy soils. From 2012 to 2014, two sites per year were established on loamy-sand textured soils near Quebec City. Soil series were Morin, Orleans and Saint-Nicolas. Each site included eight K treatments as a combination of rates and sources of KCl and Sul-Po-Mag with three replications. In 2012, the K was applied at four rates (0, 70, 140 and 210 kg K2O ha-1). In 2013 and 2014, another K rate was added (105 kg K2O ha-1) as well as three rates of calcium (15, 125, 250 kg Ca ha-1) applied as CaSO4. The soil solution was sampled biweekly from planting to harvest using suction lysimeters and the concentrations of K (SSK), Ca (SSCa) and Mg (SSMg) in the soil solution were measured. From 2012 to 2014, adding K fertilizers did not significantly influence the SSK except on specific dates. K leaching was higher at the beginning of the growing season, then it gradually decreased but increased at the end of the growing season until plant reached senescence stage. For all the sites, SSCa and SSMg were significantly influenced by the K treatments and the sampling period. The rate of K generally had no impact on the leaching of K in sandy soils but increased SSCa and SSMg leaching.

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Wen, Guoqi. "Étude des effets de la fertilisation azotée sur les concentrations foliaires en sucres, en acides aminés et en glycoalcaloïdes des plants de pommes de terre." Doctoral thesis, Université Laval, 2020. http://hdl.handle.net/20.500.11794/66330.

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Haffani, Yosr Zakia. "Transfert et expression du gène cry3Ca1 du Bacillus thuringiensis chez la pomme de terre (Solanum tuberosum L.)." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 2000. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk1/tape2/PQDD_0019/NQ54001.pdf.

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EL-IMANE, COLLET RACHIDA. "Ecologie et caracterisation d'helminthosporium solani dur. & mont. , agent de lagale argentee de la pomme de terre." Paris 11, 1993. http://www.theses.fr/1993PA112489.

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Abstract:

La gale argentee de la pomme de terre, longtemps consideree comme une maladie d'importance mineure, est en nette recrudescence. Dans le cadre de cette etude, differents themes ont ete developpes, ayant pour principal objectif la definition, a moyen et a long termes, d'un maximum de mesures aussi bien prophylactiques, genetiques que chimiques, intervenant dans un systeme de lutte raisonnee. Trois facteurs de nuisibilite ont ete etudies: l'etat sanitaire de la semence, le mode de defanage et la date de la recolte. Le premier facteur n'a de nuisibilite agronomique appreciable que si le plant est fletri; de ce fait, la definition d'un seuil de nuisibilite ne peut etre base sur le seul critere de la surface attaquee. La correlation negative qui existe entre le degre d'attaque du tubercule-mere et l'etat sanitaire de la descendance a ete confirmee. Concernant les deux derniers facteurs, c'est la date de recolte qui joue le role le plus important dans la frequence de la maladie a la recolte. Nos experimentations ont confirme le role important joue par la semence dans la transmission et la conservation d'h. Solani. Elles ont egalement mis en evidence la possibilite d'une transmission par le sol. Sur un seul cycle de culture, cette derniere source d'inoculum est de moindre importance; toutefois son impact peut se ressentir si l'on considere le schema de production du plant. D'autres sources potentielles de transmission de l'agent de cette maladie sont discutees. Dans la mesure ou le parasite doit constituer la cible de la strategie a developper, une part importante des recherches porte sur la caracterisation d'une collection de souches monospores au sein de populations naturelles d'h. Solani. Il en ressort que la variabilite s'exprime au travers de tous les criteres etudies: morphologie, vitesse de croissance, optimum thermique, deficience en vitamines, capacite de sporulation, pouvoir pathogene, profils enzymatiques et serologie. Il y a une correspondance entre les criteres morphologiques, biochimiques et biologiques. Cette etude a clairement mis en evidence une variabilite importante qui s'exprime a deux niveaux: variabilite intersouches, qui se concretise par la definition de deux groupes de souches, r et l, bien distincts; variabilite intrasouche, qui se manifeste par l'apparition de secteurs variants. Dans une perspective de lutte genetique, des methodes d'experimentation au champ sont mises au point pour apprecier le comportement varietal. L'analyse des differents cultivars a permis la mise en evidence de deux niveaux de comportement: la sensibilite et la tolerance. Ces deux derniers sont discutes. Au travers des etudes histologiques, nous avons decrit le deroulement du processus infectieux et analyse la reponse de la plante face a l'infection. Des differences structurales entre cultivars ayant un comportement different sont rapportees

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Youcef-Ali, Sabri. "Etude numérique et expérimentale des séchoirs solaires indirects à convection forcée : Application à la pomme de terre." Valenciennes, 2001. https://ged.uphf.fr/nuxeo/site/esupversions/7db5b7f1-e247-4d7f-9a14-5040200b9cb4.

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Abstract:

Nous avons développé un code de calcul permettant de simuler le comportement d'une chaine énergétique (insolateur-séchoir) fonctionnant en convection forcée pour des applications au séchage de produits agro-alimentaires. L’insolateur plan, relié à l'armoire de séchage, est à simple passe arrière, la veine d'air mobile pouvant être munie d'ailettes permettant d'améliorer les performances de ce capteur. Le séchoir est une armoire en bois comportant quatre grilles superposées, sur lesquelles le produit a séché et disposées en lits de rondelles. Dans le modèle théorique décrivant son comportement, nous tenons compte en particulier des pertes calorifiques à travers les parois latérales et du rétrécissement volumique du produit en cours de séchage, phénomènes généralement négligés. Le premier sous-programme itératif développé détermine les performances thermiques instantanées de l'insolateur. Le second gère un modèle théorique qui repose sur les équations de bilan de chaleur et de masse dans les milieux poreux. Dans ce modèle, intervient un coefficient de migration de l'eau dans la masse des particules propre au produit utilisé. Nous avons déterminé ce coefficient expérimentalement, pour plusieurs températures de l'air asséchant, en fonction de l'humidité absolue moyenne des rondelles, ce qui nous a permis de le représenter sous une forme mathématique exploitable dans l'algorithme de calcul. Le modèle théorique est validé par un grand nombre d'expériences en utilisant la pomme de terre, en ensoleillement artificiel et naturel. Cette validation nous a donc permis de tester les possibilités de la chaine étudiée (notamment à travers le coefficient d'efficacité que nous définissons par le rapport de la masse de produit à sécher au temps de séchage global) et de dégager certains principes permettant d'en tirer le maximum de production. Nous présentons enfin quelques prédictions du modèle numérique pour différentes valeurs des paramètres aérothermiques de l'air de séchage.

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LECARDONNEL, ANNE. "Transformation genetique de la pomme de terre par differents genes marqueurs et d'interet : impact sur le doryphore." Amiens, 1998. http://www.theses.fr/1998AMIE0111.

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Abstract:

A l'heure actuelle, l'alternative biotechnologique semble etre une reponse interessante aux differents problemes souleves par l'utilisation des insecticides chimiques (pollution, resistance des insectes cibles, destruction de la faune auxiliaire). Ainsi, de nombreuses plantes transgeniques resistantes aux insectes ont ete produites par differents laboratoires et sont deja commercialisees, ce qui suscite des questions quant aux repercutions eventuelles sur l'environnement. Dans ce contexte, nous avons utilise le systeme pomme de terre transgenique - doryphore, afin d'evaluer l'interet potentiel de deux genes, les genes cryiiia (codant pour une -endotoxine de bacillus thuringiensis) et oci (codant pour une cystatine du riz), pour la lutte contre les insectes ravageurs. En outre, nous avons evalue l'impact de la transformation genetique par des genes neutres, les genes marqueurs nptii et gus, sur la prise alimentaire du doryphore. Dans un premier temps, nous avons produit plusieurs lignees de pomme de terre transgeniques, via agrobacterium tumefaciens. Les plantes obtenues ont ete caracterisees au niveau moleculaire pour l'integration du t-dna. Les analyses des proteines par western blot ou par mesures d'activite enzymatique ont montre l'existence d'une variabilite de l'expression des transgenes entre les lignees, sans correlation avec le nombre d'inserts. L'impact des differents genes introduits, sur le doryphore, a ensuite ete mesure par des tests d'alimentation sur feuillage transgenique. La prise alimentaire, ainsi que le developpement larvaire de l'insecte ont ete etudies. Des reponses variables ont ete enregistrees. Alors qu'aucun effet significatif des plantes cryiiia n'a pu etre detecte, la presence du gene oci dans quatre lignees de pomme de terre a provoque une mortalite accrue des larves, pouvant atteindre 53. 3%, ce qui confirme l'interet potentiel de ce gene dans le cadre de la lutte contre les insectes. La presence des deux genes marqueurs dans les pommes de terre transgeniques a eu pour consequence inattendue l'augmentation de la consommation des larves de deuxieme stade sur les plantes transformees. Une augmentation de la consommation moyenne de 50% a ete mise en evidence sur des plantes ayant integre les genes gus et nptii. En revanche, aucune difference significative de la consommation n'a ete observee entre les plantes non transformees et les plantes ayant integre le gene nptii seul. Ces resultats soulignent la necessite d'utiliser les genes marqueurs avec prudence dans les plantes transgeniques.

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Chaouechi, Ameni. "Lixiviation du potassium sous culture de pomme de terre irriguée en sol sableux : impact des engrais azotés." Master's thesis, Université Laval, 2014. http://hdl.handle.net/20.500.11794/25452.

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Abstract:

Au Québec, la pomme de terre est cultivée sur des sols sableux favorisant les pertes par lixiviation de l’azote et du potassium. Selon le principe de réactions d’échanges cationiques, on a supposé que les doses et les sources d'azote puissent avoir un impact sur la lixiviation du potassium. Ainsi, une expérience a été menée, pendant trois années, dans un champ de pomme. Le dispositif expérimental est un bloc complet aléatoire de quatre répétitions constitué de 10 traitements qui sont un factoriel de trois sources d'azote (nitrate d’ammonium, sulfate d’ammonium et un engrais à libération lente) et trois doses (120, 200 et 280 kg N ha⁻¹) avec un traitement témoin. Des lysimètres ont été installés pour récupérer la solution du sol et doser sa concentration en potassium aux deux semaines. Les résultats ont révélé un effet non significatif de la source et de la dose de l'azote sur la lixiviation du potassium. Un modèle d’évolution de la lixiviation de potassium est obtenu pour aider les producteurs à mieux fractionner leurs engrais potassiques. Le bilan partiel de K montre une lixiviation nette pour les parcelles qui ont reçu une fertilisation azotée mais pas pour le témoin.

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Herbez, Christopher. "Parallélisation massive de dynamiques spatiales : contribution à la gestion durable du mildiou de la pomme de terre." Thesis, Littoral, 2016. http://www.theses.fr/2016DUNK0437/document.

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Abstract:

La simulation à évènements discrets, dans le contexte du formalisme DEVS, est en plein essor depuis quelques années. Face à une demande grandissante en terme de taille de modèles et par conséquent en temps de calcul, il est indispensable de construire des outils tel qu'ils garantissent une optimalité ou au mieux une excellente réponse en terme de temps de simulations. Certes, des outils de parallélisation et de distribution tel que PDEVS existent, mais la répartition des modèles au sein des noeuds de calculs reste entièrement à la charge du modélisateur. L'objectif de cette thèse est de proposer une démarche d'optimisation des temps de simulation parallèle et distribuée, en restructurant la hiérarchie de modèles. La nouvelle hiérarchie ainsi créée doit garantir une exécution simultanée d'un maximum de modèles atomiques, tout en minimisant le nombre d'échanges entre modèles n'appartenant pas au même noeud de calculs (i.e. au même sous-modèle). En effet, l'optimisation des temps de simulation passe par une exécution simultanée d'un maximum de modèles atomiques, mais dans un contexte distribué, il est important de minimiser le transfert d'évènements via le réseau pour éviter les surcoûts liés à son utilisation. Il existe différentes façons de structurer un modèle DEVS : certains utilisent une structure hiérarchique à plusieurs niveaux, d'autres optent pour une structure dite "à plat". Notre approche s'appuie sur cette dernière. En effet, il est possible d'obtenir un unique graphe de modèles, correspondant au réseau de connexions qui lient l'ensemble des modèles atomiques. À partir de ce graphe, la création d'une hiérarchie de modèles optimisée pour la simulation distribuée repose sur le partitionnement de ce graphde de modèles. En effet, la théorie des graphes offre un certain nombre d'outils permettant de partitionner un graphe de façon à satisfaire certaines contraintes. Dans notre cas, la partition de modèles obtenue doit être équilibrée en charge de calcul et doit minimiser le transfert de messages entre les sous-modèles. L'objectif de cette thèse est de présenter la démarche d'optimization, ainsi que les outils de partitionnement et d'apprentissage utilisés pour y parvenir. En effet, le graphe de modèles fournit par la structure à plat ne contient pas toutes les informations nécessaires au partitionnement. C'est pourquoi, il est nécessaire de mettre en place une pondération de celui qui reflète au mieux la dynamique individuelle des modèles qui le compose. Cette pondération est obtenue par apprentissage, à l'aide de chaînes de Markov cachées (HMM). L'utilisation de l'apprentissage dans un contexte DEVS a nécessité quelques modifications pour prendre en compte toutes ces spécificités. Cette thèse présente également toute une phase de validation : à la fois, dans un contexte parallèle dans le but de valider le comportement du noyau de simulation et d'observer les limites liées au comportement des modèles atomiques, et d'autre part, dans un contexte distribué. Pour terminer, cette thèse présente un aspect applicatif lié à la gestion durable du mildiou de la pomme de terre. Le modèle mildiou actuel est conçu pour être utilisé à l'échelle de la parcelle. En collaboration avec des agronomes, nous proposons d'apporter quelques modifications à ce dernier pour étendre son champ d'action et proposer une nouvelle échelle spatiale
Discrete-event simulation, in a context of DEVS formalism, has been experiencing a boom over the recent years. In a situation of increasing demand in terms of model size and consequently in calculation time, it is necessary to build up tools to ensure optimality, or even better, an excellent response to simulation times.Admittedly, there exist parallelization and distribution tools like PDEVS, but the distribution of models within compute nodes is under the modeler s sole responsability.The Ph.D. main scope is to propose an optimization approach of parallel and distributed simulation times, restructuring the hierarchy of models. The new founded hierarchy can thus guarantee a simultaneous execution of a maximum quantity of atomic models while minimizing the number of exchanges between models, which are not associated with the same calculation node (i.e. with the same sub-model). Accordingly, optimizing simulation time goes through a simultaneous implementation of a maximum quantity of atomic models, but in a distributed context it is highly important to minimize the adaptation transfer via the network to avoid overcharges related to its use. Ther exist deifferent ways of structuring a DEVS model : some scientist use a multi-leveled hierarchical structure, and others opt for a "flat" structure. Our objective focuses on the latter. Indeed, it is possible to obtain a single graph of models, corresponding to the connection network linking all the atomic models. From this graph the creation of a model hierarchy optimized by the distributed simulation focuses on the partitioning of this model graph. In such cases, the graph theory reveals a certain numbers of tools to partition the graph to meet some constraints. In our study, the resulting model partition must not only balance calculation needs but also minimize the message transfer between sub-models. The Ph.D. main scope it to propose not only an optimization approach but also partitioning and learning tools to achieve full compliance in our processing methods. In such cases, the model graph using the flat structure does not provide us with all the necessary information related to partitioning. That is the reason whi it is highly necessary to assign a weighting in the graph that best reflects the individual dynamics of models composing it. This weighting comes from learning, using the Hidden Markov Models (HMM). The use of learning in DEVS context results in some adjustments ti consider all the specificities. The thesis also ensures the complete validation phase, either in a parallel context to validate the simulation node behavior and observe the limits of atomic model behavior, or in a distributed context. This dissertation in its final state also includes a pratice-oriented approach to sustainably manage potato blight. The current fungus Phytophthora infestans simulation model is conceived for a plot scale. In collacoration with agronomists, we provide a few changes to update the Phytophthora infestans model to extend the scope of action and propose a new scale of values

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Bakari, Kouassi Dit Abou. "Résistance de Solanum sparsipilum aux nématodes à galles Meloidoyne incognita, M. Arenaria, M. Javanica et M. Fallax : analyse des mécanismes et cartographie des facteurs de résistance." Rennes, Agrocampus, 2005. http://www.theses.fr/2005NSARC077.

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Abstract:

Les nématodes à galles sont des parasites telluriques très polyphages contre lesquels les rotations culturales sont peu efficaces. La lutte chimique a montré aussi ses limites par la toxicité des produits utilisés. Sur pomme de terre, Solanum tuberosum, les racines mais aussi les tubercules sont infectés et présentent des galles qui les rendent non commercialisables. L'utilisation de plantes résistantes constitue une alternative de lutte efficace et n on polluante mais à ce jour aucune variété de pomme de terre résistante n'est disponible. Aussi, les ressources génétiques des Solanacées tubéreuses sauvages sont explorées à la recherche de résistances naturelles transférables dans les variétés cultivées. Nous avons étudié les résistances de deux accessions de l'esp èce S. Sparsipilum, respectivement contre les trois espèces majeures de nématodes à galles des régions tropicales, M. Incognita, M. Arenaria et M. Javanica et contre une espèce des régions tempérées, M. Fallax. Nous avons d'abord caractérisé ces résistances à travers l'étude de leur déterminismes génétiques, leurs mécanismes d'action (réactions pré et post infectieuses au n niveau de la plante et influence sur le développement des nématodes) et leur thermo-sensibilité. Les facteurs génétiques (gènes majeurs ou loi à effets quantitatifs) contrôlant ces résistances ont été cartographiés par la suite sur le génome de S. Sparsipilum. Une plante est considérée comme résistante aux nématodes à galles lorsqu'elle inhibe totalement ou diminue fortement la capacité des juvéniles à évoluer au stade femelle
Root-knot nematodes (Meloidogyne spp. ) are telluric plant parasites with a broad host range that limits the use of crop rotation as control strategy. Chemicals are also restricted in practical agriculture due to their toxicity for human health. Besides the roots Meloidogyne species infest and induce galls on the surf ace and necrotic spots in the fesh of tubers of the potato, Solanum tuberosum. Infested tubers are unacceptable for both processing and fresh market and they are putative sources of dissemintatin of these parasites. Genetic resistance is the favoured control strategy in nematode management because it is usually effective and has no deleterious effects on environment but, no resistant potato cultivar is yet available. For breeding purpose, the resistances of two accessionsof nematodes species Meloidogyne incognita, M. Arenaria and M. Javanica and the temperate species M. Fallax have been investigated. Our objectives were to : 1° understand the species M. Fallax have been investigated. Our objectives were to: 1) understand the effects on the feeding and the development of the juveniles, genetic determinism of the resistances); 2) map major gene (s) or quantitative trait loci (QTL) that control the resistance. Compared to susceptible potato plants, both resistant accessions were significantly less infected. This was due to delayed and then arrested penetration of the juveniles in the roots. The accession harbouring the resistance to M. Fallax developed a necrotic reaction at the feeding site of the juveniles and prevented their development to the female stage. A “F1” diploid progeny was obtained using a dihaploid susceptible potato genotype as the female juveniles suggesting a monogenic control of the resistance. However, “necrotic” and “non necrotic” hybrid genetoypes showed a continuous distribution when considering the nematode females developed in their roots

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Feray, Annie. "Rôle des polyamines dans la tubérisation de la pomme de terre (Solanum tuberosum l. ) : relations avec le transport à longue distance." Brest, 1992. http://www.theses.fr/1992BRES2033.

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Abstract:

L'initiation du tubercule chez la pomme de terre est accompagnee de changements morphologiques et physiologiques profonds. Cette tuberisation est sous la dependance de nombreux facteurs environnementaux et endogenes (hormones). Les polyamines, distribuees de facon ubiquiste chez les vegetaux superieurs, sont impliquees dans la regulation de la croissance et de la differenciation cellulaire, mais leur mode d'action reste encore mal connu. Ce travail montre que les polyamines exogenes (putrescine, spermidine, spermine) introduites dans le milieu de micropropagation, controlent de maniere specifique les processus morphogenetiques chez la pomme de terre. Ce role des polyamines est confirme par les effets specifiques obtenus avec les inhibiteurs de leur biosynthese. En particulier, le methylglyoxal-bis(guanylhydrazone) ou mgbg, inhibiteur de la synthese de spermidine, s'oppose au developpement des tiges, des feuilles et des racines et accelere la formation des tubercules. Ces effets sont associes a une diminution des teneurs en polyamines libres dans les parties aeriennes et une augmentation des taux de polyamines conjuguees dans les tubercules. Une action morphogenetique souleve au moins 2 problemes, celui de la traduction du signal recu et celui de l'action a distance de la molecule. La putrescine et la spermidine apportees par voie foliaire peuvent orienter comme les phytohormones la distribution des nutriments au sein de la plante. L'utilisation de la putrescine-#1#4c apportee au niveau d'une feuille donneuse a permis de mettre en evidence la mobilite de cette molecule dans la plante ; ce transport bidirectionnel semble s'effectuer essentiellement par le phloeme. Il est montre d'autre part, que l'action des polyamines peut etre dependante d'autres hormones (interaction polyamines-cytokinines), ce qui suggere que les polyamines pourraient constituer pour partie une reponse au signal hormonal

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Dissertations / Theses on the topic 'Pomme de terre – Amélioration'

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